View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3638_low_6 (Length: 314)

Name: NF3638_low_6
Description: NF3638
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3638_low_6
NF3638_low_6
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (3-314)||(19228157-19228468)
chr5 (1-314)||(512257-512570)
chr5 (1-314)||(42537424-42537737)
chr5 (1-314)||(38968372-38968686)
chr5 (1-314)||(7757599-7757912)
chr5 (1-314)||(42941972-42942284)
chr5 (2-314)||(8701709-8702021)
chr5 (1-313)||(8579992-8580303)
chr5 (2-314)||(17658598-17658910)
chr5 (1-314)||(28876918-28877230)
chr5 (2-304)||(28241295-28241596)
chr5 (1-228)||(14260-14487)
chr5 (2-240)||(40624473-40624720)
chr5 (2-240)||(20422215-20422463)
chr5 (112-231)||(19040685-19040804)
chr5 (112-231)||(5197359-5197478)
chr5 (112-228)||(27673224-27673340)
chr5 (112-231)||(30705522-30705641)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-314)||(6320048-6320361)
chr6 (1-314)||(24088267-24088580)
chr6 (1-314)||(31768976-31769293)
chr6 (112-228)||(21600990-21601106)
chr6 (112-231)||(3501555-3501674)
chr6 (112-231)||(24722314-24722433)
chr6 (113-228)||(26423384-26423499)
chr6 (112-231)||(6201534-6201653)
chr6 (112-231)||(11688501-11688620)
chr6 (112-231)||(22301566-22301685)
chr6 (112-231)||(30829220-30829339)
chr6 (112-231)||(27617101-27617220)
chr6 (2-200)||(3381049-3381258)
chr6 (5-90)||(30424143-30424228)
chr6 (6-90)||(29821737-29821821)
chr6 (210-267)||(3381256-3381313)
chr6 (3-40)||(7912702-7912739)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-314)||(51683477-51683790)
chr4 (1-314)||(48256056-48256369)
chr4 (1-314)||(55407272-55407585)
chr4 (2-314)||(21022374-21022685)
chr4 (1-314)||(50275009-50275322)
chr4 (1-314)||(37021563-37021881)
chr4 (1-314)||(50901755-50902067)
chr4 (1-314)||(40357766-40358078)
chr4 (1-236)||(67866-68101)
chr4 (2-304)||(30726237-30726538)
chr4 (2-304)||(1089080-1089381)
chr4 (2-304)||(1308610-1308911)
chr4 (2-236)||(46436521-46436754)
chr4 (3-285)||(21537975-21538258)
chr4 (2-267)||(14315650-14315925)
chr4 (2-231)||(10752995-10753234)
chr4 (2-231)||(10966764-10967003)
chr4 (2-249)||(14297401-14297658)
chr4 (2-243)||(11083562-11083813)
chr4 (112-285)||(11050037-11050210)
chr4 (112-231)||(50023111-50023230)
chr4 (112-231)||(9892836-9892955)
chr4 (112-231)||(41798563-41798682)
chr4 (112-231)||(50030229-50030348)
chr4 (114-243)||(41933179-41933308)
chr4 (4-228)||(4719949-4720163)
chr4 (112-231)||(6181358-6181477)
chr4 (112-231)||(49090806-49090925)
chr4 (112-231)||(49165419-49165538)
chr4 (112-227)||(3184342-3184457)
chr4 (112-227)||(3185456-3185571)
chr4 (112-227)||(3185664-3185779)
chr4 (122-236)||(30704419-30704533)
chr4 (112-231)||(31422083-31422203)
chr4 (112-231)||(44679643-44679762)
chr4 (112-231)||(50193864-50193984)
chr4 (276-314)||(68070-68108)
chr4 (278-314)||(46436725-46436761)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-314)||(35258358-35258671)
chr1 (1-314)||(45825151-45825465)
chr1 (1-314)||(51320989-51321301)
chr1 (1-314)||(23275589-23275902)
chr1 (1-314)||(31783213-31783526)
chr1 (1-314)||(19527028-19527341)
chr1 (1-314)||(52802406-52802719)
chr1 (1-314)||(47502590-47502891)
chr1 (2-304)||(19925018-19925319)
chr1 (2-304)||(30890337-30890638)
chr1 (2-284)||(49857461-49857740)
chr1 (8-228)||(17514267-17514497)
chr1 (1-118)||(29622105-29622222)
chr1 (1-94)||(11183456-11183549)
chr1 (112-231)||(21141413-21141532)
chr1 (112-231)||(50343537-50343656)
chr1 (1-231)||(2424936-2425173)
chr1 (1-90)||(11196155-11196244)
chr1 (1-229)||(22524401-22524636)
chr1 (112-231)||(2365622-2365741)
chr1 (112-231)||(19156401-19156520)
chr1 (112-231)||(97516-97635)
chr1 (112-227)||(47656256-47656371)
chr1 (112-231)||(3731949-3732068)
chr1 (112-231)||(13639591-13639710)
chr1 (112-231)||(26876043-26876162)
chr1 (153-231)||(38127050-38127128)
chr1 (112-200)||(8474171-8474259)
chr1 (269-314)||(19524671-19524716)
chr1 (269-314)||(19524858-19524903)
chr1 (269-314)||(19525519-19525564)
chr1 (269-314)||(19526654-19526699)
chr1 (269-314)||(19526841-19526886)
chr1 (4-110)||(25147571-25147676)
chr1 (153-227)||(25166976-25167050)
chr1 (4-59)||(38127223-38127278)
chr1 (114-183)||(23935581-23935650)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (2-314)||(36977874-36978186)
chr7 (3-314)||(47672570-47672881)
chr7 (3-314)||(37340581-37340892)
chr7 (1-314)||(9494281-9494593)
chr7 (1-314)||(17835351-17835664)
chr7 (1-314)||(39460803-39461116)
chr7 (1-314)||(47776609-47776922)
chr7 (1-314)||(27453104-27453417)
chr7 (1-295)||(10517255-10517549)
chr7 (1-314)||(34738641-34738954)
chr7 (2-304)||(15073724-15074025)
chr7 (5-304)||(42507523-42507821)
chr7 (35-306)||(14689551-14689822)
chr7 (2-228)||(17741019-17741255)
chr7 (112-240)||(556205-556333)
chr7 (112-231)||(5541108-5541227)
chr7 (112-231)||(41880876-41880995)
chr7 (112-231)||(48403743-48403862)
chr7 (112-231)||(35609984-35610103)
chr7 (112-231)||(45257374-45257492)
chr7 (112-231)||(46740115-46740234)
chr7 (126-231)||(16675186-16675291)
chr7 (126-231)||(17649554-17649659)
chr7 (112-231)||(9370958-9371073)
chr7 (112-191)||(17465329-17465408)
chr7 (112-191)||(17587806-17587885)
chr7 (4-59)||(41734441-41734496)
chr7 (194-231)||(17462862-17462899)
chr7 (194-231)||(17590315-17590352)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (10-314)||(5303706-5304010)
chr8 (1-314)||(34822501-34822815)
chr8 (1-314)||(40076744-40077048)
chr8 (1-314)||(43211780-43212093)
chr8 (1-300)||(39846485-39846784)
chr8 (1-314)||(39938701-39939014)
chr8 (1-314)||(43188324-43188637)
chr8 (1-314)||(15036213-15036526)
chr8 (1-267)||(39601990-39602256)
chr8 (1-314)||(39252287-39252590)
chr8 (1-314)||(45064516-45064818)
chr8 (1-314)||(41249574-41249871)
chr8 (2-304)||(489125-489426)
chr8 (2-304)||(42485025-42485335)
chr8 (2-314)||(24249759-24250068)
chr8 (1-312)||(2984397-2984715)
chr8 (1-130)||(25864609-25864737)
chr8 (2-236)||(37327080-37327293)
chr8 (112-231)||(35552051-35552170)
chr8 (112-231)||(20857671-20857790)
chr8 (112-231)||(25095-25214)
chr8 (112-231)||(1052910-1053029)
chr8 (112-231)||(23021889-23022008)
chr8 (112-231)||(26659832-26659951)
chr8 (112-231)||(45128135-45128254)
chr8 (112-243)||(5677456-5677587)
chr8 (142-231)||(34371462-34371551)
chr8 (35-228)||(22495216-22495419)
chr8 (23-69)||(35026740-35026786)
chr8 (278-314)||(37327264-37327300)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (1-314)||(49195932-49196245)
chr3 (1-314)||(42756428-42756739)
chr3 (1-314)||(20917500-20917815)
chr3 (1-314)||(20926462-20926777)
chr3 (1-314)||(30255487-30255800)
chr3 (1-314)||(42165437-42165750)
chr3 (1-314)||(44229988-44230301)
chr3 (1-314)||(47073692-47074005)
chr3 (1-314)||(48889018-48889322)
chr3 (1-314)||(4007808-4008121)
chr3 (1-314)||(50963229-50963541)
chr3 (1-314)||(3975981-3976294)
chr3 (1-314)||(42805746-42806052)
chr3 (1-279)||(50216398-50216676)
chr3 (1-314)||(48563218-48563515)
chr3 (1-231)||(597033-597263)
chr3 (1-214)||(3501477-3501690)
chr3 (1-170)||(51807244-51807413)
chr3 (112-231)||(16611463-16611582)
chr3 (112-231)||(22047671-22047790)
chr3 (112-244)||(17567619-17567751)
chr3 (4-228)||(31045165-31045388)
chr3 (112-229)||(41612753-41612870)
chr3 (112-231)||(52390964-52391083)
chr3 (112-231)||(2274482-2274601)
chr3 (112-231)||(29009245-29009364)
chr3 (112-231)||(42903758-42903877)
chr3 (112-231)||(46389347-46389466)
chr3 (112-231)||(50480352-50480471)
chr3 (112-231)||(54386509-54386628)
chr3 (112-230)||(36127822-36127940)
chr3 (112-231)||(20351030-20351149)
chr3 (112-231)||(49144031-49144149)
chr3 (112-231)||(34045762-34045880)
chr3 (112-231)||(46701593-46701712)
chr3 (122-228)||(4178199-4178305)
chr3 (122-228)||(4172201-4172307)
chr3 (265-314)||(54681976-54682025)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (1-314)||(39947875-39948188)
chr2 (1-314)||(28468916-28469228)
chr2 (1-314)||(45428866-45429178)
chr2 (1-314)||(32955844-32956152)
chr2 (1-304)||(17420842-17421144)
chr2 (1-274)||(21998465-21998737)
chr2 (1-214)||(25965095-25965308)
chr2 (1-178)||(7185304-7185481)
chr2 (1-128)||(45137103-45137230)
chr2 (135-314)||(45136788-45136956)
chr2 (112-243)||(25515366-25515496)
chr2 (112-229)||(29401174-29401291)
chr2 (112-231)||(20938282-20938401)
chr2 (112-231)||(36655918-36656037)
chr2 (112-229)||(45284558-45284675)
chr2 (112-229)||(45291921-45292038)
chr2 (210-314)||(22686863-22686966)
chr2 (112-231)||(3940297-3940416)
chr2 (112-231)||(5352351-5352470)
chr2 (112-231)||(10828593-10828712)
chr2 (112-231)||(15831514-15831633)
chr2 (112-231)||(30496515-30496634)
chr2 (112-231)||(43978906-43979025)
chr2 (112-231)||(43539306-43539425)
chr2 (5-90)||(35464313-35464398)
chr2 (5-94)||(31367308-31367397)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-314)||(15107-15421)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-295)||(233-526)
[»] scaffold0634 (2 HSPs)
scaffold0634 (1-231)||(7693-7923)
scaffold0634 (278-314)||(7899-7935)
[»] scaffold0155 (3 HSPs)
scaffold0155 (1-109)||(8478-8586)
scaffold0155 (133-236)||(10761-10864)
scaffold0155 (276-314)||(10833-10871)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (113-231)||(18501-18619)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (112-243)||(4210-4341)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (4-227)||(251048-251270)
scaffold0007 (152-200)||(246180-246228)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (2-88)||(40746-40832)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19228468 - 19228157
Alignment:
Q  3 agtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228468 agtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtt 19228369  T
Q  103 gtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228368 gtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 19228269  T
Q  203 attatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19228268 attatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgataaaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtttaggt 19228169  T
Q  303 tatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||    
T  19228168 tatgagaattat 19228157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 512570 - 512257
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  512570 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatg 512471  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  512470 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacccaaagtgtttgatcaaatacctcaatga 512371  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512370 aaattatattgcttatttagttagtttaggttatgaaaattatagaaatgatgttaattatagtttagttaagtgtatattgattttttagttagtttag 512271  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  512270 gttatgagaattat 512257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 42537424 - 42537737
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537424 agagtagtttgcatgttgttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 42537523  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537524 ttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 42537623  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42537624 aatttatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagttaag 42537723  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  42537724 gttacgagaattat 42537737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 38968372 - 38968686
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968372 agagtagtttgcatgtggttagggtttattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 38968471  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctt-tgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatg 199  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968472 ttgttaaaatcataatgtgacttatgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatg 38968571  T
Q  200 aaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagttta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  38968572 aaaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgtttttttggttagttta 38968671  T
Q  300 ggttatgagaattat 314  Q
    ||||| | |||||||    
T  38968672 ggttacgggaattat 38968686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 7757599 - 7757912
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757599 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 7757698  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7757699 ttgtttaaattataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaacatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 7757798  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7757799 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatagaaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 7757898  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  7757899 gttacgagaattat 7757912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42942284 - 42941972
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942284 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 42942185  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42942184 ctgtttaaatcataatatggctttgaattgtggcaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 42942085  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42942084 caattttattgatt-tttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 42941986  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  42941985 gttacgagaattat 42941972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8702021 - 8701709
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8702021 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagtagttgcatatgt 8701922  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701921 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 8701822  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8701821 aattatattgattatttagtttgtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattgtttagttagtttagg 8701722  T
Q  302 ttatgagaattat 314  Q
    |||||| ||||||    
T  8701721 ttatgaaaattat 8701709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8580303 - 8579992
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8580303 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatg 8580204  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8580203 ttgtttaaatcataatgtagctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 8580104  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8580103 caattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttag 8580005  T
Q  301 gttatgagaatta 313  Q
    |||| ||||||||    
T  8580004 gttacgagaatta 8579992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 314
Target Start/End: Original strand, 17658598 - 17658910
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||     |||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17658598 gagtagtttgtatgtggttaggtttgataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgtggcctatgt 17658697  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658698 tgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 17658797  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17658798 aattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 17658897  T
Q  302 ttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||    
T  17658898 ttatgagaattat 17658910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 28876918 - 28877230
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  28876918 agagtagtttgtatgtggttagggttgaattcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattaaatgtagttgttgcctata 28877017  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28877018 ttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatga 28877117  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28877118 caattttattgattatttagttagttt-ggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttag 28877216  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  28877217 gttacgagaattat 28877230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28241596 - 28241295
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28241596 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgt 28241497  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||     
T  28241496 agtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgac 28241397  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28241396 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttagg 28241298  T
