View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3672_low_2 (Length: 424)

Name: NF3672_low_2
Description: NF3672
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3672_low_2
NF3672_low_2
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (15-307)||(5674567-5674862)
chr6 (18-307)||(5757285-5757571)
chr6 (18-289)||(22709041-22709300)
chr6 (27-307)||(21356040-21356318)
chr6 (18-307)||(31086281-31086566)
chr6 (18-290)||(5572050-5572316)
chr6 (134-307)||(11856979-11857154)
chr6 (134-307)||(22010602-22010777)
chr6 (61-290)||(18232867-18233096)
chr6 (135-307)||(28155477-28155649)
chr6 (18-307)||(31979517-31979802)
chr6 (134-307)||(14737482-14737656)
chr6 (134-307)||(28184510-28184684)
chr6 (134-307)||(14742342-14742516)
chr6 (18-290)||(21801149-21801419)
chr6 (215-307)||(6005422-6005514)
chr6 (215-307)||(33330433-33330525)
chr6 (171-290)||(10077120-10077240)
chr6 (215-307)||(16838749-16838841)
chr6 (215-307)||(33335930-33336022)
chr6 (216-307)||(6438506-6438595)
chr6 (19-82)||(11857154-11857216)
chr6 (19-82)||(14737420-14737482)
chr6 (19-82)||(22010540-22010602)
chr6 (61-307)||(4629958-4630203)
chr6 (18-272)||(22963739-22963989)
chr6 (18-272)||(23824404-23824654)
chr6 (19-82)||(14742280-14742342)
chr6 (18-109)||(5017303-5017390)
chr6 (18-113)||(31936774-31936865)
chr6 (369-413)||(5674924-5674968)
chr6 (19-82)||(28184684-28184749)
chr6 (18-290)||(24435779-24436046)
chr6 (228-290)||(31936609-31936671)
chr6 (228-280)||(5017482-5017534)
chr6 (369-413)||(21355936-21355980)
chr6 (61-108)||(14521877-14521924)
chr6 (369-413)||(5757631-5757675)
chr6 (37-81)||(28155432-28155475)
[»] chr7 (57 HSPs)
chr7 (15-307)||(1533241-1533536)
chr7 (18-307)||(21639813-21640102)
chr7 (15-307)||(2057970-2058268)
chr7 (18-307)||(21646011-21646300)
chr7 (15-307)||(20357344-20357639)
chr7 (18-307)||(18408768-18409056)
chr7 (18-307)||(18413645-18413932)
chr7 (61-307)||(21983288-21983536)
chr7 (18-289)||(2479360-2479626)
chr7 (98-289)||(44848567-44848758)
chr7 (19-307)||(29159807-29160096)
chr7 (22-307)||(21988912-21989194)
chr7 (18-290)||(2580412-2580679)
chr7 (133-307)||(12406336-12406512)
chr7 (18-290)||(2647504-2647771)
chr7 (18-307)||(47263682-47263956)
chr7 (134-307)||(24024232-24024406)
chr7 (171-307)||(9189963-9190101)
chr7 (134-307)||(12396916-12397091)
chr7 (18-307)||(20284093-20284379)
chr7 (216-307)||(19992318-19992408)
chr7 (134-307)||(31109489-31109663)
chr7 (227-307)||(4866735-4866814)
chr7 (215-307)||(16880078-16880169)
chr7 (215-307)||(16884934-16885025)
chr7 (18-307)||(46516112-46516403)
chr7 (65-290)||(55970-56195)
chr7 (171-307)||(49091665-49091803)
chr7 (215-307)||(24261311-24261403)
chr7 (215-307)||(24266190-24266282)
chr7 (20-280)||(4796477-4796732)
chr7 (181-280)||(33332415-33332515)
chr7 (19-82)||(12397091-12397153)
chr7 (19-82)||(31109427-31109489)
chr7 (171-289)||(35960839-35960958)
chr7 (19-80)||(4873310-4873370)
chr7 (19-80)||(12406513-12406573)
chr7 (243-307)||(21812254-21812318)
chr7 (18-280)||(23402820-23403078)
chr7 (19-82)||(24024170-24024232)
chr7 (228-290)||(28617238-28617300)
chr7 (18-109)||(9184981-9185068)
chr7 (18-105)||(44847932-44848015)
chr7 (369-413)||(1533598-1533642)
chr7 (228-276)||(9185178-9185226)
chr7 (369-413)||(18413541-18413585)
chr7 (369-413)||(21639708-21639752)
chr7 (369-413)||(21645906-21645950)
chr7 (37-81)||(21812099-21812143)
chr7 (18-109)||(9189813-9189901)
chr7 (39-81)||(19992493-19992535)
chr7 (18-109)||(3047457-3047544)
chr7 (369-413)||(2479237-2479281)
chr7 (214-272)||(5817268-5817327)
chr7 (369-412)||(18408665-18408708)
chr7 (373-410)||(20357707-20357744)
chr7 (18-109)||(33332257-33332344)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (15-307)||(11098724-11099019)
chr2 (15-307)||(14291493-14291788)
chr2 (15-307)||(9296199-9296493)
chr2 (18-307)||(3491755-3492044)
chr2 (99-307)||(25398500-25398710)
chr2 (99-307)||(25403638-25403848)
chr2 (18-307)||(28258984-28259270)
chr2 (99-280)||(25407654-25407837)
chr2 (18-290)||(36757569-36757837)
chr2 (18-307)||(40738848-40739124)
chr2 (19-306)||(23078279-23078562)
chr2 (20-307)||(8040064-8040354)
chr2 (18-307)||(13569332-13569619)
chr2 (18-307)||(14698816-14699100)
chr2 (18-290)||(34388880-34389141)
chr2 (21-307)||(21629948-21630232)
chr2 (18-280)||(8389956-8390215)
chr2 (29-307)||(10707070-10707345)
chr2 (136-290)||(42039588-42039744)
chr2 (134-307)||(39811894-39812068)
chr2 (148-290)||(10445375-10445519)
chr2 (18-307)||(34682138-34682427)
chr2 (135-307)||(32246793-32246966)
chr2 (18-289)||(31056067-31056335)
chr2 (215-307)||(44312613-44312704)
chr2 (18-290)||(33118158-33118425)
chr2 (18-307)||(17865207-17865495)
chr2 (18-290)||(39482953-39483223)
chr2 (215-307)||(19344426-19344518)
chr2 (215-307)||(19349284-19349376)
chr2 (18-307)||(20522224-20522512)
chr2 (18-307)||(33528431-33528714)
chr2 (18-88)||(25409854-25409923)
chr2 (19-82)||(39811832-39811894)
chr2 (214-279)||(16940207-16940273)
chr2 (214-279)||(17010872-17010938)
chr2 (214-290)||(2869691-2869768)
chr2 (18-109)||(10445274-10445361)
chr2 (369-413)||(3491651-3491695)
chr2 (369-413)||(25398393-25398437)
chr2 (369-413)||(25403531-25403575)
chr2 (226-274)||(27149305-27149353)
chr2 (18-108)||(2837834-2837923)
chr2 (214-307)||(2838028-2838123)
chr2 (18-109)||(35397712-35397799)
chr2 (373-413)||(11099087-11099127)
chr2 (20-88)||(2869501-2869566)
chr2 (18-104)||(1344351-1344435)
chr2 (373-410)||(9296561-9296598)
chr2 (18-88)||(41586357-41586425)
chr2 (214-307)||(1345538-1345634)
chr2 (37-81)||(32246968-32247011)
[»] chr3 (70 HSPs)
chr3 (15-307)||(8477367-8477664)
chr3 (15-307)||(40372593-40372887)
chr3 (15-307)||(2671383-2671678)
chr3 (15-307)||(7167249-7167545)
chr3 (15-307)||(9091098-9091393)
chr3 (19-307)||(8738864-8739155)
chr3 (16-307)||(28503662-28503956)
chr3 (18-307)||(26928395-26928683)
chr3 (18-290)||(32143343-32143613)
chr3 (21-307)||(1305953-1306239)
chr3 (16-268)||(28501495-28501750)
chr3 (18-307)||(27974748-27975035)
chr3 (18-290)||(16264372-16264639)
chr3 (18-307)||(27986252-27986529)
chr3 (18-290)||(27452980-27453248)
chr3 (18-307)||(8370285-8370569)
chr3 (18-307)||(21711227-21711512)
chr3 (18-290)||(6794511-6794778)
chr3 (18-307)||(36029097-36029383)
chr3 (18-290)||(33386471-33386731)
chr3 (18-307)||(40592578-40592865)
chr3 (18-263)||(35925529-35925768)
chr3 (18-307)||(1736100-1736388)
chr3 (134-307)||(22173100-22173275)
chr3 (18-307)||(3715796-3716085)
chr3 (61-307)||(18552721-18552966)
chr3 (18-290)||(48438236-48438505)
chr3 (18-290)||(25795803-25796072)
chr3 (171-307)||(30709735-30709873)
chr3 (18-228)||(39032351-39032555)
chr3 (216-307)||(18656440-18656530)
chr3 (18-290)||(24694962-24695229)
chr3 (215-307)||(2672919-2673011)
chr3 (215-307)||(2677075-2677167)
chr3 (215-307)||(8512222-8512314)
chr3 (215-307)||(8517102-8517194)
chr3 (215-307)||(32475490-32475580)
chr3 (215-307)||(32480348-32480438)
chr3 (171-290)||(40844674-40844793)
chr3 (18-279)||(26299021-26299278)
chr3 (22-307)||(47923704-47923989)
chr3 (19-82)||(22173038-22173100)
chr3 (18-290)||(3323487-3323755)
chr3 (171-307)||(3328302-3328439)
chr3 (214-290)||(37466313-37466389)
chr3 (18-229)||(47649653-47649862)
chr3 (171-307)||(1417436-1417573)
chr3 (215-307)||(24968112-24968204)
chr3 (18-88)||(4386773-4386840)
chr3 (214-276)||(4386915-4386978)
chr3 (228-290)||(39039995-39040057)
chr3 (18-109)||(3328153-3328240)
chr3 (21-257)||(8126685-8126917)
chr3 (369-413)||(1305849-1305893)
chr3 (369-413)||(1309754-1309798)
chr3 (369-413)||(8477261-8477305)
chr3 (18-82)||(23392106-23392167)
chr3 (214-270)||(21353604-21353661)
chr3 (263-307)||(10207939-10207983)
chr3 (369-413)||(32143221-32143265)
chr3 (18-116)||(37725871-37725965)
chr3 (18-79)||(23410529-23410587)
chr3 (18-109)||(1417287-1417374)
chr3 (18-109)||(25929192-25929278)
chr3 (373-413)||(7167141-7167180)
chr3 (37-81)||(18656614-18656657)
chr3 (18-88)||(27026929-27026996)
chr3 (18-88)||(27038274-27038341)
chr3 (369-413)||(27986589-27986633)
chr3 (244-276)||(53894087-53894119)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (15-307)||(24135853-24136146)
chr5 (18-307)||(38219403-38219692)
chr5 (18-307)||(35387667-35387956)
chr5 (15-307)||(31180219-31180513)
chr5 (18-307)||(15464536-15464824)
chr5 (19-307)||(30631411-30631702)
chr5 (18-307)||(9353139-9353425)
chr5 (18-307)||(36932155-36932443)
chr5 (18-307)||(14520234-14520520)
chr5 (118-307)||(38192178-38192369)
chr5 (18-307)||(11916779-11917065)
chr5 (18-307)||(10281755-10282044)
chr5 (18-280)||(12083984-12084240)
chr5 (134-307)||(1457067-1457242)
chr5 (18-307)||(17003766-17004053)
chr5 (134-307)||(43592284-43592459)
chr5 (134-307)||(15044691-15044865)
chr5 (134-307)||(27449819-27449994)
chr5 (61-290)||(3880321-3880550)
chr5 (134-307)||(27444975-27445150)
chr5 (134-299)||(43598737-43598904)
chr5 (134-299)||(43604229-43604396)
chr5 (134-299)||(43609721-43609888)
chr5 (18-307)||(19588750-19589035)
chr5 (139-307)||(28807485-28807652)
chr5 (217-307)||(37556613-37556702)
chr5 (217-307)||(37561435-37561524)
chr5 (215-307)||(2785380-2785472)
chr5 (215-307)||(31396981-31397073)
chr5 (215-307)||(31401838-31401930)
chr5 (215-307)||(33768184-33768276)
chr5 (215-307)||(33791321-33791413)
chr5 (21-290)||(28832281-28832544)
chr5 (19-82)||(15044865-15044928)
chr5 (20-307)||(31300404-31300689)
chr5 (171-280)||(42127366-42127475)
chr5 (19-82)||(1457005-1457067)
chr5 (19-82)||(27445150-27445212)
chr5 (19-82)||(27449994-27450056)
chr5 (19-82)||(43592459-43592521)
chr5 (19-82)||(43598904-43598966)
chr5 (19-82)||(43604396-43604458)
chr5 (19-82)||(43609888-43609950)
chr5 (20-273)||(11181641-11181890)
chr5 (17-109)||(24553333-24553421)
chr5 (203-276)||(6741888-6741962)
chr5 (214-290)||(24553506-24553581)
chr5 (369-413)||(38192071-38192115)
chr5 (369-413)||(38219296-38219340)
chr5 (18-109)||(7160711-7160798)
chr5 (369-413)||(9353485-9353529)
chr5 (369-413)||(15464431-15464475)
chr5 (20-109)||(42127179-42127264)
chr5 (234-276)||(33030959-33031001)
chr5 (369-410)||(24135751-24135791)
chr5 (372-413)||(35387562-35387603)
chr5 (227-271)||(2630272-2630316)
chr5 (248-276)||(4410241-4410269)
chr5 (37-81)||(28807436-28807479)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (15-307)||(24741945-24742240)
chr4 (15-307)||(29760646-29760941)
chr4 (18-307)||(28468341-28468621)
chr4 (18-307)||(5396478-5396764)
chr4 (18-307)||(31985440-31985726)
chr4 (18-289)||(16623100-16623367)
chr4 (18-306)||(36315037-36315321)
chr4 (18-306)||(36329246-36329530)
chr4 (18-280)||(3777581-3777839)
chr4 (18-290)||(5143281-5143550)
chr4 (18-307)||(5147681-5147968)
chr4 (18-307)||(10047383-10047671)
chr4 (135-307)||(45357203-45357376)
chr4 (134-307)||(9224312-9224487)
chr4 (18-307)||(38152245-38152532)
chr4 (134-307)||(51520462-51520637)
chr4 (134-307)||(3814029-3814202)
chr4 (134-307)||(9229099-9229274)
chr4 (18-229)||(8689303-8689509)
chr4 (18-290)||(24333831-24334103)
chr4 (149-307)||(5732670-5732828)
chr4 (135-307)||(45347723-45347897)
chr4 (18-290)||(5269007-5269266)
chr4 (22-306)||(6743226-6743507)
chr4 (171-307)||(3796474-3796612)
chr4 (18-160)||(16628679-16628815)
chr4 (215-299)||(56146700-56146783)
chr4 (216-307)||(18855732-18855821)
chr4 (185-279)||(16630649-16630744)
chr4 (214-307)||(39245998-39246093)
chr4 (19-82)||(51520637-51520699)
chr4 (19-82)||(9224250-9224312)
chr4 (19-82)||(9229037-9229099)
chr4 (19-82)||(18712609-18712671)
chr4 (20-269)||(42599383-42599626)
chr4 (18-290)||(25861840-25862097)
chr4 (214-290)||(5112259-5112336)
chr4 (22-109)||(5112440-5112523)
chr4 (369-413)||(28468681-28468725)
chr4 (200-274)||(1983284-1983359)
chr4 (215-276)||(34495822-34495884)
chr4 (171-272)||(54867223-54867325)
chr4 (214-290)||(39774303-39774380)
chr4 (26-82)||(3814202-3814257)
chr4 (373-413)||(24741837-24741877)
chr4 (37-81)||(45347678-45347721)
chr4 (228-290)||(8689498-8689558)
chr4 (18-82)||(6542378-6542439)
chr4 (18-82)||(51336974-51337035)
chr4 (37-81)||(5732844-5732887)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (18-307)||(24202572-24202861)
chr1 (15-307)||(24787161-24787456)
chr1 (18-307)||(19358647-19358935)
chr1 (18-307)||(19361236-19361524)
chr1 (60-307)||(19379916-19380164)
chr1 (20-290)||(3281730-3281995)
chr1 (18-307)||(26644705-26644990)
chr1 (18-289)||(13604429-13604697)
chr1 (18-280)||(21536377-21536634)
chr1 (18-208)||(19366111-19366300)
chr1 (20-307)||(37069774-37070055)
chr1 (18-307)||(47703740-47704029)
chr1 (134-307)||(41398241-41398415)
chr1 (18-290)||(29651833-29652103)
chr1 (134-307)||(41390586-41390760)
chr1 (44-290)||(16124347-16124591)
chr1 (19-307)||(9476265-9476551)
chr1 (20-307)||(13598402-13598688)
chr1 (18-307)||(19072932-19073220)
chr1 (18-307)||(19120822-19121110)
chr1 (18-290)||(32889461-32889728)
chr1 (216-307)||(25445079-25445169)
chr1 (18-307)||(47098632-47098917)
chr1 (216-307)||(39445505-39445594)
chr1 (216-307)||(44023864-44023953)
chr1 (215-307)||(43988452-43988544)
chr1 (216-307)||(1055002-1055091)
chr1 (214-280)||(27104370-27104437)
chr1 (19-82)||(41398415-41398477)
chr1 (18-243)||(40816621-40816842)
chr1 (22-82)||(41390760-41390819)
chr1 (227-290)||(775694-775757)
chr1 (214-307)||(47102840-47102934)
chr1 (18-109)||(47102646-47102733)
chr1 (20-105)||(27104211-27104291)
chr1 (25-85)||(22819657-22819714)
chr1 (214-258)||(48382479-48382524)
chr1 (214-273)||(22819468-22819528)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (15-307)||(36979382-36979676)
chr8 (15-307)||(30655651-30655946)
chr8 (15-307)||(4759871-4760167)
chr8 (18-307)||(1261757-1262046)
chr8 (15-307)||(18870358-18870654)
chr8 (15-307)||(10688937-10689235)
chr8 (15-307)||(18852964-18853260)
chr8 (15-307)||(33037605-33037898)
chr8 (15-307)||(6311302-6311598)
chr8 (21-290)||(31071035-31071304)
chr8 (18-307)||(26287906-26288184)
chr8 (18-307)||(26301163-26301441)
chr8 (18-307)||(26313157-26313435)
chr8 (18-290)||(4456050-4456318)
chr8 (18-307)||(7412345-7412630)
chr8 (18-290)||(19175561-19175829)
chr8 (18-307)||(23799383-23799670)
chr8 (18-307)||(26403034-26403323)
chr8 (134-307)||(25328184-25328358)
chr8 (134-307)||(7289831-7290006)
chr8 (18-307)||(5702287-5702576)
chr8 (171-290)||(19752349-19752469)
chr8 (18-290)||(6127243-6127515)
chr8 (215-307)||(10684252-10684344)
chr8 (215-307)||(35745396-35745488)
chr8 (216-307)||(39784813-39784902)
chr8 (18-307)||(4696415-4696689)
chr8 (19-82)||(7289769-7289831)
chr8 (19-82)||(25327996-25328058)
chr8 (19-82)||(25328122-25328184)
chr8 (200-272)||(6813723-6813796)
chr8 (22-109)||(9054231-9054314)
chr8 (369-413)||(1262106-1262150)
chr8 (248-307)||(9765852-9765912)
chr8 (369-413)||(26287801-26287845)
chr8 (369-413)||(26313052-26313096)
chr8 (369-413)||(31071383-31071427)
chr8 (214-276)||(3051156-3051219)
chr8 (214-290)||(9054835-9054912)
chr8 (18-109)||(19752201-19752288)
chr8 (18-135)||(3051296-3051410)
chr8 (373-413)||(4760236-4760276)
chr8 (373-413)||(36979274-36979314)
chr8 (248-280)||(18810982-18811014)
chr8 (37-81)||(39784685-39784728)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (18-307)||(17755-18044)
scaffold0188 (18-307)||(23848-24137)
scaffold0188 (369-413)||(18105-18150)
scaffold0188 (369-413)||(24198-24243)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (18-307)||(8224-8512)
[»] scaffold0087 (3 HSPs)
scaffold0087 (18-307)||(43768-44054)
scaffold0087 (18-307)||(36639-36925)
scaffold0087 (369-413)||(44114-44158)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (18-289)||(133086-133354)
scaffold0006 (20-307)||(5687-5973)
scaffold0006 (18-290)||(2514-2784)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (18-307)||(85687-85973)
[»] scaffold0135 (2 HSPs)
scaffold0135 (134-307)||(34967-35142)
scaffold0135 (19-82)||(34905-34967)
[»] scaffold0355 (2 HSPs)
scaffold0355 (134-307)||(9549-9722)
scaffold0355 (19-82)||(3692-3754)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (20-290)||(10751-11021)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (215-307)||(14297-14389)
scaffold0197 (215-307)||(19153-19245)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (216-307)||(368-457)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (215-307)||(2239-2331)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (215-307)||(148944-149036)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (243-307)||(181980-182044)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (172-289)||(17286-17404)
[»] scaffold0098 (3 HSPs)
scaffold0098 (228-289)||(45276-45337)
scaffold0098 (18-136)||(45374-45489)
scaffold0098 (369-413)||(45153-45197)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (248-276)||(11505-11533)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 5674567 - 5674862
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5674567 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaag 5674665  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttg-ctcttgtgtaagcttgcaagc-- 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  5674666 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaagcttgcaagcta 5674765  T
Q  211 ttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5674766 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 5674862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 5757285 - 5757571
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  5757285 agggttgagtgtctttgtatttaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 5757380  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    |||   ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  5757381 ccttccgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagagtggaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtataagcttgcaagctatttt 5757479  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  5757480 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5757571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22709300 - 22709041
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  22709300 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaactt 22709205  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22709204 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 22709105  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattg 289  Q
            || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22709104 --------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattg 22709041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21356318 - 21356040
Alignment:
Q  27 tgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcctctagtg 126  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| |||||||||| | |||    
T  21356318 tgtctttgtagtgaggatctcttgggttagg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcatcattggaagaatcaaaagcttccttttgtg 21356223  T
Q  127 ccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttttcttgtaac 224  Q
     ||| ||||| ||||||| | |||| ||||||| | ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21356222 tcttttcttt-agggttcattattgagagagtgagaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttttcttgtaac 21356124  T
Q  225 tctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  21356123 tcttagtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21356040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 31086281 - 31086566
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |   ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  31086281 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttaggttgag---aaacattgtaaacaccttgggttgtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 31086376  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    | | |  ||  |||||||  ||| ||| |  | |||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||    
T  31086377 ctttttatgttttctctt--aggattcattat-tgagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttataagctaattt 31086473  T
Q  217 cttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  31086474 cttgtaactcctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaa 31086566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 5572050 - 5572316
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    ||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||    
T  5572050 agggttgggtgtctttgtagtggggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcactattggaatgatcaaaagctt 5572145  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagg-gtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  |||| ||| | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||    
T  5572146 ccttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgacacaaaatgcgtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaattt 5572241  T
Q  217 cttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  5572242 cttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattgg 5572316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11857154 - 11856979
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  11857154 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 11857055  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11857054 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 11856979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 22010602 - 22010777
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  22010602 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 22010701  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22010702 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 22010777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 18233096 - 18232867
Alignment:
Q  61 aaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtgg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| ||||    
T  18233096 aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgg 18233000  T
Q  160 ggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggag 257  Q
    |  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  18232999 gtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctgatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattggag 18232900  T
Q  258 agctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
     | ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18232899 ggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 307
Target Start/End: Original strand, 28155477 - 28155649
Alignment:
Q  135 tttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgta 232  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||| ||||| |||||   ||||||||||  ||||||    
T  28155477 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctaaattcttgtaaccttttgta 28155575  T
Q  233 acactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28155576 acactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 28155649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31979802 - 31979517
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  31979802 agggttgagtgtctttgtagtgaggttcttttgggttgag---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 31979707  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa--gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    ||| | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  |||| |||  ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||| |  ||    
T  31979706 ccttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgacacaaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagttaatt 31979611  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| | || ||||||||||||    
T  31979610 tcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 14737482 - 14737656
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || | ||||| ||||| | |||    |||||||||  |||||    
T  14737482 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgt 14737581  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  14737582 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaa 14737656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28184684 - 28184510
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    | |||||||  |||||    
T  28184684 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtgttgtaaccttttgt 28184585  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28184584 aacactttc-tcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 28184510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 14742342 - 14742516
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || | ||||| ||||| | |||    |||||||||  |||||    
T  14742342 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgt 14742441  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  14742442 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaa 14742516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 21801149 - 21801419
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||| |    
T  21801149 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaacattggaaggatcaaaaag 21801244  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||||| | |||  |||||||  ||||||| | ||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  || |||||| |||| |||||||||  ||| |      
T  21801245 cttccttttgtgttttctctt--agggttcat-ttgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaagtcttgttcttttgtaagcttataagataa 21801341  T
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  21801342 tttcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattgg 21801419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6005514 - 6005422
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6005514 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 6005422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 33330433 - 33330525
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33330433 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 33330525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 10077120 - 10077240
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  10077120 gggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaacttttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctc 10077219  T
Q  270 ccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  10077220 ccccagattaggtcatattgg 10077240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16838841 - 16838749
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16838841 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaa 16838749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 33335930 - 33336022
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||    
T  33335930 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaa 33336022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6438595 - 6438506
