View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3694_low_3 (Length: 438)

Name: NF3694_low_3
Description: NF3694
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3694_low_3
NF3694_low_3
[»] chr3 (93 HSPs)
chr3 (1-431)||(7853913-7854343)
chr3 (7-431)||(33341812-33342236)
chr3 (8-431)||(54685202-54685625)
chr3 (7-409)||(30152893-30153297)
chr3 (1-396)||(17955878-17956274)
chr3 (1-400)||(45581591-45581993)
chr3 (1-388)||(54038018-54038406)
chr3 (1-388)||(3992522-3992911)
chr3 (7-388)||(23492346-23492728)
chr3 (7-379)||(53771022-53771397)
chr3 (7-352)||(16261463-16261809)
chr3 (1-379)||(2844172-2844552)
chr3 (7-379)||(38167896-38168269)
chr3 (7-262)||(28558271-28558526)
chr3 (1-226)||(55513006-55513231)
chr3 (7-249)||(18970034-18970277)
chr3 (99-431)||(19946629-19946962)
chr3 (1-246)||(15550714-15550959)
chr3 (228-376)||(16996172-16996321)
chr3 (228-384)||(19570801-19570957)
chr3 (84-249)||(48421690-48421855)
chr3 (228-372)||(50112164-50112309)
chr3 (202-384)||(22144358-22144542)
chr3 (228-384)||(317621-317778)
chr3 (202-378)||(16182032-16182209)
chr3 (228-356)||(12349843-12349970)
chr3 (228-384)||(13817492-13817646)
chr3 (228-384)||(35123674-35123830)
chr3 (204-384)||(6154419-6154600)
chr3 (202-379)||(53898541-53898719)
chr3 (202-384)||(6146832-6147015)
chr3 (228-384)||(14298399-14298555)
chr3 (228-384)||(14304026-14304182)
chr3 (228-400)||(17523002-17523176)
chr3 (228-384)||(14295415-14295573)
chr3 (292-431)||(47784924-47785064)
chr3 (228-378)||(17100636-17100787)
chr3 (228-378)||(17101321-17101472)
chr3 (228-395)||(17139474-17139643)
chr3 (235-388)||(11329081-11329235)
chr3 (228-388)||(14528124-14528286)
chr3 (137-431)||(9303129-9303425)
chr3 (228-388)||(54423986-54424146)
chr3 (287-379)||(28558188-28558282)
chr3 (241-388)||(12560362-12560510)
chr3 (228-379)||(19260952-19261104)
chr3 (228-384)||(14301042-14301200)
chr3 (228-379)||(12349652-12349809)
chr3 (262-388)||(55440996-55441123)
chr3 (114-202)||(14177017-14177105)
chr3 (62-206)||(17393590-17393735)
chr3 (54-200)||(11402752-11402898)
chr3 (225-404)||(12488835-12489017)
chr3 (99-249)||(14285075-14285225)
chr3 (223-285)||(34439451-34439513)
chr3 (228-379)||(14059325-14059478)
chr3 (137-249)||(8275874-8275986)
chr3 (255-394)||(17204667-17204807)
chr3 (277-403)||(38811170-38811297)
chr3 (292-404)||(1990759-1990873)
chr3 (112-202)||(12539066-12539156)
chr3 (322-403)||(17960520-17960602)
chr3 (144-249)||(16934010-16934115)
chr3 (137-249)||(8268774-8268886)
chr3 (240-351)||(8631801-8631912)
chr3 (228-354)||(17938582-17938708)
chr3 (279-395)||(9590918-9591035)
chr3 (292-409)||(12952915-12953034)
chr3 (228-354)||(16880131-16880258)
chr3 (112-183)||(37915290-37915361)
chr3 (254-395)||(15876034-15876176)
chr3 (292-379)||(3576615-3576703)
chr3 (292-403)||(34559857-34559969)
chr3 (137-217)||(38375718-38375798)
chr3 (1-39)||(15857157-15857195)
chr3 (1-39)||(19232089-19232127)
chr3 (228-356)||(11061118-11061247)
chr3 (3-44)||(13301360-13301401)
chr3 (3-44)||(13312016-13312057)
chr3 (6-39)||(15615137-15615170)
chr3 (320-394)||(17191511-17191583)
chr3 (7-44)||(51961031-51961068)
chr3 (7-39)||(2050115-2050147)
chr3 (7-39)||(2449152-2449184)
chr3 (7-39)||(8268650-8268682)
chr3 (7-39)||(8275750-8275782)
chr3 (137-217)||(10913031-10913111)
chr3 (137-249)||(11477220-11477332)
chr3 (7-39)||(14842487-14842519)
chr3 (7-39)||(16933869-16933901)
chr3 (7-39)||(17912398-17912430)
chr3 (7-39)||(18911300-18911332)
chr3 (7-39)||(19260749-19260781)
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (1-396)||(35015051-35015447)
chr6 (1-431)||(18583264-18583678)
chr6 (1-396)||(19983186-19983581)
chr6 (7-379)||(26089718-26090091)
chr6 (7-388)||(18002395-18002777)
chr6 (7-379)||(23994904-23995279)
chr6 (7-388)||(15742120-15742505)
chr6 (8-431)||(4991002-4991427)
chr6 (3-272)||(15889601-15889871)
chr6 (3-249)||(22585441-22585688)
chr6 (3-249)||(22590272-22590519)
chr6 (7-272)||(25640456-25640720)
chr6 (137-431)||(18823417-18823712)
chr6 (31-273)||(15004831-15005072)
chr6 (137-431)||(18839272-18839567)
chr6 (228-372)||(32898779-32898924)
chr6 (233-384)||(25744331-25744483)
chr6 (228-384)||(22440911-22441068)
chr6 (228-384)||(31628245-31628402)
chr6 (228-384)||(13014822-13014979)
chr6 (228-388)||(18777119-18777280)
chr6 (228-378)||(16086001-16086151)
chr6 (228-378)||(18432626-18432777)
chr6 (100-246)||(32276756-32276902)
chr6 (235-409)||(18398890-18399065)
chr6 (235-396)||(18381803-18381965)
chr6 (228-369)||(18570271-18570413)
chr6 (320-431)||(17083383-17083496)
chr6 (225-403)||(22361874-22362054)
chr6 (115-246)||(19629447-19629578)
chr6 (228-384)||(16106499-16106650)
chr6 (254-379)||(25367376-25367502)
chr6 (137-249)||(16300010-16300122)
chr6 (112-206)||(17374924-17375018)
chr6 (137-202)||(21931364-21931429)
chr6 (119-244)||(26512260-26512385)
chr6 (119-244)||(26517376-26517501)
chr6 (280-388)||(28195259-28195367)
chr6 (322-379)||(15740211-15740269)
chr6 (290-395)||(18629786-18629892)
chr6 (254-400)||(25651197-25651345)
chr6 (320-403)||(25919571-25919655)
chr6 (6-39)||(1650020-1650053)
chr6 (137-202)||(19175311-19175376)
chr6 (138-202)||(16136423-16136487)
chr6 (7-39)||(16232199-16232231)
chr6 (7-39)||(19610325-19610357)
chr6 (320-379)||(33324675-33324735)
chr6 (320-379)||(35136217-35136277)
[»] chr8 (64 HSPs)
chr8 (7-388)||(41506709-41507091)
chr8 (1-396)||(24716756-24717152)
chr8 (2-369)||(39115267-39115635)
chr8 (1-388)||(274416-274804)
chr8 (1-388)||(641045-641433)
chr8 (1-388)||(826851-827239)
chr8 (7-352)||(24385652-24385988)
chr8 (142-400)||(16038916-16039176)
chr8 (98-248)||(22321437-22321587)
chr8 (7-246)||(21259391-21259630)
chr8 (3-249)||(17502274-17502521)
chr8 (31-249)||(23217990-23218208)
chr8 (202-384)||(19993141-19993324)
chr8 (202-379)||(22234890-22235068)
chr8 (228-384)||(41246635-41246792)
chr8 (55-249)||(4233968-4234162)
chr8 (228-384)||(20573305-20573461)
chr8 (202-356)||(37611675-37611829)
chr8 (228-400)||(20481565-20481739)
chr8 (224-372)||(20647938-20648087)
chr8 (228-372)||(20654018-20654163)
chr8 (228-395)||(39446878-39447046)
chr8 (316-384)||(20567200-20567268)
chr8 (292-384)||(20567335-20567427)
chr8 (292-384)||(20573528-20573620)
chr8 (280-384)||(25122513-25122618)
chr8 (241-403)||(38533607-38533770)
chr8 (85-202)||(18118259-18118376)
chr8 (228-379)||(21680984-21681137)
chr8 (99-239)||(21494452-21494592)
chr8 (299-409)||(29759893-29760005)
chr8 (254-403)||(5854572-5854722)
chr8 (99-249)||(22886440-22886590)
chr8 (137-246)||(22147555-22147664)
chr8 (323-403)||(22736046-22736127)
chr8 (142-248)||(2545061-2545167)
chr8 (235-396)||(23837163-23837325)
chr8 (137-246)||(18612523-18612632)
chr8 (137-246)||(18619428-18619537)
chr8 (320-384)||(15969796-15969860)
chr8 (254-403)||(26011452-26011602)
chr8 (144-249)||(3431317-3431422)
chr8 (224-288)||(20561740-20561804)
chr8 (325-396)||(21198362-21198434)
chr8 (254-404)||(33528383-33528533)
chr8 (254-403)||(15933256-15933406)
chr8 (137-246)||(16002113-16002223)
chr8 (279-404)||(23226240-23226368)
chr8 (1-39)||(16404894-16404932)
chr8 (278-404)||(23149736-23149865)
chr8 (327-396)||(24929018-24929087)
chr8 (7-41)||(31194217-31194251)
chr8 (279-396)||(31194488-31194606)
chr8 (320-396)||(17285232-17285309)
chr8 (7-39)||(5238404-5238436)
chr8 (7-39)||(13662182-13662214)
chr8 (7-39)||(13720845-13720877)
chr8 (7-39)||(16872968-16873000)
chr8 (290-404)||(22742717-22742833)
chr8 (7-39)||(22907128-22907160)
chr8 (7-39)||(24661162-24661194)
chr8 (292-395)||(27233244-27233348)
chr8 (7-39)||(43373392-43373424)
chr8 (7-39)||(43685863-43685895)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (7-388)||(2031783-2032165)
chr5 (8-409)||(11342635-11343039)
chr5 (20-388)||(21204898-21205268)
chr5 (7-388)||(21650668-21651050)
chr5 (7-431)||(16105573-16105999)
chr5 (228-430)||(11583982-11584188)
chr5 (228-409)||(1168317-1168500)
chr5 (228-384)||(28261498-28261655)
chr5 (85-221)||(22662653-22662789)
chr5 (11-249)||(25004929-25005165)
chr5 (202-377)||(21397073-21397253)
chr5 (202-384)||(24475560-24475738)
chr5 (228-384)||(11337299-11337455)
chr5 (202-384)||(21646826-21647009)
chr5 (228-384)||(4865239-4865397)
chr5 (228-400)||(20712036-20712210)
chr5 (137-431)||(108862-109158)
chr5 (228-353)||(21906729-21906851)
chr5 (228-356)||(24183245-24183370)
chr5 (228-395)||(19405503-19405672)
chr5 (99-249)||(7529014-7529164)
chr5 (235-403)||(7728378-7728547)
chr5 (262-384)||(23466434-23466557)
chr5 (137-246)||(17909622-17909731)
chr5 (235-404)||(3673818-3673989)
chr5 (254-403)||(21616974-21617124)
chr5 (144-249)||(9730419-9730524)
chr5 (241-404)||(23493875-23494040)
chr5 (320-395)||(16595474-16595550)
chr5 (225-387)||(19862183-19862347)
chr5 (320-403)||(32966352-32966436)
chr5 (392-430)||(24225596-24225634)
chr5 (292-404)||(6456580-6456694)
chr5 (292-403)||(37983325-37983434)
chr5 (7-39)||(7425631-7425663)
chr5 (7-39)||(20623286-20623318)
chr5 (7-39)||(21233442-21233474)
chr5 (7-39)||(23507270-23507302)
chr5 (7-39)||(25900320-25900352)
chr5 (292-395)||(29917931-29918035)
chr5 (7-39)||(35791015-35791047)
chr5 (7-39)||(37053061-37053093)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (1-409)||(126366-126776)
chr7 (1-388)||(111163-111550)
chr7 (1-400)||(32493940-32494341)
chr7 (7-379)||(42056188-42056563)
chr7 (7-388)||(2028893-2029276)
chr7 (7-379)||(3049565-3049937)
chr7 (7-379)||(2190085-2190460)
chr7 (1-396)||(1936911-1937290)
chr7 (11-146)||(15516765-15516901)
chr7 (228-431)||(7284173-7284376)
chr7 (232-384)||(39046740-39046893)
chr7 (55-246)||(39291457-39291648)
chr7 (228-388)||(11287390-11287551)
chr7 (9-249)||(13352065-13352306)
chr7 (228-384)||(35094794-35094950)
chr7 (228-384)||(12758965-12759121)
chr7 (228-384)||(15822544-15822701)
chr7 (202-384)||(47289758-47289942)
chr7 (228-388)||(3894998-3895159)
chr7 (228-395)||(16570118-16570287)
chr7 (228-395)||(16595375-16595544)
chr7 (228-379)||(26070377-26070529)
chr7 (228-379)||(26094164-26094316)
chr7 (202-384)||(44865204-44865391)
chr7 (228-388)||(12248233-12248395)
chr7 (254-384)||(45452305-45452435)
chr7 (228-395)||(13274753-13274922)
chr7 (228-395)||(49047786-49047955)
chr7 (202-384)||(143622-143800)
chr7 (278-431)||(14272049-14272203)
chr7 (86-206)||(15977820-15977940)
chr7 (228-400)||(12369953-12370127)
chr7 (278-396)||(17224101-17224220)
chr7 (254-403)||(16915067-16915217)
chr7 (254-403)||(48356602-48356752)
chr7 (144-249)||(371203-371308)
chr7 (254-404)||(13377485-13377637)
chr7 (62-202)||(18151259-18151399)
chr7 (137-202)||(8563369-8563434)
chr7 (112-186)||(17984753-17984827)
chr7 (1-38)||(7283950-7283987)
chr7 (292-404)||(4484683-4484797)
chr7 (140-186)||(15575874-15575920)
chr7 (325-404)||(4446168-4446249)
chr7 (325-404)||(14935319-14935400)
chr7 (325-404)||(15362912-15362993)
chr7 (7-44)||(25124445-25124482)
chr7 (7-39)||(7293333-7293365)
chr7 (7-39)||(11516544-11516576)
chr7 (1-41)||(13377849-13377889)
chr7 (7-39)||(13758677-13758709)
chr7 (228-339)||(13863042-13863154)
chr7 (7-39)||(14113903-14113935)
chr7 (7-39)||(15441478-15441510)
chr7 (7-39)||(15862226-15862258)
chr7 (7-39)||(15927875-15927907)
chr7 (7-39)||(16212071-16212103)
chr7 (7-39)||(18979938-18979970)
chr7 (7-39)||(30262043-30262075)
chr7 (320-403)||(34241393-34241477)
chr7 (7-39)||(36052971-36053003)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (7-409)||(14951713-14952117)
chr4 (1-396)||(25119101-25119498)
chr4 (1-396)||(5682422-5682817)
chr4 (7-379)||(15272211-15272586)
chr4 (3-238)||(19559483-19559719)
chr4 (228-384)||(53704846-53705003)
chr4 (202-396)||(34395222-34395418)
chr4 (228-384)||(44055892-44056049)
chr4 (232-409)||(55376714-55376893)
chr4 (228-384)||(16732146-16732303)
chr4 (202-384)||(23270020-23270204)
chr4 (7-109)||(15135907-15136010)
chr4 (228-372)||(44346816-44346961)
chr4 (228-384)||(30457880-30458037)
chr4 (228-384)||(53907812-53907966)
chr4 (228-369)||(21959576-21959718)
chr4 (228-378)||(820029-820177)
chr4 (55-249)||(49071800-49071994)
chr4 (137-431)||(16522748-16523044)
chr4 (84-249)||(34177617-34177781)
chr4 (228-340)||(8872584-8872699)
chr4 (137-431)||(9295624-9295920)
chr4 (228-379)||(12837313-12837464)
chr4 (228-379)||(30232609-30232761)
chr4 (99-249)||(14500208-14500358)
chr4 (254-388)||(18494467-18494602)
chr4 (228-379)||(13809622-13809775)
chr4 (228-356)||(45458968-45459096)
chr4 (255-395)||(27960938-27961078)
chr4 (137-249)||(14996241-14996353)
chr4 (320-403)||(37957230-37957314)
chr4 (254-431)||(7185983-7186159)
chr4 (133-198)||(21417471-21417536)
chr4 (99-220)||(32460699-32460820)
chr4 (137-249)||(8045058-8045170)
chr4 (294-403)||(7964890-7965000)
chr4 (225-404)||(15044784-15044966)
chr4 (235-356)||(52265628-52265749)
chr4 (137-249)||(9795330-9795442)
chr4 (132-192)||(12133626-12133686)
chr4 (320-403)||(19821981-19822065)
chr4 (320-396)||(14901197-14901274)
chr4 (225-396)||(41166055-41166228)
chr4 (320-396)||(47535251-47535328)
chr4 (254-404)||(15109488-15109640)
chr4 (224-302)||(10104374-10104452)
chr4 (143-249)||(19697408-19697514)
chr4 (143-249)||(19707993-19708099)
chr4 (292-404)||(41256546-41256660)
chr4 (1-39)||(54118162-54118200)
chr4 (6-39)||(14996445-14996478)
chr4 (255-403)||(18276392-18276541)
chr4 (7-39)||(7131982-7132014)
chr4 (7-39)||(13246737-13246769)
chr4 (7-39)||(15287162-15287194)
chr4 (7-39)||(15294271-15294303)
chr4 (224-304)||(15675213-15675293)
chr4 (7-39)||(16327840-16327872)
chr4 (7-39)||(16609013-16609045)
chr4 (7-39)||(17145574-17145606)
chr4 (7-39)||(20001030-20001062)
chr4 (7-39)||(26680517-26680549)
chr4 (224-304)||(31115688-31115768)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-379)||(79846-80225)
scaffold0034 (228-356)||(46171-46299)
scaffold0034 (228-356)||(40664-40792)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-396)||(31174-31570)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-396)||(41274-41670)
scaffold0078 (7-39)||(36980-37012)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-396)||(5977-6373)
scaffold0686 (1-153)||(5771-5923)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (1-396)||(22274688-22275083)
chr2 (1-396)||(22283921-22284316)
chr2 (7-388)||(9652796-9653179)
chr2 (7-376)||(21273949-21274319)
chr2 (8-431)||(25212977-25213403)
chr2 (1-249)||(15633327-15633575)
chr2 (202-384)||(23836791-23836975)
chr2 (228-384)||(32465835-32465992)
chr2 (7-272)||(7321607-7321872)
chr2 (202-400)||(25876006-25876206)
chr2 (278-431)||(19433495-19433649)
chr2 (228-384)||(28974026-28974183)
chr2 (228-384)||(271148-271304)
chr2 (228-384)||(4448246-4448402)
chr2 (228-396)||(25601989-25602158)
chr2 (202-384)||(6879414-6879597)
chr2 (228-400)||(36890798-36890972)
chr2 (137-431)||(24826748-24827044)
chr2 (268-384)||(27261783-27261900)
chr2 (228-395)||(22579974-22580140)
chr2 (277-403)||(3403-3529)
chr2 (85-202)||(20279571-20279688)
chr2 (228-395)||(24571404-24571572)
chr2 (99-249)||(28031230-28031380)
chr2 (99-249)||(33128158-33128308)
chr2 (225-431)||(43645824-43646031)
chr2 (320-403)||(722353-722437)
chr2 (144-249)||(17204445-17204550)
chr2 (235-400)||(67952-68119)
chr2 (363-404)||(24884643-24884684)
chr2 (320-390)||(25305416-25305487)
chr2 (1-39)||(19794623-19794661)
chr2 (1-39)||(20627232-20627270)
chr2 (3-44)||(19666843-19666884)
chr2 (6-39)||(19689314-19689347)
chr2 (277-400)||(23821767-23821892)
chr2 (277-400)||(23830846-23830971)
chr2 (137-214)||(25595168-25595245)
chr2 (7-39)||(463043-463075)
chr2 (7-39)||(3798520-3798552)
chr2 (7-39)||(8944153-8944185)
chr2 (7-39)||(12635785-12635817)
chr2 (7-39)||(12641559-12641591)
chr2 (7-39)||(12728699-12728731)
chr2 (7-39)||(14906354-14906386)
chr2 (7-39)||(16935900-16935932)
chr2 (7-39)||(17006560-17006592)
chr2 (7-39)||(22863235-22863267)
chr2 (7-39)||(23820388-23820420)
chr2 (224-304)||(24341513-24341593)
chr2 (7-39)||(36982364-36982396)
chr2 (7-39)||(42177886-42177918)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (8-409)||(15861327-15861728)
chr1 (1-388)||(21859984-21860372)
chr1 (1-391)||(44034865-44035255)
chr1 (84-409)||(22366970-22367296)
chr1 (228-384)||(49967628-49967784)
chr1 (228-384)||(35522432-35522588)
chr1 (228-384)||(41212046-41212206)
chr1 (202-379)||(22403196-22403375)
chr1 (228-384)||(21718206-21718362)
chr1 (1-100)||(41218667-41218766)
chr1 (228-400)||(35054716-35054890)
chr1 (228-388)||(27329868-27330026)
chr1 (256-395)||(51627805-51627945)
chr1 (320-403)||(27674755-27674838)
chr1 (320-402)||(22829629-22829712)
chr1 (254-356)||(9784239-9784341)
chr1 (254-403)||(17608886-17609036)
chr1 (320-403)||(19603055-19603139)
chr1 (323-403)||(38033882-38033962)
chr1 (137-246)||(20254430-20254539)
chr1 (144-249)||(21650076-21650181)
chr1 (292-396)||(20177140-20177245)
chr1 (1-39)||(41394527-41394565)
chr1 (228-302)||(9784177-9784248)
chr1 (320-403)||(20955644-20955728)
chr1 (292-395)||(21194980-21195084)
chr1 (225-403)||(37233969-37234149)
chr1 (137-213)||(40436291-40436367)
chr1 (278-396)||(13377003-13377122)
chr1 (6-39)||(45051726-45051759)
chr1 (1-37)||(27675120-27675156)
chr1 (7-39)||(37844374-37844406)
chr1 (325-396)||(41229149-41229221)
chr1 (7-39)||(46523695-46523727)
[»] scaffold0016 (5 HSPs)
scaffold0016 (1-396)||(162072-162469)
scaffold0016 (1-396)||(166158-166547)
scaffold0016 (228-372)||(164204-164349)
scaffold0016 (292-396)||(116690-116795)
scaffold0016 (1-41)||(116445-116485)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-396)||(30056-30455)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (7-388)||(12418-12802)
scaffold0039 (255-388)||(19049-19183)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (7-388)||(878-1261)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (7-388)||(55553-55936)
scaffold0032 (7-110)||(108075-108179)
scaffold0032 (316-403)||(93973-94061)
scaffold0032 (292-379)||(104799-104887)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (7-388)||(17304-17686)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (7-388)||(13285-13669)
scaffold0251 (179-379)||(21432-21634)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-391)||(346-736)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (7-379)||(6443-6816)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (6-388)||(193396-193770)
scaffold0004 (141-379)||(186560-186799)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (7-388)||(9882-10248)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (75-388)||(14921-15236)
scaffold0175 (7-39)||(882-914)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (7-253)||(4346-4593)
scaffold0303 (84-379)||(5-301)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (8-431)||(130486-130911)
scaffold0028 (224-301)||(89578-89655)
scaffold0028 (225-379)||(79521-79677)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (8-148)||(42568-42708)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (228-431)||(75-278)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (137-388)||(9537-9789)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (254-431)||(3230-3407)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (228-431)||(21442-21646)
scaffold0120 (228-431)||(31141-31345)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (228-431)||(24890-25092)
scaffold0158 (228-362)||(25212-25345)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (137-388)||(94948-95204)
scaffold0037 (228-388)||(24841-25002)
[»] scaffold0310 (4 HSPs)
scaffold0310 (228-431)||(227-430)
scaffold0310 (355-431)||(6603-6679)
scaffold0310 (1-38)||(4-41)
scaffold0310 (1-38)||(6298-6335)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (3-249)||(44009-44256)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (202-384)||(32180-32363)
scaffold0091 (202-384)||(41940-42123)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-249)||(1398-1643)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (84-249)||(219-384)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (228-377)||(11821-11970)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (228-384)||(132363-132520)
scaffold0021 (229-388)||(11660-11821)
scaffold0021 (228-348)||(88289-88409)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (228-384)||(70735-70892)
scaffold0001 (235-384)||(60784-60933)
scaffold0001 (137-249)||(164995-165107)
scaffold0001 (7-39)||(172210-172242)
scaffold0001 (7-39)||(177913-177945)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (202-384)||(5333-5516)
scaffold0480 (228-388)||(8994-9156)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (228-384)||(22668-22825)
scaffold0008 (7-39)||(128095-128127)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (202-384)||(6932-7118)
scaffold0673 (228-384)||(935-1092)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (202-384)||(254900-255084)
scaffold0011 (202-384)||(261506-261690)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (202-384)||(14854-15034)
scaffold0083 (291-384)||(14194-14288)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (228-377)||(7556-7703)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (235-388)||(109582-109736)
scaffold0035 (228-388)||(118076-118237)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (228-384)||(689-846)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (228-372)||(38287-38432)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (228-372)||(85321-85466)
scaffold0014 (224-388)||(159275-159438)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (228-396)||(253102-253271)
scaffold0012 (7-39)||(247366-247398)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (228-395)||(9903-10071)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (228-400)||(15584-15761)
scaffold0077 (6-39)||(36836-36869)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (228-388)||(8960-9121)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (228-384)||(631-788)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (3-247)||(3732-3981)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (228-378)||(1300-1451)
scaffold0359 (202-384)||(11740-11921)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (228-384)||(112658-112812)
scaffold0022 (254-395)||(109556-109698)
scaffold0022 (316-403)||(103123-103211)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (325-431)||(28466-28573)
scaffold0150 (381-431)||(21637-21687)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (228-400)||(146561-146735)
scaffold0025 (7-39)||(146906-146938)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (112-249)||(5996-6133)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (228-379)||(3-155)
scaffold0160 (292-388)||(3492-3589)
[»] scaffold1164 (2 HSPs)
scaffold1164 (228-409)||(1332-1515)
scaffold1164 (1-38)||(1701-1738)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (228-396)||(4906-5075)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (228-384)||(11681-11837)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (223-384)||(48124-48286)
scaffold0068 (223-384)||(61572-61734)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (99-249)||(17812-17962)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (228-395)||(33840-34008)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (224-356)||(33668-33800)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (99-246)||(5338-5485)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (290-388)||(24372-24471)
scaffold0122 (1-38)||(19844-19881)
scaffold0122 (1-38)||(24148-24185)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (257-395)||(31010-31149)
scaffold0031 (228-299)||(70676-70748)
scaffold0031 (320-403)||(97403-97487)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (107-249)||(5580-5722)
scaffold0335 (349-400)||(5823-5875)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (277-388)||(1889-2001)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (137-249)||(34442-34554)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (202-296)||(4351-4445)
scaffold0740 (316-384)||(4284-4353)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (228-372)||(3308-3454)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (235-396)||(76967-77129)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (99-249)||(61218-61368)
scaffold0023 (7-39)||(48903-48935)
scaffold0023 (7-39)||(153924-153956)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (137-245)||(11862-11970)
scaffold0162 (7-39)||(26340-26372)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (292-403)||(43975-44087)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (137-249)||(49877-49989)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (278-400)||(270-393)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (318-388)||(7807-7878)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (315-400)||(6622-6708)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (254-403)||(69415-69565)
scaffold0009 (136-201)||(244855-244920)
scaffold0009 (7-39)||(272330-272362)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (225-403)||(2483-2663)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (371-428)||(12990-13048)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (144-249)||(6252-6357)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (320-396)||(35444-35520)
scaffold0013 (149-202)||(7112-7165)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (149-249)||(17355-17455)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (339-396)||(1364-1422)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (225-404)||(2425-2607)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (149-246)||(12637-12734)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (391-431)||(12694-12734)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (137-216)||(902-981)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (318-388)||(22715-22786)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (396-431)||(3392-3427)
scaffold0090 (62-192)||(34404-34535)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (62-192)||(19881-20012)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (7-41)||(5990-6024)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (7-41)||(57392-57426)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-38)||(94-131)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (140-189)||(10992-11041)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-38)||(20493-20530)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (292-404)||(107967-108080)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (7-39)||(1431-1463)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (7-39)||(1492-1524)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (7-39)||(9183-9215)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (7-39)||(2700-2732)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (7-39)||(12418-12450)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (7-39)||(1430-1462)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (7-39)||(22857-22889)
scaffold0141 (7-39)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (7-39)||(1496-1528)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 375; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 7854343 - 7853913
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7854343 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcat 7854244  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854243 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 7854144  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7854143 atgtatgaaaatggataattggtaaattatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 7854044  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 400  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7854043 tgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtttgcatgaatcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggt 7853944  T
Q  401 tgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7853943 tgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7853913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33341812
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 33342137  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342136 aatctttgaaattcgtgctaatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 33342037  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342036 gaaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 33341937  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataa 406  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33341936 gtcatatggttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataa 33341837  T
Q  407 tgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||    
T  33341836 tgaagaagtttgattttgattatgt 33341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 431
Target Start/End: Original strand, 54685202 - 54685625
Alignment:
Q  8 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 107  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685202 aaggtaagtgggttagtctttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 54685301  T
Q  108 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685302 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 54685401  T
Q  208 aaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttag 307  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685402 aaaatgggtagttggtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttag 54685501  T
Q  308 tcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataat 407  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  54685502 tcatatggttgatgataattcatggcttggatttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgctgttgctggttttgtaaaatgggttgataat 54685601  T
Q  408 gaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  54685602 gaagaagtttgattttgatgatgt 54685625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30152893
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttaattaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 30153198  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153197 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 30153098  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153097 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 30152998  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  30152997 gtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgat 30152898  T
Q  405 aatga 409  Q
     ||||    
T  30152897 tatga 30152893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 17955878 - 17956274
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17955878 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataatcgattatgagaataagtgattatcat 17955977  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955978 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtctgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 17956077  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956078 atgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatactcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 17956177  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17956178 tgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 17956274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45581993 - 45581591
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaaggggg-ttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45581993 gataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatca 45581894  T
Q  100 tgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45581893 tgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcat 45581794  T
Q  200 gatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45581793 gatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttg 45581694  T
Q  300 ttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatg 397  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || ||||||    
T  45581693 ttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatg 45581594  T
Q  398 ggt 400  Q
    |||    
T  45581593 ggt 45581591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Original strand, 54038018 - 54038406
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54038018 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcat 54038117  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54038118 gaactcaatgtttgacattcgtgcttatattgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 54038217  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54038218 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgt 54038317  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||| | ||||||    
T  54038318 tgtttagtcatatagttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttaagaaataaattgttgttgttggttt 54038406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3992911 - 3992522
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3992911 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtaattatcat 3992812  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3992811 gaactcaacctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaggttcatg 3992712  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3992711 atgtaggaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgt 3992612  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  3992611 tgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 3992522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492346
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 23492629  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23492628 aatctttgaaattcttgcttatgttgtagagatatgtttgaatgtgttaatttgatgttaaatgaattgttgattatgaaattgcaagttcatgatgtat 23492529  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  23492528 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 23492429  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  23492428 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcatagtttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 23492346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771022
