View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3634_low_13 (Length: 423)

Name: NF3634_low_13
Description: NF3634
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3634_low_13
NF3634_low_13
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (19-207)||(25535641-25535829)
chr6 (19-209)||(19005383-19005573)
chr6 (19-209)||(34963605-34963795)
chr6 (19-209)||(17377588-17377778)
chr6 (19-209)||(30676450-30676640)
chr6 (19-207)||(1598291-1598478)
chr6 (19-207)||(26924381-26924568)
chr6 (19-209)||(18914164-18914354)
chr6 (19-201)||(12742557-12742739)
chr6 (19-207)||(1540652-1540839)
chr6 (19-207)||(18334333-18334520)
chr6 (18-207)||(19847711-19847896)
chr6 (19-207)||(24422781-24422968)
chr6 (19-207)||(25688736-25688924)
chr6 (19-207)||(33862028-33862215)
chr6 (19-207)||(33864512-33864699)
chr6 (19-195)||(28289077-28289253)
chr6 (19-209)||(31630281-31630471)
chr6 (19-207)||(2290921-2291108)
chr6 (19-207)||(8055263-8055451)
chr6 (19-207)||(23992657-23992844)
chr6 (19-207)||(22782461-22782648)
chr6 (19-207)||(19858663-19858847)
chr6 (19-148)||(19005637-19005766)
chr6 (63-207)||(12942435-12942579)
chr6 (19-148)||(1905-2034)
chr6 (19-148)||(8864-8993)
chr6 (18-148)||(25688988-25689118)
chr6 (18-148)||(112-242)
chr6 (22-148)||(1598542-1598668)
chr6 (19-148)||(25689181-25689310)
chr6 (19-147)||(27557016-27557144)
chr6 (19-140)||(18914619-18914740)
chr6 (29-148)||(25737128-25737247)
chr6 (21-128)||(31630090-31630197)
chr6 (19-148)||(1598735-1598864)
chr6 (19-148)||(19847519-19847648)
chr6 (19-148)||(30676257-30676386)
chr6 (30-140)||(26924199-26924309)
chr6 (19-140)||(18914426-18914547)
chr6 (19-140)||(23415265-23415386)
chr6 (19-101)||(15892149-15892231)
chr6 (53-148)||(22981321-22981416)
chr6 (53-148)||(23806992-23807087)
chr6 (105-179)||(15875663-15875737)
chr6 (19-86)||(17883238-17883305)
chr6 (156-207)||(31630524-31630575)
chr6 (156-207)||(19005280-19005330)
chr6 (30-141)||(19984130-19984241)
chr6 (19-141)||(16240283-16240405)
chr6 (19-141)||(16556945-16557067)
chr6 (19-141)||(16633501-16633623)
chr6 (19-141)||(16650175-16650297)
chr6 (27-141)||(22593590-22593704)
chr6 (156-207)||(15875540-15875590)
chr6 (156-207)||(18914061-18914111)
chr6 (19-141)||(25904461-25904584)
chr6 (58-141)||(35016043-35016126)
chr6 (30-148)||(18334151-18334269)
chr6 (30-148)||(24423032-24423150)
chr6 (19-141)||(27654597-27654719)
chr6 (30-74)||(10905416-10905460)
chr6 (58-141)||(22226608-22226692)
chr6 (30-141)||(21776107-21776218)
chr6 (109-148)||(33864763-33864802)
chr6 (59-141)||(1555514-1555596)
chr6 (59-141)||(10487958-10488040)
chr6 (59-141)||(16377288-16377370)
chr6 (59-141)||(16384612-16384694)
chr6 (59-141)||(16826408-16826490)
chr6 (59-141)||(33315116-33315198)
chr6 (59-100)||(16133087-16133128)
chr6 (19-55)||(25737028-25737064)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (19-207)||(46822495-46822683)
chr3 (19-209)||(12119394-12119584)
chr3 (19-209)||(13436531-13436721)
chr3 (19-207)||(24513910-24514098)
chr3 (19-207)||(53301244-53301432)
chr3 (19-207)||(7781087-7781275)
chr3 (19-207)||(17463412-17463599)
chr3 (19-207)||(27165486-27165674)
chr3 (19-207)||(34159560-34159747)
chr3 (19-207)||(45606647-45606835)
chr3 (19-207)||(54521056-54521244)
chr3 (19-207)||(8499754-8499942)
chr3 (19-207)||(10557142-10557330)
chr3 (19-207)||(13544259-13544445)
chr3 (19-207)||(15412665-15412853)
chr3 (19-207)||(15977767-15977954)
chr3 (19-207)||(55476725-55476912)
chr3 (19-207)||(12567794-12567981)
chr3 (19-165)||(20629932-20630078)
chr3 (19-208)||(17444504-17444693)
chr3 (19-207)||(6468875-6469062)
chr3 (19-208)||(38961578-38961768)
chr3 (19-208)||(16282498-16282687)
chr3 (19-207)||(16454021-16454209)
chr3 (19-208)||(41124172-41124361)
chr3 (19-207)||(13153996-13154183)
chr3 (19-207)||(13151531-13151718)
chr3 (19-179)||(28848362-28848522)
chr3 (19-208)||(25237076-25237265)
chr3 (19-207)||(10247464-10247651)
chr3 (19-207)||(29544582-29544770)
chr3 (19-208)||(25229489-25229678)
chr3 (19-155)||(10379613-10379749)
chr3 (70-207)||(12305379-12305516)
chr3 (19-148)||(20629739-20629868)
chr3 (19-148)||(38961385-38961514)
chr3 (19-148)||(41124425-41124554)
chr3 (19-148)||(10557394-10557523)
chr3 (19-148)||(53301051-53301180)
chr3 (19-145)||(8500009-8500135)
chr3 (19-137)||(13937520-13937638)
chr3 (19-148)||(14567432-14567561)
chr3 (19-148)||(27165738-27165867)
chr3 (19-148)||(55319044-55319173)
chr3 (19-147)||(15465448-15465576)
chr3 (27-149)||(36528447-36528569)
chr3 (22-148)||(55318854-55318980)
chr3 (19-140)||(46822755-46822876)
chr3 (19-147)||(26055005-26055133)
chr3 (19-148)||(17444311-17444440)
chr3 (19-147)||(5223677-5223805)
chr3 (19-140)||(16282305-16282426)
chr3 (19-148)||(17393201-17393330)
chr3 (42-140)||(16358238-16358336)
chr3 (42-149)||(3264324-3264431)
chr3 (156-207)||(9707484-9707535)
chr3 (84-140)||(15007996-15008052)
chr3 (18-72)||(15007868-15007922)
chr3 (59-141)||(25058285-25058367)
chr3 (156-207)||(8899328-8899378)
chr3 (156-207)||(16282689-16282739)
chr3 (156-207)||(17444694-17444744)
chr3 (156-207)||(38961769-38961819)
chr3 (156-207)||(41124121-41124171)
chr3 (59-141)||(16934851-16934933)
chr3 (59-141)||(49231755-49231837)
chr3 (58-128)||(51158683-51158753)
chr3 (19-63)||(36528340-36528384)
chr3 (156-207)||(25237025-25237075)
chr3 (19-141)||(14528625-14528747)
chr3 (30-148)||(34159811-34159929)
chr3 (60-141)||(30152437-30152518)
chr3 (156-207)||(11913928-11913978)
chr3 (109-148)||(17463663-17463702)
chr3 (59-126)||(54039167-54039234)
chr3 (109-148)||(55476976-55477015)
chr3 (59-141)||(1468654-1468736)
chr3 (19-141)||(8276474-8276596)
chr3 (19-69)||(16358408-16358458)
chr3 (59-141)||(17956869-17956951)
chr3 (42-132)||(21026092-21026182)
[»] chr8 (77 HSPs)
chr8 (19-209)||(27472157-27472347)
chr8 (19-207)||(24048845-24049032)
chr8 (19-209)||(38549745-38549935)
chr8 (19-209)||(16413056-16413246)
chr8 (19-209)||(24485784-24485974)
chr8 (19-209)||(25657893-25658083)
chr8 (19-207)||(32121962-32122150)
chr8 (19-209)||(16198126-16198316)
chr8 (19-205)||(18677805-18677991)
chr8 (19-207)||(1484636-1484823)
chr8 (19-207)||(14409185-14409372)
chr8 (19-207)||(15070794-15070982)
chr8 (19-207)||(4483514-4483702)
chr8 (19-207)||(5853033-5853220)
chr8 (19-205)||(14824011-14824196)
chr8 (22-208)||(45290385-45290571)
chr8 (19-191)||(15202919-15203091)
chr8 (19-209)||(16401665-16401855)
chr8 (19-208)||(1326672-1326861)
chr8 (19-207)||(22001987-22002174)
chr8 (19-205)||(20045936-20046121)
chr8 (19-208)||(20403512-20403701)
chr8 (19-207)||(4542114-4542301)
chr8 (19-179)||(19936648-19936808)
chr8 (19-208)||(19896554-19896743)
chr8 (18-148)||(19896807-19896937)
chr8 (18-148)||(27471963-27472093)
chr8 (19-148)||(20403765-20403894)
chr8 (19-149)||(15202726-15202856)
chr8 (19-147)||(14397481-14397609)
chr8 (19-140)||(15202533-15202654)
chr8 (19-148)||(32122214-32122343)
chr8 (19-137)||(38549360-38549478)
chr8 (18-120)||(45290287-45290389)
chr8 (27-148)||(16401287-16401408)
chr8 (19-140)||(24049104-24049225)
chr8 (19-148)||(15071046-15071175)
chr8 (19-148)||(38549552-38549681)
chr8 (19-135)||(16401472-16401588)
chr8 (18-140)||(19897008-19897130)
chr8 (22-148)||(16412866-16412992)
chr8 (19-140)||(19936455-19936576)
chr8 (19-114)||(11361036-11361131)
chr8 (156-209)||(13425336-13425389)
chr8 (156-209)||(20982498-20982551)
chr8 (156-207)||(20982604-20982655)
chr8 (19-74)||(32810263-32810318)
chr8 (156-207)||(38549988-38550039)
chr8 (19-141)||(15319989-15320111)
chr8 (19-141)||(15500358-15500480)
chr8 (59-128)||(29759429-29759498)
chr8 (156-207)||(1326915-1326965)
chr8 (156-207)||(20403461-20403511)
chr8 (30-141)||(24717722-24717833)
chr8 (156-207)||(32810165-32810215)
chr8 (156-207)||(45290572-45290622)
chr8 (167-209)||(13425241-13425283)
chr8 (59-141)||(13663129-13663211)
chr8 (59-141)||(22007126-22007208)
chr8 (156-207)||(16401908-16401958)
chr8 (156-207)||(19896503-19896553)
chr8 (30-148)||(1484887-1485005)
chr8 (58-128)||(17150655-17150725)
chr8 (157-207)||(19936882-19936931)
chr8 (156-205)||(15203109-15203157)
chr8 (59-148)||(20045783-20045872)
chr8 (109-148)||(5852930-5852969)
chr8 (109-148)||(14409082-14409121)
chr8 (58-141)||(22089412-22089495)
chr8 (19-141)||(223305-223427)
chr8 (59-141)||(272204-272286)
chr8 (59-141)||(643563-643645)
chr8 (19-141)||(688076-688198)
chr8 (19-141)||(736928-737050)
chr8 (59-141)||(829369-829451)
chr8 (19-141)||(860823-860945)
chr8 (58-128)||(39114415-39114485)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (19-209)||(52872813-52873003)
chr4 (18-209)||(362412-362603)
chr4 (18-209)||(3515239-3515430)
chr4 (19-209)||(14970447-14970637)
chr4 (19-207)||(15534415-15534603)
chr4 (21-209)||(19617809-19617997)
chr4 (19-209)||(15495914-15496104)
chr4 (19-207)||(15118093-15118280)
chr4 (19-207)||(29267587-29267775)
chr4 (19-207)||(49547514-49547702)
chr4 (19-191)||(11995-12167)
chr4 (19-207)||(44615522-44615710)
chr4 (19-207)||(44772824-44773011)
chr4 (19-207)||(50222080-50222267)
chr4 (19-207)||(19242934-19243122)
chr4 (19-207)||(36038104-36038292)
chr4 (19-199)||(14746252-14746432)
chr4 (18-179)||(19857840-19858001)
chr4 (19-208)||(52312795-52312983)
chr4 (19-179)||(1837260-1837420)
chr4 (19-207)||(14048811-14048999)
chr4 (19-205)||(7640927-7641112)
chr4 (19-148)||(15495721-15495850)
chr4 (19-146)||(362668-362795)
chr4 (19-148)||(19858064-19858193)
chr4 (19-148)||(362859-362988)
chr4 (19-148)||(14746059-14746188)
chr4 (19-148)||(14970254-14970383)
chr4 (19-148)||(18214751-18214880)
chr4 (18-148)||(52872619-52872749)
chr4 (19-148)||(3515493-3515622)
chr4 (19-148)||(52313240-52313369)
chr4 (19-148)||(52313047-52313176)
chr4 (102-209)||(18214992-18215099)
chr4 (19-148)||(19617614-19617743)
chr4 (42-148)||(14185621-14185727)
chr4 (18-167)||(30147189-30147338)
chr4 (128-209)||(15355068-15355149)
chr4 (109-207)||(18239250-18239347)
chr4 (30-140)||(22725284-22725393)
chr4 (156-207)||(19857716-19857767)
chr4 (31-141)||(14951257-14951367)
chr4 (78-140)||(14745925-14745987)
chr4 (59-141)||(14995631-14995713)
chr4 (58-126)||(55377225-55377293)
chr4 (156-207)||(12185-12235)
chr4 (156-207)||(15355202-15355252)
chr4 (156-207)||(18215152-18215202)
chr4 (156-207)||(52312744-52312794)
chr4 (30-128)||(25120046-25120144)
chr4 (27-141)||(43281694-43281808)
chr4 (58-141)||(18293695-18293778)
chr4 (156-207)||(19618050-19618100)
chr4 (30-148)||(15117911-15118029)
chr4 (19-141)||(18247726-18247848)
chr4 (19-141)||(47357170-47357292)
chr4 (19-56)||(12778423-12778460)
chr4 (30-141)||(5683367-5683478)
chr4 (26-141)||(9198543-9198658)
chr4 (156-207)||(14746495-14746545)
chr4 (19-126)||(15287859-15287966)
chr4 (19-126)||(15294969-15295076)
chr4 (156-207)||(15496949-15496999)
chr4 (19-114)||(16731690-16731785)
chr4 (30-141)||(22355071-22355182)
chr4 (156-207)||(52873056-52873106)
chr4 (19-141)||(10643733-10643855)
chr4 (32-74)||(11940064-11940106)
chr4 (59-141)||(18168280-18168362)
chr4 (59-112)||(17146320-17146373)
chr4 (111-148)||(44772723-44772760)
chr4 (30-74)||(11557892-11557936)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (19-209)||(23706957-23707147)
chr2 (19-209)||(24642489-24642679)
chr2 (19-209)||(24671257-24671447)
chr2 (19-209)||(24918372-24918562)
chr2 (19-207)||(39682547-39682735)
chr2 (19-209)||(24681676-24681866)
chr2 (18-207)||(24529286-24529475)
chr2 (19-207)||(571631-571819)
chr2 (19-207)||(20261453-20261641)
chr2 (19-207)||(18809177-18809364)
chr2 (19-207)||(23131096-23131284)
chr2 (19-207)||(23133563-23133751)
chr2 (19-207)||(23711754-23711941)
chr2 (19-207)||(28577333-28577520)
chr2 (19-207)||(34402262-34402450)
chr2 (19-207)||(45027645-45027832)
chr2 (19-208)||(22105698-22105887)
chr2 (19-207)||(23709273-23709460)
chr2 (19-209)||(38967711-38967901)
chr2 (19-208)||(41523813-41524002)
chr2 (19-207)||(10684503-10684691)
chr2 (18-179)||(32214670-32214831)
chr2 (19-191)||(24368076-24368248)
chr2 (19-207)||(24897936-24898123)
chr2 (19-207)||(24905373-24905560)
chr2 (22-208)||(6726280-6726466)
chr2 (19-205)||(26505615-26505800)
chr2 (19-205)||(26508093-26508278)
chr2 (42-207)||(25616415-25616580)
chr2 (19-207)||(24900419-24900606)
chr2 (19-207)||(24902896-24903083)
chr2 (19-207)||(24907848-24908035)
chr2 (19-208)||(21154748-21154937)
chr2 (18-179)||(23135841-23136002)
chr2 (20-207)||(32039240-32039426)
chr2 (19-148)||(6726533-6726662)
chr2 (18-148)||(22105951-22106081)
chr2 (19-148)||(24529094-24529223)
chr2 (19-140)||(41523427-41523548)
chr2 (19-148)||(24918626-24918755)
chr2 (19-148)||(41523620-41523749)
chr2 (19-126)||(23931775-23931882)
chr2 (21-148)||(24368312-24368439)
chr2 (19-146)||(45027452-45027579)
chr2 (19-140)||(21154362-21154483)
chr2 (19-148)||(24681930-24682059)
chr2 (19-148)||(21154555-21154684)
chr2 (19-140)||(24671519-24671640)
chr2 (19-145)||(23931949-23932075)
chr2 (19-148)||(23706573-23706702)
chr2 (19-148)||(23709080-23709209)
chr2 (18-146)||(32214476-32214604)
chr2 (19-140)||(23706765-23706886)
chr2 (83-147)||(31345490-31345554)
chr2 (59-141)||(16900802-16900884)
chr2 (59-141)||(16994193-16994275)
chr2 (57-141)||(67326-67410)
chr2 (156-207)||(6726229-6726279)
chr2 (19-141)||(24686598-24686720)
chr2 (59-141)||(34823737-34823819)
chr2 (156-205)||(24368010-24368058)
chr2 (96-148)||(24642373-24642425)
chr2 (30-74)||(44584588-44584632)
chr2 (160-207)||(21154942-21154988)
chr2 (156-207)||(22105647-22105697)
chr2 (156-207)||(23707200-23707250)
chr2 (156-207)||(24642732-24642782)
chr2 (156-207)||(24681573-24681623)
chr2 (58-141)||(27261319-27261402)
chr2 (156-207)||(38967608-38967658)
chr2 (59-141)||(12727698-12727780)
chr2 (30-148)||(18809428-18809546)
chr2 (19-141)||(19887275-19887397)
chr2 (19-100)||(6483113-6483194)
chr2 (159-207)||(24671154-24671201)
chr2 (42-90)||(34135071-34135119)
chr2 (109-148)||(23131347-23131386)
chr2 (109-148)||(23711651-23711690)
chr2 (156-207)||(24918269-24918319)
chr2 (109-148)||(26505864-26505903)
chr2 (109-148)||(26508342-26508381)
chr2 (109-148)||(27920402-27920441)
chr2 (109-148)||(32039136-32039175)
chr2 (109-148)||(34402160-34402199)
chr2 (156-199)||(41524003-41524045)
chr2 (59-141)||(11232253-11232335)
chr2 (59-141)||(22514100-22514182)
chr2 (59-141)||(28776702-28776784)
chr2 (19-100)||(6486580-6486661)
chr2 (60-128)||(22274022-22274090)
chr2 (30-74)||(24788042-24788086)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (19-207)||(17516904-17517092)
chr5 (19-209)||(20901661-20901851)
chr5 (19-203)||(2154372-2154556)
chr5 (19-207)||(38619670-38619858)
chr5 (19-207)||(20909246-20909433)
chr5 (19-207)||(264509-264696)
chr5 (19-207)||(23064747-23064935)
chr5 (19-207)||(37804643-37804831)
chr5 (19-208)||(20917587-20917776)
chr5 (19-207)||(10732681-10732868)
chr5 (19-207)||(39245370-39245557)
chr5 (19-207)||(39363618-39363806)
chr5 (19-208)||(32027678-32027867)
chr5 (19-207)||(42245106-42245293)
chr5 (19-191)||(29330233-29330404)
chr5 (19-207)||(29346214-29346401)
chr5 (19-207)||(9776592-9776780)
chr5 (19-207)||(29348687-29348874)
chr5 (19-207)||(29351160-29351347)
chr5 (18-148)||(32028511-32028641)
chr5 (19-148)||(32028124-32028254)
chr5 (18-148)||(17516517-17516647)
chr5 (19-140)||(296015-296136)
chr5 (19-148)||(29330468-29330597)
chr5 (19-148)||(17516711-17516840)
chr5 (19-148)||(20901468-20901597)
chr5 (23-148)||(295826-295951)
chr5 (19-140)||(2154179-2154300)
chr5 (19-140)||(20917394-20917515)
chr5 (19-140)||(32027939-32028060)
chr5 (19-140)||(32028326-32028447)
chr5 (156-207)||(20901904-20901955)
chr5 (58-141)||(27183208-27183291)
chr5 (19-141)||(22883904-22884026)
chr5 (156-207)||(29330165-29330215)
chr5 (156-207)||(32027627-32027677)
chr5 (59-141)||(1220384-1220466)
chr5 (59-141)||(10778832-10778914)
chr5 (19-141)||(43444009-43444131)
chr5 (32-128)||(23511127-23511223)
chr5 (156-207)||(20917830-20917880)
chr5 (19-141)||(11890-12012)
chr5 (19-141)||(25426164-25426286)
chr5 (109-148)||(264406-264445)
chr5 (19-126)||(7424879-7424986)
chr5 (109-148)||(20909497-20909536)
chr5 (109-148)||(39245621-39245660)
chr5 (109-148)||(39363869-39363908)
chr5 (59-141)||(11212734-11212816)
chr5 (31-141)||(11342177-11342287)
chr5 (59-141)||(21074249-21074331)
chr5 (19-141)||(22367095-22367217)
chr5 (30-68)||(23280293-23280331)
chr5 (59-141)||(35581327-35581409)
chr5 (59-141)||(36990679-36990761)
chr5 (59-128)||(1168832-1168901)
chr5 (59-128)||(21933283-21933352)
chr5 (59-128)||(21939453-21939522)
chr5 (30-86)||(22755214-22755270)
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (19-209)||(15081582-15081772)
chr7 (19-209)||(16213916-16214106)
chr7 (18-209)||(8940511-8940706)
chr7 (19-209)||(14269697-14269887)
chr7 (19-207)||(456555-456743)
chr7 (19-207)||(13869582-13869770)
chr7 (19-207)||(27217094-27217282)
chr7 (19-207)||(41523151-41523339)
chr7 (19-207)||(41525613-41525801)
chr7 (19-207)||(15376454-15376641)
chr7 (19-207)||(20384864-20385051)
chr7 (18-209)||(45847394-45847585)
chr7 (19-209)||(8468967-8469157)
chr7 (19-207)||(11303481-11303669)
chr7 (19-207)||(14948863-14949050)
chr7 (19-207)||(16232754-16232942)
chr7 (19-207)||(16410293-16410480)
chr7 (33-207)||(11393041-11393215)
chr7 (21-207)||(21189338-21189523)
chr7 (19-207)||(23664693-23664881)
chr7 (19-207)||(32125725-32125912)
chr7 (19-205)||(18627802-18627987)
chr7 (19-207)||(29796844-29797032)
chr7 (19-207)||(29800663-29800851)
chr7 (19-205)||(18640508-18640693)
chr7 (22-207)||(18430946-18431130)
chr7 (19-207)||(16108429-16108617)
chr7 (19-179)||(24702490-24702650)
chr7 (19-179)||(24704937-24705097)
chr7 (19-207)||(26355722-26355909)
chr7 (19-207)||(26358174-26358361)
chr7 (19-208)||(11972781-11972970)
chr7 (21-148)||(10501136-10501263)
chr7 (49-208)||(13841287-13841446)
chr7 (19-148)||(38897775-38897904)
chr7 (19-148)||(8940769-8940897)
chr7 (19-148)||(14269311-14269440)
chr7 (19-148)||(16214170-16214299)
chr7 (19-148)||(14156626-14156755)
chr7 (18-148)||(14156818-14156944)
chr7 (19-148)||(21189143-21189272)
chr7 (19-147)||(25926870-25926998)
chr7 (19-140)||(15081389-15081510)
chr7 (19-147)||(1856970-1857097)
chr7 (19-148)||(8940962-8941091)
chr7 (19-147)||(13918143-13918272)
chr7 (19-148)||(14269504-14269633)
chr7 (19-114)||(10500968-10501063)
chr7 (19-148)||(17985125-17985254)
chr7 (30-148)||(45847213-45847331)
chr7 (61-149)||(11310239-11310327)
chr7 (151-209)||(38897995-38898053)
chr7 (156-209)||(45847638-45847691)
chr7 (58-128)||(11286976-11287046)
chr7 (156-206)||(11972731-11972780)
chr7 (59-128)||(125965-126034)
chr7 (30-114)||(16202766-16202850)
chr7 (156-207)||(14269940-14269990)
chr7 (156-207)||(15081825-15081875)
chr7 (156-207)||(38898106-38898156)
chr7 (30-148)||(15376272-15376390)
chr7 (30-148)||(20384682-20384800)
chr7 (30-74)||(13475728-13475772)
chr7 (156-207)||(8940408-8940458)
chr7 (62-141)||(15951637-15951716)
chr7 (109-148)||(16410544-16410583)
chr7 (109-148)||(18628051-18628090)
chr7 (109-148)||(18640757-18640796)
chr7 (109-148)||(26355619-26355658)
chr7 (109-148)||(26358071-26358110)
chr7 (59-141)||(7822000-7822082)
chr7 (59-141)||(7829311-7829393)
chr7 (59-141)||(15760779-15760861)
chr7 (59-141)||(27102552-27102634)
chr7 (59-141)||(27109900-27109982)
chr7 (59-141)||(27175692-27175774)
chr7 (59-141)||(38784644-38784726)
chr7 (30-110)||(10000996-10001076)
chr7 (19-63)||(11310133-11310177)
chr7 (19-51)||(20110747-20110779)
chr7 (19-51)||(23461832-23461864)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (18-208)||(27161326-27161516)
chr1 (19-209)||(16274996-16275187)
chr1 (19-208)||(29776973-29777162)
chr1 (19-207)||(13989100-13989287)
chr1 (19-207)||(21474827-21475015)
chr1 (19-208)||(31612598-31612787)
chr1 (19-207)||(21923032-21923219)
chr1 (19-207)||(15859749-15859936)
chr1 (19-207)||(16362152-16362340)
chr1 (19-207)||(21841001-21841188)
chr1 (19-208)||(22122755-22122944)
chr1 (19-208)||(29298474-29298663)
chr1 (19-208)||(22050577-22050766)
chr1 (19-175)||(13227129-13227285)
chr1 (19-207)||(23593474-23593662)
chr1 (19-175)||(29535317-29535473)
chr1 (19-148)||(16274803-16274932)
chr1 (19-148)||(31612851-31612980)
chr1 (19-148)||(29298727-29298856)
chr1 (19-148)||(22122561-22122691)
chr1 (19-148)||(15859543-15859672)
chr1 (19-140)||(31613052-31613173)
chr1 (19-140)||(29777234-29777355)
chr1 (19-140)||(9044745-9044866)
chr1 (19-148)||(27161134-27161263)
chr1 (19-138)||(40129387-40129506)
chr1 (19-148)||(16401407-16401536)
chr1 (78-148)||(10812612-10812682)
chr1 (19-73)||(43543269-43543323)
chr1 (156-207)||(16275240-16275291)
chr1 (156-207)||(22050767-22050817)
chr1 (156-207)||(29776922-29776972)
chr1 (58-141)||(21858579-21858662)
chr1 (156-207)||(22122945-22122995)
chr1 (156-207)||(29298370-29298420)
chr1 (156-207)||(31612547-31612597)
chr1 (30-141)||(44035830-44035941)
chr1 (30-148)||(13989351-13989469)
chr1 (59-141)||(17003896-17003978)
chr1 (59-141)||(21650910-21650992)
chr1 (59-141)||(22366514-22366596)
chr1 (157-207)||(27161518-27161567)
chr1 (21-141)||(18060577-18060697)
chr1 (156-208)||(29298421-29298473)
[»] scaffold0747 (4 HSPs)
scaffold0747 (24-209)||(821-1006)
scaffold0747 (19-148)||(1075-1204)
scaffold0747 (19-114)||(1229-1323)
scaffold0747 (156-207)||(718-768)
[»] scaffold0230 (4 HSPs)
scaffold0230 (19-207)||(23271-23459)
scaffold0230 (19-207)||(14181-14369)
scaffold0230 (18-148)||(22917-23047)
scaffold0230 (62-148)||(23121-23207)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (22-209)||(267-454)
scaffold0494 (156-209)||(507-560)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (19-209)||(4926-5116)
scaffold0716 (19-148)||(5180-5309)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (19-207)||(441-629)
scaffold1792 (18-148)||(853-983)
scaffold1792 (62-148)||(693-779)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (19-207)||(4043-4231)
scaffold0741 (19-148)||(3850-3979)
scaffold0741 (19-140)||(3657-3778)
scaffold0741 (96-140)||(3541-3585)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (19-207)||(6181-6368)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (19-207)||(13626-13814)
scaffold0444 (108-148)||(13878-13918)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (19-207)||(20981-21169)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (19-207)||(38055-38243)
scaffold0134 (30-148)||(38307-38425)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (21-209)||(10023-10211)
scaffold0043 (19-148)||(10277-10406)
scaffold0043 (19-140)||(10478-10599)
scaffold0043 (156-190)||(9936-9970)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (19-207)||(94645-94832)
scaffold0023 (19-209)||(17180-17370)
scaffold0023 (36-148)||(17004-17116)
scaffold0023 (30-148)||(94896-95014)
scaffold0023 (59-141)||(154892-154974)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (19-209)||(30251-30441)
scaffold0149 (19-148)||(30505-30634)
scaffold0149 (158-207)||(30147-30196)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (19-179)||(6713-6873)
scaffold0574 (19-148)||(6937-7066)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (19-207)||(3257-3445)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (18-209)||(11521-11712)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (21-207)||(15156-15342)
scaffold0306 (19-190)||(11080-11251)
scaffold0306 (19-148)||(10887-11016)
scaffold0306 (19-148)||(15398-15526)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (19-207)||(40634-40821)
scaffold0044 (19-141)||(37847-37968)
scaffold0044 (108-148)||(40885-40925)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (14-209)||(53607-53802)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (19-207)||(9476-9663)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (19-207)||(6676-6864)
scaffold0317 (19-148)||(6483-6612)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (19-207)||(134445-134632)
scaffold0028 (19-207)||(136914-137101)
scaffold0028 (19-207)||(139383-139570)
scaffold0028 (19-207)||(141852-142039)
scaffold0028 (19-207)||(144321-144508)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (19-184)||(7996-8161)
scaffold0278 (22-148)||(8225-8351)
scaffold0278 (19-145)||(8421-8547)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (19-209)||(38396-38586)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (42-207)||(1662-1827)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (31-207)||(13379-13555)
scaffold0040 (21-178)||(43002-43159)
scaffold0040 (19-148)||(43225-43354)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (57-209)||(57713-57865)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (18-175)||(68227-68384)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (19-148)||(1740-1869)
scaffold1296 (18-61)||(1634-1677)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (19-148)||(18423-18552)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (19-159)||(501347-501486)
scaffold0001 (22-148)||(501550-501676)
scaffold0001 (174-209)||(501316-501351)
scaffold0001 (30-86)||(139589-139645)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (19-140)||(33472-33593)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (22-148)||(36749-36875)
scaffold0151 (18-148)||(36938-37068)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (19-147)||(7430-7558)
scaffold0711 (24-148)||(7243-7367)
scaffold0711 (53-146)||(7079-7172)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (19-147)||(17947-18075)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (19-148)||(8311-8440)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (71-207)||(11007-11142)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (19-147)||(19829-19957)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (19-147)||(39626-39754)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (19-147)||(31497-31625)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (92-208)||(28074-28190)
scaffold0114 (156-207)||(28023-28073)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (144-209)||(10647-10712)
scaffold0513 (156-203)||(10765-10811)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (43-144)||(113313-113414)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (19-128)||(6196-6305)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (27-141)||(12489-12603)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (19-141)||(8553-8675)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (19-141)||(30457-30579)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (18-63)||(75644-75689)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (156-207)||(9965-10016)
scaffold0145 (158-208)||(10017-10067)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (132-179)||(15030-15077)
scaffold0106 (156-207)||(15150-15200)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (59-128)||(6970-7039)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (19-128)||(725-834)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (59-142)||(1361-1444)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (26-141)||(1218-1333)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (30-141)||(1267-1378)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (30-141)||(32118-32229)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (30-141)||(40615-40726)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (58-141)||(39952-40035)
scaffold0034 (58-141)||(45435-45518)
