View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3693_low_8 (Length: 585)

Name: NF3693_low_8
Description: NF3693
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3693_low_8
NF3693_low_8
[»] chr6 (103 HSPs)
chr6 (44-564)||(27603106-27603620)
chr6 (44-569)||(28787499-28788023)
chr6 (44-569)||(28793620-28794144)
chr6 (44-564)||(26803712-26804228)
chr6 (44-564)||(27680216-27680732)
chr6 (146-569)||(26885328-26885751)
chr6 (308-569)||(26647740-26648001)
chr6 (308-569)||(26753708-26753969)
chr6 (308-564)||(31285825-31286081)
chr6 (308-564)||(26624537-26624793)
chr6 (308-564)||(26730514-26730770)
chr6 (146-556)||(26657236-26657643)
chr6 (146-556)||(26763207-26763614)
chr6 (47-262)||(27676029-27676243)
chr6 (44-262)||(27591427-27591644)
chr6 (44-256)||(27609532-27609743)
chr6 (44-263)||(27697001-27697219)
chr6 (51-256)||(27716918-27717122)
chr6 (44-264)||(27704675-27704894)
chr6 (80-266)||(26624811-26624997)
chr6 (80-266)||(26730788-26730974)
chr6 (147-569)||(26825080-26825493)
chr6 (308-569)||(27697246-27697507)
chr6 (80-257)||(31286114-31286291)
chr6 (315-567)||(27704921-27705173)
chr6 (117-553)||(25491791-25492224)
chr6 (308-569)||(27717159-27717420)
chr6 (80-257)||(26648028-26648205)
chr6 (80-257)||(26753996-26754173)
chr6 (308-569)||(27609780-27610041)
chr6 (303-559)||(27215723-27215979)
chr6 (308-569)||(26862841-26863102)
chr6 (343-569)||(27426307-27426533)
chr6 (308-537)||(25581015-25581244)
chr6 (308-537)||(26144161-26144390)
chr6 (117-262)||(26813102-26813247)
chr6 (308-558)||(25512163-25512413)
chr6 (100-264)||(27529774-27529938)
chr6 (117-263)||(26863123-26863269)
chr6 (308-522)||(27529964-27530178)
chr6 (308-537)||(25484352-25484581)
chr6 (308-537)||(26057215-26057444)
chr6 (308-537)||(26077185-26077414)
chr6 (354-564)||(28326744-28326954)
chr6 (354-564)||(28504380-28504590)
chr6 (146-262)||(26637193-26637309)
chr6 (146-262)||(26743159-26743275)
chr6 (146-262)||(25075432-25075548)
chr6 (136-264)||(25546531-25546659)
chr6 (136-264)||(26057470-26057598)
chr6 (136-264)||(26077440-26077568)
chr6 (354-564)||(28186660-28186870)
chr6 (354-564)||(28296446-28296656)
chr6 (354-564)||(28515417-28515627)
chr6 (146-263)||(2186369-2186486)
chr6 (136-264)||(25484607-25484735)
chr6 (136-264)||(26144416-26144544)
chr6 (146-262)||(26850277-26850393)
chr6 (298-553)||(29842642-29842897)
chr6 (95-264)||(27426077-27426246)
chr6 (145-484)||(27663715-27664050)
chr6 (354-500)||(28182439-28182585)
chr6 (136-261)||(25581273-25581398)
chr6 (146-263)||(26951295-26951412)
chr6 (146-263)||(26960677-26960794)
chr6 (136-264)||(25512439-25512567)
chr6 (97-257)||(27216007-27216167)
chr6 (354-564)||(27591727-27591937)
chr6 (354-564)||(28244061-28244271)
chr6 (146-259)||(26978936-26979049)
chr6 (395-564)||(27676367-27676536)
chr6 (122-263)||(29827541-29827682)
chr6 (192-264)||(28141089-28141161)
chr6 (399-553)||(29827263-29827417)
chr6 (192-264)||(28150726-28150798)
chr6 (450-537)||(25539836-25539923)
chr6 (298-433)||(26938426-26938561)
chr6 (298-491)||(2186165-2186358)
chr6 (469-569)||(27336916-27337016)
chr6 (469-569)||(27397656-27397756)
chr6 (191-263)||(28097007-28097079)
chr6 (298-458)||(28097093-28097253)
chr6 (172-262)||(29469759-29469849)
chr6 (191-263)||(29842547-29842619)
chr6 (409-564)||(26849978-26850133)
chr6 (410-564)||(26960391-26960545)
chr6 (410-484)||(26978726-26978800)
chr6 (126-264)||(29673508-29673646)
chr6 (136-257)||(26938581-26938702)
chr6 (405-509)||(28240678-28240778)
chr6 (397-519)||(29469523-29469645)
chr6 (396-505)||(29727698-29727807)
chr6 (400-564)||(26636912-26637076)
chr6 (400-564)||(26742878-26743042)
chr6 (397-521)||(28140844-28140968)
chr6 (409-484)||(25075213-25075288)
chr6 (173-264)||(29694932-29695023)
chr6 (450-507)||(28228395-28228452)
chr6 (224-269)||(28296328-28296373)
chr6 (224-269)||(28515700-28515745)
chr6 (191-264)||(29759010-29759083)
chr6 (191-263)||(28186955-28187027)
chr6 (396-460)||(29673757-29673821)
[»] scaffold1870 (1 HSPs)
scaffold1870 (44-569)||(30-551)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (47-569)||(8748-9266)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (44-569)||(12078-12596)
scaffold0277 (44-569)||(3115-3633)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (308-569)||(29272498-29272759)
chr8 (44-253)||(29272250-29272458)
chr8 (409-510)||(35984619-35984720)
chr8 (172-263)||(16371673-16371764)
chr8 (402-492)||(16450236-16450326)
chr8 (172-264)||(12590286-12590378)
chr8 (146-255)||(35984859-35984968)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (308-564)||(267000-267256)
chr1 (44-264)||(266761-266980)
chr1 (298-569)||(28126325-28126596)
chr1 (150-569)||(28132012-28132422)
chr1 (126-263)||(26137434-26137571)
chr1 (149-264)||(28126200-28126315)
chr1 (136-259)||(5921978-5922101)
chr1 (298-509)||(26137209-26137420)
chr1 (397-521)||(5922218-5922342)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (51-256)||(1957-2162)
scaffold0349 (308-569)||(2199-2460)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (343-569)||(60830-61056)
scaffold0003 (95-264)||(61117-61286)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (343-569)||(18075022-18075248)
chr4 (95-264)||(18075309-18075478)
chr4 (395-564)||(18722828-18722997)
chr4 (193-267)||(18730060-18730134)
chr4 (395-564)||(18688369-18688538)
chr4 (395-564)||(18698143-18698312)
chr4 (395-564)||(18730247-18730416)
chr4 (146-262)||(18653995-18654111)
chr4 (146-262)||(18678075-18678191)
chr4 (146-262)||(18722588-18722704)
chr4 (193-267)||(18688179-18688253)
chr4 (193-267)||(18697965-18698039)
chr4 (299-516)||(5089601-5089818)
chr4 (395-564)||(18654220-18654389)
chr4 (395-564)||(18678303-18678472)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (354-564)||(57000-57210)
scaffold0019 (172-269)||(56830-56927)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (146-264)||(17991713-17991831)
chr2 (399-508)||(3280981-3281090)
chr2 (400-484)||(17991967-17992051)
[»] scaffold0038 (3 HSPs)
scaffold0038 (354-564)||(44223-44433)
scaffold0038 (405-509)||(40840-40940)
scaffold0038 (450-507)||(28893-28950)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (126-264)||(16692412-16692550)
chr5 (312-475)||(16692222-16692385)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (397-492)||(238614-238709)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (204-264)||(615341-615401)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 103)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 564
Target Start/End: Original strand, 27603106 - 27603620
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27603106 tagtatgagatgatcatatttagtccaaaaagaccaaaagtcatattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacagtgttttct 27603205  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603206 gttagaacatgaactatatcgtcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 27603305  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgt 343  Q
    |||||| ||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||||      ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27603306 tcaagttatgcagtgtcactttataaatagatccagaatggtaag------tacaaatctgaacaagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgt 27603399  T
Q  344 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  27603400 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaaccacttccaatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactctgctgctct 27603499  T
Q  444 tcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctct 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27603500 tcctccaaagcatcatagcttactttaagaatctcgtggatctttttattgggaatcttctcatatccttctaacgtacccttccattcttctatcctct 27603599  T
Q  544 tcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  27603600 ttccaaacaagttggaaccca 27603620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 28788023 - 28787499
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||   || ||||||||| |||||||  | ||||||    
T  28788023 tagtatgagatggtcatatttagtccaaaaagagcaaa-gtcgtatcaaaattaaataacaaattgaacataaatatcaatcatactcacggtgttttct 28787925  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28787924 tttaaaacattaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggcgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcttcta 28787825  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgt 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28787824 tcaagtcatgtaatctcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagtactactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgt 28787725  T
Q  344 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |  ||||||    
T  28787724 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaaactcctcccactcacatcctttgaagcaacatgcaatgtctagaaaaacactttgttgctct 28787625  T
Q  444 tcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctct 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  28787624 tcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaaagtacccttccattcttctatcgtct 28787525  T
Q  544 tcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28787524 ttccaaacaagttggaacccactatt 28787499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 28794144 - 28793620
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||   || ||||||||| |||||||  | ||||||    
T  28794144 tagtatgagatggtcatatttagtccaaaaagagcaaa-gtcgtatcaaaattaaataacaaattgaacataaatatcaatcatactcacggtgttttct 28794046  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28794045 tttaaaacattaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggcgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcttcta 28793946  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgt 343  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28793945 tcaagtcatgtaatctcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagtactactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgt 28793846  T
Q  344 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |  ||||||    
T  28793845 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaaactcctcccactcacatcctttgaagcaacatgcaatgtctagaaaaacactttgttgctct 28793746  T
Q  444 tcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctct 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  28793745 tcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaaagtacccttccattcttctatcgtct 28793646  T
Q  544 tcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28793645 ttccaaacaagttggaacccactatt 28793620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 26804228 - 26803712
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || ||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  26804228 tagtatgagatggtcatatgtagtcctaaaaatgcaaa-gtcgtatctaaactaaataacaaattgaacataaatatcaatcttactcacaatgttttct 26804130  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     ||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26804129 tttataacatgaactatatcttcatgacgccataacctacttcgtttttcaggatctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtccttta 26804030  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgt 343  Q
    |||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26804029 tcaagtcatgtactcttacaacatcaatagatcccgaatggtaacaagt---actaatcttaatgagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgt 26803933  T
Q  344 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctct 443  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26803932 tatgcaatggccataatgaacatgaagtatatcttcaaactcctcccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactctgctgctct 26803833  T
Q  444 tcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctct 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26803832 tcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttttatgctct 26803733  T
Q  544 tcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  26803732 ttccaaacaagttggaaccca 26803712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 44 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 27680732 - 27680216
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  27680732 tagtatcagatgatcatatttagtgcaaaaagagcaaa-gtcgtattaaaactaaataacaaaatgatcatagatatcaatcatactcacagtgttttct 27680634  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27680633 tttaaaacatgaattatatcttcttgacgccataacctacttcgttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtccttta 27680534  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27680533 tcaagtcatgtaatctcacatcattaatagatcccgaagggtaataagt---actaatcttaacgagagattttccagccaacactcctagatgatgtgt 27680437  T
Q  344 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctct 443  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  27680436 tatgcaatggtcataatgagcacaaagtatatcttcgaactccttccattgatatcctttgaagcagcaagcgatgtcaagaaagacactctgctcctct 27680337  T
Q  444 tcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctct 543  Q
    || || |||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||    
T  27680336 tcttccaaagcatcatagctcaccttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcatacccatctaatgtatgcttccaatcttctatgctct 27680237  T
Q  544 tcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  27680236 ttccaaacaagttagaaccca 27680216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 146 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 26885751 - 26885328
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |    
