View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3678_low_36 (Length: 297)

Name: NF3678_low_36
Description: NF3678
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3678_low_36
NF3678_low_36
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (45-237)||(21030526-21030719)
chr5 (45-243)||(3029172-3029371)
chr5 (48-237)||(27066292-27066482)
chr5 (45-243)||(7286094-7286293)
chr5 (45-243)||(20995500-20995699)
chr5 (48-244)||(1851562-1851759)
chr5 (49-243)||(3150207-3150402)
chr5 (48-244)||(2195585-2195782)
chr5 (45-243)||(4882689-4882888)
chr5 (45-231)||(33610755-33610942)
chr5 (45-243)||(10511968-10512167)
chr5 (45-243)||(38934879-38935078)
chr5 (45-243)||(30689728-30689929)
chr5 (45-237)||(35539533-35539725)
chr5 (45-243)||(26320680-26320877)
chr5 (45-243)||(19448411-19448611)
chr5 (45-243)||(20350351-20350551)
chr5 (45-231)||(3396751-3396938)
chr5 (45-232)||(33706388-33706576)
chr5 (45-243)||(41781258-41781458)
chr5 (49-243)||(17996989-17997184)
chr5 (45-243)||(34373987-34374185)
chr5 (49-243)||(20758366-20758561)
chr5 (45-232)||(33930231-33930419)
chr5 (114-243)||(12420200-12420329)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (45-243)||(9761463-9761662)
chr8 (45-243)||(6477086-6477285)
chr8 (49-237)||(33423858-33424047)
chr8 (45-243)||(14078423-14078622)
chr8 (45-243)||(42810526-42810725)
chr8 (48-243)||(38962367-38962563)
chr8 (48-243)||(38992711-38992907)
chr8 (51-243)||(22332320-22332513)
chr8 (45-243)||(3751309-3751508)
chr8 (45-243)||(27273428-27273626)
chr8 (45-243)||(38993880-38994078)
chr8 (45-243)||(44599897-44600095)
chr8 (45-232)||(19248310-19248498)
chr8 (45-232)||(19321494-19321682)
chr8 (45-243)||(45293164-45293364)
chr8 (45-231)||(19395167-19395354)
chr8 (45-243)||(36597628-36597827)
chr8 (45-243)||(41977694-41977893)
chr8 (45-243)||(44382393-44382592)
chr8 (52-243)||(23522253-23522442)
chr8 (70-243)||(5835816-5835990)
chr8 (45-243)||(41629083-41629283)
chr8 (123-243)||(42785443-42785563)
chr8 (45-243)||(22946393-22946588)
chr8 (124-243)||(41533452-41533571)
chr8 (45-144)||(41156835-41156935)
chr8 (154-243)||(30826699-30826788)
chr8 (45-96)||(30826650-30826701)
chr8 (51-96)||(12760616-12760661)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (45-243)||(35087443-35087642)
chr3 (48-243)||(18741833-18742029)
chr3 (45-232)||(50770863-50771051)
chr3 (45-243)||(50741823-50742022)
chr3 (49-243)||(21699192-21699387)
chr3 (45-243)||(55294386-55294584)
chr3 (45-243)||(31368620-31368820)
chr3 (45-243)||(6103731-6103931)
chr3 (45-243)||(8242941-8243140)
chr3 (45-243)||(16342107-16342305)
chr3 (45-243)||(49113515-49113714)
chr3 (45-243)||(11597565-11597764)
chr3 (45-243)||(32755964-32756163)
chr3 (45-243)||(40824275-40824474)
chr3 (46-243)||(48520645-48520843)
chr3 (48-232)||(48977137-48977317)
chr3 (45-243)||(54513233-54513434)
chr3 (45-243)||(52462536-52462735)
chr3 (96-237)||(51248806-51248947)
chr3 (45-243)||(54934256-54934455)
chr3 (51-205)||(52853087-52853242)
chr3 (117-243)||(23194712-23194838)
chr3 (191-243)||(50802805-50802857)
chr3 (191-243)||(50873020-50873072)
chr3 (190-243)||(2843528-2843581)
chr3 (48-156)||(23936964-23937072)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (45-232)||(54331274-54331462)
chr4 (45-243)||(19831017-19831216)
chr4 (45-243)||(36514960-36515159)
chr4 (45-243)||(55998332-55998531)
chr4 (45-240)||(2776748-2776944)
chr4 (46-243)||(13628526-13628725)
chr4 (45-243)||(14829131-14829330)
chr4 (45-243)||(38008732-38008931)
chr4 (45-232)||(5271906-5272094)
chr4 (45-243)||(7643412-7643612)
chr4 (45-243)||(8531289-8531488)
chr4 (45-243)||(22115671-22115870)
chr4 (45-231)||(34056195-34056382)
chr4 (53-243)||(53342889-53343080)
chr4 (45-243)||(17699647-17699846)
chr4 (45-243)||(37701217-37701416)
chr4 (45-237)||(23479371-23479564)
chr4 (45-243)||(28973534-28973732)
chr4 (45-243)||(40622622-40622821)
chr4 (45-243)||(41983853-41984051)
chr4 (56-243)||(33502621-33502808)
chr4 (55-243)||(7847505-7847694)
chr4 (45-243)||(17740513-17740711)
chr4 (45-173)||(21353553-21353682)
chr4 (45-243)||(47557046-47557242)
chr4 (102-232)||(36857597-36857727)
chr4 (147-243)||(39742614-39742710)
chr4 (48-106)||(35495301-35495360)
chr4 (161-243)||(35495221-35495303)
chr4 (45-96)||(28134833-28134884)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (45-243)||(8925519-8925718)
chr7 (14-283)||(41261940-41262212)
chr7 (45-243)||(33638283-33638482)
chr7 (45-243)||(11500314-11500513)
chr7 (45-243)||(17478368-17478567)
chr7 (45-243)||(17574647-17574846)
chr7 (45-243)||(42688007-42688208)
chr7 (45-243)||(17470186-17470385)
chr7 (45-243)||(17482803-17483002)
chr7 (45-243)||(17570212-17570411)
chr7 (45-243)||(17582829-17583028)
chr7 (53-243)||(19521613-19521803)
chr7 (45-243)||(27734658-27734856)
chr7 (48-243)||(23766048-23766244)
chr7 (45-243)||(42918318-42918517)
chr7 (45-228)||(5963151-5963336)
chr7 (44-243)||(23299332-23299531)
chr7 (45-243)||(33031315-33031512)
chr7 (51-232)||(14309314-14309497)
chr7 (45-243)||(47174918-47175116)
chr7 (45-243)||(42826966-42827165)
chr7 (81-243)||(9149815-9149978)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (45-243)||(1072876-1073075)
chr6 (45-243)||(14887551-14887750)
chr6 (45-243)||(18598598-18598798)
chr6 (45-243)||(2521600-2521799)
chr6 (45-243)||(34856387-34856586)
chr6 (46-243)||(17939956-17940154)
chr6 (48-243)||(35041526-35041722)
chr6 (45-243)||(4424920-4425119)
chr6 (45-243)||(15276071-15276270)
chr6 (45-243)||(33321066-33321265)
chr6 (45-243)||(34321530-34321729)
chr6 (51-240)||(18312232-18312421)
chr6 (45-243)||(7222745-7222945)
chr6 (46-243)||(22373456-22373653)
chr6 (45-243)||(30044643-30044842)
chr6 (45-243)||(21799978-21800175)
chr6 (103-243)||(11933095-11933235)
chr6 (103-243)||(33814485-33814625)
chr6 (127-243)||(25540450-25540566)
chr6 (45-153)||(14831952-14832061)
chr6 (190-236)||(14832064-14832110)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (45-243)||(36632657-36632856)
chr2 (45-232)||(26822106-26822294)
chr2 (45-243)||(19126291-19126489)
chr2 (48-243)||(33663403-33663599)
chr2 (45-243)||(21098175-21098374)
chr2 (45-243)||(42885860-42886059)
chr2 (45-243)||(18092327-18092526)
chr2 (45-243)||(33907718-33907916)
chr2 (54-232)||(11448226-11448405)
chr2 (45-243)||(11707101-11707299)
chr2 (45-243)||(16723956-16724155)
chr2 (45-243)||(26827986-26828184)
chr2 (45-243)||(30570155-30570354)
chr2 (52-243)||(19167465-19167657)
chr2 (45-237)||(1514598-1514791)
chr2 (45-243)||(45204626-45204824)
chr2 (51-232)||(45399279-45399461)
chr2 (75-232)||(27364454-27364612)
chr2 (45-243)||(35285898-35286093)
chr2 (125-243)||(5252901-5253019)
chr2 (45-147)||(4812033-4812136)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (45-243)||(18814678-18814877)
chr1 (45-243)||(34688046-34688245)
chr1 (45-243)||(41962521-41962720)
chr1 (45-243)||(44406819-44407018)
chr1 (45-231)||(31620148-31620335)
chr1 (45-243)||(34692574-34692773)
chr1 (45-236)||(38844807-38844999)
chr1 (45-232)||(41829654-41829841)
chr1 (45-243)||(50561508-50561707)
chr1 (49-243)||(52521210-52521405)
chr1 (45-243)||(10694416-10694615)
chr1 (76-243)||(48340805-48340973)
chr1 (45-243)||(17671909-17672108)
chr1 (45-243)||(45005229-45005428)
chr1 (45-243)||(52310294-52310492)
chr1 (45-243)||(36682498-36682696)
chr1 (45-243)||(12245487-12245682)
chr1 (45-215)||(17709424-17709595)
chr1 (45-166)||(47135860-47135982)
chr1 (45-145)||(16031287-16031388)
chr1 (46-94)||(51965474-51965522)
chr1 (191-237)||(16031229-16031275)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (45-243)||(25965-26164)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (45-243)||(10379-10578)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (45-243)||(48841-49039)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (45-243)||(176911-177109)
scaffold0010 (45-242)||(120356-120554)
[»] scaffold1634 (1 HSPs)
scaffold1634 (45-243)||(638-836)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (45-243)||(398-597)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (51-243)||(11019-11212)
scaffold0032 (51-243)||(4570-4763)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (45-232)||(101161-101349)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (45-243)||(3025-3223)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (45-243)||(12534-12733)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (45-173)||(869-998)
scaffold0122 (194-243)||(5099-5148)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (98-233)||(14953-15088)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (151-243)||(10340-10432)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 21030526 - 21030719
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030526 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 21030625  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030626 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatg 21030719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 3029172 - 3029371
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3029172 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatcaagagaagccacctaaaaatatgcacgttcacg 3029271  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3029272 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgttactt 3029371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 48 - 237
Target Start/End: Original strand, 27066292 - 27066482
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27066292 ggccaatggatcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 27066391  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27066392 tttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctatactagattatcttcactcaccgatg 27066482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 7286094 - 7286293
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7286094 ggcggccaatggttcaaatttcgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaag 7286193  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7286194 tcgtttccaaataaagagttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 7286293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20995699 - 20995500
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20995699 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaagtgataagctattttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 20995600  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20995599 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatcttcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 20995500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 48 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1851759 - 1851562
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1851759 ggccaatggttcaaattttgtcgagaacatattttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 1851660  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  1851659 tttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcattttcaacagatcaccttaactctaatcctagactacattatcttcactcaccgatgctacttg 1851562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3150402 - 3150207
Alignment:
Q  49 gccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 147  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3150402 gccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttaaaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 3150303  T
Q  148 ttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3150302 tttcaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 3150207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 244
Target Start/End: Original strand, 2195585 - 2195782
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2195585 ggccaatggttcaaattttgccaagaacatatgttataggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 2195684  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttacttg 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  2195685 tttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcattgatgctacttg 2195782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 4882689 - 4882888
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatag-ttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4882689 ggcggccaatggttcaagttttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 4882788  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  4882789 tcgtttccaaataacgatttgatgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattattttcactcaccaatgctactt 4882888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33610942 - 33610755
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  33610942 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacataaaaatatgcacgttgaag 33610843  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33610842 tcgtttccaaataaagatttggtgttcataatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactca 33610755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10512167 - 10511968
