View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3699_low_5 (Length: 335)

Name: NF3699_low_5
Description: NF3699
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3699_low_5
NF3699_low_5
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (11-335)||(27623760-27624084)
chr6 (19-335)||(27284421-27284737)
chr6 (19-335)||(29555380-29555697)
chr6 (11-335)||(22928934-22929258)
chr6 (11-335)||(8899750-8900075)
chr6 (11-335)||(13518245-13518569)
chr6 (19-335)||(27200008-27200326)
chr6 (19-335)||(26772687-26773004)
chr6 (11-335)||(27356162-27356487)
chr6 (19-335)||(26110469-26110786)
chr6 (19-335)||(27248907-27249226)
chr6 (19-335)||(16755642-16755959)
chr6 (19-335)||(27490955-27491272)
chr6 (11-335)||(33370482-33370807)
chr6 (11-335)||(4763586-4763910)
chr6 (19-335)||(4539817-4540135)
chr6 (19-335)||(28213276-28213594)
chr6 (11-335)||(24869532-24869857)
chr6 (11-335)||(27024967-27025292)
chr6 (11-332)||(28166319-28166641)
chr6 (19-335)||(4531110-4531427)
chr6 (19-335)||(13293004-13293321)
chr6 (19-335)||(27013555-27013872)
chr6 (11-335)||(34458557-34458882)
chr6 (19-335)||(14139453-14139770)
chr6 (19-335)||(26791638-26791955)
chr6 (19-335)||(29507238-29507555)
chr6 (11-335)||(29578837-29579162)
chr6 (11-335)||(27030843-27031170)
chr6 (19-335)||(4778702-4779020)
chr6 (11-335)||(16938075-16938401)
chr6 (11-335)||(27063303-27063629)
chr6 (82-335)||(23851450-23851703)
chr6 (11-335)||(24299806-24300131)
chr6 (11-335)||(26926592-26926915)
chr6 (11-335)||(30552051-30552392)
chr6 (19-335)||(16679961-16680278)
chr6 (11-324)||(15406579-15406894)
chr6 (11-324)||(15418366-15418681)
chr6 (11-335)||(20174371-20174696)
chr6 (11-335)||(22161295-22161620)
chr6 (19-214)||(27208848-27209043)
chr6 (19-214)||(27240185-27240380)
chr6 (174-335)||(4718349-4718511)
chr6 (225-335)||(27184750-27184860)
chr6 (225-335)||(27264380-27264490)
chr6 (19-77)||(26666716-26666774)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (11-335)||(3285-3610)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (11-335)||(21891852-21892177)
chr1 (21-335)||(20334531-20334845)
chr1 (11-335)||(20466606-20466929)
chr1 (11-335)||(3646973-3647298)
chr1 (11-335)||(16202139-16202462)
chr1 (11-335)||(10968492-10968817)
chr1 (11-335)||(10950918-10951243)
chr1 (11-335)||(51644047-51644372)
chr1 (19-335)||(41787422-41787740)
chr1 (19-335)||(28590910-28591227)
chr1 (11-335)||(28155561-28155878)
chr1 (260-317)||(6200107-6200164)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (11-335)||(16618640-16618964)
chr3 (11-335)||(32296417-32296742)
chr3 (11-335)||(4629573-4629898)
chr3 (11-335)||(8217420-8217745)
chr3 (19-335)||(28027079-28027396)
chr3 (11-335)||(21680489-21680814)
chr3 (11-335)||(29142904-29143229)
chr3 (11-335)||(29659115-29659440)
chr3 (11-335)||(4340823-4341149)
chr3 (11-335)||(5472776-5473101)
chr3 (19-335)||(22381735-22382051)
chr3 (11-335)||(28110102-28110428)
chr3 (11-335)||(5727766-5728091)
chr3 (11-335)||(16421972-16422295)
chr3 (11-335)||(18248526-18248851)
chr3 (11-335)||(4422707-4423031)
chr3 (11-335)||(17979098-17979425)
chr3 (11-335)||(5716856-5717181)
chr3 (11-335)||(5764277-5764602)
chr3 (11-335)||(10648859-10649184)
chr3 (11-335)||(17971011-17971336)
chr3 (11-335)||(47029241-47029566)
chr3 (11-335)||(5603462-5603787)
chr3 (11-335)||(10401937-10402262)
chr3 (11-335)||(18230981-18231306)
chr3 (11-335)||(20570993-20571318)
chr3 (19-335)||(22865001-22865318)
chr3 (19-335)||(22880060-22880377)
chr3 (11-335)||(31958604-31958929)
chr3 (11-335)||(6207688-6208014)
chr3 (19-335)||(6536898-6537215)
chr3 (11-335)||(24333961-24334286)
chr3 (11-335)||(28344959-28345284)
chr3 (11-335)||(51787810-51788135)
chr3 (11-335)||(19700275-19700599)
chr3 (19-335)||(8283624-8283941)
chr3 (11-335)||(15735242-15735567)
chr3 (11-335)||(18286501-18286826)
chr3 (11-335)||(18301802-18302127)
chr3 (11-335)||(31030385-31030710)
chr3 (19-335)||(32444942-32445259)
chr3 (19-335)||(5019501-5019818)
chr3 (19-335)||(7079012-7079327)
chr3 (11-335)||(35886552-35886878)
chr3 (19-335)||(4727421-4727738)
chr3 (11-335)||(5590508-5590833)
chr3 (11-335)||(11104509-11104834)
chr3 (19-335)||(48471715-48472032)
chr3 (11-335)||(4689438-4689765)
chr3 (18-335)||(18057048-18057367)
chr3 (19-335)||(4790788-4791106)
chr3 (19-335)||(18336416-18336734)
chr3 (11-335)||(20071823-20072146)
chr3 (11-335)||(5657923-5658249)
chr3 (53-335)||(15886894-15887179)
chr3 (77-335)||(8002348-8002607)
chr3 (260-317)||(20445787-20445844)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (11-335)||(3795370-3795695)
chr5 (11-335)||(22894249-22894573)
chr5 (11-335)||(28953784-28954109)
chr5 (11-335)||(33298365-33298690)
chr5 (11-335)||(33880959-33881283)
chr5 (11-335)||(37746332-37746656)
chr5 (11-335)||(37352648-37352973)
chr5 (19-335)||(15752864-15753180)
chr5 (11-335)||(32590279-32590604)
chr5 (11-335)||(26486228-26486554)
chr5 (19-335)||(37665498-37665815)
chr5 (11-335)||(37760814-37761139)
chr5 (11-335)||(6880135-6880461)
chr5 (11-335)||(9323309-9323635)
chr5 (11-335)||(33522211-33522539)
chr5 (11-335)||(9544713-9545037)
chr5 (19-335)||(11555186-11555503)
chr5 (11-335)||(18494771-18495096)
chr5 (11-335)||(24729802-24730127)
chr5 (11-335)||(30174297-30174622)
chr5 (11-335)||(31820412-31820737)
chr5 (19-335)||(23897707-23898023)
chr5 (11-335)||(13180792-13181118)
chr5 (11-335)||(41680536-41680861)
chr5 (11-335)||(43084090-43084415)
chr5 (11-326)||(33783328-33783644)
chr5 (11-335)||(12138008-12138334)
chr5 (11-335)||(11329469-11329794)
chr5 (19-335)||(13318839-13319156)
chr5 (11-335)||(25206111-25206435)
chr5 (11-335)||(25270267-25270591)
chr5 (11-335)||(28655074-28655399)
chr5 (19-335)||(31437296-31437613)
chr5 (11-335)||(30035259-30035583)
chr5 (19-335)||(13436691-13437010)
chr5 (19-335)||(30157865-30158183)
chr5 (11-335)||(18369536-18369861)
chr5 (19-335)||(23631801-23632118)
chr5 (11-335)||(24975681-24976006)
chr5 (14-335)||(8659479-8659801)
chr5 (19-335)||(34622350-34622668)
chr5 (19-335)||(2516897-2517214)
chr5 (19-335)||(15652770-15653087)
chr5 (19-335)||(22993128-22993445)
chr5 (19-335)||(24608078-24608395)
chr5 (11-335)||(5643634-5643957)
chr5 (19-335)||(18122428-18122745)
chr5 (19-335)||(40467565-40467882)
chr5 (11-335)||(30940468-30940794)
chr5 (261-317)||(34471338-34471394)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (11-335)||(27602973-27603297)
chr8 (11-335)||(28356018-28356344)
chr8 (11-335)||(16260048-16260373)
chr8 (11-335)||(29835148-29835473)
chr8 (11-335)||(31360353-31360678)
chr8 (11-335)||(19202429-19202755)
chr8 (11-335)||(19655408-19655735)
chr8 (19-335)||(12086797-12087115)
chr8 (11-335)||(19693920-19694246)
chr8 (11-335)||(9360447-9360772)
chr8 (19-335)||(22138732-22139049)
chr8 (11-335)||(44566806-44567131)
chr8 (11-335)||(31483938-31484263)
chr8 (19-335)||(33248191-33248508)
chr8 (19-335)||(33264556-33264873)
chr8 (11-335)||(19680273-19680599)
chr8 (11-335)||(2131328-2131653)
chr8 (9-335)||(21342234-21342562)
chr8 (19-335)||(15773399-15773716)
chr8 (11-335)||(19911230-19911555)
chr8 (11-335)||(18715307-18715630)
chr8 (19-335)||(18796531-18796849)
chr8 (17-335)||(22075002-22075320)
chr8 (11-335)||(14568982-14569306)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (11-335)||(5141325-5141650)
chr7 (11-335)||(16047139-16047462)
chr7 (11-335)||(16745511-16745836)
chr7 (11-335)||(26441075-26441400)
chr7 (19-335)||(11446710-11447027)
chr7 (19-335)||(45393040-45393358)
chr7 (11-335)||(16443994-16444318)
chr7 (11-335)||(31558384-31558708)
chr7 (11-335)||(24586524-24586850)
chr7 (15-335)||(26663907-26664228)
chr7 (11-335)||(26313837-26314163)
chr7 (19-335)||(5164206-5164523)
chr7 (11-335)||(16512424-16512749)
chr7 (11-335)||(26518615-26518940)
chr7 (15-335)||(26679099-26679420)
chr7 (11-335)||(4205211-4205537)
chr7 (19-335)||(5153906-5154223)
chr7 (11-335)||(26269079-26269404)
chr7 (11-335)||(39207129-39207454)
chr7 (19-335)||(31084620-31084938)
chr7 (19-335)||(2779074-2779391)
chr7 (19-335)||(3451140-3451457)
chr7 (19-335)||(31129727-31130044)
chr7 (11-335)||(2160393-2160717)
chr7 (11-335)||(4139237-4139562)
chr7 (11-335)||(45737125-45737448)
chr7 (11-335)||(11418769-11419094)
chr7 (11-335)||(26509686-26510012)
chr7 (11-335)||(10910910-10911235)
chr7 (11-288)||(10847452-10847730)
chr7 (77-335)||(26531926-26532185)
chr7 (175-335)||(16732684-16732845)
chr7 (216-335)||(2104357-2104476)
chr7 (11-76)||(26595750-26595815)
chr7 (260-317)||(795898-795955)
chr7 (260-317)||(16284754-16284811)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (11-335)||(1906089-1906413)
chr4 (11-335)||(39856473-39856798)
chr4 (11-335)||(15233653-15233977)
chr4 (11-335)||(54839228-54839552)
chr4 (20-335)||(21975537-21975856)
chr4 (11-335)||(24586465-24586791)
chr4 (19-335)||(6575698-6576015)
chr4 (11-335)||(20332527-20332852)
chr4 (15-335)||(40099745-40100066)
chr4 (19-335)||(14104380-14104696)
chr4 (11-335)||(5011713-5012039)
chr4 (11-335)||(18794721-18795046)
chr4 (11-335)||(30759600-30759925)
chr4 (11-335)||(14753597-14753922)
chr4 (11-335)||(15276736-15277061)
chr4 (11-335)||(33667905-33668230)
chr4 (19-335)||(5700375-5700694)
chr4 (18-335)||(14670852-14671171)
chr4 (11-335)||(17018888-17019214)
chr4 (11-335)||(31120615-31120943)
chr4 (11-335)||(15380342-15380667)
chr4 (11-335)||(27157418-27157746)
chr4 (19-335)||(36338630-36338947)
chr4 (19-335)||(34183074-34183391)
chr4 (19-335)||(24118498-24118816)
chr4 (143-335)||(18311414-18311608)
chr4 (11-155)||(1673877-1674021)
chr4 (19-82)||(36324421-36324484)
chr4 (260-317)||(3361412-3361469)
chr4 (260-317)||(3362109-3362166)
chr4 (260-317)||(3362806-3362863)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (11-335)||(11863-12186)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (11-335)||(1482-1808)
scaffold0322 (11-335)||(11872-12197)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (11-335)||(21697270-21697593)
chr2 (19-335)||(12710703-12711020)
chr2 (11-335)||(12592633-12592958)
chr2 (11-335)||(40239332-40239657)
chr2 (11-335)||(3788317-3788642)
chr2 (11-335)||(11629278-11629603)
chr2 (11-335)||(27809524-27809849)
chr2 (11-335)||(32055626-32055950)
chr2 (11-335)||(21671266-21671592)
chr2 (11-335)||(37679986-37680312)
chr2 (11-335)||(37695251-37695577)
chr2 (11-335)||(16823431-16823759)
chr2 (11-335)||(16897721-16898049)
chr2 (11-335)||(27782055-27782380)
chr2 (19-335)||(34160667-34160984)
chr2 (11-335)||(34867506-34867831)
chr2 (11-335)||(37931195-37931520)
chr2 (11-335)||(13930640-13930965)
chr2 (11-335)||(16167301-16167626)
chr2 (19-335)||(12661362-12661679)
chr2 (11-335)||(22922239-22922564)
chr2 (11-335)||(27122348-27122673)
chr2 (11-335)||(27396146-27396471)
chr2 (11-335)||(27428540-27428865)
chr2 (11-335)||(28888102-28888427)
chr2 (11-335)||(37945960-37946285)
chr2 (19-335)||(34269023-34269339)
chr2 (11-335)||(19410580-19410906)
chr2 (19-335)||(37383500-37383818)
chr2 (19-335)||(34296980-34297296)
chr2 (11-335)||(254746-255071)
chr2 (19-335)||(9344089-9344406)
chr2 (19-335)||(39895891-39896209)
chr2 (19-335)||(19450529-19450846)
chr2 (11-335)||(23122666-23122992)
chr2 (19-335)||(31882110-31882427)
chr2 (11-335)||(20843736-20844061)
chr2 (19-335)||(39045924-39046241)
chr2 (106-335)||(31887682-31887912)
chr2 (174-335)||(27821812-27821974)
chr2 (11-111)||(31868879-31868979)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-335)||(15394-15719)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (19-335)||(9040-9357)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (19-335)||(9753-10069)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (19-335)||(13774-14092)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (19-335)||(202-519)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (11-335)||(9739-10064)
scaffold0143 (11-335)||(33122-33448)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (17-335)||(24941-25259)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (19-335)||(18410-18728)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (11-335)||(5891-6217)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (19-335)||(4716-5037)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (11-335)||(25005-25331)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (17-232)||(26243-26458)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (23-313)||(40759-41068)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (225-335)||(20512-20622)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (258-335)||(11855-11934)
[»] scaffold0242 (1 HSPs)
scaffold0242 (293-335)||(309-351)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 27623760 - 27624084
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623760 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27623859  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27623860 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttctgatggagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 27623959  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623960 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 27624059  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27624060 cttgcctgagttgcgtacaatctca 27624084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 27284421 - 27284737
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284421 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 27284520  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27284521 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatgg 27284620  T
Q  219 tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 318  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27284621 tggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatttttgcctg 27284720  T
Q  319 agttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||    
T  27284721 agttgcgtacaatctca 27284737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29555697 - 29555380
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555697 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 29555598  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||      
T  29555597 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacg 29555498  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555497 gtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 29555398  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29555397 gagttgcgtacaatctca 29555380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 22928934 - 22929258
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928934 aagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 22929033  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22929034 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 22929133  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    ||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22929134 gggaatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 22929233  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  22929234 cttgcctgagttgcatacaatctca 22929258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 8899750 - 8900075
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899750 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 8899849  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  8899850 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 8899949  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899950 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 8900049  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8900050 tcttgcctgagttgcatacaatctca 8900075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 13518245 - 13518569
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518245 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 13518344  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13518345 tacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 13518444  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13518445 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcatt 13518544  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
     |||||||||||||| |||||||||    
T  13518545 tttgcctgagttgcgaacaatctca 13518569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27200326 - 27200008
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27200326 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 27200227  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  27200226 aacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 27200127  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27200126 ggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 27200027  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27200026 tgagttgcgtacaatctca 27200008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 26772687 - 26773004
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772687 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 26772786  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  26772787 acacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 26772886  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772887 gtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 26772986  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  26772987 gagttgtatacaatctca 26773004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 27356162 - 27356487
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356162 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27356261  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  27356262 tacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 27356361  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356362 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 27356461  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27356462 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 27356487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 26110469 - 26110786
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110469 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 26110568  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||      
T  26110569 acacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacg 26110668  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26110669 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcattcttgcct 26110768  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  26110769 gagttgtgtacaatctca 26110786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 27248907 - 27249226
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27248907 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 27249006  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa--gggga 215  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||    
T  27249007 aacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccccaaggggga 27249106  T
