View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3653_low_15 (Length: 238)

Name: NF3653_low_15
Description: NF3653
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3653_low_15
NF3653_low_15
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (1-230)||(21395872-21396101)
chr8 (1-230)||(21790365-21790594)
chr8 (1-230)||(21389342-21389571)
chr8 (30-230)||(21778697-21778897)
chr8 (25-230)||(16199559-16199765)
chr8 (25-230)||(31971257-31971463)
chr8 (25-230)||(45130911-45131117)
chr8 (27-230)||(21918915-21919121)
chr8 (25-230)||(20536208-20536416)
chr8 (25-230)||(18879150-18879352)
chr8 (25-230)||(22626736-22626943)
chr8 (25-230)||(18818322-18818530)
chr8 (25-229)||(28648957-28649164)
chr8 (158-230)||(5866323-5866395)
chr8 (25-230)||(7372778-7372978)
chr8 (117-230)||(17140916-17141031)
chr8 (25-230)||(21923841-21924049)
chr8 (113-230)||(16092344-16092463)
chr8 (158-230)||(21490995-21491067)
chr8 (130-233)||(6759255-6759360)
chr8 (114-230)||(6520368-6520486)
chr8 (132-230)||(23406379-23406479)
chr8 (25-230)||(22875065-22875273)
chr8 (158-230)||(38855300-38855372)
chr8 (158-230)||(23760893-23760962)
chr8 (113-214)||(20498578-20498681)
chr8 (117-227)||(14409495-14409606)
chr8 (158-211)||(983455-983508)
chr8 (158-230)||(21249384-21249457)
chr8 (158-230)||(21255222-21255295)
chr8 (113-211)||(21285616-21285716)
chr8 (158-226)||(26355747-26355815)
chr8 (117-227)||(1484402-1484513)
chr8 (117-227)||(5853343-5853454)
chr8 (117-211)||(16413367-16413462)
chr8 (117-227)||(20403227-20403338)
chr8 (117-227)||(22001753-22001864)
chr8 (159-214)||(24353036-24353091)
chr8 (159-214)||(37116363-37116418)
chr8 (157-214)||(19154935-19154992)
chr8 (134-223)||(13508108-13508199)
chr8 (158-230)||(17612159-17612231)
chr8 (159-214)||(17267044-17267099)
chr8 (117-227)||(20046246-20046357)
chr8 (117-227)||(41598188-41598299)
chr8 (130-227)||(15203295-15203393)
chr8 (25-229)||(23648554-23648761)
chr8 (25-94)||(25363053-25363123)
chr8 (113-211)||(26219733-26219831)
chr8 (113-227)||(26225295-26225409)
chr8 (117-227)||(4483281-4483391)
chr8 (168-227)||(4542477-4542535)
chr8 (159-214)||(17439557-17439612)
chr8 (168-227)||(19896265-19896323)
chr8 (161-223)||(13597669-13597731)
chr8 (130-211)||(15070574-15070656)
chr8 (131-214)||(19801447-19801530)
chr8 (130-211)||(45290759-45290841)
chr8 (162-211)||(21673723-21673772)
chr8 (177-233)||(19937118-19937174)
chr8 (1-39)||(17353827-17353865)
chr8 (111-228)||(18678102-18678221)
chr8 (161-215)||(20502154-20502207)
chr8 (177-227)||(25484380-25484430)
chr8 (111-228)||(32121734-32121853)
chr8 (25-80)||(6759408-6759464)
chr8 (159-215)||(22525573-22525628)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (25-230)||(20309108-20309313)
chr2 (25-230)||(38029-38235)
chr2 (12-230)||(23285865-23286082)
chr2 (25-230)||(22731147-22731355)
chr2 (113-230)||(23103399-23103516)
chr2 (25-227)||(298727-298933)
chr2 (12-230)||(23654286-23654507)
chr2 (25-230)||(22738093-22738300)
chr2 (25-230)||(23076442-23076650)
chr2 (30-230)||(23060513-23060716)
chr2 (1-226)||(40622098-40622327)
chr2 (25-230)||(22337115-22337323)
chr2 (25-230)||(23660023-23660230)
chr2 (117-227)||(22105412-22105524)
chr2 (158-230)||(23071998-23072070)
chr2 (158-226)||(7679589-7679657)
chr2 (154-230)||(8946657-8946732)
chr2 (158-225)||(28405981-28406048)
chr2 (157-214)||(23207293-23207350)
chr2 (113-214)||(7735-7838)
chr2 (158-230)||(19671830-19671902)
chr2 (166-230)||(23040247-23040310)
chr2 (158-226)||(25175854-25175922)
chr2 (117-227)||(571397-571508)
chr2 (117-227)||(18808943-18809054)
chr2 (158-229)||(22134256-22134326)
chr2 (117-227)||(23130862-23130973)
chr2 (117-227)||(23133329-23133440)
chr2 (117-227)||(23135590-23135701)
chr2 (117-227)||(23709583-23709694)
chr2 (117-227)||(23712064-23712175)
chr2 (117-227)||(26505379-26505490)
chr2 (117-227)||(26507857-26507968)
chr2 (117-227)||(34402573-34402684)
chr2 (117-227)||(39682313-39682424)
chr2 (130-227)||(6725995-6726093)
chr2 (117-229)||(32214972-32215085)
chr2 (159-214)||(20520243-20520298)
chr2 (117-211)||(24367790-24367885)
chr2 (158-211)||(18786952-18787005)
chr2 (132-224)||(21155126-21155219)
chr2 (157-214)||(22413186-22413243)
chr2 (158-211)||(23708668-23708721)
chr2 (117-227)||(24898246-24898358)
chr2 (117-227)||(24900729-24900841)
chr2 (117-227)||(24903206-24903318)
chr2 (117-227)||(24905683-24905795)
chr2 (117-227)||(24908158-24908270)
chr2 (161-213)||(32451981-32452033)
chr2 (159-214)||(23004764-23004819)
chr2 (159-214)||(25108903-25108958)
chr2 (117-227)||(32039549-32039660)
chr2 (177-227)||(28577099-28577149)
chr2 (177-227)||(38967374-38967424)
chr2 (177-227)||(45029966-45030016)
chr2 (168-225)||(43137301-43137357)
chr2 (159-215)||(23287378-23287433)
chr2 (132-227)||(24529595-24529691)
chr2 (168-224)||(24643054-24643109)
chr2 (159-214)||(23791289-23791344)
chr2 (160-215)||(26392397-26392451)
chr2 (159-214)||(24697657-24697712)
chr2 (1-38)||(23038227-23038264)
chr2 (111-211)||(25616204-25616306)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (25-230)||(16282-16487)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (25-230)||(1289-1494)
scaffold0106 (25-230)||(7266-7471)
scaffold0106 (161-227)||(15291-15356)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (25-230)||(27847746-27847951)
chr7 (25-228)||(40443393-40443597)
chr7 (25-230)||(12698831-12699040)
chr7 (25-230)||(9509189-9509397)
chr7 (25-230)||(16386160-16386369)
chr7 (25-230)||(10589039-10589246)
chr7 (12-230)||(26211995-26212217)
chr7 (25-227)||(18456326-18456530)
chr7 (1-226)||(17137953-17138177)
chr7 (42-230)||(38227481-38227671)
chr7 (117-230)||(13647325-13647440)
chr7 (1-226)||(12187019-12187243)
chr7 (158-230)||(16495402-16495474)
chr7 (158-230)||(28505347-28505419)
chr7 (158-230)||(34200786-34200858)
chr7 (113-227)||(3564366-3564482)
chr7 (158-230)||(67745-67817)
chr7 (113-227)||(48273392-48273508)
chr7 (158-230)||(11996076-11996148)
chr7 (111-230)||(16219717-16219835)
chr7 (113-211)||(2280121-2280221)
chr7 (158-226)||(811180-811248)
chr7 (158-226)||(18005650-18005718)
chr7 (158-226)||(44014182-44014250)
chr7 (158-230)||(47831807-47831879)
chr7 (111-227)||(16213684-16213801)
chr7 (117-227)||(17061966-17062077)
chr7 (158-230)||(15754936-15755008)
chr7 (117-227)||(456321-456432)
chr7 (117-227)||(11972496-11972607)
chr7 (117-227)||(14949173-14949284)
chr7 (117-227)||(15376764-15376875)
chr7 (117-227)||(16232520-16232631)
chr7 (117-227)||(16410059-16410170)
chr7 (117-227)||(18640272-18640383)
chr7 (117-227)||(20385174-20385285)
chr7 (117-227)||(21189646-21189757)
chr7 (117-211)||(24275187-24275282)
chr7 (117-227)||(32125491-32125602)
chr7 (117-227)||(41522917-41523028)
chr7 (117-227)||(41525379-41525490)
chr7 (117-226)||(11393338-11393448)
chr7 (113-230)||(18430709-18430827)
chr7 (113-230)||(22072913-22073033)
chr7 (117-227)||(24704688-24704796)
chr7 (113-211)||(16056347-16056446)
chr7 (117-227)||(24702238-24702349)
chr7 (117-227)||(27216860-27216971)
chr7 (117-227)||(44116509-44116620)
chr7 (130-227)||(13869346-13869444)
chr7 (154-211)||(12901342-12901399)
chr7 (159-211)||(14044765-14044817)
chr7 (159-211)||(14354795-14354847)
chr7 (168-227)||(3386333-3386391)
chr7 (134-230)||(10063841-10063939)
chr7 (159-214)||(20220238-20220293)
chr7 (157-211)||(1868043-1868097)
chr7 (158-208)||(12255842-12255892)
chr7 (177-227)||(20110556-20110606)
chr7 (157-214)||(15008547-15008604)
chr7 (157-214)||(48991196-48991253)
chr7 (167-211)||(15144096-15144139)
chr7 (158-230)||(19486793-19486865)
chr7 (159-202)||(14036282-14036325)
chr7 (159-202)||(14346312-14346355)
chr7 (152-211)||(18154885-18154943)
chr7 (112-177)||(2530139-2530205)
chr7 (177-227)||(13831373-13831423)
chr7 (113-211)||(38898423-38898523)
chr7 (161-215)||(9177718-9177772)
chr7 (177-226)||(19649557-19649606)
chr7 (1-82)||(24054618-24054698)
chr7 (177-229)||(2832509-2832561)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (25-230)||(17046487-17046692)
chr4 (25-230)||(14053215-14053422)
chr4 (12-230)||(12902757-12902978)
chr4 (12-230)||(7088877-7089098)
chr4 (25-228)||(22636437-22636642)
chr4 (25-230)||(44052829-44053037)
chr4 (25-223)||(23374272-23374473)
chr4 (25-230)||(16270149-16270356)
chr4 (49-230)||(7798774-7798958)
chr4 (25-227)||(16377436-16377639)
chr4 (25-230)||(16239883-16240090)
chr4 (158-230)||(15551817-15551889)
chr4 (111-230)||(52873367-52873488)
chr4 (1-144)||(15121693-15121834)
chr4 (154-230)||(3096293-3096368)
chr4 (25-230)||(7893703-7893908)
chr4 (61-230)||(6899891-6900062)
chr4 (25-225)||(14038653-14038856)
chr4 (113-214)||(13853-13956)
chr4 (158-226)||(12774011-12774079)
chr4 (158-230)||(39706337-39706409)
chr4 (114-211)||(12288211-12288312)
chr4 (113-227)||(54798756-54798872)
chr4 (158-211)||(52243245-52243298)
chr4 (113-227)||(14280316-14280431)
chr4 (117-227)||(18215325-18215436)
chr4 (113-227)||(44928926-44929042)
chr4 (158-226)||(8846360-8846428)
chr4 (117-227)||(12358-12469)
chr4 (117-227)||(15118403-15118514)
chr4 (161-228)||(22353835-22353901)
chr4 (117-227)||(23803316-23803427)
chr4 (117-227)||(44615288-44615399)
chr4 (117-227)||(44773138-44773249)
chr4 (117-227)||(51463919-51464030)
chr4 (117-227)||(52312510-52312621)
chr4 (165-211)||(43198611-43198657)
chr4 (117-233)||(19242693-19242810)
chr4 (117-229)||(19618223-19618336)
chr4 (157-214)||(46640504-46640561)
chr4 (161-213)||(6190479-6190531)
chr4 (117-227)||(1837560-1837671)
chr4 (117-227)||(3515007-3515118)
chr4 (117-227)||(18239470-18239581)
chr4 (117-227)||(50222390-50222501)
chr4 (159-214)||(53082202-53082257)
chr4 (130-211)||(15355389-15355471)
chr4 (113-211)||(8574871-8574969)
chr4 (130-230)||(15367690-15367791)
chr4 (130-230)||(15370018-15370119)
chr4 (130-230)||(15371202-15371303)
chr4 (130-230)||(15373483-15373584)
chr4 (130-230)||(15402703-15402804)
chr4 (25-104)||(3096772-3096851)
chr4 (168-227)||(7641286-7641344)
chr4 (168-227)||(12610950-12611008)
chr4 (29-94)||(17047989-17048055)
chr4 (112-177)||(43256161-43256227)
chr4 (177-227)||(44102214-44102264)
chr4 (177-230)||(16223532-16223585)
chr4 (117-211)||(14970758-14970853)
chr4 (179-214)||(21815699-21815734)
chr4 (158-192)||(16596686-16596720)
chr4 (159-215)||(17333292-17333347)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (25-230)||(965-1170)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (25-230)||(51582-51787)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (25-230)||(16920546-16920751)
chr6 (25-230)||(22831503-22831710)
chr6 (24-218)||(11185517-11185711)
chr6 (58-230)||(35245586-35245758)
chr6 (25-230)||(20360873-20361081)
chr6 (25-230)||(20638196-20638404)
chr6 (25-230)||(29060540-29060748)
chr6 (111-230)||(16496244-16496365)
chr6 (25-230)||(19303454-19303661)
chr6 (25-229)||(18409740-18409947)
chr6 (111-230)||(20076700-20076817)
chr6 (25-230)||(20593773-20593981)
chr6 (25-230)||(25629268-25629476)
chr6 (29-230)||(17287713-17287917)
chr6 (25-230)||(22780140-22780348)
chr6 (158-230)||(27333267-27333339)
chr6 (158-230)||(27394007-27394079)
chr6 (158-230)||(28496520-28496592)
chr6 (158-230)||(29808931-29809003)
chr6 (130-227)||(25656629-25656727)
chr6 (117-227)||(22782227-22782338)
chr6 (113-211)||(25644339-25644440)
chr6 (158-211)||(9098563-9098616)
chr6 (113-211)||(20109157-20109257)
chr6 (158-230)||(1561303-1561375)
chr6 (158-226)||(19652199-19652267)
chr6 (117-227)||(1595549-1595660)
chr6 (117-227)||(12742317-12742428)
chr6 (117-227)||(18334643-18334754)
chr6 (117-227)||(19005046-19005157)
chr6 (117-227)||(19858970-19859081)
chr6 (117-227)||(24422547-24422658)
chr6 (117-227)||(25754809-25754920)
chr6 (117-227)||(33861794-33861905)
chr6 (117-227)||(33864278-33864389)
chr6 (113-230)||(23019408-23019525)
chr6 (117-229)||(30676761-30676874)
chr6 (117-227)||(2291231-2291342)
chr6 (117-227)||(8055029-8055140)
chr6 (117-227)||(26924691-26924802)
chr6 (117-214)||(18456732-18456830)
chr6 (117-214)||(18461892-18461990)
chr6 (165-211)||(19668390-19668436)
chr6 (168-230)||(25714417-25714478)
chr6 (117-207)||(4185827-4185919)
chr6 (159-212)||(23076748-23076801)
chr6 (117-229)||(34963371-34963484)
chr6 (159-212)||(35008166-35008219)
chr6 (132-211)||(25688518-25688598)
chr6 (117-227)||(1540962-1541073)
chr6 (130-224)||(16448591-16448686)
chr6 (117-227)||(20556943-20557054)
chr6 (183-230)||(22080799-22080846)
chr6 (168-214)||(18821904-18821949)
chr6 (112-177)||(27415942-27416008)
chr6 (157-215)||(33443062-33443119)
chr6 (158-230)||(8227560-8227632)
chr6 (168-227)||(3852121-3852179)
chr6 (117-207)||(4186390-4186482)
chr6 (164-215)||(18199473-18199523)
chr6 (152-226)||(19873120-19873193)
chr6 (152-226)||(22432249-22432322)
chr6 (152-226)||(22438799-22438872)
chr6 (177-226)||(19862978-19863027)
chr6 (1-82)||(22438951-22439031)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (25-230)||(38801304-38801508)
chr1 (12-230)||(27250629-27250850)
chr1 (12-230)||(21026680-21026901)
chr1 (25-229)||(50210126-50210333)
chr1 (25-227)||(34509783-34509988)
chr1 (130-230)||(20847173-20847275)
chr1 (29-230)||(22532269-22532473)
chr1 (117-230)||(45574893-45575008)
chr1 (158-230)||(14295600-14295672)
chr1 (113-214)||(21896258-21896361)
chr1 (25-155)||(22354485-22354616)
chr1 (113-214)||(21861572-21861675)
chr1 (158-226)||(22921918-22921986)
chr1 (3-94)||(48603652-48603744)
chr1 (158-230)||(33681010-33681079)
chr1 (130-214)||(35261097-35261183)
chr1 (113-230)||(22237630-22237746)
chr1 (158-211)||(16758668-16758721)
chr1 (158-211)||(20918623-20918676)
chr1 (158-211)||(21754064-21754117)
chr1 (117-227)||(13988866-13988977)
chr1 (117-227)||(21923342-21923453)
chr1 (117-227)||(23593786-23593897)
chr1 (113-227)||(31612313-31612428)
chr1 (159-214)||(50614167-50614222)
chr1 (159-214)||(50621995-50622050)
chr1 (25-229)||(20135188-20135395)
chr1 (158-230)||(52928019-52928088)
chr1 (161-214)||(16368338-16368391)
chr1 (158-226)||(20248283-20248351)
chr1 (161-229)||(20454606-20454673)
chr1 (117-228)||(21840766-21840878)
chr1 (117-227)||(21475138-21475249)
chr1 (111-229)||(22468696-22468816)
chr1 (113-227)||(433012-433125)
chr1 (130-211)||(22123131-22123214)
chr1 (177-230)||(13212974-13213027)
chr1 (157-214)||(41050084-41050141)
chr1 (177-233)||(21342090-21342146)
chr1 (168-227)||(29298137-29298195)
chr1 (168-227)||(29776688-29776746)
chr1 (177-227)||(21346961-21347011)
chr1 (177-227)||(21707167-21707217)
chr1 (177-227)||(21711709-21711759)
chr1 (160-214)||(50686627-50686681)
chr1 (177-233)||(15860121-15860177)
chr1 (132-227)||(16275430-16275526)
chr1 (157-212)||(16093933-16093988)
chr1 (159-214)||(26064954-26065009)
chr1 (179-229)||(16361915-16361965)
chr1 (152-226)||(21714546-21714619)
chr1 (112-177)||(33797573-33797639)
chr1 (1-82)||(21714699-21714779)
chr1 (168-226)||(21161720-21161778)
chr1 (185-215)||(21533948-21533978)
chr1 (177-229)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (25-227)||(5044-5246)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (25-230)||(46995-47200)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (25-230)||(10339-10544)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (25-230)||(32067-32272)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (25-230)||(13497-13703)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (25-230)||(15378-15584)
scaffold0114 (1-226)||(7295-7519)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (25-230)||(4712-4919)
scaffold0358 (25-155)||(13-143)
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (25-230)||(21292883-21293090)
chr5 (25-230)||(23390409-23390617)
chr5 (1-223)||(37723910-37724133)
chr5 (30-230)||(8286760-8286964)
chr5 (12-230)||(22075018-22075240)
chr5 (25-230)||(24493569-24493776)
chr5 (111-230)||(21729064-21729185)
chr5 (111-230)||(21808389-21808510)
chr5 (25-230)||(25421532-25421740)
chr5 (25-230)||(13025311-13025518)
chr5 (25-230)||(13095495-13095702)
chr5 (1-226)||(22032323-22032545)
chr5 (25-227)||(24529223-24529428)
chr5 (25-230)||(9077952-9078160)
chr5 (1-226)||(18769894-18770118)
chr5 (158-230)||(19660884-19660956)
chr5 (158-230)||(36314577-36314649)
chr5 (25-210)||(25431414-25431602)
chr5 (130-230)||(21997553-21997655)
chr5 (114-230)||(21329500-21329618)
chr5 (114-214)||(20026942-20027046)
chr5 (1-132)||(23572178-23572308)
chr5 (32-230)||(1096467-1096668)
chr5 (158-226)||(22959581-22959649)
chr5 (111-230)||(21502156-21502277)
chr5 (115-226)||(21565546-21565659)
chr5 (113-227)||(22412187-22412302)
chr5 (117-227)||(264819-264930)
chr5 (117-227)||(10732991-10733102)
chr5 (117-227)||(20909012-20909123)
chr5 (117-227)||(39363384-39363495)
chr5 (130-227)||(39245136-39245234)
chr5 (158-211)||(26012084-26012137)
chr5 (158-230)||(19668898-19668970)
chr5 (132-211)||(20902075-20902155)
chr5 (158-214)||(22144065-22144121)
chr5 (117-227)||(29329934-29330045)
chr5 (117-227)||(42245416-42245527)
chr5 (130-227)||(11581263-11581361)
chr5 (117-227)||(36154834-36154942)
chr5 (157-214)||(22178269-22178326)
chr5 (132-227)||(2154680-2154776)
chr5 (130-224)||(18319098-18319193)
chr5 (168-227)||(20918052-20918110)
chr5 (117-227)||(29345980-29346091)
chr5 (130-227)||(10775740-10775838)
chr5 (112-177)||(18356367-18356433)
chr5 (111-211)||(18418599-18418699)
chr5 (112-177)||(20910800-20910866)
chr5 (130-227)||(31061068-31061166)
chr5 (177-227)||(38619434-38619484)
chr5 (177-226)||(23064512-23064561)
chr5 (12-95)||(22107273-22107357)
chr5 (117-227)||(29348453-29348564)
chr5 (117-227)||(29350926-29351037)
chr5 (117-227)||(32027393-32027504)
chr5 (161-215)||(15796434-15796487)
chr5 (160-214)||(26740697-26740750)
chr5 (160-209)||(26732884-26732932)
chr5 (158-230)||(40725853-40725925)
chr5 (152-203)||(21873277-21873327)
chr5 (152-211)||(26704090-26704148)
chr5 (152-211)||(26973823-26973881)
chr5 (177-227)||(20806854-20806904)
chr5 (161-215)||(23469818-23469871)
chr5 (1-39)||(23501235-23501273)
chr5 (184-214)||(27989004-27989034)
chr5 (3-80)||(21873400-21873476)
chr5 (25-69)||(22412337-22412381)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (25-230)||(20698349-20698556)
chr3 (25-230)||(12399209-12399417)
chr3 (25-230)||(13442274-13442482)
chr3 (25-230)||(17487856-17488064)
chr3 (25-230)||(17499338-17499546)
chr3 (25-230)||(14972854-14973062)
chr3 (26-230)||(23083275-23083482)
chr3 (25-230)||(18438534-18438742)
chr3 (25-230)||(26686887-26687095)
chr3 (25-211)||(14576746-14576934)
chr3 (25-227)||(24153122-24153326)
chr3 (1-226)||(856140-856364)
chr3 (25-230)||(43840932-43841140)
chr3 (158-230)||(13210376-13210448)
chr3 (26-230)||(25476299-25476506)
chr3 (132-230)||(11424781-11424880)
chr3 (158-226)||(49668125-49668193)
chr3 (113-230)||(15470927-15471043)
chr3 (158-226)||(9512924-9512992)
chr3 (158-226)||(9520899-9520967)
chr3 (158-226)||(12174308-12174376)
chr3 (3-94)||(14179570-14179662)
chr3 (113-211)||(42386429-42386529)
chr3 (132-211)||(14572608-14572688)
chr3 (117-230)||(43550529-43550644)
chr3 (158-211)||(32307696-32307749)
chr3 (113-227)||(36166598-36166712)
chr3 (158-214)||(52523778-52523834)
chr3 (117-227)||(9707658-9707769)
chr3 (114-230)||(14234487-14234605)
chr3 (117-227)||(17672626-17672737)
chr3 (117-227)||(29172634-29172745)
chr3 (165-227)||(28194693-28194755)
chr3 (158-227)||(27165250-27165319)
chr3 (115-227)||(55500942-55501055)
chr3 (162-226)||(16097332-16097396)
chr3 (158-226)||(16103784-16103852)
chr3 (25-227)||(40213634-40213838)
chr3 (117-227)||(6469185-6469296)
chr3 (117-227)||(7781398-7781509)
chr3 (117-227)||(17463178-17463289)
chr3 (159-214)||(22110402-22110457)
chr3 (134-230)||(24340746-24340844)
chr3 (117-227)||(28848662-28848773)
chr3 (117-227)||(34159326-34159437)
chr3 (159-214)||(43925974-43926029)
chr3 (117-227)||(45606958-45607069)
chr3 (117-227)||(55476491-55476602)
chr3 (157-226)||(37251216-37251283)
chr3 (113-211)||(21618465-21618563)
chr3 (158-227)||(53301600-53301669)
chr3 (117-227)||(8899094-8899205)
chr3 (117-227)||(16454332-16454443)
chr3 (117-211)||(38961942-38962037)
chr3 (130-227)||(12119789-12119887)
chr3 (130-227)||(15412429-15412527)
chr3 (117-214)||(53070704-53070802)
chr3 (161-214)||(606378-606431)
chr3 (157-213)||(12377938-12377994)
chr3 (117-227)||(13151841-13151953)
chr3 (117-227)||(13154306-13154418)
chr3 (117-228)||(13544024-13544136)
chr3 (130-227)||(17737236-17737337)
chr3 (117-227)||(10247774-10247885)
chr3 (117-211)||(12567576-12567671)
chr3 (168-227)||(15977515-15977573)
chr3 (135-225)||(16282880-16282971)
chr3 (117-227)||(17446706-17446816)
chr3 (117-211)||(50242838-50242933)
chr3 (177-227)||(8499518-8499568)
chr3 (177-227)||(10556985-10557035)
chr3 (130-227)||(44494809-44494907)
chr3 (177-227)||(45577950-45578000)
chr3 (158-211)||(23274706-23274759)
chr3 (158-230)||(37642314-37642386)
chr3 (177-225)||(41123892-41123940)
chr3 (159-215)||(13919344-13919399)
chr3 (152-226)||(15878095-15878168)
chr3 (25-94)||(16796685-16796755)
chr3 (111-228)||(46822267-46822386)
chr3 (161-226)||(23077530-23077594)
chr3 (177-229)||(14665398-14665450)
chr3 (177-229)||(14668554-14668606)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (25-230)||(4849-5057)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (12-230)||(949-1169)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (25-230)||(13211-13419)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-229)||(174767-174996)
scaffold0021 (160-230)||(121766-121835)
scaffold0021 (25-138)||(124679-124793)
scaffold0021 (154-214)||(136414-136474)
scaffold0021 (154-214)||(145122-145182)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (12-230)||(167879-168099)
scaffold0011 (25-230)||(51913-52121)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (25-230)||(3470-3678)
scaffold0292 (32-230)||(343-543)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (25-230)||(1851-2059)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (25-230)||(1952-2160)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (30-230)||(6039-6245)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (25-211)||(24214-24405)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (25-230)||(32942-33149)
scaffold0145 (25-230)||(38761-38968)
scaffold0145 (132-232)||(9744-9845)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (29-230)||(3068-3271)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (12-230)||(20910-21132)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (1-214)||(26840-27052)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (29-229)||(3103-3306)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (17-227)||(22886-23098)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (25-230)||(8446-8650)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (25-228)||(39479-39684)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (25-228)||(75128-75333)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (25-229)||(17128-17337)
scaffold0056 (168-214)||(79388-79433)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (25-223)||(25978-26179)
scaffold0122 (113-227)||(44709-44825)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (1-226)||(1881-2105)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (55-230)||(32901-33077)
scaffold0120 (55-230)||(45928-46104)
scaffold0120 (154-230)||(16113-16188)
scaffold0120 (168-230)||(17389-17450)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (110-230)||(28414-28536)
scaffold0046 (158-230)||(11292-11364)
scaffold0046 (158-230)||(1997-2069)
scaffold0046 (174-230)||(4552-4608)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (25-230)||(25896-26103)
scaffold0026 (25-230)||(39858-40065)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (158-230)||(1118-1190)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (158-230)||(119875-119947)
scaffold0023 (113-226)||(100378-100493)
scaffold0023 (113-227)||(44454-44570)
scaffold0023 (159-226)||(40224-40291)
scaffold0023 (117-227)||(94411-94522)
scaffold0023 (158-226)||(101503-101571)
scaffold0023 (117-211)||(17491-17586)
scaffold0023 (3-76)||(38371-38443)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (1-226)||(21696-21920)
scaffold0210 (1-226)||(29588-29812)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (1-132)||(12857-12987)
scaffold0029 (117-210)||(11305-11399)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (25-227)||(339863-340065)
scaffold0003 (117-227)||(158501-158612)