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10512167 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttaaaggtaggtgataagttaatttttgatttagagaagccacctaaaaatatgcacgtttaag 10512068  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10512067 tcgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacagattaccttaactctaatcctagactagattatctttactcaccgaagttactt 10511968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 38934879 - 38935078
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38934879 ggcggccaatggttcaaattttgtcgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaatttttgatgtagagaagccatttaaaaatatgcacgttcaag 38934978  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  38934979 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcacatatgttactt 38935078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 30689728 - 30689929
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaatttt--ttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttca 141  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30689728 ggcgaccaatggttcaaattttgccgagaacgtatgttagaggtaggtgataagttaattttttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttca 30689827  T
Q  142 agtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  30689828 agtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcaccttaactttaattctagactagattattttcactcactgatgctac 30689927  T
Q  242 tt 243  Q
    ||    
T  30689928 tt 30689929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35539725 - 35539533
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35539725 ggcggccaatggttcaaattttcc-gagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 35539627  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatg 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  35539626 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattaactcaccgatg 35539533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26320877 - 26320680
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26320877 ggcggacaatggttcaaattttgacgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 26320778  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26320777 tcgtttccaaataaagatttg--gttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 26320680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 19448411 - 19448611
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgtt-agaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19448411 ggcggccaatgattcaaattttgccaagaacatatgtttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 19448510  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||  |||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19448511 gtcgcttccaaataaaaatttggtgtttatgatctgcactttcagcagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctact 19448610  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  19448611 t 19448611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 20350351 - 20350551
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaatttt-ttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 142  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350351 ggcggtcaacggttcaaattttgccgaaaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttttatctaaagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 20350450  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20350451 gtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacaaatcactttaactctaatcctacactagattatcttcactcatcgatgctact 20350550  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  20350551 t 20350551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3396938 - 3396751
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3396938 ggcggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 3396839  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactca 231  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  3396838 gcgtttccaaataaagatttgatgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctaaactagattttcttcactca 3396751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33706576 - 33706388
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33706576 ggcggtcaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 33706477  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | | || ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  33706476 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgattcgcaatttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcaatcac 33706388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 41781258 - 41781458
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781258 ggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 41781357  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaat-cttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41781358 tcgttcccaaataaagactttgtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatccctagactagattatcttcactcactgatgctact 41781457  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  41781458 t 41781458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 17996989 - 17997184
Alignment:
Q  49 gccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 147  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  | | ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17996989 gccaatggttcaaattttgtcaagaacatatgttagaggaggttaataagttaatttttgatttagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 17997088  T
Q  148 ttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17997089 ttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccaatgatactt 17997184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34374185 - 34373987
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34374185 ggcggccaatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaaa 34374087  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  34374086 tcgttcacaaataaagatttggtgttcatgatccgtactttcaacagatcaccttaactctaattctagactagattatattcactcaccgatgctactt 34373987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Original strand, 20758366 - 20758561
Alignment:
Q  49 gccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 147  Q
    |||||| ||||||||||||  | |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20758366 gccaattgttcaaattttgtcgtgaacatatgtcaaaggtatgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaagtcgt 20758465  T
Q  148 ttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | || ||| ||  ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20758466 ttccaagtaaagatttggtgttcatgattcgcattttcaacagatcatcttaactataatcctaaactagattatcttcactcaccgatgttactt 20758561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 33930231 - 33930419
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33930231 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatattttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccgcctaaaaatatgcacgttcaag 33930330  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || ||   |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33930331 tcattcccaaataaagatttggtattcatgatccgcacgttcaacatatcaccttaattttaatcatatactagattatcttcactcac 33930419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12420329 - 12420200
Alignment:
Q  114 agaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttaga 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  12420329 agaagccacctaaaaatatgcacgtttaaatcgttcccaaataaagattcggtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctaga 12420230  T
Q  214 ctagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12420229 caagattatcttcactcactgatgttactt 12420200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 9761463 - 9761662
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9761463 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 9761562  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9761563 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaatagatcaccttaactctaatcgtagactagattatcttcactcactgatgctactt 9761662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6477285 - 6477086
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6477285 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 6477186  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6477185 tcgtttccaaacaaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctagattagattatcttcactcaccgatgctactt 6477086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33424047 - 33423858
Alignment:
Q  49 gccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33424047 gccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaagtcgt 33423948  T
Q  148 ttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423947 ttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcaccgatg 33423858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14078622 - 14078423
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14078622 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgtacgttcaag 14078523  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14078522 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatctttactcactgatgttactt 14078423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42810725 - 42810526
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42810725 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagggttaggtgataagttaatttttaatctagagaagccacctaaaaatatgcacattcaag 42810626  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42810625 tcgtttccaaataaatatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcctcactcaccgatgctactt 42810526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 38962367 - 38962563
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  38962367 ggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttaaaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagtcacctaaaaatatgcacgttcaagtca 38962466  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  38962467 tttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattaccttcactcactgatgctactt 38962563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 38992711 - 38992907
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  38992711 ggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttaaaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagtcacctaaaaatatgcacgttcaagtca 38992810  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  38992811 tttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattaccttcactcactgatgctactt 38992907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22332513 - 22332320
Alignment:
Q  51 caatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 149  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332513 caatggtttaaattttgtcgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 22332414  T
Q  150 ccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22332413 ccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcagtcaccgatgctactt 22332320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 3751309 - 3751508
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3751309 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgtttaat 3751408  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3751409 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 3751508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 27273428 - 27273626
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27273428 ggcggccaatggtttaaatttttc-gagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacataaaaatatgcacgttcaat 27273526  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27273527 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaattctagactagattatcttcactcactgatgctactt 27273626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 38993880 - 38994078
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  38993880 ggcggccaatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaaa 38993978  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  38993979 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctactt 38994078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 44599897 - 44600095
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  44599897 ggcggccaatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaaa 44599995  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44599996 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctactt 44600095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 19248310 - 19248498
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagt-taattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19248310 ggcggccaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgagaaactaatttttgatcaagagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaag 19248409  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19248410 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacgagattatcttcactcac 19248498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 19321494 - 19321682
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagt-taattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19321494 ggcggccaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgagaaactaatttttgatcaagagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaag 19321593  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19321594 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacgagattatcttcactcac 19321682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45293364 - 45293164