T  26885751 taaaacatgaactatatcatcgtgacaccataacctactacgttctccaggctctttacttgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctctacc 26885652  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccg---aatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtg 342  Q
    |||||||||||||||||||||  |  |  || ||   || ||||   |||   | ||||||| | ||||||||||||  |||||||||| | |||||||     
T  26885651 aagtcatgtaatgtcacatcaacatgatttctcgctgaacggtattgagt---attaatctttaagagagatttttcgaccaacactccaacatgatgtt 26885555  T
Q  343 ttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctc 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || |||    
T  26885554 ttatgcaatggccataatgagcatgaagtatatcttcgacctctgtccatttacaccctttgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctc 26885455  T
Q  443 ttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctc 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||  |||||| |||    
T  26885454 ttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttgtattaggaatcttttcatatccatctagtgtactcttccatgtttctatgctc 26885355  T
Q  543 ttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||    
T  26885354 tttccaaacaagttggaacccactatt 26885328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 308 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 26648001 - 26647740
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26648001 gagagatttttcagccaacactccaagatgatgtgttatgcaatggccataatgataacgaagtatatcttcaaactcctcccatctacatcctttgaag 26647902  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26647901 caacaagcaatgtctagaaagacactctgctgctcttcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcat 26647802  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  26647801 atccatctaatgtacccttccattcttctatgctctttccatataagttggaacccactatt 26647740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 308 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 26753969 - 26753708
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26753969 gagagatttttcagccaacactccaagatgatgtgttatgcaatggccataatgataacgaagtatatcttcaaactcctcccatctacatcctttgaag 26753870  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26753869 caacaagcaatgtctagaaagacactctgctgctcttcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcat 26753770  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  26753769 atccatctaatgtacccttccattcttctatgctctttccatataagttggaacccactatt 26753708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 308 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 31286081 - 31285825
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  || |||  |||||| ||||||||||||    
T  31286081 gagagatttttcagccaacacttctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagcatggagtatatctttgacatccgcccatccgcatcctttgaag 31285982  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31285981 caacaagcaatgtccagaaagacactctgctcctcttcttccaaagcatcatagcttactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcttgtcat 31285882  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  31285881 acccatctaatgtactcttccatttttctatgctctttccaaacaagtttgaaccca 31285825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 308 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 26624793 - 26624537
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||    
T  26624793 gagacatttgtcaaccaacactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagcatatcttcgaactccctccatccacatcctttcgag 26624694  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  26624693 caacaagcaatatctagaaagacactctgctcctcttcttccaaagcatcatagctcactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcat 26624594  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26624593 acccatctaatgtatacttccattcttctatgctctttccaaacaagttggaaccca 26624537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 308 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 26730770 - 26730514
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||    
T  26730770 gagacatttgtcaaccaacactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagcatatcttcgaactccctccatccacatcctttcgag 26730671  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  26730670 caacaagcaatatctagaaagacactctgctcctcttcttccaaagcatcatagctcactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcat 26730571  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26730570 acccatctaatgtatacttccattcttctatgctctttccaaacaagttggaaccca 26730514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 26657643 - 26657236
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26657643 taaaacatgaactatgtcattgtgacaccataacctactacgttctccgggctctttacttgattcttgtcggacgatttctttacccatgtcctctatc 26657544  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatgg-taagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgtt 344  Q
    || || ||||||| |||||||| | || ||  |  |||| |  |    | || ||||||  | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  26657543 aaatcgtgtaatgccacatcatcattatatgaccgatggctttg----tgtattaatctctatgagagatttttcaaccaacactccaacatgatgtttt 26657448  T
Q  345 atgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctctt 444  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||| |||||  || ||| ||||||||||||  ||||||| || || | ||||||||| | || |||||    
T  26657447 atgcaatgaccatagtgagcaagaagtgtctcttcgacctcactcaatctacatcctttgaaaaaacaagctatatctaaaaagacactttgctcctctt 26657348  T
Q  445 cctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctctt 544  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||    
T  26657347 cctccaaatcatcatagcttactttaagtatctcttgaatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtactcttccatttttcgatgctctt 26657248  T
Q  545 cccaaacaagtt 556  Q
     |||||||||||    
T  26657247 tccaaacaagtt 26657236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 26763614 - 26763207
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26763614 taaaacatgaactatgtcattgtgacaccataacctactacgttctccgggctctttacttgattcttgtcggacgatttctttacccatgtcctctatc 26763515  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatgg-taagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgtt 344  Q
    || || ||||||| |||||||| | || ||  |  |||| |  |    | || ||||||  | ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||    
T  26763514 aaatcgtgtaatgccacatcatcattatatgaccgatggctttg----tgtattaatctctatgagagatttttcaaccaacactccaacatgatgtttt 26763419  T
Q  345 atgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctctt 444  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| | ||||| |||||  || ||| ||||||||||||  ||||||| || || | ||||||||| | || |||||    
T  26763418 atgcaatgaccatagtgagcaagaagtgtctcttcgacctcactcaatctacatcctttgaaaaaacaagctatatctaaaaagacactttgctcctctt 26763319  T
Q  445 cctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctctt 544  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| || |||||    
T  26763318 cctccaaatcatcatagcttactttaagtatctcttgaatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtactcttccatttttcgatgctctt 26763219  T
Q  545 cccaaacaagtt 556  Q
     |||||||||||    
T  26763218 tccaaacaagtt 26763207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 47 - 262
Target Start/End: Original strand, 27676029 - 27676243
Alignment:
Q  47 tatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgtt 146  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27676029 tatgagatggtcatatttagtccaaaatgagcaaaatt-gtattaaaactaaataacaaattgaacatagatatcaatcttactcacagtgttttctgtt 27676127  T
Q  147 aaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27676128 aaaacatgaactatatcatcttgagaccataacctgcttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggaccacttctttacccatgacctctatca 27676227  T
Q  247 agtcatgtaatgtcac 262  Q
    | ||||||||||||||    
T  27676228 attcatgtaatgtcac 27676243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 262
Target Start/End: Original strand, 27591427 - 27591644
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  27591427 tagtatgagatggtcatatttagtccaaaatgagcaaa-gttgtattaaaactaaataacaaattgaacatagatatcaatcttacgcacagtgttttct 27591525  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27591526 tttaaaacatgaactatatcatcttgagaccataacctgcttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgacctcta 27591625  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcac 262  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  27591626 tcaattcatgtaatgtcac 27591644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Original strand, 27609532 - 27609743
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  27609532 tagtatcagatgatcatatttagtgcaaaaagagcaaa-gtcgtattaaaactaaataacaaaatgatcatagatatcaatcttactcacagtgttttct 27609630  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609631 cttaaaacacgaactatatcatcctgacagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 27609730  T
Q  244 tcaagtcatgtaa 256  Q
    |||||||||||||    
T  27609731 tcaagtcatgtaa 27609743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Original strand, 27697001 - 27697219
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  27697001 tagtatcagatgatcatatttagtgcaaatagagcaaa-gtcgtattaaaactaaataacaaaatgatcatagatatcaatcttactcacagtgttttct 27697099  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     |||||||  ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27697100 cttaaaacccgagttatatcatcctgacagcataacctacttctttctccaggctctttagttgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 27697199  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27697200 tcaagtcatgtaatgtcaca 27697219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 256
Target Start/End: Original strand, 27716918 - 27717122
Alignment:
Q  51 agatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaa 150  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  27716918 agatgatcatatttagttcaaaaagagcaaa-gttgtattaaaactaaataacaaaatgatcatagatatcaatcttactcacagtgttttctcttaaaa 27717016  T
Q  151 catgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtc 250  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27717017 cacgaactatatcatcctgacagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtc 27717116  T
Q  251 atgtaa 256  Q
    ||||||    
T  27717117 atgtaa 27717122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 27704675 - 27704894
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  27704675 tagtatgagatggtcatatttagtccaaaaagagcaaa-gtcatattaaaactaaataacaaaatgatcatagatatcaatcttactcacagtgttttct 27704773  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     |||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27704774 tttaagacattaactatatcatcatggcagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatatcctcta 27704873  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  27704874 tcaagttatgtaatgtcacat 27704894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 80 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26624997 - 26624811
Alignment:
Q  80 aaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataac 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  26624997 aaagtagtattaaaactaaataataaattgatcatagatatcaatcttactcacactgttttcttttaaaacatgaaatatatcatcttgacaccataat 26624898  T
Q  180 ctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacatca 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26624897 ctacttcgttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgattgctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaaggtcatatca 26624811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 80 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26730974 - 26730788
Alignment:
Q  80 aaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataac 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  26730974 aaagtagtattaaaactaaataataaattgatcatagatatcaatcttactcacactgttttcttttaaaacatgaaatatatcatcttgacaccataat 26730875  T
Q  180 ctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacatca 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26730874 ctacttcgttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgattgctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaaggtcatatca 26730788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 26825493 - 26825080
Alignment:
Q  147 aaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatca 246  Q
    ||||||||||  |||||||  |||||||| | ||| || | ||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  26825493 aaaacatgaataatatcattgtgacaccacagcctgctgcgttcaccgggctctttagatgattgttgtcggactacttctttgcccatgtcctttatca 26825394  T
Q  247 agtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttat 346  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| ||||| | |   |      ||||||||||   | |||||||||||| |||||||||   | ||||||| ||||    
T  26825393 agtcatgtaatgtcacat---aaatatatccccacttcga------tctactaatcactatgagagatttttctgccaacacttgaacatgatgttttat 26825303  T
Q  347 gcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcc 446  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | |  | |||||||||||||||||||||| || || ||||| |  ||||||||     
T  26825302 gcaatggccgtaatgagtacgaagtatatcttcgaactcctcccaactatgttctttgaagcaacaagcaatgtcgaggaaaacactttgttgctcttct 26825203  T
Q  447 tctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcc 546  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||  || ||| ||||| |    
T  26825202 tccaaagcatcatagcttactctaagtatctcttggatctttttgtcaggaatcctttcatatccatctaatgcacccttccatatttgtatgctctttc 26825103  T
Q  547 caaacaagttggaacccattatt 569  Q
    ||||||| |||||||||| ||||    
T  26825102 caaacaaattggaacccactatt 26825080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 308 - 569
