View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3646_low_14 (Length: 223)

Name: NF3646_low_14
Description: NF3646
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3646_low_14
NF3646_low_14
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (2-223)||(9077962-9078183)
chr5 (4-223)||(24529230-24529449)
chr5 (2-223)||(25421542-25421763)
chr5 (2-223)||(1096477-1096698)
chr5 (2-213)||(25431414-25431625)
chr5 (1-223)||(23390385-23390607)
chr5 (1-223)||(24493579-24493800)
chr5 (1-223)||(8286731-8286954)
chr5 (1-223)||(13025321-13025542)
chr5 (1-223)||(13095505-13095726)
chr5 (1-223)||(22075029-22075251)
chr5 (18-219)||(22412198-22412388)
chr5 (1-223)||(21292859-21293080)
chr5 (66-223)||(21808343-21808500)
chr5 (67-219)||(264768-264919)
chr5 (67-219)||(29329945-29330096)
chr5 (67-219)||(29345991-29346142)
chr5 (67-219)||(39363395-39363546)
chr5 (68-219)||(10732941-10733091)
chr5 (125-223)||(21997547-21997645)
chr5 (66-223)||(21729018-21729175)
chr5 (67-219)||(20909023-20909174)
chr5 (67-219)||(29348464-29348615)
chr5 (67-219)||(29350937-29351088)
chr5 (67-219)||(42245365-42245516)
chr5 (18-219)||(11581151-11581350)
chr5 (67-219)||(32027404-32027555)
chr5 (107-218)||(20902049-20902159)
chr5 (2-129)||(21986037-21986164)
chr5 (67-219)||(36154783-36154931)
chr5 (67-219)||(39245147-39245298)
chr5 (67-219)||(18319033-18319185)
chr5 (107-219)||(2154654-2154765)
chr5 (18-219)||(18418594-18418793)
chr5 (51-221)||(21565554-21565723)
chr5 (26-223)||(37723913-37724108)
chr5 (1-95)||(22107262-22107356)
chr5 (67-219)||(10775675-10775827)
chr5 (67-219)||(31061079-31061231)
chr5 (107-219)||(38619445-38619557)
chr5 (12-214)||(22144068-22144271)
chr5 (18-167)||(20766035-20766174)
chr5 (107-219)||(23064522-23064634)
chr5 (115-214)||(20026942-20027043)
chr5 (67-219)||(24067118-24067270)
chr5 (67-219)||(20917952-20918099)
chr5 (118-221)||(22959538-22959641)
chr5 (115-219)||(21329500-21329604)
chr5 (111-218)||(26012034-26012141)
chr5 (58-184)||(18356364-18356488)
chr5 (18-207)||(40725879-40726069)
chr5 (85-219)||(17517174-17517308)
chr5 (162-223)||(19660884-19660946)
chr5 (135-223)||(36314587-36314675)
chr5 (111-184)||(29448052-29448126)
chr5 (114-219)||(21502158-21502263)
chr5 (26-206)||(21873277-21873453)
chr5 (118-221)||(19668910-19669013)
chr5 (114-184)||(20910801-20910869)
chr5 (111-214)||(22178218-22178323)
chr5 (164-217)||(26732884-26732937)
chr5 (165-215)||(26704089-26704139)
chr5 (164-214)||(26740697-26740747)
chr5 (165-215)||(26973822-26973872)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (2-223)||(50210103-50210324)
chr1 (2-223)||(34509790-34510011)
chr1 (2-223)||(22532279-22532500)
chr1 (4-223)||(27250621-27250840)
chr1 (1-217)||(21026696-21026912)
chr1 (1-219)||(20135201-20135419)
chr1 (19-219)||(22468604-22468803)
chr1 (1-156)||(22354461-22354616)
chr1 (18-219)||(433023-433222)
chr1 (67-219)||(21840778-21840929)
chr1 (51-219)||(23593719-23593886)
chr1 (67-219)||(13988877-13989028)
chr1 (67-219)||(21923291-21923442)
chr1 (67-214)||(45574842-45574989)
chr1 (51-219)||(16361928-16362095)
chr1 (67-219)||(21475087-21475238)
chr1 (67-219)||(29776699-29776850)
chr1 (67-219)||(31612324-31612475)
chr1 (67-219)||(29298148-29298298)
chr1 (1-95)||(22356063-22356158)
chr1 (1-95)||(22357749-22357844)
chr1 (67-219)||(16275363-16275515)
chr1 (30-219)||(21346972-21347161)
chr1 (17-96)||(48603651-48603730)
chr1 (27-219)||(13212821-13213013)
chr1 (67-219)||(21707178-21707329)
chr1 (67-219)||(21711720-21711871)
chr1 (30-219)||(21342107-21342296)
chr1 (107-221)||(21754057-21754170)
chr1 (1-207)||(38801280-38801483)
chr1 (51-218)||(33681022-33681188)
chr1 (122-219)||(15860064-15860160)
chr1 (67-215)||(22123067-22123215)
chr1 (131-223)||(20847173-20847265)
chr1 (51-214)||(21896195-21896358)
chr1 (52-214)||(21861510-21861672)
chr1 (111-221)||(22921868-22921978)
chr1 (12-218)||(16758664-16758872)
chr1 (24-214)||(35260992-35261180)
chr1 (51-217)||(20918620-20918782)
chr1 (49-206)||(21787979-21788136)
chr1 (86-218)||(22237642-22237773)
chr1 (67-219)||(40389165-40389317)
chr1 (165-219)||(20454606-20454660)
chr1 (118-213)||(14295557-14295652)
chr1 (118-221)||(20248291-20248394)
chr1 (111-214)||(50614114-50614219)
chr1 (111-214)||(50621942-50622047)
chr1 (26-219)||(21714556-21714754)
chr1 (111-214)||(41050033-41050138)
chr1 (51-184)||(22130850-22130978)
chr1 (58-184)||(33797570-33797694)
chr1 (135-218)||(52927993-52928076)
chr1 (111-214)||(16368284-16368388)
chr1 (18-95)||(21477654-21477732)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (2-223)||(28648934-28649155)
chr8 (2-223)||(6759268-6759487)
chr8 (2-223)||(16092231-16092453)
chr8 (1-223)||(18818298-18818520)
chr8 (7-223)||(22875075-22875291)
chr8 (2-223)||(22626746-22626966)
chr8 (1-223)||(21923817-21924039)
chr8 (1-223)||(20536218-20536440)
chr8 (2-223)||(7372788-7373001)
chr8 (3-223)||(23406389-23406611)
chr8 (1-223)||(21918889-21919111)
chr8 (1-223)||(18879126-18879342)
chr8 (1-219)||(23648567-23648785)
chr8 (1-223)||(31971267-31971487)
chr8 (1-223)||(45130887-45131107)
chr8 (67-219)||(14409444-14409595)
chr8 (67-219)||(16413316-16413467)
chr8 (67-219)||(1484413-1484564)
chr8 (67-219)||(5853292-5853443)
chr8 (1-223)||(16199535-16199755)
chr8 (67-219)||(20403238-20403389)
chr8 (67-219)||(22001764-22001915)
chr8 (18-219)||(41598199-41598399)
chr8 (67-219)||(15203231-15203382)
chr8 (67-219)||(20046195-20046346)
chr8 (18-219)||(26219728-26219918)
chr8 (67-219)||(4483292-4483442)
chr8 (67-219)||(4542373-4542524)
chr8 (12-223)||(21389353-21389561)
chr8 (67-219)||(19896276-19896430)
chr8 (17-223)||(21395888-21396091)
chr8 (17-223)||(21790381-21790584)
chr8 (107-219)||(26223930-26224041)
chr8 (87-219)||(26225268-26225398)
chr8 (1-96)||(25363029-25363124)
chr8 (18-214)||(19801333-19801527)
chr8 (30-223)||(21778697-21778887)
chr8 (107-217)||(15070571-15070681)
chr8 (67-205)||(14823798-14823935)
chr8 (51-215)||(13508024-13508188)
chr8 (111-219)||(38855250-38855358)
chr8 (115-219)||(6520382-6520486)
chr8 (51-215)||(13597556-13597720)
chr8 (111-219)||(21285611-21285719)
chr8 (107-219)||(45290734-45290846)
chr8 (108-219)||(19937046-19937157)
chr8 (67-219)||(25484275-25484419)
chr8 (118-223)||(5866280-5866385)
chr8 (130-223)||(17140926-17141019)
chr8 (85-219)||(18678075-18678209)
chr8 (118-223)||(21491005-21491110)
chr8 (85-219)||(32121746-32121880)
chr8 (115-218)||(983407-983512)
chr8 (18-215)||(17612018-17612213)
chr8 (51-214)||(20498581-20498744)
chr8 (111-218)||(23760843-23760950)
chr8 (111-221)||(21673716-21673826)
chr8 (112-221)||(26355699-26355807)
chr8 (111-214)||(37116366-37116471)
chr8 (49-206)||(23776772-23776929)
chr8 (17-219)||(17353843-17354050)
chr8 (111-207)||(17439504-17439602)
chr8 (118-223)||(21249394-21249500)
chr8 (118-223)||(21255232-21255338)
chr8 (18-69)||(26222987-26223039)
chr8 (111-214)||(17266991-17267096)
chr8 (111-214)||(24353039-24353143)
chr8 (111-152)||(40492850-40492891)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (2-223)||(16377413-16377632)
chr4 (2-223)||(14038658-14038879)
chr4 (1-223)||(44052839-44053061)
chr4 (1-223)||(12902767-12902989)
chr4 (1-223)||(16239859-16240080)
chr4 (16-223)||(16270140-16270346)
chr4 (1-223)||(7088887-7089109)
chr4 (1-223)||(7893713-7893932)
chr4 (1-223)||(22636445-22636666)
chr4 (1-223)||(23374248-23374470)
chr4 (49-223)||(7798784-7798958)
chr4 (18-219)||(54798669-54798861)
chr4 (18-219)||(14280327-14280518)
chr4 (18-219)||(44928829-44929031)
chr4 (67-219)||(19618172-19618323)
chr4 (61-223)||(6899901-6900062)
chr4 (67-219)||(18215274-18215425)
chr4 (114-223)||(52873369-52873478)
chr4 (67-219)||(12307-12458)
chr4 (51-219)||(1837494-1837660)
chr4 (67-219)||(15118352-15118503)
chr4 (67-219)||(44773087-44773238)
chr4 (67-219)||(52312521-52312672)
chr4 (67-219)||(3515018-3515169)
chr4 (67-219)||(19242710-19242861)
chr4 (67-219)||(44615299-44615450)
chr4 (67-219)||(50222339-50222490)
chr4 (1-223)||(17046497-17046716)
chr4 (67-219)||(18239419-18239570)
chr4 (67-219)||(23803265-23803416)
chr4 (67-219)||(51463868-51464019)
chr4 (18-219)||(44102225-44102425)
chr4 (1-223)||(14053191-14053412)
chr4 (67-219)||(15355324-15355476)
chr4 (67-219)||(14970707-14970858)
chr4 (87-216)||(8574844-8574971)
chr4 (18-218)||(52243099-52243302)
chr4 (51-214)||(13790-13953)
chr4 (67-219)||(12610961-12611105)
chr4 (18-215)||(15367708-15367905)
chr4 (18-215)||(15402721-15402918)
chr4 (69-214)||(21815587-21815731)
chr4 (107-221)||(12774019-12774132)
chr4 (18-215)||(15371220-15371417)
chr4 (18-215)||(15373501-15373698)
chr4 (1-96)||(17047961-17048056)
chr4 (67-219)||(7641192-7641333)
chr4 (107-215)||(15370036-15370144)
chr4 (147-223)||(3096303-3096379)
chr4 (4-95)||(3096782-3096872)
chr4 (51-218)||(43198492-43198661)
chr4 (107-215)||(16223550-16223658)
chr4 (115-218)||(12288211-12288316)
chr4 (123-219)||(39706299-39706395)
chr4 (67-214)||(22353852-22353999)
chr4 (118-223)||(15551827-15551932)
chr4 (129-221)||(8846368-8846460)
chr4 (67-219)||(20149840-20149992)
chr4 (12-214)||(6190481-6190683)
chr4 (58-184)||(43256106-43256230)
chr4 (111-214)||(46640453-46640558)
chr4 (18-69)||(8574784-8574836)
chr4 (2-36)||(15091093-15091127)
chr4 (130-195)||(16596686-16596751)
chr4 (49-206)||(15093798-15093955)
chr4 (111-151)||(15464930-15464970)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (2-223)||(3041-3261)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (2-223)||(3564254-3564475)
chr7 (18-219)||(18456319-18456519)
chr7 (1-223)||(12698841-12699064)
chr7 (1-223)||(9509199-9509421)
chr7 (1-223)||(26212006-26212228)
chr7 (1-223)||(38227491-38227712)
chr7 (1-217)||(10589055-10589270)
chr7 (1-218)||(15143926-15144143)
chr7 (18-219)||(48273403-48273594)
chr7 (1-223)||(16386136-16386359)
chr7 (67-214)||(13647344-13647491)
chr7 (67-219)||(18430723-18430874)
chr7 (67-219)||(456332-456483)
chr7 (67-219)||(11393287-11393438)
chr7 (67-219)||(11972507-11972658)
chr7 (67-219)||(14949122-14949273)
chr7 (67-219)||(15376713-15376864)
chr7 (51-219)||(16213695-16213861)
chr7 (67-219)||(16232531-16232682)
chr7 (67-219)||(18640283-18640434)
chr7 (67-219)||(20385123-20385274)
chr7 (67-219)||(21189595-21189746)
chr7 (67-219)||(24702249-24702400)
chr7 (67-219)||(32125502-32125653)
chr7 (1-223)||(40443401-40443621)
chr7 (67-219)||(41522928-41523079)
chr7 (67-219)||(41525390-41525541)
chr7 (80-219)||(24275182-24275320)
chr7 (67-219)||(27216871-27217022)
chr7 (67-219)||(44116520-44116671)
chr7 (69-219)||(16410070-16410219)
chr7 (27-218)||(2280033-2280225)
chr7 (67-219)||(3386344-3386495)
chr7 (67-219)||(24704699-24704847)
chr7 (1-223)||(27847722-27847941)
chr7 (18-219)||(17061866-17062066)
chr7 (107-219)||(13869357-13869469)
chr7 (67-219)||(38898376-38898528)
chr7 (107-219)||(13831384-13831495)
chr7 (110-219)||(67759-67868)
chr7 (111-221)||(18005658-18005768)
chr7 (50-219)||(20110567-20110724)
chr7 (18-194)||(12756622-12756797)
chr7 (118-223)||(34200796-34200901)
chr7 (67-167)||(26355983-26356083)
chr7 (67-167)||(26358435-26358535)
chr7 (123-221)||(811142-811240)
chr7 (120-221)||(44014190-44014291)
chr7 (114-218)||(16219719-16219823)
chr7 (111-219)||(22072927-22073036)
chr7 (135-223)||(28505321-28505409)
chr7 (18-207)||(19486649-19486839)
chr7 (12-218)||(1867895-1868101)
chr7 (118-223)||(16495412-16495517)
chr7 (111-218)||(16056343-16056449)
chr7 (115-219)||(47831821-47831925)
chr7 (57-206)||(15211484-15211633)
chr7 (12-207)||(15008398-15008594)
chr7 (51-206)||(12255730-12255887)
chr7 (118-223)||(11996033-11996138)
chr7 (118-223)||(15754893-15754998)
chr7 (111-215)||(10063817-10063921)
chr7 (114-184)||(2530140-2530208)
chr7 (50-145)||(15113031-15113125)
chr7 (165-215)||(18154894-18154944)
chr7 (120-214)||(20220194-20220290)
chr7 (127-218)||(12901338-12901431)
chr7 (64-219)||(14932685-14932841)
chr7 (64-219)||(15356120-15356276)
chr7 (64-219)||(15360234-15360390)
chr7 (163-214)||(18203831-18203882)
chr7 (163-218)||(14044761-14044817)
chr7 (163-218)||(14354791-14354847)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (2-223)||(25629245-25629466)
chr6 (2-223)||(29060550-29060771)
chr6 (2-223)||(18409717-18409938)
chr6 (2-223)||(20593783-20594004)
chr6 (6-223)||(19303435-19303651)
chr6 (1-222)||(20360849-20361070)
chr6 (1-223)||(20638172-20638394)
chr6 (1-223)||(22780116-22780338)
chr6 (2-219)||(17287686-17287903)
chr6 (67-219)||(22782238-22782389)
chr6 (67-219)||(2291180-2291331)
chr6 (67-219)||(12742328-12742479)
chr6 (67-219)||(18334592-18334743)
chr6 (67-219)||(19005057-19005208)
chr6 (67-219)||(19858919-19859070)
chr6 (67-219)||(24422558-24422709)
chr6 (67-219)||(30676710-30676861)
chr6 (67-219)||(33861805-33861956)
chr6 (67-219)||(33864289-33864440)
chr6 (66-223)||(20076710-20076863)
chr6 (66-223)||(16496254-16496411)
chr6 (18-214)||(18456735-18456930)
chr6 (67-219)||(1540911-1541062)
chr6 (67-219)||(8055040-8055191)
chr6 (107-219)||(25688513-25688624)
chr6 (67-219)||(25754820-25754971)
chr6 (67-219)||(26924640-26924791)
chr6 (67-219)||(34963384-34963535)
chr6 (67-219)||(1595560-1595711)
chr6 (12-218)||(25644335-25644543)
chr6 (67-219)||(25656640-25656791)
chr6 (80-214)||(18461895-18462028)
chr6 (67-219)||(16448526-16448678)
chr6 (67-219)||(20556894-20557043)
chr6 (67-219)||(3852017-3852168)
chr6 (1-207)||(16920522-16920725)
chr6 (2-206)||(15041441-15041644)
chr6 (1-195)||(25603274-25603467)
chr6 (12-212)||(22831524-22831723)
chr6 (51-218)||(20109153-20109322)
chr6 (49-214)||(18821782-18821946)
chr6 (3-195)||(25611614-25611805)
chr6 (58-223)||(35245596-35245758)
chr6 (18-223)||(8227416-8227622)
chr6 (111-221)||(19652207-19652316)
chr6 (111-214)||(23019425-23019528)
chr6 (118-216)||(28496477-28496575)
chr6 (118-216)||(29808888-29808986)
chr6 (135-219)||(27333241-27333325)
chr6 (135-219)||(27393981-27394065)
chr6 (118-218)||(9098518-9098620)
chr6 (115-218)||(19668386-19668491)
chr6 (25-214)||(11185524-11185710)
chr6 (172-219)||(25714431-25714478)
chr6 (118-223)||(1561313-1561418)
chr6 (118-221)||(4185827-4185930)
chr6 (114-184)||(27415943-27416011)
chr6 (161-212)||(33443068-33443119)
chr6 (114-219)||(19847997-19848102)
chr6 (3-51)||(5834388-5834436)
chr6 (3-51)||(20177096-20177144)
chr6 (3-51)||(22158847-22158895)
chr6 (85-219)||(23992441-23992572)
chr6 (165-206)||(21766718-21766759)
chr6 (49-124)||(25642120-25642196)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (2-223)||(14972864-14973085)
chr3 (2-223)||(18438544-18438765)
chr3 (2-219)||(40213611-40213827)
chr3 (2-223)||(25476275-25476496)
chr3 (1-223)||(13442284-13442506)
chr3 (1-223)||(17487866-17488088)
chr3 (3-223)||(26686897-26687117)
chr3 (1-220)||(14576722-14576940)
chr3 (1-223)||(23083250-23083472)
chr3 (12-215)||(42386428-42386632)
chr3 (3-223)||(43840942-43841162)
chr3 (1-223)||(17499348-17499570)
chr3 (2-223)||(11424653-11424870)
chr3 (1-223)||(20698325-20698546)
chr3 (18-219)||(24153115-24153315)
chr3 (1-223)||(12399219-12399441)
chr3 (1-220)||(14572602-14572820)
chr3 (67-219)||(12567571-12567722)
chr3 (67-219)||(13544036-13544187)
chr3 (51-219)||(29172567-29172734)
chr3 (67-219)||(9707607-9707758)
chr3 (67-219)||(10247723-10247874)
chr3 (67-219)||(17463189-17463340)
chr3 (67-219)||(34159337-34159488)
chr3 (87-219)||(36166609-36166739)
chr3 (67-219)||(38961891-38962042)
chr3 (67-219)||(45606907-45607058)
chr3 (67-219)||(55476502-55476653)
chr3 (18-219)||(21618460-21618650)
chr3 (67-219)||(7781347-7781498)
chr3 (67-219)||(8899105-8899256)
chr3 (67-219)||(16454281-16454432)
chr3 (67-219)||(17672637-17672788)
chr3 (67-219)||(28848611-28848762)
chr3 (67-219)||(50242833-50242984)
chr3 (67-214)||(53070653-53070799)
chr3 (67-219)||(13151790-13151942)
chr3 (67-219)||(13154255-13154407)
chr3 (67-219)||(6469134-6469285)
chr3 (67-219)||(16282811-16282962)
chr3 (67-219)||(17446655-17446805)
chr3 (67-214)||(43550478-43550625)
chr3 (107-219)||(15977526-15977637)
chr3 (67-219)||(41123901-41124049)
chr3 (116-219)||(55500953-55501055)
chr3 (1-218)||(30029855-30030071)
chr3 (17-96)||(14179569-14179648)
chr3 (18-215)||(24340628-24340826)
chr3 (27-219)||(12119684-12119876)
chr3 (107-219)||(15412440-15412552)
chr3 (51-221)||(16103792-16103960)
chr3 (107-221)||(32307689-32307802)
chr3 (122-219)||(8499529-8499625)
chr3 (18-214)||(52523633-52523831)
chr3 (111-218)||(15470939-15471046)
chr3 (51-221)||(16097340-16097509)
chr3 (1-96)||(16796684-16796779)
chr3 (130-219)||(44494820-44494908)
chr3 (18-215)||(23274705-23274903)
chr3 (54-221)||(12174205-12174368)
chr3 (118-223)||(13210333-13210438)
chr3 (111-219)||(10556996-10557104)
chr3 (51-219)||(27165261-27165429)
chr3 (123-219)||(53301562-53301658)
chr3 (18-207)||(37642170-37642360)
chr3 (85-219)||(46822279-46822413)
chr3 (115-219)||(14234501-14234605)
chr3 (107-221)||(49668071-49668185)
chr3 (85-219)||(12511071-12511205)
chr3 (127-221)||(9512932-9513026)
chr3 (127-221)||(9520907-9521001)
chr3 (111-214)||(37251165-37251270)
chr3 (111-214)||(43925977-43926082)
chr3 (51-152)||(2051138-2051239)
chr3 (131-219)||(17737247-17737337)
chr3 (117-214)||(12377940-12378039)
chr3 (111-214)||(22110349-22110454)
chr3 (107-221)||(1644670-1644782)
chr3 (169-219)||(28194704-28194755)
chr3 (18-179)||(22147431-22147591)
chr3 (177-219)||(45577947-45577989)
chr3 (18-69)||(36166747-36166799)
chr3 (165-219)||(856150-856204)
chr3 (165-219)||(23077530-23077584)
chr3 (163-212)||(13919350-13919399)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (2-223)||(39487-39707)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (2-223)||(25955-26176)
scaffold0122 (87-219)||(44682-44814)
scaffold0122 (2-108)||(33385-33491)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (2-223)||(75105-75325)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (2-222)||(4519-4738)
scaffold0228 (2-222)||(12101-12320)
scaffold0228 (2-222)||(22053-22272)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (2-223)||(16490-16711)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (2-223)||(17105-17328)
scaffold0056 (18-214)||(79235-79430)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (1-223)||(22337125-22337347)
chr2 (3-223)||(23060523-23060742)
chr2 (2-223)||(23660033-23660253)
chr2 (9-223)||(23076452-23076666)
chr2 (1-223)||(22731123-22731345)
chr2 (1-223)||(23654275-23654497)
chr2 (1-223)||(23285875-23286093)
chr2 (1-219)||(22738069-22738286)
chr2 (1-219)||(298703-298922)
chr2 (1-223)||(38005-38225)
chr2 (67-219)||(22105423-22105575)
chr2 (67-219)||(18808954-18809105)
chr2 (67-219)||(23130873-23131024)
chr2 (67-219)||(23133340-23133491)
chr2 (67-219)||(23709532-23709683)
chr2 (67-219)||(23712013-23712164)
chr2 (67-219)||(24367785-24367936)
chr2 (67-219)||(26505390-26505541)
chr2 (67-219)||(26507868-26508019)
chr2 (67-219)||(32214921-32215072)
chr2 (67-219)||(34402522-34402673)
chr2 (67-219)||(39682324-39682475)
chr2 (1-223)||(20309118-20309337)
chr2 (67-219)||(571408-571559)
chr2 (67-219)||(6726006-6726157)
chr2 (67-219)||(21155060-21155211)
chr2 (67-219)||(23135601-23135752)
chr2 (67-219)||(24898195-24898347)
chr2 (67-219)||(24900678-24900830)
chr2 (67-219)||(24903155-24903307)
chr2 (67-219)||(24905632-24905784)
chr2 (67-219)||(24908107-24908259)
chr2 (67-219)||(32039498-32039649)
chr2 (67-219)||(43137310-43137461)
chr2 (12-218)||(23708518-23708725)
chr2 (67-219)||(28577110-28577261)
chr2 (67-219)||(45029854-45030005)
chr2 (1-78)||(27753730-27753807)
chr2 (64-223)||(23103348-23103506)
chr2 (18-215)||(19671848-19672043)
chr2 (111-221)||(28405988-28406099)
chr2 (107-219)||(24529569-24529680)
chr2 (67-219)||(38967385-38967537)
chr2 (111-221)||(25175862-25175972)
chr2 (49-206)||(22799063-22799220)
chr2 (49-219)||(23019643-23019813)
chr2 (160-223)||(8946667-8946730)
chr2 (66-203)||(7687-7824)
chr2 (107-221)||(22134203-22134315)
chr2 (85-219)||(25616199-25616333)
chr2 (115-219)||(7679599-7679702)
chr2 (170-223)||(23040247-23040300)
chr2 (12-214)||(32451829-32452031)
chr2 (111-214)||(23207296-23207401)
chr2 (135-223)||(23071972-23072060)
chr2 (67-144)||(24642856-24642933)
chr2 (12-214)||(20520092-20520295)
chr2 (172-219)||(24643054-24643101)
chr2 (118-218)||(18786907-18787009)
chr2 (12-214)||(22413035-22413240)
chr2 (111-207)||(23004774-23004872)
chr2 (163-212)||(23287384-23287433)
chr2 (164-212)||(26392403-26392451)
chr2 (50-137)||(22459500-22459587)
chr2 (111-214)||(23791292-23791397)
chr2 (49-121)||(22758652-22758725)
chr2 (111-152)||(24697604-24697645)
chr2 (49-124)||(22740897-22740973)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-223)||(51923-52145)
scaffold0011 (1-223)||(167868-168089)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (2-223)||(25906-26126)
scaffold0026 (2-223)||(39868-40088)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (2-223)||(339840-340058)
scaffold0003 (67-219)||(158450-158601)
scaffold0003 (114-184)||(71350-71418)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-223)||(13221-13443)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-223)||(38771-38992)
scaffold0145 (16-223)||(32952-33158)
scaffold0145 (107-219)||(9760-9871)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (29-223)||(3103-3297)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (2-219)||(22897-23113)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-223)||(1861-2083)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-223)||(3480-3702)
scaffold0292 (2-215)||(361-573)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (3-223)||(8424-8640)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (2-223)||(39923-40143)
scaffold0080 (112-214)||(19883-19987)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (7-170)||(3424-3588)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-223)||(4859-5081)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-223)||(6010-6235)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (22-223)||(16123-16323)
scaffold0120 (16-223)||(32863-33067)
scaffold0120 (16-223)||(45938-46142)
scaffold0120 (172-223)||(17389-17440)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (2-151)||(27912-28061)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-215)||(24190-24406)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-223)||(938-1159)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (3-181)||(13144-13322)
scaffold0175 (118-223)||(34133-34238)
scaffold0175 (177-223)||(283-329)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-223)||(8489-8707)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-215)||(20928-21143)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-223)||(13507-13727)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-223)||(32077-32296)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-223)||(1962-2184)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-223)||(15354-15574)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (2-174)||(853-1021)
scaffold0395 (167-223)||(4888-4944)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-223)||(4722-4943)
scaffold0358 (1-168)||(1-167)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-223)||(10315-10534)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (67-219)||(4705-4856)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (67-219)||(10784-10935)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-95)||(124723-124817)
scaffold0021 (55-223)||(174776-174943)
scaffold0021 (164-223)||(121776-121835)
scaffold0021 (115-214)||(136370-136471)
scaffold0021 (115-214)||(145078-145179)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-223)||(16292-16511)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (67-219)||(20758-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (67-219)||(37832-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (67-219)||(17440-17591)
scaffold0023 (67-219)||(94422-94573)
scaffold0023 (70-219)||(44465-44614)
scaffold0023 (111-221)||(100386-100496)
scaffold0023 (111-221)||(40173-40283)
scaffold0023 (26-219)||(38394-38586)
scaffold0023 (162-223)||(119885-119947)
scaffold0023 (26-125)||(23581-23679)
scaffold0023 (162-221)||(101511-101571)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (67-219)||(501095-501246)
scaffold0001 (27-219)||(85539-85731)
scaffold0001 (51-221)||(160696-160864)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (18-219)||(16795-16995)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-223)||(1299-1518)
scaffold0106 (1-223)||(7276-7495)
scaffold0106 (165-219)||(15291-15345)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (114-223)||(28424-28533)
scaffold0046 (118-223)||(11302-11407)
scaffold0046 (118-223)||(2007-2112)
scaffold0046 (180-223)||(4562-4605)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (15-214)||(20328-20524)
scaffold0031 (66-158)||(128825-128917)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (67-219)||(13403-13554)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (67-219)||(9253-9404)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (67-219)||(13958-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (67-219)||(136691-136842)
scaffold0028 (67-219)||(139160-139311)
scaffold0028 (67-219)||(144098-144249)
scaffold0028 (67-219)||(134222-134373)
scaffold0028 (67-219)||(141629-141780)
scaffold0028 (111-207)||(62224-62317)
scaffold0028 (107-221)||(132670-132784)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (67-219)||(82083-82234)
scaffold0037 (51-218)||(22610-22776)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (67-219)||(11299-11450)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (87-219)||(116441-116571)
scaffold0022 (111-214)||(128968-129072)
scaffold0022 (111-207)||(78348-78445)
scaffold0022 (18-69)||(116579-116631)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-174)||(6669-6842)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (67-219)||(117-268)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (67-219)||(4308-4459)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (67-219)||(12249-12400)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (67-219)||(40411-40562)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (27-217)||(161049-161239)
scaffold0007 (27-150)||(164550-164674)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (12-223)||(952-1160)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (2-212)||(4545-4754)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (17-214)||(51601-51795)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (51-218)||(8481-8650)
scaffold0621 (111-221)||(6547-6657)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-96)||(1051-1146)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (27-219)||(2088-2280)
scaffold0247 (18-215)||(17932-18130)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (67-219)||(12075-12220)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (67-216)||(29946-30094)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (51-218)||(10481-10647)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (111-221)||(19276-19386)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (2-73)||(10323-10394)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (51-221)||(129917-130086)
scaffold0010 (12-207)||(60614-60811)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (67-219)||(4225-4377)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (17-223)||(5036-5239)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (51-215)||(11482-11646)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (27-218)||(16014-16206)
scaffold0357 (27-214)||(13147-13336)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (27-218)||(27663-27855)
scaffold0165 (1-74)||(3640-3713)
scaffold0165 (1-74)||(7704-7777)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (51-215)||(38195-38359)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (111-221)||(2805-2915)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (116-223)||(11447-11554)
scaffold0235 (1-49)||(11402-11450)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (51-221)||(45732-45901)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (23-223)||(47005-47202)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (111-221)||(5655-5765)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (67-219)||(1280-1432)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (51-203)||(53488-53640)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (51-221)||(141-310)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (111-221)||(14696-14806)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (118-219)||(15675-15776)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (51-219)||(38641-38809)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (111-218)||(32551-32657)
scaffold0034 (12-214)||(51784-51985)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-54)||(17876-17929)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (123-219)||(6134-6230)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (26-206)||(16264-16442)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (111-214)||(1051-1154)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (111-214)||(12587-12690)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (111-218)||(10542-10649)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (115-221)||(12778-12884)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (111-221)||(2644-2754)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (118-223)||(1075-1180)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (111-219)||(1096-1204)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (123-219)||(15788-15884)