scaffold0034 (58-141)||(78990-79073)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (60-126)||(15780-15846)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (19-141)||(110065-110187)
scaffold0035 (19-141)||(118566-118688)
scaffold0035 (30-73)||(15910-15953)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (58-141)||(855-938)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (59-126)||(912-979)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (58-141)||(53933-54016)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (58-141)||(19939-20022)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (19-62)||(398-441)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (59-141)||(18192-18274)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (59-141)||(38362-38444)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25535829 - 25535641
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25535829 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 25535730  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535729 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19005573 - 19005383
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19005573 aattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 19005474  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19005473 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttgtgaatgcgatattgttc 19005383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34963795 - 34963605
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  34963795 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 34963696  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963695 tcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 34963605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 17377588 - 17377778
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  17377588 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatgg 17377687  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17377688 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 17377778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 30676450 - 30676640
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  30676450 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgagttatgg 30676549  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676550 taaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 30676640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1598478 - 1598291
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |    
T  1598478 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtcatag 1598379  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1598378 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 1598291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 26924381 - 26924568
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  26924381 aattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 26924480  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26924481 tcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 26924568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18914354 - 18914164
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18914354 aattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaaaaggatgtatagaacttgagttatgg 18914255  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18914254 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtaaatacgatattgttc 18914164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12742739 - 12742557
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  12742739 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12742640  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacga 201  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742639 tcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacga 12742557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 1540652 - 1540839
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1540652 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1540751  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1540752 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 1540839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 18334333 - 18334520
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18334333 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 18334432  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18334433 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18334520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 19847711 - 19847896
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19847711 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 19847806  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847807 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 19847896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24422968 - 24422781
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24422968 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24422869  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24422868 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 24422781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25688924 - 25688736
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  25688924 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaaattgagttatgg 25688825  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25688824 tcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgt 25688736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33862215 - 33862028
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  33862215 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 33862116  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33862115 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 33862028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33864699 - 33864512
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  33864699 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 33864600  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33864599 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 33864512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 28289077 - 28289253
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28289077 aattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 28289176  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtga 195  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  28289177 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtga 28289253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 31630281 - 31630471
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31630281 aattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 31630380  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630381 tcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 31630471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 2290921 - 2291108
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  2290921 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 2291020  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2291021 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 2291108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8055451 - 8055263
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  8055451 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 8055352  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055351 tcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 8055263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23992844 - 23992657
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23992844 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23992745  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23992744 tcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 23992657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22782648 - 22782461
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  22782648 aattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaatttgagttatgg 22782549  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22782548 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 22782461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 19858663 - 19858847
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  19858663 aattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 19858759  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  19858760 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ctgtgaatacgatattgt 19858847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19005766 - 19005637
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  19005766 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgt 19005667  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19005666 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 63 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12942579 - 12942435
Alignment:
Q  63 agctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgatt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  12942579 agctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgatt 12942480  T
Q  163 gatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12942479 gatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 12942435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 1905 - 2034
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1905 aattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 2004  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2005 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 8864 - 8993
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8864 aattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8963  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8964 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25689118 - 25688988
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| ||| ||    
T  25689118 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaaaaatttatagaacttgcgttatg 25689019  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25689018 gtcatattactgcacgtaggtcatagtgaat 25688988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 112 - 242
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  112 aaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatg 211  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  212 gtcaaagtactgcacgtaggtcatagtgaat 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1598668 - 1598542
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  1598668 tggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatggtca 1598569  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  1598568 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25689310 - 25689181
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  25689310 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 25689211  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689210 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 25689181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27557144 - 27557016
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||||  |||||||||||||||||| |||    
T  27557144 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaaaacaatttatagaacttgagttatgg 27557045  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27557044 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 27557016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18914740 - 18914619
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  18914740 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaaaaaaatttatagaacttgagttatgg 18914641  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18914640 tcaaattactgcacgtaggtca 18914619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  29 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  129 gcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 128
Target Start/End: Original strand, 31630090 - 31630197
Alignment:
Q  21 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtc 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31630090 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 31630189  T
Q  121 aaattact 128  Q
    ||||||||    
T  31630190 aaattact 31630197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1598864 - 1598735
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1598864 aattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatgg 1598765  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1598764 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 19847519 - 19847648
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||| |||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  19847519 aattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcg 19847618  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19847619 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 30676257 - 30676386
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  30676257 aattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 30676356  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30676357 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 26924199 - 26924309
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26924199 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 26924298  T
Q  130 cacgtaggtca 140  Q
    |||||||||||    
T  26924299 cacgtaggtca 26924309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18914547 - 18914426
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  18914547 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgattgatagaacttgagttatgg 18914448  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  18914447 tcaaagtactgcacgtaggtca 18914426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 23415386 - 23415265
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  23415386 aatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 23415287  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  23415286 tcaagttactgcacgtaggtca 23415265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 101
Target Start/End: Original strand, 15892149 - 15892231
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattta 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15892149 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 148
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981416
Alignment:
Q  53 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 53 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806992
Alignment:
Q  53 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875663
Alignment:
Q  105 aacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 15875663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Original strand, 17883238 - 17883305
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 86  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17883238 aattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 31630524 - 31630575
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630524 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 31630575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19005330 - 19005280
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19005330 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 19005280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984241
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||     
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattacta 19984229  T
Q  130 cacgtaggtcat 141  Q
    ||| | ||||||    
T  19984230 cacatgggtcat 19984241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16240405 - 16240283
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||| ||     
T  16240405 aattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatga 16240306  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  16240305 tcaaattactacacatgggtcat 16240283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 16556945 - 16557067
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  16556945 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16557044  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  16557045 tcaaattactacacatgggtcat 16557067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 16633501 - 16633623
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  16633501 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16633600  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  16633601 tcaaattactacacatgggtcat 16633623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 16650175 - 16650297
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||| ||     
T  16650175 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatga 16650274  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  16650275 tcaaattactacacatgggtcat 16650297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 141
Target Start/End: Original strand, 22593590 - 22593704
Alignment:
Q  27 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatta 126  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  22593590 ttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaatta 22593689  T
Q  127 ctgcacgtaggtcat 141  Q
    || ||| | ||||||    
T  22593690 ctacacatgggtcat 22593704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15875590 - 15875540
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15875590 tatgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15875540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18914111 - 18914061
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18914111 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttatgaatacgatattgt 18914061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25904584 - 25904461
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||| ||    
T  25904584 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatg 25904485  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
     |||||||||| ||| | ||||||    
T  25904484 atcaaattactacacatgggtcat 25904461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 35016043 - 35016126
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  35016043 atgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 35016126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 27654597 - 27654719
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  27654597 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 27654696  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  27654697 ttaaattactacacatgggtcat 27654719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 74  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 22226608 - 22226692
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  22226608 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 22226692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776218
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| | || | ||||||||     
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattacta 21776206  T
Q  130 cacgtaggtcat 141  Q
    ||| | ||||||    
T  21776207 cacatgggtcat 21776218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 33864802 - 33864763
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33864802 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555514
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||| | ||||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcat 1555514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10488040 - 10487958
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  10488040 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 10487958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 16377288 - 16377370
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  16377288 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 16377370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 16384612 - 16384694
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  16384612 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 16384694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 16826408 - 16826490
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||| | ||||||    
T  16826408 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcat 16826490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 33315116 - 33315198
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| || |||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  33315116 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 33315198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Original strand, 16133087 - 16133128
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16133087 tgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgattt 16133128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 25737064 - 25737028
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtat 55  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25737064 aattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46822683 - 46822495
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46822683 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 46822584  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 46822495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 12119394 - 12119584
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  12119394 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12119493  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119494 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 12119584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13436721 - 13436531
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13436721 aattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13436622  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13436621 tccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttc 13436531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24514098 - 24513910
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  24514098 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 24513999  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24513998 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 53301244 - 53301432
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  53301244 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 53301343  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301344 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 53301432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 7781087 - 7781275
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7781087 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 7781186  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781187 tcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 7781275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17463599 - 17463412
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17463599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 17463500  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17463499 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 17463412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27165674 - 27165486
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27165674 aattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 27165575  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165574 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 27165486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34159747 - 34159560
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  34159747 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 34159648  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34159647 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 34159560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 45606647 - 45606835
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45606647 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 45606746  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606747 tcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 45606835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 54521244 - 54521056
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54521244 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 54521145  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54521144 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 54521056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8499942 - 8499754
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8499942 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 8499843  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    | ||||||| | || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499842 tgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 8499754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10557330 - 10557142
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10557330 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 10557231  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10557230 tcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgt 10557142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13544445 - 13544259
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13544445 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13544346  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13544345 tcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 13544259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15412853 - 15412665
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15412853 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatgg 15412754  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412753 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 15412665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15977954 - 15977767
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  15977954 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 15977855  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15977854 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15977767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 55476912 - 55476725
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  55476912 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 55476813  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55476812 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 55476725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12567981 - 12567794
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  12567981 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 12567882  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12567881 tcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 12567794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 20629932 - 20630078
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20629932 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20630031  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgat 165  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20630032 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgat 20630078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 17444504 - 17444693
