View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3654_low_10 (Length: 303)

Name: NF3654_low_10
Description: NF3654
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3654_low_10
NF3654_low_10
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (10-262)||(25175563-25175815)
chr6 (10-262)||(27653983-27654235)
chr6 (10-262)||(16825752-16826006)
chr6 (14-303)||(14626089-14626377)
chr6 (21-303)||(23153458-23153741)
chr6 (14-262)||(1650105-1650352)
chr6 (21-274)||(1657748-1657999)
chr6 (10-274)||(35009439-35009702)
chr6 (21-274)||(15862484-15862734)
chr6 (78-274)||(29665941-29666137)
chr6 (189-274)||(27751603-27751688)
chr6 (174-258)||(29605612-29605696)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (10-262)||(25426628-25426880)
chr5 (10-262)||(12374-12626)
chr5 (10-262)||(19499899-19500151)
chr5 (10-262)||(22366481-22366733)
chr5 (10-237)||(18778017-18778244)
chr5 (10-262)||(21073595-21073847)
chr5 (10-237)||(43443420-43443647)
chr5 (10-237)||(4200010-4200237)
chr5 (10-300)||(23506965-23507254)
chr5 (10-237)||(27009841-27010068)
chr5 (10-303)||(27182516-27182810)
chr5 (10-301)||(22053804-22054096)
chr5 (10-301)||(18531038-18531330)
chr5 (62-262)||(29188284-29188483)
chr5 (21-274)||(34939289-34939540)
chr5 (127-274)||(20623085-20623232)
chr5 (127-274)||(21233528-21233675)
chr5 (128-272)||(25900408-25900552)
chr5 (127-274)||(16536313-16536460)
chr5 (127-274)||(37052860-37053007)
chr5 (14-54)||(29190482-29190522)
chr5 (10-51)||(17471803-17471844)
chr5 (174-258)||(29918127-29918212)
chr5 (178-267)||(32950862-32950951)
chr5 (176-251)||(5450850-5450926)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (10-262)||(19886661-19886913)
chr2 (15-303)||(462743-463030)
chr2 (10-274)||(17396653-17396916)
chr2 (10-303)||(8891242-8891536)
chr2 (10-300)||(19794676-19794967)
chr2 (10-303)||(20627284-20627576)
chr2 (10-303)||(36982410-36982704)
chr2 (10-303)||(43642926-43643220)
chr2 (10-301)||(24341360-24341652)
chr2 (10-274)||(25265390-25265653)
chr2 (10-224)||(7507894-7508107)
chr2 (127-274)||(19689401-19689548)
chr2 (127-274)||(23820187-23820334)
chr2 (127-274)||(14906440-14906587)
chr2 (127-274)||(20015127-20015274)
chr2 (176-258)||(24884850-24884933)
chr2 (176-257)||(68156-68238)
[»] chr4 (18 HSPs)
chr4 (10-262)||(47357654-47357906)
chr4 (10-237)||(10644219-10644446)
chr4 (18-274)||(13048221-13048477)
chr4 (10-303)||(13246430-13246724)
chr4 (10-303)||(54118213-54118507)
chr4 (110-303)||(121989-122181)
chr4 (10-301)||(15675060-15675352)
chr4 (10-274)||(26680201-26680463)
chr4 (10-247)||(31115629-31115865)
chr4 (78-301)||(10104221-10104445)
chr4 (127-274)||(10488678-10488825)
chr4 (127-274)||(16327926-16328073)
chr4 (10-107)||(111395-111492)
chr4 (211-301)||(33240900-33240992)
chr4 (78-258)||(40885570-40885749)
chr4 (10-54)||(10104450-10104494)
chr4 (176-257)||(15044992-15045074)
chr4 (176-251)||(15109356-15109432)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (10-262)||(10989410-10989661)
chr7 (10-237)||(2437457-2437684)
chr7 (10-237)||(13911049-13911277)
chr7 (10-237)||(13572676-13572903)
chr7 (16-274)||(25292338-25292595)
chr7 (10-267)||(18253842-18254098)
chr7 (12-300)||(16211768-16212055)
chr7 (10-303)||(13036983-13037277)
chr7 (10-303)||(3059966-3060258)
chr7 (15-303)||(11580707-11580997)
chr7 (10-300)||(36052667-36052955)
chr7 (10-274)||(47481031-47481294)
chr7 (10-237)||(16478987-16479213)
chr7 (10-274)||(7293017-7293279)
chr7 (10-273)||(13321014-13321278)
chr7 (127-274)||(11516343-11516490)
chr7 (127-274)||(15441564-15441711)
chr7 (127-274)||(30262129-30262276)
chr7 (153-302)||(295936-296087)
chr7 (176-257)||(13377693-13377775)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (10-262)||(30120722-30120974)
chr8 (10-200)||(222753-222943)
chr8 (10-200)||(736376-736566)
chr8 (10-200)||(860271-860461)
chr8 (10-262)||(16674392-16674644)
chr8 (10-237)||(21844597-21844824)
chr8 (10-237)||(21851990-21852217)
chr8 (9-303)||(16193687-16193980)
chr8 (10-300)||(43373440-43373731)
chr8 (21-303)||(24928762-24929043)
chr8 (14-262)||(6774258-6774505)
chr8 (14-262)||(24548986-24549233)
chr8 (10-303)||(16404944-16405235)
chr8 (10-274)||(22907214-22907476)
chr8 (21-274)||(17345581-17345832)
chr8 (127-274)||(5238203-5238350)
chr8 (127-274)||(24661248-24661395)
chr8 (127-274)||(43685662-43685809)
chr8 (138-200)||(691908-691970)
chr8 (217-258)||(23226076-23226117)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (10-262)||(55316219-55316471)
chr3 (10-262)||(41270075-41270327)
chr3 (10-303)||(14842532-14842824)
chr3 (10-237)||(16821139-16821366)
chr3 (10-274)||(13975722-13975985)
chr3 (10-274)||(45860805-45861068)
chr3 (9-284)||(51158008-51158282)
chr3 (10-300)||(12030121-12030410)
chr3 (10-300)||(15858996-15859287)
chr3 (10-274)||(13954890-13955153)
chr3 (10-300)||(2049810-2050099)
chr3 (21-303)||(13838905-13839186)
chr3 (10-267)||(15936634-15936890)
chr3 (13-267)||(15938476-15938729)
chr3 (14-262)||(15614838-15615085)
chr3 (10-303)||(16744086-16744377)
chr3 (10-274)||(17912483-17912744)
chr3 (127-274)||(2449238-2449385)
chr3 (211-303)||(19231981-19232075)
chr3 (228-301)||(19260796-19260869)
chr3 (10-123)||(47984650-47984763)
chr3 (10-123)||(47993937-47994050)
chr3 (10-123)||(48003224-48003337)
chr3 (10-123)||(48012510-48012623)
chr3 (10-51)||(15468555-15468596)
chr3 (178-267)||(11986173-11986262)
chr3 (217-258)||(14080715-14080756)
chr3 (10-51)||(22275209-22275250)
chr3 (174-258)||(4145814-4145898)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (10-237)||(36093-36320)
scaffold0023 (10-303)||(48598-48890)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (10-237)||(18601143-18601370)
chr1 (10-262)||(5072388-5072640)
chr1 (10-303)||(20931345-20931637)
chr1 (10-303)||(41394222-41394514)
chr1 (10-303)||(20913037-20913322)
chr1 (10-303)||(20893595-20893889)
chr1 (10-224)||(22227809-22228022)
chr1 (10-224)||(22232506-22232719)
chr1 (10-303)||(20445679-20445973)
chr1 (10-303)||(37844419-37844714)
chr1 (10-303)||(20531444-20531738)
chr1 (14-237)||(2116258-2116481)
chr1 (76-237)||(45051489-45051649)
chr1 (127-274)||(51452608-51452755)
chr1 (14-54)||(45051446-45051486)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (10-237)||(42997-43224)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (12-303)||(3553-3843)
scaffold0266 (10-303)||(1124-1416)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-303)||(6035-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (10-303)||(927-1218)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (10-237)||(31700-31928)
scaffold0008 (10-303)||(128140-128431)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (34-267)||(5552-5785)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (10-237)||(35-262)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (10-300)||(12115-12403)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (10-303)||(8878-9170)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (10-206)||(64584-64780)
scaffold0026 (10-267)||(107747-108003)
scaffold0026 (217-259)||(89863-89905)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-267)||(48187-48443)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (10-300)||(148721-149012)
scaffold0025 (10-273)||(8849-9111)
scaffold0025 (254-303)||(146844-146893)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (10-303)||(19206-19500)
scaffold0195 (10-274)||(21290-21553)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (10-237)||(21141-21367)
scaffold0139 (10-237)||(14086-14312)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (10-303)||(123133-123427)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-303)||(5031-5324)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (21-303)||(171916-172197)
scaffold0001 (21-303)||(177619-177900)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (14-303)||(41733-42021)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (10-300)||(36885-37176)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (10-303)||(26385-26678)
scaffold0162 (127-274)||(8180-8327)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-303)||(247411-247694)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-224)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (10-224)||(3722-3936)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (14-237)||(9374-9596)
scaffold0215 (14-237)||(16272-16494)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (16-303)||(272031-272317)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (116-262)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (10-274)||(534-797)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (128-303)||(51153-51328)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (10-274)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (10-274)||(37066-37328)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (10-274)||(41648-41911)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (10-116)||(9-115)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (14-263)||(2966-3215)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (128-303)||(89423-89600)
scaffold0028 (223-303)||(107753-107835)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (10-274)||(13506-13769)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-116)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (106-237)||(13350-13480)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (127-274)||(26911-27058)