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45293364 ggcggccaatggttcaacttttgctgagagcatatgttagaggtaggtgaaaagctcatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 45293265  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaa-ctctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  45293264 tcgttctcaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaatagatcaccttaatctctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctact 45293165  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  45293164 t 45293164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19395354 - 19395167
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatag-ttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19395354 ggcggccaatggttcaaatttcgccgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 19395255  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactca 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  19395254 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaaccaatcaccttaactctaatccttgactcgattatcttcactca 19395167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36597827 - 36597628
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36597827 ggcgggcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaagtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 36597728  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
     ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||  || ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36597727 gcgtttccaaataaagattgagtgttcatgatccgcactttcaacagagcaccttaactctaatcccatactagattatcttcactcactgatgctactt 36597628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 41977694 - 41977893
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41977694 ggcggtcaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgtacaag 41977793  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||  || |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41977794 tcattcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcattttcaacagaccaccttaactctaatcctagagaagattatctccactcaccgatgctactt 41977893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44382592 - 44382393
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44382592 ggcggtcaatggttcaacttttgccaagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctatagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 44382493  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44382492 tcgttactaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatattcactcaccgatgctactt 44382393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23522442 - 23522253
Alignment:
Q  52 aatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttc 150  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  23522442 aatggttcaaattttgacgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttaatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt---ttc 23522346  T
Q  151 caaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23522345 caaataaagaattggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaatgatgttactt 23522253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Original strand, 5835816 - 5835990
Alignment:
Q  70 gagaacatatgttagaggtaggtgatag-ttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5835816 gagaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttctaaataaagatttggtgt 5835915  T
Q  169 tcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5835916 tcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcatagatcagattatcttcactcactgatgttactt 5835990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 41629083 - 41629283
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctga-gaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 142  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||    
T  41629083 ggcggccaatggttcaaactttgccgaagaatatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacataaaagtatggatgttcaa 41629182  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41629183 gtcgtttccaaataaagatctaatgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctact 41629282  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  41629283 t 41629283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 243
Target Start/End: Original strand, 42785443 - 42785563
Alignment:
Q  123 ctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42785443 ctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaatagatcaccttaactttaatcctagactagattat 42785542  T
Q  223 cttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||| |||| |||||    
T  42785543 cttcactcactgatgctactt 42785563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22946588 - 22946393
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22946588 ggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatg----aggtaggtgataagctaatttttgacttagagaagccaccaaaaaatatgcacgttcaag 22946493  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || ||   |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22946492 tcattcccaaataaagatttggtattcatgatccgcacgttcaacatatcaccttaattctaatcatatactagattatcttcactcactgatgctactt 22946393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 124 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41533571 - 41533452
Alignment:
Q  124 taaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatc 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  41533571 taaaaatatgcacgttcaagtagttcccaaataaatatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacaagattatt 41533472  T
Q  224 ttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || |||||||||||||||||    
T  41533471 tttactcaccgatgttactt 41533452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Original strand, 41156835 - 41156935
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41156835 ggcggtcaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaaaccacctaaaaatatgcacgttcaag 41156934  T
Q  144 t 144  Q
    |    
T  41156935 t 41156935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 243
Target Start/End: Original strand, 30826699 - 30826788
Alignment:
Q  154 ataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30826699 ataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctatactagattatcttcactcactgatgctactt 30826788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Original strand, 30826650 - 30826701
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata 96  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30826650 ggcggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgata 30826701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 96
Target Start/End: Original strand, 12760616 - 12760661
Alignment:
Q  51 caatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata 96  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12760616 caatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgata 12760661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35087642 - 35087443
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087642 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 35087543  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35087542 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 35087443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18742029 - 18741833
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18742029 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccatctaaaaatatgcacgttcaagtcg 18741930  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18741929 tttccaaatgaaggtttggtgttcatgatccgcacttttaacagatcaccttaactctaatcttagactagataatcttcactcaccgatgctactt 18741833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50771051 - 50770863
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50771051 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccaactaaaaatatgcacgttcaag 50770952  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50770951 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcgtagactagattatcttcactcac 50770863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 50741823 - 50742022
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50741823 ggcggtcaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 50741922  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50741923 ttttttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctactt 50742022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21699387 - 21699192
Alignment:
Q  49 gccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21699387 gccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaagtatgcacgttcaagtcgt 21699288  T
Q  148 ttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21699287 ttccaaataaagatttggtgttcataatccgcactttcagcatatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgctactt 21699192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55294584 - 55294386
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 144  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55294584 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaatatatgttagaggtaggtgatagctaattttttatctaaagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 55294485  T
Q  145 cgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  55294484 cgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccaatgttactt 55294386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31368820 - 31368620
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaatttttt-atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 142  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31368820 ggcggtcaatagttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 31368721  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31368720 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctact 31368621  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  31368620 t 31368620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6103931 - 6103731
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtagg-tgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6103931 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtagggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 6103832  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6103831 gttctttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacataccaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgttact 6103732  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  6103731 t 6103731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 8242941 - 8243140
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8242941 ggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatacacgttcaag 8243040  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8243041 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactccaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 8243140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 16342107 - 16342305
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16342107 ggcggccaatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 16342205  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16342206 tcgttctcaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgttactt 16342305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 49113515 - 49113714
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatag-ttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49113515 ggcggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatatagagaagtcacctaaaaatatgcacgttcaag 49113614  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49113615 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacacttgcaacaaatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcaatcaccgatgctactt 49113714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11597764 - 11597565
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11597764 ggcggtcaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacattcaag 11597665  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11597664 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcttagacaagattatcttcactcaccaatgctactt 11597565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 32755964 - 32756163
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagt-taattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32755964 ggcggccaatggttcaaattttaccgagaacatatgttagaggtaggtgataatctaatttttgatctagagaagccacataaaaatatgcacgttcaag 32756063  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32756064 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcactttaattctaatcctatactagattatcttcactcactgatgctactt 32756163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40824474 - 40824275
