View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3651_low_13 (Length: 386)

Name: NF3651_low_13
Description: NF3651
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3651_low_13
NF3651_low_13
[»] chr2 (107 HSPs)
chr2 (1-273)||(39906246-39906518)
chr2 (1-274)||(44542806-44543078)
chr2 (9-268)||(39904618-39904876)
chr2 (9-274)||(7681990-7682253)
chr2 (1-274)||(20939687-20939959)
chr2 (8-274)||(6332260-6332525)
chr2 (9-274)||(38986918-38987181)
chr2 (1-273)||(44257416-44257689)
chr2 (1-253)||(22301955-22302206)
chr2 (9-274)||(9689360-9689625)
chr2 (1-274)||(30406438-30406710)
chr2 (1-274)||(22711010-22711282)
chr2 (8-274)||(2586338-2586603)
chr2 (2-271)||(33173459-33173726)
chr2 (37-274)||(9690171-9690407)
chr2 (14-271)||(15554012-15554268)
chr2 (21-272)||(4293201-4293451)
chr2 (22-271)||(34082551-34082797)
chr2 (133-271)||(3769414-3769552)
chr2 (22-271)||(16513038-16513281)
chr2 (70-246)||(324933-325109)
chr2 (9-143)||(3769653-3769786)
chr2 (22-271)||(13001986-13002232)
chr2 (36-271)||(18370231-18370462)
chr2 (22-258)||(11675136-11675370)
chr2 (22-270)||(8386681-8386929)
chr2 (22-271)||(42850000-42850246)
chr2 (36-271)||(1750153-1750383)
chr2 (3-196)||(1297569-1297746)
chr2 (1-127)||(19630729-19630855)
chr2 (1-127)||(19827630-19827756)
chr2 (36-271)||(37169556-37169786)
chr2 (22-269)||(29512041-29512287)
chr2 (37-271)||(16075009-16075237)
chr2 (169-271)||(8741639-8741741)
chr2 (22-183)||(33739531-33739691)
chr2 (153-271)||(23234012-23234130)
chr2 (132-266)||(29403914-29404046)
chr2 (124-264)||(17265356-17265494)
chr2 (4-263)||(23664715-23664971)
chr2 (191-271)||(33740105-33740184)
chr2 (211-274)||(41927550-41927612)
chr2 (36-209)||(1576652-1576822)
chr2 (36-208)||(23387153-23387322)
chr2 (225-274)||(19630712-19630761)
chr2 (225-274)||(19827613-19827662)
chr2 (36-209)||(768569-768740)
chr2 (192-271)||(41527823-41527901)
chr2 (225-271)||(23175355-23175401)
chr2 (225-271)||(23586612-23586658)
chr2 (201-271)||(27337050-27337119)
chr2 (31-150)||(23387063-23387181)
chr2 (225-273)||(38987157-38987205)
chr2 (225-271)||(7681968-7682014)
chr2 (225-271)||(9689338-9689384)
chr2 (224-270)||(17264893-17264939)
chr2 (1-51)||(23175369-23175419)
chr2 (1-51)||(23586626-23586676)
chr2 (225-267)||(44257657-44257699)
chr2 (225-271)||(44543046-44543092)
chr2 (225-274)||(39904852-39904901)
chr2 (230-274)||(45629682-45629726)
chr2 (235-274)||(9282117-9282156)
chr2 (225-271)||(3352281-3352327)
chr2 (225-271)||(3769762-3769808)
chr2 (225-271)||(22301941-22301987)
chr2 (225-271)||(30406424-30406470)
chr2 (229-271)||(39906232-39906274)
chr2 (1-58)||(17264906-17264963)
chr2 (9-72)||(324729-324793)
chr2 (1-90)||(45629699-45629790)
chr2 (22-125)||(18370363-18370464)
chr2 (225-260)||(22711007-22711042)
chr2 (36-99)||(29511965-29512028)
chr2 (225-271)||(20939673-20939719)
chr2 (103-181)||(24755157-24755234)
chr2 (225-271)||(33173695-33173741)
chr2 (103-162)||(7682076-7682135)
chr2 (103-162)||(22302049-22302108)
chr2 (200-264)||(26368520-26368583)
chr2 (103-162)||(33173575-33173634)
chr2 (24-72)||(37169689-37169737)
chr2 (103-162)||(44542925-44542984)
chr2 (200-264)||(45629827-45629890)
chr2 (224-271)||(1297553-1297600)
chr2 (21-72)||(13002035-13002086)
chr2 (127-166)||(44288810-44288849)
chr2 (22-72)||(1750202-1750252)
chr2 (225-271)||(2586578-2586624)
chr2 (2-40)||(3352274-3352312)
chr2 (25-71)||(4206528-4206574)
chr2 (22-72)||(16075056-16075106)
chr2 (103-167)||(20939775-20939840)
chr2 (22-72)||(29513924-29513974)
chr2 (82-166)||(33739600-33739682)
chr2 (82-166)||(11675205-11675288)
chr2 (1-34)||(34082750-34082783)
chr2 (103-155)||(39904730-39904782)
chr2 (103-155)||(39906348-39906400)
chr2 (1-33)||(2586355-2586387)
chr2 (103-162)||(2586457-2586516)
chr2 (103-162)||(6332347-6332406)
chr2 (1-33)||(6332476-6332508)
chr2 (103-166)||(16513149-16513212)
chr2 (1-37)||(18370412-18370448)
chr2 (103-162)||(38987035-38987094)
chr2 (127-219)||(43660823-43660915)
[»] chr5 (120 HSPs)
chr5 (1-271)||(30687880-30688150)
chr5 (1-274)||(29302070-29302343)
chr5 (2-274)||(15808919-15809191)
chr5 (1-274)||(4736743-4737012)
chr5 (1-273)||(33282206-33282476)
chr5 (4-274)||(17604990-17605258)
chr5 (1-249)||(11448706-11448955)
chr5 (4-267)||(1921416-1921678)
chr5 (1-235)||(1951399-1951632)
chr5 (1-258)||(26905862-26906115)
chr5 (4-274)||(33026176-33026446)
chr5 (9-274)||(30667555-30667816)
chr5 (1-273)||(37282132-37282400)
chr5 (3-272)||(33833033-33833290)
chr5 (9-254)||(17209848-17210091)
chr5 (34-266)||(3960637-3960867)
chr5 (1-163)||(37249361-37249523)
chr5 (1-271)||(37468494-37468754)
chr5 (22-274)||(4737878-4738127)
chr5 (137-274)||(14795640-14795777)
chr5 (129-274)||(30486058-30486203)
chr5 (22-271)||(14369716-14369962)
chr5 (36-271)||(25912044-25912275)
chr5 (1-147)||(17559190-17559335)
chr5 (111-273)||(27005155-27005317)
chr5 (22-271)||(28747711-28747958)
chr5 (36-271)||(6436372-6436603)
chr5 (134-274)||(7014474-7014614)
chr5 (22-274)||(12910009-12910258)
chr5 (1-271)||(22701710-22701977)
chr5 (36-271)||(17421643-17421874)
chr5 (22-271)||(2528716-2528964)
chr5 (36-274)||(33695999-33696233)
chr5 (58-270)||(31240268-31240476)
chr5 (117-271)||(3038836-3038988)
chr5 (22-253)||(4083705-4083933)
chr5 (36-267)||(13711033-13711262)
chr5 (22-253)||(7944254-7944482)
chr5 (22-263)||(2695084-2695320)
chr5 (41-271)||(10951004-10951230)
chr5 (21-141)||(1807474-1807592)
chr5 (8-123)||(22282185-22282301)
chr5 (63-159)||(38661242-38661337)
chr5 (36-271)||(17232918-17233145)
chr5 (38-267)||(39038472-39038698)
chr5 (36-271)||(6260993-6261224)
chr5 (36-207)||(31752128-31752296)
chr5 (22-272)||(39548829-39549074)
chr5 (103-264)||(8410685-8410844)
chr5 (137-215)||(1797420-1797498)
chr5 (173-271)||(40234211-40234307)
chr5 (22-162)||(857945-858085)
chr5 (211-274)||(39999185-39999248)
chr5 (4-94)||(7014630-7014720)
chr5 (201-265)||(38661179-38661243)
chr5 (22-217)||(9124704-9124899)
chr5 (36-271)||(22800642-22800868)
chr5 (117-252)||(17233353-17233486)
chr5 (36-205)||(4150976-4151148)
chr5 (186-273)||(22213127-22213214)
chr5 (186-271)||(31752395-31752479)
chr5 (4-99)||(11351787-11351883)
chr5 (225-271)||(4736980-4737026)
chr5 (225-274)||(29302053-29302102)
chr5 (225-274)||(30687863-30687912)
chr5 (211-271)||(857858-857917)
chr5 (22-130)||(25912176-25912282)
chr5 (225-271)||(1921649-1921695)
chr5 (225-271)||(15809160-15809206)
chr5 (229-271)||(26906087-26906129)
chr5 (22-99)||(32736377-32736455)
chr5 (225-271)||(37249491-37249537)
chr5 (225-271)||(37282368-37282414)
chr5 (36-207)||(33832728-33832898)
chr5 (225-269)||(37468722-37468766)
chr5 (224-271)||(1951385-1951432)
chr5 (225-271)||(22213077-22213123)
chr5 (225-271)||(30667533-30667579)
chr5 (225-271)||(33282444-33282490)
chr5 (223-274)||(22701693-22701744)
chr5 (25-92)||(25593287-25593354)
chr5 (11-54)||(27005107-27005150)
chr5 (23-126)||(40234209-40234310)
chr5 (22-72)||(3038885-3038935)
chr5 (225-271)||(7014691-7014737)
chr5 (225-271)||(17209826-17209872)
chr5 (225-271)||(17559176-17559222)
chr5 (22-72)||(31240378-31240428)
chr5 (229-271)||(33026421-33026463)
chr5 (224-274)||(33833014-33833064)
chr5 (82-181)||(17421738-17421835)
chr5 (23-72)||(33696051-33696100)
chr5 (103-162)||(15809038-15809097)
chr5 (103-162)||(17209936-17209995)
chr5 (2-62)||(22213092-22213152)
chr5 (103-166)||(26905963-26906026)
chr5 (103-162)||(38661246-38661305)
chr5 (117-157)||(40234169-40234209)
chr5 (22-125)||(6436370-6436471)
chr5 (223-254)||(11351787-11351818)
chr5 (21-72)||(13711166-13711217)
chr5 (225-271)||(1807580-1807626)
chr5 (22-72)||(10951053-10951103)
chr5 (22-68)||(17421696-17421742)
chr5 (225-271)||(17605229-17605275)
chr5 (82-166)||(25912098-25912180)
chr5 (25-71)||(27365811-27365857)
chr5 (134-207)||(8318124-8318197)
chr5 (22-94)||(17210138-17210210)
chr5 (103-155)||(30687982-30688034)
chr5 (230-266)||(9124667-9124703)
chr5 (103-162)||(13711092-13711151)
chr5 (103-166)||(14369830-14369893)
chr5 (1-33)||(15808936-15808968)
chr5 (103-162)||(17605108-17605167)
chr5 (1-33)||(33026193-33026225)
chr5 (103-166)||(33696116-33696179)
chr5 (22-58)||(33832728-33832764)
chr5 (107-162)||(37468605-37468660)
chr5 (133-209)||(38952198-38952273)
[»] chr1 (126 HSPs)
chr1 (1-274)||(20411160-20411433)
chr1 (9-274)||(14494340-14494605)
chr1 (1-274)||(36817613-36817886)
chr1 (1-261)||(27255615-27255875)
chr1 (1-274)||(12864241-12864512)
chr1 (1-274)||(13385681-13385956)
chr1 (3-273)||(1804938-1805207)
chr1 (1-271)||(39424233-39424501)
chr1 (1-258)||(27389453-27389711)
chr1 (9-274)||(43236125-43236398)
chr1 (9-245)||(16960254-16960489)
chr1 (21-273)||(32716356-32716603)
chr1 (9-271)||(32374492-32374753)
chr1 (1-274)||(52772209-52772474)
chr1 (1-230)||(47130907-47131136)
chr1 (1-274)||(51464975-51465241)
chr1 (25-272)||(28094382-28094615)
chr1 (106-274)||(14387468-14387636)
chr1 (1-163)||(20201757-20201919)
chr1 (22-273)||(10764558-10764809)
chr1 (127-274)||(13943351-13943498)
chr1 (1-271)||(16005528-16005796)
chr1 (22-271)||(34515114-34515362)
chr1 (36-271)||(13157557-13157791)
chr1 (22-266)||(26842983-26843224)
chr1 (22-271)||(28454667-28454915)
chr1 (83-271)||(463360-463544)
chr1 (1-131)||(12010567-12010699)
chr1 (22-250)||(16073423-16073650)
chr1 (2-246)||(27348095-27348333)
chr1 (36-270)||(6192424-6192656)
chr1 (22-271)||(8642960-8643203)
chr1 (36-271)||(32155947-32156178)
chr1 (36-271)||(50559250-50559481)
chr1 (22-271)||(51431809-51432057)
chr1 (117-271)||(32994250-32994402)
chr1 (22-272)||(23413600-23413845)
chr1 (104-271)||(27787867-27788033)
chr1 (22-267)||(158399-158641)
chr1 (63-271)||(13264497-13264699)
chr1 (3-271)||(14387221-14387485)
chr1 (9-123)||(28646733-28646847)
chr1 (22-271)||(41146214-41146460)
chr1 (1-241)||(42199847-42200084)
chr1 (1-241)||(42208715-42208952)
chr1 (23-271)||(45818746-45818990)
chr1 (176-271)||(12010475-12010569)
chr1 (36-209)||(36389459-36389629)
chr1 (103-271)||(3979443-3979610)
chr1 (22-271)||(24770616-24770861)
chr1 (36-253)||(34306440-34306657)
chr1 (36-271)||(5491602-5491833)
chr1 (44-271)||(4158116-4158341)
chr1 (21-163)||(50797648-50797788)
chr1 (22-167)||(13157266-13157412)
chr1 (1-72)||(2965334-2965405)
chr1 (9-206)||(24190757-24190954)
chr1 (155-271)||(33675786-33675899)
chr1 (22-163)||(3273402-3273543)
chr1 (36-162)||(33676084-33676209)
chr1 (126-237)||(47130797-47130907)
chr1 (225-271)||(13385924-13385970)
chr1 (225-271)||(27389679-27389725)
chr1 (225-271)||(2965373-2965419)
chr1 (225-271)||(20411146-20411192)
chr1 (225-271)||(27255601-27255647)
chr1 (228-274)||(52772192-52772238)
chr1 (26-99)||(3099558-3099631)
chr1 (36-155)||(20201700-20201817)
chr1 (22-90)||(5491734-5491802)
chr1 (9-57)||(15660477-15660525)
chr1 (22-126)||(27787933-27788036)
chr1 (22-125)||(463445-463546)
chr1 (224-271)||(1805176-1805223)
chr1 (223-274)||(14387202-14387253)
chr1 (103-166)||(32151931-32151994)
chr1 (186-248)||(13157416-13157477)
chr1 (22-72)||(13157692-13157742)
chr1 (225-271)||(20201887-20201933)
chr1 (108-162)||(32151995-32152049)
chr1 (225-271)||(34386314-34386360)
chr1 (9-83)||(34825554-34825628)
chr1 (225-271)||(36817599-36817645)
chr1 (225-271)||(39424219-39424264)
chr1 (225-271)||(47131104-47131150)
chr1 (230-271)||(10558271-10558312)
chr1 (1-90)||(32994151-32994239)
chr1 (22-144)||(28704439-28704560)
chr1 (103-162)||(47130983-47131042)
chr1 (22-126)||(13264494-13264594)
chr1 (117-164)||(32144130-32144177)
chr1 (22-72)||(4158240-4158290)
chr1 (22-72)||(6192558-6192608)
chr1 (22-87)||(10558197-10558263)
chr1 (225-271)||(32374729-32374775)
chr1 (22-72)||(33675834-33675884)
chr1 (26-72)||(34306580-34306626)
chr1 (225-271)||(43236103-43236149)
chr1 (234-271)||(12705744-12705781)
chr1 (103-162)||(1805056-1805115)
chr1 (103-162)||(39424326-39424385)
chr1 (225-260)||(12010667-12010702)
chr1 (103-161)||(13385802-13385860)
chr1 (229-271)||(15660505-15660548)
chr1 (103-166)||(32144057-32144120)
chr1 (82-166)||(463367-463449)
chr1 (3-100)||(10368051-10368148)
chr1 (225-263)||(10368220-10368258)
chr1 (225-271)||(28646711-28646757)
chr1 (224-274)||(32994134-32994184)
chr1 (2-40)||(34386329-34386367)
chr1 (1-34)||(10368219-10368252)
chr1 (225-262)||(16960241-16960278)
chr1 (103-166)||(27389555-27389622)
chr1 (132-205)||(28182162-28182234)
chr1 (36-76)||(463018-463058)
chr1 (103-162)||(12864360-12864419)
chr1 (1-33)||(28094397-28094429)
chr1 (1-37)||(32374506-32374542)
chr1 (103-162)||(32716474-32716533)
chr1 (103-166)||(36389513-36389576)
chr1 (103-162)||(36817708-36817767)
chr1 (224-260)||(42200051-42200087)
chr1 (224-260)||(42208919-42208955)
chr1 (24-72)||(47130843-47130891)
chr1 (103-162)||(52772304-52772363)
[»] chr6 (74 HSPs)
chr6 (1-271)||(31132842-31133112)
chr6 (1-274)||(29646175-29646447)
chr6 (1-274)||(27828273-27828550)
chr6 (1-261)||(9955761-9956021)
chr6 (1-274)||(15962703-15962977)
chr6 (9-274)||(1369873-1370137)
chr6 (1-271)||(11100346-11100616)
chr6 (1-274)||(16599035-16599308)
chr6 (2-273)||(4184228-4184498)
chr6 (1-273)||(8171836-8172107)
chr6 (3-258)||(10777911-10778166)
chr6 (9-272)||(5187744-5188005)
chr6 (4-196)||(26667834-26668026)
chr6 (96-274)||(20755416-20755594)
chr6 (22-271)||(33730482-33730725)
chr6 (1-128)||(15881892-15882018)
chr6 (4-273)||(26211248-26211514)
chr6 (22-267)||(4898432-4898674)
chr6 (22-274)||(30525341-30525589)
chr6 (22-271)||(18102649-18102896)
chr6 (36-271)||(4838236-4838473)
chr6 (5-123)||(10196574-10196692)
chr6 (22-271)||(14488259-14488505)
chr6 (1-271)||(15718169-15718437)
chr6 (171-274)||(15882021-15882124)
chr6 (21-135)||(11210283-11210396)
chr6 (139-274)||(10315306-10315442)
chr6 (22-271)||(25061622-25061860)
chr6 (9-123)||(24022847-24022961)
chr6 (6-271)||(9406543-9406805)
chr6 (103-271)||(18154505-18154671)
chr6 (22-263)||(3437979-3438217)
chr6 (36-271)||(11742283-11742514)
chr6 (36-271)||(4898128-4898360)
chr6 (33-124)||(35001995-35002085)
chr6 (124-271)||(11010001-11010148)
chr6 (186-271)||(32194176-32194260)
chr6 (22-245)||(21969880-21970100)
chr6 (213-271)||(27902275-27902335)
chr6 (41-108)||(33311671-33311738)
chr6 (225-271)||(15881878-15881924)
chr6 (225-267)||(8172075-8172117)
chr6 (225-271)||(9955747-9955793)
chr6 (225-271)||(11100332-11100378)
chr6 (225-271)||(29646415-29646461)
chr6 (225-270)||(31132829-31132874)
chr6 (36-206)||(11100081-11100251)
chr6 (223-274)||(15718403-15718454)
chr6 (229-271)||(16599021-16599063)
chr6 (229-271)||(20755358-20755400)
chr6 (228-274)||(26211228-26211274)
chr6 (134-215)||(32889636-32889715)
chr6 (22-130)||(4838229-4838335)
chr6 (173-260)||(228035-228119)
chr6 (225-267)||(1369855-1369897)
chr6 (25-138)||(8062105-8062216)
chr6 (229-271)||(15962689-15962731)
chr6 (225-271)||(27828259-27828305)
chr6 (228-273)||(4184211-4184256)
chr6 (230-271)||(27902349-27902390)
chr6 (21-72)||(11010048-11010099)
chr6 (22-125)||(18154503-18154604)
chr6 (22-72)||(4898261-4898311)
chr6 (225-255)||(10777911-10777941)
chr6 (1-47)||(20755372-20755418)
chr6 (225-271)||(26667817-26667863)
chr6 (119-157)||(26668062-26668100)
chr6 (103-155)||(9955863-9955915)
chr6 (103-155)||(29646294-29646346)
chr6 (103-155)||(31132944-31132996)
chr6 (103-162)||(4184320-4184379)
chr6 (103-162)||(5187830-5187889)
chr6 (103-162)||(8171954-8172013)
chr6 (103-182)||(30525393-30525472)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (1-274)||(6114736-6115009)
chr3 (1-274)||(6109131-6109404)
chr3 (1-274)||(21727600-21727873)
chr3 (1-274)||(7848482-7848754)
chr3 (1-274)||(7521313-7521586)
chr3 (1-274)||(6748617-6748889)
chr3 (1-274)||(47461649-47461922)
chr3 (1-274)||(11460105-11460377)
chr3 (1-274)||(12896592-12896865)
chr3 (1-274)||(8815287-8815558)
chr3 (1-274)||(4043583-4043863)
chr3 (1-274)||(45059499-45059772)
chr3 (56-274)||(26158254-26158472)
chr3 (1-272)||(994689-994960)
chr3 (40-274)||(37504496-37504729)
chr3 (1-274)||(38797931-38798207)
chr3 (2-257)||(994996-995251)
chr3 (9-274)||(27728146-27728413)
chr3 (1-273)||(26152164-26152437)
chr3 (1-273)||(51147977-51148249)
chr3 (2-272)||(17065685-17065952)
chr3 (10-274)||(51952165-51952421)
chr3 (21-271)||(3544246-3544495)
chr3 (1-150)||(26152477-26152626)
chr3 (9-274)||(27800419-27800666)
chr3 (130-274)||(17226270-17226414)
chr3 (69-271)||(2868198-2868400)
chr3 (36-271)||(53581513-53581744)
chr3 (22-271)||(13349089-13349335)
chr3 (22-271)||(1375989-1376236)
chr3 (22-274)||(31039549-31039798)
chr3 (1-157)||(52654387-52654542)
chr3 (4-135)||(3269203-3269333)
chr3 (22-271)||(33837801-33838052)
chr3 (169-274)||(21408617-21408722)
chr3 (22-271)||(3800150-3800397)
chr3 (1-274)||(50912971-50913241)
chr3 (36-274)||(53467358-53467592)
chr3 (1-101)||(17226169-17226269)
chr3 (36-271)||(27359951-27360180)
chr3 (9-268)||(32203111-32203362)
chr3 (23-271)||(36823909-36824154)
chr3 (36-271)||(27317593-27317825)
chr3 (36-271)||(8814732-8814963)
chr3 (2-271)||(48765182-48765451)
chr3 (1-100)||(30347741-30347840)
chr3 (22-271)||(12127508-12127741)
chr3 (169-274)||(48649291-48649396)
chr3 (36-260)||(3269334-3269555)
chr3 (62-271)||(26103649-26103853)
chr3 (22-209)||(50801589-50801774)
chr3 (22-209)||(50874106-50874291)
chr3 (187-271)||(17604886-17604969)
chr3 (9-122)||(48649399-48649513)
chr3 (186-271)||(22894903-22894987)
chr3 (211-271)||(45293134-45293194)
chr3 (9-69)||(42856947-42857007)
chr3 (22-166)||(17605530-17605673)
chr3 (103-252)||(34277553-34277700)
chr3 (4-66)||(52945467-52945529)
chr3 (225-271)||(6748603-6748649)
chr3 (225-271)||(7848722-7848768)
chr3 (225-273)||(11460345-11460393)
chr3 (22-164)||(22894539-22894679)
chr3 (22-271)||(29239586-29239829)
chr3 (225-271)||(6109117-6109163)
chr3 (225-271)||(6114977-6115023)
chr3 (225-271)||(8815526-8815572)
chr3 (225-271)||(12896833-12896879)
chr3 (225-271)||(17065921-17065967)
chr3 (225-271)||(17226155-17226201)
chr3 (225-271)||(21727841-21727887)
chr3 (225-271)||(26152463-26152509)
chr3 (229-271)||(30347727-30347769)
chr3 (229-271)||(45059485-45059527)
chr3 (225-271)||(47461890-47461936)
chr3 (225-269)||(38798175-38798219)
chr3 (229-271)||(994675-994717)
chr3 (225-271)||(3269186-3269232)
chr3 (225-271)||(27728389-27728435)
chr3 (225-271)||(27800642-27800688)
chr3 (229-271)||(48649493-48649535)
chr3 (225-271)||(52654510-52654556)
chr3 (36-94)||(54244748-54244806)
chr3 (225-274)||(7565441-7565490)
chr3 (225-271)||(51147963-51148011)
chr3 (103-162)||(51952276-51952335)
chr3 (22-69)||(53467490-53467537)
chr3 (22-125)||(53581511-53581612)
chr3 (225-271)||(4043831-4043877)
chr3 (229-271)||(7521558-7521600)
chr3 (36-149)||(8815062-8815173)
chr3 (22-72)||(22894888-22894938)
chr3 (22-72)||(27317642-27317692)
chr3 (225-267)||(34277462-34277503)
chr3 (22-72)||(36823958-36824008)
chr3 (124-162)||(53455661-53455699)
chr3 (224-273)||(50912955-50913004)
chr3 (103-162)||(7848601-7848660)
chr3 (227-263)||(26152158-26152194)
chr3 (103-155)||(51148081-51148132)
chr3 (229-264)||(994988-995023)
chr3 (2-37)||(7565437-7565472)
chr3 (103-166)||(27360064-27360126)
chr3 (127-162)||(29950609-29950644)
chr3 (127-162)||(29999763-29999798)
chr3 (223-274)||(32203336-32203387)
chr3 (224-274)||(3544482-3544532)
chr3 (225-267)||(52945454-52945496)
chr3 (103-155)||(3544363-3544415)
chr3 (103-155)||(7521432-7521484)
chr3 (1-34)||(22894940-22894973)
chr3 (144-181)||(29950657-29950694)
chr3 (144-181)||(29999811-29999848)
chr3 (223-256)||(48765182-48765215)
chr3 (1-33)||(6114753-6114785)
chr3 (103-162)||(6748711-6748770)
chr3 (103-166)||(27317707-27317770)
chr3 (1-49)||(27418802-27418850)
chr3 (103-166)||(32203221-32203284)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-274)||(57854-58127)
scaffold0068 (225-271)||(58095-58141)
[»] chr4 (141 HSPs)
chr4 (1-274)||(14202835-14203108)
chr4 (1-274)||(13211795-13212067)
chr4 (1-273)||(5046606-5046877)
chr4 (1-274)||(12584251-12584524)
chr4 (1-274)||(48559978-48560250)
chr4 (1-274)||(578722-578997)
chr4 (2-273)||(17180931-17181204)
chr4 (1-267)||(42807876-42808142)
chr4 (1-274)||(13621078-13621350)
chr4 (9-273)||(7630038-7630302)
chr4 (9-272)||(6213965-6214228)
chr4 (1-271)||(41172393-41172662)
chr4 (2-274)||(5156977-5157249)
chr4 (2-269)||(17377478-17377745)
chr4 (1-274)||(30820454-30820727)
chr4 (1-274)||(50182155-50182425)
chr4 (3-273)||(17745131-17745396)
chr4 (1-268)||(21519717-21519984)
chr4 (1-274)||(51783934-51784208)
chr4 (1-267)||(34683013-34683279)
chr4 (8-273)||(49970576-49970839)
chr4 (4-271)||(26958522-26958786)
chr4 (9-274)||(13371198-13371455)
chr4 (9-274)||(13381399-13381656)
chr4 (4-199)||(10216220-10216414)
chr4 (1-272)||(47382144-47382404)
chr4 (1-209)||(3818789-3818998)
chr4 (1-196)||(30258092-30258286)
chr4 (9-247)||(52437410-52437647)
chr4 (97-274)||(13621375-13621552)
chr4 (102-274)||(10981367-10981539)
chr4 (112-271)||(18470240-18470399)
chr4 (36-271)||(26335707-26335938)
chr4 (22-272)||(16553390-16553637)
chr4 (9-271)||(38425638-38425897)
chr4 (22-271)||(46106640-46106886)
chr4 (36-271)||(9744146-9744377)
chr4 (67-271)||(6946611-6946811)
chr4 (4-260)||(40496123-40496377)
chr4 (22-271)||(52306734-52306980)
chr4 (82-271)||(6137559-6137744)
chr4 (67-271)||(14862939-14863138)
chr4 (36-271)||(4712623-4712855)
chr4 (22-271)||(45875726-45875971)
chr4 (4-271)||(54742414-54742682)
chr4 (43-271)||(4490631-4490856)
chr4 (22-271)||(6192954-6193201)
chr4 (36-271)||(33105877-33106109)
chr4 (117-271)||(33811011-33811163)
chr4 (22-271)||(29101951-29102198)
chr4 (127-265)||(45801793-45801934)
chr4 (82-274)||(6137460-6137649)
chr4 (22-208)||(49425759-49425943)
chr4 (22-196)||(20458831-20459004)
chr4 (22-166)||(23383925-23384065)
chr4 (36-271)||(14948089-14948319)
chr4 (36-271)||(142600-142816)
chr4 (140-271)||(43638943-43639072)
chr4 (9-166)||(43639068-43639227)
chr4 (126-271)||(49605985-49606128)
chr4 (36-207)||(15725208-15725376)
chr4 (23-166)||(11777496-11777638)
chr4 (173-271)||(13211626-13211722)
chr4 (117-271)||(36955326-36955475)
chr4 (200-271)||(49426124-49426194)
chr4 (170-274)||(56532591-56532685)
chr4 (200-270)||(4505567-4505636)
chr4 (225-271)||(5046592-5046638)
chr4 (225-271)||(13621318-13621364)
chr4 (225-271)||(21519952-21519998)
chr4 (225-271)||(30258078-30258124)
chr4 (225-271)||(34682999-34683045)
chr4 (225-271)||(41172630-41172676)
chr4 (225-271)||(42807862-42807908)
chr4 (225-271)||(47382372-47382418)
chr4 (228-271)||(48560221-48560264)
chr4 (225-271)||(578708-578754)
chr4 (225-271)||(5157218-5157264)
chr4 (225-271)||(7630278-7630324)
chr4 (225-271)||(17745366-17745412)
chr4 (213-271)||(20459170-20459227)
chr4 (225-271)||(32012835-32012881)
chr4 (225-271)||(50182393-50182439)
chr4 (214-271)||(23384091-23384147)
chr4 (186-239)||(30258343-30258396)
chr4 (227-271)||(14202821-14202865)
chr4 (225-269)||(17377714-17377758)
chr4 (218-274)||(56532528-56532584)
chr4 (224-271)||(3818965-3819012)
chr4 (224-271)||(30820440-30820487)
chr4 (36-142)||(102261-102366)
chr4 (225-271)||(10216203-10216249)
chr4 (229-271)||(12584237-12584279)
chr4 (22-72)||(26335756-26335806)
chr4 (225-271)||(26958757-26958803)
chr4 (224-274)||(33811311-33811361)
chr4 (173-271)||(50677909-50678004)
chr4 (225-271)||(51783920-51783966)
chr4 (4-99)||(38425540-38425636)
chr4 (228-271)||(13371434-13371477)
chr4 (228-271)||(13381635-13381678)
chr4 (22-69)||(50677961-50678007)
chr4 (22-72)||(4712672-4712722)
chr4 (22-72)||(6946660-6946710)
chr4 (22-72)||(9744278-9744328)
chr4 (225-271)||(13212035-13212081)
chr4 (22-72)||(14862988-14863038)
chr4 (22-72)||(43638992-43639042)
chr4 (185-258)||(40496396-40496468)
chr4 (103-162)||(10216311-10216370)
chr4 (103-162)||(13211914-13211973)
chr4 (103-162)||(30820548-30820607)
chr4 (103-162)||(48560097-48560156)
chr4 (103-181)||(142699-142777)
chr4 (22-69)||(33811063-33811110)
chr4 (1-59)||(33811285-33811344)
chr4 (103-161)||(42807972-42808030)
chr4 (223-274)||(43639201-43639252)
chr4 (225-271)||(52437385-52437434)
chr4 (103-152)||(578829-578878)
chr4 (82-166)||(9744200-9744282)
chr4 (36-94)||(13211554-13211612)
chr4 (225-271)||(17181173-17181219)
chr4 (228-274)||(38425520-38425566)
chr4 (106-163)||(38425723-38425780)
chr4 (1-34)||(32012834-32012867)
chr4 (103-162)||(3818843-3818902)
chr4 (103-162)||(5046700-5046759)
chr4 (103-166)||(6946725-6946788)
chr4 (24-72)||(13211625-13211673)
chr4 (103-162)||(13371310-13371369)
chr4 (103-162)||(13381511-13381570)
chr4 (103-166)||(14863052-14863115)
chr4 (103-162)||(17181049-17181108)
chr4 (103-162)||(21519830-21519889)
chr4 (103-162)||(26958636-26958695)
chr4 (103-162)||(30258186-30258245)
chr4 (103-162)||(41172509-41172568)
chr4 (1-33)||(42808100-42808132)
chr4 (1-33)||(48559995-48560027)
chr4 (223-271)||(54742651-54742699)
[»] chr7 (119 HSPs)
chr7 (1-274)||(20516881-20517154)
chr7 (1-274)||(4655006-4655283)
chr7 (6-273)||(38876136-38876403)
chr7 (1-274)||(27811903-27812175)
chr7 (1-255)||(12080679-12080932)
chr7 (1-272)||(11327559-11327830)
chr7 (1-264)||(15230036-15230297)
chr7 (1-271)||(48454508-48454778)
chr7 (1-264)||(14777898-14778158)
chr7 (1-274)||(24720222-24720494)
chr7 (1-232)||(45225396-45225627)
chr7 (4-274)||(14718961-14719229)
chr7 (1-274)||(8047937-8048205)
chr7 (1-266)||(26380039-26380304)
chr7 (1-274)||(18199529-18199806)
chr7 (1-271)||(28605407-28605674)
chr7 (1-274)||(7437761-7438035)
chr7 (1-271)||(34986490-34986759)
chr7 (1-274)||(27596981-27597266)
chr7 (4-274)||(18123048-18123309)
chr7 (21-269)||(14770040-14770288)
chr7 (21-269)||(15220491-15220739)
chr7 (1-274)||(22479168-22479439)
chr7 (1-267)||(32852840-32853090)
chr7 (111-274)||(45225221-45225384)
chr7 (1-189)||(37138899-37139087)
chr7 (25-274)||(43711873-43712123)
chr7 (22-271)||(938860-939106)
chr7 (65-274)||(48193114-48193323)
chr7 (22-271)||(25818449-25818696)
chr7 (22-273)||(41407305-41407553)
chr7 (138-274)||(33889043-33889179)
chr7 (22-274)||(28912044-28912293)
chr7 (36-260)||(18352315-18352536)
chr7 (37-271)||(27168254-27168484)
chr7 (9-145)||(33889847-33889982)
chr7 (36-271)||(38367856-38368087)
chr7 (22-271)||(454069-454315)
chr7 (36-271)||(2936605-2936837)
chr7 (36-271)||(19069361-19069592)
chr7 (22-271)||(2509306-2509551)
chr7 (1-271)||(6559322-6559586)
chr7 (1-154)||(18829775-18829931)
chr7 (9-271)||(41037323-41037578)
chr7 (134-274)||(32577466-32577607)
chr7 (143-274)||(1325335-1325470)
chr7 (22-252)||(2362736-2362961)
chr7 (22-260)||(2633877-2634110)
chr7 (36-271)||(11766088-11766317)
chr7 (22-267)||(6736498-6736738)
chr7 (1-225)||(9401620-9401842)
chr7 (58-163)||(32577615-32577719)
chr7 (22-271)||(38796808-38797056)
chr7 (22-236)||(15957199-15957410)
chr7 (1-91)||(32577713-32577803)
chr7 (22-271)||(23740011-23740250)
chr7 (9-78)||(48193344-48193413)
chr7 (290-368)||(48597929-48598011)
chr7 (145-263)||(3512711-3512827)
chr7 (50-123)||(17317370-17317443)
chr7 (225-274)||(34986727-34986776)
chr7 (225-271)||(8047923-8047969)
chr7 (225-271)||(11327798-11327844)
chr7 (225-271)||(12080900-12080946)
chr7 (147-209)||(18829697-18829759)
chr7 (225-271)||(24720462-24720508)
chr7 (225-271)||(37138885-37138931)
chr7 (224-271)||(20517121-20517168)
chr7 (225-271)||(4655251-4655297)
chr7 (225-271)||(18199774-18199820)
chr7 (229-271)||(26380025-26380067)
chr7 (225-271)||(27812143-27812189)
chr7 (225-271)||(32577771-32577817)
chr7 (225-271)||(45225595-45225641)
chr7 (228-274)||(48454491-48454537)
chr7 (82-166)||(27168307-27168389)
chr7 (22-126)||(38367988-38368090)
chr7 (228-271)||(7437747-7437790)
chr7 (225-272)||(32853058-32853105)
chr7 (22-72)||(2936654-2936704)
chr7 (225-271)||(15230266-15230311)
chr7 (229-271)||(22479411-22479453)
chr7 (22-72)||(27168385-27168435)
chr7 (225-271)||(27597234-27597280)
chr7 (225-271)||(48193389-48193435)
chr7 (25-78)||(3407153-3407206)
chr7 (225-274)||(33889958-33890007)
chr7 (103-162)||(12080779-12080838)
chr7 (22-72)||(7835357-7835407)
chr7 (9-51)||(17327168-17327210)
chr7 (22-72)||(18352448-18352498)
chr7 (225-271)||(28605642-28605688)
chr7 (228-273)||(41037557-41037602)
chr7 (1-197)||(14780074-14780268)
chr7 (103-162)||(20517000-20517059)
chr7 (103-162)||(24720341-24720400)
chr7 (82-164)||(6736566-6736647)
chr7 (103-161)||(11327676-11327734)
chr7 (224-271)||(18123031-18123078)
chr7 (82-163)||(25818544-25818623)
chr7 (4-71)||(27131071-27131138)
chr7 (225-271)||(14718944-14718990)
chr7 (225-263)||(14778127-14778164)
chr7 (225-271)||(17327186-17327232)
chr7 (225-271)||(18829899-18829945)
chr7 (22-72)||(19069410-19069460)
chr7 (103-163)||(18352373-18352433)
chr7 (103-155)||(38876233-38876285)
chr7 (2-34)||(3512788-3512820)
chr7 (1-33)||(8048156-8048188)
chr7 (103-166)||(9401710-9401773)
chr7 (103-162)||(14719052-14719111)
chr7 (1-33)||(20516898-20516930)
chr7 (103-162)||(27812022-27812081)
chr7 (103-166)||(28605522-28605585)
chr7 (103-162)||(32577623-32577682)
chr7 (1-37)||(38368037-38368073)
chr7 (103-166)||(41407421-41407484)
chr7 (25-72)||(45225274-45225322)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (1-274)||(26017-26290)
scaffold0074 (229-271)||(26003-26045)
[»] chr8 (121 HSPs)
chr8 (1-274)||(21442094-21442366)
chr8 (1-274)||(9483615-9483887)
chr8 (1-267)||(31071520-31071784)
chr8 (6-274)||(14826252-14826518)
chr8 (1-274)||(19971390-19971662)
chr8 (9-274)||(41942833-41943094)
chr8 (1-273)||(1782968-1783225)
chr8 (9-270)||(30577842-30578103)
chr8 (31-274)||(21021181-21021423)
chr8 (38-274)||(5642479-5642706)
chr8 (38-274)||(5644420-5644647)
chr8 (1-137)||(3154165-3154301)
chr8 (22-271)||(8258285-8258531)
chr8 (22-271)||(26042904-26043150)
chr8 (22-271)||(27545747-27545993)
chr8 (6-271)||(25127840-25128104)
chr8 (22-271)||(2823565-2823811)
chr8 (1-271)||(30633028-30633295)
chr8 (36-271)||(35550555-35550786)
chr8 (36-271)||(13468264-13468496)
chr8 (36-271)||(30207169-30207400)
chr8 (22-271)||(32069009-32069253)
chr8 (57-271)||(29125673-29125883)
chr8 (36-271)||(32486890-32487122)
chr8 (22-250)||(10616278-10616503)
chr8 (1-118)||(4018650-4018767)
chr8 (22-271)||(3369699-3369944)
chr8 (1-253)||(1201635-1201884)
chr8 (172-274)||(3154066-3154168)
chr8 (1-123)||(14819273-14819394)
chr8 (143-271)||(42556441-42556567)
chr8 (22-271)||(34102987-34103233)
chr8 (139-273)||(25281053-25281186)
chr8 (22-267)||(26630016-26630251)
chr8 (22-271)||(26867886-26868133)
chr8 (22-239)||(5946782-5946996)
chr8 (42-271)||(39934364-39934590)
chr8 (117-271)||(1281847-1281999)
chr8 (1-115)||(1775514-1775627)
chr8 (36-271)||(10776977-10777206)
chr8 (36-236)||(13269232-13269429)
chr8 (36-260)||(25123380-25123600)
chr8 (22-239)||(184093-184308)
chr8 (146-271)||(23161282-23161405)
chr8 (44-252)||(45299571-45299774)
chr8 (159-271)||(2178669-2178780)
chr8 (186-274)||(23053810-23053897)
chr8 (1-97)||(25280962-25281058)
chr8 (36-215)||(9483938-9484115)
chr8 (114-188)||(21442395-21442469)
chr8 (36-271)||(9413810-9414041)
chr8 (127-271)||(18804880-18805022)
chr8 (117-271)||(32512114-32512266)
chr8 (2-225)||(13290463-13290684)
chr8 (22-166)||(23544858-23545002)
chr8 (187-271)||(36901237-36901320)
chr8 (186-271)||(29377845-29377929)
chr8 (36-183)||(36899739-36899886)
chr8 (131-271)||(42556757-42556895)
chr8 (36-158)||(17691217-17691337)
chr8 (186-271)||(17952593-17952677)
chr8 (22-99)||(18804309-18804386)
chr8 (169-274)||(9869530-9869640)
chr8 (8-147)||(25123632-25123770)
chr8 (22-148)||(39922359-39922484)
chr8 (103-271)||(44874097-44874263)
chr8 (21-100)||(21352391-21352470)
chr8 (229-271)||(1775599-1775641)
chr8 (225-271)||(1782954-1783000)
chr8 (225-271)||(3154269-3154315)
chr8 (225-271)||(4018735-4018781)
chr8 (229-271)||(9483601-9483643)
chr8 (225-271)||(14819259-14819305)
chr8 (225-271)||(19971630-19971676)
chr8 (36-162)||(35067001-35067127)
chr8 (9-63)||(42556395-42556449)
chr8 (22-93)||(7089968-7090040)
chr8 (22-130)||(29125666-29125772)
chr8 (228-271)||(21442080-21442123)
chr8 (1-91)||(42556648-42556739)
chr8 (225-271)||(30577820-30577866)
chr8 (22-72)||(35550604-35550654)
chr8 (225-271)||(41942811-41942857)
chr8 (186-255)||(35067345-35067412)
chr8 (231-271)||(184692-184732)
chr8 (225-260)||(31071517-31071552)
chr8 (22-72)||(10777107-10777157)
chr8 (22-72)||(13269246-13269296)
chr8 (22-72)||(23161331-23161381)
chr8 (229-271)||(42556373-42556415)
chr8 (82-181)||(32069063-32069160)
chr8 (1-37)||(1281861-1281897)
chr8 (103-162)||(1783062-1783121)
chr8 (103-162)||(9483709-9483768)
chr8 (103-162)||(19971509-19971568)
chr8 (103-162)||(21021245-21021304)
chr8 (226-274)||(25123609-25123656)
chr8 (224-271)||(25280947-25280995)
chr8 (103-166)||(31071609-31071672)
chr8 (21-72)||(8258334-8258385)
chr8 (22-69)||(23053865-23053912)
chr8 (146-209)||(29377534-29377597)
chr8 (103-165)||(30207224-30207286)
chr8 (224-271)||(30633262-30633309)
chr8 (223-274)||(42556631-42556682)
chr8 (22-72)||(1281896-1281946)
chr8 (169-246)||(9872305-9872383)
chr8 (82-166)||(10616347-10616429)
chr8 (224-274)||(25127818-25127868)
chr8 (1-46)||(5643083-5643128)
chr8 (1-46)||(5645024-5645069)
chr8 (103-163)||(8258399-8258459)
chr8 (1-34)||(26042918-26042951)
chr8 (1-34)||(29125687-29125720)
chr8 (25-66)||(32486945-32486986)
chr8 (103-166)||(1201725-1201788)
chr8 (22-66)||(9483938-9483982)
chr8 (224-256)||(13290463-13290495)
chr8 (1-33)||(19971407-19971439)
chr8 (1-33)||(21021374-21021406)
chr8 (103-166)||(45299665-45299728)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-274)||(452333-452604)
scaffold0002 (231-271)||(452319-452359)
[»] scaffold0119 (6 HSPs)
scaffold0119 (4-196)||(2767-2959)
scaffold0119 (4-196)||(14822-15014)
scaffold0119 (119-157)||(2693-2731)
scaffold0119 (225-271)||(2930-2976)
scaffold0119 (119-157)||(14748-14786)
scaffold0119 (225-271)||(14985-15031)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (36-271)||(20620-20852)
scaffold0217 (23-78)||(20754-20809)
scaffold0217 (1-34)||(20805-20838)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (36-271)||(9733-9964)
scaffold0015 (22-72)||(9866-9916)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (22-270)||(6504-6749)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (4-260)||(5658-5911)
scaffold0418 (185-258)||(5567-5639)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (10-260)||(22589-22838)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (22-252)||(4043-4269)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (9-123)||(82716-82830)
scaffold0031 (225-271)||(82694-82740)
[»] scaffold0069 (2 HSPs)
scaffold0069 (1-134)||(14829-14962)
scaffold0069 (229-271)||(14934-14976)
[»] scaffold0778 (2 HSPs)
scaffold0778 (1-77)||(6237-6313)
scaffold0778 (225-271)||(6223-6269)
[»] scaffold1808 (2 HSPs)
scaffold1808 (22-249)||(550-774)
scaffold1808 (223-274)||(761-812)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (232-271)||(1-40)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (9-249)||(65934-66167)
[»] scaffold1717 (1 HSPs)
scaffold1717 (22-99)||(1366-1443)
[»] scaffold1527 (1 HSPs)
scaffold1527 (22-99)||(1612-1689)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 107)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 39906246 - 39906518
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39906246 cccactaatttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 39906345  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906346 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 39906445  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906446 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 39906518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44543078 - 44542806
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  44543078 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 44542979  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  44542978 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaggagtgg 44542880  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44542879 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 44542806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 39904876 - 39904618
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39904876 tttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 39904777  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39904776 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatac 39904677  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagc 268  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39904676 accttaaggtgtagctttgct-aaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagc 39904618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 7681990 - 7682253
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  7681990 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaag-aagtgg 7682088  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7682089 gtgtattttagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccactt-ttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 7682187  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7682188 accttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagaaaaccc 7682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 20939687 - 20939959
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| | |||    
T  20939687 cccactagtttttatgtggaagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgcatgttgctataacacactttctaaataaa 20939786  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20939787 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 20939885  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20939886 ttaaatacatcttaaggtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaactagtgagagtgttctagcaaaccc 20939959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 8 - 274
Target Start/End: Original strand, 6332260 - 6332525
Alignment:
Q  8 atttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtg 107  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6332260 atttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtg 6332358  T
Q  108 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6332359 ggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtagttaaata 6332458  T
Q  208 cagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6332459 caccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccc 6332525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38987181 - 38986918
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38987181 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaaacaagtgg 38987082  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38987081 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacatccacttacattttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaattggttaaatac 38986982  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38986981 accttaaggtgtagctttgctaaaacact--cacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 38986918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44257689 - 44257416
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  44257689 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaa 44257590  T
Q  101 -gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44257589 agcaagtgggtgtgttctaacaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaaatg 44257490  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  44257489 gttcaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtttattttagcaaacc 44257416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22301955 - 22302206
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22301955 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacct-aaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaa 22302053  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22302054 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattgtttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 22302153  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactag 253  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22302154 ttaaatacaccttaaagtgtagctttgctaaaacactcccacataaaagctag 22302206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 9689360 - 9689625
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||     
T  9689360 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtga 9689459  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9689460 gtgtattctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaattactaaaaagtggttaaatac 9689559  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  9689560 accttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaaccagtggatgtgttatagcaaaccc 9689625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 30406438 - 30406710
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  30406438 cccactagtttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaa 30406537  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30406538 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcacttgctacaatacacccacttattttttagatggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtgg 30406636  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30406637 ttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtaggtgtgttctagcaaaccc 30406710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 22711010 - 22711282
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  22711010 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaa 22711109  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  22711110 taaa-tgggtgtgttataacaaatcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagtaaataaataactaaaaagtgg 22711208  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22711209 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgttaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccc 22711282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2586603 - 2586338
Alignment:
Q  8 atttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtg 107  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||     
T  2586603 atttttatgtgggattgttttagcaagttataactaaaaaactaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaat-aagtt 2586505  T
Q  108 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2586504 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataacaaaaaagtggttaaata 2586405  T
Q  208 cagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2586404 caccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttccagcaaaccc 2586338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33173726 - 33173459
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||      
T  33173726 ccactaatttttatgtgggagtgttgtagcaagttataactaaaaagttaataaataaaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaat- 33173628  T
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33173627 -aagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggt 33173529  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||    
T  33173528 taaatacaccctaatgtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtagatgtgttttagcaaa 33173459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 37 - 274
Target Start/End: Original strand, 9690171 - 9690407
Alignment:
Q  37 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9690171 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcttaaaaaa-caagtgagtgtgttctagcaaatcttataggcatt 9690269  T
Q  137 tgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||    
T  9690270 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaaatcaataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgttaaaatac 9690369  T
Q  237 tcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9690370 tcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 9690407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 271
Target Start/End: Original strand, 15554012 - 15554268
Alignment:
Q  14 atgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtg 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15554012 atgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttcctataacacacattctaaaaaaa-caaatgggtgtg 15554110  T
Q  114 ttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagctt 213  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  15554111 ttctagcaaatcctattgacatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaagttattaaatacacctt 15554210  T
Q  214 aaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15554211 aaagtgtaactttgctaaaacactcccacataaaaactaatggatgtgttctagcaaa 15554268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 21 - 272
Target Start/End: Original strand, 4293201 - 4293451
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  4293201 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaa-caagtgggtgtgttatagc 4293299  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||    
T  4293300 aaattatataggtatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtgattaaatacaccctaagatgt 4293399  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  4293400 agctttgctaaaacactcctacataaaaattagtgggtgtgttttaacaaac 4293451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 34082551 - 34082797
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  34082551 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 34082648  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34082649 aactcctataggcatttgctaggatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 34082747  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34082748 agctt-gctaaaacactaccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 34082797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 133 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3769552 - 3769414
Alignment:
Q  133 catttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaa 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3769552 catttgctagaacacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 3769453  T
Q  233 acactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3769452 gcactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 3769414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16513281 - 16513038
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  16513281 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 16513184  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     |||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16513183 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttag---gtgtatgttagcaaat-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 16513088  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16513087 agc-ttgctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 16513038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 324933 - 325109
Alignment:
Q  70 gtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaa 169  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  324933 gtatgttgctataacacacattctaaacaaaacaagtgagtgtgttctagcaaattttataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaagga 325032  T
Q  170 gtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataa 246  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  325033 gtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccataaggtgtagctttgctaaaacactctcacataa 325109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 3769786 - 3769653
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3769786 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaacaagtgg 3769688  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3769687 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaga 3769653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13002232 - 13001986
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| |||  || | ||   |||| ||||| |  ||||    
T  13002232 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccctaaggtgaatgttgctaaaacactcctcgtaaacaat--aagtaggtgtatgttagc 13002135  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13002134 aactcctataggcatttgctaaaatacaccctcttattttttagaaggagtgttttagcaagtg-ataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgt 13002036  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13002035 agc-atgctaaaacactcccacataaaaattagtcggtgtgttctagcaaa 13001986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 18370231 - 18370462
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| ||||   |||||||||| |  ||| || || ||||| |||    
T  18370231 tataactaaaaaattgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacgcaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagaaactcttatagtcat 18370328  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  18370329 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaactt-gctaaaaca 18370426  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18370427 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 18370462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 258
Target Start/End: Original strand, 11675136 - 11675370
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| || |   |||||||||| |  ||||    
T  11675136 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagc 11675233  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccactta-ttttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11675234 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtg 11675332  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggt 258  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11675333 tagc-ttgctaaaacacacccacatagaaactagtgggt 11675370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 270
Target Start/End: Original strand, 8386681 - 8386929
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||    ||||||| |  ||||    
T  8386681 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaaaaaagtggttgggtgtatgttagc 8386780  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |  | ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||| ||    
T  8386781 aactcctatatgcatttgctagaatacacccacttatttttttacaagatatgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccctaagatg 8386879  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 270  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8386880 tagctt-gataaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaa 8386929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 42850000 - 42850246
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| | ||   |  ||||||| |  ||||    
T  42850000 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacactccttctaaagaataga--tgggtgtatgttagc 42850097  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||    
T  42850098 aattcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttaaaaagtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaaagtgt 42850196  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42850197 agc-ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtattctagcaaa 42850246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1750383 - 1750153
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||   |||||| ||| |  |||||| ||||| | ||||    
T  1750383 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttccaaaaaat--aagtgg-tgtatgttagcaactcctacatgcat 1750287  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||| |||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  1750286 ttgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagtaagtta-taactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagctt-gctaaaaca 1750189  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1750188 ctctcacctaaaaactagtgggtgtgttttagcaaa 1750153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 1297569 - 1297746
Alignment:
Q  3 cactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    ||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  1297569 cactagtttttatacgggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaataaaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaac 1297667  T
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||            ||||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1297668 aagtgagtgtgttctagcaaatc------------gctagaatacaaccacttattttttag---gagtattttagcaagtgaataactaaaaa 1297746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 19630729 - 19630855
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  19630729 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttctaacaaaa 19630828  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcct 127  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  19630829 ataagtgggtgtgttctagcaaatcct 19630855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 19827630 - 19827756
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  19827630 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacacattaaggtatatgttgctataacacaccttctaacaaaa 19827729  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcct 127  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  19827730 ataagtgggtgtgttctagcaaatcct 19827756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 37169556 - 37169786
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||| || ||| |   ||||||||| |  ||||||  | |||||||||    
T  37169556 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacactccttttaaaaata---agtgggtgtatgttagcaacccatataggcat 37169652  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |  |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||| ||| |||    
T  37169653 ttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggtgcgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgttaagaca 37169750  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37169751 ctcccacataaaaattagtggatgtgttctagcaaa 37169786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29512287 - 29512041
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||  ||| |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||   |||||||| | |  ||||    