scaffold0141 (127-267)||(22656-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (127-274)||(1582-1729)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (10-107)||(9382-9479)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (181-274)||(3360-3453)
scaffold0361 (12-66)||(3210-3264)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (178-267)||(56106-56195)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (176-258)||(8174-8257)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (176-257)||(2317-2399)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (178-224)||(45198-45244)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175815
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27653983
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825752
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 207  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  208 taacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626089
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaattcaaacaacatttgagaatt 14626089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153741
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 23153741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650105
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||| ||| |||||    
T  1650153 caattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca 1650105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657748
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1657801 tgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009439
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862734
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  15862681 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 274
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666137
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  177 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||  || |||||| || || | |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatccat 29666137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 274
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751688
Alignment:
Q  189 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 29605612 - 29605696
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||  ||||||||||| |||||||| || |||| || |||||| |||||    
T  29605612 tatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatcactaattcatgcattcaaacatatcaccataattagagcacgaattt 29605696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426880
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12626
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500151
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366481
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778017
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18778017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073595
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443420
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacataaca 43443420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200010
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacataaca 4200010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507254
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaa 23507254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010068
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 27010068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182516
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27182611 tcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 27182516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053804
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 301  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||    
T  22053897 tcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaa 22053804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531038
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-attcatacaacatttgaaaa 301  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || ||| |||||||| |||||||||||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaacattcataccacatttgaaaa 18531038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188284
Alignment:
Q  62 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat 161  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  162 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagc 261  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| ||| ||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagc 29188285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939540
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  34939487 tgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623232
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20623185 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233528
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21233575 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900408
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  228 aaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatcc 272  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25900452 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536460
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16536413 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37053007
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37052960 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 17471844 - 17471803
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17471844 catcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcat 17471803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Original strand, 29918127 - 29918212
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaattt 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  || ||| || |||||| |||||| || |||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  29918127 tatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgtattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 29918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Original strand, 32950862 - 32950951
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| |||| || || || |||||| || |||| |||||| |||||| |||||||    
T  32950862 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5450926 - 5450850
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagca 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  5450926 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagca 5450850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886661
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Original strand, 462743 - 463030
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  115 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  215 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 463030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396653
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891536
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  8891441 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 8891536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794676
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  19794768 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 19794676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627284
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||||||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataatcataattcatacaatatttgaaaatt 20627284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982410
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  36982505 tcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 36982410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642926
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 43642926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341360
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 301  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||  |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||    
T  24341453 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaa 24341360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265390
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- 7508009  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  209 aacatcaattcatgca 224  Q
    | ||||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689401
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19689448 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820334
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23820287 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906440
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14906487 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015274
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20015227 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 24884850 - 24884933
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattc-atgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaattt 258  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || |||||| |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  24884850 tgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcaccaattccatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 24884933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 68156 - 68238
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  68156 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 68238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 18)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357906