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40824474 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttaatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 40824375  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  40824374 tcgttcccaaataaagatttggtgtttatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatctcagacaagattatcttcactcatcgatgctactt 40824275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 46 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48520843 - 48520645
Alignment:
Q  46 gcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 144  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48520843 gcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 48520744  T
Q  145 cgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  48520743 tgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatccaagacaagattatcttcactcaccaatgctactt 48520645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 48 - 232
Target Start/End: Original strand, 48977137 - 48977317
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48977137 ggccaatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 48977236  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||    
T  48977237 tttccaaataaagatttggtgttcatgatccgtactttcaacagatcaccttaactataatc-----ctagattatcttcactcac 48977317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 54513233 - 54513434
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54513233 ggcggccaatgat-caaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 54513331  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactag---attatcttcactcaccgatgtta 240  Q
    |||||  ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||| ||    
T  54513332 tcgttctcaattaaagatttcgtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattattatcttcactcaccgatgcta 54513431  T
Q  241 ctt 243  Q
    |||    
T  54513432 ctt 54513434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 52462735 - 52462536
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52462735 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccaccttaaaatatgcacgttcaag 52462636  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| |||  ||||| ||   |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  52462635 tcgttcccaaataaagattatgtgttcatgatccgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactggattatcttcactcactgatgctactt 52462536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 237
Target Start/End: Original strand, 51248806 - 51248947
Alignment:
Q  96 agttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcac 195  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||    
T  51248806 agttaatttttgatctagagaagtcacctaaaaataagcatgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcac 51248905  T
Q  196 cttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatg 237  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51248906 cttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatg 51248947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 54934256 - 54934455
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54934256 ggcgaccaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtagatgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 54934355  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||   || ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  54934356 tcattcccaaataaagatttggtgttcatgatatgcactttcaacatattaccttaattctaatcatatactagattatcttcactcactgatgctactt 54934455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52853242 - 52853087
Alignment:
Q  51 caatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatag-ttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  52853242 caatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaagtaggtgataaattaatttttgatctagagaagtcatctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 52853143  T
Q  150 ccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactcta 205  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  52853142 ctaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagattaccttaactcta 52853087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 243
Target Start/End: Original strand, 23194712 - 23194838
Alignment:
Q  117 agccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagacta 216  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||| |||||||| |||| ||    
T  23194712 agccacctaaaaatatgtacgatcaagtcgttcccaaataaatatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttatctctaatcctagatta 23194811  T
Q  217 gattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23194812 gattatcttcactcatcgatgttactt 23194838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50802857 - 50802805
Alignment:
Q  191 atcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50802857 atcaccttaactctaatcttagattagattatcttcactcaccgatgttactt 50802805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 243
Target Start/End: Original strand, 50873020 - 50873072
Alignment:
Q  191 atcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50873020 atcaccttaactctaatcttagattagattatcttcactcaccgatgttactt 50873072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2843581 - 2843528
Alignment:
Q  190 gatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2843581 gatcaccttaactctaatcctagactagattgtcttcactcaccgatgctactt 2843528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Original strand, 23936964 - 23937072
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagt-taattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||| |||| ||   |||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  23936964 ggccaatggttcaaatttttccgaga-catgtgttagtggtcggtggtaaactaatctttgatctggaaaagccacctaaaaacatgcacgttcaagttg 23937062  T
Q  147 tttccaaata 156  Q
    || |||||||    
T  23937063 ttcccaaata 23937072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 54331462 - 54331274
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331462 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 54331363  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54331362 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcac 54331274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19831216 - 19831017
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19831216 ggcggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatatagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 19831117  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19831116 tcgtttccaaataaatatttggtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 19831017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36515159 - 36514960
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36515159 ggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 36515060  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36515059 tcatttccaaataaagatttggtgttcatgattcacacttttaacagatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcaccgatgttactt 36514960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55998531 - 55998332
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55998531 ggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 55998432  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55998431 tcgtttccaaataaagatttggtgttgatgacccacacgttgaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 55998332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 240
Target Start/End: Original strand, 2776748 - 2776944
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776748 ggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 2776847  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgtta 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776848 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcccagactagattatcttcactcaccgatgtta 2776944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 46 - 243
Target Start/End: Original strand, 13628526 - 13628725
Alignment:
Q  46 gcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaa-atatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13628526 gcggctaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaatatatgcacgttcaag 13628625  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13628626 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgtactttcaatagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 13628725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14829330 - 14829131
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14829330 ggcggccaatggttcaaattttgccgataacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 14829231  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14829230 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcagtgatgttactt 14829131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 38008732 - 38008931
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38008732 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 38008831  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  38008832 tcgctcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 38008931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5272094 - 5271906
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5272094 ggcggccaatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 5271995  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5271994 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactaaattatcttcactcac 5271906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7643612 - 7643412
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaatttttt-atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 142  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7643612 ggcgcccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttgatctagagaagccgcctaataatatgcacgttcaa 7643513  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7643512 gtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctact 7643413  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  7643412 t 7643412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 8531289 - 8531488
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8531289 ggcggtcaatggttaaacttttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 8531388  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8531389 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaatagatcaccttaactctaatcatagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 8531488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22115870 - 22115671
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115870 ggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 22115771  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22115770 tcgtttccaaataaagatttaatgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactctccgatgttactt 22115671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34056382 - 34056195
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34056382 ggcggccaatggttcaaattttgccgaaaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 34056283  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  34056282 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacaaatcaccttaactataatcctagacaagattatattcactca 34056195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Original strand, 53342889 - 53343080
Alignment:
Q  53 atggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttcc 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53342889 atggttcaaatattgctgagaacatatgttagagataggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaattcgtttcc 53342988  T
Q  152 aaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53342989 aaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacaaatcaccttaactctaatcctaaactagattatcttcactcaccgatgctactt 53343080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 17699647 - 17699846
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  17699647 ggcggccaatggttcaaattttgccaaaaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttaatctagagaagccacctaaaaatatgcatcttcaag 17699746  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17699747 tcgtttctaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcacattaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 17699846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37701416 - 37701217
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37701416 ggcggccaattgttcaaattttaccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaag 37701317  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37701316 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgtactttcaacatatcaccttaactctaatcctaaactagattatcttcactcaccgatgctactt 37701217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Original strand, 23479371 - 23479564
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23479371 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaattttttatctagagaagccgcctaaaaacatgcacgttcaag 23479470  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatg 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23479471 tcatttccaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatg 23479564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 28973534 - 28973732