scaffold0020 (166-215)||(178912-178961)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (118-221)||(6824-6927)
scaffold0556 (111-158)||(8090-8137)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (127-218)||(23898-23989)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (125-219)||(6625-6719)
scaffold0333 (125-219)||(14005-14099)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (115-218)||(8075-8180)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (26-219)||(23853-24048)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (115-219)||(1037-1141)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (51-212)||(7998-8161)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (51-176)||(225465-225588)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (111-207)||(38342-38440)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (115-218)||(12954-13057)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (111-214)||(6281-6386)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (111-218)||(25121-25229)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (58-184)||(15362-15486)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (57-206)||(192920-193070)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (162-221)||(28818-28879)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (111-176)||(2217-2281)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (163-212)||(206575-206624)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-41)||(20595-20635)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (15-121)||(32544-32650)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (111-214)||(97024-97129)
scaffold0006 (111-214)||(106302-106407)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (172-214)||(11982-12024)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (107-145)||(13092-13130)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (49-219)||(4741-4911)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (54-142)||(1169-1257)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (115-214)||(569-669)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (115-218)||(103632-103737)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (111-214)||(267679-267784)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (165-219)||(10575-10629)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (111-152)||(1795-1836)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (166-219)||(36464-36517)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (26-121)||(69905-70000)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9078183 - 9077962
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9078183 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatg 9078084  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9078083 aatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 9077984  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    | |||  |||||||||||||||    
T  9077983 gggtcagtctaagttgatgaag 9077962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24529449 - 24529230
Alignment:
Q  4 acttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgat 103  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  24529449 acttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaa 24529350  T
Q  104 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatga 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24529349 tgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 24529250  T
Q  204 gtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  24529249 gtcggtctaagttgatgaag 24529230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25421763 - 25421542
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||     
T  25421763 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 25421664  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25421663 attgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcat 25421564  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  25421563 gagtcggtctaagttgatgaag 25421542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1096698 - 1096477
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1096698 agacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 1096599  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1096598 aatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 1096499  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  1096498 gagtcggtctaagttgatgaag 1096477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25431625 - 25431414
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||     
T  25431625 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 25431526  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25431525 attgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcat 25431426  T
Q  202 gagtcgatctaa 213  Q
    |||||| |||||    
T  25431425 gagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23390385 - 23390607
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  23390385 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat 23390484  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23390485 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 23390584  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  23390585 tgagtcggtctaagttgatgaag 23390607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24493800 - 24493579
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||    
T  24493800 aagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtat 24493701  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |    
T  24493700 aattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgca 24493602  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  24493601 tgagtcggtctaagttgatgaag 24493579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 8286731 - 8286954
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  8286731 aagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat 8286830  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-ttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgt 199  Q
    | |||  || || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8286831 gtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgc 8286930  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  8286931 atgagtcggtctaagttgatgaag 8286954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13025542 - 13025321
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||  |||    
T  13025542 aagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtat 13025443  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13025442 aattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgca 13025344  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  13025343 tgagtcggtctaagttgatgaag 13025321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13095726 - 13095505
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||  |||    
T  13095726 aagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtat 13095627  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  13095626 aattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgca 13095528  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  13095527 tgagtcggtctaagttgatgaag 13095505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22075251 - 22075029
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |    
T  22075251 aagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaatt 22075152  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22075151 atttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaa 22075052  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  22075051 tgagtcggtctaagttgttgaag 22075029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412198
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21292859 - 21293080
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  21292859 aagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 21292957  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttg-acttgcat-ttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 198  Q
     ||||||||  | |||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292958 aattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 21293055  T
Q  199 tatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
     |||| ||| |||||| || |||||    
T  21293056 catgaatcggtctaagatgttgaag 21293080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 223
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808500
Alignment:
Q  66 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 21808500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264919
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 264919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329945
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29329945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345991
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29345991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363395
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39363395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 68 - 219
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733091
Alignment:
Q  68 gtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 167  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  168 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10733041 -ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10733091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 223
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997645
Alignment:
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21997645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 223
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729175
Alignment:
Q  66 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 21729175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909023
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348464
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29348464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350937
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245516
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 42245516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 11581151 - 11581350
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  11581151 ttaatgataatctgtgaagttgatttatgatga-ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgaga 11581248  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11581249 cgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11581347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027404
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 32027404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 218
Target Start/End: Original strand, 20902049 - 20902159
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20902049 ataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 20902147  T
Q  207 gatctaagttga 218  Q
    | ||||||||||    
T  20902148 ggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 129
Target Start/End: Original strand, 21986037 - 21986164
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21986037 agacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattacttgagatatg 21986136  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttg 129  Q
    | | ||||||  ||||||||||||||||    
T  21986137 aatttataatgaagatgttgttgacttg 21986164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154931
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||   || || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36154931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245147
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39245198 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39245147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319185
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Original strand, 2154654 - 2154765
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2154654 ataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 2154752  T
Q  207 gatctaagttgat 219  Q
    | |||||||||||    
T  2154753 ggtctaagttgat 2154765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||  | | |||| || ||| |||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaat-attaaga 18418695  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||  |||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565554
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 21565554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37724108 - 37723913
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataa--gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgtt 123  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || || |||||||||||| |    
T  37724108 aatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt-taattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgat 37724011  T
Q  124 gacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaa 222  Q
    || ||  ||||||||| || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||| || ||||    
T  37724010 gaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaa 37723914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 22107262 - 22107356
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttga 95  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||    
T  22107262 aagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttga 22107356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775827
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10775827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31061231 - 31061079
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || | ||||   || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31061231 tgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 31061132  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  || | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  31061131 t-actgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 31061079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38619557 - 38619445
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38619557 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 38619459  T
Q  206 cgatctaagttgat 219  Q
    || |||||||||||    
T  38619458 cggtctaagttgat 38619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22144271 - 22144068
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||| || | |||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||      
T  22144271 atgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 22144172  T
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22144171 ttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22144073  T
Q  210 ctaag 214  Q
    |||||    
T  22144072 ctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766174
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcgtac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 20766124  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20766125 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23064634 - 23064522
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23064634 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 23064536  T
Q  206 cgatctaagttgat 219  Q
    || |||||||||||    
T  23064535 cggtctaagttgat 23064522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 214
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatct 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgtttt-ggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  212 aag 214  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067118
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||    
T  24067170 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgat 24067118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 20917952 - 20918099
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgat-tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||    || |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  20917952 tgtgatataattatatatgctttacttgaatta-gatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatac 20918046  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20918047 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20918099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 221
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959641
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  217 gatga 221  Q
    |||||    
T  22959637 gatga 22959641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329604
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21329598  T
Q  214 gttgat 219  Q
    ||||||    
T  21329599 gttgat 21329604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 26012034 - 26012141
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |    
T  26012034 ttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  26012133 ctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  58 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||  ||| ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  158 tcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
      |||| ||||||||||||||||||||    
T  18356388 --gtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725879
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||| ||||||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgcttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcg 40725879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Original strand, 17517174 - 17517308
Alignment:
Q  85 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  17517174 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 17517273  T
Q  185 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||| ||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  17517274 attaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 17517308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660946
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 19660946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314587
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 36314587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29448126 - 29448052
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29448126 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttt-atatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 219
Target Start/End: Original strand, 21502158 - 21502263
Alignment:
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 212  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  21502158 agatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 21502256  T
Q  213 agttgat 219  Q
    |||||||    
T  21502257 agttgat 21502263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21873453 - 21873277
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 125  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| ||  || |||   ||||||    
T  21873453 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatggttaaga---tgttga 21873358  T
Q  126 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
      ||   |||||||||| | |||||| || | | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  21873357 aatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19669013 - 19668910
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  19669013 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagtt 19668915  T
Q  217 gatga 221  Q
    |||||    
T  19668914 gatga 19668910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 20910801 - 20910869
Alignment:
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910801 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 22178218 - 22178323
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  ||||||  |||||||||||||||| || |||||  ||||||||| || ||||||||    
T  22178218 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt-atatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcg 22178316  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  22178317 gtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 217
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26704139 - 26704089
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  26704139 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26704089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 214
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26973872 - 26973822
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  26973872 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26973822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 50210103 - 50210324
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  50210103 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 50210202  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50210203 aatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 50210302  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  50210303 gagtcggtctaagttgatgaag 50210324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34510011 - 34509790
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34510011 agacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatg 34509912  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34509911 aatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 34509812  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  34509811 gagtcggtctaagttgatgaag 34509790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22532500 - 22532279
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  22532500 agacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 22532401  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | || ||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||    
T  22532400 aatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcat 22532301  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  22532300 gagttggtctaagttgatgaag 22532279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 27250621 - 27250840
Alignment:
Q  4 acttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgat 103  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||  |    
T  27250621 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatt 27250720  T
Q  104 tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatga 203  Q
    || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27250721 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatga 27250820  T
Q  204 gtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  27250821 gtcggtctaagttgttgaag 27250840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21026912 - 21026696
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |    
T  21026912 aagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaatt 21026813  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  21026812 atttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgca 21026713  T
Q  201 tgagtcgatctaagttg 217  Q
    ||||||| |||||||||    
T  21026712 tgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20135419 - 20135201
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||  | |    
T  20135419 aagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttt 20135320  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || |    
T  20135319 tattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgca 20135220  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  20135219 tgagtcagtctaagttgat 20135201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468803
Alignment:
Q  19 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  119 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 22468802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22354461 - 22354616
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||    
T  22354461 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaat 22354560  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt 156  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  22354561 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 433222 - 433023
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  433222 ttaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 433123  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  433122 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 433026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840778
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21840829 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 219
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593886
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23593886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988877
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13988877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923442
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21923442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45574989
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361928
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | ||||||  |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16361995 gttgtttttatatactg-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475238
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 21475238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776699
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29776750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612324
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 31612324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298148
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29298199 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29298148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 22356063 - 22356158
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttga 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22356063 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 22356158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 22357749 - 22357844
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttga 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22357749 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttga 22357844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275515
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||| || |   || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21347161 - 21346972
Alignment:
Q  30 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgact 127  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| ||||||    
T  21347161 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 21347063  T
Q  128 tgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21347062 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21346972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603651
Alignment:
Q  17 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgag 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgag 48603651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Original strand, 13212821 - 13213013
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 124  Q
    |||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||    
T  13212821 atctgtgaagttgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 13212919  T
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13212920 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13213013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707178
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21707229 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21707178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711720
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21711771 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21711720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21342296 - 21342107
Alignment:
Q  30 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgact 127  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| ||||||    
T  21342296 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 21342198  T
Q  128 tgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21342197 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21342107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754057
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  206 cgatctaagttgatga 221  Q
    || |||||||||||||    
T  21754072 cggtctaagttgatga 21754057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 38801280 - 38801483
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||   ||    
T  38801280 aagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaat 38801378  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgt 199  Q
     ||||||||  | | |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  38801379 aattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgtt---gcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 38801475  T
Q  200 atgagtcg 207  Q
    ||||||||    
T  38801476 atgagtcg 38801483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681022
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 219
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860160
Alignment:
Q  122 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 15860160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123215
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  167 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |  | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 223