Q  302 tta 304  Q
    |||    
T  28241297 tta 28241295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14487 - 14260
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14487 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgaaaatttgatgattgcatgcgtagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatg 14388  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14387 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 14288  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagttta 228  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14287 taattttattgattatttagttagttta 14260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40624720 - 40624473
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40624720 gagtagtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgc 40624622  T
Q  102 tgtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40624621 tgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 40624522  T
Q  192 cctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaat 240  Q
    ||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40624521 ccttaataacaattttattgattatttagttagtttagattatgaaaat 40624473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Original strand, 20422215 - 20422463
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20422215 gagtagtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgacaatttgatgattggatgtgtagtgtatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgt 20422314  T
Q  102 tgtttaaat----------cataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    | |||||||           ||||||| | ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20422315 tatttaaatgatgttctagtataatgtagttttaaatggtgccaaatgaacacattttgaatatgtttgatacttttcacacaaagtgtttgataaaatg 20422414  T
Q  192 cctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaat 240  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20422415 ccccaatgacaattattttgattatttagttagtttaggttatggaaat 20422463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19040804 - 19040685
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | |||||    
T  19040804 ataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 19040705  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19040704 attatttagttagtttaggt 19040685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 5197359 - 5197478
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  5197359 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5197458  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5197459 attatttagttagtttaggt 5197478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27673340 - 27673224
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  27673340 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 27673241  T
Q  212 attatttagttagttta 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  27673240 attatttagttagttta 27673224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 30705522 - 30705641
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  30705522 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacatttttagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30705621  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30705622 attatttagttagtttaggt 30705641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6320361 - 6320048
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320361 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 6320262  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6320261 ttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagcgtttgatcaaatgcctcaatga 6320162  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320161 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 6320062  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  6320061 gttacgagaattat 6320048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24088580 - 24088267
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24088580 agagtagtttgcatgtggttagtgttgattttaaaattgacaatttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatg 24088481  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24088480 ttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtttgatcaaatgtctcaatga 24088381  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24088380 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaatgatagtttgattaggtgtatattgattttttagttagtttag 24088281  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  24088280 gttatgagaattat 24088267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 31768976 - 31769293
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattac----atgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  31768976 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaatcgacaatttgatgattgcttgcatgtgtggtttaggaattgacaaatgaatgtagttgttgct 31769075  T
Q  97 tatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31769076 tatgttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctca 31769175  T
Q  197 atgaaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagt 296  Q
    |||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769176 atgacaaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagt 31769275  T
Q  297 ttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||| |||||||||    
T  31769276 ttaggttacgagaattat 31769293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 228
Target Start/End: Original strand, 21600990 - 21601106
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||    
T  21600990 ataatgtggttttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaatgagaattatattg 21601089  T
Q  212 attatttagttagttta 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  21601090 attatttagttagttta 21601106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 3501555 - 3501674
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||    
T  3501555 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaaggacaattttattg 3501654  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
     |||||||||||||||||||    
T  3501655 tttatttagttagtttaggt 3501674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 24722314 - 24722433
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  24722314 ataatgtgtttttgaatggtgtcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcgtcaatgacaattttattg 24722413  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24722414 attatttagttagtttaggt 24722433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 228
Target Start/End: Original strand, 26423384 - 26423499
Alignment:
Q  113 taatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattga 212  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||     
T  26423384 taatatggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattgt 26423483  T
Q  213 ttatttagttagttta 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  26423484 ttatttagttagttta 26423499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 6201534 - 6201653
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  6201534 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6201633  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6201634 attatttagttagtttaggt 6201653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 11688501 - 11688620
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  11688501 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 11688600  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11688601 attatttagttagtttaggt 11688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 22301566 - 22301685
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  22301566 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 22301665  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22301666 attatttagttagtttaggt 22301685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30829339 - 30829220
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  30829339 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30829240  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30829239 attatttagttagtttaggt 30829220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 27617101 - 27617220
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | |||||    
T  27617101 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 27617200  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27617201 attatttagttagtttaggt 27617220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 3381049 - 3381258
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  3381049 gagtaatttgcatgtggttaggttttataagtgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgcattgatgaatgaatatagttgttgcctatgc 3381148  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctt-------------tgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaa 188  Q
    ||||| ||| |  |||| | ||             ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  3381149 tgtttcaatga--atgtagtttatgtattgataaatgaatggtgtcaaatgaacacaatttgaatatgttttatatattgcacacaaagtggttgataaa 3381246  T
Q  189 atgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||    
T  3381247 atgcctcaatga 3381258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 30424228 - 30424143
Alignment:
Q  5 tagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 90  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |   |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30424228 tagtgtgcatgtggttagagtttatgtatgaattgacattttgatgattgcatgtatagtttaggaattgataaatgaatgtagtt 30424143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 29821821 - 29821737
Alignment:
Q  6 agtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 90  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |   |||||||| |||||| | |  ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  29821821 agtttgtatgtggttagggttgatctaggaattgacattttgataaatgtatgtgtaatttatgaatttagaaatgaatgtagtt 29821737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Original strand, 3381256 - 3381313
Alignment:
Q  210 tgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttg 267  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  3381256 tgattatttaattagtttatgttatggaaatgattaaaatgatgttaattatagtttg 3381313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 40
Target Start/End: Original strand, 7912702 - 7912739
Alignment:
Q  3 agtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattga 40  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7912702 agtagtttgcatgtggttagggttgatgttgaaattga 7912739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 51683477 - 51683790
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51683477 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatg 51683576  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683577 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 51683676  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683677 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 51683776  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  51683777 gttacgagaattat 51683790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48256369 - 48256056
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256369 agagtagtttgcatgtggttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 48256270  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256269 tagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaaaacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 48256170  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256169 aaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 48256070  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  48256069 gttatgagaattat 48256056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55407585 - 55407272
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407585 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 55407486  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  55407485 ttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcgaatgcctcattga 55407386  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407385 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttcgttaagtgtatattgattttttagttagtttag 55407286  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  55407285 gttacgagaattat 55407272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 2 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21022685 - 21022374
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022685 gagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 21022586  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  21022585 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 21022486  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022485 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 21022387  T
Q  302 ttatgagaattat 314  Q
    ||| |||||||||    
T  21022386 ttacgagaattat 21022374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 50275009 - 50275322
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275009 agagtagtttgcatgtggttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 50275108  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50275109 ttgtttaaatcagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 50275208  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  50275209 caattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtatattgattttttagttagtgtag 50275308  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  50275309 gttacgagaattat 50275322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 37021881 - 37021563
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37021881 agagtagtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcatatg 37021782  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37021781 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcttcaatga 37021682  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattg-----attttttagttag 295  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  37021681 caattttattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattatattaattttttagttag 37021582  T
Q  296 tttaggttatgagaattat 314  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  37021581 tttaggttacgagaattat 37021563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 50901755 - 50902067
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50901755 agagtagtttacatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgtctatg 50901854  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  50901855 ttgtttaattcataatgtggctttgaatggtgttaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatga 50901954  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50901955 caattttattgatt-tttagttagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 50902053  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  50902054 gttacgagaattat 50902067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40358078 - 40357766
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40358078 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatg 40357979  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40357978 ttgtttaaatcataatgtggatttgaatggtggcaaatgaacacagtttgaatatgttttatactttgcacaccaagtgtttgataaaatgtctcaatga 40357879  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  40357878 caattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaa 40357780  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  40357779 gttacgagaattat 40357766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 67866 - 68101
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  67866 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttaatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaataaatgtagttgttgcctatg 67965  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67966 ttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacataaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 68065  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatga 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  68066 aaattatattgattatttagttagtttaggttatga 68101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 30726538 - 30726237
