View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3639_low_17 (Length: 391)

Name: NF3639_low_17
Description: NF3639
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3639_low_17
NF3639_low_17
[»] chr3 (172 HSPs)
chr3 (18-361)||(14966237-14966576)
chr3 (74-361)||(52989492-52989774)
chr3 (18-367)||(16643234-16643579)
chr3 (19-344)||(43550156-43550477)
chr3 (18-344)||(50242985-50243307)
chr3 (170-361)||(324303-324490)
chr3 (18-357)||(10833817-10834151)
chr3 (40-362)||(15465142-15465453)
chr3 (40-362)||(5223371-5223682)
chr3 (18-357)||(14763439-14763774)
chr3 (18-357)||(23371185-23371520)
chr3 (18-357)||(51300634-51300969)
chr3 (164-361)||(21837493-21837685)
chr3 (18-234)||(24152922-24153138)
chr3 (18-354)||(8928143-8928474)
chr3 (18-189)||(41930-42101)
chr3 (18-166)||(53646538-53646686)
chr3 (18-201)||(6158789-6158971)
chr3 (164-352)||(13919408-13919591)
chr3 (18-189)||(35961365-35961536)
chr3 (18-309)||(9533416-9533703)
chr3 (18-168)||(40807420-40807570)
chr3 (18-168)||(54875961-54876111)
chr3 (19-184)||(37038226-37038391)
chr3 (18-194)||(2248448-2248624)
chr3 (18-189)||(13029754-13029925)
chr3 (18-181)||(14642028-14642191)
chr3 (18-232)||(10989281-10989495)
chr3 (18-168)||(11192505-11192655)
chr3 (18-168)||(17538531-17538681)
chr3 (18-168)||(17693492-17693642)
chr3 (18-168)||(35065059-35065208)
chr3 (18-168)||(44273898-44274048)
chr3 (18-167)||(40812258-40812407)
chr3 (18-166)||(17044392-17044540)
chr3 (18-189)||(6805439-6805610)
chr3 (18-189)||(13026162-13026333)
chr3 (18-168)||(3803259-3803409)
chr3 (18-168)||(5206132-5206282)
chr3 (18-168)||(14441592-14441742)
chr3 (18-168)||(14508272-14508421)
chr3 (18-216)||(16979287-16979484)
chr3 (18-168)||(35354023-35354173)
chr3 (240-367)||(54876322-54876445)
chr3 (18-166)||(33564555-33564703)
chr3 (18-161)||(10541936-10542079)
chr3 (18-201)||(12275941-12276123)
chr3 (18-168)||(15931985-15932135)
chr3 (18-168)||(17519351-17519501)
chr3 (18-168)||(17534213-17534363)
chr3 (164-350)||(12378003-12378184)
chr3 (18-194)||(1988710-1988885)
chr3 (18-201)||(3394480-3394662)
chr3 (18-161)||(12511279-12511422)
chr3 (18-161)||(14671255-14671398)
chr3 (18-168)||(41172848-41172999)
chr3 (18-161)||(43889277-43889420)
chr3 (18-168)||(22307061-22307211)
chr3 (19-168)||(2841942-2842090)
chr3 (261-362)||(12339773-12339874)
chr3 (261-357)||(10542384-10542480)
chr3 (18-194)||(11913119-11913295)
chr3 (261-361)||(14179439-14179539)
chr3 (261-357)||(14670995-14671091)
chr3 (261-361)||(43889578-43889678)
chr3 (18-168)||(13519706-13519857)
chr3 (18-165)||(17670187-17670334)
chr3 (18-165)||(17685321-17685468)
chr3 (18-161)||(18699951-18700094)
chr3 (164-346)||(316202-316381)
chr3 (18-164)||(20248462-20248608)
chr3 (18-168)||(50351478-50351628)
chr3 (18-195)||(6819507-6819683)
chr3 (166-352)||(9577700-9577882)
chr3 (18-191)||(10554668-10554841)
chr3 (36-181)||(10563120-10563265)
chr3 (261-361)||(12469969-12470069)
chr3 (261-357)||(14682494-14682590)
chr3 (261-361)||(16796554-16796654)
chr3 (18-201)||(179185-179367)
chr3 (18-161)||(12470233-12470376)
chr3 (19-181)||(42324700-42324862)
chr3 (240-361)||(17691644-17691760)
chr3 (261-361)||(18700259-18700359)
chr3 (18-181)||(18367236-18367399)
chr3 (18-164)||(38311481-38311628)
chr3 (18-168)||(43928775-43928925)
chr3 (21-201)||(13522891-13523071)
chr3 (18-191)||(55292119-55292292)
chr3 (18-167)||(49900153-49900310)
chr3 (19-130)||(14567691-14567802)
chr3 (18-162)||(17513010-17513154)
chr3 (73-168)||(11258891-11258986)
chr3 (18-189)||(16325019-16325190)
chr3 (259-334)||(44494901-44494976)
chr3 (18-168)||(50348504-50348654)
chr3 (259-367)||(28194754-28194863)
chr3 (18-194)||(31224431-31224608)
chr3 (164-355)||(15246093-15246281)
chr3 (36-207)||(18889749-18889920)
chr3 (259-372)||(37427772-37427885)
chr3 (204-349)||(23318615-23318754)
chr3 (18-168)||(14152877-14153027)
chr3 (18-168)||(14519687-14519836)
chr3 (164-334)||(15207032-15207199)
chr3 (18-188)||(22652236-22652405)
chr3 (18-162)||(19443941-19444085)
chr3 (40-156)||(26055128-26055244)
chr3 (164-355)||(15265214-15265402)
chr3 (164-351)||(32402819-32403002)
chr3 (291-364)||(3264997-3265070)
chr3 (296-361)||(11914003-11914068)
chr3 (291-364)||(36527809-36527882)
chr3 (74-161)||(14682754-14682841)
chr3 (18-168)||(6156130-6156279)
chr3 (18-168)||(50755860-50756009)
chr3 (18-87)||(17046631-17046700)
chr3 (20-149)||(18893067-18893196)
chr3 (270-354)||(34852617-34852701)
chr3 (18-168)||(9511644-9511793)
chr3 (18-168)||(9519619-9519768)
chr3 (18-168)||(17207766-17207915)
chr3 (286-347)||(38311759-38311820)
chr3 (119-207)||(18892975-18893063)
chr3 (269-355)||(14568921-14569007)
chr3 (18-168)||(15565938-15566087)
chr3 (18-168)||(25104680-25104829)
chr3 (18-168)||(24546261-24546414)
chr3 (171-345)||(52523593-52523763)
chr3 (112-168)||(19568940-19568996)
chr3 (85-168)||(42353218-42353302)
chr3 (311-362)||(15964944-15964995)
chr3 (311-362)||(15968868-15968919)
chr3 (311-362)||(15972792-15972843)
chr3 (286-347)||(20248741-20248803)
chr3 (18-168)||(54330784-54330933)
chr3 (18-83)||(5215156-5215221)
chr3 (311-362)||(11854708-11854759)
chr3 (18-93)||(18739394-18739469)
chr3 (311-358)||(19775744-19775791)
chr3 (18-168)||(12952466-12952615)
chr3 (169-300)||(29172491-29172618)
chr3 (208-345)||(2051102-2051235)
chr3 (311-362)||(4107480-4107531)
chr3 (311-362)||(4111332-4111383)
chr3 (311-362)||(7109673-7109724)
chr3 (311-362)||(7113608-7113659)
chr3 (311-362)||(11070043-11070094)
chr3 (311-362)||(11165612-11165663)
chr3 (311-362)||(15617349-15617400)
chr3 (18-93)||(17938025-17938100)
chr3 (311-362)||(22321639-22321690)
chr3 (311-362)||(22336694-22336745)
chr3 (311-362)||(27409727-27409778)
chr3 (311-362)||(28949699-28949750)
chr3 (311-362)||(30065921-30065972)
chr3 (311-362)||(37439719-37439770)
chr3 (311-362)||(55022842-55022893)
chr3 (317-362)||(4588862-4588907)
chr3 (169-234)||(21618627-21618692)
chr3 (169-234)||(36166776-36166841)
chr3 (315-352)||(54520977-54521014)
chr3 (276-356)||(43926034-43926114)
chr3 (164-210)||(37427930-37427976)
chr3 (315-344)||(12567723-12567752)
chr3 (315-344)||(13544188-13544217)
chr3 (281-354)||(14647688-14647760)
chr3 (164-201)||(16059622-16059659)
chr3 (315-352)||(29544812-29544849)
chr3 (18-67)||(51603078-51603127)
chr3 (330-362)||(11300532-11300564)
chr3 (204-232)||(23274882-23274910)
[»] chr8 (127 HSPs)
chr8 (18-367)||(19808075-19808420)
chr8 (18-363)||(22237732-22238073)
chr8 (18-363)||(17460765-17461106)
chr8 (18-344)||(25483952-25484274)
chr8 (40-362)||(14397604-14397915)
chr8 (18-201)||(39695006-39695188)
chr8 (18-201)||(41680612-41680795)
chr8 (18-189)||(11775125-11775296)
chr8 (22-201)||(15635662-15635840)
chr8 (18-189)||(19882371-19882542)
chr8 (164-356)||(20533267-20533455)
chr8 (18-232)||(364148-364362)
chr8 (166-355)||(16799561-16799748)
chr8 (188-355)||(23943876-23944039)
chr8 (164-356)||(19154744-19154932)
chr8 (19-168)||(6102232-6102381)
chr8 (18-194)||(20454638-20454813)
chr8 (18-166)||(22207693-22207841)
chr8 (164-357)||(37515778-37515967)
chr8 (167-345)||(17439367-17439541)
chr8 (231-357)||(23659480-23659602)
chr8 (18-166)||(6573534-6573682)
chr8 (20-168)||(19140189-19140337)
chr8 (18-166)||(42818385-42818533)
chr8 (164-347)||(14103083-14103262)
chr8 (18-165)||(18833898-18834045)
chr8 (18-310)||(27941367-27941655)
chr8 (18-168)||(5760957-5761107)
chr8 (18-168)||(18024173-18024323)
chr8 (18-168)||(20178999-20179149)
chr8 (18-168)||(21861098-21861248)
chr8 (18-216)||(26454087-26454285)
chr8 (18-232)||(44522904-44523118)
chr8 (18-194)||(23478478-23478654)
chr8 (36-232)||(44432221-44432417)
chr8 (18-232)||(17795592-17795806)
chr8 (18-168)||(39936489-39936638)
chr8 (261-362)||(25363154-25363255)
chr8 (18-194)||(20455395-20455570)
chr8 (18-194)||(20460373-20460548)
chr8 (164-345)||(40492711-40492887)
chr8 (18-168)||(361690-361840)
chr8 (18-216)||(19880205-19880402)
chr8 (18-168)||(32950025-32950175)
chr8 (18-167)||(17437796-17437945)
chr8 (18-166)||(5082690-5082838)
chr8 (18-181)||(21579685-21579848)
chr8 (70-188)||(8414240-8414358)
chr8 (166-357)||(20501962-20502149)
chr8 (20-164)||(44476851-44476996)
chr8 (20-164)||(44480113-44480258)
chr8 (18-194)||(42560006-42560181)
chr8 (18-164)||(8728415-8728561)
chr8 (164-357)||(17086012-17086201)
chr8 (18-168)||(20084116-20084266)
chr8 (18-160)||(38185564-38185706)
chr8 (19-161)||(39363955-39364097)
chr8 (42-172)||(23914344-23914473)
chr8 (164-354)||(22253024-22253210)
chr8 (164-353)||(23667885-23668071)
chr8 (18-201)||(42266073-42266252)
chr8 (166-346)||(22995927-22996104)
chr8 (259-364)||(17438166-17438272)
chr8 (47-167)||(17501350-17501470)
chr8 (295-361)||(23409864-23409930)
chr8 (259-357)||(5083103-5083202)
chr8 (259-357)||(18833635-18833733)
chr8 (18-168)||(20517596-20517745)
chr8 (19-168)||(21321819-21321968)
chr8 (18-181)||(29763347-29763510)
chr8 (18-168)||(18816940-18817089)
chr8 (18-172)||(22258782-22258935)
chr8 (18-168)||(22344466-22344615)
chr8 (18-168)||(22356126-22356275)
chr8 (18-168)||(22483171-22483320)
chr8 (19-168)||(21326417-21326566)
chr8 (261-357)||(22963364-22963461)
chr8 (285-357)||(23914110-23914183)
chr8 (18-168)||(18815301-18815450)
chr8 (164-287)||(22525659-22525778)
chr8 (19-168)||(4381272-4381420)
chr8 (19-168)||(36305083-36305231)
chr8 (261-315)||(21346185-21346239)
chr8 (18-172)||(38988886-38989039)
chr8 (18-172)||(39019983-39020136)
chr8 (26-119)||(23660688-23660781)
chr8 (286-347)||(44476753-44476814)
chr8 (286-347)||(44480015-44480076)
chr8 (86-161)||(21345945-21346020)
chr8 (166-344)||(28397635-28397809)
chr8 (18-93)||(36733002-36733077)
chr8 (18-172)||(23670069-23670222)
chr8 (18-172)||(36405538-36405691)
chr8 (296-361)||(16401983-16402054)
chr8 (296-344)||(19936956-19937004)
chr8 (311-362)||(18862728-18862779)
chr8 (311-362)||(21410922-21410973)
chr8 (311-362)||(21805414-21805465)
chr8 (311-362)||(21828097-21828148)
chr8 (278-352)||(35026831-35026903)
chr8 (262-345)||(37116434-37116517)
chr8 (18-168)||(17978895-17979044)
chr8 (18-93)||(21399209-21399284)
chr8 (18-93)||(21793702-21793777)
chr8 (262-352)||(22419367-22419455)
chr8 (275-344)||(2418839-2418906)
chr8 (286-347)||(8728620-8728682)
chr8 (53-168)||(18118677-18118792)
chr8 (311-362)||(19278366-19278417)
chr8 (311-362)||(21972668-21972719)
chr8 (311-362)||(21976753-21976804)
chr8 (18-165)||(24907203-24907348)
chr8 (311-362)||(43251785-43251836)
chr8 (315-357)||(1327013-1327055)
chr8 (19-89)||(21513823-21513892)
chr8 (18-168)||(22474176-22474325)
chr8 (289-330)||(21346241-21346282)
chr8 (169-234)||(26222945-26223010)
chr8 (262-345)||(17266945-17267028)
chr8 (143-181)||(23410018-23410056)
chr8 (278-319)||(18024465-18024506)
chr8 (281-354)||(21329104-21329176)
chr8 (281-354)||(21967540-21967612)
chr8 (276-345)||(22364748-22364816)
chr8 (281-354)||(34950622-34950694)
chr8 (128-164)||(18122327-18122363)
chr8 (164-212)||(22381593-22381641)
[»] chr4 (112 HSPs)
chr4 (18-361)||(10056707-10057046)
chr4 (18-344)||(23802942-23803264)
chr4 (18-336)||(630381-630695)
chr4 (18-344)||(12611106-12611425)
chr4 (18-344)||(51463545-51463867)
chr4 (18-357)||(18212805-18213140)
chr4 (36-357)||(24047030-24047347)
chr4 (164-356)||(17333352-17333542)
chr4 (18-189)||(28385646-28385817)
chr4 (18-201)||(9638399-9638581)
chr4 (18-201)||(10704890-10705072)
chr4 (18-201)||(10918660-10918842)
chr4 (18-168)||(53630951-53631101)
chr4 (164-357)||(13591785-13591974)
chr4 (164-357)||(32306854-32307043)
chr4 (18-181)||(15447894-15448057)
chr4 (164-346)||(14825551-14825730)
chr4 (18-216)||(15008342-15008540)
chr4 (18-192)||(15990439-15990613)
chr4 (18-168)||(25091077-25091227)
chr4 (18-168)||(42875223-42875373)
chr4 (18-232)||(56115314-56115528)
chr4 (18-166)||(11479089-11479237)
chr4 (18-189)||(10694725-10694896)
chr4 (18-189)||(10908491-10908662)
chr4 (18-168)||(3337523-3337673)
chr4 (18-168)||(10356914-10357064)
chr4 (18-168)||(19609748-19609898)
chr4 (18-168)||(35660270-35660420)
chr4 (18-216)||(40619907-40620104)
chr4 (42-187)||(15883917-15884062)
chr4 (170-356)||(26050340-26050521)
chr4 (18-166)||(9923622-9923770)
chr4 (18-166)||(37019095-37019243)
chr4 (18-168)||(14549050-14549200)
chr4 (18-232)||(33849102-33849316)
chr4 (18-167)||(15114648-15114796)
chr4 (261-361)||(17048086-17048186)
chr4 (18-168)||(19435175-19435326)
chr4 (18-181)||(33186312-33186475)
chr4 (18-168)||(16997954-16998099)
chr4 (52-168)||(11425379-11425495)
chr4 (259-355)||(16043087-16043183)
chr4 (18-168)||(33243774-33243924)
chr4 (18-156)||(3485347-3485482)
chr4 (18-124)||(15011991-15012097)
chr4 (18-191)||(16277805-16277978)
chr4 (18-191)||(53387415-53387588)
chr4 (164-357)||(14852734-14852924)
chr4 (18-168)||(14630250-14630400)
chr4 (271-370)||(40907131-40907230)
chr4 (18-172)||(44024082-44024235)
chr4 (47-167)||(15214552-15214672)
chr4 (259-357)||(15041911-15042010)
chr4 (259-357)||(15112414-15112513)
chr4 (259-370)||(40906974-40907084)
chr4 (98-232)||(43251120-43251255)
chr4 (18-168)||(19566397-19566546)
chr4 (100-201)||(9871126-9871226)
chr4 (296-361)||(14746570-14746635)
chr4 (166-346)||(15791857-15792034)
chr4 (171-345)||(52243059-52243230)
chr4 (18-172)||(40229723-40229877)
chr4 (18-160)||(10237976-10238117)
chr4 (18-172)||(15344297-15344449)
chr4 (270-354)||(4831496-4831580)
chr4 (270-354)||(4834791-4834875)
chr4 (270-354)||(14047715-14047799)
chr4 (166-326)||(26789441-26789598)
chr4 (19-172)||(46740619-46740771)
chr4 (297-364)||(14185045-14185112)
chr4 (18-169)||(45314815-45314965)
chr4 (270-363)||(30146453-30146546)
chr4 (283-356)||(26045268-26045340)
chr4 (18-93)||(16026407-16026482)
chr4 (95-165)||(13036332-13036402)
chr4 (18-168)||(25513167-25513316)
chr4 (18-168)||(26445309-26445458)
chr4 (18-80)||(55582703-55582765)
chr4 (18-79)||(18108356-18108417)
chr4 (36-172)||(12622792-12622927)
chr4 (36-168)||(14508186-14508317)
chr4 (311-362)||(12487683-12487734)
chr4 (311-362)||(14954250-14954301)
chr4 (311-362)||(25689842-25689893)
chr4 (311-362)||(27533998-27534049)
chr4 (317-362)||(10712828-10712873)
chr4 (317-362)||(10926598-10926643)
chr4 (315-367)||(19857584-19857636)
chr4 (18-168)||(2425099-2425248)
chr4 (169-255)||(54798627-54798713)
chr4 (315-352)||(49547744-49547781)
chr4 (18-166)||(20595909-20596056)
chr4 (311-362)||(4561417-4561468)
chr4 (311-362)||(5757021-5757072)
chr4 (311-362)||(9556502-9556553)
chr4 (172-255)||(14280474-14280557)
chr4 (311-362)||(14757505-14757556)
chr4 (311-362)||(33742350-33742401)
chr4 (315-357)||(15497041-15497083)
chr4 (315-352)||(14048732-14048769)
chr4 (123-168)||(26922254-26922299)
chr4 (315-352)||(36038025-36038062)
chr4 (315-364)||(52873148-52873197)
chr4 (311-355)||(17810251-17810295)
chr4 (203-300)||(44928821-44928914)
chr4 (169-234)||(8574742-8574807)
chr4 (106-167)||(12134425-12134486)
chr4 (315-352)||(15534336-15534373)
chr4 (18-91)||(19081819-19081892)
chr4 (203-248)||(20157189-20157234)
chr4 (203-232)||(44102404-44102433)
[»] chr2 (95 HSPs)
chr2 (18-367)||(27472482-27472827)
chr2 (18-357)||(34873925-34874260)
chr2 (18-357)||(18358447-18358781)
chr2 (18-361)||(21081449-21081788)
chr2 (18-344)||(22173506-22173828)
chr2 (18-357)||(9241999-9242334)
chr2 (18-357)||(19662133-19662468)
chr2 (40-362)||(31345184-31345495)
chr2 (20-357)||(21073207-21073540)
chr2 (18-213)||(34858863-34859058)
chr2 (18-357)||(6260856-6261192)
chr2 (18-189)||(21915025-21915196)
chr2 (36-168)||(23969119-23969251)
chr2 (18-168)||(9975353-9975503)
chr2 (70-357)||(30643811-30644094)
chr2 (18-168)||(36839595-36839745)
chr2 (18-200)||(41301451-41301633)
chr2 (18-189)||(26903561-26903732)
chr2 (18-168)||(24781318-24781468)
chr2 (18-168)||(27484948-27485098)
chr2 (18-168)||(5031608-5031758)
chr2 (18-172)||(20915525-20915679)
chr2 (18-232)||(23338878-23339092)
chr2 (18-176)||(25183603-25183761)
chr2 (166-364)||(34137006-34137200)
chr2 (19-167)||(19201680-19201828)
chr2 (164-357)||(26392455-26392643)
chr2 (18-168)||(17306911-17307061)
chr2 (18-168)||(24273737-24273887)
chr2 (18-167)||(21368532-21368681)
chr2 (18-194)||(24883785-24883960)
chr2 (18-161)||(9785013-9785156)
chr2 (18-161)||(23068928-23069071)
chr2 (18-201)||(31520509-31520691)
chr2 (18-168)||(43707763-43707912)
chr2 (18-183)||(18388775-18388940)
chr2 (18-181)||(10039612-10039775)
chr2 (237-361)||(23069215-23069335)
chr2 (164-356)||(23287438-23287625)
chr2 (19-161)||(28652981-28653123)
chr2 (20-164)||(6482946-6483091)
chr2 (20-164)||(6486413-6486558)
chr2 (164-345)||(23004835-23005012)
chr2 (18-168)||(24515610-24515760)
chr2 (18-174)||(20590800-20590956)
chr2 (261-357)||(9784754-9784848)
chr2 (20-232)||(28349268-28349489)
chr2 (164-345)||(20520051-20520227)
chr2 (259-366)||(21237816-21237924)
chr2 (76-191)||(2524265-2524380)
chr2 (259-364)||(19201924-19202030)
chr2 (164-355)||(18546803-18546991)
chr2 (296-361)||(23707275-23707340)
chr2 (296-361)||(24918179-24918244)
chr2 (164-308)||(22412994-22413134)
chr2 (86-201)||(22501260-22501374)
chr2 (86-201)||(22509194-22509308)
chr2 (166-345)||(24697467-24697641)
chr2 (296-361)||(24681483-24681548)
chr2 (296-360)||(24671065-24671129)
chr2 (18-168)||(21316140-21316289)
chr2 (18-172)||(22690101-22690254)
chr2 (18-168)||(29113786-29113935)
chr2 (18-168)||(22332142-22332290)
chr2 (18-172)||(22694697-22694850)
chr2 (270-354)||(22703174-22703258)
chr2 (18-168)||(21335931-21336080)
chr2 (18-168)||(23609901-23610050)
chr2 (286-347)||(6482838-6482899)
chr2 (286-347)||(6486305-6486366)
chr2 (36-168)||(22686264-22686395)
chr2 (311-362)||(1283361-1283412)
chr2 (311-362)||(30345074-30345125)
chr2 (311-362)||(41531087-41531138)
chr2 (270-354)||(13101597-13101682)
chr2 (262-346)||(43947324-43947408)
chr2 (296-344)||(24642807-24642855)
chr2 (18-93)||(1384164-1384239)
chr2 (18-93)||(25587165-25587240)
chr2 (208-300)||(23708521-23708609)
chr2 (123-168)||(24841377-24841422)
chr2 (311-362)||(12901595-12901646)
chr2 (311-362)||(24628562-24628613)
chr2 (311-362)||(24649329-24649380)
chr2 (311-362)||(27379516-27379567)
chr2 (311-362)||(27383562-27383613)
chr2 (311-362)||(27601768-27601819)
chr2 (139-189)||(34492091-34492141)
chr2 (62-167)||(22786819-22786924)
chr2 (311-355)||(10101728-10101772)
chr2 (326-364)||(22459579-22459617)
chr2 (315-352)||(10684735-10684772)
chr2 (315-352)||(20261374-20261411)
chr2 (18-47)||(40911868-40911897)
chr2 (166-210)||(43947232-43947276)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (18-364)||(225-567)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (18-361)||(67330-67668)
scaffold0032 (18-92)||(62448-62522)
scaffold0032 (26-167)||(116891-117032)
[»] chr7 (177 HSPs)
chr7 (52-361)||(14273583-14273888)
chr7 (94-361)||(46580464-46580727)
chr7 (18-357)||(16998665-16999006)
chr7 (18-344)||(13647492-13647816)
chr7 (39-362)||(13918266-13918578)
chr7 (18-357)||(18872399-18872734)
chr7 (18-364)||(16008610-16008952)
chr7 (20-357)||(11661345-11661677)
chr7 (40-362)||(25926993-25927301)
chr7 (18-357)||(14566241-14566576)
chr7 (18-357)||(18607526-18607861)
chr7 (181-362)||(1858707-1858884)
chr7 (18-234)||(18456126-18456342)
chr7 (164-344)||(9177524-9177700)
chr7 (18-357)||(14422023-14422359)
chr7 (164-355)||(17017326-17017513)
chr7 (18-189)||(709033-709204)
chr7 (18-189)||(48812241-48812412)
chr7 (18-168)||(14415962-14416112)
chr7 (164-357)||(17060282-17060472)
chr7 (18-189)||(14191564-14191735)
chr7 (19-194)||(30820735-30820910)
chr7 (18-194)||(58896-59071)
chr7 (18-189)||(14188770-14188941)
chr7 (18-189)||(16462439-16462610)
chr7 (18-189)||(32160680-32160851)
chr7 (19-201)||(8756875-8757056)
chr7 (237-364)||(32301353-32301476)
chr7 (18-168)||(46386565-46386715)
chr7 (19-168)||(12371699-12371848)
chr7 (18-166)||(15119773-15119921)
chr7 (18-189)||(47975389-47975560)
chr7 (18-168)||(13745254-13745404)
chr7 (18-168)||(19282516-19282666)
chr7 (18-310)||(147704-147992)
chr7 (18-161)||(16460410-16460553)
chr7 (18-181)||(47094491-47094654)
chr7 (18-168)||(13147950-13148100)
chr7 (18-168)||(13745678-13745828)
chr7 (18-216)||(16550482-16550679)
chr7 (18-216)||(16614983-16615180)
chr7 (18-168)||(44374370-44374520)
chr7 (18-168)||(44383235-44383385)
chr7 (18-167)||(8851637-8851786)
chr7 (261-361)||(16460717-16460817)
chr7 (18-161)||(16580091-16580234)
chr7 (18-161)||(16585429-16585572)
chr7 (18-168)||(11066892-11067042)
chr7 (18-168)||(12465738-12465888)
chr7 (18-164)||(15167403-15167549)
chr7 (18-172)||(32434067-32434221)
chr7 (18-194)||(36685727-36685904)
chr7 (18-194)||(12755184-12755359)
chr7 (259-367)||(14157054-14157162)
chr7 (261-361)||(14258519-14258619)
chr7 (261-361)||(16579827-16579927)
chr7 (261-361)||(16585736-16585836)
chr7 (37-168)||(14928829-14928960)
chr7 (37-168)||(15352295-15352426)
chr7 (18-181)||(17070771-17070934)
chr7 (259-364)||(10501373-10501478)
chr7 (36-161)||(14258783-14258908)
chr7 (20-181)||(40555223-40555384)
chr7 (166-364)||(42462015-42462209)
chr7 (184-346)||(48991266-48991422)
chr7 (18-194)||(832501-832676)
chr7 (18-194)||(1197681-1197856)
chr7 (18-201)||(4325448-4325630)
chr7 (18-201)||(13699367-13699549)
chr7 (164-344)||(16091844-16092019)
chr7 (18-164)||(10896472-10896618)
chr7 (38-168)||(12127662-12127792)
chr7 (170-357)||(16996295-16996477)
chr7 (18-195)||(13408170-13408346)
chr7 (19-184)||(34957579-34957744)
chr7 (18-174)||(15213917-15214073)
chr7 (261-357)||(20487614-20487710)
chr7 (18-194)||(37727405-37727580)
chr7 (41-168)||(20585780-20585907)
chr7 (18-168)||(33001338-33001488)
chr7 (18-191)||(17505482-17505655)
chr7 (18-191)||(17547559-17547732)
chr7 (36-168)||(13894519-13894651)
chr7 (18-161)||(32301613-32301756)
chr7 (18-140)||(12323408-12323530)
chr7 (259-357)||(38519445-38519543)
chr7 (36-354)||(38828304-38828617)
chr7 (18-168)||(48743727-48743877)
chr7 (164-320)||(9725518-9725670)
chr7 (164-353)||(11768777-11768964)
chr7 (170-356)||(130680-130864)
chr7 (18-164)||(20619714-20619860)
chr7 (18-200)||(29004214-29004396)
chr7 (203-308)||(2529951-2530052)
chr7 (164-364)||(9033204-9033401)
chr7 (237-346)||(14929152-14929257)
chr7 (237-346)||(15352618-15352723)
chr7 (36-160)||(32771760-32771884)
chr7 (182-357)||(11525440-11525612)
chr7 (18-172)||(14153450-14153603)
chr7 (259-364)||(20619446-20619552)
chr7 (164-252)||(14044922-14045010)
chr7 (164-252)||(14354952-14355040)
chr7 (164-345)||(15008357-15008533)
chr7 (285-361)||(15720064-15720140)
chr7 (47-167)||(28719885-28720005)
chr7 (19-168)||(18875325-18875474)
chr7 (18-117)||(29052633-29052732)
chr7 (63-161)||(20487874-20487972)
chr7 (296-361)||(8940318-8940383)
chr7 (164-237)||(14036387-14036460)
chr7 (164-237)||(14346417-14346490)
chr7 (18-172)||(8514224-8514377)
chr7 (18-195)||(13864873-13865040)
chr7 (184-356)||(1867874-1868040)
chr7 (18-168)||(39292215-39292364)
chr7 (270-354)||(837317-837401)
chr7 (270-354)||(1202497-1202581)
chr7 (270-354)||(16109474-16109558)
chr7 (296-356)||(38898181-38898241)
chr7 (18-168)||(43277221-43277372)
chr7 (18-168)||(4691374-4691523)
chr7 (18-168)||(24270460-24270609)
chr7 (270-354)||(833321-833405)
chr7 (270-354)||(1198501-1198585)
chr7 (18-167)||(3192771-3192920)
chr7 (286-347)||(10896687-10896748)
chr7 (19-168)||(14161334-14161482)
chr7 (286-347)||(15167285-15167346)
chr7 (19-91)||(15720250-15720322)
chr7 (18-168)||(20252820-20252969)
chr7 (18-168)||(21538667-21538816)
chr7 (18-167)||(15978534-15978682)
chr7 (18-166)||(9743559-9743706)
chr7 (277-356)||(18203887-18203965)
chr7 (311-362)||(45170089-45170140)
chr7 (18-168)||(48213423-48213572)
chr7 (296-344)||(15081900-15081948)
chr7 (112-168)||(15720200-15720256)
chr7 (18-93)||(3287489-3287564)
chr7 (18-93)||(18080196-18080271)
chr7 (311-362)||(18279375-18279426)
chr7 (311-362)||(18283338-18283389)
chr7 (40-102)||(1857092-1857154)
chr7 (18-172)||(3136715-3136868)
chr7 (314-364)||(8468783-8468833)
chr7 (38-168)||(15576329-15576458)
chr7 (18-168)||(25941862-25942011)
chr7 (315-364)||(14270032-14270081)
chr7 (208-345)||(2280021-2280155)
chr7 (311-362)||(33079-33130)
chr7 (311-362)||(70848-70899)
chr7 (311-362)||(74957-75008)
chr7 (311-362)||(12704742-12704793)
chr7 (311-362)||(12714836-12714887)
chr7 (311-362)||(12718640-12718691)
chr7 (311-362)||(12723551-12723602)
chr7 (311-362)||(16907284-16907335)
chr7 (311-362)||(26292367-26292418)
chr7 (311-362)||(39722238-39722289)
chr7 (169-255)||(48273550-48273636)
chr7 (171-345)||(12255657-12255827)
chr7 (281-354)||(13892670-13892742)
chr7 (262-345)||(20220142-20220222)
chr7 (123-168)||(21675491-21675536)
chr7 (311-355)||(16114220-16114264)
chr7 (311-355)||(16117373-16117417)
chr7 (18-66)||(46580402-46580450)
chr7 (18-168)||(8564069-8564218)
chr7 (111-156)||(1858644-1858689)
chr7 (315-352)||(11303402-11303439)
chr7 (327-364)||(15113009-15113046)
chr7 (315-352)||(16108659-16108696)
chr7 (315-352)||(23664923-23664960)
chr7 (315-352)||(29796763-29796800)
chr7 (315-352)||(29800582-29800619)
chr7 (281-354)||(34957416-34957488)
[»] chr5 (83 HSPs)
chr5 (18-357)||(6765901-6766235)
chr5 (18-360)||(30138642-30138979)
chr5 (18-356)||(29448078-29448412)
chr5 (18-234)||(22412365-22412580)
chr5 (18-357)||(37598595-37598930)
chr5 (18-364)||(42960608-42960951)
chr5 (18-357)||(28370734-28371069)
chr5 (18-234)||(18418770-18418986)
chr5 (18-201)||(24277084-24277266)
chr5 (18-201)||(24384947-24385129)
chr5 (18-189)||(33473042-33473213)
chr5 (18-194)||(17812795-17812970)
chr5 (166-357)||(25576716-25576902)
chr5 (18-189)||(263260-263431)
chr5 (18-168)||(20565978-20566128)
chr5 (19-165)||(21399482-21399628)
chr5 (18-168)||(41876071-41876221)
chr5 (18-166)||(8833677-8833824)
chr5 (164-357)||(23469876-23470064)
chr5 (18-166)||(26761827-26761975)
chr5 (18-216)||(17011102-17011300)
chr5 (18-168)||(19921058-19921208)
chr5 (18-168)||(20198066-20198216)
chr5 (166-357)||(25574330-25574516)
chr5 (166-357)||(25575523-25575709)
chr5 (18-168)||(32607803-32607953)
chr5 (261-357)||(22107386-22107482)
chr5 (20-164)||(22750372-22750516)
chr5 (18-194)||(36460368-36460544)
chr5 (18-168)||(36509254-36509405)
chr5 (18-298)||(38145216-38145492)
chr5 (19-181)||(17875410-17875572)
chr5 (164-357)||(26740505-26740693)
chr5 (18-166)||(33895360-33895508)
chr5 (170-357)||(26732698-26732880)
chr5 (18-194)||(21557522-21557699)
chr5 (18-194)||(31456196-31456372)
chr5 (18-168)||(27869053-27869203)
chr5 (20-164)||(19511614-19511759)
chr5 (36-232)||(22758387-22758583)
chr5 (18-174)||(21554856-21555013)
chr5 (164-346)||(21328073-21328252)
chr5 (95-194)||(12122077-12122175)
chr5 (286-357)||(22336640-22336711)
chr5 (286-357)||(22340178-22340249)
chr5 (18-168)||(16062910-16063059)
chr5 (18-164)||(22336748-22336894)
chr5 (259-357)||(21809531-21809629)
chr5 (261-320)||(33895607-33895666)
chr5 (18-168)||(22111024-22111173)
chr5 (18-164)||(22340286-22340432)
chr5 (18-91)||(40917451-40917524)
chr5 (303-362)||(18356264-18356323)
chr5 (275-357)||(21731426-21731509)
chr5 (273-356)||(27988892-27988978)
chr5 (18-168)||(18744074-18744223)
chr5 (270-354)||(10816478-10816562)
chr5 (286-347)||(22750264-22750325)
chr5 (270-354)||(23538504-23538588)
chr5 (169-300)||(18318942-18319068)
chr5 (164-291)||(20572025-20572149)
chr5 (303-362)||(20910910-20910969)
chr5 (18-168)||(1627859-1628008)
chr5 (18-168)||(8504347-8504496)
chr5 (18-168)||(14026286-14026435)
chr5 (18-168)||(16605082-16605231)
chr5 (286-347)||(19511516-19511577)
chr5 (257-356)||(15796494-15796594)
chr5 (18-93)||(23199867-23199942)
chr5 (311-364)||(10753334-10753387)
chr5 (35-168)||(30613937-30614069)
chr5 (123-172)||(26749534-26749583)
chr5 (35-168)||(30611977-30612109)
chr5 (47-167)||(28901346-28901465)
chr5 (47-167)||(28937741-28937860)
chr5 (311-362)||(15236863-15236914)
chr5 (311-362)||(19472803-19472854)
chr5 (311-362)||(20295819-20295870)
chr5 (311-362)||(40723670-40723721)
chr5 (262-356)||(22178172-22178266)
chr5 (317-362)||(15236924-15236969)
chr5 (169-234)||(20765993-20766058)
chr5 (315-352)||(9776513-9776550)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (18-363)||(15809-16147)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (18-361)||(1588-1926)
scaffold0125 (36-168)||(27724-27856)
[»] chr1 (91 HSPs)
chr1 (26-357)||(13881102-13881429)
chr1 (18-338)||(22130543-22130858)
chr1 (55-344)||(45574556-45574841)
chr1 (164-357)||(27653081-27653270)
chr1 (20-367)||(28312577-28312920)
chr1 (18-357)||(20437705-20438041)
chr1 (18-168)||(20588103-20588253)
chr1 (18-168)||(20592641-20592791)
chr1 (18-168)||(14238090-14238240)
chr1 (18-160)||(19676143-19676285)
chr1 (18-168)||(41227182-41227332)
chr1 (18-168)||(51082640-51082790)
chr1 (164-355)||(52940736-52940923)
chr1 (19-168)||(41225930-41226079)
chr1 (18-201)||(21180803-21180985)
chr1 (18-181)||(44822600-44822763)
chr1 (166-357)||(22124358-22124545)
chr1 (18-182)||(50000883-50001048)
chr1 (18-201)||(24815330-24815512)
chr1 (19-201)||(16401060-16401241)
chr1 (18-168)||(21046527-21046677)
chr1 (18-168)||(21239773-21239923)
chr1 (18-201)||(8276470-8276652)
chr1 (18-189)||(46198203-46198374)
chr1 (18-168)||(12710312-12710462)
chr1 (18-168)||(16058792-16058942)
chr1 (166-357)||(21043142-21043329)
chr1 (18-189)||(29764112-29764287)
chr1 (18-160)||(42912482-42912624)
chr1 (18-168)||(7052533-7052684)
chr1 (18-193)||(20031368-20031543)
chr1 (18-201)||(22349980-22350162)
chr1 (18-168)||(38887565-38887716)
chr1 (18-168)||(51323699-51323849)
chr1 (18-201)||(7792330-7792512)
chr1 (18-168)||(20634112-20634263)
chr1 (165-357)||(20958181-20958369)
chr1 (18-232)||(296715-296929)
chr1 (36-354)||(2332706-2333019)
chr1 (18-168)||(4596323-4596473)
chr1 (18-194)||(38057129-38057304)
chr1 (261-361)||(48603521-48603621)
chr1 (18-168)||(45496369-45496520)
chr1 (166-345)||(21533735-21533908)
chr1 (181-357)||(14800602-14800779)
chr1 (181-357)||(14809476-14809653)
chr1 (164-257)||(20345973-20346066)
chr1 (261-357)||(41781542-41781636)
chr1 (19-162)||(23195030-23195173)
chr1 (20-232)||(294396-294617)
chr1 (286-357)||(16372070-16372141)
chr1 (18-168)||(1643020-1643169)
chr1 (18-172)||(14793040-14793193)
chr1 (18-168)||(22823885-22824034)
chr1 (166-324)||(47190707-47190861)
chr1 (262-355)||(48520586-48520679)
chr1 (170-297)||(16093748-16093871)
chr1 (18-168)||(50544276-50544425)
chr1 (270-354)||(32649787-32649871)
chr1 (269-356)||(16381256-16381346)
chr1 (259-321)||(20329118-20329181)
chr1 (260-322)||(11945564-11945626)
chr1 (164-324)||(26065045-26065201)
chr1 (18-164)||(16372178-16372325)
chr1 (272-349)||(635944-636022)
chr1 (18-168)||(24720172-24720321)
chr1 (18-168)||(39060520-39060669)
chr1 (18-172)||(44891869-44892021)
chr1 (171-301)||(16758780-16758906)
chr1 (311-362)||(1925212-1925263)
chr1 (311-362)||(20924226-20924277)
chr1 (311-362)||(23819381-23819432)
chr1 (164-345)||(35260939-35261114)
chr1 (18-168)||(17902240-17902389)
chr1 (281-354)||(29534624-29534697)
chr1 (18-93)||(6833713-6833788)
chr1 (316-367)||(51326855-51326906)
chr1 (18-168)||(18121029-18121178)
chr1 (47-167)||(16655793-16655912)
chr1 (311-362)||(1010695-1010746)
chr1 (311-362)||(20228892-20228943)
chr1 (311-362)||(21407327-21407378)
chr1 (262-345)||(41049988-41050070)
chr1 (262-345)||(50614068-50614151)
chr1 (262-345)||(50621896-50621979)
chr1 (315-357)||(43543201-43543243)
chr1 (164-207)||(48520787-48520830)
chr1 (262-345)||(50686698-50686781)
chr1 (311-362)||(52639513-52639564)
chr1 (163-201)||(42697112-42697150)
chr1 (311-362)||(16375541-16375593)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (18-344)||(269-590)
[»] chr6 (121 HSPs)
chr6 (20-357)||(25619437-25619770)
chr6 (18-357)||(14979100-14979435)
chr6 (21-361)||(15817239-15817573)
chr6 (18-344)||(20556571-20556893)
chr6 (41-362)||(23414952-23415262)
chr6 (39-362)||(27556710-27557022)
chr6 (116-344)||(25754972-25755196)
chr6 (18-357)||(4476897-4477232)
chr6 (164-356)||(33443122-33443307)
chr6 (116-308)||(25752838-25753026)
chr6 (18-201)||(27851394-27851577)
chr6 (18-189)||(23956265-23956436)
chr6 (164-355)||(20224018-20224205)
chr6 (164-355)||(22118002-22118189)
chr6 (18-201)||(20733925-20734107)
chr6 (18-216)||(13764730-13764927)
chr6 (164-357)||(18453255-18453444)
chr6 (18-168)||(7827396-7827546)
chr6 (18-216)||(15173933-15174130)
chr6 (19-201)||(18658598-18658779)
chr6 (18-168)||(19655707-19655857)
chr6 (18-168)||(28947768-28947918)
chr6 (18-166)||(18928149-18928297)
chr6 (18-168)||(31734132-31734280)
chr6 (18-168)||(18708923-18709073)
chr6 (18-172)||(20177166-20177319)
chr6 (18-194)||(611139-611314)
chr6 (36-168)||(27125973-27126105)
chr6 (18-161)||(19773187-19773330)
chr6 (21-168)||(23491652-23491799)
chr6 (21-168)||(23497250-23497397)
chr6 (18-172)||(5834213-5834366)
chr6 (18-168)||(17318600-17318750)
chr6 (18-168)||(18702988-18703138)
chr6 (18-172)||(22158672-22158825)
chr6 (18-168)||(23150745-23150894)
chr6 (18-357)||(23838247-23838573)
chr6 (18-167)||(25601755-25601904)
chr6 (18-194)||(19825967-19826142)
chr6 (18-164)||(27318033-27318179)
chr6 (36-161)||(15705107-15705232)
chr6 (261-361)||(19773494-19773594)
chr6 (261-363)||(15705395-15705497)
chr6 (18-155)||(15891189-15891326)
chr6 (18-194)||(34296747-34296923)
chr6 (164-308)||(18696609-18696749)
chr6 (237-361)||(22806001-22806120)
chr6 (18-162)||(8759994-8760138)
chr6 (18-162)||(8767741-8767885)
chr6 (262-361)||(28103851-28103950)
chr6 (17-179)||(19443757-19443919)
chr6 (18-181)||(29847981-29848146)
chr6 (164-345)||(18706391-18706568)
chr6 (18-127)||(23655804-23655913)
chr6 (18-162)||(25347556-25347700)
chr6 (18-172)||(20182984-20183137)
chr6 (18-172)||(22152854-22153007)
chr6 (18-134)||(1254215-1254331)
chr6 (204-349)||(18896215-18896354)
chr6 (204-349)||(19362507-19362646)
chr6 (259-361)||(20136739-20136840)
chr6 (259-361)||(22196029-22196130)
chr6 (18-179)||(16133148-16133309)
chr6 (18-125)||(755-862)
chr6 (269-354)||(23539045-23539130)
chr6 (18-122)||(25807602-25807706)
chr6 (18-110)||(31022175-31022267)
chr6 (259-357)||(20182866-20182962)
chr6 (259-357)||(22153029-22153125)
chr6 (18-172)||(20411150-20411303)
chr6 (259-357)||(16493219-16493317)
chr6 (262-356)||(18177624-18177719)
chr6 (262-356)||(18199368-18199463)
chr6 (262-356)||(18204152-18204247)
chr6 (18-168)||(18455550-18455699)
chr6 (262-356)||(23076806-23076900)
chr6 (262-356)||(23538884-23538978)
chr6 (18-168)||(25921154-25921303)
chr6 (22-165)||(22556676-22556819)
chr6 (18-167)||(17857170-17857319)
chr6 (259-355)||(23528056-23528150)
chr6 (270-354)||(29416865-29416949)
chr6 (18-165)||(13285136-13285282)
chr6 (18-168)||(32259272-32259420)
chr6 (19-93)||(34141104-34141178)
chr6 (19-93)||(34153720-34153794)
chr6 (262-356)||(35008224-35008318)
chr6 (311-367)||(31477893-31477949)
chr6 (169-300)||(16448435-16448561)
chr6 (311-362)||(16760267-16760318)
chr6 (18-93)||(18585117-18585192)
chr6 (311-362)||(22949080-22949131)
chr6 (311-362)||(22953036-22953087)
chr6 (311-362)||(23871524-23871575)
chr6 (311-362)||(23875480-23875531)
chr6 (18-93)||(29044809-29044884)
chr6 (18-168)||(18398343-18398492)
chr6 (95-167)||(16135519-16135591)
chr6 (318-362)||(18955853-18955897)
chr6 (164-210)||(20078033-20078079)
chr6 (270-354)||(25738457-25738540)
chr6 (311-362)||(8243833-8243884)
chr6 (311-362)||(11566834-11566885)
chr6 (311-362)||(12618927-12618978)
chr6 (311-362)||(14472243-14472294)
chr6 (311-362)||(18917349-18917400)
chr6 (311-362)||(19870562-19870613)
chr6 (311-362)||(22862918-22862969)
chr6 (311-362)||(23395040-23395091)
chr6 (311-362)||(23989892-23989943)
chr6 (204-300)||(8227409-8227501)
chr6 (315-357)||(15875456-15875498)
chr6 (18-172)||(15938704-15938857)
chr6 (281-354)||(7429918-7429990)
chr6 (203-300)||(18456846-18456938)
chr6 (18-65)||(22806276-22806323)
chr6 (203-253)||(25644495-25644545)
chr6 (317-362)||(1644680-1644725)
chr6 (315-352)||(12942356-12942393)
chr6 (281-354)||(14594210-14594282)
chr6 (166-207)||(17229776-17229817)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (18-361)||(486-823)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (18-361)||(105149-105486)
scaffold0023 (18-229)||(162647-162858)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (17-344)||(12221-12544)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (18-361)||(169475-169801)
scaffold0020 (18-167)||(143038-143187)
scaffold0020 (259-357)||(142654-142753)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (18-344)||(82235-82560)
scaffold0037 (317-362)||(80424-80469)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (164-361)||(9943-10136)
scaffold0107 (186-357)||(36253-36420)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (164-364)||(24456-24652)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (18-357)||(110726-111061)
scaffold0026 (18-189)||(21484-21655)
scaffold0026 (18-168)||(146156-146306)
scaffold0026 (18-162)||(124038-124182)
[»] scaffold0117 (2 HSPs)
scaffold0117 (40-362)||(39320-39631)
scaffold0117 (18-68)||(21285-21335)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (40-362)||(31191-31502)
scaffold0051 (18-165)||(64547-64694)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (40-362)||(17641-17952)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (164-344)||(3186-3362)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (18-354)||(9434-9765)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (39-362)||(19951-20263)
scaffold0293 (164-357)||(17575-17764)
[»] scaffold0019 (4 HSPs)
scaffold0019 (18-357)||(132989-133324)
scaffold0019 (37-168)||(29582-29713)
scaffold0019 (18-207)||(133642-133831)
scaffold0019 (237-355)||(29285-29390)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (18-189)||(11100-11271)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (167-336)||(121-286)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (18-189)||(176195-176366)
scaffold0001 (18-185)||(168846-169013)
scaffold0001 (18-193)||(152688-152863)
scaffold0001 (18-181)||(77098-77261)
scaffold0001 (281-354)||(163071-163143)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (18-166)||(10925-11073)
scaffold0371 (36-128)||(17223-17315)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (164-365)||(4555-4752)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (18-249)||(1172-1390)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (18-189)||(3420-3591)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (18-201)||(19122-19304)
[»] scaffold0108 (4 HSPs)
scaffold0108 (18-181)||(5828-5991)
scaffold0108 (19-168)||(7261-7409)
scaffold0108 (302-364)||(3323-3385)
scaffold0108 (164-207)||(3395-3438)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (166-357)||(621-808)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (164-327)||(2285-2444)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (18-168)||(22482-22632)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (18-168)||(455-605)
scaffold0109 (18-166)||(5758-5906)
scaffold0109 (18-229)||(2702-2912)
scaffold0109 (311-362)||(36025-36076)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (18-168)||(78488-78638)
scaffold0047 (164-346)||(22361-22540)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (18-189)||(11985-12156)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (18-168)||(945-1095)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (18-168)||(5191-5341)
scaffold0737 (18-192)||(6155-6330)
[»] scaffold0639 (2 HSPs)
scaffold0639 (18-164)||(7067-7213)
scaffold0639 (259-357)||(7438-7537)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (18-168)||(7863-8013)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (18-216)||(5835-6032)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (184-364)||(10539-10715)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (18-166)||(7401-7549)
scaffold0546 (120-168)||(11219-11267)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (18-310)||(2205-2493)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (18-168)||(22269-22419)
scaffold0080 (18-200)||(29124-29306)
scaffold0080 (18-200)||(34589-34771)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (18-168)||(58172-58322)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (18-168)||(15064-15214)
scaffold0061 (18-168)||(24122-24272)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (164-346)||(13979-14158)
scaffold0005 (18-168)||(186983-187133)
[»] scaffold1539 (2 HSPs)
scaffold1539 (18-167)||(1332-1481)
scaffold1539 (259-364)||(1004-1110)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (18-178)||(8478-8638)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (18-166)||(1130-1278)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (164-324)||(3701-3857)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (18-181)||(3117-3280)
[»] scaffold0575 (2 HSPs)
scaffold0575 (18-161)||(5804-5947)
scaffold0575 (261-357)||(6111-6207)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (18-165)||(8781-8928)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (164-347)||(520-699)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (18-189)||(70306-70477)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (18-161)||(21083-21226)
scaffold0018 (261-361)||(20819-20919)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (18-161)||(126179-126322)
scaffold0011 (261-361)||(126024-126124)
scaffold0011 (18-172)||(32874-33027)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (18-168)||(7941-8091)
scaffold0529 (26-137)||(8152-8263)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (18-216)||(22247-22444)
scaffold0046 (204-349)||(16818-16957)
scaffold0046 (204-349)||(25978-26117)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (24-165)||(9711-9851)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (164-357)||(18026-18215)
[»] scaffold0452 (3 HSPs)
scaffold0452 (18-161)||(13143-13286)
scaffold0452 (47-167)||(8157-8277)
scaffold0452 (261-315)||(13450-13502)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (18-161)||(6944-7087)
scaffold0292 (261-357)||(6684-6780)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (18-181)||(13357-13520)
scaffold0220 (18-181)||(16175-16338)
scaffold0220 (18-142)||(8686-8810)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (18-161)||(120341-120484)
scaffold0034 (262-364)||(120074-120176)
scaffold0034 (18-128)||(29675-29785)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (18-168)||(589-739)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (18-189)||(4433-4608)
[»] scaffold0306 (2 HSPs)
scaffold0306 (18-189)||(4433-4608)
scaffold0306 (296-358)||(15069-15131)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (18-168)||(21679-21829)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (40-194)||(21040-21193)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (18-168)||(13014-13164)
scaffold0111 (259-349)||(7510-7601)
scaffold0111 (259-349)||(14629-14720)
scaffold0111 (106-168)||(19369-19431)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (18-166)||(5145-5293)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (18-176)||(10636-10795)
scaffold0462 (18-172)||(740-892)
scaffold0462 (18-172)||(6246-6398)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (18-161)||(3701-3844)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (18-161)||(21499-21642)
scaffold0096 (261-357)||(21239-21335)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (18-168)||(8034-8184)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (18-168)||(7557-7707)
[»] scaffold0241 (3 HSPs)
scaffold0241 (18-168)||(1988-2138)
scaffold0241 (80-168)||(5141-5229)
scaffold0241 (18-88)||(5413-5483)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (18-168)||(30036-30186)
scaffold0205 (259-355)||(29747-29844)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (18-168)||(28846-28996)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (18-168)||(7643-7793)
scaffold0104 (18-168)||(14274-14424)
scaffold0104 (18-160)||(26358-26500)
scaffold0104 (18-160)||(27740-27882)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (259-364)||(8097-8202)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (18-194)||(395-571)
scaffold0599 (296-361)||(1279-1344)
[»] scaffold0123 (4 HSPs)
scaffold0123 (18-210)||(6407-6599)
scaffold0123 (167-309)||(658-796)
scaffold0123 (165-324)||(25213-25367)
scaffold0123 (18-168)||(16362-16511)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (36-232)||(22929-23125)
scaffold0077 (18-140)||(33791-33913)
scaffold0077 (164-357)||(55543-55733)
scaffold0077 (36-162)||(23386-23512)
scaffold0077 (36-162)||(17753-17879)
scaffold0077 (36-125)||(22676-22765)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (18-181)||(7295-7458)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (18-181)||(8468-8631)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (18-137)||(106681-106800)
scaffold0040 (259-370)||(11206-11316)
scaffold0040 (259-370)||(22306-22416)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (164-356)||(206383-206570)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (19-165)||(632-778)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (18-168)||(1509-1659)
scaffold0334 (18-104)||(4-90)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (18-168)||(21157-21307)
scaffold0106 (164-356)||(19505-19693)
scaffold0106 (296-361)||(15225-15290)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (19-168)||(11583-11732)
scaffold0439 (18-168)||(3843-3994)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (19-196)||(51355-51531)
scaffold0042 (18-73)||(67187-67242)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (166-364)||(713-906)
scaffold0010 (164-301)||(60573-60706)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (164-357)||(85618-85807)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (18-194)||(159428-159603)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (274-361)||(15030-15117)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (18-121)||(4568-4671)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (18-201)||(6191-6373)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (261-367)||(915-1021)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (234-357)||(1967-2086)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (18-194)||(36049-36224)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (52-232)||(138135-138315)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (41-176)||(33334-33469)
scaffold0138 (262-356)||(18190-18284)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (18-164)||(10407-10554)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (18-168)||(168861-169012)
scaffold0021 (270-354)||(146261-146345)
[»] scaffold0357 (4 HSPs)
scaffold0357 (164-275)||(2849-2956)
scaffold0357 (165-345)||(15959-16136)
scaffold0357 (165-345)||(13213-13391)
scaffold0357 (291-356)||(2737-2802)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (18-168)||(9479-9629)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (18-168)||(39523-39673)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (164-257)||(8296-8389)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (18-178)||(12748-12908)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (18-168)||(460-610)
scaffold0083 (18-168)||(5764-5914)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (170-357)||(221072-221254)
scaffold0012 (311-362)||(189460-189511)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (259-357)||(3029-3128)
[»] scaffold1186 (1 HSPs)
scaffold1186 (18-168)||(1135-1285)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (18-136)||(11101-11219)
scaffold0413 (203-232)||(15513-15542)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (259-361)||(75778-75880)
scaffold0054 (18-172)||(65459-65612)
scaffold0054 (163-210)||(75686-75733)
[»] scaffold0169 (1 HSPs)
scaffold0169 (164-357)||(29282-29472)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (234-357)||(3940-4060)
[»] scaffold0485 (2 HSPs)
scaffold0485 (259-357)||(10236-10334)
scaffold0485 (166-219)||(10358-10411)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (18-168)||(66510-66660)
scaffold0004 (204-322)||(332423-332537)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (18-135)||(23682-23799)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (47-167)||(857-977)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (259-357)||(2620-2719)
scaffold0507 (83-164)||(2377-2458)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (262-352)||(101-191)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (74-168)||(10135-10229)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (296-361)||(628-693)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (264-364)||(7900-8000)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (296-364)||(4256-4324)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (55-167)||(11722-11833)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (204-349)||(57898-58037)
[»] scaffold0914 (2 HSPs)
scaffold0914 (264-346)||(1785-1868)
scaffold0914 (166-202)||(1928-1964)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (259-357)||(30404-30503)
scaffold0013 (18-74)||(7855-7911)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (18-172)||(8240-8393)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (78-168)||(3059-3149)
scaffold0256 (18-80)||(2531-2593)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (18-172)||(56397-56550)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (296-361)||(53825-53890)
scaffold0022 (262-345)||(128922-129005)
scaffold0022 (169-234)||(116608-116673)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (47-167)||(7931-8051)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (55-167)||(2295-2406)
scaffold0409 (55-167)||(10550-10661)
[»] scaffold0790 (1 HSPs)
scaffold0790 (262-349)||(6116-6203)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (20-167)||(11698-11844)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (18-172)||(18132-18285)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (300-361)||(6932-6993)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (296-361)||(6889-6954)
scaffold0317 (18-166)||(13254-13402)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (270-354)||(48403-48487)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (98-194)||(1373-1468)
scaffold0825 (18-79)||(1112-1173)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (18-172)||(106-259)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (18-168)||(18589-18738)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (18-172)||(62139-62292)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (165-253)||(27526-27614)
scaffold0165 (203-345)||(27646-27785)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (47-165)||(32671-32788)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (18-168)||(25940-26089)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (18-168)||(34689-34834)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (311-362)||(367-418)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (311-362)||(11584-11635)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (18-93)||(18604-18679)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (311-362)||(32743-32794)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (311-362)||(36169-36220)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (262-345)||(97092-97175)
scaffold0006 (262-345)||(106370-106453)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (18-168)||(35995-36144)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (95-168)||(16525-16598)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (18-93)||(7333-7408)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (311-362)||(14170-14221)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (311-362)||(58802-58853)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (110-168)||(2364-2422)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (20-93)||(1-74)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (123-172)||(24586-24635)
scaffold0162 (18-56)||(24541-24579)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (17-93)||(8097-8173)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (311-362)||(422-473)
scaffold0676 (18-77)||(2403-2462)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (311-362)||(3958-4009)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (311-362)||(5184-5235)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (311-362)||(12394-12445)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (311-362)||(65611-65662)
scaffold0029 (311-362)||(61695-61746)
scaffold0029 (311-362)||(80687-80738)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (262-356)||(6235-6329)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (262-356)||(38392-38486)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (315-352)||(1583-1620)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (315-352)||(3178-3215)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (317-362)||(207591-207636)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (120-168)||(1-49)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (316-364)||(10858-10906)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (203-232)||(11659-11688)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (281-354)||(16541-16613)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (281-354)||(209001-209073)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 172)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14966576 - 14966237
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14966576 gaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattctaaacctaaaaac 14966477  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14966476 tagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataatattactga 14966377  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14966376 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaattgat 14966281  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14966280 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 14966237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 74 - 361
Target Start/End: Original strand, 52989492 - 52989774
Alignment:
Q  74 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgag 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989492 ctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgag 52989591  T
Q  174 ttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatata 273  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  52989592 ttgatccttggg-taggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaatata 52989686  T
Q  274 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52989687 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 52989774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 16643579 - 16643234
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  16643579 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacactcaaaac 16643480  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  16643479 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaagataacattactga 16643380  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16643379 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataggatgtttaagttgat 16643284  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  16643283 gttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgtttatgtgatgtct 16643234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 344
Target Start/End: Original strand, 43550156 - 43550477
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||    
T  43550156 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaact 43550255  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgat 218  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43550256 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactgat 43550355  T
Q  219 gatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43550356 gatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatg 43550451  T
Q  319 ttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  43550452 ttgattatgatttgatgttgttatat 43550477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 50243307 - 50242985
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||    
T  50243307 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaac 50243208  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||||||||| |||    
T  50243207 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatgagggttaaatataatattactga 50243108  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50243107 tgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 50243012  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50243011 gttgattatgatttgatgttgttatat 50242985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 170 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 324490 - 324303
Alignment:
Q  170 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 269  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  324490 tgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaa 324395  T
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324394 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 324303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 10833817 - 10834151
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  10833817 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 10833916  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| || |  |||    
T  10833917 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggtttattatagtactgttga 10834016  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10834017 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatata-ttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 10834111  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10834112 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 10834151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465142
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  140 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 239  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15465353 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 15465261  T
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    || ||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15465260 ataatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgcttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 15465165  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15465164 tatatcttgagatgtttacgtgt 15465142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 5223682 - 5223371
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  5223682 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 5223583  T
Q  140 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 239  Q
    ||||| |||||||||||   |   || ||||    ||    | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5223582 aaggtgtttaagagtataata---atattatttagtg----tcggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 5223490  T
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  5223489 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 5223394  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5223393 tatatcttgagatgtttacgtgt 5223371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 14763439 - 14763774
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||    
T  14763439 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaac 14763538  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  14763539 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 14763638  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | |||||||| |||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14763639 tgttgagtgagtcagatataatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 14763734  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14763735 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 14763774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 23371185 - 23371520
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  ||||||||    
T  23371185 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaac 23371284  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  23371285 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 23371384  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23371385 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 23371480  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23371481 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 23371520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 51300969 - 51300634
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  ||||||||    
T  51300969 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaac 51300870  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || ||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  51300869 tagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 51300770  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51300769 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 51300674  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51300673 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 51300634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 164 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21837685 - 21837493
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    ||    
T  21837685 atgttatgagttgatccttcgggtaggaattgaggttgaatataatattactgatgatcagtgaagctgttacaatatgatttaatgatgatag----ta 21837590  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837589 atgtaataaatttgtatatgcatt-tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 21837493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 24152922 - 24153138
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  24152922 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 24153021  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24153022 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatta 24153121  T
Q  218 tgatctgtgaagctgtt 234  Q
    | |||||||||||||||    
T  24153122 taatctgtgaagctgtt 24153138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Original strand, 8928143 - 8928474
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||    
T  8928143 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaac 8928242  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |  |||    
T  8928243 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtttattataatactgttga 8928342  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttga 316  Q
    || || ||||  ||| ||||| |||| || |||||    | || | ||||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  8928343 tgttcagtgagtctgatataagatga-ttgatgtt----gttaatgatgtggtatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg- 8928436  T
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8928437 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 8928474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 42101 - 41930
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42101 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 42002  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  42001 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 41930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 53646538 - 53646686
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  53646538 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 53646637  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53646638 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatg 53646686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6158971 - 6158789
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  6158971 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 6158872  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6158871 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6158789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13919591 - 13919408
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||         
T  13919591 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactaatgttatgtgaagctgttataatatgatttaatgtttatagc----g 13919496  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  13919495 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaag-tgttgttgattattatgtgataatgttatatcttgagat 13919408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 35961365 - 35961536
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  35961365 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaaattagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaaa 35961464  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  35961465 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 35961536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9533703 - 9533416
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||     
T  9533703 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaat 9533604  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  9533603 tagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 9533504  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 309  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9533503 tgttgagtgagtcggatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttt 9533416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40807570 - 40807420