scaffold0003 (112-177)||(71353-71419)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (153-230)||(34123-34200)
scaffold0175 (12-180)||(13141-13313)
scaffold0175 (177-230)||(273-326)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (113-214)||(1048-1151)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (115-230)||(11447-11564)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (28-230)||(16516-16721)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (26-230)||(8479-8682)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (113-211)||(8485-8585)
scaffold0621 (158-230)||(6535-6607)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (25-230)||(39913-40120)
scaffold0080 (113-214)||(19885-19990)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (113-226)||(2808-2923)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (25-230)||(4508-4715)
scaffold0228 (25-230)||(12090-12297)
scaffold0228 (25-230)||(22042-22249)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (154-227)||(15664-15737)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (113-214)||(12584-12687)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (158-230)||(6611-6683)
scaffold0333 (158-230)||(13991-14063)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (158-230)||(6172-6244)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (158-226)||(19268-19336)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (158-230)||(15826-15898)
scaffold0020 (177-211)||(178913-178947)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (17-170)||(6669-6826)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (113-230)||(10543-10659)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (158-230)||(23932-24001)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (114-230)||(12942-13057)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (158-214)||(6828-6884)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (158-230)||(1083-1155)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (113-214)||(13144-13247)
scaffold0357 (159-214)||(2677-2732)
scaffold0357 (158-211)||(16149-16202)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (158-226)||(2694-2762)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (158-226)||(160688-160756)
scaffold0001 (130-227)||(85644-85742)
scaffold0001 (117-211)||(501100-501195)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (159-226)||(14747-14814)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (113-230)||(22672-22788)
scaffold0037 (117-227)||(82072-82183)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (158-211)||(1101-1154)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (158-211)||(5662-5715)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (154-211)||(8119-8176)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (113-227)||(38704-38820)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (113-227)||(116430-116544)
scaffold0022 (159-214)||(129021-129075)
scaffold0022 (161-214)||(78338-78391)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (113-211)||(129924-130024)
scaffold0010 (154-214)||(60761-60821)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (158-226)||(45841-45909)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (113-214)||(53551-53654)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (166-226)||(132662-132722)
scaffold0028 (117-227)||(136680-136791)
scaffold0028 (117-227)||(139149-139260)
scaffold0028 (117-227)||(144087-144198)
scaffold0028 (158-211)||(62217-62270)
scaffold0028 (117-227)||(134211-134322)
scaffold0028 (117-227)||(141618-141729)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (114-230)||(12766-12884)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (117-227)||(13392-13503)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (117-227)||(20747-20858)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (117-227)||(37821-37932)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (157-211)||(25125-25179)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (161-214)||(566-619)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (157-214)||(6332-6389)
scaffold0420 (164-214)||(13793-13843)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (113-211)||(10546-10646)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (158-211)||(32555-32608)
scaffold0034 (161-213)||(51936-51987)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (158-226)||(133-201)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (158-230)||(11464-11536)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (117-228)||(10772-10884)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (166-226)||(32102-32162)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (158-230)||(38305-38377)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (117-214)||(20430-20527)
scaffold0031 (111-230)||(128751-128871)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (117-211)||(4710-4805)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (163-230)||(4888-4954)
scaffold0395 (132-170)||(983-1021)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (134-230)||(18050-18148)
scaffold0247 (177-211)||(2241-2275)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (117-227)||(13947-14058)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (117-227)||(16784-16895)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (48-209)||(4545-4709)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (157-207)||(38339-38389)
scaffold0139 (177-226)||(19980-20029)
scaffold0139 (1-82)||(20132-20212)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (111-214)||(8059-8166)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (158-226)||(28818-28887)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (113-211)||(27751-27851)
scaffold0165 (25-70)||(3644-3689)
scaffold0165 (25-70)||(7708-7753)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (157-214)||(2691-2748)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (132-211)||(29948-30028)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (117-227)||(40400-40511)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (159-214)||(97021-97076)
scaffold0006 (159-214)||(106299-106354)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (130-227)||(4214-4312)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (168-214)||(11979-12024)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (25-94)||(1052-1122)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (112-177)||(15417-15483)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (132-224)||(4300-4393)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (117-229)||(12300-12413)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (157-214)||(267676-267733)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (168-228)||(9241-9300)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (113-227)||(161136-161252)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (168-227)||(106-164)
[»] scaffold0198 (2 HSPs)
scaffold0198 (1-80)||(23995-24073)
scaffold0198 (152-226)||(23843-23916)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (157-211)||(103679-103733)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (117-227)||(12064-12169)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (177-226)||(36454-36503)
scaffold0131 (1-82)||(36607-36687)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (1-70)||(8847-8915)
scaffold0101 (177-224)||(1393-1440)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (29-95)||(27967-28034)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (159-209)||(206575-206624)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (152-226)||(69794-69867)
scaffold0004 (1-78)||(69949-70025)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (185-214)||(1874-1903)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (161-226)||(10575-10639)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (3-80)||(16241-16317)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (25-70)||(10326-10371)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21395872 - 21396101
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  21395872 gagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatg 21395971  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21395972 tttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 21396071  T
Q  201 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396072 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21790365 - 21790594
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  21790365 gagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatg 21790464  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21790465 tttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 21790564  T
Q  201 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790565 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 21389342 - 21389571
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  21389342 gagaccaatatatgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatg 21389441  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21389442 tttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatga 21389541  T
Q  201 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389542 gtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  30 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattga 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  230 t 230  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 16199559 - 16199765
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||    
T  16199559 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatga 16199658  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199659 attgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 16199758  T
Q  224 atgatgt 230  Q
    |||||||    
T  16199759 atgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31971463 - 31971257
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31971463 taatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 31971364  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 222  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31971363 attggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 31971265  T
Q  223 gatgatgt 230  Q
    ||||||||    
T  31971264 gatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 45130911 - 45131117
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||    
T  45130911 taatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatga 45131010  T
Q  125 a-ttgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 222  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131011 atttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 45131109  T
Q  223 gatgatgt 230  Q
    ||||||||    
T  45131110 gatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 230
Target Start/End: Original strand, 21918915 - 21919121
Alignment:
Q  27 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaa-atttgtatccataagatgttgatgaa 125  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||   |||||||||| ||||    
T  21918915 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  126 ttgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 222  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 21919113  T
Q  223 gatgatgt 230  Q
    ||||||||    
T  21919114 gatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20536416 - 20536208
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  20536416 taatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 20536317  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20536316 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 20536218  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  20536217 atgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 18879150 - 18879352
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  18879150 taatctgtgaagctga-taagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 18879248  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
    ||||| | ||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18879249 aattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 18879345  T
Q  224 atgatgt 230  Q
    |||||||    
T  18879346 atgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22626943 - 22626736
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||   ||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||    
T  22626943 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 22626844  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22626843 atttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22626745  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  22626744 tgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 18818322 - 18818530
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   ||||||| || ||    
T  18818322 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 18818421  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18818422 acttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 18818520  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  18818521 atgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Original strand, 28648957 - 28649164
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||  |    |||||   |||||||||| ||    
T  28648957 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttg 28649056  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28649057 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 28649155  T
Q  221 atgatgatg 229  Q
    |||||||||    
T  28649156 atgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866395
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7372978 - 7372778
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||       | ||||||||||| | | ||| ||   ||||||| || |||    
T  7372978 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttga 7372886  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
     ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  7372885 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7372787  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  7372786 tgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140916
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T
Q  215 ttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||    
T  17140931 ttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 21923841 - 21924049
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    |||| ||| | || ||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||    
T  21923841 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 21923940  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| | ||||||| || |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21923941 acttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21924039  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  21924040 atgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Original strand, 16092344 - 16092463
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092344 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16092442  T
Q  210 agatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    || || |||||||||||||||    
T  16092443 agttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21490995
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6759360 - 6759255
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6759360 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 6759262  T
Q  227 atgtcca 233  Q
    |||||||    
T  6759261 atgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  114 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  212 atgttgaagatgatgatgt 230  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23406479 - 23406379
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 228  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23406479 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 23406381  T
Q  229 gt 230  Q
    ||    
T  23406380 gt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22875273 - 22875065
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgat 122  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |    |||||   | |||||||| |    
T  22875273 taatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgtt 22875174  T
Q  123 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  22875173 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaag 22875075  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  22875074 atgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 14409495 - 14409606
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14409592  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  14409593 gattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983508
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 983508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21249457 - 21249384
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21249457 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21255295 - 21255222
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21255295 atactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285616
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaa 21285617  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  21285616 g 21285616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1484513 - 1484402
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484513 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1484416  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  1484415 gattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 5853343 - 5853454
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853343 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 5853440  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  5853441 gattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413462
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16413462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20403338 - 20403227
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20403241  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  20403240 gattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22001864 - 22001753
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22001864 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22001767  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  22001766 gattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154992
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 19154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 223
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  134 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612231
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 20046246 - 20046357
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20046246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20046343  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  20046344 gattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41598299 - 41598188
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41598299 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41598202  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  41598201 gattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Original strand, 15203295 - 15203393
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  15203295 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23648761 - 23648554
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||     ||| ||   |||||||||| ||    
T  23648761 taatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttg 23648662  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtca---tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
     |||| |  |||||| |||||||||   || |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||    
T  23648661 tattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 23648563  T
Q  221 atgatgatg 229  Q
    ||| |||||    
T  23648562 atgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Original strand, 25363053 - 25363123
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgtattacttga 94  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  25363053 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26219831 - 26219733
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219831 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26219734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Original strand, 26225295 - 26225409
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225295 agatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26225392  T
Q  211 gatgttgaagatgatga 227  Q
    | || | ||||||||||    
T  26225393 gttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4483391 - 4483281
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4483391 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4483295  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  4483294 gattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439612
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaagatg 17439612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597731
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15070656 - 15070574
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070656 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15070574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 214
Target Start/End: Original strand, 19801447 - 19801530
Alignment:
Q  131 tttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801447 tttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagatg 19801530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Original strand, 45290759 - 45290841
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290759 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45290841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21673772 - 21673723
Alignment:
Q  162 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaag 21673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 17353827 - 17353865
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 39  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17353827 gagacctatataagaagttaattgtaatctgtgaagctg 17353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Original strand, 18678102 - 18678221
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18678102 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 18678200  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgat 228  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  18678201 taagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502207
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgtt-gtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 20502207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121734
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattc 32121755  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgat 228  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  32121754 taagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 6759464 - 6759408
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt 80  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6759464 taatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 6759408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525573
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 22525573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20309313 - 20309108
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  20309313 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 20309214  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309213 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 20309114  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  20309113 tgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 38029 - 38235
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||    
T  38029 taatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatga 38128  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 222  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38129 atcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 38227  T