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847265
Alignment:
Q  131 atttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 20847265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||| ||| ||||   || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21896295 gctgtttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 214
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  52 tgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 151  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  152 atgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
     |||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  21861610 ctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921978
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||| ||||||    
T  22921967 ctaagatgatga 22921978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16758872 - 16758664
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||      
T  16758872 atgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatg- 16758774  T
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  16758773 ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcg 16758675  T
Q  208 atctaagttga 218  Q
     ||||||||||    
T  16758674 gtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 214
Target Start/End: Original strand, 35260992 - 35261180
Alignment:
Q  24 ataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgt 122  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||| | || ||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||  || ||  ||||||   |||    
T  35260992 ataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgt 35261088  T
Q  123 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35261089 tgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20918782 - 20918620
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||| | ||| |||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  20918782 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 20918687  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 217  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20918686 gatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788136
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||  | |||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtc 21788078  T
Q  149 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    ||| |||| | ||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  21788079 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22237773 - 22237642
Alignment:
Q  86 cattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgtt 184  Q
    |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||| |||| |||||    
T  22237773 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgtt 22237676  T
Q  185 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  22237675 atttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389165
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||  |||| ||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgat 40389165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454660
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 213
Target Start/End: Original strand, 14295557 - 14295652
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14295557 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248291
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  217 gatga 221  Q
    |||||    
T  20248295 gatga 20248291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 50614114 - 50614219
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  50614114 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 50614212  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  50614213 gtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 50621942 - 50622047
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  50621942 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 50622040  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  50622041 gtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21714754 - 21714556
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataa--gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgtt 123  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || || |||||||||||| |    
T  21714754 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt-taattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgct 21714657  T
Q  124 gacttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
       ||  |||||||||     ||| |||||||  |||| | |||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21714656 tgtttttatttgatatcgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttga 21714557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 41050033 - 41050138
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||  ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||     
T  41050033 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcgg 41050132  T
Q  209 tctaag 214  Q
    ||||||    
T  41050133 tctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Original strand, 22130850 - 22130978
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||| ||| | ||| |||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  22130850 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttg-ataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 22130945  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22130946 gatggtttgg-atactgcctatgttgctgttgtt 22130978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  58 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||   |  ||| ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt 33797595  T
Q  158 tcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
      |||| |||| |||||||||||||||    
T  33797594 --gtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 218
Target Start/End: Original strand, 52927993 - 52928076
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  52927993 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 16368284 - 16368388
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||    
T  16368284 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 16368381  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  16368382 gtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 21477732 - 21477654
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttga 95  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  21477732 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcattacttga 21477654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 182; Significance: 1e-98; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 28648934 - 28649155
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  28648934 agacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatg 28649033  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  28649034 aatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcat 28649133  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  28649134 gagtcggtctaagttgatgaag 28649155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6759487 - 6759268
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  6759487 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattat 6759388  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
    || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6759387 gagtgtataattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgca 6759291  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  6759290 tgagtcggtctaagttgatgaag 6759268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 16092231 - 16092453
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  16092231 agacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattat 16092330  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16092331 gaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgca 16092430  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  16092431 tgagtcggtctaagttgatgaag 16092453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18818298 - 18818520
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  18818298 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtat 18818397  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18818398 aattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 18818497  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  18818498 tgagtcggtctaagttgatgaag 18818520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22875291 - 22875075
Alignment:
Q  7 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattg 105  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  22875291 taatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22875192  T
Q  106 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  22875191 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagt 22875093  T
Q  206 cgatctaagttgatgaag 223  Q
    || ||||| |||||||||    
T  22875092 cggtctaaattgatgaag 22875075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22626966 - 22626746
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||     
T  22626966 agacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtata 22626867  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22626866 attgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 22626768  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  22626767 gagtcggtctaagttgatgaag 22626746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21923817 - 21924039
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| |||||  |||||||||||  |||    
T  21923817 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtat 21923916  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923917 aattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 21924016  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  21924017 tgagtcggtctaagttgatgaag 21924039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20536440 - 20536218
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  20536440 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat 20536341  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  20536340 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgca 20536241  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  20536240 tgagtcggtctaagttgatgaag 20536218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7373001 - 7372788
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||  |||     
T  7373001 agacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtata 7372910  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7372909 attgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 7372810  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  7372809 gagtcggtctaagttgatgaag 7372788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23406611 - 23406389
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatga 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |    
T  23406611 gacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23406512  T
Q  103 ttgtataattgagatgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
    ||| ||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23406511 ttgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 23406412  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  23406411 tgagtcggtctaagttgatgaag 23406389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21918889 - 21919111
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  21918889 aagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 21918987  T
Q  101 gatt-gtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgt 199  Q
     ||| | ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21918988 tatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgc 21919087  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  21919088 atgagtcggtctaagttgttgaag 21919111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 18879126 - 18879342
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  18879126 aagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaat 18879224  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18879225 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 18879319  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  18879320 tgagtcggtctaagttgatgaag 18879342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23648785 - 23648567
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | |    
T  23648785 aagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttt 23648686  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |    
T  23648685 tattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgca 23648586  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  23648585 tgagtcagtctaagttgat 23648567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31971487 - 31971267
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  31971487 aagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 31971389  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31971388 atttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 31971290  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  31971289 tgagtcggtctaagttgttgaag 31971267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 45130887 - 45131107
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  45130887 aagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 45130985  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttg-acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgt 199  Q
     ||||||||  | |||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45130986 aattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgc 45131083  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  45131084 atgagtcggtctaagatgttgaag 45131107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409595
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14409595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413467
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484413
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1484413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853443
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5853443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16199535 - 16199755
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||   ||    
T  16199535 aagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 16199633  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
      |||||||  | |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16199634 atttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 16199731  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  16199732 atgagtcggtctaagatgttgaag 16199755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403238
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20403238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001764
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22001764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41598399 - 41598199
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  41598399 ttaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 41598301  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41598300 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41598202  T
Q  217 gat 219  Q
    |||    
T  41598201 gat 41598199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203382
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgat 15203382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046346
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20046295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20046346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26219918 - 26219728
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  26219918 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 26219829  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26219828 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26219731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483292
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4483292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542524
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4542524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389561
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataat 111  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||      
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21389451  T
Q  112 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatc 210  Q
    | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21389452 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T
Q  211 taagttgatgaag 223  Q
    |||| || |||||    
T  21389549 taagatgttgaag 21389561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896276
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatta---ttatgtcatgatgttttcgtat 163  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  164 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19896330 accg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19896276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396091
Alignment:
Q  17 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21395986  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  21395987 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21396083  T
Q  216 tgatgaag 223  Q
    || |||||    
T  21396084 tgttgaag 21396091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790584
Alignment:
Q  17 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21790479  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  21790480 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21790576  T
Q  216 tgatgaag 223  Q
    || |||||    
T  21790577 tgttgaag 21790584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26224041 - 26223930
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || || | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  26224041 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattg-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtc 26223943  T
Q  207 gatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||    
T  26223942 gatctaagttgat 26223930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225398
Alignment:
Q  87 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattg-ttgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  187 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 25363029 - 25363124
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgag 96  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  25363029 aagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttgag 25363124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 19801333 - 19801527
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  19801333 ttaatgatgatctgtgaagctgatttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 19801431  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19801432 cgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 223
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778887
Alignment:
Q  30 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttg 129  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||||||| ||| |||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  130 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 21778887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15070681 - 15070571
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15070681 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15070583  T
Q  206 cgatctaagttg 217  Q
    || |||||||||    
T  15070582 cggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823798
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt 14823798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 215
Target Start/End: Original strand, 13508024 - 13508188
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  13508024 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13508123  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||| | | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  13508124 gatgttgt-gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Original strand, 38855250 - 38855358
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  38855250 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38855348  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  38855349 ctaagttgat 38855358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520382
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6520388  T
Q  214 gttgat 219  Q
    ||||||    
T  6520387 gttgat 6520382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 215
Target Start/End: Original strand, 13597556 - 13597720
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  13597556 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13597655  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  13597656 gatgtttt-gcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285611
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  21285620 ctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Original strand, 45290734 - 45290846
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290734 ataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 45290832  T
Q  206 cgatctaagttgat 219  Q
    || |||||||||||    
T  45290833 cggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 219
Target Start/End: Original strand, 19937046 - 19937157
Alignment:
Q  108 taattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19937046 taattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19937144  T
Q  207 gatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||    
T  19937145 ggtccaagttgat 19937157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484419
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
           | ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgat 25484419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866385
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  5866379 gttgaag 5866385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140926
Alignment:
Q  130 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 17140926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Original strand, 18678075 - 18678209
Alignment:
Q  85 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  18678075 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 18678174  T
Q  185 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  18678175 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 18678209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21491005
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  21491011 gttgaag 21491005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32121880 - 32121746
Alignment:
Q  85 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  32121880 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 32121781  T
Q  185 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  32121780 atttaactaagttgcatgagtcattctaagttgat 32121746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt-ttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 212  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  213 agttga 218  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 17612018 - 17612213
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||   ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||    
T  17612018 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt---tataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 17612114  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  17612115 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    | | ||||   |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  20498644 gctatttt-acatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Original strand, 23760843 - 23760950
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23760843 ttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttac-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 23760941  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  23760942 ctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673716
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||||| |    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  21673727 ctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355807
Alignment:
Q  112 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatc 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  26355699 tgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 26355796  T
Q  211 taagttgatga 221  Q
    |||||||||||    
T  26355797 taagttgatga 26355807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37116471 - 37116366
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  37116471 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 37116373  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  37116372 gtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776929
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 148  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||  | |||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtc 23776871  T
Q  149 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    ||| || | | ||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  23776872 atgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 17353843 - 17354050
Alignment:
Q  17 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataag-cattacttgagttatgattgtataattgag 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||| || |||||  |   |||||||||| |||||| || || ||||||    
T  17353843 gttaattgtaatctgtgaagctgtt-atgaaatgtttatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaattatgaatgaatgattgag 17353941  T
Q  116 atgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatc 210  Q
    ||| || |  |||| |||||||||     ||| ||||||| ||||| | |||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||||||||     
T  17353942 atgatgcttgcttgtatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgata 17354041  T
Q  211 taagttgat 219  Q
    |||| ||||    
T  17354042 taagatgat 17354050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 207
Target Start/End: Original strand, 17439504 - 17439602
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  17439504 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 17439602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21249500 - 21249394
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21249500 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21249402  T
Q  216 tgatgaag 223  Q
    || |||||    
T  21249401 tgttgaag 21249394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21255338 - 21255232
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21255338 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21255240  T
Q  216 tgatgaag 223  Q
    || |||||    
T  21255239 tgttgaag 21255232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 69  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 17266991 - 17267096
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||   |||||  | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  17266991 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgtttt-atgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 17267089  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  17267090 gtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24353143 - 24353039
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||    
T  24353143 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 24353046  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  24353045 gtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Original strand, 40492850 - 40492891
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  40492850 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 16377413 - 16377632
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16377413 agacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 16377512  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16377513 aatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 16377610  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  16377611 gagtcggtctaagttgatgaag 16377632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14038879 - 14038658
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  14038879 agacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatg 14038780  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14038779 aatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 14038680  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  14038679 gagtcagtctaagttgatgaag 14038658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44053061 - 44052839
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  44053061 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaat 44052962  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  44052961 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgca 44052862  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  44052861 tgagtcggcctaagttgatgaag 44052839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12902989 - 12902767