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  17444504 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttattgaacttgagttatag 17444603  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  17444604 tcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 17444693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 6468875 - 6469062
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  6468875 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 6468974  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6468975 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 6469062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 38961578 - 38961768
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtc-gttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  38961578 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttata 38961677  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  38961678 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 38961768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 16282498 - 16282687
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16282498 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattg 16282597  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  16282598 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 16282687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 16454021 - 16454209
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa-ggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |     
T  16454021 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatggatttatagaactatagttata 16454120  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16454121 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 16454209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 41124361 - 41124172
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  41124361 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 41124262  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  41124261 tcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 41124172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 13153996 - 13154183
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13153996 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13154095  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13154096 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 13154183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 13151531 - 13151718
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13151531 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13151630  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13151631 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttgtgaatacgatattgt 13151718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 28848362 - 28848522
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  28848362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 28848461  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28848462 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 28848522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25237265 - 25237076
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25237265 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 25237166  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  25237165 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 25237076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 10247464 - 10247651
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |      
T  10247464 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 10247563  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10247564 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 10247651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 29544582 - 29544770
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29544582 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 29544681  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||    
T  29544682 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttgttaaaatgatattgt 29544770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25229678 - 25229489
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  25229678 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 25229579  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  25229578 tcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 25229489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10379749 - 10379613
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  10379749 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 10379650  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10379649 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305379
Alignment:
Q  70 taatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaat 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  170 tcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 12305379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 20629739 - 20629868
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||| |||    
T  20629739 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaaagcgatttatagaacttgagttatgg 20629838  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629839 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 20629868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 38961385 - 38961514
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38961385 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 38961484  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38961485 tcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 41124554 - 41124425
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  41124554 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatga 41124455  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41124454 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10557523 - 10557394
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  10557523 aattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 10557424  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10557423 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 53301051 - 53301180
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  53301051 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 53301150  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  53301151 tcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8500135 - 8500009
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8500135 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8500036  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtg 145  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8500035 tcaagttactgcacgtaggtcacagtg 8500009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 137
Target Start/End: Original strand, 13937520 - 13937638
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  13937520 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgtgttatgg 13937619  T
Q  119 tcaaattactgcacgtagg 137  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13937620 tcaaattactgcacgtagg 13937638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567561
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14567531  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14567532 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 27165867 - 27165738
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  27165867 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatag 27165768  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27165767 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 55319044 - 55319173
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |||    
T  55319044 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatgg 55319143  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  55319144 tcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15465576 - 15465448
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15465576 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15465477  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15465476 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  27 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatta 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  127 ctgcacgtaggtcatagtgaata 149  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Original strand, 55318854 - 55318980
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  55318854 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 55318953  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||    
T  55318954 aattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 46822876 - 46822755
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  46822876 aattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatcg 46822777  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  46822776 tcaaattactgcacgtaggtca 46822755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 26055005 - 26055133
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  26055005 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 26055104  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26055105 taaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 17444311 - 17444440
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||  ||||||| |||||||| | |||    
T  17444311 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaaaacaatttatacaacttgagctatgg 17444410  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444411 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 17444440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5223805 - 5223677
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  5223805 aattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatga 5223706  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5223705 tcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 16282305 - 16282426
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| || |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16282305 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 16282404  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16282405 tcaaattactgcacgtaggtca 16282426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17393330 - 17393201
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| | |    
T  17393330 aattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgatttttagaacattagttatag 17393231  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17393230 tcaaattactacacataggtcatagtgaat 17393201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 140
Target Start/End: Original strand, 16358238 - 16358336
Alignment:
Q  42 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  16358238 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcataggtca 16358336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 149
Target Start/End: Original strand, 3264324 - 3264431
Alignment:
Q  42 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  3264324 aaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcac 3264423  T
Q  142 agtgaata 149  Q
    ||||||||    
T  3264424 agtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 9707484 - 9707535
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707484 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 9707535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007996
Alignment:
Q  84 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 15007996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15007922 - 15007868
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 72  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007922 aaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25058367 - 25058285
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  25058367 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacataggtcat 25058285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8899378 - 8899328
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8899378 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 8899328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 16282689 - 16282739
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16282689 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 16282739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 17444694 - 17444744
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17444694 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 17444744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 38961769 - 38961819
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38961769 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 38961819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41124171 - 41124121
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41124171 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 41124121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 16934851 - 16934933
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  16934851 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 16934933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 49231837 - 49231755
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  49231837 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 49231755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 36528384 - 36528340
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 63  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36528384 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25237075 - 25237025
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25237075 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 25237025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 14528625 - 14528747
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||     
T  14528625 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatga 14528724  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  14528725 ttaaattactacacatgggtcat 14528747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30152518 - 30152437
Alignment:
Q  60 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  30152518 gttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 30152437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 11913928 - 11913978
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  11913928 tatgattgatgaattagtatatgtatgtacatg-ttgcgaatacgatattgt 11913978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17463702 - 17463663
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17463702 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 126
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatta 126  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 55477015 - 55476976
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55477015 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 1468654 - 1468736
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  1468654 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 1468736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 8276474 - 8276596
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  8276474 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatga 8276573  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  8276574 ttaaattactacacatgggtcat 8276596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 16358408 - 16358458
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttc 69  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358408 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 17956869 - 17956951
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  17956869 tgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 17956951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21026182 - 21026092
Alignment:
Q  42 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcac 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||| || ||| |  ||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  21026182 aaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatactgcac 21026092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 77)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 27472157 - 27472347
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27472157 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 27472256  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472257 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 27472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24049032 - 24048845
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  24049032 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 24048933  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048932 tcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 24048845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 38549745 - 38549935
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38549745 aattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 38549844  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549845 tcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 38549935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 16413056 - 16413246
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16413056 aattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16413155  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413156 tcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 16413246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 24485784 - 24485974
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  24485784 aattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagttatag 24485883  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485884 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 24485974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 25657893 - 25658083
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25657893 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 25657992  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25657993 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttc 25658083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32122150 - 32121962
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32122150 aattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 32122051  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32122050 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaatacgatattgt 32121962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16198316 - 16198126
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||    
T  16198316 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaatatttatagaacttgagttatgg 16198217  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198216 tccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 16198126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 18677805 - 18677991
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  18677805 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 18677904  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18677905 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttgtgaatacgatatt 18677991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1484823 - 1484636
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1484823 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1484724  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1484723 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 1484636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 14409185 - 14409372
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14409185 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14409284  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14409285 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 14409372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15070982 - 15070794
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||    
T  15070982 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaaaatgatttatacaacttgagttatgg 15070883  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070882 tcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 15070794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4483702 - 4483514
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4483702 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 4483603  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4483602 tcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgt 4483514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 5853033 - 5853220
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  5853033 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 5853132  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5853133 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 5853220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14824196 - 14824011
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  14824196 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14824097  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  14824096 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatatt 14824011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290571
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 45290571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 15202919 - 15203091
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  15202919 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 15203018  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgttt 191  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  15203019 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgttt 15203091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 16401665 - 16401855
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  16401665 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatag 16401764  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16401765 tcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatactatattgttc 16401855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 1326672 - 1326861
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  1326672 aattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 1326771  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1326772 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttgtaaatacgatattgtt 1326861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22002174 - 22001987
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  22002174 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatag 22002075  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22002074 tcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 22001987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 20045936 - 20046121
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  20045936 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20046035  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20046036 tcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 20046121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20403701 - 20403512
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |    
T  20403701 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaaaaggatttatagaacttgagttattg 20403602  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  20403601 tcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 20403512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 4542114 - 4542301
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |    
T  4542114 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaaaatgatttatagaactagagttatag 4542213  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4542214 tcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 4542301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 19936648 - 19936808
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  19936648 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaggtatag 19936747  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  19936748 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaattagtatatgt 19936808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19896743 - 19896554
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  19896743 aattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 19896644  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  19896643 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 19896554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19896937 - 19896807
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19896937 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatg 19896838  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19896837 gtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 27471963 - 27472093
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27471963 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 27472062  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27472063 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20403894 - 20403765
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20403894 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20403795  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20403794 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 15202726 - 15202856
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15202726 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 15202825  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaata 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15202826 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 14397481 - 14397609
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  14397481 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttgtagaacttgagttatgg 14397580  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14397581 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 15202533 - 15202654
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15202533 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15202632  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15202633 tcaaattactgcacgtaggtca 15202654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32122343 - 32122214
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32122343 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 32122244  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32122243 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 137
Target Start/End: Original strand, 38549360 - 38549478
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38549360 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 38549459  T
Q  119 tcaaattactgcacgtagg 137  Q
    |||||||||||||||||||    
T  38549460 tcaaattactgcacgtagg 38549478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Original strand, 45290287 - 45290389
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45290287 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 45290386  T
Q  118 gtc 120  Q
    |||    
T  45290387 gtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 148
Target Start/End: Original strand, 16401287 - 16401408