Q  223 gatgatgt 230  Q
    ||||||||    
T  38228 gatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23286082 - 23285865
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||       
T  23286082 aagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatt 23285983  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285982 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23285885  T
Q  211 gatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23285884 gttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 22731147 - 22731355
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   ||| |||||||||    
T  22731147 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatg 22731246  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  22731247 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaag 22731345  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  22731346 atgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  212 atgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 298727 - 298933
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||   |||||||||| ||    
T  298727 taatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttg 298826  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  298827 aattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 298926  T
Q  221 atgatga 227  Q
    |||||||    
T  298927 atgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 23654286 - 23654507
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  || | ||| ||       
T  23654286 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatt 23654385  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654386 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23654484  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  23654485 taagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 22738093 - 22738300
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  22738093 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22738192  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  22738193 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaag 22738290  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  22738291 atgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23076650 - 23076442
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   |||||| ||| ||    
T  23076650 taatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttg 23076551  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  23076550 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaag 23076452  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  23076451 atgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23060716 - 23060513
Alignment:
Q  30 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattg 128  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||  ||   |||||||||| ||| |||    
T  23060716 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttg 23060617  T
Q  129 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 225  Q
     | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  23060616 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23060518  T
Q  226 gatgt 230  Q
    |||||    
T  23060517 gatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 40622098 - 40622327
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  40622098 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaata 40622196  T
Q  101 tttgta-----tccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 193  Q
    ||||||     | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||| ||| |||     
T  40622197 tttgtactgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttattcaaccaagt 40622294  T
Q  194 tgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  40622295 tgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22337323 - 22337115
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||    
T  22337323 taatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 22337224  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
      ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22337223 tcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 22337125  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  22337124 atgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23660230 - 23660023
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||   |   ||| ||   |||||||||| ||    
T  23660230 taatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttg 23660131  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||    
T  23660130 atttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaaga 23660032  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  23660031 tgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22105524 - 22105412
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105524 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22105426  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  22105425 gattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072070
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679589
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  154 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671830
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 230
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571397
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  571410 gattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18809054 - 18808943
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18809054 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18808957  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  18808956 gattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 229
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23130973 - 23130862
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23130973 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23130876  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  23130875 gattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23133440 - 23133329
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23133343  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  23133342 gattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23135701 - 23135590
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23135701 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23135604  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  23135603 gattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 23709583 - 23709694
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709583 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23709680  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  23709681 gattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 23712064 - 23712175
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23712064 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23712161  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  23712162 gattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26505490 - 26505379
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26505490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26505393  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  26505392 gattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26507968 - 26507857
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26507968 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26507871  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  26507870 gattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 34402573 - 34402684
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402573 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34402670  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  34402671 gattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39682424 - 39682313
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39682424 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39682327  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  39682326 gattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6726093 - 6725995
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  6726093 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215085
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T
Q  214 gttgaagatgatgatg 229  Q
    | | |||||| |||||    
T  32215070 gattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24367885 - 24367790
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367885 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24367790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18787005
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 224
Target Start/End: Original strand, 21155126 - 21155219
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  21155126 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 23708668 - 23708721
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23708668 atactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaag 23708721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 24898246 - 24898358
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24898246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24898343  T
Q  213 tgttgaagatgatga 227  Q
    || | ||||||||||    
T  24898344 tgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 24900729 - 24900841
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24900729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24900826  T
Q  213 tgttgaagatgatga 227  Q
    || | ||||||||||    
T  24900827 tgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 24903206 - 24903318
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24903206 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24903303  T
Q  213 tgttgaagatgatga 227  Q
    || | ||||||||||    
T  24903304 tgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 24905683 - 24905795
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24905683 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24905780  T
Q  213 tgttgaagatgatga 227  Q
    || | ||||||||||    
T  24905781 tgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 24908158 - 24908270
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24908158 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 24908255  T
Q  213 tgttgaagatgatga 227  Q
    || | ||||||||||    
T  24908256 tgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452033
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004764
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 23004764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108903
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 25108903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 32039549 - 32039660
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  32039549 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagtt 32039646  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  32039647 gattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030016
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137301
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287378
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 23287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 24529595 - 24529691
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  24529595 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 224
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23791344 - 23791289
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23791344 tactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatg 23791289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392397
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 26392397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697712
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaagatg 24697712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 23038264 - 23038227
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagct 38  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23038264 gagacctatataagaagttatctgcaatctgtgaagct 23038227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25616306 - 25616204
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| |||| || || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  25616306 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gtaatttaactaagttgcatgagtcagtc 25616208  T
Q  208 taag 211  Q
    ||||    
T  25616207 taag 25616204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16487 - 16282
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16487 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatga 16388  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16387 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 16288  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  16287 tgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 174; Significance: 9e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1494 - 1289
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  1494 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 1395  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1394 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1295  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  1294 tgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7471 - 7266
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  7471 taatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 7372  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7371 attgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 7272  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  7271 tgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 27847746 - 27847951
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27847746 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 27847845  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27847846 attgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatga 27847945  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  27847946 tgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40443597 - 40443393
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  40443597 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatga 40443498  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40443497 attgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatg 40443398  T
Q  224 atgat 228  Q
    |||||    
T  40443397 atgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12699040 - 12698831
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  12699040 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 12698941  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgt----tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaa 219  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12698940 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 12698842  T
Q  220 gatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||    
T  12698841 gatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9509397 - 9509189
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  9509397 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 9509298  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9509297 aattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 9509199  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  9509198 atgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 16386160 - 16386369
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||  |   |||| ||   |||||||||||||    
T  16386160 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatg 16386259  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    || |  | |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16386260 aaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 16386359  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  16386360 atgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10589246 - 10589039
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |     ||||||||| |||    
T  10589246 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttga 10589147  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  10589146 attgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaaga 10589048  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  10589047 tgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26212217 - 26211995
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||       
T  26212217 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 26212118  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26212117 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtc 26212019  T
Q  208 taagatgttgaag-atgatgatgt 230  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  26212018 taagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 18456326 - 18456530
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||    
T  18456326 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 18456425  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  18456426 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18456524  T
Q  222 tgatga 227  Q
    ||||||    
T  18456525 tgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 17137953 - 17138177
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  17137953 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 17138051  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||    
T  17138052 attgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcat 17138149  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17138150 gagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38227671 - 38227481
Alignment:
Q  42 taagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgta--ttacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatata 139  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | |||||  ||| |||||| | | ||| ||   |||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  38227671 taagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgat-atgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatt 38227573  T
Q  140 attatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  38227572 attatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13647440 - 13647325
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 13647342  T
Q  214 gttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||| ||||||||||    
T  13647341 gttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12187243 - 12187019
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  12187243 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-taagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 12187145  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct----gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 196  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |     |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||    
T  12187144 attgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtaattgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgc 12187049  T
Q  197 atgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  12187048 atgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495402
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505419
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200786
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Original strand, 3564366 - 3564482
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564366 agatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 3564464  T
Q  210 agatgttgaagatgatga 227  Q
    || || ||||||||||||    
T  3564465 agttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  210 agatgttgaagatgatga 227  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996148
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  209 aagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280221
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 2280220  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  2280221 g 2280221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16213801 - 16213684
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213801 taagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16213704  T
Q  208 taagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||| || | ||||||||||    
T  16213703 taagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062077
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T
Q  215 ttgaagatgatga 227  Q
     | ||||||||||    
T  17062065 attaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15755008
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 456432 - 456321
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  456432 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 456335  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  456334 gattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11972607 - 11972496
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11972607 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11972510  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  11972509 gattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 14949173 - 14949284
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14949173 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14949270  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  14949271 gattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 15376764 - 15376875
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376764 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15376861  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  15376862 gattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16232631 - 16232520
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232631 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16232534  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  16232533 gattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410059
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  16410072 gattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18640383 - 18640272
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640383 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18640286  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  18640285 gattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 20385174 - 20385285
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20385174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20385271  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  20385272 gattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 21189646 - 21189757
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21189646 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21189743  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  21189744 gattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275187
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24275187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32125602 - 32125491
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32125505  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  32125504 gattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41523028 - 41522917
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41523028 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41522931  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  41522930 gattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41525490 - 41525379
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41525490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41525393  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  41525392 gattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 226
Target Start/End: Original strand, 11393338 - 11393448
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11393338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11393435  T
Q  214 gttgaagatgatg 226  Q
    | | |||||||||    
T  11393436 gattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18430827 - 18430709