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40807570 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 40807471  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40807470 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 40807420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 54875961 - 54876111
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  54875961 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 54876060  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  54876061 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 54876111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 37038391 - 37038226
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  37038391 aaaatactccagagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaacctcaaaact 37038292  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgg 184  Q
    |||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37038291 agaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttttgagttgatctttgg 37038226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 2248448 - 2248624
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||    
T  2248448 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaac 2248547  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  2248548 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatg 2248624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 13029754 - 13029925
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  13029754 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 13029853  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  13029854 tagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtag 13029925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 14642028 - 14642191
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  14642028 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 14642127  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14642128 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 14642191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 10989281 - 10989495
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  10989281 gaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 10989380  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||  |||  ||||||| ||    
T  10989381 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatatcaatgaaagttatataggatattaagga 10989480  T
Q  218 tgatctgtgaagctg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  10989481 tgatctgtgaagctg 10989495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11192655 - 11192505
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11192655 gaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 11192556  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11192555 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11192505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17538681 - 17538531
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17538681 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccttttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcgaaacctcaaaac 17538582  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17538581 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17538531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17693642 - 17693492
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17693642 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 17693543  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17693542 tagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17693492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 35065059 - 35065208
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35065059 gaaaatactcccatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattc-aaacctcaaaac 35065157  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35065158 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 35065208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44274048 - 44273898
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44274048 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 44273949  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44273948 tagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgtt 44273898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40812407 - 40812258
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40812407 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 40812308  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40812307 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 40812258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17044540 - 17044392
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  17044540 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaat 17044441  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17044440 tagaaatactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 17044392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 6805439 - 6805610
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  6805439 gaaaatactccaaggaggtcctagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaat 6805538  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||    
T  6805539 tagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggttcttggggtag 6805610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 13026162 - 13026333
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  13026162 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaaattatgggataattccaaagctcaaaac 13026261  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  13026262 tagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtag 13026333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3803409 - 3803259
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3803409 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacctcaaaac 3803310  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3803309 tagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3803259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 5206132 - 5206282
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5206132 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 5206231  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5206232 tagaagtactatgagttcaattatggtgtttaagattatttaacctatgtt 5206282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14441742 - 14441592
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  14441742 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaac 14441643  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14441642 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14441592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14508421 - 14508272
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14508421 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 14508323  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14508322 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14508272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16979484 - 16979287
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  16979484 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttataaaaattcagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 16979385  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16979384 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16979287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35354173 - 35354023
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  35354173 gaaaatactccaacgagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaac 35354074  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35354073 tagaagtactgggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 35354023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 240 - 367
Target Start/End: Original strand, 54876322 - 54876445
Alignment:
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54876322 atgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 54876417  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtgttgtct 367  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  54876418 tatatcttgagatgtttacgtgctgtct 54876445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33564703 - 33564555
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  33564703 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataattccaatcctcaaaac 33564604  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33564603 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 33564555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 10541936 - 10542079
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10541936 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 10542035  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  10542036 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 10542079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12276123 - 12275941
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  12276123 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 12276024  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  12276023 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 12275941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 15931985 - 15932135
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  15931985 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaacctcaaaac 15932084  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  15932085 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttcatctatgtt 15932135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 17519351 - 17519501
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  17519351 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 17519450  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17519451 tagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 17519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 17534213 - 17534363
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  17534213 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 17534312  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17534313 tagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 17534363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 164 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12378184 - 12378003
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||    
T  12378184 atgttttgagttgatccttagggtagcaatggaggttaaatacaatattaatgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagta 12378089  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgag 350  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  12378088 atttaatata-ttgtatatgtattatttgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgag 12378003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 1988710 - 1988885
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  1988710 gaaaatactccaaggaggtcttagtgcaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 1988809  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1988810 tataactactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1988885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 3394480 - 3394662
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||    
T  3394480 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaac 3394579  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  3394580 tagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 3394662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12511422 - 12511279
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  12511422 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaac 12511323  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  12511322 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 12511279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14671398 - 14671255
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14671398 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 14671299  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  14671298 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 14671255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 41172848 - 41172999
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  41172848 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaac 41172947  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  41172948 tagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 41172999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 43889277 - 43889420
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43889277 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaac 43889376  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  43889377 tagaagtactaggagtttaattaagggttttaagagtatttaac 43889420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 22307061 - 22307211
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22307061 gaaaatactcgaaggaggtcttactgaaatcctatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaac 22307160  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22307161 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 22307211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 2841942 - 2842090
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  2841942 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttcc-aagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaact 2842040  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2842041 agaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 2842090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12339874 - 12339773
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12339874 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 12339775  T
Q  361 gt 362  Q
    ||    
T  12339774 gt 12339773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Original strand, 10542384 - 10542480
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542384 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 10542480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11913295 - 11913119
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  11913295 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaac 11913196  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  11913195 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 11913119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14179539 - 14179439
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14179539 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 14179440  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  14179439 g 14179439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14671091 - 14670995
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671091 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 14670995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 43889578 - 43889678
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43889578 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 43889677  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  43889678 g 43889678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13519857 - 13519706
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  13519857 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaac 13519758  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||||||  | ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  13519757 tagaagtactaggagtttgattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 13519706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 17670187 - 17670334
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17670187 gaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 17670286  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17670287 tagaaatactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaatctat 17670334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 17685321 - 17685468
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17685321 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 17685420  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    ||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||    
T  17685421 tagaaatactatgaattcaattagggtgtttaagagtatttaatctat 17685468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 18699951 - 18700094
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  18699951 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattccaaacctcaaaac 18700050  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  18700051 tagaagtgctaggagtttagttaagggatttaagagtatttaac 18700094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 164 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 316381 - 316202
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||| || || |||| |||||||||||||||||    ||    
T  316381 atgttatgagttgatcattgggatatgaatggaggttgattatgatattactgatgctatgtgaatctattgtaatgtgatttaatgttgatag----ta 316286  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  316285 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 316202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 20248462 - 20248608
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  20248462 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcgaaac 20248561  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20248562 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaaccta 20248608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 50351478 - 50351628
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  50351478 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 50351577  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | ||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  50351578 ttgaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 50351628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6819683 - 6819507
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||    
T  6819683 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaagctcaaaac 6819584  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 195  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  6819583 tataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgggttgatc-ttgggataggaatgg 6819507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9577882 - 9577700
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||| |||||||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  9577882 gttataagttgatccttggggtgggaacgaaggttgattataatattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 9577787  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9577786 gtgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaaggtgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagat 9577700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10554841 - 10554668
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||    
T  10554841 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggctcaaaac 10554742  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 191  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  10554741 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 10554668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 10563265 - 10563120
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10563265 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 10563166  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10563165 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 10563120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12470069 - 12469969
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12470069 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttcacgt 12469970  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  12469969 g 12469969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14682590 - 14682494
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14682590 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatcttgttatatcttgagatgttta 14682494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16796654 - 16796554
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16796654 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgtttacgt 16796555  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  16796554 g 16796554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 179185 - 179367
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| ||||  || |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  179185 gaaaataccccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 179284  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  179285 tagaagtactatgagttgaattaaggtgtttaacagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaggttg 179367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12470376 - 12470233
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  12470376 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaac 12470277  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  12470276 tagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 12470233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Original strand, 42324700 - 42324862
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||   ||||||||| |||||  ||||||||||| || ||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  42324700 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaact 42324799  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  42324800 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctt 42324862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 240 - 361
Target Start/End: Original strand, 17691644 - 17691760
Alignment:
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17691644 atgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgataatcatttgatgttat 17691739  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  17691740 tatatc-tgagatgtttacgtg 17691760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 18700259 - 18700359
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18700259 gtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 18700358  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  18700359 g 18700359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 18367236 - 18367399
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |    
T  18367236 gaaaatatttcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaagc 18367335  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18367336 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctt 18367399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 38311481 - 38311628
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaa 116  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  38311481 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacctcgaaa 38311580  T
Q  117 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38311581 ctagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 38311628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 43928925 - 43928775
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  43928925 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaat 43928826  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  43928825 tagaagtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacatatgtt 43928775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 13522891 - 13523071
Alignment:
Q  21 aatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaa-cttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    ||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||  ||||||||||    
T  13522891 aatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataattccaaggctcaaaacta 13522990  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  13522991 gaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 13523071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 55292119 - 55292292
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  55292119 gaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaacccaaaacttatgggataattccaagactcaaaac 55292218  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 191  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||    
T  55292219 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacccatgttatgagtagacctttgaggtagga 55292292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 49900310 - 49900153
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt--------aatccaaaacttagggaataattcaaaac 109  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  49900310 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaac 49900211  T
Q  110 ctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49900210 ctcaaaactagaagtactagaagtttaattaaggattttaagagtatttaacctatgt 49900153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 130
Target Start/End: Original strand, 14567691 - 14567802
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  14567691 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgaaataattccaaacctcaaaact 14567790  T
Q  119 agaagtactagg 130  Q
    ||||||||||||    
T  14567791 agaagtactagg 14567802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17513154 - 17513010
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  17513154 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataattccaaacctccaaac 17513055  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 162  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  17513054 tagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacc 17513010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11258986 - 11258891
Alignment:
Q  73 tctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11258986 tctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 11258891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 16325019 - 16325190
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||  || |||||    
T  16325019 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggctaaaaac 16325118  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||| || |||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  16325119 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttatgaatatttatcctaagttgtgagttggtccttggggtag 16325190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44494976 - 44494901
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44494976 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 44494901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 50348504 - 50348654
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||    
T  50348504 gaaaatactccaagtaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattccaaacctcaaaac 50348603  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || |||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  50348604 tataagtactaggggtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 50348654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 259 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28194863 - 28194754
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28194863 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgtttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 28194764  T
Q  358 cgtgttgtct 367  Q
     ||| |||||    
T  28194763 tgtgctgtct 28194754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 31224431 - 31224608
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  31224431 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaac 31224530  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggt-atttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||| | ||||| || | ||||||| ||||||    
T  31224531 tagaagtactatgagttcaattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtgagtcgacccttggggtcggaatg 31224608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15246281 - 15246093
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   || || |  ||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  15246281 atgttatgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----ta 15246186  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  15246185 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 15246093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18889920 - 18889749
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||  |||||| ||||||||| || ||||||    
T  18889920 tcttagtgaaatcttatgaaaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttccaaggctcaaatctagaagtaatatgagttc 18889821  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 207  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  18889820 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttgggacaggaatggaggttgattata 18889749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37427885 - 37427772
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  37427885 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgatgattatcatttgatactgttatatcttgagatgtttat 37427786  T
Q  359 gtgttgtctgtgct 372  Q
    ||| || |||||||    
T  37427785 gtgctgcctgtgct 37427772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 349
Target Start/End: Original strand, 23318615 - 23318754
Alignment:
Q  204 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 303  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23318615 tataatattactgatgaactgtgaatctgttataa-atgatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 23318709  T
Q  304 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
     |||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  23318710 ttgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 23318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 14152877 - 14153027
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||    
T  14152877 gaaaatacttcaagaaggtcttagtgaacttttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaac 14152976  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14152977 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 14153027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14519836 - 14519687
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  14519836 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 14519737  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14519736 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14519687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15207199 - 15207032
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   || || |  ||||| |||||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  15207199 atgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgttctgtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----ta 15207104  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 334  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15207103 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgat 15207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22652405 - 22652236
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  22652405 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagc 22652306  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggta 188  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  22652305 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta 22652236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19444085 - 19443941
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||    
T  19444085 gaaaatactccaaggaggtcttattaaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctccaaac 19443986  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 162  Q
    ||||||| | | |||||||| |||||| ||| ||| |||||||||    
T  19443985 tagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagaatatttaacc 19443941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 156
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055244
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  140 aaggtatttaagagtat 156  Q
    ||||| |||||||||||    
T  26055228 aaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15265402 - 15265214
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   || || |  |||||  | ||||  ||| |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  15265402 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgaccttagtactgttgatgtacagtgagtctgatataatgtgatttgatgttgttat----ta 15265307  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  15265306 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 15265214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 351
Target Start/End: Original strand, 32402819 - 32403002
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||| |||| ||||||||  |||||    | ||||    
T  32402819 atgttatgagttgatctttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgctcagtgagtctgatata-tatgatttgttgttg----cgagta 32402913  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-aagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 351  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32402914 atgtgatatagttttatatgcattatgtgaattatctaagatgtttaaagttgctattgattattatttgatattgttatatcttgaga 32403002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 364
Target Start/End: Original strand, 3264997 - 3265070
Alignment:
Q  291 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3264997 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcatgagatgtttatgtgttg 3265070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Original strand, 11914003 - 11914068
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11914003 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 11914068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36527882 - 36527809
Alignment:
Q  291 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36527882 tgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatatttatgtgttg 36527809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14682841 - 14682754
Alignment:
Q  74 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  14682841 ctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 14682754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 6156279 - 6156130
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  6156279 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 6156180  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6156179 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 6156130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 50755860 - 50756009
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  50755860 gaaaatactccaaggtggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagc 50755959  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50755960 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50756009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 17046700 - 17046631
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaa 87  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17046700 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18893196 - 18893067
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||    
T  18893196 aaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaacta 18893097  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtattta 149  Q
     ||||| || ||||| || |||||| ||||    
T  18893096 caagtaatatgagtttaattaaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 34852617 - 34852701
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34852617 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 34852701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 9511644 - 9511793
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||    
T  9511644 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaac 9511743  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| ||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9511744 ttg-tgtactatgagattaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 9511793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 9519619 - 9519768
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||    
T  9519619 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaac 9519718  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| ||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9519719 ttg-tgtactatgagattaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 9519768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17207915 - 17207766
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| |    
T  17207915 gaaaatactccaaggaggtcttactgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttattgattgtctccaaacttcaaagc 17207816  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17207815 ttg-tgtactatgagttcaaataaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17207766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 38311759 - 38311820
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38311759 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 38311820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18893063 - 18892975
Alignment:
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 207  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18893063 agaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattata 18892975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 355
Target Start/End: Original strand, 14568921 - 14569007
Alignment:
Q  269 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| |||| ||||    
T  14568921 atataattgtatatgcgttatgtgaattatatatgatgtttaggttgatgttgactgtcacttgatattgttatatcatgagctgtt 14569007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15566087 - 15565938
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  15566087 gaaaatactccaaggaggtcatagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 15565988  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
       |  ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15565987 -ctatttactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15565938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 25104680 - 25104829
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| ||||||     
T  25104680 gaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaat 25104779  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25104780 ttg-tgtactatcagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 25104829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24546414 - 24546261
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttga----aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctca 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| |||    
T  24546414 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaattaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatggattgtctccaaacttca 24546315  T
Q  114 aaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || |  |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24546314 aagcctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24546261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 345
Target Start/End: Original strand, 52523593 - 52523763
Alignment:
Q  171 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 270  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||    
T  52523593 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtt---ta-taatgtgat 52523687  T
Q  271 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| || || ||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  52523688 ataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatc 52523763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 168
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19568996
Alignment:
Q  112 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19568996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 168
Target Start/End: Original strand, 42353218 - 42353302
Alignment:
Q  85 caaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggta-tttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  42353218 caaaacttagggaataattctaaacctcaaaacaaaaagtattaggagtttaattaagggagtttaagagtatttaacgtatgtt 42353302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15964995 - 15964944
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15964995 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15964944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15968919 - 15968868
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15968919 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15968868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15972843 - 15972792
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15972843 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 15972792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 20248741 - 20248803
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  20248741 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattatcatttgatactgttatatctt 20248803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 54330784 - 54330933
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  54330784 gaaaacacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 54330883  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54330884 ttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 54330933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 5215221 - 5215156
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaat 83  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5215221 gaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11854759 - 11854708
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11854759 agttgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11854708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18739469 - 18739394
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  18739469 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 18739394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 19775791 - 19775744
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19775791 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 19775744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12952615 - 12952466
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| | |||||||| |||| |||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| |    
T  12952615 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaatc 12952516  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  || ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12952515 ttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 12952466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 300
Target Start/End: Original strand, 29172491 - 29172618
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 268  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||  ||||| || ||||  ||| |||||||| |||| |||||||    ||||| |||     
T  29172491 atgagttgatccttggggtaggaatggaggtcggttatagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatataatttgatgttga----tagtattgtg 29172586  T
Q  269 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 300  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatat 29172618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 2051102 - 2051235
Alignment:
Q  208 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  2051102 atattaatgatgatttgtgaagctgctataagatgattga-tgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg 2051196  T
Q  307 tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  2051197 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 2051235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 4107480 - 4107531
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4107480 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4107531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 4111332 - 4111383
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4111332 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4111383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7109724 - 7109673
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7109724 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 7109673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 7113659 - 7113608
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7113659 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 7113608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11070094 - 11070043
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11070094 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 11070043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 11165612 - 11165663
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11165612 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 11165663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15617400 - 15617349
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15617400 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 15617349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 17938100 - 17938025
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  17938100 gaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaacctta 17938025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22321690 - 22321639
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22321690 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 22321639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22336745 - 22336694
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22336745 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 22336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 27409727 - 27409778
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27409727 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27409778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28949750 - 28949699
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28949750 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 28949699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30065972 - 30065921
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30065972 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 30065921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 37439719 - 37439770
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37439719 agttgttgttgattattatttgatatggttatatcttgagatgtttacgtgt 37439770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 55022893 - 55022842
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  55022893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 55022842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 362
Target Start/End: Original strand, 4588862 - 4588907
Alignment:
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4588862 tgttgattatcatttgaaattgttatatcttgagatgtttatgtgt 4588907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21618692 - 21618627
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21618692 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 21618627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36166841 - 36166776
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36166841 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 36166776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 54521014 - 54520977
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54521014 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 54520977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43926114 - 43926034
Alignment:
Q  276 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  43926114 tgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttt 43926034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 37427976 - 37427930
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  37427976 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 37427930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12567752 - 12567723
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567752 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 12567723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13544217 - 13544188
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544217 gatgttgattatcatttgatgttgttatat 13544188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Original strand, 14647688 - 14647760
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  14647688 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 14647760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16059659 - 16059622
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16059659 atgttatgagttggtctttggggtaggaatggaagttg 16059622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Original strand, 29544812 - 29544849
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29544812 gatgttgattaccatttgatgttgttatgtcttgagat 29544849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Original strand, 51603078 - 51603127
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataa 67  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  51603078 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataa 51603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 330 - 362
Target Start/End: Original strand, 11300532 - 11300564
Alignment:
Q  330 ttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11300532 ttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11300564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23274910 - 23274882
Alignment:
Q  204 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274910 tataatattaatgatgatctgtgaagctg 23274882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 127)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Original strand, 19808075 - 19808420
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808075 gaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 19808174  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19808175 tagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactga 19808274  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19808275 tgatctgtgaaactgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgat 19808370  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19808371 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtct 19808420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 363
Target Start/End: Original strand, 22237732 - 22238073
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22237732 gaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 22237831  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||||||||| || || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22237832 tagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactga 22237931  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237932 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 22238027  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22238028 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 22238073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 18 - 363
Target Start/End: Original strand, 17460765 - 17461106
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||    
T  17460765 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaac 17460864  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17460865 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactga 17460964  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460965 tgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 17461060  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  17461061 gttgattatcatttgatgttgttatatctctagatgtttatgtgtt 17461106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Original strand, 25483952 - 25484274
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||     
T  25483952 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaat 25484051  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25484052 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactga 25484151  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25484152 tgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 25484247  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25484248 gttgattatgatttgatgttattatat 25484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Original strand, 14397604 - 14397915
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  14397604 agtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 14397703  T
Q  140 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 239  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14397704 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 14397796  T
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  14397797 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgctgttgattatcaattgatattgt 14397892  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14397893 tatatcttgagatgtttacgtgt 14397915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 39695006 - 39695188
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39695006 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcaaaacctcaaaac 39695105  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  39695106 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 39695188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 41680612 - 41680795
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  41680612 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaac 41680711  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  41680712 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatggaggttg 41680795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11775296 - 11775125
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11775296 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 11775197  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  11775196 tagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 11775125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 201
Target Start/End: Original strand, 15635662 - 15635840
Alignment:
Q  22 atactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactaga 121  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||    
T  15635662 atactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatcctcaaaactaga 15635761  T
Q  122 agtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  15635762 agtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 15635840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19882542 - 19882371
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19882542 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 19882443  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  19882442 tagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 19882371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Original strand, 20533267 - 20533455
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||    
T  20533267 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgttctgtgaagctgttataatgtgatttattgttga----tagta 20533362  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  20533363 atgtaatataattgtatatgcattttgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgatcatcacttgatattattatatctggatatgttt 20533455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 364362 - 364148
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  364362 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 364263  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||    
T  364262 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaagga 364163  T
Q  218 tgatctgtgaagctg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  364162 tgatctgtgaagctg 364148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16799748 - 16799561
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatc-tttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||    
T  16799748 gttaagagttgatcctttggggtatgaatggaggatgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagtaa 16799653  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  16799652 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaaatatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 16799561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 188 - 355
Target Start/End: Original strand, 23943876 - 23944039
Alignment:
Q  188 aggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcatt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23943876 aggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttgatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcatt 23943971  T
Q  288 atgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  23943972 atgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 23944039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Original strand, 19154744 - 19154932
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||    
T  19154744 atgttacgagttgatccttggtgtaggaatggaggttatatgtaatattaatgatgatttgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tacta 19154839  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||    
T  19154840 atgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattattatatctggatatgttt 19154932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 6102232 - 6102381
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6102232 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaact 6102331  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  6102332 agaagtactatgagttcaattaggatatttaagagtatttaacctatgtt 6102381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20454813 - 20454638
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  20454813 gaaaatactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattcaaacccacaaaac 20454714  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20454713 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20454638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 22207841 - 22207693
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22207841 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataattccaaacctgaaaac 22207742  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22207741 tagaagtatcaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 22207693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37515967 - 37515778
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| | | |||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||    
T  37515967 atgttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttttatgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----ta 37515872  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37515871 atgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgttta 37515778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 167 - 345
Target Start/End: Original strand, 17439367 - 17439541
Alignment:
Q  167 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  17439367 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacagtattaatgatgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttgataa----taatg 17439462  T
Q  267 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17439463 tgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17439541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 231 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23659602 - 23659480
Alignment:
Q  231 tgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23659602 tgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 23659507  T
Q  331 tgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||    
T  23659506 tgatgttgttatatctcaagatgttta 23659480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 6573534 - 6573682
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6573534 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 6573633  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  6573634 tagaggtactaggggttcaattaagttgtttaagagtatctaacatatg 6573682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19140337 - 19140189
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19140337 aaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaacta 19140238  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19140237 gaagtactatgagttcaactagggtgtttaacagtatttaacctatgtt 19140189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 42818385 - 42818533
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42818385 gaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 42818484  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  42818485 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatctatg 42818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 164 - 347
Target Start/End: Original strand, 14103083 - 14103262
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagt 262  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||     |    
T  14103083 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttgt-ataatatgattttaatgttgatat----t 14103177  T
Q  263 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14103178 aatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 14103262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18834045 - 18833898
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18834045 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 18833946  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18833945 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctat 18833898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 27941367 - 27941655
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| |||  || |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  27941367 gaaaatacttcaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaac 27941466  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  27941467 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 27941566  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 310  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27941567 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatatgagatgttta 27941655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5761107 - 5760957
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5761107 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 5761008  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5761007 tagaagtaccatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 5760957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 18024173 - 18024323
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||||||||    
T  18024173 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagttccaaggctcaaaac 18024272  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18024273 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18024323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 20178999 - 20179149
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  20178999 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaac 20179098  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20179099 tagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20179149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 21861098 - 21861248
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  21861098 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 21861197  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21861198 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtt 21861248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26454285 - 26454087
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||    
T  26454285 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaac 26454186  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  26454185 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 26454087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 44522904 - 44523118
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  44522904 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctcatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 44523003  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||    
T  44523004 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaagga 44523103  T
Q  218 tgatctgtgaagctg 232  Q
    |||  ||||||||||    
T  44523104 tgacgtgtgaagctg 44523118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23478654 - 23478478
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  23478654 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatgcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 23478555  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  23478554 tagaagtactatgagttcaactaaggtgtttcatagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggtagaaatg 23478478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44432417 - 44432221
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44432417 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 44432318  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  44432317 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 44432221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17795806 - 17795592
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  17795806 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 17795707  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||    
T  17795706 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacaagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaagga 17795607  T
Q  218 tgatctgtgaagctg 232  Q
    |||| ||||||||||    
T  17795606 tgatgtgtgaagctg 17795592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 39936489 - 39936638
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||| ||||    