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 53771298  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771297 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 53771198  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  53771197 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 53771098  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  53771097 agtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 53771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261463
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcgtaattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16261710  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261709 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 16261610  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  16261609 cgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 16261510  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 352  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16261509 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcat 16261463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 2844552 - 2844172
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2844552 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttgattctttttctcttattctatgcataattgattatgggaataagcgattatcat 2844453  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2844452 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatttttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 2844353  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  2844352 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgt 2844253  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2844252 tgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2844172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38167896
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 38168170  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168169 aatctttgaaattcgtacttatgttgtagaaatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 38168070  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  38168069 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 38167970  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  38167969 gtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 38167896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 28558526 - 28558271
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28558526 taaggtaagagggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttccatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacct 28558427  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558426 aatctttgaaattcgtgcttatgtgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgataaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 28558327  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 262  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558326 gaaaatgggtagtttgtaaatgatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 55513231 - 55513006
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  55513231 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatggaaataagtgattatcat 55513132  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55513131 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaattcgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttaatg 55513032  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaa 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  55513031 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaa 55513006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18970277 - 18970034
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  18970277 taaggtaagggggttagatttcaatcataaccacttagttagtttcttttctctttttctatgcataagtgattatttgaataagtgattattatgaacc 18970178  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18970177 caatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttaagtatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaatttcatgttcatgatgta 18970078  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  18970077 tgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgatgaattatg 18970034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19946962 - 19946629
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||  | | ||||  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  19946962 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataaatttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 19946863  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttg 296  Q
    | ||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | |||||    
T  19946862 taatgtatgaaaatgagtagttgtgaaattatgcttaattgatgatttatgacatg-ttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttg 19946764  T
Q  297 ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19946763 ttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 19946664  T
Q  397 gggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19946663 gggttgataatatagaagtttgattttgatgatgt 19946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15550959 - 15550714
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  |  |||||  || ||||||||| || | ||  ||||||||||||||  |    
T  15550959 gataattaagataagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctctttttatgcataagtgctaatttgaataagtgattattgt 15550860  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15550859 gaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatg 15550760  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaatt 246  Q
    ||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  15550759 atgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 15550714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 228 - 376
Target Start/End: Original strand, 16996172 - 16996321
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16996172 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 16996271  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  16996272 catggcttgagtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagttgt 16996321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 19570801 - 19570957
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19570801 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 19570900  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19570901 catggcttgagtttgcataattcttggttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19570957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 84 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48421855 - 48421690
Alignment:
Q  84 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 183  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  48421855 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcatgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttggtgat 48421756  T
Q  184 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  48421755 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaattggtgaattatg 48421690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Original strand, 50112164 - 50112309
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  50112164 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 50112263  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  50112264 catggcttgagtttgcatgattcatggtttgtttttgagaaatgag 50112309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 22144358 - 22144542
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22144358 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgt 22144457  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||| || ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22144458 tgttaagccatgttgttgatgataatacatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 22144542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 317621 - 317778
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  317621 tatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 317720  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||| ||||| || |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  317721 catggcttgagtttgtataattcttggtttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 317778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 378
Target Start/End: Original strand, 16182032 - 16182209
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16182032 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgccaaattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgtt 16182131  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 378  Q
     ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  16182132 ttttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttg 16182209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Original strand, 12349843 - 12349970
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  12349843 tatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 12349942  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12349943 catggcttggg-ttgcatgattcatgatt 12349970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13817646 - 13817492
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||    
T  13817646 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataatt 13817550  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13817549 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 13817492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35123830 - 35123674
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  35123830 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 35123731  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35123730 catggtttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35123674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 384
Target Start/End: Original strand, 6154419 - 6154600
Alignment:
Q  204 tatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 302  Q
    |||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6154419 tatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattg 6154518  T
Q  303 tttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    || |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6154519 ttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcataattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6154600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 202 - 379
Target Start/End: Original strand, 53898541 - 53898719
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  53898541 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgt 53898640  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    || |  ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  53898641 tgatatgtcatgttgttggtgataattcatggcttgggtttgcaagattcatgatttatgttgagaaatgagatgttgt 53898719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 6146832 - 6147015
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  6146832 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgt 6146931  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6146932 tgttaagtcatgttgttgataataattcatggcttgggttt-catgattcatgattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6147015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14298555 - 14298399
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||    
T  14298555 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataatt 14298456  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14298455 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14298399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14304182 - 14304026
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||    
T  14304182 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataatt 14304083  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14304082 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14304026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 400
Target Start/End: Original strand, 17523002 - 17523176
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgt-ttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||  | | |||||||||||    
T  17523002 tatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataat 17523101  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||    
T  17523102 tcatggcttgggtttgcatgatttatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggt 17523176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14295573 - 14295415
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||||||    
T  14295573 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataat 14295474  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14295473 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14295415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 292 - 431
Target Start/End: Original strand, 47784924 - 47785064
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||||| ||| || |  ||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  47784924 tgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggtgattctg 47785023  T
Q  391 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47785024 taaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 47785064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17100787 - 17100636
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  17100787 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 17100688  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17100687 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17100636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17101472 - 17101321
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  17101472 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 17101373  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17101372 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17101321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 17139643 - 17139474
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||    
T  17139643 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataat 17139544  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  17139543 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgcgaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 17139474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 388
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329235
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11329181 tgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Original strand, 14528124 - 14528286
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| ||||    
T  14528124 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaat 14528223  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14528224 tcatggcttgggtatgaatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 14528286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 431
Target Start/End: Original strand, 9303129 - 9303425
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  9303129 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 9303228  T
Q  237 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||| ||| ||||| |||| ||| || ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||  || | | ||||||    
T  9303229 ttgatgacttatgacatg-ttgctgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgactatgaattatggct 9303327  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||| | |||    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9303328 tgggtgttcatataccatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaacgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 54424146 - 54423986
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | ||| |  |  | |||||| |||    
T  54424146 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattatt 54424047  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  54424046 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttatgagaaataagttgttgttgttggttt 54423986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 287 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 28558282 - 28558188
Alignment:
Q  287 atggttgttg-ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  28558282 atggttgttgattgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgt 28558188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560510
Alignment:
Q  241 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 340  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | |||| |||||| ||||||||||     
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggta 12560461  T
Q  341 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12560462 tgcatgattcatgatttgatgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 12560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Original strand, 19260952 - 19261104
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | | || |  |  ||| |||||    
T  19260952 tatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaatgttaatt 19261051  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  19261052 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttatgaaataagttgttgt 19261104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14301200 - 14301042
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||    
T  14301200 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattat 14301101  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14301100 tcatgtctttggtttgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14301042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Original strand, 12349652 - 12349809
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  | |||||||| |    
T  12349652 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaat 12349751  T
Q  328 catggcttg-----ggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||     |||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  12349752 catggcttggccatggtttgcatgattcataatttgatgatgagaaataagttgttgt 12349809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 262 - 388
Target Start/End: Original strand, 55440996 - 55441123
Alignment:
Q  262 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 360  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| || | ||| || |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  55440996 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgattttttg 55441095  T
Q  361 ttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  55441096 ttgagaaatgagatgttgttggtggttt 55441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 202
Target Start/End: Original strand, 14177017 - 14177105
Alignment:
Q  114 gaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 202  Q
    ||||||||| || |||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14177017 gaaattcgtcctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgttcatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 14177105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 17393735 - 17393590
Alignment:
Q  62 ttctatgcataattgatta--tgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaattt 159  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||   || |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  17393735 ttctatgcataattgcttaattgaga-taagtgattattatgaacttaattgttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgggtatgttaattt 17393637  T
Q  160 gatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    | || ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  17393636 gttgataattgaattattgacgatgaaattgcatgttcatgctgtat 17393590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11402898 - 11402752
Alignment:
Q  54 ttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgt 153  Q
    |||||| |||||||||| || || ||||  ||||||||||||||  |||||  |||  |||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||| |    
T  11402898 ttctctagttctatgcacaagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctcatattatagtgatatgtttgagtatat 11402799  T
Q  154 taatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
     ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  11402798 gaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcatg 11402752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 404
Target Start/End: Original strand, 12488835 - 12489017
Alignment:
Q  225 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  12488835 aattatgctcaaattgatgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 12488934  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  || || ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  12488935 aattcatggcttgggtgttcataattcatgatttaatgatgggaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 12489017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14285225 - 14285075
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  14285225 atgaacccaacccttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 14285126  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |  |||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| |||||||||    
T  14285125 tagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaaatatgcttaattgatgaattatg 14285075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 285
Target Start/End: Original strand, 34439451 - 34439513
Alignment:
Q  223 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatc 285  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34439451 taaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Original strand, 14059325 - 14059478
Alignment:
Q  228 tatgctcaattgg-tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    ||||||||||| | ||||||||||   ||||||| |||||| |||||   |||||| ||||| | |||| |||||| |  || || |  |||||||||||    
T  14059325 tatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgataat 14059424  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14059425 tcatggcttgggtttgcataattcatgatctgttgatgagaaatgagatgttgt 14059478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 8275874 - 8275986
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  8275874 gataagtttgagtatgttaattgaacgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 8275973  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    ||| |||||||||    
T  8275974 ttgatgaattatg 8275986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17204807 - 17204667
Alignment:
Q  255 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 354  Q
    |||||| |||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  17204807 ttgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatga 17204708  T
Q  355 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 394  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17204707 tttgttgatgagaaatgagttgttgttagtggttttgtaaa 17204667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 403
Target Start/End: Original strand, 38811170 - 38811297
Alignment:
Q  277 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttg 375  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| || | ||||||||||||    
T  38811170 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgatcagaaatgagttg 38811269  T
Q  376 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38811270 ttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38811297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1990873 - 1990759
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt-tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtttt 389  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1990873 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtttt 1990774  T
Q  390 gtaaaatgggttgat 404  Q
    |||||||||||||||    
T  1990773 gtaaaatgggttgat 1990759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 202
Target Start/End: Original strand, 12539066 - 12539156
Alignment:
Q  112 ttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 202  Q
    ||||||||||||||  |||  ||| |||||| |||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12539066 ttgaaattcgtgctcttgttttagtgatatggttgagtatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 12539156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 403
Target Start/End: Original strand, 17960520 - 17960602
Alignment:
Q  322 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  17960520 ataattcatgacttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgggaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 17960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Original strand, 16934010 - 16934115
Alignment:
Q  144 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtga 243  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  16934010 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 16934109  T
Q  244 attatg 249  Q
     |||||    
T  16934110 cttatg 16934115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 8268774 - 8268886
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||| ||| |||   |||||||||| ||    
T  8268774 gataagtttgagtatgttaattgaacgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaattggttgttatgaaattatgcttaa 8268873  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    ||| |||||||||    
T  8268874 ttgatgaattatg 8268886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8631912 - 8631801
Alignment:
Q  240 gtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggt 339  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||| ||||| ||||||| |  ||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  8631912 gtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggt 8631813  T
Q  340 ttgcatgattca 351  Q
    ||||||||||||    
T  8631812 ttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 228 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17938708 - 17938582
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| ||||| |||||||||| | ||||||| || ||| || |   ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| || |||    
T  17938708 tatgcttaattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcatt 17938609  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17938608 catggcttgggtttacatgattcatga 17938582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 395
Target Start/End: Original strand, 9590918 - 9591035
Alignment:
Q  279 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 377  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  9590918 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgagaaatgagttgtt 9591017  T
Q  378 gtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    || | |||||||||||||    
T  9591018 gttgttggttttgtaaaa 9591035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12953034 - 12952915
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12953034 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 12952935  T
Q  391 t-aaaatgggttgataatga 409  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  12952934 taaaaatgggttgattatga 12952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16880258 - 16880131
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaa-ttatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | |||| |||||| | ||| || |  | |||||||||    
T  16880258 tatgctcaatttgtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataat 16880159  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga 354  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16880158 tcatggcttgggtgtgcataattcatga 16880131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 183
Target Start/End: Original strand, 37915290 - 37915361
Alignment:
Q  112 ttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 183  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37915290 ttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttgatgat 37915361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 15876176 - 15876034
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  15876176 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttaggtattcataattcatg 15876077  T
Q  354 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  15876076 atttgtggatgagaaatgagttggtgttggtagtttggtaaaa 15876034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 379
Target Start/End: Original strand, 3576615 - 3576703
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  | | |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3576615 tgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgt 3576703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34559969 - 34559857
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||| ||| | || |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34559969 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttg 34559870  T
Q  391 taaaatgggttga 403  Q
    |||||||||||||    
T  34559869 taaaatgggttga 34559857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 217
Target Start/End: Original strand, 38375718 - 38375798
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggta 217  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  38375718 gatatgtttgagtacatgaatttgatgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatttgtgaaaatgggta 38375798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 15857157 - 15857195
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15857157 gataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15857195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 19232127 - 19232089
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19232127 gataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 19232089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Original strand, 11061118 - 11061247
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||||    ||||| ||||| | |||||||| || | ||| ||||  ||| |||| ||    
T  11061118 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttggtgctaagtgatattgttgttgatgat 11061217  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 356  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  11061218 tcatggcttgggtgttcataattcatgatt 11061247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
Target Start/End: Original strand, 13301360 - 13301401
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 44  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13301360 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13301401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
Target Start/End: Original strand, 13312016 - 13312057
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 44  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  13312016 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 13312057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15615137
Alignment:
Q  6 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15615137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17191583 - 17191511
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 394  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17191583 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtt---ggtggttttgtaaa 17191511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 44
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961068
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 44  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 51961068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2050115
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2050115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 8268650 - 8268682
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8268650 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8268682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 8275750 - 8275782
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8275750 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8275782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10913111 - 10913031
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggta 217  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||    
T  10913111 gatatgtttgagtacatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaatgggta 10913031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 11477220 - 11477332
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||| | | || ||||  || |||||| ||| |||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  11477220 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgatttgtggttaataaaataacatgttcataatgcatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 11477319  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    ||| |||||||||    
T  11477320 ttgatgaattatg 11477332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842519
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14842519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 18911332 - 18911300
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18911332 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18911300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260781
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19260781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 35015051 - 35015447
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35015051 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcat 35015150  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015151 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 35015250  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35015251 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 35015350  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35015351 tgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 35015447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18583678 - 18583264
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18583678 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcctgttctatgcatcattgattatgggaataagtgattatcat 18583579  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583578 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 18583479  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  18583478 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttg- 18583380  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 400  Q