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430827 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18430730  T
Q  210 agatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    || || | |||||||||||||    
T  18430729 agttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  210 agatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    || || | |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24704796 - 24704688
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24704796 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T
Q  217 gaagatgatga 227  Q
     ||||||||||    
T  24704698 taagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056347
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaag 16056347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24702349 - 24702238
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24702349 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24702252  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  24702251 gattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27216971 - 27216860
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27216971 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 27216874  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  27216873 gattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116509
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  44116522 gattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13869444 - 13869346
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  13869444 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 13869347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901342
Alignment:
Q  154 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 12901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044765
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14044765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354795
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 14354795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  134 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 20220238 - 20220293
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20220238 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatg 20220293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Original strand, 1868043 - 1868097
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868043 tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255892
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 15008547 - 15008604
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15008547 tatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 15008604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991196
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgatccaagatg 48991196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 211
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144139
Alignment:
Q  167 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15144139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 19486793 - 19486865
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  19486793 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Original strand, 18154885 - 18154943
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18154885 tgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 18154943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831373
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 38898423 - 38898523
Alignment:
Q  113 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38898423 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggttt 38898520  T
Q  209 aag 211  Q
    |||    
T  38898521 aag 38898523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177772
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtctatgatgt 9177772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24054698 - 24054618
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta 82  Q
    |||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24054698 gagacctatataaggagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatatgatgttta 24054618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17046692 - 17046487
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  17046692 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 17046593  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046592 attgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 17046493  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  17046492 tgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 14053215 - 14053422
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataag-atgttgatg 123  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  14053215 taatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatg 14053314  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 222  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14053315 aattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagat 14053414  T
Q  223 gatgatgt 230  Q
    ||||||||    
T  14053415 gatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12902978 - 12902757
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||       
T  12902978 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 12902879  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902878 taagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12902780  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  12902779 taagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7089098 - 7088877
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || |||||||||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||       
T  7089098 aagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatg 7088999  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088998 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7088900  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  7088899 taagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22636642 - 22636437
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  22636642 taatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22636544  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22636543 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 22636445  T
Q  221 atgatgat 228  Q
    ||||||||    
T  22636444 atgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44053037 - 44052829
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  44053037 taatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 44052938  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  44052937 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaag 44052839  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  44052838 atgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 23374272 - 23374473
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||   |||||||||| ||    
T  23374272 taatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttg 23374371  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23374372 aattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaag 23374470  T
Q  221 atg 223  Q
    |||    
T  23374471 atg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 16270149 - 16270356
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| |     
T  16270149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 16270248  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  16270249 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 16270347  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  16270348 tgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  49 tgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 147  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || |||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  148 atgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 16377436 - 16377639
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    ||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||    
T  16377436 taatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 16377535  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 222  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16377536 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T
Q  223 gatga 227  Q
     ||||    
T  16377635 aatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 16239883 - 16240090
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    ||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| | || ||||||| ||| | | ||| ||   |||||||||| ||    
T  16239883 taatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttg 16239982  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  16239983 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaaga 16240081  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  16240082 tgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 15121693 - 15121834
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  15121693 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaggctga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 15121791  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 144  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15121792 attgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096293
Alignment:
Q  154 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7893908 - 7893703
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||   |||||||||||  |||||| | | || ||||||||||| | | ||| ||   ||||||| || ||    
T  7893908 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 7893812  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  7893811 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaag 7893713  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  7893712 atgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  61 ttatgatgtgttataatgtttatgta--ttacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--g 156  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  ||| ||||  |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgtt-atgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttg 6899964  T
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14038856 - 14038653
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||    
T  14038856 taatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttg 14038757  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  14038756 acttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 14038658  T
Q  221 atgat 225  Q
    |||||    
T  14038657 atgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13956
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13952  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  13953 gatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 211
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288312
Alignment:
Q  114 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12288310  T
Q  210 ag 211  Q
    ||    
T  12288311 ag 12288312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  210 agatgttgaagatgatga 227  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243298
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52243298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  210 agatgttgaagatgatga 227  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 18215325 - 18215436
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215325 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18215422  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  18215423 gattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Original strand, 44928926 - 44929042
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||  ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928926 agatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44929024  T
Q  210 agatgttgaagatgatga 227  Q
    || || | ||||||||||    
T  44929025 agttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12469
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12358 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12455  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  12456 gattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 15118403 - 15118514
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118403 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15118500  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  15118501 gattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22353901 - 22353835
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22353901 ctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803427
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  23803414 gattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44615399 - 44615288
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44615399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44615302  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  44615301 gattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773249
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  44773236 gattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464030
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  51464017 gattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52312621 - 52312510
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312621 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 52312524  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  52312523 gattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198657
Alignment:
Q  165 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43198657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19242810 - 19242693
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19242810 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19242713  T
Q  214 gttgaagatgatgatgtcca 233  Q
    | | |||||||||| |||||    
T  19242712 gattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618336
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  214 gttgaagatgatgatg 229  Q
    | | |||||| |||||    
T  19618321 gattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190479
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 1837560 - 1837671
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1837560 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1837657  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  1837658 gattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3515118 - 3515007
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3515118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3515021  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  3515020 gattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 18239470 - 18239581
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18239470 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18239567  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  18239568 gattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 50222390 - 50222501
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222390 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50222487  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  50222488 gattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Original strand, 15355389 - 15355471
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355389 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 15355471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 8574871 - 8574969
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574871 agatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8574968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15367791 - 15367690
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15367791 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15367694  T
Q  227 atgt 230  Q
    ||||    
T  15367693 atgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15370119 - 15370018
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15370119 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15370022  T
Q  227 atgt 230  Q
    ||||    
T  15370021 atgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15371303 - 15371202
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15371303 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15371206  T
Q  227 atgt 230  Q
    ||||    
T  15371205 atgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15373584 - 15373483
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15373584 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15373487  T
Q  227 atgt 230  Q
    ||||    
T  15373486 atgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15402804 - 15402703
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  15402804 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttg 15402707  T
Q  227 atgt 230  Q
    ||||    
T  15402706 atgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 3096851 - 3096772
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttg 104  Q
    |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3096851 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610950
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 94
Target Start/End: Original strand, 17047989 - 17048055
Alignment:
Q  29 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgtattacttga 94  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Original strand, 43256161 - 43256227
Alignment:
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  43256161 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Original strand, 14970758 - 14970853
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14970758 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaag 14970853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 214
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815734
Alignment:
Q  179 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatg 21815734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16596720 - 16596686
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596720 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333292
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcagtctatgatgt 17333292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 965 - 1170
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  965 taatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 1064  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1065 attgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 1164  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  1165 tgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 51787 - 51582
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  51787 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgtatacataagatgttgatga 51688  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51687 attgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatga 51588  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  51587 tgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 16920546 - 16920751
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16920546 taatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatga 16920645  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16920646 atggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatga 16920745  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  16920746 tgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22831710 - 22831503
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccat--aagatgttgat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||  |||||||||||    
T  22831710 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgat 22831611  T
Q  123 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 222  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22831610 gaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagat 22831511  T
Q  223 gatgatgt 230  Q
    ||||||||    
T  22831510 gatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11185711 - 11185517
Alignment:
Q  24 gtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||||| |||||    
T  11185711 gtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatg 11185612  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185611 aattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  58 tgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt 157  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 20360873 - 20361081
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  20360873 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 20360972  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||     
T  20360973 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaa 20361071  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  20361072 atgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 20638196 - 20638404
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||  |||| ||    |||||||||||     
T  20638196 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgata 20638295  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  20638296 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaag 20638394  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  20638395 atgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29060748 - 29060540
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | || ||||||||||  |    ||||| | | |||||||| ||    
T  29060748 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 29060649  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  29060648 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaag 29060550  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  29060549 atgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16496365 - 16496244
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496365 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16496267  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  16496266 taagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 19303454 - 19303661
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgta--ttacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgat 122  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |    |||||   | |||||||| |    
T  19303454 taatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt-atgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgtt 19303552  T
Q  123 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19303553 gacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaag 19303651  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  19303652 atgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Original strand, 18409740 - 18409947
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |    || ||   | |||||||| ||    
T  18409740 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttg 18409839  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18409840 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 18409938  T
Q  221 atgatgatg 229  Q
    |||||||||    
T  18409939 atgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20076817 - 20076700
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076817 taagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20076722  T
Q  209 aagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  20076721 aagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20593981 - 20593773
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||   |   ||||||   | |||||||| ||    
T  20593981 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttg 20593882  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||    
T  20593881 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaag 20593783  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  20593782 atgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 25629268 - 25629476
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||    
T  25629268 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 25629367  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| |||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25629368 acttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 25629466  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  25629467 atgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 230