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  12902989 aagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataat 12902890  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12902889 atttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 12902790  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  12902789 tgagtcggtctaagttgttgaag 12902767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16239859 - 16240080
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |  |||    
T  16239859 aagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtat 16239958  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| || |    
T  16239959 aattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgca 16240057  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||| | |||||||||||||||    
T  16240058 tgagttggtctaagttgatgaag 16240080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270346
Alignment:
Q  16 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgag 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 16270239  T
Q  116 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  16270240 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  216 tgatgaag 223  Q
    ||||||||    
T  16270339 tgatgaag 16270346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7089109 - 7088887
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  7089109 aagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataat 7089010  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| |||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7089009 atttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 7088910  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  7088909 tgagtcggtctaagttgatgaag 7088887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7893932 - 7893713
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||| |||  |||||||||||  |||    
T  7893932 aagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtat 7893836  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7893835 aattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgca 7893736  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  7893735 tgaatcggtctaagttgatgaag 7893713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22636666 - 22636445
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  22636666 aagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaat 22636568  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  22636567 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgca 22636468  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  22636467 tgagtcggtctaagttgatgaag 22636445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23374248 - 23374470
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |    
T  23374248 aagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaatt 23374347  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23374348 atttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 23374447  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  23374448 tgagtcgttctaagttgttgaag 23374470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798784
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  149 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 7798784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798861
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280327
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| | |||| ||||||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatctatatttgaga 14280429  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14280428 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 44928829 - 44929031
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  || |||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  44928829 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44928928  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44928929 tgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44929028  T
Q  217 gat 219  Q
    |||    
T  44929029 gat 44929031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618323
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899901
Alignment:
Q  61 ttatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  161 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaag 6899901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215425
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18215425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873478
Alignment:
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52873468  T
Q  214 gttgatgaag 223  Q
    ||||||||||    
T  52873469 gttgatgaag 52873478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12458
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 219
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837660
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1837494 ttgatgttg-ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118503
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15118503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773238
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44773238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312521
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52312521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515018
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242710
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19242761 g-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19242710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615299
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44615299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222490
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50222490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17046716 - 17046497
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||||   ||    
T  17046716 aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaat 17046618  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
    | |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  17046617 gtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---ctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 17046521  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  17046520 atgagtcggtctaagatgttgaag 17046497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239570
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18239519 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18239570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803416
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23803365 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23803416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464019
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51463968 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 51464019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44102425 - 44102225
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  44102425 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44102327  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44102326 cgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44102228  T
Q  217 gat 219  Q
    |||    
T  44102227 gat 44102225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 14053191 - 14053412
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  14053191 aagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 14053289  T
Q  101 gattgtataattgag-atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctg 198  Q
      ||||||   | || |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||    
T  14053290 atttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttg 14053387  T
Q  199 tatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
     ||||||||||||||| || |||||    
T  14053388 catgagtcgatctaagatgttgaag 14053412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355476
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15355424 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970858
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 216
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574971
Alignment:
Q  87 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 8574941  T
Q  187 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8574942 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243302
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||   || ||  ||||||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52243199 tgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T
Q  214 gttga 218  Q
    |||||    
T  52243298 gttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13890 gttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610961
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12610961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367708
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||| ||||   || ||||||||||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15367807  T
Q  117 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15367806 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402721
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||| ||||   || ||||||||||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15402820  T
Q  117 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15402819 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 214
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  69 tgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgc 168  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  169 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774019
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  206 cgatctaagttgatga 221  Q
    || |||||||||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatga 12774019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15371417 - 15371220
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||| ||||   || ||||||||||    
T  15371417 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15371319  T
Q  117 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15371318 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15373698 - 15373501
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||| ||||   || ||||||||||    
T  15373698 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15373600  T
Q  117 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15373599 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 17047961 - 17048056
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgag 96  Q
    |||||||||||| ||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  17047961 aagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgag 17048056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641333
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||            
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-------- 7641283  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7641284 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7641333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15370144 - 15370036
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15370144 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15370046  T
Q  206 cgatctaagt 215  Q
    |  |||||||    
T  15370045 cagtctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096303
Alignment:
Q  147 tcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 3096303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3096872 - 3096782
Alignment:
Q  4 acttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttga 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  3096872 acttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtt-tatgcattacttga 3096782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  151 ga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    ||  |||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43198592 gaattgtttt-gcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16223658 - 16223550
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16223658 ataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 16223560  T
Q  206 cgatctaagt 215  Q
    |  |||||||    
T  16223559 cagtctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatct 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  212 aagttga 218  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706395
Alignment:
Q  123 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39706395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353852
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||     |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15551932 - 15551827
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15551932 gttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15551834  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  15551833 gttgaag 15551827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8846460 - 8846368
Alignment:
Q  129 gcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  8846460 gcattcgatattgttatctcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatga 8846368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149840
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| || |||||||  |||||||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgat 20149840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6190683 - 6190481
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgat-tatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||||| | ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||  | | | || ||||    
T  6190683 atgatattaattacaattcgtgaagctgtt-atgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataa 6190586  T
Q  111 ttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    |||||||| |||||  ||| |||| |||||| |||||||||| | |||| | || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||     
T  6190585 ttgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcgg 6190487  T
Q  209 tctaag 214  Q
    ||||||    
T  6190486 tctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  58 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 157  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||   |  ||| ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 43256203  T
Q  158 tcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256204 tggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 46640453 - 46640558
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  46640453 ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 46640551  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  46640552 gtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 8574784 - 8574836
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 69  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8574784 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 15091127 - 15091093
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaag 36  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15091127 agacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16596751 - 16596686
Alignment:
Q  130 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 195  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16596751 cattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15093955 - 15093798
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||| |||| || ||| | ||||||| ||  || | |||||||||| | |||    
T  15093955 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtc 15093856  T
Q  149 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    ||| |||| | ||   ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| || |||||||    
T  15093855 atgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtc 15093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 151
Target Start/End: Original strand, 15464930 - 15464970
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15464930 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 3041 - 3261
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3041 agacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 3140  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3141 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 3239  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  3240 gagtcggtctaagttgatgaag 3261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 3564254 - 3564475
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3564254 agacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatg 3564353  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3564354 aatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 3564453  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  3564454 gagtcggtctaagttgatgaag 3564475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456519
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  218 at 219  Q
    ||    
T  18456518 at 18456519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12699064 - 12698841
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  12699064 aagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat 12698965  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgt 199  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12698964 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgc 12698865  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  12698864 atgagtcggtctaagttgatgaag 12698841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9509421 - 9509199
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||   ||    
T  9509421 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaat 9509322  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  9509321 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgca 9509222  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  9509221 tgagtcggtctaagttgatgaag 9509199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26212228 - 26212006
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||   |    
T  26212228 aagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaatt 26212129  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26212128 atttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgta 26212029  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  26212028 tgagtcggtctaagttgttgaag 26212006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38227712 - 38227491
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||| ||||  |||    
T  38227712 aagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtat 38227613  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  38227612 aattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgca 38227514  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||| |||||||    
T  38227513 tgagtcggtctaagtagatgaag 38227491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10589270 - 10589055
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||   ||    
T  10589270 aagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattgcttgaagaat 10589172  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| | | |  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10589171 atttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgca 10589072  T
Q  201 tgagtcgatctaagttg 217  Q
    |||||||||||||||||    
T  10589071 tgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 15143926 - 15144143
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagtta 99  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||    
T  15143926 aagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaatta 15144025  T
Q  100 tgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgt 199  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||| | | ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15144026 tgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttgctgttgttatttaactaagctgc 15144124  T
Q  200 atgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15144125 atgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273403
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtata-ttgaga 48273506  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  48273505 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 16386136 - 16386359
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||   |    
T  16386136 aagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaatt 16386235  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
    | ||| ||| || |||||||| |||  | || |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||     
T  16386236 gtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgc 16386335  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  16386336 atgagtcggtctaagttgttgaag 16386359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647344
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430723
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18430723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456332
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 456332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393438
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11393438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972507
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11972507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949273
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376864
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15376864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16213861 - 16213695
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16213861 ttgatgttg-ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 16213763  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16213762 gttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16213695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232531
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16232531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640283
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18640283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385274
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20385274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189746
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21189746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702249
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24702249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125502
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32125502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40443621 - 40443401
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  40443621 aagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 40443523  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
      |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  40443522 atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 40443425  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    | |||||| |||||| || |||||    
T  40443424 acgagtcggtctaagatgttgaag 40443401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522928
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41522928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525390
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41525390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275182
Alignment:
Q  80 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 179  Q
    |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 24275222  T
Q  180 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216871
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 27216871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116520
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44116520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410070
Alignment:
Q  69 tgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgc 168  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 16410121  T
Q  169 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16410120 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16410070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280225
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||   || ||| |||||||||||||||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  126 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386344
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3386344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704699
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatact 24704751  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24704750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 27847722 - 27847941
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||   ||    
T  27847722 aagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtt-tatgcattacttgaagaat 27847820  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
    | |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||   ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  27847821 gtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgc 27847917  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||| ||| |||||| || |||||    
T  27847918 atgaatcggtctaagatgttgaag 27847941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 17061866 - 17062066
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  ||||||||||    
T  17061866 ttaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgaga 17061964  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17061965 cgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactg-ctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17062062  T
Q  216 tgat 219  Q
    ||||    
T  17062063 tgat 17062066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13869469 - 13869357
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13869469 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13869371  T
Q  206 cgatctaagttgat 219  Q
    || |||||||||||    
T  13869370 cggtctaagttgat 13869357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898528
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    || || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  38898476 tg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13831495 - 13831384
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13831495 ataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactacc-gtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 13831397  T
Q  207 gatctaagttgat 219  Q
    | ||||| |||||    
T  13831396 ggtctaaattgat 13831384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67759
Alignment:
Q  110 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  209 tctaagttgat 219  Q
    |||||||||||    
T  67769 tctaagttgat 67759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18005768 - 18005658
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18005768 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18005670  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  18005669 ctaagttgatga 18005658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20110724 - 20110567
Alignment:
Q  50 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 149  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110724 gttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 20110626  T
Q  150 tgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    || |||||| |||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20110625 tgctgtttttgtata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20110567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 12756622 - 12756797
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| || |   || ||||||||||    
T  12756622 ttaatgatgatctgtgatgctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgaga 12756720  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 194  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12756721 cgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgctgttgttatttaactaa 12756797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200796
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  34200802 gttgaag 34200796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 167
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  167 g 167  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 167
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  167 g 167  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811240
Alignment:
Q  123 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 811240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014190
Alignment:
Q  120 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  219 tga 221  Q
    |||    
T  44014192 tga 44014190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 218
Target Start/End: Original strand, 16219719 - 16219823
Alignment:
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 212  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  16219719 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 16219817  T
Q  213 agttga 218  Q
    ||||||    
T  16219818 agttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072927
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||  |    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  22072936 ctaagttgat 22072927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505409
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaag 28505409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 19486649 - 19486839
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||   ||  || ||||||    