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||     |||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726538 gagtagtttgcatttggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcacgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 30726439  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  30726438 agtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 30726339  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30726338 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatactttggttaagtttattttgattttttagttagtttagg 30726240  T
Q  302 tta 304  Q
    |||    
T  30726239 tta 30726237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1089381 - 1089080
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1089381 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcaagtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcatatgt 1089282  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  1089281 agtttaaataataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 1089182  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1089181 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttagg 1089083  T
Q  302 tta 304  Q
    |||    
T  1089082 tta 1089080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1308911 - 1308610
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1308911 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcatatgt 1308812  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||     
T  1308811 agtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgac 1308712  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1308711 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttagg 1308613  T
Q  302 tta 304  Q
    |||    
T  1308612 tta 1308610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 46436521 - 46436754
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||     
T  46436521 gagtagtttgcacgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattaataaacgaatgtagttgttgcttatgc 46436619  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  46436620 tgtttaaatgatattgtggttctgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatggc 46436719  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatga 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46436720 aattttattgattatttagttagtttaggttatga 46436754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21538258 - 21537975
Alignment:
Q  3 agtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21538258 agtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgggtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtt 21538159  T
Q  103 gtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgc 192  Q
    |||||||| ||          ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21538158 gtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatgatgccaaatgaacacaatttgaatctgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgc 21538059  T
Q  193 ctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgatt 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21538058 ctcaatgataattatattgattatttagttagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttgataaagtgtatattgatt 21537975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 2 - 267
Target Start/End: Original strand, 14315650 - 14315925
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14315650 gagtagtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 14315749  T
Q  102 tgtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  14315750 tgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatg 14315849  T
Q  192 cctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttg 267  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14315850 cccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttg 14315925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10753234 - 10752995
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  10753234 gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgc 10753135  T
Q  102 tgtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10753134 tgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 10753035  T
Q  192 cctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10753034 cctcaatgataattatattgattatttaattagtttaggt 10752995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10967003 - 10966764
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  10967003 gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgaacattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagatgttgcctatgc 10966904  T
Q  102 tgtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10966903 tgtttaaatgatgtttaatgataatgtggttttgaatggtggcaaatggacactctttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 10966804  T
Q  192 cctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10966803 cctcaatgataattatattgattatttaattagtttaggt 10966764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 14297401 - 14297658
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14297401 gagtagtttgcatgtggttaggttttatgaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 14297500  T
Q  102 tgtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  14297501 tgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacattttgagtatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgacaaaatg 14297600  T
Q  192 cctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaat 249  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  14297601 cccaaatgaaaattgtattgattattgagttagtttaggttatggaaatgattgaaat 14297658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11083813 - 11083562
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11083813 gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacaatttgatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgc 11083714  T
Q  102 tgtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    ||||||||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||    
T  11083713 tgtttaaatgatgtataataaaaatgtggttttgaatggtgtcaaatgaacacattttgagtatgtttgatgctttgcacacaaagtgtttgacaaaatg 11083614  T
Q  192 cctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgat 243  Q
    ||  |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11083613 cccaaatgaaaattgtactgattattgagttagtttaggttatgaaaatgat 11083562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 112 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11050210 - 11050037
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11050210 ataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcatcaatgaaaattatattg 11050111  T
Q  212 attatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgatt 285  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || | | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  11050110 attatttagttagtttaggttatggaaatgatggagaggatgttaatgatagtttgataaagtgtatattgatt 11050037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50023230 - 50023111
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  50023230 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50023131  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50023130 attatttagttagtttaggt 50023111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9892955 - 9892836
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  9892955 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9892856  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9892855 attatttagttagtttaggt 9892836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41798682 - 41798563
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || || | |||||    
T  41798682 ataatgtgggtttgaatggtagcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaacgacaaatttattg 41798583  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  41798582 attatttagttagttaaggt 41798563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50030348 - 50030229
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| || ||    
T  50030348 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcatcaatgacaattttactg 50030249  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50030248 attatttagttagtttaggt 50030229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41933308 - 41933179
Alignment:
Q  114 aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgat 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41933308 aatgtggttttgaatggtgtcaaatgaagattatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaaagccccaatgaaaattatattgat 41933209  T
Q  214 tatttagttagtttaggtgatgaaaatgat 243  Q
    |||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  41933208 tattgagttagtttagattatggaaatgat 41933179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4720163 - 4719949
Alignment:
Q  4 gtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | | |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||             
T  4720163 gtagtttgcatgtggttagggtttacgtaagaattgacattttgatgattgcgtgtgtagtttatgaattggtaaatgaatgtaattgatg--------- 4720073  T
Q  104 tttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaa 203  Q
    ||||| | | ||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  4720072 tttaagt-agaatgtgattttgaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaa 4719974  T
Q  204 ttatattgattatttagttagttta 228  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||    
T  4719973 ttgcattgattatttacttagttta 4719949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6181477 - 6181358
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  6181477 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 6181378  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6181377 attatttagttagtttaggt 6181358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 49090806 - 49090925
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  49090806 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49090905  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  49090906 attatttagttagtttaggt 49090925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 49165419 - 49165538
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  49165419 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatagtttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49165518  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  49165519 attatttagttagtttaggt 49165538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 3184342 - 3184457
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||     
T  3184342 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3184441  T
Q  212 attatttagttagttt 227  Q
     |||||||||||||||    
T  3184442 tttatttagttagttt 3184457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3185571 - 3185456
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||     
T  3185571 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185472  T
Q  212 attatttagttagttt 227  Q
     |||||||||||||||    
T  3185471 tttatttagttagttt 3185456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3185779 - 3185664
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||     
T  3185779 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacccaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgacaattttattt 3185680  T
Q  212 attatttagttagttt 227  Q
     |||||||||||||||    
T  3185679 tttatttagttagttt 3185664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Original strand, 30704419 - 30704533
Alignment:
Q  122 tttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagt 221  Q
    |||||||||||| ||| || |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  30704419 tttgaatggtgggaaaagaacacatttttagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatatctcaatgacaattttattgattatttagt 30704518  T
Q  222 tagtttaggtgatga 236  Q
    |||||||||| ||||    
T  30704519 tagtttaggttatga 30704533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 31422083 - 31422203
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg-atcaaatgcctcaatgaaaattatatt 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||    
T  31422083 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgaataaaatgtgtcaatgacaattttatt 31422182  T
Q  211 gattatttagttagtttaggt 231  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31422183 gattatttagttagtttaggt 31422203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44679762 - 44679643
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||  ||||    
T  44679762 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatattttgcacacaaagtgtttgataaaatgtttcaatgaccatttcattg 44679663  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44679662 attatttagttagtttaggt 44679643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 50193864 - 50193984
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgag-cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatatt 210  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |  |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  50193864 ataatgtggttttgaatagtggcaaaaaaaacacattttgagtatgtttgatactttgcacataaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttatt 50193963  T
Q  211 gattatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  50193964 gattatttacttagtttaggt 50193984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 314
Target Start/End: Original strand, 68070 - 68108
Alignment:
Q  276 tatattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  68070 tatattgattatttagttagtttaggttatgagaattat 68108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 314
Target Start/End: Original strand, 46436725 - 46436761
Alignment:
Q  278 tattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46436725 tattgattatttagttagtttaggttatgagaattat 46436761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35258671 - 35258358
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35258671 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatttagttgttgcctatg 35258572  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258571 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 35258472  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258471 aaattatattgattatttagttagtttaggttatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtttag 35258372  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  35258371 gttatgagaattat 35258358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 45825151 - 45825465
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825151 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 45825250  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatac-tttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatg 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825251 ttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatacttttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatg 45825350  T
Q  200 aaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagttta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825351 aaaattatattgattatttagttaatttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagttta 45825450  T
Q  300 ggttatgagaattat 314  Q
     |||| |||||||||    
T  45825451 agttacgagaattat 45825465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 51320989 - 51321301
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51320989 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctata 51321088  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321089 ttgtttaaatcataatgtgactttgaatagtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatattttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 51321188  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51321189 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattga-tttttagttagtttag 51321287  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  51321288 gttatgagaattat 51321301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23275902 - 23275589
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275902 agagtagtttgcatgtggttagggttgatttttaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 23275803  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaat-ggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275802 ttgtttaaatcataatgtgactttgaatgggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatg 23275703  T
Q  200 aaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagttta 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275702 aaaattatattgattatttagtcagtttaagttatggaaatgatagaaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagttta 23275604  T