Target Start/End: Original strand, 17287713 - 17287917
Alignment:
Q  29 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaatt 127  Q
    |||||||||||  |||||| |||||  |||||||||| | ||  |||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   ||||||| || ||| ||    
T  17287713 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 17287812  T
Q  128 gaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  17287813 gcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 17287911  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  17287912 tgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 22780140 - 22780348
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta-tgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||   || ||||||||||| | | ||| ||   ||||||| || ||    
T  22780140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 22780239  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 22780338  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  22780339 atgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496592
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29809003
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25656727 - 25656629
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  25656727 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22782338 - 22782227
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22782241  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  22782240 gattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644339
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| |||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 25644341  T
Q  210 ag 211  Q
    ||    
T  25644340 ag 25644339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098616
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20109257 - 20109157
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| | ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20109257 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 20109158  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  20109157 g 20109157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561303
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1595660 - 1595549
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  1595660 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1595563  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  1595562 gattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12742428 - 12742317
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742428 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12742331  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  12742330 gattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 18334643 - 18334754
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334643 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18334740  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  18334741 gattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19005157 - 19005046
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19005060  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  19005059 gattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 19858970 - 19859081
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19858970 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19859067  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  19859068 gattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24422658 - 24422547
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422658 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24422561  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  24422560 gattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25754920 - 25754809
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754920 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25754823  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  25754822 gattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33861905 - 33861794
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33861905 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33861808  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  33861807 gattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33864389 - 33864278
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864389 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33864292  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  33864291 gattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  211 gatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676874
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T
Q  214 gttgaagatgatgatg 229  Q
    | | |||||| |||||    
T  30676859 gattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 2291231 - 2291342
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2291231 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2291328  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  2291329 gattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8055140 - 8055029
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8055140 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8055043  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  8055042 gattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 26924691 - 26924802
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26924691 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26924788  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  26924789 gattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18456830 - 18456732
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456830 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18456733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18461990 - 18461892
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461990 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18461893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668390
Alignment:
Q  165 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 207
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185919
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4185919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34963484 - 34963371
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  34963484 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 34963387  T
Q  214 gttgaagatgatgatg 229  Q
    | | |||||| |||||    
T  34963386 gattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688518
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaag 25688518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 1540962 - 1541073
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1540962 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagtt 1541059  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  1541060 gattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 224
Target Start/End: Original strand, 16448591 - 16448686
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  16448591 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 20556943 - 20557054
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20556943 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 20557040  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  20557041 gattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 230
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  183 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 214
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821949
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Original strand, 27415942 - 27416008
Alignment:
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27415942 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443062
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 33443062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 8227560 - 8227632
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  8227560 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186390
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtc 4186390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 164 - 215
Target Start/End: Original strand, 18199473 - 18199523
Alignment:
Q  164 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18199473 cctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 18199523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19873193 - 19873120
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19873193 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22432322 - 22432249
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22432322 tgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22432249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22438872 - 22438799
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22438872 tgttgtaaactgcctatgctgctatt-gttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 22438799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22439031 - 22438951
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta 82  Q
    |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22439031 gagatctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgattatgatgtgatataaagttta 22438951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 38801304 - 38801508
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||    
T  38801304 taatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatga 38801403  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38801404 attgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatga 38801502  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  38801503 tgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 27250629 - 27250850
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||       
T  27250629 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatt 27250728  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250729 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 27250827  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  27250828 taagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21026901 - 21026680
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||       
T  21026901 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 21026802  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026801 taagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21026703  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  21026702 taagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Original strand, 50210126 - 50210333
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttat-gtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||  |    ||||| | | |||||||| ||    
T  50210126 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 50210225  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  50210226 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 50210324  T
Q  221 atgatgatg 229  Q
    |||||||||    
T  50210325 atgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34509988 - 34509783
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||   |    |||||   |||||||||| ||    
T  34509988 taatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 34509889  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34509888 acttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 34509790  T
Q  221 atgatga 227  Q
    |||||||    
T  34509789 atgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  227 atgt 230  Q
    ||||    
T  20847272 atgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532269
Alignment:
Q  29 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaatt 127  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||  |    || ||   |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  128 gaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    | | | ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 22532275  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  22532274 tgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45575008
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 45574991  T
Q  214 gttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||| ||||||||||    
T  45574992 gttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295672
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 155
Target Start/End: Original strand, 22354485 - 22354616
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  22354485 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22354584  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt 155  Q
    ||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  22354585 aattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 48603744 - 48603652
Alignment:
Q  3 gacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgtattacttga 94  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  48603744 gacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 214
Target Start/End: Original strand, 35261097 - 35261183
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261097 atttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  211 gatgttgaagatgatgatgt 230  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758668
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaag 16758668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918623
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20918623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754064
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21754064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13988977 - 13988866
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13988977 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13988880  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  13988879 gattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 21923342 - 21923453
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923342 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21923439  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  21923440 gattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 23593786 - 23593897
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593786 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23593883  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  23593884 gattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31612428 - 31612313
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612428 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 31612331  T
Q  210 agatgttgaagatgatga 227  Q
    || || | ||||||||||    
T  31612330 agttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20135395 - 20135188
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||     ||| || | |||||||||| ||    
T  20135395 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttg 20135296  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtc---atgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||   ||| |||||||  ||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||    
T  20135295 aattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 20135197  T
Q  221 atgatgatg 229  Q
    ||| |||||    
T  20135196 atgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840766
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  214 gttgaagatgatgat 228  Q
    | | |||||| ||||    
T  21840780 gattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 21475138 - 21475249
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21475138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagtt 21475235  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  21475236 gattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 22468696 - 22468816
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| || |||||||||||||||   |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22468696 taagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 22468794  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    |||| || | |||||| |||||    
T  22468795 taagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 433125 - 433012
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433125 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 433030  T
Q  210 agatgttgaagatgatga 227  Q
    || || | ||||||||||    
T  433029 agttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 211
Target Start/End: Original strand, 22123131 - 22123214
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123131 atttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29776746 - 29776688
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  29776746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686627
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatg 50686627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgtcca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 16275430 - 16275526
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16275430 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 212
Target Start/End: Original strand, 16093933 - 16093988
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16093933 tatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaaga 16093988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064954
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtctatgatg 26064954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  179 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21714619 - 21714546
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  21714619 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33797639 - 33797573
Alignment:
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  33797639 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21714779 - 21714699
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta 82  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21714779 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttta 21714699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161720
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||| || ||| |||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 215
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21533978
Alignment:
Q  185 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 21533978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 5044 - 5246
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  5044 taatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 5143  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144 attgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 5243  T
Q  225 tga 227  Q
    |||    
T  5244 tga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 47200 - 46995
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47200 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatga 47101  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47100 attgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatga 47001  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  47000 tgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 10339 - 10544
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||    
T  10339 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttga 10438  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10439 attgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 10538  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  10539 tgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32272 - 32067
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  32272 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatga 32173  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32172 attgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 32074  T
Q  224 atgatgt 230  Q
    |||||||    
T  32073 atgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13703 - 13497
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13703 taatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 13604  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 222  Q
    || ||| ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13603 atcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagtt 13505  T
Q  223 gatgatgt 230  Q
    ||||||||    
T  13504 gatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 15378 - 15584
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  15378 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatatttttatacataagatgttgatga 15477  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagat 222  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15478 attgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagat 15576  T
Q  223 gatgatgt 230  Q
    ||||||||    
T  15577 gatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7519 - 7295
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| || || |||||   ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  7519 gagacctatataagaagttaactgcaatctatgaaactga-tatgagatgtttgcgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 7421  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||    
T  7420 attgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcat 7323  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||    
T  7322 gagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4919 - 4712
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  4919 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 4820  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4819 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaaga 4721  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  4720 tgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 143 - 13
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  143 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatga 44  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt 155  Q
    |||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  43 attgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 21292883 - 21293090
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||    
T  21292883 taatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatga 21292982  T
Q  125 a-ttgaat-ttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21292983 atttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaaga 21293081  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  21293082 tgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 23390409 - 23390617
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  23390409 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 23390508  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23390509 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 23390607  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  23390608 atgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37724133 - 37723910
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta--tgtattacttgaagaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  |  || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||  |    
T  37724133 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaatta 37724035  T
Q  99 aatttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
        || ||   | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37724034 tgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcat 37723935  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  37723934 gagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 8286760 - 8286964
Alignment:
Q  30 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattg 128  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||  ||||  |   ||||||||||||||||||    
T  8286760 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattg 8286859  T
Q  129 aatttgatataattatgtcatgctgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8286860 caattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 8286958  T
Q  225 tgatgt 230  Q
    ||||||    
T  8286959 tgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22075240 - 22075018
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| ||       