Target Start/End: Original strand, 27697246 - 27697507
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||   | || | |||||||  ||||||||||    
T  27697246 gagagatttttcagccaacactgctagatgatgtgttatggaatggccataatgagcatgaagcatatatttggcatcttcccatccatgtcctttgaag 27697345  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  27697346 caacaagcaatgtccagaaagacactttgctcctcttcttccaaagcatcatagctcactctaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcat 27697445  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  27697446 acccatctaatatatacttccattcttctatgttctttccaaacaagttagaacccactatt 27697507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 80 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31286291 - 31286114
Alignment:
Q  80 aaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataac 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31286291 aaagtcgttttaaaactaaataacaaattgaacatagatatcaatcttactcacagtgttttcatttaaagcatgaactatatcatcttgacaccatagc 31286192  T
Q  180 ctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaat 257  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31286191 ctacttctttctcctggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaat 31286114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 315 - 567
Target Start/End: Original strand, 27704921 - 27705173
Alignment:
Q  315 ttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaag 414  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||  || ||| | | ||||| ||||||||||    
T  27704921 ttttcagccaacactcgtagatgatgtgttatacaatggtcataatgagaatgaagtatattttcaacctctgtcaatctatacccttttaagcaacaag 27705020  T
Q  415 caatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatc 514  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  27705021 caatgtcaagaaagacactctgctcctcttcttccaaagcatcatagctcactctaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcatacccatc 27705120  T
Q  515 taatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccatta 567  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27705121 taatgtattcttccattcttctatgttcttgccaaacaagttagaacccatta 27705173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 117 - 553
Target Start/End: Original strand, 25491791 - 25492224
Alignment:
Q  117 atatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtc 216  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  25491791 atatcaatcttacttaccgtgttttctcttaaaacttgaaccatatcatcgggacaccacaacctactacgttctccaggatcattacgtgattcttgtc 25491890  T
Q  217 ggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagattt 316  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||| || ||||   |||   | | || || | || ||||||    
T  25491891 gaacgacttctttacccatgtgctctatcaagttatgtaatgtttcatcatgaatatatcccaaagggtatatagt---agttatatttatgaaagattt 25491987  T
Q  317 ttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagca 416  Q
    || |||||||  ||| | |||||   ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  || |||  ||||   || ||||||||| ||||||      
T  25491988 tttagccaactttccaagatgatagtttacgcaatggccataatgatcatgaagtatatttttgacatccgcccatttccaacctttgaagaaacaagtc 25492087  T
Q  417 atgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatcta 516  Q
    ||||| ||||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  25492088 atgtctagaaagatactctgctccttttcctccaaagcatcatagctcactctaagtatcttttggatctctttattgaaaatcttttcatactcatcta 25492187  T
Q  517 atgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    |||||| ||||||||||||||| || || ||||||||    
T  25492188 atgtacacttccattcttctatgctatttccaaacaa 25492224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 308 - 569
Target Start/End: Original strand, 27717159 - 27717420
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||   | || | ||||  ||||| |||||||    
T  27717159 gagagatttttcaaccaacactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagaattaagtatatatttggcatcttcccatttacatcttttgaag 27717258  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  27717259 caacaagcaatgtctagaaagacactttgctgctcttcctccaaagcatcataacttactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcat 27717358  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| ||| | ||||| ||||||| ||||    
T  27717359 acccatctaatgtattcttccattcctctatgttctttccagataagttagaacccactatt 27717420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26648205 - 26648028
Alignment:
Q  80 aaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataac 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26648205 aaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatcatagatattaatcttactcacagtgttttcttttaaaacatgaactatttcatcttgacaccataac 26648106  T
Q  180 ctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaat 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26648105 ctactttgttctccaggctctttacgtgattcttgtcggactacttccttacccatgtcctttatcaagtcatgtaat 26648028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 80 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26754173 - 26753996
Alignment:
Q  80 aaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataac 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26754173 aaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatcatagatattaatcttactcacagtgttttcttttaaaacatgaactatttcatcttgacaccataac 26754074  T
Q  180 ctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaat 257  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26754073 ctactttgttctccaggctctttacgtgattcttgtcggactacttccttacccatgtcctttatcaagtcatgtaat 26753996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 308 - 569
Target Start/End: Original strand, 27609780 - 27610041
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||  |   | || | |||   | |||||||||||    
T  27609780 gagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgttatggaatggccataatgagaatgaagtgtatactttgcatcttcccaattatatcctttgaag 27609879  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  27609880 caacaagcaatgtccagaaagacactttgctcctcttcttccaaagaatcatagctcactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcat 27609979  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  27609980 acccatctaatgtatacttccattcctctatgttctttccaaacaagttagaacccactatt 27610041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 303 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 27215979 - 27215723
Alignment:
Q  303 ttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctt 402  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||   |||||  ||| ||||    
T  27215979 ttaatgagagatttttcggccaacacttcaacatgatgttttatgcaatggccataatgggcatgaagtatatctttgacctttgtccatttacaccctt 27215880  T
Q  403 tgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatctt 502  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  27215879 tgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactcttctccttttcctccagagcatcatagctgactttaagtatcctttggatctctttattgggaatctt 27215780  T
Q  503 ttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttgga 559  Q
    ||||||| |||||||| |||  | ||| |||||||  ||| | |||||||| |||||    
T  27215779 ttcatactcatctaatatacgttcccaatcttctacactccttccaaacaaattgga 27215723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 308 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 26863102 - 26862841
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||||     |||||||||||| |  ||  |||| | ||  ||||||||     
T  26863102 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttttatgcatcggccataatgatatttaagtatatcttcgaattctatccagctaccccctttgaaa 26863003  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26863002 caacaagcaatatctagaaagacactttgctgctcttcttccaaagcatcatagcttactttaagtatcctttggatctctttattgggaatcttttcat 26862903  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  26862902 acccatctaatgtgcattgccattcttccatgctctttccaaacaagttagaacccactatt 26862841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 569
Target Start/End: Original strand, 27426307 - 27426533
Alignment:
Q  343 ttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctc 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||    
T  27426307 ttatgcaatgaccataatgagcatgaagtatttctttgaccttttcccatttacaacctttgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactttgctcctc 27426406  T
Q  443 ttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctc 542  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  ||    
T  27426407 ttcctccaaagaatcatagctcactttaagtattctttggatctctttattgggaatcttttcataccaatctaatgtattcttgcattcttctatgttc 27426506  T
Q  543 ttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  27426507 tttccaaacaagttagaacccactatt 27426533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 308 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25581244 - 25581015
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||   |||||  ||| |||||||||    
T  25581244 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgcaatggccataatgagcatgaagtatttttttaacctttgtccatttacaccctttgaag 25581145  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |   || |||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  25581144 caacaagcaatgtctagaaagacactcttctcctttggttccaaagcatcatagctaacttgaagtatcctttggatatctttattgggaatattttcat 25581045  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttcta 537  Q
    || |||||||| ||| |||||| |||||||    
T  25581044 actcatctaatatacgcttccaatcttcta 25581015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 308 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 26144390 - 26144161
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||   ||||| |||| |||||||||    
T  26144390 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgcaatggccataatgagcatgaagtatttttttaacctttgtccattcacaccctttgaag 26144291  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  26144290 caacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatcctttggatatctttatcgggaatattttcat 26144191  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttcta 537  Q
    || | |||||||||| || ||| |||||||    
T  26144190 actcgtctaatgtacgctcccaatcttcta 26144161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 117 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26813247 - 26813102
Alignment:
Q  117 atatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtc 216  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||||||||     
T  26813247 atatcaatcttactcacaatgttttcttttaaaacatgaactatatcatcttgacaccatagcctacttcgttctcctggttcttcaggtgattcttgtt 26813148  T
Q  217 ggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcac 262  Q
    |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26813147 ggacaatttctttacccgtgtgctctatcaagtcatgtaatgtcac 26813102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 308 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 25512413 - 25512163
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  || |   |||||  | | |||||||||    
T  25512413 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgcaatggccataatgagcatgaagtattttttttacttttgtccatttataccctttgaag 25512314  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  25512313 taacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatcctttggatatctttatcgggaatattttcat 25512214  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttgg 558  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||||| | || | |||||||| ||||    
T  25512213 actcatctaatgtacgcttccaatcttctaccttccttccaaacaaattgg 25512163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 264
Target Start/End: Original strand, 27529774 - 27529938
Alignment:
Q  100 taacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctc 199  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||   | | |||| |||||||| | ||||||||||||    
T  27529774 taacaaattgttcctagatatcaatcttactcacagtgtttttttttaaaacatgaactatatcacgctcaaaccacaacctactgcgttctccaggctc 27529873  T
Q  200 tttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27529874 atcgggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 27529938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 117 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26863269 - 26863123
Alignment:
Q  117 atatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtc 216  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  26863269 atatcaatcttactcacagtgttttcttctaaaacgtggattatatcatcatgacaccataacctacttcgttcacccggctctttaggagattcttgtc 26863170  T
Q  217 ggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26863169 ggacgatttctttgcccatgtcctctatcaagtcatgtaatctcaca 26863123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 308 - 522
Target Start/End: Original strand, 27529964 - 27530178
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||| ||| | | |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  |||||   ||||  ||| |||||||||    
T  27529964 gagagatttttcagccaaaactgcaacatgatgtactatgcaatgaccataatgagcatgaagtatttctttgacctctggccatttacaccctttgaag 27530063  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||| | |||||    
T  27530064 caacaagcaatgtctagaaagacactttgctcttctttctccaaagaatcatagctcactttaagtattctttggatctctttattgggaatttcttcat 27530163  T
Q  508 acccatctaatgtac 522  Q
    |||||||||||||||    
T  27530164 acccatctaatgtac 27530178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 308 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25484581 - 25484352
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  || |   |||||  | | |||||||||    