Q  300 ggttatgagaattat 314  Q
    ||||| |||||||||    
T  23275603 ggttacgagaattat 23275589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31783526 - 31783213
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31783526 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgtatgtgtagtttaggaattgataaataaatgtagttgttgcctatg 31783427  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31783426 ttctttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 31783327  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783326 caattttattgattatttagttagtttagattatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 31783227  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  31783226 gttacgagaattat 31783213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19527341 - 19527028
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19527341 agagtagtttgcatgtggttatggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtattttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 19527242  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19527241 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatggacacaatttgaatatgttttatgttttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaataa 19527142  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19527141 caattttattgattatgtagttaatttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttagttatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtgtag 19527042  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  19527041 gttacgagaattat 19527028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 52802406 - 52802719
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52802406 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaagaattgataaatgaatgtagttgttgcttatg 52802505  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  52802506 ttgtttaagtcataatgtgattttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatcttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 52802605  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52802606 caattttattgattgtttagttagtttaggctatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatttttttgttagtttag 52802705  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  52802706 gttaagagaattat 52802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 47502590 - 47502891
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502590 agagtagtttgcatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 47502689  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47502690 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttggtaaaatgcctcaatga 47502789  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||   |||         | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502790 caattttattgattatttagttag---agg---------ttatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 47502877  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||  ||||||||    
T  47502878 gttacaagaattat 47502891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Original strand, 19925018 - 19925319
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19925018 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgt 19925117  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||     
T  19925118 agtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgac 19925217  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19925218 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttagg 19925316  T
Q  302 tta 304  Q
    |||    
T  19925317 tta 19925319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Original strand, 30890337 - 30890638
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30890337 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgt 30890436  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||     
T  30890437 agtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgac 30890536  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30890537 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttagg 30890635  T
Q  302 tta 304  Q
    |||    
T  30890636 tta 30890638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 49857740 - 49857461
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||| ||||| || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857740 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgataattttatcattgcatgtgtagtttatgttttgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 49857641  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  49857640 tgtttaaatgagaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctca---aa 49857544  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgat 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49857543 aattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgat 49857461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17514497 - 17514267
Alignment:
Q  8 tttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgttta 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||     |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    || ||||||    
T  17514497 tttgcatgtggttagggtttataaatgaattgacattttgaagattacgtgtgtagtttatgaattgataaatgaatatagttgttgtaattgatgttta 17514398  T
Q  108 aatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaa 197  Q
    ||| ||          ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  17514397 aatgatgtataagtataatgtggttttgaatggtgccaaatgaacacaatttgaatatgtttgattctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcccaaa 17514298  T
Q  198 tgaaaattatattgattatttagttagttta 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17514297 taaaaattatattgattatttagttaattta 17514267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 29622222 - 29622105
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29622222 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatg 29622123  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgt 118  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29622122 ttgtttaaatcataatgt 29622105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 11183456 - 11183549
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttg 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11183456 agagtagtttgcatgtggttagagttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagttgttg 11183549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 21141413 - 21141532
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  21141413 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 21141512  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21141513 attatttagttagtttaggt 21141532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50343656 - 50343537
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  50343656 ataatatggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 50343557  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50343556 attatttagttagtttaggt 50343537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2425173 - 2424936
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||  | ||| ||||||||||||||||    ||    
T  2425173 agagtagtttgtatgtggttagagttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtgttatt-atgatgttatagatgaatgtagttgttgtaattg 2425075  T
Q  101 ttgtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 190  Q
    |||||| ||| ||          ||||||| || |||||| | ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2425074 ttgtttgaatgatttttaagtataatgtggtttggaatggagccaaataaacacaatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaat 2424977  T
Q  191 gcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 231  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2424976 gcctcaataacaattttattgattatttatttagtttaggt 2424936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 11196155 - 11196244
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 90  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11196155 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaattaatgtagtt 11196244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 22524401 - 22524636
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||  | ||| || ||||||||||||     ||    
T  22524401 agagtggtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtgttgta-atgatgttatagattaatgtagttgttataattg 22524499  T
Q  101 ttgtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaat 190  Q
    |||||| ||| ||          ||||||| || |||||| | ||||| | || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22524500 ttgtttgaatgatttttaagtataatgtggtttggaatggagccaaataaacataatttgaat--gttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaat 22524597  T
Q  191 gcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttag 229  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22524598 gcctcaatgacaattttattgattatttagttagtttag 22524636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 2365622 - 2365741
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  2365622 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2365721  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2365722 attatttagttagtttaggt 2365741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 19156401 - 19156520
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  19156401 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 19156500  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19156501 attatttagttagtttaggt 19156520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 97635 - 97516
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  97635 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagatcacattttgagtatgtttgatactttgtacacaaagtgtttgagaaaatgcctcaatgataattttattg 97536  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
     |||||||||||||||||||    
T  97535 tttatttagttagtttaggt 97516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 227
Target Start/End: Original strand, 47656256 - 47656371
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  47656256 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 47656355  T
Q  212 attatttagttagttt 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  47656356 attatttagttagttt 47656371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3732068 - 3731949
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  3732068 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3731969  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3731968 attatttagttagtttaggt 3731949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13639710 - 13639591
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  13639710 ataatgtggttttgaattgtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 13639611  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13639610 attatttagttagtttaggt 13639591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 26876043 - 26876162
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  26876043 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26876142  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26876143 attatttagttagtttaggt 26876162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38127128 - 38127050
Alignment:
Q  153 tatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38127128 tatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaaaattttattgattacttagttagtttaggt 38127050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 200
Target Start/End: Original strand, 8474171 - 8474259
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  8474171 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatga 8474259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19524716 - 19524671
Alignment:
Q  269 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19524716 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19524671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19524903 - 19524858
Alignment:
Q  269 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19524903 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19524858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19525564 - 19525519
Alignment:
Q  269 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19525564 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19525519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19526699 - 19526654
Alignment:
Q  269 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19526699 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19526654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19526886 - 19526841
Alignment:
Q  269 ttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  19526886 ttaagtgtatattgattttttagttagtgtaggttacgagaattat 19526841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 110
Target Start/End: Original strand, 25147571 - 25147676
Alignment:
Q  4 gtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||   ||||||    
T  25147571 gtagtttgcatctggttagtgttgatgtaggaattga-actttgatgattgcatgtgtagtttatgatgttatagatgaatgtagttgatgtgaatgttg 25147669  T
Q  104 tttaaat 110  Q
    |||||||    
T  25147670 tttaaat 25147676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 227
Target Start/End: Original strand, 25166976 - 25167050
Alignment:
Q  153 tatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagttt 227  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||  |||| ||||||| ||| ||||||||    
T  25166976 tatgtttcatactttgcactcaaagtgtttgataaaattcctaaatgaggattacattgatttttttgttagttt 25167050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 38127278 - 38127223
Alignment:
Q  4 gtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgt 59  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  38127278 gtagtttgcacgtggttagggttgatgttggaattgaaaatttgatgattgcatgt 38127223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23935650 - 23935581
Alignment:
Q  114 aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttg 183  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||   |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23935650 aatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaatggtaataagtttcatactttgcactcaaagtgtttg 23935581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 2 - 314
Target Start/End: Original strand, 36977874 - 36978186
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36977874 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 36977973  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36977974 tgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 36978073  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36978074 aattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 36978173  T
Q  302 ttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||    
T  36978174 ttatgagaattat 36978186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47672881 - 47672570
Alignment:
Q  3 agtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672881 agtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtataatctatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtt 47672782  T
Q  103 gtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47672781 gtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 47672682  T
Q  203 attatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47672681 attatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttctagttagtttaggt 47672582  T
Q  303 tatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||    
T  47672581 tatgagaattat 47672570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 314
Target Start/End: Original strand, 37340581 - 37340892
Alignment:
Q  3 agtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtt 102  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37340581 agtagtttggatgtggttaggattgattttaaaattgacaatttgatgatttcatgtgtagtttatgaattgaaaaatgaatgtacttgttgcctatgtt 37340680  T
Q  103 gtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340681 gtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaa 37340780  T
Q  203 attatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37340781 attatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgctgttaattatagtttggttaagagtatattaatttgttagttagtttaggt 37340880  T
Q  303 tatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||    
T  37340881 tatgagaattat 37340892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9494593 - 9494281