Alignment:
Q  27 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatta 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16401287 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtcaaatta 16401386  T
Q  127 ctgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    | |||||||||||| |||||||    
T  16401387 cagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24049225 - 24049104
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  24049225 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 24049126  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24049125 tcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15071175 - 15071046
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15071175 aattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 15071076  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15071075 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 38549552 - 38549681
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38549552 aattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 38549651  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38549652 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Original strand, 16401472 - 16401588
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16401472 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16401571  T
Q  119 tcaaattactgcacgta 135  Q
    ||||||||| |||||||    
T  16401572 tcaaattacagcacgta 16401588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 19897130 - 19897008
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19897130 aaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 19897031  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19897030 gtcaaattactgcacgtaggtca 19897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Original strand, 16412866 - 16412992
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16412866 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 16412965  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||    
T  16412966 aattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 19936455 - 19936576
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| || | | |||| ||||||||||||||||||| ||     
T  19936455 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaaaacgatttatagaacttgagttatgc 19936554  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19936555 tcaaattactgcacgtaggtca 19936576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11361131 - 11361036
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  11361131 aattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagtt 11361036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 13425336 - 13425389
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425336 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 13425389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 20982498 - 20982551
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982498 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 20982551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 20982604 - 20982655
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982604 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 20982655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 32810318 - 32810263
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32810318 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 38549988 - 38550039
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549988 tatgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 38550039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 15319989 - 15320111
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  15319989 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15320088  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  15320089 tcaaattactacacatgggtcat 15320111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 15500358 - 15500480
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  15500358 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15500457  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  15500458 tcaaattactacacatgggtcat 15500480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 1326915 - 1326965
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1326915 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 1326965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20403511 - 20403461
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20403511 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 20403461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717833
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||     
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattacta 24717821  T
Q  130 cacgtaggtcat 141  Q
    ||| | ||||||    
T  24717822 cacatgggtcat 24717833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32810215 - 32810165
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32810215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 32810165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 45290572 - 45290622
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45290572 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 45290622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425283
Alignment:
Q  167 aattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 13425283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663211
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 13663211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 22007126 - 22007208
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  22007126 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 22007208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 16401908 - 16401958
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16401908 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 16401958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19896553 - 19896503
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19896553 tatgattgatgaattagtatatgtatatatatg-ttgtgaatacgatattgt 19896503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Original strand, 17150655 - 17150725
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||    
T  17150655 atgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 17150725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Original strand, 19936882 - 19936931
Alignment:
Q  157 atgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19936882 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 19936931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 205
Target Start/End: Original strand, 15203109 - 15203157
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15203109 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaataagatatt 15203157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 148
Target Start/End: Original strand, 20045783 - 20045872
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20045783 tgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 5852930 - 5852969
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5852930 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 14409082 - 14409121
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14409082 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 22089412 - 22089495
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||| |  |||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  22089412 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 22089495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 223305 - 223427
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  223305 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 223404  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  223405 ttaaattactacacatgggtcat 223427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 272204 - 272286
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  272204 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 272286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 643645 - 643563
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  643645 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 643563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 688076 - 688198
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  688076 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 688175  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  688176 ttaaattactacacatgggtcat 688198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 736928 - 737050
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  736928 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 737027  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  737028 ttaaattactacacatgggtcat 737050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 829451 - 829369
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  829451 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 829369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 860823 - 860945
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  860823 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 860922  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  860923 ttaaattactacacatgggtcat 860945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39114485 - 39114415
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  39114485 atgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 52872813 - 52873003
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52872813 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 52872912  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872913 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 52873003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 362603 - 362412
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  362603 aaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaaaacgatttatagaacttgatttatg 362504  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362503 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 362412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3515430 - 3515239
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  3515430 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagctatg 3515331  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3515330 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttgtgaatacgatattgttc 3515239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 14970447 - 14970637
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14970447 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 14970546  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970547 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 14970637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15534603 - 15534415
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15534603 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 15534504  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15534503 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 15534415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 19617809 - 19617997
Alignment:
Q  21 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtc 120  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19617809 ttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaaaaggatttatagaagttgagttatggtc 19617908  T
Q  121 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19617909 aaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 19617997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 15495914 - 15496104
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  15495914 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcgaaaggttttatagaacttgagttatgg 15496013  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15496014 tcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttctgaatacgatattgttc 15496104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 15118093 - 15118280
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15118093 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 15118192  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15118193 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15118280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29267775 - 29267587
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29267775 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 29267676  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29267675 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgt 29267587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 49547514 - 49547702
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49547514 aattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 49547613  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49547614 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 49547702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Original strand, 11995 - 12167
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11995 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 12094  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgttt 191  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12095 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 12167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 44615710 - 44615522
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  44615710 aattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 44615611  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615610 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 44615522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 44772824 - 44773011
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  44772824 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatag 44772923  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44772924 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 44773011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 50222080 - 50222267
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  50222080 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 50222179  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50222180 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 50222267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19243122 - 19242934
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19243122 aattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 19243023  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19243022 ttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 19242934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 36038292 - 36038104
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36038292 aattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 36038193  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36038192 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 36038104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Original strand, 14746252 - 14746432
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14746252 aattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaaaaggatttatagaacttgagttatgg 14746351  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14746352 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttgtgaatac 14746432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19858001 - 19857840
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||    
T  19858001 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaataatttatagaacttgatttatg 19857902  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19857901 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 19857840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 52312983 - 52312795
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  52312983 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 52312884  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  52312883 tc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 52312795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 1837260 - 1837420
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |    
T  1837260 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaaaaggatttatagaactagagttatag 1837359  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1837360 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 1837420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14048999 - 14048811
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  14048999 aattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttacagaacttgtgttatgg 14048900  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048899 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 14048811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Original strand, 7640927 - 7641112
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  7640927 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 7641026  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    | ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7641027 ttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 7641112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 15495721 - 15495850
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  15495721 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 15495820  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15495821 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 362795 - 362668
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  362795 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 362696  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtga 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  362695 tcaaattactgcacgtaggtcatagtga 362668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19858193 - 19858064
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19858193 aattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 19858094  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19858093 tcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 362988 - 362859
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  362988 aattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaatttgagttatgg 362889  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  362888 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 14746059 - 14746188
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14746059 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 14746158  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14746159 tcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 14746188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 14970254 - 14970383
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  14970254 aattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 14970353  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14970354 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 18214751 - 18214880
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18214751 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 18214850  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  18214851 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 52872619 - 52872749
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  52872619 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 52872718  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52872719 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3515622 - 3515493
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  3515622 aattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 3515523  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3515522 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 52313369 - 52313240
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  52313369 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 52313270  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52313269 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 52313176 - 52313047
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |||    
T  52313176 aattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgatttatgg 52313077  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52313076 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215099
Alignment:
Q  102 tagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacga 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  202 tattgttc 209  Q
    ||||||||    
T  18215092 tattgttc 18215099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 19617614 - 19617743
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  19617614 aattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaaaatgatttattgaacttgagttatgg 19617713  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19617714 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14185727 - 14185621
Alignment:
Q  42 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||     
T  14185727 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtaggtcac 14185628  T
Q  142 agtgaat 148  Q
    |||||||    
T  14185627 agtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30147338 - 30147189
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||   |||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30147338 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaaaaagatttatagaacttgagttatg 30147239  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatga 167  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30147238 gtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 128 - 209
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355149
Alignment:
Q  128 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttc 15355149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 207
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239347
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18239347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 140
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725393
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaatc-cgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  130 cacgtaggtca 140  Q
    |||||||||||    
T  22725383 cacgtaggtca 22725393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19857767 - 19857716
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 19857716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14951367 - 14951257
Alignment:
Q  31 gtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgc 130  Q
    |||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |    
T  14951367 gtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactac 14951268  T
Q  131 acgtaggtcat 141  Q
    || | ||||||    
T  14951267 acatgggtcat 14951257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 140
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745987
Alignment:
Q  78 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 14745987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14995713 - 14995631
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  14995713 tgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 14995631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 126
Target Start/End: Original strand, 55377225 - 55377293
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatta 126  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  55377225 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 12185 - 12235
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12185 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 12235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 15355202 - 15355252
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15355202 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 18215152 - 18215202
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18215152 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18215202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52312794 - 52312744
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52312794 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 52312744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120144
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 141
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281808
Alignment:
Q  27 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatta 126  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  127 ctgcacgtaggtcat 141  Q
    || ||| | ||||||    
T  43281794 ctacacatgggtcat 43281808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 18293695 - 18293778
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  18293695 atgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 18293778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 19618050 - 19618100
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19618050 tatgattgatgaattggtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 19618100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18247848 - 18247726
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  18247848 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 18247749  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  18247748 ttaaattactacacatgggtcat 18247726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 47357292 - 47357170
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  47357292 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatga 47357193  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  47357192 ttaaattactacacatgggtcat 47357170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Original strand, 12778423 - 12778460
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatg 56  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12778423 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683478
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||     
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattacta 5683466  T
Q  130 cacgtaggtcat 141  Q
    ||| | ||||||    
T  5683467 cacatgggtcat 5683478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9198658 - 9198543
Alignment:
Q  26 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatt 125  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||||||    
T  9198658 cttagttgtaaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaatt 9198559  T
Q  126 actgcacgtaggtcat 141  Q
    | | |||||| |||||    
T  9198558 aatacacgtatgtcat 9198543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 14746495 - 14746545
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  14746495 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatatgatattgt 14746545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Original strand, 15287859 - 15287966
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  15287859 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15287958  T
Q  119 tcaaatta 126  Q
    ||||||||    
T  15287959 tcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Original strand, 15294969 - 15295076
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  15294969 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15295068  T
Q  119 tcaaatta 126  Q