T  25484581 gagacatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgcaatggccataatgagcatgaagtattttttttacttttgtccatttataccctttgaag 25484482  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  25484481 taacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatcctttggatatctttatcgggaatattttcat 25484382  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttcta 537  Q
    || |||||||||||| |||||| |||||||    
T  25484381 actcatctaatgtacgcttccaatcttcta 25484352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 308 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 26057444 - 26057215
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||| | || |||||   |||||  ||| |||||||||    
T  26057444 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgggatggccataatgagcatgaagtatttttttaacctttgtccatttacaccctttgaag 26057345  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  26057344 caacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatcctttggatatctttatcgggaatattttcat 26057245  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttcta 537  Q
    || | |||||| ||| || ||| |||||||    
T  26057244 actcgtctaatatacgctcccaatcttcta 26057215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 308 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 26077414 - 26077185
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||  |||||||||||||||| ||||||| | || |||||   |||||  ||| |||||||||    
T  26077414 gagagatttttcagccaacactccaacatgatgttctatgggatggccataatgagcatgaagtatttttttaacctttgtccatttacaccctttgaag 26077315  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  26077314 caacaagcaatgtctagaaagacactctgatccttttccttcaaagcatcatagcttacttgaagtatcctttggatatctttatcgggaatattttcat 26077215  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttcta 537  Q
    || | |||||| ||| || ||| |||||||    
T  26077214 actcgtctaatatacgctcccaatcttcta 26077185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 354 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28326954 - 28326744
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaag 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  || ||| || || |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||  ||||| || ||||    
T  28326954 ccataatgagcatgaagtatatcttcaagttctttcaattcatatccattgaagcagcaagcaatgtcgagaaaaacattctgctcatcttcatccaaag 28326855  T
Q  454 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  || ||||| |   || |||||| ||||  |||| ||||||||    
T  28326854 catcaaagcttactttaagtatcgcttggatctttttaatgggaatcctttcatactgatataatgcagatttacattctactatattctttccaaacaa 28326755  T
Q  554 gttggaaccca 564  Q
    |||||||||||    
T  28326754 gttggaaccca 28326744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 354 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28504590 - 28504380
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaag 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  || ||| || || |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||  ||||| || ||||    
T  28504590 ccataatgagcatgaagtatatcttcaagttctttcaattcatatccattgaagcagcaagcaatgtcgagaaaaacattctgctcatcttcatccaaag 28504491  T
Q  454 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||  || ||||| |   || |||||| ||||  |||| ||||||||    
T  28504490 catcaaagcttactttaagtatcgcttggatctttttaatgggaatcctttcatactgatataatgcagatttacattctactatattctttccaaacaa 28504391  T
Q  554 gttggaaccca 564  Q
    |||||||||||    
T  28504390 gttggaaccca 28504380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26637309 - 26637193
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  26637309 taaaacatgaactatatcgtcatgacaccacaacctactgcgttctccaggcttattacgtgattcttgtcggacgatttctatacccatatcctctatc 26637210  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcac 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  26637209 aagtcatgtaatgtcac 26637193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26743275 - 26743159
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  26743275 taaaacatgaactatatcgtcatgacaccacaacctactgcgttctccaggcttattacgtgattcttgtcggacgatttctatacccatatcctctatc 26743176  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcac 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  26743175 aagtcatgtaatgtcac 26743159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25075548 - 25075432
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  25075548 taaaacatcaaatatatcatcgtgataccacaacctactacgttctccaggctctttaattgattcatgtcggacgatttctttacccatgtcctctaac 25075449  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcac 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  25075448 aagtcatgtaatgtcac 25075432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25546659 - 25546531
Alignment:
Q  136 tattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccat 235  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||||||  || |||| |||||||| | |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25546659 tattatctcttaaaacgttaactatatcatcgcgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttgttgggagattcttgtcggacgacttctttacccat 25546560  T
Q  236 gtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25546559 gtcctctatcaagtcatgtaaggtcacat 25546531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26057598 - 26057470
Alignment:
Q  136 tattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccat 235  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||||||  || |||| |||||||| | |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26057598 tattatctcttaaaacgttaactatatcatcgcgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttattgggagattcttgtcggacgacttctttacccat 26057499  T
Q  236 gtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26057498 gtcctctatcaagtcatgtaaggtcacat 26057470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26077568 - 26077440
Alignment:
Q  136 tattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccat 235  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||||||  || |||| |||||||| | |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26077568 tattatctcttaaaacgttaactatatcatcgcgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttcttgggagattcttgtcggacgacttctttacccat 26077469  T
Q  236 gtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26077468 gtcctctatcaagtcatgtaaggtcacat 26077440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28186870 - 28186660
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgct-cttcctctaaa 452  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||  || ||| || || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | || | || ||||| | |||    
T  28186870 ccataatgagcatgaagtacatcttcaagttctttcaattcatatcctttgaagcagcaagcgatgtcgagaaaaacatt-ttgttctgcttcccccaaa 28186772  T
Q  453 gcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaaca 552  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||| |   ||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  28186771 gcatcaaagcttactttgagtatctcttggatctttttatcgggaatcctttcatactgatttaatgcagatttccattctcctatattctttccaaaca 28186672  T
Q  553 agttggaaccca 564  Q
    ||||||||||||    
T  28186671 agttggaaccca 28186660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 354 - 564
Target Start/End: Original strand, 28296446 - 28296656
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaag 453  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  || ||| || || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||  |||||||| ||||    
T  28296446 ccataatgagcatgaagtatattttcaagttctttcaattcatatcctttgaagcagcaagcgatgtcaagaaaaacatttttctcatcttcctccaaag 28296545  T
Q  454 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||  |  ||||| |   |||||||||  |||  |||| ||||||||    
T  28296546 catcaaagcttactttaagtatctcttggatctttctaatgggtctcctttcatactgacttaatgcagatttccattctcttatattctttccaaacaa 28296645  T
Q  554 gttggaaccca 564  Q
    |||||||||||    
T  28296646 gttggaaccca 28296656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 354 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28515627 - 28515417
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaag 453  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||  || ||| || || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||  |||||||| ||||    
T  28515627 ccataatgagcatgaagtatattttcaagttctttcaattcatatcctttgaagcagcaagcgatgtcaagaaaaacatttttctcatcttcctccaaag 28515528  T
Q  454 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  || ||||||||  |  ||||| |   |||||||||  |||  |||| ||||||||    
T  28515527 catcaaagcttactttaagtatctcttggatctttctaatgggtctcctttcatactgacttaatgcagatttccattctcttatattctttccaaacaa 28515428  T
Q  554 gttggaaccca 564  Q
    |||||||||||    
T  28515427 gttggaaccca 28515417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2186486 - 2186369
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    ||||||| |||||||||| || ||  |||| |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  2186486 taaaacaggaactatatcttcatgggaccacaacctactacgttttccaggctcttttggtgattcttgtcgtacgatttctttacccatttcctctatc 2186387  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2186386 aagtcatgtaatgtcaca 2186369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25484735 - 25484607
Alignment:
Q  136 tattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccat 235  Q
    |||| ||| ||||||| | || ||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||||||  || || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25484735 tattatctcttaaaacgttaagtatatcatcgtgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttcttgggagattcttgtcgaacgacttctttacccat 25484636  T
Q  236 gtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25484635 gtcctctatcaagtcatgtaaggtcacat 25484607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26144544 - 26144416
Alignment:
Q  136 tattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccat 235  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||||||  || |||| |||||||| | |||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26144544 tattatctcttaaaacgttaactatatcatcgggaaaccacaacctactgcgttctccaggcttgttgggagattcttgtcggacgatttctttacccat 26144445  T
Q  236 gtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26144444 gtcctctatcaagtcatgtaaggtcacat 26144416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 26850393 - 26850277
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||| |||||||| |    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26850393 taaaacatgaacaatatcatcacaacaccacaacctactgcgccttccaggctctttaattgattcttgtcggacgatttctttacccatgtcctctatc 26850294  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcac 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  26850293 aagtcatgtaatgtcac 26850277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 553
Target Start/End: Original strand, 29842642 - 29842897
Alignment:
Q  298 taatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccaca 397  Q
    ||||||| | ||||| ||||||  |||||||||| | ||||| |  |||||| || |||| || ||||| ||| ||||||||||||||   | |  || |    
T  29842642 taatctttatgagagttttttcgaccaacactccaatatgatattctatgcattgaccatgataagcacaaagaatatcttcaacctctcccaaatcata 29842741  T
Q  398 tcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgc-tcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattggg 496  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |  ||||||| |||||| ||    
T  29842742 ccctttgaagcaacaagcaatgtcgagaaaaacac-cttgttcgtcttcctccaaagcatcaaagcttattttaagtatattgtggatctctttattagg 29842840  T
Q  497 aatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  29842841 aatcctttcatacctatctaatgtagatttccattcttctatattctttccaaacaa 29842897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 264
Target Start/End: Original strand, 27426077 - 27426246
Alignment:
Q  95 ctaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctcca 194  Q
    ||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||| | ||||||  || ||| | || |||||| | || | |||||||||| ||||||| ||||    
T  27426077 ctaaataacaaattgttcctgcatatcaatcttactcacagtgttttcttctagaacttcaaatatatccttttcaaaccataacctgcttctttttcca 27426176  T
Q  195 ggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27426177 ggctcaaaaggtgattctagtcggacgagttctttacccatgttctctatcaagttatgtaatgacacat 27426246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 145 - 484
Target Start/End: Original strand, 27663715 - 27664050
Alignment:
Q  145 ttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctat 244  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| | |  |||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||    
T  27663715 ttaaaacatgagctatatcatcatgacgccacaacctagtgcgctctccaggctctttaattgattcttgtcggactatttctatacccatatactctat 27663814  T
Q  245 caagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatgg-taagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgt 343  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||  || |   | |||| |  | ||    ||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||  | |||||||||    
T  27663815 caagtcatgtaatgtaacaatataagaag-tgtagtatggatctggag---cactaatctttatgagagattcatcaaccaacactctaacatgatgtgt 27663910  T
Q  344 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctct 443  Q
     ||  ||||||||||||||    ||||| | || | || || || |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  || |||    
T  27663911 cattgaatggccataatgaaattgaagtgtctc-tgaaacttctgccaatcacatcctttgaagcaacaagcaatatccaaaaagacactctgttgttct 27664009  T
Q  444 tcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 484  Q