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494593 agagtagtttgcatgtggtttgggttgattttaaaattgaaaatttgatggttgcatgtgtaatttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 9494494  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9494493 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcgtcaatga 9494394  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494393 aaattatattgattatttagttagtttaggttatg-gaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtttag 9494295  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  9494294 gttatgagaattat 9494281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 17835351 - 17835664
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835351 agagtagtttgtatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 17835450  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17835451 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 17835550  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835551 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 17835650  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  17835651 gttacgagaattat 17835664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 39460803 - 39461116
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39460803 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatt 39460902  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39460903 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 39461002  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39461003 caattttattgattatttagttagtttaggttatggatatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatgttttagttagtttag 39461102  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||  ||||||||    
T  39461103 gttacaagaattat 39461116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 47776609 - 47776922
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776609 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 47776708  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47776709 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgacaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 47776808  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776809 caaatttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtctggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 47776908  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  47776909 gttacgagaattat 47776922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27453417 - 27453104
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27453417 agagtagtttgcatgtggttagagttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttacctatg 27453318  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  27453317 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcattga 27453218  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27453217 caattttattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 27453118  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  27453117 gttacgagaattat 27453104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 10517255 - 10517549
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517255 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 10517354  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10517355 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 10517454  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 295  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517455 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 10517549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 34738641 - 34738954
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34738641 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttacctatg 34738740  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  34738741 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgctcacaaagtgtttgataaaatgtctcgatga 34738840  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  34738841 caattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtgtaa 34738940  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  34738941 gttacgagaattat 34738954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15074025 - 15073724
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15074025 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 15073926  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  15073925 agtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 15073826  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15073825 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttagg 15073727  T
Q  302 tta 304  Q
    |||    
T  15073726 tta 15073724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42507821 - 42507523
Alignment:
Q  5 tagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgt 104  Q
    ||||||||||||||||||| || ||     |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42507821 tagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattaacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagttgttgcctatgtagt 42507722  T
Q  105 ttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaat 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  42507721 ttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaat 42507622  T
Q  205 tatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggtta 304  Q
    | |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42507621 tttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttaggtta 42507523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14689822 - 14689551
Alignment:
Q  35 aattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggc 134  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  14689822 aattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatttattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaatgataatgtagctttgaatagtggc 14689723  T
Q  135 aaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtgat 234  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14689722 aaataaacacaatttgaatatcttttatactttgcatacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttatgttat 14689623  T
Q  235 gaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatg 306  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14689622 ggaaatgataaaaatgatgttaattattgtttggttaagtgtatattgattatttagttagtttatgttatg 14689551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17741255 - 17741019
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||     
T  17741255 gagtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgaagattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattga 17741156  T
Q  102 tgtttaaatcat----------aatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    | ||||||| ||          ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  17741155 tatttaaatgatgtttaagtataatgtggttttgaatggtgccatatgaacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatt 17741056  T
Q  192 cctcaatgaaaattatattgattatttagttagttta 228  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17741055 cccaaatgagaattatattgattatttagttagttta 17741019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 556333 - 556205
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  556333 ataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacatattttgagtatgtttgatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattt 556234  T
Q  212 attatttagttagtttaggtgatgaaaat 240  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  556233 attatttagttagtttatgttatgaaaat 556205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5541227 - 5541108
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || || | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  5541227 ataacgtggttttgaatggtggcaaaagatcatattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 5541128  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5541127 attatttagttagtttaggt 5541108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 41880876 - 41880995
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  41880876 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 41880975  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41880976 attatttagttagtttaggt 41880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 48403743 - 48403862
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  48403743 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgataattttattg 48403842  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48403843 attatttagttagtttaggt 48403862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35610103 - 35609984
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  35610103 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 35610004  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35610003 attatttagttagtttaggt 35609984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 45257374 - 45257492
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  45257374 ataatgtggttttgaatggtggtaaaaaa-cacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 45257472  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45257473 attatttagttagtttaggt 45257492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46740234 - 46740115
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  46740234 ataatgtgattttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgattgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46740135  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  46740134 attatttaattagtttaggt 46740115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Original strand, 16675186 - 16675291
Alignment:
Q  126 aatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagt 225  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  16675186 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 16675285  T
Q  226 ttaggt 231  Q
    ||||||    
T  16675286 ttaggt 16675291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Original strand, 17649554 - 17649659
Alignment:
Q  126 aatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagt 225  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  17649554 aatggtggcaaaagaatacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttaataaaatgtctcaatgacaattttattgattattttgttagt 17649653  T
Q  226 ttaggt 231  Q
    ||||||    
T  17649654 ttaggt 17649659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9371073 - 9370958
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  9371073 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatg----atactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 9370978  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9370977 attatttagttagtttaggt 9370958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17465408 - 17465329
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17465408 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 17587806 - 17587885
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatg 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17587806 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatg 17587885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 41734441 - 41734496
Alignment:
Q  4 gtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgt 59  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  41734441 gtagtttgcacgtggttagggttgatgttggaattgaaaatttgatgattgcatgt 41734496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17462899 - 17462862
Alignment:
Q  194 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17462899 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 17462862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 231
Target Start/End: Original strand, 17590315 - 17590352
Alignment:
Q  194 tcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17590315 tcaatgacaattttattgattatttagttagtttaggt 17590352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 10 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5304010 - 5303706
Alignment:
Q  10 tgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5304010 tgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttcatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatgttgtttaaa 5303911  T
Q  110 tcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303910 tcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatat 5303811  T
Q  210 tgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5303810 tgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgaga 5303711  T
Q  310 attat 314  Q
    |||||    
T  5303710 attat 5303706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34822815 - 34822501
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822815 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 34822716  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822715 ttggttaaatcataatgtggctttgaatgactgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactctgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 34822616  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgatt-ttttagttagttta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34822615 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatattaattatagtttggttaagtgtatattgatttttttagttagttta 34822516  T
Q  300 ggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||||    
T  34822515 ggttatgagaattat 34822501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40077048 - 40076744
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40077048 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattatatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagctgttgcctatg 40076949  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076948 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttataatttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 40076849  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||         | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076848 aaattatattgattatttagttagtttagg---------ttacagaaatgatgataattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 40076758  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  40076757 gttatgagaattat 40076744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 43211780 - 43212093
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43211780 agagtagtttgtatgtgcttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 43211879  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43211880 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtgggaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 43211979  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43211980 caattttattgattatttagttagtttaggttaaggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 43212079  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  43212080 gttacgagaattat 43212093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39846784 - 39846485
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846784 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 39846685  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||| ||||    
T  39846684 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgtacacaaagtgtttgataaactgtctccatga 39846585  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846584 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 39846485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39939014 - 39938701
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39939014 agagtagtttacatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattacatgtatagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 39938915  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  39938914 ttgtttaaatcataatggggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaataagttttatactttgcacacaaagtatttgataaaatgtctcaatga 39938815  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39938814 caattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtgtag 39938715  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  39938714 gttacgagaattat 39938701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 43188324 - 43188637