Q  216 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 315  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27249107 cggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 27249206  T
Q  316 ctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27249207 ctgagttgcgtacaatctca 27249226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16755959 - 16755642
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755959 gctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 16755860  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  16755859 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 16755760  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755759 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 16755660  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16755659 gagttgcgtacaatctca 16755642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27491272 - 27490955
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491272 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 27491173  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| | || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  27491172 acacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 27491073  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491072 gtggttggccagatatagttacttgccttctgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 27490973  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27490972 gagttgcgtacaatctca 27490955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 33370482 - 33370807
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370482 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 33370581  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  33370582 tacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 33370681  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370682 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcctgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 33370781  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||    
T  33370782 tcttgcctgagttgtgtataatctca 33370807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4763910 - 4763586
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763910 aagcaaaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 4763811  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  4763810 tacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 4763711  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763710 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgtatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 4763611  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4763610 cttgcctgagttgcgtacaatctca 4763586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 4539817 - 4540135
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4539817 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 4539916  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  4539917 aacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggac 4540016  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4540017 ggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 4540116  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4540117 tgagttgcgtacaatctca 4540135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28213594 - 28213276
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28213594 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 28213495  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  28213494 aacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggac 28213395  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28213394 ggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 28213295  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28213294 tgagttgcgtacaatctca 28213276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24869857 - 24869532
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869857 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 24869758  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| |||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24869757 tacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 24869658  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869657 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttccatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 24869558  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  24869557 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 24869532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27025292 - 27024967
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025292 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27025193  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || | ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  27025192 tacattgaacacagtaatcattacatttcctagagactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 27025093  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27025092 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcat 27024993  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27024992 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 27024967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28166641 - 28166319
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166641 aagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 28166542  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  28166541 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 28166442  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  28166441 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggtttttgattcatcgagacgctcat 28166342  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28166341 tcttgcctgagttgcgtacaatc 28166319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4531427 - 4531110
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531427 gctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 4531328  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  4531327 acacagtaatcatgacatttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 4531228  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531227 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgaccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 4531128  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  4531127 gagttgtgtacaatctca 4531110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 13293004 - 13293321
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293004 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 13293103  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    |||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |       
T  13293104 acacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaggcg 13293203  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13293204 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcctttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 13293303  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13293304 gagttgcgtacaatctca 13293321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27013872 - 27013555
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013872 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 27013773  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  27013772 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 27013673  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013672 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 27013573  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27013572 gagttgcgtacaatctca 27013555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 34458557 - 34458882
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458557 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 34458656  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  34458657 tacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 34458756  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  | | || |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458757 gggggacggcggttggccagatatagttacttgcctttcatttcaatctcgtttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 34458856  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  34458857 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 34458882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 14139453 - 14139770
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139453 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 14139552  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  14139553 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 14139652  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139653 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 14139752  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  14139753 gagttgtgtacaatctca 14139770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26791955 - 26791638
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791955 gctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 26791856  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  26791855 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 26791756  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  26791755 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgatccatcgagacgctcattcttgcct 26791656  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  26791655 gagttgcctgcaatctca 26791638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29507555 - 29507238
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507555 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 29507456  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||      
T  29507455 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcatatgccccaagggagacg 29507356  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507355 gtggttggccagatatagttatttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 29507256  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29507255 gagttgcgtacaatctca 29507238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29579162 - 29578837
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579162 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 29579063  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||  ||||   || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  29579062 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatttgcaagtgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaa 29578963  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29578962 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 29578863  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  29578862 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 29578837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27031170 - 27030843
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031170 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27031071  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  27031070 tacattgaatacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 27030971  T
Q  211 ggggatt--gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgg-ctcatcgagacgctc 307  Q
     ||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27030970 cgggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggtctcatcgagacgctc 27030871  T
Q  308 attcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27030870 attcttgcctgagttgtgtacaatctca 27030843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4779020 - 4778702
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4779020 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 4778921  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  4778920 aacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 4778821  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4778820 ggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcc 4778721  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4778720 tgagttgcgtacaatctca 4778702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 16938075 - 16938401
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938075 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16938174  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  ||||||||| |||| ||| || |||| |||| ||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  16938175 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcgcaagtacaaaagcttcagatggagatggccattaacagctgcagatgcccca 16938274  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938275 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttatttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 16938374  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16938375 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 16938401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27063629 - 27063303
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27063629 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtgg 27063530  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  |||| |||||||||||||||| |  | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27063529 tacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaagcataagagctcttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 27063430  T
Q  211 ggggattg-tgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||   | || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063429 gggggacgatggttagccagatatagttacttgcctttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 27063330  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27063329 ttcttgcctgagttgtgtacaatctca 27063303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851703
Alignment:
Q  82 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaag 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaag 23851549  T
Q  182 acggtcattaacagctggagatgccccaaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttc 281  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23851550 atggtcattaacagctgcagatgccccaagggaatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttc 23851649  T
Q  282 cgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23851650 cgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcatacaatctca 23851703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 24299806 - 24300131
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24299806 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtga 24299905  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  24299906 tacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 24300005  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24300006 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggtccatcgagacgctcat 24300105  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  24300106 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 24300131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26926915 - 26926592
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26926915 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 26926816  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| ||||||      ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  26926815 tacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcattcg--cttttgatgaagatggtcattaacagctgcggatgccccaa 26926718  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26926717 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 26926618  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26926617 tcttgcctgagttgcgtgcaatctca 26926592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 30552051 - 30552392
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552051 aagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 30552150  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatg--ccc 207  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  30552151 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccc 30552250  T
Q  208 caagggg--------------attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggc 293  Q
    |||||||              |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30552251 caagggggacggtggttagccacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggc 30552350  T
Q  294 tcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30552351 tcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtttacaatctca 30552392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16680278 - 16679961
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680278 gctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggattttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 16680179  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  16680178 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 16680079  T
Q  219 tgatttgccaga-tatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16680078 tggttggccagattatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 16679979  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||| |||||||||    
T  16679978 gagttgcgcacaatctca 16679961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Original strand, 15406579 - 15406894
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15406579 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 15406678  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
     |||||||||||||| |||||   |||||||| | || ||||||||| |||||  ||   ||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  15406679 atacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtaggggcttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgcccca 15406778  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406779 agggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 15406878  T
Q  309 ttcttgcctgagttgc 324  Q
    ||||||||||||||||    
T  15406879 ttcttgcctgagttgc 15406894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 324
Target Start/End: Original strand, 15418366 - 15418681
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15418366 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 15418465  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
     |||||||||||||| |||||   |||||||| | || ||||||||| |||||  ||   ||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  15418466 atacattgaacacagcaatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtaggggcttttgatgaagatggccattaacagctgcagatgcccca 15418565  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418566 agggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 15418665  T
Q  309 ttcttgcctgagttgc 324  Q
    ||||||||||||||||    
T  15418666 ttcttgcctgagttgc 15418681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20174696 - 20174371