T  29512287 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacattttatggtgaatgttgctaaaacacacattctagaaaat--aagtgggtatatgttagc 29512190  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt--agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggt 218  Q
    || | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||   || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29512189 aacttctatagacatttactaggatacacccacttattttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtggttaaatacactttaaggt 29512091  T
Q  219 gtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 269  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29512090 gtagctt-gctaaaacacttccacataaaaactagtggatgtgttctagca 29512041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16075237 - 16075009
Alignment:
Q  37 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatt 136  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||| ||||| |  |||||| |||| ||||||||    
T  16075237 ataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagttggtgtatgttagcaactcctgtaggcatt 16075140  T
Q  137 tgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacac 236  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| ||||||||  ||    
T  16075139 tactaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacacattaaggtgtagc-ttgctaaa--ac 16075044  T
Q  237 tcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16075043 tcttacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaa 16075009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 271
Target Start/End: Original strand, 8741639 - 8741741
Alignment:
Q  169 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8741639 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatatactttaaggtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaactagtaggtgtgttttagc 8741738  T
Q  269 aaa 271  Q
    |||    
T  8741739 aaa 8741741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 183
Target Start/End: Original strand, 33739531 - 33739691
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  33739531 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 33739628  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagt 183  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  33739629 aactcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt 33739691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 153 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23234130 - 23234012
Alignment:
Q  153 cttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaacta 252  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23234130 cttattttttagaaggggtactttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacatcctgaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaatta 23234031  T
Q  253 gtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || ||||||||||| ||||    
T  23234030 gtaggtgtgttctaacaaa 23234012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29404046 - 29403914
Alignment:
Q  132 gcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaa 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||| |||||    
T  29404046 gcatttgctaaaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaaatga-taactaaaaaatggttcaatgcaccctaaggtgtagctt-gctaa 29403949  T
Q  232 aacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 266  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29403948 aatactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 29403914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 124 - 264
Target Start/End: Original strand, 17265356 - 17265494
Alignment:
Q  124 tcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagc 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||| |||||||||  ||    
T  17265356 tcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatg-ataactaagaagtagttaagtacaccttaaggtgatgc 17265454  T
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  17265455 -ttgctaaaacactcccacataaaaattggtggatgtgttc 17265494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 263
Target Start/End: Original strand, 23664715 - 23664971
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||      
T  23664715 actagtttttatgtgg-agtgttttagcaaagatataattaaaaaattgttaaatacattttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaata 23664813  T
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    || || |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||    
T  23664814 aa-tgagtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagtt 23664911  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 263  Q
    |||||||  ||||| | |||| ||||| |||||||| ||  |||||| |||||| ||||||    
T  23664912 aaatacactttaagatatagc-ttgctgaaacactcacaagtaaaaattagtggatgtgtt 23664971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 271
Target Start/End: Original strand, 33740105 - 33740184
Alignment:
Q  191 taaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33740105 taaaaagtagttaaatgtaccttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 33740184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 274
Target Start/End: Original strand, 41927550 - 41927612
Alignment:
Q  211 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41927550 cttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 41927612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Original strand, 1576652 - 1576822
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||  |||||||||| |  |||||| |||||||  |||    
T  1576652 tataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacaccttct-gaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataatcat 1576749  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 209  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||   || |||||| || |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  1576750 ttgctaggatgcacccacttattttttagaatgtgtgttttaggaaat-tataactaaaaagtagttaaataca 1576822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23387322 - 23387153
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||  | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  23387322 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatcttgttaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 23387225  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||||||   |||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  23387224 ttgttaggatacacctacttattttttagaaggtgtatcttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatac 23387153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19630761 - 19630712
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19630761 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 19630712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19827662 - 19827613
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19827662 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 19827613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 768740 - 768569
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataac-acaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 134  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| | ||  |||| ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  768740 tataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaaatacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 768643  T
Q  135 tttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 209  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||   |  ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  768642 tttgctacgatacaccaacttattttttagaaggtgcgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 768569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41527901 - 41527823
Alignment:
Q  192 aaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41527901 aaaaagtagttaaatacactctaaggtgtagtttt-ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 41527823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23175401 - 23175355
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23175401 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 23175355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23586658 - 23586612
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23586658 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 23586612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 201 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27337119 - 27337050
Alignment:
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27337119 ttaaatacaccttaaggcgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaaccagtgggtgtgttctaacaaa 27337050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23387181 - 23387063
Alignment:
Q  31 caagttataactaaaaagttaataaatac-accttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctat 129  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||    
T  23387181 caagttataactaaaaagtagttaaatacgaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctat 23387084  T
Q  130 aggcatttgctagaatacacc 150  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  23387083 aggcatttgctaggatacacc 23387063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 38987157 - 38987205
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38987157 ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaacc 38987205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7682014 - 7681968
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7682014 ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaa 7681968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9689384 - 9689338
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9689384 ttgctaaaacactcccacataaaaactagcgggtgtgttctagcaaa 9689338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17264939 - 17264893
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17264939 tttgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 17264893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 23175369 - 23175419
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagtta 51  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23175369 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagtta 23175419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 23586626 - 23586676
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagtta 51  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23586626 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagtta 23586676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Original strand, 44257657 - 44257699
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44257657 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 44257699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 44543046 - 44543092
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44543046 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgctctagcaaa 44543092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 39904852 - 39904901
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39904852 ttgctaaaacactctcacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaaccc 39904901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45629726 - 45629682
Alignment:
Q  230 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45629726 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtattctagcaaaccc 45629682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9282156 - 9282117
Alignment:
Q  235 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9282156 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 9282117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 3352281 - 3352327
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3352281 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtattctagcaaa 3352327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 3769762 - 3769808
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3769762 ttgctaaaacactcccacataaaaactaatggatgtgttctagcaaa 3769808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22301987 - 22301941
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22301987 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgtactagcaaa 22301941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30406470 - 30406424
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30406470 ttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaa 30406424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39906274 - 39906232
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39906274 taaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 39906232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 17264906 - 17264963
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaata 58  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17264906 cccactagtttttatgtaggagtgttttagcaaattataactaaaaagttgataaata 17264963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 72
Target Start/End: Original strand, 324729 - 324793
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  324729 tttttatgtgggagtgttttaacaaaaatataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 324793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 45629699 - 45629790
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagc--aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacacct 90  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||  |  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||    
T  45629699 cccactagtttttatgtgggagtgtttttaccaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacacct 45629790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 18370363 - 18370464
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  18370363 gtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ctagtgggtgtgttctagca 18370460  T
Q  122 aatc 125  Q
    ||||    
T  18370461 aatc 18370464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22711042 - 22711007
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22711042 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 22711007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Original strand, 29511965 - 29512028
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29511965 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctagaaaa 29512028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20939719 - 20939673
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20939719 ttgctaaaatacttccacataaaaactagtgggtatgttctagcaaa 20939673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 24755234 - 24755157
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaa 181  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24755234 aagtgggtgtatattagcaagtcctataaatatttgctaaaatacacccacttat-ttttagaaagagtattttagcaa 24755157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 33173695 - 33173741
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  33173695 ttgctacaacactcccacataaaaattagtggatgtgttctagcaaa 33173741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7682135 - 7682076
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7682135 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctaaaatacacccacttctttttt 7682076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 22302108 - 22302049
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22302108 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 22302049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26368583 - 26368520
Alignment:
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 264  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26368583 gttaagtacaccttaaggtatagctt-gctaaaatacttccacataaaaactaatgggtgtgttc 26368520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 33173575 - 33173634
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatc-ctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33173575 aagtgggtgtattctagcaaatgtctatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 33173634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 37169689 - 37169737
Alignment:
Q  24 gttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  37169689 gttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgta 37169737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 44542925 - 44542984
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44542925 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 44542984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 264
Target Start/End: Original strand, 45629827 - 45629890
Alignment:
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 264  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||    
T  45629827 gttaaatgcaccttaaggtgtagctt-gctaaaaaactcacatataaaaacaagtgggtgtgttc 45629890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1297600 - 1297553
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1297600 tttgctaaaacactcccgtataaaaactagtgagtgtgttctatcaaa 1297553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13002086 - 13002035
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  13002086 agtgttttagcaagtgataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgta 13002035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 44288849 - 44288810
Alignment:
Q  127 tataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44288849 tataggcatttgctaaaatactcccacttattttttagaa 44288810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1750252 - 1750202
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  1750252 gtgttttagtaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 1750202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 2586578 - 2586624
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  2586578 ttgctaaaacaatcccacataaaaatcaatgggtgtgttctagcaaa 2586624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 3352312 - 3352274
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataa 40  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3352312 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataa 3352274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Original strand, 4206528 - 4206574
Alignment:
Q  25 ttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  4206528 ttttagcaagttataactaaaaagtggataatcacaccttaaggtgt 4206574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16075106 - 16075056
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| ||||||||||    
T  16075106 gtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacacattaaggtgta 16075056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20939840 - 20939775
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattt-tttagaaa 167  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  20939840 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttatttagaaa 20939775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 29513924 - 29513974
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||||    
T  29513924 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacattttaaggtgta 29513974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33739682 - 33739600
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33739682 aacacaccttctaaaaaat--aagtggatgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 33739600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11675288 - 11675205
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  11675288 aacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatattttagaa 11675205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 34082783 - 34082750
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaag 34  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34082783 cccactagtttttatgtggtagtgttttagcaag 34082750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 39904730 - 39904782
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39904730 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccactt 39904782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39906400 - 39906348
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39906400 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccactt 39906348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 2586355 - 2586387
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2586355 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 2586387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 2586457 - 2586516
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2586457 aagtaggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacaccaacttatttttt 2586516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6332406 - 6332347
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatc-ctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6332406 aagtgggtgtattctagcaaatgtctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 6332347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 6332508 - 6332476
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6332508 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 6332476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 16513149 - 16513212
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16513149 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 16513212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 18370448 - 18370412
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagtta 37  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18370448 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagtta 18370412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 38987035 - 38987094
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38987035 aagtggatgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 38987094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43660915 - 43660823
Alignment:
Q  127 tataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||  |  |||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  43660915 tatagggatttgctaagatacacccaattgttttttatgaggagtattttaggaaagatataactaaaaagtggttaaatacaccttgaggtg 43660823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 120)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 30687880 - 30688150
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30687880 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 30687979  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30687980 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 30688079  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30688080 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagttggtgtgttctagcaaa 30688150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 29302070 - 29302343
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29302070 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 29302169  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29302170 gcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccgcttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaggtgg 29302269  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29302270 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 29302343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15809191 - 15808919
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  15809191 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttacaacttaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaa 15809092  T
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15809091 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggt 15808992  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15808991 taaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccc 15808919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4737012 - 4736743
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  4737012 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattctaaaaaaa 4736913  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4736912 -caagtgggtgtgttatagcaaatcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagga---gtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 4736817  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4736816 ttaaatacaccttaagatgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaaccc 4736743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33282476 - 33282206
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  33282476 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaa 33282377  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33282376 -caagtgggtgtgttctagcaaatccaataggcatttgctagaatgcacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtag 33282278  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33282277 ttaaata-aacttaaggtatagctttgctaagacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 33282206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17605258 - 17604990
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  17605258 actagtttttatgtaggagtgttttagcaagttataactaaaaatttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-ca 17605160  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17605159 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtaaataactaaaaagtggtta 17605060  T
Q  204 aatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17605059 aatacaccttaa-gtgtagctttgctaaaagactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 17604990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11448955 - 11448706
Alignment:
Q  1 cccactaattttt-atgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||    
T  11448955 cccactaattttttatgtgatagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaacaaa 11448856  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11448855 aacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacatccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaatatctaaaaagtg 11448756  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448755 gttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 11448706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1921678 - 1921416
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||  ||||  |    
T  1921678 actagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatattgttataacacatcttctaacaaaaata 1921579  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1921578 agtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctcggatacacccacttagtttttaaaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 1921479  T
Q  204 aatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1921478 aatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtaggtgtgttctag 1921416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 1951399 - 1951632
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  1951399 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaagaaa 1951498  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1951499 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatatgttagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 1951597  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1951598 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca 1951632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26906115 - 26905862
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  26906115 cccactagtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa- 26906017  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  26906016 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacagccacttattttttt--aggagtattttagcaaatgaataactaaaaagttg 26905920  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggt 258  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26905919 ttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattaatgggt 26905862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33026446 - 33026176
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  33026446 actagttttcatgtgggagtgttttaacaagttacaactaaaaaagttaataaatacatcttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-c 33026348  T
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  33026347 aagtgggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccgacttattttttagaaggagtattttagcaaattaataactaaaaagtggtt 33026248  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33026247 aaatacaccctaagatgtagttttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctaacaaaccc 33026176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 30667555 - 30667816
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||     
T  30667555 tttttatgtgggagtgttttagcaagttatgactaaaaagttaataaatacaccataagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa--aagtga 30667652  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  30667653 gtgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacacaca--tattttttagaatgagtattttagcaagtgaaaaattaaaaagtgattaaatac 30667750  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30667751 actttaacgtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttccagcaaaccc 30667816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37282400 - 37282132
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37282400 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaagttaacaaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa 37282301  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37282300 a-caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaaaatacactcacttattttttag---gagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 37282205  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||| |||| |  | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37282204 gtt-aatagacttcaagatgtagctttggtaaaacactcccatataaaaactagtgggtgtgttataacaaacc 37282132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 33833033 - 33833290
Alignment:
Q  3 cactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||            ||||||||| |||||||||||||||  |||| |    
T  33833033 cactaatttttatgtgggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaat------------gtatgttgctataacacaccttctaacaaaaac 33833120  T
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33833121 aagtgggtgtgttctaacaaatcctatatacatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagttagtgaataactaaaaagtggtt 33833220  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33833221 aaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 33833290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 254
Target Start/End: Original strand, 17209848 - 17210091
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaag--ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagt 106  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||    
T  17209848 tttttatgtaggagtgttttagcaagttgtaactaaaaagagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaat-aagt 17209946  T
Q  107 gggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  17209947 gggtgtgttcaagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagga---gtattttagcaaatcaataactaaaaaatggttaaat 17210043  T
Q  207 acagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagt 254  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17210044 acaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagt 17210091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Original strand, 3960637 - 3960867
Alignment:
Q  34 gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  3960637 gttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtgctctagcaaatcctacatgc 3960735  T
Q  134 atttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3960736 atttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaa 3960835  T
Q  234 cactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 266  Q
    |||||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  3960836 cactcccatat-aaaattagtaggtgtgttcta 3960867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37249523 - 37249361
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37249523 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 37249424  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttta 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37249423 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccatttatttttta 37249361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37468754 - 37468494
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  37468754 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttgataaatacaccttgagttgtatgtttctataacacaccttcta-aaaaa 37468656  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtga-ataactaaaaagtg 199  Q
      |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||||||    ||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  37468655 ataagtgggtgtatgttagcaaatcctataggaatttgctagaatacaccc------tttttag---gagtattttagcaagtgataacactaaaaagtg 37468565  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37468564 gttaaatgcaccctaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttttagcaaa 37468494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4738127 - 4737878
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |   |||||||||| |  ||||    
T  4738127 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagc 4738030  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4738029 aactcatatgggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 4737931  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4737930 agctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 4737878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 137 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14795777 - 14795640
Alignment:
Q  137 tgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14795777 tgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataaaccttaaggtgtagctttgctaaaacac 14795678  T
Q  237 tcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14795677 tcccacataaaaactagtgagtgtgttctagcaaaccc 14795640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 129 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30486203 - 30486058
Alignment:
Q  129 taggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgc 228  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30486203 taggcatttgctaggatacatccacttagtttttagaatgagtattttagcaattgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgc 30486104  T
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30486103 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 30486058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14369962 - 14369716
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  14369962 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaactacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 14369865  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14369864 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 14369766  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  14369765 agc-ttgctaaaacactcccacatgaaaactagcgggtgtcttctagcaaa 14369716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 25912044 - 25912275
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  | ||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  25912044 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaaggttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 25912141  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  25912142 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 25912239  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25912240 ctcccacataaaaactagtaggtgtgttctagcaaa 25912275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 17559190 - 17559335
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17559190 cccactgatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaa 17559288  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatac 147  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17559289 acaagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacatttgctagaatac 17559335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 273
Target Start/End: Original strand, 27005155 - 27005317
Alignment:
Q  111 gtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacag 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |     
T  27005155 gtgttctagcaaatcctttagacatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatagac 27005254  T
Q  211 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  27005255 cttaaggtgtagctttgctaaaatactctcacataaaaattagtgggtgcgttccagcaaacc 27005317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28747958 - 28747711
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | | ||| ||||||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  28747958 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaagcactccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 28747860  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  28747859 aactcctatagacatttgctagaatacacccacttaatttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccctaaggtgt 28747761  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28747760 agc-ttgctaaaacactctcacataaaaacaagtgggtgtgttctagcaaa 28747711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6436603 - 6436372
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| | |||| || ||||| ||||   |||||| ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  6436603 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacaaacattctaaaaaat--aagtggttgtatgttagcaactcctataggcat 6436506  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||   || ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6436505 ttgctaggattcacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttac-aactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagctt-gctaaaaca 6436408  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436407 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 6436372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 134 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7014614 - 7014474
Alignment:
Q  134 atttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaa 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7014614 atttgctagaacacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaa 7014515  T
Q  234 cactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7014514 cactcccacataaaaattaatgggtgtgttctagcaaaccc 7014474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 12910009 - 12910258
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||| ||||| || |   ||||| |||| |  ||||    
T  12910009 gtgttttagcaaagatataattaaaaaattgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaaaatat--aagtgagtgtatgttagc 12910106  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12910107 aactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtatgttttagcatgtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 12910205  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12910206 agctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaaccc 12910258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 22701710 - 22701977
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  22701710 cccactaatttttatgtgggagtgttttaacaaagatataactaaaaagttgtgaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 22701809  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
       ||| ||||||    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   || ||||||||||| | ||||||||||||     
T  22701810 t--aagcgggtgtacgttagcaactcttataagcatttgctagaatacacccacttatttttg-gaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagta 22701905  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaa-actagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22701906 gttaaatgcaccttaaggtgtaac-ttgctaaaacactcccacataaaacactagtgggtgtgttctagcaaa 22701977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17421874 - 17421643
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| | || || | ||||| ||||   |||||||||| |  ||| || |||||||| |||    
T  17421874 tataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaatactcattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagaaactcctatagacat 17421777  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||    
T  17421776 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccataaggcgtagctt-gctaaatca 17421679  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421678 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 17421643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2528964 - 2528716
Alignment:
Q  22 gtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  ||||    
T  2528964 gtgttttagcgaagttataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 2528866  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   || ||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| || ||||||||     
T  2528865 aactcctatagacatttgctagaatacatccacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactgaaaagtagttaaatgcaccttaaggta 2528767  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2528766 tacctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 2528716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33696233 - 33695999
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  33696233 tataactaaaaagttgttaaatacaccttatggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 33696136  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  33696135 ttgctagaatacacccacttattttttagaagttatgttttagcatgt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgttaaaaca 33696038  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33696037 caaccacataaaaactagtgagtttgttctagcaaaccc 33695999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 270
Target Start/End: Original strand, 31240268 - 31240476
Alignment:
Q  58 acaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttat 157  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |   |||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31240268 acaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcttataggcatttgctaggatacacccacttat 31240365  T
Q  158 tttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtggg 257  Q
    |||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  31240366 tttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagc-ttgctaaaacactctcacataaaaactagtgga 31240463  T
Q  258 tgtgttctagcaa 270  Q
    |||||||||||||    
T  31240464 tgtgttctagcaa 31240476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3038988 - 3038836
Alignment:
Q  117 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaag 216  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3038988 tagcaactcctataggcatttgttaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaag 3038890  T
Q  217 gtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3038889 gtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtatgttctagcaaa 3038836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4083933 - 4083705
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| || |   ||||||||||    ||||    
T  4083933 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtcgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtacgttagc 4083836  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4083835 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgt 4083737  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactag 253  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4083736 agc-ttgttaaaacactcccacataaaaactag 4083705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 267
Target Start/End: Original strand, 13711033 - 13711262
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||  | ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  13711033 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattcattctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 13711131  T
Q  136 ttgctagaatacacccac-ttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaac 234  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||  ||| |||||||||||  ||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13711132 ttgctagaatacacccactttttttttttgaatgagtgttttagcaagt-tataatcaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaac 13711229  T
Q  235 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13711230 actctcacataaaaaccagtgggtgtgttctag 13711262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7944482 - 7944254
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||| |   ||||||||| |  ||||    
T  7944482 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaata---agtgggtgtatgttagc 7944386  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagt-ggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||    
T  7944385 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaagttaaatacaccttaaagtg 7944287  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactag 253  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7944286 taac-ttgctaaaacactcccacataaaaactag 7944254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 2695084 - 2695320
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  |||||    
T  2695084 gtgttttagcaaaatataactaaaatgttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtgggtgtatgttagca 2695181  T
Q  122 aatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgta 221  Q
    | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2695182 actcctataggcatttgctaggata-acccacttacattttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 2695279  T
Q  222 gctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 263  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  2695280 gc-ttgctaaaatattcccacataaaaactagtttgtgtgtt 2695320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10951230 - 10951004
Alignment:
Q  41 ctaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgct 140  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||  ||||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |    
T  10951230 ctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttctaaaacacacattc--gaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgat 10951133  T
Q  141 agaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactccc 240  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||   || ||||||||||| | || ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10951132 ataatacacctacttattttttataaggtgtgttttagcaagtta-tatctaaaaagtagctaaatacatcttaaggtgtagctt-gctaaaacactccc 10951035  T
Q  241 acataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10951034 acattaaaactagtggatgtgttctaccaaa 10951004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1807592 - 1807474
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||    
T  1807592 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatatatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaacaagt-ggtgtgttccagc 1807495  T
Q  121 aaatcctataggcatttgcta 141  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  1807494 aaattctataggcatttgcta 1807474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 123
Target Start/End: Original strand, 22282185 - 22282301
Alignment:
Q  8 atttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtg 107  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  22282185 atttttatgtgggagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaacaaaaacaagtg 22282284  T
Q  108 ggtgtg-ttctagcaaa 123  Q
    |||||| ||||||||||    
T  22282285 ggtgtgtttctagcaaa 22282301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38661337 - 38661242
Alignment:
Q  63 ttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattt 159  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38661337 ttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattt 38661242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 17232918 - 17233145
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||| ||||   || ||  ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  17232918 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatgttgctaaagcacaccttctaaaaaat--aaatgaatgtatgttagcaactcctataggcat 17233015  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| | | |||||||||    || |||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  17233016 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaatta-taactaaaa----gtgaaatgcaccttaaggtgtagctt-gctaaaaca 17233109  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17233110 ctcctacataaaaactagtgggtgtgttctaccaaa 17233145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 39038698 - 39038472
Alignment:
Q  38 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 137  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||||| |||||  |||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||    
T  39038698 taactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaaat-aagtgggtctatgttagcaactcctatatgcattt 39038600  T
Q  138 gctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacact 237  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||   || ||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  39038599 gctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagttaaataaaccttaaggtgtaac-ttgctaaaacact 39038502  T
Q  238 cccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    |  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  39038501 catacataaaaattagtaggtgtgttctag 39038472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 6260993 - 6261224
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| || ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  6260993 tataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 6261090  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||  ||| ||| | || |||||||||||    
T  6261091 ttgctaggatatacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataattaaaaaatagttaaatacactttacggtatggc-ttgctaaaaca 6261188  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6261189 ctctcacataaaaaatagtaggtgtgttctagcaaa 6261224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31752296 - 31752128
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||| ||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  31752296 tataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtaggtgtatgttagcaactcctataggcat 31752199  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  31752198 ttgctagaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaata 31752128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Original strand, 39548829 - 39549074
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||| || | ||||   |||||| ||| |  ||||    
T  39548829 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgata-aacacaccatcaaaaaaat--aagtgg-tgtatgttagc 39548924  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||| |||    
T  39548925 aacttctatagccatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatataccttaagatgt 39549023  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  39549024 agc-ttgctaaaacactcctacataaaaactaggaggtgtgttctaacaaac 39549074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 264
Target Start/End: Original strand, 8410685 - 8410844
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    ||||| |||| | ||||||| |||||||  |||||||||| ||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  8410685 aagtgagtgtatcctagcaactcctataaacatttgctaggatacatcaacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagtt 8410783  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 264  Q
    ||| | |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8410784 aaacatacattaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 8410844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1797498 - 1797420
Alignment:
Q  137 tgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1797498 tgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa 1797420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Original strand, 40234211 - 40234307
Alignment:
Q  173 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40234211 ttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtag-tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 40234307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 858085 - 857945
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||| |  ||||    
T  858085 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctagaaaa--taagtgggtgtctgttagc 857988  T
Q  121 aaatcctataggca-tttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  857987 aactcctatatgcattttgctagaatacacccacttacttttt 857945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 211 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39999248 - 39999185
Alignment:
Q  211 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39999248 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 39999185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7014720 - 7014630
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttcta 94  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  7014720 actagtttttatgtgagagtgttttagcaagctctaactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattcta 7014630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38661243 - 38661179
Alignment:
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttct 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38661243 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttct 38661179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9124899 - 9124704
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  || |    
T  9124899 gtgttttagcaaagatataactaaaaatttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttaac 9124801  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatt-ttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaagg 217  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   || |||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  9124800 aacttctataggcatttgctagaatacatccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatatttaaatacaccttaagg 9124704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 22800642 - 22800868