    ||||||||    
T  15295069 tcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 15496949 - 15496999
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15496949 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 15496999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16731785 - 16731690
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 114  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  16731785 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagtt 16731690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355182
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | || | ||||||||     
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattacta 22355170  T
Q  130 cacgtaggtcat 141  Q
    ||| | ||||||    
T  22355171 cacatgggtcat 22355182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 52873056 - 52873106
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52873056 tatgattgatgaattaatatacgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 52873106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10643855 - 10643733
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| |||| |||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  10643855 aattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatga 10643756  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  10643755 ttaaattactacacatgggtcat 10643733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11940106 - 11940064
Alignment:
Q  32 tgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 74  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  11940106 tgtaaacataaaagttgtaggtatggatgtaagctttccaatg 11940064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18168362 - 18168280
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  18168362 tgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattactacacatgggtcat 18168280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 112
Target Start/End: Original strand, 17146320 - 17146373
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgag 112  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||    
T  17146320 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgag 17146373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 148
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  111 agttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11557936 - 11557892
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 74  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11557936 ggtgtaaacattcaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 11557892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 23706957 - 23707147
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23706957 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23707056  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23707057 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 23707147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 24642489 - 24642679
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24642489 aattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatgg 24642588  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24642589 tcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 24642679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24671447 - 24671257
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24671447 aattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttattg 24671348  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24671347 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 24671257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24918562 - 24918372
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24918562 aattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24918463  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24918462 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 24918372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39682735 - 39682547
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39682735 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 39682636  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682635 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 39682547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24681866 - 24681676
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24681866 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttccaaaggatttatagaacttgagttatgg 24681767  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24681766 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 24681676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 24529286 - 24529475
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  24529286 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagcacttgagatatg 24529385  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    || ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529386 gtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 24529475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 571819 - 571631
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  571819 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 571720  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571719 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 571631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20261641 - 20261453
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20261641 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20261542  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20261541 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 20261453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18809364 - 18809177
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18809364 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 18809265  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18809264 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18809177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23131284 - 23131096
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23131284 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23131185  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23131184 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgt 23131096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23133751 - 23133563
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23133751 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23133652  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23133651 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgt 23133563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 23711754 - 23711941
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23711754 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 23711853  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23711854 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 23711941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28577520 - 28577333
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  28577520 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 28577421  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28577420 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacaatattgt 28577333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 34402262 - 34402450
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34402262 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 34402361  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34402362 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgt 34402450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 45027645 - 45027832
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  45027645 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgaattatag 45027744  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45027745 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 45027832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22105887 - 22105698
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22105887 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 22105788  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  22105787 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 22105698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 23709273 - 23709460
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23709273 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 23709372  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23709373 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 23709460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38967901 - 38967711
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  38967901 aattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagtatttatagaacttgagttatag 38967802  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38967801 tgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 38967711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 41523813 - 41524002
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  41523813 aattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 41523912  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  41523913 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 41524002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 10684503 - 10684691
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10684503 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 10684602  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10684603 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 10684691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 32214670 - 32214831
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32214670 aaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 32214769  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32214770 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 32214831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 24368248 - 24368076
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  24368248 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 24368149  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgttt 191  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24368148 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 24368076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 24897936 - 24898123
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24897936 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24898035  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24898036 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 24898123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 24905373 - 24905560
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24905373 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24905472  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24905473 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 24905560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 6726466 - 6726280
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  6726466 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttaagttatagtca 6726367  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  6726366 aattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 6726280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26505800 - 26505615
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |    
T  26505800 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatag 26505701  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26505700 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 26505615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26508278 - 26508093
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |    
T  26508278 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaagaatttatagaactagagttatag 26508179  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26508178 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 26508093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25616580 - 25616415
Alignment:
Q  42 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||     
T  25616580 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtcac 25616481  T
Q  142 agtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616480 aatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 25616415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 24900419 - 24900606
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24900419 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24900518  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  24900519 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgt 24900606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 24902896 - 24903083
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24902896 aattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24902995  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  24902996 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttgtgaatacgatattgt 24903083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 24907848 - 24908035
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  24907848 aattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 24907947  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24907948 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 24908035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 21154748 - 21154937
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  21154748 aatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 21154847  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  21154848 tcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 21154937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23136002 - 23135841
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  23136002 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttata 23135903  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23135902 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 23135841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 207
Target Start/End: Original strand, 32039240 - 32039426
Alignment:
Q  20 attggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggt 119  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  32039240 attggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatggt 32039339  T
Q  120 caaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  32039340 caaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatctgatattgt 32039426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6726662 - 6726533
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6726662 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6726563  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726562 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 6726533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22106081 - 22105951
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  22106081 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgagttatg 22105982  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22105981 gtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 24529094 - 24529223
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  24529094 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24529193  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24529194 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 41523427 - 41523548
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41523427 aattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 41523526  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41523527 tcaaattactgcacgtaggtca 41523548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24918755 - 24918626
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  24918755 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 24918656  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24918655 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 41523620 - 41523749
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41523620 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 41523719  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41523720 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 23931882 - 23931775
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23931882 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23931783  T
Q  119 tcaaatta 126  Q
    ||||||||    
T  23931782 tcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24368439 - 24368312
Alignment:
Q  21 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  24368439 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttaagttatggtc 24368340  T
Q  121 aaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24368339 aaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 45027452 - 45027579
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  45027452 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 45027551  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtga 146  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  45027552 tcaaattactacacgtaggtcacagtga 45027579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 21154362 - 21154483
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  21154362 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaatgatttatagaacttgacttttag 21154461  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  21154462 tcaaattactgcacgtaggtca 21154483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24682059 - 24681930
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  24682059 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaaaaagatttatagagcttgagttatgg 24681960  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24681959 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 21154555 - 21154684
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  21154555 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaatttgagttacgg 21154654  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21154655 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24671640 - 24671519
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  24671640 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaaaaatatttatagaacttgagttatgg 24671541  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24671540 tcaaattactgcacgtaggtca 24671519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23932075 - 23931949
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  23932075 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 23931976  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtg 145  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||    
T  23931975 tcaatttacttcacttaggtcacagtg 23931949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 23706573 - 23706702
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |  ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  23706573 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 23706672  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23706673 tcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 23709080 - 23709209
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23709080 aattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 23709179  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23709180 tctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 32214476 - 32214604
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||    
T  32214476 aaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaaaacaatttatagaacttaagttatg 32214575  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 146  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32214576 gtcaaattacagcacgtaggtcacagtga 32214604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 23706765 - 23706886
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |||    
T  23706765 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaaaacgaattatagaacttgagttatgg 23706864  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  23706865 tcaaattactgcacgtaagtca 23706886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  83 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900802
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtcat 16900802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994193
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtcat 16994193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 67410 - 67326
Alignment:
Q  57 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  67410 gatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 67326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6726279 - 6726229
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6726279 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 6726229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 24686598 - 24686720
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||| ||     
T  24686598 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatga 24686697  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  24686698 tcaaattactacacatgggtcat 24686720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823737
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 34823737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24368058 - 24368010
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24368058 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 24368010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 148
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  96 gatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 207
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21154988
Alignment:
Q  160 attgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 21154988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22105697 - 22105647
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22105697 tatgattgatgaattagtatatgtatgtaaatg-ttgtgaatacgatattgt 22105647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 23707200 - 23707250
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23707200 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 23707250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 24642732 - 24642782
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24642732 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 24642782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24681623 - 24681573
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24681623 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 24681573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27261402 - 27261319
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| || |||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  27261402 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 27261319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38967658 - 38967608
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38967658 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 38967608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12727780 - 12727698
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  12727780 tgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 12727698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 19887275 - 19887397
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  19887275 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 19887374  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  19887375 ttaaattactacacatgggtcat 19887397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6483194 - 6483113
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  6483194 aattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671154
Alignment:
Q  159 gattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 24671154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 90
Target Start/End: Original strand, 34135071 - 34135119
Alignment:
Q  42 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 90  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34135071 aaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttc 34135119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 23711651 - 23711690
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23711651 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 24918319 - 24918269
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  24918319 tatgattgatgaattagtatatgtatgcatatg-ttgcgaatacgatattgt 24918269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26505903 - 26505864
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26505903 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26508381 - 26508342
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26508381 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 27920402 - 27920441
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27920402 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 32039136 - 32039175
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32039136 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 199
Target Start/End: Original strand, 41524003 - 41524045
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41524003 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 11232253 - 11232335
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  11232253 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 11232335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 22514100 - 22514182
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  22514100 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 22514182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 28776702 - 28776784
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  28776702 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 28776784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6486661 - 6486580
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 100  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  6486661 aattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 6486580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  60 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24788086 - 24788042
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 74  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788086 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 17516904 - 17517092
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17516904 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatcg 17517003  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517004 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 17517092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 20901661 - 20901851
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20901661 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 20901760  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901761 tcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 20901851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 2154372 - 2154556