T  22075240 aagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatt 22075141  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075140 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtc 22075042  T
Q  208 taagatgttgaag-atgatgatgt 230  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  22075041 taagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24493776 - 24493569
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||    
T  24493776 taatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 24493677  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24493676 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 24493578  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  24493577 tgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Original strand, 21729064 - 21729185
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729064 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21729162  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21729163 taagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Original strand, 21808389 - 21808510
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808389 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21808487  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  21808488 taagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25421740 - 25421532
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   ||||||| || ||    
T  25421740 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttg 25421641  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25421640 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 25421542  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  25421541 atgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13025518 - 13025311
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgta--ttacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgat 122  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||| | | ||| ||   |||||||||| |    
T  13025518 taatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgtt-atgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgtt 13025420  T
Q  123 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    || ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  13025419 gacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 13025321  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  13025320 atgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13095702 - 13095495
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgta--ttacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgat 122  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||| | | ||| ||   |||||||||| |    
T  13095702 taatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgtt-atgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgtt 13095604  T
Q  123 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    || ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  13095603 gacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 13095505  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  13095504 atgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22032545 - 22032323
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  22032545 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 22032447  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgct--gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |   |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||    
T  22032446 attgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataatta--tcatgattgtttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcat 22032351  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||    
T  22032350 gagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24529428 - 24529223
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||   |    |||||   |||||||||| ||    
T  24529428 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 24529329  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24529328 acttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 24529230  T
Q  221 atgatga 227  Q
    |||||||    
T  24529229 atgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9078160 - 9077952
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||   |    |||||   | |||||||| ||    
T  9078160 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttg 9078061  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  9078060 acttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaag 9077962  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  9077961 atgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 18769894 - 18770118
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  18769894 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 18769992  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  ||||||||  || ||| |||||    
T  18769993 attgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcgaccaagttgcat 18770090  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||    
T  18770091 gagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314577
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25431602 - 25431414
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| |    |||||||||| ||    
T  25431602 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttg 25431503  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431502 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997655
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  227 atgt 230  Q
    ||||    
T  21997652 atgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  114 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  212 atgttgaagatgatgatgt 230  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  114 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  210 agatg 214  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23572308 - 23572178
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||| || || |||||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  23572308 gagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagttga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 23572210  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatt 132  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23572209 attgtatacataagatgttgatgaattgaatt 23572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1096668 - 1096467
Alignment:
Q  32 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattgaa 130  Q
    ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||| ||| |    
T  1096668 tgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgca 1096569  T
Q  131 tttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |   ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  1096568 tttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttga 1096470  T
Q  228 tgt 230  Q
    |||    
T  1096469 tgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Original strand, 21502156 - 21502277
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||  |||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21502156 taagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 21502255  T
Q  209 aagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||| || | |||||||||||||    
T  21502256 aagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  115 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  213 tgttgaagatgatg 226  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412187
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 22412204  T
Q  211 gatgttgaagatgatga 227  Q
    | || | ||||||||||    
T  22412203 gttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 264819 - 264930
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  264819 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 264916  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  264917 gattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 10732991 - 10733102
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10732991 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10733088  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  10733089 gattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20909123 - 20909012
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20909123 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20909026  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  20909025 gattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39363495 - 39363384
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39363398  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  39363397 gattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39245234 - 39245136
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  39245234 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 26012084 - 26012137
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012084 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26012137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902155
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20902155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22144121 - 22144065
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144121 atactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29330045 - 29329934
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29330045 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29329948  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  29329947 gattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 42245416 - 42245527
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  42245416 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 42245513  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  42245514 gattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Original strand, 11581263 - 11581361
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  11581263 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11581360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 36154834 - 36154942
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36154834 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 36154928  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  36154929 gattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 2154680 - 2154776
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  2154680 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 224
Target Start/End: Original strand, 18319098 - 18319193
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  18319098 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29346091 - 29345980
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29346091 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29345994  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  29345993 gattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Original strand, 10775740 - 10775838
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  10775740 atttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 10775837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18356433 - 18356367
Alignment:
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtt 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18356433 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 18356367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18418699 - 18418599
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctatgttgctgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  18418699 taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtct 18418602  T
Q  209 aag 211  Q
    |||    
T  18418601 aag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Original strand, 20910800 - 20910866
Alignment:
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  20910800 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31061166 - 31061068
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  31061166 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 95
Target Start/End: Original strand, 22107273 - 22107357
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgtattacttgaa 95  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||    
T  22107273 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29348564 - 29348453
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29348564 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29348467  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  29348466 gattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29351037 - 29350926
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29351037 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 29350940  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  29350939 gattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32027504 - 32027393
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |    
T  32027504 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagtt 32027407  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  32027406 gattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796434
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaagatgt 15796434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 214
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740750
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 26740750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 209
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732932
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26732932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40725925 - 40725853
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  40725925 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21873327 - 21873277
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 203  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873327 tgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26704148 - 26704090
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704148 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26704090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26973881 - 26973823
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26973881 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 26973823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469818
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    |||||||||||||||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatatt-aattaagctgcatgagtcggtctaagatgt 23469818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 23501235 - 23501273
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctg 39  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23501235 gagacctatataagaagttaattgcaatctgtgaagctg 23501273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 214
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989034
Alignment:
Q  184 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 27989034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21873476 - 21873400
Alignment:
Q  3 gacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt 80  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||    
T  21873476 gacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgtt 21873400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22412381 - 22412337
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgt 69  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22412381 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 22412337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 20698349 - 20698556
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  20698349 taatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatga 20698448  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    |||| | ||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  20698449 attgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20698547  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  20698548 tgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12399417 - 12399209
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |  ||||| ||   |||||||||| ||    
T  12399417 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttg 12399318  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12399317 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 12399219  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  12399218 atgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13442482 - 13442274
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  13442482 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 13442383  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  13442382 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 13442284  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  13442283 atgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17488064 - 17487856
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  17488064 taatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 17487965  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17487964 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 17487866  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  17487865 atgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17499546 - 17499338
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  17499546 taatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 17499447  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17499446 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 17499348  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  17499347 atgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14973062 - 14972854
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |    |||||  || |||||||| ||    
T  14973062 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttg 14972963  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14972962 atttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 14972864  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  14972863 atgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Original strand, 23083275 - 23083482
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||| | || |||||| |||| ||| ||| ||   |||||||||| |||    
T  23083275 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttga 23083374  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
     ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23083375 cttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23083473  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  23083474 tgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18438742 - 18438534
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||   |    |||||  | ||||||||| ||    
T  18438742 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttg 18438643  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  18438642 acttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 18438544  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  18438543 atgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26687095 - 26686887
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| | | | | ||   ||||||| || ||    
T  26687095 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttg 26686996  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  26686995 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaag 26686897  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  26686896 atgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Original strand, 14576746 - 14576934
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| ||    
T  14576746 taatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 14576845  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttg--tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14576846 acttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaag 14576934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 24153122 - 24153326
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| |||||| | | ||| ||   |||||||||| ||    
T  24153122 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 24153221  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  24153222 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24153320  T
Q  222 tgatga 227  Q
    ||||||    
T  24153321 tgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 856364 - 856140
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | || || |||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |    
T  856364 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctta-tatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagatta 856266  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  856265 attgtatacataagatgttgttgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcat 856168  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||    
T  856167 gagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 43841140 - 43840932
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   ||||||| || ||    
T  43841140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 43841041  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  43841040 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaag 43840942  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    || |||||||    
T  43840941 ataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210448
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Original strand, 25476299 - 25476506
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||| |  | ||||||||||  |    ||||| | | |||||||| |||    
T  25476299 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttga 25476398  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  25476399 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 25476497  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  25476498 tgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 230
Target Start/End: Original strand, 11424781 - 11424880
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  211 gatgttgaagatgatgatgt 230  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14179662 - 14179570
Alignment:
Q  3 gacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgtattacttga 94  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  14179662 gacctatataagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42386529 - 42386429
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42386529 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtcta 42386431  T
Q  210 ag 211  Q
    ||    
T  42386430 ag 42386429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572608
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 14572608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Original strand, 43550529 - 43550644
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 43550627  T
Q  214 gttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43550628 gttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307696
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32307696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  211 gatgttgaagatgatga 227  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 9707658 - 9707769
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707658 gttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9707755  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  9707756 gattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  114 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  212 atgttgaagatgatgatgt 230  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672626
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  17672639 gattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 29172634 - 29172745
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172634 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29172731  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  29172732 gattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  165 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27165319 - 27165250