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6438595 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaa 6438506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11857216 - 11857154
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11857216 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 11857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 14737420 - 14737482
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14737420 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 14737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 22010540 - 22010602
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22010540 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4630203 - 4629958
Alignment:
Q  61 aaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggg 160  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||||  ||| ||| | ||| |||  ||||    
T  4630203 aaacattttaaacacattgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttccttttgtgttttctctt--aggattcat-ttgagagtttggg 4630108  T
Q  161 gaacaccaaag-ggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggaga 258  Q
      |||| |||  |||||||  ||||||||| |||| |||||||||  ||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  4630107 tgacacaaaataggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagttaatttcttgtaactattttgtaacactttcatcttagtggattggaga 4630008  T
Q  259 gctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  4630007 gctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaa 4629958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22963989 - 22963739
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||  ||    
T  22963989 agggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaattt 22963894  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    ||  | |||  || ||||||||| ||| | |||| ||| ||| |  |||  ||| ||||||||  || | |||| | ||||||||| ||  |||||  ||    
T  22963893 ccctttgtg--ttttcttttaggattcattattgagagtgtgagtgacaaaaaatgggtagaaattacggcttgtt-ttgtgtaaggttataagctaatt 22963797  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22963796 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccc 22963739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 272
Target Start/End: Original strand, 23824404 - 23824654
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||  ||    
T  23824404 agggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttggattggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaattt 23824499  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    ||  | |||  || ||||||||| ||| | |||| ||| ||| |  |||  ||| ||||||||  || | |||| | ||||||||| ||  |||||  ||    
T  23824500 ccctttgtg--ttttcttttaggattcattattgagagtgtgagtgacaaaaaatgggtagaaattacggcttgtt-ttgtgtaaggttataagctaatt 23824596  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccc 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23824597 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccc 23824654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 14742280 - 14742342
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14742280 gggttaagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcactttgggt 14742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 5017303 - 5017390
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||    
T  5017303 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtaatga-gatttcaccattggaaggatc 5017390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 31936865 - 31936774
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||    
T  31936865 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctattgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaa 31936774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 5674924 - 5674968
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5674924 ggtgttgctctacactagactagggctggttttgttgttgttgct 5674968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 28184749 - 28184684
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggg--aaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||    
T  28184749 gggttgagggtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaaaacatagtaatcaccttgggt 28184684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 24435779 - 24436046
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  24435779 agggttgagtgtctttgt-gtgaggttctcttgagttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 24435873  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa--gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| |||  ||| |||  |||||  | |  |||  ||||||||  ||||||||| | || |||||||||  |||||  |    
T  24435874 tccttttgtgttttctctt--aggattc--attatgaatgtgggtgatataaaaatgggtagaaattaggtcttgtttttttgtaagcttataagctaat 24435969  T
Q  215 ttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  24435970 ttcttgtaattcatttgtaacattttcatcctagtggatcggagggctgctctctcccctagagtaggtcatattgg 24436046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31936671 - 31936609
Alignment:
Q  228 ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||    
T  31936671 ttgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattgg 31936609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 280
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017534
Alignment:
Q  228 ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattag 5017534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21355980 - 21355936
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21355980 ggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgct 21355936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14521924 - 14521877
Alignment:
Q  61 aaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggat 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  14521924 aaacattgtaaacaccttgggtagtgagaatttcaccattggaaggat 14521877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 5757631 - 5757675
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  5757631 ggtgttgctctacactagattaggtctgtttttgttgttgttgct 5757675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Original strand, 28155432 - 28155475
Alignment:
Q  37 gagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 81  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28155432 gagagtgtttcttaggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 28155475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 57)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 1533241 - 1533536
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1533241 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaag 1533339  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggg-gaacaccaaagggtagaatctaggtcttg-ctcttgtgtaagcttgcaagc-- 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||      
T  1533340 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggaaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaagcttgcaagcta 1533439  T
Q  211 ttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1533440 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 1533536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21640102 - 21639813
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21640102 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 21640005  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21640004 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 21639905  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21639904 tcttgtaaccctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 21639813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2058268 - 2057970
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactatt---ggaaggatcta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   || ||||||||    
T  2058268 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgggggaggatcta 2058170  T
Q  112 aagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaag 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |    
T  2058169 aagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaatg 2058070  T
Q  210 ctttt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2058069 ctattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 2057970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21646300 - 21646011
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||    
T  21646300 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaatctt 21646203  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21646202 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 21646103  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21646102 tcttgtaaccctttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 21646011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 20357344 - 20357639
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20357344 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 20357442  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgt-aagcttgcaagc- 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| | || |||||||| ||||||| | ||     
T  20357443 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcatgttcttgtgtaaagcttgaaggct 20357542  T
Q  211 -ttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20357543 attgtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 20357639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18409056 - 18408768
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||  |||||||| ||||||    
T  18409056 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattaaaaggatcttaagctt 18408959  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  18408958 cctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt 18408860  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18408859 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18408768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18413932 - 18413645
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18413932 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg-aaaaacaatgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcttaagctt 18413835  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  18413834 cctcttgtgtcttc-cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaatctatttt 18413736  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18413735 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18413645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21983536 - 21983288
Alignment:
Q  61 aaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggg 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  21983536 aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcataagcttccttttgtgttttctcttt-agggttcatattttgagagtggg 21983439  T
Q  161 gaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt--gtaacactttcatcatattggattggag 257  Q
      |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21983438 tgacacaaaatgggtagaaactaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttcttgtaactctttttgtaacactttcatcatagtggattggag 21983339  T
Q  258 agctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  21983338 agctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21983288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2479626 - 2479360
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  2479626 agggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 2479531  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| |  |  ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2479530 ccttttatatcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggaaacacacatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 2479432  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattg 289  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||    
T  2479431 cttataactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattg 2479360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 289
Target Start/End: Original strand, 44848567 - 44848758
Alignment:
Q  98 attggaaggatctaaagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgt 196  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| || |||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||  ||||||    
T  44848567 attggaaggatcaaaagcttccttttgtgtcttctcttt-agagttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttattcttgt 44848665  T
Q  197 gtaagcttgcaagcttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  44848666 gtaagcttgcaagcttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattg 44848758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29160096 - 29159807
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gc 115  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||| ||    
T  29160096 gggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaacattggaaggatcaaaaagc 29160001  T
Q  116 ttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa--gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    ||||| | |||  |||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  29160000 ttccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaa 29159903  T
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  29159902 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 29159807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21989194 - 21988912
Alignment:
Q  22 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcctc 121  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | || || ||||||||||||  |||||||||     
T  21989194 ttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-attttaccattggaaggatcataagcttcctt 21989099  T
Q  122 tagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttg 220  Q
    || ||  |||||||| ||||||| |||| | ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||| ||  |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  21989098 tattgttttctcttt-agggttcatatttttagagtgggtgacacaaaatgggtagaaactaggttttattcttgtataagcttgcaatctattttcttg 21989000  T
Q  221 taactc--tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||| |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  21988999 taactctttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttg--ctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21988912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2580679 - 2580412
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||| |||    
T  2580679 agggttgagtgtctttgt-gtgaggttctcttgggttgg---aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattgaaaggatcaaaaagct 2580585  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa---gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  | |  |||   |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  2580584 tccttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctat 2580489  T
Q  214 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  2580488 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattgg 2580412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 133 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12406512 - 12406336
Alignment:
Q  133 cttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactcttt 229  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  |||    
T  12406512 cttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaacctttt 12406413  T
Q  230 gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12406412 gtaacactttc-tcatattggattggagagctattctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 12406336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 2647504 - 2647771
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag-ct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||  ||    
T  2647504 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacatggtaagcaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaaact 2647599  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    || | | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||    
T  2647600 tcattttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatt 2647695  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  2647696 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgg 2647771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 47263956 - 47263682
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||   |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  47263956 agggttgagtgtctttgtagtgagaatctcttcggttggg---aaacattgtaaataccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 47263861  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||| ||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47263860 ccttttgtgtcttctattt-agggttcattattgagagagtgggaaacacaaatggatagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 47263762  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |          || |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  47263761 c----------ttataacactttcatcatagtggattggagagctg--ctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47263682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 24024232 - 24024406
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    |||||||||  |||||    
T  24024232 ttttagggttcatcgtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaacattttgt 24024331  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24024332 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24024406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 307
Target Start/End: Original strand, 9189963 - 9190101
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9189963 gggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctc 9190062  T
Q  270 ccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||| |||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  9190063 ccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12397091 - 12396916
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| | ||  | |||    ||||||||||  ||||    
T  12397091 ttttagggttcatattgtgatagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagattaaaggctagagttcttgtaaccttttg 12396992  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12396991 taacactttc-tcatattggattggagagctgttctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 12396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20284379 - 20284093
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  20284379 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 20284284  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa---gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  | |  |||   ||||||||  |||| |||| |||| |||||||||  |||||      
T  20284283 tccttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgatatgaaaaaagggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaa 20284188  T
Q  214 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  20284187 tttcttgtaacgcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19992408 - 19992318
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19992408 tcttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 19992318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 31109489 - 31109663
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||  ||| || |||| || ||||| | |||    |||||||||  |||||    
T  31109489 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaatatcaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgt 31109588  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31109589 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 31109663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4866814 - 4866735
Alignment:
Q  227 tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4866814 tttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 4866735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16880169 - 16880078
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16880169 ttcttgtaactctttgtaaaacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 16880078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16885025 - 16884934
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16885025 ttcttgtaactctttgtaaaacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 16884934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 46516112 - 46516403
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  46516112 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgagttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 46516207  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttc----gtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct 211  Q
    || | | |||  |||||||  | | |||    ||   ||| | |||||  |||| ||| ||||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||||    
T  46516208 tcattttgtgttttctctt--aagattcattggtggagtgtgtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttttaagct 46516305  T
Q  212 tttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  46516306 aatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 46516403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 56195 - 55970
Alignment:
Q  65 attgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtgggga 162  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| | | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||      
T  56195 attgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagcttctttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtg 56099  T
Q  163 acaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagc 260  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  56098 acacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggc 55999  T
Q  261 tgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  55998 tgctctct-ccccagattaggtcatattgg 55970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 49091803 - 49091665
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  49091803 gggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataaggtaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctt 49091704  T
Q  270 ccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||  |||||||| || | ||||||||||||    
T  49091703 ccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaa 49091665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 24261311 - 24261403
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24261311 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 24261403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 24266190 - 24266282
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24266190 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 24266282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 280
Target Start/End: Original strand, 4796477 - 4796732
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gcttc 118  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  4796477 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg---aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagcttc 4796572  T
Q  119 ctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
     | | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||  || ||  |||| ||| ||||| ||   |||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||    
T  4796573 tttttgtgttttctctt--aggattc--attgagaatgtaggtgacacaaaatgggtataaatgaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttc 4796668  T
Q  218 ttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  4796669 ttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattag 4796732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 280
Target Start/End: Original strand, 33332415 - 33332515
Alignment:
Q  181 taggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 279  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33332415 taggtcttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagatta 33332514  T
Q  280 g 280  Q
    |    
T  33332515 g 33332515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12397153 - 12397091
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12397153 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 12397091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 31109427 - 31109489
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31109427 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 31109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35960958 - 35960839
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||  |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  35960958 gggtagaaattaggtattgttcttttgtaagcttataagctaatttcttctaactcatttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctc 35960859  T
Q  270 ccccagattagaccatattg 289  Q
    |||||||||||  |||||||    
T  35960858 ccccagattaggtcatattg 35960839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4873370 - 4873310
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgg 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4873370 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgg 4873310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12406573 - 12406513
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgg 80  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12406573 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgg 12406513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 243 - 307
Target Start/End: Original strand, 21812254 - 21812318
Alignment:
Q  243 catattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21812254 catattggattggaaagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 21812318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Original strand, 23402820 - 23403078
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  23402820 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaatgatcaaaaagct 23402915  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa---gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| ||| |  |    |||   ||||||||  |||| |||| |||| |||||||||  |||||      
T  23402916 tccttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgagtgatgtgaaaaatgggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaa 23403011  T
Q  214 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  23403012 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtagattggagggctgctcactccctcagattag 23403078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 24024170 - 24024232
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  24024170 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-tggaaaaacattgtaatcaccgtgggt 24024232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Original strand, 28617238 - 28617300
Alignment:
Q  228 ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28617238 ttgtatcactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattgg 28617300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 9184981 - 9185068