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||| || |||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || |||    
T  22800642 tataattaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctacaacactccttttaaaaaaag-aagtgggtgtatgttagcaactcctacagacat 22800740  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||      | |||||  ||||||||||||    
T  22800741 ttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagtagctaaatac------acgtgta-atttgctaaaaca 22800832  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||| ||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  22800833 ctctcacgtaaaaactagtggatttgttctatcaaa 22800868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 252
Target Start/End: Original strand, 17233353 - 17233486
Alignment:
Q  117 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaag 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   || ||||| ||| |  |||| |||||||| |||||||||  ||||||    
T  17233353 tagcaactcctataggcatttgctagaacacactcacttattttttagaagttgtgttttaccaaat-tataattaaaaagtagttaaatactccttaag 17233451  T
Q  217 gtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaacta 252  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17233452 gtgtaac-ttgctaaaacacttccacataaaaacta 17233486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4151148 - 4150976
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtg--tgttctagcaaatc---ctata 130  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||   |||| ||    ||||    
T  4151148 tataactaaaaaattaataaatacatcttgaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaa---aagtgggtgtatgttagcgcaactcttattata 4151052  T
Q  131 ggcatttgctagaatacacccactta-ttttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 205  Q
     |||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4151051 tgcatatgctagaatactccaacttatttttttaaaaagagtattttaacaagtgaataactaaaaagtgattaaa 4150976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 273
Target Start/End: Original strand, 22213127 - 22213214
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22213127 ataattaaaaagtggttaaatacaccctaaattgtagctttgttaaaacactctcacttaaaaattagtgggtgtgttctagcaaacc 22213214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31752479 - 31752395
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| | |||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31752479 ataactaaaaactagttaaatgtaccttaagatgtag-tttgctaaaacactcccacataaaaactagtggttgtgttctagcaaa 31752395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 99
Target Start/End: Original strand, 11351787 - 11351883
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  11351787 actagtttttatgtgggagtgttttagcaaagatataattaaaaagttattgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 11351883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 4736980 - 4737026
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4736980 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 4737026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29302102 - 29302053
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29302102 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccc 29302053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30687912 - 30687863
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30687912 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccc 30687863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 857917 - 857858
Alignment:
Q  211 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  857917 cttaaggtgtaactt-gctaaaacactcccacatacaaactagtgggtgtgttctagcaaa 857858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Original strand, 25912176 - 25912282
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  | | ||||| | ||| ||||||||||||||    
T  25912176 gtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ctagtaggtgtgttctagca 25912273  T
Q  122 aatcctata 130  Q
    |||||||||    
T  25912274 aatcctata 25912282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 1921649 - 1921695
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1921649 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtaggtgtgttctagcaaa 1921695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 15809160 - 15809206
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15809160 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 15809206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 26906087 - 26906129
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26906087 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 26906129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32736455 - 32736377
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  32736455 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 32736377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 37249491 - 37249537
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37249491 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 37249537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 37282368 - 37282414
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37282368 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttgtagcaaa 37282414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33832898 - 33832728
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||| | | ||||||||||||| |||||  || || |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  33832898 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaacgtttctaaaacacaccttctaaaaaaataaa-tgagtgtatgttagcaactcctataggcat 33832800  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttatt-ttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    ||| |||||  |||||||||||| |||| |||   || |||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  33832799 ttgttagaacgcacccacttattgttttggaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaata 33832728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 37468722 - 37468766
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37468722 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttttagca 37468766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1951432 - 1951385
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  1951432 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtattttagcaaa 1951385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22213123 - 22213077
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22213123 ttgctaaaacacttccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 22213077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30667579 - 30667533
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30667579 ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctaacaaa 30667533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 33282444 - 33282490
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33282444 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtatgttctagcaaa 33282490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22701744 - 22701693
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  22701744 ctttgttaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtatcctagcaaaccc 22701693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 92
Target Start/End: Original strand, 25593287 - 25593354
Alignment:
Q  25 ttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttc 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||| | || ||||||||    
T  25593287 ttttagcaagttataactaaaaagtggataattacaccttaaggtgtgagttgctaaaagacaccttc 25593354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 27005150 - 27005107
Alignment:
Q  11 tttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaata 54  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27005150 tttatgtgggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaata 27005107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Original strand, 40234209 - 40234310
Alignment:
Q  23 tgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  |||| | ||||| ||  | | ||||| | |||||||||||||||||||    
T  40234209 tgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtagtttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ctagtgggtgtgttctagcaa 40234306  T
Q  123 atcc 126  Q
    ||||    
T  40234307 atcc 40234310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3038935 - 3038885
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  3038935 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgta 3038885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 7014691 - 7014737
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7014691 ttgctaaaacactctcacataaaaactagtatgtgtgttctagcaaa 7014737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17209872 - 17209826
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17209872 ttgctaaaacactcctacataaaaactaatggatgtgttctagcaaa 17209826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17559222 - 17559176
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  17559222 ttgctaaaacactcccacataaaaatcagtgggtgtgttatagcaaa 17559176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 31240378 - 31240428
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  31240378 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgta 31240428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 33026421 - 33026463
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33026421 taaaacactcccacatgaaaactagtaggtgtgttctagcaaa 33026463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33833064 - 33833014
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||    
T  33833064 tttgctaaaacactcccacataaaaattagtgcgtgtatcctagcaaaccc 33833014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Original strand, 17421738 - 17421835
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatc-ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagca 180  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||  |||||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17421738 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtattctagcaaatgtctataggagttt-ctaacatacacccacttattttttagaatgagtattttagca 17421834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33696100 - 33696051
Alignment:
Q  23 tgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33696100 tgttttagcatgttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 33696051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 15809038 - 15809097
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15809038 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 15809097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17209995 - 17209936
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17209995 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgcttgaacacacccacttatttttt 17209936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 62
Target Start/End: Original strand, 22213092 - 22213152
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacc 62  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||    
T  22213092 ccactagtttttatgtggaagtgttttagcaatttataattaaaaagtggttaaatacacc 22213152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 26905963 - 26906026
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26905963 aagtggctgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgttttttagaa 26906026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 38661246 - 38661305
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  38661246 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 38661305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 157
Target Start/End: Original strand, 40234169 - 40234209
Alignment:
Q  117 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttat 157  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40234169 tagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttat 40234209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 6436471 - 6436370
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||| | ||||| ||  | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  6436471 gtgttttagcaagttacaactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ctagtgggtgtgttctagca 6436374  T
Q  122 aatc 125  Q
    ||||    
T  6436373 aatc 6436370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11351818 - 11351787
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagt 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351818 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagt 11351787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 13711166 - 13711217
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13711166 agtgttttagcaagttataatcaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 13711217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 1807580 - 1807626
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1807580 ttgctaaaacactctcatgtaaaaactaatgggtgtgttctagcaaa 1807626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 10951103 - 10951053
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  10951103 gtgttttagcaagttatatctaaaaagtagctaaatacatcttaaggtgta 10951053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 17421742 - 17421696
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  17421742 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccataagg 17421696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 17605229 - 17605275
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  17605229 ttgctaaaacactcctacataaaaactagtaggtatgttctaacaaa 17605275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 25912180 - 25912098
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25912180 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 25912098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 71
Target Start/End: Original strand, 27365811 - 27365857
Alignment:
Q  25 ttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  27365811 ttttagcaagttataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgt 27365857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8318197 - 8318124
Alignment:
Q  134 atttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    ||||||||  |||||||| |||  |||||| || ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  8318197 atttgctatgatacacccgcttggtttttataagaagtattttagcaaagatataactaaaaagtggttaaata 8318124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17210210 - 17210138
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttcta 94  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||||    
T  17210210 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttg-taaatacaccttaaggtgaatgttggtaaaacacacattcta 17210138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 30688034 - 30687982
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30688034 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccactt 30687982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9124703 - 9124667
Alignment:
Q  230 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 266  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9124703 aaaacactcccacattaaaattagtgggtgtgttcta 9124667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13711151 - 13711092
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  13711151 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatttttt 13711092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 14369830 - 14369893
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14369830 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 14369893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 15808936 - 15808968
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15808936 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 15808968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 17605108 - 17605167
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  17605108 aagtgggtgtattccagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 17605167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 33026193 - 33026225
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33026193 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 33026225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 33696116 - 33696179
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  33696116 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatattttagaa 33696179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 33832764 - 33832728
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaata 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33832764 gtgttttagcaagttataactaaaaagtaattaaata 33832728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 162
Target Start/End: Original strand, 37468605 - 37468660
Alignment:
Q  107 gggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37468605 gggtgtattctagcaaattcctatagg-atttgctaacatacacccacttatttttt 37468660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38952273 - 38952198
Alignment:
Q  133 catttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||| ||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  38952273 catttgctaaaatacacccacttattttttataaggagtgttttggcatgt-cataactaaaaagtagctaaataca 38952198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 126)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 20411160 - 20411433
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20411160 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 20411259  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20411260 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagtcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatcttagcaagtgaataactaaaaagtgg 20411359  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20411360 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 20411433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 14494340 - 14494605
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  14494340 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgg 14494439  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14494440 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataa 14494539  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14494540 accttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 14494605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 36817613 - 36817886
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  36817613 cccactaatttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctacaaaaa 36817712  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36817713 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggaatttgctagaatacacacacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 36817812  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36817813 ttaaattcaccttaaggtgtagctttgctaaaacactctcacataaaaactagtgagtgtgttctagcaaaccc 36817886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 27255615 - 27255875
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  27255615 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttttagaaaaa 27255714  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27255715 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccctcttattttttaaaaggagtattttaggaagtaaataactaaaaagtgg 27255814  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtg 261  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27255815 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtg 27255875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12864512 - 12864241
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   | |||||    
T  12864512 cccactaatttttatatgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgctataacacaccta--aaaaaaa 12864415  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12864414 acaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaatacacccacttattttttaaaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 12864315  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12864314 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactactgggtgtgttctagcaaaccc 12864241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13385956 - 13385681
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  13385956 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaa 13385857  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13385856 ataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattgaataactaaaaagtgg 13385757  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagcttt--gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13385756 ttaaatacaccttaaggtgtaactttgcgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtatgttctagcaaaccc 13385681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1805207 - 1804938
Alignment:
Q  3 cactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |    
T  1805207 cactagtttttatgttggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttttaaaaaaa-c 1805109  T
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1805108 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatcttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtggtt 1805009  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1805008 aaatacatcctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattaatgggtgtgttctagcaaacc 1804938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 39424233 - 39424501
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39424233 cccactagtttttatgtgg-agtgttttagcaagatataattaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 39424331  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39424332 t-aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 39424430  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39424431 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaagtacttccacataaaaactagtgggtgtattctggcaaa 39424501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27389711 - 27389453
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||     
T  27389711 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttatgactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaa- 27389613  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatc----ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
     ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27389612 -caagtgggtgtgttctagcaaatcaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 27389514  T
Q  197 gtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggt 258  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27389513 gtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaaca-tcccacataaaaactagtgggt 27389453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 43236125 - 43236398
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||    
T  43236125 tttttatgtcggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataagtgg 43236224  T
Q  109 gtgtgttct--------agcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     || |||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43236225 atgcgttctaggcttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaagtggataactaaaaagtgg 43236324  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43236325 ttaaatacaccttaatgtgttgctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 43236398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 245
Target Start/End: Original strand, 16960254 - 16960489
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16960254 tttttatgtgggagtgttttagcaagatataactaaaaatttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgg 16960352  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16960353 gtgtgttatagcaaatcatataggcatttgctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 16960452  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacata 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16960453 accttaaggtgtagctttgctaaaacactccaacata 16960489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32716603 - 32716356
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32716603 agtgttttatcaagttataactaaaaagttaataaatacatat----gtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagc 32716509  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32716508 aaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttaagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgt 32716409  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32716408 agctttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaacc 32716356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32374753 - 32374492
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| |||||||    
T  32374753 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaaacaagtgg 32374654  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32374653 gtgtgttatagcaaatcctatagacatttgttacgatacacccacttagtttgtagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 32374554  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32374553 accttaaggtgtaac-ttgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 32374492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 52772209 - 52772474
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||    
T  52772209 cccactagtttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgt-ataacacatcttctaaaaaaa 52772307  T
Q  101 g-caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52772308 aacaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttcagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 52772407  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  52772408 gttaaat--------aggtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaattaatgggtgtgttctagcaaaccc 52772474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47131136 - 47130907
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  47131136 cccactagtttttatgtgtgagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaa 47131038  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccactta-ttttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  47131037 ataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtg 47130938  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgcta 230  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47130937 gttaaatacaccctaaggtgtagctttgcta 47130907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51465241 - 51464975
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  51465241 cccattaatttttacgtgg-agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 51465143  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  51465142 -caagtggatgtgttatagcaaatcttacaggcaattgctagaatacacc-acttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaaatgg 51465045  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  51465044 ttaaatacagcctaaggtgtaactttgctaaaacactcccacataaaaa----tgggtgtgttctagcaaaccc 51464975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 28094615 - 28094382
Alignment:
Q  25 ttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28094615 ttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaaacaagtggatgtgttctagcaaat 28094516  T
Q  125 cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagct 224  Q
    ||||||||||              ||||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  28094515 cctataggca--------------cccacttatttttaagaaggagtattttagtaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgtagct 28094430  T
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28094429 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaac 28094382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 274
Target Start/End: Original strand, 14387468 - 14387636
Alignment:
Q  106 tgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14387468 tgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttggcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 14387567  T
Q  206 tacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14387568 tacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcacacggaaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 14387636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20201919 - 20201757
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20201919 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatagaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 20201820  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttta 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20201819 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctataatacacccacttatttttta 20201757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10764809 - 10764558
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  ||||    
T  10764809 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 10764711  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10764710 aactcttatagacattttctagaatacacccactcattttttagaaggtgtgttatagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccctaaggtgt 10764611  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10764610 agctttgttaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtcttctagcaaacc 10764558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 13943351 - 13943498
Alignment:
Q  127 tataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagcttt 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13943351 tataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagcttt 13943450  T
Q  227 gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13943451 gttaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 13943498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16005796 - 16005528
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  16005796 cccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacctcaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 16005697  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
    |  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||     
T  16005696 at-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagta 16005599  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16005598 gttaaatacaccttaagatgtagc-ttgttaaaacacttctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 16005528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 34515114 - 34515362
Alignment:
Q  22 gtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  | ||| || |||||  |||||  |||||||||| |  ||||    
T  34515114 gtgttttagcgaagatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacgcatcttcttaaaaaaataagtgggtgtatgttagc 34515213  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34515214 aactcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 34515312  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34515313 agc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttatagcaaa 34515362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 13157557 - 13157791
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaa---atcctatagg 132  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  ||||||   |||||||||     
T  13157557 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactgatcctataga 13157654  T
Q  133 catttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaa 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13157655 catttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaa 13157752  T
Q  233 acactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13157753 acactcccacataaaaactagtaggtgtgttctagcaaa 13157791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 266
Target Start/End: Original strand, 26842983 - 26843224
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| | ||||||| |||||  |||   ||||||||||||  ||||    
T  26842983 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacacacattctaataaat--aagtgggtgtgtgttagc 26843080  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  26843081 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaagttgt 26843179  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 266  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26843180 agc-ttgctaaaacactcacacataaaaactagttggtgtgttcta 26843224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28454915 - 28454667
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  28454915 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaagctgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaa--aagtgggtgtatgttagc 28454818  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||    
T  28454817 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaacagtagttaaatataacttaaggtgt 28454719  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacat--aaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28454718 agc-ttgctaaaacactcccacataaaaaaactagtgggtgtgctctagcaaa 28454667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 271
Target Start/End: Original strand, 463360 - 463544
Alignment:
Q  83 acacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaag 182  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  463360 acacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaag 463457  T
Q  183 tgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    | | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  463458 tta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 463544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 12010699 - 12010567
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtg--tatgttgcgataacacaccttctagaaa 98  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||    
T  12010699 cccactagtttttatgtggcagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatatgttgttataacacaccttctaaaaa 12010600  T
Q  99 aagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatag 131  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12010599 aaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctatag 12010567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Original strand, 16073423 - 16073650
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  16073423 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaaaaaataagtgggtgtttgttagc 16073522  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  16073523 aactcctacaggcatttgttatgatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacacgttaaggtgt 16073621  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaac 250  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  16073622 aac-ttgctaaaacacacccacataaaaac 16073650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Original strand, 27348095 - 27348333
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||     
T  27348095 ccactagtttttatgtgggagagttttatcaagttataactaaaaagttgataaatacaccttaaggtgtat-ttgctataacacacct--tataaaaaa 27348191  T
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 201  Q
     || ||||| |||  |||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||    
T  27348192 taaatgggtatgtgttagcaactcttata-gcatttgttagaatacaccaacttattttttagaagaagtattttagcaaatg-ataactaaaaaatagt 27348289  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataa 246  Q
    ||| |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  27348290 taagtacatcttaagttgtagc-ttgttcaaacactcctacataa 27348333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 270
Target Start/End: Original strand, 6192424 - 6192656
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt--atgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 133  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| |||||| ||||   ||||||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  6192424 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaat--aagtgggtgtgtgttagcaactcctatatgc 6192521  T
Q  134 atttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6192522 atttgctagaatacacccacttatattttagaaggtgtgtttcagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaa 6192619  T
Q  234 cactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 270  Q
     |||   |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6192620 tactatgacataaaaactagtggatgtgttccagcaa 6192656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8643203 - 8642960
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||   ||| ||||| || ||||||| | ||||||||||| | ||||   |||||||||| |  ||||    
T  8643203 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaa---cactttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcaaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 8643109  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |  |||||| |||    
T  8643108 aactcctatacgcatttgctataatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataaccaaaaagtagttaaatgcgccttaagatgt 8643010  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8643009 agc-ttgctaaaacactcccatataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 8642960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32156178 - 32155947
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||||||||| || ||||||| | |||||   ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||| || ||||    
T  32156178 tataactaaaaaattgttaaatgcaccttaagatgaatgttgctaaaacaccgtttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctgtatgcat 32156081  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  32156080 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtgttttagcaagt-tataaataaaaagtagttaaatacatcctaaggtgtagc-ttgctaaaaca 32155983  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32155982 ttcacacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaa 32155947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 50559250 - 50559481
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   || | | ||| |  |||||| ||||||||||||    
T  50559250 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aaatagatgtatgttagcaactcctataggcat 50559347  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||| |||   || ||||||||||| | |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||| |||||||||    
T  50559348 ttgttaggatacgcccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtttagctt-gctaaaaca 50559445  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50559446 ctcctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 50559481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51432057 - 51431809
Alignment:
Q  22 gtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  |||     
T  51432057 gtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggttaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagg 51431959  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |  |||||| |||||   ||||||| || |||||||||    
T  51431958 aactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaaat-tataactaaaaaaacagttaaatgcaccttaaggtg 51431860  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51431859 taac-ttgctaaaacactccaacataaaaactagtgggtgtgttctggcaaa 51431809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Original strand, 32994250 - 32994402
Alignment:
Q  117 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaag 216  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||| || ||||||    
T  32994250 tagcaaatcatatggccatttgctagaatacactcatttattttttagaatatgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatgcatcttaag 32994348  T
Q  217 gtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32994349 gtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 32994402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23413845 - 23413600
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| || |  ||||||||||| |  ||||    
T  23413845 gtgttttagcaaatatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaata--caagtgggtgtatgttagc 23413748  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||   |   ||  ||||| || | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23413747 aactcctatgaacatttgctagaatacatccacttattttttt--aggtgtgctttaggaattta-taactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgt 23413651  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23413650 agctt-gctaaaacacccccacataaaaactagtgggtgtcttctagcaaac 23413600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 104 - 271
Target Start/End: Original strand, 27787867 - 27788033
Alignment:
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 203  Q
    ||||||||| |  |||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27787867 agtgggtgtatgttagcaactcttataggaatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtta 27787965  T
Q  204 aatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacat-aaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27787966 aatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaaaatagtgggtgtgttctagcaaa 27788033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 158399 - 158641
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  || ||| ||| |  ||||    
T  158399 gtgttttagcaaagataaaactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctt-aaaaattaaatggatgtatgttagc 158497  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||   || |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  158498 aactcctataggaatttgctataattcacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagctaaatacaccttaaggtgt 158596  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
     || ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  158597 tgc-ttgctaaaacactccc-tataaaaattagtgggtgtgttctag 158641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13264699 - 13264497
Alignment:
Q  63 ttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||||| ||| |  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13264699 ttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaat--aagtggatgtatgttagcaactcatataggcatttgctaggatacacccacttatttttt 13264602  T
Q  163 agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgt 262  Q
    ||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  13264601 agaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccac--taaaactagtgggtgtgt 13264506  T
Q  263 tctagcaaa 271  Q
    |||||||||    
T  13264505 tctagcaaa 13264497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 14387221 - 14387485
Alignment:
Q  3 cactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||| ||||      
T  14387221 cactagtttttatgtgggagtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttgaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatcttctaaaaaat- 14387319  T
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 201  Q
     || ||||||  |  |||||  |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||   || ||||| ||||| | |||||||||| | ||    
T  14387320 -aaatgggtgcatgttagcagctcctatagccatttactagaatacatccatttattttt-agaaggtgtgttttaacaagtta-taactaaaaaatagt 14387416  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14387417 taaatgcaccttaaggtgtagctt-gctaacacactcccacataagaactaatgggtgtgttctagcaaa 14387485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 28646733 - 28646847
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||    
T  28646733 tttttatgtaggagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaacaaacaagtgg 28646832  T
Q  109 gtgtgttctagcaaa 123  Q
    |||||||||||||||    
T  28646833 gtgtgttctagcaaa 28646847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41146460 - 41146214
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| |||||  |||   ||||||| || |  || |    
T  41146460 gtgttttagcaaatatataactaaaaggttgctaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattctaagaaat--aagtgggcgtatgttaac 41146363  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||   || ||||||||||| | |||||||||||| || |||| || ||||||||||    
T  41146362 aactccaatagacatttgctaggatatacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgt 41146264  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41146263 agctt-gctaaaacactcccatataaaaactagtgggtgttttctagcaaa 41146214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42200084 - 42199847
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| ||| || ||||    
T  42200084 cccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatcttttaaaaaa 42199985  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
       |||| ||||| |  |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||     
T  42199984 t--aagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcatttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagta 42199888  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactccca 241  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42199887 gttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactccca 42199847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42208952 - 42208715
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||| ||| || ||||    
T  42208952 cccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtaaatgttgctaaaacacatcttttaaaaaa 42208853  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
       |||| ||||| |  |||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||     
T  42208852 t--aagtaggtgtatgttagcaactcttacaggcatttgctagaatacacacacttaatttttagaaggtgtattttagcaagt-tataactaaaaagta 42208756  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactccca 241  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42208755 gttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactccca 42208715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45818990 - 45818746
Alignment:
Q  23 tgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||| ||| |  |||||    
T  45818990 tgttttagcaaatatataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgg-tgtatgttagca 45818893  T
Q  122 aatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgta 221  Q
    | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||| || | | |||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||    
T  45818892 actcatatagacatttgctataatacacccacttattttttagaagttgtgctttagaaaatta-taactaaaaagaagttaaaaacaccttaag-tgta 45818795  T
Q  222 gctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45818794 gctt-gctaaaacactccgacataaaaactagtgggtgtattctagcaaa 45818746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12010569 - 12010475
Alignment:
Q  176 tagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12010569 tagcaagtaaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaa-actcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 12010475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Original strand, 36389459 - 36389629
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  36389459 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 36389556  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 209  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  36389557 ttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 36389629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 271
Target Start/End: Original strand, 3979443 - 3979610
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  |||| ||||| | |||||||||||| |||    
T  3979443 aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttaacaagtta-taactaaaaagtagtt 3979541  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccaca-taaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3979542 aaaaacatcttaagatgtagatt-gctaaaacactcccacaataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 3979610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 24770616 - 24770861
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||  |||||| | ||||||| | || | |||||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  24770616 gtgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacat-ttaaggggaatgttgctaaaataaaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 24770712  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||   || ||||||||||| | |||||||||||| || |||| || |||||| |||    
T  24770713 aacccctataggcatttgctaggatacacccacttattcttttgaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagtgaaatgcaccttaagatgt 24770811  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24770812 agctt-gctaaaacactctcacataaaaactagtgagtgtgttctaccaaa 24770861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 253
Target Start/End: Original strand, 34306440 - 34306657
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || |||| | ||||| | ||||| ||||   ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  34306440 tataattaaaaagttgctaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcattctaaaaaat--aagtgagtgtatgttagcaactcctataggcat 34306537  T
Q  136 ttgctagaatacac----ccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaa 231  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||||||   ||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || || |    
T  34306538 ttgctagaatacactcacccacttattttttagaagttgtgctttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttcctga 34306635  T
Q  232 aacactcccacataaaaactag 253  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  34306636 aacactccgacataaaaactag 34306657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 5491602 - 5491833
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||  ||||||   |||||  |||||| ||||   |||||| ||| |  |||||| |||||||| |||    
T  5491602 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaagtgattgttgctgaaacactacttctaaaaaat--aagtggatgtatgttagcaactcctatagacat 5491699  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||    
T  5491700 ttactagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtatc-ttgctaaaaca 5491797  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    | || | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5491798 cacctatataaaaattagtgggtgtgttatagcaaa 5491833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 271
Target Start/End: Original strand, 4158116 - 4158341
Alignment:
Q  44 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaga 143  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||| ||| |  |||||| ||||||| ||||||| |||     
T  4158116 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtggatgtatgttagcaactcctataagcatttgttagg 4158213  T
Q  144 atacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgct-aaaacactcccac 242  Q
    | |||||||||||||||||| ||   || |||||||| ||  ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4158214 aaacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaggt-tataactaaaaaataattaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaacactcccac 4158311  T
Q  243 at-aaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  4158312 ataaaaaactagcgagtgtgttctagcaaa 4158341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 163
Target Start/End: Original strand, 50797648 - 50797788
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||  ||||| ||||||||  |||||  |||||||||| |  ||||    
T  50797648 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaacaaatactccttgagatgtatgttgttataacccaccttct--aaaaaataagtgggtgtatgatagc 50797745  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttta 163  Q
    || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  50797746 aactcctataagcacttgttagaatatacccacttatttttta 50797788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 13157266 - 13157412
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||   ||||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  13157266 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacactaattctaaaaaaaataagtgggtgtatgttagc 13157365  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaa 167  Q
    || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13157366 aactcctataggcatttgctataattcacccacttattttttagaaa 13157412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2965405 - 2965334
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2965405 cccactagtttttatgtcggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 2965334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24190954 - 24190757
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagca-agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtg 107  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||     
T  24190954 tttttatgtgataatgttttagcagagttataattaagaagttcataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacaccttct--aaaaaataagta 24190857  T
Q  108 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccact--tattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 205  Q
     |||| |  |||||  | ||||| ||||||||||||||| | | |||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||    
T  24190856 agtgtatattagcatcttctatatgcatttgctagaatagaacgacttatattttttagaaggagtattttatcaagtgaa-aactaaaaaatgattaaa 24190758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33675899 - 33675786
Alignment:
Q  155 tattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagt 254  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  33675899 tattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagc-ttgctaaaatac-cccacataaaaactagt 33675803  T
Q  255 gggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| |||||||    
T  33675802 gggtgtgttttagcaaa 33675786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3273543 - 3273402
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | | ||| | ||||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  3273543 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaagcactcattctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 3273445  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttta 163  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3273444 aactcctataggcatttgttagaatgcacccacttatttttta 3273402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33676209 - 33676084
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||| |||    