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644446
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 10644446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048221
Alignment:
Q  18 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  118 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 217  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  218 tcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246724
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13246629 tcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 13246724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118213
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 54118213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 303
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122181
Alignment:
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 122181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 10 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675060
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 301  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaa 15675060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680463
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26680399 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 247
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115865
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttgg 247  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  31115828 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 78 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104221
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--ta 275  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaatta 10104247  T
Q  276 atcaaaattcatacaacatttgaaaa 301  Q
       ||||||||||| |||||||||||    
T  10104246 tgaaaaattcataccacatttgaaaa 10104221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488825
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10488778 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327926
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16327973 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111492
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 301
Target Start/End: Original strand, 33240900 - 33240992
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| |||||||||||    
T  33240900 catcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaa 33240992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885570
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || ||||||  || |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaattt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 15044992 - 15045074
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  15044992 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 15045074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15109432 - 15109356
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagca 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  15109432 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagca 15109356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989661
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437684
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacataaca 2437684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911049
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 13911049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572903
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 13572903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292338
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25292396 attcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253842
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 300
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16212055
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataagcaaaattcatacaacatttgaaa 16212055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13036983
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||      
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 13036983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060258
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||| ||||||||||| |||  | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatataacatttgaaaatt 3060258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580707
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  115 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  215 aattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat---caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  11580798 aattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattatgcaaaaaattcatacaacatttgaaaatt 11580707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052955
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || |||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  36052863 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaa 36052955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481031
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478987
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 16478987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293279
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
      || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7293215 ttattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321278
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  110 taacaa-caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa 206  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
Q  207 ctaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca 273  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516490
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11516443 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441564
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15441611 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262129
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30262176 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 295936
Alignment:
Q  153 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcac 252  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| |||||||||||| |  | || || |||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacac 295988  T
Q  253 aaatttagcaacaatcatccataat-caaaa-ttcatacaacatttgaaaat 302  Q
     |||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||  |||||||||    
T  295987 gaatttagcaacaattattcattatgcaaaatttcatacaaagtttgaaaat 295936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Original strand, 13377693 - 13377775
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  13377693 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 13377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120974
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674392
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844597
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21844597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851990
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 21851990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193687
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16193781 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaattcatacaatatttgaaaatt 16193687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373440
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  43373532 tcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattatacaaaaattcatacaacatttgaaa 43373440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928762
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24928844 tgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 24928762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774258
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| ||| |||||    
T  6774306 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549233
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||  |||||| ||| |||||    
T  24549185 caattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16404944
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 16404944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907214
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22907278 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 274
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345832
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  17345779 tgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238350
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5238303 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661248
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24661295 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685809
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43685762 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  138 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316471
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270327
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842532
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     | |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14842625 tcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatt 14842532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821366
