View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3653_low_10 (Length: 265)

Name: NF3653_low_10
Description: NF3653
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3653_low_10
NF3653_low_10
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (1-259)||(7088877-7089135)
chr4 (2-259)||(12902757-12903014)
chr4 (1-259)||(44052829-44053087)
chr4 (2-257)||(22636437-22636691)
chr4 (10-252)||(23374231-23374473)
chr4 (2-259)||(16239834-16240090)
chr4 (1-259)||(7893703-7893958)
chr4 (75-259)||(7798774-7798958)
chr4 (2-256)||(16377387-16377639)
chr4 (1-259)||(14053165-14053422)
chr4 (47-259)||(16270145-16270356)
chr4 (3-254)||(14038653-14038904)
chr4 (134-259)||(52873363-52873488)
chr4 (1-144)||(3096759-3096901)
chr4 (87-256)||(44928873-44929042)
chr4 (87-259)||(6899891-6900062)
chr4 (24-259)||(17046487-17046719)
chr4 (2-136)||(17047936-17048070)
chr4 (87-256)||(18215268-18215436)
chr4 (87-256)||(12301-12469)
chr4 (87-256)||(15118346-15118514)
chr4 (87-256)||(23803259-23803427)
chr4 (87-256)||(52312510-52312678)
chr4 (87-262)||(19242693-19242867)
chr4 (87-256)||(3515007-3515175)
chr4 (87-256)||(44102214-44102382)
chr4 (87-256)||(44773081-44773249)
chr4 (87-256)||(51463862-51464030)
chr4 (93-256)||(1837509-1837671)
chr4 (87-258)||(19618166-19618336)
chr4 (93-256)||(44615288-44615450)
chr4 (93-256)||(50222339-50222501)
chr4 (113-256)||(54798729-54798872)
chr4 (112-256)||(18239438-18239581)
chr4 (133-256)||(14280316-14280438)
chr4 (87-258)||(14970701-14970871)
chr4 (173-259)||(3096293-3096379)
chr4 (87-252)||(15355318-15355483)
chr4 (87-256)||(12610950-12611111)
chr4 (87-259)||(15367690-15367862)
chr4 (87-259)||(15402703-15402875)
chr4 (93-240)||(13806-13953)
chr4 (118-259)||(15370018-15370159)
chr4 (87-257)||(22353835-22354005)
chr4 (87-259)||(15371202-15371374)
chr4 (87-259)||(15373483-15373655)
chr4 (183-259)||(39706332-39706409)
chr4 (87-256)||(7641186-7641344)
chr4 (133-256)||(8574864-8574985)
chr4 (87-253)||(20149832-20149998)
chr4 (84-210)||(43256106-43256230)
chr4 (118-259)||(16223532-16223673)
chr4 (95-240)||(21815587-21815731)
chr4 (56-244)||(52243111-52243302)
chr4 (188-259)||(15551817-15551889)
chr4 (183-255)||(12774011-12774084)
chr4 (93-244)||(43198508-43198661)
chr4 (141-244)||(12288211-12288316)
chr4 (3-62)||(15091093-15091152)
chr4 (183-255)||(8846360-8846433)
chr4 (170-255)||(13569502-13569587)
chr4 (158-240)||(6190481-6190564)
chr4 (196-233)||(5756988-5757025)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (1-259)||(27250592-27250850)
chr1 (10-259)||(21026680-21026929)
chr1 (2-259)||(22532269-22532526)
chr1 (2-258)||(50210077-50210333)
chr1 (6-256)||(34509783-34510033)
chr1 (2-182)||(22354436-22354616)
chr1 (2-258)||(20135188-20135444)
chr1 (45-258)||(22468604-22468816)
chr1 (87-256)||(16275357-16275526)
chr1 (87-256)||(21475081-21475249)
chr1 (5-259)||(38801258-38801508)
chr1 (87-256)||(13988866-13989034)
chr1 (87-256)||(21923285-21923453)
chr1 (87-256)||(23593729-23593897)
chr1 (1-148)||(22356037-22356185)
chr1 (1-148)||(22357723-22357871)
chr1 (87-259)||(45574836-45575008)
chr1 (87-256)||(31612313-31612481)
chr1 (87-257)||(21840766-21840935)
chr1 (86-256)||(29298137-29298305)
chr1 (87-256)||(29776688-29776856)
chr1 (87-256)||(433012-433178)
chr1 (38-136)||(48603637-48603735)
chr1 (168-259)||(20847184-20847275)
chr1 (87-256)||(21346961-21347130)
chr1 (87-262)||(21342090-21342265)
chr1 (87-258)||(16361915-16362085)
chr1 (87-259)||(13212855-13213027)
chr1 (87-256)||(21707167-21707335)
chr1 (87-256)||(21711709-21711877)
chr1 (93-240)||(21896211-21896358)
chr1 (84-210)||(33797570-33797694)
chr1 (87-253)||(40389157-40389323)
chr1 (164-262)||(15860080-15860177)
chr1 (87-256)||(22123061-22123230)
chr1 (93-240)||(21861525-21861672)
chr1 (183-255)||(20248283-20248356)
chr1 (10-81)||(20847091-20847163)
chr1 (112-255)||(33681011-33681153)
chr1 (191-258)||(20454606-20454673)
chr1 (133-255)||(22921864-22921986)
chr1 (183-252)||(21754052-21754122)
chr1 (183-244)||(16758664-16758726)
chr1 (170-255)||(21714546-21714631)
chr1 (112-255)||(22237631-22237773)
chr1 (112-240)||(35261055-35261180)
chr1 (183-244)||(52928014-52928076)
chr1 (183-259)||(14295595-14295672)
chr1 (75-231)||(21787979-21788135)
chr1 (183-243)||(20918620-20918681)
chr1 (196-233)||(52639560-52639597)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-259)||(912-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-259)||(167842-168099)
scaffold0011 (2-259)||(51913-52170)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (1-259)||(23654249-23654507)
chr2 (2-259)||(23285865-23286118)
chr2 (24-259)||(22731120-22731355)
chr2 (2-259)||(22738044-22738300)
chr2 (10-256)||(298686-298933)
chr2 (29-259)||(23060513-23060742)
chr2 (2-259)||(23076442-23076699)
chr2 (1-259)||(37979-38235)
chr2 (2-259)||(23660023-23660279)
chr2 (2-259)||(22337115-22337372)
chr2 (1-259)||(20309108-20309363)
chr2 (87-256)||(22105412-22105581)
chr2 (87-258)||(32214915-32215085)
chr2 (87-253)||(21155054-21155219)
chr2 (87-256)||(18808943-18809111)
chr2 (87-256)||(23709526-23709694)
chr2 (87-256)||(23712007-23712175)
chr2 (87-256)||(39682313-39682481)
chr2 (93-256)||(23130862-23131024)
chr2 (93-256)||(23133329-23133491)
chr2 (93-256)||(26505379-26505541)
chr2 (93-256)||(26507857-26508019)
chr2 (93-256)||(34402522-34402684)
chr2 (87-256)||(571397-571565)
chr2 (87-256)||(6725995-6726163)
chr2 (87-256)||(24367774-24367942)
chr2 (112-256)||(23135590-23135733)
chr2 (87-256)||(32039492-32039660)
chr2 (87-256)||(45029848-45030016)
chr2 (93-256)||(24898195-24898358)
chr2 (93-256)||(24900678-24900841)
chr2 (93-256)||(24903155-24903318)
chr2 (93-256)||(24905632-24905795)
chr2 (93-256)||(24908107-24908270)
chr2 (87-256)||(28577099-28577267)
chr2 (93-259)||(23103351-23103516)
chr2 (1-104)||(27753730-27753833)
chr2 (87-254)||(43137301-43137467)
chr2 (56-259)||(23708536-23708738)
chr2 (87-256)||(24529522-24529691)
chr2 (129-252)||(25616192-25616315)
chr2 (92-256)||(38967374-38967538)
chr2 (133-254)||(28405981-28406103)
chr2 (182-259)||(8946657-8946734)
chr2 (196-259)||(23040247-23040310)
chr2 (183-259)||(23071993-23072070)
chr2 (93-207)||(7688-7801)
chr2 (177-253)||(24643034-24643109)
chr2 (93-259)||(19671830-19671995)
chr2 (183-258)||(22134251-22134326)
chr2 (183-255)||(7679589-7679662)
chr2 (133-255)||(25175854-25175976)
chr2 (137-231)||(22799125-22799219)
chr2 (182-240)||(22413181-22413240)
chr2 (137-223)||(23019705-23019791)
chr2 (189-240)||(25108906-25108958)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (7-259)||(20360829-20361081)
chr6 (1-259)||(20638146-20638404)
chr6 (1-259)||(22780090-22780348)
chr6 (2-259)||(17287660-17287917)
chr6 (2-258)||(18409691-18409947)
chr6 (3-259)||(29060540-29060796)
chr6 (3-259)||(25629220-25629476)
chr6 (93-259)||(16496244-16496410)
chr6 (3-259)||(19303406-19303661)
chr6 (6-259)||(20593773-20594026)
chr6 (93-259)||(20076700-20076862)
chr6 (1-259)||(16920496-16920751)
chr6 (87-258)||(34963371-34963541)
chr6 (84-259)||(35245586-35245758)
chr6 (87-256)||(1595549-1595717)
chr6 (87-256)||(12742317-12742485)
chr6 (87-256)||(19005046-19005214)
chr6 (87-256)||(19858913-19859081)
chr6 (87-256)||(22782227-22782395)
chr6 (87-256)||(24422547-24422715)
chr6 (87-256)||(25754809-25754977)
chr6 (87-256)||(33861794-33861962)
chr6 (87-256)||(33864278-33864446)
chr6 (93-256)||(18334592-18334754)
chr6 (87-258)||(30676704-30676874)
chr6 (87-256)||(8055029-8055197)
chr6 (1-259)||(22831503-22831760)
chr6 (93-256)||(2291180-2291342)
chr6 (93-256)||(26924640-26924802)
chr6 (87-256)||(25656629-25656797)
chr6 (113-256)||(25688502-25688644)
chr6 (87-256)||(20556888-20557054)
chr6 (87-256)||(1540905-1541073)
chr6 (3-231)||(25603250-25603477)
chr6 (87-253)||(16448520-16448686)
chr6 (87-256)||(3852011-3852179)
chr6 (87-240)||(18456735-18456887)
chr6 (112-244)||(25644335-25644468)
chr6 (87-257)||(19847943-19848114)
chr6 (112-240)||(18461895-18462022)
chr6 (112-259)||(20109140-20109285)
chr6 (15-240)||(11185524-11185746)
chr6 (3-231)||(25611588-25611815)
chr6 (84-210)||(27415887-27416011)
chr6 (129-257)||(23992429-23992554)
chr6 (183-259)||(27333262-27333339)
chr6 (183-259)||(27394002-27394079)
chr6 (129-231)||(15041541-15041643)
chr6 (183-255)||(19652199-19652272)
chr6 (198-259)||(25714417-25714478)
chr6 (159-240)||(18821866-18821946)
chr6 (183-259)||(28496515-28496592)
chr6 (183-259)||(29808926-29809003)
chr6 (206-259)||(1561303-1561356)
chr6 (170-255)||(19873120-19873205)
chr6 (182-244)||(9098557-9098620)
chr6 (8-77)||(5834367-5834436)
chr6 (170-255)||(19862978-19863063)
chr6 (8-77)||(20177096-20177165)
chr6 (8-77)||(22158826-22158895)
chr6 (191-231)||(21766719-21766759)
chr6 (182-238)||(33443068-33443124)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (5-259)||(13211-13465)
[»] chr5 (61 HSPs)
chr5 (2-259)||(8286706-8286964)
chr5 (10-259)||(22075018-22075268)
chr5 (1-259)||(23390359-23390617)
chr5 (2-259)||(25421532-25421789)
chr5 (2-259)||(25431395-25431651)
chr5 (2-259)||(13025311-13025567)
chr5 (2-259)||(13095495-13095751)
chr5 (2-259)||(24493569-24493825)
chr5 (6-259)||(9077952-9078205)
chr5 (2-256)||(24529223-24529477)
chr5 (93-259)||(21808344-21808510)
chr5 (93-259)||(21729019-21729185)
chr5 (4-259)||(21292836-21293090)
chr5 (5-259)||(1096467-1096721)
chr5 (44-256)||(22412187-22412388)
chr5 (93-256)||(42245365-42245527)
chr5 (153-259)||(21997549-21997655)
chr5 (2-136)||(22107237-22107371)
chr5 (87-256)||(264762-264930)
chr5 (87-256)||(32027393-32027561)
chr5 (87-256)||(36154777-36154942)
chr5 (93-256)||(39363384-39363546)
chr5 (94-256)||(10732941-10733102)
chr5 (87-256)||(29329934-29330102)
chr5 (93-256)||(20909012-20909174)
chr5 (87-256)||(29345980-29346148)
chr5 (44-245)||(18418594-18418793)
chr5 (87-256)||(11581193-11581361)
chr5 (87-256)||(29348453-29348621)
chr5 (87-256)||(29350926-29351094)
chr5 (87-256)||(39245136-39245304)
chr5 (87-253)||(18319027-18319193)
chr5 (84-210)||(18356364-18356488)
chr5 (87-256)||(20902002-20902172)
chr5 (87-256)||(2154607-2154776)
chr5 (87-256)||(31061068-31061237)
chr5 (153-256)||(38619434-38619536)
chr5 (92-256)||(10775674-10775838)
chr5 (129-257)||(17517192-17517320)
chr5 (84-210)||(20910745-20910869)
chr5 (153-255)||(23064512-23064613)
chr5 (164-256)||(20918019-20918110)
chr5 (93-240)||(22144068-22144215)
chr5 (88-252)||(37723910-37724073)
chr5 (2-121)||(21986011-21986130)
chr5 (183-259)||(19660879-19660956)
chr5 (183-259)||(21329541-21329618)
chr5 (87-253)||(24067110-24067276)
chr5 (183-255)||(22959576-22959649)
chr5 (136-259)||(21502154-21502277)
chr5 (112-255)||(21565546-21565688)
chr5 (141-240)||(20026942-20027043)
chr5 (183-259)||(19668898-19668975)
chr5 (183-259)||(36314577-36314654)
chr5 (158-231)||(21873278-21873351)
chr5 (170-255)||(26704075-26704160)
chr5 (170-255)||(26973808-26973893)
chr5 (113-193)||(20766095-20766174)
chr5 (182-240)||(22178264-22178323)
chr5 (183-259)||(26012079-26012154)
chr5 (204-256)||(20806852-20806904)
[»] chr3 (79 HSPs)
chr3 (1-259)||(17487856-17488114)
chr3 (1-259)||(17499338-17499596)
chr3 (1-259)||(13442274-13442532)
chr3 (1-259)||(20698299-20698556)
chr3 (12-259)||(12399209-12399456)
chr3 (2-259)||(26686887-26687144)
chr3 (29-259)||(43840932-43841162)
chr3 (3-259)||(14972854-14973110)
chr3 (2-255)||(14576697-14576949)
chr3 (3-259)||(23083226-23083482)
chr3 (6-259)||(18438534-18438787)
chr3 (2-246)||(14572602-14572845)
chr3 (2-259)||(25476249-25476506)
chr3 (2-256)||(40213585-40213838)
chr3 (44-256)||(24153115-24153326)
chr3 (2-259)||(11424627-11424880)
chr3 (1-244)||(30029855-30030097)
chr3 (43-241)||(42386428-42386627)
chr3 (3-136)||(16796670-16796803)
chr3 (87-256)||(17672626-17672794)
chr3 (92-256)||(29172582-29172745)
chr3 (93-256)||(16454281-16454443)
chr3 (87-256)||(7781341-7781509)
chr3 (87-256)||(9707601-9707769)
chr3 (87-256)||(17463178-17463346)
chr3 (87-256)||(45606901-45607069)
chr3 (93-256)||(34159326-34159488)
chr3 (93-256)||(55476491-55476653)
chr3 (87-256)||(8899094-8899262)
chr3 (87-256)||(38961885-38962053)
chr3 (112-256)||(28848630-28848773)
chr3 (87-257)||(13544024-13544193)
chr3 (87-254)||(41123892-41124055)
chr3 (87-256)||(6469128-6469296)
chr3 (87-256)||(10247717-10247885)
chr3 (87-252)||(12567564-12567728)
chr3 (87-256)||(17446649-17446816)
chr3 (87-256)||(50242822-50242990)
chr3 (93-256)||(13151790-13151953)
chr3 (93-256)||(13154255-13154418)
chr3 (87-259)||(43550472-43550644)
chr3 (87-254)||(16282805-16282971)
chr3 (38-136)||(14179555-14179653)
chr3 (142-256)||(55500942-55501055)
chr3 (129-257)||(46822267-46822395)
chr3 (92-240)||(53070652-53070799)
chr3 (113-256)||(36166598-36166739)
chr3 (153-256)||(12119785-12119887)
chr3 (153-256)||(15412429-15412531)
chr3 (125-256)||(15977515-15977645)
chr3 (129-257)||(12511059-12511187)
chr3 (153-256)||(8499518-8499620)
chr3 (115-256)||(53301527-53301669)
chr3 (183-252)||(1644718-1644787)
chr3 (159-256)||(44494809-44494905)
chr3 (113-245)||(21618460-21618590)
chr3 (153-256)||(10556985-10557087)
chr3 (93-240)||(52523682-52523831)
chr3 (115-256)||(27165250-27165391)
chr3 (112-255)||(16097332-16097474)
chr3 (35-136)||(12339890-12339986)
chr3 (159-256)||(17737236-17737335)
chr3 (108-241)||(23274705-23274838)
chr3 (183-255)||(12174303-12174376)
chr3 (183-259)||(13210371-13210448)
chr3 (136-259)||(14234487-14234610)
chr3 (140-255)||(15470928-15471043)
chr3 (93-259)||(24340678-24340844)
chr3 (183-252)||(32307684-32307754)
chr3 (183-255)||(16103784-16103857)
chr3 (183-255)||(49668120-49668193)
chr3 (204-256)||(45577948-45578000)
chr3 (206-256)||(28194693-28194743)
chr3 (183-255)||(9512924-9512997)
chr3 (183-255)||(9520899-9520972)
chr3 (170-255)||(15878083-15878168)
chr3 (191-255)||(856140-856204)
chr3 (93-177)||(2051154-2051238)
chr3 (191-231)||(23077530-23077570)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (1-259)||(9509189-9509447)
chr7 (10-259)||(26211995-26212245)
chr7 (5-259)||(12698831-12699086)
chr7 (3-259)||(16386112-16386369)
chr7 (3-259)||(10589039-10589294)
chr7 (3-259)||(38227481-38227736)
chr7 (44-256)||(18456319-18456530)
chr7 (1-257)||(40443393-40443647)
chr7 (3-256)||(3564229-3564482)
chr7 (1-259)||(27847696-27847951)
chr7 (87-259)||(13647325-13647497)
chr7 (87-256)||(16213684-16213852)
chr7 (87-256)||(27216860-27217028)
chr7 (87-256)||(456321-456489)
chr7 (87-256)||(11972496-11972664)
chr7 (87-256)||(15376707-15376875)
chr7 (87-256)||(16232520-16232688)
chr7 (87-256)||(18640272-18640440)
chr7 (87-256)||(20385117-20385285)
chr7 (87-256)||(21189589-21189757)
chr7 (87-256)||(32125491-32125659)
chr7 (87-256)||(41522917-41523085)
chr7 (87-256)||(41525379-41525547)
chr7 (87-255)||(11393281-11393448)
chr7 (93-256)||(14949122-14949284)
chr7 (93-259)||(18430709-18430874)
chr7 (87-256)||(24702238-24702406)
chr7 (112-252)||(24275175-24275314)
chr7 (140-256)||(48273392-48273508)
chr7 (113-256)||(16410059-16410201)
chr7 (87-256)||(44116509-44116677)
chr7 (56-259)||(2280036-2280238)
chr7 (87-256)||(3386333-3386501)
chr7 (93-252)||(38898376-38898535)
chr7 (87-256)||(24704688-24704853)
chr7 (128-256)||(13869346-13869474)
chr7 (130-256)||(13831373-13831498)
chr7 (87-256)||(17061909-17062077)
chr7 (136-255)||(16219715-16219834)
chr7 (93-255)||(14932688-14932851)
chr7 (93-255)||(15356123-15356286)
chr7 (93-255)||(15360237-15360400)
chr7 (87-256)||(20110556-20110714)
chr7 (140-259)||(22072913-22073033)
chr7 (3-244)||(15143902-15144143)
chr7 (3-231)||(15211485-15211703)
chr7 (87-193)||(26355977-26356083)
chr7 (87-193)||(26358429-26358535)
chr7 (183-259)||(67745-67822)
chr7 (183-259)||(11996071-11996148)
chr7 (183-259)||(16495402-16495479)
chr7 (183-259)||(28505342-28505419)
chr7 (183-259)||(34200786-34200863)
chr7 (183-255)||(44014182-44014255)
chr7 (188-259)||(47831807-47831879)
chr7 (126-210)||(2530126-2530208)
chr7 (87-220)||(12756665-12756797)
chr7 (183-255)||(811175-811248)
chr7 (188-255)||(18005650-18005718)
chr7 (170-253)||(18154873-18154956)
chr7 (170-255)||(9703263-9703348)
chr7 (206-259)||(15754955-15755008)
chr7 (182-244)||(1868038-1868101)
chr7 (182-244)||(12901338-12901401)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-259)||(1851-2109)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (1-259)||(20536208-20536466)
chr8 (1-259)||(21918863-21919121)
chr8 (2-259)||(18818273-18818530)
chr8 (2-258)||(28648908-28649164)
chr8 (1-259)||(31971257-31971513)
chr8 (2-259)||(21923792-21924049)
chr8 (2-259)||(22626736-22626992)
chr8 (1-259)||(18879100-18879352)
chr8 (29-259)||(23406379-23406611)
chr8 (28-259)||(7372778-7373001)
chr8 (1-259)||(45130861-45131117)
chr8 (3-259)||(16092206-16092463)
chr8 (3-262)||(6759255-6759512)
chr8 (1-259)||(16199509-16199765)
chr8 (2-258)||(23648554-23648810)
chr8 (3-259)||(22875065-22875321)
chr8 (43-259)||(21389358-21389571)
chr8 (2-136)||(25363004-25363138)
chr8 (38-259)||(21395883-21396101)
chr8 (38-259)||(21790376-21790594)
chr8 (56-259)||(21778697-21778897)
chr8 (87-256)||(14409438-14409606)
chr8 (87-256)||(1484402-1484570)
chr8 (87-256)||(5853286-5853454)
chr8 (87-252)||(16413310-16413474)
chr8 (87-256)||(20403227-20403395)
chr8 (93-256)||(22001753-22001915)
chr8 (87-256)||(41598188-41598356)
chr8 (87-256)||(15203225-15203393)
chr8 (87-256)||(20046189-20046357)
chr8 (93-256)||(4483281-4483442)
chr8 (87-256)||(14823774-14823941)
chr8 (129-257)||(18678093-18678221)
chr8 (93-256)||(4542373-4542535)
chr8 (87-256)||(19896265-19896436)
chr8 (86-256)||(25484268-25484430)
chr8 (129-257)||(32121734-32121862)
chr8 (87-258)||(26223917-26224087)
chr8 (165-262)||(19937078-19937174)
chr8 (159-252)||(45290761-45290853)
chr8 (136-259)||(6520368-6520491)
chr8 (93-240)||(20498581-20498728)
chr8 (113-256)||(26219717-26219858)
chr8 (133-259)||(38855246-38855372)
chr8 (153-243)||(15070571-15070660)
chr8 (183-259)||(21490995-21491072)
chr8 (188-259)||(17140916-17140988)
chr8 (140-255)||(21285601-21285716)
chr8 (133-256)||(26225288-26225409)
chr8 (183-259)||(5866318-5866395)
chr8 (87-240)||(19801376-19801527)
chr8 (183-255)||(26355742-26355815)
chr8 (93-259)||(17612065-17612231)
chr8 (141-244)||(983407-983512)
chr8 (93-252)||(13508040-13508199)
chr8 (188-255)||(23760893-23760961)
chr8 (133-247)||(21673716-21673830)
chr8 (209-259)||(21249384-21249434)
chr8 (209-259)||(21255222-21255272)
chr8 (93-252)||(13597572-13597731)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (2-259)||(3470-3727)
scaffold0292 (2-259)||(343-599)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-259)||(5984-6245)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (10-259)||(4849-5098)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-259)||(1952-2210)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (3-259)||(20910-21167)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (2-259)||(38761-39017)
scaffold0145 (47-259)||(32942-33153)
scaffold0145 (87-261)||(9744-9918)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (5-259)||(4712-4965)
scaffold0358 (5-194)||(1-189)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-241)||(24164-24406)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-259)||(32067-32322)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (2-259)||(3015-3271)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (2-259)||(39858-40113)
scaffold0026 (2-259)||(25896-26152)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (29-259)||(8424-8650)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (2-256)||(22886-23139)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (6-257)||(39479-39729)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (6-257)||(75083-75333)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-259)||(13497-13753)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-259)||(15328-15584)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-259)||(10289-10544)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (3-252)||(25930-26179)
scaffold0122 (113-256)||(44682-44825)
scaffold0122 (3-123)||(33360-33480)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (2-259)||(39913-40169)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (3-259)||(4508-4763)
scaffold0228 (3-259)||(12090-12345)
scaffold0228 (3-259)||(22042-22297)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (2-207)||(13144-13349)
scaffold0175 (184-259)||(34123-34199)
scaffold0175 (204-259)||(273-328)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (2-259)||(8479-8732)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (2-258)||(17079-17337)
scaffold0056 (87-240)||(79278-79430)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-200)||(6669-6868)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (4-259)||(16466-16721)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (56-258)||(3104-3306)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (6-256)||(339818-340065)
scaffold0003 (87-256)||(158444-158612)
scaffold0003 (84-210)||(71350-71474)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (1-169)||(124675-124843)
scaffold0021 (190-259)||(121766-121835)
scaffold0021 (94-258)||(174767-174930)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (127-259)||(28414-28546)
scaffold0046 (183-259)||(11292-11369)
scaffold0046 (183-259)||(1997-2074)
scaffold0046 (206-259)||(4552-4605)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-259)||(46995-47244)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-259)||(915-1170)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-259)||(16282-16537)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (3-259)||(32824-33077)
scaffold0120 (3-259)||(45928-46181)
scaffold0120 (48-259)||(16113-16323)
scaffold0120 (198-259)||(17389-17450)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-259)||(7266-7521)
scaffold0106 (1-259)||(1289-1544)
scaffold0106 (191-256)||(15291-15356)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-256)||(4994-5246)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (2-136)||(1037-1171)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (3-238)||(4545-4779)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (87-258)||(11286-11456)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (137-259)||(11442-11564)
scaffold0235 (2-75)||(11377-11450)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (87-256)||(20747-20915)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (87-256)||(37821-37989)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (87-256)||(82072-82240)
scaffold0037 (112-244)||(22645-22776)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (87-256)||(94411-94579)
scaffold0023 (93-252)||(17440-17598)
scaffold0023 (112-256)||(44454-44598)
scaffold0023 (132-255)||(100378-100501)
scaffold0023 (188-259)||(119875-119947)
scaffold0023 (183-255)||(101503-101576)
scaffold0023 (189-255)||(40224-40291)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (3-178)||(27911-28086)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (93-256)||(141618-141780)
scaffold0028 (93-256)||(136680-136842)
scaffold0028 (93-256)||(139149-139311)
scaffold0028 (93-256)||(144087-144249)
scaffold0028 (93-256)||(134211-134373)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (2-100)||(3640-3738)
scaffold0165 (2-100)||(7704-7802)
scaffold0165 (56-244)||(27666-27855)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (87-256)||(4694-4862)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (87-256)||(13947-14115)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-259)||(51582-51837)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (112-256)||(13392-13535)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (33-196)||(3424-3588)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (87-253)||(4300-4465)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (87-257)||(10772-10941)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (93-259)||(128751-128916)
scaffold0031 (87-240)||(20373-20524)
scaffold0031 (170-255)||(65830-65915)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (112-244)||(8481-8613)
scaffold0621 (133-259)||(6535-6661)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (87-256)||(16784-16952)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (87-252)||(501088-501252)
scaffold0001 (87-256)||(85573-85742)
scaffold0001 (183-255)||(160688-160761)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (87-256)||(106-274)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (92-256)||(4214-4378)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (2-200)||(827-1021)
scaffold0395 (193-259)||(4888-4954)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (87-258)||(12243-12413)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (84-210)||(15362-15486)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (93-256)||(40400-40562)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (87-257)||(9241-9410)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (87-253)||(1274-1440)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (87-242)||(29946-30100)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (87-256)||(12064-12226)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (115-256)||(38679-38820)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (87-256)||(161083-161252)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (2-79)||(17851-17928)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (113-256)||(116430-116571)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (94-255)||(29558-29720)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (183-259)||(6611-6688)
scaffold0333 (183-259)||(13991-14068)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (183-259)||(15821-15898)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (3-99)||(10323-10419)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (56-240)||(13147-13333)
scaffold0357 (56-244)||(16017-16206)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (87-256)||(2122-2291)
scaffold0247 (93-259)||(17982-18148)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (93-207)||(53504-53617)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (183-259)||(1113-1190)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (188-259)||(1083-1155)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (93-240)||(12587-12733)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (112-247)||(129917-130051)
scaffold0010 (112-240)||(60689-60818)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (133-255)||(19268-19390)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (183-256)||(15664-15738)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (183-255)||(1086-1159)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (183-259)||(6167-6244)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (183-255)||(23927-24000)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (133-240)||(1051-1158)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (112-255)||(133-275)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (93-177)||(8014-8098)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (136-259)||(12766-12889)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (188-255)||(2694-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (136-255)||(12943-13062)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (133-255)||(2801-2923)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (133-255)||(14692-14814)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (112-244)||(10516-10647)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (170-255)||(23843-23928)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (133-247)||(5655-5769)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (183-255)||(28813-28887)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-67)||(20595-20661)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (84-231)||(26852-26996)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (206-255)||(45860-45909)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (140-244)||(10542-10646)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (152-259)||(32538-32643)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (84-231)||(192921-193069)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (93-202)||(225465-225572)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (170-255)||(69794-69879)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (168-255)||(32102-32190)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (151-231)||(29118-29198)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (93-259)||(11464-11630)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (93-259)||(38211-38377)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (183-244)||(8118-8180)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (137-231)||(4803-4897)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (183-247)||(6824-6889)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (206-255)||(36454-36503)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (191-255)||(10575-10639)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7089135 - 7088877
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  7089135 cgagagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatat 7089036  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089035 aatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 7088936  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7088935 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12903014 - 12902757