T  33676209 tataattaataagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgctagcaactcctatagacat 33676111  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33676110 ttgttaggatacacccacttatttttt 33676084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 237
Target Start/End: Original strand, 47130797 - 47130907
Alignment:
Q  126 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctt 225  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |  |||||||| || | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  47130797 ctatgggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaatgtgcgttttagcaggtta-taactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtagctt 47130895  T
Q  226 tgctaaaacact 237  Q
    ||||||||||||    
T  47130896 tgctaaaacact 47130907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 13385924 - 13385970
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13385924 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 13385970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 27389679 - 27389725
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27389679 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 27389725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 2965373 - 2965419
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2965373 ttgctaaaacactccgacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 2965419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20411192 - 20411146
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20411192 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 20411146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27255647 - 27255601
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27255647 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 27255601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 52772238 - 52772192
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52772238 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaaccc 52772192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Original strand, 3099558 - 3099631
Alignment:
Q  26 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  3099558 tttatcaagttaaaactaaaaagttgataaatacaccttaaaatgtatgttgctataacacacattctaaaaaa 3099631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 155
Target Start/End: Original strand, 20201700 - 20201817
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggca 134  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |  || |||||  |||||||||| || ||||||||  ||||||| |    
T  20201700 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacat--tataaaaaataagtgggtgtattatagcaaatgtctatagg-a 20201796  T
Q  135 tttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  20201797 tttgctagaacacacccactt 20201817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 90
Target Start/End: Original strand, 5491734 - 5491802
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacacct 90  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||    
T  5491734 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgtatcttgctaaaacacacct 5491802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15660525 - 15660477
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaat 57  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15660525 tttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaat 15660477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 27787933 - 27788036
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  | | |||||   ||||||||||||||||||    
T  27787933 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccac-ataaaaaaatagtgggtgtgttctagca 27788031  T
Q  122 aatcc 126  Q
    |||||    
T  27788032 aatcc 27788036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Original strand, 463445 - 463546
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  463445 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ctagtgggtgtgttctagca 463542  T
Q  122 aatc 125  Q
    ||||    
T  463543 aatc 463546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Original strand, 1805176 - 1805223
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1805176 tttgctaaaacactccaacataaaaactagtgagtgtgttctagcaaa 1805223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14387253 - 14387202
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  14387253 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgagtgtatcctagcaaaccc 14387202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 32151931 - 32151994
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32151931 aagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaa 32151994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Original strand, 13157416 - 13157477
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaa 248  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13157416 ataactaaaaaatagttaaatacaccctaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaa 13157477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 13157692 - 13157742
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  13157692 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 13157742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 20201887 - 20201933
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20201887 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctaacaaa 20201933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 162
Target Start/End: Original strand, 32151995 - 32152049
Alignment:
Q  108 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32151995 ggtgtgttttagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttatttttt 32152049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34386360 - 34386314
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  34386360 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtattctagcaaa 34386314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 34825628 - 34825554
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataa 83  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| ||||    
T  34825628 tttttacgtgggagtgttttagcaaattatcactaaaaagttgataaatacatattgaggtgtatgttgctataa 34825554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36817645 - 36817599
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36817645 ttgctaaaacactctcacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 36817599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39424264 - 39424219
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39424264 ttgctaaaacactcc-acataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 39424219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 47131104 - 47131150
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47131104 ttgctaaaacactcacacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaa 47131150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Original strand, 10558271 - 10558312
Alignment:
Q  230 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10558271 aaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 10558312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 32994151 - 32994239
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacacct 90  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  32994151 cccactagtttttatttaggagtgttttagcaaat-ataactaaaaagttgttaagtacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct 32994239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 28704560 - 28704439
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||  |||||  || || |||| |  ||||    
T  28704560 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattct--aaaaaataaatgagtgtatattagc 28704463  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaa 144  Q
    || ||||||| |||||||||||||    
T  28704462 aactcctataagcatttgctagaa 28704439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 47130983 - 47131042
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47130983 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 47131042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13264594 - 13264494
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||  |||| | ||||| ||  ||    ||| | ||||||||||||||||||    
T  13264594 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccact----aaaactagtgggtgtgttctagca 13264499  T
Q  122 aatcc 126  Q
    |||||    
T  13264498 aatcc 13264494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 117 - 164
Target Start/End: Original strand, 32144130 - 32144177
Alignment:
Q  117 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttag 164  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32144130 tagcaactcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttag 32144177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 4158240 - 4158290
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  4158240 gtgttttagcaggttataactaaaaaataattaaatacaccttaaggtgta 4158290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 6192558 - 6192608
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  6192558 gtgtttcagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 6192608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 10558197 - 10558263
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacaca 87  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  10558197 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaca 10558263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 32374729 - 32374775
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  32374729 ttgctaaaacactcccacataaaaacaaatggatgtgttctagcaaa 32374775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 33675884 - 33675834
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  33675884 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgta 33675834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Original strand, 34306580 - 34306626
Alignment:
Q  26 tttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34306580 tttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 34306626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43236149 - 43236103
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43236149 ttgctaaaacactccgacataaaaactaatgagtgtgttctagcaaa 43236103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12705781 - 12705744
Alignment:
Q  234 cactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12705781 cactcccacataaaaactagttggtgtgttctagcaaa 12705744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 1805056 - 1805115
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1805056 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 1805115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39424385 - 39424326
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39424385 aagttggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 39424326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 260
Target Start/End: Original strand, 12010667 - 12010702
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12010667 ttgctaaaacactgccacataaaaactagtgggtgt 12010702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 161
Target Start/End: Original strand, 13385802 - 13385860
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttt 161  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13385802 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttattttt 13385860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 15660505 - 15660548
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaac-tagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15660505 taaaacactcccacataaaaaaatagtgggtgtgttctagcaaa 15660548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 32144057 - 32144120
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| |  |||||| || |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32144057 aagtgggtgtatgttagcaactcttatatgcatttgctgggatacacccacttattttttagaa 32144120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 463449 - 463367
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  463449 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 463367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 100
Target Start/End: Original strand, 10368051 - 10368148
Alignment:
Q  3 cactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  || | |||||||||||  ||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  10368051 cactagtttttatgtgggagtgttttaataaagatataactaaaat-ttgttaaatacaccttaagttgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaa 10368148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 10368220 - 10368258
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10368220 ttgctaaaacacttccacataaaaattagtgggtgtgtt 10368258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28646757 - 28646711
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  28646757 ttgctaaaatactcctacataaaaactaatgggtgtgttctaacaaa 28646711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32994184 - 32994134
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  32994184 tttgctaaaacactcctaaataaaaactagtgggtgtatcctaacaaaccc 32994134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 40
Target Start/End: Original strand, 34386329 - 34386367
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataa 40  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34386329 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataa 34386367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 10368252 - 10368219
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaag 34  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10368252 cccactaatttttatgtggaagtgttttagcaag 10368219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16960278 - 16960241
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16960278 ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgtgtgtgt 16960241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 27389555 - 27389622
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggc---atttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27389555 aagtgggtgtattctagcaaatgcctataggattgatttgctagaacacacccacttgttttttagaa 27389622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28182234 - 28182162
Alignment:
Q  132 gcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 205  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||  ||||||||||||| ||||||    
T  28182234 gcatttgctaaaatacaccaacttatttttttgaaagagtgttttaacatgt-cataactaaaaagtagttaaa 28182162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 76
Target Start/End: Original strand, 463018 - 463058
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgtt 76  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  463018 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtt 463058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 12864360 - 12864419
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12864360 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatatg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 12864419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 28094397 - 28094429
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28094397 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 28094429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 32374506 - 32374542
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagtta 37  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32374506 cccactagtttttatgtggaagtgttttagcaagtta 32374542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 32716474 - 32716533
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32716474 aagtgggtgtattctagcaaatgcctataag-atttgctagaacacacccacttgtttttt 32716533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 36389576 - 36389513
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36389576 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 36389513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 36817767 - 36817708
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36817767 aagtgtgtgtattctagcaaattcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 36817708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Original strand, 42200051 - 42200087
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42200051 tttgctaaaacactcccacttaaaaattagtgggtgt 42200087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Original strand, 42208919 - 42208955
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42208919 tttgctaaaacactcccacttaaaaattagtgggtgt 42208955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 47130843 - 47130891
Alignment:
Q  24 gttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||    
T  47130843 gttttagcaggttataactaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgta 47130891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 52772363 - 52772304
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52772363 aagtgggtgtattctagcaaatgcctataag-atttgctagaacacacccacttgtttttt 52772304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 74)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 31132842 - 31133112
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  31132842 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctatagcacaccttctagaaaaa 31132941  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31132942 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 31133041  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31133042 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 31133112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29646447 - 29646175
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29646447 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaa-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 29646349  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29646348 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 29646249  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29646248 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgttaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 29646175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 27828273 - 27828550
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataa----cacaccttctaga 96  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  27828273 cccactaattttaatgtggaagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctaga 27828372  T
Q  97 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828373 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaa 27828472  T
Q  197 gtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27828473 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaagctagtgggtgtgttctagcaaaccc 27828550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 9955761 - 9956021
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9955761 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaa 9955860  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9955861 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttaacaaatgaataactaaaaagtgg 9955960  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtg 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9955961 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtg 9956021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 15962703 - 15962977
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15962703 cccactaatttgtatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 15962802  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15962803 gcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcattttctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgtataactaaaaagtgg 15962902  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacat-aaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15962903 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 15962977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 1369873 - 1370137
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  1369873 tttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaa-caagtgg 1369971  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1369972 gtgtgttctaacaaatcctatagacatttgctagaatacatccatttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 1370071  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1370072 accttaaggtgtagctttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 1370137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 11100346 - 11100616
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  11100346 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctaacaaaa 11100445  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11100446 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 11100545  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  11100546 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtagatgtgatctagcaaa 11100616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 16599035 - 16599308
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16599035 cccactaatttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 16599134  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16599135 acaagttggtgtgttttagtgaatcctataggcatttactagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtta 16599234  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16599235 ataaatacaccttaaggtgtagctttggtaaaacactcccacataaaaactagtgagtgtgttctagcaaaccc 16599308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Original strand, 4184228 - 4184498
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||||||| |||||     
T  4184228 ccactaatttttatgtgagagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt--acgttgttataacgcaccttctaaaaaaaa 4184325  T
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4184326 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 4184425  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa-ctagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4184426 taaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaacctagtggatgtgttctagcaaacc 4184498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8172107 - 8171836
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  8172107 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaaaaa 8172008  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  8172007 -caagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaacagtgg 8171909  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||||||||   |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8171908 ttaaatacactctaagttatagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtggatgtgttctagcaaacc 8171836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 258
Target Start/End: Original strand, 10777911 - 10778166
Alignment:
Q  3 cactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| |    
T  10777911 cactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaac 10778010  T
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10778011 aagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacatttgctaggatacacccacttggtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgttt 10778110  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggt 258  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10778111 aaatacaccttaagatgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggt 10778166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Original strand, 5187744 - 5188005
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  ||||||    
T  5187744 tttttatgtaggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaat-aagtgg 5187842  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5187843 gtgtgttctagcaaaacctacaggcatttgctagaatacacccacttattttttagattgagtattttaacaaatgaataactaaaaagtgattaaatac 5187942  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    | | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5187943 a-cctaagatgtagatttgctaaaacacttccacataaaaattaatgggtgtgttctagtaaac 5188005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 26667834 - 26668026
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||    
T  26667834 actagtttttatatggaagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaca 26667933  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26667934 agtgggtgtgttctagcaaattctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 26668026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 274
Target Start/End: Original strand, 20755416 - 20755594
Alignment:
Q  96 aaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaa 195  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20755416 aaaaaacaagtgaatgtgttctagcaaatcctatagacgtttgctagaatacacgcacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaa 20755515  T
Q  196 agtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20755516 agtggttaaatacaccttaaggtatattttttctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 20755594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33730725 - 33730482
Alignment:
Q  22 gtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |   | || ||||  |||    
T  33730725 gtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaataa---gagtatgtt--agc 33730631  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  33730630 aactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgt 33730532  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730531 agctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 33730482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 15881892 - 15882018
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15881892 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 15881991  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatccta 128  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  15881992 -caagtgggtgtgttctagcaaatccta 15882018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 273
Target Start/End: Original strand, 26211248 - 26211514
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||| |||||| || ||||| ||||   |    
T  26211248 actagtttttatgtgggagtgttttagtaagttatagctaaaaagttgataaatacacctcggggcgtatgttgctataacatacgttctaaaaaat--a 26211345  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 203  Q
    | ||||||| |  |||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||| || |    
T  26211346 aatgggtgtatgttagcaattcttgtaggcatttgctagaatacacctacttattttttagaagaagtattttagcaaatg-ataattaaaaagtagtca 26211444  T
Q  204 aatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacat-aaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26211445 agtacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccatataaaaaactagtgaatgtgttctagcaaacc 26211514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 4898432 - 4898674
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||   |||||||||| |  ||||    
T  4898432 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttttaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 4898529  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  4898530 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgt 4898628  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4898629 agc-ttgctaaaacactcatacataaaaattagtggatgtgttctag 4898674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 30525341 - 30525589
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||  ||| |||||||||||||| || |||| | || |||||||||| || |   |||||||||| |  ||||    
T  30525341 gtgttttagcaaatatacaactaaaaagttgttaa-tacaccttaaggtgaatcttgctaaaatacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagc 30525437  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  30525438 aactcctataggcatttgctagaatacactcacttattttttagaaagtatgttttagcaaatta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgc 30525536  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30525537 agctt-gctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaaccc 30525589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18102896 - 18102649
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||  | |||||||||| || |||||  |||| ||||| |   |||    
T  18102896 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgttaaaacacaccttttaaaaaaat-aagttggtgtatgtcagc 18102798  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||    
T  18102797 aacttctataggcatttgctatgatacacccacttattttttagaatgtgtattttagcaagtta-taactaaagagtagttaaatacaccttcaggtgt 18102699  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18102698 agctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtcgatgtgttctagcaaa 18102649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4838473 - 4838236
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  4838473 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 4838376  T
Q  136 ttgctagaa------tacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgct 229  Q
    || |||| |      ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  4838375 ttactaggaataggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaaatacttagatacaccttaaggtgtagctt-gct 4838278  T
Q  230 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4838277 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 4838236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10196692 - 10196574
Alignment:
Q  5 ctaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaa 104  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10196692 ctaatttttatgtgagagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacatcttctagaaaaagcaa 10196593  T
Q  105 gtgggtgtgttctagcaaa 123  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  10196592 gtgggtgtattctagcaaa 10196574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14488505 - 14488259
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||| | ||||| ||||   ||||| |||| |  ||||    
T  14488505 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactcattctaaaaaat--aagtgagtgtatgttagc 14488408  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||    
T  14488407 aactcatataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacattctaaggtgt 14488309  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  14488308 agc-ttactaaaacactcctacataaaatctagtggacgtgttctagcaaa 14488259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15718437 - 15718169
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | |||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  15718437 cccactagtttttatgtgggagtgttgtagcaaagatataacgaaaaatttgttaaatacattttaaggtgaatgttgctaaaacacactttcta-aaaa 15718339  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
    |  ||||||||||    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||   || ||||| ||| |  |||||||||||||     
T  15718338 attaagtgggtgtaagttagcaactcctataggcatttgttagaatacatccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagta 15718240  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15718239 gttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacattcccacataaaaactattgagtgtgttctagcaaa 15718169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 171 - 274
Target Start/End: Original strand, 15882021 - 15882124
Alignment:
Q  171 tattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15882021 tattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcataaggtgtagctttgttaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 15882120  T
Q  271 accc 274  Q
    ||||    
T  15882121 accc 15882124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 11210283 - 11210396
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||    
T  11210283 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaataagtgggtgcgttctagc 11210381  T
Q  121 aaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||    
T  11210382 aaatcctataggcat 11210396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 274
Target Start/End: Original strand, 10315306 - 10315442
Alignment:
Q  139 ctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaa-taactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacact 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  10315306 ctagaatacactcacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaaataactaaaaggttgttaaatacaccctaatgtgtagctttgctaaaacact 10315405  T
Q  238 cccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10315406 cccacataaaaactagcgggtgtgttctagcataccc 10315442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25061860 - 25061622
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  25061860 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaag-tgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 25061764  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  25061763 aactcctataggcatttgctaggatacaccaacttatttgttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaataca-tttaaggtgt 25061666  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| |||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||    
T  25061665 agc-ttgctaaaacactcc------aaaactagtgggtgtgttctagcaaa 25061622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 24022961 - 24022847
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  24022961 tttttatgtaggagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgg 24022862  T
Q  109 gtgtgttctagcaaa 123  Q
    |||||||||| ||||    
T  24022861 gtgtgttctaccaaa 24022847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9406805 - 9406543
Alignment:
Q  6 taatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaag 105  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    ||||||||||||| |||||  ||     
T  9406805 taatttttgtgtaggagtgttttagcaagttataactaaaaagttgataaatacactttgaggtgcatgttgttgcaacacaccttctaaaaaaataaa- 9406707  T
Q  106 tgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 205  Q
    | ||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |     
T  9406706 taggtgtatattagcaattcctatatgcatttgctagaatacacccacttattgtttacaatgagtgtttcagcaagtgaa-aactaaaaagtagttcag 9406608  T
Q  206 tacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    | || | ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||| |||| | |||||||    
T  9406607 tgcaccataaagtgtagc-ttgctaaaacactaccgcataaaaattaatggatgtgctttagcaaa 9406543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 103 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18154671 - 18154505
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    || ||||||||||| | |||| ||||| | |||    
T  18154671 aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttatagacggtgtgttttagcaagtta-taacaaaaaaatagtt 18154573  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18154572 aaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 18154505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 263
Target Start/End: Original strand, 3437979 - 3438217
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| | || ||| |||||| ||||   | |||||||| |  || |    
T  3437979 gtgttttagcaaatatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgctgctaaaatacaacttctaaaaaat--atgtgggtgtatgttacc 3438076  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || || ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3438077 aactcttataggcatttgcaaggatatacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 3438175  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 263  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3438176 agctta-ctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgtt 3438217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11742514 - 11742283
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  11742514 tataactaaaaagttgttaaatacattttaaggtgtattttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 11742417  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||  ||   || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  11742416 ttgctaggatacacccatttaattttttaaaggtgtgttttagcaggt-tataactaaaaaatagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 11742319  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11742318 cttcctcataaaaattagtgggtgtgttctaacaaa 11742283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 4898128 - 4898360
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||    |||||| |||||| || ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||| ||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  4898128 tataactaaaaagttgtccaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagttggtgtatgttagcaactcctataggcat 4898225  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaa-gtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaac 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||   || ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| || | |||||||||| |||||||     
T  4898226 ttgctagaatacactcacttattttttattaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaaattgttaaatacacctcatggtgtagctt-gctaaaat 4898323  T
Q  235 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  4898324 actcccacataaaaagtagtgggtgtgttctaacaaa 4898360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 33 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35002085 - 35001995
Alignment:
Q  33 agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35002085 agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacattcta-acaaaacaagtgggtgtgttctagcaaat 35001995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 124 - 271
Target Start/End: Original strand, 11010001 - 11010148
Alignment:
Q  124 tcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaa--aagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgta 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||       |||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11010001 tcctatatgcatttgctagaatacactcactttttttttttttttgaagtgttttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgta 11010099  T
Q  222 gctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11010100 gctt-gctaaaacactcccatataaaaactagtgggtgtgttatagcaaa 11010148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32194260 - 32194176
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32194260 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctta-ctaaaacacttccacatgaaaactagtggatgtgttctagcaaa 32194176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 245
Target Start/End: Original strand, 21969880 - 21970100
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||||  | || | |  ||||| ||||   |||||||||| |  || |    
T  21969880 gtgttttagcaaagatataactaaaatgttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaatataatttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttacc 21969977  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || || ||||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||   |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  21969978 aactcttataaacatttgctagaatacatctacttattttttataaggtgtattttaacaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgt 21970076  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacata 245  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||    
T  21970077 agc-ttgctaaaacacttccacata 21970100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 213 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27902335 - 27902275
Alignment:
Q  213 taaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaa--actagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27902335 taaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaacactagtgggtgtgttctagcaaa 27902275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Original strand, 33311671 - 33311738
Alignment:
Q  41 ctaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33311671 ctaaaaaattaataaatacaccttaaagtatatgttgctataacacatcttctagaaaaagcaagtgg 33311738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15881924 - 15881878
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15881924 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 15881878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Original strand, 8172075 - 8172117
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8172075 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 8172117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9955793 - 9955747
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9955793 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 9955747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11100378 - 11100332
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11100378 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaa 11100332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 29646415 - 29646461
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29646415 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 29646461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31132874 - 31132829
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31132874 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaa 31132829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11100251 - 11100081
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||| ||||  || ||||| |||||| || ||||||| | ||||| | || || ||||||  | ||| ||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  11100251 tataactaaatagttgttacatacagcttaagatgaatgttgctaaaacactcattttaaaaaaagtgaatggttgtatattagcaactcctatatgcat 11100152  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttatt-ttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 206  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  11100151 ttgctagaatgcacccacttatttttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaat 11100081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Original strand, 15718403 - 15718454
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15718403 ctttgctacaacactcccacataaaaactagtgggtgtatcctagcaaaccc 15718454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16599063 - 16599021
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16599063 taaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 16599021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20755400 - 20755358
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20755400 taaaacactcccgcataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 20755358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 26211274 - 26211228
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26211274 ctaaaacactcccacataaaaactagtaggtatgttctagcaaaccc 26211228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 215
Target Start/End: Original strand, 32889636 - 32889715
Alignment:
Q  134 atttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  32889636 atttgctagaatacacccacttattttttaaaagaagtattttaacaaagatataact--aaagtggttaaatacaccttaa 32889715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 4838335 - 4838229
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  4838335 gtgttttagcaagttataactaaaaaatacttagatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ctagtgggtgtgttctagca 4838238  T
Q  122 aatcctata 130  Q
    |||||||||    
T  4838237 aatcctata 4838229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 260
Target Start/End: Original strand, 228035 - 228119
Alignment:
Q  173 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  228035 ttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatataccttaaa-tgtagctt-gctaaaacacttccacatgaaaactagtgggtgt 228119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1369897 - 1369855
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1369897 ttgctaaaacactctcacataaaaacttgtgggtgtgttctag 1369855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Original strand, 8062105 - 8062216
Alignment:
Q  25 ttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat 124  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| | |||| |||||||   ||||   ||||| ||| ||||| |||||    
T  8062105 ttttaacaagttataattaaaaagtgaataaatacactttcacgtgtatgttgctaaaacaaaccttct--taaaaattagtggatgtcttctaacaaat 8062202  T
Q  125 cctataggcatttg 138  Q
    | ||||||||||||    
T  8062203 cttataggcatttg 8062216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15962731 - 15962689
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  15962731 taaaacactcccacatacaaattagtgggtgtgttctagcaaa 15962689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27828305 - 27828259
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27828305 ttgctaaaacacttccacattaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 27828259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4184256 - 4184211
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4184256 ctaaaacactctcacataaaaattagtggctgtgttctagcaaacc 4184211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 271
Target Start/End: Original strand, 27902349 - 27902390
Alignment:
Q  230 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27902349 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgcgttatagcaaa 27902390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Original strand, 11010048 - 11010099
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  11010048 agtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgta 11010099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18154604 - 18154503
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  18154604 gtgttttagcaagttataacaaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ctagtgggtgtgttctagca 18154507  T
Q  122 aatc 125  Q
    ||||    
T  18154506 aatc 18154503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 4898261 - 4898311
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||    
T  4898261 gtgttttagcaagttataactaaaaaattgttaaatacacctcatggtgta 4898311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10777941 - 10777911
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10777941 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 10777911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 20755372 - 20755418
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaa 47  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20755372 cccactagtttttatgcgggagtgttttaacaagttataactaaaaa 20755418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26667863 - 26667817
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26667863 ttgctaaaacacttccatataaaaactagttggtgtgttctatcaaa 26667817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 157
Target Start/End: Original strand, 26668062 - 26668100
Alignment:
Q  119 gcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  26668062 gcaaatcctataggcatttgttaaaatacacccacttat 26668100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9955915 - 9955863
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9955915 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccactt 9955863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 29646294 - 29646346
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29646294 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccactt 29646346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31132996 - 31132944
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31132996 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccactt 31132944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4184379 - 4184320
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4184379 aagttggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 4184320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5187889 - 5187830
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5187889 aagtgggtgtattctagcaaatgcctgtaggt-tttgctagaacacacccacttatttttt 5187830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 8171954 - 8172013
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8171954 aagtgggtgtattctagcaaatgcctataag-atttgctagaacacacccacttgtttttt 8172013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 30525472 - 30525393
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaag 182  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  30525472 aagtgagtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatattttagaaggtgtattttagcaag 30525393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6115009 - 6114736
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6115009 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 6114910  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6114909 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtgg 6114810  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6114809 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccc 6114736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 6109131 - 6109404
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6109131 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 6109230  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6109231 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaatacacccatttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 6109330  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6109331 ttaaatacaccttaaggtgtagcgttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 6109404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21727873 - 21727600
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  21727873 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttataaaaaaa 21727774  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21727773 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctacaggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtaaataactaaaaagtgg 21727674  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21727673 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 21727600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7848754 - 7848482
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7848754 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtacgttgctataacacaccttctaaaaaaa 7848655  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7848654 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 7848556  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7848555 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 7848482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7521586 - 7521313
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7521586 cccactaatttttatgtgggagtattttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 7521487  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7521486 gcaagtgggtgtattctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaagaatattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 7521387  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7521386 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacaaacccacataaaaactagtgggtgtattctagcaaaccc 7521313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 6748617 - 6748889
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6748617 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 6748716  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6748717 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttcttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 6748815  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6748816 ttaaatacaccttaaggtgtaactttgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 6748889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47461922 - 47461649
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  47461922 cccactagtttttatgtgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctattaaaa 47461823  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47461822 ttaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 47461723  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47461722 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 47461649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11460377 - 11460105
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  11460377 cccactagtttttatgtgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 11460278  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11460277 -caagtgagtgtgctctagcaaatcctataggcatttgctagaatgcacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 11460179  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11460178 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagtaaaccc 11460105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12896865 - 12896592
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  12896865 cccactagtttttatgtggaagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaa 12896766  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12896765 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttaatttttggaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 12896666  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12896665 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtttgttctagcaaaccc 12896592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8815558 - 8815287
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8815558 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 8815459  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8815458 -caagtgggtgtgttttagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctacttattttt-agaaggagtattttcgcaagtgaataactaaaaagtgg 8815361  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8815360 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 8815287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4043863 - 4043583
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4043863 cccactaatatttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 4043764  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagc-------aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaa 193  Q
