View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3654_low_6 (Length: 337)

Name: NF3654_low_6
Description: NF3654
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3654_low_6
NF3654_low_6
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (20-316)||(18107137-18107433)
chr7 (18-320)||(616763-617065)
chr7 (20-316)||(15067638-15067934)
chr7 (16-320)||(30788284-30788588)
chr7 (20-316)||(42501156-42501452)
chr7 (16-320)||(43622147-43622451)
chr7 (16-320)||(45765124-45765428)
chr7 (20-316)||(47062630-47062926)
chr7 (20-316)||(10707697-10707994)
chr7 (20-316)||(8401250-8401546)
chr7 (50-316)||(12116418-12116684)
chr7 (93-310)||(43826698-43826915)
chr7 (20-54)||(12113572-12113606)
chr7 (20-160)||(3762832-3762971)
chr7 (105-166)||(25569735-25569796)
chr7 (105-166)||(46792245-46792306)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (20-316)||(13745737-13746033)
chr3 (20-316)||(16446369-16446665)
chr3 (16-320)||(3950488-3950792)
chr3 (16-320)||(30945654-30945958)
chr3 (20-316)||(36815532-36815828)
chr3 (20-320)||(8158999-8159299)
chr3 (16-320)||(6742632-6742936)
chr3 (20-316)||(14400306-14400602)
chr3 (20-316)||(48248885-48249181)
chr3 (20-316)||(46991264-46991561)
chr3 (20-316)||(29949730-29950026)
chr3 (20-316)||(29998884-29999180)
chr3 (20-307)||(21954258-21954545)
chr3 (20-316)||(6503974-6504270)
chr3 (20-307)||(77039-77326)
chr3 (184-304)||(7839353-7839473)
chr3 (105-169)||(4511042-4511106)
chr3 (110-166)||(40467293-40467349)
chr3 (103-166)||(8118509-8118572)
chr3 (121-168)||(24148288-24148335)
chr3 (105-166)||(2284136-2284197)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (20-316)||(29354704-29355000)
chr1 (20-316)||(13631165-13631461)
chr1 (16-320)||(38774126-38774430)
chr1 (16-320)||(44467327-44467631)
chr1 (16-313)||(3991357-3991654)
chr1 (20-316)||(5079684-5079980)
chr1 (16-320)||(3946473-3946777)
chr1 (16-320)||(20351201-20351505)
chr1 (20-316)||(12648595-12648891)
chr1 (20-307)||(50115782-50116069)
chr1 (26-316)||(37016660-37016950)
chr1 (23-310)||(51664010-51664297)
chr1 (20-316)||(38690958-38691254)
chr1 (20-316)||(13175527-13175823)
chr1 (23-316)||(36074820-36075114)
chr1 (20-316)||(19497483-19497779)
chr1 (114-316)||(46974910-46975112)
chr1 (221-316)||(41455586-41455681)
chr1 (20-106)||(46976765-46976851)
chr1 (20-166)||(32105687-32105833)
chr1 (102-166)||(27283960-27284024)
chr1 (108-166)||(36359603-36359661)
chr1 (20-78)||(25232218-25232273)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (16-320)||(1610763-1611067)
chr6 (20-316)||(28358067-28358363)
chr6 (20-316)||(31148068-31148364)
chr6 (20-316)||(18607742-18608031)
chr6 (20-316)||(21357369-21357665)
chr6 (20-316)||(23961351-23961647)
chr6 (20-315)||(254427-254722)
chr6 (102-166)||(26684103-26684167)
chr6 (20-79)||(34110720-34110779)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (20-316)||(38858206-38858502)
chr5 (24-316)||(28884458-28884750)
chr5 (16-316)||(37818889-37819189)
chr5 (20-316)||(11031468-11031764)
chr5 (20-316)||(27865861-27866157)
chr5 (23-316)||(13566126-13566419)
chr5 (20-316)||(7019982-7020278)
chr5 (20-316)||(25895113-25895409)
chr5 (12-316)||(1037100-1037404)
chr5 (96-316)||(34079529-34079749)
chr5 (20-298)||(7799034-7799312)
chr5 (20-316)||(4198922-4199218)
chr5 (59-316)||(18536395-18536651)
chr5 (22-268)||(20288065-20288311)
chr5 (104-169)||(25054192-25054257)
chr5 (105-166)||(27012749-27012810)
chr5 (105-166)||(11820136-11820197)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (20-316)||(7264729-7265025)
chr2 (16-320)||(38947508-38947812)
chr2 (16-320)||(211453-211757)
chr2 (16-320)||(5348912-5349216)
chr2 (16-320)||(10622466-10622770)
chr2 (16-320)||(41561757-41562061)
chr2 (20-316)||(39795719-39796015)
chr2 (20-316)||(27274376-27274672)
chr2 (20-307)||(24751417-24751704)
chr2 (20-316)||(28347416-28347712)
chr2 (20-307)||(9655910-9656197)
chr2 (20-316)||(12906511-12906807)
chr2 (20-307)||(24604108-24604395)
chr2 (20-307)||(24940669-24940956)
chr2 (20-316)||(34919801-34920097)
chr2 (23-316)||(43948305-43948597)
chr2 (20-316)||(45477104-45477400)
chr2 (20-316)||(437058-437362)
chr2 (20-307)||(11691849-11692136)
chr2 (64-316)||(1097889-1098141)
chr2 (23-315)||(41006998-41007290)
chr2 (20-187)||(3797817-3797984)
chr2 (183-313)||(3801745-3801875)
chr2 (20-316)||(17996206-17996487)
chr2 (20-166)||(25618105-25618251)
chr2 (102-169)||(28422550-28422617)
chr2 (103-166)||(24683970-24684033)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (16-320)||(2626-2930)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (16-320)||(34554-34858)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (16-320)||(8421868-8422172)
chr8 (16-320)||(32430877-32431181)
chr8 (16-320)||(7341824-7342128)
chr8 (16-320)||(32376920-32377224)
chr8 (16-320)||(30303622-30303926)
chr8 (20-316)||(2145018-2145314)
chr8 (23-307)||(43371522-43371806)
chr8 (20-307)||(35964765-35965051)
chr8 (20-271)||(43683256-43683507)
chr8 (20-303)||(7169646-7169922)
chr8 (20-228)||(22581991-22582199)
chr8 (20-230)||(22585851-22586062)
chr8 (273-316)||(43686422-43686465)
chr8 (114-166)||(17317379-17317431)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (20-316)||(3405539-3405835)
chr4 (16-320)||(19071669-19071973)
chr4 (20-316)||(4977977-4978273)
chr4 (24-316)||(4769880-4770172)
chr4 (20-316)||(38462856-38463152)
chr4 (20-293)||(4977523-4977796)
chr4 (20-195)||(51643023-51643198)
chr4 (23-187)||(17238850-17239014)
chr4 (20-124)||(9891813-9891917)
chr4 (201-316)||(11503252-11503367)
chr4 (20-102)||(11503387-11503470)
chr4 (102-166)||(13896850-13896914)
chr4 (23-154)||(17497455-17497586)
chr4 (108-165)||(20970619-20970675)
chr4 (20-78)||(6183670-6183728)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (20-316)||(15373-15669)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (103-168)||(2101-2166)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (102-160)||(1168-1226)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18107433 - 18107137
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18107433 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 18107334  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107333 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 18107234  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107233 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 18107137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 18 - 320
Target Start/End: Original strand, 616763 - 617065
Alignment:
Q  18 tgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  616763 tgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctatttgtggtcctgc 616862  T
Q  118 aaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcact 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  616863 aaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcact 616962  T
Q  218 acatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  616963 acatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttaagtgggcgattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcc 617062  T
Q  318 cga 320  Q
    |||    
T  617063 cga 617065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15067934 - 15067638
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15067934 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcatccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 15067835  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15067834 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctaaaaaaattgggaaatcactac 15067735  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067734 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 15067638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30788588 - 30788284
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30788588 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 30788489  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30788488 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 30788389  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30788388 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 30788289  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  30788288 cccga 30788284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42501452 - 42501156
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42501452 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccatgtttgtggtcatgcaa 42501353  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42501352 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggtataatctacaaaaattgggaaatcactac 42501253  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42501252 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 42501156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 43622147 - 43622451
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43622147 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 43622246  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43622247 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 43622346  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43622347 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 43622446  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  43622447 cccga 43622451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45765428 - 45765124
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45765428 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 45765329  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45765328 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 45765229  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45765228 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 45765129  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  45765128 cccga 45765124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47062926 - 47062630
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47062926 atgtattttcttccaacaagtacccaaatcacctacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 47062827  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||||||||    
T  47062826 ccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacataattattgaaaagtgggaaatcactac 47062727  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  47062726 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccataccctcattatcttctccacaacatc 47062630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 10707697 - 10707994
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcga-ccctgtttgtggtcctgca 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||||    