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12903014 gagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 12902915  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902914 atgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 12902815  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12902814 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44053087 - 44052829
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  44053087 cgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatat 44052988  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052987 aatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 44052888  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || ||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44052887 tgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22636691 - 22636437
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||| ||||||||| ||| || |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  22636691 gagaattgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatata 22636593  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22636592 atgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgtt 22636493  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22636492 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 252
Target Start/End: Original strand, 23374231 - 23374473
Alignment:
Q  10 aacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgtttta 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23374231 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 23374330  T
Q  110 ttcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgt 209  Q
    | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23374331 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgt 23374430  T
Q  210 tatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||||||||||| | ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  23374431 tatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 16239834 - 16240090
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||| || ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  16239834 gagagttgaactttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatata 16239933  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16239934 atgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatttt 16240032  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16240033 gctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7893958 - 7893703
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||    
T  7893958 cgagagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg---ctgattatgatgtgaaat 7893862  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| | | | |||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893861 aatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 7893762  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || | |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7893761 tgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 75 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  75 tgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtc 174  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  175 atgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 16377387 - 16377639
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  16377387 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 16377486  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16377487 atgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgtt 16377584  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16377585 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 14053165 - 14053422
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  14053165 cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatat 14053264  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaag-atgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  14053265 aatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatg 14053361  T
Q  200 ttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  14053362 ctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 259
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  47 attataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgtt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  147 gatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatg 246  Q
    | | | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  247 aagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14038904 - 14038653
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  14038904 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 14038805  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| | | |||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||    
T  14038804 tgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttg 14038705  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgat 254  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14038704 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  134 tatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttg 233  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  234 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 3096901 - 3096759
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  3096901 cgagagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatac 3096802  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatg 144  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3096801 aatg-tttatgcattacttgaagaatatttgaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929042
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17046719 - 17046487
Alignment:
Q  24 attaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaat 123  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||| |||||||||||     
T  17046719 attaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatg-tttatacattacttgaag 17046621  T
Q  124 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagt 222  Q
    ||| |||| |||  |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||   |||| || |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||     
T  17046620 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagc 17046524  T
Q  223 tacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  17046523 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 17047936 - 17048070
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17047936 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 17048035  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatat 136  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  17048036 atgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 17048070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 18215268 - 18215436
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18215268 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18215367  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18215368 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 12301 - 12469
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12301 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12400  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12401 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 15118346 - 15118514
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15118346 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 15118445  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15118446 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 23803259 - 23803427
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23803259 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23803358  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23803359 tatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 52312678 - 52312510
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  52312678 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 52312579  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  52312578 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19242867 - 19242693
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19242867 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 19242768  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 262  Q
    |||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242767 tatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3515175 - 3515007
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3515175 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttg 3515076  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3515075 tatactg-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44102382 - 44102214
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44102382 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 44102283  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||  || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44102282 tatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 44773081 - 44773249
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| || | |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44773081 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 44773180  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44773181 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 51463862 - 51464030
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  51463862 ttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 51463961  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  51463962 tatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 1837509 - 1837671
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837509 tgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatact 1837608  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1837609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 19618166 - 19618336
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19618166 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttg 19618265  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  19618266 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798872
Alignment:
Q  113 attacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 212  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  213 ttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    | ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 256
Target Start/End: Original strand, 18239438 - 18239581
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||    
T  18239438 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgttgtta 18239536  T
Q  212 tttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18239537 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280316
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagtt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | |||||||     
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 14280340  T
Q  233 ggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  14280339 ggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 14970701 - 14970871
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | |||  ||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14970701 ttatattgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14970800  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    |||| || || | ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| |||||    
T  14970801 tatattg-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  173 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Original strand, 15355318 - 15355483
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15355318 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 15355417  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15355418 gtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12611111 - 12610950
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12611111 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12611012  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |        | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12611011 t--------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15367862 - 15367690
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| | ||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15367862 ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 15367763  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15367762 gtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15402875 - 15402703
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| | ||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15402875 ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 15402776  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15402775 gtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Original strand, 13806 - 13953
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  13806 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 13904  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13905 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 118 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15370159 - 15370018
Alignment:
Q  118 ttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaa 216  Q
    |||||| |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||    
T  15370159 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaa 15370061  T
Q  217 ctaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15370060 ctaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22354005 - 22353835
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  |     
T  22354005 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgcta 22353906  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
     |  ||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||||    
T  22353905 caatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15371374 - 15371202
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| | ||| |||||| |||| |||||| || |||  ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15371374 ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 15371275  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15371274 gtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15373655 - 15373483
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| | ||| |||||| |||| |||||| || |||  ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15373655 ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 15373556  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  15373555 gtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 39706332 - 39706409
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39706332 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 7641186 - 7641344
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  7641186 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 7641285  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |           |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7641286 t-----------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagtt 232  Q
    |||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | |||||||     
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  233 ggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||| || ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20149998 - 20149832
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20149998 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 20149899  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    ||||||||  | ||| | ||||||||||| |  ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  20149898 gtatactg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttt 183  Q
    |||||||  ||||||||||| || ||| |||||||| |  | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 43256203  T
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttgttgtt 210  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||    
T  43256204 tggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16223673 - 16223532
Alignment:
Q  118 ttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaa 216  Q
    |||||| |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||    
T  16223673 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaa 16223575  T
Q  217 ctaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  16223574 ctaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  95 tgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 194  Q
    |||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  195 ctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
     | ||||| ||| |||||||||||||| | || |||| ||||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 52243111 - 52243302
Alignment:
Q  56 tgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 154  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| || || ||||  |||||||||||  | ||| ||||||||| || |||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  52243111 tgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatt 52243210  T
Q  155 gcaattgacattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
     || |||| ||| |||| |||||  |||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  52243211 tcatttgatattgttatatcatgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  188 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 244
Target Start/End: Original strand, 43198508 - 43198661
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatg-ctgtttttgtatac 191  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||  |||| |||||  |  ||||| |||     
T  43198508 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatat 43198607  T
Q  192 tgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  43198608 tgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 244
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  141 gatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtct 237  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  238 aagttga 244  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 15091152 - 15091093
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaag 62  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15091152 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13569587 - 13569502
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  13569587 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 13569502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6190564 - 6190481
Alignment:
Q  158 attgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||| || ||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  6190564 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Original strand, 5756988 - 5757025
Alignment:
Q  196 tatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttg 233  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5756988 tatgctgttattgttatttaactaagttacatgagttg 5757025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 27250592 - 27250850
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27250592 cgagagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 27250691  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250692 aatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 27250791  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27250792 tgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21026929 - 21026680
Alignment:
Q  10 aacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgtttta 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  21026929 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgtttta 21026830  T
Q  110 ttcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgt 209  Q
    | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21026829 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgt 21026730  T
Q  210 tatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026729 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22532526 - 22532269
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||||  || || ||| ||||||||||| || |||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  22532526 gagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22532427  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532426 atgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 22532327  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532326 gctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 50210077 - 50210333
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  50210077 gagagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 50210176  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    |||||  |  |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50210177 atgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 50210276  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50210277 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34510033 - 34509783
Alignment:
Q  6 gttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgt 105  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  34510033 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgt 34509934  T
Q  106 tttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg 205  Q
    | ||  ||||||||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34509933 tataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 34509834  T
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34509833 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 182
Target Start/End: Original strand, 22354436 - 22354616
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||| |||||||||| || || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  22354436 gagaattgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22354535  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtt 182  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22354536 atgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20135444 - 20135188
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  20135444 gagagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatata 20135345  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||| |||||||||||   |  ||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |    
T  20135344 atgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgct 20135245  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    | | ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  20135244 gctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  45 taattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttga-ataatatttgaatatttaagat 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||| | | |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatg-taattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattatt-gaataattaagat 22468701  T
Q  144 gttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttg 243  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  22468702 gttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 22468801  T
Q  244 atgaagatgatgatg 258  Q
    || |||||| |||||    
T  22468802 attaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 16275357 - 16275526
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||  ||| |||||| || ||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16275357 ttatattgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttttt 16275456  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16275457 gtatactgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 21475081 - 21475249
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21475081 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 21475180  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21475181 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Original strand, 38801258 - 38801508
Alignment:
Q  5 agttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatg 104  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  38801258 agttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatg 38801357  T
Q  105 ttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgtt 204  Q
     ||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | |||| || |||||||| |||||   ||| | ||||||||||||| |    
T  38801358 -tttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgct 38801453  T
Q  205 g-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||| | |||||| | ||||||| || |||||||||||||||    
T  38801454 gtttgttatttaactaagctgcatgag-tcgtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13989034 - 13988866
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13989034 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 13988935  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13988934 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 21923285 - 21923453
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21923285 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 21923384  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21923385 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 23593729 - 23593897
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23593729 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23593828  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23593829 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 22356037 - 22356185
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ctgattatgttgtgata 99  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||    
T  22356037 cgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgata 22356136  T
Q  100 taatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttga 148  Q
    ||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  22356137 taatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 22357723 - 22357871
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ctgattatgttgtgata 99  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||    
T  22357723 cgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgata 22357822  T
Q  100 taatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttga 148  Q
    ||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  22357823 taatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Original strand, 45574836 - 45575008
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  45574836 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 45574935  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  45574936 catactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31612481 - 31612313
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31612481 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 31612382  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||   | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31612381 tatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21840935 - 21840766
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||| ||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21840935 ttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttg 21840836  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  21840835 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29298305 - 29298137
Alignment:
Q  86 attatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  29298305 attatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgttttt 29298207  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29298206 gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29776856 - 29776688
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  29776856 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttg 29776757  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29776756 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 433178 - 433012
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  433178 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttg 433079  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||||    |||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  433078 tatactgcct---gtgttgccgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 48603735 - 48603637
Alignment:
Q  38 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatat 136  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  48603735 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 48603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 259
Target Start/End: Original strand, 20847184 - 20847275
Alignment:
Q  168 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20847184 ttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21347130 - 21346961
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  21347130 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 21347031  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21347030 gtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21342265 - 21342090
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||| ||||  | ||| ||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  21342265 ttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 21342166  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 262  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21342165 gtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16362085 - 16361915