    |||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4043763 gcaagtgggtgtgttctaacttctaacaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaa 4043664  T
Q  194 aaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4043663 aaagtggttaaatacaccttaaggtgtagatttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 4043583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 45059499 - 45059772
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||  ||||    
T  45059499 cccactagtttttatgtgggagtgttttaacaggttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgttataacacacattctaacaaaa 45059598  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45059599 ataagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 45059698  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45059699 ttaaatacactttaaggtgtagctttgctaaaacactcccaaataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 45059772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 56 - 274
Target Start/End: Original strand, 26158254 - 26158472
Alignment:
Q  56 atacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26158254 atacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacctactt 26158353  T
Q  156 attttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 255  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26158354 attttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagatttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 26158453  T
Q  256 ggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26158454 ggtgtgttctagcaaaccc 26158472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Original strand, 994689 - 994960
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  994689 cccactaatttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgctgctataacacaccttctaaaaaaa 994788  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  994789 -caattgggtgtgttctaccaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtgg 994887  T
Q  201 ttaaataca-gcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    |||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  994888 ttaaatacactctaagggtgtagctttgctaaaacattcccacataaaaattagtgggtgtgttatagcaaac 994960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 40 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37504729 - 37504496
Alignment:
Q  40 actaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  37504729 actaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgt 37504631  T
Q  140 tagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37504630 tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaagtgaataactaaaaagtggttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttc 37504531  T
Q  240 cacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37504530 cacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 37504496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38798207 - 38797931
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38798207 cccactagtttttatgcgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaagtgtatgttgcgataacacaccttctaaaaaaa 38798108  T
Q  101 g-caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38798107 aacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaaaatacatccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtg 38798008  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca--ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38798007 gttaaatacacattaaggtatagctttgttaaaacactctctcacataaaaactagtgagtgtgttctagcaaaccc 38797931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Original strand, 994996 - 995251
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||     
T  994996 ccactagtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctgtaacacaccttctaaaaaaa- 995094  T
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  995095 caagtgggtatgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaaccacttatttttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtgg 995194  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtggg 257  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  995195 ttaaatacaccataaggtgtagctttgctaaaacattcccacataaaaactagtggg 995251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27728413 - 27728146
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacac--cttctagaaaaagcaagt 106  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||  ||||    
T  27728413 ttttaatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacacaccttctaacaaaaataagt 27728314  T
Q  107 gggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27728313 gggtgtgttttagcaaatcctataggcatttgcttagatacacccacttagtttttagaaggaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaat 27728214  T
Q  207 acagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27728213 acaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataataactagtgggtgtgttctagcaaaccc 27728146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 26152164 - 26152437
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  26152164 cccactagtttttatgtgagagtgttttagctagttataactaaaaagttaataaatataccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaa 26152263  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26152264 acaagcaggtgtgttctatcaaatcctataggcatttggtaagatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 26152363  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagc-tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26152364 ttaaatacaccttaaggtgtagcttttactaaaacactcccacataaaaactagtgggtatgttctagcaaacc 26152437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 51147977 - 51148249
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtg--gtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaa 98  Q
    ||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||     
T  51147977 cccactagtttttatgtgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacactttctaaaag 51148076  T
Q  99 aagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 198  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51148077 aaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctata-gaatttgctagaacgcacccacttattttttagaatgagtattttagtaagtgaataactaaaaagt 51148175  T
Q  199 ggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51148176 ggttaaatacaacttaaggtgtagctttgctaaaacactcctacat-aaaaccagtgagtgtgttctagcaaacc 51148249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17065952 - 17065685
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||     
T  17065952 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaagaagttaataaatacgtcttaaggtgtatgttattataacacaccttctaaaaaaa- 17065854  T
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17065853 caagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatgtacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggt 17065754  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17065753 taaatacacccgaagatgtagctttgctaaaacact--cacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaac 17065685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 51952421 - 51952165
Alignment:
Q  10 ttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtggg 109  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  51952421 ttttatgtgaaagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaaataagtggg 51952322  T
Q  110 tgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatt-ttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  51952321 tgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaataggttaaatac 51952222  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
              |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51952221 ---------cgtagctttactaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaaccc 51952165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3544495 - 3544246
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||   ||| | || || ||||||||||| |||||||    
T  3544495 agtgttttagcaaattataactaaaaagataataaatacatcttaaggtgtatgttgatataacacg--ttcaaaaataaacaagtgggtgtattctagc 3544398  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3544397 aaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaagaattaaaaagtggttaaatacaccctaaggtg 3544298  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3544297 tagctttactaaaacactcccacataaaaactagtgagtgtgttctagcaaa 3544246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 26152477 - 26152626
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26152477 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 26152576  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacc 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26152577 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacc 26152626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27800666 - 27800419
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  27800666 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaagtgtatgttgctataacacaccttgtaacaaaaacaagtgg 27800567  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    ||||||||||||||||||                  |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27800566 gtgtgttctagcaaatcc------------------tacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 27800485  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    | |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||    
T  27800484 accttaagatgtaactttgctaaaacacttccacataaaaactaacgggtgcgtactagcaaaccc 27800419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 274
Target Start/End: Original strand, 17226270 - 17226414
Alignment:
Q  130 aggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17226270 aggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaaatattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgct 17226369  T
Q  230 aaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17226370 aaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaaccc 17226414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 69 - 271
Target Start/End: Original strand, 2868198 - 2868400
Alignment:
Q  69 tgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaa 168  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||      
T  2868198 tgtatgttgctataacacacattctaacaaaattaagtgggtgttttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatg 2868297  T
Q  169 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagc 268  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  2868298 agtgttttagcaagtgaataaataaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttcaacataaaaactagttggtatgatctagc 2868397  T
Q  269 aaa 271  Q
    |||    
T  2868398 aaa 2868400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 53581744 - 53581513
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  53581744 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 53581647  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  53581646 ttgctaagatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagctt-gctaaaaca 53581549  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53581548 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 53581513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13349335 - 13349089
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |   |||||||||| |  ||||    
T  13349335 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagc 13349238  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  13349237 aactccaataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggcgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgg 13349139  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13349138 agctt-gctaaaacactcccacataaaaaccagtgggtgtgttctagcaaa 13349089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 1375989 - 1376236
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  1375989 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 1376087  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | || |||||||    
T  1376088 aactcctataggcatttgctaggatacatccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatatacctgaaggtgt 1376186  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1376187 agcta-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 1376236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Original strand, 31039549 - 31039798
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||   ||||| |||| |  ||||    
T  31039549 gtgttttagcaaagatataactaaaaatttgttcaatacaccttaaggtgaatgatgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgcgtgtatgttagc 31039646  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31039647 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 31039745  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31039746 agc-ttgctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 31039798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 52654542 - 52654387
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  52654542 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtatatgttgctataacacaccttcta-aaaaa 52654444  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttat 157  Q
      ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52654443 ataagtgagtgtgttctagcaaattctataggcatttgctaaaatacacccacttat 52654387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 3269203 - 3269333
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  3269203 actaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaaca 3269301  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3269302 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 3269333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 33837801 - 33838052
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  33837801 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 33837899  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaa---taactaaaaagtggttaaatacagcttaagg 217  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||| |    ||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  33837900 aactcctatagacatttgctaggatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagttataactaattaaaaagtagttaaatacaccttaagg 33837999  T
Q  218 tgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33838000 tgtagctt-gctaaaacactcctacataaaaactagtgcgtgtgttctagcaaa 33838052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 169 - 274
Target Start/End: Original strand, 21408617 - 21408722
Alignment:
Q  169 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagc 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21408617 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagc 21408716  T
Q  269 aaaccc 274  Q
    ||||||    
T  21408717 aaaccc 21408722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3800397 - 3800150
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||   |||||||||| |  || |    
T  3800397 gtgttttagcaatgatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttaac 3800300  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaa-gtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    ||   ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||    || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3800299 aacatctataagcattttctaggatacacccacttattttttagaaggttgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtg 3800201  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3800200 tagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 3800150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 50912971 - 50913241
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||  ||||| ||||    
T  50912971 cccactaatttttatgtgggagtattttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgataaaacacatattctaaaaaa 50913070  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
       || ||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||  ||| | ||||||||||||     
T  50913071 t--aaatgggtgtatgttagcaactcctacaggcatttgctagaatacacccacttaatttttagaaggtgtgttttagggagtta-taactaaaaagta 50913167  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50913168 gttaaatgtaccttaagatgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtaggtgtgctctagcaaaccc 50913241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 274
Target Start/End: Original strand, 53467358 - 53467592
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| || |   |||| ||||| |  |||||| || | |||||||    
T  53467358 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtggatgttgctaaaacacacattctaaaatat--aagttggtgtatgttagcaactcatgtaggcat 53467455  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || | ||| |||||||    
T  53467456 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtataac-ttgttaaaaca 53467553  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  53467554 ctcccacataaaaactagtaggtatgttctagcaaaccc 53467592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 17226169 - 17226269
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17226169 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 17226268  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  17226269 g 17226269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27360180 - 27359951
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||  | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  27360180 tataactaaaaagttattaaatacaccttagagtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatag-cat 27360084  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||   || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||  | |||||||| |||||| |||||||||    
T  27360083 ttgctagaatacatccacttattttttataaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaa-gtagttaaatgtaccttaaggtatagctt-gctaaaaca 27359987  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27359986 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 27359951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32203362 - 32203111
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtg 107  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    ||| | |||| || ||||| ||||   |||||    
T  32203362 tttttatgtcggagtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgt----tgctaaaacatacattctaaaaaat--aagtg 32203269  T
Q  108 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    ||||| |  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||     
T  32203268 ggtgtatgttagcaactcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactagaaagtagttaaatg 32203170  T
Q  208 cagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagc 268  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32203169 ca-cttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaacactagtgagtgtgttctagc 32203111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36824154 - 36823909
Alignment:
Q  23 tgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  ||| |    
T  36824154 tgttttagcaaagatataattaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagta 36824057  T
Q  122 aatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgta 221  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||   || ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36824056 actccaataggcatttgctagaatacaagaacttgttttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 36823958  T
Q  222 gctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36823957 gctt-gctaaaacactcccacataaaaactagttggtgtgttctagcaaa 36823909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27317825 - 27317593
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataaca-caccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 134  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||||| | || | ||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  27317825 tataactaaaaatttattaaatacaccttagagtgaatgttgctaaaaaaacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggca 27317728  T
Q  135 tttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaac 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  27317727 tttgctagaatacatccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaac 27317630  T
Q  235 actcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  27317629 actcccacgaaaaaactagcgagtgtgttctagcaaa 27317593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8814963 - 8814732
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  8814963 tataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaacttctataagcat 8814866  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||| | | | |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8814865 ttgctagaatacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaagtta-tgattaaaaagtagttcaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaaca 8814768  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8814767 ctcccacataaatcctagtgggtgtgttctagcaaa 8814732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 271
Target Start/End: Original strand, 48765182 - 48765451
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgat---aacacaccttctagaa 97  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |    ||||||| ||||| ||    
T  48765182 ccactagtttttatgtgggagtgttttagtaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctactaaaacacactttctacaa 48765281  T
Q  98 aaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaag 197  Q
    ||   |||||||||| |  || ||| |||||| |  |||||||| |||||||||| |||||||||||||   || |||||| |||| | |||||||||||    
T  48765282 aat--aagtgggtgtatgttaacaactcctatggatatttgctaaaatacacccatttattttttagaaggtgtgttttagtaagtta-taactaaaaag 48765378  T
Q  198 tggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    | ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48765379 tagttaaatgcaccttaaggtgtagctt-gctaaaatactcacacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 48765451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 30347741 - 30347840
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30347741 cccactagtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 30347840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12127741 - 12127508
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  12127741 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 12127644  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||| |               
T  12127643 aactcctataggcattttctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcatgt-tataactaaaaagtagttatataaa----------- 12127556  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12127555 ---cttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttttagcaaa 12127508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48649396 - 48649291
Alignment:
Q  169 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagc 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  48649396 agtattttagcaagtaaataactaaaaagtggtcaaatacaccttatgatgtagctttgctaaaatactcccacataaaaactagtaggtgtgttctaac 48649297  T
Q  269 aaaccc 274  Q
    ||||||    
T  48649296 aaaccc 48649291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3269555 - 3269334
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||| ||||| |  || ||| ||||||| ||||    
T  3269555 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagttggtgtatgttaccaactcctatatgcat 3269458  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaac 234  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||    | |||||||| ||  |||||| ||||| | ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  3269457 ttgctaggatacacacacttattttttagaatgtctgttttagcatgt-tataactaaaaaaatagttaaatacactttaaggtgcagc-ttgctaaaac 3269360  T
Q  235 actcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3269359 acttccacataaaaactagtgggtgt 3269334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 62 - 271
Target Start/End: Original strand, 26103649 - 26103853
Alignment:
Q  62 cttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttt 161  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||| | |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||    
T  26103649 cttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttccaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctatatgcatttgccagga--cacccacttattttt 26103745  T
Q  162 tagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtg 261  Q
    |||||   || ||||||||||| | |||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||    
T  26103746 tagaaggtgtcttttagcaagtta-taactaaaaaatagttaaatacaccttaagatgtagctt-gctaaaacactcccaaataaaaattagtggatatg 26103843  T
Q  262 ttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||    
T  26103844 ttctagcaaa 26103853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 50801774 - 50801589
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | |||||| |||||| ||||   || || |||| |  ||||    
T  50801774 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaat--aaatgagtgtatgttagc 50801677  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 209  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  50801676 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 50801589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 50874106 - 50874291
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | |||||| |||||| ||||   || || |||| |  ||||    
T  50874106 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaacttctataaaat--aaatgagtgtatgttagc 50874203  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 209  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  50874204 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaataca 50874291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17604969 - 17604886
Alignment:
Q  187 taactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17604969 taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 17604886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 48649513 - 48649399
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaataca-ccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||  |||||    
T  48649513 tttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacatctttgaggtgtatgttgctataacacacattctaacaaaaataagtg 48649414  T
Q  108 ggtgtgttctagcaa 122  Q
    |||||||| ||||||    
T  48649413 ggtgtgttttagcaa 48649399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 271
Target Start/End: Original strand, 22894903 - 22894987
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22894903 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtattctagcaaa 22894987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 271
Target Start/End: Original strand, 45293134 - 45293194
Alignment:
Q  211 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45293134 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 45293194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Original strand, 42856947 - 42857007
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42856947 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 42857007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17605673 - 17605530
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||   | |||||| |||||| ||||   ||||||| || |  ||||    
T  17605673 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtttttaaaacacatcttctaaaaaat--aagtgggggtatgttagc 17605576  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17605575 aactcctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaa 17605530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 252
Target Start/End: Original strand, 34277553 - 34277700
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataact-aaaaagtggt 201  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||||| ||||| ||||    
T  34277553 aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacgtttg-tagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaacg-ataactaaaaaaatggt 34277650  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaacta 252  Q
    ||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  34277651 taaatacactctaaggtgtag-tttgctaaaacattcatacataaaaacta 34277700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 66
Target Start/End: Original strand, 52945467 - 52945529
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaa 66  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52945467 actaatttttatgtgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatataccttaa 52945529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6748649 - 6748603
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6748649 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 6748603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 7848722 - 7848768
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7848722 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 7848768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Original strand, 11460345 - 11460393
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11460345 ttgctaaaacattcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 11460393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 164
Target Start/End: Original strand, 22894539 - 22894679
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| | ||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  22894539 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacat-ctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 22894635  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttag 164  Q
    || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22894636 aactcctataaacatttgctaggatacacccacttattttttag 22894679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 29239586 - 29239829
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| | ||||| |||| | | |||  |||    ||||    
T  29239586 gtgttttagcaaagatataactaaaaagctgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacactcattctaaaaaatgtaggtgtatgt----tagc 29239681  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccactta-ttttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || || |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||   || ||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||| |   |||||||    
T  29239682 aactcgtataggcatttgttaaaatacacccacatatttttttagaatgtgtgttttaccaagt-tataactaaaaagtagttagatatactctaaggtg 29239780  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| ||||||||||| |  | | ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29239781 tagc-ttgctaaaacaat--ctcgtaaaaactagtgaatgtgttctagcaaa 29239829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6109163 - 6109117
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6109163 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 6109117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 6114977 - 6115023
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6114977 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 6115023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 8815526 - 8815572
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8815526 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcgagcaaa 8815572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 12896833 - 12896879
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12896833 ttgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 12896879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 17065921 - 17065967
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17065921 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 17065967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17226201 - 17226155
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17226201 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 17226155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 21727841 - 21727887
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21727841 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 21727887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26152509 - 26152463
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26152509 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 26152463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30347769 - 30347727
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30347769 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 30347727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45059527 - 45059485
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45059527 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 45059485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 47461890 - 47461936
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47461890 ttgctaaaacattcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 47461936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 38798175 - 38798219
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 269  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38798175 ttgctaaaacactcccgcataaaaactagtgggtgtgttctagca 38798219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 994717 - 994675
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  994717 taaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 994675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3269232 - 3269186
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3269232 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtaggtgtgttctagcaaa 3269186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 27728389 - 27728435
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27728389 ttgctaaaacactcccacattaaaacaagtgggtgtgttctagcaaa 27728435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 27800642 - 27800688
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27800642 ttgctaaaacactcccacataaaaactattaggtgtgttctagcaaa 27800688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 48649493 - 48649535
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48649493 taaaacactcccacataaaaactagagggtgtgttctagcaaa 48649535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 52654510 - 52654556
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52654510 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgatctagcaaa 52654556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 54244806 - 54244748
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttcta 94  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  54244806 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta 54244748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 7565441 - 7565490
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  7565441 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtggatgtgttatagcaaaccc 7565490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51148011 - 51147963
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccaca--taaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51148011 ttgctaaaacactcccacacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 51147963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 51952276 - 51952335
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51952276 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 51952335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Original strand, 53467490 - 53467537
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  53467490 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 53467537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 53581612 - 53581511
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||| | ||||| ||  | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  53581612 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtgtagcttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ctagtgggtgtgttctagca 53581515  T
Q  122 aatc 125  Q
    ||||    
T  53581514 aatc 53581511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 4043831 - 4043877
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4043831 ttgctaaaacactctcacataaatattagtgggtgtgttctagcaaa 4043877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 7521558 - 7521600
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7521558 taaaatactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 7521600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8815173 - 8815062
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| | ||||| ||||    
T  8815173 tataactaaaaaattgttaaatacatcctaaggtgaatgttgctaaaacacacgttct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctataagcat 8815076  T
Q  136 ttgctagaatacac 149  Q
    ||||||||||||||    
T  8815075 ttgctagaatacac 8815062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 22894888 - 22894938
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  22894888 gtgttttaacaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 22894938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 27317692 - 27317642
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  27317692 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 27317642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34277503 - 34277462
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34277503 ttgctaaaacactcc-acataaaaactagtgggtgtgttctag 34277462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 36824008 - 36823958
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  36824008 gtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 36823958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 162
Target Start/End: Original strand, 53455661 - 53455699
Alignment:
Q  124 tcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53455661 tcctataggcatttgctagaatacacccacttctttttt 53455699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 50913004 - 50912955
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  50913004 tttgctaaaatactcccacataaaaattagtgggtgtatcctagcaaacc 50912955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 7848601 - 7848660
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7848601 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 7848660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26152194 - 26152158
Alignment:
Q  227 gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 263  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26152194 gctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgtt 26152158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 51148132 - 51148081
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51148132 aagtgggtgcgttctagcaaattctatagg-atttgctagaacacacccactt 51148081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 995023 - 994988
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  995023 taaaacactcccacataaaaactagtggctgtgttc 994988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 7565472 - 7565437
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagtta 37  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7565472 ccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagtta 7565437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 27360064 - 27360126
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27360064 aagtggatgtattctagcaaatgctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 27360126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29950644 - 29950609
Alignment:
Q  127 tataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29950644 tataggcatttgatagaatacacccacttatttttt 29950609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29999798 - 29999763
Alignment:
Q  127 tataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29999798 tataggcatttgatagaatacacccacttatttttt 29999763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Original strand, 32203336 - 32203387
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  32203336 ctttgctaaaacactccgacataaaaactaatgggtgtatcctaacaaaccc 32203387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 274
Target Start/End: Original strand, 3544482 - 3544532
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  3544482 tttgctaaaacactcttacataaaaacgagtaagtgtgttctagcaaaccc 3544532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 52945496 - 52945454
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  52945496 ttgctaaaacattcccacataaaaattagtaggtgtgttctag 52945454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 3544363 - 3544415
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3544363 aagtgggtgtattctagcaaatgcctataag-atttgctagaatacacccactt 3544415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 7521432 - 7521484
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7521432 aagtgggtgtattctaacaaatgcctatagg-atttgctagaatacacccactt 7521484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 22894973 - 22894940
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaag 34  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22894973 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaag 22894940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 181
Target Start/End: Original strand, 29950657 - 29950694
Alignment:
Q  144 atacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29950657 atacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaa 29950694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 181
Target Start/End: Original strand, 29999811 - 29999848
Alignment:
Q  144 atacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaa 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29999811 atacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaa 29999848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48765215 - 48765182
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgg 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48765215 ctttactaaaacactcccacataaaaactagtgg 48765182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 6114753 - 6114785
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6114753 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 6114785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6748770 - 6748711
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcct-ataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6748770 aagtgggtgtattctagcaaatgcttatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 6748711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 27317707 - 27317770
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27317707 aagtggatgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 27317770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 27418850 - 27418802
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagt 49  Q
    ||||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  27418850 cccactaatttttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaagt 27418802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 32203221 - 32203284
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32203221 aagtgggtgtattctagcaaatgcctataag-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 32203284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 58127 - 57854
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  58127 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 58028  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  58027 gcaagttggtgttttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatgg 57928  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57927 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 57854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 58095 - 58141
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  58095 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 58141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 141)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 14202835 - 14203108
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14202835 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcgagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagatgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 14202934  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14202935 gcaagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtggataactaaaaagtgg 14203034  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14203035 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 14203108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13212067 - 13211795
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13212067 cccactagtttttatatgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 13211968  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211967 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 13211869  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211868 tcaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaagcactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 13211795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 5046606 - 5046877
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5046606 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 5046705  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5046706 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatgg 5046804  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5046805 ttaaatacaccttaaggtgtaactttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaacc 5046877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 12584251 - 12584524
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12584251 cccactagtttttacgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 12584350  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12584351 acaagtgggtatgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 12584450  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12584451 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctagaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaaccc 12584524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48560250 - 48559978
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  48560250 cccactagtttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgttttaacacaccttctaaaaaaa 48560151  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48560150 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaatttaataactaaaaagtgg 48560052  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48560051 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccc 48559978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 578722 - 578997
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgata--acacaccttctagaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  578722 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttaaggtgtatgttgctatataacacaccttctagaaa 578821  T
Q  99 aagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 198  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  578822 aagcaaatgggtgtattctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaagt 578921  T
Q  199 ggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  578922 ggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcatacataaaaactagtgggtgtattctaacaaaccc 578997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17181204 - 17180931
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||     
T  17181204 ccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaacttaaggtgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaa 17181105  T
Q  102 --caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  17181104 aacaagtgggtgcgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtatttttgcaatttaataactaaaaagtg 17181005  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17181004 gttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 17180931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 42807876 - 42808142
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  42807876 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaa 42807975  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42807976 ataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 42808075  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42808076 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttccacataaaaattagtgggtgtgttctag 42808142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13621350 - 13621078
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13621350 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatactccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 13621251  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621250 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggataca-ccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 13621152  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13621151 ttaaatacaccttaatttttagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcgaaccc 13621078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7630302 - 7630038
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  7630302 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatattgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgg 7630203  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7630202 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagattttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 7630103  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7630102 accttaaggtgtagctttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 7630038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6214228 - 6213965
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  6214228 tttttatgtgagagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccctctaacaaaaacaagtgg 6214129  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6214128 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaagaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 6214029  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6214028 accttaaagtgtagctttgctaaaacactctcacataaaaactagtggatgtgttctagcaaac 6213965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41172662 - 41172393
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41172662 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagatataactaaaaagttaataaatacattttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 41172563  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172562 taaa-tgggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 41172464  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172463 ttaaatacactttaaggtgtagctttgctaaagcactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 41172393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5157249 - 5156977
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  5157249 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa- 5157151  T
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 201  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5157150 caaatgggtgtgttctagcaaatcctataggcctttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggt 5157051  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaact-agtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5157050 taaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactttcacataaaaactaaatgggtgtgttctagcaaaccc 5156977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17377745 - 17377478
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaag 101  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||     
T  17377745 ccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaa 17377646  T
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17377645 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcttttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatagt 17377546  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 269  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377545 ttaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccgcataaaaactagtgggtgtgttctagca 17377478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 30820454 - 30820727
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  30820454 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 30820553  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
      || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30820554 taaattgg-tgtattctagcaaatcctataggcatttgctagaagacacccacttatttttttagaaggagtattttaccaagtgaataactaaaaagtg 30820652  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30820653 gttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 30820727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 50182425 - 50182155
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  50182425 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 50182326  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50182325 -caagtgggtgtgttctagcaaat--tataggcatttgttagaatacactcacttattttttagaagcagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 50182229  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50182228 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaatactttcacataaaaattaatgggtgtgttctagcaaaccc 50182155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17745396 - 17745131
Alignment:
Q  3 cactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  17745396 cactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttcaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-c 17745298  T
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17745297 aagtggatgtgttctagcaaatcctataggcat--gctagaatacacccacctattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaatggtt 17745200  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17745199 aaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacacttc--cataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 17745131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21519984 - 21519717
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||    