T  19486649 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||| ||||||||    
T  19486749 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcg 19486839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 1867895 - 1868101
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataat 111  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||| ||| ||||   || ||  |    
T  1867895 atgatattaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtt 1867993  T
Q  112 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||     
T  1867994 tgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcgg 1868091  T
Q  209 tctaagttga 218  Q
    ||||||||||    
T  1868092 tctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495412
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16495419  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  16495418 gttgaag 16495412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47831925 - 47831821
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| | | | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47831925 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 47831827  T
Q  214 gttgat 219  Q
    ||||||    
T  47831826 gttgat 47831821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211484
Alignment:
Q  57 ttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||  | | |||| |||||||||||||||| || ||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  157 ttcgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
     | || || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 207
Target Start/End: Original strand, 15008398 - 15008594
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||||||| |||| ||   ||      
T  15008398 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattat-atatgatgt 15008496  T
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15008497 ttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 15008594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255887
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||   || ||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  151 ga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    ||  || ||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12255830 gaattgattt-gcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 12255887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 11996033 - 11996138
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11996033 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagtt 11996131  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  11996132 gttgaag 11996138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15754998
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15754991  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  15754992 gttgaag 15754998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 215
Target Start/End: Original strand, 10063817 - 10063921
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||  |    
T  10063817 ttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagt 10063915  T
Q  210 ctaagt 215  Q
    ||||||    
T  10063916 ctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 2530140 - 2530208
Alignment:
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  2530140 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15113125 - 15113031
Alignment:
Q  50 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113125 gttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 215
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154944
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 214
Target Start/End: Original strand, 20220194 - 20220290
Alignment:
Q  120 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20220194 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12901431 - 12901338
Alignment:
Q  127 ttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  12901431 ttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932841
Alignment:
Q  64 tgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 162  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  | | |||| ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  163 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 14932841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356276
Alignment:
Q  64 tgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 162  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  | | |||| ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  163 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 15356276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360390
Alignment:
Q  64 tgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 162  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  | | |||| ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  163 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||  |||||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgat 15360390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 163 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 25629245 - 25629466
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25629245 agacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 25629344  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  25629345 aatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcat 25629444  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  25629445 gagtcggtctaagttgatgaag 25629466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 29060771 - 29060550
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  29060771 agacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatg 29060672  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29060671 aatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 29060572  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  29060571 gagtcggtctaagctgatgaag 29060550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 18409717 - 18409938
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  18409717 agacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatg 18409816  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18409817 aatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcat 18409916  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  18409917 gagtcggtctaagttgatgaag 18409938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20594004 - 20593783
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  20594004 agacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatg 20593905  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  20593904 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcat 20593805  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    || ||| |||||||||||||||    
T  20593804 gattcggtctaagttgatgaag 20593783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 19303435 - 19303651
Alignment:
Q  6 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||| ||    
T  19303435 ttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatg 19303534  T
Q  106 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19303535 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 19303633  T
Q  206 cgatctaagttgatgaag 223  Q
    || |||||| ||||||||    
T  19303634 cggtctaagatgatgaag 19303651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Original strand, 20360849 - 20361070
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  20360849 aagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaat 20360948  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20360949 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 20361048  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20361049 tgagtcgatctaagttgatgaa 20361070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20638172 - 20638394
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||   ||    
T  20638172 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaat 20638271  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
    | ||| ||| |  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20638272 gtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgca 20638371  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||| | |||||||||||||||    
T  20638372 tgagttggtctaagttgatgaag 20638394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22780116 - 22780338
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||  |||    
T  22780116 aagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtat 22780215  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  22780216 aattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgca 22780315  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  22780316 tgagtcagtctaagttgatgaag 22780338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 17287686 - 17287903
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||  |||     
T  17287686 agacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtata 17287785  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17287786 attgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 17287885  T
Q  202 gagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||| |||||||||||    
T  17287886 gagtcggtctaagttgat 17287903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782238
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22782238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291331
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2291331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742328
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12742328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334743
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18334743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005057
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859070
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19859070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422558
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24422558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676861
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861805
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33861805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864289
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33864289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076710
Alignment:
Q  66 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||  || |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaaga---tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 20076710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496254
Alignment:
Q  66 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 16496254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18456930 - 18456735
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  18456930 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 18456832  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18456831 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541062
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1541011 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 1541062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055040
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8055040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25688624 - 25688513
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25688624 ataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 25688526  T
Q  207 gatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||    
T  25688525 gatctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754820
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25754820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924791
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26924791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963384
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595560
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  1595611 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 1595560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25644543 - 25644335
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| | || ||||  ||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||      
T  25644543 atgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgt 25644444  T
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25644443 ttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 25644344  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  25644343 ctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656640
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||| ||||   || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25656691 g-ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25656640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  80 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 179  Q
    |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctg 18461930  T
Q  180 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448678
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557043
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattata--tgtgaaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  20556992 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 20557043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852168
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3852117 -attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3852168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16920522 - 16920725
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||   ||    
T  16920522 aagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtt-tatgcattacttgaagaat 16920620  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
      |||||||  | |||||||| ||| | | |||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  16920621 atttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgc 16920717  T
Q  200 atgagtcg 207  Q
    ||||||||    
T  16920718 atgagtcg 16920725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 15041441 - 15041644
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | ||||| |||  |||||||||||| | |     
T  15041441 agacctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatg-tatgtgcattacttgagatttt 15041539  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||   ||||||||| | || |||||||||||||||| || ||    
T  15041540 attgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcat 15041639  T
Q  202 gagtc 206  Q
    |||||    
T  15041640 gagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 25603274 - 25603467
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||  | |    
T  25603274 aagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagttt 25603373  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 195  Q
     |||| ||||||||||||| | ||| ||  |  ||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25603374 tattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaag 25603467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22831723 - 22831524
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtata-a 110  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||   ||| ||||||| |    
T  22831723 atgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 22831625  T
Q  111 t-tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    | | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||   | | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  22831624 tctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 22831528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 148  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  149 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  20109222 atgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 214
Target Start/End: Original strand, 18821782 - 18821946
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatg 146  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | | | || |||||||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||    
T  18821782 tgttaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatg 18821879  T
Q  147 tcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
     |||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18821880 gcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Original strand, 25611614 - 25611805
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatga 102  Q
    |||||||||| |||||| |  | ||||| |||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||  | | |    
T  25611614 gacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattacttgaagtttta 25611713  T
Q  103 ttgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 195  Q
    ||| ||||||||||||| | ||| ||  |  ||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25611714 ttgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaag 25611805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245596
Alignment:
Q  58 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 157  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 35245661  T
Q  158 tcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
      ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  35245660 --gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 35245596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 8227416 - 8227622
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||    
T  8227416 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  8227516 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 8227614  T
Q  216 tgatgaag 223  Q
    || |||||    
T  8227615 tgttgaag 8227622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652207
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  19652218 ctaagttgatga 19652207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019425
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  210 ctaag 214  Q
    |||||    
T  23019429 ctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 216
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496575
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 216
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29808986
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 27333241 - 27333325
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27333241 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27333325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 27393981 - 27394065
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27393981 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27394065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Original strand, 9098518 - 9098620
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9098518 gttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt-gcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T
Q  215 ttga 218  Q
    ||||    
T  9098617 ttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatct 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||| | |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  212 aagttga 218  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 11185710 - 11185524
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttg 124  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||   ||| |||||||    ||||| || ||    
T  11185710 taatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714431
Alignment:
Q  172 tgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25714431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561313
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1561320  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  1561319 gttgaag 1561313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 221
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185930
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| || |||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4185925  T
Q  217 gatga 221  Q
    |||||    
T  4185926 gatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 27415943 - 27416011
Alignment:
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27415943 agatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgttt--gtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443068
Alignment:
Q  161 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 219
Target Start/End: Original strand, 19847997 - 19848102
Alignment:
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||    
T  19847997 agatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaa 19848096  T
Q  214 gttgat 219  Q
    ||||||    
T  19848097 gttgat 19848102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Original strand, 5834388 - 5834436
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 51  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5834388 gacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 5834436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 20177144 - 20177096
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 51  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20177144 gacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 20177096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 51
Target Start/End: Original strand, 22158847 - 22158895
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 51  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22158847 gacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 22158895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23992572 - 23992441
Alignment:
Q  85 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||   | ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  23992572 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg---aattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 23992476  T
Q  185 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||| ||||| || |||||||  |||||||||||    
T  23992475 atttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 124
Target Start/End: Original strand, 25642120 - 25642196
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttg 124  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||||    
T  25642120 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14973085 - 14972864
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14973085 agacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 14972986  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14972985 aatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 14972886  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  14972885 gagtcggtctaagttgatgaag 14972864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18438765 - 18438544
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18438765 agacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatg 18438666  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18438665 aatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacat 18438566  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  18438565 gagtcggtctaagttgatgaag 18438544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Original strand, 40213611 - 40213827
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  40213611 agacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatg 40213710  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  40213711 aatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatgttgttatttaactaagctacat 40213809  T
Q  202 gagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||| |||||||||||    
T  40213810 gagtcggtctaagttgat 40213827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 25476275 - 25476496
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  25476275 agacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatg 25476374  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  25476375 aatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacat 25476474  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  25476475 gagtcggtctaagttgatgaag 25476496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13442506 - 13442284
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  13442506 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat 13442407  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13442406 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgca 13442307  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  13442306 tgagtcggtctaagttgatgaag 13442284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17488088 - 17487866
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  17488088 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaat 17487989  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17487988 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgca 17487889  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  17487888 tgagtcggtctaagttgatgaag 17487866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26687117 - 26686897
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatga 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |    
T  26687117 gacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 26687018  T
Q  103 ttgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatg 202  Q
    | | ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  26687017 tggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 26686918  T
Q  203 agtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||| |||||||||| ||||    
T  26686917 agtcggtctaagttgaagaag 26686897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 14576722 - 14576940
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  14576722 aagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtat 14576821  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  14576822 aattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgt-ttatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaa 14576920  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  14576921 tgagtcggtctaagttgatg 14576940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23083250 - 23083472
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||     
T  23083250 aagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaa 23083349  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23083350 aattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgca 23083449  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  23083450 tgagtcggtctaagttgatgaag 23083472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42386632 - 42386428
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || |||     
T  42386632 atgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatat 42386533  T
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  42386532 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtc 42386433  T
Q  211 taagt 215  Q
    |||||    
T  42386432 taagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43841162 - 43840942
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatga 102  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |    
T  43841162 gacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 43841063  T
Q  103 ttgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatg 202  Q
    ||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  43841062 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 43840963  T
Q  203 agtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  43840962 agtcggtttaagttgatgaag 43840942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17499570 - 17499348
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  17499570 aagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaat 17499471  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17499470 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgca 17499371  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  17499370 tgagtcggtctaagttgatgaag 17499348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 11424653 - 11424870
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11424653 agacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 11424752  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11424753 aatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 11424848  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||  |||||||||||||||    
T  11424849 gagtcagtctaagttgatgaag 11424870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 20698325 - 20698546
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  20698325 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 20698423  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| |||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20698424 atttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 20698523  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  20698524 tgagtcggtctaagttgatgaag 20698546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153315
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagat 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||  ||| |||| ||| || ||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  218 at 219  Q
    ||    
T  24153314 at 24153315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12399441 - 12399219
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||   |    
T  12399441 aagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaatt 12399342  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12399341 atttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 12399242  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  12399241 tgagtcggtctaagttgttgaag 12399219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14572820 - 14572602