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacataaca 16821366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975722
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861068
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158008
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 284  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51158083 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaatt 51158008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030121
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaagtcatacaacatttgaaa 12030121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15858996
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaa 15858996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954890
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     || |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050099
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2050009 tcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattgatacaacatttgaaa 2050099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839186
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 13839186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936634
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938476
Alignment:
Q  13 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||  | |||||||||||  |||||| ||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615085
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||| |||||    
T  15615037 caattcatgcatacaaatataacaccacagtaagagcacaaatctagca 15615085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744086
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
      ||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744179 ttatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 16744086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912483
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17912644 caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17912546 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatca-agttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449238
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2449285 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 303
Target Start/End: Original strand, 19231981 - 19232075
Alignment:
Q  211 catcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19231981 catcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 19232075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260796
Alignment:
Q  228 aaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaa 301  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaa 19260796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468555
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcat 15468555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11986262 - 11986173
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || ||| || ||||||| || || |||||| || |||| |||||| |||||| |||||||    
T  11986262 aacatgtaatttcaaccacaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 258
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 51
Target Start/End: Original strand, 22275209 - 22275250
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcat 51  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22275209 catcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcat 22275250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4145898 - 4145814
Alignment:
Q  174 tatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaattt 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||| || || ||||||||| || |||||||| || |||| |||||| || |||||    
T  4145898 tatgaacatgtaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaattcatgtattcaaacatatcaccataattggagtacgaattt 4145814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36320
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacataaca 36320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48890
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 48890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601143
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacataaca 18601143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072388
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931637
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaacttcatacaacaattgaaaatt 20931637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394514
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||      
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394421 tcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 41394514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913322
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       |||    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat 20913129  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaagcaaaattcatacaacaattgaaaatt 20913322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893595
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||      
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20893690 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 20893595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
Q  210 acatcaattcatgca 224  Q
     ||||||||||||||    
T  22228008 tcatcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
Q  210 acatcaattcatgca 224  Q
     ||||||||||||||    
T  22232705 tcatcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445973
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 20445973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844419
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  37844515 atcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 37844419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531738
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||  | || | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20531643 tcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 20531738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116481
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacataaca 2116481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 76 - 237
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051649
Alignment:
Q  76 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 175  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaaca 45051649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452755
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  51452708 caaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Original strand, 45051446 - 45051486
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaa 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45051446 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaa 45051486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43224
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacataaca 43224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3553
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataatcaaaattcatacaacttttgaaaatt 3553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1416
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
      |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1323 ttatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagaaaaattcatacaacatttgaaaatt 1416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6035
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctcaa-t 6228  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatt 6035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 927
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||||| |    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctcaa-t 1120  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataatcacaattcatacaacatttgagaatt 927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31700
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacataaca 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128140
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-t 128333  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  128233 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacttttgaaaatt 128140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 267
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5785
Alignment:
Q  34 acccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  134 cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T
Q  234 aacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5752 aacatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Original strand, 35 - 262
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacataaca 262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12403
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |    
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt 12214  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
      |||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12215 --acaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaa-ttcatacaacatttgaaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataatcaaaatttcatacagcatttgaaa 12403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9170
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataagcaaaattcgtacaacttttgaaaatt 9170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64584
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 64584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 107747 - 108003