T  21519984 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttttaaaaaaa 21519885  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21519884 acaagtgggtgtgttctagtaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtattttagcaaatcaataactaaaaagtgg 21519785  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagc 268  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||    
T  21519784 ttaaatacaccctaaggagtagctttactaaaacactcccacataaaaattaatgagcgtgttctagc 21519717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 51783934 - 51784208
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  51783934 cccactagtttttatgtggaagtgttttagcaagtaataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aataa 51784032  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccc-acttattttttagaa-aaagtattttagcaagtgaataactaaaaagt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  51784033 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccctacttattttttagaagggagtattttagtaaataaataactaaaaagt 51784132  T
Q  199 ggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51784133 gattaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaatactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccc 51784208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 34683013 - 34683279
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  34683013 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaacaaatacagcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaa 34683112  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34683113 acaagtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaattaaataactaaaaagtgg 34683212  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34683213 ttaaatacaccttaaggtgtaactctgctaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttctag 34683279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 49970839 - 49970576
Alignment:
Q  8 atttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtg 107  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  49970839 atttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctactaaaaaaa-caagtg 49970741  T
Q  108 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  49970740 ggtgtgtt-tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagaaaatgaataactaaaaagtggttaaata 49970642  T
Q  208 cagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    || | ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49970641 caccctaatgtgtagatttgctaaaacactcccaaataaaaattagtgggtgtgttctagcaaacc 49970576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26958786 - 26958522
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  26958786 actagtttttatgtgggagtgttgtagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaaaca 26958688  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 203  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  26958687 agtgggtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaaat-tataactaaaaagtagtta 26958589  T
Q  204 aatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26958588 aatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 26958522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13371455 - 13371198
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13371455 tttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgg 13371357  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13371356 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaatac 13371257  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13371256 ------aggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagt-ggtgtgttctagcaaaccc 13371198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13381656 - 13381399
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13381656 tttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgg 13381558  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13381557 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaaccacttatgttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtaaaatac 13381458  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13381457 ------aggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagt-ggtgtgttctagcaaaccc 13381399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Original strand, 10216220 - 10216414
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  10216220 actagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-ca 10216318  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10216319 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 10216414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47382404 - 47382144
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttct-agaaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||    
T  47382404 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtttgttgatataacacaccttctaaaaaaa 47382305  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||           |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47382304 aacaagtggatgtgttctaacaaatcctataggcatatgctaaaata-----------tttttagaaagagtattttagcaagtgaataaccaaaaagtg 47382216  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47382215 attaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaac-ctgccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 47382144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3818998 - 3818789
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  3818998 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaagtgtatgttgctataacacatcttctaaaaaaa 3818899  T
Q  101 gc-aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3818898 aataagtgggtgtgttctagcaaatcctataaacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 3818799  T
Q  200 gttaaataca 209  Q
    ||||||||||    
T  3818798 gttaaataca 3818789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 30258092 - 30258286
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||    
T  30258092 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacgcattctaaaaaaa 30258191  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30258192 -caagtgagtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaatgaataactaaaaa 30258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 52437410 - 52437647
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttct-agaaaaagcaagtg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | |||||  |||||    
T  52437410 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaagttgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaaaaagtg 52437509  T
Q  108 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52437510 ggtgtgttctagcaactcctatagacatttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtggttaaata 52437608  T
Q  208 cagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaa 247  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52437609 caccttaaggtgtag-tttgctaaaacactcccacataaa 52437647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 274
Target Start/End: Original strand, 13621375 - 13621552
Alignment:
Q  97 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621375 aaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaa 13621474  T
Q  197 gtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13621475 gtggttaaatacaccacaagatgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcgaaccc 13621552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 102 - 274
Target Start/End: Original strand, 10981367 - 10981539
Alignment:
Q  102 caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 201  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10981367 caagtgggtgtgttctaacaaattttataggcatttgctagaatacatccacttattttctagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggt 10981466  T
Q  202 taaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10981467 taaatacacattaaggtgtagctttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 10981539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18470399 - 18470240
Alignment:
Q  112 tgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagc 211  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18470399 tgttctagtaaattctatagccatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacacc 18470300  T
Q  212 ttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18470299 ttaaggtgtagttttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaa 18470240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26335938 - 26335707
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  26335938 tataactaaaaaattgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 26335841  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26335840 ttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaaca 26335743  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26335742 ctcccacataaaaactagttggtgtgttctagcaaa 26335707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16553637 - 16553390
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |   |||| ||||| |  ||||    
T  16553637 gtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtaggtgtatgttagc 16553540  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  16553539 aactcctataggcatttgctagaatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgt 16553441  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16553440 agc-ttgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtattctaacaaac 16553390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Original strand, 38425638 - 38425897
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtg 107  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||| || || ||||   |||||    
T  38425638 tttttatgttggagtgttttagcaaagatataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacacattttaaaaaat--aagtg 38425735  T
Q  108 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||     
T  38425736 ggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaacacacccatttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatg 38425834  T
Q  208 cagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38425835 caacttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactcgtgggtgtgttctagcaaa 38425897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 46106886 - 46106640
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| || |   |||||||||| |  ||||    
T  46106886 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctcctaaaatat--aagtgggtgtatgttagc 46106789  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||     
T  46106788 aactccaataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttgaatacaccttaaggtgg 46106690  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46106689 agctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 46106640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 9744146 - 9744377
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  9744146 tataactaaaaagttgttagatacaccttaaggtgaatgttgctacaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatattagcaactcctataggcat 9744243  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |    
T  9744244 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataaataaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaata 9744341  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9744342 ctctcacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 9744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6946811 - 6946611
Alignment:
Q  67 ggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6946811 ggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaa 6946714  T
Q  167 aaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 266  Q
     | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6946713 gatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgtagc-ttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttcta 6946616  T
Q  267 gcaaa 271  Q
    |||||    
T  6946615 gcaaa 6946611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Original strand, 40496123 - 40496377
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    |||| ||||||| | | |||||||||| || | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||      
T  40496123 actagtttttatataggagtgttttagaaaagatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat- 40496221  T
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    ||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  40496222 aagtgggtgtaagttagcaactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtt 40496320  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40496321 aaatataccttaaggtgtagc-ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgt 40496377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 52306980 - 52306734
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||   |||||||||| |  ||||    
T  52306980 gtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttataaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 52306883  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||   || || || ||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  52306882 aactcctatagacatttgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttataacaact-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 52306784  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52306783 ag-gttgctaaaacactctcccataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 52306734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 271
Target Start/End: Original strand, 6137559 - 6137744
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaa 181  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||    
T  6137559 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaa 6137656  T
Q  182 gtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6137657 gt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtatagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 6137744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14863138 - 14862939
Alignment:
Q  67 ggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  14863138 ggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttag-a 14863042  T
Q  167 aaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 266  Q
    |  || |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14863041 agtgtgttttagcaagt-tataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 14862944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4712855 - 4712623
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||| | || |||||||||| |||||  ||||||||||    |||||| ||||||||||||    
T  4712855 tataactagaaatttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaatacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtaagttagcaactcctataggcat 4712757  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  4712756 tcgctaaaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 4712659  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4712658 ctcccacataaaaaccaatgggtgtgttttagcaaa 4712623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45875971 - 45875726
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || || ||||   |||||||||| |  ||||    
T  45875971 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattttaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 45875874  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   || ||||||||| |  ||||||||||||| || |||| || ||||||||||    
T  45875873 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgttttagcaaat-tataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgt 45875775  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45875774 agc-ttgttaaaacactcccacataaaaacta-tgggtgtgttctagcaaa 45875726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54742682 - 54742414
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||  |||||||| |||||| || ||||||| | ||||||| ||||| |||||      
T  54742682 actagtttttacgtgggagtgttttagcaaagatataacgaaaaatttgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaaat 54742583  T
Q  103 aagtgggtgtgttc--tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||    || ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||| | |||||| ||||| |    
T  54742582 aagtgggtgtgtaagttaacaactcttataggcatttgctaaaatacacccacttatattttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactagaaagtag 54742484  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54742483 ttaaatgcactttaaggtgtagctt-gctaaaacattcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 54742414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4490856 - 4490631
Alignment:
Q  43 aaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctag 142  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||     
T  4490856 aaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctt-aaaaattaagtgggtgtatgttagcaactcctatagacatttgctat 4490758  T
Q  143 aatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccac 242  Q
    |||||||||||||||||  || || | || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||   |||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  4490757 aatacacccacttatttcctaaaatatgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacgctaagatgtagctt-gttaaaacactcccac 4490660  T
Q  243 ataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4490659 ataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 4490631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 6192954 - 6193201
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| | || || |||||  | |||||||| |  ||||    
T  6192954 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacactcattttaaaaaaatga-gtgggtgtatgttagc 6193052  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  6193053 aacacctataagcatttgctagaatacactcacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataacaaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgt 6193151  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6193152 agc-ttgctaaaacactccaacataaaaactagtatgtgtgttctagcaaa 6193201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33106109 - 33105877
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  33106109 tataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatagacat 33106012  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||   || |||||||||||  ||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  33106011 ttgctaggatacgcccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagt-tataatcaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaata 33105914  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtggg-tgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33105913 ctcccacataaaaactagtgggatgtgttatagcaaa 33105877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33811163 - 33811011
Alignment:
Q  117 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaag 216  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  33811163 tagcaactcctacaggcatttgctataatacacccacttaatttttagaaagtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatgcaccttaag 33811065  T
Q  217 gtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33811064 gtatagctt-gttaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 33811011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29102198 - 29101951
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaag-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctag 119  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||  ||||||| | | ||||||||||| ||||  |||||| |||| |  ||     
T  29102198 gtgttttagcaaagatataactaaaaaaattgttaaatacactttaaggtaaatgttgctaaatcacaccttctacaaaa--caagtgagtgtatgttaa 29102101  T
Q  120 caaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    ||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  29102100 caactcctataaacatttgctaggatacacccacttattttttataagatgtgttttagcaagtta-taattaaaaagtagttaaatacacattaagatg 29102002  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29102001 tagctta-ctaaaacactcctacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 29101951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 127 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45801934 - 45801793
Alignment:
Q  127 tataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataac---taaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagc 223  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  45801934 tataggcatttgttagaatacatccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaataaaaagtggttaaatacactctaatgtgtagc 45801835  T
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttct 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  45801834 tttgttaaaacactcccacataaaaactaatagatgtgttct 45801793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6137649 - 6137460
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagca 180  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  6137649 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagca 6137553  T
Q  181 agtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    || | ||||||||||||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  6137552 ag-gtataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtatatctttgctaaaacacgccttaataaaaactagtgggtgtatcctagcaaaccc 6137460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Original strand, 49425759 - 49425943
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  ||||||||||    ||||    
T  49425759 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtgggtgtacgttagc 49425856  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   || ||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  49425857 aacttctataggcatttgctaggatacacctacttattttttagaaggtgtgttttagcaact-tataactaaaaagtagttaaatac 49425943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 22 - 196
Target Start/End: Original strand, 20458831 - 20459004
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||| ||||||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  20458831 gtgttttagcaaagatatagttaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacactccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 20458929  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||    
T  20458930 aactcctataggcatttgctagaatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaa 20459004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Original strand, 23383925 - 23384065
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||     |||||  |||||||||| |  ||||    
T  23383925 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct-----aaaaaataagtgggtgtatgttagc 23384019  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23384020 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaa 23384065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14948319 - 14948089
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| | ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| || | ||| |||    
T  14948319 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacgcattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcatttagacat 14948222  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| ||   || |||||  |||| | ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||     
T  14948221 ttgttaggattcacccacttattttttaaaaggtgtgttttaataagtta-taactaaaa-gtagttaaatacaccttaagatgtagctt-gctaaaacc 14948125  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14948124 ctcctacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaa 14948089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 142816 - 142600
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | || |||| ||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  142816 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaagacactttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 142719  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||   || ||||                |||||| || |||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  142718 ttgctaggatacacccacttatttttttgaatgtgtgtttt----------------aaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 142636  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142635 ctccaacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 142600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43639072 - 43638943
Alignment:
Q  140 tagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcc 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  43639072 tagaatacacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaagcagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaatacttc 43638975  T
Q  240 cacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||||||    
T  43638974 cacataaaaattaatgaatgtgttctagcaaa 43638943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43639227 - 43639068
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaag-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagt 106  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| | ||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||  ||||    
T  43639227 tttttatgtgggagtgctttagcaaagatataattaaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctagaaaaaataagt 43639128  T
Q  107 gggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    || ||| |  |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43639127 ggatgtatgttagcaactcctatagacatttgttagaatacacccacttattttttagaa 43639068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 49606128 - 49605985
Alignment:
Q  126 ctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctt 225  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  49606128 ctatatgcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgcgttttagcaagtta-tagataaaaagtagttaaatacactttaaagtgtagctt 49606030  T
Q  226 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49606029 -gttaaaacactcccacctaaaaactagtgggtatgttctagcaaa 49605985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15725376 - 15725208
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||   ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||    
T  15725376 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgagtgtatgttagcaactcctataggcat 15725279  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  15725278 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagtaagt-tataactaaaaaatagttaaata 15725208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 166
Target Start/End: Original strand, 11777496 - 11777638
Alignment:
Q  23 tgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||| ||||   || ||||||| |  |||||    
T  11777496 tgttttagcaaaggtataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacatattctaaaaaat--aattgggtgtatgttagca 11777593  T
Q  122 aatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11777594 actcctataagcatttgctaggatacacccacttattttttagaa 11777638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Original strand, 13211626 - 13211722
Alignment:
Q  173 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| | |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13211626 ttttagcaagtta-taactaaaaaatagttaaatgcaccttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacatcaaaactagtgagtgtgttctagcaaa 13211722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36955475 - 36955326
Alignment:
Q  117 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa-tacagcttaa 215  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| |        
T  36955475 tagcaactcatataggcatttgctagaatacactcacttattttttataatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaattacacc---- 36955381  T
Q  216 ggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  36955380 gttgtag-tttgctaaaacactcccatataaaaactagtgaatgtgttctagcaaa 36955326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 271
Target Start/End: Original strand, 49426124 - 49426194
Alignment:
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49426124 gttaaatacaccttaaggtgtaggtt-gctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 49426194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 274
Target Start/End: Original strand, 56532591 - 56532685
Alignment:
Q  170 gtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  56532591 gtattttagcaagtgaataactaaaaaatggttaaataca-tttaagatgtagcttttctaaaacactcc---------actagtgggtgtgttctagca 56532680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 270
Target Start/End: Original strand, 4505567 - 4505636
Alignment:
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 270  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4505567 gttaaatacacccaaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttttagcaa 4505636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5046638 - 5046592
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5046638 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 5046592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 13621318 - 13621364
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13621318 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 13621364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 21519952 - 21519998
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21519952 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 21519998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30258124 - 30258078
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30258124 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 30258078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34683045 - 34682999
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34683045 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 34682999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 41172630 - 41172676
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172630 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 41172676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42807908 - 42807862
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42807908 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 42807862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 47382372 - 47382418
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47382372 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 47382418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 271
Target Start/End: Original strand, 48560221 - 48560264
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48560221 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 48560264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 578754 - 578708
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  578754 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 578708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 5157218 - 5157264
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5157218 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 5157264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 7630278 - 7630324
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7630278 ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaa 7630324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 17745366 - 17745412
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17745366 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgagtgtgttctagcaaa 17745412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 271
Target Start/End: Original strand, 20459170 - 20459227
Alignment:
Q  213 taaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20459170 taaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtattctaacaaa 20459227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 32012835 - 32012881
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32012835 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 32012881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 50182393 - 50182439
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50182393 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaa 50182439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 23384091 - 23384147
Alignment:
Q  214 aaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23384091 aaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactggtgggtatgttctagcaaa 23384147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30258396 - 30258343
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcc 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30258396 ataactaaaaagtggttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaaatactcc 30258343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14202865 - 14202821
Alignment:
Q  227 gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14202865 gctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 14202821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 17377714 - 17377758
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17377714 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctagca 17377758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 56532584 - 56532528
Alignment:
Q  218 tgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  56532584 tgtagctttgctaaaacactcccacatgaatattagtgggtgtgttatagcaaaccc 56532528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Original strand, 3818965 - 3819012
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3818965 tttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctaacaaa 3819012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30820487 - 30820440
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30820487 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtattcaagcaaa 30820440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 142
Target Start/End: Original strand, 102261 - 102366
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||  |||||  |||||||| | |  |||||| ||||||||||||    
T  102261 tataactaaaaagttgttaaatacacattaaggtgaatgttgttaaaacacaccttct-taaaaaataagtgggtttatgttagcaactcctataggcat 102359  T
Q  136 ttgctag 142  Q
    |||||||    
T  102360 ttgctag 102366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10216249 - 10216203
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10216249 ttgctaaaacactcccacataaaaactagttgatgtgttctagcaaa 10216203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12584279 - 12584237
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12584279 taaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 12584237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 26335806 - 26335756
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  26335806 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 26335756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 26958757 - 26958803
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26958757 ttgctacaacactcccacataaaaactagtaggtgtgttctagcaaa 26958803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 274
Target Start/End: Original strand, 33811311 - 33811361
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  33811311 tttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtatcctagcaaaccc 33811361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 50678004 - 50677909
Alignment:
Q  173 ttttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50678004 ttttagcaagtta-taactaaaaagta-ttaaatacaccttaaggtatagcat-gataaaacactcctacataaaaactagtgggtgtattctaacaaa 50677909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51783966 - 51783920
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51783966 ttgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtctgttctagcaaa 51783920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 99
Target Start/End: Original strand, 38425540 - 38425636
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||| ||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| ||||    
T  38425540 actagtttttatgttggagtgttttagtaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgttaaaacacaccttctaaaaaa 38425636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 271
Target Start/End: Original strand, 13371434 - 13371477
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13371434 ctaaaacactcccacataaaaaccagcgggtgtgttctagcaaa 13371477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 271
Target Start/End: Original strand, 13381635 - 13381678
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13381635 ctaaaacactcccacataaaaaccagcgggtgtgttctagcaaa 13381678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 50678007 - 50677961
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  50678007 gtgttttagcaagttataactaaaaag-tattaaatacaccttaaggt 50677961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 4712722 - 4712672
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  4712722 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 4712672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 6946710 - 6946660
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  6946710 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacactttaaggtgta 6946660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 9744278 - 9744328
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9744278 gtgttttagcaagttataaataaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 9744328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 13212035 - 13212081
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  13212035 ttgctaaaacactcccatataaaaactagtgggtgtattatagcaaa 13212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14863038 - 14862988
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14863038 gtgttttagcaagttataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 14862988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 43639042 - 43638992
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  43639042 gtgttttagcaagttataactaaaaagcagttaaatacaccttaaggtgta 43638992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40496468 - 40496396
Alignment:
Q  185 aataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggt 258  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  40496468 aataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttattaaaacattctcacgtaaaaactagtgggt 40496396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 10216370 - 10216311
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10216370 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 10216311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 13211914 - 13211973
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13211914 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 13211973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30820607 - 30820548
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  30820607 aagtgggtgtcttctagcaaatgcctatagg-atttgctagaatacaccaatttatttttt 30820548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 48560097 - 48560156
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48560097 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 48560156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 181
Target Start/End: Original strand, 142699 - 142777
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaa 181  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  142699 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaagtgtcttttagcaa 142777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 33811110 - 33811063
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||    
T  33811110 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggt 33811063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 33811344 - 33811285
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatac 59  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||    
T  33811344 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatac 33811285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42808030 - 42807972
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttt 161  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42808030 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttattttt 42807972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Original strand, 43639201 - 43639252
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||    
T  43639201 ctttgctaaagcactcccacataaaaactaatgggtgtatcctaacaaaccc 43639252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 52437434 - 52437385
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacata---aaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  52437434 ttgctaaaacactcccacataaaaaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 52437385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 578878 - 578829
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacaccca 152  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  578878 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaatacaccca 578829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9744282 - 9744200
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9744282 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaatatacacccacttattttttagaa 9744200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 94
Target Start/End: Original strand, 13211554 - 13211612
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttcta 94  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||    
T  13211554 tataactaaaaagttgttaaatacacctttaggtgaatgttgctaaaacataccttcta 13211612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 17181173 - 17181219
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  17181173 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtggatgttttctaacaaa 17181219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38425566 - 38425520
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  38425566 ctaaaacactccaacataaaaactagtaggtgtatcctagcaaaccc 38425520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 38425780 - 38425723
Alignment:
Q  106 tgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttta 163  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38425780 tgggtgtgttctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatttttta 38425723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 32012867 - 32012834
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaag 34  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32012867 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaag 32012834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 3818843 - 3818902
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcct-ataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3818843 aagtgggtgtattctagcaaatgtttatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 3818902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 5046759 - 5046700
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatc-ctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5046759 aagtgggtgtattctagcaaatgtctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 5046700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 6946725 - 6946788
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6946725 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 6946788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 13211625 - 13211673
Alignment:
Q  24 gttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||    
T  13211625 gttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatgcaccttaaggtgta 13211673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 13371310 - 13371369
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13371310 aagtggttgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 13371369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 13381511 - 13381570
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  13381511 aagtggttgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 13381570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 14863052 - 14863115
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14863052 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 14863115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 17181049 - 17181108
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  17181049 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacgcacccacttgtttttt 17181108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 21519830 - 21519889
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  21519830 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttactagaacacacccacttgtttttt 21519889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 26958636 - 26958695
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26958636 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatatg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 26958695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30258245 - 30258186
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  30258245 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacactcacttgtttttt 30258186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 41172509 - 41172568
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41172509 aagtgggtgtattctagcaaatgcctataag-atttgctagaacacacccatttatttttt 41172568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 42808132 - 42808100
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42808132 cccactaatttttatgtggaagtgttttagcaa 42808100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 48559995 - 48560027
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48559995 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 48560027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 271
Target Start/End: Original strand, 54742651 - 54742699
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||    
T  54742651 ctttgctaaaacactcccacgtaaaaactagttagtgtatcctagcaaa 54742699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 119)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20517154 - 20516881
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20517154 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 20517055  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20517054 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtgg 20516955  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20516954 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctaacaaaccc 20516881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4655283 - 4655006
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataa----cacaccttctaga 96  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||    
T  4655283 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataagtaacacaccttctaga 4655184  T
Q  97 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655183 aaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctaaaatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 4655084  T
Q  197 gtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4655083 gtggttaaatacatcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 4655006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 273
Target Start/End: Original strand, 38876136 - 38876403
Alignment:
Q  6 taatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaag 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38876136 taatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaagcaag 38876235  T
Q  106 tgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38876236 tgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaa 38876335  T
Q  206 tacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38876336 tacatcttaaggtgtagctttgttaaaacactcccatataaaaattagtgagtgtgttctagcaaacc 38876403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27812175 - 27811903
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  27812175 cccactagtttttatatgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaaaaaa 27812076  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27812075 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctgtaggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtag 27811977  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27811976 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 27811903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12080932 - 12080679
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12080932 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 12080833  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12080832 t-aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 12080734  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 255  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12080733 ttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 12080679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11327830 - 11327559
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  11327830 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaa 11327731  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327730 ataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 11327631  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  11327630 ttaaatacaccttaaggtatagctttgctaaaacacttccacataaaaaccagtaggtgtgttctagcaaac 11327559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 15230297 - 15230036
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||    
T  15230297 cccactagtttttatgtgg-agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaa 15230199  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15230198 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 15230100  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 264  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15230099 ttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 15230036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 48454508 - 48454778
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||    
T  48454508 cccactagtttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagataataaatacaccttaaggtatatgttgatataacacaccttctaaaataa 48454607  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48454608 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtgg 48454707  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48454708 ttaaatgcaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 48454778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14778158 - 14777898
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||    
T  14778158 cccactagtttttatgtgg-agtgttttagcaagttataactaaaa-gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataatacaccttctaaacaaa 14778061  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14778060 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 14777962  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 264  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14777961 ttaaacacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 14777898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24720494 - 24720222
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  24720494 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccattaggtgtatgttgctataacgcaccttctaaaaaaa 24720395  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24720394 taaa-tgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaataaataactaaaaagtgg 24720296  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24720295 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcctacataaaaattagtgggtgtgttctagaaaaccc 24720222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45225627 - 45225396
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  45225627 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaatgtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaa 45225528  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45225527 gcaagtgggtgtgttctagcaaattctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtgg 45225428  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaa 232  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45225427 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaa 45225396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 14718961 - 14719229
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  14718961 actagtttttatataggagtgttttagcaagttataactaaaattttaataaatacatcttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-ca 14719059  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14719060 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctggaatacacccacttattttttagaaggagtattttaacaagtgaataactaaaaagtggtta 14719159  T
Q  204 aatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14719160 aatacaccttaa-gtgtagctttgctaaaagactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 14719229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 8047937 - 8048205
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  8047937 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacactttaaggtgtatgttgctataacacaccttttaaaaaaa 8048036  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      |     ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8048037 taa-----gtgtgttatagcaaatcctacagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtgg 8048131  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8048132 ttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcgaaccc 8048205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 26380039 - 26380304
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||    
T  26380039 cccactagtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtatatgtttctataacacaccttctaacaaaa 26380138  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26380139 acaagtgaatgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccgcttagtttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 26380238  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttcta 266  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26380239 ttaaatacaacttaaggtgtaactttgctaaaacactcccacataaaaactaatggatgtgttcta 26380304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18199806 - 18199529