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |   ||||| ||||  |||    
T  14572820 aagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatttgaagtat 14572721  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14572720 aattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 14572622  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatg 220  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  14572621 tgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567571
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544036
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 219
Target Start/End: Original strand, 29172567 - 29172734
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172567 ttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29172666  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29172667 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29172734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707758
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9707758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247874
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 10247874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463189
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17463189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159337
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34159337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166609
Alignment:
Q  87 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  187 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36166609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962042
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607058
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45607058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476502
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 55476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21618650 - 21618460
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  21618650 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 21618561  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21618560 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21618463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781498
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7781498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899105
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 8899105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454432
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 16454432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672637
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17672688 g-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17672637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848762
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28848711 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28848762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242833
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  50242884 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151942
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13151942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154407
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13154407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469285
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||   ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6469234 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6469285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282962
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16282911 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16282962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446805
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg-tctaagttgat 17446805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550625
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15977637 - 15977526
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15977637 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 15977539  T
Q  207 gatctaagttgat 219  Q
    | |||||||||||    
T  15977538 ggtctaagttgat 15977526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123901
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |    |  || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41123901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500953
Alignment:
Q  116 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  216 tgat 219  Q
    ||||    
T  55500956 tgat 55500953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30030071 - 30029855
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||  | |    
T  30030071 aagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttt 30029972  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||| |||||||||| |||| | |||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| || |    
T  30029971 tattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgca 30029873  T
Q  201 tgagtcgatctaagttga 218  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  30029872 tgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179569
Alignment:
Q  17 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgag 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgag 14179569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340826
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||||||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  24340728 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Original strand, 12119684 - 12119876
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| ||   ||||   || |||||||||| |||| |||    
T  12119684 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattg 12119782  T
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  12119783 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15412552 - 15412440
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15412552 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15412454  T
Q  206 cgatctaagttgat 219  Q
    || |||||||||||    
T  15412453 cggtctaagttgat 15412440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103792
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||  |||||  ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16103792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307689
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  206 cgatctaagttgatga 221  Q
    || |||||||||||||    
T  32307704 cggtctaagttgatga 32307689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499529
Alignment:
Q  122 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8499529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 52523633 - 52523831
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||  ||||||    
T  52523633 ttaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 52523731  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52523732 tgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52523830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470939
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  15470947 ctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097340
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    |||| ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 16097340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16796779 - 16796684
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgag 96  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16796779 aagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgag 16796684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494820
Alignment:
Q  130 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 44494820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23274903 - 23274705
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgt-ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||  | |||||||| ||||   || ||| ||||||    
T  23274903 ttaatgatgatctgtgaagctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgaga 23274804  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||  |||||||    
T  23274803 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 221
Target Start/End: Original strand, 12174205 - 12174368
Alignment:
Q  54 atgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 153  Q
    |||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  12174205 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttg-atatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgat 12174300  T
Q  154 gttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12174301 gattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 12174368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210438
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  13210432 gttgaag 13210438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10556996
Alignment:
Q  111 ttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 10557006  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  10557005 ctaagttgat 10556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165261
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||| ||||| | ||||   || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27165329 gttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27165261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 53301562 - 53301658
Alignment:
Q  123 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53301562 tgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 53301658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642360
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||| ||||||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcg 37642360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 46822413 - 46822279
Alignment:
Q  85 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  46822413 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 46822314  T
Q  185 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  46822313 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 46822279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234501
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaa 14234507  T
Q  214 gttgat 219  Q
    ||||||    
T  14234506 gttgat 14234501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Original strand, 49668071 - 49668185
Alignment:
Q  107 ataattgagatgtt-gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgag 204  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49668071 ataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 49668168  T
Q  205 tcgatctaagttgatga 221  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  49668169 tcggtctaagatgatga 49668185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12511205 - 12511071
Alignment:
Q  85 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| |  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  12511205 gcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 12511106  T
Q  185 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  12511105 atttaactaagttgcatgagtcattctaagttgat 12511071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512932
Alignment:
Q  127 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 9512932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520907
Alignment:
Q  127 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatga 9520907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 37251165 - 37251270
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||    
T  37251165 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcg 37251263  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  37251264 gtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43926082 - 43925977
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  43926082 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 43925984  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  43925983 gtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051239
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  151 ga 152  Q
    ||    
T  2051238 ga 2051239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737247
Alignment:
Q  131 atttgatattattatgtcatgatgttttcgta---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||   || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12378039 - 12377940
Alignment:
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||  |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12378039 tgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 22110349 - 22110454
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  22110349 ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 22110447  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  22110448 gtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Original strand, 1644670 - 1644782
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||     
T  1644670 ataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagtt 1644767  T
Q  207 gatctaagttgatga 221  Q
    | |||||||||||||    
T  1644768 ggtctaagttgatga 1644782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194704
Alignment:
Q  169 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28194704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 22147431 - 22147591
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||    
T  22147431 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattt-atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 22147529  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 179  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||    
T  22147530 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcataccgcctacgttgctg 22147591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 219
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577989
Alignment:
Q  177 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45577989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 36166799 - 36166747
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 69  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36166799 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856150
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||    
T  856204 ctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgat 856150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077584
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||| ||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgat 23077584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 212  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39707 - 39487
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  39707 agacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 39608  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  39607 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcat 39509  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  39508 gagtcggtctaagttgatgaag 39487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 25955 - 26176
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  25955 agacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 26054  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26055 aatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 26154  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  26155 gagtcggtctaagttgatgaag 26176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44814
Alignment:
Q  87 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  187 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 44814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Original strand, 33385 - 33491
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  33385 agacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 33484  T
Q  102 attgtat 108  Q
    | |||||    
T  33485 aatgtat 33491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 75105 - 75325
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  75105 agacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 75204  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  75205 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcat 75303  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  75304 gagtcggtctaagttgatgaag 75325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4738 - 4519
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4738 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 4639  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4638 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcat 4540  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaa 222  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  4539 gagtcggtctaagttgatgaa 4519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12320 - 12101
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12320 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 12221  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12220 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcat 12122  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaa 222  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  12121 gagtcggtctaagttgatgaa 12101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22272 - 22053
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22272 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 22173  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22172 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcat 22074  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaa 222  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  22073 gagtcggtctaagttgatgaa 22053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 166; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 16490 - 16711
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16490 agacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatg 16589  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16590 aatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 16689  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| ||||| |||||||||    
T  16690 gagtcggtctaaattgatgaag 16711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 17105 - 17328
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  17105 agacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatg 17204  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg--ttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgt 199  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17205 aatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgc 17304  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  17305 atgagtcggtctaagttgatgaag 17328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 214
Target Start/End: Original strand, 79235 - 79430
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  79235 ttaatgatgatcagtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 79333  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  79334 cgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 3e-87; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22337347 - 22337125
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22337347 aagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattat 22337248  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22337247 gaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgca 22337148  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  22337147 tgagtcggtctaagttgatgaag 22337125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23060742 - 23060523
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatga 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |    
T  23060742 gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23060644  T
Q  103 ttgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatg 202  Q
    ||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23060643 tttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 23060544  T
Q  203 agtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  23060543 agtcggtctaagttgatgaag 23060523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23660253 - 23660033
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23660253 agacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatg 23660154  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||    
T  23660153 attgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacat 23660055  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  23660054 gagtcggtctaagttgatgaag 23660033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23076666 - 23076452
Alignment:
Q  9 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||    
T  23076666 atgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaat 23076567  T
Q  109 aattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23076566 atttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 23076467  T
Q  209 tctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||    
T  23076466 tctaagtggatgaag 23076452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 22731123 - 22731345
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  22731123 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat 22731222  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || | |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22731223 atttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 22731322  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||| |||||||||    
T  22731323 tgagtcggtctaacttgatgaag 22731345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 23654275 - 23654497
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  23654275 aagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaat 23654374  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  23654375 acttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgca 23654474  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  23654475 tgagtcggtctaagttgttgaag 23654497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23286093 - 23285875
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |     
T  23286093 aagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaac 23285994  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23285993 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 23285898  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  23285897 tgagtcggtctaagttgatgaag 23285875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22738069 - 22738286
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  22738069 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat 22738168  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |    
T  22738169 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgca 22738267  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22738268 tgagtcggtctaagttgat 22738286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 298703 - 298922
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |    
T  298703 aagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaatt 298802  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
      ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  298803 atttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 298902  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  298903 atgagtcggtctaagttgat 298922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 38005 - 38225
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  38005 aagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 38103  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
    | |||||||  | ||||| || ||| | | | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38104 gtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 38202  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  38203 tgagtcggtctaagttgttgaag 38225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105423
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22105423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808954
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18808954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130873
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23130873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133340
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23133340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709683
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23709683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712164
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23712164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367785
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505390
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26505390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507868
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26507868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215072
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402673
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34402673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682324
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39682324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20309337 - 20309118
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||   ||    
T  20309337 aagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaat 20309239  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgt 199  Q
      |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  20309238 atttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgc 20309142  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  20309141 atgagtcggtctaagatgttgaag 20309118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571408
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  571459 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 571408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6726006
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6726006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155211
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135601
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23135652 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23135601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898347
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24898347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900830
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24900830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903307
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905784
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24905784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908259
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24908259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039649
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgat 32039649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137310
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtata-t 43137363  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43137362 tactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 43137310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Original strand, 23708518 - 23708725
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||  ||| ||      
T  23708518 atgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgt 23708617  T
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  23708618 ttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggt 23708716  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  23708717 ctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577110
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28577161 g-ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28577110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030005
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  45029954 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45030005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27753807 - 27753730
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753807 aagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103506
Alignment:
Q  64 tgatgtgatataatgttataa--gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgt 161  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| |||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||  ||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtt-taattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gt 23103444  T
Q  162 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  23103445 atactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 23103506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19672043 - 19671848
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||||||    
T  19672043 ttaatgataatctgtgaagctgatctatgatga-ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata-ttgaga 19671947  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  19671946 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405988
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  28405999 ctaagttgatga 28405988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Original strand, 24529569 - 24529680