T  10707697 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattttatccctgttggtggtcctgca 10707796  T
Q  119 accaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcacta 218  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||||    
T  10707797 acatagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgggaaatcacta 10707896  T
Q  219 catgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10707897 catgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagcattccatgccttcattatcttcttcacaacatc 10707994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 8401546 - 8401250
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  8401546 atgtattttctcccaacaagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagctgattctaccatgttggtggttctgcaa 8401447  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||| ||||||||||    
T  8401446 ctaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcatttcattcaaggtggtcatgacatactttaggaaaagtggaaaatcactac 8401347  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  8401346 aaaaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatc 8401250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 50 - 316
Target Start/End: Original strand, 12116418 - 12116684
Alignment:
Q  50 acccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgcc 149  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12116418 acccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattctaccctgttagtggtcctgcaaccaagatgcagcacatggtctgtccatgcc 12116517  T
Q  150 ctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttg 249  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12116518 ctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatgtttgaaaagtgggaaatcaccacatgaatcttggaactccactaatgcatttg 12116617  T
Q  250 catataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12116618 caaataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttctatgccctcattatcttcttcacaacatc 12116684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 93 - 310
Target Start/End: Original strand, 43826698 - 43826915
Alignment:
Q  93 gattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacat 192  Q
    ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43826698 gattctaccctgttggtagttctacaaccaagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcgctattttctccttcacttcattcaaggcggtcatggcat 43826797  T
Q  193 aatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgc 292  Q
    | | ||  ||||  ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43826798 actttaggaaaagcgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgc 43826897  T
Q  293 cttcattatcttcttcac 310  Q
     |||||||||||||||||    
T  43826898 attcattatcttcttcac 43826915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 54
Target Start/End: Original strand, 12113572 - 12113606
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcaccca 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12113572 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcaccca 12113606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 3762971 - 3762832
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||  | |||| ||   | | ||  |||| ||||| |||||     
T  3762971 atgtattttatcccaacaagtacc-aagtcatccacactagtgctcaaatatttcttcaacctaccatgagcccctacaactgtgttggtggttctgcag 3762873  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatttt 160  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  3762872 ccaagatgcaagacatggtctgaccatgcccccactatttt 3762832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 25569735 - 25569796
Alignment:
Q  105 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  25569735 tttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 25569796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 46792306 - 46792245
Alignment:
Q  105 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  46792306 tttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 46792245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 13745737 - 13746033
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13745737 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 13745836  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745837 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 13745936  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745937 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 13746033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16446665 - 16446369
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16446665 atgtattttctcccagcaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctgcaa 16446566  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446565 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 16446466  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446465 atgaatctttgaactccactaatgcatttgaatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 16446369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3950792 - 3950488
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3950792 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcct 3950693  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3950692 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 3950593  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3950592 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 3950493  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  3950492 cccga 3950488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 30945654 - 30945958
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30945654 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 30945753  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30945754 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 30945853  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30945854 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 30945953  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  30945954 cccga 30945958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 36815532 - 36815828
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36815532 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 36815631  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815632 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 36815731  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36815732 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgacaacatc 36815828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Original strand, 8158999 - 8159299
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8158999 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 8159098  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8159099 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgagaaatcactac 8159198  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcccg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8159199 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 8159298  T
Q  320 a 320  Q
    |    
T  8159299 a 8159299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6742936 - 6742632
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6742936 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 6742837  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6742836 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaagatggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 6742737  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6742736 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattattgattaggagattcaaccataattttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 6742637  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  6742636 cccga 6742632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 14400602 - 14400306
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14400602 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 14400503  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14400502 ccaagatgcaacacatggtctttctatgccctcataattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 14400403  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14400402 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggtgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgacaacatc 14400306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 48248885 - 48249181
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48248885 atgtattttctcccaacaagtatccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccttgttcgtggtcctgcaa 48248984  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||    
T  48248985 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaattgggaaatcactac 48249084  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  48249085 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggtgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatc 48249181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 46991264 - 46991561
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  46991264 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 46991363  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataa-tctacaaaaattgggaaatcacta 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |   ||||||||||||||||||    
T  46991364 ccaagatgcaacacatggcctgtccatgccctcacaattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttttaaaattgggaaatcacta 46991463  T
Q  219 catgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  46991464 catgaatcttggaactccattaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatc 46991561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29950026 - 29949730
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  29950026 atgtattttctcccaacaagtgcccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtggccctacaa 29949927  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  29949926 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 29949827  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  29949826 atgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagatttccatgccctcattatcttattcacaacatc 29949730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29999180 - 29998884
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  29999180 atgtattttctcccaacaagtgcccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtggccctacaa 29999081  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  29999080 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 29998981  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  29998980 atgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagatttccatgccctcattatcttattcacaacatc 29998884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 21954258 - 21954545