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  18199806 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactacaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaacttctataaaaa 18199707  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatac----acccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||   |  | |    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18199706 acaagtgggtgtgttctagcaaatcctatagactagtgggtgtgttctataacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaa 18199607  T
Q  197 gtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18199606 gtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 18199529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28605674 - 28605407
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||     
T  28605674 cccactagtttttatgagagaatgttttagcaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacataccttctaaaaaa- 28605576  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28605575 -caagtgggtgtgttttagcaaattctataggtatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 28605477  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28605476 ttaaacacaccttaaggtgtagctttactaaagcactcccacataaaaactagt-ggtgtgttctagcaaa 28605407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 7437761 - 7438035
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagtta-taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  7437761 cccactagtttttatgtgggagtattttagtaagtgaataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacacaccttccaaaaaa 7437860  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7437861 aacaagtgggtgtgttatagtaaatcctataggcatttgctagaatacacccaattattttttagaatgagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 7437960  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  7437961 gttaaacccaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaatgagtggatgtgttctaacaaaccc 7438035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34986759 - 34986490
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || || ||    
T  34986759 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagataataaatacaccttaaggtgtatgttgatataacacaccttataaaataa 34986660  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34986659 ataagtgaatgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagagtattttagcaagtgaagaactaaaaagtgg 34986560  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| | ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34986559 ttaaataca-cctaaagcgtaactttgctaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 34986490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27597266 - 27596981
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27597266 cccactagtatttatgtgggagtgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 27597167  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt-------------gctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaat 187  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||    
T  27597166 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttcctatagacatttgctagaatacatccacttattttttagaatgagtattttagcaaataaat 27597068  T
Q  188 aactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27597067 aactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactataacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 27596981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 274
Target Start/End: Original strand, 18123048 - 18123309
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||    
T  18123048 actaatttctatgtgggagtgttttaccaaattataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctgacaaaagca 18123147  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18123148 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaggatacacccacttagtttttagaaggagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggtta 18123247  T
Q  204 aatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  18123248 aat---------ggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactaattggtgtgttctagcgaaccc 18123309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14770288 - 14770040
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  14770288 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgagtgtgttatagc 14770190  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtg-aataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || | |||||||    
T  14770189 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagtgaaataattaaaaggtgattaaatgcaccctaaggtg 14770090  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 269  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14770089 tagttttgctaaaatactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 14770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15220739 - 15220491
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  15220739 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataagtacaccttaaggtgtatgtttctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgagtgtgttatagc 15220641  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtg-aataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || | |||||||    
T  15220640 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttcgcaagtgaaataattaaaaggtgattaaatgcaccctaaggtg 15220541  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 269  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15220540 tagttttgctaaaatactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagca 15220491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22479439 - 22479168
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||    
T  22479439 cccactagtttttatgtgggtgtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataggacaccttcgaaaaaaa 22479340  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22479339 -caagtgggtgtgttctatcaaatcctatatacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtgg 22479241  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||    
T  22479240 ttaaattcaccctaa-gtgtagctttgctaaaacacttccacataaaaattagtgagtgtcttctaacaaaccc 22479168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 32853090 - 32852840
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32853090 cccactagtttttatgtgggaatgttttagcaagttataattaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 32852991  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32852990 -caagtgggtgtgttatagcaaatcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 32852892  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    ||||             |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32852891 ttaa-------------tgtagctttgctaaa--actcccacataaaaacttgtgggtgtgttctag 32852840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 111 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45225384 - 45225221
Alignment:
Q  111 gtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  45225384 gtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagttaataactaaaaagtggttaaatacac 45225285  T
Q  211 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45225284 cttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 45225221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 37138899 - 37139087
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37138899 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 37138998  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataa 189  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37138999 ataagtgggtgtgttctaacaaatcctatagacatttgctaaaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataa 37139087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 43712123 - 43711873
Alignment:
Q  25 ttttagcaagttataactaaaaag-ttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43712123 ttttagcaagttataattaaaaaaattaataaatatagtttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaa 43712025  T
Q  124 tcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtag 222  Q
    | |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  43712024 tactatatacatttgctagaatatacccacttatttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacactttaaagtgtag 43711925  T
Q  223 ctttgctaaaacactcccacata-aaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43711924 ttttgctaaaacactcccacataaaaaactaatgggtgtgttct-gcaaaccc 43711873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 939106 - 938860
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||||||| |  ||||    
T  939106 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcta--aaaagtaagtgggtgtatgttagc 939009  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  939008 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 938910  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  938909 agctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 938860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 65 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48193323 - 48193114
Alignment:
Q  65 aaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttag 164  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48193323 aaggtgtatgttgctataacacatcttctaataaaaacaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgttagaatacacccacttattttttag 48193224  T
Q  165 aaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttc 264  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  48193223 aaggagtattttaacaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccccaagatgtagctttgctaaaatactcccatctaaaaattagtgggtgtgttc 48193124  T
Q  265 tagcaaaccc 274  Q
    || |||||||    
T  48193123 taacaaaccc 48193114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25818696 - 25818449
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  ||||    
T  25818696 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgtttaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 25818598  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  25818597 aactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagcagttaaatgcaccttaaggtgt 25818499  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25818498 agc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 25818449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41407553 - 41407305
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| || |   |||||||||| |  ||||    
T  41407553 gtgttttagcaaatatacaactaaaaagttgttatatacaccttaaggtaaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagc 41407456  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  41407455 aactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaatgtgt 41407357  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41407356 agc-ttgctaaaacactcccacataaaaactaataggtgtgttctagcaaacc 41407305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 138 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33889179 - 33889043
Alignment:
Q  138 gctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacact 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33889179 gctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaaggggttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacact 33889080  T
Q  238 cccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33889079 ccgacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 33889043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28912293 - 28912044
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  28912293 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 28912196  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  28912195 aactcctatgggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggcgt 28912097  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28912096 agc-ttgctaaaacactcctacataaaaactagtgagtgtgttctagctaaccc 28912044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 260
Target Start/End: Original strand, 18352315 - 18352536
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  18352315 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 18352413  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  18352414 ttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtagc-ttgttaaaaca 18352511  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18352512 ctcccacataaaaactagtgggtgt 18352536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 271
Target Start/End: Original strand, 27168254 - 27168484
Alignment:
Q  37 ataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcat 135  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| | ||| ||||| |||||||| |     
T  27168254 ataattaaaaagttcttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatcctaccaaatgcctatagg-ag 27168350  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27168351 ttgctaacatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaaca 27168448  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168449 ctcacacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 27168484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33889982 - 33889847
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  33889982 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacattaaggtgtatgttgctataacgcaccttcta-aaaaaacaagtgg 33889884  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaat 145  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33889883 gtgtgttctagcaaatcatataggcatttgctagaat 33889847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 38367856 - 38368087
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||  || |||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |  ||| ||||||||||||    
T  38367856 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtaaatcttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttgacaactcctataggcat 38367953  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  38367954 ttgctagaatacagccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaactt-gctaaaaca 38368051  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38368052 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 38368087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 454315 - 454069
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  454315 gtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgttaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 454218  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  454217 aactcctataggcatttgttaggatacacccacttattttttagaaggtgtattttagcaagt-tttaactaaaaagtagttaattacaccttaagatgt 454119  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  454118 agc-ttgctaaaacactcctacataaaaaatagtgggtgtgttctagcaaa 454069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2936837 - 2936605
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||  |||||| ||| |  |||||| |||||| |||||    
T  2936837 tataactaaaatgttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaaataagtgg-tgtatgttagcaactcctattggcat 2936739  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  2936738 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 2936641  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2936640 ctcaaacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaa 2936605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19069592 - 19069361
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |   |||||||| | |  |||||| ||||||||  ||    
T  19069592 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtttatgttagcaactcctatagctat 19069495  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19069494 ttgctaggatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taattaaaaactagttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaaca 19069397  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19069396 ctcttacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 19069361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 2509306 - 2509551
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| | ||   |||||||||| |  || |    
T  2509306 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaagaat--aagtgggtgtatgttaac 2509403  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  2509404 aactcctatatgcatttgctagaatacacccacttattttt-agaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtggttaaatgtaccttaaggtgt 2509501  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2509502 agctt-gctaaaacactcccacatcaaaactagtggatgtgttctagcaaa 2509551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6559586 - 6559322
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||     ||||    
T  6559586 cccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacct-----aaaa 6559492  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
    |  |||||||||| |  || ||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    | ||||||||||| | ||||||||||||     
T  6559491 aataagtgggtgtatgttaacaactcatataggcatttgctataatacacccgcttattttatagaatgtatgttttagcaagtta-taactaaaaagta 6559393  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6559392 gttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacatcaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 6559322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18829931 - 18829775
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttct---agaa 97  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||    
T  18829931 cccactagtttttatatgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 18829832  T
Q  98 aaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccact 154  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  18829831 aaaataagtgggtgcgttctagcaaattctataagcatttgctagaacacatccact 18829775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41037578 - 41037323
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||     |||||| ||||| ||  || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||  |||||     
T  41037578 tttttatgtgggagtgttttaga----tataacgaaaaatttgttatatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaaat-aagtga 41037484  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    ||||    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||   || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |    
T  41037483 gtgtaagttagcaactcctataggcatttgctaaaatacacccagttatatttaagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatgc 41037385  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41037384 accttaaggtgtagctt-gctaaaacattcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 41037323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32577607 - 32577466
Alignment:
Q  134 atttgctagaatacacccacttatttttt-agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaa 232  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32577607 atttgctagaacacacccatttgtttttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagttgttaaatacatcctaaggtgtagctttgctaaa 32577508  T
Q  233 acactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32577507 acactcccatataaaaattagtgggtgtgttctagcaaaccc 32577466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Original strand, 1325335 - 1325470
Alignment:
Q  143 aatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccac 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1325335 aatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtagttaaatgcacgttaagatgtagctttgctaaaacactcccac 1325434  T
Q  243 ataaaaactag----tgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||  ||    |||||||||||||||||||||    
T  1325435 ataaaaatcagtggatgggtgtgttctagcaaaccc 1325470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2362961 - 2362736
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||  |||||| ||| |  ||||    
T  2362961 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaaat-aagtggatgtatgttagc 2362863  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     || |||||||||||  || |||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  2362862 aactcctatagacatttgctaggatacacccacttattttttag---gtgtgttttagcaagt-tatcactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtat 2362767  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaacta 252  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362766 aac-ttgctaaaacactcccacataaaaacta 2362736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 260
Target Start/End: Original strand, 2633877 - 2634110
Alignment:
Q  22 gtgttttagca-agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||| | || || |||| | ||||||| |||||||||||  |||||||||| |  ||||    
T  2633877 gtgttttagcatagatataacgaaaaagttgttaaatacaccttacgatgaatattgctaaaacacacattctagaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 2633975  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     || |||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  2633976 aactcctataggcatttgctagaatacacctacttattttttag---gtgtgttttagcaagt-tataaccaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgt 2634071  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2634072 agc-ttgttaaaacaatcccacatataaactagtgggtgt 2634110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11766317 - 11766088
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   ||||||  || |  |||||| || |||| ||||    
T  11766317 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaatgtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtggacgtatgttagcaactcttatatgcat 11766220  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  11766219 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaata-aatttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 11766123  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11766122 ct-ccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 11766088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 6736498 - 6736738
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| || |||| | ||||| |||     |||||  |||||||||| |  ||||    
T  6736498 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaactacaccttaaggtgaatattgctaaaacactcct-----aaaaaataagtgggtgtatgttagc 6736592  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt-agaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   || ||||| ||| | | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  6736593 aactcctataggcatttgctagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaaatta-taactaaaaagtagttaagtacaccttaaggtg 6736691  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6736692 tagctta-ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgcgttctag 6736738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 9401620 - 9401842
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| || |    
T  9401620 cccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgtagctaaaacacaccttctaaaata 9401719  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
       |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||  |||| ||||||||     
T  9401720 t--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagatggtgtgttttagcatgt-tataattaaaaagta 9401816  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctt 225  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  9401817 gttaaatataccttaaggtgtagctt 9401842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 32577719 - 32577615
Alignment:
Q  58 acaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttat 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32577719 acaccttaaggtgtatgttgctataacacgccttccaaaaaaa-caagtgggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttat 32577621  T
Q  158 ttttta 163  Q
    ||||||    
T  32577620 ttttta 32577615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 38796808 - 38797056
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | | ||  | ||||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  38796808 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaagcattcattctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 38796906  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaag-tggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || ||||| ||||| | ||||||||||  | ||||| |||| | |||||||    
T  38796907 aactcctatagacatttgctagaatacacccgcttattttttaaaaggtgtgttttaacaagtta-taactaaaaaaatagttaattacaccctaaggtg 38797005  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38797006 taactt-gctaaaacacttccacataaaaacaagtgggtgtgttctagcaaa 38797056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 236
Target Start/End: Original strand, 15957199 - 15957410
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||   ||||  |||||||||| |  || |    
T  15957199 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaacgttgctaaaacacaccttct---aaaaataagtgggtgtatgttaac 15957295  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccactta-ttttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15957296 aactcctatagacatttgctaggatacaccaacttatttttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacatcttaaggtg 15957394  T
Q  220 tagctttgctaaaacac 236  Q
    |||| ||||||||||||    
T  15957395 tagc-ttgctaaaacac 15957410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 32577803 - 32577713
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacacctt 91  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32577803 cccactagtttttatgtgggaatgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacacctt 32577713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23740250 - 23740011
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||  | ||||| ||||||| ||||   ||||| |||| |  ||||    
T  23740250 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatattgttaaaacactccttctaaaaaat--aagtgtgtgtatgttagc 23740153  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttatt-ttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||   || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |            
T  23740152 aactcctataggcatttgttagaatacacctacttatttttttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtggttaaatacacc-------- 23740062  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23740061 tagc-ttgctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgcgatctagcaaa 23740011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 48193413 - 48193344
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgc 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48193413 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgc 48193344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 290 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 48598011 - 48597929
Alignment:
Q  290 gtataatgtgataaaaa-gaatgatgagagtagaattaggatata---tagttattcttgggagaaaaaatgaatgagagtgc 368  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48598011 gtataatgtgataaaaaagaatgatgagagtagaattaggatatatagtagttattcttgggagaaaaaatgaatgagagtgc 48597929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 263
Target Start/End: Original strand, 3512711 - 3512827
Alignment:
Q  145 tacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacat 244  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| | |||||||||||| || |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3512711 tacacccacttattttttagaagatgtgttttagtaagtta-taactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacat 3512808  T
Q  245 aaaaactagtgggtgtgtt 263  Q
    ||||| |||||| ||||||    
T  3512809 aaaaattagtggatgtgtt 3512827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17317443 - 17317370
Alignment:
Q  50 taataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17317443 taataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgggtgtgttctagcaaa 17317370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 34986727 - 34986776
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34986727 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 34986776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8047969 - 8047923
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8047969 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 8047923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 11327798 - 11327844
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327798 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 11327844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 12080900 - 12080946
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12080900 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 12080946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18829759 - 18829697
Alignment:
Q  147 cacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 209  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18829759 cacccacttatttttttaaaagagtattttagtaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 18829697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 24720462 - 24720508
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24720462 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 24720508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37138931 - 37138885
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37138931 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 37138885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Original strand, 20517121 - 20517168
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20517121 tttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 20517168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 4655251 - 4655297
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4655251 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 4655297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 18199774 - 18199820
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18199774 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaa 18199820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26380067 - 26380025
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26380067 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 26380025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 27812143 - 27812189
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27812143 ttgctaaaacactcccatataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 27812189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 32577771 - 32577817
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32577771 ttgctaaaacattcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 32577817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 45225595 - 45225641
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45225595 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 45225641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 48454537 - 48454491
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48454537 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaaccc 48454491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27168389 - 27168307
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27168389 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttggtaggatacacccacttattttttagaa 27168307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 38367988 - 38368090
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  | | ||||| | ||||||||||||||||||    
T  38367988 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtaacttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ctagtgggtgtgttctagca 38368085  T
Q  122 aatcc 126  Q
    |||||    
T  38368086 aatcc 38368090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7437790 - 7437747
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7437790 ctaaaatactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 7437747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 272
Target Start/End: Original strand, 32853058 - 32853105
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaac 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32853058 ttgctaaaacattcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaac 32853105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 2936704 - 2936654
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  2936704 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 2936654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 15230266 - 15230311
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15230266 ttgctaaaacactcc-acataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 15230311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 22479411 - 22479453
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22479411 taaaacacacccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 22479453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 27168385 - 27168435
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  27168385 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 27168435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 27597234 - 27597280
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27597234 ttgctaaaacactcccacataaatactagtgggtgtgttctaacaaa 27597280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 48193389 - 48193435
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48193389 ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtttgttctagcaaa 48193435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3407206 - 3407153
Alignment:
Q  25 ttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||    
T  3407206 ttttagcaagttataactaaaaagtgaataaatacaccttgaagtgtgtgttgc 3407153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 274
Target Start/End: Original strand, 33889958 - 33890007
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  33889958 ttgctaaaacactcccacataaaaactaattgatgtgttctagcaaaccc 33890007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 12080779 - 12080838
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12080779 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttatttttt 12080838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 7835357 - 7835407
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  7835357 gtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgta 7835407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 17327210 - 17327168
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagtta 51  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17327210 tttttatgtgggagtattttagcaagttataactaaaaagtta 17327168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 18352448 - 18352498
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  18352448 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 18352498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 28605642 - 28605688
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28605642 ttgctaaaacattctctcataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 28605688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 273
Target Start/End: Original strand, 41037557 - 41037602
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  41037557 ctaaaacactcccacataaaaactagcgggtgtttcctagcaaacc 41037602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14780268 - 14780074
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  | |||||| |||||||  ||||||||||||   ||||| |||  | |||||||||| | || | | |    
T  14780268 cccactattttttgtgtgg-agtgttttcgcgcgatataacaaaaaagtatataaatacacctctgggtgtgtgtctctataacacaccctataaacaca 14780170  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaag 197  Q
     |||||| |||||| ||  || ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  14780169 -caagtgtgtgtgtgctcacatatcctataaacatttgatagaaaacaccctctttttttttagagagagttttttagcgagtgaataactcaaaag 14780074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 20517000 - 20517059
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20517000 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 20517059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 24720341 - 24720400
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24720341 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccatttatttttt 24720400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 6736647 - 6736566
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttag 164  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6736647 aacacaccttctaaaaaaat-aagtaggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttag 6736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 161
Target Start/End: Original strand, 11327676 - 11327734
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttt 161  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11327676 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttattttt 11327734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18123078 - 18123031
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  18123078 tttggtaaaacactcccacatagaaattagtaggtgtgttctagcaaa 18123031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 163
Target Start/End: Original strand, 25818544 - 25818623
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttta 163  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25818544 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatttttta 25818623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Original strand, 27131071 - 27131138
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgt 71  Q
    |||||||||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  27131071 actaatttttatgaaggtgtcttttagcaagttataactaaaaagttgataatcacaccttgaggtgt 27131138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14718990 - 14718944
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14718990 ttgctaaaacactcctatataaaaactagtaggtatgttctagcaaa 14718944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 263
Target Start/End: Original strand, 14778127 - 14778164
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgtt 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14778127 ttgctaaaacactcc-acataaaaactagtgggtgtgtt 14778164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 17327186 - 17327232
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  17327186 ttgctaaaatactcccacataaaaacggttgggtgtgttctagcaaa 17327232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 18829899 - 18829945
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18829899 ttgctaaaacattcccatataaaaactagtgggtatgttctaacaaa 18829945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 19069460 - 19069410
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  19069460 gtgttttagcaagttataattaaaaactagttaaatacaccttaaggtgta 19069410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 18352433 - 18352373
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttta 163  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18352433 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatttttta 18352373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38876285 - 38876233
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccactt 155  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38876285 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccactt 38876233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 3512820 - 3512788
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagcaag 34  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3512820 ccactaatttttatgtgggagtgttttagcaag 3512788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 8048188 - 8048156
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8048188 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 8048156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9401773 - 9401710
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  9401773 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatattttagaa 9401710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14719111 - 14719052
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14719111 aagtgggtgtattccagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 14719052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 20516898 - 20516930
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20516898 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 20516930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 27812022 - 27812081
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27812022 aagtgggtgtattctagcaaatgcctacagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 27812081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 28605522 - 28605585
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  28605522 aagtgggtgtattctagcaaatacctata-gaatttgctaaaacacacccacttgttttttagaa 28605585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 32577623 - 32577682
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcct-ataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32577623 aagtgggtgtattctagcaaatgcttatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 32577682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 38368073 - 38368037
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagtta 37  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38368073 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagtta 38368037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 41407421 - 41407484
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  41407421 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatattttagaa 41407484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 45225322 - 45225274
Alignment:
Q  25 ttttagcaagtta-taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  45225322 ttttagcaagttaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgta 45225274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 26017 - 26290
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26017 cccaataatttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 26116  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26117 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcatttgctagaatacacccacttatattttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtgg 26216  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26217 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcgaaccc 26290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26045 - 26003
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26045 taaaacactcccacataaaaattattgggtgtgttctagcaaa 26003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 121)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 21442094 - 21442366
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21442094 cccactaatttttatgtgggagtgttttagtaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 21442193  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21442194 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaataca-ccacttgttttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 21442292  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21442293 ttaaatacaccttaaggtgtagatttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 21442366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 9483615 - 9483887
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9483615 cccactagtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatagacattaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 9483714  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9483715 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 9483813  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9483814 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaatactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 9483887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 31071520 - 31071784
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||     
T  31071520 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaaattaataaatacaccttaaggtgtatgtcgctataacacaccttctaaaaaa- 31071618  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31071619 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacaccaacttattttttagaaggagtattttagcaaatcaataactaaaaagtgg 31071717  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071718 ttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 31071784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14826518 - 14826252
Alignment:
Q  6 taatttttatg-tggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaa 104  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  14826518 taatttttatggtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa-caa 14826420  T
Q  105 gtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 204  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14826419 gtaggtgtgttctagcaaatcctataagcatttgctagaatacacccacttattttttagaatgaatatttttgcaagtgaataactaaaaagtggttaa 14826320  T
Q  205 atacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14826319 atacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgg--gtgttctagcaaaccc 14826252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19971662 - 19971390
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  19971662 cccactagtttttatgttggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaa 19971563  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19971562 t-aagtgggtgtgttctaacaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatgg 19971464  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19971463 ttaaatacaccctaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttgtagcaaaccc 19971390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Original strand, 41942833 - 41943094
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  41942833 tttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccctaaggtgtatcttgctataacacaccttctaaaaaa--caagtgg 41942930  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41942931 g-gtgttctagcaaatcctataggcatt-gctagaatacacccacttattttttaggaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 41943028  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41943029 actttaaggtgtaactttgctaaaacactcccacataaaaactaatggatgtgttctagcaaaccc 41943094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 1782968 - 1783225
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1782968 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 1783067  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1783068 -caagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtgttttagcaagtgaataactaaaaagtgg 1783166  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
    |||||              || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1783167 ttaaa--------------taactttactaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 1783225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 30577842 - 30578103
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  | ||||    
T  30577842 tttttatgtgagagtgttttagcaagttataactgaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaataggtgg 30577941  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30577942 gtgtgttctagcaaattctataggcatttgctaggatacacccgcttattttttagaatgagtattttagcaggtgaataactaaaaagtggttaaatac 30578041  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 270  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  30578042 accataaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaattagtggatgtgttatagcaa 30578103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 31 - 274
Target Start/End: Original strand, 21021181 - 21021423
Alignment:
Q  31 caagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctata 130  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21021181 caagttataaataaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttactataacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtgttctaacaaatcctata 21021279  T
Q  131 ggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgcta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21021280 ggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaaatggttaaatacaccctaaggtgtagctttgcta 21021379  T
Q  231 aaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21021380 aaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttgtagcaaaccc 21021423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5642706 - 5642479
Alignment:
Q  38 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  5642706 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataa-caagtgggtgt-----agcaaatcctataggcattt 5642613  T
Q  138 gctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacact 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5642612 gctagaatacacccactttttttgtagga---gtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaacact 5642516  T
Q  238 cccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5642515 cccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaaccc 5642479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5644647 - 5644420
Alignment:
Q  38 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||     ||||||||||||||||||||    
T  5644647 taactaaaaagttaataaatacaccttaaggtatatgttgctataacacaccttctaaaataa-caagtgggtgt-----agcaaatcctataggcattt 5644554  T
Q  138 gctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacact 237  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5644553 gctagaatacacccactttttttgtagga---gtattttagcaagtgaataattaaaaagtggttaaatacaccttaaagtgtagctttgctagaacact 5644457  T
Q  238 cccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5644456 cccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaaccc 5644420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3154301 - 3154165
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3154301 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctagaaaaa 3154202  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcattt 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3154201 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcttataggcattt 3154165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8258531 - 8258285
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||  |||| || ||||   |||||||||| |  ||||    
T  8258531 gtgttttagcaaagatataactaaaaaattgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacattccttataaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 8258434  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8258433 aactcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaagaagtgttttagcaaat-tataaccaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 8258335  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8258334 agc-ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttatagcaaa 8258285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26043150 - 26042904
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||| ||||   |||||||||| |  || |    
T  26043150 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatattgctaaaatacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttaac 26043053  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26043052 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 26042954  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26042953 agctt-gctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 26042904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 27545747 - 27545993
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |   |||||||||| |  ||||    
T  27545747 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagc 27545844  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27545845 aactcctataagcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 27545943  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27545944 ag-attgctaaaacactaccacataaaaactagcgggtgtgttctagcaaa 27545993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 271
Target Start/End: Original strand, 25127840 - 25128104
Alignment:
Q  6 taatttttatgtggtagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaa 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||  ||    
T  25127840 taatttttatgtgggagtgttttagcaaaaatataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacaaaccttctaaaaaaaataa 25127939  T
Q  105 gtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaa 204  Q
    |||||||| |  |||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  25127940 gtgggtgtatgttagcaactcctacagacatttgctagaatactctcacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaa 25128038  T
Q  205 atacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25128039 atgcaccttaaggtgtagc-ttgctaaaacactcccacataaaaactaatgggtgtgttatagcaaa 25128104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2823811 - 2823565
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   || ||||||| |  ||||    
T  2823811 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aattgggtgtatgttagc 2823714  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  2823713 aactcctatagacatttgctaggatacatccacttattttttagaaagtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtat 2823615  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2823614 agctt-gctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 2823565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30633295 - 30633028
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  30633295 cccactaatttttaagtgggagtgttttagcaaaaatataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 30633196  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
       |||||||||| |  |||||| | ||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||     
T  30633195 t--aagtgggtgtttgttagcaacttctacatgcatttgctagaatacacccatttaatttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagta 30633099  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30633098 gttaaatgcaccttaaggtgtagctta-ctaaaacactctcacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaa 30633028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35550786 - 35550555