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43188324 agagtagtttgcatgtggttatggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgtctatg 43188423  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  43188424 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacgatttgaatatgttttatactttgcatacaaagtgtttgataaaatgtttcaatga 43188523  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43188524 caattttattgattatttagttagtttatgttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtttag 43188623  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  43188624 gttacgagaattat 43188637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15036526 - 15036213
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036526 agagtggtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagttcaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 15036427  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15036426 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 15036327  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaa-tgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagttta 299  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036326 caattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaattagggttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagttta 15036228  T
Q  300 ggttatgagaattat 314  Q
    ||||| |||||||||    
T  15036227 ggttacgagaattat 15036213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 39601990 - 39602256
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39601990 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 39602089  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39602090 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 39602189  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttg 267  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39602190 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatattttg 39602256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 39252287 - 39252590
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39252287 agagtagtttgtatgtggttagg-ttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattaataaatgaatgtagttgttgcatatg 39252385  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39252386 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaatacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 39252485  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| |||         |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252486 caattttattgattatttagttagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttggtcaagtgtatattgattttttagttagtttag 39252576  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  39252577 gttacgagaattat 39252590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 45064516 - 45064818
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45064516 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatg 45064615  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||           ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45064616 ttgtttaaatcttaatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaat----------ttttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 45064705  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45064706 caattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttag 45064804  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  45064805 gttaggagaattat 45064818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41249871 - 41249574
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41249871 agagtagtttgcatgtggttagggtagattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 41249772  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||                | |||| ||||||    
T  41249771 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgctttatactttgcac----------------attgccgcaatga 41249688  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41249687 caattttattgattatgtagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtgtag 41249588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 489426 - 489125
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || |      |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  489426 gagtagtttgcatgtggttaggttttacaaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgt 489327  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||     
T  489326 agtttaaattataatgtggctttgaatggttgcaaatgaacacaatttaaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgac 489227  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttagg 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  489226 aattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttagg 489128  T
Q  302 tta 304  Q
    |||    
T  489127 tta 489125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 42485335 - 42485025
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42485335 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtagatgttgcctatgt 42485236  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||     
T  42485235 agtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgttcgataaaatgtctcaatgac 42485136  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttag--------gtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagtt 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||         ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42485135 aattttattgattatttagttagtttagttatggaaatgatagaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagtt 42485036  T
Q  294 agtttaggtta 304  Q
    |||||||||||    
T  42485035 agtttaggtta 42485025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 314
Target Start/End: Original strand, 24249759 - 24250068
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||     
T  24249759 gagtagtttgcatgtggttagggttgatataggaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtaattga 24249858  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||     
T  24249859 tgtttaagt-ataatgtggttttgaatggtgtcaaatgagcacattttgaatatgtttgatactttgcacataaagtatttgataaaatgccccaatgag 24249957  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttt-------tagtta 294  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||         ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||       ||||||    
T  24249958 aattatattgattatttagtcagtttaggttatggaaatgat---------gttaattttagtttgataaagtgtatattgattattgattatttagtta 24250048  T
Q  295 gtttaggttatgagaattat 314  Q
    || |||||||||||||||||    
T  24250049 gtgtaggttatgagaattat 24250068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 2984397 - 2984715
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcct--a 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||  | ||| ||||||||| ||| |   |  |    
T  2984397 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgttaa-gatgttatagatgaatgtaattgatctttgaa 2984495  T
Q  99 tgttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaat 198  Q
    || | ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  2984496 tgatttttaagt-ataatgtggttttgaatgatgccaaataaacacaatttgaataagtttcatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaac 2984594  T
Q  199 gaaaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgta-------tattgattttttag 291  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||       |||||||| |||||    
T  2984595 gacaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatgaaaatgatgttaattatagtttgataaagtgtatattgattattgattatttag 2984694  T
Q  292 ttagtttaggttatgagaatt 312  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2984695 ttagtttaggttatgagaatt 2984715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25864737 - 25864609
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25864737 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtt-atgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 25864639  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25864638 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatgg 25864609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 236
Target Start/End: Original strand, 37327080 - 37327293
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgt 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  37327080 gagtagtttgcatgtg-ttagggttaattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgta-------------- 37327164  T
Q  102 tgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaa 201  Q
          ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  37327165 ------aatgataatgtgattttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgac 37327258  T
Q  202 aattatattgattatttagttagtttaggtgatga 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37327259 aattttattgattatttagttagtttaggttatga 37327293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 35552051 - 35552170
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  35552051 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 35552150  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35552151 attatttagttagtttaggt 35552170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 20857671 - 20857790
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  20857671 ataatgtggttttgaatggttgcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaattgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 20857770  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20857771 attatttagttagtttaggt 20857790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25214 - 25095
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  25214 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 25115  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25114 attatttagttagtttaggt 25095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 1052910 - 1053029
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  1052910 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtatcaatgacaattttattg 1053009  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1053010 attatttagttagtttaggt 1053029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23022008 - 23021889
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  23022008 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 23021909  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23021908 attatttagttagtttaggt 23021889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 26659832 - 26659951
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  26659832 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 26659931  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26659932 attatttagttagtttaggt 26659951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 45128135 - 45128254
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||    
T  45128135 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacgttttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgccccaatgtgaattgtattg 45128234  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  45128235 attattgagttagtttaggt 45128254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Original strand, 5677456 - 5677587
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5677456 ataatgtggttttgaatggtagcaaaagaatacattttgagtatgtttgatgttttgcacagaaagtgtttgataaaatgccccaatgaaaattatattg 5677555  T
Q  212 attatttagttagtttaggtgatgaaaatgat 243  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  5677556 attatcgagtaagtttaggttatggaaatgat 5677587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 142 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34371551 - 34371462
Alignment:
Q  142 cacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggt 231  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34371551 cacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaatttttttgattatttagttagtttaggt 34371462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 228
Target Start/End: Original strand, 22495216 - 22495419
Alignment:
Q  35 aattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttgtttaaatcat----------aatgtggcttt 124  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    || |||||| || ||          ||||||| |||    
T  22495216 aattgacattttgatggttgcatgtgtagtttacgaattgataaatgaatgtagttgatgtaattgatgtttagatgatgtttaagtagaatgtggtttt 22495315  T
Q  125 gaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttag 224  Q
    |||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||| |   | |||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  22495316 gaatggtgtcaaattaacacaatgagaatatgtttgatactttgcacaaatgttttttgataaaatgcccaaatgaaaattgcattgattatttacttag 22495415  T
Q  225 ttta 228  Q
    ||||    
T  22495416 ttta 22495419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 69
Target Start/End: Original strand, 35026740 - 35026786
Alignment:
Q  23 ggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatg 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35026740 ggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatg 35026786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 314
Target Start/End: Original strand, 37327264 - 37327300
Alignment:
Q  278 tattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37327264 tattgattatttagttagtttaggttatgagaattat 37327300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 49196245 - 49195932
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49196245 agagtagtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 49196146  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49196145 ttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcttcaatga 49196046  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49196045 aaattatattgattatttagttagtttaggttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaattgtatattgattttttagttagtttag 49195946  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
     |||  ||||||||    
T  49195945 cttacaagaattat 49195932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 42756428 - 42756739
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42756428 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatggatgtagttgttgtctatg 42756527  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756528 ttgtttaaatcataatgtcgctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 42756627  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756628 aaat--tattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtttag 42756725  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  42756726 gttatgagaattat 42756739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20917815 - 20917500
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917815 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 20917716  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917715 ttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 20917616  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaa--gtgtatattgattttttagttagttt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20917615 aaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtgtatattgattttttagttagttt 20917516  T
Q  299 aggttatgagaattat 314  Q
    |||||| |||||||||    
T  20917515 aggttacgagaattat 20917500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20926777 - 20926462
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926777 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 20926678  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926677 ttgttaaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 20926578  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaa--gtgtatattgattttttagttagttt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20926577 aaattatattgattatttagttagtttaagttatggaaatgattgaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtgtatattgattttttagttagttt 20926478  T
Q  299 aggttatgagaattat 314  Q
    |||||| |||||||||    
T  20926477 aggttacgagaattat 20926462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30255800 - 30255487
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30255800 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaagttgacaatttgatgattgcatgtttagtttgtgaattgctaaatgaatgtagttgttgcctatg 30255701  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255700 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 30255601  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255600 aatttatattgattatttagttagttcaggttaaggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtttag 30255501  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  30255500 gttatgagaattat 30255487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 42165437 - 42165750