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| || | |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  16362085 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttta 16361986  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    |||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  16361985 tatactg-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Original strand, 13212855 - 13213027
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  13212855 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 13212954  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||  |  || | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212955 gtatactgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21707335 - 21707167
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||  |||||| ||| | |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  21707335 ttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttg 21707236  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||   | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21707235 tatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21711877 - 21711709
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||  |||||| ||| | |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  21711877 ttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttg 21711778  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||   | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21711777 tatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Original strand, 21896211 - 21896358
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  21896211 tgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgtatact 21896309  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21896310 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttt 183  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 33797597  T
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttgttgtt 210  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||    
T  33797596 ttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40389323 - 40389157
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  40389323 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 40389224  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  40389223 gtatactg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 164 - 262
Target Start/End: Original strand, 15860080 - 15860177
Alignment:
Q  164 attattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  15860080 attattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 22123061 - 22123230
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| | || |||||| || |||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22123061 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttg 22123160  T
Q  187 tatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| || ||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  22123161 tatactg-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Original strand, 21861525 - 21861672
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  21861525 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatact 21861623  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||||||||| || |||||  ||| ||||| | ||||||| ||||||||    
T  21861624 gcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20248356 - 20248283
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20248356 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Original strand, 20847091 - 20847163
Alignment:
Q  10 aacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgtt 81  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  20847091 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgtttaaagatgtgttgtt 20847163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 33681153 - 33681011
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 210  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| || ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  33681153 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 33681056  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  33681055 atttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 258
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  191 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  232 tggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
     |||||||| |||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21754122 - 21754052
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21754122 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16758726 - 16758664
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16758726 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22237773 - 22237631
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 210  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||| | |||| |||    
T  22237773 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgtt 22237676  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  22237675 atttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 240
Target Start/End: Original strand, 35261055 - 35261180
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgtt 210  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||| ||||||||||   ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  35261055 cattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 35261150  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  35261151 tattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 14295595 - 14295672
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  14295595 tttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 231
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788135
Alignment:
Q  75 tgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttga-ataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgt 173  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||| | | |||||||| | ||| |||| ||||  ||||||||||| |||| || |||||| ||||  | ||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattatt-gaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagt 21788077  T
Q  174 catgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||    
T  21788078 catgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagt 21788135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20918681 - 20918620
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttg 243  Q
    |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  20918681 tttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52639597 - 52639560
Alignment:
Q  196 tatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttg 233  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639597 tatgctgttattgttatttaactaagttacatgagttg 52639560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 912 - 1169
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  912 cgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatat 1011  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1012 aatgttt-atgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgt 1110  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1111 tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 167842 - 168099
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||    
T  167842 cgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatat 167941  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  167942 aatgttt-atgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgt 168040  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  168041 tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51913
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  52170 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatata 52071  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52070 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgtt 51971  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51970 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 23654249 - 23654507
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23654249 cgagagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatat 23654348  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||     
T  23654349 aatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgc 23654448  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23654449 tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23286118 - 23285865
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23286118 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 23286019  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  23286018 atgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgtt 23285923  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23285922 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 24 - 259
Target Start/End: Original strand, 22731120 - 22731355
Alignment:
Q  24 attaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaat 123  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||     
T  22731120 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 22731219  T
Q  124 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagtt 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  22731220 aatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 22731319  T
Q  224 acatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22731320 gcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 22738044 - 22738300
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  22738044 gagaattgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22738143  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22738144 atgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-tt 22738242  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
      |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738243 aatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 256
Target Start/End: Original strand, 298686 - 298933
Alignment:
Q  10 aacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgtttta 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||    
T  298686 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgtttta 298785  T
Q  110 ttcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttg 208  Q
    | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  298786 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttg 298885  T
Q  209 ttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  298886 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23060742 - 23060513
Alignment:
Q  29 gacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatat 128  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||  |||     
T  23060742 gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23060644  T
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  23060643 tttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 23060544  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23060543 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23076699 - 23076442
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||| || ||| || |||  || || |||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||    
T  23076699 gagagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatata 23076600  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076599 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 23076500  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  23076499 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 37979 - 38235
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  37979 cgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatat 38078  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||  ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38079 aatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgt 38176  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23660279 - 23660023
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  23660279 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 23660180  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  23660179 atgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgtt 23660081  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23660080 gctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22337372 - 22337115
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  22337372 gagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatata 22337273  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  |||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22337272 atgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgtt 22337173  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22337172 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20309363 - 20309108
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||| |||    
T  20309363 cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttat 20309264  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  20309263 aatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgt 20309168  T
Q  201 tg-ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |  |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20309167 tgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22105581 - 22105412
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22105581 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 22105482  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22105481 catactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 32214915 - 32215085
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32214915 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 32215014  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  32215015 tatactg-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Original strand, 21155054 - 21155219
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21155054 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 21155153  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21155154 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18809111 - 18808943
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18809111 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18809012  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18809011 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 23709526 - 23709694
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23709526 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23709625  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23709626 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 23712007 - 23712175
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23712007 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23712106  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23712107 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39682481 - 39682313
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39682481 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 39682382  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39682381 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 571565 - 571397
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||| | || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  571565 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 571466  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  571465 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6726163 - 6725995
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6726163 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttg 6726064  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6726063 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24367942 - 24367774
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24367942 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24367843  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  24367842 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23135733 - 23135590
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  23135733 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtta 23135635  T
Q  212 tttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23135634 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 32039492 - 32039660
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32039492 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 32039591  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||  |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  32039592 tatactg-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 45029848 - 45030016
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| |||||||||||   | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45029848 ttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 45029947  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45029948 tatattgt-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28577267 - 28577099
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28577267 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttg 28577168  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  |  |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28577167 tatactg-ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 23103351 - 23103516
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttatt-cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatac 191  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||   |||||  || |||||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||||  ||||||    
T  23103351 tgtgatataatgtttaattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatac 23103448  T
Q  192 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  23103449 tgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27753833 - 27753730
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27753833 cgagagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 27753734  T
Q  101 aatg 104  Q
    ||||    
T  27753733 aatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 43137467 - 43137301
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||| | || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43137467 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 43137368  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgat 254  Q
    |||| |  || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43137367 tata-ttactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 259
Target Start/End: Original strand, 23708536 - 23708738
Alignment:
Q  56 tgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 154  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| || || ||||  |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||    
T  23708536 tgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgattt 23708635  T
Q  155 gcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  23708636 gcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatga 23708732  T
Q  254 tgatgt 259  Q
    ||||||    
T  23708733 tgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 24529522 - 24529691
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||| || || ||| |||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24529522 ttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttt 24529621  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24529622 gtatactga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25616315 - 25616192
Alignment:
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||    
T  25616315 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatg 25616216  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||  |||||||||||| ||||||    
T  25616215 agtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38967538 - 38967374
Alignment:
Q  92 ttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtata 190  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  38967538 ttgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtata 38967439  T
Q  191 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
     ||  | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38967438 ttgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  232 tggtctaagttgatgaagatgat 254  Q
     ||||||||||||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  182 ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 196 - 259
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  196 tatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 23071993 - 23072070
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  23071993 tttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 207
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7801
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  193 gcctatgttgttgtt 207  Q
    |||||||||| ||||    
T  7787 gcctatgttgctgtt 7801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 253
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  177 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19671995 - 19671830
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| | | ||||  | || |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  19671995 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata-ttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatact 19671898  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  19671897 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 258
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134326
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||| ||||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 7679662 - 7679589
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  7679662 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  232 tggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Original strand, 22799125 - 22799219
Alignment:
Q  137 ttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| ||||| | |||||| |||| ||||   ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22799125 ttaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 22799219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 240
Target Start/End: Original strand, 22413181 - 22413240
Alignment:
Q  182 ttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22413181 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 223
Target Start/End: Original strand, 23019705 - 23019791
Alignment:
Q  137 ttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagtt 223  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| ||||| | |||||| |||| ||||   ||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  23019705 ttaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagtt 23019791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108906
Alignment:
Q  189 tactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 259
Target Start/End: Original strand, 20360829 - 20361081
Alignment:
Q  7 ttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgtt 106  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20360829 ttgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt 20360928  T
Q  107 ttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgt 206  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20360929 atatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgt 20361028  T
Q  207 tgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361029 tgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 20638146 - 20638404
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20638146 cgagagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 20638245  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    || ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20638246 aacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgt 20638345  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638346 tgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 22780090 - 22780348
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22780090 cgagagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatat 22780189  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    ||||||   | |||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22780190 aatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgt 22780289  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22780290 ttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 17287660 - 17287917
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||    
T  17287660 gagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacata 17287759  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17287760 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgtt 17287859  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287860 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 18409691 - 18409947
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18409691 gagagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 18409790  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| |||  |||| |||||| ||   || ||  || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  18409791 atgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgtt 18409890  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    | ||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18409891 gctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29060796 - 29060540
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    |||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||    
T  29060796 agagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataa 29060697  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| | | |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29060696 tgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttg 29060597  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060596 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 25629220 - 25629476
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  25629220 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 25629319  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||     
T  25629320 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttc 25629419  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25629420 ctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496244
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 19303406 - 19303661
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  19303406 agagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 19303505  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| | | |||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  19303506 tgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttg 19303604  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303605 ttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20594026 - 20593773
Alignment:
Q  6 gttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgt 105  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  20594026 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgt 20593927  T
Q  106 tttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg 205  Q
    | ||  |||||||||| | ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||    
T  20593926 tatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctg 20593827  T
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||| || | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20593826 tttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20076862 - 20076700
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20076862 tgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttact 20076767  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 16920496 - 16920751
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  | |||||||| |||||| | ||||||||  ||||||  ||||||| |||||||| |||| |||    
T  16920496 cgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtat 16920595  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| | | |||| ||  |||||||||| ||   ||||||||||||||||     
T  16920596 aatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgc 16920691  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || || |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||| || |||||||||||||||    
T  16920692 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34963541 - 34963371
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34963541 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 34963442  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  34963441 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttt 183  Q
    |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgatt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1595717 - 1595549
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1595717 ttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 1595618  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  1595617 tatactg-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12742485 - 12742317