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  35550786 tataagtaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacactttctaaaatat--aagtgggtgtatattagcaactcctataggcat 35550689  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  35550688 ttgctaggatacactcacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaaca 35550591  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35550590 ctcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 35550555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13468496 - 13468264
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  13468496 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 13468398  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||||||| |    
T  13468397 ttgctataatacacccacttattttttagaaggtgtgctttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatactccttaaggtatagc-ttgctaaaata 13468300  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13468299 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaa 13468264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 30207169 - 30207400
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  30207169 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccatctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 30207266  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||||| |  |||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||    
T  30207267 ttgctagaatacacccacttattttttaaagagtgtgttttagcaaat-tataattaaaaagtagttaaatgcacattaaggtgtaac-ttgctaaaaca 30207364  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30207365 ctcccacataaaaactagtggatgtgttctagcaaa 30207400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 32069009 - 32069253
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  32069009 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 32069106  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32069107 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataact--aaagtagttaaatacaccttaaggtgt 32069203  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  32069204 agc-ttgctaaaacactcacacatgaaaactagtgggtgtggtctagcaaa 32069253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29125883 - 29125673
Alignment:
Q  57 tacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccactta 156  Q
    |||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  |||   |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29125883 tacaccttaaggtgaatgttactaaaacacaccttctaagaaat--aagtgggtgtatcttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccaccta 29125786  T
Q  157 ttttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgg 256  Q
    |||||| |||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29125785 ttttttggaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaattagtgg 29125688  T
Q  257 gtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||    
T  29125687 gtgtgttctagcaaa 29125673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32487122 - 32486890
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| |  || |||  | |||||||||| || |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  32487122 tataactaaaaagttgttaaatacatcttaagataaatcttggtaaaacacacctt-taaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 32487024  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  32487023 ttgctaggatacacccacttattttttagaaagtgtattttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgcagc-ttgctaaaaca 32486926  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32486925 ctcccacgtaaaaaccagtgggtgtgttctaacaaa 32486890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Original strand, 10616278 - 10616503
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| || |||||||| || |||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  10616278 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatatacattaaggtgaatattgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 10616375  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  10616376 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccttaaggtgt 10616474  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaac 250  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10616475 ag-tttgctaaaacactcccacataaaaac 10616503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4018767 - 4018650
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  4018767 cccactagtttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 4018668  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttcta 118  Q
     |||||||||||||||||    
T  4018667 acaagtgggtgtgttcta 4018650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 3369699 - 3369944
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| || |   |||||||||| |  ||||    
T  3369699 gtgttttagcaaatatatagctaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaatat--aagtgggtgtatgttagc 3369796  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||   || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  3369797 aactcctataggcatttgctaggatacacccacttatttttaa-aaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatataccttaaggtgt 3369894  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  3369895 agctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtatgtgtgttctaacaaa 3369944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 1201635 - 1201884
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||||||||   |  |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  1201635 cccactaatttttattaaggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgtaaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaa 1201734  T
Q  100 agcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtg 199  Q
       |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||   || ||||| ||| |  |||||||||||||     
T  1201735 t--aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcatttgctaggatacacccacttatattttagaaggtgtgttttaacaaat-tataactaaaaagta 1201831  T
Q  200 gttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactag 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1201832 gttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgttaaaacactcccacataaaaactag 1201884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 172 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 3154168 - 3154066
Alignment:
Q  172 attttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3154168 attttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaaggtgtagttttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 3154069  T
Q  272 ccc 274  Q
    |||    
T  3154068 ccc 3154066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 14819273 - 14819394
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14819273 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaacacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttcta-aaaaa 14819371  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaa 123  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  14819372 acaagtggatgtgttctagcaaa 14819394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 271
Target Start/End: Original strand, 42556441 - 42556567
Alignment:
Q  143 aatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccac 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  42556441 aatacacctacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacatcttaaggtgtatc-ttgctaaaacac-cccac 42556538  T
Q  243 ataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42556539 ataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 42556567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 34102987 - 34103233
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||||   |||||||||| |  ||||    
T  34102987 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattctaaaaaat--aagtgggtgtatgttagc 34103084  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || | |||||||| |||||||  ||||| ||| |||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||  |||| ||||    
T  34103085 aacttctataggcttttgctatgatacatccatttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaaaatagttaaatacactttaacgtgt 34103183  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34103184 agctt-gctaaaacaatcccacatgaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 34103233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 139 - 273
Target Start/End: Original strand, 25281053 - 25281186
Alignment:
Q  139 ctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25281053 ctagaatacacccacttattttttagaatgagtattttagcaaataaataactaaaaagtgcttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactc 25281152  T
Q  239 ccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaacc 273  Q
     |||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  25281153 acacataaaaattact-ggtgtgttctagcaaacc 25281186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 267
Target Start/End: Original strand, 26630016 - 26630251
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  ||||    
T  26630016 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtgggtgtatgttagc 26630113  T
Q  121 aaatcctataggcattt-gctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | || ||||         ||||||||||||| || |||| || |||||||||    
T  26630114 aactcctatagacatttagctaggatacacccacttatttttttgaagatgtgtttt---------ataactaaaaagtagtgaaatgcaccttaaggtg 26630204  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 267  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26630205 tagc-ttgctcaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctag 26630251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26868133 - 26867886
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  ||||| |||| |  ||||    
T  26868133 gtgttttagcaaagataaaactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgccaaaacacaccttct-taaaaattaagtgcgtgtatgttagc 26868035  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||   || |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  26868034 aactcctataggcatttactataacacacccacttattttctagaaggtgtgttttagcaagt-tatatctaaaaagtagttaaatacaccctaaggtgt 26867936  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  26867935 agc-ttgctaaattactcccacataaaaattattggatgtgttctagcaaa 26867886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 5946996 - 5946782
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagt-tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||||||| |||||  |||||||||| |  ||||    
T  5946996 gtgttttagcaaatatataactaaaaagttgttaaataaaccttaaggtgaatgttgttgaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 5946898  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  5946897 aactcctatcggcatttgctaggatacacc-acttattttttagaagatgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgt 5946800  T
Q  221 agctttgctaaaacactcc 239  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  5946799 agc-ttgctaaaacactcc 5946782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39934590 - 39934364
Alignment:
Q  42 taaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgcta 141  Q
    |||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||| | ||||| | || || |||||  |||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  39934590 taaaaagttgttaaatataccttaatgtgaatgttgctaaaacactcatt-taaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctacaggcatttgcta 39934492  T
Q  142 gaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactccca 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   || ||||| |||||  |||||||||| || |||||||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  39934491 gaatacaccaacttattttttagaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaggtagttaaatacaccctaaggtgtaac-ttgataaaacactccca 39934394  T
Q  242 cataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39934393 aataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 39934364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1281999 - 1281847
Alignment:
Q  117 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaag 216  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  1281999 tagcaacttctataggcatttggtagaatacatccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagtta-taactaaaatgtagttaaatacactttaag 1281901  T
Q  217 gtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1281900 gtgtaactt-gctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 1281847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1775627 - 1775514
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  1775627 cccactagtttttatgtgggagtgttttaacaagttataactaaaatgttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttct-taaaaa 1775529  T
Q  101 gcaagtgggtgtgtt 115  Q
     ||||||||||||||    
T  1775528 acaagtgggtgtgtt 1775514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 10776977 - 10777206
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  10776977 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacacattcta-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcat 10777075  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||     || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |    
T  10777076 ttgctaagatacatccacttattttttag---gtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgtag-tttgctaaaata 10777170  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    || ||||||||||||||  | ||||||| |||||||    
T  10777171 cttccacataaaaactaaagagtgtgttatagcaaa 10777206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13269429 - 13269232
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||||||  |||    
T  13269429 tataattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataaacat 13269331  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| | |||||||||||    
T  13269330 ttgctagaatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgtaac-ttgctaaaaca 13269233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 36 - 260
Target Start/End: Original strand, 25123380 - 25123600
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   || ||| ||| |  ||||||  ||||||| |||    
T  25123380 tataactaaaaaattgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aaatggttgtatgttagcaacgcctatagacat 25123477  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||| |||||  ||||||||||||| ||||||| || || |||  ||||| |||||||||||    
T  25123478 ttgctagaatacacccacttattttttaaaaggtgtgttttaacaagt-tataactaaaaagtagttaaatgcacctgaagacgtagc-ttgctaaaaca 25123575  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  25123576 ctctcacataaaaactagtgggtgt 25123600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 239
Target Start/End: Original strand, 184093 - 184308
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  ||||    
T  184093 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaagtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtgggtgtatgttagc 184190  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccactta-ttttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtg 219  Q
    ||  | ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   || |||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  184191 aacccatatagacatttgctaggatacacccacttatttttttagaatgtgtgttttaataagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtg 184289  T
Q  220 tagctttgctaaaacactcc 239  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  184290 tagc-ttgctaaaacactcc 184308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23161405 - 23161282
Alignment:
Q  146 acacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacata 245  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  23161405 acacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagtagttaaatacacattaaggtgtagctt-gctaaaacactcccacatg 23161308  T
Q  246 aaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23161307 aaaactagtgggtatgttctagcaaa 23161282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 45299774 - 45299571
Alignment:
Q  44 aaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctaga 143  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   |||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||     
T  45299774 aaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatgctagcaactcttataggcatttgctagg 45299677  T
Q  144 atacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccaca 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||   || ||||||||| |  |||| |||||| | || |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45299676 atacacccacttatttttttgaaggtgtgttttagcaaat-tataattaaaaaatagtgaaatgca-cttaaggtgtagc-ttgctcaaacactcccaca 45299580  T
Q  244 taaaaacta 252  Q
    |||||||||    
T  45299579 taaaaacta 45299571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2178780 - 2178669
Alignment:
Q  159 ttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggt 258  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  2178780 ttttagaaggagtattttagcaaatgaataactaaaaagtggttaaatacaccttaa-gtgtaggtttgctaaaacactcccatataaaaaccagtggat 2178682  T
Q  259 gtgttctagcaaa 271  Q
    || ||||||||||    
T  2178681 gtcttctagcaaa 2178669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23053897 - 23053810
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23053897 ataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtatagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 23053810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 25280962 - 25281058
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaa 97  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25280962 cccactagtttttatgtgagagtgttttaacaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtaagttgctataacacaccttctagaa 25281058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9484115 - 9483938
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||| ||||    
T  9484115 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacactttcta-aaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctataagcat 9484017  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaa 215  Q
    ||| ||  ||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  9484016 ttgttaagatatacccacttattttttagaagatgtgttttagcaagt-tataactaaaaaatagttaaatacaccttaa 9483938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 21442469 - 21442395
Alignment:
Q  114 ttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaata 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21442469 ttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtgaata 21442395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 9413810 - 9414041
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| |||||| || ||||||| | ||| |||||||||  |||   |||||| ||| |  |||||| |||||||| |||    
T  9413810 tataactaaaaaattgttaaatacatcttaagatgaatgttgctaaaactcaccttctaacaaat--aagtggatgtatgttagcaactcctatagacat 9413907  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||    | ||||||||||| | ||| |||||||| | | |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  9413908 ttgctagaatacatctacttattttttaaaaggtatgttttagcaagtta-taattaaaaagtcggtgaatataacttaaggtgtagctt-gctaaaaca 9414005  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9414006 ctcctacataaaaactagtgagcgtgttctagcaaa 9414041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 271
Target Start/End: Original strand, 18804880 - 18805022
Alignment:
Q  127 tataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagcttt 226  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||     
T  18804880 tatagccatttgttagaataaacccacatattttttagaaggactattttaacaaatga-taactaaaaagtagttaagtacaccttaaggtatagctt- 18804977  T
Q  227 gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18804978 gctaaaataatcccacataaaaactagtgggtgtgttatagcaaa 18805022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Original strand, 32512114 - 32512266
Alignment:
Q  117 tagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaag 216  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||   | |||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||||| |||||     
T  32512114 tagcaactcttataggcatttgctataatacatttatttattttttagaatgagtgttttagcaaatga-taaataaaaaatagttaaatacatcttaaa 32512212  T
Q  217 gtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32512213 gtgtagctt-gctaaaacactctcacataaaaactagtggatgtgttctaacaaa 32512266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 13290463 - 13290684
Alignment:
Q  2 ccactaatttttatgtggtagtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  || || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||| || ||||  |||||    
T  13290463 ccactaatttttatgtgggagtgttttagcaaaaataaaattaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacagacattct--aaaaa 13290560  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      |||||| ||| |  |||||| || || | ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  13290561 ataagtggatgtatgttagcaactcttacatgcatttgttagaatacatccacttaatttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtag 13290659  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctt 225  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||    
T  13290660 ttaaatgcactttaaggtgtagctt 13290684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23545002 - 23544858
Alignment:
Q  22 gtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  ||||    
T  23545002 gtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaat-aagtgggtgtatgttagc 23544904  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23544903 aactcctatagacatttgttagaatacacccacttattttttagaa 23544858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 271
Target Start/End: Original strand, 36901237 - 36901320
Alignment:
Q  187 taactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36901237 taactaaaaagtagttaaatacaccttaagatgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttttagcaaa 36901320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29377929 - 29377845
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29377929 ataactgaaaagttgttaaatacaccttaaggtgtaactt-gctaaaacactcccacataaaaactagggggtgtgttctagcaaa 29377845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Original strand, 36899739 - 36899886
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacac--cttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggc 133  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || |   |||||||||| |  |||||| ||||||| ||    
T  36899739 tataactaaaaagttgttaaatacacatcttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaatat--aagtgggtgtatgttagcaactcctatacgc 36899836  T
Q  134 atttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  36899837 atttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt 36899886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 271
Target Start/End: Original strand, 42556757 - 42556895
Alignment:
Q  131 ggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgcta 230  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||   || ||||||||||| | |||||||||||  || ||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  42556757 ggcatttgctaggatacactcacttatttttttgaatgtgtgttttagcaagtta-taactaaaaagcagtgaaatgtaccttaaggtgtagctt-gcta 42556854  T
Q  231 aaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42556855 aaacactcttacataaaaactagtggatgtgttatagcaaa 42556895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 36 - 158
Target Start/End: Original strand, 17691217 - 17691337
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  |||||| | |||||| |||    
T  17691217 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtgggtgtatgttagcaacttctatagacat 17691314  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttatt 158  Q
    ||| || ||||||||||||||||    
T  17691315 ttgttataatacacccacttatt 17691337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 186 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17952677 - 17952593
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17952677 ataactaaaaagtagttaaatacaccctaaaatgtagctt-gctaaaacactcccacataaaaactagtggatgtgttctaccaaa 17952593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 18804309 - 18804386
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  18804309 gtgttttaacaagttataattaaaaagttgataaatacaccttgaggtgtatgttgctataagacaccttctaaaaaa 18804386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9869640 - 9869530
Alignment:
Q  169 agtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccaca-----taaaaactagtgggtgtgtt 263  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||| |||     ||||||| ||||||||||||    
T  9869640 agtattttagcatgtaaataactaaaaagtggttaaatacacctttacgtgtatctttcataaaacactccgacataacttaaaaacaagtgggtgtgtt 9869541  T
Q  264 ctagcaaaccc 274  Q
    || ||||||||    
T  9869540 ctcgcaaaccc 9869530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Original strand, 25123632 - 25123770
Alignment:
Q  8 atttttatgtggtagtgttttagca-agttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagt 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||  ||||    
T  25123632 atttttatgtgggagtgttttagcatagatataactaaaaagttgttaaatacactttaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaaaaataagt 25123729  T
Q  107 gggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatac 147  Q
    |||||| |  || ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  25123730 gggtgtatgttaacaactcttataaacatttgctagaatac 25123770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 39922484 - 39922359
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||  ||||| |||| |  ||||    
T  39922484 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacacattct--aaaaaataagtgagtgtatgttagc 39922387  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaataca 148  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||    
T  39922386 aactcctataggcatttgctaggataca 39922359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44874263 - 44874097
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    |||||||||| |  || ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| | ||| |  ||||||||||||| |||    
T  44874263 aagtgggtgtatgttaacaactcctacagacaattgctagaatacacccacttattttttagaaagtgtgtttcaccaact-tataactaaaaagtagtt 44874165  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| | |||| ||   ||||||||| || |||||||    
T  44874164 aaatacaccttaagatgtagc-ttgttaaaacactctcgcatacaattcagtgggtgttttgtagcaaa 44874097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21352470 - 21352391
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  21352470 agtgttttaacaagttataactaaaaattcgataaatacacattaaggtgtatgttgttataacacacattctaaaaaaa 21352391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 1775599 - 1775641
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1775599 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 1775641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1783000 - 1782954
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1783000 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttatagcaaa 1782954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 3154269 - 3154315
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3154269 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 3154315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 4018735 - 4018781
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4018735 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctaacaaa 4018781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9483643 - 9483601
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9483643 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 9483601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14819305 - 14819259
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14819305 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 14819259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 19971630 - 19971676
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19971630 ttgctaaaacactccaacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 19971676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 162
Target Start/End: Original strand, 35067001 - 35067127
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||| ||||  |||||  |||||||||| |  |||||| |||| |||| ||    
T  35067001 tataattaaaaagttgttaattacaccttaagataaatgttgctaaaacacacattcttaaaaaaataagtgggtgtatgttagcaactcctttaggtat 35067100  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35067101 ttgctagaatacgcccacttatttttt 35067127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Original strand, 42556395 - 42556449
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacacct 63  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42556395 tttttacgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttaataaatacacct 42556449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 7090040 - 7089968
Alignment:
Q  22 gtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttct 93  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  7090040 gtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct 7089968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 29125772 - 29125666
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagca 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  | | |||||   ||||||||||||||||||    
T  29125772 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagcttgctaaaacactcccac-ataaaaa-ttagtgggtgtgttctagca 29125675  T
Q  122 aatcctata 130  Q
    |||||||||    
T  29125674 aatcctata 29125666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21442123 - 21442080
Alignment:
Q  228 ctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21442123 ctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 21442080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 42556648 - 42556739
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacacctt 91  Q
    ||||||| |||||||  ||  |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  42556648 cccactagtttttattagggtgtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacacctt 42556739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30577866 - 30577820
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30577866 ttgctaaaacactctcacataaaaactaatgggtgtgttctagcaaa 30577820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 35550654 - 35550604
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  35550654 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 35550604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41942857 - 41942811
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41942857 ttgctaaaacactcccacataaaaactagcgggtgcgttctagcaaa 41942811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 255
Target Start/End: Original strand, 35067345 - 35067412
Alignment:
Q  186 ataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtg 255  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35067345 ataactaaaaagtagttaaaaaca-cttaaggtgtagctt-gctaaaacacttctacataaaaactagtg 35067412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 271
Target Start/End: Original strand, 184692 - 184732
Alignment:
Q  231 aaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  184692 aaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 184732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31071552 - 31071517
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071552 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 31071517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 10777107 - 10777157
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  10777107 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaagtgta 10777157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13269296 - 13269246
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||    
T  13269296 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatgcaccttaaggtgta 13269246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23161381 - 23161331
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  23161381 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacacattaaggtgta 23161331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42556415 - 42556373
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  42556415 taaaacactcccacgtaaaaactagcgggtgtgttctagcaaa 42556373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32069160 - 32069063
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagca 180  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  32069160 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaaagtgtgttttagca 32069064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 1281861 - 1281897
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagtta 37  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1281861 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagtta 1281897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1783121 - 1783062
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  1783121 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 1783062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9483768 - 9483709
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9483768 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgtttttt 9483709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Original strand, 19971509 - 19971568
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19971509 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgttagaacacacccacttatttttt 19971568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21021304 - 21021245
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttt 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21021304 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgttagaacacacccacttatttttt 21021245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25123656 - 25123609
Alignment:
Q  226 tgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  25123656 tgctaaaacactcccacataaaaa-tagtgggtgtgtcctaacaaaccc 25123609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25280995 - 25280947
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtg-ttctagcaaa 271  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25280995 tttgttaaaacactctcacataaaaactagtgggtgtgtttctagcaaa 25280947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31071672 - 31071609
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31071672 aagttggtgtattctagcaaatgcctatagg-atttgctagaacacacccacttgttttttagaa 31071609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 8258385 - 8258334
Alignment:
Q  21 agtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  8258385 agtgttttagcaaattataaccaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 8258334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23053912 - 23053865
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggt 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23053912 gtgttttagcaagatataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggt 23053865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Original strand, 29377534 - 29377597
Alignment:
Q  146 acacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaataca 209  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||    
T  29377534 acactcacttgttttttagaataagtattttagcaaaaatataattaaaaagtggttaaataca 29377597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30207286 - 30207224
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttaga 165  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30207286 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttaga 30207224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 271
Target Start/End: Original strand, 30633262 - 30633309
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  30633262 tttgctaaaacactcccacttaaaaattagtgggtgtatcctagcaaa 30633309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 42556682 - 42556631
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  42556682 ctttgctaaaacacaccctaataaaaactagtgggtgtatcctagcaaaccc 42556631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 1281946 - 1281896
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||    
T  1281946 gtgttttagcaagttataactaaaatgtagttaaatacactttaaggtgta 1281896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 246
Target Start/End: Original strand, 9872305 - 9872383
Alignment:
Q  169 agtattttagcaagtgaata-actaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataa 246  Q
    |||||||||||| || |||| | |||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  9872305 agtattttagcatgtaaatagattaaaaattggttaaatacaccttcacgtgtacctttcctaaaacactccaacataa 9872383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 10616429 - 10616347
Alignment:
Q  82 aacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10616429 aacacaccttctaaaaaat--aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 10616347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25127868 - 25127818
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| | |||||||||||    
T  25127868 tttgctaaaacactcccacataaaaattaatggttgtatcctagcaaaccc 25127818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 5643128 - 5643083
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaa 46  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5643128 cccactagtttttacgtggaagtgttttaacaagttataactaaaa 5643083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 5645069 - 5645024
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaa 46  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5645069 cccactagtttttacgtggaagtgttttaacaagttataactaaaa 5645024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 163
Target Start/End: Original strand, 8258399 - 8258459
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttatttttta 163  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8258399 aagtgggtgtattctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttatttttta 8258459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 26042918 - 26042951
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaag 34  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26042918 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaag 26042951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 29125687 - 29125720
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaag 34  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29125687 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaag 29125720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 32486986 - 32486945
Alignment:
Q  25 ttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  32486986 ttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaa 32486945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1201788 - 1201725
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1201788 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctatagg-agttgctaacatacacccacttattttttagaa 1201725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 9483982 - 9483938
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  9483982 gtgttttagcaagttataactaaaaaatagttaaatacaccttaa 9483938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13290495 - 13290463
Alignment:
Q  224 tttgctaaaacactcccacataaaaactagtgg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13290495 tttgctaaaacactcccacataaaaattagtgg 13290463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 19971407 - 19971439
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19971407 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 19971439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 21021406 - 21021374
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaa 33  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21021406 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaa 21021374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Original strand, 45299665 - 45299728
Alignment:
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaat-cctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaa 166  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45299665 aagtgggtgtatcctagcaaatgcctataag-agttgctagcatacacccacttattttttagaa 45299728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 452333 - 452604
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  452333 cccactagtttttatgtgagagtgttt-agcaaattataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaaaaaaa 452431  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtgg 200  Q
      ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  452432 t-aagtgcgtgtgttctagcaaatcgtataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagcaagtatataactaaaaagtgg 452530  T
Q  201 ttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452531 ttaaatacaccttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 452604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 452359 - 452319
Alignment:
Q  231 aaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  452359 aaacactctcacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 452319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 6)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2959 - 2767
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||    
T  2959 actagtttttatatggaagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaca 2860  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2859 agtgggtgtgttctagcaaattctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15014 - 14822
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagca 103  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||    
T  15014 actagtttttatatggaagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacatcttaagatgtatgttgttataacacaccttctaaaaaaaaca 14915  T
Q  104 agtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  14914 agtgggtgtgttctagcaaattctataggcatttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtattttagtaagtgtataactaaaaa 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2731 - 2693
Alignment:
Q  119 gcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2731 gcaaatcctataggcatttgttaaaatacacccacttat 2693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 2930 - 2976
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2930 ttgctaaaacacttccatataaaaactagttggtgtgttctatcaaa 2976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14786 - 14748
Alignment:
Q  119 gcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttat 157  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14786 gcaaatcctataggcatttgttaaaatacacccacttat 14748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Original strand, 14985 - 15031
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14985 ttgctaaaacacttccatataaaaactagttggtgtgttctatcaaa 15031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 20620 - 20852
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||| |  |||||| ||||||||||||    
T  20620 tataactaaaaagttgttaaatacaccttaagatgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggtgtatgttagcaactcctataggcat 20718  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  20719 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtatgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtatc-ttgctaaaaca 20816  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20817 ctcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 20852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 78
Target Start/End: Original strand, 20754 - 20809
Alignment:
Q  23 tgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgc 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20754 tgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtatcttgc 20809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 20838 - 20805
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaag 34  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20838 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaag 20805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 271
Target Start/End: Original strand, 9733 - 9964
Alignment:
Q  36 tataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcat 135  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||  ||||||| || |  |||||| ||||||||||||    
T  9733 tataactaaaaagttgttaaatacacctcaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaaat-aagtgggcgtatgttagcaactcctataggcat 9831  T
Q  136 ttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaaca 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9832 ttgctaggatacacccacttattttttagaaggtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttgctaaaaca 9929  T
Q  236 ctcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9930 ctcctacataaaaactagt-ggtgtgttctagcaaa 9964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 72
Target Start/End: Original strand, 9866 - 9916
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgta 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  9866 gtgttttagcaagttataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgta 9916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6749 - 6504
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| || || ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||   || |||||||||  ||||    
T  6749 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatatactttgaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat--aattgggtgtgtgttagc 6652  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  6651 aactcctataggcatttgctaggatacatctatttattttttagaaggtgtattttagcaagtta-taactaaaaagtaattaaatacaccttaaggtgt 6553  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 270  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6552 agctt-gctaaaacacttccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaa 6504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5911 - 5658
Alignment:
Q  4 actaatttttatgtggtagtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagc 102  Q
    |||| ||||||| | | |||||||||| || | |||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||       
T  5911 actagtttttatataggagtgttttagaaaagatataactaaaaagttgttaaatataccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttctaaaaaat-- 5814  T
Q  103 aagtgggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggtt 202  Q
    ||||||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  5813 aagtgggtgtaagttagcaactcctatagacatttgctagaatacacccacttattttttagaatgtgtgttttagcaagt-tataactaaaaagtagtt 5715  T
Q  203 aaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    ||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5714 aaatataccttaaggtgtagc-ttactaaaacactcccacgtaaaaactagtgggtgt 5658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 258
Target Start/End: Original strand, 5567 - 5639
Alignment:
Q  185 aataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggt 258  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  5567 aataattaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgtagc-ttattaaaacattctcacgtaaaaactagtgggt 5639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 260
Target Start/End: Original strand, 22589 - 22838
Alignment:
Q  10 ttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaa--gttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtg 107  Q
    ||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||||||    
T  22589 ttttatgtgcttgtattttaacaagttttaactaaaaaaagttaataaatacaccttgaggtgtatgttgctataacacactttt--gaaaaaacaagtg 22686  T
Q  108 ggtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaata 207  Q
    ||||| |  |||||| |  |||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  22687 ggtgtatgttagcaagttttatatgtgtttgttagaatacacccacttattttttagaaggagtcatttggtaagtgaataattaaaaagtggttaaata 22786  T
Q  208 cagcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgt 260  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22787 caccctaaggtgtagc-ttgctaaaacacttccacatagaaactattgggtgt 22838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 4269 - 4043
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||  |||||| ||| |  ||||    
T  4269 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaaatacaccttaaggtgaatgttgctaaaacacaccttct--aaaaaataagtggatgtatgttagc 4172  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || ||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4171 aactcctataagcatttgcta-aatacacccacttattttttagaaggtgtgtttgagcaagt-tataactaaaaagtagttaaatacaccttaaggtgt 4074  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaacta 252  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4073 aac-ttgctaaaacactcctacataaaaacta 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Original strand, 82716 - 82830
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  82716 tttttatgtgggagtattttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgctataacacaccttctaacaaaaacaagtgg 82815  T
Q  109 gtgtgttctagcaaa 123  Q
    |||||||||||||||    
T  82816 gtgtgttctagcaaa 82830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 82740 - 82694
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  82740 ttgctaaaatactcccacataaaaacggttgggtgtgttctagcaaa 82694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 14962 - 14829
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| || | |||    
T  14962 cccactactttttacgtgggagtgttttaacaagttataactaaaaagttattaaacacaccttactgtgtatgttgctataacacaccttgtatagaaa 14863  T
Q  101 gcaagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 134  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14862 ataagtgggtgtgttctagcaaatcctataggca 14829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 14934 - 14976
Alignment:
Q  229 taaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14934 taaaacactcccacgtaaaaagtagtgggtgtgttctagcaaa 14976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0778
Description:

Target: scaffold0778; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 6237 - 6313
Alignment:
Q  1 cccactaatttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg 77  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6237 cccactaatttttatgtgggagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttg 6313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0778; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6269 - 6223
Alignment:
Q  225 ttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6269 ttgctaaaacactcccacataaaaattagtgggtgtgttctagcaaa 6223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 774 - 550
Alignment:
Q  22 gtgttttagcaa-gttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgggtgtgttctagc 120  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||| | | | ||||||| ||||| || |   |||||||||| |  ||||    
T  774 gtgttttagcaaagatataactaaaaagttgttaattacaccttaagatgaatgcttctaaaacacacattctaaaatat--aagtgggtgtatgttagc 677  T
Q  121 aaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatacagcttaaggtgt 220  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    | ||||||||||  | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  676 aactcctataggcattttctaggatacacccacttatttttcagaaggtatgttttagcaagcta-taactaaaaagtagttaaaaacaccttaaggtgt 578  T
Q  221 agctttgctaaaacactcccacataaaaa 249  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  577 agc-ttgctagaacactcccacaaaaaaa 550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 274
Target Start/End: Original strand, 761 - 812
Alignment:
Q  223 ctttgctaaaacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaaccc 274  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  761 ctttgctaaaacacaccttaataaaaactagtgggtgtattctagcaaaccc 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 271
Target Start/End: Original strand, 1 - 40
Alignment:
Q  232 aacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aacactcccacataaaaactagtgggtgtgttctagcaaa 40  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Original strand, 65934 - 66167
Alignment:
Q  9 tttttatgtggtagtgttttagcaagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaaagcaagtgg 108  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||||||| | |||||| ||| |  ||| |  |||| |    
T  65934 tttttatgttggattgttttagcaatttataactaaaaagttgataaatgctctttgaggtgtatgttgctacaacacatctttt--aaagaataagtag 66031  T
Q  109 gtgtgttctagcaaatcctataggcatttgctagaatacacccacttattttttagaaaaagtattttagcaagtgaataactaaaaagtggttaaatac 208  Q
    |||| |  ||  || ||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||    ||||||||||  | || ||| ||||||| |  ||||||||    
T  66032 gtgtatgttaataactcctatatgcatttgctagaattcacacaattattttttag---gagtattttagttattg-atacctaaaaaattattaaatac 66127  T
Q  209 agcttaaggtgtagctttgctaaaacactcccacataaaaa 249  Q
    | |||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  66128 atcttaagatgtagc-tcgctaaaacacttccacgtaaaaa 66167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1717 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1717
Description:

Target: scaffold1717; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 1366 - 1443
Alignment:
Q  22 gtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  1366 gtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaataca-cttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaa 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1527 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1527
Description:

Target: scaffold1527; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 99
Target Start/End: Original strand, 1612 - 1689
Alignment:
Q  22 gtgttttagc-aagttataactaaaaagttaataaatacaccttaaggtgtatgttgcgataacacaccttctagaaaa 99  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||    
T  1612 gtgttttagcgaagatataactaaaaagttgttaaataca-cttaaggtgaatgttgctaaaacataccttctaaaaaa 1689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University