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24529569 ataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtc 24529667  T
Q  207 gatctaagttgat 219  Q
    | |||||||||||    
T  24529668 ggtctaagttgat 24529680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967385
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25175972 - 25175862
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |    
T  25175972 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgt 25175874  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  25175873 ctaagttgatga 25175862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Original strand, 22799063 - 22799220
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  22799063 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 22799162  T
Q  149 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||||||| | ||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  22799163 atgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 219
Target Start/End: Original strand, 23019643 - 23019813
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 148  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  23019643 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 23019742  T
Q  149 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||| |||| | ||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||    
T  23019743 atgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgat 23019813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8946730 - 8946667
Alignment:
Q  160 gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8946730 gtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 8946667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 203
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7824
Alignment:
Q  66 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatac 7785  T
Q  166 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatga 203  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Original strand, 22134203 - 22134315
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22134203 ataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtc 22134300  T
Q  207 gatctaagttgatga 221  Q
    | |||| | ||||||    
T  22134301 ggtctatgatgatga 22134315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25616333 - 25616199
Alignment:
Q  85 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| ||||     
T  25616333 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgta 25616234  T
Q  185 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  25616233 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 25616199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679599
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  7679702 gatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 7679605  T
Q  214 gttgat 219  Q
    ||||||    
T  7679604 gttgat 7679599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 223
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040300
Alignment:
Q  170 tatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 23040300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 32451829 - 32452031
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |   |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||  | | | || ||||    
T  32451829 atgatattaattacaatttgtgaagctgtt-atgggatgttaatgttgatttatgatgtgatattatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataa 32451926  T
Q  111 ttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||| | || ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||     
T  32451927 ttgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcgg 32452025  T
Q  209 tctaag 214  Q
    ||||||    
T  32452026 tctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23207401 - 23207296
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  23207401 ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23207303  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  23207302 gtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072060
Alignment:
Q  135 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaag 23072060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 144
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 144  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 20520092 - 20520295
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| | | || |||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || ||      
T  20520092 atgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgt 20520190  T
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  | |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||    
T  20520191 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 20520288  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  20520289 gtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 219
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643101
Alignment:
Q  172 tgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24643054 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Original strand, 18786907 - 18787009
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  || ||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18786907 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggttt-gcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T
Q  215 ttga 218  Q
    ||||    
T  18787006 ttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 22413035 - 22413240
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||||   |||| ||||||| ||| ||||  || |        
T  22413035 atgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat--ttatgatg 22413132  T
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatat--tattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| || |||||  ||||||||| || ||||||    
T  22413133 ttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagt 22413231  T
Q  206 cgatctaag 214  Q
    || ||||||    
T  22413232 cggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23004872 - 23004774
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  | |||  | |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  23004872 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23004774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 212  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 137
Target Start/End: Original strand, 22459500 - 22459587
Alignment:
Q  50 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgat 137  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22459500 gttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23791397 - 23791292
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||  ||||||||    
T  23791397 ttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcg 23791299  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  23791298 gtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Original strand, 22758652 - 22758725
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg 121  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  22758652 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 22758725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Original strand, 24697604 - 24697645
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24697604 ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatga 24697645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 124
Target Start/End: Original strand, 22740897 - 22740973
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttg 124  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||||    
T  22740897 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52145 - 51923
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  52145 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtat 52046  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52045 aattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 51946  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  51945 tgagtcggtctaagttgatgaag 51923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 167868 - 168089
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  167868 aagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataat 167966  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  167967 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgca 168066  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  168067 tgagtcggtctaagttgttgaag 168089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26126 - 25906
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||     
T  26126 agacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtata 26027  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  26026 attgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcat 25928  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  25927 gagtcggtctaagttgatgaag 25906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40088 - 39868
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||     
T  40088 agacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtata 39989  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  39988 attgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcat 39890  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  39889 gagttggtctaagttgatgaag 39868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 339840 - 340058
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  339840 agacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatg 339939  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||    
T  339940 aatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgttg-tgttatttaactaagctgcat 340036  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||| |||||||||| ||||    
T  340037 gagtcggtctaagttgacgaag 340058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158601
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 158601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 71418 - 71350
Alignment:
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  71418 agatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgttt--gtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13443 - 13221
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  13443 aagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaat 13344  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13343 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 13244  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  13243 tgagtcagtctaagttgatgaag 13221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38992 - 38771
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  38992 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtat 38893  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     |||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  38892 aattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgca 38794  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    
T  38793 tgactcggtctaagttgatgaag 38771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32952
Alignment:
Q  16 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgag 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 33059  T
Q  116 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  33058 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  216 tgatgaag 223  Q
    ||||||||    
T  32959 tgatgaag 32952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9871 - 9760
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9871 ataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 9773  T
Q  207 gatctaagttgat 219  Q
    | |||||||||||    
T  9772 ggtctaagttgat 9760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3297
Alignment:
Q  29 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgactt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  129 gcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 3297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23113 - 22897
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||     
T  23113 agacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 23014  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23013 attgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcat 22915  T
Q  202 gagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22914 gagtcggtctaagttgat 22897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2083 - 1861
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  2083 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat 1984  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1983 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 1884  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  1883 tgagtcggtctaagttgatgaag 1861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3702 - 3480
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  3702 aagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaat 3603  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |    
T  3602 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctaca 3503  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  3502 tgagtcggtctaagttgatgaag 3480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 573 - 361
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||     
T  573 agacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 474  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    || | ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  473 atcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcat 375  T
Q  202 gagtcgatctaagt 215  Q
    |||||| |||||||    
T  374 gagtcggtctaagt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 223
Target Start/End: Original strand, 8424 - 8640
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatga 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |    
T  8424 gacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 8523  T
Q  103 ttgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatg 202  Q
    ||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||    
T  8524 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatg 8619  T
Q  203 agtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  8620 agtcggtctaagttgatgaag 8640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40143 - 39923
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||     
T  40143 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtata 40044  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 201  Q
    ||   ||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  40043 atcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcat 39945  T
Q  202 gagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  39944 gagttggtctaagttgatgaag 39923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 214
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  112 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||     
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  209 tctaag 214  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 170
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  7 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  106 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcct 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5081 - 4859
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |    
T  5081 aagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaatt 4982  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4981 atttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgca 4882  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  4881 tgagtcggtctaagttgttgaag 4859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 6010 - 6235
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||   ||    
T  6010 aagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaat 6109  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgccta---tgttgctgttgttatttaactaagct 197  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6110 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagct 6209  T
Q  198 gtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    | |||||||| |||||||||||||||    
T  6210 gcatgagtcggtctaagttgatgaag 6235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16123
Alignment:
Q  22 ttataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgtt 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  121 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatg 220  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  221 aag 223  Q
    |||    
T  16125 aag 16123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 32863 - 33067
Alignment:
Q  16 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattga 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||| || | ||| || |    
T  32863 tgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaa 32959  T
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  32960 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 33058  T
Q  215 ttgatgaag 223  Q
    |||||||||    
T  33059 ttgatgaag 33067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 46142 - 45938
Alignment:
Q  16 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattga 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||| || | ||| || |    
T  46142 tgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaa 46046  T
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  46045 gatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 45947  T
Q  215 ttgatgaag 223  Q
    |||||||||    
T  45946 ttgatgaag 45938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17440
Alignment:
Q  172 tgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 122; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28061 - 27912
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28061 agacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatg 27962  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 151  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27961 aatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 24190 - 24406
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttg-attatgatgtgatataatgttataagcattacttgagtta 99  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||   |    
T  24190 aagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaa 24289  T
Q  100 tgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 198  Q
    |  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24290 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 24389  T
Q  199 tatgagtcgatctaagt 215  Q
     |||||||| |||||||    
T  24390 catgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 938 - 1159
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  938 aagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaataat 1036  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1037 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgca 1136  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  1137 tgagtcggtctaagttgttgaag 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13322 - 13144
Alignment:
Q  3 gacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatga 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |    
T  13322 gacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 13223  T
Q  103 ttgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt 181  Q
    ||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13222 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34133
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  34139 gttgaag 34133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 283
Alignment:
Q  177 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaag 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8707 - 8489
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||||  |||||||||||  ||     
T  8707 aagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtac 8612  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      ||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  8611 acttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgca 8512  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  8511 tgagtcggtctaagttgatgaag 8489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 21143 - 20928
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    |     
T  21143 aagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaac 21044  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
      ||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  21043 atttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagcttt 20944  T
Q  200 atgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||| |||||||    
T  20943 atgagtcggtctaagt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13727 - 13507
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  13727 aagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 13629  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
    | |||||||  | |||||||| ||| | | | |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13628 gtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 13530  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  13529 tgagtcggtctaagttgttgaag 13507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32296 - 32077
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||    
T  32296 aagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttgaagaat 32198  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32197 atttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 32100  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  32099 tgagtcggtctaagttgttgaag 32077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2184 - 1962
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||||||||| | |||| | ||||| ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  2184 aagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataat 2085  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
    | ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  2084 gtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgca 1985  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| |||||| || |||||    
T  1984 tgagtcggtctaagatgttgaag 1962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 15354 - 15574
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||   ||    
T  15354 aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcattacttgaagaat 15452  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      || ||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15453 atttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgca 15551  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||  ||||||||| |||||    
T  15552 tgagtcagtctaagttgttgaag 15574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 853 - 1021
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 101  Q
    |||||||||| ||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  853 agacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatg 952  T
Q  102 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgt 174  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||    
T  953 attgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4944
Alignment:
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaag 4944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4943 - 4722
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||   ||    
T  4943 aagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaat 4845  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
      |||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  4844 atttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgca 4745  T
Q  201 tgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  4744 tgagtcggtctaagttgttgaag 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 167 - 1
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||   ||    
T  167 aagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt-tatgccttacttgaagaat 69  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgc 168  Q
      |||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  68 atttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 10315 - 10534
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||    
T  10315 aagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaat 10413  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
      ||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||     
T  10414 atttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgc 10510  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  10511 atgagtcggtctaagttgttgaag 10534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4705
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10784
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10835 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 124817 - 124723
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttga 95  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  124817 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttga 124723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174776
Alignment:
Q  55 tgttgattatgatgtgatataatgtt-ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 153  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| |    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  154 gttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  174843 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 174776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121776
Alignment:
Q  164 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 121776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 214
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatct 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| || |||||||| |||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 136468  T
Q  212 aag 214  Q
    |||    
T  136469 aag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 214
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatct 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| || |||||||| |||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 145176  T
Q  212 aag 214  Q
    |||    
T  145177 aag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16511 - 16292
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||   ||    
T  16511 aagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaat 16413  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
    | |||||||  | | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  16412 gtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgc 16316  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  16315 atgagtcggtctaagatgttgaag 16292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20758
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37832
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 37832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17591
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94422
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 94422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44465
Alignment:
Q  70 gatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-ttttcgtatactgc 168  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg- 44516  T
Q  169 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 100496 - 100386
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  100496 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 100398  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  100397 ctaagttgatga 100386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 40173 - 40283
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||  |    
T  40173 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagt 40271  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  40272 ctaagttgatga 40283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 219
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38586
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 125  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  38394 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttga 38492  T
Q  126 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || | |||||||||  | |||||| |||| | ||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||    
T  38493 aatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgat 38586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119885
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 119885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 125
Target Start/End: Original strand, 23581 - 23679
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 125  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  23581 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttga 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101511
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 101511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501095
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Original strand, 85539 - 85731
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||| ||| |||| |||    
T  85539 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattg 85637  T
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  85638 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 85731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 160864 - 160696