    || || |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27664010 tcttccaaagtatcaaagcttactttaagtatcttttggat 27664050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 354 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 28182585 - 28182439
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaag 453  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| || ||| |  || ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||  || ||||| | ||    
T  28182585 ccataatgagcatgaaatatatcttcaacttctttcaaatcatatccttttaagaaacaagaaatgtccagaaaaacattctgctcatcatcctccagag 28182486  T
Q  454 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatc 500  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28182485 catcatagctaactttaagtatctcttggatctttttcatgggaatc 28182439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25581398 - 25581273
Alignment:
Q  136 tattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccat 235  Q
    |||| ||| ||||||| | || ||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||| |  || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25581398 tattatctcttaaaacgtcaaatatatcatcgtgaaaccacaacctactgcgttctccagggttcttgggagattcttgtcggacgatttctttacccat 25581299  T
Q  236 gtcctctatcaagtcatgtaatgtca 261  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25581298 gtcctctatcaagtcatgtaaggtca 25581273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26951412 - 26951295
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||| |||||||| | ||||||||| ||| ||  |||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||    
T  26951412 taaaacatgaacaatatcatcacgagaccacaacctactgcgttctccaggttctctaattgattcttgtcggatgatttctatacccatatcctctatc 26951313  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26951312 aagtcatgtaatgtcaca 26951295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26960794 - 26960677
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | || |||||||||||||  |||||| ||||| || | |||  ||||||| |||||||||    
T  26960794 taaaacatgaactatatcatcacgacaccacaacctactgcgttttccaggctctttaattgattcctgtcgaacaatttccatacccatatcctctatc 26960695  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26960694 aagtcatgtaatgtcaca 26960677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25512567 - 25512439
Alignment:
Q  136 tattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccat 235  Q
    |||| ||| ||||||| | || |||||||||  || |||| |||||||| | |||||||||||  || || |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25512567 tattatctcttaaaacgttaagtatatcatcgcgaaaccacaacctactgcgttctccaggcttgttgggagattcttgtcggacggtttctttacccat 25512468  T
Q  236 gtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25512467 gtcctctatcaagtcatgtaaggtcacat 25512439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27216167 - 27216007
Alignment:
Q  97 aaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccagg 196  Q
    ||||||||||||| |  || |||| | | ||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||| |||||    
T  27216167 aaataacaaattgttcataaatattatttttactcacgatattttcttttagaacttgaactatatcatcgtgaaaccacaacctactgcgttccccagg 27216068  T
Q  197 ctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaat 257  Q
     |  |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27216067 attgtcgggtgattcttgtcggacaacttctctacccatatcctctatcaagtcatgtaat 27216007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 564
Target Start/End: Original strand, 27591727 - 27591937
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaag 453  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||  || | || | ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| || ||||    
T  27591727 ccataatgagcatgaagtatctgtttgactttctccaatctacatcctttgatgcaacaagcaatatccaaaaagacactctgctcctcttcttccaaag 27591826  T
Q  454 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    |||||||||| | | ||||||||| |||||| | |||||  |||||  || |||||  ||||||||||  ||  |||||| | || ||||| ||||||||    
T  27591827 catcatagctgagtctaagtatcttttggatatctttatgtggaattcttccatacttatctaatgtagactcacattctgcaatactctttccaaacaa 27591926  T
Q  554 gttggaaccca 564  Q
    ||| |||||||    
T  27591927 gttagaaccca 27591937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 28244271 - 28244061
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaag 453  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  || ||| |   | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||  |||| ||| ||||    
T  28244271 ccataatgagcataaagtatatcttcaagttctttcaaattatatcctttgaagcagcaagcaatgtcgagaaaaacattctgctcatctttctccaaag 28244172  T
Q  454 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||  ||||| |||||||| |   ||||||||| ||||  | || ||||| ||    
T  28244171 catcaaagcttactttaagtatctcctgtatctttttaatcggaatccttctataccgatctaatgcagatttccattctcctatattatttccaaataa 28244072  T
Q  554 gttggaaccca 564  Q
    ||| |||||||    
T  28244071 gtttgaaccca 28244061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26979049 - 26978936
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    ||||||||||||||||  ||   ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  26979049 taaaacatgaactatactattacgacaccacaacctactgcgttctccaggttctttaattgattcttgtcggacgatttctatacccatatcctctatc 26978950  T
Q  246 aagtcatgtaatgt 259  Q
    |||| |||||||||    
T  26978949 aagtaatgtaatgt 26978936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 395 - 564
Target Start/End: Original strand, 27676367 - 27676536
Alignment:
Q  395 acatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattg 494  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| | | ||||||||| |||||| | |||||      
T  27676367 acatcctttgatgcaacaagcaatatccaaaaagacactctgctcctcttcgtccaaagcatcatagctcagtctaagtatcttttggatatctttatgt 27676466  T
Q  495 ggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    |||||  || |||||  ||||||||||  ||  |||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  27676467 ggaattcttccatacttatctaatgtagactcacattctgcaatactctttccaaacaagttagaaccca 27676536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 29827682 - 29827541
Alignment:
Q  122 aatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacg 221  Q
    ||||||||||||   |||||||  ||| || ||||||||||| || |   |||| |||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  29827682 aatcttactcaccgaattttcttctaagacttgaactatatcttcatagaaccacaacctactacgctttccaggctctttcggtgattcttgtcgtaca 29827583  T
Q  222 acttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29827582 atttctttacccatgtcttctatcaagtcatgtaatgtcaca 29827541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28141161 - 28141089
Alignment:
Q  192 ccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28141161 ccaggctcttttggtgattcttgtcgaacaatttctttacccatctcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 28141089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 399 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 29827417 - 29827263
Alignment:
Q  399 cctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgc-tcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattggga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| | | |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||| |||||| |||    
T  29827417 cctttgaagcaacaagcaatgtcgagaaaaacac-cttgttcatcttcctccaaagcatcaaaacttattttaagtatattttggatctctttattagga 29827319  T
Q  498 atcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    ||| ||||||| | ||||||| ||   ||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  29827318 atcctttcatatctatctaatatagatttccattcttctatattctttccaaacaa 29827263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28150798 - 28150726
Alignment:
Q  192 ccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28150798 ccaggctcttttggtgattcttgtcgtacaatttctttacccatgtcttctatcaagtcatgtaatgttacat 28150726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 450 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 25539923 - 25539836
Alignment:
Q  450 aaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttcta 537  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  25539923 aaagcatcatagcttacttgaagtatcctttggatatctttatcgggaatattttcatactcatctaatgtacgcttccaatcttcta 25539836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26938561 - 26938426
Alignment:
Q  298 taatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccaca 397  Q
    ||||||| | ||||||||| | | |||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||   | ||| |||    
T  26938561 taatctttatgagagatttattaaccaacactccaacatgattttttatgcaatgaccataatgagcatgaagtttatcttcaacctcagccaatctaca 26938462  T
Q  398 tcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacact 433  Q
     || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  26938461 cccattgaagcaacacgtaatatccagaaagacact 26938426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 2186358 - 2186165
Alignment:
Q  298 taatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttcca-tccac 396  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| | ||||| | | |||||||    ||||||||||  |||||||||||  | ||| ||||| || ||    
T  2186358 taatctttatgagtgatttttcaaccaacactccaatatgatttttgatgcaataagtataatgagcatcaagtatatcttggaactc-ttccagtctac 2186260  T
Q  397 atcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatcttttta 491  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||| |  || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2186259 atcctttgaaaaaacaagcaatgtcgagaaagagactcttatcttcctcctgcaaagcatcaaagctgactttaagtatctgttggatgttttta 2186165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 469 - 569
Target Start/End: Original strand, 27336916 - 27337016
Alignment:
Q  469 taagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattat 568  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  27336916 taagtatcttttgtatctctttattgggaatcctgtcatacccatctaatgtgttcttccatacttctatgttctttccaaacaagttagaacccactat 27337015  T
Q  569 t 569  Q
    |    
T  27337016 t 27337016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 469 - 569
Target Start/End: Original strand, 27397656 - 27397756
Alignment:
Q  469 taagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattat 568  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  27397656 taagtatcttttgtatctctttattgggaatcctgtcatacccatctaatgtgttcttccatacttctatgttctttccaaacaagttagaacccactat 27397755  T
Q  569 t 569  Q
    |    
T  27397756 t 27397756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Original strand, 28097007 - 28097079
Alignment:
Q  191 tccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28097007 tccaggttcttttggtgattcttgtcttacaatttctttacccatgtcttctatcaagtcatgtaatgtcaca 28097079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 458
Target Start/End: Original strand, 28097093 - 28097253
Alignment:
Q  298 taatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccaca 397  Q
    ||||||| || |||||||||| | |||||||||| |  |||| | | ||||  || || |||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||  | |    
T  28097093 taatcttcacaagagattttttaaccaacactccaatgtgatatctcatgcgttgaccgtaatgagcacaaagcatatcttccacctctttcaatttata 28097192  T
Q  398 tcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatca 458  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||    
T  28097193 ccctttgaagcaacaagcaatgtcgagaaaaacactcctctcatcttcctccaaagcatca 28097253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29469849 - 29469759
Alignment:
Q  172 accataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcac 262  Q
    ||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||  || | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29469849 accataacctactgcgttttccaggatcttcaggtgattcttgtctaacaatttctttccccatatcctctatcaaatcatgtaatgtcac 29469759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Original strand, 29842547 - 29842619
Alignment:
Q  191 tccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29842547 tccaggctctttcgttgattctggtcgtacaatttctttacccatgtcttctatcaagtcatgtagtgtcaca 29842619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 26850133 - 26849978
Alignment:
Q  409 aacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcata 508  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  || ||||| || ||||  |||||||||| | ||||||||| ||| || | |  ||  |||||  |||||||    
T  26850133 aacaagcaatatccaaaaagacactctgttgttcttcatccaaagagtcatagcttattctaagtatcttttgaatatctgcatgtggaattctttcata 26850034  T
Q  509 cccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    |  ||||||||||  ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26850033 cttatctaatgtagactcgcattcttctatactctttccaaacaagttggaaccca 26849978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 26960545 - 26960391
Alignment:
Q  410 acaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatac 509  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  || |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  |||||  | ||||||    
T  26960545 acaagcaatatccaaaaagacactctgttgttcttcagccaaagcgtcatagcttactttaagtatcttttggatatcttcatgtggaattctgtcatac 26960446  T
Q  510 ccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
      |||||||  |  ||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26960445 ttatctaataaagactcacattctgctatactcttgccaaacaagttggaaccca 26960391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 26978800 - 26978726
Alignment:
Q  410 acaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 484  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  26978800 acaagcaatatccaaaaagacactctgttgttcttcgtccaaagcatcaaagcttactttaagtatcttttggat 26978726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 29673508 - 29673646
Alignment:
Q  126 ttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgactt 225  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||| |||| |||||| ||   | ||||||||||||| | || |||||| |||| ||||| ||||||||  || | ||    
T  29673508 ttactcactgtattttcttctaaaacttgaattatatcttcggaaaaccataacctactacgttttccaggatcttcaggtgcttcttgtctaacaattt 29673607  T
Q  226 ctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29673608 cttttcccatatcctctaccaaatcatgtaatgtcacat 29673646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26938702 - 26938581
Alignment:
Q  136 tattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccat 235  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |  | | |||| || ||| | | |||||||| ||||||   |||||||||||  || | ||||||||||||    
T  26938702 tattttcttttaatacatgaactatatctttgtcaaaccacaatctagtgcgttctccagcctctttgactgattcttgtctaacaatttctttacccat 26938603  T
Q  236 gtcctctatcaagtcatgtaat 257  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  26938602 gtcctcaatcaagtcatgtaat 26938581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28240778 - 28240678
Alignment:
Q  405 aagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatctttt 504  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||| ||| ||||||||| |    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||    
T  28240778 aagcaacaagcaatgtcgagaaaaacactttgctcatctttctccaaagcatcaaa----actttaagtatcttttggatctctttatttggaatccttt 28240683  T
Q  505 catac 509  Q
    |||||    
T  28240682 catac 28240678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 29469645 - 29469523
Alignment:
Q  397 atcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattggg 496  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||  |||||  |||||||  ||||||||| |||| | ||  ||||||  ||||||||||||||  ||    
T  29469645 atcctttgaagcagcaggcaatgtcaagaaaaacagacttctcttcttcctgcaaagcatcaaagctaagttgtagtatcgtttggatctttttatcagg 29469546  T
Q  497 aatcttttcatacccatctaatg 519  Q
    |||| ||||||| | ||||||||    
T  29469545 aatcctttcataacgatctaatg 29469523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 396 - 505
Target Start/End: Original strand, 29727698 - 29727807
Alignment:
Q  396 catcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgg 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||  || ||||| | ||||||| |||| ||||  ||| ||  ||||||||||||||  |    
T  29727698 catcctttgaagcaacaagcaatgtcaagaaaaacaaacttctcttcgtcctccagagcatcaaagctcacttgtagtgtcatttggatctttttatgag 29727797  T
Q  496 gaatcttttc 505  Q
    |||| |||||    
T  29727798 gaattttttc 29727807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 26637076 - 26636912
Alignment:
Q  400 ctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaat 499  Q
    |||| ||| |||||||||| || | |||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| | || ||  |||||    
T  26637076 ctttaaagaaacaagcaatatctaaaaagacactctgttgttcttcatccaaagcgtcatagctaactttaagaatcttttggatatcttcatgtggaat 26636977  T
Q  500 cttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
      | ||||||  |||||||  |  ||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26636976 tctgtcatacttatctaataaagactcacattctgctatactctttccaaacaagttggaaccca 26636912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 26743042 - 26742878
Alignment:
Q  400 ctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaat 499  Q
    |||| ||| |||||||||| || | |||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||| |||||| | || ||  |||||    
T  26743042 ctttaaagaaacaagcaatatctaaaaagacactctgttgttcttcatccaaagcgtcatagctaactttaagaatcttttggatatcttcatgtggaat 26742943  T
Q  500 cttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
      | ||||||  |||||||  |  ||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26742942 tctgtcatacttatctaataaagactcacattctgctatactctttccaaacaagttggaaccca 26742878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28140968 - 28140844
Alignment:
Q  397 atcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattggg 496  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||| ||| |||  |||| |||| |||||||||||||   ||| || |||||  ||    
T  28140968 atcctctgaaacaacaagcaatgtcgagaaaaacactttgctcatctttctccaaactatcaaagctcactttaagtatcttcaggacctctttatgagg 28140869  T
Q  497 aatcttttcatacccatctaatgta 521  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28140868 aatcctttcataccgatctaatgta 28140844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 25075288 - 25075213
Alignment:
Q  409 aacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 484  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  || ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  25075288 aacaagcaatatccaaaaagacactctgttgttcttcgtccaaagcgtcaaagcttactttaagtattttttggat 25075213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 264
Target Start/End: Original strand, 29694932 - 29695023
Alignment:
Q  173 ccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||||||||| | | || |||||| |||| |||||||||| |||  || | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  29694932 ccataacctagtgcgttttccaggatcttcaggtgattctcgtctaacaatttctttccccatatcctctatcaaatcatgtaatgttacat 29695023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28228452 - 28228395
Alignment:
Q  450 aaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28228452 aaagcatcaaagcttattttaagtatctctgtgatatttttaatgggaatcctttcat 28228395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Original strand, 28296328 - 28296373
Alignment:
Q  224 ttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacatcataa 269  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28296328 ttctttacccattttctctatcaaggcatgtaatgtcacaacataa 28296373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28515745 - 28515700
Alignment:
Q  224 ttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacatcataa 269  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  28515745 ttctttacccattttctctatcaaggcatgtaatgtcacaacataa 28515700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 264
Target Start/End: Original strand, 29759010 - 29759083
Alignment:
Q  191 tccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||  || | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  29759010 tccaggatcttgaggcgattcttgtctaacaatttctttacccatatcctctaccaaatcatgcaatgtcacat 29759083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28187027 - 28186955
Alignment:
Q  191 tccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    |||||||||||| || || ||||  ||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  28187027 tccaggctcttttggagactctttccggacaatttctttacccattttctctatcaaggcatgtaacgtcaca 28186955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 396 - 460
Target Start/End: Original strand, 29673757 - 29673821
Alignment:
Q  396 catcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcata 460  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||  |||| ||||||    
T  29673757 catcctttgaagcaacatgcaatgtcaagaaacacaatcttctcttcttcctgcaaagaatcata 29673821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 551 - 30
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  551 tagtatgagatggtcatatttagtccaaaaagagcaaa-gtcatatcaaaactaaataacaaattgaacatagatatcaatcttactcacagtgttttct 453  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  452 tttaaaacattaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctcctggctctttaggcgattcttgtcgtacgacttctttacccatgtcctcta 353  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgt 343  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  352 taaagtcatgtaatgtcacatgattaatagatcccgaat---aagaagtactactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctagatgatgttt 256  T
Q  344 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  255 tatgcaatggccataatgagcacgtagtatatcttcaaactccttccatccacatcctttgaagcaacaggcaatgtctagaaaaacactttgctgctct 156  T
Q  444 tcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctct 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  155 tcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatcgtct 56  T
Q  544 tcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  55 ttccaaacaagttggaacccactatt 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 47 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 9266 - 8748
Alignment:
Q  47 tatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgtt 146  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  9266 tatgagatggtcatatttagtccaaaaagagcaaa-gtcatatcaaaactaaataacaaattgaacatagatatcaatcttactcacagtgttttctttt 9168  T
Q  147 aaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatca 246  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9167 aaaacattaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctcctggctctttaggcgattcttgtcgtacgacttctttacccatgtcctctataa 9068  T
Q  247 agtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttat 346  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9067 agtcatgtaatgtcacatgattaatagatcccgaat---aagaagtactactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctagatgatgttttat 8971  T
Q  347 gcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcc 446  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  8970 gcaatggccataatgagcacgtagtatatcttcaaactccttccatccacatcctttgaagcaacaggcaatgtctagaaaaacactttgctgctcttcc 8871  T
Q  447 tctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcc 546  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  8870 tccaaagcatcataacttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatcgtctttc 8771  T
Q  547 caaacaagttggaacccattatt 569  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  8770 caaacaagttggaacccactatt 8748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 44 - 569
Target Start/End: Original strand, 12078 - 12596
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  12078 tagtatgagatggtcatatttagtccaaaaagagcaaa-gtcatatcaaaactaaataacaaattgaacatagatatcaatcttactcacagtgttttct 12176  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12177 tttaaaacattaactatatcatcttcacaccataatctacttctttctccaggctctttgggcgattcttgtcggacgacttctttacccatgtccttta 12276  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgt 343  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||  |  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12277 tcaagtcatgtagtgtcagttcataaatagatccataatggggatgagt------aatcttaacgagagatttttcagccaacactactagatgatgtgt 12370  T
Q  344 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctct 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  12371 tatgcgatggccataatgagcacgaagtatatattcaaactccttccatccacatcctttgaagcaacaggcaatgtctagaaaaacactttgctgctct 12470  T
Q  444 tcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctct 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12471 tcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctcgtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatcgtct 12570  T
Q  544 tcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  12571 ttccaaacaagttggaacccactatt 12596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 44 - 569
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3633
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  3115 tagtatgagatggtcatatttagtccaaaaagagcaaa-gtcatatcaaaactaaataacaaattgaacatagatatcaatcttactcacagtgttttct 3213  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3214 tttaaaacattaactatatcatcttcacaccataatctacttctttctccaggctctttgggcgattcttgtcggacgacttctttacccatgtccttta 3313  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgt 343  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||  |  |||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3314 tcaagtcatgtagtgtcagttcataaatagatccataatggggatgagt------aatcttaacgagagatttttcagccaacactactagatgatgtgt 3407  T
Q  344 tatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctct 443  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  3408 tatgcgatggccataatgagcacgaagtatatattcaaactcctcccatccacatcctttgaagcaacaggcaatgtctagaaaaacactttgctgctct 3507  T
Q  444 tcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctct 543  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3508 tcctccaaagcatcatagcttactttaagtatctggtggatctttttattgggaatcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatcgtct 3607  T
Q  544 tcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  3608 ttccaaacaagttggaacccactatt 3633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 308 - 569
Target Start/End: Original strand, 29272498 - 29272759
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||   | || | |||| |||| |||||||||    
T  29272498 gagagatttttcagccaatactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagaatgaagtatatatttggcatcttcccattcacaacctttgaag 29272597  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29272598 caacaagcaatgtccagaaagacactttgttgctcttcttccaaagcatcataacttactttaagtatctggtggatccttttattgggaatcttttcat 29272697  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29272698 atccatctaatgtacccttccattcttctatcctctttccaaacaagttggaacccactatt 29272759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 253
Target Start/End: Original strand, 29272250 - 29272458
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | ||||||    
T  29272250 tagtatcagatgataatatttagtccaaaaagagcaaa-gtcgtattaaaactaaataacaaaatgatcatagatatcaatcttactcacagtgttttct 29272348  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     |||||||| |||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29272349 cttaaaacacgaactagatcatcctggcagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatgtccccta 29272448  T