T  39936489 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattccaaatctcgaaac 39936588  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39936589 tagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39936638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 362
Target Start/End: Original strand, 25363154 - 25363255
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25363154 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 25363253  T
Q  361 gt 362  Q
    ||    
T  25363254 gt 25363255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20455570 - 20455395
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||    
T  20455570 gaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaac 20455471  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20455470 tagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20455395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20460548 - 20460373
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |  |||||||||    
T  20460548 gaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccatccctcaaaac 20460449  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  20460448 tagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 20460373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 164 - 345
Target Start/End: Original strand, 40492711 - 40492887
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||     
T  40492711 atgttgtgagttgatccttgtggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtg 40492806  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  40492807 atgtaatatatttgtatatgcaat-catgaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 40492887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 361690 - 361840
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  361690 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 361789  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  361790 taggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 361840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19880402 - 19880205
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||| ||||    
T  19880402 gaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatctcgaaac 19880303  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| | |||  || |||| ||||||||||||||    
T  19880302 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttggggca-gaaacgaagttgtatataatattaatg 19880205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32950175 - 32950025
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  32950175 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 32950076  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32950075 tagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 32950025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 17437796 - 17437945
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  17437796 gaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattccaaatctcaaaac 17437895  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||| || ||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17437896 tagaaataataggattttaattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 17437945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 5082690 - 5082838
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  5082690 gaaaatactccaagtaggtctgagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaac 5082789  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  5082790 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacttatg 5082838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 21579685 - 21579848
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||     
T  21579685 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaat 21579784  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21579785 tagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatctt 21579848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Original strand, 8414240 - 8414358
Alignment:
Q  70 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  8414240 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttg 8414339  T
Q  170 tgagttgatctttggggta 188  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  8414340 tgagttggtccttggggta 8414358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 20501962 - 20502149
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  20501962 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatataattgttgatgttcagtgaatctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 20502057  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20502058 atgacatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttatgttgttgttggttatcatttgatattgttatatcttgagatattta 20502149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44476996 - 44476851
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaact 118  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  44476996 aaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaact 44476897  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44476896 agaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44476851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44480258 - 44480113
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaact 118  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  44480258 aaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaact 44480159  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44480158 agaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 44480113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 42560006 - 42560181
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||    
T  42560006 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaagctc-aaac 42560104  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  42560105 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 42560181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 8728415 - 8728561
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatt-caaaacctcaaaa 116  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8728415 gaaaatactacaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataattccaaaacctcgaaa 8728513  T
Q  117 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8728514 ctagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 8728561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 17086012 - 17086201
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| ||  |||  |   ||||||||||||| ||||||||||    ||    
T  17086012 atgttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcaatgagtccaatataatatgatttgatgttgatag----ta 17086107  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17086108 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgttta 17086201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 20084116 - 20084266
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  20084116 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataattccaaacctcaaa-c 20084214  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtat-ttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||    
T  20084215 tagaagtactaggagtttaattaagggggcttaagattatttaacctatgtt 20084266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Original strand, 38185564 - 38185706
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  38185564 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 38185663  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 160  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  38185664 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 38185706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 39364097 - 39363955
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  39364097 aaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaact 39363998  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  39363997 agaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaac 39363955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23914473 - 23914344
Alignment:
Q  42 tgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||    
T  23914473 tgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaagtagaagtactaggagtt-tattaa 23914375  T
Q  142 ggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    ||  ||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23914374 ggggtttaacagtatttaacatgtgttatga 23914344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 354
Target Start/End: Original strand, 22253024 - 22253210
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || || |  ||| ||||||||||||| |||||  |||    ||    
T  22253024 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtaagtctgatataatatgatttgatgttcttag----ta 22253119  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||| ||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22253120 atgtgataaagttatatatgcattatgtggatcacataagatgtttaagttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22253210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23668071 - 23667885
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||| || ||||  ||  ||| ||||||||| | |||| |||    ||    
T  23668071 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttaatgttcagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttag----ta 23667976  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt-gattatcatttgatgttgttatatcttgagatg 353  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23667975 atgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgtttaagttgatgttaaaatattatttgatattgttatatcttgagatg 23667885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 42266073 - 42266252
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||   ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||||    
T  42266073 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctt---aaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataattccaaccctccaaac 42266169  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  42266170 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttaatc-ttgggataggaatggaagttg 42266252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 166 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22996104 - 22995927
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||  ||| |||| | ||||||| ||||| | |     |||    
T  22996104 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtctgctatatacatgatttgatgttaaaaa----taa 22996009  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22996008 tgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 22995927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Original strand, 17438166 - 17438272
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17438166 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 17438265  T
Q  358 cgtgttg 364  Q
     ||||||    
T  17438266 tgtgttg 17438272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17501470 - 17501350
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |    
T  17501470 ttttatgaaaaattagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggt 17501371  T
Q  147 ttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  17501370 ttaagagtatttaacctatgt 17501350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 295 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23409930 - 23409864
Alignment:
Q  295 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23409930 ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 23409864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Original strand, 5083103 - 5083202
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5083103 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatccttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 5083202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18833733 - 18833635
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18833733 tagtaatgtgatatatgtgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgttta 18833635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 20517596 - 20517745
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||     || |||| |||||||    
T  20517596 gaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttatggatcgtctccaaacttcaaaac 20517695  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20517696 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20517745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 21321819 - 21321968
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    ||||||||||||   | ||||||| |||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| |    
T  21321819 aaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaatt 21321918  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21321919 ataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 21321968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 29763347 - 29763510
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||| || ||||   ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  29763347 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagaataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataattccaaccctcaaaac 29763446  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    |||||||| || |||||||| |||| |    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29763447 tagaagtaatatgagttcaattaagatgggaaagagtgtttaacctatgttgtgaattgatctt 29763510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 18816940 - 18817089
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  18816940 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacatcaaagc 18817039  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18817040 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18817089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 22258782 - 22258935
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  22258782 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagc 22258881  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22258882 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaactatgttatga 22258935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22344615 - 22344466
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  22344615 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagc 22344516  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22344515 ttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22344466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22356275 - 22356126
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  22356275 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaacttcaaagc 22356176  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22356175 ttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22356126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22483320 - 22483171
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||    
T  22483320 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaac 22483221  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22483220 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 22483171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 21326417 - 21326566
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    ||||||||||||   | |||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||| |    
T  21326417 aaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctaaaaatt 21326516  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |||||| | |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  21326517 aaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtatttaacctatgtt 21326566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Original strand, 22963364 - 22963461
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22963364 gtaatgtgatataattgtatatgcattgtgtgaattataaaatatgttaaagttgatgttgaattattatttgatattgttatatcttgagatgttta 22963461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 285 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23914183 - 23914110
Alignment:
Q  285 attatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23914183 attatgtgaattaatataagatgtttaagttgttgctgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 23914110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 18815301 - 18815450
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||      
T  18815301 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagt 18815400  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18815401 ttg-tgtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 18815450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 164 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22525778 - 22525659
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||    | | |||    
T  22525778 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttaattataatactcctgatgttttgtgaatctgttataacatgatttaatgtt----gttggta 22525683  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcatt 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  22525682 atgtcatatatttgtatatgcatt 22525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 4381272 - 4381420
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | | |   || |||| ||||| ||    
T  4381272 aaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttctccaaacttcaaagct 4381371  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4381372 tg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 4381420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36305231 - 36305083
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||| | ||| |   || |||| ||||||||    
T  36305231 aaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatggattgtctccaaacttcaaaact 36305132  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     |  |||||| |||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36305131 tg-tgtactatgagtccaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 36305083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Original strand, 21346185 - 21346239
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21346185 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatatttaagttg 21346239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 38989039 - 38988886
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  38989039 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 38988940  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38988939 ttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 38988886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 39020136 - 39019983
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  | || ||| |||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  39020136 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctagttcaacccagaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 39020037  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39020036 ttg-tgtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 39019983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23660781 - 23660688
Alignment:
Q  26 tccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  23660781 tccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44476814 - 44476753
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44476814 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44476753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44480076 - 44480015
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44480076 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 44480015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 161
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346020
Alignment:
Q  86 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 21346020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 166 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28397809 - 28397635
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||  | | | ||  ||| ||||| |||||||||||||| ||     |||    
T  28397809 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattataatattgttgatttttcagagagtctgatataa-atgatttaatgttgttaa----taa 28397715  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  28397714 tgtgatatatt-gtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatat 28397635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 36733002 - 36733077
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  36733002 gaaaatactccaatgaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 36733077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23670222 - 23670069
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| |||||      
T  23670222 gaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttattaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtatccaaacttcaaaga 23670123  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23670122 ttgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 23670069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 36405538 - 36405691
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| ||||| |    
T  36405538 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagc 36405637  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  36405638 ttg-tgtactatgagttcaattaatgtgtttaatagtatttaacctaagttatga 36405691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Original strand, 16401983 - 16402054
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatc------atttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401983 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgaatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 16402054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 296 - 344
Target Start/End: Original strand, 19936956 - 19937004
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936956 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 19937004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 18862728 - 18862779
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18862728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18862779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21410973 - 21410922
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21410973 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21410922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21805465 - 21805414
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21805465 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21805414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 21828097 - 21828148
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21828097 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 21828148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 352
Target Start/End: Original strand, 35026831 - 35026903
Alignment:
Q  278 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35026831 tatatgcattatgtgaattatatatgatgttttaa--gatgttgattatcgtttgatattgttatatcttgagat 35026903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37116517 - 37116434
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  37116517 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 17978895 - 17979044
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||      
T  17978895 gaaaatatttcaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagt 17978994  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17978995 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgtt 17979044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21399284 - 21399209
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21399284 gaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 21793777 - 21793702
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  21793777 gaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 21793702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 352
Target Start/End: Original strand, 22419367 - 22419455
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |   ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22419367 taatgtgatatgattgtatatgcattatgtgaattatttatgatgtttta--agatgttgattatcgtttgaaattgttatatcttgagat 22419455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 344
Target Start/End: Original strand, 2418839 - 2418906
Alignment:
Q  275 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2418839 ttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttca--agatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 8728620 - 8728682
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  8728620 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgaattaccatttgatactgttatatctt 8728682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 53 - 168
Target Start/End: Original strand, 18118677 - 18118792
Alignment:
Q  53 gaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta-ggagttcaactaaggtatttaag 151  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||  |  | | |||| |||||||| | |||| || ||||||||| |||||| ||| ||    
T  18118677 gaaaattcagcctaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggtttgttcccaaacttcaaaacttg-agtattagggagttcaattaaggtgttttag 18118775  T
Q  152 agtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||||||    
T  18118776 agtatttaacctatgtt 18118792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 19278366 - 19278417
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19278366 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 19278417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 21972668 - 21972719
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21972668 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 21972719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 21976753 - 21976804
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21976753 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 21976804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24907348 - 24907203
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||||| ||| |  |||  ||| |||||||    
T  24907348 gaaaatactctaaggaggtttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaattctaagtcaacccaaaacttatggattgtttc-caacttcaaaac 24907250  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    | |  |||||| |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  24907249 ttg-tgtactatgagttcaattaagttgtttaagaatatttaacctat 24907203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 43251836 - 43251785
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43251836 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 43251785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 357
Target Start/End: Original strand, 1327013 - 1327055
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1327013 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 1327055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 21513892 - 21513823
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaa 89  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||    
T  21513892 aaaatactccaa-gaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaa 21513823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22474325 - 22474176
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||| | |||||| || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  22474325 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaactccacataattatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagc 22474226  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22474225 ttgt-gtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 22474176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 330
Target Start/End: Original strand, 21346241 - 21346282
Alignment:
Q  289 tgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatt 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21346241 tgtgaattatataagatatttaagttgttgttgattatcatt 21346282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Original strand, 26222945 - 26223010
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 234  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26222945 atgagttggtctttcgggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 26223010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 17266945 - 17267028
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||   |||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  17266945 taatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23410056 - 23410018
Alignment:
Q  143 gtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23410056 gtatttaagagtatttaacatatgttgtgagttgatctt 23410018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 319
Target Start/End: Original strand, 18024465 - 18024506
Alignment:
Q  278 tatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 319  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  18024465 tatatgcattatatggattatacaagatgtttaagttgatgt 18024506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21329176 - 21329104
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  21329176 atgcattatgtggataatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 21329104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Original strand, 21967540 - 21967612
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  21967540 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 21967612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22364816 - 22364748
Alignment:
Q  276 tgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22364816 tgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatc 22364748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34950694 - 34950622
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  34950694 atgcattatgtggattaagtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgttatattttgggatgt 34950622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 164
Target Start/End: Original strand, 18122327 - 18122363
Alignment:
Q  128 aggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18122327 aggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 18122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Original strand, 22381593 - 22381641
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatt 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22381593 atgttatgggtttatccttggggtaggaatcgaggttgattataatatt 22381641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 112)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10057046 - 10056707
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  10057046 gaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaatc 10056947  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10056946 tagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgaatataatattactga 10056847  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056846 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 10056751  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056750 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 10056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Original strand, 23802942 - 23803264
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||    
T  23802942 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaac 23803041  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  23803042 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactga 23803141  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803142 tgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 23803237  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23803238 gttgattatgattttatgttgttatat 23803264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 18 - 336
Target Start/End: Original strand, 630381 - 630695
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||    
T  630381 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaac 630480  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  630481 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaatggaggttgaatataatattactga 630580  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  630581 tgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttaaagttgat 630676  T
Q  318 gttgattatcatttgatgt 336  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  630677 gttgattatgatttgatgt 630695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12611425 - 12611106
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||    
T  12611425 gaaaatagtccaacgaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaac 12611326  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  12611325 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattactga 12611226  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  12611225 tgatctatgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcatt---tgaattatataagatgtttaagttgat 12611133  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12611132 gttgattatgatttgatgttgttatat 12611106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Original strand, 51463545 - 51463867
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||| | || |||||||||    
T  51463545 gaaaatagtctaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataataccaaccctcaaaac 51463644  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  51463645 tagaagtactatgagtttaattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattattga 51463744  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463745 tgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 51463840  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  51463841 gttgattatgatttgatgttgttatat 51463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18213140 - 18212805
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  18213140 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 18213041  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  18213040 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 18212941  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18212940 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 18212845  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18212844 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 18212805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 357
Target Start/End: Original strand, 24047030 - 24047347
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  24047030 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 24047129  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 235  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | ||    
T  24047130 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagata 24047229  T
Q  236 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatg 335  Q
    ||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24047230 taatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgata 24047325  T
Q  336 ttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  24047326 ttgttatatcttaagatgttta 24047347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17333542 - 17333352
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||    
T  17333542 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataataatactgatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt----gttagta 17333447  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||| || | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17333446 atgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgattaagtgttgttgattattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 17333352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28385817 - 28385646
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28385817 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 28385718  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||    
T  28385717 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtgagttggtccttggggtag 28385646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9638581 - 9638399
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  9638581 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaatctcaaaac 9638482  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9638481 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 9638399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10705072 - 10704890
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10705072 gaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 10704973  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10704972 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10704890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 10918842 - 10918660
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10918842 gaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 10918743  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  10918742 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 10918660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 53630951 - 53631101
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53630951 gaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaac 53631050  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  53631051 tagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 53631101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 13591785 - 13591974
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||    
T  13591785 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----ta 13591880  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13591881 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatattttgagatgttta 13591974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 32306854 - 32307043
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || || |  ||| ||||||||| ||| ||||||||||    ||    
T  32306854 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattattgatgttcagtaagtctgatataatatggtttgatgttgatag----ta 32306949  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32306950 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttaatattgttatatcttgagatgttta 32307043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 15447894 - 15448057
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  15447894 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 15447993  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15447994 tggaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttctgagttgatctt 15448057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14825730 - 14825551
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  14825730 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14825635  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  14825634 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14825551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15008540 - 15008342
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  15008540 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattcgaaacctcaaaac 15008441  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15008440 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 15008342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15990613 - 15990439
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  15990613 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 15990514  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 192  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15990513 tagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtcattggggtaggaa 15990439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25091227 - 25091077
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  25091227 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcgaaac 25091128  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25091127 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaccaatgtt 25091077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 42875373 - 42875223
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  42875373 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattccaaacctcaaaac 42875274  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  42875273 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaggagtatttaacctatgtt 42875223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 56115314 - 56115528
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||     
T  56115314 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaag 56115413  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
     |||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||    
T  56115414 cagaagtactatgagttctattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaagga 56115513  T
Q  218 tgatctgtgaagctg 232  Q
    |||||||||||||||    
T  56115514 tgatctgtgaagctg 56115528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 11479089 - 11479237
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  11479089 gaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaac 11479188  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11479189 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatg 11479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 10694725 - 10694896
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  10694725 gaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 10694824  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10694825 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10694896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 10908491 - 10908662
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  10908491 gaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 10908590  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10908591 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 10908662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3337673 - 3337523
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  3337673 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 3337574  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3337573 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3337523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 10356914 - 10357064
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  10356914 gaaaatacaccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 10357013  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10357014 tagaagtattatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 10357064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19609898 - 19609748
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  19609898 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattccaaacctcaaaac 19609799  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19609798 tagaagtactatcagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19609748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 35660420 - 35660270
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  35660420 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataatctcaaacctcaaaac 35660321  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  35660320 tagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 35660270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40620104 - 40619907
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||    
T  40620104 gaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaatctcaaaac 40620005  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  40620004 tagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattatacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 40619907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 187
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884062
Alignment:
Q  42 tgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaa 141  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  142 ggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggt 187  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggt 15884062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 170 - 356
Target Start/End: Original strand, 26050340 - 26050521
Alignment:
Q  170 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 269  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| |    
T  26050340 tgagttgatccttgggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcaatgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taatgtga 26050435  T
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26050436 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgttt 26050521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9923770 - 9923622
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  9923770 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaac 9923671  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  9923670 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaatagtgtttaacctatg 9923622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37019243 - 37019095
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  37019243 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 37019144  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37019143 tagaagtactatgggttcaactaaggtgtttaagagtatttaacctatg 37019095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14549200 - 14549050
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  14549200 gaaagtactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaagac 14549101  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14549100 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttagcctatgtt 14549050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33849316 - 33849102
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  33849316 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 33849217  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||    
T  33849216 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaagga 33849117  T
Q  218 tgatctgtgaagctg 232  Q
    |||| | ||||||||    
T  33849116 tgatgtttgaagctg 33849102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15114796 - 15114648
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| ||  || |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  15114796 gaaaatactcaaagtaggtcttagtgaaatttat-gaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaccttaaaac 15114698  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15114697 tagaagtactaggagtttaattaaggagtttaagagtatttaacctatgt 15114648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 17048086 - 17048186
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17048086 gtaatgtaatatatttgtacatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 17048185  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  17048186 g 17048186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 19435175 - 19435326
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19435175 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattatatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataattccaaacctcaaaac 19435274  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  19435275 tagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 19435326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 33186475 - 33186312
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||||||     
T  33186475 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataactccaaccctcaaaat 33186376  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33186375 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatctt 33186312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16998099 - 16997954
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      
T  16998099 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaa-- 16998002  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
       |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16998001 ---aagtactatgagttgaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16997954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11425495 - 11425379
Alignment:
Q  52 tgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaag 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||| ||||||    
T  11425495 tgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactattagttcaattagggtgtttaag 11425396  T
Q  152 agtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||||||    
T  11425395 agtatttaacctatgtt 11425379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16043183 - 16043087
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16043183 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 16043087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 33243774 - 33243924
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  33243774 gaaaatactccaaaggggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctcaaaac 33243873  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  33243874 tagaagtactaggagtttaattgaggtgtttaagagtagctaacctatgtt 33243924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3485482 - 3485347
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||    
T  3485482 gaaaatactccaaggagatcttagtgaa--ttgttaaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc-caaccccaagac 3485386  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtat 156  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  3485385 tagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 3485347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 15011991 - 15012097
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15011991 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 15012090  T
Q  118 tagaagt 124  Q
    |||||||    
T  15012091 tagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 16277805 - 16277978
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| | ||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  16277805 gaaaatactccaaggaggttttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaac 16277904  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 191  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  16277905 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 16277978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 53387415 - 53387588
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||     
T  53387415 gaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaat 53387514  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 191  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  53387515 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 53387588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 14852734 - 14852924
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||    
T  14852734 atgttataagttgacccttggggtgggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----ta 14852829  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14852830 atgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttta 14852924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14630400 - 14630250
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||    
T  14630400 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaac 14630301  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14630300 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 14630250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 271 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40907230 - 40907131
Alignment:
Q  271 atatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtctgtg 370  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40907230 atatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttgattatcatttgatatttttatatcttgagatgtttatgtgttgcctgtg 40907131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 44024082 - 44024235
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  44024082 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 44024181  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44024182 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 44024235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Original strand, 15214552 - 15214672
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||   |    
T  15214552 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatatttccaaacctcgaaactggaagtactaggagtttaattaagaggt 15214651  T
Q  147 ttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15214652 ttaagagtatttaacctatgt 15214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Original strand, 15041911 - 15042010
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  15041911 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttaagatgttta 15042010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15112513 - 15112414
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  15112513 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgattaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttaagatgttta 15112414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40907084 - 40906974
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  40907084 tagtaatgtgatatagttatatatgcatgatgtggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttat 40906986  T
Q  359 gtgttgtctgtg 370  Q
    ||| ||| ||||    
T  40906985 gtgatgtttgtg 40906974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 232
Target Start/End: Original strand, 43251120 - 43251255
Alignment:
Q  98 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgga 196  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| |    
T  43251120 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaa 43251219  T
Q  197 ggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43251220 agttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctg 43251255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 19566397 - 19566546
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||    
T  19566397 gaaaatactccaaggaggtcttactgaaattttgtgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaac 19566496  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19566497 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19566546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 201
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871226
Alignment:
Q  100 aattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggt 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagt 9871224  T
Q  200 tg 201  Q
    ||    
T  9871225 tg 9871226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Original strand, 14746570 - 14746635
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746570 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 14746635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15792034 - 15791857
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| | | | ||  ||| ||||| ||||||| |||||| ||     |||    
T  15792034 gttatgagttgatcattgaggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttaa----taa 15791940  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15791939 tgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatacaagatgtttaagttgatgttgaattatcctttgatattgttatatct 15791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 345
Target Start/End: Original strand, 52243059 - 52243230
Alignment:
Q  171 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 270  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||| ||    
T  52243059 gagttgaactttggggtagtaatgaagattgtataagatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgat 52243154  T
Q  271 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    ||| ||||||||||||||  || |||||||| | |||||| || || |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  52243155 ataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40229877 - 40229723
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatctta-gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||     
T  40229877 gaaaatactccaaggaggtcttaagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaag 40229778  T
Q  117 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    || |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40229777 cttgt-gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 40229723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Original strand, 10237976 - 10238117
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||    
T  10237976 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaac 10238075  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 160  Q
    | |  |||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||    
T  10238076 ttg-tgtactatgagttaaattaatgtgtttaagagtatttaa 10238117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15344449 - 15344297
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||||| ||| |   || |||  ||||| |    
T  15344449 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtctccaaa-ttcaaagc 15344351  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    |  | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15344350 t-tatgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 15344297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 4831496 - 4831580
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4831496 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4831580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 4834791 - 4834875
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4834791 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 4834875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14047799 - 14047715
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14047799 tatattcgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 14047715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 26789598 - 26789441
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg-atctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||  || | ||  ||| ||||| || |||| |||||    | || |||    
T  26789598 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatgttgtagatgtttcagagagtctgatataa-ataatttgatgtt----gttaataa 26789504  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatt-atataagatgtttaagttgatgttgattat 326  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789503 tgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattaatataagatgtttaagttgatgttgattat 26789441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 46740771 - 46740619
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    
T  46740771 aaaatactccaaagacgtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct 46740672  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
     |  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  46740671 tg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 46740619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14185112 - 14185045
Alignment:
Q  297 atataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14185112 atatgagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgatgttatatcttgagacgtttatgtgttg 14185045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 45314815 - 45314965
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||  ||| |   || |||| ||||| |    
T  45314815 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttgtggattgtctccaaacttcaaagc 45314914  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 169  Q
    | |  | | || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45314915 ttg-tgcattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtta 45314965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 270 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 30146546 - 30146453
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 363  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  30146546 tatatttgcaaatgcattaagtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtctatgtgtt 30146453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 356
Target Start/End: Original strand, 26045268 - 26045340
Alignment:
Q  283 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26045268 gcattatgtggattatataagatgtttaagt-gttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgttt 26045340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 16026407 - 16026482
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  16026407 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataagtatttctaagttaacccaaaactta 16026482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 165
Target Start/End: Original strand, 13036332 - 13036402
Alignment:
Q  95 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||||||    
T  13036332 ggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaacctat 13036402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25513316 - 25513167
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |   |  |||||||||| |    
T  25513316 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaagttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgggttgtcttcaaacctcaaagc 25513217  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25513216 ttg-tgtactacgagttcaattacggtgtttaagaatatttaacctatgtt 25513167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26445458 - 26445309
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  26445458 gaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaatttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 26445359  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26445358 ttg-tgtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26445309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 55582765 - 55582703
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 80  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  55582765 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Original strand, 18108356 - 18108417
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 79  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18108356 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagt 18108417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12622927 - 12622792
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  12622927 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttc 12622829  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12622828 aattaaggtgtttaagagtatttaacctattttatga 12622792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14508317 - 14508186
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| || |  |||||| ||||||    
T  14508317 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagcttgt-gtactatgagttc 14508219  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14508218 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14508186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12487734 - 12487683
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12487734 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 12487683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 14954250 - 14954301
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14954250 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 14954301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25689893 - 25689842
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25689893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 25689842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27534049 - 27533998
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27534049 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 27533998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10712873 - 10712828
Alignment:
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10712873 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 10712828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10926643 - 10926598
Alignment:
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10926643 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 10926598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19857636 - 19857584
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 367  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19857636 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttgtct 19857584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 2425099 - 2425248
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||  |||||      
T  2425099 gaaactactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagg 2425198  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2425199 ttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 2425248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 255
Target Start/End: Original strand, 54798627 - 54798713
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  54798627 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 54798713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Original strand, 49547744 - 49547781
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49547744 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 49547781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 20595909 - 20596056
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| |||  || |||| ||||||||||  ||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||||||| ||  | || | ||||||||||||    
T  20595909 gaaaatacttcaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatgccaaacctcaaaac 20596008  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    | | |||  ||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  20596009 ttg-agttataggagttcaattatgatgtttaagagtatttaacctatg 20596056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 4561417 - 4561468