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  12742485 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12742386  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12742385 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19005214 - 19005046
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19005214 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 19005115  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19005114 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 19858913 - 19859081
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19858913 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 19859012  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19859013 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22782395 - 22782227
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| || | |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22782395 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 22782296  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22782295 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24422715 - 24422547
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24422715 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24422616  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24422615 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25754977 - 25754809
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25754977 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 25754878  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25754877 tatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33861962 - 33861794
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33861962 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 33861863  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33861862 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33864446 - 33864278
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33864446 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 33864347  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33864346 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 30676704 - 30676874
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30676704 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttg 30676803  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  30676804 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8055197 - 8055029
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8055197 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 8055098  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||   | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8055097 tatact-tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22831760 - 22831503
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |  | |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||| |||    
T  22831760 cgagagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttat 22831661  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctat 198  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||   |||  ||| | | |||||||    
T  22831660 aatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctat 22831565  T
Q  199 gttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||   || |||||||||||||||    
T  22831564 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
       | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25656797 - 25656629
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | |||  |||| |||||| |||| |||||| || ||| |||  | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25656797 ttatattgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 25656698  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  25656697 tatactgc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  113 attacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 212  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  213 ttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 20556888 - 20557054
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||   || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20556888 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaa--ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttg 20556985  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20556986 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 1540905 - 1541073
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||| ||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1540905 ttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttg 1541004  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  1541005 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 25603250 - 25603477
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| | || ||| |||||||||||||||||||| | ||   |||||||| |||||||| |    
T  25603250 agagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatga 25603349  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| ||| |||||||||||   |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||| ||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||    
T  25603350 tgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctg 25603448  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
     |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  25603449 ctgttgttaattaactaagtcgcatgagt 25603477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Original strand, 16448520 - 16448686
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16448520 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 16448619  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  16448620 gtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 3852011 - 3852179
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| || | ||||| |||||||||||||||||    
T  3852011 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttg 3852110  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||   | ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3852111 tatact-attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18456887 - 18456735
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18456887 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18456788  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    ||||||   | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18456787 tatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 25644468 - 25644335
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgt-tgtt 210  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| || || |||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  25644468 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgtt 25644369  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  25644368 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Original strand, 19847943 - 19848114
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||  |||||||  |    
T  19847943 ttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgat 19848042  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||  ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  19848043 gtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18462022 - 18461895
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  18462022 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgtta 18461924  T
Q  212 tttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18461923 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109140
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgtt 210  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||| | ||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 20109187  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109186 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11185746 - 11185524
Alignment:
Q  15 ttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcat 114  Q
    ||||| || |||||||||||||   ||||||||   |||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| || |||    
T  11185746 ttgggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagttt-atgcat 11185648  T
Q  115 tacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatt 213  Q
    |||||||| ||| |||| |||   |||||| |||||||||| | |||| || |||||||||   |||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||||    
T  11185647 tacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatt 11185551  T
Q  214 taactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  11185550 taactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Original strand, 25611588 - 25611815
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| || ||| |  | ||| | |||||||||||||||||| | ||   |||||||| |||||||| |    
T  25611588 agagttgaacctttgggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatga 25611687  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| ||| |||||||||||   |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||| ||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||    
T  25611688 tgttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctg 25611786  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
     |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  25611787 ctgttgttaattaactaagtcgcatgagt 25611815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttt 183  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| | |  | |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||  |    
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacctaagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg--t 27415984  T
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttgttgtt 210  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  27415985 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23992554 - 23992429
Alignment:
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||    
T  23992554 ttgaatatttaagatgttga---attgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatg 23992458  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  23992457 agtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333339
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394079
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 231
Target Start/End: Original strand, 15041541 - 15041643
Alignment:
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||||    
T  15041541 ttgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatg 15041640  T
Q  229 agt 231  Q
    |||    
T  15041641 agt 15041643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19652272 - 19652199
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19652272 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  198 tgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 240
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821946
Alignment:
Q  159 ttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 28496515 - 28496592
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28496515 tttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 29808926 - 29809003
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  29808926 tttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 244
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  182 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 77
Target Start/End: Original strand, 5834367 - 5834436
Alignment:
Q  8 tgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgt 77  Q
    |||||||| ||| || |||  |||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5834367 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 5834436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20177165 - 20177096
Alignment:
Q  8 tgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgt 77  Q
    |||||||| ||| || |||  |||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20177165 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 20177096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 77
Target Start/End: Original strand, 22158826 - 22158895
Alignment:
Q  8 tgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgt 77  Q
    |||||||| ||| || |||  |||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22158826 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 22158895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766719
Alignment:
Q  191 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 21766719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  182 ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtcta 238  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13465 - 13211
Alignment:
Q  5 agttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatg 104  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  13465 agttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 13366  T
Q  105 ttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgtt 204  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13365 ttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 13266  T
Q  205 gttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13265 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 61)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 8286706 - 8286964
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  8286706 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 8286805  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctg-tttttgtatactgcctatgt 200  Q
    ||||| | | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8286806 atgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgt 8286905  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8286906 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22075268 - 22075018
Alignment:
Q  10 aacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgtttta 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22075268 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 22075169  T
Q  110 ttcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgt 209  Q
    | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22075168 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgt 22075069  T
Q  210 tatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 259  Q
    |||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075068 tatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 23390359 - 23390617
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  23390359 cgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 23390458  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23390459 aatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgt 23390558  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23390559 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25421789 - 25421532
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  25421789 gagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 25421690  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25421689 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 25421590  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25421589 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25431651 - 25431395
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  25431651 gagagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 25431552  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25431551 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 25431452  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  25431451 gctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13025567 - 13025311
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||    
T  13025567 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatata 13025468  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13025467 atgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgtt 13025369  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13025368 gctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13095751 - 13095495
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||    
T  13095751 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatata 13095652  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13095651 atgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgtt 13095553  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13095552 gctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24493825 - 24493569
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  24493825 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatata 24493726  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24493725 atgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgtt 24493627  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | |||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24493626 gctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9078205 - 9077952
Alignment:
Q  6 gttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgt 105  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  9078205 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 9078106  T
Q  106 tttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg 205  Q
    | ||  |||||||||| | ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9078105 tatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg 9078006  T
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9078005 ttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24529477 - 24529223
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  24529477 gagagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatata 24529378  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  ||||||||||   ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24529377 atgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 24529278  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24529277 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808510
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729185
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 259
Target Start/End: Original strand, 21292836 - 21293090
Alignment:
Q  4 gagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataat 103  Q
    |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21292836 gagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat 21292935  T
Q  104 gttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgca--attgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| ||| |||  |||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  21292936 g-tttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgtt 21293032  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| || |||||||||||||||    
T  21293033 gctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1096721 - 1096467
Alignment:
Q  5 agttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatg 104  Q
    ||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||    
T  1096721 agttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 1096622  T
Q  105 ttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgtt 204  Q
    || ||| |||||||||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||| |    
T  1096621 ttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgct 1096522  T
Q  205 gttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096521 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  44 ttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||           | ||||||||||| ||   || |||||| ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----------ttattacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  144 gttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttg 243  Q
    |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  244 atgaagatgatga 256  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997655
Alignment:
Q  153 ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 21997648  T
Q  253 atgatgt 259  Q
    |||||||    
T  21997649 atgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 22107237 - 22107371
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22107237 gagagatgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatata 22107336  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatat 136  Q
    || | |||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  22107337 atatattatgcattacttgaatggtacttgaatat 22107371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 264762 - 264930
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  264762 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 264861  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  264862 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32027561 - 32027393
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32027561 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttg 32027462  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32027461 tatactg-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 36154777 - 36154942
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36154777 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 36154876  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||   || ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36154877 tatactgc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 256
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  94 gtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactg 193  Q
    ||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  194 cctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
      | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10733041 -ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29330102 - 29329934
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29330102 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 29330003  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29330002 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29346148 - 29345980
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29346148 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 29346049  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | || || |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29346048 tatactg-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  44 ttaattataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaaga 142  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||    |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||   |  ||||||||| ||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatt-aaga 18418695  T
Q  143 tgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta-tttaactaagttacatgagttggtctaagt 241  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 11581193 - 11581361
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||  |||||| || ||| |||  ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11581193 ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 11581292  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11581293 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29348621 - 29348453
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29348621 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 29348522  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | || || |||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29348521 tatactg-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29351094 - 29350926
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29351094 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 29350995  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | || || |||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29350994 tatactg-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39245304 - 39245136
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||| ||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| ||  || |||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39245304 ttatattgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 39245205  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39245204 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Original strand, 18319027 - 18319193
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18319027 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 18319126  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  18319127 gtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttt 183  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttgttgtt 210  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 20902002 - 20902172
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||| || || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20902002 ttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttt 20902101  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttg-atgaagatgatga 256  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20902102 gtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 2154607 - 2154776
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||| || || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2154607 ttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgttttt 2154706  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||  | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  2154707 gtatactgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31061237 - 31061068
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| |||||||||||| || ||| ||||| || ||| || | |||||| || | | |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31061237 ttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 31061138  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| | | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  31061137 gtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 153 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38619536 - 38619434
Alignment:
Q  153 ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38619536 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T
Q  253 atga 256  Q
    ||||    
T  38619437 atga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Original strand, 10775674 - 10775838
Alignment:
Q  92 ttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtata 190  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10775674 ttgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatata 10775773  T
Q  191 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||| | ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10775774 ctgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Original strand, 17517192 - 17517320
Alignment:
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |||||||| ||||||||| ||||    
T  17517192 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatg 17517291  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  17517292 agtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttt 183  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |    
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--t 20910842  T
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttgttgtt 210  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  20910843 ttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23064613 - 23064512
Alignment:
Q  153 ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23064613 ttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T
Q  253 atg 255  Q
    |||    
T  23064514 atg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 256
Target Start/End: Original strand, 20918019 - 20918110
Alignment:
Q  164 attattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20918019 attattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 22144117  T
Q  193 gcctatgttgttgt-tgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
     ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 37724073 - 37723910
Alignment:
Q  88 tatgttgtgatataatgttttatt-cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||   |||||  || |||||||||||||||  | |||| || || |||||||||||||   |    
T  37724073 tatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---g 37723977  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||||||||    
T  37723976 tatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 121
Target Start/End: Original strand, 21986011 - 21986130
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| |||||| |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||  |||||| |    
T  21986011 gagagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaa 21986110  T
Q  102 atgttttattcattacttga 121  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  21986111 atgttatatgcattacttga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660956
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329618
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24067276 - 24067110
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  24067276 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 24067177  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||| ||| | |||  || ||||||||||||| |||||||    
T  24067176 gtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502277
Alignment:
Q  136 tttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttgg 234  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | || ||| |||| |||||||| |||   ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| | ||||||| ||    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  235 tctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21565688 - 21565546