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  21954258 atgtattttctcccaacaagtacccaaattactcacattattgtccaattatttcttcaataaagcatgtgccgattcgactctgtttgtggtccttcaa 21954357  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |   |||||||||||||||||||    
T  21954358 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggtataatttttgaaaattgggaaatcactac 21954457  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21954458 atgaatcttggaactccactaatgcaattgcatataaatgttgagtgggcgattcaacaatagctttccatgctctcattatgttctt 21954545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 6503974 - 6504270
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||| || ||||||  |||||||||||    
T  6503974 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccactctattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccaatttgaacctgttgttggtcctgcaa 6504073  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| ||||||||||||    
T  6504074 ccaagatgcaacacatggtatgtctatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttttaaaattaggaaatcactac 6504173  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||| || |||||    
T  6504174 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagatttccatttcctcattatcttcttgacaacatc 6504270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 77039 - 77326
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  77039 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccgcactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaa 77138  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||  ||||||||||||||    
T  77139 ccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtgggaaatcactac 77238  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 307  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  77239 aagcatcttggaactccactaatgcatttacatataactcttgagtgggagattcaaccatagctttccatgccctcatgatcttctt 77326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7839473 - 7839353
Alignment:
Q  184 tcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagc 283  Q
    |||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  7839473 tcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcataaaactcttgactgggcgattcaaccatagc 7839374  T
Q  284 tttccatgccttcattatctt 304  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  7839373 tttccatgccctcattatctt 7839353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4511106 - 4511042
Alignment:
Q  105 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcac 169  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4511106 tttgtggtcctgcacccaagatgtaacagaaagtctgtccatgctctcactattttgtccttcac 4511042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 166
Target Start/End: Original strand, 40467293 - 40467349
Alignment:
Q  110 ggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    |||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40467293 ggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactattttgtcctt 40467349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 8118572 - 8118509
Alignment:
Q  103 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  8118572 tgttggtggtcctgcatccaagatgcaatacaaggtatgcccatgccctcactattttttcctt 8118509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24148335 - 24148288
Alignment:
Q  121 caagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 168  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24148335 caagatgcatcacatggtatgtccatgctctcacaattttttccttca 24148288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 2284136 - 2284197
Alignment:
Q  105 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  2284136 tttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 2284197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 29354704 - 29355000
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29354704 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 29354803  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354804 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 29354903  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354904 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 29355000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13631461 - 13631165
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13631461 atgtattttctcccagcaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctgcaa 13631362  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13631361 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 13631262  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13631261 atgaatctttgaactccactaatgcatttgaatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 13631165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 38774126 - 38774430
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38774126 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 38774225  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38774226 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 38774325  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38774326 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 38774425  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  38774426 cccga 38774430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44467631 - 44467327
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44467631 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 44467532  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44467531 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 44467432  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44467431 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 44467332  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  44467331 cccga 44467327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3991654 - 3991357
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3991654 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 3991555  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3991554 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 3991455  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3991454 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccac 3991357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5079980 - 5079684
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5079980 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaattatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaa 5079881  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079880 cctagatgcaacacatggtctgtccatgccttcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 5079781  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079780 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 5079684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 3946473 - 3946777
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3946473 tgtgatgtattttctctcaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 3946572  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  3946573 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtctatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgagaaatca 3946672  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3946673 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 3946772  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  3946773 cccga 3946777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20351505 - 20351201
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20351505 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 20351406  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20351405 gcaaccaagatgcaatacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 20351306  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20351305 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatattcttcaccacat 20351206  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  20351205 cccga 20351201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 12648595 - 12648891
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12648595 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 12648694  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12648695 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcataattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 12648794  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  12648795 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatc 12648891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 50115782 - 50116069
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   | ||||||||||| ||||||||||||    
T  50115782 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaaaaaagcatgagacaaatcgaccctgttagtggtcctgcaa 50115881  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  50115882 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatataaaaaaattgggaaatcactaa 50115981  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50115982 atgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttctt 50116069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37016950 - 37016660
Alignment:
Q  26 tttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaaga 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37016950 tttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaaga 37016851  T
Q  126 tgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||| ||| |||||||    
T  37016850 tgcaacacatggtctgtccatgccctaacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaattggaaaattactgcatgaat 37016751  T
Q  226 ctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  37016750 cttggaactccactaatgcatttgcatataactgctgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatc 37016660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51664297 - 51664010
Alignment:
Q  23 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51664297 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttatccaataaagcatgagccgattcgaccctgttagtggtcctgcaacca 51664198  T
Q  123 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 222  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||||||||    
T  51664197 agatgcaacatatggtttgtccatgccttcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactacatg 51664098  T
Q  223 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcac 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51664097 aatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccatcattatcttcttcac 51664010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 38690958 - 38691254