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18583379 ---------------ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggt 18583295  T
Q  401 tgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18583294 tgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 18583264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 19983186 - 19983581
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983186 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 19983285  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983286 gaatccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 19983385  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  19983386 atgtatgaaaatgggtagttt-aaaactatgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgt 19983484  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19983485 tgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 19983581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26089718
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 26089992  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26089991 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcataatgta 26089892  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||     
T  26089891 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 26089792  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||| || |  | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  26089791 agtgatgttatggatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataattgttgttgtgaaataagttgttgt 26089718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002777
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgggcataagtgattatcatgaacc 18002494  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002495 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttcatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 18002594  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  18002595 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 18002694  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||| |  |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18002695 agtgacgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcatacttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18002777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23994904
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 23995180  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995179 caatatttggaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 23995080  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  23995079 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 23994980  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23994979 agtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 23994904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742505
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatcctttggttaattctttttctcttgttc-atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 15742218  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg-ttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742219 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgattatgttaatttgatgattaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15742318  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatgg---ttgttgttgttg 302  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  15742319 tgaaaatgggtaatttgtatattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttg 15742418  T
Q  303 tttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    || ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  15742419 ttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgctggttt 15742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991002
Alignment:
Q  8 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgtttaattctttttctcttgattttatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 4991328  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  4991327 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgtt-atttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 4991229  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtt 304  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||    | ||  ||| |  ||||| | ||||||||||| |    
T  4991228 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggtgtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct 4991130  T
Q  305 tagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
     ||  || |  ||||| || | |  |||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4991129 gagatatgttgttgatcatgaattttggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttga 4991030  T
Q  404 taatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4991029 taaagaagaagtttgattttgatgatgt 4991002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 15889601 - 15889871
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||  ||    
T  15889601 taattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaatacgtgattattgtg 15889700  T
Q  102 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15889701 aacccaacctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgatttgttgatgatgaaattgcatgttcatga 15889800  T
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 272  Q
    |||||  ||||||||||||| | ||||||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  15889801 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaactgatgaattatgacat-gttgttgatgaattgtgat 15889871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 22585441 - 22585688
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||    
T  22585441 taattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttg 22585540  T
Q  102 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22585541 aacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 22585640  T
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||    
T  22585641 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatg 22585688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 22590272 - 22590519
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||    
T  22590272 taattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttg 22590371  T
Q  102 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 201  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22590372 aacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 22590471  T
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||    
T  22590472 tgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattgaagaattatg 22590519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 272
Target Start/End: Original strand, 25640456 - 25640720
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||  |  |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  25640456 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttaggtaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaccc 25640555  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25640556 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtag-gatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtag 25640654  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 272  Q
      ||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  25640655 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaattgtgacat-gttgttgttgaattttgat 25640720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 431
Target Start/End: Original strand, 18823417 - 18823712
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   || ||||||| ||    
T  18823417 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaagttatgcttaa 18823516  T
Q  237 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  18823517 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattgcggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggct 18823615  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18823616 tgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatggcttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 18823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Original strand, 15004831 - 15005072
Alignment:
Q  31 cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgt 130  Q
    |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15004831 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagagattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgt 15004930  T
Q  131 ggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattat 230  Q
     |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||    
T  15004931 tgtagtgatatgtttgagtatg-taatttgatgttgattgaattgttgatgaggaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattat 15005029  T
Q  231 gctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgata 273  Q
    | ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  15005030 gttcaattgatgaattatgacat-gttgttgttgaattgtgata 15005072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 431
Target Start/End: Original strand, 18839272 - 18839567
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  18839272 gataagtttgagtatgttaactgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 18839371  T
Q  237 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||| ||| ||||| |||| || ||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  18839372 ttgatgacttatgacatg-ttattgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggct 18839470  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  18839471 tgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgagttgaaaaagaagaagtttgattttgatgatgt 18839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 32898924 - 32898779
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  32898924 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 32898825  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 372  Q
     |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32898824 aatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 32898779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 233 - 384
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744483
Alignment:
Q  233 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 332  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  333 cttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25744431 cttgggtttgcataattcttggtttgttgtagagaaatgagatgttgttggtg 25744483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22441068 - 22440911
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  22441068 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 22440969  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  22440968 catggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 22440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 31628402 - 31628245
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  31628402 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 31628303  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  31628302 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 31628245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 13014822 - 13014979
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||||    
T  13014822 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataatt 13014921  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  13014922 cgtggcttggg-ttgcatgattcttgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 13014979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18777280 - 18777119
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  18777280 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 18777181  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18777180 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18777119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 228 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16086151 - 16086001
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || |||||||||    
T  16086151 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataatt 16086052  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttg 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  16086051 catgacttgggtttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttg 16086001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18432777 - 18432626
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||| |  || || |  ||||||||||||    
T  18432777 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataatt 18432678  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 378  Q
    |||||||||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| |||||    
T  18432677 catggcttgggtttgcatgattaatggtttattgttgaaaaatgagatgttg 18432626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 246
Target Start/End: Original strand, 32276756 - 32276902
Alignment:
Q  100 tgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcat 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||    
T  32276756 tgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcat 32276855  T
Q  200 gatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaatt 246  Q
     ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  32276856 aatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaatt 32276902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398890
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 18398966  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 409  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18398965 tgggtgtgcataattcatgaattgtgataagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgattatga 18398890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 396
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381965
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 18381902  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18381903 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 18381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18570413 - 18570271
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  18570413 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 18570314  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 369  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  18570313 catggcctgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 18570271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 320 - 431
Target Start/End: Original strand, 17083383 - 17083496
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagttt 417  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || | |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17083383 tgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgattagaaatgagttgttgttgttgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagttt 17083482  T
Q  418 gaatttgatgatgt 431  Q
    || |||||||||||    
T  17083483 gattttgatgatgt 17083496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 225 - 403
Target Start/End: Original strand, 22361874 - 22362054
Alignment:
Q  225 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  22361874 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 22361973  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
     ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22361974 gattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaattgagttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 22362054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 19629578 - 19629447
Alignment:
Q  115 aaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgg 214  Q
    |||||||||||  ||| || | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||    
T  19629578 aaattcgtgctcttgttgtggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgg 19629479  T
Q  215 gtagtttctaaattatgctcaattggtgaatt 246  Q
    || |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  19629478 gttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 19629447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16106650 - 16106499
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || |||||||||    
T  16106650 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataatt 16106551  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||| |     ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16106550 catgac-----tttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttgttggtg 16106499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 379
Target Start/End: Original strand, 25367376 - 25367502
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25367376 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattcatg 25367475  T
Q  354 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25367476 aattgttgatgagaaatgagatgttgt 25367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 16300010 - 16300122
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||  ||    
T  16300010 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcctaa 16300109  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    ||| | |||||||    
T  16300110 ttgataaattatg 16300122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 112 - 206
Target Start/End: Original strand, 17374924 - 17375018
Alignment:
Q  112 ttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  17374924 ttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgctaatttgttgataattgaattattgatgatgaaattacatgttcatggtgtat 17375018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 21931429 - 21931364
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 202  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21931429 gatatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgat 21931364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26512385 - 26512260
Alignment:
Q  119 tcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtag 218  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||    ||||||||| ||  |||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||    
T  26512385 tcgtgcttatcttgtagagatatgtttgggtacaagaatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtag 26512286  T
Q  219 tttctaaattatgctcaattggtgaa 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  26512285 tttgtgaattatgctcaattgatgaa 26512260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26517501 - 26517376
Alignment:
Q  119 tcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtag 218  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||  ||    ||||||||| ||  |||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||  ||||||||||    
T  26517501 tcgtgcttatcttgtagagatatgtttgggtacaagaatttgatgatatttgaattgttgttgttgaaattacatgtttatgatatatataaatgggtag 26517402  T
Q  219 tttctaaattatgctcaattggtgaa 244  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||    
T  26517401 tttgtgaattatgctcaattgatgaa 26517376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 388
Target Start/End: Original strand, 28195259 - 28195367
Alignment:
Q  280 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 378  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  28195259 atgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataatt-atgatttattgttgagaaatgagatgttg 28195357  T
Q  379 tcggtggttt 388  Q
    | ||| ||||    
T  28195358 ttggtagttt 28195367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15740269 - 15740211
Alignment:
Q  322 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15740269 ataattcatggtttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgt 15740211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 395
Target Start/End: Original strand, 18629786 - 18629892
Alignment:
Q  290 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  18629786 gttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 18629885  T
Q  389 tgtaaaa 395  Q
    |||||||    
T  18629886 tgtaaaa 18629892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25651345 - 25651197
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  25651345 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 25651246  T
Q  354 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  25651245 attggatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 25651197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25919655 - 25919571
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  25919655 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgaaaaatgagttattgttggtgactttgtaaaatgagttga 25919571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 39
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650053
Alignment:
Q  6 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1650053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19175376 - 19175311
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 202  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  19175376 gatatgtttgagtatataaaattgatgataattgaattgttgttgataaaattgcatgttcatgat 19175311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16136487 - 16136423
Alignment:
Q  138 atatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 202  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  16136487 atatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaatagtttttgatgaaattgcatgttcatgat 16136423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 16232231 - 16232199
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16232231 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16232199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 19610357 - 19610325
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19610357 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 19610325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33324735 - 33324675
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  33324735 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 33324675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 379
Target Start/End: Original strand, 35136217 - 35136277
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  35136217 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 35136277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 64)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 41506709 - 41507091
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41506709 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 41506808  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506809 aatctttgaaatccgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 41506908  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506909 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 41507008  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41507009 gtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 41507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 24716756 - 24717152
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716756 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 24716855  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  24716856 gaacccgatctttgaaattcgtggttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgataatgaaattgcaagttcacg 24716955  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||     
T  24716956 atgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttga 24717055  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24717056 tgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcataatttgttgttgataaatggattgttgttggtggttttgtaaaat 24717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 2 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39115635 - 39115267
Alignment:
Q  2 ataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 101  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39115635 ataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatg 39115536  T
Q  102 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115535 aacccaatctttgacattcgtgcttatgttgtaaagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 39115436  T
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39115435 tgtatgaaaatgggtaatttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 39115336  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  39115335 gtttagtcatatggttgatgataattcatgacttgtgtatgcatgattcataatttattgttgagaaat 39115267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 274804 - 274416
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  274804 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcat 274705  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  274704 gaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 274605  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| |    
T  274604 atgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttat 274505  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  274504 tgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 274416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Original strand, 641045 - 641433
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  641045 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcat 641144  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  641145 gaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 641244  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| |    
T  641245 atgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttat 641344  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  641345 tgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 641433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Original strand, 826851 - 827239
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  826851 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcat 826950  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826951 gaacccaatctttgaaattcgtgcgtatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 827050  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| |    
T  827051 atgtatgaaaatgtgtagtttgtaaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttat 827150  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  827151 tgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 827239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 7 - 352
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385988
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattccttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattattatgaaccc 24385751  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385752 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgataatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 24385851  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||         | | ||||||||| | ||||||||||||| |    
T  24385852 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaat---------tgtaatgatcaatagatgttgttgttgttaa 24385942  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat 352  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24385943 gtgattttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcat 24385988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 400
Target Start/End: Original strand, 16038916 - 16039176
Alignment:
Q  142 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggt 241  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  16038916 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattagt 16039015  T
Q  242 gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||| ||||||||| | |    
T  16039016 gaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatttatggcttggatat 16039115  T
Q  342 gcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  16039116 gcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 16039176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 248
Target Start/End: Original strand, 22321437 - 22321587
Alignment:
Q  98 catgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321437 catgaacccaatctttgaaattcgtgctcaggttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 22321536  T
Q  198 atgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattat 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22321537 atgacgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 22321587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 246
Target Start/End: Original strand, 21259391 - 21259630
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  21259391 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttagttaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaccc 21259490  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21259491 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtat 21259590  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaatt 246  Q
      ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||    
T  21259591 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 21259630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17502521 - 17502274
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 101  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||    
T  17502521 taattgagataagggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatg 17502422  T
Q  102 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17502421 aacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttcatga 17502322  T
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |||||  ||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17502321 tgtatataaaagggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaattatg 17502274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23218208 - 23217990
Alignment:
Q  31 cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgt 130  Q
    |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23218208 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgcttatgt 23218109  T
Q  131 ggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattat 230  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||| | ||||||    
T  23218108 ggtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttaatgatgtatataaatggctagtttgtgaattat 23218009  T
Q  231 gctcaattggtgaattatg 249  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  23218008 gttcaattgatgaattatg 23217990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 19993141 - 19993324
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  19993141 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgtt 19993240  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19993241 gtttagtcatgttgttgatgataattcatggctagggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19993324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 379
Target Start/End: Original strand, 22234890 - 22235068
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22234890 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgtt 22234989  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  22234990 gtttagtcatgttgttgatgataattcatggattgggtttgcataattcttggtttgttgttgaggattgagatgttgt 22235068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41246792 - 41246635
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  41246792 tatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 41246693  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41246692 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 41246635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4234162 - 4233968
Alignment:
Q  55 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgtt 154  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||| ||||||    
T  4234162 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgcagtgatatgtttgagtatgtt 4234063  T
Q  155 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    ||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||    
T  4234062 aatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattattttcaattgatgaattatg 4233968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 20573305 - 20573461
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  20573305 tatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 20573404  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573405 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37611829 - 37611675
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  37611829 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgt 37611730  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 356  Q
    |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37611729 tgttaagtcatgtggttgatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgatt 37611675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 228 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20481739 - 20481565
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||    
T  20481739 tatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaatt 20481640  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20481639 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20481565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 372
Target Start/End: Original strand, 20647938 - 20648087
Alignment:
Q  224 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |    
T  20647938 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgtt 20648037  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20648038 aatccatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20648087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Original strand, 20654018 - 20654163
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||||    
T  20654018 tatgcttaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatt 20654117  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 372  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20654118 cattgcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Original strand, 39446878 - 39447046
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| |||||    