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2154372 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 2154471  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgata 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154472 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgata 2154556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38619858 - 38619670
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38619858 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 38619759  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619758 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 38619670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20909433 - 20909246
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  20909433 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20909334  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20909333 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 20909246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 264509 - 264696
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  264509 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 264608  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  264609 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 264696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23064935 - 23064747
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23064935 aattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23064836  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064835 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 23064747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 37804643 - 37804831
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  37804643 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatgg 37804742  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37804743 tcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 37804831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 20917587 - 20917776
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  20917587 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20917686  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  20917687 tcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 20917776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 10732681 - 10732868
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  10732681 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 10732780  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10732781 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgattttgt 10732868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39245557 - 39245370
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  39245557 aattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 39245458  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39245457 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 39245370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39363806 - 39363618
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39363806 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 39363707  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39363706 tcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgt 39363618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32027867 - 32027678
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  32027867 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 32027768  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  32027767 tcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 32027678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 42245106 - 42245293
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | |    
T  42245106 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaaatggatttatagaactatagttatag 42245205  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42245206 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 42245293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 29330404 - 29330233
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  29330404 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 29330305  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgttt 191  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  29330304 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 29330233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29346401 - 29346214
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |      
T  29346401 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29346302  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29346301 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29346214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9776780 - 9776592
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9776780 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 9776681  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9776680 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 9776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29348874 - 29348687
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |      
T  29348874 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29348775  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29348774 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29348687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29351347 - 29351160
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |      
T  29351347 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgatttatac 29351248  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29351247 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29351160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32028641 - 32028511
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  32028641 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaaaacgatttatagagcttgagttatg 32028542  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028541 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 32028254 - 32028124
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg-tttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  32028254 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatg 32028155  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028154 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 32028124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 17516517 - 17516647
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17516517 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 17516616  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17516617 gtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 296015 - 296136
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  296015 aattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 296114  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  296115 tcaaattactgcacgtaggtca 296136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29330597 - 29330468
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29330597 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 29330498  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  29330497 tcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 17516711 - 17516840
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  17516711 aattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatcg 17516810  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    || ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17516811 tcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 20901468 - 20901597
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  20901468 aattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaactttagttatgg 20901567  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20901568 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 148
Target Start/End: Original strand, 295826 - 295951
Alignment:
Q  23 ggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaa 122  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  295826 ggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaa 295925  T
Q  123 attactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  295926 attactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 2154179 - 2154300
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | |    
T  2154179 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttaagttatag 2154278  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  2154279 tcaaattactgcacgtatgtca 2154300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 20917394 - 20917515
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||    
T  20917394 aattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaatcatttataaaacttgagttatgg 20917493  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  20917494 tcaaattactacacgtaggtca 20917515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 32028060 - 32027939
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  32028060 aattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaaaacgatttatagagcttgagttatgg 32027961  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  32027960 tcaaattactgcacgtaagtca 32027939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 32028447 - 32028326
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||||| |||    
T  32028447 aattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaaaacaatttatagagcttgagttatgg 32028348  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32028347 tcaaattactgcacgtaggtca 32028326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 20901904 - 20901955
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901904 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 20901955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 27183208 - 27183291
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  27183208 atgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 27183291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 22883904 - 22884026
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  22883904 aattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatga 22884003  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  22884004 tcaaattactacacatgggtcat 22884026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29330215 - 29330165
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29330215 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29330165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32027677 - 32027627
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32027677 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 32027627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220466
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 1220466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778914
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 10778914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 43444009 - 43444131
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  43444009 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 43444108  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  43444109 ttaaattactacacatgggtcat 43444131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23511223 - 23511127
Alignment:
Q  32 tgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    |||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  23511223 tgtaaacataaaagttttaggtaattaagttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 23511127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 20917830 - 20917880
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20917830 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatcttgt 20917880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11890
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  12012 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 11913  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  11912 ttaaattactacacatgggtcat 11890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25426286 - 25426164
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  25426286 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 25426187  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  25426186 ttaaattactacacatgggtcat 25426164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 264406 - 264445
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  264406 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7424986 - 7424879
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  7424986 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 7424887  T
Q  119 tcaaatta 126  Q
    ||||||||    
T  7424886 tcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20909536 - 20909497
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20909536 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212816
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 11212816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11342287 - 11342177
Alignment:
Q  31 gtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgc 130  Q
    |||||||||  |||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | || | |||||||| |    
T  11342287 gtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactac 11342188  T
Q  131 acgtaggtcat 141  Q
    || | ||||||    
T  11342187 acatgggtcat 11342177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074331
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||| | ||||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcat 21074331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 22367095 - 22367217
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||| | ||     
T  22367095 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatga 22367194  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    | |||||||| ||| | ||||||    
T  22367195 ttaaattactacacatgggtcat 22367217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 68
Target Start/End: Original strand, 23280293 - 23280331
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagcttt 68  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23280293 ggtgtaaacacaaaagttgtagatattgatgttagcttt 23280331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35581409 - 35581327
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  35581409 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 35581327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 36990679 - 36990761
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  36990679 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 36990761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Original strand, 1168832 - 1168901
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| | | ||||||||| || ||||||||||    
T  1168832 tgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaattact 1168901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Original strand, 21933283 - 21933352
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  21933283 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Original strand, 21939453 - 21939522
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  21939453 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22755270 - 22755214
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 86  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  22755270 ggtgtaaacatgaaagttgtagatatggatgttagctttcatatgtatttggtttga 22755214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 15081582 - 15081772
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15081582 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 15081681  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15081682 tcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 15081772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16214106 - 16213916
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16214106 aattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16214007  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214006 tcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 16213916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8940706 - 8940511
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacaca----aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940706 aaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 8940607  T
Q  114 tttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8940606 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 8940511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 14269697 - 14269887
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  14269697 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaaaaggatttatagaaattgagttatgg 14269796  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269797 tcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 14269887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 456743 - 456555
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  456743 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 456644  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456643 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 456555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13869770 - 13869582
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13869770 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13869671  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869670 ttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 13869582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27217282 - 27217094
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27217282 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 27217183  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217182 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 27217094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41523339 - 41523151
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41523339 aattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 41523240  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523239 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 41523151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41525801 - 41525613
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  41525801 aattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 41525702  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525701 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 41525613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 15376454 - 15376641
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15376454 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 15376553  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15376554 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 15376641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 20384864 - 20385051
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  20384864 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 20384963  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20384964 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 20385051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 45847394 - 45847585
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  45847394 aaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 45847493  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45847494 gtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgatattgttc 45847585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8469157 - 8468967
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  8469157 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatga 8469058  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8469057 tcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttttgaatacgatattgttc 8468967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11303669 - 11303481
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11303669 aattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 11303570  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11303569 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 11303481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 14948863 - 14949050
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  14948863 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 14948962  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14948963 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 14949050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16232942 - 16232754
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  16232942 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaaaaggatttatagaatttgagttattg 16232843  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232842 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 16232754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16410480 - 16410293
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  16410480 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 16410381  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16410380 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 16410293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393215
Alignment:
Q  33 gtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcac 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  133 gtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 11393215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 21189338 - 21189523
Alignment:
Q  21 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtc 120  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21189338 ttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtc 21189437  T
Q  121 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21189438 aaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttgtgaatacgatattgt 21189523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 23664693 - 23664881
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23664693 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 23664792  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23664793 tcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 23664881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32125912 - 32125725
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  32125912 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 32125813  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32125812 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 32125725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18627987 - 18627802
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  18627987 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18627888  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18627887 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 18627802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29797032 - 29796844
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  29797032 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatgg 29796933  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29796932 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 29796844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29800851 - 29800663
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  29800851 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagctatgg 29800752  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29800751 tcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgt 29800663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 18640693 - 18640508
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  18640693 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgatttatag 18640594  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18640593 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatatt 18640508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18431130 - 18430946
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  18431130 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatagtca 18431031  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18431030 aattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 18430946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 16108429 - 16108617
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16108429 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 16108528  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16108529 tcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacaatattgt 16108617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24702650 - 24702490
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24702650 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24702551  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24702550 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt 24702490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24705097 - 24704937
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24705097 aattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 24704998  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24704997 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtatatgt 24704937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 26355722 - 26355909
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26355722 aattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 26355821  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26355822 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgt 26355909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 26358174 - 26358361
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  26358174 aattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 26358273  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  26358274 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaaatacgatattgt 26358361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 11972970 - 11972781
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  11972970 aatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatctatagaacttgagttatag 11972871  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| || ||| |||||    
T  11972870 tcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgtttatgagtatgatgttgtt 11972781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Original strand, 10501136 - 10501263
Alignment:
Q  21 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10501136 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaaatggatttatagaacttgagttatggtc 10501235  T
Q  121 aaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10501236 aaattactgcacgaaggtcatagtgaat 10501263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841287
Alignment:
Q  49 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  149 aattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 13841287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 38897775 - 38897904
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38897775 aattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 38897874  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38897875 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8940897 - 8940769