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | | |||| ||  |||| || ||||| ||||||||||||    
T  38690958 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaaatatttcttccatagaacatgagcctattctactctgttggtggtcctgcaa 38691057  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||     
T  38691058 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttttccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactaa 38691157  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38691158 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcaaataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 38691254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13175823 - 13175527
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||  ||||| |||||    
T  13175823 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacaccattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagctagttcgaccctgttgatggtcttgcaa 13175724  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  13175723 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcattgcataattttggaaaagtgggaaatcactac 13175624  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13175623 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagttttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 13175527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 36074820 - 36075114
Alignment:
Q  23 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcga-ccctgtttgtggtcctgcaacc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||  | ||||||| |||||||||||||     
T  36074820 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattttatccctgttggtggtcctgcaaca 36074919  T
Q  122 aagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacat 221  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||| || ||||    
T  36074920 tagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgggaaattaccacat 36075019  T
Q  222 gaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36075020 gaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcaattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 36075114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 19497483 - 19497779
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||| |    
T  19497483 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaaaatttctttactaaagcatgagcctattctaccctgttggtggttctgcca 19497582  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  19497583 ccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttctttcaaggtggtcatggcataatttaggaaaagtgggaaatcactac 19497682  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19497683 atgcatctaggaactccactaatgcatttccatataactcttgagtgtgcgattcaaccataacttttcatgccctcattatcttcttcacaacatc 19497779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 114 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46975112 - 46974910
Alignment:
Q  114 ctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||    
T  46975112 ctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcactattttcttcttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaat 46975013  T
Q  214 cactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccac 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  46975012 cactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcaaataactcttgagtgggcgtttcaaccataactttccatgccctcgttatcttcttcacaac 46974913  T
Q  314 atc 316  Q
    |||    
T  46974912 atc 46974910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 221 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41455681 - 41455586
Alignment:
Q  221 tgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41455681 tgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgaccacatc 41455586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46976851 - 46976765
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  46976851 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattctaccttgtt 46976765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 32105687 - 32105833
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||| |  | |||||| ||   ||| || ||||| ||||| ||| |     
T  32105687 atgtattttctctcagcaagtacccaaatcacccacattattgctcgaatatttctttattatagcatgagccccttcaactctgttggtggttctgtat 32105786  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32105787 ccaagatgcaagacatgatatgtccatgccctcactatttcgtcctt 32105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27284024 - 27283960
Alignment:
Q  102 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  27284024 ctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactaatttgtcctt 27283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Original strand, 36359603 - 36359661
Alignment:
Q  108 gtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  36359603 gtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 36359661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 25232273 - 25232218
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttca 78  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  25232273 atgtattttctcccaa---gtacccaaatcatccacactattgctcaaatatttcttca 25232218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 1610763 - 1611067
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1610763 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 1610862  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1610863 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 1610962  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1610963 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 1611062  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  1611063 cccga 1611067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28358363 - 28358067
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28358363 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagtcgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 28358264  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358263 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 28358164  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28358163 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtggacgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgaccacatc 28358067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31148364 - 31148068
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31148364 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaatcgtgagctgattcgaccctcttggtggtcctgcaa 31148265  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |   |||||||| ||||||||||    
T  31148264 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacatattttttgaaaattggaaaatcactac 31148165  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||    
T  31148164 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgtcgagtgggcgattcaactatagctttccatgccctcaatatcttcttgacaacatc 31148068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18608031 - 18607742
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18608031 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgacccagttggtggtcctgcaa 18607932  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  18607931 ccaagatgcaacacatggtctgttcatgccctcac-------tccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 18607839  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18607838 atgaatcttctaactccactaatgcatttccatataactcttgattgggtgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 18607742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 21357369 - 21357665
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  21357369 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacattattgtccaaatatttctttcctaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcag 21357468  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  21357469 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctctttcacttctttcaaggtggtcatggcataatttaggaaaagtgggaaatcactac 21357568  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21357569 atgcatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgtgcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 21357665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 23961351 - 23961647
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||     
T  23961351 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacattattgtccaaatatttctttcctaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcag 23961450  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  23961451 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctctttcacttctttcaaggtggtcatggcataatttaggaaaagtgggaaatcactac 23961550  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23961551 atgcatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgtgcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 23961647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 315
Target Start/End: Original strand, 254427 - 254722
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || |  | |||||| ||  |||| ||| |||| ||||| |||||     
T  254427 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgctcaaatatttatttactatagcatgagccaattctaccttgttggtggttctgcat 254526  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||  ||| |||||||| |||| | ||   || |||  |||| ||||||  ||    
T  254527 ccaagatgcaacacatagtctgtccatgctctcattattttctccttaacaacatccaaggtggccatggcctaggttataaactttggaaaatcatgac 254626  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    |   || || |||||||||||||||| || ||| ||| | |||| |||| || ||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  254627 aaacattttggaactccactaatgcactttcatttaatttttgaatgggtgattcaacaataacttcccatgctctcattatcttcttcactacat 254722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 166
Target Start/End: Original strand, 26684103 - 26684167
Alignment:
Q  102 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26684103 ctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccatgccctcattattttgtcctt 26684167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 79
Target Start/End: Original strand, 34110720 - 34110779
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaa 79  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  34110720 atgtattttctcccaacaagtatccaaatcatccacactattgctcaaatatttcttcaa 34110779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 38858206 - 38858502
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  38858206 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctacaa 38858305  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858306 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 38858405  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858406 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagcttttcatgccttcattatcttcttcaccacatc 38858502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Original strand, 28884458 - 28884750