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 210  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||    
T  21565688 cattacatgaattatgtttga-tatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgtt 21565591  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21565590 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  141 gatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtct 237  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  238 aag 240  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668898
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | || |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36314654 - 36314577
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  36314654 tttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21873351 - 21873278
Alignment:
Q  158 attgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||    
T  21873351 attgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagt 21873278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766174
Alignment:
Q  113 attacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactg 193  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 240
Target Start/End: Original strand, 22178264 - 22178323
Alignment:
Q  182 ttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22178264 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 26012079 - 26012154
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26012079 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Original strand, 20806852 - 20806904
Alignment:
Q  204 tgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  20806852 tgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 79)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17488114 - 17487856
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  17488114 cgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 17488015  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  17488014 aatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattt 17487915  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17487914 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17499596 - 17499338
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  17499596 cgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatat 17499497  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  17499496 aatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattt 17499397  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17499396 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13442532 - 13442274
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  13442532 cgagagttgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 13442433  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13442432 aatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgt 13442333  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13442332 tgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 20698299 - 20698556
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  20698299 cgagagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatat 20698398  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698399 aatgttt-atgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 20698497  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20698498 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12399456 - 12399209
Alignment:
Q  12 cctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttatt 111  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||     
T  12399456 cctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatg 12399357  T
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 211  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12399356 cattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgtta 12399257  T
Q  212 tttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12399256 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26687144 - 26686887
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||| || ||| || |||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26687144 gagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatata 26687045  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| | |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687044 atgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 26686945  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26686944 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43841162 - 43840932
Alignment:
Q  29 gacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatat 128  Q
    ||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||     
T  43841162 gacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 43841063  T
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  43841062 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 43840963  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  43840962 agtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14973110 - 14972854
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  14973110 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 14973011  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14973010 tgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttg 14972911  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14972910 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 255
Target Start/End: Original strand, 14576697 - 14576949
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  14576697 gagagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 14576796  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  14576797 atgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgtt 14576895  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  14576896 gctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 23083226 - 23083482
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    |||||||||||||  || || ||||||||||| ||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  23083226 agagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataa 23083325  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| | | ||||||| |||  | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23083326 tgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttg 23083425  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     | |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23083426 ctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18438787 - 18438534
Alignment:
Q  6 gttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgt 105  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  18438787 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgt 18438688  T
Q  106 tttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg 205  Q
    | ||| ||||||||||   ||   || |||   ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18438687 tatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 18438588  T
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18438587 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14572845 - 14572602
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  || || ||||| |||||||||    
T  14572845 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatata 14572746  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14572745 atgtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgtt 14572647  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatg 246  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  14572646 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 25476249 - 25476506
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||||  || || ||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  25476249 gagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatata 25476348  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| |   |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25476349 atgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgtt 25476448  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25476449 gctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 40213585 - 40213838
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  40213585 gagagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 40213684  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  ||||||||| || ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||    
T  40213685 atgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgtt 40213783  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40213784 gatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  44 ttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| | | ||||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  144 gttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttg 243  Q
    |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  244 atgaagatgatga 256  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 11424627 - 11424880
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||| || ||| || ||| ||||||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||    
T  11424627 gagagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatata 11424726  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  |||||||||||| ||   || ||| || ||||||||||   |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11424727 atgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgtt 11424822  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11424823 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30030097 - 30029855
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||| ||||||||    
T  30030097 cgagagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatat 30029998  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||| | | |||||||||||   |  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||| |||||     
T  30029997 aatgttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgc 30029899  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    || | |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  30029898 tgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42386627 - 42386428
Alignment:
Q  43 gttaattataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaag 141  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||   ||||||||| ||    
T  42386627 gttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgag 42386528  T
Q  142 atgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagt 241  Q
    |||||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||    
T  42386527 atgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16796803 - 16796670
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16796803 agagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataa 16796704  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatat 136  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  16796703 tgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 16796670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17672794 - 17672626
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672794 ttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 17672695  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17672694 tatactg-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Original strand, 29172582 - 29172745
Alignment:
Q  92 ttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatac 191  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172582 ttgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 29172681  T
Q  192 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29172682 tg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 7781341 - 7781509
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  7781341 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 7781440  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7781441 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 9707601 - 9707769
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9707601 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttg 9707700  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9707701 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17463346 - 17463178
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17463346 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 17463247  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17463246 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 45606901 - 45607069
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  45606901 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 45607000  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45607001 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8899262 - 8899094
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8899262 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 8899163  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899162 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 38961885 - 38962053
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  38961885 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 38961984  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  38961985 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 256
Target Start/End: Original strand, 28848630 - 28848773
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  28848630 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtta 28848728  T
Q  212 tttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28848729 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13544193 - 13544024
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13544193 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttg 13544094  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  13544093 tatattg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41124055 - 41123892
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41124055 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41123956  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgat 254  Q
    |||||||    |  ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  41123955 tatactg----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 6469128 - 6469296
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||| ||| |||| ||| || || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6469128 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 6469227  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6469228 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 10247717 - 10247885
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10247717 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 10247816  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | || || |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10247817 tatactg-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12567728 - 12567564
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12567728 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttg 12567629  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12567628 tatattg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 17446649 - 17446816
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17446649 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 17446748  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  17446749 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgag-tcgtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 50242990 - 50242822
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50242990 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 50242891  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  50242890 tatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaact-aagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Original strand, 43550472 - 43550644
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43550472 ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 43550571  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  43550572 catactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 254
Target Start/End: Original strand, 16282805 - 16282971
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
T  16282805 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttg 16282904  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgat 254  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16282905 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14179653 - 14179555
Alignment:
Q  38 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatat 136  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  14179653 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 14179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  142 atgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagt 241  Q
    |||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  242 tgatgaagatgatga 256  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 46822395 - 46822267
Alignment:
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||    
T  46822395 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 46822296  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  46822295 agtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 92 - 240
Target Start/End: Original strand, 53070652 - 53070799
Alignment:
Q  92 ttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatac 191  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  53070652 ttgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatac 53070751  T
Q  192 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  53070752 tg-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  113 attacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 212  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  213 ttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 256
Target Start/End: Original strand, 12119785 - 12119887
Alignment:
Q  153 ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12119785 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T
Q  253 atga 256  Q
    ||||    
T  12119884 atga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15412531 - 15412429
Alignment:
Q  153 ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15412531 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15412433  T
Q  253 atga 256  Q
    ||||    
T  15412432 atga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977515
Alignment:
Q  125 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagtta 224  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||| |     
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  225 catgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12511187 - 12511059
Alignment:
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||  ||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||    
T  12511187 ttgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 12511088  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||   ||||||||||| |||||| ||||    
T  12511087 agtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8499620 - 8499518
Alignment:
Q  153 ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8499620 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8499522  T
Q  253 atga 256  Q
    ||||    
T  8499521 atga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 256
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  115 tacttgaataatatttgaatatttaagatgttga-tgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttat 212  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||| |||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  213 ttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644787
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  159 ttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  113 attacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 212  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | |||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 21618493  T
Q  213 ttaactaagttacatgagttggtctaagttgat 245  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  21618492 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10557087 - 10556985
Alignment:
Q  153 ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10557087 ttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  253 atga 256  Q
    ||||    
T  10556988 atga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Original strand, 52523682 - 52523831
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatg--ctgtttttgtata 190  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| |||||  ||| ||||| |||    
T  52523682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactg-ttttgcata 52523780  T
Q  191 ctgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  52523781 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27165391 - 27165250
Alignment:
Q  115 tacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatt 213  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||  ||| ||||| |||||| | |||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  27165391 tacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatt 27165293  T
Q  214 taactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27165292 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16097474 - 16097332
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 210  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | || ||| |||| | ||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  16097474 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgtt 16097377  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16097376 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12339986 - 12339890
Alignment:
Q  35 atgaagaggttaattataatatgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaa 133  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||      |||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||    
T  12339986 atgaagaggctaattataatatgtgaagctgttttaagatgtgttgttgttga------tgtgatataatgttttatgcatcacttgagaattatttgaa 12339893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737236
Alignment:
Q  159 ttgacattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||   || ||| | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23274838 - 23274705
Alignment:
Q  108 tattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-t 206  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | | ||||  | || |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| || |    
T  23274838 tattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgat 23274740  T
Q  207 tgttatttaactaagttacatgagttggtctaagt 241  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  23274739 tgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 13210371 - 13210448
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13210371 tttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234487
Alignment:
Q  136 tttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttgg 234  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||| |  |    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  235 tctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470928
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgt-tgttatttaactaagttacatgagttggtcta 238  Q
    |||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  239 agttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||| || |||||||    
T  15470944 agttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 24340678 - 24340844
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | | ||||  | || |||||||| ||||| || || || |||||    
T  24340678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatact 24340776  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || ||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  24340777 gcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 32307754 - 32307684
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32307754 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16103857 - 16103784
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16103857 tttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Original strand, 45577948 - 45578000
Alignment:
Q  204 tgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45577948 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28194743 - 28194693
Alignment:
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28194743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856140
Alignment:
Q  191 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Original strand, 2051154 - 2051238
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatg 177  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| |||||    
T  2051154 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 231
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077570
Alignment:
Q  191 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagt 23077570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9509447 - 9509189
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  9509447 cgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 9509348  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    | |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9509347 agtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgt 9509248  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9509247 tactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26212245 - 26211995
Alignment:
Q  10 aacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgtttta 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  26212245 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgtttta 26212146  T
Q  110 ttcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgt 209  Q
    | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26212145 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgt 26212046  T
Q  210 tatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaag-atgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212045 tatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12699086 - 12698831
Alignment:
Q  5 agttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatg 104  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  12699086 agttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 12698987  T
Q  105 ttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgt 203  Q
    || | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  12698986 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgc 12698887  T
Q  204 tgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12698886 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 16386112 - 16386369
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  16386112 agagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataa 16386211  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16386212 tgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcg 16386311  T
Q  203 ttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16386312 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10589294 - 10589039
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10589294 agagttggacctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataa 10589195  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10589194 tgttt-atgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttg 10589096  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  10589095 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38227736 - 38227481
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||    
T  38227736 agagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataa 38227637  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    || | | | ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38227636 tgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttg 38227538  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  38227537 ctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  44 ttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagat 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  144 gttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttg 243  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  244 atgaagatgatga 256  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40443647 - 40443393
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  40443647 cgagagatgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatat 40443548  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||    
T  40443547 aatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgt 40443451  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    || || |||||||||||||||| | || |||| |||||||| || |||||||||||||    
T  40443450 tgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Original strand, 3564229 - 3564482
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    |||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||    
T  3564229 agagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaa 3564328  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| || || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3564329 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttg 3564428  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3564429 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 27847696 - 27847951