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27165319 atactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  115 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  212 atgttgaagatgatga 227  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  162 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 40213634 - 40213838
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| |  |    |||||   | |||||||| ||    
T  40213634 taatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttg 40213733  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||    
T  40213734 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaag 40213831  T
Q  221 atgatga 227  Q
    |||||||    
T  40213832 atgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469296
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  6469283 gattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 7781398 - 7781509
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7781398 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7781495  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  7781496 gattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17463289 - 17463178
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463289 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17463192  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  17463191 gattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  134 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 28848662 - 28848773
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28848662 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28848759  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  28848760 gattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34159437 - 34159326
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159437 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34159340  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  34159339 gattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 45606958 - 45607069
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45606958 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 45607055  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  45607056 gattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55476602 - 55476491
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55476505  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  55476504 gattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 226
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21618563 - 21618465
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618563 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21618466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 227
Target Start/End: Original strand, 53301600 - 53301669
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53301600 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8899205 - 8899094
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8899205 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaatt 8899108  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  8899107 gattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 16454332 - 16454443
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16454332 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 16454429  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  16454430 gattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Original strand, 38961942 - 38962037
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961942 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 38962037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Original strand, 12119789 - 12119887
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  12119789 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 12119886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15412527 - 15412429
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  15412527 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15412430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Original strand, 53070704 - 53070802
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070704 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 53070801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606431
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataagatg 606431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 13151841 - 13151953
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13151841 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13151938  T
Q  213 tgttgaagatgatga 227  Q
    || | ||||||||||    
T  13151939 tgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 13154306 - 13154418
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  13154306 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagt 13154403  T
Q  213 tgttgaagatgatga 227  Q
    || | ||||||||||    
T  13154404 tgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13544136 - 13544024
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13544136 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13544039  T
Q  214 gttgaagatgatgat 228  Q
    | | |||||| ||||    
T  13544038 gattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgttgt------atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||      ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17737240  T
Q  224 atga 227  Q
    ||||    
T  17737239 atga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 10247774 - 10247885
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10247774 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 10247871  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  10247872 gattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12567671 - 12567576
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567671 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12567576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977515
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 225
Target Start/End: Original strand, 16282880 - 16282971
Alignment:
Q  135 atataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 225  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  16282880 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 17446706 - 17446816
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  17446706 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagtt 17446802  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  17446803 gattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 50242933 - 50242838
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242933 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 50242838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44494907 - 44494809
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  44494907 atttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 227
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274706
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 37642314 - 37642386
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919344
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgt 215  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgatgt 13919344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 226
Target Start/End: Original strand, 15878095 - 15878168
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  15878095 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16796755 - 16796685
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgtattacttga 94  Q
    |||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  16796755 taatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46822386 - 46822267
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| || |||||   ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46822386 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtc 46822288  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgat 228  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  46822287 taagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 226
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | ||||||| | |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5057 - 4849
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| || | |||||||||| ||    
T  5057 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttg 4958  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4957 aattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 4859  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  4858 atgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 949 - 1169
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccat 111  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||   |    
T  949 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 1048  T
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 1147  T
Q  209 aagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  1148 aagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 13211
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  13419 taatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 13320  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  13319 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 13221  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  13220 atgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 174996 - 174767
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta--tgtattacttgaagaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  || ||||||||||  |    
T  174996 gagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagct-attatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaatta 174898  T
Q  99 aatttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
        || ||   | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174897 tgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 174798  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  174797 gagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  160 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 124793 - 124679
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||   ||| | |||||||    
T  124793 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatg 124694  T
Q  124 aattgaatttgatat 138  Q
    ||||| | |||||||    
T  124693 aattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 136414 - 136474
Alignment:
Q  154 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136414 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 136474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 145122 - 145182
Alignment:
Q  154 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  145122 ttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 145182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Original strand, 167879 - 168099
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaatttgtatccat 111  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||   |    
T  167879 aagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatattt 167978  T
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167979 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 168077  T
Q  209 aagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  168078 aagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52121 - 51913
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   ||||||| || ||    
T  52121 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 52022  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52021 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 51923  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  51922 atgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3678 - 3470
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  3678 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 3579  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  3578 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 3480  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  3479 atgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 543 - 343
Alignment:
Q  32 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattgaa 130  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | | | ||   |||||||||| ||| ||  |    
T  543 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttcca 444  T
Q  131 tttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 228  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  443 attgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgat 345  T
Q  229 gt 230  Q
    ||    
T  344 gt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1851
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  2059 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 1960  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1959 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 1861  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  1860 atgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2160 - 1952
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||  |||| ||   |||||||||| ||    
T  2160 taatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 2061  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2060 aattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 1962  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||||||||    
T  1961 atgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 6039 - 6245
Alignment:
Q  30 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattg 128  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  6039 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 6138  T
Q  129 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
     | ||||||| || |||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6139 caattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6238  T
Q  224 atgatgt 230  Q
    |||||||    
T  6239 atgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 211
Target Start/End: Original strand, 24214 - 24405
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgat 122  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
T  24214 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat 24313  T
Q  123 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgt----tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||| | |||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24314 gaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33149 - 32942
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| |     
T  33149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 33050  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  33049 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 32951  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  32950 tgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38968 - 38761
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| |     
T  38968 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttt 38869  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  38868 atttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaaga 38770  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  38769 tgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9845 - 9744
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 228  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  9845 ttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 9748  T
Q  229 gtcc 232  Q
    ||||    
T  9747 gtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 230
Target Start/End: Original strand, 3068 - 3271
Alignment:
Q  29 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaatt 127  Q
    |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||| ||    
T  3068 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 3167  T
Q  128 gaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 225  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  3168 gcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3266  T
Q  226 gatgt 230  Q
    |||||    
T  3267 gatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21132 - 20910
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttt-atgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| ||  |    
T  21132 aagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatata 21033  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |   ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  21032 taagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtc 20933  T
Q  208 taagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||  |||||||||| ||||||    
T  20932 taagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27052 - 26840
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  27052 gagacatatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaata 26954  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  26953 tttgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttgatataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagatgcat 26856  T
Q  199 gagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||| | |||||||    
T  26855 gagtcgatataagatg 26840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  29 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttat-gtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaatt 127  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||  |    ||||| | | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  128 gaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  225 tgatg 229  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23098 - 22886
Alignment:
Q  17 gttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   |||||    
T  23098 gttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 22999  T
Q  116 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 212  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22998 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 22901  T
Q  213 tgttgaagatgatga 227  Q
    || | ||||||||||    
T  22900 tgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8650
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   ||||||| || ||    
T  8446 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 8545  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8546 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8641  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  8642 tgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39684 - 39479
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||    
T  39684 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 39585  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39584 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 39486  T
Q  222 tgatgat 228  Q
     ||||||    
T  39485 cgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 25 - 228
Target Start/End: Original strand, 75128 - 75333
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||    
T  75128 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 75227  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  75228 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 75326  T
Q  222 tgatgat 228  Q
     ||||||    
T  75327 cgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Original strand, 17128 - 17337
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttat-gtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||  |    ||||| | | |||||||| ||    
T  17128 taatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 17227  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 218  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  17228 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 17326  T
Q  219 agatgatgatg 229  Q
    |||||||||||    
T  17327 agatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 214
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79433
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 25978 - 26179
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttat-gtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||  |    ||||| | | ||| |||| ||    
T  25978 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttg 26077  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26078 aattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 26176  T
Q  221 atg 223  Q
    |||    
T  26177 atg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  210 agatgttgaagatgatga 227  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2105 - 1881
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| || || |||||   ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2105 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaata 2007  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||    
T  2006 attgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaaccaagttgcat 1909  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||    
T  1908 gagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33077
Alignment:
Q  55 tgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | | | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  154 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45928
Alignment:
Q  55 tgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | | | | ||   |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  154 tt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16188 - 16113
Alignment:
Q  154 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16188 ttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28536 - 28414
Alignment:
Q  110 ataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 206  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28536 ataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 28438  T
Q  207 ctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||| || |||||||||||||||    
T  28437 ctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11292
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1997
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  174 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26103 - 25896
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta-tgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   | |||||||| |     
T  26103 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt 26004  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  26003 acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25905  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    | |||||||    
T  25904 taatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40065 - 39858
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta-tgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   | |||||||| |     
T  40065 taatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt 39966  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||    
T  39965 acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaaga 39867  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  39866 tgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1190
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  211 gatgttgaagatgatg 226  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44570 - 44454
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt----gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44570 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 44473  T
Q  209 aagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  44472 aagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 226
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 94522 - 94411
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  94522 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 94425  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  94424 gattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Original strand, 17491 - 17586
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17491 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Original strand, 38371 - 38443
Alignment:
Q  3 gacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataa 76  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  38371 gacctatataagaagttagttgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataa 38443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 21696 - 21920