Alignment:
Q  24 attttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884458 attttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaa 28884557  T
Q  124 gatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatga 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28884558 gatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcaatacatga 28884657  T
Q  224 atctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884658 atctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgagtgggcgattcaaccatagttttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 28884750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Original strand, 37818889 - 37819189
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  37818889 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattttccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcct 37818988  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37818989 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgttcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 37819088  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37819089 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgtcttcattatctttttcaccacat 37819188  T
Q  316 c 316  Q
    |    
T  37819189 c 37819189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 11031468 - 11031764
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||    
T  11031468 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgatttgactctgtttgtggtcctacaa 11031567  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031568 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttttccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 11031667  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11031668 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgtcttcattatcttcttcaccacatc 11031764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 27865861 - 27866157
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27865861 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgatttgaccctgtttgtggtcctgcaa 27865960  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27865961 ctaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 27866060  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27866061 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgaccacatc 27866157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 13566126 - 13566419
Alignment:
Q  23 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566126 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 13566225  T
Q  123 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13566226 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaaatgggaaatcactacatg 13566325  T
Q  223 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13566326 aatctttgaactccactaatgcattttcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcatgaccacatc 13566419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 7019982 - 7020278
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  7019982 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataatgcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 7020081  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7020082 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctaccgaaattgggaaatcactac 7020181  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020182 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataaccgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 7020278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 25895113 - 25895409
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25895113 atgtattttctcccaacaactacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttcgtggtcctgcaa 25895212  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25895213 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtagtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 25895312  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25895313 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataaatgttgagtggccgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgacaacatc 25895409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1037404 - 1037100
Alignment:
Q  12 aacctgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtgg 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  1037404 aacctgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattatccaagtatgtcttcaataaagtatgagccgattcgaccctgttcgtgg 1037305  T
Q  112 tcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||    
T  1037304 tcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaattgggaa 1037205  T
Q  212 atcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcacc 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||     
T  1037204 atcactacaggaatctttgaactccactaatgcatttgcatataacttttgagtgggtgattcaaccatagcttttcatgcctacattatcttcttgaca 1037105  T
Q  312 acatc 316  Q
    |||||    
T  1037104 acatc 1037100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 96 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34079749 - 34079529
Alignment:
Q  96 tcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34079749 tcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat 34079650  T
Q  196 ctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgcctt 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34079649 ctacaaaaattggaaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgcctt 34079550  T
Q  296 cattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  34079549 cattatcttcttgaccacatc 34079529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 298
Target Start/End: Original strand, 7799034 - 7799312
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7799034 atgtattttctcccaacaagtacccaaattacccacaatattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 7799133  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |   |||| || |||||||||||    
T  7799134 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcattgcataatttttgaaaagtgagaaatcactac 7799233  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcat 298  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7799234 ttgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcat 7799312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 4198922 - 4199218
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4198922 atgtattttctctcaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 4199021  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| || |||||||||||    
T  4199022 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttttaaaagtgagaaatcactac 4199121  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||    
T  4199122 atgaatcttggaactccactaatgtatttgcatataactcttgaatggacaattcaaccatagctttccatgctctcattatcatcttcacaacatc 4199218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 59 - 316
Target Start/End: Original strand, 18536395 - 18536651
Alignment:
Q  59 attgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatt 158  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  18536395 attgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgtttctacctcgtt-gtggtcctgcaaccaagatgcaacatatggtctgttcatgccctcactatt 18536493  T
Q  159 ttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataact 258  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18536494 ttctccttcacttcattcaatgtggtcatggcataatttttggaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatacatttgcaaataact 18536593  T
Q  259 gttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18536594 cttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 18536651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20288311 - 20288065
Alignment:
Q  22 gtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattg-tccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||| |||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  20288311 gtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgctccaa-tatttatttactaaatcatgagccgattctaccctattggtggttctgcaac 20288213  T
Q  121 caagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactaca 220  Q
    ||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||| | |||| ||||   ||  |||||||| |||||| ||||    
T  20288212 caagatataacacatggtttatccatgccctcactattttctccttaacaacatccaaggtagacatggcataggttaggaaaattggaaaatcattaca 20288113  T
Q  221 tgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtggg 268  Q
       || ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  20288112 aacatttttgaactccactaatgcatttgaatataattcttgagtggg 20288065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25054257 - 25054192
Alignment:
Q  104 gtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcac 169  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25054257 gtttgtggtcctgcacccaagatgtaacacaagctctgtccatgctctcactattttgtcattcac 25054192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Original strand, 27012749 - 27012810
Alignment:
Q  105 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27012749 tttgtggtcctacacccaagatgtaacactaggtccgtccatgccctcactattttgtcctt 27012810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 11820197 - 11820136
Alignment:
Q  105 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  11820197 tttgtggtactacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 11820136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7265025 - 7264729
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7265025 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaa 7264926  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7264925 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgagaaatcactac 7264826  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264825 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 7264729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38947812 - 38947508
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38947812 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 38947713  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38947712 gcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgttcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 38947613  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38947612 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgattgggcgattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 38947513  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  38947512 cccga 38947508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 211453 - 211757