T  39446878 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataat 39446977  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  39446978 tcatggcttgggtatgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 39447046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 384
Target Start/End: Original strand, 20567200 - 20567268
Alignment:
Q  316 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567200 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 384
Target Start/End: Original strand, 20567335 - 20567427
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567335 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 384
Target Start/End: Original strand, 20573528 - 20573620
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573528 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 280 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122513
Alignment:
Q  280 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgtt 377  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgtt 25122520  T
Q  378 gtcggtg 384  Q
    || ||||    
T  25122519 gttggtg 25122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533607
Alignment:
Q  241 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 340  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtg 38533671  T
Q  341 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||    
T  38533670 tgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggagactttgtaaaatgggttga 38533607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Original strand, 18118259 - 18118376
Alignment:
Q  85 aataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 184  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  18118259 aataagtgattattgtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcgtgttatagagatatgtttgcgtatataaatttgatgataattgaattgttgttgatg 18118358  T
Q  185 aaattgcaagttcatgat 202  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18118359 aaattgcatgttcatgat 18118376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21681137 - 21680984
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaa-ttatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||  || |  || || |  |||||||||||    
T  21681137 tatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataat 21681038  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  21681037 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaataagatgttgt 21680984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 239
Target Start/End: Original strand, 21494452 - 21494592
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||  | | ||||  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  21494452 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataattttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 21494551  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattg 239  Q
    | ||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||    
T  21494552 taatgtatgaaaaggggtagttgtgaaattatgcttaattg 21494592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 299 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 29760005 - 29759893
Alignment:
Q  299 gttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaat 396  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||  ||||    
T  29760005 gttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgttgttggtgttttggtgtaaat 29759906  T
Q  397 gggttgataatga 409  Q
    |||||||| ||||    
T  29759905 gggttgattatga 29759893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5854722 - 5854572
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  5854722 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 5854623  T
Q  354 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5854622 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 5854572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22886590 - 22886440
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  |||  | |  ||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  22886590 atgaatccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtaataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 22886491  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||| ||||    
T  22886490 taatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgaactatg 22886440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22147664 - 22147555
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  22147664 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 22147565  T
Q  237 ttggtgaatt 246  Q
    ||| ||||||    
T  22147564 ttgatgaatt 22147555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Original strand, 22736046 - 22736127
Alignment:
Q  323 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22736046 taattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattgttgatgaaaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 22736127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2545167 - 2545061
Alignment:
Q  142 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggt 241  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  ||  ||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |    
T  2545167 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatattcataatgtgtgaaaatgggtagttgtaaaattatgcttaattgat 2545068  T
Q  242 gaattat 248  Q
    |||||||    
T  2545067 gaattat 2545061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837163
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 23837226  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23837225 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtgaaat 23837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18612632 - 18612523
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||    
T  18612632 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaa 18612533  T
Q  237 ttggtgaatt 246  Q
    ||| ||||||    
T  18612532 ttgatgaatt 18612523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18619537 - 18619428
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||    
T  18619537 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatggattgttatgaaattatgcttaa 18619438  T
Q  237 ttggtgaatt 246  Q
    ||| ||||||    
T  18619437 ttgatgaatt 18619428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15969860 - 15969796
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  15969860 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattgtagaggagaaatgagttgttgttggtg 15969796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26011602 - 26011452
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  26011602 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 26011503  T
Q  354 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26011502 atttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 26011452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Original strand, 3431317 - 3431422
Alignment:
Q  144 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtga 243  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||| |||    
T  3431317 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagttgttgtgaaattatgcttaattgatga 3431416  T
Q  244 attatg 249  Q
     |||||    
T  3431417 cttatg 3431422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 288
Target Start/End: Original strand, 20561740 - 20561804
Alignment:
Q  224 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaat 288  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20561740 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 396
Target Start/End: Original strand, 21198362 - 21198434
Alignment:
Q  325 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21198362 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtggtttggtaaaat 21198434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 33528533 - 33528383
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  33528533 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatat-tttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 33528435  T
Q  354 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 404  Q
    ||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  33528434 atttgatgatgagaaatgggttgttgttgttgattttgtaaaatgggttgat 33528383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15933406 - 15933256
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |   | | |||||    
T  15933406 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatcatg 15933307  T
Q  354 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||| |  | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15933306 atttgaagatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 15933256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16002223 - 16002113
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctc-a 235  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||| |||  || |||||| ||||| |    
T  16002223 gatatgtttgagtatatgaatttgatgataatttaattgttgttgatgaaattgtatgttcatgatatgtgaaaatgagtatattgtaaattgtgctcta 16002124  T
Q  236 attggtgaatt 246  Q
    |||| ||||||    
T  16002123 attgttgaatt 16002113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 404
Target Start/End: Original strand, 23226240 - 23226368
Alignment:
Q  279 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgtt 377  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |  |||||||||  |||||    
T  23226240 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgattatgagaaatggattgtt 23226339  T
Q  378 gtcggtggttttgta--aaatgggttgat 404  Q
    || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23226340 gttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23226368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 16404894 - 16404932
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16404894 gataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23149865 - 23149736
Alignment:
Q  278 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| | ||| || |  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  23149865 tcatgttcaatagttgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgatgatgaaaaatgagttgt 23149766  T
Q  377 tgtcggtggttttgta--aaatgggttgat 404  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23149765 tgttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23149736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 396
Target Start/End: Original strand, 24929018 - 24929087
Alignment:
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24929018 tcattgcttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 24929087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 41
Target Start/End: Original strand, 31194217 - 31194251
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 41  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31194217 taaggtaagggggttagttttcatcataatcattt 31194251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 396
Target Start/End: Original strand, 31194488 - 31194606
Alignment:
Q  279 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 377  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  31194488 catgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgcacatgattcatgatttgttggtgaaaaatgagttgtt 31194587  T
Q  378 gtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  31194588 gttggtgactttgtaaaat 31194606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17285309 - 17285232
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17285309 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcaaaat 17285232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 13662182 - 13662214
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13662182 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13662214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 13720845 - 13720877
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13720845 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13720877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 16872968 - 16873000
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16872968 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16873000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 22742833 - 22742717
Alignment:
Q  290 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||| |||||||||| | ||| | || | | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22742833 gttgttgttgttgttgaggaatattgttgttgatgattcgtggcttgggtgttcataaatcttggtttgttgatgagaaataagttgttgttgttggttt 22742734  T
Q  389 tgt-aaaatgggttgat 404  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22742733 tgtaaaaatgggttgat 22742717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 395
Target Start/End: Original strand, 27233244 - 27233348
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | |  |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  27233244 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgataatgagaaataagttgttgttgttggttttg 27233343  T
Q  391 taaaa 395  Q
    |||||    
T  27233344 taaaa 27233348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373424
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43373424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2032165 - 2031783
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2032165 taaggtaagggggttagttttcatcataatcgtttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 2032066  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2032065 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 2031966  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2031965 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 2031866  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  2031865 gtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 2031783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11343039 - 11342635
Alignment:
Q  8 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11343039 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 11342940  T
Q  108 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342939 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 11342840  T
Q  208 aaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgttta 306  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11342839 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgttta 11342740  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || || |||||||||||||    
T  11342739 gtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgtcttggtgaaaatgggttgat 11342640  T
Q  405 aatga 409  Q
     ||||    
T  11342639 tatga 11342635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21205268 - 21204898
Alignment:
Q  20 ttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatt 119  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205268 ttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatt 21205169  T
Q  120 cgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagt 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205168 cgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagt 21205069  T
Q  220 ttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttga 319  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |  || |    
T  21205068 ttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttattta 21204969  T
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21204968 ttctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 21204898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21651050 - 21650668
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21651050 taaggtaagggggttaatatttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctgtgcatagttgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 21650951  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650950 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 21650851  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  21650850 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 21650751  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    || || |  |  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21650750 gtgatgttatgaatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgtggtgaaataagttgttgttgttggttt 21650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105573
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 16105900  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| |||||    
T  16105899 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgta 16105801  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgt 303  Q
    ||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | | ||  ||| |  ||||| | |||||||||||     
T  16105800 tgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgc 16105702  T
Q  304 ttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 402  Q
    | ||  || |  ||||| || | | ||||||| ||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16105701 tgagatatgttgttgattatgaattatggcttaggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttg 16105602  T
Q  403 ataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16105601 ataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16105573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 228 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 11584188 - 11583982
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 324  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11584188 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgata 11584089  T
Q  325 attcatggcttggg-tttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 423  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  11584088 attcatggcttgggttttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttcgtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagtttgttttt 11583989  T
Q  424 gatgatg 430  Q
    |||||||    
T  11583988 gatgatg 11583982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 228 - 409
Target Start/End: Original strand, 1168317 - 1168500
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  1168317 tatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 1168416  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  1168417 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28261655 - 28261498
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  28261655 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataatt 28261556  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28261555 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 28261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 22662653 - 22662789
Alignment:
Q  85 aataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 184  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22662653 aataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatttgaatatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatg 22662752  T
Q  185 aaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagttt 221  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  22662753 aaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagttt 22662789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25005165 - 25004929
Alignment:
Q  11 gtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatc 110  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |  |||||  ||||| |||| |||| || | |   ||||||||||||||  |||||||||||    
T  25005165 gtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtttagt--ttttcaattgttgtatgaataagtgctcaattgaataagtgattattgtgaacccaatc 25005068  T
Q  111 tttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaa 210  Q
    ||||||||||||||| |||| | || ||||||||||| | ||||||||| | | ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25005067 tttgaaattcgtgctcatgttgaagtgatatgtttgagtgtgttaatttaaggataattgaattgttaattatgaaattgcatgttcatgatgtatgtaa 25004968  T
Q  211 atgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  25004967 atgggtagtttgagaattatgctcaattggtgatttatg 25004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21397253 - 21397073
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg---t 297  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   |    
T  21397253 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttat 21397154  T
Q  298 tgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgtt 377  Q
    ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  21397153 tgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgtt 21397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24475738 - 24475560
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  24475738 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaat---tgttgttgtt 24475644  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24475643 gtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 24475560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 11337299 - 11337455
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  11337299 tatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataatt 11337398  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11337399 catggcttgagtttacatgattcatgattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 11337455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 21646826 - 21647009
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21646826 tgtatgaaaatgggtatgtatgaaaatatgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgtt 21646925  T
Q  302 gtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21646926 gtttagtcatgatg-ttgatgataattcatggcttgggtttgtataattattggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 21647009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4865397 - 4865239
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa-t 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||||||| |    
T  4865397 tatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataatt 4865298  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4865297 tcatggcttgggtttgcataattcttgaattgttgttgagagatgaggtgttgttggtg 4865239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20712210 - 20712036
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||    
T  20712210 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaatt 20712111  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20712110 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20712036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 431
Target Start/End: Original strand, 108862 - 109158
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |  || |||||| |||||||||||||| | |||   |||||||||| ||    
T  108862 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaattaacatgttcataatgtatgaaaatggattgttgtgaaattatgcttaa 108961  T
Q  237 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| || | | ||||||    
T  108962 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggct 109060  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  109061 tgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgatagagaagaagtttgattttgatgatgt 109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 21906851 - 21906729
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  21906851 tatgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 21906755  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21906754 catggcttgggtttgcatgattcatg 21906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Original strand, 24183245 - 24183370
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | || |||||||| |  |||||    ||||||||||||    
T  24183245 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtcat---gttgatgataatt 24183341  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 356  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24183342 aatggcttgggtttgcatgattcatgatt 24183370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 19405672 - 19405503
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||  || |  || || |  |||||||||||    
T  19405672 tatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataat 19405573  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  19405572 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 19405503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7529164 - 7529014
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  7529164 atgaacccaacccttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 7529065  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |  |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  7529064 tagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 7529014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728378
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||| || |||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgct 7728448  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  7728447 tgggtgtgcataattcatgaattgttggtgagagatgaggtgttgttggtgactttgaaaaatgggttga 7728378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23466557 - 23466434
Alignment:
Q  262 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgtt 359  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23466557 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 23466459  T
Q  360 gttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||    
T  23466458 gttgaggaatgatatgttgttggtg 23466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17909731 - 17909622
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  17909731 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 17909632  T
Q  237 ttggtgaatt 246  Q
    ||| ||||||    
T  17909631 ttgatgaatt 17909622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673818
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||  |  || |||||||| ||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggct 3673890  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    ||||| | ||| | ||| || ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  3673889 tgggtgttcataaatcacgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 3673818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21617124 - 21616974
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  21617124 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcatg 21617025  T
Q  354 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21617024 atttgatgatgagaagtgagctgttgtggttggttttgtaaaatgggttga 21616974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Original strand, 9730419 - 9730524
Alignment:
Q  144 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtga 243  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  9730419 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 9730518  T
Q  244 attatg 249  Q
     |||||    
T  9730519 cttatg 9730524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493875
Alignment:
Q  241 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 340  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| |||||||||||||||     
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtg 23493941  T
Q  341 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||| ||||||    
T  23493940 ttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgagttgat 23493875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16595550 - 16595474
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  16595550 tgataattcatgacttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 16595474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 19862347 - 19862183
Alignment:
Q  225 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  |||||  |||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  19862347 aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgat 19862248  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtt 387  Q
     ||||||| ||||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19862247 gattcatgacttgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtt 19862183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Original strand, 32966352 - 32966436
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32966352 tgataattcatggcttgagcgtgcataattcataattggttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 32966436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 430
Target Start/End: Original strand, 24225596 - 24225634
Alignment:
Q  392 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24225596 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 24225634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6456694 - 6456580
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | || |||||    
T  6456694 tgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtttttg 6456595  T
Q  391 ta-aaatgggttgat 404  Q
    || ||| ||||||||    
T  6456594 tacaaacgggttgat 6456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 37983434 - 37983325
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | ||| |||| | || ||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  37983434 tgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcaggatttgatgatgaaaaatgagttgttgt---tggttttg 37983338  T
Q  391 taaaatgggttga 403  Q
    |||||||||||||    
T  37983337 taaaatgggttga 37983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 7425663 - 7425631
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7425663 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7425631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23507270
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23507270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 29918035 - 29917931
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  29918035 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgttgagaaataaattattgtcgttggttttg 29917936  T
Q  391 taaaa 395  Q
    |||||    
T  29917935 taaaa 29917931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 35791015 - 35791047
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35791015 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 35791047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 126776 - 126366
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126776 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctattgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 126677  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126676 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgcagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 126577  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126576 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 126477  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg-taaaatgg 398  Q
    ||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |  |||||||    
T  126476 tgtttagtcatactgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggagaaaatgg 126377  T
Q  399 gttgataatga 409  Q
    |||||| ||||    
T  126376 gttgattatga 126366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Original strand, 111163 - 111550
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  111163 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgaaaataagtgattatcat 111262  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  111263 gaacccaatatttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatg 111362  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111363 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 111462  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  111463 tgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcaaatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 111550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 400
Target Start/End: Original strand, 32493940 - 32494341
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32493940 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcat 32494039  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32494040 gaacccaatctttgaaattcgtgtttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 32494139  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32494140 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgt 32494239  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgg 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||    
T  32494240 tgtttagtcatatgattgatgataattcatggcttgtgtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgg 32494339  T
Q  399 gt 400  Q
    ||    
T  32494340 gt 32494341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056563
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 42056287  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056288 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 42056387  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  42056388 tgaaaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 42056487  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||| ||||  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  42056488 agtgatattatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 42056563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2028893
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattttttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 2029177  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2029176 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtac 2029077  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| |    
T  2029076 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaa 2028977  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    || || |  | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  2028976 gtgatgttatggatgctaattcatgacttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 2028893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049565
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 3049838  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049837 aatctttgaaattcgtgtttatattgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattg-ggatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 3049739  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  3049738 gaatatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 3049639  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  3049638 gtgatgttatggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 3049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 2190085 - 2190460