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  9184981 agggttgagtatctttgtagtaaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatc 9185068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 105
Target Start/End: Original strand, 44847932 - 44848015
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaag 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  44847932 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttggatagtga-gatttcaccattggaag 44848015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 1533598 - 1533642
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1533598 ggtgttgctctacactagactggggctggttttgttgttgttgct 1533642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 276
Target Start/End: Original strand, 9185178 - 9185226
Alignment:
Q  228 ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaga 276  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9185178 ttgtaacactttcatcttagtggattggagagcttctctctcccccaga 9185226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18413585 - 18413541
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18413585 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 18413541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21639752 - 21639708
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21639752 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 21639708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21645950 - 21645906
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  21645950 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 21645906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Original strand, 21812099 - 21812143
Alignment:
Q  37 gagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 81  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21812099 gagagtgtttcttaggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 21812143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 9189813 - 9189901
Alignment:
Q  18 agggttgagtgt-ctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  9189813 agggttgagtgttctttgtagtaaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatc 9189901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 19992535 - 19992493
Alignment:
Q  39 gagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 81  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992535 gagtgtttcttaggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 19992493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 3047544 - 3047457
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  3047544 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacactataatcatcttgggtagtga-gatttcatcattggaaggatc 3047457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2479281 - 2479237
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2479281 ggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgct 2479237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 272
Target Start/End: Original strand, 5817268 - 5817327
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccc 272  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  5817268 tttcttgtaacccctttgtatcactttcatattagtggattggagagctgctctctcccc 5817327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18408708 - 18408665
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgc 412  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  18408708 ggtgttgctctacactagactacggctgtttttgttgttgttgc 18408665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 410
Target Start/End: Original strand, 20357707 - 20357744
Alignment:
Q  373 ttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgtt 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20357707 ttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgtt 20357744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 33332257 - 33332344
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  33332257 agggttgagtgtttttgtagtaaggttctcttgggttgag---aaacattgtaaacatcttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatc 33332344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 11098724 - 11099019
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  11098724 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagtacattagttggaaggatctaaa 11098822  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||     
T  11098823 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgcaagcta 11098922  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11098923 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 11099019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14291788 - 14291493
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14291788 caaagggttgagcgtctttgtagatagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 14291690  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||     
T  14291689 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaggcta 14291590  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14291589 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 14291493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 9296199 - 9296493
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9296199 caaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctattgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaag 9296297  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagc--t 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||  |    
T  9296298 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtataagcttgaaggctat 9296397  T
Q  212 tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9296398 tgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 9296493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3492044 - 3491755
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  3492044 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgga-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-attccaccattggaaggatcttaagctt 3491947  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3491946 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 3491847  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3491846 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 3491755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25398710 - 25398500
Alignment:
Q  99 ttggaaggatctaaagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  25398710 ttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtg 25398611  T
Q  198 taagcttgcaagct-tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacc 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  25398610 taagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaac 25398511  T
Q  297 tgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||    
T  25398510 tgggtcaacaa 25398500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 25403848 - 25403638
Alignment:
Q  99 ttggaaggatctaaagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  25403848 ttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtg 25403749  T
Q  198 taagcttgcaagct-tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacc 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  25403748 taagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaac 25403649  T
Q  297 tgggtcaacaa 307  Q
    || ||||||||    
T  25403648 tgagtcaacaa 25403638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 28258984 - 28259270
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  28258984 agggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 28259079  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    ||| | ||| |||||||||  ||||   ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28259080 ccttttgtgtcttctctttaggggtcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattagatcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttc 28259179  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  28259180 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 28259270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25407837 - 25407654
Alignment:
Q  99 ttggaaggatctaaagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  25407837 ttggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggagaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtg 25407738  T
Q  198 taagcttgcaagct-tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407737 taagcttgcaagctatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattag 25407654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 36757569 - 36757837
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  36757569 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 36757664  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36757665 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggttttgttcttgtgtaagcttgaaagctttttt 36757763  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||||    
T  36757764 cttataactctttgaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattgg 36757837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40739124 - 40738848
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  40739124 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 40739029  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
     || | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40739028 actattgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaagacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 40738929  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
            || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  40738928 --------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaa 40738848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 306
Target Start/End: Original strand, 23078279 - 23078562
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttc 118  Q
    |||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||||||||    
T  23078279 gggttgagtgtctttgtgatgagaatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcatcattggaaggatcaaaagcttc 23078374  T
Q  119 ctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    || | ||| ||||||||  ||||||| | |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23078375 cttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttc 23078472  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggct-gacctgggtcaaca 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||| | || |||||||||||    
T  23078473 ttgtaactctttctaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaaca 23078562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8040354 - 8040064
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  8040354 ggttgagtgtctttgtagtgaagttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 8040259  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| |  ||  || ||| ||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||    
T  8040258 tccttttatgtttt-tctcttaggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatt 8040160  T
Q  216 tcttgtaactct---ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  8040159 tcttgtaactctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13569619 - 13569332
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  13569619 agggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattataaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 13569524  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacac-caaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||  |||||  ||    
T  13569523 tccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacaaacaaagggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaaacttataagctaatt 13569426  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  13569425 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13569332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 14698816 - 14699100
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  14698816 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctctcgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcactattggaaggatcaaaaagct 14698911  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||    
T  14698912 tccttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatt 14699007  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  14699008 tcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 34389141 - 34388880
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagct 116  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  34389141 agggttgtgtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaaagct 34389046  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  || ||| ||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||   ||     ||    
T  34389045 tccttttgtg--ttttctcttaggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagct---aa-----tt 34388956  T
Q  216 tcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34388955 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattgg 34388880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21630232 - 21629948
Alignment:
Q  21 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gcttcc 119  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  21630232 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagcttcc 21630137  T
Q  120 tctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    | | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  || |||||| ||||||||||||||  || ||  ||||    
T  21630136 ttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttataaactaatttc 21630039  T
Q  218 ttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  21630038 ttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 21629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Original strand, 8389956 - 8390215
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   ||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||| ||||||| | || || |||||||| ||| ||| |||    
T  8389956 agggttgagggtctttgtagtgatgatctcttgggttagg---aaacattgtaaacaccttggatagtgag-attttaccattggaagaatcaaaaagct 8390051  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||||| |||  |||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||    
T  8390052 tcctcttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgcaagcttgtaagctaatt 8390149  T
Q  216 tcttgtaactctttgt-aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8390150 tcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattag 8390215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 307
Target Start/End: Original strand, 10707070 - 10707345
Alignment:
Q  29 tctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gcttcctctagtgc 127  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||| ||| ||||||| | |||     
T  10707070 tctttgtagtgaggatctcttgggttgag---aaacattgtaaacaccttgggtagttag-atttcaccattagaaggatcaaaaagcttccttttgtgt 10707165  T
Q  128 cttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactc- 226  Q
     |||||||  ||| ||| |||||||||||||||  ||||  | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  10707166 tttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacagatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatttcttgtaactct 10707263  T
Q  227 tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  10707264 tttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10707345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 290
Target Start/End: Original strand, 42039588 - 42039744
Alignment:
Q  136 ttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt-ttttcttgtaactctttgtaa 233  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  42039588 ttaggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgtttttgtgtaagcttgcaagctaattttcttgtaactcttcgtaa 42039687  T
Q  234 cactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  42039688 cactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattgg 42039744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 39811894 - 39812068
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    |||||||||  |||||    
T  39811894 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgt 39811993  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  39811994 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaa 39812068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 290
Target Start/End: Original strand, 10445375 - 10445519
Alignment:
Q  148 ttgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcat 245  Q
    |||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10445375 ttgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagattgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcataat 10445474  T
Q  246 attggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10445475 agtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 10445519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 34682138 - 34682427
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttggg--ttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |  ||||   |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | | |||||||| ||| |    
T  34682138 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagagttgg---aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccacttgaaggatcaaaatg 34682233  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
     ||||| | |||  |||||||  ||| |||   |||||||||||||  |||| ||| ||||||||  || |||||| |||||||||||| || |||||      
T  34682234 tttccttttgtgttttctctt--aggattcaccttgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcctgtaagctaa 34682331  T
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | || ||||||||||||    
T  34682332 tttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32246966 - 32246793
Alignment:
Q  135 tttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgta 232  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||| ||||| |||||    |||||||||  ||||||    
T  32246966 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtataatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgta 32246867  T
Q  233 acactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||    
T  32246866 acactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaacaaggtcaacaa 32246793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31056335 - 31056067
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||| |    
T  31056335 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattgaaaggatcaaaaag 31056240  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||||| | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||      
T  31056239 cttccttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaa 31056144  T
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattg 289  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  31056143 tttattgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattg 31056067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 44312613 - 44312704
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44312613 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 44312704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33118425 - 33118158
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||| |||    
T  33118425 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggggaa---cattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcgccattggaaggatcaaaaagct 33118330  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  |||||||  | | |||  |||| ||| | |||  |||| ||| ||||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||||  ||    
T  33118329 tccttttgtgttttctctt--aagattc--attgagagtgagggtgacacaaaatgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatt 33118234  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  33118233 tcttgtaactattttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 33118158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 17865495 - 17865207
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| | | |||||||| ||| |||    
T  17865495 agggttgagtgtctttgtagtgaagatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcacaaatagaaggatcaaaaagct 17865400  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaag-ggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| ||||   |||  |||  |||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||||  |    
T  17865399 tccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtggatgacataaaataggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat 17865302  T
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatatt-ggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||||    
T  17865301 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaa 17865207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 39483223 - 39482953
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag-ct 116  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| |||  ||    
T  39483223 agggttgagtgtctttgttgtgaggatctcttgggttggg---aaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaatgatcaaaaaact 39483128  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||  ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |    
T  39483127 tccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacataaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat 39483030  T
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  39483029 ttcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattgg 39482953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19344518 - 19344426
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19344518 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 19344426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19349376 - 19349284
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19349376 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 19349284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20522512 - 20522224
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||   || |||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||| |||    
T  20522512 agggttgagtgtctttgtagtgagtatctcttgggttggg---aagcattgtaaacaacttgggtagtgag-atttcaccatttgaatgatcaaaaagct 20522417  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  || ||||  |||  || | |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  || |||||| |||| |||||||||  || ||  |    
T  20522416 tccttttgtgttttttctt--aggactcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaagtcttgttcttttgtaagcttataatctaat 20522319  T
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  20522318 ttcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20522224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 33528431 - 33528714
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  33528431 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacacattgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaaagct 33528526  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttc-gtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  || ||| ||||| |||  ||||| |||  ||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||     |||||  |||||  |    
T  33528527 tccttttgtg--ttttctcttaggattcattattgagagtttgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttctt-----agcttataagctaat 33528619  T
Q  215 ttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  33528620 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 33528714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 25409923 - 25409854
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25409923 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggtt-gggaaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag 25409854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 39811832 - 39811894
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39811832 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggtt-gagaaaaacattgtaatcaccttgggt 39811894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 279
Target Start/End: Original strand, 16940207 - 16940273
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 279  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  16940207 tttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagatta 16940273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 279
Target Start/End: Original strand, 17010872 - 17010938
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 279  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17010872 tttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagatta 17010938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Original strand, 2869691 - 2869768
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  2869691 tttcttgtaactcctttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattgg 2869768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 10445274 - 10445361
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  10445274 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctctcgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatc 10445361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 3491695 - 3491651
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3491695 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 3491651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25398437 - 25398393
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25398437 ggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgct 25398393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25403575 - 25403531
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25403575 ggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgct 25403531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 274
Target Start/End: Original strand, 27149305 - 27149353
Alignment:
Q  226 ctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccccca 274  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27149305 ctttgtatcactttcattatagtggattggagagctgctctctccccca 27149353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 108
Target Start/End: Original strand, 2837834 - 2837923
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||    
T  2837834 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttggatagtgagaatttcaccattggaaggat 2837923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 307
Target Start/End: Original strand, 2838028 - 2838123
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  2838028 tttcttgtaactcatttgtatcactttcattttagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 2838123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 35397799 - 35397712