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  211453 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 211552  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  211553 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 211652  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  211653 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 211752  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  211753 cccga 211757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5349216 - 5348912
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5349216 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 5349117  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5349116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 5349017  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5349016 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 5348917  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  5348916 cccga 5348912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 10622466 - 10622770
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10622466 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 10622565  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10622566 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 10622665  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10622666 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 10622765  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  10622766 cccga 10622770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41562061 - 41561757
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41562061 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 41561962  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41561961 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 41561862  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41561861 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 41561762  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  41561761 cccga 41561757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39796015 - 39795719
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  39796015 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctacaa 39795916  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795915 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgctctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 39795816  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795815 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactattgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 39795719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 27274376 - 27274672
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  27274376 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 27274475  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27274476 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 27274575  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27274576 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgacaacatc 27274672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24751704 - 24751417
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24751704 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 24751605  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24751604 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 24751505  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751504 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 24751417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 28347416 - 28347712
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  28347416 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctattggtggtcctgcaa 28347515  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  28347516 ccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcaattcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactac 28347615  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  28347616 atgaatcttggaactccactaattcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatc 28347712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9656197 - 9655910
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||    
T  9656197 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctacaa 9656098  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  9656097 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtctttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 9655998  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9655997 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccgtcattatcttctt 9655910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 12906511 - 12906807
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12906511 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaaacatgagccgattcaaccctgttggtggtcctgcaa 12906610  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  12906611 ccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgggaaatcactac 12906710  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12906711 atgaatcttggaactccaccaatgcatttgcatataactcttgagtaggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 12906807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 24604108 - 24604395
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  24604108 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtagtcctgcaa 24604207  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  24604208 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat-tttgaaaagtgggaaataactac 24604306  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgc-cttcattatcttctt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  24604307 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaatcatagctttgcatgcgcctcattatcttctt 24604395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 24940669 - 24940956
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  24940669 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtagtcctgcaa 24940768  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  24940769 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat-tttgaaaagtgggaaataactac 24940867  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgc-cttcattatcttctt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  24940868 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaatcatagctttgcatgcgcctcattatcttctt 24940956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 34919801 - 34920097
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34919801 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggtcctgcaa 34919900  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |   |||| ||| |||||||| |    
T  34919901 ccaagatgcaacgcatggtctgtccatgctctcactattttctccttcacttcattcaatatggtcatgacataattttggaaaagtggaaaatcactgc 34920000  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34920001 atgaatcttggaactccactaatacatttgcatataacttttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 34920097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 316
Target Start/End: Original strand, 43948305 - 43948597
Alignment:
Q  23 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43948305 tattttctcctaacaagtacccaaatcacccacactattgcccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaacca 43948404  T
Q  123 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| |||  |||||||| |||    
T  43948405 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat-tttgaaaagtggagaatcactatatg 43948503  T
Q  223 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  43948504 aatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgcccccattatcttcttcacaacatc 43948597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45477400 - 45477104
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45477400 atgtattttctccaaacaagtacccaaatcacccacactattttccaaatatttattcactaaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 45477301  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| || |||||||||||    
T  45477300 ccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcgctattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgagaaatcactac 45477201  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  45477200 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagttttccatgcccttattatcttcttcacaacatc 45477104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 437362 - 437058
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |  ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  437362 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaaacatgagaagattcaaccatgttggtggtcctgcaa 437263  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  437262 ccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactac 437163  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcattt--------gcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcacc 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  437162 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcattattgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcaca 437063  T
Q  312 acatc 316  Q
    |||||    
T  437062 acatc 437058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 11691849 - 11692136
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11691849 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggtcctgcaa 11691948  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  |||| ||||||||||||||    
T  11691949 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctaactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaagtgggaaatcactac 11692048  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 307  Q
    |   ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  11692049 aaacatcttggagctccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgctctcattatcttctt 11692136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 316
Target Start/End: Original strand, 1097889 - 1098141
Alignment:
Q  64 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 163  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1097889 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctaccaattttgtc 1097988  T
Q  164 cttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttga 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1097989 cttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaattgggaaatcactacatgaatcttggaactccattaatgcatttgcatataactgttga 1098088  T