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28973534 ggcggccaatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccatctaaaaatatgcacgttcaag 28973632  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  28973633 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactaaattatattcactcaccgatgctactt 28973732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 40622622 - 40622821
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40622622 ggcggtcaatggttcaacttttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 40622721  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||  |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  40622722 tcgttctcaaataaagatttggtcttcatgatccgcatttttaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 40622821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41984051 - 41983853
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41984051 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttta-atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 41983953  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41983952 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgctctttcaacagatcaccttaactctaatcctaaactagattatcttcactcaccgatgctactt 41983853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33502808 - 33502621
Alignment:
Q  56 gttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatag-ttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaa 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33502808 gttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagagaagc-acctaataatatgcatgttcaagtcgtttccaaa 33502710  T
Q  155 taaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33502709 taaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 33502621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 243
Target Start/End: Original strand, 7847505 - 7847694
Alignment:
Q  55 ggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaa 153  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7847505 ggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacattcaagtcgttcccaa 7847604  T
Q  154 ataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7847605 ataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 7847694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 17740513 - 17740711
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17740513 ggcggtcaatgattaaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttg-atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 17740611  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  || |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  17740612 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagaccaccttaactctaatcctagaaaatattatcttcactcaccgatgctactt 17740711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 173
Target Start/End: Original strand, 21353553 - 21353682
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21353553 ggcggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtgggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaag 21353652  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21353653 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatg 21353682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 47557242 - 47557046
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47557242 ggcggtcaatgatgcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatgtagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 47557143  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||     ||||||||||||||||||||||| | | || ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  47557142 tc---cacaaataaagatttggtgttcatgattcgcaatttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcaatcaccgatgctactt 47557046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 232
Target Start/End: Original strand, 36857597 - 36857727
Alignment:
Q  102 ttttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||    
T  36857597 ttttttatctagagaagccacctaaaaatatgcaggttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgatgcgcactttcaacagatcaccttaac 36857696  T
Q  202 tctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  36857697 tctaattttagagtagattatcctcactcac 36857727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 147 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39742710 - 39742614
Alignment:
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39742710 tttcctaataaagatttgatgttcatgatacacactttcaacatatcaccttaactctaatcatagactagattatcttcactcactgatgctactt 39742614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 35495360 - 35495301
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgat-agttaattttt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35495360 ggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaattttt 35495301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35495303 - 35495221
Alignment:
Q  161 tttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35495303 tttgatgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctacactagattatcttcactcaccgatgctactt 35495221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 28134884 - 28134833
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata 96  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28134884 ggcgaccaatggttcgaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgata 28134833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8925718 - 8925519
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8925718 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 8925619  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  8925618 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccacactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattagcttcactcactgatgctactt 8925519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41262212 - 41261940
Alignment:
Q  14 gcaaaaaaggtataaagtgtctcttgataatggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatcta 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  41262212 gcaaaaaaggtataa-gtgtctcttgataatggcggccaatggttcaaattttgcctagtacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatc-- 41262116  T
Q  113 gagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttag 212  Q
       |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||    
T  41262115 ---aagccacctaaaaatatgcatgttcaagtcgtttctaaataaagatttgatgtttatgatccacactttcaacagatcactttaactctaatcctag 41262019  T
Q  213 actagattatcttcactcaccgatg--------ttacttgatttcattcgaccctcgtatatagcatgcaatccaattt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  41262018 actagattatcttcactcaccgatgttgtttctttgcttgatttcattcgaccctcacatatagcatgcaatgcaattt 41261940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33638482 - 33638283
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33638482 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 33638383  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33638382 tcgtttccaaataaaaatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgttactt 33638283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 11500314 - 11500513
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11500314 ggcggctaatggttcaaattttgccgagaacttatgttagaggtaagtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 11500413  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11500414 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcattttcaatagatcaacttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 11500513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 17478368 - 17478567
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17478368 ggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 17478467  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||   | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17478468 tcgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacaaaacaccataactctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctactt 17478567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17574846 - 17574647
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17574846 ggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 17574747  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||   | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17574746 tcgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacaaaacaccataactctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctactt 17574647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 42688007 - 42688208
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccac--ctaaaaatatgcacgttca 141  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  42688007 ggcggccaatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttaatctagagaagccacacctaaaaataagcacgttca 42688106  T
Q  142 agtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttac 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42688107 agtcgtttacaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctaaactagattatcttcactcaccgatgctac 42688206  T
Q  242 tt 243  Q
    ||    
T  42688207 tt 42688208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 17470186 - 17470385
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17470186 ggcggccaatggttcaaattttatcgtgaacatatgttagaggtggatgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 17470285  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17470286 tcgtttccaaataaagatttggtcttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccaatgttactt 17470385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 17482803 - 17483002
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17482803 ggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagctacctaaaaatatgcacgttcaag 17482902  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||   | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17482903 tcgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacaaaacaccataactctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctactt 17483002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17570411 - 17570212
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17570411 ggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagctacctaaaaatatgcacgttcaag 17570312  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||   | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17570311 tcgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacaaaacaccataactctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctactt 17570212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17583028 - 17582829
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17583028 ggcggccaatggttcaaattttatcgtgaacatatgttagaggtggatgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 17582929  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17582928 tcgtttccaaataaagatttggtcttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccaatgttactt 17582829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 243
Target Start/End: Original strand, 19521613 - 19521803
Alignment:
Q  53 atggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttcc 151  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19521613 atggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtag-tgataagttaatttttgatctagataagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttcc 19521711  T
Q  152 aaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19521712 aaataaaaatttggtgttcatgatccgcactttcaacggatcaccttaactctaattctagactagattatcttcactcacagatgctactt 19521803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 27734856 - 27734658
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 144  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  27734856 ggcggtcaacggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgatagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaaat 27734757  T
Q  145 cgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27734756 cgttcccaaataaagatttggtattcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 27734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23766244 - 23766048
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23766244 ggccaatggttcaaattttgacgagaacatgtgttagatgtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 23766145  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23766144 tttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcactttaacattaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 23766048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 42918318 - 42918517
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42918318 ggcggtcaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgaaaagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 42918417  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||  || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42918418 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatgtgcactttcaacagaccaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 42918517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 228