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165437 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 42165536  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42165537 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 42165636  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165637 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 42165736  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  42165737 gttacgagaattat 42165750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 44229988 - 44230301
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44229988 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 44230087  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44230088 ttgtttaaaacataatgtggctttgaacggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaatgtgtttgataaaatgcctcaatga 44230187  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44230188 caattttattgattatttagttggtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 44230287  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  44230288 gttacgagaattat 44230301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47074005 - 47073692
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47074005 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgaatgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctata 47073906  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47073905 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 47073806  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47073805 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 47073706  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  47073705 gttacgagaattat 47073692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 48889018 - 48889322
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889018 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 48889117  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48889118 ttgtttaaatcataatgtgactttgaatggtggtaaatgaacataatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaaggcctcaatga 48889217  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889218 aaattatattgattatttagttagtttaggttatg---------gaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 48889308  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||    
T  48889309 gttatgagaattat 48889322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4008121 - 4007808
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4008121 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 4008022  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4008021 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 4007922  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4007921 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttgattaagtgtatattgattttttagttagtttag 4007822  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    ||||  ||||||||    
T  4007821 gttacaagaattat 4007808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 50963229 - 50963541
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963229 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 50963328  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  50963329 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgataaaatgcctcagtga 50963428  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963429 caattttataaattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaa-tatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 50963527  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  50963528 gttacgagaattat 50963541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 3975981 - 3976294
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  3975981 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttaaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattggcaattgaatgtagttgttgcctatg 3976080  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3976081 tagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 3976180  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976181 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaaggatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 3976280  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  3976281 gttacgagaattat 3976294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42806052 - 42805746
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42806052 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgataattg--------catgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgtctatg 42805961  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42805960 ttgtttaaatgataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatga 42805861  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgatt-ttttagttagttta 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42805860 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgattaggtgtatattgatttttttagttagttta 42805761  T
Q  300 ggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||||    
T  42805760 ggttatgagaattat 42805746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 50216676 - 50216398
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216676 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgataatttgatgattgcatgtgtaatttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 50216577  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50216576 ttgtttaaatcataatgtggttttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatgctttgcacacaaagtgtttgataaaatgcttcaatga 50216477  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtata 279  Q
     |||| |||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216476 caattttattgattatgtggttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtata 50216398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 48563218 - 48563515
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |                |    
T  48563218 agagtagtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtctatgaattgataaatata----------------g 48563301  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48563302 ttgtttaaatcataatgtgtctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaaatgtttgatcaaatgcctcaatga 48563401  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563402 aaattatattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 48563501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 597033 - 597263
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  597033 agagtagtttgcatgtggttagggttgatttaaatattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcccatg 597132  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  597133 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacattttgattatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 597232  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggt 231  Q
     |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  597233 caattttattgattatttagttagcttaggt 597263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3501690 - 3501477
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3501690 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatg 3501591  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  3501590 ttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 3501491  T
Q  201 aaattatattgatt 214  Q
     |||| ||||||||    
T  3501490 caattttattgatt 3501477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 51807244 - 51807413
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51807244 agagtagtttgcatgtggttatgattgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttgttgtctatg 51807343  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgca 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51807344 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgca 51807413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 16611463 - 16611582
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  16611463 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 16611562  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16611563 attatttagttagtttaggt 16611582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22047790 - 22047671
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  22047790 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 22047691  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22047690 attatttagttagtttaggt 22047671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17567751 - 17567619
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  17567751 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 17567652  T
Q  212 attatttagttagtttaggtgatgaaaatgata 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  17567651 attatttagttagtttaggttatggatatgata 17567619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31045388 - 31045165
Alignment:
Q  4 gtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||     |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||    || ||    
T  31045388 gtagtttgcatgtggttagggtttatgaatgaattgacattttgatgattgcatgtgtagtttataaattgataaacgaatgtagttaatgtaattgatg 31045289  T
Q  104 tttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaa 203  Q
    ||||| | | ||||||| ||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||    
T  31045288 tttaagtaa-aatgtggttttgaatggtgtcaaaataacacaatgtgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgccaaaatgagaa 31045190  T
Q  204 ttatattgattatttagttagttta 228  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||    
T  31045189 ttgcatttattatttagttagttta 31045165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 41612753 - 41612870
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  41612753 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 41612852  T
Q  212 attatttagttagtttag 229  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  41612853 attatctagttagtttag 41612870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52391083 - 52390964
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || | |||||    
T  52391083 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacaatttgaatatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaaatttattg 52390984  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52390983 attatttagttagtttaggt 52390964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2274601 - 2274482
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  2274601 ataatgtggttttgaatggtgggaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 2274502  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2274501 attatttagttagtttaggt 2274482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 29009245 - 29009364
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  29009245 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 29009344  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29009345 attatttagttagtttaggt 29009364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 42903877 - 42903758
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  42903877 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 42903778  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42903777 attatttagttagtttaggt 42903758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 46389347 - 46389466
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  46389347 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46389446  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  46389447 attatttagttagtttaggt 46389466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50480471 - 50480352
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  50480471 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 50480372  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  50480371 attatttagttagtttaggt 50480352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 54386509 - 54386628
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  54386509 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 54386608  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  54386609 attatttagttagtttaggt 54386628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 230
Target Start/End: Original strand, 36127822 - 36127940
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| | |||    
T  36127822 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttcttg 36127921  T
Q  212 attatttagttagtttagg 230  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  36127922 attatttggttagtttagg 36127940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 20351030 - 20351149
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaa-tgcctcaatgaaaattatatt 210  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||    
T  20351030 ataatttggttttgaatggtggcaaaagaacaca-tttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgattaaaatgtctcaatgacaattttatt 20351128  T
Q  211 gattatttagttagtttaggt 231  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20351129 gattatttagttagtttaggt 20351149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49144149 - 49144031
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  49144149 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgaatat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 49144051  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  49144050 attatttagttagtttaggt 49144031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 34045762 - 34045880
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  34045762 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtat-tttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 34045860  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34045861 attatttagttagtttaggt 34045880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46701712 - 46701593
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |  ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  46701712 ataatgtggttttgattggtggcaaaataagacattttgagcatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 46701613  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  46701612 attatttagttagtttaggt 46701593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Original strand, 4178199 - 4178305
Alignment:
Q  122 tttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagt 221  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  4178199 tttgaatggtgtcaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacacaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgaaaattttattgattatttagt 4178298  T
Q  222 tagttta 228  Q
    |||||||    
T  4178299 tagttta 4178305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Original strand, 4172201 - 4172307
Alignment:
Q  122 tttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagt 221  Q
    |||||||||||  ||||||  | ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  4172201 tttgaatggtgttaaatgaagataatttgaatacttttgatactttgcacaaaaagtgtttgacaaaatgcccaaatgagaattttattgattatttagt 4172300  T
Q  222 tagttta 228  Q
    |||||||    
T  4172301 tagttta 4172307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 314
Target Start/End: Original strand, 54681976 - 54682025
Alignment:
Q  265 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54681976 ttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 54682025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 39947875 - 39948188
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39947875 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaattcgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 39947974  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39947975 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaaagaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 39948074  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39948075 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 39948174  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  39948175 gttacgagaattat 39948188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 28468916 - 28469228