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||  ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  35397799 agggttgattgtctttgtagtgaggttcttctgggttgg---aaaacattgtaattaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatc 35397712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 413
Target Start/End: Original strand, 11099087 - 11099127
Alignment:
Q  373 ttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  11099087 ttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgct 11099127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Original strand, 2869501 - 2869566
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 88  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2869501 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagttgg---aaaacattgtaaacacattgggtagtgag 2869566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 104
Target Start/End: Original strand, 1344351 - 1344435
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg-ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||   ||||||||||| || ||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  1344351 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgaggttggg---aaacattgtaaacatcttcggtagtgagaatttcaccattggaa 1344435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 373 - 410
Target Start/End: Original strand, 9296561 - 9296598
Alignment:
Q  373 ttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgtt 410  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9296561 ttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgtt 9296598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Original strand, 41586357 - 41586425
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaaca-ttgtaatcaccttgggtagtgag 88  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41586357 agggttgagtgtctttggtgagagcttctcttgggttgg---aaaacagttgtaaacaccttgggtagtgag 41586425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 307
Target Start/End: Original strand, 1345538 - 1345634
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatat-tggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  1345538 tttcttgcaactcatttgtatcactttcatcttaagtggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1345634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 32247011 - 32246968
Alignment:
Q  37 gagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 81  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32247011 gagagtgtttcttaggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 32246968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 70)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8477664 - 8477367
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8477664 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 8477566  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg--aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctc-ttgtgtaagcttgcaagc 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  8477565 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtgggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttattgtgtaagcttgcaagc 8477466  T
Q  211 tttt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    | ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8477465 tattgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 8477367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 40372593 - 40372887
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  40372593 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 40372691  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct- 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  40372692 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattatgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgcaagcta 40372791  T
Q  212 tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40372792 tttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 40372887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 2671383 - 2671678
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2671383 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 2671481  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||     
T  2671482 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttggtcttgtgtaagcttgcaatcta 2671581  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2671582 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 2671678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7167545 - 7167249
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  7167545 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 7167446  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||     
T  7167445 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggcta 7167346  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7167345 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 7167249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 9091098 - 9091393
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  9091098 caaagggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgaaaggatctaaa 9091196  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||     
T  9091197 gcttcctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaagcttgaaggcta 9091296  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9091297 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 9091393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Original strand, 8738864 - 8739155
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  8738864 gggttgagtgtctttgtagagagtatctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgaaaggatctaaagctt 8738962  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt-- 214  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| ||      
T  8738963 cctctagtgtcttctcttctagggttcatattgtgagagtggggaaatacatatgggtagaatctagggattgttcttgtgtaagcttgaaggctattgt 8739062  T
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  8739063 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 8739155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Original strand, 28503662 - 28503956
Alignment:
Q  16 aaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28503662 aaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaatattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 28503760  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgt-aagcttgcaagct- 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| | |||     
T  28503761 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggcta 28503860  T
Q  212 -tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
       |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28503861 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 28503956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 26928395 - 26928683
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  26928395 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 26928490  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct--ttt 214  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  26928491 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 26928590  T
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26928591 ttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaa 26928683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32143613 - 32143343
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  32143613 agggttgagtgtctttgtagtgatgatctcttgggttgg---aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 32143518  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32143517 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 32143418  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32143417 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 32143343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1306239 - 1305953
Alignment:
Q  21 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcct 120  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1306239 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcttaagcttcct 1306142  T
Q  121 ctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttttct 218  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  1306141 cttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttttct 1306042  T
Q  219 tgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1306041 tgtaaccctttgtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 1305953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 28501495 - 28501750
Alignment:
Q  16 aaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaag 114  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  28501495 aaagggatgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaag 28501593  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgt-aagcttgcaagct- 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||| | |||     
T  28501594 cttcctctagtgacttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaaggcta 28501693  T
Q  212 -tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctct 268  Q
       |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28501694 gagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 27974748 - 27975035
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  27974748 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtcggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 27974843  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||| |||| |||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27974844 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagaatgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 27974942  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  27974943 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27975035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16264639 - 16264372
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  16264639 agggttgagtgtctttgtaatgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 16264544  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||  ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || | ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16264543 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgggtaacacaaatgtgtagaaattaggtcttgttcttgtggaagcttgcaagctatttt 16264446  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16264445 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 16264372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 27986252 - 27986529
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  27986252 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 27986347  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  27986348 ccttttgtgtcttctcttttagggttgatattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctttttt- 27986446  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
           || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  27986447 -------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 27986529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27453248 - 27452980
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    ||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  27453248 agggttgagtgtct--gtagtgaggatctcttgggttggc---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 27453155  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27453154 ccttttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaaaataggaattgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 27453055  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  27453054 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattgg 27452980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 8370285 - 8370569
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||    
T  8370285 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagttt 8370380  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    ||| | |||  |||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||||  ||||    
T  8370381 ccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttttaagctaatttc 8370478  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  8370479 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21711512 - 21711227
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  21711512 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgagtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 21711417  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||    
T  21711416 ccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttttaagctaattt 21711319  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  21711318 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 21711227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 6794511 - 6794778
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||| || | |||||||    
T  6794511 agggttgagtgtcattgtagtgaggttctcttgagttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaatgaacaaaagctt 6794606  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-ttttt 216  Q
    ||| |  ||  || ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  6794607 ccttt--tgtattttctcttagggttcatattgtgagagtgggtgacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctaatttt 6794704  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  6794705 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgg 6794778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36029383 - 36029097
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  36029383 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 36029288  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  |||||||  ||| ||| |||| |||||||| |  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||    
T  36029287 ccttttgtgttttctctt--aggattcatattttgagagtgagtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagtttgtaagctaattt 36029190  T
Q  217 cttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  36029189 cttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaa 36029097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 33386471 - 33386731
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  33386471 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgag---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 33386566  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttc-gtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  33386567 ccttttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttt 33386666  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
            || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33386667 --------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 33386731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 40592578 - 40592865
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  40592578 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 40592673  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||| |||||  ||    
T  40592674 tccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattagattttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatt 40592771  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  40592772 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 40592865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 35925768 - 35925529
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  35925768 agggttgaatgtctttgtagtgaggatcttttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 35925673  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    ||| | |||  |||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||  || ||  ||||    
T  35925672 ccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaatgggtagaaattaggttttgttctagtgtaagcttataaactaatttc 35925575  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35925574 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagaactgc 35925529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 1736100 - 1736388
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  1736100 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctattgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 1736195  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    || | | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| || ||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||| |  |    
T  1736196 tctttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgttggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagttaat 1736293  T
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  1736294 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 22173100 - 22173275
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  22173100 ttttagggttcatattaggagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 22173199  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  22173200 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 22173275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 3715796 - 3716085
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaag 114  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||    
T  3715796 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaaag 3715891  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    ||| || | |||  || ||| ||||| ||| |||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||  || |||||| ||||||||||| ||| |||||      
T  3715892 ctttcttttgtg--ttttctcttaggattcatattgtgaaagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagtttgtaagctaa 3715989  T
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  3715990 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 3716085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 307
Target Start/End: Original strand, 18552721 - 18552966
Alignment:
Q  61 aaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag-cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgg 159  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||  |||||| | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| ||||    
T  18552721 aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaaacttccttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgg 18552815  T
Q  160 ggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggag 257  Q
    |  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18552816 gtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggag 18552915  T
Q  258 agctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  18552916 ggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 48438505 - 48438236
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  48438505 agggttgagtgtctttgtagtaaggatctcttgg-ttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaatgatcaaaaagct 48438411  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  | |||  |    
T  48438410 tccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttatatgctaat 48438313  T
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48438312 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 48438236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25796072 - 25795803
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |    
T  25796072 agggttgagtgtctttgtagtgaggctctcttgagggttggg---aaacaatgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaag 25795977  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||||| |  ||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||      
T  25795976 cttccttttatgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaa 25795881  T
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25795880 tttcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 25795803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 307
Target Start/End: Original strand, 30709735 - 30709873
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  30709735 gggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctc 30709834  T
Q  270 ccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  30709835 ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 228
Target Start/End: Original strand, 39032351 - 39032555
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  39032351 agggttgagtgtctttgtagtgaga-tctcttgggttggt---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 39032445  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||  ||||||| | |||| ||||||| | ||||  || || |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  39032446 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgagaaacataaatggatagaaattagatcttgctcttgcgtaagcttgcaagctatttt 39032543  T
Q  217 cttgtaactctt 228  Q
    ||||||||||||    
T  39032544 cttgtaactctt 39032555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18656530 - 18656440
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18656530 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18656440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 24694962 - 24695229
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  24694962 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtggtga-gatttcaccattggaatgatcaaaaagct 24695057  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  || ||||||||| |||  |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||  |||||  ||    
T  24695058 tccttttgtg--ttttcttttaggattc--attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagtttataagctaatt 24695153  T
Q  216 tcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  24695154 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattgg 24695229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 2672919 - 2673011
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2672919 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 2673011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 2677075 - 2677167
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2677075 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 2677167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8512314 - 8512222
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8512314 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 8512222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8517194 - 8517102
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8517194 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 8517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32475580 - 32475490
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32475580 ttcttgtaactctttgtaa-acattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 32475490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32480438 - 32480348
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32480438 ttcttgtaactctttgtaa-acattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 32480348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40844793 - 40844674
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||     
T  40844793 gggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct- 40844695  T
Q  270 ccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  40844694 ccccagattaggtcatattgg 40844674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26299278 - 26299021
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||  ||| ||| |||    
T  26299278 agggttgaatgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaattatcaaaaagct 26299183  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| |  ||  || ||| ||||| ||   |||| ||  |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||  |||||  ||    
T  26299182 tcctttt-tgtgttttctcttaggatta--attgagattgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtctaagtttataagctaatt 26299086  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 279  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26299085 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagatta 26299021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 307
Target Start/End: Original strand, 47923704 - 47923989
Alignment:
Q  22 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagcttcct 120  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  47923704 ttgagtgtctttgtagtgagaatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaaagcttcct 47923799  T
Q  121 ctagtgccttctcttttagggttc-gtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctc-ttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
     | |||  || |||  |||| |||  ||||| ||| ||||   |||| ||| ||||| ||  ||||| |||||| |||||||| |||  |||||  ||||    
T  47923800 tttgtg--ttttctcgtaggattcattattgagagtgtggatgacacaaaatgggtataaattaggttttgctctttgtgtaaacttttaagctaatttc 47923897  T
Q  218 ttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggct-gacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  47923898 ttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 47923989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 22173038 - 22173100
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22173038 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 22173100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 3323487 - 3323755
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  3323487 agggttgagtgtctttatagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaatgatcaaaaagct 3323582  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacac---caaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||| | |||  |||||||  ||  |||  |||| ||| |||||  | |    ||| ||||||||  || | |||| |||| |||||||||  |||||      
T  3323583 tccttttgtgttttctctt--agaattc--attgagagtgtgggtgatatgaacaatgggtagaaattatgacttgttcttttgtaagcttataagctaa 3323678  T
Q  214 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  3323679 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgttctctctcccagattaggtcatattgg 3323755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 307
Target Start/End: Original strand, 3328302 - 3328439
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcc 270  Q
    ||||||||  |||| |||| |||| |||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||    
T  3328302 gggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcc 3328401  T
Q  271 cccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
     | |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  3328402 tctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaa 3328439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 37466389 - 37466313
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37466389 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattgg 37466313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47649862 - 47649653
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||| ||| |    