Q  244 tcaagtcatg 253  Q
    |||| |||||    
T  29272449 tcaaatcatg 29272458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 35984720 - 35984619
Alignment:
Q  409 aacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcata 508  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||  |||||||    
T  35984720 aacaagcaatgtcaagaaaaacactttgctcatcttcctctaaagcatcaaaacttactttaagtatcttttggatgtctttattaggaatggtttcata 35984621  T
Q  509 cc 510  Q
    ||    
T  35984620 cc 35984619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 263
Target Start/End: Original strand, 16371673 - 16371764
Alignment:
Q  172 accataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    ||||||||||||| | ||| || ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  16371673 accataacctactacgttcgcctggctcctttggtgattcttgtcggacaatttctttacccatgtcttctaccaggttatgtaatgtcaca 16371764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 402 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 16450326 - 16450236
Alignment:
Q  402 ttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttat 492  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16450326 ttgaagaaacaagcaatgtcaagaaaaacactcctctcatcttcatccaaggaatcatagctgactttaagtatgtctttgatctttttat 16450236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12590378 - 12590286
Alignment:
Q  172 accataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||||| | || |||||| | ||  |||||||||||||  || | |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  12590378 accataacctactacgttttccaggattttccggtgattcttgtctaactatttctttccccatatcctctaccaaatcatgtaatgtcacat 12590286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 35984968 - 35984859
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    |||||| |||| |||||| || ||| ||||||||| ||| |  | |||||| ||||  ||||||||  |||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  35984968 taaaacttgaattatatcttcatgagaccataaccgactacgctttccaggttcttctggtgattccagtcgaacaatttccttacccatgtcctctatc 35984869  T
Q  246 aagtcatgta 255  Q
    ||| ||||||    
T  35984868 aaggcatgta 35984859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 308 - 564
Target Start/End: Original strand, 267000 - 267256
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||   | || | |||| || |||||||||||    
T  267000 gagagatttttcagccaacactcctagatgatgtgttatgcagtggccataatgagaatgaagtatatgtttggcatcttcccattcatatcctttgaag 267099  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  267100 caacaagcaatgtctaaaaagacactctgctcctcttcttccaaaccatcatagctcactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcttatcat 267199  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  267200 acccatctaatgtacccttccattcttctatgctctttccaaacaagttagaaccca 267256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 264
Target Start/End: Original strand, 266761 - 266980
Alignment:
Q  44 tagtatgagatgatcatatttagaccaaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttct 143  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| | ||||      
T  266761 tagtatgagatggtcatattttgtccaaaaagagcaaa-gtcgtattaaaactaaataacaaattgatcattgatatcaatcttactcacagtgttttta 266859  T
Q  144 gttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctcta 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  266860 tttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttcgttctccaggctctttaggtgattcttggcggaccacttctttacccatgtcctcta 266959  T
Q  244 tcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  266960 tcatgtcatgtaatgtcacat 266980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 298 - 569
Target Start/End: Original strand, 28126325 - 28126596
Alignment:
Q  298 taatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccaca 397  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||| | |    
T  28126325 taatctcaatgagagatttttcaaccaacactccaacatgatgctttatgcaatggccataatgagcatgaagtatcttttcaacctctgtcaatctata 28126424  T
Q  398 tcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattggga 497  Q
     ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  28126425 ccctttgaagcagcaagctatatcgagaaagacactttgctcatcttcctccaaagcatcatagcttagtttaaatatctcttggatctttttatttgga 28126524  T
Q  498 atcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  28126525 atcttttcatatccatctaatgtacccttccattcttctatgctctttccaaataagttggaacccactatt 28126596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 569
Target Start/End: Original strand, 28132012 - 28132422
Alignment:
Q  150 acatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagt 249  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||   |||||||   |||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  28132012 acatgaactatatcattgtgacaccataacctactgcgttctccaggttccttacacgattctttatggacgatttctttacctgtgtcttctatcaagt 28132111  T
Q  250 catgtaatgtcacatcataaatagatcccgaatggtaagaagttctactaatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgca 349  Q
    ||||||||||||||||  ||  | ||   ||| | ||   ||| ||  ||||||  | ||||||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  28132112 catgtaatgtcacatc--aacgacat---gaaag-tatcgagt-ct--taatctctatgagagatttttcgaccaacactccaacatgatgttttatgca 28132202  T
Q  350 atggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctct 449  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||    || ||| | | || |||||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||||||     
T  28132203 atggccattatgagcatgaagtatctcttcgaccattgtcaatctataccccttgaagcaacaagctatatccagaaagacactttgctcctcttcctcc 28132302  T
Q  450 aaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaa 549  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28132303 aaagcatcgtaacttactttaaatatctcatggatctttttattaggaatcttttcatatccatctaatgtacacttccattcttctatgctctttccaa 28132402  T
Q  550 acaagttggaacccattatt 569  Q
    | ||||| ||||||| ||||    
T  28132403 ataagtttgaacccactatt 28132422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26137571 - 26137434
Alignment:
Q  126 ttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgactt 225  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  26137571 ttactcactgtattttcttttaaaacatgaactatatcttcatgaaaccacaacctactgcgttttccaggttctttgggtgattcttgtcggacaattt 26137472  T
Q  226 ctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcaca 263  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26137471 ctttacccatatcctctatcaagtcatgtaatgccaca 26137434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 149 - 264
Target Start/End: Original strand, 28126200 - 28126315
Alignment:
Q  149 aacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaag 248  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  | | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  28126200 aacatgaactatatcattgtgacaccataacctgttgcgttctccaggctctttacgtgattctttccggacgatttctttacccgtatcctctatcaag 28126299  T
Q  249 tcatgtaatgtcacat 264  Q
    ||||||||||||||||    
T  28126300 tcatgtaatgtcacat 28126315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Original strand, 5921978 - 5922101
Alignment:
Q  136 tattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccat 235  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||  || | |||||| |||||    
T  5921978 tattttcttctaaaacttgaactatatcttcagggcaccataacctactgcgctttccaggctctttcggtgattcttgtctaacaatttcttttcccat 5922077  T
Q  236 gtcctctatcaagtcatgtaatgt 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||    
T  5922078 gtcctctatcacatcatgtaatgt 5922101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 26137420 - 26137209
Alignment:
Q  298 taatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccaca 397  Q
    ||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||| | ||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||  || ||  || ||  |||    
T  26137420 taatcttcatgagagctttatcaaccaacactccaacatgactttttatgcaatggtcataacgagcatgaagtatcttttggacttctgtcaatttaca 26137321  T
Q  398 tcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattggga 497  Q
     |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |  || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | || ||  |||    
T  26137320 ccctttgaagcaacaagcaatatccaaaaatacactttgttgttcttcgtccaaagcatcatagcttactctaagtatgttttggatatcttcatgtgga 26137221  T
Q  498 atcttttcatac 509  Q
    ||| ||||||||    
T  26137220 atcctttcatac 26137209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 521
Target Start/End: Original strand, 5922218 - 5922342
Alignment:
Q  397 atcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattggg 496  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||| || | |  ||| ||||||||||  ||    
T  5922218 atcctttgaagcaacaagcaatatcaagaaaaacacttttctcttcttcttccaaagcatcaaagctcacttttagcaacgtttgcatctttttatcagg 5922317  T
Q  497 aatcttttcatacccatctaatgta 521  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||    
T  5922318 aatcctttcataacgatctaatgta 5922342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 256
Target Start/End: Original strand, 1957 - 2162
Alignment:
Q  51 agatgatcatatttagac-caaaaagggcaaaagtcgtattaaaactaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaa 149  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  1957 agatgatcatatttagttacaaaaagagcaaa-gttgtattaaaactaaataacaaaatgatcatagatatcaatcttactcacagtgttttctcttaaa 2055  T
Q  150 acatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagt 249  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2056 acacgaactatatcatcctgacagcataacctacttctttctccaggctctttaattgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagt 2155  T
Q  250 catgtaa 256  Q
    |||||||    
T  2156 catgtaa 2162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 308 - 569
Target Start/End: Original strand, 2199 - 2460
Alignment:
Q  308 gagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaag 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||   | || | ||||  ||||| |||||||    
T  2199 gagagatttttcaaccaacactcctagatgatgtgttatgcaatggccataatgagaattaagtatatatttggcatcttcccatttacatcttttgaag 2298  T
Q  408 caacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  2299 caacaagcaatgtctagaaagacactttgctgctcttcctccaaagcatcataacttactttaagtatcttttggatctctttattgggaatcctgtcat 2398  T
Q  508 acccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||| ||| | ||||| ||||||| ||||    
T  2399 acccatctaatgtattcttccattcctctatgttctttccagataagttagaacccactatt 2460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 61056 - 60830
Alignment:
Q  343 ttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctc 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||    
T  61056 ttatgcaatgaccataatgagcatgaagtatttctttgaccttttcccatttacaacctttgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactttgctcctc 60957  T
Q  443 ttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctc 542  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  ||    
T  60956 ttcctccaaagaatcatagctcactttaagtattctttggatctctttattgggaatcttttcataccaatctaatgtattcttgcattcttctatgttc 60857  T
Q  543 ttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  60856 tttccaaacaagttagaacccactatt 60830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 61286 - 61117
Alignment:
Q  95 ctaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctcca 194  Q
    ||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||| | ||||||  || ||| | || |||||| | || | |||||||||| ||||||| ||||    
T  61286 ctaaataacaaattgttcctgcatatcaatcttactcacagtgttttcttctagaacttcaaatatatccttttcaaaccataacctgcttctttttcca 61187  T
Q  195 ggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  61186 ggctcaaaaggtgattctagtcggacgagttctttacccatgttctctatcaagttatgtaatgacacat 61117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 343 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 18075248 - 18075022
Alignment:
Q  343 ttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctc 442  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  ||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||    
T  18075248 ttatgcaatgaccataatgagcatgaagtatttctttgaccttttcccatttacaacctttgaagcaacaagcaatgtctagaaagacactttgctcctc 18075149  T
Q  443 ttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctc 542  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  ||    
T  18075148 ttcctccaaagaatcatagctcactttaagtattctttggatctctttattgggaatcttttcataccaatctaatgtattcttgcattcttctatgttc 18075049  T
Q  543 ttcccaaacaagttggaacccattatt 569  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  18075048 tttccaaacaagttagaacccactatt 18075022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18075478 - 18075309
Alignment:
Q  95 ctaaataacaaattgatattatatatcaatcttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctcca 194  Q
    ||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||| | ||||||  || ||| | || |||||| | || | |||||||||| ||||||| ||||    
T  18075478 ctaaataacaaattgttcctgcatatcaatcttactcacagtgttttcttctagaacttcaaatatatccttttcaaaccataacctgcttctttttcca 18075379  T
Q  195 ggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18075378 ggctcaaaaggtgattctagtcggacgagttctttacccatgttctctatcaagttatgtaatgacacat 18075309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 395 - 564
Target Start/End: Original strand, 18722828 - 18722997
Alignment:
Q  395 acatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattg 494  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |  || |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||      
T  18722828 acatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgttcttcgcccaaagcatcaaagcttactttaagtatcttttggatatcttcatct 18722927  T