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8940897 aattggtcttaggtgtaaaca-aaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 8940799  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8940798 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 14269311 - 14269440
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  14269311 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttattg 14269410  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14269411 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16214299 - 16214170
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  16214299 aattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 16214200  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16214199 tcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 14156626 - 14156755
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  14156626 aattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgacttatga 14156725  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  14156726 tcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 14156818 - 14156944
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14156818 aaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacgtgagttatg 14156913  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14156914 ttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 21189143 - 21189272
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  21189143 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 21189242  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21189243 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaat 21189272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 25926870 - 25926998
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| |||    
T  25926870 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaaagagttatagaacttgagttatgg 25926969  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25926970 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 15081389 - 15081510
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  15081389 aattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 15081488  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  15081489 ttaaattactgcacgtaggtca 15081510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 1856970 - 1857097
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  1856970 aattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatataacttgagttatgg 1857068  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1857069 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8941091 - 8940962
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  8941091 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaaaatgatttatagaacttgagttatgc 8940992  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  8940991 tcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 13918143 - 13918272
Alignment:
Q  19 aattggtctt-aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  13918143 aattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 13918242  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918243 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 13918272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 14269504 - 14269633
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |      
T  14269504 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaaaaaaatttatagaacttgagttatca 14269603  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  14269604 tcaaattattgcacgcaggtcagagtgaat 14269633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 10500968 - 10501063
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 114  Q
    |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10500968 aattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 10501063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 17985125 - 17985254
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||||| | |    
T  17985125 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaaaatgatatttagaacttgagttatag 17985224  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17985225 tcaaattactacacgtaggtcatagtgaat 17985254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  61 ttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaata 149  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898053
Alignment:
Q  151 ttgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 38898053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 45847638 - 45847691
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847638 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 45847691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11287046 - 11286976
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  11287046 atgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11972780 - 11972731
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattg 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972780 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattg 11972731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 114
Target Start/End: Original strand, 16202766 - 16202850
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||    
T  16202766 ggtgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagtt 16202850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 14269940 - 14269990
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14269940 tatgattgatgaattaatatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 14269990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 15081825 - 15081875
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15081825 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 15081875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 38898106 - 38898156
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38898106 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 38898156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Original strand, 13475728 - 13475772
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 74  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13475728 ggtgtaaacacaaaggttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 13475772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8940458 - 8940408
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8940458 tatgattgatgaattagtatatttatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 8940408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 62 - 141
Target Start/End: Original strand, 15951637 - 15951716
Alignment:
Q  62 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  15951637 tagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattactacacatgggtcat 15951716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 148
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  109 tgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7822082 - 7822000
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  7822082 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 7822000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7829393 - 7829311
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  7829393 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 7829311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760861
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||| | ||||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcat 15760861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 27102552 - 27102634
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  27102552 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 27102634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 27109900 - 27109982
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  27109900 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 27109982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27175774 - 27175692
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  27175774 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 27175692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 38784644 - 38784726
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  38784644 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 38784726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001076
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttg 110  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttg 10001076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 11310177 - 11310133
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 63  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  11310177 aattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 51  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Original strand, 23461832 - 23461864
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtag 51  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23461832 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 208
Target Start/End: Original strand, 27161326 - 27161516
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27161326 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatg 27161425  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  27161426 gtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttatgaataaaatattgtt 27161516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 16274996 - 16275187
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa-tgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16274996 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 16275095  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16275096 gtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaattcgatattgttc 16275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29777162 - 29776973
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29777162 aattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 29777063  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  29777062 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 29776973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13989287 - 13989100
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13989287 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 13989188  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13989187 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 13989100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 21474827 - 21475015
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  21474827 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 21474926  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474927 tcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 21475015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31612787 - 31612598
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  31612787 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 31612688  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | || |||||||||    
T  31612687 tcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatcagtatgatattgtt 31612598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 21923032 - 21923219
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  21923032 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 21923131  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21923132 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 21923219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 15859749 - 15859936
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  15859749 aattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaaaagaatttatacaacttgagttatgg 15859848  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  15859849 tcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttgcgaatacgatattgt 15859936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16362340 - 16362152
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  16362340 aattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttaagttatgg 16362241  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16362240 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgttaatacgatattgt 16362152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21841188 - 21841001
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  21841188 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 21841089  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21841088 tcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 21841001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 22122755 - 22122944
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |    
T  22122755 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgggttatag 22122854  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  22122855 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 22122944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29298663 - 29298474
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  29298663 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 29298564  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  29298563 tcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 29298474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Original strand, 22050577 - 22050766
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |  |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22050577 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 22050676  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  22050677 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 22050766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13227285 - 13227129
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13227285 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 13227186  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtat 175  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13227185 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 23593474 - 23593662
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||| | |    
T  23593474 aattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaataatttatagaacttgcgttatag 23593573  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593574 ttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 23593662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 29535473 - 29535317
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29535473 aattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaaaagaatttatagaacttgagttatgg 29535374  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtat 175  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29535373 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 16274803 - 16274932
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  16274803 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatttatagaacttgagttatgg 16274902  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274903 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 16274932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31612980 - 31612851
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31612980 aattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31612881  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31612880 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 29298856 - 29298727
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  29298856 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaaaacgatttataaaacttgagttatgg 29298757  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29298756 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 22122561 - 22122691
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacac-aaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  22122561 aattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaaaacgatttgtagaacttgagttatg 22122660  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  22122661 gtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 15859543 - 15859672
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| ||     
T  15859543 aattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaactatttatagaacttgagttatga 15859642  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15859643 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31613173 - 31613052
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31613173 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31613074  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  31613073 tcaaattactgcacgtaggtca 31613052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 29777355 - 29777234
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29777355 aattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaacgatttatagaacttgagttatgg 29777256  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  29777255 tcaaattactgaacgtaggtca 29777234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 9044745 - 9044866
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  9044745 aattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 9044844  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9044845 tcaaattactgcacgtaggtca 9044866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 27161134 - 27161263
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |||    
T  27161134 aattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgaattatgg 27161233  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27161234 tcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40129506 - 40129387
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  40129506 aattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgatttatagaacttgagttatag 40129407  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggt 138  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  40129406 tcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16401536 - 16401407
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| | || |  |||||||||||| |||||||||| |||    
T  16401536 aattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaaggatttatataacttgagttatgg 16401437  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16401436 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 78 - 148
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  78 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 43543323 - 43543269
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 73  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543323 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 16275240 - 16275291
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16275240 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgt 16275291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 22050767 - 22050817
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22050767 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 22050817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29776972 - 29776922
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29776972 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29776922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21858662 - 21858579
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  21858662 atgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 21858579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 22122945 - 22122995
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22122945 tatgattgatgaattggtatatgtatgtttatg-ttgtgaatacgatattgt 22122995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29298420 - 29298370
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29298420 tatgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 29298370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31612597 - 31612547
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31612597 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatattgt 31612547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 44035830 - 44035941
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||||| || ||||||||||     
T  44035830 ggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattacta 44035929  T
Q  130 cacgtaggtcat 141  Q
    ||| | ||||||    
T  44035930 cacatgggtcat 44035941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17003978 - 17003896
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  17003978 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 17003896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 21650910 - 21650992
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  21650910 tgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattactacacatgggtcat 21650992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22366596 - 22366514
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| | || | |||||||| ||| | ||||||    
T  22366596 tgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattactacacatgggtcat 22366514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161567
Alignment:
Q  157 atgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 27161567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060697
Alignment:
Q  21 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtc 120  Q
    |||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||  | |||||||| | || |     
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgatt 18060676  T
Q  121 aaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||| ||| | ||||||    
T  18060677 aaattactacacatgggtcat 18060697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 29298473 - 29298421
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||    
T  29298473 tatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtt 29298421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 821
Alignment:
Q  24 gtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaa 123  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1006 gtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaattatttatagaacttgagttatggtcaaa 907  T
Q  124 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  906 ttactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttc 821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1075
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  1204 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagatttatagaacttgagttatgg 1105  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1104 tcaaattactacacgcaggtcatagtgaat 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 1323 - 1229
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  1323 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttatagaacttgagtt 1229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 718
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  768 tatgattgattaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgt 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 23271 - 23459
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  23271 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 23370  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23371 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 23459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14369 - 14181
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  14369 aattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 14270  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 22917 - 23047
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  22917 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacatgagttatg 23016  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23017 gtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 148
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  62 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 267 - 454
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  267 tggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 366  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  367 aattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 507 - 560
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  507 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5116 - 4926
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  5116 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 5017  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5016 tcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 4926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5180
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  5309 aattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaaaacgatatatagaacttgagttatgg 5210  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5209 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 629 - 441
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  629 aattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 530  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  529 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttgtgaatacgatattgt 441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 983 - 853
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  983 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatg 884  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  883 gtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  62 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 4043 - 4231
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4043 aattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 4142  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4143 tcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgt 4231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 3850 - 3979
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||| ||     
T  3850 aattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaacgatttatgaaacttgagttatga 3949  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3950 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 3657 - 3778
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||| ||     
T  3657 aattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaaaacgatttatgtaacttgagttatgc 3756  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  3757 tcaaattactgaacgtaggtca 3778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 140
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3585
Alignment:
Q  96 gatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtca 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6368 - 6181
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  6368 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 6269  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6268 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 6181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13814 - 13626
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13814 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 13715  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13714 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 13626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13878
Alignment:
Q  108 ttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21169 - 20981