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20174696 aagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 20174597  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaa-attttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||| ||  |||| ||||  |||||||  |  ||||||||||||||||   || | |||||||  |  ||    ||| |||| |  |||||||  |    
T  20174596 tacattgagcatggtaaacactatatttcctttagcattttgaattcacaagtgtagtagcttctgacaagaacaactattgacagttacagatgcctaa 20174497  T
Q  210 aggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20174496 aggggatggtgacttgctagaaatagttacttgccttttgtttcaatctcattttttcatgaaccgccctttcgggttttcggttcattgagacgctcat 20174397  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  20174396 ttttgcctgagttgcgtacaatctca 20174371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 22161295 - 22161620
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22161295 aagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 22161394  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaa-attttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||| ||  |||| ||||  |||||||  |  ||||||||||||||||   || | |||||||  |  ||    ||| |||| |  |||||||  |    
T  22161395 tacattgagcatggtaaacactatatttcctttagcattttgaattcacaagtgtagtagcttctgacaagaacaactattgacagttacagatgcctaa 22161494  T
Q  210 aggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22161495 aggggatggtgacttgctagaaatagttacttgccttttgtttcaatctcattttttcatgaaccgccctttcgggttttcggttcattgagacgctcat 22161594  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  22161595 ttttgcctgagttgcgtacaatctca 22161620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27209043 - 27208848
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27209043 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattga 27208944  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg 214  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27208943 acacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27208848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 27240185 - 27240380
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27240185 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattga 27240284  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg 214  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27240285 acacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggg 27240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 4718349 - 4718511
Alignment:
Q  174 tgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 272  Q
    |||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4718349 tgatgaagataggcattaatagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatcttatttttgcatgaa 4718448  T
Q  273 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4718449 ccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 4718511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27184860 - 27184750
Alignment:
Q  225 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184860 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 27184761  T
Q  325 gtacaatctca 335  Q
     | ||||||||    
T  27184760 atgcaatctca 27184750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Original strand, 27264380 - 27264490
Alignment:
Q  225 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27264380 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 27264479  T
Q  325 gtacaatctca 335  Q
     | ||||||||    
T  27264480 atgcaatctca 27264490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 77
Target Start/End: Original strand, 26666716 - 26666774
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaa 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26666716 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 3285 - 3610
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 3384  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3385 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 3484  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 3584  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3585 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 3610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 21891852 - 21892177
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21891852 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 21891951  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21891952 tacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 21892051  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21892052 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 21892151  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21892152 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 21892177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 335
Target Start/End: Original strand, 20334531 - 20334845
Alignment:
Q  21 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334531 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 20334630  T
Q  121 acagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattgtg 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  20334631 acagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatggtg 20334730  T
Q  221 atttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgag 320  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20334731 gttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatttttgcctgag 20334830  T
Q  321 ttgcgtacaatctca 335  Q
    |||| ||||||||||    
T  20334831 ttgcatacaatctca 20334845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20466929 - 20466606
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466929 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 20466830  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20466829 tacattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcatagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 20466730  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20466729 ggggatggtgatttgccaaatat-gttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcagctcatcgagacgctcatt 20466631  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20466630 cttgcctgagttgcgtacaatctca 20466606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3647298 - 3646973
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647298 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 3647199  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  3647198 tacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 3647099  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647098 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 3646999  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3646998 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 3646973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 16202139 - 16202462
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202139 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16202238  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16202239 tacattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcacaggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 16202338  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    | |||| ||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202339 gaggatggtggttggccagatatagttacttgcc-tctgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttgcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 16202437  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  16202438 cttgcctgagttgtgtacaatctca 16202462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10968817 - 10968492
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968817 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 10968718  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  10968717 tacattgaacacagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 10968618  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968617 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 10968518  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  10968517 tcttgcctgagttgtttacaatctca 10968492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10951243 - 10950918
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951243 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 10951144  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| | ||||   || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  10951143 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaatccgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 10951044  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951043 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 10950944  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  10950943 tcttgcctgagttgtttacaatctca 10950918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51644372 - 51644047
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644372 aagcaaaggctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 51644273  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||    
T  51644272 tacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattgacagctgcagatgccccaa 51644173  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644172 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 51644073  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  51644072 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 51644047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 41787422 - 41787740
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41787422 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 41787521  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  41787522 aacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggac 41787621  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41787622 ggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttcagggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 41787721  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  41787722 tgagttgtgtacaatctca 41787740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28591227 - 28590910
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591227 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 28591128  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || |  || |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||      
T  28591127 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagtttttgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggggacg 28591028  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591027 gtggtcggccagatatagctacttgccttttatttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 28590928  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    || |||||||||||||||    
T  28590927 gatttgcgtacaatctca 28590910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28155878 - 28155561
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155878 aagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 28155779  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||| |||| ||||||||| ||||  ||    ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28155778 tacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 28155681  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155680 gggggacggtggttggccagatatagttacttgtcttttgtt------tcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 28155587  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  28155586 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 28155561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Original strand, 6200107 - 6200164
Alignment:
Q  260 atttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |  || ||||||||||||| ||||||    
T  6200107 atttttgcatgaaccgcccttttgggttttcagtccaccgagacgctcatttttgcct 6200164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 16618640 - 16618964
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618640 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16618739  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16618740 tacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 16618839  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618840 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 16618939  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||    
T  16618940 cttacctaagttgcgtacaatctca 16618964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32296742 - 32296417
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296742 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 32296643  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  32296642 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaacttctgatgaaaatggtcattaacagctgcaaatgccccaa 32296543  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32296542 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 32296443  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||    
T  32296442 tcttgcctgagttgtgtataatctca 32296417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4629898 - 4629573
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629898 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattaacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 4629799  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4629798 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 4629699  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629698 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 4629599  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4629598 tcttgcctgagttgcatacaatctca 4629573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8217745 - 8217420
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217745 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 8217646  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8217645 tacattgaacacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 8217546  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8217545 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggttcattgagacgctcat 8217446  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8217445 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 8217420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28027396 - 28027079
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027396 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 28027297  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  28027296 acacagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 28027197  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027196 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 28027097  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  28027096 gagttgtgtacaatctca 28027079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21680814 - 21680489
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680814 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 21680715  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21680714 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaa 21680615  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680614 gggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 21680515  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  21680514 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 21680489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 29142904 - 29143229
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142904 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 29143003  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29143004 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 29143103  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29143104 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcgattcatcgagacgctcat 29143203  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  29143204 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 29143229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 29659115 - 29659440
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659115 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 29659214  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  29659215 tacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 29659314  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659315 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 29659414  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  29659415 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 29659440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 4340823 - 4341149
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340823 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 4340922  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4340923 tacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcccca 4341022  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4341023 agggagacagtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctca 4341122  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4341123 ttcttgcctgagttgtgtacaatctca 4341149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5473101 - 5472776
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473101 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 5473002  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5473001 tacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 5472902  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5472901 gggggacggtggttggccaggtatagctacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 5472802  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5472801 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 5472776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 22381735 - 22382051
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381735 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22381834  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  22381835 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagctt-tgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 22381933  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381934 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 22382033  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22382034 gagttgcgtacaatctca 22382051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 28110102 - 28110428
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110102 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacggattcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 28110201  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28110202 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 28110301  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28110302 agggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctca 28110401  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  28110402 ttcttgcctgagttgtgttcaatctca 28110428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5728091 - 5727766