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2190085 taaggtaaggcggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgtacc 2190184  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190185 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 2190284  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||     
T  2190285 tgaaaatggatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgtta 2190384  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2190385 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2190460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 1936911 - 1937290
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1936911 gataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 1937010  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1937011 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttcatgatgaaattgcaagttcatg 1937110  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||     
T  1937111 at-----aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaatt------------atgatcaatggttgttgttga 1937193  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||    
T  1937194 tgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcataattttttgttgagaaatggattattgttggtggttttgtgaaat 1937290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516901
Alignment:
Q  11 gtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaat 15516864  T
Q  110 ctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15516865 ctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttg 15516901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Original strand, 7284173 - 7284376
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||||    
T  7284173 tatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataatt 7284272  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 427  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  7284273 catggcttgagtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgttaaatgggttgataatggagaagtttgattttgacg 7284372  T
Q  428 atgt 431  Q
    ||||    
T  7284373 atgt 7284376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 232 - 384
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046893
Alignment:
Q  232 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 39046839  T
Q  332 gcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39046840 gcttgggtttgcataattcttgatctgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 39046893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 246
Target Start/End: Original strand, 39291457 - 39291648
Alignment:
Q  55 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgtt 154  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  39291457 tctctttttctatgcataagtacttatttgaataagtgattattgtgaacctaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgtt 39291556  T
Q  155 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaatt 246  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39291557 aatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttgatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaatt 39291648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11287551 - 11287390
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  11287551 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 11287452  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11287451 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11287390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13352306 - 13352065
Alignment:
Q  9 aggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 107  Q
    ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||| ||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  13352306 aggtaagggggttagatttcaagcataatcacttaattagtttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaataagtgattattgtgaaccca 13352207  T
Q  108 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 207  Q
    | | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  13352206 acccttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgttaatttgatgatatttgatttgttgatggtgaaattgcatgttcatgatgtata 13352107  T
Q  208 aaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
     ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13352106 taaatgggtagtattttaattatgctcaattgatgaattatg 13352065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35094950 - 35094794
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |    
T  35094950 tatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat-gttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaat 35094852  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35094851 catggcttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 35094794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12759121 - 12758965
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||    
T  12759121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataatt 12759022  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  12759021 catggcttgggtttgcaggatttatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 12758965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 15822544 - 15822701
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||    
T  15822544 tatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcatt 15822643  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15822644 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 15822701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47289942 - 47289758
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| |||||     
T  47289942 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgc 47289843  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||| |||||| |   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  47289842 tgttaagtcatgttgatgatgataattcatggcttgtg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 47289758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3895159 - 3894998
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  3895159 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 3895060  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  3895059 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 3894998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Original strand, 16570118 - 16570287
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||    
T  16570118 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataat 16570217  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16570218 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16570287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16595544 - 16595375
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||    
T  16595544 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataat 16595445  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16595444 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16595375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Original strand, 26070377 - 26070529
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| |||    
T  26070377 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattatt 26070476  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26070477 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26070529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Original strand, 26094164 - 26094316
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| |||    
T  26094164 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattatt 26094263  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26094264 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26094316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44865391 - 44865204
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  44865391 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgt 44865292  T
Q  301 tgttt---agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||    |||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  44865291 tgttgttaagtcatgtagtttatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 44865204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Original strand, 12248233 - 12248395
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||    
T  12248233 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataat 12248332  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12248333 gcatgacttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 12248395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 384
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452435
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatg 45452404  T
Q  354 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45452405 atttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 45452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 13274922 - 13274753
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||    
T  13274922 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgat 13274823  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  13274822 tcatggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 13274753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Original strand, 49047786 - 49047955
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||||||    
T  49047786 tatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataat 49047885  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  49047886 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaacgagatgttgttggtagtttggtaaaa 49047955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 143800 - 143622
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||      |||||||    
T  143800 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa------ttgttgt 143707  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||| |||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  143706 tgttaagtcatgttgttaatgataattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Original strand, 14272049 - 14272203
Alignment:
Q  278 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  14272049 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgattagatgatgagaaatgagttgt 14272148  T
Q  377 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  14272149 tggtggtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagttttattttaatgatgt 14272203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 206
Target Start/End: Original strand, 15977820 - 15977940
Alignment:
Q  86 ataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatga 185  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||   || |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||    
T  15977820 ataagtgattattatgaactaaatgtttgaaattcatgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgttgataattgaattattgatgatga 15977919  T
Q  186 aattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  15977920 aattgcatgttcatggtgtat 15977940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 400
Target Start/End: Original strand, 12369953 - 12370127
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| || |  |  || || |||    
T  12369953 tatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattatt 12370052  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || | |||||| || |||||||||    
T  12370053 catggcttaggtatgcatgattcatgatttgttattgagaaataagttgtagttgttggtttggtgaaaatgggt 12370127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 17224101 - 17224220
Alignment:
Q  278 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17224101 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 17224200  T
Q  377 tgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  17224201 tgttggtggttttgtaaaat 17224220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Original strand, 16915067 - 16915217
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  16915067 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 16915166  T
Q  354 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    | ||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16915167 atttgatgaagagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 16915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 48356752 - 48356602
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  48356752 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 48356653  T
Q  354 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48356652 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 48356602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 371308 - 371203
Alignment:
Q  144 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtga 243  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  371308 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 371209  T
Q  244 attatg 249  Q
     |||||    
T  371208 cttatg 371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 13377637 - 13377485
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  13377637 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 13377538  T
Q  354 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    | ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  13377537 atttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 13377485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Original strand, 18151259 - 18151399
Alignment:
Q  62 ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttga 161  Q
    |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||||  || | |||||||||||||| |||| |||| |||||| ||   ||||||||||||     
T  18151259 ttctatgcataaattcttatttgaataagtgattattgtgaacttaaccgttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgattaggtatgttaatttgt 18151358  T
Q  162 tgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 202  Q
    || ||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  18151359 tgataattgaattgttgatgacgaatttgtatgttcatgat 18151399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 202
Target Start/End: Original strand, 8563369 - 8563434
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 202  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8563369 gatatgtttgagtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgat 8563434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 186
Target Start/End: Original strand, 17984753 - 17984827
Alignment:
Q  112 ttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaa 186  Q
    ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  17984753 ttgaaattcgtgctcttgttttagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgataattgaattgttgatgatgaa 17984827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 7283950 - 7283987
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7283950 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4484797 - 4484683
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||   ||||||||    
T  4484797 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgtgcttggttttg 4484698  T
Q  391 t-aaaatgggttgat 404  Q
    | |||||||||||||    
T  4484697 taaaaatgggttgat 4484683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 186
Target Start/End: Original strand, 15575874 - 15575920
Alignment:
Q  140 atgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaa 186  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15575874 atgtttggatatgttaatttgatgttaattaagttgttgatgatgaa 15575920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 4446249 - 4446168
Alignment:
Q  325 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  4446249 attcatggcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgtgaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 4446168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 14935400 - 14935319
Alignment:
Q  325 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14935400 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 14935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15362993 - 15362912
Alignment:
Q  325 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15362993 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 15362912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124445
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 44  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagt 25124445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 13377889 - 13377849
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 41  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13377889 gataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt 13377849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 13758709 - 13758677
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13758709 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 13758677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 339
Target Start/End: Original strand, 13863042 - 13863154
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||||   |||||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||||  ||| | || ||    
T  13863042 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgttgctaagtgatattgttgttaatgat 13863141  T
Q  327 tcatggcttgggt 339  Q
     ||||||||||||    
T  13863142 gcatggcttgggt 13863154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 15862258 - 15862226
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15862258 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15862226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 15927907 - 15927875
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15927907 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15927875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16212071
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16212071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 18979938 - 18979970
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18979938 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 18979970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Original strand, 34241393 - 34241477
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  34241393 tgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaagggttga 34241477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052971
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36052971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14951713
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 14952018  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952017 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 14951918  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14951917 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttattta 14951818  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || |||||||||||||    
T  14951817 gtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgat 14951718  T
Q  405 aatga 409  Q
     ||||    
T  14951717 tatga 14951713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 25119101 - 25119498
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25119101 gataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcat 25119200  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119201 gaacccaatcttgaaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 25119300  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25119301 atgtatgaaaatggatagtttgtaaattatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 25119400  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25119401 tgtttagtcatattgttgataatgatacatggcttgggtttgcatgattcataattttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25119498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 5682422 - 5682817
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682422 gataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcatttagttaatt-ttttcctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 5682520  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682521 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 5682620  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  5682621 atgtatgaaattgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgt 5682720  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    | |||| ||||||  |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5682721 tttttattcatattgttgatgatgatatatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 5682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272586
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15272310  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272311 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaacgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 15272410  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||     
T  15272411 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgtta 15272510  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15272511 agtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 15272586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19559719 - 19559483
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||    
T  19559719 taattgaggtaagggggttagatttcaagcataatcaattagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatg 19559620  T
Q  102 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 201  Q
     ||||||  |||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19559619 tacccaacttttgaaattcctgctcatgttgtagtgatatgtttgagcatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 19559520  T
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaatt 238  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19559519 tgtatgtaaatgggtagtttgtgaattatgctcaatt 19559483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 53704846 - 53705003
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  53704846 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 53704945  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53704946 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53705003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 202 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 34395418 - 34395222
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  34395418 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 34395319  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    || |  ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  34395318 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 34395222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 44056049 - 44055892
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||    
T  44056049 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataatt 44055950  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44055949 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 44055892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 232 - 409
Target Start/End: Original strand, 55376714 - 55376893
Alignment:
Q  232 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 331  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |  ||||||||||||||||    
T  55376714 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataattcatg 55376813  T
Q  332 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  55376814 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgatgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 55376893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16732303 - 16732146
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  16732303 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 16732204  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16732203 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 16732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 23270020 - 23270204
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  23270020 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgt 23270119  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23270120 tgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 23270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15136010
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 15136006  T
Q  106 caat 109  Q
    ||||    
T  15136007 caat 15136010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44346961 - 44346816
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||    
T  44346961 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataatt 44346862  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 372  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  44346861 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 44346816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30458037 - 30457880
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  30458037 tatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataatt 30457938  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  30457937 catggcttggg-ttgcataattcattattttgttatagagaaatgagatgttgttggtg 30457880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 53907812 - 53907966
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||    
T  53907812 tatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgattagtcatgttgttgatgataatt 53907908  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53907909 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53907966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Original strand, 21959576 - 21959718
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  21959576 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 21959675  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaat 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21959676 catggcttgggcttgcatgattcatagtttgtggttgagaaat 21959718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 228 - 378
Target Start/End: Original strand, 820029 - 820177
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  820029 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 820125  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttg 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||    
T  820126 catggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttg 820177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49071994 - 49071800
Alignment:
Q  55 tctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgtt 154  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||    
T  49071994 tctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgatcattgtgaacccaaccgttgaaattcgtgctcatattgtagtgatatgtttgagtatgtt 49071895  T
Q  155 aatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||  || ||  | || |||||||||||| |||||||||    
T  49071894 aatttgatgttaattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgatatatgtatatgaatacttgatgaaatatgctcaattgatgaattatg 49071800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16523044 - 16522748
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  16523044 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 16522945  T
Q  237 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| || | | ||||||    
T  16522944 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggct 16522846  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16522845 tgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16522748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 84 - 249
Target Start/End: Original strand, 34177617 - 34177781
Alignment:
Q  84 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 183  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  34177617 gaataagtgattattgtgaatccaatcttgaaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaattacatgataattgaattgttgatgat 34177716  T
Q  184 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
     |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  34177717 aaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtag-ttgagaattatgttcaattggtgaattatg 34177781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Original strand, 8872584 - 8872699
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  8872584 tatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgata 8872683  T
Q  325 attcatggcttgggtt 340  Q
    | ||||||||||||||    
T  8872684 actcatggcttgggtt 8872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 9295920 - 9295624
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  9295920 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtaatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 9295821  T
Q  237 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| || | | ||||||    
T  9295820 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggct 9295722  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9295721 tgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttatgtaaaatgagttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9295624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Original strand, 12837313 - 12837464
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  12837313 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 12837412  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  12837413 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg-tgagaaataagttgttgt 12837464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Original strand, 30232609 - 30232761
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  30232609 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 30232708  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  30232709 catggcttgggtatgcattattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 30232761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 14500208 - 14500358
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||  || |||||    
T  14500208 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaatttaatgataaatgaattattggtgatgaaataacatgttca 14500307  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  14500308 taatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 14500358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 388
Target Start/End: Original strand, 18494467 - 18494602
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| || || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18494467 gttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggtatgcatgattcatg 18494566  T
Q  354 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18494567 acttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 18494602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Original strand, 13809622 - 13809775
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | | | || |  |||||||||||    
T  13809622 tatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataat 13809721  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13809722 tcatggcttggatatgcatgattcatgattggttgttgagaaatgagatgttgt 13809775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Original strand, 45458968 - 45459096
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||| ||||||     
T  45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatc 45459067  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45459068 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 45459096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 27961078 - 27960938
Alignment:
Q  255 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 354  Q
    |||||| |||||| | ||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27961078 ttgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt-atga 27960980  T
Q  355 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
     || ||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||    
T  27960979 tttattgttgagaaatgagatattgttggtagtttggtaaaa 27960938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14996353 - 14996241
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  14996353 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaaagaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 14996254  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    ||| |||||||||    
T  14996253 ttgatgaattatg 14996241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Original strand, 37957230 - 37957314
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37957230 tgataattcacggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 37957314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 431
Target Start/End: Original strand, 7185983 - 7186159
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || | |||||    
T  7185983 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatcatg 7186082  T
Q  354 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7186083 atttgatgatgagatatgagttgttgt---tgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7186159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21417536 - 21417471
Alignment:
Q  133 tagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21417536 tagagatatgtttgaatatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaatttcatgttca 21417471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 220
Target Start/End: Original strand, 32460699 - 32460820
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||  | |  |||  ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  32460699 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggttataattttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 32460798  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtt 220  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  32460799 taatgtatgaaaaggggtagtt 32460820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8045170 - 8045058
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| |||   |||||||||| ||    
T  8045170 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 8045071  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    ||| ||| |||||    