Target Start/End: Original strand, 5963151 - 5963336
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963151 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 5963250  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccaca-cttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcac 228  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5963251 ttgtttccaaataaagatttagtgttcatgatccgcacctttcaacatatcaccttaactctaatcctatactagattatcttcac 5963336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23299531 - 23299332
Alignment:
Q  44 tggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 142  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23299531 tggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttg-atctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaa 23299433  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23299432 gtcattcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctact 23299333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 33031315 - 33031512
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33031315 ggcggtcaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatttagataagccacctaaaaatatgcacgttcaag 33031414  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||   ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  33031415 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacatatcaccttaactctaatcttgaact--attatcttcactcaccgatgctactt 33031512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Original strand, 14309314 - 14309497
Alignment:
Q  51 caatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaatttttt-atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtt 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14309314 caatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttttatgtagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaattcctt 14309413  T
Q  149 tccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14309414 tccaaataaagatttagtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcac 14309497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 47174918 - 47175116
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagt-taattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||     
T  47174918 ggcggccaatggttcaacttttgcagagaacatatgttagaggtaggtgataaactaatttttgatctagagaagccacctaaaattatgcacat-caaa 47175016  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  47175017 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcatcgatgctactt 47175116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42827165 - 42826966
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42827165 ggcggccaacggtttaacttttgccgataacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 42827066  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || ||  |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42827065 tcattctcaaataaagacttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcactgatgctactt 42826966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 243
Target Start/End: Original strand, 9149815 - 9149978
Alignment:
Q  81 ttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccac 179  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  9149815 ttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatctgc 9149914  T
Q  180 acttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||   | |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  9149915 actttcaacataccaccttaattctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 9149978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1073075 - 1072876
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1073075 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 1072976  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1072975 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 1072876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14887750 - 14887551
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14887750 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 14887651  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14887650 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatcctcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 14887551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18598798 - 18598598
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaatttttt-atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18598798 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaa 18598699  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18598698 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctact 18598599  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  18598598 t 18598598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 2521600 - 2521799
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2521600 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccaccttaaaatatgcacgttcaag 2521699  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2521700 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatgtcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 2521799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 34856387 - 34856586
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34856387 ggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 34856486  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  34856487 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 34856586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 46 - 243
Target Start/End: Original strand, 17939956 - 17940154
Alignment:
Q  46 gcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 144  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17939956 gcggtcaatggtttaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaagttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 17940055  T
Q  145 cgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17940056 cgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 17940154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 35041526 - 35041722
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35041526 ggccaatggttcaaattttgtcgtgaacatatgttagaggtgggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaatcg 35041625  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35041626 tttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcacttaccaatgttactt 35041722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 4424920 - 4425119
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4424920 ggcgaccaatggtacaaattttgctgagaacatatgtaagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaggcacctagaaatatgcacgttcaag 4425019  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4425020 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaattgtagactagattatcttcactgaccgatgctactt 4425119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 15276071 - 15276270
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276071 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 15276170  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||| |||||    
T  15276171 tcgttcccaactaaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacacatcaccttaactctaatcctagacgagaatatctttactcactgatgctactt 15276270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33321265 - 33321066
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33321265 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 33321166  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33321165 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactttaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 33321066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 34321530 - 34321729
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagt-taattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34321530 ggcggccaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgaaaaactaatttttcatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 34321629  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||||    
T  34321630 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagaaaaaattatcttcactcaccgatgctactt 34321729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 240
Target Start/End: Original strand, 18312232 - 18312421
Alignment:
Q  51 caatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatag-ttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 149  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18312232 caatggttcaaattttgtcgataacatatgttagaggtaggtgataaattaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaagtcgttt 18312331  T
Q  150 ccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgtta 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18312332 ccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaacagatcaccttaa-tctaatcgtagactagattatcttcactcaccaatgtta 18312421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 7222745 - 7222945
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatag-ttaattttttatctagagaagccacctaaaa-atatgcacgttcaa 142  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7222745 ggcggtcaatggttcaaattttgccgagaacatatgttataggtaagtgataaattaatttttgatctagagaagccacctaaaaaatatgcacattcaa 7222844  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7222845 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcactttaactctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctact 7222944  T
Q  243 t 243  Q
    |    
T  7222945 t 7222945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 46 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22373653 - 22373456
Alignment:
Q  46 gcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22373653 gcggccaatggttcaaattttgtcgagaa-atatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatttagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaggt 22373555  T
Q  145 cgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22373554 cattcccaaataaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 22373456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 30044643 - 30044842
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacct-aaaaatatgcacgttcaa 142  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30044643 ggcggccaatggtttaaattt-gccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccaccggaaaaatatgcacgttcaa 30044741  T
Q  143 gtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  30044742 gtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaattctagactagattatattcactcactgatgctact 30044841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 21799978 - 21800175
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21799978 ggcggccaatggtttaaattttgacgaaaacatgtattagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagtcacataaaaatatgcacgttcaag 21800077  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21800078 tcgttttcaaataaagatttg--gttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgttactt 21800175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11933235 - 11933095
Alignment:
Q  103 tttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaact 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  11933235 ttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaact 11933136  T
Q  203 ctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11933135 ctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 11933095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 243
Target Start/End: Original strand, 33814485 - 33814625
Alignment:
Q  103 tttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaact 202  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  33814485 ttttgatctagagaagacacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaact 33814584  T
Q  203 ctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33814585 ctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 33814625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 243
Target Start/End: Original strand, 25540450 - 25540566
Alignment:
Q  127 aaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttc 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  25540450 aaatatgcacgttcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatctacactttcaacagatcaccttaattctaatcctagacaagattatcttc 25540549  T
Q  227 actcaccgatgttactt 243  Q
    |||||| |||| |||||    
T  25540550 actcactgatgctactt 25540566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Original strand, 14831952 - 14832061
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14831952 ggcggtcaatggttcaacttttgtcaagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcgcgttcaag 14832051  T
Q  144 tcgtttccaa 153  Q
    ||||| ||||    
T  14832052 tcgttcccaa 14832061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 236
Target Start/End: Original strand, 14832064 - 14832110
Alignment:
Q  190 gatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgat 236  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14832064 gatcatcttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgat 14832110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36632856 - 36632657