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  21696 gagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 21794  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  21795 attgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcat 21892  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||    
T  21893 gagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 29588 - 29812
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  29588 gagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 29686  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 198  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||    
T  29687 attgtatacataagatgttgatgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgct-attgttatttaaccaagttgcat 29784  T
Q  199 gagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||| | ||||||| | |||||||||    
T  29785 gagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12987 - 12857
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgtattacttgaagaaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  12987 gagacctatataagaagttaactgcaatttgtgaagct-aatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagatta 12889  T
Q  101 tttgtatccataagatgttgatgaattgaatt 132  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12888 attgtatacataagatgttgatgaattgaatt 12857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11305
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 11305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Original strand, 339863 - 340065
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||||  |    ||||| | | |||||||| ||    
T  339863 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 339962  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  339963 acttga-tttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaaga 340059  T
Q  222 tgatga 227  Q
    ||||||    
T  340060 tgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 158501 - 158612
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  158501 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 158598  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  158599 gattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 71419 - 71353
Alignment:
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  71419 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34123
Alignment:
Q  153 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34200 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13141
Alignment:
Q  12 aagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatcca 110  Q
    |||| |||| || ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||       
T  13313 aagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatt 13214  T
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgt 180  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  13213 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  |||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 230
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  115 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  212 atgttgaagatgatgatgt 230  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 16516 - 16721
Alignment:
Q  28 tctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaat 126  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |    ||||| | | ||||| || ||| |    
T  16516 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgact 16615  T
Q  127 tgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatg 223  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16616 tccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatg 16714  T
Q  224 atgatgt 230  Q
    |||||||    
T  16715 atgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8682 - 8479
Alignment:
Q  26 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatga 124  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||    ||||||| | || ||||||||||| | | ||| ||   |||||||||| |||    
T  8682 aatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttga 8587  T
Q  125 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
     ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8586 cttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8488  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  8487 tgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8485
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8585 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8486  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  8485 g 8485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 40120 - 39913
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    ||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| | | |   ||   |||||||||  ||    
T  40120 taatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattg 40021  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaga 221  Q
    |  || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  40020 acatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaaga 39922  T
Q  222 tgatgatgt 230  Q
    |||||||||    
T  39921 tgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19990
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgtata--ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtct 19984  T
Q  209 aagatg 214  Q
    ||||||    
T  19985 aagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 226
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  211 gatgttgaagatgatg 226  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4715 - 4508
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||    
T  4715 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 4616  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  4615 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaa 4518  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||    
T  4517 atgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12297 - 12090
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||    
T  12297 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 12198  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  12197 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaa 12100  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||    
T  12099 atgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22249 - 22042
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatg 123  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||  |    |||||   | |||||||| ||    
T  22249 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 22150  T
Q  124 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 220  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  22149 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaa 22052  T
Q  221 atgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||    
T  22051 atgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15664
Alignment:
Q  154 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178913
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 178913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6826 - 6669
Alignment:
Q  17 gttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataaga 115  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||  |||| ||   |||||    
T  6826 gttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaaga 6727  T
Q  116 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgt 170  Q
    ||||| |||||||   ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  6726 tgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  211 gatgttgaagatgatgatgt 230  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  114 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  212 atgttgaagatgatgatgt 230  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2677
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Original strand, 16149 - 16202
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16149 atactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160688
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Original strand, 85644 - 85742
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  85644 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatg 85741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 501195 - 501100
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501195 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 501100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 226
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 230
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  211 gatgttgaagatgatgatgt 230  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 82183 - 82072
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  82183 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 82086  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  82085 gattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1101
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5662
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaag 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8176
Alignment:
Q  154 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  211 gatgttgaagatgatga 227  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  211 gatgttgaagatgatga 227  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78338
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatg 78338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129924
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 129925  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  129924 g 129924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60821
Alignment:
Q  154 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatg 60821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 214
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53654
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaa 53650  T
Q  211 gatg 214  Q
    ||||    
T  53651 gatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 132722 - 132662
Alignment:
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  132722 tatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 136791 - 136680
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  136791 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 136694  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  136693 gattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 139260 - 139149
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  139260 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 139163  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  139162 gattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 144198 - 144087
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  144198 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 144101  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  144100 gattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62217
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaag 62217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 134322 - 134211
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  134322 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgtt 134225  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  134224 gattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 141729 - 141618
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  141729 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 141632  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  141631 gattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  114 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  212 atgttgaagatgatgatgt 230  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13503 - 13392
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13503 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13406  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  13405 gattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20858 - 20747
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20858 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20761  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  20760 gattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37932 - 37821
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37932 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 37835  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  37834 gattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25125
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 214
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13843
Alignment:
Q  164 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 13843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10546
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaa 10547  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  10546 g 10546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32608 - 32555
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32608 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51987
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 51987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11464
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10772
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  214 gttgaagatgatgat 228  Q
    | | |||||| ||||    
T  10786 gattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32162 - 32102
Alignment:
Q  166 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  32162 tatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 158 - 230
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38377
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Original strand, 20430 - 20527
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20430 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 128871 - 128751
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  || | |  |   | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  128871 taagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtct 128773  T
Q  209 aagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||  || | |||||||||||||    
T  128772 aatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4710
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 4710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 230
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  163 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 170
Target Start/End: Original strand, 983 - 1021
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgt 170  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  983 ttgatattattatgccatgctgttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  134 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 230  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 211
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2275
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaag 2275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14058 - 13947
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14058 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagtt 13961  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  13960 gattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16784
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16895 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  16797 gattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4545
Alignment:
Q  48 atgttgttgttgattatgatgtgttataatgt-ttatgtattacttgaagaaaatttgtatccataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 146  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |  || ||   |||||||||| ||||||  ||||||||| || || |    
T  4709 atgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatat 4610  T
Q  147 catgctgttgt---atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    | ||||| |||   |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4609 cttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38339
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20212 - 20132
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta 82  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||  || || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20212 gagacctatataagaagttaactgcaacctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttta 20132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8166
Alignment:
Q  111 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 206  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||  |||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggt 8158  T
Q  207 ctaagatg 214  Q
    ||| ||||    
T  8159 ctatgatg 8166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 226
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  158 atactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 27751 - 27851
Alignment:
Q  113 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 210  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27751 agatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 27850  T
Q  211 g 211  Q
    |    
T  27851 g 27851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3689 - 3644
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtg 70  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3689 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtg 3644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7753 - 7708
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtg 70  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7753 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtg 7708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 30028 - 29948
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30028 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40511 - 40400
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  40511 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 40414  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  40413 gattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 97076 - 97021
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 97021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 106354 - 106299
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatg 106299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4312 - 4214
Alignment:
Q  130 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  4312 atttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11979
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1122 - 1052
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgtattacttga 94  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  1122 taatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Original strand, 15417 - 15483
Alignment:
Q  112 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctatgttgctgtt 177  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  15417 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4300
Alignment:
Q  132 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  4393 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 229
Target Start/End: Original strand, 12300 - 12413
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||   |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12300 gttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 12397  T
Q  214 gttgaagatgatgatg 229  Q
    | | |||||| |||||    
T  12398 gattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 267733 - 267676
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  267733 tatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 267676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9300 - 9241
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  9300 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 227
Target Start/End: Original strand, 161136 - 161252
Alignment:
Q  113 agatgttgat-gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 208  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||  ||||   ||||||||| | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  161136 agatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtct 161233  T
Q  209 aagatgttgaagatgatga 227  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  161234 aagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 106
Alignment:
Q  168 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24073 - 23995
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt 80  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  ||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||||    
T  24073 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttaagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt 23995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23916 - 23843
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  23916 tgttgtaatctgcctatggtgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Original strand, 103679 - 103733
Alignment:
Q  157 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 211  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  103679 tatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaag 103733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12169 - 12064
Alignment:
Q  117 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 213  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12169 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgttt-------aactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12078  T
Q  214 gttgaagatgatga 227  Q
    | | ||||||||||    
T  12077 gattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36687 - 36607
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgttta 82  Q
    ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36687 gagacctatttaagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttta 36607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 8847 - 8915
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtg 70  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  || || |||||| |||||| |||||||||    
T  8847 gagacctatataagaagttaactgtaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttgatgttgaatatgatgtg 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 224
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  177 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatga 224  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 28034 - 27967
Alignment:
Q  29 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt-tatgtattacttgaa 95  Q
    |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28034 ctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaa 27967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  159 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 69867 - 69794
Alignment:
Q  152 tgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||  ||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  69867 tgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 70025 - 69949
Alignment:
Q  1 gagacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg 78  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  70025 gagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatg 69949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 214
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1903
Alignment:
Q  185 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg 1903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 226
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  161 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 226  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 80
Target Start/End: Original strand, 16241 - 16317
Alignment:
Q  3 gacctatataagaagttatttgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtt 80  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || |||||  |||||| ||||||||| |||||||||    
T  16241 gacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctg-ttatgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgtt 16317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 10371 - 10326
Alignment:
Q  25 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtg 70  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10371 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtg 10326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University