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||  ||    
T  27847696 cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgat 27847795  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||| |||   ||||| |||||||||||    
T  27847796 aatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgt 27847891  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || || || ||||||||||||| | ||||| | |||||||| || |||||||||||||||    
T  27847892 tgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13647497 - 13647325
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13647497 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 13647398  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  13647397 catactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| ||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16213752 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27217028 - 27216860
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27217028 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 27216929  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27216928 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 456489 - 456321
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  456489 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 456390  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  456389 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11972664 - 11972496
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11972664 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 11972565  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  11972564 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 15376707 - 15376875
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15376707 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 15376806  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15376807 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16232688 - 16232520
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16232688 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 16232589  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16232588 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18640440 - 18640272
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18640440 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18640341  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18640340 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 20385117 - 20385285
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20385117 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20385216  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20385217 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 21189589 - 21189757
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21189589 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 21189688  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21189689 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32125659 - 32125491
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32125659 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 32125560  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  32125559 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41523085 - 41522917
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41523085 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41522986  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41522985 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41525547 - 41525379
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41525547 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41525448  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41525447 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 255
Target Start/End: Original strand, 11393281 - 11393448
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11393281 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 11393380  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11393381 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24702406 - 24702238
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24702406 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 24702307  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24702306 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24275314 - 24275175
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  24275314 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 24275216  T
Q  212 tttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24275215 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaa 239  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  240 gttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||| ||||||||||    
T  48273408 gttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16410201 - 16410059
Alignment:
Q  113 attacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 212  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  16410201 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttat 16410103  T
Q  213 ttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16410102 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44116677 - 44116509
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||| ||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44116677 ttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 44116578  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44116577 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 259
Target Start/End: Original strand, 2280036 - 2280238
Alignment:
Q  56 tgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 154  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| || || ||||  ||||||||||| || |||  |||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||    
T  2280036 tgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgattt 2280135  T
Q  155 gcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    ||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  2280136 gcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatga 2280232  T
Q  254 tgatgt 259  Q
    ||||||    
T  2280233 tgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3386501 - 3386333
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | |||  ||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3386501 ttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttg 3386402  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||   | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3386401 tatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 93 - 252
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatac 191  Q
    |||||||||||  | ||| ||||| |||||| || | |||||| || |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  192 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24704853 - 24704688
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||| ||   ||||||    
T  24704853 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttg 24704757  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24704756 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13869474 - 13869346
Alignment:
Q  128 tttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttaca 226  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | |||||||||||||||||| | ||    
T  13869474 tttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 13869376  T
Q  227 tgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13869375 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13831498 - 13831373
Alignment:
Q  130 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatga 229  Q
    |||||| || ||| |||| ||| ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13831498 tgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  230 gttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 17061909 - 17062077
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| |    
T  17061909 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-g 17062007  T
Q  187 tatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||  | |||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17062008 tatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 255
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219834
Alignment:
Q  136 tttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttgg 234  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  235 tctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16219814 tctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 255
Target Start/End: Original strand, 14932688 - 14932851
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatac 191  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||   |  ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||  |    
T  14932688 tgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatc 14932787  T
Q  192 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    | |||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  14932788 tacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 255
Target Start/End: Original strand, 15356123 - 15356286
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatac 191  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||   |  ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||  |    
T  15356123 tgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatc 15356222  T
Q  192 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    | |||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  15356223 tacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 255
Target Start/End: Original strand, 15360237 - 15360400
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatac 191  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||   |  ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||  |    
T  15360237 tgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatc 15360336  T
Q  192 tgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    | |||||| |  | |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  15360337 tacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20110714 - 20110556
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||  ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20110714 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20110615  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||           | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20110614 tata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtcta 238  Q
    |||||||| ||| || || |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||  |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  239 agttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 244
Target Start/End: Original strand, 15143902 - 15144143
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||  ||| || | ||||||||||||| || ||| | |||||| ||| ||||||||| ||||||| |||    |||||||| ||||||||     
T  15143902 agagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatg 15144001  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  |||||||| ||| ||   || ||| || |||||||| ||  ||||| |||| ||||| || || ||||||| ||| ||||||   |||||    
T  15144002 atgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgtt 15144100  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  15144101 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15211703 - 15211485
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||| |  || |||||||||||||||||||||          |||||||| ||||||||||    
T  15211703 agagttgaacctttgggtagctttaagacttaataatgacgtttaagatgatatgtgaagctgtttaagat----------tgattatgatgtgatataa 15211614  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgt-atactgcctatgtt 201  Q
    |||| ||| |||  ||||||   |  ||||||| || |||||||| ||||||  || ||| ||| |||||||||| |||| |||| || ||||||||| |    
T  15211613 tgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgct 15211515  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15211514 gctgttgttaattaactaagttgcatgagt 15211485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Original strand, 26355977 - 26356083
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26355977 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttg 26356076  T
Q  187 tatactg 193  Q
    |||||||    
T  26356077 tatactg 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Original strand, 26358429 - 26358535
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26358429 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttg 26358528  T
Q  187 tatactg 193  Q
    |||||||    
T  26358529 tatactg 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 67822 - 67745
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  67822 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 11996071 - 11996148
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11996071 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16495479 - 16495402
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  16495479 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 28505342 - 28505419
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505342 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34200863 - 34200786
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34200863 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44014255 - 44014182
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44014255 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  188 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 2530126 - 2530208
Alignment:
Q  126 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtt 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  2530126 tatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Original strand, 12756665 - 12756797
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||  ||| |||||| || ||| |||| | | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12756665 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 12756764  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 220  Q
    |||| ||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  12756765 tatattg-ttgtgttgctgttgttatttaactaa 12756797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 811175 - 811248
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  811175 tttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  188 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 253
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9703348 - 9703263
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| ||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  9703348 atgtcatactgttgttgcaatctgcctatgctgttattgttatttaactatgttgcatgagttgatataagatgatcaagatgatg 9703263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 244
Target Start/End: Original strand, 1868038 - 1868101
Alignment:
Q  182 ttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  1868038 ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  182 ttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||| ||| ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2109 - 1851
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  2109 cgagagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 2010  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2009 aatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgt 1910  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1909 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20536466 - 20536208
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    |||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  20536466 cgagtgttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatat 20536367  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536366 aatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 20536267  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20536266 ttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 21918863 - 21919121
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21918863 cgagagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatat 21918962  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 199  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918963 aatgttt-atgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 21919061  T
Q  200 ttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21919062 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 18818273 - 18818530
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||  || ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18818273 gagagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatata 18818372  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818373 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 18818472  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18818473 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 28648908 - 28649164
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  28648908 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 28649007  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  |||||||||||| ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28649008 atgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgtt 28649107  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    | | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28649108 gcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31971513 - 31971257
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  31971513 cgagagctgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatat 31971414  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  31971413 aatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgt 31971316  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31971315 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 21923792 - 21924049
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||    
T  21923792 gagagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaata 21923891  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    | ||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21923892 aggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgtt 21923991  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21923992 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22626992 - 22626736
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  22626992 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatata 22626893  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22626892 atgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgtt 22626794  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22626793 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 18879100 - 18879352
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| | |||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  18879100 cgagagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatat 18879198  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  18879199 aatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgt 18879293  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18879294 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23406611 - 23406379
Alignment:
Q  29 gacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatat 128  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||     
T  23406611 gacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23406512  T
Q  129 ttgaatatttaagatgtt--gatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttaca 226  Q
    |||||||||||||||| |  | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  23406511 ttgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 23406412  T
Q  227 tgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23406411 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7373001 - 7372778
Alignment:
Q  28 agacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataata 127  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||         |||||||||||  |||    
T  7373001 agacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataag--------cattacttgaagtata 7372910  T
Q  128 tttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacat 227  Q
     |||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
T  7372909 attgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 7372810  T
Q  228 gagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7372809 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 45130861 - 45131117
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  45130861 cgagagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatat 45130960  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  45130961 aatg-tttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatg 45131057  T
Q  200 ttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  45131058 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 16092206 - 16092463
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||| ||| |  ||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  16092206 agagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 16092305  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  |||||||| ||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16092306 atgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgtt 16092405  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16092406 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6759512 - 6759255
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  6759512 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 6759413  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  ||||| |||||| ||   || ||| || |||||||||    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6759412 atgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgtt 6759316  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 262  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759315 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 16199509 - 16199765
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  16199509 cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatat 16199608  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||    
T  16199609 aatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgt 16199705  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  16199706 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23648810 - 23648554
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  23648810 gagagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 23648711  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||   |  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  23648710 atgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgtt 23648611  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    | | |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  23648610 gctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22875321 - 22875065
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |||  |||||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  22875321 agagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 22875222  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||  |||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  22875221 atgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgtt 22875123  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | || || |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875122 gctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 259
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  43 gttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaaga 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||  |||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21389456  T
Q  143 tgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagt 241  Q
    ||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||     
T  21389457 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21389553  T
Q  242 tgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||    
T  21389554 tgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Original strand, 25363004 - 25363138
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  25363004 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtata 25363103  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatat 136  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  25363104 atgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 25363138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 259
Target Start/End: Original strand, 21395883 - 21396101
Alignment:
Q  38 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatt 137  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||      
T  21395883 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 21395981  T
Q  138 taagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtc 236  Q
    |||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  21395982 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21396078  T
Q  237 taagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21396079 taagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 259
Target Start/End: Original strand, 21790376 - 21790594
Alignment:
Q  38 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatt 137  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||      
T  21790376 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtataca 21790474  T
Q  138 taagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtc 236  Q
    |||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  21790475 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21790571  T
Q  237 taagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21790572 taagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 259
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  56 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 155  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  156 caattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgat 254  Q
     | |||| || ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  255 gatgt 259  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 14409438 - 14409606
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14409438 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14409537  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14409538 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1484570 - 1484402
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1484570 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 1484471  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1484470 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 5853286 - 5853454
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5853286 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 5853385  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5853386 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Original strand, 16413310 - 16413474
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16413310 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 16413409  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16413410 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20403395 - 20403227
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20403395 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20403296  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20403295 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41598356 - 41598188
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41598356 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41598257  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41598256 tatact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 15203225 - 15203393
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15203225 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttg 15203324  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  15203325 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 20046189 - 20046357
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20046189 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 20046288  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20046289 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14823941 - 14823774
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14823941 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14823842  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14823841 tatactg-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgag-tggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Original strand, 18678093 - 18678221
Alignment:
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||    
T  18678093 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 18678192  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  18678193 agtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
       | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19896436 - 19896265