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36632856 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgacaagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 36632757  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36632756 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatcctcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 36632657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 26822106 - 26822294
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26822106 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccaactaaaaatatgcacgttcaag 26822205  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26822206 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcgtagactagattatcttcactcac 26822294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19126489 - 19126291
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19126489 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaa-tatgcacgttcaag 19126391  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19126390 tcgtttccaaataaagatttggtgttcacgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcactgatgttactt 19126291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33663599 - 33663403
Alignment:
Q  48 ggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcg 146  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33663599 ggccaatgattcaaattttgccgagaacatatgttagaggtatgtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaagtcg 33663500  T
Q  147 tttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33663499 tttccaaataaagatttggtgttcataatccgcactttcaacgaatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcaccgatgctactt 33663403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 21098175 - 21098374
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatag-ttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098175 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataaattaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 21098274  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21098275 tcgtttctaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcacattaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 21098374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 42885860 - 42886059
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42885860 ggcggccaatgattcaaattttgccgataacatatgttagaggtagatgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 42885959  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42885960 tcgtttctaaataaagatttggtgttaatgattcacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagattagattatcttcactcaccgatgctactt 42886059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18092526 - 18092327
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18092526 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 18092427  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18092426 tcgttcccaaataaatatttagtgttcatgatccacactttcaacagatcaccttaactctaatcctagataagattatcttcactcaccgatgctactt 18092327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 33907718 - 33907916
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33907718 ggcggccaatgattcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 33907816  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33907817 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctactt 33907916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 232
Target Start/End: Original strand, 11448226 - 11448405
Alignment:
Q  54 tggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttcca 152  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11448226 tggttcaatttatgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagaaaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttccca 11448325  T
Q  153 aataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11448326 aataaagatttggtgttcatgatccccactttcaacagatcaccttaactctaaccctagactagattatcttcactcac 11448405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 11707101 - 11707299
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11707101 ggcggccaatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaatatatgcacgttcaaa 11707199  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11707200 tcgttcccaaataaagattcggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctactt 11707299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16724155 - 16723956
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724155 ggcggccaatgattcaaattttgacgagaacatgtgttagagataggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 16724056  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16724055 tcgtttccaaataaaaatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaacattaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 16723956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 26827986 - 26828184
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26827986 ggcggccaatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagtttatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 26828084  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  26828085 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactaaattatattcactcaccgatgctactt 26828184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30570354 - 30570155
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  30570354 ggcggccaatagttcaaattttgccgataacatatgttataggtatgtgataagttaatttttgatctagagaagccacataaaaatatgcacgttcatg 30570255  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30570254 tcgtttccaaataaagatttggtgttcgtgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 30570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19167657 - 19167465
Alignment:
Q  52 aatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttc 150  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||     
T  19167657 aatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaaaccacctaaaaatatacatgttcaagtcgtttt 19167558  T
Q  151 caaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19167557 caaataaagatttggtgttcattatccgcactttcaacagatcaccttaactctaattctaggctagattatcttcactcatcgatgttactt 19167465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1514791 - 1514598
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1514791 ggcggtcaatggttcaacttttgtcgagaacatatgttaaaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 1514692  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatg 237  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| ||||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  1514691 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccggactttcaacagatcaccttaactttaatcctaaacaaaattatcttcactcaccgatg 1514598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45204824 - 45204626
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45204824 ggcggccaatagttcaaattttgccgagaa-atatgttagagggaggtggcaagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgatcaag 45204726  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45204725 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttatctctaatcctagactggattatctccactcactgatgttactt 45204626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Original strand, 45399279 - 45399461
Alignment:
Q  51 caatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 149  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  45399279 caatggttcaacttttgccgagaacatatattagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacccaaaaatatgcacgttcaagtcattc 45399378  T
Q  150 ccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  45399379 ccaaataaagattttgtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcac 45399461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27364612 - 27364454
Alignment:
Q  75 catatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatg 173  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27364612 catatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcattcccaaataaagatttggtgttcatg 27364513  T
Q  174 gtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
     ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27364512 atccgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcac 27364454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 35286093 - 35285898
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35286093 ggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatg----aggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacccaaaaatatgcacgttcaag 35285998  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || ||   |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35285997 tcattcccaaataaagatttggtattcatgatccgcacgttcaacatatcaccttaattctaatcatatactagattatcttcactcactgatgctactt 35285898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Original strand, 5252901 - 5253019
Alignment:
Q  125 aaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatct 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5252901 aaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaagagatcaccttaactctgatcctagactagattatct 5253000  T
Q  225 tcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  5253001 tcactcaccaatgttactt 5253019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Original strand, 4812033 - 4812136
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4812033 ggcggtcaatggtttaacttttgctgagaacatttgttagaggtaggttataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 4812132  T
Q  144 tcgt 147  Q
    ||||    
T  4812133 tcgt 4812136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 18814678 - 18814877
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18814678 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 18814777  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18814778 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 18814877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 34688046 - 34688245
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34688046 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 34688145  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  34688146 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 34688245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 41962720 - 41962521
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41962720 ggcggtcaatggtttaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 41962621  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41962620 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcacctttactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgttactt 41962521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 44406819 - 44407018
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44406819 ggcggccaatggttcaaattttgtcgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 44406918  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  44406919 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgattcgcactttcaactaatcaccttaactctaatcatagactatattatcttcactcaccaatgttactt 44407018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 31620148 - 31620335
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31620148 ggcggccaatggttcaaattttgccgataacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 31620247  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactca 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31620248 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactca 31620335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 34692574 - 34692773
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34692574 ggcggccaatagttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgtacgttcaag 34692673  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  34692674 tcgtttccaaataaagatttggtgttcataatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcactgatgctactt 34692773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38844999 - 38844807
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagtt-aattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38844999 ggcggccaatggttcaaatttttccgagaacatatgtttgaggtaggtgataatttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 38844900  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgat 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38844899 tcgttttcaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatcttcagtcaccgat 38844807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41829841 - 41829654
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41829841 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaggtaggtaataagttaattttt-atctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 41829743  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41829742 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcac 41829654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 50561508 - 50561707