Q  264 gtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  1098089 gtgggcgattcaaccatagttttccatgccctcattatcttcttgacaacatc 1098141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 315
Target Start/End: Original strand, 41006998 - 41007290
Alignment:
Q  23 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  41006998 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtgatcctgcaacca 41007097  T
Q  123 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |   |||| ||||||| |||  ||||    
T  41007098 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtgattatggcataatttttgaaaagtgggaaaacacatcatg 41007197  T
Q  223 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||    
T  41007198 aatcttggaactccactaatgcatttacatataactcttgagtgggcgattcaaccatagtttttcatgtcctcattatcttcttcacaacat 41007290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 3797817 - 3797984
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3797817 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgactctgtttgtggtcctgcaa 3797916  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcat 187  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3797917 cctagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcat 3797984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 3801745 - 3801875
Alignment:
Q  183 gtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3801745 gtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatag 3801844  T
Q  283 ctttccatgccttcattatcttcttcaccac 313  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3801845 atttccatgccttcattatcttcttcaccac 3801875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 17996206 - 17996487
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| |||| ||| || || ||||||    
T  17996206 atgtattttctcccaaaaagtacccaaatcacccacattattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctacccggttggtcgttctgcaa 17996305  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
     |||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||||||||    
T  17996306 tcaagatgcaacacatggtctgtccatg---------------ccttcacttcatccaaggtggtcatggcataggttaggaaaattgggaaatcactac 17996390  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||   || ||||||||||||| |||||    
T  17996391 aaacatcttggaactccaataatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaacaatagttttccatgtgctcgttatcttcttcactacatc 17996487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 25618105 - 25618251
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| |||| |  |||| ||| |||||||| || ||||| |||||  ||||     
T  25618105 atgtattttctcccaacaagtacccagatcacccacactattactcaaatatatctttactaaagtatgagctgattcaactctgttggtggttatgcag 25618204  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  25618205 ccaagatgcaacacatggtctttccatgccctcactattttatcctt 25618251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 169
Target Start/End: Original strand, 28422550 - 28422617
Alignment:
Q  102 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcac 169  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28422550 ctgtttgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtctatccatgccctcactattttgtccttcac 28422617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24684033 - 24683970
Alignment:
Q  103 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24684033 tgtttgtggttctgcaactaagatgcaagacacggtgtgtccatgccctcactattttttcctt 24683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2930 - 2626
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2930 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 2831  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2830 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 2731  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2730 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 2631  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  2630 cccga 2626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34858 - 34554
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34858 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 34759  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34758 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 34659  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34658 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 34559  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  34558 cccga 34554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 8421868 - 8422172
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8421868 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 8421967  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8421968 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 8422067  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8422068 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 8422167  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  8422168 cccga 8422172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 32430877 - 32431181
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32430877 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 32430976  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32430977 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 32431076  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32431077 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 32431176  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  32431177 cccga 32431181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7342128 - 7341824
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7342128 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcct 7342029  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7342028 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 7341929  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7341928 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 7341829  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  7341828 cccga 7341824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 32376920 - 32377224
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32376920 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 32377019  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32377020 gcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 32377119  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32377120 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 32377219  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  32377220 cccga 32377224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 30303622 - 30303926
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30303622 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttttggtcct 30303721  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30303722 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 30303821  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30303822 ctacatgaatctttgaactccactaatacatttgcatataattgttgattgggagattcaaccataactttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 30303921  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  30303922 cccga 30303926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 2145018 - 2145314
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2145018 atgtattttctcccaacaagtacctaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttggtggtcctgcaa 2145117  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  2145118 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcactgcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactac 2145217  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||    
T  2145218 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttaagtgggcaattcaaccatagctttccattccctcattatcttcttgacaacatc 2145314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43371806 - 43371522
Alignment:
Q  23 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43371806 tattttcttccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctattggtggtcctgcaacca 43371707  T
Q  123 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 222  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||||||||    
T  43371706 agatgcatcacatggtctctccatgccctcacaattttttccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactacatg 43371607  T
Q  223 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 307  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43371606 aatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttctt 43371522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 35964765 - 35965051
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  35964765 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaagtatttcttcaataaagcatgagctgattcgacc-tgttcgtggtcctgaaa 35964863  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||| ||||||||||    
T  35964864 tcaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgatcatgacataatttttgaaaattggaaaatcactac 35964963  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttctt 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  35964964 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataattgttgagtggacgattcaaccatagcttttcatgccctcattatcttctt 35965051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 271
Target Start/End: Original strand, 43683256 - 43683507
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||    
T  43683256 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcataagcagattcgaccctgttggttgtcatgcaa 43683355  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   |||| ||||||||||||||    
T  43683356 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacttaatttttgaaaagtgggaaatcactac 43683455  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcga 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  43683456 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttaagtgggcga 43683507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7169922 - 7169646
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  7169922 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaa 7169823  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||| || |||      |||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  7169822 ccaagatgcaaccca-ggt------atgccctcactattttctccttcacttcttccaaggtggtcatggcataatttaagaaaattgggaaatcattac 7169730  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatct 303  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  7169729 atgtatcttggaactccactaatgcatttgcatataattattgagtgtgcgattcaaccatagctttccgagccctcattatct 7169646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22582199 - 22581991