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattat---gtcatgctgttt 183  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||   ||||||||||||    
T  19896436 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgttt 19896337  T
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  19896336 ttgtataccgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 256
Target Start/End: Original strand, 25484268 - 25484430
Alignment:
Q  86 attatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25484268 attatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 25484367  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||        | | |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25484368 gtatac--------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 129 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32121862 - 32121734
Alignment:
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||    
T  32121862 ttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatg 32121763  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||   ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121762 agtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26224087 - 26223917
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| || ||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26224087 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttg 26223988  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    |||| || || | ||| ||||||||||||| |||| | |||| || | ||||||||||| |||||| |||||    
T  26223987 tatattg-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 262
Target Start/End: Original strand, 19937078 - 19937174
Alignment:
Q  165 ttattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  19937078 ttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 252
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290853
Alignment:
Q  159 ttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520368
Alignment:
Q  136 tttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttgg 234  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  235 tctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20498728 - 20498581
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||  ||||  |||||    
T  20498728 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-attttacatact 20498630  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20498629 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219717
Alignment:
Q  113 attacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 212  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatact-attttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 26219761  T
Q  213 ttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  26219760 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 259
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855372
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  232 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15070660 - 15070571
Alignment:
Q  153 ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttg 243  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  15070660 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21491072 - 21490995
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21491072 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17140988 - 17140916
Alignment:
Q  188 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17140988 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtcta 238  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  239 agttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagtt 232  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| | |||||||||||||||||| | |||||||     
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  233 ggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 5866318 - 5866395
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  5866318 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Original strand, 19801376 - 19801527
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||| ||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19801376 ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttg 19801474  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||||||  | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  19801475 tatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 17612065 - 17612231
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| | | || |    || |||||||| ||||| |||||| | |||||    
T  17612065 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatact 17612163  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  17612164 gcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 244
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  141 gatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtcta 238  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||   || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  239 agttga 244  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 252
Target Start/End: Original strand, 13508040 - 13508199
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | | ||||  | || |||||||| ||||| || || || ||| |    
T  13508040 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatatt 13508138  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||  |||||||| | ||||||||    
T  13508139 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760961
Alignment:
Q  188 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagt 21673732  T
Q  232 tggtctaagttgatga 247  Q
     |||||||||||||||    
T  21673731 cggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  209 ttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  209 ttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 252
Target Start/End: Original strand, 13597572 - 13597731
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| | | ||||  | || |||||||| ||||| || ||||| || ||    
T  13597572 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcattct 13597670  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    || ||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||  |||||||| | ||||||||    
T  13597671 gcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3727 - 3470
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||| |||||| || ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  3727 gagaattgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 3628  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3627 atgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 3528  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3527 gctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 599 - 343
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  599 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 500  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  499 atgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgtt 401  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  400 attgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 5984 - 6245
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  5984 cgagagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 6083  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgccta--- 197  Q
    |||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       
T  6084 aatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgt 6183  T
Q  198 tgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6184 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5098 - 4849
Alignment:
Q  10 aacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgtttta 109  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  5098 aacctttggctagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 4999  T
Q  110 ttcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgt 209  Q
    | ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4998 tgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgt 4899  T
Q  210 tatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4898 tatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2210 - 1952
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| | ||||||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  2210 cgagagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatat 2111  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  2110 aatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 2011  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     | |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  2010 cgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21167 - 20910
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21167 agagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataa 21068  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21067 tgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttg 20968  T
Q  203 ttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     || |||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20967 ctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39017 - 38761
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  39017 gagagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 38918  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38917 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgtt 38819  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | ||||||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38818 gctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  47 attataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgtt 146  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  147 gatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatg 246  Q
    | | | ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  247 aagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9918 - 9744
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaa-tatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||| || || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9918 ttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgttttt 9819  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc 261  Q
    ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9818 gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4712
Alignment:
Q  5 agttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatg 104  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4965 agttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg 4866  T
Q  105 ttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgtt 204  Q
    ||| || | ||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865 ttt-atgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgtt 4767  T
Q  205 gttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4766 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 1
Alignment:
Q  5 agttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatg 104  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  189 agttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg 90  T
Q  105 ttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 194  Q
     ||||| | ||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  89 -tttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 24164 - 24406
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctga-ttatgttgtgata 99  Q
    |||||||||||| || ||  || ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  24164 cgagagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgata 24263  T
Q  100 taatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctat 198  Q
    ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24264 taatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctat 24363  T
Q  199 gttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagt 241  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  24364 gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32322 - 32067
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  32322 cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatat 32223  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  32222 aatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtttactgcctatgt 32126  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32125 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 3015 - 3271
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  3015 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 3114  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3115 atgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgtt 3213  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3214 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40113 - 39858
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  40113 gagagttgaacctt-gggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 40015  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    |||||  || |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  40014 atgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgtt 39916  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39915 gctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26152 - 25896
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  26152 gagagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatata 26053  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    |||||  || |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  26052 atgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgtt 25954  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25953 gctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 259
Target Start/End: Original strand, 8424 - 8650
Alignment:
Q  29 gacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatat 128  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||  |||     
T  8424 gacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 8523  T
Q  129 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatg 228  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  8524 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgccta---tgttgctgttatttaactaagctgcatg 8619  T
Q  229 agttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8620 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23139 - 22886
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  23139 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatata 23040  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  23039 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgtt 22941  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22940 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39729 - 39479
Alignment:
Q  6 gttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgt 105  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  39729 gttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 39630  T
Q  106 tttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg 205  Q
    | | | |||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39629 tatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttg 39531  T
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  39530 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 257
Target Start/End: Original strand, 75083 - 75333
Alignment:
Q  6 gttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgt 105  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||||||| | || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  75083 gttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 75182  T
Q  106 tttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg 205  Q
    | | | |||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75183 tatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttg 75281  T
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  75282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13753 - 13497
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  13753 cgagagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatat 13654  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13653 aatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgt 13556  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13555 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 15328 - 15584
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||  | ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  15328 cgagagttgactcgttgggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatat 15427  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||  ||||| ||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15428 aat-atttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgt 15525  T
Q  201 tgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || | |||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  15526 tgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 10289 - 10544
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||    
T  10289 cgagagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatat 10388  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    ||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  10389 aatg-attatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgt 10484  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || || |||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10485 tgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Original strand, 25930 - 26179
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    |||| |||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  25930 agagctgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 26029  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    ||||  |  |||||||||||| ||   || ||| || ||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26030 tgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 26129  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26130 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  113 attacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 212  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  213 ttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 123
Target Start/End: Original strand, 33360 - 33480
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  33360 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataa 33459  T
Q  103 tgttttattcattacttgaat 123  Q
    ||||  |  ||||||||||||    
T  33460 tgttaaacgcattacttgaat 33480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40169 - 39913
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  40169 gagagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatata 40070  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| |  |||||||||||||||  |||  |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40069 atgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgtt 39971  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39970 gctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4763 - 4508
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  4763 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 4664  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  4663 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttg 4564  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4563 ctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12345 - 12090
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  12345 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 12246  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  12245 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttg 12146  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12145 ctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22297 - 22042
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  22297 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 22198  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 202  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  22197 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttg 22098  T
Q  203 ttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22097 ctgttgttatttaactaag-cgcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13349 - 13144
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||| || ||| || |||  ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13349 gagagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatata 13250  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13249 atgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 13150  T
Q  202 gttgtt 207  Q
    | ||||    
T  13149 gctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 273
Alignment:
Q  204 tgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  328 tgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8479
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||    ||    
T  8732 gagagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----ta 8637  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| | | |||||||||||  | | |||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8636 atgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgtt 8537  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | | |||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8536 gctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 17079 - 17337
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  17079 gagagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatata 17178  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttt--tgtatactgcctatg 199  Q
    |||||  |  |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17179 atgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatg 17278  T
Q  200 ttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17279 ttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Original strand, 79278 - 79430
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| |||||||||| |  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||     
T  79278 ttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgttttta 79377  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  79378 tatactgtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6868 - 6669
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  6868 cgagagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatat 6769  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6768 aacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 259
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16721
Alignment:
Q  4 gagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataat 103  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  16466 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataat 16565  T
Q  104 gttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgt 203  Q
    ||| ||  |||||||||||| ||   || ||| || ||||| || ||| || || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||     
T  16566 gttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgc 16665  T
Q  204 tgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16666 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Original strand, 3104 - 3306
Alignment:
Q  56 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||||||     
T  3104 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatta 3203  T
Q  156 caattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3204 catttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 3303  T
Q  256 atg 258  Q
    |||    
T  3304 atg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 256
Target Start/End: Original strand, 339818 - 340065
Alignment:
Q  6 gttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgt 105  Q
    |||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  339818 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 339917  T
Q  106 tttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg 205  Q
    | ||  |||||||||||| ||   || ||| || |||||||| ||| ||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  339918 tatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg 340015  T
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  340016 -tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 158444 - 158612
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  158444 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 158543  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  158544 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttt 183  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||| | |  | |||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||  |    
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacctaagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg--t 71377  T
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttgttgtt 210  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  71376 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 124843 - 124675
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  124843 cgagagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 124744  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattatt 169  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  124743 aatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  190 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 174930 - 174767
Alignment:
Q  94 gtgatataatgttttatt-cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||| ||   |||||  || |||||||| ||||||| | |||| || || |||||||||||||   |||||||    
T  174930 gtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatact 174834  T
Q  193 gcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  174833 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28546 - 28414
Alignment:
Q  127 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttaca 226  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  28546 atttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgca 28447  T
Q  227 tgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28446 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11369 - 11292
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11369 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2074 - 1997
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2074 tttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47244 - 46995
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  | |||      |||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  47244 cgagagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgag------tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatat 47151  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| |||||||||||    
T  47150 aatgttt-atgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgt 47055  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  47054 tgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 915 - 1170
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| |||||  | |||||||| |||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||| |||    
T  915 cgagagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttat 1014  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  1015 aatg-tttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgt 1110  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || || || ||| ||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  1111 tgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16537 - 16282
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||| |||    
T  16537 cgagagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttat 16438  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||  ||| |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16437 aatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgt 16342  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || || || ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  16341 tgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 32824 - 33077
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatg-tgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| | ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||| |  || || || || |||| ||| |||| ||||    
T  32824 agagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttata 32921  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||| ||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32922 atgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgtt 33019  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33020 gctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 46181 - 45928
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatg-tgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| | ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||| |  || || || || |||| ||| |||| ||||    
T  46181 agagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttata 46084  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    ||||| ||| ||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  46083 atgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgtt 45986  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    | |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45985 gctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  48 ttataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgtt 146  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  || || |||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||| | ||   || ||| || ||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  147 gatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatg 246  Q