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28468916 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtaattgttgcctatg 28469015  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28469016 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 28469115  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28469116 caattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttag 28469214  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  28469215 gttacgagaattat 28469228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 45428866 - 45429178
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45428866 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttaaaaaatgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctacg 45428965  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45428966 tagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 45429065  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429066 caattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 45429164  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  45429165 gttacgagaattat 45429178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32956152 - 32955844
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32956152 agagtagtttgtatgtggtttgggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtacttgttgcctatg 32956053  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32956052 ttgtttaaattataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 32955953  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32955952 caat----ttgattatttagttagtttaggttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttgg-taagtgtatattgattttttagttagtttag 32955858  T
Q  301 gttatgagaattat 314  Q
    |||| |||||||||    
T  32955857 gttacgagaattat 32955844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 17420842 - 17421144
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17420842 agagtagtttgcatgtggttagggttgatttcaaaattgagaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgatcattgaatgtagttgttgcctatg 17420941  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17420942 ttgtttaaatcataatgtgggtttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacatcaagtgtttgataaaatgtctcaatga 17421041  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttag 300  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17421042 caattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtttattttgattttttagttagtttag 17421140  T
Q  301 gtta 304  Q
    ||||    
T  17421141 gtta 17421144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 21998465 - 21998737
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| || |||||| |||||    
T  21998465 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagtaattgataattgaatttatttgttgtctatg 21998564  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21998565 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 21998664  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagt 274  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21998665 caattttattgattatttagttagttta-gttatggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagt 21998737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 25965095 - 25965308
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25965095 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgtttcctatg 25965194  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25965195 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatgttggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatga 25965294  T
Q  201 aaattatattgatt 214  Q
     |||| ||||||||    
T  25965295 taattttattgatt 25965308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 7185304 - 7185481
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7185304 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgttgtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 7185403  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7185404 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagt 7185481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 45137230 - 45137103
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45137230 agagtagtttgcatgtggttaaggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttcttgcctatg 45137131  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaat 128  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||    
T  45137130 ttatttaaatcataatgtggccttgaat 45137103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45136956 - 45136788
Alignment:
Q  135 aaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtgat 234  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||           |||||||||| ||    
T  45136956 aaatgaacacaatttaaatatattttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttatt-----------tagtttaggttat 45136868  T
Q  235 gaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45136867 ggaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaaatgtatattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 45136788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25515496 - 25515366
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25515496 ataatgtggttttgaatggtggcaaa-gagcacgatttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgagaattatattg 25515398  T
Q  212 attatttagttagtttaggtgatgaaaatgat 243  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  25515397 attattgagttagtttaggttatggaaatgat 25515366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29401291 - 29401174
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  29401291 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattg 29401192  T
Q  212 attatttagttagtttag 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29401191 attatttagttagtttag 29401174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 20938282 - 20938401
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  20938282 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 20938381  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20938382 attatttagttagtttaggt 20938401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36656037 - 36655918
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  36656037 ataatgtggttttcaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgaacattttattg 36655938  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36655937 attatttagttagtttaggt 36655918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 45284558 - 45284675
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  45284558 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45284657  T
Q  212 attatttagttagtttag 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45284658 attatttagttagtttag 45284675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 229
Target Start/End: Original strand, 45291921 - 45292038
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  45291921 ataatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttaagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatggctcaatgacaattttattg 45292020  T
Q  212 attatttagttagtttag 229  Q
    ||||||||||||||||||    
T  45292021 attatttagttagtttag 45292038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 314
Target Start/End: Original strand, 22686863 - 22686966
Alignment:
Q  210 tgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttagtttaggttatgaga 309  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22686863 tgattatttagttagtttagtt-atggaaatggtagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttagtttaggttacgaga 22686961  T
Q  310 attat 314  Q
    |||||    
T  22686962 attat 22686966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3940416 - 3940297
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  3940416 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 3940317  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3940316 attatttagttagtttaggt 3940297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 5352351 - 5352470
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  5352351 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 5352450  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5352451 attatttagttagtttaggt 5352470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10828712 - 10828593
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| || | || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  10828712 ataatgtggttttgaattgtggcaaaagaacgcattttgagtatgtttgatactttggacacaaagtgtttgataaaatgtctcaatgacaattttattg 10828613  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10828612 attatttagttagtttaggt 10828593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 15831514 - 15831633
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  15831514 ataatgtggttttgaatggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtctttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 15831613  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15831614 attatttagttagtttaggt 15831633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30496634 - 30496515
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  30496634 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 30496535  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30496534 attatttagttagtttaggt 30496515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Original strand, 43978906 - 43979025
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  43978906 ataatgtggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43979005  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43979006 attatttagttagtttaggt 43979025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43539425 - 43539306
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||  | |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||| |||||    
T  43539425 ataatatggttttgattggtggcaaaataacacattttgagtatgtttgatactttgcacacaatgtttttgataaaatgtgtcaatgacaattttattg 43539326  T
Q  212 attatttagttagtttaggt 231  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43539325 attatttagttagtttaggt 43539306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 35464398 - 35464313
Alignment:
Q  5 tagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagtt 90  Q
    ||||||||||||||||||| || || |   |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35464398 tagtttgcatgtggttaggatttatgtatgaattgacattctgatgattgcatgtgtagtttatgaatttataaatgaatgtagtt 35464313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 31367308 - 31367397
Alignment:
Q  5 tagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  31367308 tagtttgcatgtggttagggttgatgtaggaattgatattttgatgattgcatatatagtttatgaatttataaatgaatttatttgttg 31367397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15421 - 15107
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15421 agagtagtttgtatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataaatgaatgtagttattgcctatg 15322  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15321 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgataaaatgcctcaatga 15222  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgatt-ttttagttagttta 299  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15221 caattttattgattatttagttagtttaggttatggaaatgatataaatgatgttaattatagtttggttaagtgtatattgatttttttggttagttta 15122  T
Q  300 ggttatgagaattat 314  Q
    |||||  ||||||||    
T  15121 ggttacaagaattat 15107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 526 - 233
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  526 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttagaaattgataattgaatgtagttgttgcctatg 427  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  426 tagtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaacgtgtttgataaaatgtctcaatga 327  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggtgatgaaaatgatagaaatgttgttaattatagtttggttaagtgtatattgattttttagttag 295  Q
     |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  326 caattttattaattatttagttagttta-gttatgaaaatgatagaaatgatgttaattatagtttggttaagtgtattttgattttttagttag 233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7693 - 7923
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7693 agagtagtttgtatgtggttagggttgatttcaaaattgacaatttgatgattgcatgtgtagtttaggaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 7792  T
Q  101 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7793 ttgtttaaatcataatgtggctttgaatgatggcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtatttgataaaatgcctcaatga 7892  T
Q  201 aaattatattgattatttagttagtttaggt 231  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7893 caattttattgattttttagttagtttaggt 7923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 314
Target Start/End: Original strand, 7899 - 7935
Alignment:
Q  278 tattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7899 tattgattttttagttagtttaggttacgagaattat 7935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 8478 - 8586
Alignment:
Q  1 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8478 agagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattgcatgtatagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatg 8577  T
Q  101 ttgtttaaa 109  Q
    |||||||||    
T  8578 ttgtttaaa 8586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 236
Target Start/End: Original strand, 10761 - 10864
Alignment:
Q  133 gcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattgattatttagttagtttaggtg 232  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10761 gcaaatgaacacaatttgaatatgttttatactttacacacaaagtgtttgaaaaaatgtctcaatgacaattatattgattatttagttagtttaggtt 10860  T
Q  233 atga 236  Q
    ||||    
T  10861 atga 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 314
Target Start/End: Original strand, 10833 - 10871
Alignment:
Q  276 tatattgattttttagttagtttaggttatgagaattat 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10833 tatattgattatttagttagtttaggttatgagaattat 10871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18619 - 18501
Alignment:
Q  113 taatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattga 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  18619 taatgtggttttgaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatactttgcacgcaaagtgtttgataaaatgcctcaatgacaattttattga 18520  T
Q  213 ttatttagttagtttaggt 231  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18519 ttatttagttagtttaggt 18501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 112 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4341 - 4210
Alignment:
Q  112 ataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaattatattg 211  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||    
T  4341 ataatgtggtttttaatggtggcaaaagaacacattttgagtatgtttgatgttttgcacacaaagtgtttgataaagtgccccaatgagaattatattg 4242  T
Q  212 attatttagttagtttaggtgatgaaaatgat 243  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  4241 attattgagttagtttagggtatgaaaatgat 4210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 251270 - 251048
Alignment:
Q  4 gtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgttgcctatgttg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  |   ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    || ||    
T  251270 gtagtttgcatatggttagggtttacgtatgaattggcattttgataattgcatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtagttgatgtaattgatg 251171  T
Q  104 tttaaatcataatgtggctttgaatggtggcaaatgagcacaatttgaatatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatgaaaa 203  Q
    ||| ||  | ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||  ||||||   ||||||||    
T  251170 ttt-aagaagaatgtggttttgaatggtgtcaaattaacacaataagaatatgtttgatattttacacataaagtgattgacaaaatgctcaaatgaaaa 251072  T
Q  204 ttatattgattatttagttagttt 227  Q
    ||  |||||||||||| |||||||    
T  251071 ttgcattgattatttacttagttt 251048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 200
Target Start/End: Original strand, 246180 - 246228
Alignment:
Q  152 atatgttttatactttgcacacaaagtgtttgatcaaatgcctcaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  246180 atatgttttatactttgcacccaaagtgtttgataaaatgcctaaatga 246228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 40832 - 40746
Alignment:
Q  2 gagtagtttgcatgtggttagggttgattttaaaattgacaatttgatgattacatgtgtagtttatgaattgataaatgaatgtag 88  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||     |||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40832 gagtagtttgcatgtggttaggttttataaatgaattgacaatttcatcattgcatgtgtagtttatgtattgataaatgaatgtag 40746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University