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  22582199 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtgattctgcaa 22582100  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22582099 acaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtagtcatggcataatttaggaaaattgggaaatcactac 22582000  T
Q  220 atgaatctt 228  Q
    |||||||||    
T  22581999 atgaatctt 22581991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22586062 - 22585851
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaa-gtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgca 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||| | |||||    
T  22586062 atgtattttctcccaacaaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtgattctgca 22585963  T
Q  119 accaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcacta 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  22585962 accaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtagtcatggcataatttaggaaaattgggaaatcacta 22585863  T
Q  219 catgaatctttg 230  Q
    ||||||||||||    
T  22585862 catgaatctttg 22585851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 316
Target Start/End: Original strand, 43686422 - 43686465
Alignment:
Q  273 tcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43686422 tcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatc 43686465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17317431 - 17317379
Alignment:
Q  114 ctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17317431 ctgcacccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttttcctt 17317379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3405835 - 3405539
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3405835 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctatttgtggtcctgcaa 3405736  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405735 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtagtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 3405636  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405635 atgaatctttgaactccactaatgcatttggatataactgtcgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 3405539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 16 - 320
Target Start/End: Original strand, 19071669 - 19071973
Alignment:
Q  16 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcct 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19071669 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 19071768  T
Q  116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19071769 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 19071868  T
Q  216 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacat 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19071869 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 19071968  T
Q  316 cccga 320  Q
    |||||    
T  19071969 cccga 19071973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 4977977 - 4978273
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||    
T  4977977 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgaccaaatacttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgctggtggtcctgcaa 4978076  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  4978077 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcaaaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgtcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 4978176  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  4978177 atgaatcttgaaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatc 4978273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 4770172 - 4769880
Alignment:
Q  24 attttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaa 123  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4770172 attttctcccaacaagtatccaaatcacccacactgttgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattcgaccttgttggtggtcctgcaaccaa 4770073  T
Q  124 gatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatga 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||| |    
T  4770072 gatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacataattttggaaaagtgggaaatcactacatta 4769973  T
Q  224 atctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  4769972 atcttggaactccactaatgcatttgcatataaatcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcgttattttcttcacaacatc 4769880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 38462856 - 38463152
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  38462856 atgtattttctcccaaaaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttgctggtcctgcaa 38462955  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   |||| || |||||||||||    
T  38462956 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgagaaatcactac 38463055  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38463056 atgaattttggaactccactgatgcatttgcatataactcttgagtgggcaattcgaccatagcttttcatgccctcattatcttcttcacaacatc 38463152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4977796 - 4977523
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4977796 atgtattttctcccaacaagtacacaaatcacccatactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 4977697  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| || |||||||||||    
T  4977696 ccaagatgcatcacacagtctgtccatgccctcacaattttgtcattcacttcattcaaggtggtcatgacataattttttaaaagtgagaaatcactac 4977597  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgcc 293  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4977596 atgaatattggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtggccgattcaaccatagctttccatgcc 4977523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 195
Target Start/End: Original strand, 51643023 - 51643198
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  51643023 atgtattttctcccaacaagtacacaaatcacctacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagtcgattctactctgttggtggtcctgcaa 51643122  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  51643123 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcatttcatttaaggtggtcatggcataat 51643198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 17238850 - 17239014
Alignment:
Q  23 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17238850 tattttctcccaacaagtacccaaaacacccacgctattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaacca 17238949  T
Q  123 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcat 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17238950 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttctttcaaggtggtcat 17239014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9891917 - 9891813
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9891917 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 9891818  T
Q  120 ccaag 124  Q
    |||||    
T  9891817 ccaag 9891813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 201 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11503367 - 11503252
Alignment:
Q  201 aaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcatta 300  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11503367 aaaagtgggaaatcgctacatgaatcttggaactccactaatgcattttcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcatta 11503268  T
Q  301 tcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||| |||||    
T  11503267 tcttcttcacaacatc 11503252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 11503470 - 11503387
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaa-caagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11503470 atgtattttctcccaaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagctgattcgaccc 11503387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 166
Target Start/End: Original strand, 13896850 - 13896914
Alignment:
Q  102 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 166  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  13896850 ctgttggtggttctgcagccaagatgcaacacacggtatgtccatgccttcacaattttttcctt 13896914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17497586 - 17497455
Alignment:
Q  23 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 122  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||       ||  ||| |||| ||||| || |||||| |||  ||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  17497586 tattttttcccaacaagtacccaaatcacccttggaggtggacaaatattccttcaccacagcatgagctccttcaactctgttcgtggtcctgcaccca 17497487  T
Q  123 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcac 154  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  17497486 agatgtaacacaaggtatgtccatgccctcac 17497455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 165
Target Start/End: Original strand, 20970619 - 20970675
Alignment:
Q  108 gtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcct 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  20970619 gtggtcctgcacccaagatgcaacacaaggtatgtccatg-cctcactattttgtcct 20970675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 6183728 - 6183670
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttca 78  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||    
T  6183728 atgtattttctcccaacaagcatccaaatcaccagcactattgctcaaatatttcttca 6183670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Original strand, 15373 - 15669
Alignment:
Q  20 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggctgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15373 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 15472  T
Q  120 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 219  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15473 cctagatgcaacacatggtctgtccattccctcacaattttgtctttcacttcattcaaggtggtcatggcacaatctacaaaaattgggaaatcactac 15572  T
Q  220 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgactcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15573 atgaatctttgaactccagtaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatc 15669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Original strand, 2101 - 2166
Alignment:
Q  103 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 168  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2101 tgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccataccctcactattttgtccttca 2166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 160
Target Start/End: Original strand, 1168 - 1226
Alignment:
Q  102 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatttt 160  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1168 ctgttggtggttcggcagccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcactatttt 1226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University