    | ||  ||||| |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  247 aagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  198 tgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7521 - 7266
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||  | |||||||| |||||| | ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  ||| |||    
T  7521 cgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttat 7422  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||   |||| |||||||||||||||||    
T  7421 aatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgt 7326  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  7325 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1544 - 1289
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||  | |||||||| |||||| | ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  ||| |||    
T  1544 cgagagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttat 1445  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| ||   ||||| |||||||||||    
T  1444 aatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtacactgcctatgt 1349  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  1348 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  191 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 4994 - 5246
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||| |||||| | |||| |||    
T  4994 cgagagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttat 5093  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||| ||   ||||||| | |||||||    
T  5094 aatg-tttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtataatacctatgt 5189  T
Q  201 tgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    || || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  5190 tgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 1171 - 1037
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1171 gagagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatata 1072  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatat 136  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  1071 atgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4779 - 4545
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    |||||||||||||  || || ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  || || |||| ||| |||||||||    
T  4779 agagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgatgtgatata 4682  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtt 201  Q
    |||| |||| |||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| |    
T  4681 atgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgct 4582  T
Q  202 gttgttgttatttaactaagttacatgagttggtcta 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  4581 gttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11456 - 11286
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11456 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 11357  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||    
T  11356 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 259
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11564
Alignment:
Q  137 ttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtc 236  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  237 taagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  11542 taagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 75
Target Start/End: Original strand, 11377 - 11450
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgt 75  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  11377 gagagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20915 - 20747
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20915 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20816  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  20815 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37989 - 37821
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  37989 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 37890  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  37889 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 82240 - 82072
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  82240 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 82141  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  82140 tatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 22645 - 22776
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 210  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||| | |||| |||    
T  22645 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgtt 22742  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  22743 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 94579 - 94411
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  94579 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 94480  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  94479 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 252
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44598 - 44454
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgttgttgtt 210  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  44598 cattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtt 44500  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44499 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 100501 - 100378
Alignment:
Q  132 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgag 230  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| | || |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  100501 aatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 100403  T
Q  231 ttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  100402 tcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  188 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 255
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  189 tactgcctatgttgttgttg-ttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28086 - 27911
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataa 102  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  28086 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataa 27987  T
Q  103 tgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgc 178  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  27986 tgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 3738 - 3640
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3738 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 7802 - 7704
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  7802 gagagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 27666 - 27855
Alignment:
Q  56 tgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 154  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| || || ||||  |||||||||||  | ||| ||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  27666 tgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgattt 27765  T
Q  155 gcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
     || |||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  27766 acatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4862 - 4694
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4862 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 4763  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  4762 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14115 - 13947
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14115 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14016  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  14015 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 51837 - 51582
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatat 100  Q
    ||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||  ||| |||    
T  51837 cgagaattggacccttgggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttat 51738  T
Q  101 aatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    ||||||| || |||| ||||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||| | |||  || ||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  51737 aatgttt-atgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgt 51642  T
Q  201 tgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || |||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  51641 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13535 - 13392
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgtta 211  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  13535 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgtta 13437  T
Q  212 tttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13436 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  33 taatgaagaggttaattataatatgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttg 131  Q
    |||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||   ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  132 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 196  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4465 - 4300
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||| || || ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4465 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttg 4366  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4365 tatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10941 - 10772
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||| ||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  10941 ttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttg 10842  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  10841 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128751
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-tttttt 128818  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
       | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  128817 ttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Original strand, 20373 - 20524
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| || |||||    
T  20373 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttg 20471  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  20472 tatactg-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65915
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||| |||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaagatgatg 65915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8481
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgtt 210  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtt 8515  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  8514 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6535
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  232 tggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16952 - 16784
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16952 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16853  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16852 tatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 501252 - 501088
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  501252 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 501153  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatg 252  Q
    |||| || || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  501152 tatattg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 85573 - 85742
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| || | |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  85573 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 85672  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  85673 gtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 160761 - 160688
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  160761 tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 106
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  274 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 175  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||   | ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  174 tatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4214
Alignment:
Q  92 ttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtata 190  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4378 ttgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtata 4279  T
Q  191 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||| | ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4278 ctgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 827 - 1021
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgatata 101  Q
    ||||||||||||||  || || ||| ||||||||||  || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||||||    
T  827 gagagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatata 926  T
Q  102 atgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 200  Q
    ||||| | | |||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  927 atgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 258
Target Start/End: Original strand, 12243 - 12413
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12243 ttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttg 12342  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 258  Q
    ||| ||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  12343 tattctg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgttt 183  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |  | |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||  |    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--t 15459  T
Q  184 ttgtatactgcctatgttgttgttgtt 210  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||    
T  15460 ttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||||||||  ||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9410 - 9241
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||| ||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  9410 ttatattgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttta 9311  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgat 257  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  9310 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 253
Target Start/End: Original strand, 1274 - 1440
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1274 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt 1373  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatga 253  Q
    ||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1374 gtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30100 - 29946
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | |||  |||| |||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30100 ttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttg 30001  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagtt 242  Q
    |||||||  | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  30000 tatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12226 - 12064
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttg 186  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12226 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttag 12127  T
Q  187 tatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||   ||    ||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12126 tatactgc---tg----tgttgctgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 256
Target Start/End: Original strand, 38679 - 38820
Alignment:
Q  115 tacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatt 213  Q
    ||||||||| |||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  38679 tacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatt 38777  T
Q  214 taactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38778 taactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 161083 - 161252
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| || | |||||| || |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||  |||||||    
T  161083 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgttttt 161182  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  161183 gtatactgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 17851 - 17928
Alignment:
Q  2 gagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttg 79  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17851 gagaattgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  113 attacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttat 212  Q
    ||||||||||| ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||  | ||| | |||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  213 ttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  94 gtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||   |  ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  193 gcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
     |||||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6611
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13991
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15898
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10419 - 10323
Alignment:
Q  3 agagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgttgtgata 99  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  10419 agagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13333 - 13147
Alignment:
Q  56 tgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaata-tttaagatgttgatgaat 153  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| || || ||||  |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| |||||  ||| |||||||| ||| |    
T  13333 tgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatt 13234  T
Q  154 tgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||| |||| ||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  13233 tgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 244
Target Start/End: Original strand, 16017 - 16206
Alignment:
Q  56 tgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgctgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 154  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| || || ||||  |||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||| ||| ||    
T  16017 tgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgattt 16116  T
Q  155 gcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
     || |||| ||| |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  16117 acatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 2122 - 2291
Alignment:
Q  87 ttatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgacattattatgtcatgctgttttt 185  Q
    |||| ||||||||||||  | ||| ||||| |||||| || | |||||| || ||| ||| || || ||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  2122 ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttt 2221  T
Q  186 gtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  2222 gtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 17982 - 18148
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | | ||||  | || |||||||| ||||| || || || ||| |    
T  17982 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataat 18080  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    || ||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| ||||||    
T  18081 gcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 207
Target Start/End: Original strand, 53504 - 53617
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  53504 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 53602  T
Q  193 gcctatgttgttgtt 207  Q
    |||||||||| ||||    
T  53603 gcctatgttgctgtt 53617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 1113 - 1190
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  1113 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 259
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  188 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12733 - 12587
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| ||||||| |||| |||| | | ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  12733 tgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatact 12636  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12635 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 130051 - 129917
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgt-tgtt 210  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  130051 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgtt 129954  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttgatga 247  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  129953 atttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 240
Target Start/End: Original strand, 60689 - 60818
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcat--gctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttg 208  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||| |||  ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  60689 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgc-attgatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttg 60786  T
Q  209 ttatttaactaagttacatgagttggtctaag 240  Q
    ||  ||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  60787 tttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  232 tggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15738 - 15664
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatga 256  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15738 tttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 259
Target Start/End: Original strand, 6167 - 6244
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6167 tttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 23927 - 24000
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||||||| | | | |||| ||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  232 tggtctaag 240  Q
     ||||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 275 - 133
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 210  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  275 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgtt 178  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
     |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  177 gtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 177
Target Start/End: Original strand, 8014 - 8098
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatg 177  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||    
T  8014 tgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatg 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12889 - 12766
Alignment:
Q  136 tttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttgg 234  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||    
T  12889 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  235 tctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  188 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12943
Alignment:
Q  136 tttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttgg 234  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| ||    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  235 tctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  12963 tctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  232 tggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
     |||||||| |||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 255
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | || |||| ||| ||||| || |||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  232 tggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
     ||||||||||||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 10516 - 10647
Alignment:
Q  112 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 210  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  10516 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 10613  T
Q  211 atttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    ||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||    
T  10614 atttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  133 atatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  232 tggtctaagttgatga 247  Q
     |||||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 255
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgt--tgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20661 - 20595
Alignment:
Q  1 cgagagttgaacctttgggcagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtt 67  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20661 cgagagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26996 - 26852
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatg-ctgtt 182  Q
    |||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||  ||||    
T  26996 tgattatgatgtattataatgttt-atgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgtt 26901  T
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
     |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||| | |||||||    
T  26900 gttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagt 26852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Original strand, 45860 - 45909
Alignment:
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  45860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  140 agatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtcta 238  Q
    |||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||| ||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  239 agttga 244  Q
    ||||||    
T  10547 agttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32643 - 32538
Alignment:
Q  152 attgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaaga 250  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||||    
T  32643 attgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 32547  T
Q  251 tgatgatgt 259  Q
    |||||||||    
T  32546 tgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 192921 - 193069
Alignment:
Q  84 tgattatgttgtgatataatgttttatt-cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtt 182  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||   |  ||||||| || |||||||| ||||||  || ||| ||| |||||||||| ||||    
T  192921 tgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 193019  T
Q  183 tttgt-atactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
     |||| || ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  193020 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagt 193069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 225572 - 225465
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||    
T  225572 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcacgctg-ttttgcatact 225475  T
Q  193 gcctatgttg 202  Q
    | ||||||||    
T  225474 gactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  170 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 32190 - 32102
Alignment:
Q  168 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  32190 ttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29198 - 29118
Alignment:
Q  151 aattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||  || |||||| |  | |||||||||||||||| | |||||||    
T  29198 aattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagt 29118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11630 - 11464
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| | | || |    || |||||||| ||||| |||||| | |||||    
T  11630 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatact 11532  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  11531 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Original strand, 38211 - 38377
Alignment:
Q  93 tgtgatataatgttttattcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatact 192  Q
    |||||||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| | | || |    || |||||||| ||||| |||||| | |||||    
T  38211 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatact 38309  T
Q  193 gcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 259  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||   ||||||| | |||||||| ||||||    
T  38310 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8180
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttga 244  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Original strand, 4803 - 4897
Alignment:
Q  137 ttaagatgttgatgaattgcaattgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagt 231  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| ||||| | |||| |||||| ||||   ||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||    
T  4803 ttaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagt 4897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  183 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatga 247  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||| |||||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  206 ttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 255
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  191 ctgcctatgttgttgttgttatttaactaagttacatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 255  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University