T  8045070 ttgatgacttatg 8045058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 403
Target Start/End: Original strand, 7964890 - 7965000
Alignment:
Q  294 ttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta 392  Q
    ||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7964890 ttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgta 7964989  T
Q  393 aaatgggttga 403  Q
    |||||||||||    
T  7964990 aaatgggttga 7965000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 225 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 15044966 - 15044784
Alignment:
Q  225 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  15044966 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 15044867  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
     ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15044866 gattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15044784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 356
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265749
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||   || |||| ||||||||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggct 52265727  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgatt 356  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  52265728 tgggtgttcataattcatgatt 52265749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9795442 - 9795330
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||  || |||||| |||| | |||||| ||||||   |||||||| | ||    
T  9795442 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattcttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtcaaaatgagtagttgtgaaattatgtttaa 9795343  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    |||||||||||||    
T  9795342 ttggtgaattatg 9795330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 192
Target Start/End: Original strand, 12133626 - 12133686
Alignment:
Q  132 gtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 192  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12133626 gtagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttaatgatgaaattgca 12133686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Original strand, 19821981 - 19822065
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||    
T  19821981 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtttttggtgactttgtaaaatgagttga 19822065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 14901274 - 14901197
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14901274 tgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatgagaaatgggttgttgttggtggttttgtaaaat 14901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 396
Target Start/End: Original strand, 41166055 - 41166228
Alignment:
Q  225 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||  | |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| ||||    
T  41166055 aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgat 41166154  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
     | ||||||||||||| | ||| | | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41166155 gaatcatggcttgggtattcataacttatgatttgttgatgagaaatgagttgttgtgggtggttttgtgaaat 41166228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 396
Target Start/End: Original strand, 47535251 - 47535328
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47535251 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttaatgagaaatgagttgttgttgatggttttgtaaaat 47535328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 404
Target Start/End: Original strand, 15109488 - 15109640
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  15109488 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 15109587  T
Q  354 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
    | ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15109588 atttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15109640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 302
Target Start/End: Original strand, 10104374 - 10104452
Alignment:
Q  224 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 302  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  10104374 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttg 10104452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Original strand, 19697408 - 19697514
Alignment:
Q  143 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtg 242  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||  || |||||| |||||||| |||| || |||   |||||||||| ||||| ||    
T  19697408 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttagttatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatg 19697507  T
Q  243 aattatg 249  Q
    |||||||    
T  19697508 aattatg 19697514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Original strand, 19707993 - 19708099
Alignment:
Q  143 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtg 242  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||  | |||||||  || |||||| |||||||| |||| || |||   |||||||||| ||||| ||    
T  19707993 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttagttatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgagttgttatgaaattatgcttaattgatg 19708092  T
Q  243 aattatg 249  Q
    |||||||    
T  19708093 aattatg 19708099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 404
Target Start/End: Original strand, 41256546 - 41256660
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  41256546 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 41256645  T
Q  391 t-aaaatgggttgat 404  Q
    | |||||||||||||    
T  41256646 taaaaatgggttgat 41256660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 54118162 - 54118200
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54118162 gataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 54118200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 14996478 - 14996445
Alignment:
Q  6 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14996478 ttaaggtaagggggttagttattatcataatcat 14996445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18276541 - 18276392
Alignment:
Q  255 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 354  Q
    |||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | |||||||||||   ||| ||||  ||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  18276541 ttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatga 18276442  T
Q  355 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    || |  | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18276441 tttgacgatgagtattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 18276392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 7131982 - 7132014
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7131982 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 7132014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246737
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13246737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 15287162 - 15287194
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15287162 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15287194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 15294271 - 15294303
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15294271 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 15294303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Original strand, 15675213 - 15675293
Alignment:
Q  224 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  15675213 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 15675293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 17145574 - 17145606
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17145574 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17145606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 20001062 - 20001030
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20001062 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 20001030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 31115768 - 31115688
Alignment:
Q  224 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |   ||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  31115768 aaattatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 31115688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 80225 - 79846
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80225 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 80126  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80125 gaacccaatctttgaaatttgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 80026  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  80025 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgt 79926  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  79925 tgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 79846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 46299 - 46171
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||  ||| |||| |||    
T  46299 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgatt 46200  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 356  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  46199 catggcttgggtgttcataattcatgatt 46171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40792 - 40664
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||    
T  40792 tatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 40693  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgatt 356  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  40692 catggcttgggtgttcataattcatgatt 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 31174 - 31570
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31174 gataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 31273  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31274 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 31373  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31374 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 31473  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31474 tgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 31570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41670 - 41274
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41670 gataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 41571  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41570 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 41471  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41470 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 41371  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  41370 tgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 41274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6373
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5977 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 6076  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6077 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgatttgttaatgatgaaattgcaagttcatg 6176  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 6276  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6277 tgtttagtaatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 5771 - 5923
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5771 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 5870  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5871 gaacccaatctttgaaattcgtgcttctgttgtagagatgtgtttgaatatgt 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22275083 - 22274688
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275083 gataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 22274984  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274983 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 22274884  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22274883 atgtatgaaaatgggttgtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttga 22274784  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22274783 tgtttagtcatattgttgatgatgatagatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 22274688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 22284316 - 22283921
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22284316 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcatatttgattatgagaataagtgattatcat 22284217  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284216 gaactcaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttaatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 22284117  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||     
T  22284116 atgtatgaaaatgaatagttagtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttga 22284017  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    ||||||||| |||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22284016 tgtttagtcttattgttgatgatgatacatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgctgttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaat 22283921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9653179
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttttcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 9652895  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652896 aatctttgaaattcgtggttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 9652995  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |    
T  9652996 gaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaa 9653095  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9653096 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9653179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 7 - 376
Target Start/End: Original strand, 21273949 - 21274319
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21273949 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 21274047  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274048 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 21274147  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  21274148 tgaaaatgggtagtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 21274247  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    ||| || |  | |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21274248 agtgatgttatggatgctaattcatggcttggg-tagcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21274319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25212977
Alignment:
Q  8 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 25213304  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  25213303 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 25213205  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtt 304  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | | ||  ||| |  ||||| | ||||||||||| |    
T  25213204 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgct 25213106  T
Q  305 tagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag--aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 402  Q
     ||  || |  ||||| || | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25213105 gagatatgttgttgataatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttg 25213006  T
Q  403 ataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  25213005 ataaagaagaaatttgattttgatgatgt 25212977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15633575 - 15633327
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15633575 gataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatcacttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattataat 15633476  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||     
T  15633475 gaacccaattcttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcata 15633376  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  15633375 atgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 15633327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 23836791 - 23836975
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23836791 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgt 23836890  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23836891 tgtttagtcattttgttgatgataattcatgacttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 23836975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32465992 - 32465835
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  32465992 tatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 32465893  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32465892 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32465835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7321872 - 7321607
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||  |  |||||| | |||||||||  || ||||  |||||||||| |||  |||||||    
T  7321872 taaggtaagggggttagaattcattataatcacttagttaatttctactctcttttcctatgcatacgtgcttatttgaataagtgactattgtgaaccc 7321773  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||    
T  7321772 aacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattttttatgatgaaatttcatgtttatgatgtat 7321673  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 272  Q
      ||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  7321672 ataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaattgtgacat-gttgttgttgaattttgat 7321607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 202 - 400
Target Start/End: Original strand, 25876006 - 25876206
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||    
T  25876006 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttatt 25876105  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatggg 399  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||    
T  25876106 gtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggcttgttattgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatggg 25876205  T
Q  400 t 400  Q
    |    
T  25876206 t 25876206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Original strand, 19433495 - 19433649
Alignment:
Q  278 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19433495 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 19433594  T
Q  377 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19433595 tgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 19433649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28974183 - 28974026
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  28974183 tatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 28974084  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28974083 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtg 28974026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 271304 - 271148
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  271304 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 271205  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  271204 catagcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaggaatgagatgttgttggtg 271148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 4448246 - 4448402
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  4448246 tatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 4448345  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4448346 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaaaaatgagatgttgttggtg 4448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25602158 - 25601989
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||| |    
T  25602158 tatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaat 25602059  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25602058 catggcttaggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25601989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 6879597 - 6879414
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6879597 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgtt 6879498  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
     ||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||  || |||| | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6879497 atttagtcatgttgttgatgataatacatgtcttgggtttaaataattcttggtttgttgttgagaattgagatgttgttggtg 6879414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 400
Target Start/End: Original strand, 36890798 - 36890972
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |  | |||||| |||    
T  36890798 tatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattatt 36890897  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  36890898 catggcttgggtatgcatgattcttgatttgttgttgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 36890972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 137 - 431
Target Start/End: Original strand, 24826748 - 24827044
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  24826748 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 24826847  T
Q  237 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  |  |  ||||| || | | ||||||    
T  24826848 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatacgttgttgattatgaattatggct 24826946  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    |||||   |||   |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24826947 tgggtgctcatttatcatgattgttgttgagaaaatgagctgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgatattgatgatgt 24827044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 27261900 - 27261783
Alignment:
Q  268 ttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgaga 366  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27261900 ttgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttaaga 27261801  T
Q  367 aatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  27261800 aatgagatgttgttggtg 27261783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Original strand, 22579974 - 22580140
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || || |  || || |  |||||||||||    
T  22579974 tatgctcaattggttgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataat 22580070  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  22580071 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 22580140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 403
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3529
Alignment:
Q  277 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3403 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattgtagatgagaaatgagttgt 3502  T
Q  377 tgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3503 tgttggtgactttgtaaaatgggttga 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20279688 - 20279571
Alignment:
Q  85 aataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 184  Q
    |||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20279688 aataagtgattatggtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcatgttatagagatatgtttgggtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatg 20279589  T
Q  185 aaattgcaagttcatgat 202  Q
    |||||||| |||||||||    
T  20279588 aaattgcatgttcatgat 20279571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Original strand, 24571404 - 24571572
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||| ||| |||||| || || | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||     
T  24571404 tatgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataac 24571503  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  24571504 tcatg-cttggctatgtatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 24571572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 28031230 - 28031380
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||  | | |||| |||| | ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  28031230 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagttttagtatgttaattgattgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 28031329  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    | |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28031330 taatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 28031380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33128308 - 33128158
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  33128308 atgaacccaatctttaattttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 33128209  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  33128208 taatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 33128158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 225 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 43646031 - 43645824
Alignment:
Q  225 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||| | || || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||  |||    
T  43646031 aattatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgat 43645932  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 423  Q
     ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||  || ||  |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  43645931 gattcatgacttgggtgttcataattcatgatttgtgatgtcatttgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttggtaatgaaaaagtttgatttt 43645832  T
Q  424 gatgatgt 431  Q
    ||||||||    
T  43645831 gatgatgt 43645824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 722437 - 722353
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  722437 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttattgatgagatatgagttgttgttggtgactttgtaaaattggttga 722353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17204550 - 17204445
Alignment:
Q  144 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtga 243  Q
    |||| ||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  17204550 ttgagtatgttaattgcatcataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 17204451  T
Q  244 attatg 249  Q
     |||||    
T  17204450 cttatg 17204445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 67952
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggct 68020  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    || || | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  68019 tgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 67952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 24884684 - 24884643
Alignment:
Q  363 gagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 404  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24884684 gagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgat 24884643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25305487 - 25305416
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25305487 tgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtagttttg 25305416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 19794623 - 19794661
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19794623 gataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19794661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 20627232 - 20627270
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20627232 gataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcat 20627270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 19666884 - 19666843
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagt 44  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  19666884 taattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 19666843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 39
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  6 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 400
Target Start/End: Original strand, 23821767 - 23821892
Alignment:
Q  277 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 375  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23821767 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23821866  T
Q  376 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23821867 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23821892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 400
Target Start/End: Original strand, 23830846 - 23830971
Alignment:
Q  277 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 375  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23830846 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23830945  T
Q  376 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23830946 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23830971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25595245 - 25595168
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgg 214  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || | |||||||||    
T  25595245 gatatgtttgagtacatgaatttggtgataaatgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaatgg 25595168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 463043
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 463043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 3798520 - 3798552
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3798520 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 3798552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 8944185 - 8944153
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8944185 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 8944153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 12635785 - 12635817
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12635785 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12635817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 12641559 - 12641591
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12641559 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12641591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 12728731 - 12728699
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12728731 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 12728699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 16935932 - 16935900
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16935932 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 16935900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 17006592 - 17006560
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17006592 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 17006560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863235
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22863235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 304
Target Start/End: Original strand, 24341513 - 24341593
Alignment:
Q  224 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  24341513 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgtt 24341593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982396
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36982396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 42177886 - 42177918
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42177886 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 42177918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 8 - 409
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861728
Alignment:
Q  8 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccca 15861426  T
Q  108 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861427 atctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 15861526  T
Q  208 aaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttag 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15861527 aaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt--ttgtttag 15861624  T
Q  308 tcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgata 405  Q
    ||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || |||||||||||||     
T  15861625 tcatattgttgatgatgatgcatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgatt 15861724  T
Q  406 atga 409  Q
    ||||    
T  15861725 atga 15861728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21860372 - 21859984
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21860372 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcat 21860273  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21860272 gaacccaatctttgaaattcgtacttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttaatgatgaaattgcaagttcatg 21860173  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21860172 atgaatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgt 21860073  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21860072 tgtttagtcatattgttgatgatgatacatggctcgggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatgaattgttgttgttggttt 21859984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 44034865 - 44035255
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034865 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 44034964  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44034965 gaacccaatctttgaaattcttgtttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 44035064  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035065 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 44035164  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 391  Q
    |||||||||||||  |||||||| | | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  44035165 tgtttagtcatatagttgatgatga-taatggcttgagtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 44035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 84 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22367296 - 22366970
Alignment:
Q  84 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367296 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 22367197  T
Q  184 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22367196 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa-tatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 22367098  T
Q  284 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  22367097 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttgg 22366998  T
Q  383 tggttttgt-aaaatgggttgataatga 409  Q
    || ||| || ||||||||||||| ||||    
T  22366997 tgttttggtgaaaatgggttgattatga 22366970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 49967784 - 49967628