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4561417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4561468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 5757021 - 5757072
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5757021 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 5757072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9556553 - 9556502
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9556553 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 9556502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14280557 - 14280474
Alignment:
Q  172 agttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  14280557 agttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 14280474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 14757505 - 14757556
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14757505 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 14757556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33742401 - 33742350
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33742401 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 33742350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 357
Target Start/End: Original strand, 15497041 - 15497083
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15497041 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 15497083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 14048769 - 14048732
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14048769 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 14048732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922299
Alignment:
Q  123 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 26922299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36038062 - 36038025
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36038062 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 36038025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 364
Target Start/End: Original strand, 52873148 - 52873197
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  52873148 gatgttgattattatttgatgttgttataccttgaggtgtttaagtgttg 52873197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17810295 - 17810251
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17810295 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 17810251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 300
Target Start/End: Original strand, 44928821 - 44928914
Alignment:
Q  203 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| |   || || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  44928821 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtt---ta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 44928914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Original strand, 8574742 - 8574807
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 234  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8574742 atgagttggtctttagggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctatgaagctgtt 8574807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 167
Target Start/End: Original strand, 12134425 - 12134486
Alignment:
Q  106 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  12134425 aaacttcaaaactaaaagtattaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 12134486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15534373 - 15534336
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  15534373 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 15534336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Original strand, 19081819 - 19081892
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 91  Q
    ||||| ||| ||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||    
T  19081819 gaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttccaagtcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 248
Target Start/End: Original strand, 20157189 - 20157234
Alignment:
Q  203 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaa 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  20157189 atatgatattaatgatgatctgtgaagttgttatatgatgatttaa 20157234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44102433 - 44102404
Alignment:
Q  203 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102433 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 44102404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 95)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 18 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27472827 - 27472482
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27472827 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 27472728  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  27472727 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttatgagttgatccttggggtaggactggaggttgaatataatattactaa 27472628  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27472627 tgatctgtgaagctgttaaaatatgatttaatgttga----tagtaatataatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgtttaagttgat 27472532  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27472531 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgctgtct 27472482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 34873925 - 34874260
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34873925 gaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaac 34874024  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34874025 tagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatataatattactga 34874124  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34874125 tgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----aagtattgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 34874220  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34874221 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 34874260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 18358447 - 18358781
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  18358447 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 18358546  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18358547 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaccga 18358646  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18358647 tgatctgcgaagctgttat-atatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttgtatatgcaatatgtgaattatataagatgcttaagttgat 18358741  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358742 gttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgttta 18358781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Original strand, 21081449 - 21081788
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  21081449 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 21081548  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21081549 tagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtaggaatggaggatgaatataatattactga 21081648  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21081649 tgatatgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tactaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 21081744  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21081745 gttgattatcatttgatgtttttatatctttagatgtttacgtg 21081788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Original strand, 22173506 - 22173828
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22173506 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaccctcaaaac 22173605  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22173606 tcaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactga 22173705  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173706 tgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattaagtgaattatataagatgtttaagttgat 22173801  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22173802 gttgattatgatttgatgttgttatat 22173828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9242334 - 9241999
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  9242334 gaaaatactccaagtagatcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 9242235  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |  |||    
T  9242234 tagaagtaatatgagtgcaactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttga 9242135  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |   |||    | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9242134 tgttgaatgagtaagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 9242039  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9242038 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 9241999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 19662133 - 19662468
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||    
T  19662133 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaac 19662232  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  19662233 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 19662332  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19662333 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 19662428  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19662429 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 19662468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345184
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  140 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 239  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatttgtgaagctattataat 31345303  T
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31345302 atgaattagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 31345207  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31345206 tatatcttgagatgtttacgtgt 31345184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 21073207 - 21073540
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||    
T  21073207 aaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaatactcaaaacta 21073306  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 219  Q
    |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||    
T  21073307 gaagcaatatgagttcaattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatg 21073406  T
Q  220 atctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 319  Q
     |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21073407 ttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatattcattatgtggattatataagatatttaagttgatgt 21073502  T
Q  320 tgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21073503 tgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21073540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 213
Target Start/End: Original strand, 34858863 - 34859058
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34858863 gaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaac 34858962  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatatta 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34858963 tagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaatggaggttgaatataatatta 34859058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 6260856 - 6261192
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||    
T  6260856 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaac 6260955  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||| || || ||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  6260956 tagaaatattacgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 6261055  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata-tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttga 316  Q
    || |  ||||  | | |||||||| |||| |||||    | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6261056 tgttgagtgagtcagatataatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatattgcattatgtggattatataagatgtttaagttga 6261151  T
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6261152 tattgattatcatttgatattgttatatcttgagacgttta 6261192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21915196 - 21915025
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21915196 gaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 21915097  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21915096 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21915025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 168
Target Start/End: Original strand, 23969119 - 23969251
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23969119 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 23969218  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23969219 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23969251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9975503 - 9975353
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  9975503 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 9975404  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9975403 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 9975353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 70 - 357
Target Start/End: Original strand, 30643811 - 30644094
Alignment:
Q  70 gtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtta 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  |||||||||| ||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  30643811 gtttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttg 30643910  T
Q  170 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 269  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| |  ||||  | | |||||||  |||| |||||| |||    |||||  |    
T  30643911 tgagttgaccattagggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttgagtgagtcagatataatacaatttgatgttgttag----taatgaga 30644006  T
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30644007 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagtagatattgattatcatttgatattgttatatcttgagacgttta 30644094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36839745 - 36839595
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36839745 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 36839646  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36839645 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 36839595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 41301451 - 41301633
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||| |||||    
T  41301451 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaacccttaaaac 41301550  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  41301551 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 41301633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26903732 - 26903561
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  26903732 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 26903633  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  26903632 tagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtcattggggtag 26903561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 24781318 - 24781468
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  24781318 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 24781417  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24781418 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagaatatttaacctatgtt 24781468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 27484948 - 27485098
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27484948 gaaaatactccaagtaggtcttagtggaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 27485047  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27485048 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 27485098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 5031608 - 5031758
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5031608 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 5031707  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||    
T  5031708 tataagtactatgagttcaactaggctgtttaagagtatttaacatatgtt 5031758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20915679 - 20915525
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  20915679 gaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 20915580  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  20915579 tagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaacctatgctatga 20915525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Original strand, 23338878 - 23339092
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  23338878 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 23338977  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||    
T  23338978 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaagga 23339077  T
Q  218 tgatctgtgaagctg 232  Q
    |||| ||||||||||    
T  23339078 tgatgtgtgaagctg 23339092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25183761 - 25183603
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  25183761 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 25183662  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 176  Q
    || ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25183661 tataagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 25183603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 34137200 - 34137006
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| || ||||  ||| ||||||||||| | |||||     ||||||||    
T  34137200 gttatgagatgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttcagtgagtctgatataatatgatgtgatgtta----ctagtaat 34137105  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34137104 gtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatctcttgagatgtttatgtgttg 34137006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 19201680 - 19201828
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  19201680 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataatttcaaacctcaaaact 19201779  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19201780 agaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 19201828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26392643 - 26392455
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||  ||      
T  26392643 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgttctgtgaatttgttattacatgatctaatgttgatagaaag-- 26392546  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
      || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26392545 --gtgatatatttgtatatgcattatgtggattagataagatgtttaag-tattgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 26392455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17307061 - 17306911
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  17307061 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattccaaaactcaaaac 17306962  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||    
T  17306961 tagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagatcatttaacatatgtt 17306911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 24273737 - 24273887
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  24273737 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 24273836  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24273837 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 24273887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21368681 - 21368532
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21368681 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataattctaaacctcaaaac 21368582  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  21368581 tagaagtactaggagtttaaataagaggtttaagagtatttaacctatgt 21368532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24883960 - 24883785
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  24883960 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaccctcaaaac 24883861  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24883860 tagaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtagtgagttgatc-ttgggataggaatg 24883785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 9785156 - 9785013
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9785156 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 9785057  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    |||||| |||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  9785056 tagaagaactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 9785013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 23068928 - 23069071
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23068928 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 23069027  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    || |||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  23069028 tataagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 23069071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31520691 - 31520509
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  31520691 gaaaatactccaaggaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaac 31520592  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    |  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||    
T  31520591 tgaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatggaagttg 31520509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 43707763 - 43707912
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43707763 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtt-ctaagttaatctaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaac 43707861  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43707862 tagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 43707912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Original strand, 18388775 - 18388940
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  18388775 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctttggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaac 18388874  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttg 183  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||  |||||||| ||||    
T  18388875 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattttactcatgttgagagttgatttttg 18388940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 10039612 - 10039775
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  10039612 gaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 10039711  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  10039712 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatctt 10039775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 237 - 361
Target Start/End: Original strand, 23069215 - 23069335
Alignment:
Q  237 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 336  Q
    |||||||||| |||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23069215 aatatgatttgatgttgatggc----aatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatat 23069310  T
Q  337 tgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23069311 tgttatatcttgagatgtttacgtg 23069335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23287625 - 23287438
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| || |||||| | |||    |||||    
T  23287625 atgttgtgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtggatctgttataacattatttaacgatga----tagta 23287530  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23287529 atgtgatatatttgtatatgcaatatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 23287438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 28652981 - 28653123
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28652981 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatggaaattcagcataaccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattccaaacctcaaaact 28653080  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  28653081 agaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaac 28653123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6483091 - 6482946
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaact 118  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  6483091 aaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaact 6482992  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6482991 agaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 6482946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6486558 - 6486413
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaact 118  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  6486558 aaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaact 6486459  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||| || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6486458 agaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 6486413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 23005012 - 23004835
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    | || |     
T  23005012 atgttatgagttgatcctttgggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgatttaacgtt----gttaatg 23004917  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  23004916 atgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 23004835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24515760 - 24515610
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||| ||||||||    
T  24515760 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaatctcaaaac 24515661  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24515660 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgtt 24515610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 20590800 - 20590956
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  20590800 gaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttaagggataattccaagactcaaaac 20590899  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 174  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20590900 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 20590956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9784848 - 9784754
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9784848 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttgattatcattggatgttgttatatcttgagatgttta 9784754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28349489 - 28349268
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataattcaaaacc 110  Q
    |||||||||||  || |||| ||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| ||| |    
T  28349489 aaatactccaagtaggtcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagc 28349390  T
Q  111 tcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  |||    
T  28349389 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgatttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggata 28349290  T
Q  211 ttaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  28349289 ttaatgatgatctgtgaagctg 28349268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 345
Target Start/End: Original strand, 20520051 - 20520227
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||    | | || ||    
T  20520051 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatg----tcgttaata 20520146  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  20520147 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 20520227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21237924 - 21237816
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21237924 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgatgaattattatttgatattgttatatcttgagatgttta 21237825  T
Q  358 cgtgttgtc 366  Q
     ||| ||||    
T  21237824 tgtgctgtc 21237816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 191
Target Start/End: Original strand, 2524265 - 2524380
Alignment:
Q  76 aagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagtt 175  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2524265 aagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaatcaaggtatttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 2524364  T
Q  176 gatctttggggtagga 191  Q
    || |||| ||||||||    
T  2524365 gacctttagggtagga 2524380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Original strand, 19201924 - 19202030
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19201924 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatatgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 19202023  T
Q  358 cgtgttg 364  Q
     ||||||    
T  19202024 tgtgttg 19202030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 355
Target Start/End: Original strand, 18546803 - 18546991
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || |  ||||| |||||||   || ||||||||  ||| |||||| |||    ||    
T  18546803 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattttagtactgttgatgttctgtgagtttgatataatatattttgatgttgttag----ta 18546898  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatta-tataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||    
T  18546899 atgtgatacatttgtatatgcattatgtaaattaatgtaagatgtctaagttgatgttgattatcctttgatattgttatgtctggatatgtt 18546991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Original strand, 23707275 - 23707340
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707275 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 23707340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24918244 - 24918179
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918244 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 24918179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 164 - 308
Target Start/End: Original strand, 22412994 - 22413134
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || ||    
T  22412994 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgtt----gttaata 22413089  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 308  Q
    |||| |||||  |||||||||||||  |||||||| || ||||||    
T  22413090 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt 22413134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501260
Alignment:
Q  86 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 185  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22501276  T
Q  186 gtaggaatggaggttg 201  Q
     |||||||||| ||||    
T  22501275 ataggaatggaagttg 22501260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509194
Alignment:
Q  86 aaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 185  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatc-ttggg 22509210  T
Q  186 gtaggaatggaggttg 201  Q
     |||||||||| ||||    
T  22509209 ataggaatggaagttg 22509194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 345
Target Start/End: Original strand, 24697467 - 24697641
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    | || ||||    
T  24697467 gttatgagtagatccttagggtaggagtggaggttgtatttaatattaatgatgatctgtgaagctg-tataatatgattttatgtt----gttaataat 24697561  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    || |||||  |||||||||||||  |||||| |||| || |||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  24697562 gtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24681548 - 24681483
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681548 tatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 24681483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 296 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24671129 - 24671065
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24671129 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 24671065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 21316140 - 21316289
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  21316140 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 21316239  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21316240 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21316289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22690254 - 22690101
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||      
T  22690254 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagt 22690155  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
     ||  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22690154 cag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22690101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29113935 - 29113786
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| ||||||     
T  29113935 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattcctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaat 29113836  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29113835 ttg-tgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 29113786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22332290 - 22332142
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| |||| ||||||     
T  22332290 gaaaacactccaatgaggtcttggtgaa-ttttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaaa 22332192  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22332191 ttgt-gtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacctatgtt 22332142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22694850 - 22694697
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||      
T  22694850 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagt 22694751  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
     ||  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22694750 cag-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatga 22694697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22703258 - 22703174
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22703258 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaaattg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 22703174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 21335931 - 21336080
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||  || ||| |   || |||| ||||| |    
T  21335931 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaagttttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaagctatggattgtctccaaacttcaaagc 21336030  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21336031 ttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 21336080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 23610050 - 23609901
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| |    
T  23610050 gaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacctatggattgtctccaaacttcaaagc 23609951  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23609950 ttg-tgtactgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23609901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6482899 - 6482838
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6482899 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6482838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6486366 - 6486305
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  6486366 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttaattaccatttgatattgttatatctt 6486305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22686395 - 22686264
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |  |||||| ||||||    
T  22686395 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatggattgtctcgaaacttcaaagcttgt-gtactatgagttc 22686297  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22686296 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22686264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1283412 - 1283361
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1283412 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1283361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 30345074 - 30345125
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30345074 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 30345125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 41531087 - 41531138
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41531087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 41531138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 13101597 - 13101682
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat-gttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13101597 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgataatttttatatcttgagatgt 13101682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 346
Target Start/End: Original strand, 43947324 - 43947408
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt-taagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  43947324 taatgtgatatatt-gtatatgcactatgtgaattatatgagatgttgtaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 43947408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 344
Target Start/End: Original strand, 24642807 - 24642855
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24642807 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 24642855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 1384164 - 1384239
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  1384164 gaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaactcaaaactta 1384239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 25587165 - 25587240
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  25587165 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaggtcaacccaaaactta 25587240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 300
Target Start/End: Original strand, 23708521 - 23708609
Alignment:
Q  208 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23708521 atattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 23708609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24841422 - 24841377
Alignment:
Q  123 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24841422 gtactatgagttcaattaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 24841377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 12901595 - 12901646
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12901595 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12901646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 24628562 - 24628613
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24628562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 24628613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24649380 - 24649329
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24649380 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 24649329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 27379516 - 27379567
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27379516 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27379567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 27383562 - 27383613
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27383562 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27383613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27601819 - 27601768
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27601819 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 27601768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 189
Target Start/End: Original strand, 34492091 - 34492141
Alignment:
Q  139 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  34492091 taaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 34492141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 167
Target Start/End: Original strand, 22786819 - 22786924
Alignment:
Q  62 gcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||   ||  |||  ||||||||||||    
T  22786819 gcataaccgtttctaactcaatccaaaacctatggaacgtttccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaatcgagagattggagagtatttaac 22786918  T
Q  162 ctatgt 167  Q
    ||||||    
T  22786919 ctatgt 22786924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Original strand, 10101728 - 10101772
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10101728 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 10101772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 364
Target Start/End: Original strand, 22459579 - 22459617
Alignment:
Q  326 tcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22459579 tcatttgatgttgttatatctttagatgtttatgtgttg 22459617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Original strand, 10684735 - 10684772
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10684735 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 10684772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20261411 - 20261374
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20261411 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 20261374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 40911897 - 40911868
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaat 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40911897 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaat 40911868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 210
Target Start/End: Original strand, 43947232 - 43947276
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 210  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  43947232 gttatgagttgacccttagggtaggaatggaggttgattataata 43947276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 567 - 225
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  567 gaaaatactccaaaaaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 468  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  467 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactga 368  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  367 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatttgaattatataagatgtttaagttgat 272  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  271 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttg 225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 67668 - 67330
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||    
T  67668 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaatctgaaaac 67569  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |    
T  67568 tagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgttaagagttgatcattggggtaggaatggatgttgaatataatattactta 67469  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  67468 tgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttttatatgcattatgtgaattgtataagatgtttaagttgat 67373  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  67372 gttgattatcatttgatgttgttatatcttg-ggtgtttacgtg 67330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 92
Target Start/End: Original strand, 62448 - 62522
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactt 92  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  62448 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaaccaaaactt 62522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 167
Target Start/End: Original strand, 116891 - 117032
Alignment:
Q  26 tccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 125  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| ||||||| |||||||    
T  116891 tccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaaccagaagta 116990  T
Q  126 ctaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
     |||||||| || ||||   |||||||||||| |||||||||    
T  116991 ttaggagtttaagtaagaggtttaagagtattaaacctatgt 117032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 177)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 52 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14273888 - 14273583
Alignment:
Q  52 tgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaag 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||    
T  14273888 tgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaag 14273789  T
Q  152 agtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 251  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273788 agtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgt 14273689  T
Q  252 tgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 351  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14273688 tga----tagtaatgtaatatatttgtatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaga 14273593  T
Q  352 tgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||    
T  14273592 tgtttacgtg 14273583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 94 - 361
Target Start/End: Original strand, 46580464 - 46580727
Alignment:
Q  94 gggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 193  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46580464 gggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaat 46580563  T
Q  194 ggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtga 293  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580564 ggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtga 46580659  T
Q  294 attatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46580660 attatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 46580727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16999006 - 16998665
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||    
T  16999006 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaac 16998907  T
Q  118 tagaagtactag------gagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatat 211  Q
    ||||||||| |       |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16998906 tagaagtaccatcaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggagattgaatataatat 16998807  T
Q  212 taatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaa 311  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998806 tactgatgatctgtgaagcagttataatatgatttaatgttgataa----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaa 16998711  T
Q  312 gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998710 gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 16998665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13647816 - 13647492
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||    
T  13647816 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaac 13647717  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13647716 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactga 13647617  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttata--atatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 315  Q
    ||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13647616 tgatctgcgaagctattataatatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttg 13647521  T
Q  316 atgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13647520 atgttgattatgatttgatgttgttatat 13647492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Original strand, 13918266 - 13918578
Alignment:
Q  39 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  13918266 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 13918365  T
Q  139 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 238  Q
    |||||| |||||||||||       || |||||| ||  | |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13918366 taaggtgtttaagagtata------atattatgatttagtgtttggg-taggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 13918458  T
Q  239 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 338  Q
    ||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |    
T  13918459 tatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattttgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatatcg 13918554  T
Q  339 ttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13918555 ttatatcttgagatgtttacgtgt 13918578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18872734 - 18872399
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||    
T  18872734 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaac 18872635  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  18872634 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 18872535  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18872534 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 18872439  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18872438 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 18872399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16008952 - 16008610
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||    
T  16008952 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaac 16008853  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  16008852 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 16008753  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | |||||||| |||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16008752 tgttgagtgagtcagatataatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 16008657  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16008656 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 16008610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 11661677 - 11661345
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| || |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||    
T  11661677 aaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaacta 11661578  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 219  Q
    |||||| || |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||    
T  11661577 gaagtaatatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga-ccctggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatg 11661479  T
Q  220 atctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 319  Q
     |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11661478 ttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgt 11661383  T
Q  320 tgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11661382 tgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 11661345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927301
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  140 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 239  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | |  ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtc-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataat 25927185  T
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    |||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  25927186 atgatttagtgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagt---tgttgattatcatttgatattgt 25927278  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25927279 tatatcttgagatgtttacgtgt 25927301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14566576 - 14566241
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  ||||||||    
T  14566576 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaac 14566477  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || ||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  14566476 tagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 14566377  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14566376 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 14566281  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14566280 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 14566241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18607861 - 18607526
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||  ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  18607861 gaaaatactccaagtaggtcttaaggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 18607762  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  18607761 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 18607662  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18607661 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 18607566  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  18607565 gttgattatcatttgatatttttatatattgagatgttta 18607526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Original strand, 1858707 - 1858884
Alignment:
Q  181 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat 280  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||    
T  1858707 ttggggtaggaatgtgggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctattataatatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtat 1858802  T
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1858803 atgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1858884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 18456126 - 18456342
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  18456126 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 18456225  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18456226 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttaaatataatattaatta 18456325  T
Q  218 tgatctgtgaagctgtt 234  Q
    | |||||||||||||||    
T  18456326 taatctgtgaagctgtt 18456342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 164 - 344
Target Start/End: Original strand, 9177524 - 9177700
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||    
T  9177524 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttttaacatgatttaatgttga----tagta 9177619  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  9177620 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattattatat 9177700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14422359 - 14422023
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  14422359 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 14422260  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  14422259 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 14422160  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttga 316  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  14422159 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggatcatataagatgttttaagttga 14422064  T
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14422063 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgttta 14422023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 164 - 355
Target Start/End: Original strand, 17017326 - 17017513
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  17017326 atgttatgagttgatccttggggtagggatggaggttgaatatagtattactaatgttctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 17017421  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  17017422 atgtaatatatttgtatatgcattatatgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatgttattatatctggatatgtt 17017513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 709033 - 709204
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  709033 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 709132  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  709133 tagaagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 709204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48812412 - 48812241
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48812412 gaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaac 48812313  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  48812312 tagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 48812241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 14415962 - 14416112
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14415962 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 14416061  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14416062 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14416112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 17060282 - 17060472
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  17060282 atgttatgagttgatccttggggtagaaacggaggttgaatataatattactgatgttctatgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 17060377  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17060378 atgtcaaatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgaagttgattatcgtttgatattgttatattttgagatgttta 17060472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 14191564 - 14191735
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  14191564 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 14191663  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    || ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14191664 tataagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14191735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 30820735 - 30820910
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  30820735 aaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaact 30820834  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  30820835 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 30820910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 58896 - 59071
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  58896 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 58995  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  58996 tagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 59071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 14188770 - 14188941
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  14188770 gaaaatactccaaggaggtctttgtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 14188869  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    || ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  14188870 tataagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 14188941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16462610 - 16462439
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16462610 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 16462511  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  16462510 tagaagtactatgagttaaattaaggtgattaacagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 16462439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 32160680 - 32160851
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  32160680 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 32160779  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||    
T  32160780 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtag 32160851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Original strand, 8756875 - 8757056
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  8756875 aaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaacctcaaaact 8756974  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8756975 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8757056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 237 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32301476 - 32301353
Alignment:
Q  237 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 336  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301476 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatctttaagttgatgttgattatcatttgatgt 32301381  T
Q  337 tgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301380 tgttatatcttgagatgtttacgtgttg 32301353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 46386565 - 46386715
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  46386565 gaaaatattccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 46386664  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46386665 tagaagtactatgagttcaactatggtgtttaagagtatttaacctatgtt 46386715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12371848 - 12371699
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  12371848 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaact 12371749  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  12371748 agaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 12371699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 15119773 - 15119921
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  15119773 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaac 15119872  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15119873 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 15119921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 47975389 - 47975560
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||    
T  47975389 gaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacatcaaaac 47975488  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  47975489 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttcgtccttggggtag 47975560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 13745254 - 13745404
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13745254 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcgatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 13745353  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13745354 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttcagagtatttaacctatgtt 13745404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19282666 - 19282516
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||     
T  19282666 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaaa 19282567  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19282566 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19282516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 147992 - 147704
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  147992 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 147893  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  147892 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaattgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 147793  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 310  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    |  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  147792 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gtgagtaatgagatatatttgtataagcattatgtggattatatgagatgttta 147704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 16460410 - 16460553
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16460410 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 16460509  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||| | ||||||||    
T  16460510 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatattatttaac 16460553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 47094654 - 47094491
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  47094654 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 47094555  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47094554 tagtagtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 47094491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 13147950 - 13148100
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13147950 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 13148049  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || ||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13148050 tacaagtattatgagatcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13148100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 13745678 - 13745828
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  13745678 gaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacctcaaaac 13745777  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13745778 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13745828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 16550482 - 16550679
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  16550482 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 16550581  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16550582 tagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16550679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16615180 - 16614983
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  16615180 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 16615081  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  16615080 tagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgttccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 16614983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44374520 - 44374370
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  44374520 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaac 44374421  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44374420 tagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44374370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 44383385 - 44383235
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  44383385 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccagacctcaaaac 44383286  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  44383285 tagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 44383235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 8851637 - 8851786
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  8851637 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaac 8851736  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8851737 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagattatttaacctatgt 8851786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 16460717 - 16460817
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16460717 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16460816  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  16460817 g 16460817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 16580234 - 16580091
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16580234 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaac 16580135  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16580134 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 16580091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 16585429 - 16585572