T  47649862 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagttag-atttcaccatttgaaggatcaaaaag 47649767  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||||| | |||  |||||||  ||| ||| ||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |      
T  47649766 cttccttttgtgttttctctt--aggattcatattgcgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtggaagcttgtaagttaa 47649669  T
Q  214 tttcttgtaactcttt 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  47649668 tttcttgtaactcttt 47649653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 307
Target Start/End: Original strand, 1417436 - 1417573
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcc 270  Q
    ||||||||  |||| |||| |||| |||||| ||  |||||  |||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||| | ||||||||||    
T  1417436 gggtagaaattaggacttgttcttttgtaagtttataagctaatttcttataactcattgtaacactttcttcttagtggattggagggatgctctctcc 1417535  T
Q  271 cccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  1417536 cccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1417573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24968204 - 24968112
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24968204 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctactctctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaa 24968112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Original strand, 4386773 - 4386840
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 88  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4386773 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaatcaccttgagtagtgag 4386840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 276
Target Start/End: Original strand, 4386915 - 4386978
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaga 276  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4386915 tttcttgtaacccatttgtatcacttttatcttattggattggagagctgctctctcccccaga 4386978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040057
Alignment:
Q  228 ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattgg 39040057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 3328153 - 3328240
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  3328153 agggttgaatgtctttgtagtgagcttctcttgggttgg---aaaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcagcattggaaggatc 3328240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8126917 - 8126685
Alignment:
Q  21 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagcttcc 119  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||  ||||||||     
T  8126917 gttgagtgtctttgtagtgaggttttcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcatcattggaaggatcaaaaagcttct 8126822  T
Q  120 tctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa--gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    | | |||  || ||| ||| | |||  |||| ||| |||||  |||| |||  ||||||||  || || ||| |||| |||||||||  |||||  ||||    
T  8126821 ttttgtg--ttttctcttaagattc--attgagagtgtgggtgacacaaaaatgggtagaaattaagtattgttcttttgtaagcttataagctaatttc 8126726  T
Q  218 ttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggag 257  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8126725 ttgtaactcttttgtaacactttcatcgtagtggattggag 8126685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1305893 - 1305849
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1305893 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 1305849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1309798 - 1309754
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1309798 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 1309754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 8477305 - 8477261
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8477305 ggtgttgttctacactagtctagggctggttttgttgttgttgct 8477261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23392167 - 23392106
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  23392167 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggt 23392106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21353661 - 21353604
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcc 270  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  21353661 tttcttgtaactcatttgtatcactttcatcttagtggattggagaggtgctctctcc 21353604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207939
Alignment:
Q  263 ctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 10207939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32143265 - 32143221
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32143265 ggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgct 32143221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 37725965 - 37725871
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  37725965 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggtgggg---aaacattataaacaccttggatagtga-gatttcaccattgaaaggatcaaaagct 37725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23410587 - 23410529
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttg 79  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  23410587 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgg---aaaacattgtaaacaccttg 23410529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 1417287 - 1417374
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||   ||||||||||| ||| || |||||||| || ||||| |||| |||||||    
T  1417287 agggttgagtgtctttgtagtgaggttatcttgggttggg---aaacattgtaaacactttaggtagtga-gatttcaccattgaaaggatc 1417374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 25929192 - 25929278
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||   |||||||||||| || |||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  25929192 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagttgg---aaaacattgtaaaca-cttgggtagtga-gatttcaccatcggaaggatc 25929278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7167180 - 7167141
Alignment:
Q  373 ttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7167180 ttgctctacactagtctagggct-gttttgttgttgttgct 7167141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18656657 - 18656614
Alignment:
Q  37 gagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 81  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18656657 gagagtgtttcttaggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 18656614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27026996 - 27026929
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 88  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |||||||| | |||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27026996 agggttgagtgtctttgtactgaggatctcttggataggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag 27026929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27038341 - 27038274
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag 88  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27038341 agggttgagtgcctttgtagtgaggatctcttgggtaggg---aaacattgtaaacaccttgggtggtgag 27038274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 27986589 - 27986633
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27986589 ggtgttgctctacactagactaggtctatttttgttgttgttgct 27986633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894087
Alignment:
Q  244 atattggattggagagctgctctctcccccaga 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccaga 53894087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24136146 - 24135853
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24136146 caaagggttgagtgtctttgtagaaagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcaccattggaaggatctaaag 24136048  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-t 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24136047 cttcctctagtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctat 24135948  T
Q  213 ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24135947 ttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24135853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38219692 - 38219403
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38219692 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 38219595  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38219594 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 38219495  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38219494 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 38219403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35387956 - 35387667
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||    
T  35387956 agggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttgga-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaaactt 35387859  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35387858 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttattcttgtgtaagcttgcaagctatttt 35387759  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  35387758 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaa 35387667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31180513 - 31180219
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  31180513 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 31180415  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgt-aagcttgcaagct 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| | |||    
T  31180414 gcttcctctagtgtcttctcttttatggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttg-tcttgtgtaaagcttgaaggct 31180316  T
Q  212 --tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
        ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  31180315 agagtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 31180219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15464824 - 15464536
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  15464824 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacatcgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 15464729  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15464728 ccttttgtgtcttctcttttagggttcattattgtgagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 15464629  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  15464628 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 15464536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30631702 - 30631411
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt-gaggagttcacta-ttggaaggatctaaagct 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  30631702 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtggaggagttcattagttggaaggatctaaagct 30631604  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgt-aagcttgcaagct--t 212  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||| ||||||| | |||       
T  30631603 tcctctagtgacttctc-tttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctaga 30631505  T
Q  213 ttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  30631504 gtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaa 30631411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 9353139 - 9353425
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  9353139 agggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 9353234  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||| |   ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9353235 ccttttgtgtcttctctttaaggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattagatcttgttcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 9353334  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  9353335 ttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9353425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 36932155 - 36932443
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  36932155 agggttgagtgtctttatagtgatgatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 36932250  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  || |||||| |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  36932251 cctcttgtgtcttctgttttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaagtcttgttcttatgtaaacttgcaagctatttt 36932350  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  36932351 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36932443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14520520 - 14520234
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  14520520 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 14520425  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgta-ttgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14520424 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcataattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 14520326  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  14520325 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14520234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 118 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 38192369 - 38192178
Alignment:
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  38192369 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 38192270  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38192269 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 38192178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 11916779 - 11917065
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  11916779 agggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaactt 11916874  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  |||||||  ||||||| |  | ||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  11916875 ccttttgtgttttctctt--agggttcatcgtttgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttt 11916972  T
Q  217 cttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  11916973 cttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 11917065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10282044 - 10281755
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaag 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||    
T  10282044 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttgtg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaaag 10281949  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    ||| || | |||  || ||| ||||| ||| ||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  10281948 ctttcttttgtg--ttttctcttaggattcatattgtgagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaa 10281851  T
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  10281850 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10281755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Original strand, 12083984 - 12084240
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactatt-ggaaggatctaaagct 116  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||  ||||||    
T  12083984 agggttgagtgtctttatagtgaggatctcttgggttggt---aaacattttaaacaccttgggtagtgagaa-ttcaccatttggaaggata-aaagct 12084078  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    |||| | |||  || ||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||| |  |||    
T  12084079 tccttttgtgttttttctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttttaagttaattt 12084176  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12084177 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattag 12084240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 1457067 - 1457242
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  1457067 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 1457166  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1457167 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 1457242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 17003766 - 17004053
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  17003766 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggtttgg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 17003861  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| ||| ||||||||||||| |  | |  ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||    
T  17003862 tccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgagtgaaattaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagttaatt 17003959  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    | |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  17003960 ttttgtaactcttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 17004053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43592459 - 43592284
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  43592459 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 43592360  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  43592359 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 43592284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15044865 - 15044691
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| |||||    |||||||||  |||||    
T  15044865 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgt 15044766  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15044765 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 15044691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27449994 - 27449819
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  27449994 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 27449895  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  27449894 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaa 27449819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3880550 - 3880321
Alignment:
Q  61 aaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgg 159  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||   ||||| |  ||| ||| ||||||||||||||    
T  3880550 aaacattgtaaacacattgggttgtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgttttttctcct--aggattcatattgtgagagtgg 3880454  T
Q  160 ggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggag 257  Q
    |  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3880453 gtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaaactaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggag 3880354  T
Q  258 agctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||| || ||||||||  ||||||||    
T  3880353 agctgctctctgcctcagattaggtcatattgg 3880321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27445150 - 27444975
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  27445150 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 27445051  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  27445050 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaa 27444975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43598904 - 43598737
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  43598904 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 43598805  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43598804 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgg 43598737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43604396 - 43604229
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  43604396 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 43604297  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43604296 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgg 43604229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43609888 - 43609721
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  43609888 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 43609789  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgg 299  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43609788 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgg 43609721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19589035 - 19588750
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag-ct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| || |||||| |||||| | ||||| |||||||||||| |||  ||    
T  19589035 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacatcttgggcagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaatct 19588940  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||  |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||| |  ||    
T  19588939 tccttttgtgttttctctt--aggattc--attgagattgtgggtgacacaaaaagggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataaggtaatt 19588844  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  19588843 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaa 19588750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 307
Target Start/End: Original strand, 28807485 - 28807652
Alignment:
Q  139 gggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgtaacac 236  Q
    |||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||| ||||| |||||   ||||||||||  ||||||||||    
T  28807485 gggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagattcttgtaaccttttgtaacac 28807583  T
Q  237 tttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28807584 tt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 28807652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 307
Target Start/End: Original strand, 37556613 - 37556702
Alignment:
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37556613 cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 37556702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 217 - 307
Target Start/End: Original strand, 37561435 - 37561524
Alignment:
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37561435 cttgtaaccttttgtaacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 37561524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 2785472 - 2785380
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2785472 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 2785380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 31396981 - 31397073
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31396981 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 31397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 31401838 - 31401930
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31401838 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccatattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 31401930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33768276 - 33768184
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33768276 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctcccccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 33768184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33791413 - 33791321
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33791413 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 33791321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28832544 - 28832281
Alignment:
Q  21 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gcttcc 119  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  28832544 gttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagcttcc 28832449  T
Q  120 tctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa---gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    | | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  | |  |||   ||||||||  |||  |||| |||| ||||  |||  |||||  |||    
T  28832448 ttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattagaacttgttcttttgta--cttataagctaattt 28832355  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28832354 cttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 28832281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15044928 - 15044865
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15044928 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttgggaaaaacattgtaatcaccttgggt 15044865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Original strand, 31300404 - 31300689
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag-cttc 118  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  31300404 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgag---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaggcttc 31300499  T
Q  119 ctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa---gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-ttt 214  Q
    || | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  | |  | |   ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| || |||    
T  31300500 cttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgatatgagaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaaactattt 31300595  T
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| |||| |||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  31300596 ttcttgcaactcattataacactttcatcttagtggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31300689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 171 - 280
Target Start/End: Original strand, 42127366 - 42127475
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcc 270  Q
    ||||||||  |||| |||| |||| |||||||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||    
T  42127366 gggtagaaagtaggacttgttcttttgtaagcttataagctaatttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcc 42127465  T
Q  271 cccagattag 280  Q
    ||||||||||    
T  42127466 cccagattag 42127475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 1457005 - 1457067
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1457005 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 1457067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 27445212 - 27445150
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27445212 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 27445150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 27450056 - 27449994
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27450056 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 27449994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 43592521 - 43592459
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43592521 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43592459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 43598966 - 43598904
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43598966 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43598904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 43604458 - 43604396
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43604458 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43604396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 43609950 - 43609888
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43609950 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 43609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 273
Target Start/End: Original strand, 11181641 - 11181890