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  49967784 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 49967685  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  49967684 cattgcttcggtttgcatgattcatggttgttgttgaggaatgagatgttgttggtg 49967628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522588
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataatt 35522531  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35522532 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35522588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41212206 - 41212046
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt---tgtttagtcatatgtttgatgata 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||    
T  41212206 tatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgata 41212107  T
Q  325 attcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41212106 attcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 41212046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 379
Target Start/End: Original strand, 22403196 - 22403375
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||||||||    
T  22403196 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgt 22403295  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  22403296 tgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttt-catgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgt 22403375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21718362 - 21718206
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  21718362 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 21718263  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21718262 catggcttgggtttgcatgattcatggttgttcttgagaaatgagatgttgttggtg 21718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41218766 - 41218667
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41218766 gataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattctcat 41218667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35054890 - 35054716
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  35054890 tatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 35054791  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35054790 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtggaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 35054716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Original strand, 27329868 - 27330026
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  27329868 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 27329967  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  27329968 catggcttgggtatgcatgattcataat--ttgttgtcaaataagttgttgttgttggttt 27330026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 395
Target Start/End: Original strand, 51627805 - 51627945
Alignment:
Q  256 tgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 354  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51627805 tgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 51627903  T
Q  355 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  51627904 tttgctgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 51627945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27674838 - 27674755
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  27674838 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 27674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 402
Target Start/End: Original strand, 22829629 - 22829712
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22829629 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttg 22829712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 356
Target Start/End: Original strand, 9784239 - 9784341
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9784239 gttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcatg 9784338  T
Q  354 att 356  Q
    |||    
T  9784339 att 9784341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 17609036 - 17608886
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  17609036 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 17608937  T
Q  354 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    | ||| |  |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17608936 atttgattatgagaattgagttgttgttgttggttttggaaaatgggttga 17608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19603139 - 19603055
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  19603139 tgataattcatgacttgggtgtgaataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 19603055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 403
Target Start/End: Original strand, 38033882 - 38033962
Alignment:
Q  323 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38033882 taattcatggcttgggtgtgcatagttcacgattgttgatgagaaataagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38033962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20254539 - 20254430
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   |||||||||| ||    
T  20254539 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagttgttatgaaattatgcttaa 20254440  T
Q  237 ttggtgaatt 246  Q
    ||| ||||||    
T  20254439 ttgatgaatt 20254430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Original strand, 21650076 - 21650181
Alignment:
Q  144 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtga 243  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||    
T  21650076 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 21650175  T
Q  244 attatg 249  Q
     |||||    
T  21650176 cttatg 21650181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20177245 - 20177140
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20177245 tgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttggatattcataattcatgatttgttgaagagaaatgagttgttgttggtggttttg 20177146  T
Q  391 taaaat 396  Q
    | ||||    
T  20177145 tgaaat 20177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 41394565 - 41394527
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41394565 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 41394527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 302
Target Start/End: Original strand, 9784177 - 9784248
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 302  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  9784177 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9784248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Original strand, 20955644 - 20955728
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  20955644 tgataattcatggcttcggtgtgaataattcgtgaattgttggtgtgaaatgagttgttgtgggtgactttgtaaaaggggttga 20955728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 21195084 - 21194980
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  21195084 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 21194985  T
Q  391 taaaa 395  Q
    |||||    
T  21194984 taaaa 21194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 403
Target Start/End: Original strand, 37233969 - 37234149
Alignment:
Q  225 aattatgctc-aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||||| || || ||||||||||   ||||| | |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  37233969 aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 37234068  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
     ||||||| ||||||| | ||| | |||||||| | || ||| || |||||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37234069 gattcatgacttgggtgtccataaatcatgatttgatgatgaaaattgagtttttgtggttggttttgtaaaatgggttga 37234149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 213
Target Start/End: Original strand, 40436291 - 40436367
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatg 213  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||    
T  40436291 gatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatg 40436367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 396
Target Start/End: Original strand, 13377003 - 13377122
Alignment:
Q  278 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| | |||||||||||| || | ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  13377003 tcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgaattgt 13377102  T
Q  377 tgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    ||| || |||||||| ||||    
T  13377103 tgttggcggttttgtgaaat 13377122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051726
Alignment:
Q  6 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 45051726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 27675156 - 27675120
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatc 37  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  27675156 gataattaaggtaagggggttagaatttatcataatc 27675120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844406
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37844406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 396
Target Start/End: Original strand, 41229149 - 41229221
Alignment:
Q  325 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  41229149 attcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaat 41229221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 46523727 - 46523695
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46523727 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 46523695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 5)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 162072 - 162469
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162072 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 162171  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  162172 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatattaaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatg 162271  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg- 299  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  162272 atgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 162371  T
Q  300 ttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  162372 ttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 162469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Original strand, 166158 - 166547
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166158 gataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 166257  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  166258 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatattaaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatg 166357  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166358 atgtatgtaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 166457  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
           | ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  166458 -------taatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaaaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 166547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 164349 - 164204
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||    
T  164349 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaatt 164250  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 372  Q
    |||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  164249 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 164204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 396
Target Start/End: Original strand, 116690 - 116795
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  116690 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggttttg 116789  T
Q  391 taaaat 396  Q
    ||||||    
T  116790 taaaat 116795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 116445 - 116485
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 41  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  116445 gataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcattt 116485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30455 - 30056
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30455 gataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcatttagttaattatttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcat 30356  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30355 gaaccctatctttgaaattcatgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 30256  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaatta---tgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | |   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255 atgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgttgtttgaaattgtatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt 30156  T
Q  298 tgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  30155 tgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 30056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12802
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttcttttgttctatgcataattgattatgggaataagttattatcatgaaccc 12517  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatg--aattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgt 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12518 aatctttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgtgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgt 12617  T
Q  205 atgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtt 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12618 atgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtt 12717  T
Q  305 tagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  12718 tagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 388
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19183
Alignment:
Q  255 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataa 19148  T
Q  355 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  19149 tttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 19183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 878 - 1261
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccc 977  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  978 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagaggtttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 1077  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  1078 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 1177  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    || || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1178 gtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgagaaataagttgttgttgttggttt 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55553
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 55837  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55836 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtag 55737  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  55736 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 55637  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  55636 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 55553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 110
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108179
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 108174  T
Q  106 caatc 110  Q
    |||||    
T  108175 caatc 108179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Original strand, 93973 - 94061
Alignment:
Q  316 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  93973 ttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttgttggtgagaaatgagatgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 94061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 379
Target Start/End: Original strand, 104799 - 104887
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  104799 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgt 104887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17686
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcatttaggtaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataattgattatcatgaaccc 17403  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17404 aatctttgaaattagtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgattttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 17503  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  17504 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaa 17603  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  17604 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatatgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13669
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 13384  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13385 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 13484  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  13485 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 13584  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  13585 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 13669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 179 - 379
Target Start/End: Original strand, 21432 - 21634
Alignment:
Q  179 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgttt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21432 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttt 21531  T
Q  279 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21532 catgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21631  T
Q  377 tgt 379  Q
    |||    
T  21632 tgt 21634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 391
Target Start/End: Original strand, 346 - 736
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346 gataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatctagttaattctttt-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 444  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  445 gaacccaatatttgaaatttgtgcttatgttgtagagatatatttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgtagatgatgaaattgcaagttcatg 544  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  545 atgtatgaaaatgaatagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttga 644  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 391  Q
    | |||| ||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  645 tatttactcatattgttgatgatgatacatggcttgggtttgcatgattaataatttgttgttgagaaatggattattgttggtggttttgt 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 379
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6816
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgataataggtgcttatcatgaaccc 6542  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6543 aatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtcaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 6642  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttta 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| |    
T  6643 gaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaa 6742  T
Q  307 gtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    || || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  6743 gtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 388
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193770
Alignment:
Q  6 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 193495  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193496 caatcattgaaattcgtgc---------agagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 193586  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  193587 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtta 193685  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  193686 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgcgaaataagttgttgttgttggttt 193770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 141 - 379
Target Start/End: Original strand, 186560 - 186799
Alignment:
Q  141 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattgg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  186560 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgg 186659  T
Q  241 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||||||||||     
T  186660 tgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggta 186758  T
Q  341 tgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  186759 tgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 186799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 9882 - 10248
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataa-ttgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataaattgattatgaaaataagtgattatcatgaacc 9981  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9982 caatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 10081  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt 305  Q
    ||||||||||||                 |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  10082 tgaaaatgggta-----------------aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgtta 10164  T
Q  306 agtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  10165 agtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgatggttt 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 15236 - 14921
Alignment:
Q  75 tgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236 tgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtcgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 15137  T
Q  175 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15136 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtttattttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatat 15037  T
Q  275 gtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgag 372  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||    
T  15036 gtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataag 14937  T
Q  373 ttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||||| | ||||||    
T  14936 ttgttgttgttggttt 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 882 - 914
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4593
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacc 105  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacc 4445  T
Q  106 caatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 205  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4446 caatctttgaaattagtgcttatgttgtagagatatgtttaaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgta 4545  T
Q  206 tgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4546 tgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatg 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 84 - 379
Target Start/End: Original strand, 5 - 301
Alignment:
Q  84 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 104  T
Q  184 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatga 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  105 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatga 204  T
Q  284 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    |||||   ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  205 tcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgagtatgcatgattcataatttattgttgtgaaataagttgttgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130486
Alignment:
Q  8 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccc 130812  T
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  130811 aatctttgaaattcgtgctcatgttgtagagatatgtttggatacgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtat 130713  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtt 304  Q
    |||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | | ||  ||| |  ||||| | |||||||||||||    
T  130712 gaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgtt 130614  T
Q  305 tagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
     ||  || |  ||||| || | | ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  130613 gagatatgttgttgattatgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttaa 130514  T
Q  404 taatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  130513 taaagaagaagtttgattttgatgatgt 130486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 301
Target Start/End: Original strand, 89578 - 89655
Alignment:
Q  224 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 79677 - 79521
Alignment:
Q  225 aattatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||    ||||||| |||||| |||| ||   |||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  79677 aattatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgat 79578  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
     ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  79577 gattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 79521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 42708 - 42568
Alignment:
Q  8 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42708 aaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaaccca 42609  T
Q  108 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42608 atctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatggttgaa 42568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 75
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  278 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 179  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  178 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgctgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 79  T
Q  428 atgt 431  Q
    ||||    
T  78 atgt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 137 - 388
Target Start/End: Original strand, 9537 - 9789
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9537 gataagtttgagtatgttaattgattgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagtttatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 9636  T
Q  237 ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttg 336  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |  | |||| ||||||||||||||    
T  9637 ttagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaattcatggcttg 9736  T
Q  337 ggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9737 ggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 254 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3230
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T
Q  354 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3307 attgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21646 - 21442
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| | | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  21646 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 21547  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgat 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21546 catggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgat 21447  T
Q  427 gatgt 431  Q
    |||||    
T  21446 gatgt 21442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31345 - 31141
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  31345 tatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 31246  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgat 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  31245 catggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaaaaagtttgattttgat 31146  T
Q  427 gatgt 431  Q
    |||||    
T  31145 gatgt 31141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25092 - 24890
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||    
T  25092 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataatt 24993  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24992 catggcttgggtt-gcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 24894  T
Q  428 atgt 431  Q
    ||||    
T  24893 atgt 24890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25345 - 25212
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||    
T  25345 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataatt 25246  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgtt 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25245 catggcttggg-ttgcatgattcatgattgttgtt 25212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 137 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 95204 - 94948
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttct----aaattatgc 232  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    |||||||||    
T  95204 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatagatagtttatttgtaaattatgc 95105  T
Q  233 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  95104 tcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatgctaattcatgg 95005  T
Q  333 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
     |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  95004 tttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 94948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Original strand, 24841 - 25002
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  24841 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 24940  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    | |||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24941 cttggcttgggtattcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 228 - 431
Target Start/End: Original strand, 227 - 430
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  227 tatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 326  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  327 catagcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagcttttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatg 426  T
Q  428 atgt 431  Q
    ||||    
T  427 atgt 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 355 - 431
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6679
Alignment:
Q  355 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6603 ttgttgttgagaattgagttgttcttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 6679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 4 - 41
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 6298 - 6335
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6298 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 249
Target Start/End: Original strand, 44009 - 44256
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagttttta-tcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 101  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||  || |||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||    
T  44009 taattgaggtaacggggttagatttcaatcataatcacttagttaatttcttctctcttttgctatgcataagtgattatttgaataagtgattattgtg 44108  T
Q  102 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44109 aacctaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatggtaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatga 44208  T
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |||||| ||||  ||||||| | | |||||||||||||  ||||||||    
T  44209 tgtatgtaaataagtagtttgtgagttatgctcaattgacgaattatg 44256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32363 - 32180
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32363 tgtatgaaaatgggtatgtttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgtt 32264  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32263 gtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 41940 - 42123
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41940 tgtatgaaaatgggtatgtttgaaaatatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgtt 42039  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42040 gtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 42123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 1398 - 1643
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||  | |   ||||  ||||| |||| |||| || |||   |||||| |||||||  |    
T  1398 gataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtagt---tttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgaataaatgattattgt 1494  T
Q  101 gaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1495 gaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatg 1594  T
Q  201 atgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    ||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  1595 atgtatataaatgagtagtttgagaattatgctcaattgatgaattatg 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 384 - 219
Alignment:
Q  84 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 183  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  384 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcttgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgat 285  T
Q  184 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  284 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgtgtagtttgtgaattatgctcaattgttgaattatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Original strand, 11821 - 11970
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  11821 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 11920  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 377  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11921 catggcttgagtttgcatggttcatgattggtgttgagaaatgagatgtt 11970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 132363 - 132520
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  132363 tatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 132462  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  132463 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 132520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11821 - 11660
Alignment:
Q  229 atgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |  |  ||||||||||||    
T  11821 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataatt 11722  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11721 catggcttggttatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 88409 - 88289
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||||    
T  88409 tatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 88310  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgat 348  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  88309 cttggcttgggtatgcatgat 88289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 70735 - 70892