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16585429 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaac 16585528  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  16585529 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 16585572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11067042 - 11066892
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  11067042 gaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgcaaacctcaaaac 11066943  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11066942 tagaagtactatgatttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 11066892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 12465738 - 12465888
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12465738 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 12465837  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| || ||||| || | | |||||||||||||||| ||||||    
T  12465838 tagaagtactatgacttcaattaggatgtttaagagtatttaacttatgtt 12465888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15167549 - 15167403
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  15167549 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaac 15167450  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15167449 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 15167403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 32434067 - 32434221
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  32434067 gaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttcaaacctcaaaac 32434166  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  32434167 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaatctatgttatga 32434221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 36685727 - 36685904
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  36685727 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaac 36685826  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggt-atttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  36685827 tagaagtactatgagttcaattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 36685904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 12755184 - 12755359
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||    
T  12755184 gaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaac 12755283  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12755284 tagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttgacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12755359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 259 - 367
Target Start/End: Original strand, 14157054 - 14157162
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14157054 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 14157153  T
Q  359 gtgttgtct 367  Q
    |||||||||    
T  14157154 gtgttgtct 14157162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14258619 - 14258519
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14258619 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 14258520  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  14258519 g 14258519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16579927 - 16579827
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579927 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16579828  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  16579827 g 16579827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 16585736 - 16585836
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16585736 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtttttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 16585835  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  16585836 g 16585836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 168
Target Start/End: Original strand, 14928829 - 14928960
Alignment:
Q  37 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14928829 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttta 14928928  T
Q  137 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  14928929 attaaagtgtttaaaagtatctaacctatgtt 14928960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 168
Target Start/End: Original strand, 15352295 - 15352426
Alignment:
Q  37 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15352295 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaggagttta 15352394  T
Q  137 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  15352395 attaatgtgtttaaaagtatctaacctatgtt 15352426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 17070771 - 17070934
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||    
T  17070771 gaaaatactccaaggaggtcttattgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaattctcaaaac 17070870  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17070871 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttgatctt 17070934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Original strand, 10501373 - 10501478
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10501373 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 10501472  T
Q  359 gtgttg 364  Q
    ||||||    
T  10501473 gtgttg 10501478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14258908 - 14258783
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14258908 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 14258809  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  14258808 aattaaggggtttaagagtatttaac 14258783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 181
Target Start/End: Original strand, 40555223 - 40555384
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||    
T  40555223 aaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaacta 40555322  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||    
T  40555323 gaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacccatattgtgagttgatctt 40555384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42462209 - 42462015
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| ||  |||  ||| |||||||| |||| |||||    | |||||||    
T  42462209 gttatgagttgacccttggggtaggaatgaaggttgattatagtactgttgatgttcaatgagtctgatataatataatttgatgtt----gttagtaat 42462114  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42462113 gtgatatagttgtatattcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 42462015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 48991422 - 48991266
Alignment:
Q  184 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatg 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| | ||||| |||||||||    
T  48991422 gggtaggaatagaggttgaatacaatattgatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaat-tgatata-ttgtatatg 48991329  T
Q  284 cattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  48991328 cattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatct 48991266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 832501 - 832676
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  832501 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaac 832600  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    |||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  832601 tagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 832676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 1197681 - 1197856
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  1197681 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaac 1197780  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    |||||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1197781 tagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1197856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4325630 - 4325448
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  4325630 gaaaatactccaagaaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataattccaaagctcaaaac 4325531  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  4325530 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 4325448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 13699367 - 13699549
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  13699367 gaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataattccaaccctcaaaac 13699466  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  13699467 tagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttt-ggataggaatggaagttg 13699549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16092019 - 16091844
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||    | || ||    
T  16092019 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatataatattaatgatgatatgtgaagctgttatactatgaattattgtt----gttaata 16091924  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||    
T  16091923 atgttacatatttgtatacgcattatgtggattatatatgatgattaag-tgttgttgattatcatttgatattattatat 16091844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 10896472 - 10896618
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10896472 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaac 10896571  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    |||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  10896572 tagaagtattatgagttcaattaagctgtttaagagtatttaaccta 10896618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 12127662 - 12127792
Alignment:
Q  38 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 137  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12127662 ttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 12127761  T
Q  138 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     || ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12127762 atagggtgtttaagagtatttaacgtatgtt 12127792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16996477 - 16996295
Alignment:
Q  170 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 269  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    |||||| |    
T  16996477 tgagttgacccttaggttaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taatgtga 16996382  T
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16996381 tatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaa-atgttgttgattttcatttgatattgttatatcttgagatgttta 16996295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13408346 - 13408170
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||    
T  13408346 gaaaattctccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaac 13408247  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 195  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  13408246 tagaagtactatgagttcaattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatgg 13408170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34957744 - 34957579
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||   ||||||||    
T  34957744 aaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataattccaaggatcaaaact 34957645  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgg 184  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34957644 agaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatccttgg 34957579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15214073 - 15213917
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  15214073 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 15213974  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagt 174  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  15213973 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaatttatgttgtgagt 15213917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20487710 - 20487614
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20487710 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatgtcttgagatattta 20487614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 37727405 - 37727580
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||    
T  37727405 gaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccatcaaaac 37727504  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  37727505 tagaagtactatgagttcaatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 37727580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20585907 - 20585780
Alignment:
Q  41 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 140  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20585907 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaattagaagtactatgagttcaacta 20585808  T
Q  141 aggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20585807 gggtgtttaagagtatttaacttatgtt 20585780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 33001488 - 33001338
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33001488 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 33001389  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33001388 tagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagaatttaacctatgtt 33001338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 17505482 - 17505655
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  17505482 gaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaac 17505581  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 191  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17505582 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 17547732 - 17547559
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  17547732 gaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattccaagactcaaaac 17547633  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtagga 191  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17547632 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagtagacccttgaggtagga 17547559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13894651 - 13894519
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13894651 tcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 13894552  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13894551 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13894519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 32301756 - 32301613
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  32301756 gaaaatactccaagtaggtcttaatgaaattttatgaaaatacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaac 32301657  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    || |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  32301656 tataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 32301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 12323408 - 12323530
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12323408 gaaaatacttgaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 12323507  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaacta 140  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  12323508 taaaagtactatgagttcaacta 12323530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 38519543 - 38519445
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38519543 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattgtataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 38519445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38828617 - 38828304
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38828617 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaactagaagtactatgagttc 38828518  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 235  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||| || || || | ||| | ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||    
T  38828517 aattaaggtgtttaagagtatttaacccacgttgtgagttgatcctcgggttatgagtgaatgtttattataatactgttgatgttcagtgagtctgata 38828418  T
Q  236 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 334  Q
    ||| |||| || |||||    | || | | ||  || ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38828417 taagatga-ttgatgtt----gttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgat 38828324  T
Q  335 gttgttatatcttgagatgt 354  Q
     || ||||||||||||||||    
T  38828323 attattatatcttgagatgt 38828304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 48743877 - 48743727
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  48743877 gaaaatacttcaaggagaacttagtgaaatcttataaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 48743778  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  48743777 tagatgtactatgagttcaattaaggtgtttaggagtatttaacatatgtt 48743727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 320
Target Start/End: Original strand, 9725518 - 9725670
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||    ||    
T  9725518 atgttattagttgatccttggggtaggaatggaggttgtttataatattactaatgttcagtgagtctgatataatgtgatttaatgttgttag----ta 9725613  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 320  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9725614 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgatgtt 9725670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 164 - 353
Target Start/End: Original strand, 11768777 - 11768964
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||    
T  11768777 atgttatgagtcgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgtttatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----ta 11768872  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg--attatcatttgatgttgttatatcttgagatg 353  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11768873 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaaatattatttgatattgttatatcttgagatg 11768964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 356
Target Start/End: Original strand, 130680 - 130864
Alignment:
Q  170 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgt-tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| || |  ||||| || ||||   ||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||     
T  130680 tgagttgatccttggggtaggaatggtggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtttgtatataatatgatttgatgtt-at---tagtaatgtg 130775  T
Q  269 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  130776 atatagttgtatatgcattatgtggattatataaggtgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 130864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20619860 - 20619714
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||     
T  20619860 gaaaatactccaagtaggtcttaataaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattccaaaactcaaaat 20619761  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    |||||||| ||||| || || |||||  |||||||||||||||||||    
T  20619760 tagaagtattaggattttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 20619714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29004396 - 29004214
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| |  ||| || ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||| |   || |||||    
T  29004396 gaaaatactcaagggaggtcctagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccaggactaaaaac 29004297  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 200  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||| |||||    
T  29004296 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctttggttaggaatgaaggtt 29004214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 203 - 308
Target Start/End: Original strand, 2529951 - 2530052
Alignment:
Q  203 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2529951 atataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtgatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaa 2530046  T
Q  303 gatgtt 308  Q
    ||||||    
T  2530047 gatgtt 2530052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 164 - 364
Target Start/End: Original strand, 9033204 - 9033401
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| || |  | ||| || ||||  ||  |||||| |||||| |||||| ||     ||    
T  9033204 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttggttatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatgtgatttgatgttgttaa----ta 9033299  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  9033300 atgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgcattattatttgatattgttatatcctgagatatttatgtgt 9033399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 237 - 346
Target Start/End: Original strand, 14929152 - 14929257
Alignment:
Q  237 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 336  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14929152 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 14929247  T
Q  337 tgttatatct 346  Q
    |||| |||||    
T  14929248 tgttgtatct 14929257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 237 - 346
Target Start/End: Original strand, 15352618 - 15352723
Alignment:
Q  237 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 336  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15352618 aatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttggatatgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatat 15352713  T
Q  337 tgttatatct 346  Q
    |||| |||||    
T  15352714 tgttgtatct 15352723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 32771884 - 32771760
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  32771884 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 32771785  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaa 160  Q
    || |||||| |||||||||||||||    
T  32771784 aattaaggtgtttaagagtatttaa 32771760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 182 - 357
Target Start/End: Original strand, 11525440 - 11525612
Alignment:
Q  182 tggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtata 281  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||| | ||||| ||   ||||||| | ||||||| |||||    
T  11525440 tggggtaggaatgaaggtggattataataatgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatatgatgtt-at---tagtaatttgatatattggtata 11525535  T
Q  282 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11525536 tgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgattgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 11525612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 14153450 - 14153603
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  14153450 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 14153549  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
      |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14153550 ctg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 14153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20619552 - 20619446
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20619552 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataatatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 20619453  T
Q  358 cgtgttg 364  Q
     ||||||    
T  20619452 tgtgttg 20619446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14045010 - 14044922
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14045010 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14044922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14355040 - 14354952
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgtt 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14355040 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatgttaatgatgatctgtgaagctgttatactatgatttaatgtt 14354952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 345
Target Start/End: Original strand, 15008357 - 15008533
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || ||    
T  15008357 atgttatgagttgaaccttcgagtatgaatggaggttgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgtt----gttaata 15008452  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  15008453 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatc 15008533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 285 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15720140 - 15720064
Alignment:
Q  285 attatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15720140 attaagtgaattagataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15720064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28720005 - 28719885
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||   |    
T  28720005 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaagaggt 28719906  T
Q  147 ttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  28719905 ttaaaagtatttaacctatgt 28719885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 18875325 - 18875474
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||  ||| |   || |||||||||||||    
T  18875325 aaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctccaaacctcaaaact 18875424  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||  ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18875425 agaagtaacaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 18875474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 117
Target Start/End: Original strand, 29052633 - 29052732
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29052633 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20487972 - 20487874
Alignment:
Q  63 cataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  20487972 cataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaacagtatttaac 20487874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8940383 - 8940318
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940383 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 8940318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14036460 - 14036387
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14036460 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14036387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 164 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14346490 - 14346417
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14346490 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgtatatgatattaatgatgatctgtgaagctgttata 14346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 8514224 - 8514377
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   | ||||| ||||| |    
T  8514224 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttaaaacttcaaatc 8514323  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8514324 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatga 8514377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 195
Target Start/End: Original strand, 13864873 - 13865040
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||   ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||     
T  13864873 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaag 13864972  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgg 195  Q
    ||||||||||| ||||||||         |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13864973 tagaagtactatgagttcaa---------ttaagagtatttaatccatgttatgagttgatc-ttgggataggaatgg 13865040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 184 - 356
Target Start/End: Original strand, 1867874 - 1868040
Alignment:
Q  184 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatg 283  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    | || |||||| |||||||||||||||    
T  1867874 gggtaggaatggaggttatatatgatattaatgatgatctgtgaagct-ttttaagatgatttgatgtt----gttaataatgtgatatatttgtatatg 1867968  T
Q  284 cattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||| || || |||| |||  || ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  1867969 cattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgttt 1868040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 39292215 - 39292364
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||| | ||  ||||||||| ||| |  ||| |||| |||||||    
T  39292215 gaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtttccaaacttcaaaac 39292314  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39292315 ttgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 39292364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 837317 - 837401
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  837317 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 837401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 1202497 - 1202581
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1202497 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 1202581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 16109474 - 16109558
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16109474 tatatttgtaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgctatatcttgagatgt 16109558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Original strand, 38898181 - 38898241
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38898181 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctagagatgttt 38898241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 43277221 - 43277372
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa-ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 116  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||| || ||  ||||||||| ||| |   || |||||||||||    
T  43277221 gaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatcaaaaattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaa 43277320  T
Q  117 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  43277321 ctagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacatatgtt 43277372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 4691374 - 4691523
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||      
T  4691374 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagt 4691473  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4691474 ttg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaaccaatgtt 4691523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 24270460 - 24270609
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  24270460 gaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaaccgaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 24270559  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  ||| |  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24270560 ttg-tgtattgtgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24270609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 833321 - 833405
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  833321 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 833405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 1198501 - 1198585
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1198501 tatatttgcaaatgcattatgtgaaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcaattgatattgttatatcttgagatgt 1198585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 3192771 - 3192920
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| |   |  ||| |||| |||||||    
T  3192771 gaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattgtgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgtttctaaacttcaaaac 3192870  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||||||| || ||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  3192871 tagaagtattatgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 3192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Original strand, 10896687 - 10896748
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10896687 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 10896748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 14161334 - 14161482
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| ||    
T  14161334 aaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct 14161433  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     |  |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14161434 tg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 14161482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15167346 - 15167285
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15167346 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 15167285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15720322 - 15720250
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 91  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15720322 aaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 20252820 - 20252969
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  20252820 gaaaatactccaatgaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagc 20252919  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |    |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20252920 t-tttgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 20252969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 21538667 - 21538816
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||| || ||||||||||  || |  ||| |||| |||||||    
T  21538667 gaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtttccaaacttcaaaac 21538766  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  ||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21538767 ttgt-gtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21538816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 15978534 - 15978682
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| ||||||| ||| |||  || ||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  15978534 gaaaacactccaaggaggtctcggtaaaactttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaac 15978633  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||   |||||||| | |||||||||||    
T  15978634 tagaagtactaggggtt-aattaagaggtttaagagcacttaacctatgt 15978682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 9743559 - 9743706
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| | ||| |    
T  9743559 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaactttaaagc 9743658  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  9743659 ttg-tgtactatgagttcaattaaggcgtttaagcgtatttaacctatg 9743706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18203965 - 18203887
Alignment:
Q  277 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18203965 gtatatgcattgtgtggattatatatgatgattaagt-gttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 18203887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 45170089 - 45170140
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45170089 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 45170140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 48213423 - 48213572
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  48213423 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 48213522  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     |   |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48213523 -atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacctatgtt 48213572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 296 - 344
Target Start/End: Original strand, 15081900 - 15081948
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15081900 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatat 15081948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15720256 - 15720200
Alignment:
Q  112 caaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15720256 caaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacttatgtt 15720200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 3287564 - 3287489
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  3287564 gaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 3287489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 18080196 - 18080271
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  18080196 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatttaatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaactta 18080271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18279426 - 18279375
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18279426 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18279375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18283389 - 18283338
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18283389 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 18283338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 102
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 102  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3136868 - 3136715
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| |||||||    
T  3136868 gaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttaagaaaattaagcataactgtttccaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacatcaaaac 3136769  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | | ||||||| ||||| || || | | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3136768 ttg-agtactaagagtttaattaggatgtttaagagtgtttaacctatgatatga 3136715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8468833 - 8468783
Alignment:
Q  314 tgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8468833 tgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 8468783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 168
Target Start/End: Original strand, 15576329 - 15576458
Alignment:
Q  38 ttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaa 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| || |   ||||| ||||||||    
T  15576329 ttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagcttg-tctactatgagttcaa 15576427  T
Q  138 ctaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     |||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  15576428 ttaaggtgtttaagggtatttaacttatgtt 15576458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25942011 - 25941862
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |   |||||| || || ||||| |||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  25942011 gaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttctaggtcaacccaaatcttatggattgtctccaaacttcaaagc 25941912  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25941911 ttgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25941862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 364
Target Start/End: Original strand, 14270032 - 14270081
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14270032 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 14270081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 345
Target Start/End: Original strand, 2280021 - 2280155
Alignment:
Q  208 atattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atg 306  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |   || |||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||||| | ||     
T  2280021 atatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaata 2280116  T
Q  307 tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    ||| || || ||||||||  |||||||| || |||||||    
T  2280117 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33130 - 33079
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33130 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 33079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 70848 - 70899
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  70848 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 70899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 74957 - 75008
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  74957 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 75008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 12704742 - 12704793
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12704742 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12704793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12714887 - 12714836
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12714887 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12714836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12718691 - 12718640
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12718691 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12718640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12723602 - 12723551
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12723602 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12723551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 16907284 - 16907335
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16907284 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 16907335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26292418 - 26292367
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26292418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 26292367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39722289 - 39722238
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39722289 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 39722238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48273636 - 48273550
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgat 255  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | ||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||    
T  48273636 atgagttggtctttggggtaggaatggtagctgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgat 48273550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 345
Target Start/End: Original strand, 12255657 - 12255827
Alignment:
Q  171 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 270  Q
    |||||||  |||||||||| |||| || ||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||| |   || |||||| ||    
T  12255657 gagttgaattttggggtagtaatgaagattgtataatatattaatgatgatctatgaagttgttataagatga-ttgatgttgtt---ta-taatgtgat 12255751  T
Q  271 atatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    ||| ||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| || || ||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  12255752 ataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatc 12255827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 13892742 - 13892670
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  13892742 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 13892670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 20220142 - 20220222
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |   ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20220142 taatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttatatc 20220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 168
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675536
Alignment:
Q  123 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21675536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16114264 - 16114220
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16114264 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 16114220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16117417 - 16117373
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16117417 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtt 16117373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Original strand, 46580402 - 46580450
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcata 66  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  46580402 gaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatgaaaattcagcata 46580450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 8564069 - 8564218
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||   | |||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || | ||  |  ||| ||||  |||||     
T  8564069 gaaaatactccaagtgggtcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaacccaaagctaatggtttgtttccaaactccaaaaa 8564168  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8564169 ttgt-gtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8564218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 1858644 - 1858689
Alignment:
Q  111 tcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtat 156  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  1858644 tcaaaactagaagttctacgagttcaattaaggtgtttaagagtat 1858689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11303439 - 11303402
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11303439 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 11303402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15113046 - 15113009
Alignment:
Q  327 catttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15113046 catttgatattgttatatcttgagatgtttaagtgttg 15113009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Original strand, 16108659 - 16108696
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16108659 gatgttgattaccgtttgatgttgttatatcttgagat 16108696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Original strand, 23664923 - 23664960
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23664923 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 23664960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29796800 - 29796763
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29796800 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29796763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29800619 - 29800582
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29800619 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 29800582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34957488 - 34957416
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  34957488 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtagg-gttgactatcatttgatattgtcatattttgagatgt 34957416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 83)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6766235 - 6765901
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||  |||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||     
T  6766235 gaaaatactccaaggaagtcttggtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaaa 6766136  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||     
T  6766135 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggtggaatataatattgctgt 6766036  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6766035 tgatctgtgaagctgttat-atatgatttaatgttga----tagtaatgtattatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgat 6765941  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765940 gttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgttta 6765901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 360
Target Start/End: Original strand, 30138642 - 30138979
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  || |||||||||    
T  30138642 gaaaatactccaaggaggttttagtgaaccttat-gaaaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataatttcaaccctcaaaac 30138740  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30138741 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactga 30138840  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30138841 tgatctgtgaagctattataatatgatttaatgtt----cgtagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgtt 30138936  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30138937 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 30138979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29448412 - 29448078
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  29448412 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaac 29448313  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  29448312 tagaagtagtatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggatgaatactatattaatga 29448213  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    || ||| || || |||||||||||||||||  |||||||  || ||||||| || || |    
T  29448212 tgatttgtgaagttgttataatatgatttgatgttga----taataaggtgatgtatttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgtt 29448117  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  29448116 gttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttt 29448078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22412580 - 22412365
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22412580 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 22412481  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22412480 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatta 22412382  T
Q  218 tgatctgtgaagctgtt 234  Q
    | |||||||||||||||    
T  22412381 taatctgtgaagctgtt 22412365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 37598595 - 37598930
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || | ||||| ||  ||||||||    
T  37598595 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggctcaaaac 37598694  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||| || || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  37598695 tagaattaatatgagtgcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 37598794  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37598795 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 37598890  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37598891 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 37598930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 42960951 - 42960608
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||| | |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||    
T  42960951 gaaaatactccaagtaggtcttcgggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaac 42960852  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttgggg-taggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    |||||||| || |||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| || |  ||    
T  42960851 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggggtaggaatggaggttgattatagtactgttg 42960752  T
Q  217 atgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttga 316  Q
    ||| |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42960751 atgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttga 42960656  T
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42960655 tattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgttg 42960608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 28370734 - 28371069
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||| ||  ||||||||    
T  28370734 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggctcaaaac 28370833  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || ||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  28370834 tagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 28370933  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||| | |||||    | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28370934 tgttgagtgagtcagatataatatgatctgatgtt----gttagtaatgagatatatttgcatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 28371029  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28371030 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 28371069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18418986 - 18418770
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  18418986 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 18418887  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18418886 tagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatta 18418787  T
Q  218 tgatctgtgaagctgtt 234  Q
    | | |||||||||||||    
T  18418786 taacctgtgaagctgtt 18418770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 24277084 - 24277266
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  24277084 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 24277183  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24277184 tataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24277266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24385129 - 24384947
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  24385129 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 24385030  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24385029 tataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24384947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 33473042 - 33473213
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33473042 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 33473141  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  33473142 tagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 33473213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17812970 - 17812795
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  17812970 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaac 17812871  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17812870 tagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 17812795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 25576716 - 25576902
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25576716 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattacagatgttcagtgagtctgatataatatgattttatgttgatag----taat 25576811  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25576812 gtgatatagttgtatatgcatgatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgatattgttatatcttgagatgttta 25576902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 263431 - 263260
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  263431 gaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgcaaacctcaaaac 263332  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  263331 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 263260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20566128 - 20565978
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  20566128 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 20566029  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20566028 tagaattactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20565978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 21399482 - 21399628
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21399482 aaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaact 21399581  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21399582 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctat 21399628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 41876071 - 41876221
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41876071 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacctcaaaac 41876170  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41876171 taaaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 41876221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 8833677 - 8833824
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8833677 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 8833776  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||| | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  8833777 tagaagtactaggggttc-attaagttgtttaagagtatttaacctatg 8833824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23470064 - 23469876
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||    ||    
T  23470064 atgttatgagttgatcattggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagtctgttataatatgatttgatgttgttag----ta 23469969  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  23469968 atgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat-atggtatatcttgagatgttta 23469876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26761975 - 26761827
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  26761975 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaacattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataactccaaacctcaaaac 26761876  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26761875 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 26761827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17011300 - 17011102
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  17011300 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacttcaaaac 17011201  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   |||  |||||||  |||||||||||||    
T  17011200 taaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttgggggtagaaacgaggttgtttataatattaatg 17011102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19921208 - 19921058
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||    
T  19921208 gaaaatactccaaggaaatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaaccttaaaac 19921109  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19921108 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacatatgtt 19921058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 20198066 - 20198216
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20198066 gaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 20198165  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | ||||||||||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20198166 ttgaagtactaggagtttaattaaggggtataagagtatttaacctatgtt 20198216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 25574330 - 25574516
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25574330 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taat 25574425  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  25574426 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgttta 25574516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 25575523 - 25575709
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  |||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||    
T  25575523 gttatgagttgatccttggggtaggaatagaggttgattataatactacagatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgatag----taat 25575618  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  25575619 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatta-ttgaaatagttatatcttgagatgttta 25575709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 32607803 - 32607953
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32607803 gaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 32607902  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  32607903 tagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 32607953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Original strand, 22107386 - 22107482
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22107386 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 22107482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22750516 - 22750372
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22750516 aaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcgaaacta 22750417  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22750416 gaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22750372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36460544 - 36460368
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  36460544 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 36460445  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  36460444 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 36460368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 36509254 - 36509405
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  36509254 gaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttcaaacctcaaaac 36509353  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  36509354 tagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 36509405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 298
Target Start/End: Original strand, 38145216 - 38145492
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||    
T  38145216 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaac 38145315  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  38145316 tagaagtaatacgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 38145415  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattat 298  Q
    || |   |||  | | |||||||| |||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38145416 tgttgactgagtcagatataatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattat 38145492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17875572 - 17875410
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  17875572 aaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataattccaaccctcaaaact 17875473  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  17875472 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccctattgtgagttgatctt 17875410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 26740505 - 26740693
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     |    
T  26740505 atgttgtgagttgatccttggggtaggagtggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatttgttattacatgatttaatgttgataga----a 26740600  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  26740601 atgtgatatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatccttagatgttta 26740693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 33895360 - 33895508
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  33895360 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatccaaacctcaaaac 33895459  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    || |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  33895460 tataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatg 33895508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 357
Target Start/End: Original strand, 26732698 - 26732880
Alignment:
Q  170 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 269  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||     ||||| |    
T  26732698 tgagttgatccttggggtaagaatggaggttgattataatgttactgatgttctgtgaatatgttattacatgatttaatgttgataga----aatgtga 26732793  T
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26732794 tatatttgtatatgcattatgtggattaaataagatgtttaag-tgtcgttgattattatttgatattgttatatcctgagatgttta 26732880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 21557522 - 21557699
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  21557522 gaaaatactccaaggatgtcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctaaaaac 21557621  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  21557622 tagaagtactataagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaaactatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatg 21557699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31456372 - 31456196
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  31456372 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaattccaaccctcaaaac 31456273  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||||||||    
T  31456272 tagaaatactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagtcgacccttggggtaggaatg 31456196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 27869053 - 27869203
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  27869053 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 27869152  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27869153 tagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacctatgtt 27869203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19511759 - 19511614
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctc-aaaact 118  Q
    |||||||||||  || |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  19511759 aaatactccaagtaggtcttagtggaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcgaaaact 19511660  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||| | || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19511659 agaagcattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 19511614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 232
Target Start/End: Original strand, 22758387 - 22758583
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  22758387 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagcactatgagttc 22758486  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    || |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||  |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22758487 aattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggataacaatgaaagttgtataagatattaaggatgatatgtgaagctg 22758583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Original strand, 21554856 - 21555013
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| ||  ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  21554856 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaac 21554955  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtattt-aagagtatttaacctatgttatgagt 174  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21554956 tagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtgagt 21555013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 346
Target Start/End: Original strand, 21328073 - 21328252
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagt 262  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||| ||||  ||||| |||||||   || |||| | ||||||| ||||| |||   | |    
T  21328073 atgttatgagttgatccatgggggaggaatggaggtttattatagtattgttgatgttctgtgagtttgctatatacatgatttgatgtt-ata---aat 21328168  T
Q  263 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21328169 aatgtgatatagttgtatatgcattatgtgatttatgtaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgctatatct 21328252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Original strand, 12122077 - 12122175
Alignment:
Q  95 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  12122077 ggaataattctaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 12122175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22336711 - 22336640
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22336711 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22336640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22340249 - 22340178
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22340249 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22340178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16063059 - 16062910