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728091 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 5727992  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  5727991 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaa 5727892  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5727891 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 5727792  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5727791 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 5727766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16422295 - 16421972
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422295 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16422196  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16422195 tacattgaacacagtaatcattacatttcc-ggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccctaa 16422097  T
Q  211 ggggattgtgatttg-ccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| |  ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422096 gggaacggtggttggcccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 16421998  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16421997 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 16421972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18248851 - 18248526
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248851 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtgg 18248752  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  18248751 tacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 18248652  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248651 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 18248552  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  18248551 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 18248526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4423031 - 4422707
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423031 aagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 4422932  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  4422931 tacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 4422832  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4422831 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcatt 4422732  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4422731 cttgcctgagttgcgtacaatctca 4422707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 17979098 - 17979425
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979098 aagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 17979197  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccc- 208  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17979198 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccc 17979297  T
Q  209 -aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 307  Q
     | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979298 aagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 17979397  T
Q  308 attcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17979398 attcttgcctgagttgtttacaatctca 17979425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5717181 - 5716856
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717181 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 5717082  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  5717081 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaa 5716982  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5716981 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 5716882  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5716881 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 5716856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 5764277 - 5764602
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764277 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 5764376  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  5764377 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaa 5764476  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764477 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 5764576  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5764577 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 5764602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10649184 - 10648859
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649184 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 10649085  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||    
T  10649084 tacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaa 10648985  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10648984 gggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 10648885  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  10648884 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 10648859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 17971011 - 17971336
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971011 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 17971110  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||| |||||||||| |||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17971111 tacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattgacagctgcagatgccccaa 17971210  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971211 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 17971310  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17971311 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 17971336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47029566 - 47029241
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029566 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 47029467  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  47029466 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 47029367  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| |   ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029366 gggagccggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 47029267  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  47029266 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 47029241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 5603462 - 5603787
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603462 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 5603561  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5603562 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 5603661  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603662 gggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 5603761  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5603762 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 5603787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10402262 - 10401937
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402262 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 10402163  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  10402162 tacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaa 10402063  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402062 gggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 10401963  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  10401962 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 10401937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18231306 - 18230981
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18231306 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcgcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 18231207  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18231206 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 18231107  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18231106 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 18231007  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    | |||||||||||||| |||||||||    
T  18231006 ttttgcctgagttgcgaacaatctca 18230981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 20570993 - 20571318
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20570993 aagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 20571092  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  20571093 tacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 20571192  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571193 gggggacggtggtcggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcgtgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 20571292  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20571293 tcttgcctgagttgtttacaatctca 20571318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 22865001 - 22865318
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865001 gctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22865100  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||      
T  22865101 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacg 22865200  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865201 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 22865300  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22865301 gagttgcgtacaatctca 22865318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 22880060 - 22880377
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880060 gctcaaattgatgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22880159  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||      
T  22880160 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgccgatgccccaagggggacg 22880259  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880260 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 22880359  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22880360 gagttgcgtacaatctca 22880377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 31958604 - 31958929
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958604 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 31958703  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31958704 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 31958803  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958804 gggggacggtggttggccagatatagtcacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccctccgggttttcggctcatcgagacgctcat 31958903  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31958904 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 31958929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6208014 - 6207688
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6208014 aagcaaaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 6207915  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6207914 gtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 6207815  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207814 agggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 6207715  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  6207714 ttcttgcctgagttgtgtacaatctca 6207688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 6536898 - 6537215
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536898 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 6536997  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  6536998 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 6537097  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6537098 gtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcgatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 6537197  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  6537198 gagttgtgtacaatctca 6537215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24334286 - 24333961
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334286 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 24334187  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24334186 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 24334087  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334086 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcattctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 24333987  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24333986 tcttgcctgagttgtatacaatctca 24333961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28345284 - 28344959
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345284 aagcataggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 28345185  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28345184 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 28345085  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28345084 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcat 28344985  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  28344984 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 28344959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51788135 - 51787810
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51788135 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtgg 51788036  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  51788035 tacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaa 51787936  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51787935 gggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcattgagacgctcat 51787836  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  51787835 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 51787810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19700599 - 19700275
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19700599 aagcacaggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtga 19700500  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19700499 tacattgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacataggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagacgccccaa 19700400  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    ||| |  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19700399 gggaacggtggttggcctgatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccaggtttacggctcatcgagacgcttatt 19700300  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19700299 cttgcctgagttgcgtacaatctca 19700275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 8283624 - 8283941
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283624 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 8283723  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    |||||  ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  8283724 acacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 8283823  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8283824 gtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgtct 8283923  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  8283924 gagttgtgtacaatctca 8283941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 15735242 - 15735567
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735242 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 15735341  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||   |   ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15735342 tacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgttggggcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 15735441  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735442 gggagacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 15735541  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    
T  15735542 tcttgtctaagttgtgtacaatctca 15735567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 18286501 - 18286826
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18286501 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 18286600  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||  |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18286601 tacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaa 18286700  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18286701 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcat 18286800  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  18286801 tcttgcctgagttgtgttcaatctca 18286826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 18301802 - 18302127
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18301802 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 18301901  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||  |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18301902 tacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatttgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaa 18302001  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18302002 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcat 18302101  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  18302102 tcttgcctgagttgtgttcaatctca 18302127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 31030385 - 31030710
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030385 aagcacaggctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 31030484  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  31030485 tacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 31030584  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31030585 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 31030684  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31030685 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 31030710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32445259 - 32444942
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445259 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 32445160  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| | |||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  32445159 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcgagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 32445060  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32445059 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 32444960  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  32444959 gagttgcgtgcaatctca 32444942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5019818 - 5019501
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019818 gctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 5019719  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||      
T  5019718 acacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacg 5019619  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019618 gtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 5019519  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5019518 gagttgtgtacaatctca 5019501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7079327 - 7079012
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079327 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 7079228  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-att 217  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| ||||||      ||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |      