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50561508 ggcggtcaatggttcaacttttgctgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 50561607  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  50561608 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctaaacaagattatcttcactcaccgatgctactt 50561707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 52521405 - 52521210
Alignment:
Q  49 gccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 147  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52521405 gccaatgtttcaaattttgctgagaagatatgttagaggcaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgt 52521306  T
Q  148 ttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || |||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52521305 tttcaaataaagatttggtgttcacaatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcactgatgttactt 52521210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10694615 - 10694416
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10694615 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcaagttcaag 10694516  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| || |||||    
T  10694515 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagacaatattatcttcattcaccggtgctactt 10694416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 76 - 243
Target Start/End: Original strand, 48340805 - 48340973
Alignment:
Q  76 atatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatgg 174  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  48340805 atatgttagaggtaggtggcaagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgatcaagtcgttcccaaataaagatttggtgttcatga 48340904  T
Q  175 tccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||| |||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48340905 tccgcactttgaacatatcaccttatctctaatcttagactagattatcttcactcactgatgttactt 48340973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 17671909 - 17672108
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671909 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 17672008  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17672009 tcattcccaaaaaaagatttggtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaattctaatcctatagtagattatcttcactcactgatgctactt 17672108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 45005229 - 45005428
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45005229 ggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 45005328  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||   || || |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  45005329 tcattcccaaataaatatttggtgttcatgatccgcactttcaacatattactttaattctaatcctatactagattatcttcactcactgatgctactt 45005428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 52310294 - 52310492
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgatagt-taattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52310294 ggcggtcaattgttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataggctaatttttgatccagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaag 52310393  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  52310394 tcgttcccaaataaaga-ttggtgttcatgattcgcactttcagcagatcaccttaactctaatcctagacaagattatctttactcaccgatgctactt 52310492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 36682498 - 36682696
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36682498 ggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 36682597  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||   || || |||| ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  36682598 tcattcccaaataaatatttggtgttcatgattcgcactttcaacatattactttaattctaatcctatactagattatcttc-ctcactgatgctactt 36682696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12245682 - 12245487
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12245682 ggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatg----aggtaggtgataagctaattttttacctaaagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 12245587  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || ||   |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12245586 tcattcccaaataaagatttggtattcatgatccgcacgttcaacatatcaccttaattctaatcatatactagattatcttcactcactgatgctactt 12245487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17709595 - 17709424
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17709595 ggcggccaatgcttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtaataagctaatttttgatctatagaaggcacataaaaatatgcacgttcaag 17709496  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagact 215  Q
     |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17709495 ccgttcccaaataaagatattgtgttcatgatccacactttgaacagatcaccttaactctaatcctagact 17709424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 166
Target Start/End: Original strand, 47135860 - 47135982
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47135860 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 47135959  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggt 166  Q
    ||||| ||||||||| |||||||    
T  47135960 tcgttcccaaataaaaatttggt 47135982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16031388 - 16031287
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgat-agttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16031388 ggcggccaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcacattcaag 16031289  T
Q  144 tc 145  Q
    ||    
T  16031288 tc 16031287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 51965522 - 51965474
Alignment:
Q  46 gcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtga 94  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51965522 gcggtcaatgattcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtga 51965474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16031275 - 16031229
Alignment:
Q  191 atcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatg 237  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16031275 atcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcactgatg 16031229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26164 - 25965
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26164 ggcggccaatggttcaaattttgccgataacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 26065  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26064 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcagtgatgttactt 25965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 10379 - 10578
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10379 ggcggccaatggttcaaattttgccgataacatgtgttagaggtaggtgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 10478  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10479 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactttaatcctagactagattatcttcactcagtgatgttactt 10578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 49039 - 48841
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49039 ggcggccaatggttcaaattt-gccgagaacatatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccaccgaaaaatatgcacgttcaag 48941  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48940 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctactt 48841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 176911 - 177109
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  176911 ggcggccaatggttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtaggtgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 177009  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  177010 tcgttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcttagactaaattatattcactcaccgatgctactt 177109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Original strand, 120356 - 120554
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  120356 ggcggtcaatggttcaacttttgcagagaacatatgttagaggtatgtgataagctaatttttgatctagagaatccacctaaaaatatgcacgttcaaa 120455  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttact 242  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  120456 tcgttcccaaataaagatttagtgttcatgatctgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctatactagattatcttcactcatcgatgctact 120554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1634 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 836 - 638
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  836 ggcggccaatggttcaaattttgccaagaacatatgttagaggtaagtgataagttaatttttgatctagagtagccacttaaaaatatg-acgttcaag 738  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  737 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatgctagactagattatcttcactcacagatgctactt 638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Original strand, 398 - 597
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  398 ggcggtcaatggttcaacttttaccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgtacgttcaag 497  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  498 tctttcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacatatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11212 - 11019
Alignment:
Q  51 caatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 149  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  11212 caatggttaaacttttcccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatacgcacgttcaagtcgtta 11113  T
Q  150 ccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11112 ccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 11019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 51 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 4763 - 4570
Alignment:
Q  51 caatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttt 149  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  4763 caatggttaaacttttcccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgatctagagaagccacctaaaaatacgcacgttcaagtcgtta 4664  T
Q  150 ccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4663 ccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactataatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 4570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 101161 - 101349
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  101161 ggcggccaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttgacctagagaagccacctaaaaatatgcatgttcaag 101260  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcac 232  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  101261 tcattcccaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaaccgatcaccttaattctaatcctatactagattatcttcactcac 101349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3223 - 3025
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3223 ggcggccaatagttcaaattt-gccgagaacagatgttagaggtagatgataagttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaaa 3125  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
     |||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  3124 gcgttccaaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcaccttaactctaatcctagactagattatattcactcaccgatgctactt 3025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12733 - 12534
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12733 ggcggtcaatggttcaacttttgccgagaacatatgttagaggtaggtgataagctaatttttaatatagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 12634  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||   ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12633 tcgttctcaaataaagatttggtgttcatgacccgcactttcaacatatcacattaactctaatcctagacaagattatcttcactcaccgatgctactt 12534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 45 - 173
Target Start/End: Original strand, 869 - 998
Alignment:
Q  45 ggcggccaatggttcaaattttgctgagaacatatgttagaggtaggtgata-gttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  869 ggcggccaatggttcaaattttgccgagaacatatgttagaagtaggcgataagttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaag 968  T
Q  144 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatg 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  969 tcgtttccaaataaagatttggtgttcatg 998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 243
Target Start/End: Original strand, 5099 - 5148
Alignment:
Q  194 accttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5099 accttaactttaatcctagactagattatcttcactcactgatgctactt 5148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15088 - 14953
Alignment:
Q  98 ttaattttttatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgtttccaaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcacct 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||    
T  15088 ttaatttttgatctagagaagccacctaaaaatatgcacgttcaagtcgttttcaaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacagatcacct 14989  T
Q  198 taactctaatcttagactagattatcttcactcacc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14988 taactctaatcctagactagattatcttcagtcacc 14953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10432 - 10340
Alignment:
Q  151 caaataaagatttggtgttcatggtccacacttttaatggatcaccttaactctaatcttagactagattatcttcactcaccgatgttactt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10432 caaataaagatttggtgttcatgatccgcactttcaacaaatcaccttaactctaatcctagacaagattatcttcactcactgatgatactt 10340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University