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  70735 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 70834  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  70835 catgacttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 70892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 235 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60784
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgact 60834  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  60833 tgggtttgcatgattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 60784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 164995 - 165107
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||  ||   |||||||||| ||    
T  164995 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttcttatgaaattatgcttaa 165094  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    ||| |||||||||    
T  165095 ttgatgaattatg 165107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 172210
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 172210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177913
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 177913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 5333 - 5516
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||| ||||  | | ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  5333 tgtatgaaaataggtatgtgcgaaaatatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgtt 5432  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    | | |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5433 gctaagtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 5516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Original strand, 8994 - 9156
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||    
T  8994 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataat 9093  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9094 tcatggcttaggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtcggtggttt 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22825 - 22668
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||    
T  22825 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataatt 22726  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22725 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgttgttggtg 22668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128127
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 128127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 6932 - 7118
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgtt 298  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   | |||||||||    
T  6932 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgtt 7031  T
Q  299 gttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7032 gttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 935 - 1092
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  935 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 1034  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1035 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 254900 - 255084
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  254900 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 254999  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    || |  ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  255000 tgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 255084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 261506 - 261690
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  261506 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 261605  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    || |  ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  261606 tgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15034 - 14854
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 301  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   |    
T  15034 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgt---t 14938  T
Q  302 gtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14937 gtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14288 - 14194
Alignment:
Q  291 ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14288 ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7556
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  7703 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 7604  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 377  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||    
T  7603 catggcttgggtttgcatgattc--gttggttgttgagaaatgagatgtt 7556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 388
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109736
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 109681  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  109682 tgggattgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 109736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Original strand, 118076 - 118237
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  118076 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 118175  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  118176 catggcttggggttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 118237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 689 - 846
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  689 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 788  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  789 catggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38432 - 38287
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  38432 tatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 38333  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 372  Q
    |||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38332 cataacttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 38287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 85466 - 85321
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  85466 tatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 85367  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 372  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85366 catggtttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 85321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159275
Alignment:
Q  224 aaattatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||| || |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |   ||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt---tgatga 159342  T
Q  323 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  159341 taatttttggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 159275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 228 - 396
Target Start/End: Original strand, 253102 - 253271
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  253102 tatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataatt 253201  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  253202 caaggcttgggtttgcatgattcatgatttcttgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 253271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247398
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 247398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 10071 - 9903
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||    
T  10071 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattatt 9972  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  9971 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 228 - 400
Target Start/End: Original strand, 15584 - 15761
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||    
T  15584 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgcta 15683  T
Q  325 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  15684 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 39
Target Start/End: Original strand, 36836 - 36869
Alignment:
Q  6 ttaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 36869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 8960
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  9121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 9022  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9021 catggcttgggtttgcttgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 631 - 788
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| |  ||||||||||||    
T  631 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataatt 730  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  731 catggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 3732 - 3981
Alignment:
Q  3 taattaaggtaagggggttagtttttat-cataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatg 101  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||  || |||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||    
T  3732 taattgaggtaaaggggttagatttcaagcataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtg 3831  T
Q  102 aacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatat----gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 197  Q
    || ||||  ||||||||||||||| |||| |||| |||||    |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  3832 aaaccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttc 3931  T
Q  198 atgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaatta 247  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||    
T  3932 atgatatatataaatgggtagtttgtgaattatgttcaattgatgaatta 3981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 228 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1300
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||    
T  1451 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcatt 1352  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1351 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttg 1300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 384
Target Start/End: Original strand, 11740 - 11921
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggta-gtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 300  Q
    |||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||   ||||||||||    
T  11740 tgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa---ttgttgttgt 11836  T
Q  301 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  11837 tgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcataactcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 11921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 112658 - 112812
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||    ||| ||||||||    
T  112658 tatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcat---gttgttgataatt 112754  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  112755 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 109698 - 109556
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  109698 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcacgattcatg 109599  T
Q  354 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  109598 atttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 403
Target Start/End: Original strand, 103123 - 103211
Alignment:
Q  316 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  103123 ttgatgataattcatggtttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 325 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28573 - 28466
Alignment:
Q  325 attcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 423  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28573 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgatttt 28474  T
Q  424 gatgatgt 431  Q
    ||||||||    
T  28473 gatgatgt 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21687 - 21637
Alignment:
Q  381 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21687 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 21637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 228 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 146735 - 146561
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||||    
T  146735 tatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcatgttaatt 146636  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 400  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  146635 catggcttgggtatgcatgattcataatttgtttttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 146561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146906
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 146906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6133 - 5996
Alignment:
Q  112 ttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaa 211  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||    
T  6133 ttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaaattgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatataagtaaa 6034  T
Q  212 tgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||| ||| |||||    
T  6033 tgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgatttatg 5996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 3
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  155 tatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataatt 56  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 379  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  55 catggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggattgttgt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3492
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  3589 tgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggaatgttgttggtggttt 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 228 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1515 - 1332
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||||||||| |||||||||    ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||| |  |||||||||| |    
T  1515 tatgctcaattgttgaattatgttatgtgattgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaat 1416  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  1415 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 1738 - 1701
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1738 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 5075 - 4906
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||    
T  5075 tatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 4976  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4975 catggcttggttgttcataattcatgatttgctgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 384
Target Start/End: Original strand, 11681 - 11837
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 327  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  11681 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 11780  T
Q  328 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11781 catgacttgggtttgcataattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 48286 - 48124
Alignment:
Q  223 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 322  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  |||||||    
T  48286 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 48187  T
Q  323 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  48186 taattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 48124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 223 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 61734 - 61572
Alignment:
Q  223 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 322  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  |||||||    
T  61734 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 61635  T
Q  323 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  61634 taattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 61572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17962 - 17812
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  17962 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 17863  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||    
T  17862 taatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 17812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 228 - 395
Target Start/End: Original strand, 33840 - 34008
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| |||||    
T  33840 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataat 33939  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  33940 tcatggcttgggtatgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 34008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33800 - 33668
Alignment:
Q  224 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  33800 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 33701  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 356  Q
     |||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  33700 gattcatggctagggtgttcataattcatgatt 33668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5485 - 5338
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  5485 atgaacccaatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgattgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 5386  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaatt 246  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  5385 taatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaattgatgaatt 5338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 290 - 388
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24471
Alignment:
Q  290 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  24372 gttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 24471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 19844 - 19881
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19844 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 24148 - 24185
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24148 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31149 - 31010
Alignment:
Q  257 gttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-t 355  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||| || |  || |  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31149 gttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattcatgact 31050  T
Q  356 tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 395  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  31049 tgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 70748 - 70676
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 299  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  70748 tatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 403
Target Start/End: Original strand, 97403 - 97487
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||| | || | |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  97403 tgatgattcatgccttgggttttcataaatcatgatttgatgataagaattgagttgttgttattggttttgtaaaatgggttga 97487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 107 - 249
Target Start/End: Original strand, 5580 - 5722
Alignment:
Q  107 aatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 206  Q
    |||||||||| ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||    
T  5580 aatctttgaatttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtat 5679  T
Q  207 gaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||  |||||||||    
T  5680 gaaaatgggttgttttgaaattatgcttaattaatgaattatg 5722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 349 - 400
Target Start/End: Original strand, 5823 - 5875
Alignment:
Q  349 tcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta-aaatgggt 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5823 tcatgattgttggtgagaaatgagatgttgttggttgttttgtataaatgggt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 2001 - 1889
Alignment:
Q  277 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 375  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |   |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2001 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattcttggcttgagtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatg 1902  T
Q  376 ttgtcggtggttt 388  Q
    ||||  |||||||    
T  1901 ttgttagtggttt 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 34442 - 34554
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  34442 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 34541  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    ||| |||||||||    
T  34542 ttgatgaattatg 34554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4445 - 4351
Alignment:
Q  202 tgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg 296  Q
    ||||||||||||||||  |   ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4445 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4353 - 4284
Alignment:
Q  316 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 384  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4353 ttgatgataattcatggtttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3454 - 3308
Alignment:
Q  228 tatgctcaattggtg-aattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataat 326  Q
    ||||||||||||||  ||||||||   ||||| | |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||| ||||| | ||| || |  | |||| ||||    
T  3454 tatgctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaat 3355  T
Q  327 tcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 372  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3354 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 396
Target Start/End: Original strand, 76967 - 77129
Alignment:
Q  235 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 334  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || |  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||  |||| ||||||||||    
T  76967 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggct 77066  T
Q  335 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  77067 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 77129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Original strand, 61218 - 61368
Alignment:
Q  99 atgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 198  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||  |||  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||    
T  61218 atgaacccaatctttaattttcgtgctcttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttca 61317  T
Q  199 tgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattatg 249  Q
    | |||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||| |||||    
T  61318 taatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatgacttatg 61368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48903
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 48903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 153924 - 153956
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  153924 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 153956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11970 - 11862
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||    
T  11970 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 11871  T
Q  237 ttggtgaat 245  Q
    ||| |||||    
T  11870 ttgatgaat 11862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26372
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 403
Target Start/End: Original strand, 43975 - 44087
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 390  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43975 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 44074  T
Q  391 taaaatgggttga 403  Q
    |||||||||||||    
T  44075 taaaatgggttga 44087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 49877 - 49989
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaa 236  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || ||    
T  49877 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatacttaa 49976  T
Q  237 ttggtgaattatg 249  Q
    ||| |||||||||    
T  49977 ttgatgaattatg 49989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 270
Alignment:
Q  278 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 376  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || | |||| |||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  393 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgccttgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 294  T
Q  377 tgtcggtggttttgtaaaatgggt 400  Q
    ||| |||||||||||||| |||||    
T  293 tgttggtggttttgtaaactgggt 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 318 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 7878 - 7807
Alignment:
Q  318 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7878 gatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 315 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 6708 - 6622
Alignment:
Q  315 tttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 400  Q
    |||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6708 tttgttgatgattcatggcttgggtggtcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggt 6622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 69565 - 69415
Alignment:
Q  254 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 353  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  69565 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 69466  T
Q  354 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  69465 atttgatgatgagaattgaggtgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 69415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Original strand, 244855 - 244920
Alignment:
Q  136 agatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 201  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||    
T  244855 agatatgtttgggtatgttaatttgttgataattgaattatggatgatgaaattgtatgttcatga 244920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272330
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 272330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2663 - 2483
Alignment:
Q  225 aattatgctc-aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||||| || || ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| ||||    
T  2663 aattatgctctaaatgttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 2564  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 403  Q
     |||||||| |||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  2563 gattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttgttggttttctaaaatgggttga 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 371 - 428
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13048
Alignment:
Q  371 agttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatga 428  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12990 agttgttgttgatggttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 144 - 249
Target Start/End: Original strand, 6252 - 6357
Alignment:
Q  144 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtga 243  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   |||||| ||| ||||| |||    
T  6252 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattaagcttaattgatga 6351  T
Q  244 attatg 249  Q
     |||||    
T  6352 cttatg 6357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 35520 - 35444
Alignment:
Q  320 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35520 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaat 35444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 202
Target Start/End: Original strand, 7112 - 7165
Alignment:
Q  149 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 202  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7112 tatgttaacttgttgataattgaattgttgatgatgaatttgcatgttcatgat 7165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Original strand, 17355 - 17455
Alignment:
Q  149 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaattat 248  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| | |   |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  17355 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgctgtgaaattatgcttaattgatgacttat 17454  T
Q  249 g 249  Q
    |    
T  17455 g 17455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1364
Alignment:
Q  339 tttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 396  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1422 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 404
Target Start/End: Original strand, 2425 - 2607
Alignment:
Q  225 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 323  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||  | ||| || |  ||||||||    
T  2425 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgat 2524  T
Q  324 aattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 404  Q
     ||||||||||||||  | ||| |||||||  ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  2525 gattcatggcttgggcgttcataattcatgttttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 246
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12734
Alignment:
Q  149 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttctaaattatgctcaattggtgaatt 246  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||  |||||  || ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  12637 tatgttaacttgttgataattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgttatatataaatgaataattgataaattatgctcaattgatgaatt 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12694
Alignment:
Q  391 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12734 taaaatgggttgatagtgaagaagtttgattttgatgatgt 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 216
Target Start/End: Original strand, 902 - 981
Alignment:
Q  137 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggt 216  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  902 gatatgtttgagtaaatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggt 981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 388
Target Start/End: Original strand, 22715 - 22786
Alignment:
Q  318 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 388  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  22715 gatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 22786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 431
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3427
Alignment:
Q  396 tgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3392 tgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 192
Target Start/End: Original strand, 34404 - 34535
Alignment:
Q  62 ttctatgcataattgattatgaga-ataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttg 160  Q
    |||||||||||| || ||||  || ||||||||||||  |||||  |||  ||||||||||||||   || |||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  34404 ttctatgcataagtgcttatttgagataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgtgaaattg 34503  T
Q  161 atgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 192  Q
    ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  34504 atgataactgaactgttgatgtggaaattgca 34535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 192
Target Start/End: Original strand, 19881 - 20012
Alignment:
Q  62 ttctatgcataattgattatgaga-ataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttg 160  Q
    |||||||||||| || ||||  || ||||||||||||  |||||  |||  |||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||  ||||| || |||    
T  19881 ttctatgcataagtgtttatttgagataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctcatgttttagtgttatgtttgggtatgtgaaattg 19980  T
Q  161 atgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 192  Q
    ||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  19981 atgataattgaattgttgatgtggaaattgca 20012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 41
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6024
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 41  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 6024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 41
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57426
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcattt 41  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattt 57426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 94
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  131 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 189
Target Start/End: Original strand, 10992 - 11041
Alignment:
Q  140 atgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaatt 189  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  10992 atgtttgagtatgtgaatttgatgttgattgagttgttgatgatgaaatt 11041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 20530 - 20493
Alignment:
Q  1 gataattaaggtaagggggttagtttttatcataatca 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20530 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 108080 - 107967
Alignment:
Q  292 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 391  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  108080 tgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattttgatgagaaataagttgttgttgttggtttttt 107981  T
Q  392 -aaaatgggttgat 404  Q
     |||||||||||||    
T  107980 aaaaatgggttgat 107967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 1431 - 1463
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1431 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 1492 - 1524
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1492 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 9183
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2700
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2732 taaggtaagggggttagttattatcataatcat 2700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12418
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1430
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  7 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 39  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University