T  7079227 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcattcg--cttttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacg 7079130  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7079129 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgcttattcttgcct 7079030  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  7079029 gagttgtgtacaatctca 7079012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35886878 - 35886552
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35886878 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 35886779  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  35886778 atacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 35886679  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35886678 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctca 35886579  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  35886578 ttcttgcctgagttgcgtgcaatctca 35886552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4727738 - 4727421
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4727738 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 4727639  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  4727638 acacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 4727539  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4727538 gtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatcccatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 4727439  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  4727438 gagttgcgtgcaatctca 4727421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 5590508 - 5590833
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590508 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 5590607  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   ||  || | |||| |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  5590608 tacattgaacacagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagctttagatgaagatagtcatcaacggcggcagatgccccaa 5590707  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590708 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 5590807  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  5590808 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 5590833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 11104509 - 11104834
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104509 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 11104608  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||||| |||||| || |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  11104609 tacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaactcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaa 11104708  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11104709 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccaggttttcggctcatcgagacgctcat 11104808  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11104809 tcttgcctgagttgcgtgcaatctca 11104834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48472032 - 48471715
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472032 gctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 48471933  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  48471932 acacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggaacttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 48471833  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48471832 gtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattcttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 48471733  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  48471732 gagttgtttacaatctca 48471715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4689765 - 4689438
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4689765 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 4689666  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  4689665 gtacattgaacgcagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 4689566  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttt-gcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 307  Q
    ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689565 agggggatggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcattttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 4689466  T
Q  308 attcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  4689465 attcttgcctgagttgtgtacaatctca 4689438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18057367 - 18057048
Alignment:
Q  18 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18057367 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacatt 18057268  T
Q  117 gaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-a 215  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18057267 gaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggga 18057168  T
Q  216 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 315  Q
      ||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057167 cggtggttggccggatatagttacttgccttttgttttaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 18057068  T
Q  316 ctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18057067 ctgagttgtgtacaatctca 18057048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 4790788 - 4791106
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4790788 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 4790887  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  4790888 aacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 4790987  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     | | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4790988 ggcggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgaggcgctcattcttgcc 4791087  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4791088 tgagttgcgtacaatctca 4791106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18336734 - 18336416
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18336734 gctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18336635  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| | || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  18336634 aacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagtataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 18336535  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18336534 ggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcc 18336435  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| || |||||    
T  18336434 tgagttgcgtgcactctca 18336416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20072146 - 20071823
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072146 aagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 20072047  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||| |||| ||||||||| ||||||      ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20072046 tacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcattcg--cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 20071949  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20071948 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 20071849  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  20071848 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 20071823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5658249 - 5657923
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgat--gtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggt 108  Q
    ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5658249 aagcacaggctcaaaatgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggt 5658150  T
Q  109 ggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccc 208  Q
    ||||| |||||||||| |||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  5658149 ggtacgttgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccc 5658050  T
Q  209 aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
     |||| |  ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5658049 cagggaacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcagctcatcgagacgctca 5657950  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5657949 ttcttgcctgagttgtgtacaatctca 5657923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 53 - 335
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887179
Alignment:
Q  53 aaggcatgactccacggattc-acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaatttt 150  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  151 gaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttg 249  Q
    |||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||| | |    
T  15886994 gaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgcctctcg 15887093  T
Q  250 tttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15887094 tttcaatctcatttttccatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 15887179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002348
Alignment:
Q  77 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctga 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 8002508  T
Q  177 tgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 275  Q
    ||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||| |  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002507 tgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaagggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 8002408  T
Q  276 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8002407 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctca 8002348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20445844 - 20445787
Alignment:
Q  260 atttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  20445844 atttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatttttgcct 20445787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3795695 - 3795370
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795695 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 3795596  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  3795595 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaggctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaa 3795496  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795495 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 3795396  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  3795395 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 3795370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22894573 - 22894249
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894573 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 22894474  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22894473 tacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 22894374  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894373 ggggatggtagttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaactgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 22894274  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22894273 cttgcctgagttgcgtacaatctca 22894249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 28953784 - 28954109
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953784 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 28953883  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  || | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28953884 tacattgaacacagtaatcactacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 28953983  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28953984 gggggacggtggttggccggatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggtcttcggctcatcgagacgctcat 28954083  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28954084 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 28954109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33298690 - 33298365
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298690 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 33298591  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33298590 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 33298491  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33298490 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcgattcatcgagacgctcat 33298391  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  33298390 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 33298365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33881283 - 33880959
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881283 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 33881184  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33881183 tacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 33881084  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33881083 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcatt 33880984  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
     |||||||||||||| |||||||||    
T  33880983 tttgcctgagttgcgaacaatctca 33880959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 37746332 - 37746656
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746332 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 37746431  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37746432 tacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 37746531  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746532 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 37746631  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  37746632 cttgcctgagttgtgtacaatctca 37746656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 37352648 - 37352973
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352648 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 37352747  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  37352748 tacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatgaagacagtcattaacagctgcagatgccccaa 37352847  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352848 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 37352947  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  37352948 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 37352973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 15752864 - 15753180
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15752864 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattga 15752963  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  15752964 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacgg 15753063  T
Q  219 tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 318  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15753064 tggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 15753163  T
Q  319 agttgcgtacaatctca 335  Q
    | |||||||||||||||    
T  15753164 atttgcgtacaatctca 15753180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 32590279 - 32590604
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590279 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 32590378  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32590379 tacattgaacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaa 32590478  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590479 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 32590578  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  32590579 tcttgcctgagttgtgttcaatctca 32590604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26486554 - 26486228
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486554 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 26486455  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486454 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 26486355  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486354 agggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 26486255  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  26486254 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 26486228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 37665498 - 37665815
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665498 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 37665597  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||||||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  37665598 acacagtaatcatgacatttcccagaaattttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 37665697  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37665698 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 37665797  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  37665798 gagttgtgtacaatctca 37665815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37761139 - 37760814
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761139 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 37761040  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37761039 tacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaa 37760940  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37760939 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 37760840  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37760839 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 37760814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6880461 - 6880135
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880461 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 6880362  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  6880361 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattcagatgaagatggtcattaacagttgcagatgcccca 6880262  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6880261 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 6880162  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6880161 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 6880135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9323635 - 9323309
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323635 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 9323536  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9323535 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 9323436  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323435 agggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 9323336  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9323335 ttcttgcctgagttgtgtacaatctca 9323309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33522539 - 33522211
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522539 aagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 33522440  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccc- 208  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  33522439 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccc 33522340  T
Q  209 --aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 306  Q
      | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522339 caagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 33522240  T
Q  307 cattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33522239 cattcttgcctgagttgtttacaatctca 33522211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 9544713 - 9545037
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544713 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 9544812  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9544813 tacattgaacacagtaatcattacatttcctg-aaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgtagatgccccaa 9544911  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544912 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 9545011  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9545012 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 9545037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11555503 - 11555186
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555503 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 11555404  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  11555403 acacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 11555304  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555303 gtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 11555204  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  11555203 gagttgtgtacaatctca 11555186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 18494771 - 18495096
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494771 aagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 18494870  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||| | |||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  18494871 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaacttcgaattcgccagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 18494970  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494971 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 18495070  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  18495071 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 18495096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24730127 - 24729802
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730127 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 24730028  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  24730027 tacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 24729928  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24729927 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 24729828  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  24729827 tcttgcctgagttgtttacaatctca 24729802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30174622 - 30174297
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174622 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 30174523  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | |||||||||| | |||||||||||    
T  30174522 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagccgcagatgccccaa 30174423  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174422 gggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 30174323  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  30174322 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 30174297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 31820412 - 31820737
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820412 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 31820511  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  31820512 tacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 31820611  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31820612 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 31820711  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31820712 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 31820737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23898023 - 23897707
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23898023 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgaatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 23897924  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||  ||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  23897923 acacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcggaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 23897824  T
Q  219 tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 318  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23897823 tggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 23897724  T
Q  319 agttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||    
T  23897723 agttgcgtacaatctca 23897707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 13180792 - 13181118
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13180792 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 13180891  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  |  | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13180892 gtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtatgagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 13180991  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180992 agggggacggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 13181091  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13181092 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 13181118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 41680861 - 41680536
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680861 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 41680762  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  41680761 tacattgaacacagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 41680662  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41680661 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcataaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 41680562  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41680561 tcttgcctgagttgcgtgcaatctca 41680536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43084415 - 43084090
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084415 aagcaaaggctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 43084316  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||| | |||| || | ||| |||||||||   ||||||||||| | ||||||||| |    
T  43084315 tacattgaacacagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattcgccagcataggagcttttgatgaagataatcattaacagcagcagatgccccca 43084216  T
Q  211 ggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||||   | || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084215 ggggggcggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 43084116  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  43084115 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 43084090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33783644 - 33783328
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33783644 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgg 33783545  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33783544 tacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 33783445  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33783444 gggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 33783345  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgt 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  33783344 tcttgcctgagttgcgt 33783328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12138334 - 12138008
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138334 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 12138235  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12138234 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 12138135  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138134 agggagacggtggttgactagatatagttacttgtcttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 12138035  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12138034 ttcttgcctgagttgtgtacaatctca 12138008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11329794 - 11329469
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329794 aagcaaaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 11329695  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  11329694 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaa 11329595  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329594 gggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaactgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 11329495  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11329494 tcttgcctgagttgcgtgcaatctca 11329469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 13318839 - 13319156
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318839 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 13318938  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-att 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||  |  | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |      
T  13318939 acacagtaatcataacatttcccagaaactttgaattcgcaagcgtatgagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 13319038  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13319039 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 13319138  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13319139 gagttgcgtacaatctca 13319156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25206435 - 25206111
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25206435 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 25206336  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| | ||||||| ||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25206335 gtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgtagatgcccca 25206236  T
Q  210 aggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    | ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206235 acgggatggtggttggccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcataaacctcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 25206137  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25206136 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 25206111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25270591 - 25270267
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25270591 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 25270492  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||| | ||||||| ||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25270491 gtacattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttctgatgaagatggtcattaacagctgtagatgcccca 25270392  T
Q  210 aggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    | ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270391 acgggatggtggttggccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcataaacctcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 25270293  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25270292 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 25270267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28655399 - 28655074
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655399 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 28655300  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  28655299 tacattgaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 28655200  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28655199 gggagacggtagttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 28655100  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  28655099 tcttgcctgagttgtgttcaatctca 28655074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31437613 - 31437296
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437613 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 31437514  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  31437513 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 31437414  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437413 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 31437314  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31437313 gagttgcgtacaatctca 31437296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30035583 - 30035259
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30035583 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtga 30035484  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30035483 tacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 30035384  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  30035383 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcatt 30035284  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
     |||||||||||||| |||||||||    
T  30035283 tttgcctgagttgcgaacaatctca 30035259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 13436691 - 13437010
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13436691 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 13436790  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgat-gaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-ga 215  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  13436791 aacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgattgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaga 13436890  T
Q  216 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 315  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436891 cggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 13436990  T
Q  316 ctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  13436991 ctgagttgtgtacaatctca 13437010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30158183 - 30157865
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30158183 gctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 30158084  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||| ||| || ||| || | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |     
T  30158083 acacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacgagtacataagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgcctcaaggggaac 30157984  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30157983 ggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 30157884  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  30157883 tgagttgtgtacaatctca 30157865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 18369536 - 18369861
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369536 aagcgaaggttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 18369635  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || |  || |||||||||  |||||||||||||| | |||||||||    
T  18369636 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagtttttgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaa 18369735  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369736 gggggacagtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 18369835  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  18369836 tcttgcctgagttgtatacaatctca 18369861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23632118 - 23631801
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632118 gctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 23632019  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    |||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  23632018 acacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 23631919  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23631918 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 23631819  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  23631818 gagttgtgtacaatctca 23631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24976006 - 24975681
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24976006 aagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 24975907  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||||||| | |||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  24975906 tacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcgagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 24975807  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24975806 gggggacggtggttggccagatatagttacttgcctctcgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 24975707  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  24975706 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 24975681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 335
Target Start/End: Original strand, 8659479 - 8659801
Alignment:
Q  14 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8659479 caaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtac 8659578  T
Q  114 attgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-gg 212  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8659579 attgaacacagcaatcattacatttcc-cgaaactttgaattcacaagtacaagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggg 8659677  T
Q  213 ggattgtgatttgccagatatagttacttg-ccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattc 311  Q
    |||  ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8659678 ggacggtggttggccagatatagttacttgccctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattc 8659777  T
Q  312 ttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||| ||||    
T  8659778 ttgcctgagttgcgaacaacctca 8659801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34622668 - 34622350
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34622668 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 34622569  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  34622568 aacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 34622469  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34622468 ggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 34622369  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  34622368 tgagttgtgtacaatctca 34622350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2517214 - 2516897
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517214 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 2517115  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||| ||||||| ||||||||||| |||||      
T  2517114 acacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattgacagctgcagatgccccaagggggacg 2517015  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517014 gtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 2516915  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  2516914 gagttgtgtataatctca 2516897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 15652770 - 15653087
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15652770 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattga 15652869  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    |||||| |||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||      