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| ||||| |    
T  16063059 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtctctaaacttcaaagc 16062960  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16062959 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 16062910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22336894 - 22336748
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  22336894 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 22336795  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    || ||||| || ||||  || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22336794 taaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22336748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Original strand, 21809531 - 21809629
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21809531 tagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 21809629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 320
Target Start/End: Original strand, 33895607 - 33895666
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33895607 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgtt 33895666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22111173 - 22111024
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  22111173 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 22111074  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22111073 ttg-tgtactgtgagttctattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22111024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22340432 - 22340286
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||  ||||||||    
T  22340432 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattccaaggctcaaaac 22340333  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    || ||||| || ||||  || |||||| |||||||||||||||||||    
T  22340332 taaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 22340286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Original strand, 40917451 - 40917524
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaact 91  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40917451 gaaaatactcaaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 303 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18356323 - 18356264
Alignment:
Q  303 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18356323 gatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18356264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 357
Target Start/End: Original strand, 21731426 - 21731509
Alignment:
Q  275 ttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21731426 ttgtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 21731509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 356
Target Start/End: Original strand, 27988892 - 27988978
Alignment:
Q  273 atttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  27988892 atttgtatatgcattgatgtgaattatacaagatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagctgttt 27988978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18744223 - 18744074
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  18744223 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 18744124  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  | |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18744123 ttg-tgcactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18744074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10816562 - 10816478
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaa-ttatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10816562 tatatttgcaaatgcattatgtggagttatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 10816478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 22750325 - 22750264
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22750325 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatattgttatatctt 22750264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23538588 - 23538504
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  23538588 tatatttgaaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatgatttgatattgttatatcttgagatgt 23538504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 300
Target Start/End: Original strand, 18318942 - 18319068
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||     || |||     
T  18318942 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgacgacctgtgaagctgttataacatgattcaatgttgtta-----tattgtg 18319036  T
Q  269 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 300  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatat 18319068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20572149 - 20572025
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttata-atatgatttaatgttgatagctagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| |||||||  ||| || | | ||||||| |||||    | ||||    
T  20572149 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgattttactattgttgatgttctgtgagtctgctaaatacatgatttgatgtt----gttagt 20572054  T
Q  263 aatgtaatatatttgtatatgcattatgt 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20572053 aatgtaatatagttgtatatgcattatgt 20572025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 303 - 362
Target Start/End: Original strand, 20910910 - 20910969
Alignment:
Q  303 gatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20910910 gatgtataagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 20910969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 1627859 - 1628008
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  1627859 gaaaatactcgaaggaggtcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagc 1627958  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1627959 ttgt-gtactatgagttcaattaacgtgtttaagagtatttaacctatgtt 1628008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 8504347 - 8504496
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   |  |||| ||||| |    
T  8504347 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtcttcaaacttcaaagc 8504446  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8504447 ttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 8504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 14026286 - 14026435
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| || ||||||| || ||| |   || |||| ||||| |    
T  14026286 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatcccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacatatggattgtctccaaacttcaaatc 14026385  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14026386 ttg-tgtactatgagttgaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 14026435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 16605082 - 16605231
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  16605082 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttataagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 16605181  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16605182 ttg-tgtactgtgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgtt 16605231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 286 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19511577 - 19511516
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  19511577 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattaccatttgatatcgttatatctt 19511516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15796594 - 15796494
Alignment:
Q  257 gctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||    
T  15796594 gctaataatgtgatataattgtatatacagtatgcgaattataagagatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgctatatcatgagctgtt 15796495  T
Q  356 t 356  Q
    |    
T  15796494 t 15796494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 23199867 - 23199942
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  23199867 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaactta 23199942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10753387 - 10753334
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10753387 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacatgttg 10753334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30614069 - 30613937
Alignment:
Q  35 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 134  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   |  |||  ||||| || |  |||||| |||||    
T  30614069 atcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctttaaaattcaaagcttg-tgtactatgagtt 30613971  T
Q  135 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30613970 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30613937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26749583 - 26749534
Alignment:
Q  123 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26749583 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 26749534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30612109 - 30611977
Alignment:
Q  35 atcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 134  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||| ||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||||| |  |||||| |||||    
T  30612109 atcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaacttgt-gtactatgagtt 30612011  T
Q  135 caactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30612010 gaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 30611977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28901465 - 28901346
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    |    
T  28901465 ttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggt 28901367  T
Q  147 ttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  28901366 tggagagtatttaacctatgt 28901346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28937860 - 28937741
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    |    
T  28937860 ttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggt 28937762  T
Q  147 ttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  28937761 tggagagtatttaacctatgt 28937741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 15236863 - 15236914
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15236863 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 15236914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 19472803 - 19472854
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19472803 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 19472854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20295870 - 20295819
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20295870 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 20295819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 40723670 - 40723721
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  40723670 agttgttgttgattatcatttaatattgatatatcttgagatgtttacgtgt 40723721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 22178172 - 22178266
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  22178172 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 22178266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 362
Target Start/End: Original strand, 15236924 - 15236969
Alignment:
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15236924 tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 15236969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Original strand, 20765993 - 20766058
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 234  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20765993 atgagttggtctttggggttggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 20766058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9776550 - 9776513
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9776550 gatgttaattaccatttgatgttgttatatcttgagat 9776513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16147 - 15809
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  16147 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 16048  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16047 tagaaatactataagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattggtga 15948  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||||||||||    || |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15947 tgatctgtgaagctgttataa---catataatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 15855  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15854 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 15809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Original strand, 1588 - 1926
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  1588 gaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaacccccaaaac 1687  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1688 tagaagtactatgagttcaattaaggt-tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactga 1786  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1787 tgatctgtgaaaatgttataatatgatttaatgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaatcatataagatgtttaagttgat 1882  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1883 gttgattatcatttgatgatgttatatcttgagatgtttacgtg 1926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 36 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27856 - 27724
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  27856 tcttactgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtac 27757  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27756 aattaaggtgtttaagagtatttaatctatgtt 27724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 91)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Original strand, 13881102 - 13881429
Alignment:
Q  26 tccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 125  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  13881102 tccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaactaaaagta 13881201  T
Q  126 ctaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgt 225  Q
     || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  13881202 atatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatgatctgt 13881301  T
Q  226 gaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatta 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13881302 gaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatta 13881397  T
Q  326 tcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13881398 tcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 13881429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 338
Target Start/End: Original strand, 22130543 - 22130858
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||    
T  22130543 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaac 22130642  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22130643 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttgaatataatattactga 22130742  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22130743 tgatctgtgaagctactataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgat 22130838  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttg 338  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  22130839 g-tgattatgatttgatgttg 22130858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 55 - 344
Target Start/End: Original strand, 45574556 - 45574841
Alignment:
Q  55 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||    
T  45574556 aaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttaagcgt 45574655  T
Q  155 atttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga 254  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45574656 atttaacccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttga 45574755  T
Q  255 tagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  45574756 ----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgttcttatat 45574841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 27653081 - 27653270
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  27653081 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgagaagcagttataatatgatttaatgttgatag----ta 27653176  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653177 atgtattatatttgtatatgcattatgagaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 27653270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 28312920 - 28312577
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||||    
T  28312920 aaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaggctcaaaacta 28312821  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 219  Q
    |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||||    
T  28312820 gaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatg 28312721  T
Q  220 atctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 319  Q
     |  ||||  | | ||||||||||||| |||||      ||||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28312720 ttgagtgagccagatataatatgatttgatgtt----tttagtaatgagatatatttgtatatacattatgtggattttataagatgtttaagttgatgt 28312625  T
Q  320 tgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28312624 tgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgctgtct 28312577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 20437705 - 20438041
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||    
T  20437705 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggcttaaaac 20437804  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  20437805 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaggttacccttggggtaggaatggaggttgactatagtactgttga 20437904  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttga 316  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| ||| |    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20437905 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgct----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttga 20438000  T
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20438001 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgaggtgttta 20438041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20588253 - 20588103
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20588253 gaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 20588154  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20588153 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20588103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20592791 - 20592641
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20592791 gaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 20592692  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20592691 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 20592641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 14238090 - 14238240
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14238090 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagac 14238189  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14238190 tagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 14238240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19676285 - 19676143
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19676285 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 19676186  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 160  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19676185 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaa 19676143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 41227182 - 41227332
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41227182 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 41227281  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  41227282 tagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 41227332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 51082790 - 51082640
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  51082790 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttaagaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagac 51082691  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  51082690 tagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 51082640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 355
Target Start/End: Original strand, 52940736 - 52940923
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||    
T  52940736 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattataatattactgatgttcagtgactctgatataatatgatttgatgttgttag----ta 52940831  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52940832 atgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttggtattgttatatcttgagatgtt 52940923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 41225930 - 41226079
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  41225930 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaact 41226029  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  41226030 agaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 41226079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 21180803 - 21180985
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||    
T  21180803 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaattcttaaaac 21180902  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21180903 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgat-tttgggataggaatggaagttg 21180985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 44822600 - 44822763
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  44822600 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataattccaaacctcaaaac 44822699  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44822700 tagaagtaatatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 44822763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22124545 - 22124358
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  22124545 gttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgactatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 22124450  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22124449 gtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22124358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 50001048 - 50000883
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaa-cttagggaataattcaaaacctcaaaa 116  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  50001048 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataattcaaaacctcaaaa 50000949  T
Q  117 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatcttt 182  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  50000948 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtcttt 50000883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 24815330 - 24815512
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  24815330 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattctaaggctcaaaac 24815429  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  24815430 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 24815512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16401241 - 16401060
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||    
T  16401241 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaact 16401142  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  16401141 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttttgagttgatc-ttgggacaggaatggaggttg 16401060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 21046527 - 21046677
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21046527 gaaaataatccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 21046626  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| | |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21046627 tagaagtactatgggttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 21046677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 21239773 - 21239923
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21239773 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 21239872  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  21239873 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatttttaacctatgtt 21239923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 8276470 - 8276652
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||    
T  8276470 gaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaac 8276569  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    |||||||||||   |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  8276570 tagaagtactataggttcaattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 8276652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 46198203 - 46198374
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  46198203 gaaaatacttcaaggaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaac 46198302  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  46198303 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttggtccttggggtag 46198374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12710462 - 12710312
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12710462 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataactccaaacctcaaaac 12710363  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12710362 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 12710312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 16058792 - 16058942
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16058792 gaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 16058891  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  16058892 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagattatttaagctatgtt 16058942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 21043142 - 21043329
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  21043142 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 21043237  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21043238 gagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatttttattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21043329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 29764112 - 29764287
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaa----cctca 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||    |||||    
T  29764112 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctca 29764211  T
Q  114 aaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  29764212 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 29764287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42912624 - 42912482
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42912624 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 42912525  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 160  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  42912524 tagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatttaa 42912482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 7052533 - 7052684
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7052533 gaaaatactccaaggaggtattagtgaaattttatgaaaattctgcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 7052632  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  7052633 tagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 7052684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 20031368 - 20031543
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||    
T  20031368 gaaaatactcaatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaac 20031467  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 193  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  20031468 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatccttgggttaggaat 20031543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22350162 - 22349980
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  22350162 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaac 22350063  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  22350062 tagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 22349980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 38887565 - 38887716
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  38887565 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattacaaaactcaaaac 38887664  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  38887665 tagaagtactaggagtttaattaagggggtttaagagtatttaacctatgtt 38887716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 51323849 - 51323699
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  51323849 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataactccaaaccttaaaac 51323750  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51323749 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 51323699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 7792330 - 7792512
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  7792330 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 7792429  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    |||||||| |  |||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  7792430 tagaagtaatgtgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgatttgatc-ttgggataggaatggaagttg 7792512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 20634112 - 20634263
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||    
T  20634112 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttcaaacctcaaaac 20634211  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaag-gtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20634212 tagaagtactaggagtttaattaagagggtttaagagtatttaacctatgtt 20634263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20958369 - 20958181
Alignment:
Q  165 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| | || ||||  ||||| || ||||  ||| ||||||||| ||| |||||| |||    |||    
T  20958369 tgttatgagttgatccttggtgtaagaatgaaggttgattgtagtattgttgatgttcagtgagtctgatataatatgttttgatgttgttag----taa 20958274  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20958273 tgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgtcatatcttgagatgttta 20958181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 296929 - 296715
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  296929 gaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 296830  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||    
T  296829 tagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaagga 296730  T
Q  218 tgatctgtgaagctg 232  Q
    |||| ||||||||||    
T  296729 tgatgtgtgaagctg 296715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 354
Target Start/End: Original strand, 2332706 - 2333019
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2332706 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttc 2332805  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtta 235  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |  || || ||||| | ||||||| |   |||| || ||||  ||| ||    
T  2332806 aattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcctcgggttttgagtgaaggtttattataatactgtcgatgttcagtgagtctgata 2332905  T
Q  236 taatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgt-gaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgat 334  Q
    ||| || | || |||||    | || | | ||  || ||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2332906 taagat-aattgatgtt----gttaatgacgtggtagatttgcaaatgcattatgtggacttatataggatgtttaagttg-tgttgattatcatttgat 2332999  T
Q  335 gttgttatatcttgagatgt 354  Q
     |||||||||||||||||||    
T  2333000 attgttatatcttgagatgt 2333019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 4596323 - 4596473
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  4596323 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 4596422  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||| ||   ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  4596423 tagaagtaatataggttcaactagggtgcttaagagtatttaacctatgtt 4596473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 38057129 - 38057304
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| | | | |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  38057129 gaaaatactccaagggggtattagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattattccaaacctcaaaac 38057228  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  38057229 tagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttaatc-ttgggataggaatg 38057304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48603621 - 48603521
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  48603621 gtaatgtaatatatttgtatatacattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttagatcttgagatgtttacgt 48603522  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  48603521 g 48603521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 45496520 - 45496369
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  45496520 gaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaataatttcaaacctccaaac 45496421  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||  ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45496420 tagaagtactctgagtttaattaaggggatttaagagtatttaacctatgtt 45496369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 345
Target Start/End: Original strand, 21533735 - 21533908
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||     |||    
T  21533735 gttatgagttgatccttggg-taggaatggaggttgattataatattactaatgttctgtgaatttattattacatgatttaatgttgataga----aat 21533829  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21533830 gtgatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatc 21533908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14800779 - 14800602
Alignment:
Q  181 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat----tt 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||||    ||    
T  14800779 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgtta---agtaacgtgatatatatagtt 14800683  T
Q  277 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14800682 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgttta 14800602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 181 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 14809653 - 14809476
Alignment:
Q  181 ttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatat----tt 276  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||   ||||| || ||||||    ||    
T  14809653 ttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgtta---agtaacgtgatatatatagtt 14809557  T
Q  277 gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14809556 gtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttgatattgttatatcttgatatgttta 14809476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20346066 - 20345973
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 257  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346066 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 20345973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Original strand, 41781542 - 41781636
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41781542 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag--gttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgttta 41781636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 162
Target Start/End: Original strand, 23195030 - 23195173
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||||    
T  23195030 aaaatactcctaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaact 23195129  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 162  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23195130 agaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacc 23195173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 294617 - 294396
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta-ggga--------ataattcaaaacc 110  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||| ||| |    
T  294617 aaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataattccaaagc 294518  T
Q  111 tcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||| ||| |||| | |||| |||  |||    
T  294517 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaaccttgggatagcaatgaaagttgtataggata 294418  T
Q  211 ttaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  294417 ttaatgatgatctgtgatgctg 294396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16372141 - 16372070
Alignment:
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16372141 ttatgtggattatataagatgtttaagttgatattgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 16372070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1643169 - 1643020
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||    
T  1643169 gaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaac 1643070  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1643069 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1643020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 14793040 - 14793193
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  14793040 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 14793139  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14793140 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 14793193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 22823885 - 22824034
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||    
T  22823885 gaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaac 22823984  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22823985 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 22824034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47190861 - 47190707
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgat-ctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| | | | ||  ||| ||||| ||||||| |||||| |||    |||    
T  47190861 gttataagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatactgttgatgtttcagagagtctgatataa-atgatttgatgttgttag----taa 47190767  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 324  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47190766 tgtgatatagttgtatatgcattatgtaaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 47190707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 48520679 - 48520586
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48520679 taatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgtttattatttgatattgttatatc-tgagatgtt 48520586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 297
Target Start/End: Original strand, 16093748 - 16093871
Alignment:
Q  170 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 269  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    |  |||||| |    
T  16093748 tgagttgatccttggggtagaattggagattgaatataatgttagtgatgatctgtgaagctgttataagatgattgaatgttga----ttttaatgtga 16093843  T
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaatta 297  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||    
T  16093844 tatatttgtatatacattacatgaatta 16093871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 50544425 - 50544276
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| |    
T  50544425 gaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaatttcaaagc 50544326  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50544325 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 50544276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32649871 - 32649787
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32649871 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 32649787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16381346 - 16381256
Alignment:
Q  269 atatatttgtatatgcatt-atgtgaattatataagatgtttaa--gttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16381346 atatatttgtatatgcattgatgtgaattatacaatatgtttaaatgttgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 16381256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20329181 - 20329118
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20329181 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgttttaagttgatgttg 20329118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11945626 - 11945564
Alignment:
Q  260 agtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11945626 agtaatgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagttgctgttga 11945564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26065201 - 26065045
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||| ||| | ||   || ||    
T  26065201 atgttatgagtttatccttggggtaggaatggatgttgtatatgatgttaatgataatctgtgaagttgttataagaggatttgatg-tcat---taata 26065106  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 324  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||| || || ||||||||    
T  26065105 atgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatt 26065045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16372325 - 16372178
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacct-caaaa 116  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  || |||||    
T  16372325 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctacaaaa 16372226  T
Q  117 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
     || ||||| || ||||  || |||||| |||||||||||||||||||    
T  16372225 ataaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaaccta 16372178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 349
Target Start/End: Original strand, 635944 - 636022
Alignment:
Q  272 tatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||||||||||    
T  635944 tatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgatgattgaatattatttgacattgttatatcttga 636022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 24720172 - 24720321
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  24720172 gaaaatacttcatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 24720271  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  | |||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24720272 ttg-tgcactatgagttcagttaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24720321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39060669 - 39060520
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || ||||  |||| |    
T  39060669 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctctaaactccaaagc 39060570  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39060569 ttg-tgtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgtt 39060520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 44892021 - 44891869
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||| ||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  44892021 gaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaatc 44891922  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | | | ||||| |||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  44891921 ttgta-tactatgagtacaattaaggtgtttaagagta-ttaacctatgttatga 44891869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16758906 - 16758780
Alignment:
Q  171 gagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaat 270  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| || |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   || |||||| ||    
T  16758906 gagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtt---ta-taatgtgat 16758811  T
Q  271 atatttgtatatgcattatgtgaattatata 301  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16758810 ataattgtatatgcattacttgaattatata 16758780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 1925212 - 1925263
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1925212 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 1925263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 20924226 - 20924277
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20924226 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 20924277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 23819381 - 23819432
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23819381 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23819432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 345
Target Start/End: Original strand, 35260939 - 35261114
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||    | || ||    
T  35260939 atgttatgagttgaacattggggtagtaatggagattgtatatgatattaacgataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgtt----gttaata 35261034  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||| || || ||||||||||||||  |||||||| || | |||||| |   ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  35261035 atgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttga---gatgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 17902240 - 17902389
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| | | ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||  ||||| |    
T  17902240 gaaaatactccaaggtggtcttgatgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaattcaaagc 17902339  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     |   |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17902340 -atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17902389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 29534697 - 29534624
Alignment:
Q  281 atgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29534697 atgcattatgtggaattttatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatatcgttatatcttgagatgt 29534624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 6833788 - 6833713
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  6833788 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttctaagtcaacccaaaactta 6833713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51326906 - 51326855
Alignment:
Q  316 atgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 367  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  51326906 atgttgattattatttgatgttgttatatcttgagatgtttaggtgctgtct 51326855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18121178 - 18121029
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  18121178 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 18121079  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
      |  | |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18121078 ctg-tgcactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18121029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16655912 - 16655793
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    |    
T  16655912 ttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgtttccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaaaaggt 16655814  T
Q  147 ttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  16655813 tggagagtatttaacctatgt 16655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1010746 - 1010695
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1010746 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 1010695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 20228892 - 20228943
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20228892 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 20228943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21407378 - 21407327
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21407378 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 21407327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 41049988 - 41050070
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  41049988 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 50614068 - 50614151
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50614068 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50614151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 50621896 - 50621979
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  50621896 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50621979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 43543243 - 43543201
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43543243 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 43543201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48520830 - 48520787
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 207  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48520830 atgttataagttgatcattggggtaggaatggaggttgattata 48520787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50686781 - 50686698
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||  ||||||||||    
T  50686781 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatc 50686698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 52639564 - 52639513
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52639564 agttgttgttgattatcattcgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 52639513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42697150 - 42697112
Alignment:
Q  163 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42697150 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatggaagttg 42697112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 16375541 - 16375593
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttg-atgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16375541 agttgttgttgattatcatttgaatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 16375593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 269
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||    
T  590 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaac 491  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  490 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtt-aagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattactga 392  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  391 tgatctgtgaagcttttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagctgat 296  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  295 gttgattatgatttgatgttgttatat 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 121)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 25619437 - 25619770
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  25619437 aaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaacta 25619536  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 219  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25619537 gaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtaggaatggaggttgaatataacattactgatg 25619636  T
Q  220 atctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgt 319  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25619637 atctgtgatgttgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatttttaagttgatgt 25619732  T
Q  320 tgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  25619733 tgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 25619770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Original strand, 14979100 - 14979435
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||    
T  14979100 gaaaatagtccaaggaggtcttggtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataatttcaaccctcaaaac 14979199  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  14979200 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcattggggtagggatggaggttgaatataacattactga 14979299  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14979300 ggatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 14979395  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14979396 gttgattatcatttgatgttgttatatctcaagatgttta 14979435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 361
Target Start/End: Original strand, 15817239 - 15817573
Alignment:
Q  21 aatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactag 120  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  15817239 aatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaccctcaaaactag 15817338  T
Q  121 aagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatga 220  Q
    ||||| || ||| |||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15817339 aagtattatgaggtcaattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatga 15817437  T
Q  221 tctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgtt 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||    | |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15817438 tctgtgaagctg-tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgtggtatatttgaatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgtt 15817532  T
Q  321 gattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15817533 aattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 15817573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Original strand, 20556571 - 20556893
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  20556571 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 20556670  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  20556671 tagaaatactatgagttaaattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttcgggtaggaatgagggttgaatataatattactga 20556770  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556771 tgatatgagaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 20556866  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20556867 gttgattatgatttgatgttgttatat 20556893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23414952
Alignment:
Q  41 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 140  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  141 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataata 240  Q
    |||| ||||||| |||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23415162 aggtgtttaagaatata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataata 23415070  T
Q  241 tgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgtt 340  Q
    ||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23415069 tgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgtt 23414974  T
Q  341 atatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23414973 atatcttgagatgtttacgtgt 23414952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27557022 - 27556710
Alignment:
Q  39 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  27557022 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgagttcaat 27556923  T
Q  139 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 238  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27556922 taaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 27556830  T
Q  239 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 338  Q
    ||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27556829 tatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgatcatcatttgatgttg 27556734  T
Q  339 ttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  27556733 ttatatattgagatgtttacgtgt 27556710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 116 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25754972
Alignment:
Q  116 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgtgggttgaatataatattact 25755097  T
Q  216 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 315  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25755096 gatgatctttgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattttataagatgtttaagttg 25755001  T
Q  316 atgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25755000 atgttgattatgatttgatgttgttatat 25754972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4477232 - 4476897
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  ||||||||    
T  4477232 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaac 4477133  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||    |||    
T  4477132 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtaccgttga 4477033  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | |||||||||| |||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4477032 tgttgagtgagtcagttataatataatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 4476937  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4476936 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 4476897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33443307 - 33443122
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  33443307 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgaatataatattattgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 33443212  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33443211 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagt---tgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 33443122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 116 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752838
Alignment:
Q  116 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaat 215  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatccttggggtaggaatgagggttgaatataatattact 25752927  T
Q  216 gatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 308  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25752926 gatgatctatgaagctattataatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 25752838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27851577 - 27851394
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  27851577 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaac 27851478  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  27851477 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgaccattggggtaggaatggaggttg 27851394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23956436 - 23956265
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23956436 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 23956337  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  23956336 tagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 23956265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 20224205 - 20224018
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  20224205 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 20224110  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  20224109 atgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 20224018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 164 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22118189 - 22118002
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  22118189 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattgctgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 22118094  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  22118093 atgtaatatatttgtgtatgaattatgtgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgtt 22118002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 20733925 - 20734107
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  20733925 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctat-gaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaac 20734023  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  20734024 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtcgacccttggggtaggaatgaaggttg 20734107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13764927 - 13764730
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13764927 gaaaatactccaaggaggtcttaatgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 13764828  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||| || ||||  |||||||||||||    
T  13764827 tagaagtactatgagttaaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggtagaaat-gaagttgtttataatattaatg 13764730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18453444 - 18453255
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||| ||||||||| |||||| |||    ||    
T  18453444 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatactactgttgatgttcagtgagtctgatattatatgatttgatgttgttag----ta 18453349  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18453348 atgtgatatagttgtatatgcattttgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgattttgttatatcttgagatgttta 18453255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7827546 - 7827396
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  7827546 gaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaat 7827447  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7827446 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7827396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 15173933 - 15174130
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  15173933 gaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 15174032  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  15174033 tagaagtactatgagttcaattaaattgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 15174130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18658779 - 18658598
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  18658779 aaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaact 18658680  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  18658679 agaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 18658598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 19655707 - 19655857
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  19655707 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 19655806  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19655807 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19655857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 28947918 - 28947768
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  28947918 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaac 28947819  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28947818 tagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 28947768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18928297 - 18928149
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  18928297 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattcaaaaactcaaaac 18928198  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18928197 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtattttacctatg 18928149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 31734280 - 31734132
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31734280 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 31734181  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31734180 tagaagtact--gagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 31734132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18709073 - 18708923
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || || ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18709073 gaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 18708974  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18708973 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 18708923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20177319 - 20177166
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20177319 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaagc-aatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaac 20177221  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20177220 tataagtactaggagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacctatgttatga 20177166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 611314 - 611139
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  611314 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 611215  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    || || ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  611214 taaaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 611139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 168
Target Start/End: Original strand, 27125973 - 27126105
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27125973 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttc 27126072  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27126073 aactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 27126105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 19773187 - 19773330
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19773187 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 19773286  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  19773287 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 19773330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 23491652 - 23491799
Alignment:
Q  21 aatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactag 120  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  23491652 aatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatag 23491751  T
Q  121 aagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23491752 aagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacatatgtt 23491799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 23497250 - 23497397
Alignment:
Q  21 aatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactag 120  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  23497250 aatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataattccaaacctcaaaaatag 23497349  T
Q  121 aagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  23497350 aagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacatatgtt 23497397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 5834213 - 5834366
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5834213 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaagt-aatccaaaacatagggaataattctaaatctcaaaac 5834311  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  5834312 tagaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga 5834366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 17318600 - 17318750