Q  495 ggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    |||||  ||||||||  ||||||||||  ||  |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  18722928 ggaattctttcatacatatctaatgtagactcacattctgcaatactctttccaaacaagttggaaccca 18722997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 267
Target Start/End: Original strand, 18730060 - 18730134
Alignment:
Q  193 caggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacatcat 267  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18730060 caggctctttgggtgattctttccggacgatttctttacccatgacctctagcaagtcatgtaatgtcacatcat 18730134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 395 - 564
Target Start/End: Original strand, 18688369 - 18688538
Alignment:
Q  395 acatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattg 494  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||  ||     
T  18688369 acatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgttcttcgtccaaagcatcaaagcttactttaagtatcttttggatatcttcgttt 18688468  T
Q  495 ggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    |||||  ||| ||||  ||||||||||  ||  ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||    
T  18688469 ggaattctttgatacttatctaatgtagactcacattctgaaatactctttccaaacaagttggaaccca 18688538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 395 - 564
Target Start/End: Original strand, 18698143 - 18698312
Alignment:
Q  395 acatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattg 494  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||      
T  18698143 acatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgttcttcgtccaaagcatcaaagcttactttaagtatcttttggatatcttcatgt 18698242  T
Q  495 ggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    |||||  ||||||||  ||||||||||   |  |||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18698243 ggaattctttcatacttatctaatgtagagtcacattctgcaaaactctttccaaacaagttggaaccca 18698312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 395 - 564
Target Start/End: Original strand, 18730247 - 18730416
Alignment:
Q  395 acatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattg 494  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||      
T  18730247 acatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgttcttcgtccaaagcatcaaagcttactttaagtatcttttggatatcttcatgt 18730346  T
Q  495 ggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    |||||  ||||||||  ||||||||||   |  |||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18730347 ggaattctttcatacttatctaatgtagaatcacattctgcaaaactctttccaaacaagttggaaccca 18730416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Original strand, 18653995 - 18654111
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    ||||| ||||||||| ||||   ||||||| |||||||| |  | | |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  18653995 taaaatatgaactatgtcattgcgacaccacaacctactacgcttttcaggctgtttaggtgattctttccggacgatttctttacccatgacctctagc 18654094  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcac 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  18654095 aagtcatgtaatgtcac 18654111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Original strand, 18678075 - 18678191
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    ||||| ||||||||| ||||   ||||||| |||||||| |  | | |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  18678075 taaaatatgaactatgtcattgcgacaccacaacctactacgcttttcaggctctttgggtgattctttccggacgatttctttacccatgacctctagc 18678174  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcac 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  18678175 aagtcatgtaatgtcac 18678191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Original strand, 18722588 - 18722704
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    ||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||| ||| | || | |||||||||||||||||||||  || | || ||||||||||||| |||||| |    
T  18722588 taaaatatgaactatgtcatcacgacaccacaaccgactacgtttttcaggctctttaggtgattctttacgaatgatttctttacccatgacctctagc 18722687  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcac 262  Q
    |||||||||||||||||    
T  18722688 aagtcatgtaatgtcac 18722704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 267
Target Start/End: Original strand, 18688179 - 18688253
Alignment:
Q  193 caggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacatcat 267  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18688179 caggctctttaggtgattctttccggacaatttctttacccatgacctctagcaagtcatgtaatgtcacttcat 18688253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 267
Target Start/End: Original strand, 18697965 - 18698039
Alignment:
Q  193 caggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacatcat 267  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18697965 caggctctttgggtgattctttccggacgatttctttacccatggcctctagcaagtcatgtaatgtcacttcat 18698039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 299 - 516
Target Start/End: Original strand, 5089601 - 5089818
Alignment:
Q  299 aatcttaacgagagatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacat 398  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||  ||||| ||||| | | |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | | | | | ||    
T  5089601 aatctttatgagagatttatcaaccaactttcctatatgatatttcatgcaataaccataatgagcacaaagtatatattcgacctcatccaagctatat 5089700  T
Q  399 cctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaa 498  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||  | |||  |||||  || | |||| ||| ||||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  5089701 cctttgaaacaacaagcaatgtcgaggaaaacactctgctcatattcacctaaattattaaagctcactataagtatcttttggatttctttattaggaa 5089800  T
Q  499 tcttttcatacccatcta 516  Q
    || |||||||| ||||||    
T  5089801 tcctttcatactcatcta 5089818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 395 - 564
Target Start/End: Original strand, 18654220 - 18654389
Alignment:
Q  395 acatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattg 494  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |  || ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | || ||      
T  18654220 acatcctttgaacaaacaagcaatatccaaaaagacactttgttgttcttcatccaaagcatcaaaacttactttaagtatcttttggatatcttcatgt 18654319  T
Q  495 ggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    |||||  ||||||||  ||||||||||   |  |||||| | || ||||| |||||||||||||||||||    
T  18654320 ggaattctttcatacttatctaatgtagattcacattctgcaatactctttccaaacaagttggaaccca 18654389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 395 - 564
Target Start/End: Original strand, 18678303 - 18678472
Alignment:
Q  395 acatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattg 494  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |  || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | || ||      
T  18678303 acatcctttgaagaaacaagcaatatccaaaaagacaatttgttgttcttcgtccaaagcatcaaagcttactttaagtatcttttggatatcttcatgt 18678402  T
Q  495 ggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaagttggaaccca 564  Q
    |||||  ||||||||  ||||||||||  ||  ||||||   ||  |||| |||||||||||||||||||    
T  18678403 ggaattctttcatacttatctaatgtagactcacattctgaaatattctttccaaacaagttggaaccca 18678472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 354 - 564
Target Start/End: Original strand, 57000 - 57210
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaag 453  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || ||  |  |||||||||  ||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| ||||    
T  57000 ccataatgagcatgaagtatatcttcaacttcttttaaatcacatccttctaagaaacaagaaatgtcgagaaaaacattcttctcatcttcctccaaag 57099  T
Q  454 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  || ||||| |   ||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  57100 catcaaagcttactttaagtatctcttggatctttttaatgggaatcctttcatactgatttaatgcagatttccattctcctatattctttccaaacaa 57199  T
Q  554 gttggaaccca 564  Q
    ||| |||||||    
T  57200 gttcgaaccca 57210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 269
Target Start/End: Original strand, 56830 - 56927
Alignment:
Q  172 accataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacatcataa 269  Q
    ||||||||||||| | |  |||||||||||| || || ||||  ||||| | |||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  56830 accataacctactacgtcttccaggctcttttggagactctttgcggacaatttctttacccattttctctatcaaggcatgtaacgtcacaacataa 56927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 264
Target Start/End: Original strand, 17991713 - 17991831
Alignment:
Q  146 taaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatc 245  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17991713 taaaacatgaactatgtcattataacaccacaatctactccgttctccaggctctttaggtgattcttgccgaacgatttctttacccatgtcctctatc 17991812  T
Q  246 aagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||||||||| ||| ||||    
T  17991813 aagtcatgtactgtaacat 17991831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 3281090 - 3280981
Alignment:
Q  399 cctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaa 498  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||  || |||| |||||| ||||    
T  3281090 cctttaaagcaacaagcaatgtcgagaaaaacactttgctcgtcttcctccaaagcatcaaaactcactttaagtatcttctgaatctctttattaggaa 3280991  T
Q  499 tcttttcata 508  Q
    || |||||||    
T  3280990 tcctttcata 3280981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 484
Target Start/End: Original strand, 17991967 - 17992051
Alignment:
Q  400 ctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggat 484  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| || | ||||||| |||||| ||| ||||| | ||||||    
T  17991967 ctttgaagcaacaagcaatatccaaaaagacactcttttgttcttcatccagagcatcaaagcttatttttagtatattttggat 17992051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 44433 - 44223
Alignment:
Q  354 ccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaag 453  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  || ||| |   | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| ||  |||| ||| ||||    
T  44433 ccataatgagcataaagtatatcttcaagttctttcaaattatatcctttgaagcagcaagcaatgtcgagaaaaacattctgctcatctttctccaaag 44334  T
Q  454 catcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcatacccatctaatgtacccttccattcttctatcctcttcccaaacaa 553  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||  ||||| |||||||| |   ||||||||| ||||  | || ||||| ||    
T  44333 catcaaagcttactttaagtatctcctgtatctttttaatcggaatccttctataccgatctaatgcagatttccattctcctatattatttccaaataa 44234  T
Q  554 gttggaaccca 564  Q
    ||| |||||||    
T  44233 gtttgaaccca 44223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 405 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 40940 - 40840
Alignment:
Q  405 aagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatctttt 504  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||  |||| ||| ||||||||| |    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||    
T  40940 aagcaacaagcaatgtcgagaaaaacactttgctcatctttctccaaagcatcaaa----actttaagtatcttttggatctctttatttggaatccttt 40845  T
Q  505 catac 509  Q
    |||||    
T  40844 catac 40840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28950 - 28893
Alignment:
Q  450 aaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttattgggaatcttttcat 507  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28950 aaagcatcaaagcttattttaagtatctctgtgatatttttaatgggaatcctttcat 28893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16692550 - 16692412
Alignment:
Q  126 ttactcacactattttctgttaaaacatgaactatatcatcttgacaccataacctacttctttctccaggctctttaggtgattcttgtcggacgactt 225  Q
    ||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||| | ||  ||||| | ||| || ||||||| |||||| | ||    
T  16692550 ttactcaccatattttcttctaaaacttgaactatatcttcgtgaaaccacaacctactgcgtttaccaggatgttttggggattcttttcggacaattt 16692451  T
Q  226 ctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  16692450 ctttacccatgtcctcaatcaagtgatgcaatgtcacat 16692412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 16692385 - 16692222
Alignment:
Q  312 gatttttcagccaacactcctaaatgatgtgttatgcaatggccataatgagcacgaagtatatcttcaacctccttccatccacatcctttgaagcaac 411  Q
    ||||||||| |||| ||||| | ||| | | ||||||| |  ||||||||||||| |||||||   ||||| ||| || |  || |||||||||||||||    
T  16692385 gatttttcaaccaatactccaatatggtattttatgcatttaccataatgagcacaaagtataaactcaacttccgtcaaatcatatcctttgaagcaac 16692286  T
Q  412 aagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtat 475  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||| |||  |||| | ||||||||||||||    
T  16692285 aagcaatgtccaaaaaaacactcttttcatcttcctccaaactatcaaaacttactttaagtat 16692222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 492
Target Start/End: Original strand, 238614 - 238709
Alignment:
Q  397 atcctttgaagcaacaagcaatgtccagaaagacactcttctgctcttcctctaaagcatcatagcttactttaagtatctcttggatctttttat 492  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||  ||||||||||||||    
T  238614 atcctttgaagcaacatgcaatgtcaagaaaaacaattttctcttcttcctgtaaagcatcatagcttagttgtagtgtcatttggatctttttat 238709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 615401 - 615341
Alignment:
Q  204 ggtgattcttgtcggacgacttctttacccatgtcctctatcaagtcatgtaatgtcacat 264  Q
    |||||||||||||  || | |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  615401 ggtgattcttgtctaacaatttctttccccatatcctctaccaaatcatgtaatgtcacat 615341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University