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagcttc 118  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  11181641 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-aatttcaccattggaaggatcaaaaagcttc 11181736  T
Q  119 ctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa--gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    || | |||  || ||| ||||| |||  |||||||| |||||  |||  |||  ||||||||  ||||||||| || | ||  |||||  | |||  |||    
T  11181737 cttttgtg--ttttctcttaggattc--attgtgagtgtgggtgacatgaaaatgggtagaaattaggtcttgttcatttgagagcttttaggctaattt 11181832  T
Q  217 cttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccccc 273  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  11181833 cttgtaactcatttgtatcactttcatcttagtggattggagggttgctctctccccc 11181890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 24553333 - 24553421
Alignment:
Q  17 aagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  24553333 aagggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattagaaggatc 24553421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6741962 - 6741888
Alignment:
Q  203 ttgcaagcttttttcttgtaact-ctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaga 276  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6741962 ttgcaagctaatttcttgtaacttctttgtatcacttccatcttaatggattggagagctgctctatcccccaga 6741888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Original strand, 24553506 - 24553581
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  24553506 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggagtggag-gctgctctctcccatagattaggtcatattgg 24553581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38192115 - 38192071
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38192115 ggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgct 38192071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38219340 - 38219296
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38219340 ggtgttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgct 38219296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 7160711 - 7160798
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||  ||||||||||||    
T  7160711 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttggattggg---aaacattgtaatcaccttggacagtga-gatttcatcattggaaggatc 7160798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 9353485 - 9353529
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9353485 ggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgct 9353529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 15464475 - 15464431
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15464475 ggtgttgctctacactagactaggtctgtttttgttgttgttgct 15464431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 109
Target Start/End: Original strand, 42127179 - 42127264
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||| ||||||||| |||  |||||||||||   || ||||||||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  42127179 ggttgagtatctttgtagtgaggttctcttgggtt---gagaaacattgtatacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatc 42127264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 234 - 276
Target Start/End: Original strand, 33030959 - 33031001
Alignment:
Q  234 cactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaga 276  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33030959 cactttcatcttagtgaattggagagctgctctctcccccaga 33031001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24135791 - 24135751
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgtt 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24135791 ggtgttgctctacactagtctagggct-gttttgttgttgtt 24135751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 372 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35387603 - 35387562
Alignment:
Q  372 gttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  35387603 gttgctctacactagactagggttgtttttgttgttgttgct 35387562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2630316 - 2630272
Alignment:
Q  227 tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccc 271  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  2630316 tttgtatcactttcatcatagtggattgaagagctgctatctccc 2630272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 276
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410269
Alignment:
Q  248 tggattggagagctgctctctcccccaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccaga 4410269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Original strand, 28807436 - 28807479
Alignment:
Q  37 gagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 81  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28807436 gagagtgtttcttaggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 28807479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24742240 - 24741945
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24742240 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 24742142  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||     
T  24742141 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggcta 24742042  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24742041 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24741945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29760941 - 29760646
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29760941 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 29760842  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgct-cttgtgtaagcttgcaagct 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  29760841 gcttcctctagtgtcttctctt--agggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctaggtcttgtttcttgtgtaagcttgcaggct 29760744  T
Q  212 ttt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
     ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29760743 attgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 29760646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 28468341 - 28468621
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28468341 agggttaagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg-aaaaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 28468438  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||    
T  28468439 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttattgtgtaagcttgcaaactatttt 28468538  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
            |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  28468539 --------ttcttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaa 28468621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 5396478 - 5396764
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  5396478 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaagaatcaaaagctt 5396573  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
     || | ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||| | ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5396574 tcttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgagtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 5396672  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  5396673 cttgtaactctttgcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 31985440 - 31985726
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  | ||||| || ||||||||| |||||||    
T  31985440 agggttgagtgtttttgtattgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgaa-atttcaccatgggaaggatcaaaagctt 31985535  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-ttttt 216  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31985536 ccttttgtgtcttctcttttagggttcacattgtgagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttt 31985635  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  31985636 cttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31985726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 16623100 - 16623367
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  16623100 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 16623195  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||   ||||  |||    
T  16623196 ccttttgtg--ttttcttttaggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttctgtaagcttattagctaattt 16623293  T
Q  217 cttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattg 289  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  16623294 cttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattg 16623367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Original strand, 36315037 - 36315321
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||    
T  36315037 agggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacacattgggtagtgag-atttaaccattggaaggatcaaaagctt 36315132  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  || || |  ||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||    
T  36315133 ccttttgtgttttttcgt--aggattcattattgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttctaagctaattt 36315230  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaaca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||    
T  36315231 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36315321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 306
Target Start/End: Original strand, 36329246 - 36329530
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||    
T  36329246 agggtttagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacacattgggtagtgag-atttaaccattggaaggatcaaaagctt 36329341  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  || || |  ||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||    
T  36329342 ccttttgtgttttttcgt--aggattcattattgagagtgtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttctaagctaattt 36329439  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaaca 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||    
T  36329440 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 36329530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3777839 - 3777581
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  3777839 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaatgatcaaaaagct 3777744  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| |  ||  || ||| ||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  3777743 tccttt--tgtattttctcttaggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattagatcttgttcttgtgtaagtttgcaagctattt 3777646  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  3777645 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattag 3777581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5143550 - 5143281
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||   |||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  5143550 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggattggg---aaactttgtaaacaccttaggtagtgag-atttcaccattggaaggatcataagctt 5143455  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagg-gtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||   |||| ||| | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5143454 ccttttgtgttttctcttt-agggttcatattctgagagtggctgacacaaaatgagtagaaattaggtcttgttcttgtgtatgcttgcaagctatttt 5143356  T
Q  217 cttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5143355 cttgtaaattttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 5143281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5147968 - 5147681
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||| |||||||||||||  ||  ||||||| ||||||   ||||||||||| ||| |||| || |||| | ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  5147968 agggtttagtgtctttgtagtaaggatctcttgagttggg---aaacattgtaaacacattggataatgag-atttcaccattggaaggatcataagctt 5147873  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5147872 ccttttgtgttttctcttt-agggttcatattgtgagaatgggtgacacaaaatgggtagaaattaggccttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 5147774  T
Q  217 cttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  5147773 cttgtaactattttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5147681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10047671 - 10047383
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag-ct 116  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||  ||    
T  10047671 agggttgagtgtctttgtaatgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaaact 10047576  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  || ||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |    
T  10047575 tccttttgtgttttgtctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat 10047478  T
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  10047477 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 307
Target Start/End: Original strand, 45357203 - 45357376
Alignment:
Q  135 tttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgta 232  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| |||||    |||||||||  ||||||    
T  45357203 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgta 45357302  T
Q  233 acactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45357303 acactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaa 45357376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 9224312 - 9224487
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||| ||||  ||||    
T  9224312 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttg 9224411  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9224412 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 9224487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 38152245 - 38152532
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||   ||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  38152245 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggatggg---aaatattgtaaacaccttgggtagtgacaa-ttcaccattggaaggatcaaaagctt 38152340  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaag-ggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    ||  | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| |||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||    
T  38152341 ccatttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaattggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatt 38152438  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| | || ||||||||||||    
T  38152439 tcttataactcttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 51520637 - 51520462
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  51520637 ttttagggttcatattaagagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 51520538  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  51520537 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaa 51520462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3814202 - 3814029
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||| ||||| |||||    |||||||||  |||||    
T  3814202 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgt 3814104  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3814103 aacactttca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 3814029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 9229099 - 9229274
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||| ||||  ||||    
T  9229099 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttg 9229198  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  9229199 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaa 9229274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 229
Target Start/End: Original strand, 8689303 - 8689509
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| ||    
T  8689303 agggtttagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattttaaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagttt 8689398  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||  ||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8689399 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgggaaacacaaattggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 8689496  T
Q  217 cttgtaactcttt 229  Q
    |||||||| ||||    
T  8689497 cttgtaacacttt 8689509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24334103 - 24333831
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |    
T  24334103 agggttgagagtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaag 24334008  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgct-cttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    |||||| | |||  |||||||  ||| ||| ||||||||||||||   |||| ||| ||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||| |||||     
T  24334007 cttccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtggctgacacaaaatgggtagaaattaggttttttttcttgtgtaagcttgtaagcta 24333910  T
Q  213 ttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
     ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  24333909 attttttataactcttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 24333831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5732828 - 5732670
Alignment:
Q  149 tgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgtaacactttcatcata 246  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||| ||||| |||||    |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  5732828 tgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaagctagagtcttgtaaccttttgtaacactttc-tcata 5732731  T
Q  247 ttggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5732730 ttggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 5732670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 307
Target Start/End: Original strand, 45347723 - 45347897
Alignment:
Q  135 tttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttt-tcttgtaactctttgt 231  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||     |||||||||  |||||    
T  45347723 tttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagaggtcttgtaaccttttgt 45347822  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45347823 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaa 45347897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 5269007 - 5269266
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  5269007 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 5269102  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacac-caaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |    
T  5269103 tccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacacaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaat 5269200  T
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||          ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5269201 ttcttgt----------aacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 5269266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 306
Target Start/End: Original strand, 6743226 - 6743507
Alignment:
Q  22 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcctc 121  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||     
T  6743226 ttgagtgtctttgtagcgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtaatgag-atttcaccattggaaggatcaaaaacttcctt 6743321  T
Q  122 tagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttctt 219  Q
    | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| ||||||||   |||||  ||| ||    
T  6743322 ttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagctat-aagctaatttttt 6743418  T
Q  220 gtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaaca 306  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||| | || |||||||||||    
T  6743419 gtagctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 307
Target Start/End: Original strand, 3796474 - 3796612
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  3796474 gggtagaaattaggtcttgttcttgtgcaagcttgtaagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctc 3796573  T
Q  270 ccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  3796574 ccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaa 3796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Original strand, 16628679 - 16628815
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||    
T  16628679 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaagctt 16628774  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggg 160  Q
    ||| | |||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16628775 ccttttgtg--ttttcttttaggattcatattgtgagagtggg 16628815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 299
Target Start/End: Original strand, 56146700 - 56146783
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgg 299  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  56146700 ttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgg 56146783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18855821 - 18855732
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18855821 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18855732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 279
Target Start/End: Original strand, 16630649 - 16630744
Alignment:
Q  185 tcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagatta 279  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16630649 tcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagatta 16630744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 39246093 - 39245998
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  39246093 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 51520699 - 51520637
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51520699 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 51520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 9224250 - 9224312
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9224250 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttggg-aaaacattgtaatcaccttgggt 9224312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 9229037 - 9229099
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9229037 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttggg-aaaacattgtaatcaccttgggt 9229099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 18712609 - 18712671
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18712609 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgttatcaccttgggt 18712671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 269
Target Start/End: Original strand, 42599383 - 42599626
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag-cttc 118  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||  ||||    
T  42599383 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttcggttggg---aaacattctaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggataaaaaaacttc 42599478  T
Q  119 ctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    || | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| | |||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||  ||||    
T  42599479 cttttgtgttttctctt--aggattc--attgagagtgcgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaatttc 42599574  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| | |||||||||    
T  42599575 ttgtaactcattgtaacattttcatcttagtggattggagggttgctctctc 42599626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 25861840 - 25862097
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||  ||| ||    
T  25861840 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgagtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaaaact 25861935  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  || ||| ||||| |||  |||| ||| |||||  |||| ||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||    
T  25861936 tccttttgtg-tttttctcttaggattc--attgagagtgtgggtgacacaaaatgggtaggaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatt 25862032  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||          ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  25862033 tc----------ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattgg 25862097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 5112336 - 5112259
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  5112336 tttcttgtaacccatttgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctcacccccaaagtagatcatattgg 5112259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5112523 - 5112440
Alignment:
Q  22 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  5112523 ttgagtgtctttgttgtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatc 5112440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 28468681 - 28468725
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28468681 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 28468725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 274
Target Start/End: Original strand, 1983284 - 1983359
Alignment:
Q  200 agcttgcaagcttttttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccccca 274  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1983284 agcttgcaagctaatttcttgtaacccctttgtatcactttgatcctagtggattggagagctgctatctccccca 1983359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 276
Target Start/End: Original strand, 34495822 - 34495884
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaga 276  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34495822 ttcttgtaacccatttgtatcactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccaga 34495884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 54867325 - 54867223
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  54867325 gggtagaaattaggtattgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttataactattttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctc 54867226  T
Q  270 ccc 272  Q
    |||    
T  54867225 ccc 54867223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Original strand, 39774303 - 39774380
Alignment:
Q  214 tttcttgtaac-tctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  39774303 tttcttgtaacctatttgtatcactttcattttagtggattggagagctgctctatcccccagagtaggtcatattgg 39774380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3814257 - 3814202
Alignment:
Q  26 gtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    |||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3814257 gtgtctttgatgagagtgtttcttaggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggt 3814202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 24741877 - 24741837
Alignment:
Q  373 ttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  24741877 ttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgct 24741837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Original strand, 45347678 - 45347721
Alignment:
Q  37 gagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 81  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45347678 gagagtgtctcttaggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 45347721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Original strand, 8689498 - 8689558
Alignment:
Q  228 ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||    
T  8689498 ttgtaacactttcatcatagtggataggagagct--cctctcccccatattagatcatattgg 8689558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 6542439 - 6542378
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  6542439 agggttgagtgtctttgtaatgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggt 6542378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 51336974 - 51337035
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  51336974 agggttgaatgtctttgtagtgaggttctcttgggttgg---aaaacattgtaaacaccttgggt 51337035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5732887 - 5732844
Alignment:
Q  37 gagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 81  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5732887 gagagtgtttcttaggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 5732844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 24202572 - 24202861
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  24202572 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atctcaccattggaaggatctaaagctt 24202669  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24202670 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 24202769  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24202770 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24202861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 24787161 - 24787456
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24787161 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattataatcaccttgggcagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 24787259  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagct 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| | |||    
T  24787260 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagttgggaaacaccaaagggtagaatctaggatttgttcttgtgtaatgcttgaaggct 24787359  T
Q  212 ttt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
     ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24787360 attgtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24787456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 19358647 - 19358935
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19358647 agggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttggg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 19358743  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19358744 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 19358843  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19358844 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaa 19358935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 19361236 - 19361524
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19361236 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg--aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 19361332  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  19361333 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttt 19361432  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19361433 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaa 19361524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 307
Target Start/End: Original strand, 19379916 - 19380164
Alignment:
Q  60 aaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgg 159  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19379916 aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagcttcctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtgg 19380014  T
Q  160 ggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggag 257  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19380015 ggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggag 19380114  T
Q  258 agctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  19380115 agctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaa 19380164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3281995 - 3281730
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcc 119  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3281995 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttcc 3281900  T
Q  120 tctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttct 218  Q
    | | ||| ||||||||  ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3281899 ttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctattttct 3281802  T
Q  219 tgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3281801 tgtaactctttgtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 3281730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 26644705 - 26644990
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  26644705 agggttgagtgtctttgtagtgaagatcttttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgagtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 26644800  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||  ||||||| | |||| ||||||| | ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26644801 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgagaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 26644898  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  26644899 cttgtaactctttgtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26644990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 13604429 - 13604697
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  13604429 agggttgagtatctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 13604524  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13604525 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagtttgcaagctatttt 13604623  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattg 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  13604624 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 13604697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 280
Target Start/End: Original strand, 21536377 - 21536634
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||   |||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  21536377 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttaggttgg---aaaacattgtaaacaccttgggtagtaag-atttcaccattggaaggatcgaaagctt 21536472  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||  ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21536473 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgggtaacacaaacgggtagaaattaagtattgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 21536570  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536571 cttgtaactctttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattag 21536634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 208
Target Start/End: Original strand, 19366111 - 19366300
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19366111 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg-aaaaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 19366208  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaa 208  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19366209 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgagagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaa 19366300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37070055 - 37069774
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcc 119  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| || |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  37070055 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttggataatgag-atttcaccattggaaggatcaaaagcttcc 37069960  T
Q  120 tctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttct 218  Q
    | | ||| ||||||||| | ||||| | |||| | ||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||      
T  37069959 ttttgtgtcttctcttt-atggttcattattgagtgagtgggtaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaaactatttt-- 37069863  T
Q  219 tgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  37069862 -gtaactctttgtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 37069774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 47703740 - 47704029
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaag- 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||  |||      
T  47703740 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaatgataaaaaaa 47703835  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||||| | |||  |||||||  ||| ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||      
T  47703836 cttccttttgtgttttctctt--aggattcatattgtgagagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaa 47703933  T
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  47703934 tttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41398415 - 41398241
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    |||||||||  |||||    
T  41398415 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgt 41398316  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41398315 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaa 41398241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 29652103 - 29651833
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| | |    
T  29652103 agggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagtt 29652008  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||| |  |    
T  29652007 tccttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagttaat 29651910  T
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  29651909 ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattgg 29651833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41390760 - 41390586
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    |||||||||  |||||    
T  41390760 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgt 41390661  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  41390660 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaa 41390586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 290
Target Start/End: Original strand, 16124347 - 16124591
Alignment:
Q  44 tctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gcttcctctagtgccttctcttttagggt 142  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||| | |||  |||||||  ||| |    
T  16124347 tctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagcttccttttgtgttttctctt--aggat 16124440  T
Q  143 tcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacacttt 239  Q
    || | ||||  || ||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16124441 tcattattgaaagtgtgggtaacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttatgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacacttt 16124540  T
Q  240 catcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16124541 catcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgg 16124591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9476551 - 9476265
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gctt 117  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||   ||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  9476551 gggttgaatgtctttgtagtgaggttctctttggttggg---aaacattgtaaacatcttgggtagtgag-atttcaccatttgaaggatcaaaaagctt 9476456  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaaggg-tagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  |||||||  | | |||  |||||||||||| |  |||| ||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||    
T  9476455 ccttttgtgttttctctt--aagattcacattgtgagagtgagtgacacaaaatggatagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaattt 9476358  T
Q  217 cttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  9476357 cttataactcttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9476265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 13598688 - 13598402
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gcttc 118  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  13598688 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggc---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagcttc 13598593  T
Q  119 ctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagg-gtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    || | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| | ||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||||  |||    
T  13598592 cttttgtgttttctctt--aggattcatcattgagagtgtgggtgacacaaaatgagtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttataagctaattt 13598495  T
Q  217 cttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  13598494 cttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19073220 - 19072932
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |    
T  19073220 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaag 19073125  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||||| | |||  |||||||  ||||||| | ||| ||| ||| |  |||| ||| ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||  |||||      
T  19073124 cttccttttgtgttttctctt--agggttcat-ttgagagtgtgagtgacacaaaatgggtagaaattaggtattgttcttttgtaagcttataagctaa 19073028  T
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  19073027 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19072932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19121110 - 19120822
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |    
T  19121110 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttggatagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaag 19121015  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||||| | |||  |||||||  ||||||| | ||| ||| ||| |  |||| ||| ||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||  |||||      
T  19121014 cttccttttgtgttttctctt--agggttcat-ttgagagtgtgagtgacacaaaatgggtagaaattaggtattgttcttttgtaagcttataagctaa 19120918  T
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  19120917 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 19120822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 32889728 - 32889461
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| || |||||||    
T  32889728 agggttgagtgtctttgtagtgaggtttttttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggttcaaaagctt 32889633  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa---gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tt 213  Q
    | | | |||  |||||||  ||| |||  |||| ||| |||||  | |  |||   ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32889632 ctttt-gtgttttctctt--aggattc--attgagagtgtgggtgatatgaaaaatgggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatt 32889538  T
Q  214 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  32889537 tttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattgg 32889461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Original strand, 25445079 - 25445169
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25445079 tcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 25445169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 47098632 - 47098917
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  47098632 agggttgagtgtctttgtagcgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 47098727  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa--gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  || ||||  ||| |||  |||| ||| |||||  |    |||  ||||||||  |||| |||| |||| |||||||||  |||||  |    
T  47098728 tccttttgtgttttttctt--aggtttc--attgagagtgtgggtgatgtgaaaatgggtagaaattaggacttgttcttttgtaagcttataagctaat 47098823  T
Q  215 ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| | || ||||||||||||    
T  47098824 ttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47098917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 39445594 - 39445505
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39445594 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 39445505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Original strand, 44023864 - 44023953
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44023864 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 44023953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 43988452 - 43988544
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||    
T  43988452 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtaaacaa 43988544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Original strand, 1055002 - 1055091
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1055002 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagttgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 1055091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 280
Target Start/End: Original strand, 27104370 - 27104437
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104370 tttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattag 27104437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 41398477 - 41398415
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41398477 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 41398415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Original strand, 40816621 - 40816842
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaag 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||    
T  40816621 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatcaaaaag 40816716  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||||| | |||  || ||| ||||| |||  |||| ||| |||||  |||| || | ||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||  |    
T  40816717 cttccttttgtg--ttttctcttaggattc--attgagagtgtgggtgacacaaatgagtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagctaat 40816812  T
Q  215 ttcttgtaactc-tttgtaacactttcatc 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40816813 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatc 40816842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 41390819 - 41390760
Alignment:
Q  22 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41390819 ttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 41390760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 775757 - 775694
Alignment:
Q  227 tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  775757 tttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattgg 775694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 307
Target Start/End: Original strand, 47102840 - 47102934
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  47102840 tttcttgtaactcattgtaacattttcatcttagtggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 47102934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 47102646 - 47102733
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  47102646 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcatcattggaaggatc 47102733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 105
Target Start/End: Original strand, 27104211 - 27104291
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaag 105  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27104211 ggttgagtgtctttgtagtgag-gtctcttgggttggg---aaacattataagcaccttgggtagtga-gatttcaccattggaag 27104291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22819714 - 22819657
Alignment:
Q  25 agtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagt 85  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  22819714 agtgtctttgtagtgaggttctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagt 22819657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 258
Target Start/End: Original strand, 48382479 - 48382524
Alignment:
Q  214 tttcttgtaac-tctttgtaacactttcatcatattggattggaga 258  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48382479 tttcttgtaacctatttgtatcactttcatcatattggattggaga 48382524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22819528 - 22819468
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctccccc 273  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  22819528 tttcttgtaactcatttgtatcactttcatcttggtggattggagggctactctctccccc 22819468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36979676 - 36979382
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36979676 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttaggttggg--aaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 36979579  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||     
T  36979578 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggcta 36979479  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36979478 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 36979382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30655946 - 30655651
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30655946 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 30655848  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||     
T  30655847 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggcta 30655748  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30655747 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 30655651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 4759871 - 4760167
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4759871 caaagggttgagtgtctttgtagagagagtctcttgggttgggaaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 4759970  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||     
T  4759971 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaaggcta 4760070  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4760071 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 4760167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 1261757 - 1262046
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1261757 agggttgagtgtctttgtagagagggtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 1261854  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  1261855 cctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaatctaggtcttgtacttgtgtaagcttgcaagctatttt 1261954  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  1261955 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaa 1262046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 18870358 - 18870654
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18870358 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 18870456  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||     
T  18870457 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaatgcta 18870556  T
Q  213 tt--ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18870557 ttgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaa 18870654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 10688937 - 10689235
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactatt---ggaaggatcta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   || ||||||||    
T  10688937 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttgggggaggatcta 10689035  T
Q  112 aagcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaag 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |    
T  10689036 aagcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaacatatgggtagaatctagggcttgttcttgtgtaagcttgaagg 10689135  T
Q  210 ctttt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    || ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10689136 ctattgtttcttgtaaccctctgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 10689235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 18852964 - 18853260
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18852964 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaatattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 18853062  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||     
T  18853063 gcttcctctagtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaataccaaagggtaaaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaatgcta 18853162  T
Q  213 tt--ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18853163 ttgtttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18853260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Original strand, 33037605 - 33037898
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33037605 caaagggttgagtgtcttcgtagagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatctaaa 33037703  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||     
T  33037704 gcttcctctagtgtcttctcttt-agggttcatattgtgagagtggggaaacacatatgggtagaatctagggtttgttcttgtgtaagcttgaaggcta 33037802  T
Q  213 tt--ttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33037803 ttgtttcttgtaaccctttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 33037898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6311598 - 6311302
Alignment:
Q  15 caaagggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcacta-ttggaaggatctaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  6311598 caaagggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcattagttggaaggatcaaaa 6311500  T
Q  114 gcttcctctagtgccttctc--ttttagggttcgtattgtgagagtgggg-aacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgt-aagcttgcaag 209  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||| | |    
T  6311499 gcttcctctagtgacttctcttttttagggttcatcttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttg-tcttgtgtaaagcttgaagg 6311401  T
Q  210 ct--tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6311400 ctagagtttcttgtaaccttttgtaacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 6311302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 290
Target Start/End: Original strand, 31071035 - 31071304
Alignment:
Q  21 gttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagcttcct 120  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31071035 gttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcttaagcttcct 31071132  T
Q  121 ctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttttct 218  Q
    || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31071133 cttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttct 31071232  T
Q  219 tgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31071233 tgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgg 31071304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26288184 - 26287906
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26288184 agggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttggg-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 26288087  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  26288086 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt- 26287988  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
           || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26287987 -------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 26287906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26301441 - 26301163
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26301441 agggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttggg-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 26301344  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  26301343 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt- 26301245  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
           || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26301244 -------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 26301163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26313435 - 26313157
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26313435 agggttgaatgtctttgtagagagaatctcttgagttggg-aaaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 26313338  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttc 217  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||     
T  26313337 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaacacaaatgggtagaaactaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt- 26313239  T
Q  218 ttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
           || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26313238 -------tc-ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 26313157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4456318 - 4456050
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  4456318 agggttgagtgtctctgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattagaaggatcaaaagctt 4456223  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  4456222 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcatcattgagagagtgggtaacacaaatgggtagaaattatgtcttgttcttgtgtaagcttgccagctatttt 4456124  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4456123 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattgg 4456050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7412630 - 7412345
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| |||||||    
T  7412630 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattgaaaggatcaaaagctt 7412535  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| |  || ||||||||  ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  7412534 ccttttatgtcttctctt--agggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagttatttt 7412437  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  7412436 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 7412345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Original strand, 19175561 - 19175829
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||    
T  19175561 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttggattggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcactattggaaggatcaaaagttt 19175656  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||| | ||| ||||||||  ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || | ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19175657 ccttttgtgtcttctctt--agggttcatcattgagagagtgggaaacacaaatgtgtagaagttaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaggctatttt 19175754  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19175755 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattgg 19175829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 23799383 - 23799670
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagct 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||| ||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||  ||||||    
T  23799383 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttgggg---aacattgtaaacaccttgagtaggga-gatttcaccattggaaggatcaaaaagct 23799478  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  || ||  ||||| ||| |||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||    
T  23799479 tccttttgtg--ttttcccttaggattcatattgtgacagtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaagctaatt 23799576  T
Q  216 tcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  23799577 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 23799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 26403034 - 26403323
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |    
T  26403034 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaag 26403129  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttt 213  Q
    |||||| | |||  ||||||| |  | ||| ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||      
T  26403130 cttccttttgtgttttctcttat--gattcatattgtgagagtgagtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgcaagcttgtaagctaa 26403227  T
Q  214 tttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  26403228 tttcctataactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 26403323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 25328184 - 25328358
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    |||||||||  |||||    
T  25328184 ttttagggttcatgttgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgt 25328283  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25328284 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 25328358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 7289831 - 7290006
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||||||||  ||||    
T  7289831 ttttagggttcatattgtgagagtggggaaacaccaaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttgtaaccttttg 7289930  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  7289931 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 7290006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 5702287 - 5702576
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  5702287 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaatattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaatgatcaaaaagct 5702382  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  || ||| ||||| ||| | |||| ||| |||||  || | ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||||  |    
T  5702383 tccttttgtgtttt-tctcttaggattcattattgagagtgtgggtgactcaaaatgggtagaaattaggttttgctcttgtgtaagcttataagctaat 5702481  T
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  5702482 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5702576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Original strand, 19752349 - 19752469
Alignment:
Q  171 gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttttcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctc 269  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  19752349 gggtagaaattaggacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttttcttgtaactcattgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctc 19752448  T
Q  270 ccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||| ||| |||  ||||||||    
T  19752449 ccctagactaggtcatattgg 19752469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 6127515 - 6127243
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-g 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |    
T  6127515 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacattttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaag 6127420  T
Q  115 cttcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctt 212  Q
    ||| || | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||     
T  6127419 ctttcttttgtgttttctctt--aggattcattattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttttgtaagcttataagcta 6127322  T
Q  213 ttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  6127321 atttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattgg 6127243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 10684252 - 10684344
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  10684252 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 10684344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35745488 - 35745396
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35745488 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 35745396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Original strand, 39784813 - 39784902
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39784813 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 39784902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 4696415 - 4696689
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  4696415 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaagatcaaaaagct 4696510  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    |||| | |||  |||||||  ||| |||  | || ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||  |||||  ||    
T  4696511 tccttttgtgttttctctt--aggattc--aatgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgcgtaagcttataagctaatt 4696606  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggct-gacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||          ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  4696607 tcttgtaactcttt----------catcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaa 4696689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 7289769 - 7289831
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7289769 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 7289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 25327996 - 25328058
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25327996 gggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 25328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 25328122 - 25328184
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25328122 gggttgtgtgtctttgatgagagtgtctcttgggtt-gggaaaaacattgtaatcaccttgggt 25328184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6813796 - 6813723
Alignment:
Q  200 agcttgcaagcttttttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccc 272  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6813796 agcttgcaagctaatttcttgtaacccctttgtgtcactttcatcttattggattggagagctgctctctcccc 6813723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 109
Target Start/End: Original strand, 9054231 - 9054314
Alignment:
Q  22 ttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  9054231 ttgagtgtttttgtagtgagattctcttgggttgg---aaaacattataatcaccttgggtagtga-gatttcaccattggaaggatc 9054314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 1262106 - 1262150
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1262106 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 1262150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 307
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765912
Alignment:
Q  248 tggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9765912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26287845 - 26287801
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26287845 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 26287801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26313096 - 26313052
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  26313096 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 26313052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 31071383 - 31071427
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31071383 ggtgttgctctacactagactagggctgtttttgttgttgttgct 31071427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3051219 - 3051156
Alignment:
Q  214 tttcttgtaactc-tttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaga 276  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  3051219 tttcttgtaactcatttgtatcactttcatcttagtggattggagaggtgctctctcctccaga 3051156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 290
Target Start/End: Original strand, 9054835 - 9054912
Alignment:
Q  214 tttcttgtaact-ctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||    
T  9054835 tttcttgtaaccactttgtatcactttcatcttagtggattagagagctgctctctcctccagagtaggtcatattgg 9054912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 109
Target Start/End: Original strand, 19752201 - 19752288
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  19752201 agggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgggttgtg---aaatattgtaaacaccttgggtagtga-gatttcatcattggaaggatc 19752288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3051410 - 3051296
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatc-taaagct 116  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||   ||||||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||  ||||||    
T  3051410 agggttgagtgtctttgtagtggggttctcttgagttggg---aaacattgtaaacatcttgggtagtga-gatttcaccattggaaagatcaaaaagct 3051315  T
Q  117 tcctctagtgccttctctt 135  Q
    |||| | |||| |||||||    
T  3051314 tccttttgtgctttctctt 3051296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 413
Target Start/End: Original strand, 4760236 - 4760276
Alignment:
Q  373 ttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4760236 ttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgct 4760276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 373 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36979314 - 36979274
Alignment:
Q  373 ttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36979314 ttgctctacactagtctagggctgtttttgttgttgttgct 36979274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 280
Target Start/End: Original strand, 18810982 - 18811014
Alignment:
Q  248 tggattggagagctgctctctcccccagattag 280  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18810982 tggattggagggctgctctctcccccagattag 18811014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 81
Target Start/End: Original strand, 39784685 - 39784728
Alignment:
Q  37 gagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttggg 81  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39784685 gagagagtctcttaggttggg-aaaaacattgtaatcaccttggg 39784728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 17755 - 18044
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17755 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 17852  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17853 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 17952  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  17953 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 18044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 23848 - 24137
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23848 agggttgagtgtctttgtagagaggatctcttgggttggg-aaaaacattgtaatcaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatctaaagctt 23945  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23946 cctcttgtgtcttctcttttagggttcatattgtgagagtggggaaacacaaatgggtagaaactatgacttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 24045  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24046 tcttgtaaccctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 24137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 18105 - 18150
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctgg-ttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18105 ggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgttgct 18150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 24198 - 24243
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctgg-ttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24198 ggtgttgctctacactagtctagggctggtttttgttgttgttgct 24243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 8224 - 8512
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||    
T  8224 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggattaaaagctt 8319  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||   ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8320 ccttttgtgtcttctcttttagggttcattattgagagagtgggaaacacaaatacgtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 8419  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  8420 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 43768 - 44054
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  43768 agggttgagtgtctttgtagtgaggatcttttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 43863  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||||| || ||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  43864 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagagtggaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtataagcttgcaagctatttt 43962  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  43963 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaa 44054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Original strand, 36639 - 36925
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  36639 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttgg---aaaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 36734  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36735 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaatcatgtcttgttcttgtgtaagcttgcaagctatttt 36833  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  36834 cttgtaactctttgtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 36925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Original strand, 44114 - 44158
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  44114 ggtgttgctctacactagattaggtctgtttttgttgttgttgct 44158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 289
Target Start/End: Original strand, 133086 - 133354
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  133086 agggttgagtttctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagctt 133181  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagct-tttt 215  Q
    ||| | ||| ||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  133182 ccttttgtgtcttctcttt-agggttcattattgagagagtgggaaacacaaatgggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagtttgcaagctatttt 133280  T
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattg 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  133281 tcttgtaactctttgtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattg 133354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 5973 - 5687
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gcttc 118  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  5973 ggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggc---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagcttc 5878  T
Q  119 ctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaagg-gtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    || | |||  |||||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| | ||||||  || |||||| ||||||||||||||  |||||  |||    
T  5877 cttttgtgttttctctt--aggattcatcattgagagtgtgggtgacacaaaatgagtagaaattaagtcttgttcttgtgtaagcttataagctaattt 5780  T
Q  217 cttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||    
T  5779 cttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2514
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  2784 agggttaagtttctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacaccttgcgtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 2689  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgt-attgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttt 214  Q
    |||| | |||  || ||||  ||| ||| | |||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||  |||||  |    
T  2688 tccttttgtgttttatctt--aggattcatcattgagagtgtgggtgacacaaaatgggtagaaattagttcttgttcttgtgtaagcttataagctaat 2591  T
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  2590 ttcttataattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattgg 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 85973 - 85687
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagctt 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  85973 agggttgagtgtctttgtagtgaggatctcttgggttggg---aaacattgtaaacactttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaactt 85878  T
Q  118 cctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaa-gggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagctttttt 216  Q
    ||| | |||  || ||| ||||  ||| ||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||  |||    
T  85877 ccttttgtgtttt-tctcttagaattcatattgtgggagtgggagacacaaaatgggtagaaattaggtcttgctcttgtgtaagcttttaagctaattt 85779  T
Q  217 cttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg-ctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  85778 cttgtaactctttgtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 85687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 34967 - 35142
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaa-caccaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagctttt-ttcttgtaactctttg 230  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    ||||| ||||  ||||    
T  34967 ttttagggttcatagtgtgagagtggggaaacaccaaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagttcttctaaccttttg 35066  T
Q  231 taacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  35067 taacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaa 35142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 34905 - 34967
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  34905 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttgggtttggg-aaaacattgtaatcaccttgggt 34967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Original strand, 9549 - 9722
Alignment:
Q  134 ttttagggttcgtattgtgagagtggggaac-accaaagggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaa-gcttgcaagcttttttcttgtaactctttgt 231  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||| ||||| | |||    |||||||||  |||||    
T  9549 ttttagggttcatagtgtgagagtgggaaaataccaaagggtaga-tctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaggctagagtcttgtaaccttttgt 9647  T
Q  232 aacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9648 aacactttc-tcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 9722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 3692 - 3754
Alignment:
Q  19 gggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggt 82  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3692 gggttgagtgtctttgttgagagtgtctcttaggtt-aggaaaaacattgtaatcaccttgggt 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 11021 - 10751
Alignment:
Q  20 ggttgagtgtctttgtagagagtgtctcttg--ggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaa-gct 116  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||    
T  11021 ggttgagtgtctttgtagtgaggttctcttgagggttggg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaaagct 10926  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttttagggttcgtattgtgagagtggggaacaccaaaggg-tagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttt 215  Q
    || | |  |   || ||| ||||| ||| |||  ||||||||||  |||| |||  | |||||  ||||||||| ||||||||||||||| || ||  ||    
T  10925 tcttttt-tctgttttctcttaggattcatatcatgagagtgggtgacacaaaatagatagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttgtaaactaatt 10827  T
Q  216 tcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattgg 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  10826 tcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattgg 10751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 14297 - 14389
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  14297 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 14389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 19153 - 19245
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||    
T  19153 ttcttgtaactcttttgtaacacactca-catattgtattggagagctgctctctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaa 19245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 457 - 368
Alignment:
Q  216 tcttgtaactctttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  457 tcttgtaaccttttgtaacactt-ca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaa 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 2239 - 2331
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2239 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 2331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 307
Target Start/End: Original strand, 148944 - 149036
Alignment:
Q  215 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  148944 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctactctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 149036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 307
Target Start/End: Original strand, 181980 - 182044
Alignment:
Q  243 catattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattggctgacctgggtcaacaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  181980 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaa 182044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17404 - 17286
Alignment:
Q  172 ggtagaatctaggtcttgctcttgtgtaagcttgcaagcttttttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcc 270  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||      
T  17404 ggtagaaattaggtcttgttcttgtgtaagcttataagctaatttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctcttt 17305  T
Q  271 cccagattagaccatattg 289  Q
    |||| |||||  |||||||    
T  17304 cccatattaggtcatattg 17286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 45337 - 45276
Alignment:
Q  228 ttgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattagaccatattg 289  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45337 ttgtaacgctttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattg 45276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 45489 - 45374
Alignment:
Q  18 agggttgagtgtcttt-gtagagagtgtctcttgggttggggaaaaacattgtaatcaccttgggtagtgaggagttcactattggaaggatctaaagct 116  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  45489 agggttgaatgtcttttgtagtgaggatctcttgggttgtg---aaacattgtaaacaccttgggtagtgag-atttcaccattggaaggatcaaaagct 45394  T
Q  117 tcctctagtgccttctcttt 136  Q
    |||| | ||| |||||||||    
T  45393 tccttttgtgtcttctcttt 45374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 369 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45197 - 45153
Alignment:
Q  369 ggtgttgctctacactaggctagggctggttttgttgttgttgct 413  Q
    |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  45197 ggtgttgctctacactagacttggtctgtttttgttgttgttgct 45153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 11533 - 11505
Alignment:
Q  248 tggattggagagctgctctctcccccaga 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11533 tggattggagagctgctctctcccccaga 11505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University