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||   ||||| ||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  160864 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttg-atatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcat 160767  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  160766 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 160696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16995 - 16795
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  ||||||||||    
T  16995 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgaga 16897  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16896 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  217 gat 219  Q
    |||    
T  16797 gat 16795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 1518 - 1299
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||    
T  1518 aagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaat 1420  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
    | |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1419 gtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 1323  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  1322 atgagtcggtctaagatgttgaag 1299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7495 - 7276
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||    
T  7495 aagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaat 7397  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgt 199  Q
    | |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  7396 gtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 7300  T
Q  200 atgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    |||||||| |||||| || |||||    
T  7299 atgagtcggtctaagatgttgaag 7276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15345
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgat 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28424
Alignment:
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  214 gttgatgaag 223  Q
    ||||||||||    
T  28433 gttgatgaag 28424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11302
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  11308 gttgaag 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 2007
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2014  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  2013 gttgaag 2007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4562
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 4562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 214
Target Start/End: Original strand, 20328 - 20524
Alignment:
Q  15 atgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattg 113  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||    
T  20328 atgttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt--ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 20425  T
Q  114 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20426 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128825
Alignment:
Q  66 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 158  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt 128825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13403
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13454 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9253
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  9304 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13958
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136691
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 136691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139160
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 139160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144098
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 144098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134222
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgat 134222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141629
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 141629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 62317 - 62224
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  62317 ttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcg 62224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132670
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagt 205  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| || | |||||||| ||| | ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  206 cgatctaagttgatga 221  Q
    || |||||| ||||||    
T  132685 cggtctaagatgatga 132670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82083
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgat 82083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||| ||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11299
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116441
Alignment:
Q  87 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  187 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 116441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 128968 - 129072
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  128968 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcg 129065  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  129066 gtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 78445 - 78348
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  78445 ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 78348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 116631 - 116579
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 69  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  116631 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatatgttaatgttgattatgatgt 116579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6842 - 6669
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    |||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | ||    
T  6842 aagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataat 6743  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgt 174  Q
    | ||| ||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  6742 gtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 117
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  168 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4308
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12400
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  12349 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40411
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || |   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgat 40411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Original strand, 161049 - 161239
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||    
T  161049 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatattg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 161147  T
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  161148 acttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 150
Target Start/End: Original strand, 164550 - 164674
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||    
T  164550 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 164648  T
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  164649 acttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 952 - 1160
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataat 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||   ||  |||||||      
T  952 atgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtataca 1050  T
Q  112 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatc 210  Q
    | |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  1051 taagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtc 1147  T
Q  211 taagttgatgaag 223  Q
    |||| || |||||    
T  1148 taagatgttgaag 1160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4754 - 4545
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttat 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||  |||    
T  4754 agacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtat 4657  T
Q  101 gattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgta 200  Q
     | || ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| || || || || | | | |||||||||||| || |||||||||||||||||| || |    
T  4656 aaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgca 4557  T
Q  201 tgagtcgatcta 212  Q
    ||||||| ||||    
T  4556 tgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 51795 - 51601
Alignment:
Q  17 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| |||||   ||  |||||||  | |||    
T  51795 gttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcatttcttgaaggatatttgtatacataaga 51697  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51696 tgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 148  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  149 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8550 atgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6657 - 6547
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6657 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6559  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  6558 ctaagttgatga 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 1146 - 1051
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgag 96  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1146 aagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 219
Target Start/End: Original strand, 2088 - 2280
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 124  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||  |||    
T  2088 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattg 2186  T
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  2187 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18130
Alignment:
Q  18 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||||||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| | | ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  18032 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12075
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | || ||||||||      ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 166  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  167 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29994 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19386 - 19276
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19386 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 19288  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  19287 ctaagttgatga 19276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 10394 - 10323
Alignment:
Q  2 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 73  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10394 agacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 130086 - 129917
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  130086 ttgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 129988  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  129987 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 207
Target Start/End: Original strand, 60614 - 60811
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || ||      
T  60614 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 60713  T
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  60714 ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctgtttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 60811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4225
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    || || ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  4277 tg-ctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 5036 - 5239
Alignment:
Q  17 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 116  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||||   ||| |||||||  | |||    
T  5036 gttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataaga 5134  T
Q  117 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  5135 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 5231  T
Q  216 tgatgaag 223  Q
    || |||||    
T  5232 tgttgaag 5239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11482
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11546 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16206
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||    | ||  |||||||||||||||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  126 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
     || ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattg-agatgttgttg 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||  ||  |||||||||||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 125  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| || ||||   || ||  |||||||||||||||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  126 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
     || ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3713 - 3640
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 74  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3713 aagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7777 - 7704
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 74  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7777 aagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 215
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38359
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38295 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2915
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||| ||||||    
T  2904 ctaagatgatga 2915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 223
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11554
Alignment:
Q  116 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 11546  T
Q  216 tgatgaag 223  Q
    || |||||    
T  11547 tgttgaag 11554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 11402 - 11450
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgt 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11402 aagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45901
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  ||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttg-ataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    |||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 45901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 47005
Alignment:
Q  23 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgt 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    ||  |||||||  | ||||||||     
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttga 47104  T
Q  123 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||| || |   ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || |||    
T  47103 tgaattgaaattgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttga 47007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5765 - 5655
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-ttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||     
T  5765 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc--atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcgg 5668  T
Q  209 tctaagttgatga 221  Q
    |||||||||||||    
T  5667 tctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 219
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1432
Alignment:
Q  67 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 165  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 203
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53640
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatga 203  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  53588 gttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 141
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  310 ttgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 212  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  211 gatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatga 141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14806
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  14795 ctaagttgatga 14806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15675
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  217 gat 219  Q
    |||    
T  15677 gat 15675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 51 - 219
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38809
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||   |  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  38741 gttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgat 38809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32551
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  32559 ctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 51784 - 51985
Alignment:
Q  12 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 110  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||  | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | | | || ||||    
T  51784 atgatattaattacaatttgtgaagctgtt-atgagatattaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataa 51881  T
Q  111 ttgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcga 208  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| | || |||||||||| |||||| | | ||||||||||||| ||||||||     
T  51882 ttgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcgg 51979  T
Q  209 tctaag 214  Q
    ||||||    
T  51980 tctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 17876 - 17929
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 54  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17876 aagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6230
Alignment:
Q  123 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 16264 - 16442
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 125  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  16264 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttga 16362  T
Q  126 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
      |  | |||||||||| | ||||||||||| | || ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  16363 aat-taattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1051
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1154 ttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1056  T
Q  210 ctaag 214  Q
    |||||    
T  1055 ctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12690 - 12587
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |    
T  12690 ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggt 12592  T
Q  210 ctaag 214  Q
    |||||    
T  12591 ctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||||| |    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  210 ctaagttga 218  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12778
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaa 12786  T
Q  214 gttgatga 221  Q
    ||||||||    
T  12785 gttgatga 12778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 221
Target Start/End: Original strand, 2644 - 2754
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2644 ttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttac-atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2742  T
Q  210 ctaagttgatga 221  Q
    ||||||||||||    
T  2743 ctaagttgatga 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1180
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1173  T
Q  217 gatgaag 223  Q
    | |||||    
T  1174 gttgaag 1180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1096
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 209  Q
    |||| |||||| |||| || ||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1204 ttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1106  T
Q  210 ctaagttgat 219  Q
    ||||||||||    
T  1105 ctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 15788 - 15884
Alignment:
Q  123 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15788 tgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178912
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 215  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 178912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6824
Alignment:
Q  118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 216  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  217 gatga 221  Q
    |||||    
T  6828 gatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 218
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23989
Alignment:
Q  127 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 218  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6719 - 6625
Alignment:
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6719 acttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14099 - 14005
Alignment:
Q  125 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14099 acttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatct 211  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtct 8173  T
Q  212 aagttga 218  Q
    |||||||    
T  8174 aagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24048 - 23853
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 125  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||  ||||| || || |||||||||||| ||     
T  24048 aatctgtgaagctgtt-aagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctgt 23950  T
Q  126 cttgcatttgatattattat-----gtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
     ||  |||||||||| ||||     |||||  |||| | |||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  23949 ttt--atttgatattgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 219
Target Start/End: Original strand, 1037 - 1141
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | | | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1037 gatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatct-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1135  T
Q  214 gttgat 219  Q
    ||||||    
T  1136 gttgat 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 212
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||   || ||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  151 ga--tgttttcgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 212  Q
    ||  || ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  8098 gagctgattt-gcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 225588 - 225465
Alignment:
Q  51 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 150  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  225588 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcac 225490  T
Q  151 gatgttttcgtatactgcctatgttg 176  Q
    | |||||| | |||||| ||||||||    
T  225489 gctgtttt-gcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38440 - 38342
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  38440 ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcg 38342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12954
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 213  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 12959  T
Q  214 gttga 218  Q
    |||||    
T  12958 gttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 6281 - 6386
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||    
T  6281 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcg 6379  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  6380 gtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25229 - 25121
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||    
T  25229 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 25132  T
Q  208 atctaagttga 218  Q
     ||||||||||    
T  25131 gtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  58 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 157  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||   |  ||| ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt 15461  T
Q  158 tcgtatactgcctatgttgctgttgtt 184  Q
      |||| |||||||||||| |||||||    
T  15462 --gtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Original strand, 192920 - 193070
Alignment:
Q  57 ttgattatgatgtgatataatgttataag-cattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt 155  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||  | | |||| |||||||||||||||| || ||  |  ||||||| ||||||||||||||    
T  192920 ttgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 193018  T
Q  156 tttcgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 206  Q
    | | || || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  193019 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 221
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28879
Alignment:
Q  162 atactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 221  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 28879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 2217 - 2281
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 176  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  2217 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 212
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  163 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 212  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 20635 - 20595
Alignment:
Q  1 aagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 41  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20635 aagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 32650 - 32544
Alignment:
Q  15 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattg 113  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||| || || ||||    
T  32650 atgttaattgcaatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgattg 32552  T
Q  114 agatgttg 121  Q
    ||||||||    
T  32551 agatgttg 32544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 97129 - 97024
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||| |    
T  97129 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgg 97031  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  97030 gtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 106407 - 106302
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||| |    
T  106407 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgg 106309  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  106308 gtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  172 tgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13130 - 13092
Alignment:
Q  107 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13130 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 49 - 219
Target Start/End: Original strand, 4741 - 4911
Alignment:
Q  49 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 148  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    ||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  4741 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 4840  T
Q  149 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    | | |||| | ||   ||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||    
T  4841 aagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgat 4911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 142
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1257
Alignment:
Q  54 atgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattat 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | ||||||||||    
T  1169 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattatttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattat 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 569
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatct 211  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||    
T  669 gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 572  T
Q  212 aag 214  Q
    |||    
T  571 aag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 218
Target Start/End: Original strand, 103632 - 103737
Alignment:
Q  115 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatct 211  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||| |||    
T  103632 gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt-ttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtct 103730  T
Q  212 aagttga 218  Q
    |||||||    
T  103731 aagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 267784 - 267679
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 207  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||||| ||||||| || |||||  ||||||||| || ||||||||    
T  267784 ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcg 267686  T
Q  208 atctaag 214  Q
     ||||||    
T  267685 gtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10629
Alignment:
Q  165 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgat 10629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Original strand, 1795 - 1836
Alignment:
Q  111 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 152  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  1795 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36464
Alignment:
Q  166 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgat 219  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69905
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg 121  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 69905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University