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21169 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 21070  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21069 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 20981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38243 - 38055
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38243 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatgg 38144  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38143 tcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 38055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10211 - 10023
Alignment:
Q  21 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtc 120  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10211 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 10112  T
Q  121 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10111 aaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 10023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10406 - 10277
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  10406 aattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaaaacgatttatagaacttgagttattg 10307  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10306 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 10599 - 10478
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  10599 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgcgttatgg 10500  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  10499 tcaaattactgcatgtaggtca 10478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9970 - 9936
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtt 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9970 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 94832 - 94645
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  94832 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 94733  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  94732 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 94645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 17180 - 17370
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  17180 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 17279  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17280 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgttc 17370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Original strand, 17004 - 17116
Alignment:
Q  36 aacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgta 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  17004 aacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaaaaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgta 17103  T
Q  136 ggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||    
T  17104 ggtcatagtgaat 17116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||| ||||||||||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  130 cacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154974
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  || |||  |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 154974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 30441 - 30251
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  30441 aattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaaaaggatttgtagtacttgagttatgg 30342  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30341 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 30251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 30634 - 30505
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  30634 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaaaacgatttataaaactttagttatgg 30535  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30534 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30147
Alignment:
Q  158 tgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgt 30147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6873 - 6713
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6873 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 6774  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6773 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 6713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 7066 - 6937
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7066 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 6967  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6966 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3445 - 3257
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3445 aattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 3346  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3345 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 3257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11712 - 11521
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  11712 aaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttata 11613  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11612 gtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 11521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15342 - 15156
Alignment:
Q  21 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtc 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15342 ttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtc 15243  T
Q  121 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15242 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgt 15156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Original strand, 11080 - 11251
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  11080 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagtacttgagttatgg 11179  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtt 190  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11180 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 10887 - 11016
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  10887 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 10986  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10987 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15526 - 15398
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  15526 aattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 15428  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15427 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40821 - 40634
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  40821 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 40722  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40721 tcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 40634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37847
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  37968 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatga 37870  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| ||||||||    
T  37869 tcaaattactacacataggtcat 37847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40885
Alignment:
Q  108 ttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Original strand, 53607 - 53802
Alignment:
Q  14 catcaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||     
T  53607 catcaaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgaga 53706  T
Q  114 tttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  53707 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttc 53802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9663 - 9476
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  9663 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatag 9564  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9563 tcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 9476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Original strand, 6676 - 6864
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6676 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6775  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6776 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgt 6864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Original strand, 6483 - 6612
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6483 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 6582  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6583 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 134632 - 134445
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  134632 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 134533  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  134532 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 134445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 137101 - 136914
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  137101 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 137002  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  137001 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 136914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 139570 - 139383
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  139570 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 139471  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  139470 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 139383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 142039 - 141852
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  142039 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 141940  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  141939 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 141852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 144508 - 144321
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  144508 aattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaactagagttatag 144409  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  144408 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 144321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7996
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||    
T  8161 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgaattatgg 8062  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgta 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8061 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8351 - 8225
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  8351 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 8252  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8251 aattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8547 - 8421
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  8547 aattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaagatttatacaacttgagttatgg 8448  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtg 145  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||    
T  8447 tgaaattactgcacgtaggtcacagtg 8421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 38396 - 38586
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  38396 aattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgt 38495  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38496 tcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 38586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1827 - 1662
Alignment:
Q  42 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  1827 aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 1728  T
Q  142 agtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1727 agtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgt 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 31 - 207
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13555
Alignment:
Q  31 gtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgc 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  131 acgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgt 13555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43159 - 43002
Alignment:
Q  21 ttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtc 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  43159 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagggtttatagaacttgagttatagtc 43060  T
Q  121 aaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatg 178  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43059 aaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 43354 - 43225
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43354 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 43255  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43254 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57713
Alignment:
Q  57 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaat 156  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaat 57766  T
Q  157 atgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57765 atgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 57713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 68384 - 68227
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  68384 aaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 68285  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtat 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  68284 gtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 1869 - 1740
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1869 aattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatag 1770  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 1677 - 1634
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgt 61  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1677 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18552 - 18423
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18552 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 18453  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18452 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 501486 - 501347
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  501486 aattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatga 501388  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatg 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  501387 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatg 501347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 501676 - 501550
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  501676 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtca 501577  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  501576 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 501351 - 501316
Alignment:
Q  174 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501351 atatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 501316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139645
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 86  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttga 139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33593 - 33472
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  33593 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaaaacgatttatagaacttgagttatgg 33494  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  33493 tcaaattactgcacgtaggtca 33472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  22 tggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtca 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  122 aattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 36938 - 37068
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttg 117  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  36938 aaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatg 37037  T
Q  118 gtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37038 gtcaaattactgcacgtagatcatagtgaat 37068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 7430 - 7558
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7430 aattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 7529  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7530 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 148
Target Start/End: Original strand, 7243 - 7367
Alignment:
Q  24 gtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaa 123  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7243 gtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttataaaacttgagttatggtcaaa 7342  T
Q  124 ttactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||    
T  7343 ttattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 146
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7172
Alignment:
Q  53 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtga 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtga 7172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18075 - 17947
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18075 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaaaatgatttatagaacttgagttatgg 17976  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17975 tcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8440 - 8311
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8440 aattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 8341  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaat 148  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8340 taaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 11007
Alignment:
Q  71 aatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatt 170  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  171 cgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgt 11007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 19829 - 19957
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| || ||||| |||||||||| | |    
T  19829 aattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgaattatataacttgagttatcg 19928  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19929 tcaaattactacacgtaggtcatagtgaa 19957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39754 - 39626
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39754 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 39655  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  39654 tcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31625 - 31497
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31625 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 31526  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcatagtgaa 147  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31525 ttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28074
Alignment:
Q  92 aaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgttt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T
Q  192 gtgaatacgatattgtt 208  Q
     ||| || ||| |||||    
T  28090 atgagtatgatgttgtt 28074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28073 - 28023
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28073 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgt 28023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 209
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10712
Alignment:
Q  144 tgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttc 10712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 203
Target Start/End: Original strand, 10765 - 10811
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgata 203  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10765 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgata 10811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 113414 - 113313
Alignment:
Q  43 aagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcata 142  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  113414 aagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaatgagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcata 113315  T
Q  143 gt 144  Q
    ||    
T  113314 gt 113313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Original strand, 6196 - 6305
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  6196 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatga 6295  T
Q  119 tcaaattact 128  Q
    ||||||||||    
T  6296 tcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 141
Target Start/End: Original strand, 12489 - 12603
Alignment:
Q  27 ttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatta 126  Q
    |||||||| |||  |||| ||||||||   |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  12489 ttaggtgttaacctaaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 12588  T
Q  127 ctgcacgtaggtcat 141  Q
    || ||| | ||||||    
T  12589 ctacacatgggtcat 12603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 8675 - 8553
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| ||     
T  8675 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatga 8576  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  8575 tcaaattactacacatgggtcat 8553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30457
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  30579 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 30480  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  30479 tcaaattactacacatgggtcat 30457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Original strand, 75644 - 75689
Alignment:
Q  18 aaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtta 63  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  75644 aaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9965
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10016 tatgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgt 9965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10017
Alignment:
Q  158 tgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 208  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtt 10017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15077
Alignment:
Q  132 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattcgtatatgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15030 cgtaggtcatagtgaataattgaatatgattaatgaattagtatatgt 15077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 207
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15200
Alignment:
Q  156 tatgattgatgaattcgtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  15150 tatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacaatattgt 15200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Original strand, 6970 - 7039
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattact 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  6970 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 725
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  834 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 735  T
Q  119 tcaaattact 128  Q
    ||||||||||    
T  734 tcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1361
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcata 142  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||    
T  1444 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcata 1361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1218
Alignment:
Q  26 cttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatt 125  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| | ||| || ||||||| || ||||||||||    
T  1333 cttagatgtaaacataaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaatt 1234  T
Q  126 actgcacgtaggtcat 141  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  1233 actacacataggtcat 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 1267 - 1378
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||     
T  1267 ggtgtaaacataaaagttttagataattgtgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattacta 1366  T
Q  130 cacgtaggtcat 141  Q
    ||| | ||||||    
T  1367 cacatgggtcat 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32229
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||     
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattacta 32217  T
Q  130 cacgtaggtcat 141  Q
    ||| | ||||||    
T  32218 cacatgggtcat 32229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40615
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactg 129  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||     
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattacta 40627  T
Q  130 cacgtaggtcat 141  Q
    ||| | ||||||    
T  40626 cacatgggtcat 40615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39952
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 39952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45435
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 45435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 78990
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 78990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15846 - 15780
Alignment:
Q  60 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatta 126  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  15846 gttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 110065 - 110187
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  110065 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 110164  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  110165 tcaaattactacacttgggtcat 110187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 118566 - 118688
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttgg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||| ||     
T  118566 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 118665  T
Q  119 tcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||| ||| | ||||||    
T  118666 tcaaattactacacttgggtcat 118688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Original strand, 15910 - 15953
Alignment:
Q  30 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 73  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15910 ggtgtacacataaaagttgtaggtatggaagttagctttctaat 15953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 855
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 912
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaatta 126  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| || || ||||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 54016 - 53933
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||| ||| | ||||||    
T  54016 atgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattactacacatgggtcat 53933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 19939 - 20022
Alignment:
Q  58 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  19939 atgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 20022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 441 - 398
Alignment:
Q  19 aattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgtt 62  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  441 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18274 - 18192
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || |||||||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  18274 tgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 18192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 38444 - 38362
Alignment:
Q  59 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttttggtcaaattactgcacgtaggtcat 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||    
T  38444 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatgatcaaattactacacatgggtcat 38362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University