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  17318600 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 17318699  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17318700 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 17318750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18703138 - 18702988
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || || ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18703138 gaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 18703039  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18703038 tagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgtt 18702988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 22158672 - 22158825
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22158672 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaaga-aatccaaaacatagggaataattctaaacctcaaaac 22158770  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  22158771 taaaagtactaggagttcaattaaggtgactaagagtatttaacctatgttatga 22158825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 23150745 - 23150894
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| |||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  23150745 gaaaatattccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaat 23150844  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23150845 tagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgtt 23150894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 23838573 - 23838247
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  |  |||||| ||||| ||  |||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||     
T  23838573 gaaaatactccaagtatgtcttagggaaatcttaagaaaattcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaat 23838474  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| |||         ||||| || || |||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  23838473 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgttt---------taacccattttgtgagttgacccttgaggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 23838383  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
     | |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23838382 ggttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 23838287  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23838286 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 23838247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 25601755 - 25601904
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25601755 gaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 25601854  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25601855 tagaagtaataagagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 25601904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 19825967 - 19826142
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||||    
T  19825967 gaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataattccaaaccttaaaac 19826066  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  19826067 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 19826142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 27318033 - 27318179
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  27318033 gaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataattcaaaacctcaaaac 27318132  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  27318133 tagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatttaaccta 27318179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 161
Target Start/End: Original strand, 15705107 - 15705232
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15705107 tcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttt 15705206  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    || |||||  ||||||||||||||||    
T  15705207 aattaaggggtttaagagtatttaac 15705232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Original strand, 19773494 - 19773594
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19773494 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttcttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 19773593  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  19773594 g 19773594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 261 - 363
Target Start/End: Original strand, 15705395 - 15705497
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  15705395 gtaatgtaatatatttgtttatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttactt 15705494  T
Q  361 gtt 363  Q
    |||    
T  15705495 gtt 15705497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 15891189 - 15891326
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  15891189 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctaaaaac 15891288  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagta 155  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||| ||||||||||    
T  15891289 tagaagtactatgatttcaattagggtgtttaagagta 15891326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 34296747 - 34296923
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  34296747 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 34296846  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    |||||| |||| ||||| || || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || | ||||||| ||||||    
T  34296847 tagaaggactatgagtttaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagtcgacccttggggttggaatg 34296923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 164 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18696749 - 18696609
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    | || ||    
T  18696749 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttatcatatgatttaatgtt----gttaata 18696654  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtt 308  Q
    |||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  18696653 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt 18696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 237 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22806120 - 22806001
Alignment:
Q  237 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 336  Q
    ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  22806120 aatatgatttaatgttgatgg----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt-agttgttgttgattatcatttgatat 22806026  T
Q  337 tgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  22806025 tgttatatcttgtgatgtttacgtg 22806001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Original strand, 8759994 - 8760138
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  8759994 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 8760093  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 162  Q
    || |||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  8760094 taaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 8760138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Original strand, 8767741 - 8767885
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  8767741 gaaagtactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 8767840  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 162  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  8767841 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 8767885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 361
Target Start/End: Original strand, 28103851 - 28103950
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28103851 taatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatataagttgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttataccttgagatgtttacgtg 28103950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 19443757 - 19443919
Alignment:
Q  17 agaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 116  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| || ||||||| | | || ||||    
T  19443757 agaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataattccagaactaaaaa 19443856  T
Q  117 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 179  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19443857 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 19443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 29847981 - 29848146
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaa--ttcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaa 115  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||| || ||||||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  29847981 gaaaatactccaagtaggtcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaa 29848080  T
Q  116 actagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  29848081 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatctt 29848146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 18706568 - 18706391
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggg-gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagt 262  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | || |    
T  18706568 atgttatgagttgatccttggttgtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgtt----gttaat 18706473  T
Q  263 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || | |||||| |  |||||| ||||||||||    
T  18706472 aatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatt-tgctttgatattgttatatc 18706391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 23655913 - 23655804
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23655913 gaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataattccaaacctcaaaac 23655814  T
Q  118 tagaagtact 127  Q
    ||||||||||    
T  23655813 tagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25347700 - 25347556
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  25347700 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctccaaac 25347601  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 162  Q
    ||||||| | | |||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  25347600 tagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacc 25347556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 20183137 - 20182984
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |    
T  20183137 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagc 20183039  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20183038 tagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctttgttatga 20182984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 22152854 - 22153007
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| || |    
T  22152854 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaacctc-aagc 22152952  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22152953 tagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctttgttatga 22153007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 1254331 - 1254215
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  1254331 gaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaac 1254232  T
Q  118 tagaagtactaggagtt 134  Q
    ||||||||||| |||||    
T  1254231 tagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 349
Target Start/End: Original strand, 18896215 - 18896354
Alignment:
Q  204 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18896215 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataaaa-gatttaatgttgttag----taatgggatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 18896309  T
Q  304 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  18896310 atgtttaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 18896354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19362646 - 19362507
Alignment:
Q  204 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19362646 tataatattactgatgatctgtgaaactgttataa-atgatttaatgttgttag----taatgtgatataattttatatgcattatgtgaattatttaag 19362552  T
Q  304 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19362551 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 19362507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20136840 - 20136739
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20136840 tagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 20136742  T
Q  359 gtg 361  Q
    |||    
T  20136741 gtg 20136739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 361
Target Start/End: Original strand, 22196029 - 22196130
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22196029 tagttatgtgatataattgtatat-cattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 22196127  T
Q  359 gtg 361  Q
    |||    
T  22196128 gtg 22196130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 16133148 - 16133309
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |  |  ||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| || ||||||| |   || |||||    
T  16133148 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaattcataggaaaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataattccaggactaaaaac 16133247  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 179  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16133248 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 16133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 862 - 755
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  862 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataattccaaagctcaaaac 763  T
Q  118 tagaagta 125  Q
    ||||||||    
T  762 tagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23539130 - 23539045
Alignment:
Q  269 atatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23539130 atatatttgtaaatgcattatgtggattatatatgatgtttatgttgatgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 23539045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25807706 - 25807602
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  25807706 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 25807607  T
Q  118 tagaa 122  Q
    |||||    
T  25807606 tagaa 25807602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Original strand, 31022175 - 31022267
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacc 110  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31022175 gaaaatacttcaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacc 31022267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20182962 - 20182866
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20182962 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 20182866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Original strand, 22153029 - 22153125
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22153029 tagtaatgtgatatagttgtatatgcatt--gtgaattatgtatgatgtttaagttgttgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 22153125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 20411150 - 20411303
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  20411150 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttcaaagc 20411249  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  ||| || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20411250 ttg-tgtaatatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttatga 20411303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16493317 - 16493219
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16493317 tagtaatgtgatatatt-gtatatgcattatgtgatttacataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttggtgttgttctatcttgagatgttta 16493219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 18177624 - 18177719
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18177624 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18177719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 18199368 - 18199463
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18199368 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18199463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18204247 - 18204152
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaag-ttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  18204247 taatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttgttt 18204152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 18455550 - 18455699
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  18455550 gaaaatacttcaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 18455649  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | | | ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18455650 ttgta-tactatgagttcaattaaggtctttaagagtatttaacctatgtt 18455699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23076900 - 23076806
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  23076900 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 23076806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23538978 - 23538884
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  23538978 taatgtgatatagttgtatatgcgttatgtgaatgatatatgatgtttaggttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcatgagctgttt 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25921303 - 25921154
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | | |   || |||| |||||      
T  25921303 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagt 25921204  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25921203 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25921154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22556819 - 22556676
Alignment:
Q  22 atactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactaga 121  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||||||    
T  22556819 atactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattttgcataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctccaaacatcaaaactaga 22556720  T
Q  122 agtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    |||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||||||||    
T  22556719 agtactaggagtttcattaaggggtttaagagtatttaacctat 22556676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 17857170 - 17857319
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||| |||||||    
T  17857170 gaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaacttcaaaac 17857269  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
     ||||||| ||||| || || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  17857270 gagaagtattaggaatttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 17857319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Original strand, 23528056 - 23528150
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||  |||||| |||||||||||||    
T  23528056 tagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagtcgatgttgatcgtcctttga--ttgttacatcttgagatgtt 23528150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 29416865 - 29416949
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29416865 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 29416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13285282 - 13285136
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  || |||||||||| ||| |   || |||| |||||||    
T  13285282 gaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagccaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaaac 13285183  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    | |  |||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13285182 ttgt-gtactatgagttcatttaaggtgtttaagagtatttaacctat 13285136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 32259420 - 32259272
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| || || |    
T  32259420 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttc-aagc 32259322  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32259321 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 32259272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Original strand, 34141104 - 34141178
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34141104 aaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 34141178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Original strand, 34153720 - 34153794
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34153720 aaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 34153794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35008318 - 35008224
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  35008318 taatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 35008224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 367
Target Start/End: Original strand, 31477893 - 31477949
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttgtct 367  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31477893 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgtcgtct 31477949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 300
Target Start/End: Original strand, 16448435 - 16448561
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgta 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||| ||     || |||     
T  16448435 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgatggtctatgaagttgttataacatgattcaatgttgtta-----tattgtg 16448529  T
Q  269 atatatttgtatatgcattatgtgaattatat 300  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatat 16448561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16760318 - 16760267
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16760318 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 16760267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18585192 - 18585117
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  18585192 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaactta 18585117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22949131 - 22949080
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22949131 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 22949080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22953087 - 22953036
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22953087 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 22953036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23871575 - 23871524
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23871575 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23871524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23875531 - 23875480
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23875531 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 23875480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 29044884 - 29044809
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  29044884 gaaaatacttcaaggagatcttagtgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactta 29044809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18398492 - 18398343
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||  || |   || |||| |||||||    
T  18398492 gaaaatactccagggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatagattgtgtccaaacttcaaaac 18398393  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  || ||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18398392 ttg-tgttctatgagctcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgtt 18398343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16135591 - 16135519
Alignment:
Q  95 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16135591 ggaatatttccaaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaagaggtttaagagtatttaacctatgt 16135519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 318 - 362
Target Start/End: Original strand, 18955853 - 18955897
Alignment:
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18955853 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 18955897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 210
Target Start/End: Original strand, 20078033 - 20078079
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20078033 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataata 20078079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 25738540 - 25738457
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  25738540 tatatttgcaaatgcattatgtggattatgaatgatgtttaagttga-gttgattattaattgatattgtcatatcttgagatgt 25738457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8243884 - 8243833
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8243884 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 8243833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11566885 - 11566834
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11566885 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 11566834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 12618927 - 12618978
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12618927 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12618978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14472294 - 14472243
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14472294 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 14472243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 18917349 - 18917400
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18917349 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 18917400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19870613 - 19870562
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19870613 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 19870562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22862969 - 22862918
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22862969 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 22862918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23395091 - 23395040
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23395091 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 23395040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23989943 - 23989892
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23989943 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 23989892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 300
Target Start/End: Original strand, 8227409 - 8227501
Alignment:
Q  204 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| |   || |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  8227409 tataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtt---ta-taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 8227501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 15875498 - 15875456
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15875498 gatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 15875456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 15938704 - 15938857
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| ||  || |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||  ||||||     
T  15938704 gaaaatactctaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatggtttgtttccaaaattcaaaaa 15938803  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | || ||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15938804 ttga-gtgttaggagttcaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgatatga 15938857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7429990 - 7429918
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  7429990 atgcattatgtgaattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 7429918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18456938 - 18456846
Alignment:
Q  203 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||| ||     || ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18456938 atataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtta-----tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 18456846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22806323 - 22806276
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcat 65  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22806323 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 22806276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25644545 - 25644495
Alignment:
Q  203 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  25644545 atatgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttg 25644495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1644725 - 1644680
Alignment:
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  1644725 tgttgattatcatttgatattgttatattctgagatgtttatgtgt 1644680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12942393 - 12942356
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  12942393 gatgttgattaccatttgatgttgttatattttgagat 12942356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Original strand, 14594210 - 14594282
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  14594210 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 14594282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 207
Target Start/End: Original strand, 17229776 - 17229817
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 207  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17229776 gttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 17229817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 823 - 486
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||    
T  823 gaaaatactacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctccaaac 724  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  723 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttatgagttgatc-ttggagtaggaatggaggttgaatatgatattaatga 625  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| |||||    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  624 tgatctatgaagctg-tataatataatttgatgtt----gttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaat 530  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  529 gttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 105486 - 105149
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  105486 gaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaac 105387  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  105386 tagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatga 105288  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  105287 tgatctatgaagctg-tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatataagatgtttaatttgat 105193  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  105192 gttaattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 105149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 162858 - 162647
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||    
T  162858 gaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataattccaaagctcaaaac 162759  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| ||    
T  162758 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaattcatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaagga 162659  T
Q  218 tgatctgtgaag 229  Q
    ||||||||||||    
T  162658 tgatctgtgaag 162647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12544 - 12221
Alignment:
Q  17 agaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 116  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||    
T  12544 agaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaa 12445  T
Q  117 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12444 ctagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtgagttgatccttggggtaggaatgggggttgaatataatattactg 12345  T
Q  217 atgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttga 316  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12344 atgatctgtgaatctattataatatggtttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttcaagttga 12249  T
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  12248 tgttgattatgatttgatgttgttatat 12221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 361
Target Start/End: Original strand, 169475 - 169801
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  169475 gaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 169574  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||||||||||||             ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  169575 tagaagtactaggagtt-------------taagaatatttaacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactga 169661  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169662 tgatctgtaaagctgttataatatgatttaatatttataa----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 169757  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169758 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 169801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 143187 - 143038
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  143187 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 143088  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  143087 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 143038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 142753 - 142654
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  142753 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 142654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 82560 - 82235
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| | || |||||||||    
T  82560 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataataccaaccctcaaaac 82461  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  82460 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtt-aagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggttggaatgggggttgaatataatattactga 82362  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtat----atgcattatgtgaattatataagatgtttaagt 313  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82361 tgatctgtgaagctattgtaatatgatttaatgttga----tagtaatgtaatatatttgtatatgcatgcattatgtgaattatataagatgtttaagt 82266  T
Q  314 tgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  82265 tgatgttgattatgatttgatgttgttatat 82235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 362
Target Start/End: Original strand, 80424 - 80469
Alignment:
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  80424 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 80469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 164 - 361
Target Start/End: Original strand, 9943 - 10136
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  9943 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag----ta 10038  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039 atgtaatatatttgtatatacattctgtgaattatataagatgtttaagatgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 10136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 36420 - 36253
Alignment:
Q  186 gtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgca 285  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| || ||||  ||  ||||||||||||| |||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||    
T  36420 gtaggaatggaggttgattataatactattgatgttcagtgagtctaatataatatgatttgatgttgttag----taatgtgatatagttgtatatgca 36325  T
Q  286 ttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36324 ttatgtggattatataagatgtttaagttgtcgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 36253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 164 - 364
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24652
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  24456 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgcaaagctgttataatatgatttaatgttgatag----ta 24551  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24552 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgaaatgtttaagtgtt 24651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 111061 - 110726
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||||||| ||  ||||||||    
T  111061 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaac 110962  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  110961 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 110862  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110861 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 110766  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  110765 attgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 110726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21655 - 21484
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21655 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 21556  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  21555 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtgagttggtccttggggtag 21484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 146306 - 146156
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  146306 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattcaaaacctcaaaac 146207  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||    
T  146206 tagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatttaatctatgtt 146156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Original strand, 124038 - 124182
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||    
T  124038 gaaaatactccaatgaggtgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaac 124137  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacc 162  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  124138 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagaatatttaacc 124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39320
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  140 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 239  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 39439  T
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39438 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 39343  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39342 tatatcttgagatgtttacgtgt 39320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 21335 - 21285
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataac 68  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21335 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataac 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31191
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  140 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 239  Q
    ||||| |||||||||||       ||  ||| | ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31402 aaggtgtttaagagtata------ataatataatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatttgtgaagctattataat 31310  T
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  31309 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgtttattatcatttgatattgt 31214  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31213 tatatcttgagatgtttacgtgt 31191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 64547 - 64694
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  64547 gaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataatttcaaacctcaaaac 64646  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  64647 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtagttaacctat 64694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17641
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |||| ||| |||||||| |    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  140 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataat 239  Q
    ||| | |||||||||||       ||  ||||| ||  | || ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  17852 aagatgtttaagagtata------ataatatgatttagtgtt-ggggtaggaatgtgggttgaatataatattactgatgatctgtgaaactattataat 17760  T
Q  240 atgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgt 339  Q
    |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17759 atgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgaattatgtgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgt 17664  T
Q  340 tatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  17663 tatatcttgagatgtttacgtgt 17641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 164 - 344
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3362
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||    
T  3186 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatattactgatgatctgtgaagctgttataatatcatttaatgttga----tagta 3281  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3282 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttaatgttgattatcatttaatgttgttatat 3362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Original strand, 9434 - 9765
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  9434 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgataattcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 9533  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  9534 tagaagtaatatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 9633  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  9634 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattgtatggattatataagatgtttaag-tgat 9728  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9729 gttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 9765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Original strand, 19951 - 20263
Alignment:
Q  39 tagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaac 138  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  19951 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 20050  T
Q  139 taaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataa 238  Q
    |||||| |||||||||||       ||  ||||| ||  | |  ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20051 taaggtgtttaagagtata------ataatatgatttagtgta-ggggtaggaatgtggattgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataa 20143  T
Q  239 tatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttg 338  Q
    ||||||||| |||||||||    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  20144 tatgatttagtgttgatag----taatgtaatatatttttatatgcactatgtgaattatatataatgtttaagttgttgttgattagcatttgatattg 20239  T
Q  339 ttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  20240 ttaaatcttgagatgtttacgtgt 20263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17575
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| | |||| | |    ||    
T  17764 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtaatgttgatgttcagtgagactgatataatatgatttgaagttgttgg----ta 17669  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17668 atgtgatatagttgtatatgccttatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 17575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 133324 - 132989
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| ||  || |||||| ||||| || ||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||    
T  133324 gaaaatactcaaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaac 133225  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||||||| ||||   |||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  133224 tagaagtaatatgagttcaattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattataatactattga 133125  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgat 317  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||| |||    ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  133124 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgttgttag----taataagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgat 133029  T
Q  318 gttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  133028 gttgattatcatttgatattgttatatcttgaaatgttta 132989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29713 - 29582
Alignment:
Q  37 cttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttca 136  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  29713 cttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaagactagaagtactaagagttta 29614  T
Q  137 actaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29613 attaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 29582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 133642 - 133831
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| ||||| || ||||| ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||     
T  133642 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaatttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaat 133741  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 207  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  133742 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattata 133831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29390 - 29285
Alignment:
Q  237 aatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 336  Q
    ||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29390 aatatgatttactgttgatag----taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaagta---------tttaagatgatgttgattatcatttgatat 29304  T
Q  337 tgttatatcttgagatgtt 355  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  29303 tgttatatcttgatatgtt 29285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11271 - 11100
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11271 gaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaac 11172  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  11171 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 11100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 121
Alignment:
Q  167 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 266  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  286 ttatgagttgaaccttgggataggaatgggggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctattataatatgatttaatgttgatag----taatg 191  T
Q  267 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  190 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttaaagttgatgttgattatgatttgatgt 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 176366 - 176195
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  176366 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 176267  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  176266 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggggtag 176195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 169013 - 168846
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  169013 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 168914  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggg 185  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  168913 tagaagtactaggggttcaattaaggagtttaagagtatttaacctaagttgtgagttggtccttggg 168846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 152688 - 152863
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||    
T  152688 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaac 152787  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaat 193  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||| |||||||    
T  152788 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtaagttgatccttgggttaggaat 152863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 77261 - 77098
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  77261 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 77162  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  77161 tagaagtacaatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttgatctt 77098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Original strand, 163071 - 163143
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  163071 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgtagattatcatttggtattgtcatattttgagatgt 163143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 10925 - 11073
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10925 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagaataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcgaaacctcaaaac 11024  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11025 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 11073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17315 - 17223
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtacta 128  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  17315 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4752
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    |||||    
T  4555 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattactgatgatctgtgaagttgttataatatgatttaatgatga----tagta 4650  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgtt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||| || ||||| | |||||    
T  4651 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttgaaatgtttaagttgttgatgattatcatatgatattattatatctggatatgttaatgtgtt 4750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Original strand, 1172 - 1390
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  1172 gaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 1271  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||||||||||             ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  1272 tagaagtactaggag-------------tttaagaatatttaacctatattataagttgatccttgggataggaatgaaggttgaatataatattactga 1358  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaat 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1359 tgatctgtaaagctgttataatatgatttaat 1390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 3420 - 3591
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  3420 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 3519  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  3520 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttggcccttggggtag 3591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Original strand, 19122 - 19304
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  19122 gaaaatactacaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 19221  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19222 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5991 - 5828
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5991 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 5892  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5891 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 5828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Original strand, 7261 - 7409
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||| ||| |   || |||  |||||  |    
T  7261 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaagtt 7360  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     |  |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7361 tg-tgtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3385 - 3323
Alignment:
Q  302 agatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3385 agatgtttcagttgatgttgattgtcatttgatattgttatatcttgagatatttatgtgttg 3323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3438 - 3395
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatata 207  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3438 atgttatgagttgatccttagggtaggaatggaggttgattata 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 621 - 808
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || |  ||| |||||| |||| | ||||||||||    ||||    
T  621 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattataatattattgatgttcagtaagcctgatataatgtgatctgatgttgatag----taat 716  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  717 gtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcttttgatattgttatatcttgagatgttta 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 327
Target Start/End: Original strand, 2285 - 2444
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2285 atgttatgagttggtccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgtcctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2380  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatc 327  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2381 atttaatatatttgtatatgcattatgtgaattatttaagatgtttaagttgtagttgattatc 2444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22632 - 22482
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22632 gaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 22533  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22532 tagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 22482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 455 - 605
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  455 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 554  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  555 tcgaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 5758 - 5906
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5758 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 5857  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5858 tagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatcaaacctatg 5906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2912 - 2702
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  2912 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaag-cttatgggataattccaaagctcaaaac 2814  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||  |||  ||||||| ||    
T  2813 tagaaatactacgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttttataggatattaagga 2714  T
Q  218 tgatctgtgaag 229  Q
    ||||||||||||    
T  2713 tgatctgtgaag 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 36025 - 36076
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36025 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 36076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 78638 - 78488
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  78638 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 78539  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  78538 tagaagtactatgagttcaactaaggtgttaaagagtatttaacctatgtt 78488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 22540 - 22361
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  22540 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 22445  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  22444 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 11985 - 12156
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  11985 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 12084  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||||    
T  12085 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtgagtttgtccttggggtag 12156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 945 - 1095
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  945 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaacctcaaaac 1044  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1045 tagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 5191 - 5341
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5191 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 5290  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5291 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactatgtt 5341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 6155 - 6330
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  6155 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttataaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagatcaaaac 6254  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaagg-tatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaa 192  Q
    ||||||||||| |||||||| || || | |||||||||||||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||    
T  6255 tagaagtactatgagttcaattagggttttttaagagtatttaacttatgttgtgagtagacccttggggtaggaa 6330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 7067 - 7213
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7067 gaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 7166  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  7167 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 7213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Original strand, 7438 - 7537
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  7438 tagtaatgtgatatatttgtgtatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgatatatcttgagatgttta 7537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 7863 - 8013
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  7863 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacttcaaaac 7962  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7963 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6032 - 5835
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  6032 gaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 5933  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  5932 tagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 184 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10715 - 10539
Alignment:
Q  184 gggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatat 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||     |||||| ||||| |||||||     
T  10715 gggtaggaatggaggttgaatatgatattaatgatgatctgtgaagctgt-ataatatgattttaatgttgatat----taatgtgatataattgtatac 10621  T
Q  283 gcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  10620 gcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttacatctagagatgtttatgtgttg 10539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7549 - 7401
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7549 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 7450  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  7449 tagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatcaaacctatg 7401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11267 - 11219
Alignment:
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11267 gaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgtt 11219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 310
Target Start/End: Original strand, 2205 - 2493
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||   || ||||||| ||  ||||||||    
T  2205 gaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggctcaaaac 2304  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatga 217  Q
    |||||||| || |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  |||    
T  2305 tagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttga 2404  T
Q  218 tgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttta 310  Q
    || |  ||||  | | ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2405 tgttgagtgagtcagatataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttta 2493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 22269 - 22419
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22269 gaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 22368  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22369 ttgaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 22419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29306 - 29124
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| |   || |||||    
T  29306 gaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaac 29207  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 200  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  29206 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 29124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34771 - 34589
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || ||||||| |   || |||||    
T  34771 gaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggactaaaaac 34672  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggtt 200  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  34671 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatccttgggttaggaatgaaggtt 34589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 58322 - 58172
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  58322 gaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattccaaacctcaaaac 58223  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  58222 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctgtgtt 58172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 15064 - 15214
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15064 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 15163  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15164 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 15214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 24122 - 24272
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24122 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 24221  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24222 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 24272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 164 - 346
Target Start/End: Original strand, 13979 - 14158
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    |||||    
T  13979 atgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttgattatgatattactgatgttctgtgaatctgttgtaatgtgatttaatgttga----tagta 14074  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  14075 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagatgttttaagttgatgttgattattcttggatattgttatatct 14158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 186983 - 187133
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||    
T  186983 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaac 187082  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  187083 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 187133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1481 - 1332
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1481 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 1382  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1381 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgt 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1110 - 1004
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  1110 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattcttatatcttgagatgttta 1011  T
Q  358 cgtgttg 364  Q
     ||||||    
T  1010 tgtgttg 1004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 8638 - 8478
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8638 gaaaatactccaaggaagtcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 8539  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 178  Q
    || |||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8538 tacaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgat 8478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1278 - 1130
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1278 gaaaatactccaaggatatcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 1179  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1178 tagaagtactaggggttcaattaagatggttaagagtatttaacctatg 1130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3857 - 3701
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    |||||    
T  3857 atgttatgagttgatccttgaggtaggaatggaggttgattataatattactgatgttctgtgaatctgttataacatgatttaatgttga----tagta 3762  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3761 atgtaatatatttgtatatgtattatgtggattatataagatgtttaagtgaatgttgatt 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3280 - 3117
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||||||    
T  3280 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaccctcaaaac 3181  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3180 tagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgcgagttgatctt 3117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 5804 - 5947
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5804 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 5903  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  5904 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaacagtatttaac 5947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Original strand, 6111 - 6207
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6111 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 6207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 8781 - 8928
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  8781 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 8880  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  8881 tagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaactat 8928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 164 - 347
Target Start/End: Original strand, 520 - 699
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagt 262  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||     |    
T  520 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatatgatataaatgatgatctatgaagttgt-ataatatgattttaatgttgatat----t 614  T
Q  263 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 347  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  615 aatgtgatataattgtatacgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatctt 699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 70306 - 70477
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||| ||||||||    
T  70306 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattccaaaactcaaaac 70405  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  70406 tagaagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttggtccttggggtag 70477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21226 - 21083
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21226 gaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 21127  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||    
T  21126 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaatagtatttaac 21083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20919 - 20819
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20919 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 20820  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  20819 g 20819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 126322 - 126179