T  15652870 acacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccgagggagacg 15652969  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652970 gtggtcggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 15653069  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  15653070 gagttgtgtacaatctca 15653087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 22993128 - 22993445
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22993128 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22993227  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    |||||| ||||  | ||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  22993228 acacagcaatcgatacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaggatagtcattaacagctgcagatgccccaagggtgacg 22993327  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22993328 gtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 22993427  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22993428 gagttgtgtacaatctca 22993445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24608395 - 24608078
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24608395 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 24608296  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggatt 217  Q
    ||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||      
T  24608295 aacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattagtagctgcagacgccccaaggggacg 24608196  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24608195 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 24608096  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  24608095 gagttgtttacaatctca 24608078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5643957 - 5643634
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643957 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtgg 5643858  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||| | || ||||||||| ||||||      ||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||||||    
T  5643857 tacattgaacacagtgatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagcattcg--cttttgatgaaaatgggcattaacagctgcagatgccccaa 5643760  T
Q  211 ggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||||  | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5643759 ggggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 5643660  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5643659 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 5643634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 18122428 - 18122745
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18122428 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 18122527  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  18122528 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 18122627  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18122628 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 18122727  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  18122728 gagttgcatgcaatctca 18122745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 40467565 - 40467882
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467565 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 40467664  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| |||||      
T  40467665 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacg 40467764  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467765 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 40467864  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  40467865 gagttgcgtgcaatctca 40467882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30940794 - 30940468
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30940794 aagcacaggctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 30940695  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  30940694 gtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 30940595  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30940594 agggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccttttcgggttttcggctcatcgagacgctca 30940495  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30940494 ttcctgcctgagttgtgtacaatctca 30940468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 261 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34471394 - 34471338
Alignment:
Q  261 tttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  34471394 tttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatttttgcct 34471338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 27602973 - 27603297
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602973 aagcacaggctcaaattgatgtctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27603072  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27603073 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 27603172  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603173 agggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcgtttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 27603272  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27603273 cttgcctgagttgcgtacaatctca 27603297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 28356018 - 28356344
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356018 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 28356117  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  28356118 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattcagatgaagatggtcattaacagttgtagatgcccca 28356217  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356218 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 28356317  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28356318 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 28356344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16260373 - 16260048
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260373 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16260274  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16260273 tacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccctaa 16260174  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260173 gggagacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagatgctcat 16260074  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16260073 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 16260048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29835473 - 29835148
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835473 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 29835374  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29835373 tacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaggcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 29835274  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835273 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 29835174  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  29835173 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 29835148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31360678 - 31360353
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360678 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 31360579  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  31360578 tacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaa 31360479  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360478 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 31360379  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  31360378 tcttgcctgagttgtgttcaatctca 31360353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 19202429 - 19202755
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202429 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 19202528  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaa-attttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   || | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19202529 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 19202628  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202629 agggagacggtggttgactagatatagttacttgccttgtgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 19202728  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19202729 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 19202755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 19655408 - 19655735
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt--attggttggt 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19655408 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttttattggttggt 19655507  T
Q  109 ggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccc 208  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19655508 ggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccc 19655607  T
Q  209 aagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 307  Q
    |||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655608 aagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctc 19655707  T
Q  308 attcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655708 attcttgcctgagttgcgtacaatctca 19655735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 12086797 - 12087115
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12086797 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 12086896  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  12086897 aacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggac 12086996  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086997 ggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 12087096  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12087097 tgagttgcgtacaatctca 12087115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19694246 - 19693920
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19694246 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 19694147  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19694146 gtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 19694047  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694046 agggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 19693947  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19693946 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 19693920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9360772 - 9360447
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360772 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 9360673  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||| ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9360672 tacattggacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgtcccaa 9360573  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9360572 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgtgttttcggctcatcgagacgctcat 9360473  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  9360472 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 9360447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22139049 - 22138732
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22139049 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 22138950  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggatt 217  Q
    ||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  22138949 aacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacg 22138850  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22138849 gtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctgatcgagacgctcattcttgcct 22138750  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22138749 gagttgcgtacaatctca 22138732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44567131 - 44566806
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567131 aagcacaggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 44567032  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctgg-aaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  44567031 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 44566932  T
Q  210 aggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44566931 aggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 44566832  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  44566831 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 44566806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 31483938 - 31484263
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483938 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 31484037  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||| |||||||     ||| |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  31484038 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgtggaagcttcagatgaagatggtcatcaacagctgcagatgccccaa 31484137  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484138 gggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 31484237  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  31484238 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 31484263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33248508 - 33248191
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248508 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 33248409  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||      
T  33248408 acacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcaaatgccccaagggagacg 33248309  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33248308 gtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcct 33248209  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33248208 gagttgcgtacaatctca 33248191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33264873 - 33264556
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264873 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 33264774  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||| | || ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||      
T  33264773 acacagtaatcatggcatttcctaggaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggacg 33264674  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264673 gtggttggccagatatagttacttgctttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 33264574  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  33264573 gagttgcatacaatctca 33264556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19680599 - 19680273
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680599 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 19680500  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19680499 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 19680400  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  19680399 agggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctca 19680300  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19680299 ttcttgcctgagttgtgtataatctca 19680273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 2131328 - 2131653
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2131328 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtga 2131427  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2131428 tacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagaaggtcattaacagctgcagatgccccaa 2131527  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2131528 gggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 2131627  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  2131628 tcttgcctgagttgtatacaatctca 2131653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 335
Target Start/End: Original strand, 21342234 - 21342562
Alignment:
Q  9 agaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttgg 107  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21342234 agaagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttgg 21342333  T
Q  108 tggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21342334 tggtacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccc 21342433  T
Q  208 caagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 306  Q
    ||||||| |  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21342434 caagggggacggtggttagccagatatagtcacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgct 21342533  T
Q  307 cattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21342534 cattcttgcctgagttgcgtgcaatctca 21342562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15773716 - 15773399
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773716 gctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 15773617  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  15773616 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaaggggaacg 15773517  T
Q  219 -tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
     || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15773516 atggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 15773417  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  15773416 gagttgcgtgcaatctca 15773399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 19911230 - 19911555
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19911230 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtgg 19911329  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  19911330 tacattgaacacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatcgtcattaacagctgcagatgccccaa 19911429  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19911430 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccggattttcggttcatcgagacgctcat 19911529  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19911530 tcttgcctgagttgcgtgcaatctca 19911555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18715630 - 18715307
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715630 aagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 18715531  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||| |||| ||||||||| ||||||      ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18715530 tacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcattcg--cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 18715433  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715432 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaacctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 18715333  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  18715332 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 18715307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18796849 - 18796531
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18796849 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18796750  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |     
T  18796749 aacacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccctaagggggac 18796650  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18796649 ggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccacccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcc 18796550  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  18796549 tgagttgcgtgcaatctca 18796531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 335