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
Q  217 ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaattta 259  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 267
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48443
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48386 tcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Original strand, 148721 - 149012
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||   ||||||||||||||||||||||    
T  148920 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 149012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 273
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9111
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatcca 273  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9048 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatcca 9111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 303
Target Start/End: Original strand, 146844 - 146893
Alignment:
Q  254 aatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  146844 aatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 146893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19500
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 19500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21553
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21141
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacataaca 21141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14086
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacataaca 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123133
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgcaaatt 123133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5031
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||| ||||||||||||| |  || |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5125 tcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatt 5031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172197
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  172115 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatt 172197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177900
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    | |||||||||||| || || |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  177818 tccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataatcaaaatttatacaacatttgaaaatt 177900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 303
Target Start/End: Original strand, 41733 - 42021
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 42021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36885
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||      
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 300  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||    
T  36977 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaa 36885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26385
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat-caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
     |||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26479 tcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattatgaaaaattcatacaacatttgaaaatt 26385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8180
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8227 caaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247411
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  221 tgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 247411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  210 acatcaattcatgca 224  Q
     ||||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
Q  209 aacatcaattcatgca 224  Q
    | ||||||||||||||    
T  3921 atcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9374
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9397 caattcatgcatacaaacataaca 9374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16272
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  214 caattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16295 caattcatgcatacaaacataaca 16272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 303
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272317
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    |||||| |||||||||||| ||  | |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  272230 attcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataatcaaaatttatacaatatttgaaaatt 272317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 116 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1304
Alignment:
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  216 attcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagca 262  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||   |||||| |||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 1304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 534
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||      
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51153
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  228 aaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    ||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51228 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatt 51153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34460
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  34525 atcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37066
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | |||||      
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
      ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37130 ttatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41911
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3215
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaa 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||   |||||| ||||||||||    
T  3165 tcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89423
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  228 aaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    ||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  89500 aaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatt 89423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107753
Alignment:
Q  223 catacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaatt 303  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt 107753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 274
Target Start/End: Original strand, 13506 - 13769
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  13506 catcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 13605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | ||||||| |  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13606 caacaacaacatagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13704  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13705 tcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13350
Alignment:
Q  106 aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 205  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
Q  206 actaacatcaattcatgcatacaaacataaca 237  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13381 attatcatcaattcatgcatacaaacataaca 13350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27058
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27011 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 267
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22796
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22756 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1582
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  227 caaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1629 caaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9479
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 274
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3453
Alignment:
Q  181 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaatcatccat 274  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 3210 - 3264
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaa 66  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| || |||||    
T  3210 tcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaatcacaacatcaa 3264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 56106
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatttagcaacaat 267  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||| ||||||| || || |||||| || |||| |||||| |||||| |||||||    
T  56195 aacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 56106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 258
Target Start/End: Original strand, 8174 - 8257
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatt-catgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaattt 258  Q
    |||||||| || |||||||||||  || ||| || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  8174 tgaacatgcaaattcaccaacaacaattcaattatcatcaatttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2399 - 2317
Alignment:
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaa-ttcatgcatacaaacataacaacatagttggagcacaaatt 257  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || ||| || || ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  2399 tgaacatgaaatttcaccaacaacaattcaattatcaacaacttcatgcattcaaacataacatcataattggagcacgaatt 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University