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  126322 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattctaaacctcaaaac 126223  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  126222 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 126179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 126124 - 126024
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  126124 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgt 126025  T
Q  361 g 361  Q
    |    
T  126024 g 126024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33027 - 32874
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  33027 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 32928  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32927 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 32874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8091 - 7941
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  8091 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 7992  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7991 tagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 137
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8263
Alignment:
Q  26 tccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 125  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  126 ctaggagttcaa 137  Q
    ||| ||||||||    
T  8252 ctatgagttcaa 8263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 22247 - 22444
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||    
T  22247 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaagattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctaaaaac 22346  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatg 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||  |||||||  |||||||||||||    
T  22347 tagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaggttgtttataatattaatg 22444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 349
Target Start/End: Original strand, 16818 - 16957
Alignment:
Q  204 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16818 tataatattactgatgatctgtgaatctgttataa-attagttaatgtt----gttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 16912  T
Q  304 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  16913 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 16957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 349
Target Start/End: Original strand, 25978 - 26117
Alignment:
Q  204 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 303  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25978 tataatattacttatgatctgtgaatctgttataa-attatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatataag 26072  T
Q  304 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  26073 atgttcaagttgttgttgattgtc-cttgatattgttatatcttga 26117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 165
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9851
Alignment:
Q  24 actccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaag 123  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  124 tactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9811 tactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctat 9851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18215
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| ||    || | |||||    
T  18026 atgttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgat----attgttagta 18121  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18122 atgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgtttattatcatttgatattgttatatcttgagatattta 18215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Original strand, 13143 - 13286
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  13143 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaaa 13242  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  13243 tagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Original strand, 8157 - 8277
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||   |    
T  8157 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaaaactcaaaactagaaatactaggagtttaattaagaggt 8256  T
Q  147 ttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  8257 ttaagagtatttaacgtatgt 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 315
Target Start/End: Original strand, 13450 - 13502
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttg 315  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13450 gtaatgtaatatatttgtat--gcattatctgaattatataagatgtttaagttg 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 7087 - 6944
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7087 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 6988  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  6987 tagaagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 6944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 6780 - 6684
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6780 gtaatgtaatatatttgtatatgtagtatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 6684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13520 - 13357
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||    
T  13520 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaac 13421  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13420 tagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 13357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16338 - 16175
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||  || ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  16338 gaaaatactttaaggaggtcttagtgaaatcttatgaatattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataattctcaacctcaaaac 16239  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16238 tagaagtactatgagttcaatgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatctt 16175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 8810 - 8686
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||||||||||    
T  8810 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataattcccaacctcaaaac 8711  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaag 142  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  8710 tagaagtactatgagttcaattaag 8686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 120484 - 120341
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  120484 gaaaatacttcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 120385  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  120384 tagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 120341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 262 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 120176 - 120074
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  120176 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaactatatcagatgtttaagttattgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtg 120077  T
Q  362 ttg 364  Q
    |||    
T  120076 ttg 120074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 29675 - 29785
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29675 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaacctcaaaac 29774  T
Q  118 tagaagtacta 128  Q
    |||||||||||    
T  29775 tagaagtacta 29785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 589
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  739 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattccaaacctcaaaac 640  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  639 tagaagtactatgagtccaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4433
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaa----cctca 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||    |||||    
T  4608 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctca 4509  T
Q  114 aaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4508 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4433
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaa----cctca 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||    |||||    
T  4608 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaattaacctca 4509  T
Q  114 aaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtag 189  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  4508 aaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggtag 4433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 15131 - 15069
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15131 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 15069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21829 - 21679
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  21829 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 21730  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21729 tagaagtactatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgtt 21679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 21040
Alignment:
Q  40 agtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaact 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21193 agtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatt 21094  T
Q  140 aaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21093 aagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtttatc-ttgggataggaatg 21040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 13014 - 13164
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  13014 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaac 13113  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13114 taaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 13164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7601 - 7510
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  7601 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttga 7510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14720 - 14629
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  14720 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttga 14629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 168
Target Start/End: Original strand, 19369 - 19431
Alignment:
Q  106 aaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19369 aaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 19431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 5145 - 5293
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  5145 gaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgattccaaacctcaaaac 5244  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  5245 tagaagttctaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatg 5293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10795 - 10636
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgttt-ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaa 116  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  10795 gaaaatactccaaagaggacttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataattccaaaactcaaaa 10696  T
Q  117 ctagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 176  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10695 ctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 892 - 740
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  892 gaaaatactc-aatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 794  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    |    ||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  793 t-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 6398 - 6246
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  6398 gaaaatactc-aatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 6300  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    |    ||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6299 t-tttgtactataaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 6246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3844 - 3701
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3844 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 3745  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    |||||| |||||||||| || |||||  ||||| | ||||||||    
T  3744 tagaaggactaggagtttaattaaggggtttaacaatatttaac 3701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21642 - 21499
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  21642 gaaaatactccaagtaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaac 21543  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaac 161  Q
    |||||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  21542 tagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaac 21499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 21335 - 21239
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21335 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgttaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 21239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 8034 - 8184
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||    
T  8034 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaccctcaaaac 8133  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  8134 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttatgattatttaacccatgtt 8184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7707 - 7557
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  7707 gaaaatactccaaggaggtcttagtcaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattcaaaagctcaaaat 7608  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  7607 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttattagtatttaacctatgtt 7557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2138 - 1988
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  2138 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcatacctcaaaac 2039  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||| || |||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  2038 tagaagtattatgagttctattagggtatttaagggtatttaacctatgtt 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5141
Alignment:
Q  80 taatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 5141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 5483 - 5413
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaa 88  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5483 gaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30186 - 30036
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  30186 gaaaatactacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacctcaagac 30087  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  30086 tagaagtaataggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacttatgtt 30036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 29844 - 29747
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatattt-gtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtt 355  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  29844 tagtaatgtaatatattttgtatgtgcattatgtgaagtatttaagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatctggatatgtt 29747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 28846 - 28996
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  28846 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 28945  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28946 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgtt 28996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7793 - 7643
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7793 gaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 7694  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7693 tagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 7643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14424 - 14274
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || |||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14424 gaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 14325  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14324 tagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 14274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26500 - 26358
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||    
T  26500 gaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaac 26401  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 160  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26400 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 26358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27882 - 27740
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||||||    
T  27882 gaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttcaaagctcaaaac 27783  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaa 160  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27782 tagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaa 27740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 259 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8202 - 8097
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8202 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttat 8103  T
Q  359 gtgttg 364  Q
    ||||||    
T  8102 gtgttg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 571 - 395
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  571 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaagctcaaaac 472  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||  |||||||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| ||| | || | ||||||||||||||    
T  471 tagaagtactttgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttttgattcgacccttggggtaggaatg 395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1344
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1279 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 1344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6599 - 6407
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  6599 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataatttcaaacctcaaaac 6500  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 210  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| | ||||| |||||||    
T  6499 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtgtttaacctatgttatgagtagatccttagggtagaaatgcaagttgattataata 6407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 167 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 796 - 658
Alignment:
Q  167 ttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatg 266  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    | || |||||    
T  796 ttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgatgtt----gttaataatg 701  T
Q  267 taatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgttt 309  Q
    | |||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  700 tgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25367 - 25213
Alignment:
Q  165 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||     || |||    
T  25367 tgttgtgagttgatccttggggtagaaatgaaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataagacgatttgatgttg-----taataa 25273  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgatt 324  Q
    ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||    
T  25272 tgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatt 25213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16511 - 16362
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || |||| |||||      
T  16511 gaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaaga 16412  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |  | |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16411 t-catgtactatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgtt 16362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23125 - 22929
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23125 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacatccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgctcaaaactagaagtactatgagttc 23026  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  23025 aattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatctgtgaagctg 22929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33913 - 33791
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  33913 gaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 33814  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaacta 140  Q
    || |||||||| |||||||||||    
T  33813 tataagtactatgagttcaacta 33791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 55543 - 55733
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||    ||    
T  55543 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctaatataatatgatttgaggttgttag----ta 55638  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55639 atgtgatatatttgcatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagatgttta 55733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Original strand, 23386 - 23512
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  23386 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 23485  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacc 162  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  23486 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 23512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Original strand, 17753 - 17879
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttc 135  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  17753 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttc 17852  T
Q  136 aactaaggtatttaagagtatttaacc 162  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||    
T  17853 aattaaggtgtttaagaatatttaacc 17879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 125
Target Start/End: Original strand, 22676 - 22765
Alignment:
Q  36 tcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagta 125  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  22676 tcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7458 - 7295
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  7458 gaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 7359  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  7358 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatctt 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8631 - 8468
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  8631 gaaaatactctaaggaggtgttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 8532  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctt 181  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  8531 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaatccatgttgtgagttgatctt 8468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 106681 - 106800
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  106681 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaac 106780  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaa 137  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  106781 tagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11316 - 11206
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  11316 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatttggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttat 11218  T
Q  359 gtgttgtctgtg 370  Q
    ||| || |||||    
T  11217 gtgctgcctgtg 11206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22416 - 22306
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  22416 tagtaatgtgatatagttgtatatgcattatatggattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttat 22318  T
Q  359 gtgttgtctgtg 370  Q
    ||| || |||||    
T  22317 gtgctgcctgtg 22306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Original strand, 206383 - 206570
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||| ||| |||    ||    
T  206383 atgttatgaggtgatccttggtgtaggaacagaggttgattataatattactgatgttctatgaatatgttataacatgatttaatattgttag----ta 206478  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  206479 atgtaatatatttgtatatgcattatgtggattatacaagatgattaag-tgttgttgattattatttgatattgttatatcttgagatgttt 206570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 632
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  778 aaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcaacataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaact 679  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctat 165  Q
    | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  678 ataagtactatgagttcaactagggggtttaagagtatttaacctat 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1509
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  1659 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 1560  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
     |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1559 aagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 90 - 4
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattc 104  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  90 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataattc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 21307 - 21157
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||  ||||||||    
T  21307 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaagaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattttaattctcaaaac 21208  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21207 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 21157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 356
Target Start/End: Original strand, 19505 - 19693
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| || |  | ||| || ||||  ||| ||| || |||||| |||||||||     ||    
T  19505 atgttatgagttaatcattggggtaggaatggaggttgattatagtactgttaatgttcagtgagtctgatattatgtgatttgatgttgataa----ta 19600  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga-tgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||    
T  19601 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatatgagattttttaagttgatgttgattattgtttgacattgttatat-ttgagatgttt 19693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Original strand, 15225 - 15290
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15225 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11732 - 11583
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11732 aaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataattccaaacctcaaaact 11633  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11632 agaagtattaggagtttaattacggtgtttaagagtatttgacctatgtt 11583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3994 - 3843
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3994 gaaaatactccatggagatcttagtgaaattttatgaaaatttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 3895  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | ||||||||||||||| || ||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  3894 tggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaacctatgtt 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 51531 - 51355
Alignment:
Q  19 aaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaact 118  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||    
T  51531 aaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaagctcaaaact 51432  T
Q  119 agaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatgga 196  Q
    |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  51431 agaagtactatgagttaaaataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatgga 51355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 67242 - 67187
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgttt 73  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  67242 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgttt 67187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 906 - 713
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaat 265  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||| || ||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||    ||||    
T  906 gttatgagatgacccttggggtagga-tggaggttgattataatactgttgatgttcagtgagtctgatataatatgatttgatgttgttag----taat 812  T
Q  266 gtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  811 gtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattattatttcatgatgtgatatcttgagatgtttatgtgttg 713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 301
Target Start/End: Original strand, 60573 - 60706
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    | || |     
T  60573 atgttatgagttgaaccttggggtaggaatggagattgtatatgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgtt----gttaatt 60668  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatata 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  60669 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatata 60706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 85807 - 85618
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgattt-aatgttgatagctagt 262  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| ||||| ||||     |    
T  85807 atgttacgagttgatccttggggtaggaatggaggttggatatgatattaatgatgatccgcgaagctat-ataatatgattttaatgtcgatat----t 85713  T
Q  263 aatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  85712 aatgtgatataatcgtatacgcattacatgaattatatatgatgcttaagttgatgttgattattatttgatgttgttatatcttgaggtgttta 85618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 159428 - 159603
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  159428 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattcaaaagctcaaaac 159527  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||| |||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  159528 tagaagtactatgagttcaattaaggtgattaagagtattcaactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 159603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 274 - 361
Target Start/End: Original strand, 15030 - 15117
Alignment:
Q  274 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15030 tttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 15117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4671 - 4568
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4671 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaac 4572  T
Q  118 taga 121  Q
    ||||    
T  4571 taga 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6373 - 6191
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||    
T  6373 gaaaaaactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataattccaaagctcaaaac 6274  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttg 201  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6273 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtttttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatggaagttg 6191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 915
Alignment:
Q  261 gtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgt 360  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1021 gtaatgtaatatatttatatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgt 922  T
Q  361 gttgtct 367  Q
    | |||||    
T  921 gctgtct 915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 234 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 1967
Alignment:
Q  234 tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 333  Q
    ||||||||||||| |||||    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2086 tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttga 1991  T
Q  334 tgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  1990 tattgttatatcttgagatgttta 1967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 36049 - 36224
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  36049 gaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaccctcaaaac 36148  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||  |||||  ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36149 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcgactcatgttgagagttgatc-ttgggataggaatg 36224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 138315 - 138135
Alignment:
Q  52 tgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaag 151  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  138315 tgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacg 138216  T
Q  152 agtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||| | |||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  138215 agtatttaatccatgttgtgagttgaactttgggatagcaatgaaagttgtataggatattaaggatgatttgtgaagctg 138135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33334
Alignment:
Q  41 gtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaacta 140  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  141 aggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttg 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 18190 - 18284
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  18190 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 18284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 10407 - 10554
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  10407 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataattccaaacctcaaaac 10506  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  10507 tagaagtactaggagtttaattaagggggtttatgagtatttaaccta 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 169012 - 168861
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  169012 gaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattccaaacctctaaac 168913  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaa-ggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | ||||||||||||||| || ||| ||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  168912 tggaagtactaggagtttaattaagggggttttagagtatttaacttatgtt 168861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 146345 - 146261
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  146345 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 146261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 164 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2956 - 2849
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  2956 atgttatgaattgatccttggggtaggaatggaggttgaatacaatattaatgatgacctgtgaagctgttataatatgatttaatgttga----tagta 2861  T
Q  264 atgtaatatatt 275  Q
    ||||||||||||    
T  2860 atgtaatatatt 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 345
Target Start/End: Original strand, 15959 - 16136
Alignment:
Q  165 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||    
T  15959 tgttatgagttgaacctttgggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taa 16054  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16055 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13391 - 13213
Alignment:
Q  165 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaa 264  Q
    ||||||||||| | | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||    
T  13391 tgttatgagttaaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taa 13296  T
Q  265 tgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaga--tgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||   |||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  13295 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 13213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2802 - 2737
Alignment:
Q  291 tgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||||    
T  2802 tgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9629 - 9479
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||  ||||||||    
T  9629 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaattccaaggctcaaaac 9530  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9529 tagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgtt 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 39673 - 39523
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  39673 gaaaatactccaaggagggcttagtgaaatcttatgaaaattcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataatttcaaacctcaaaac 39574  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| || ||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  39573 tagaagtactatgatttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgtt 39523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 164 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8389 - 8296
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 257  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389 atgttatgagttaatccttggggtaggaatggaggttgaatataatattactgatgatctttgaagctgttataatatgatttaatgttgatag 8296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12908 - 12748
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||    
T  12908 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaatccataaaac 12809  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgat 178  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||  |||||  ||||||||    
T  12808 tagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttgat 12748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 460 - 610
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  460 gaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 559  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  560 tagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 5764 - 5914
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5764 gaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaac 5863  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  5864 tagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaagagaatttaatctatgtt 5914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 357
Target Start/End: Original strand, 221072 - 221254
Alignment:
Q  170 tgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaa 269  Q
    |||||||| | || |||||||||| |||||||| |||| || |  ||||| || ||||  ||| |||||| |||||| |||||| |||    |||||| |    
T  221072 tgagttgacccttcgggtaggaatagaggttgattatagtagtgttgatgttcagtgagtctgatataatttgatttgatgttgttag----taatgtga 221167  T
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  221168 tatagttgtatatgcattatgtggattatataagac-tttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgttta 221254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 189460 - 189511
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  189460 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 189511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3128 - 3029
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3128 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacattgttatatcttgagatgttta 3029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1285 - 1135
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || ||||||||||||    
T  1285 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacctcaaaac 1186  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1185 tagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgtt 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11219 - 11101
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  11219 gaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataattccaaagctcaaaac 11120  T
Q  118 tagaagtactaggagttca 136  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  11119 tagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 232
Target Start/End: Original strand, 15513 - 15542
Alignment:
Q  203 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15513 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 15542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 259 - 361
Target Start/End: Original strand, 75778 - 75880
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttac 358  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  75778 tagtaatgtgataaaattgtatttgcattatgtggattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttac 75877  T
Q  359 gtg 361  Q
    |||    
T  75878 gtg 75880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 65459 - 65612
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| | | |   || |||| ||||| |    
T  65459 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgaattgtctccaaacttcaaagc 65558  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  65559 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 65612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 163 - 210
Target Start/End: Original strand, 75686 - 75733
Alignment:
Q  163 tatgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataata 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  75686 tatgttatgagttgatccttggggtaggaatgaaggttggttataata 75733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 164 - 357
Target Start/End: Original strand, 29282 - 29472
Alignment:
Q  164 atgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagta 263  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | ||| |  ||||  ||  ||| ||||||||| | |||| |||    ||    
T  29282 atgttatgagttgacccttggggtaggaatggaggttgattatagtattgttaatgttaagtgagtctaatatgatatgatttgaggttgttag----ta 29377  T
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttg-attatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  29378 atgtgatatatttgcatatgtattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgaaatattatttgatattgttatatcttgagaagttta 29472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 4060 - 3940
Alignment:
Q  234 tataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttg 332  Q
    ||||||||||||| |||||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4060 tataatatgatttgatgtt----gttagtaatgagatatatttgtatatgcattatgtggattatataagatgttttaagttgatgttgattatcatttg 3965  T
Q  333 atgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
     |  |||||||||||||||||||||    
T  3964 gtaatgttatatcttgagatgttta 3940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10334 - 10236
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10334 tagtaatgtgatgtagttgtatatgcattatgtggattatataagatgtttaagttgatgatgattattatttgatattgttacatcttgagatgttta 10236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10411 - 10358
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatg 219  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||| || ||||||    
T  10411 gttatgagttgatccttggtgtaggaatagaggttgattataatgtttatgatg 10358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 66510 - 66660
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |   || || | |||||||    
T  66510 gaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtctccaagcttcaaaac 66609  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  66610 tagaagtactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatttaacctatgtt 66660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 204 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 332537 - 332423
Alignment:
Q  204 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 303  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  332537 tataatattactgatgttctatgaatctgttatattatgattttatgttgaaag----taatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattataaatt 332442  T
Q  304 atgtttaagttgatgttga 322  Q
    |||||||||||||||||||    
T  332441 atgtttaagttgatgttga 332423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 23682 - 23799
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||    
T  23682 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaccctcaaaac 23781  T
Q  118 tagaagtactaggagttc 135  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  23782 tagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Original strand, 857 - 977
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   |    
T  857 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatatttccaaacctcgaaactagaagtactaggagtttaattaagaggt 956  T
Q  147 ttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  957 ttaagagtatttaacctatgt 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Original strand, 2620 - 2719
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||    
T  2620 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgcttaagttgatgattgattattatttgacatggatatatcttgagatgttta 2719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 164
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2458
Alignment:
Q  83 tccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaaccta 164  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaaccta 2458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 262 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 101
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  191 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgatgatgtttatcatttgatattgttatatcttgagat 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10229 - 10135
Alignment:
Q  74 ctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  10229 ctaagtcaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttgagagtatttaacctatgtt 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 693 - 628
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  693 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8000 - 7900
Alignment:
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatg-tttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8000 atgtaatatatttgtgtatggattatgtgaattatataagatgttttaagttgatgttgcttattatttgatattgttatatc-tgagatgtttatgtgt 7902  T
Q  363 tg 364  Q
    ||    
T  7901 tg 7900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 364
Target Start/End: Original strand, 4256 - 4324
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4256 tatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgatatgtttacgtgttg 4324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 167
Target Start/End: Original strand, 11722 - 11833
Alignment:
Q  55 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||    
T  11722 aaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagt 11821  T
Q  155 atttaacctatgt 167  Q
     ||||||||||||    
T  11822 -tttaacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 58037 - 57898
Alignment:
Q  204 tataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataag 303  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||| |||    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  58037 tataatattactgatgatctgttaaactgttataa-attatttaatgttgttag----taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatttaaa 57943  T
Q  304 atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  57942 atgttcaagttgttgttgattgtca-ttgatattgttatatcttga 57898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 1868 - 1785
Alignment:
Q  264 atgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattat-ataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatct 346  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1868 atgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattattataaggagtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatatct 1785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1964 - 1928
Alignment:
Q  166 gttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttga 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1964 gttatgagttgatccttggggtaggaatggaggttga 1928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30503 - 30404
Alignment:
Q  259 tagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatg-ttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttta 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  30503 tagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatataaaatgcttaagttgttgattgattattatttgacattgttatgtcttgagatgttta 30404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 74
Target Start/End: Original strand, 7855 - 7911
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttc 74  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  7855 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttc 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8393 - 8240
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  8393 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 8294  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8293 ttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 8240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 168
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3149
Alignment:
Q  78 gttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 80
Target Start/End: Original strand, 2531 - 2593
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagtt 80  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2531 gaaaatagtccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagtt 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 56550 - 56397
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  56550 gaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 56451  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56450 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 56397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Original strand, 53825 - 53890
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53825 tatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 53890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 128922 - 129005
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  128922 taatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 129005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 116673 - 116608
Alignment:
Q  169 atgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgtt 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  116673 atgagttggtctttggggtaggaatggtagttgtttacaatattaatgataatctgtgaagctgtt 116608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8051 - 7931
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |    
T  8051 ttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggt 7952  T
Q  147 ttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  7951 ttgagaatatttaacctatgt 7931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 167
Target Start/End: Original strand, 2295 - 2406
Alignment:
Q  55 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||   |||||||||    
T  2295 aaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaagaggtttaagagt 2394  T
Q  155 atttaacctatgt 167  Q
     ||||||||||||    
T  2395 -tttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 167
Target Start/End: Original strand, 10550 - 10661
Alignment:
Q  55 aaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||   ||| |||||    
T  10550 aaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatatttccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaagaggtttgagagt 10649  T
Q  155 atttaacctatgt 167  Q
     ||||||||||||    
T  10650 -tttaacctatgt 10661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 6203 - 6116
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttga 349  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6203 taatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattttatatgatgtttaagttgaggatgtttatcatttgatattgttatatcttga 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 11698 - 11844
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaacta 119  Q
    ||||||||||| | | |||| || ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||    
T  11698 aaatactccaaggcggtcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtttccaaacctcaaaacta 11797  T
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgt 167  Q
    ||||||||||||||| || ||| |   |||||||||||||||||||||    
T  11798 gaagtactaggagtttaattaa-gaggttaagagtatttaacctatgt 11844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 18132 - 18285
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  18132 gaaaatactccaagcaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 18231  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18232 ttg-tgtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 18285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 361
Target Start/End: Original strand, 6932 - 6993
Alignment:
Q  300 taagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6932 taagttgtttaagttgatgttgattatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 6993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 296 - 361
Target Start/End: Original strand, 6889 - 6954
Alignment:
Q  296 tatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6889 tatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatatcttgagatgtttacgtg 6954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 166
Target Start/End: Original strand, 13254 - 13402
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||| |||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| ||| |  | | |||| |||||||    
T  13254 gaaaacactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttcccaaacttcaaaac 13353  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatg 166  Q
    || ||||| || ||||| || ||||   |||||||||||||||| ||||    
T  13354 tataagtattacgagtttaattaagaggtttaagagtatttaacatatg 13402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 48487 - 48403
Alignment:
Q  270 tatatttgtatatgcattatgtg-aattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48487 tatatttgcaaatgcattatgtggaattatatatgatgtttaagttg-tgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgt 48403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 98 - 194
Target Start/End: Original strand, 1373 - 1468
Alignment:
Q  98 ataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatgagttgatctttggggtaggaatg 194  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  1373 ataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc-ttgggataggaatg 1468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1173
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagt 79  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||    
T  1112 gaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 259 - 106
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| || || | |||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  259 gaaaatactgtaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacctaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 160  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  159 ttgt-gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18738 - 18589
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  18738 gaaaatactccaaggaagtcttagagaaatcttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 18639  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18638 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgtt 18589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 62292 - 62139
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| || || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  62292 gaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactacttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagc 62193  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    | |  |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  62192 ttg-tgtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 62139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 253
Target Start/End: Original strand, 27526 - 27614
Alignment:
Q  165 tgttatgagttgatctttggggtaggaatggaggttgaatataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttg 253  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27526 tgttatgagttgaaccttggggtagtaatggaaattgtatatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg 27614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 345
Target Start/End: Original strand, 27646 - 27785
Alignment:
Q  203 atataatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttaatgttgatagctagtaatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataa 302  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   | || |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||      
T  27646 atatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttg---gtta-taatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgt 27741  T
Q  303 g-atgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    | |||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  27742 gaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 32788 - 32671
Alignment:
Q  47 ttttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtat 146  Q
    |||| |||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |    
T  32788 ttttatgaaaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgtttccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaagt 32690  T
Q  147 ttaagagtatttaacctat 165  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  32689 tggagagtatttaacctat 32671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26089 - 25940
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| | |||     |  || | |||||||    
T  26089 gaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgatggatcgtcttcaatcttcaaaac 25990  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25989 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 25940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34834 - 34689
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    || |||||||||| ||| |   || |||| ||||| |    
T  34834 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttctccaaacttcaaagc 34739  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34738 ttg-tgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 34689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 418 - 367
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  418 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 11584 - 11635
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11584 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 11635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 18604 - 18679
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  18604 gaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaaaccaaaactta 18679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 32743 - 32794
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32743 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 32794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 36169 - 36220
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36169 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttacgtgt 36220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 97175 - 97092
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  97175 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 106453 - 106370
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 345  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  106453 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 168
Target Start/End: Original strand, 35995 - 36144
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcaaaacctcaaaac 117  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||| | | |   || |||| ||||| |    
T  35995 gaaaatactcaaaggatgtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatgtattgtctccaaacttcaaagc 36094  T
Q  118 tagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    | |  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36095 ttgt-gtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgtt 36144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 168
Target Start/End: Original strand, 16525 - 16598
Alignment:
Q  95 ggaataattcaaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  16525 ggaataattcaaaacctcaaaactataagtactaggaatttaattaagggttttaaaaatatttaacctatgtt 16598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Original strand, 7333 - 7408
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  7333 gaaaatactccaaggaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaactta 7408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 14170 - 14221
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14170 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttacgtgt 14221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 58802 - 58853
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  58802 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcttgagatgtttatgtgt 58853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2422 - 2364
Alignment:
Q  110 ctcaaaactagaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  2422 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgtt 2364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 74 - 1
Alignment:
Q  20 aaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  74 aaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 172
Target Start/End: Original strand, 24586 - 24635
Alignment:
Q  123 gtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgttatga 172  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24586 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatga 24635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 56
Target Start/End: Original strand, 24541 - 24579
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaa 56  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24541 gaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 93
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8173
Alignment:
Q  17 agaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaactta 93  Q
    |||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  8097 agaaaataccacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttcttagtcaacccaaaactta 8173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 473 - 422
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  473 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 2462 - 2403
Alignment:
Q  18 gaaaatactccaatgagatcttagtgaaattttttgaaaattcagcataactgtttctaa 77  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2462 gaaaatactacaaagaggtcttagtgaagttttatgaaaattcagcataaccgtttctaa 2403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 3958 - 4009
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3958 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 4009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5235
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5184 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 5235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12445 - 12394
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12445 agttgttgttgattatcatttgatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 12394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 65611 - 65662
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  65611 agttgttgttgattatcgtttgatattgttatatcctgagatgtttacgtgt 65662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Original strand, 61695 - 61746
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  61695 agttgttgttgattatcattagatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 61746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 80738 - 80687
Alignment:
Q  311 agttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  80738 agttgttgttgattatcatttaatattgttatatcctgagatgtttatgtgt 80687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 6235 - 6329
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  6235 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38486 - 38392
Alignment:
Q  262 taatgtaatatatttgtatatgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgttt 356  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || || |||||| |  |||||||| |||| ||||| |||| |||||    
T  38486 taatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt 38392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1620 - 1583
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1620 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 1583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 3178
Alignment:
Q  315 gatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagat 352  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3215 gatgttgattaccatttgatgttgttatatcttgagat 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 362
Target Start/End: Original strand, 207591 - 207636
Alignment:
Q  317 tgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgt 362  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  207591 tgttgattatcatttgatattgttatatcttgatatgtttatgtgt 207636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 168
Target Start/End: Original strand, 1 - 49
Alignment:
Q  120 gaagtactaggagttcaactaaggtatttaagagtatttaacctatgtt 168  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1 gaagtgctatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgtt 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 364
Target Start/End: Original strand, 10858 - 10906
Alignment:
Q  316 atgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgtttacgtgttg 364  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  10858 atgttgagtattatttgatgttgttatatcttgaggtgtttaagtgttg 10906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11688 - 11659
Alignment:
Q  203 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11688 atataatattaatgatgatctgtgaagctg 11659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Original strand, 16541 - 16613
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  16541 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 16613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 209073 - 209001
Alignment:
Q  281 atgcattatgtgaattatataagatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatcttgagatgt 354  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||    
T  209073 atgcattatgtggattatgtatgatgtttaagtag-tgttgattatcatttggtattgtcatattttgggatgt 209001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University