Target Start/End: Original strand, 22075002 - 22075320
Alignment:
Q  17 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22075002 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacatt 22075101  T
Q  117 gaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggat 216  Q
    |||||| | || |||| |||||||| |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22075102 gaacacggcaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagcttctgatg-agatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 22075200  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 315  Q
     ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22075201 ggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcatttttgcatgaaccgccatttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 22075300  T
Q  316 ctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22075301 ctaagttgcgtacaatctca 22075320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14569306 - 14568982
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569306 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 14569207  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||| ||   ||| ||||||||| | | || || | ||| |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  14569206 tacattgaacacaacaatcattacattcccaa-aaactttgaattcgccatcataggagcttttgatgaagatagtcgttaacagctgcagatgccccaa 14569108  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14569107 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggtacatcgagacgctcat 14569008  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  14569007 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 14568982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 5141325 - 5141650
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141325 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 5141424  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5141425 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 5141524  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141525 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 5141624  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5141625 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 5141650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16047462 - 16047139
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047462 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16047363  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16047362 tacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 16047263  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16047262 ggggacggtggttgcccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 16047164  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16047163 cttgcctgagttgcgtacaatctca 16047139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 16745511 - 16745836
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745511 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16745610  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16745611 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 16745710  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745711 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 16745810  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  16745811 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 16745836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26441400 - 26441075
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441400 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 26441301  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26441300 tacattgaacacagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagacgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 26441201  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441200 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 26441101  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  26441100 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 26441075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11447027 - 11446710
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447027 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 11446928  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  11446927 acacagtaatcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 11446828  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11446827 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 11446728  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  11446727 gagttgtgtataatctca 11446710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45393358 - 45393040
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393358 gctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 45393259  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gat 216  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| ||| || | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  45393258 acacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacataagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagac 45393159  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393158 ggtggttggccagatatagttacttgccctttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 45393059  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45393058 tgagttgcgtacaatctca 45393040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 16443994 - 16444318
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443994 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16444093  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||| || |||| || ||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  16444094 tacattgaacacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcacataagcttcagacgaagatggtcgttaacagctgcagatgccccaa 16444193  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444194 ggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattttcgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 16444293  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  16444294 cttgcctgagttgcatacaatctca 16444318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 31558384 - 31558708
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558384 aagcaaaggctcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 31558483  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  31558484 tacattgaacacagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttcgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 31558583  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558584 ggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 31558683  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  31558684 cttgcctgagttgtgtacaatctca 31558708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 24586524 - 24586850
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586524 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 24586623  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24586624 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagattcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcctca 24586723  T
Q  210 aggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586724 aggggaacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 24586823  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24586824 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 24586850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Original strand, 26663907 - 26664228
Alignment:
Q  15 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663907 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 26664006  T
Q  115 ttgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg- 213  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||     
T  26664007 ttgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaaggga 26664106  T
Q  214 gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattctt 313  Q
    ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26664107 gacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattctt 26664206  T
Q  314 gcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  26664207 gcctgagttgtgtacaatctca 26664228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 26313837 - 26314163
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313837 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 26313936  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26313937 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 26314036  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26314037 agggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 26314136  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  26314137 ttcttgcctgagttgtgtacaatctca 26314163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5164523 - 5164206
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164523 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 5164424  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  5164423 acacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 5164324  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164323 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 5164224  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5164223 gagttgtgtacaatctca 5164206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 16512424 - 16512749
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16512424 aagcacaggcttaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16512523  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16512524 tacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 16512623  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16512624 gggggacggtggttggccagatatagttacttgcctctcgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 16512723  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  16512724 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 16512749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26518940 - 26518615
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518940 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 26518841  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  26518840 tacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 26518741  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26518740 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 26518641  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||    
T  26518640 tcttgcctgagttgtgtataatctca 26518615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Original strand, 26679099 - 26679420
Alignment:
Q  15 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679099 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 26679198  T
Q  115 ttgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg- 213  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  | ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||     
T  26679199 ttgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaggtgaagataggcattaacagctgcagatgccccaaggga 26679298  T
Q  214 gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattctt 313  Q
    ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679299 gacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattctt 26679398  T
Q  314 gcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  26679399 gcctgagttgtgtacaatctca 26679420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4205537 - 4205211
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205537 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 4205438  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4205437 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 4205338  T
Q  210 aggggattg-tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||||   | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4205337 agggggacgatggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctca 4205238  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  4205237 ttcttgcctgagttgtgttcaatctca 4205211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5154223 - 5153906
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154223 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 5154124  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  5154123 acacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 5154024  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5154023 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcaagacgctcattcttgcct 5153924  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||| ||| ||||    
T  5153923 gagttgcgtgcaacctca 5153906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 26269079 - 26269404
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269079 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 26269178  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| | ||||| |||||    
T  26269179 tacattgaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagatagtcattaacagcagcagatgtcccaa 26269278  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269279 gggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 26269378  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  26269379 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 26269404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 39207129 - 39207454
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39207129 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtgg 39207228  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  39207229 tacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcattaacagcagcagatgccccaa 39207328  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39207329 gggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcattgagacgctcat 39207428  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  39207429 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 39207454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 31084620 - 31084938
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31084620 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 31084719  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||||| ||||| | |||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  31084720 aacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 31084819  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31084820 ggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcc 31084919  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  31084920 tgagttgcgtgcaatctca 31084938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2779391 - 2779074
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779391 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 2779292  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  2779291 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 2779192  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779191 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 2779092  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  2779091 gagttgtgtacaatctca 2779074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3451457 - 3451140
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3451457 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 3451358  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||| |||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  3451357 acacagtgatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaggacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 3451258  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3451257 gtggttggccggatatagttacttgccttttgtttcaacctcctttttgcatgaaccacccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 3451158  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| ||| |||||||    
T  3451157 gagttgtgtataatctca 3451140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31130044 - 31129727
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130044 gctcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 31129945  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  31129944 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 31129845  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129844 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 31129745  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  31129744 gagttgtgtacaatctca 31129727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2160717 - 2160393
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2160717 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtga 2160618  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2160617 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatggtcattaatagctgcagatgccccaa 2160518  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    ||| || ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2160517 gggaatggtggttggctagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggtccatcgagacgctcatt 2160418  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  2160417 cttgcctgagttgtgtacaatctca 2160393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 4139237 - 4139562
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139237 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 4139336  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4139337 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 4139436  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4139437 gggggacggtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcgattcatcgagacgctcat 4139536  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||    
T  4139537 tcttgcctgagttgtgtataatctca 4139562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 45737448 - 45737125
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737448 aagcacaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 45737349  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||| |||| ||||||||| ||||||      ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  45737348 tacattgaacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcattcg--cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 45737251  T
Q  211 gggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737250 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 45737151  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  45737150 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 45737125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 11418769 - 11419094
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418769 aagcacaggctcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 11418868  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||| || | ||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  11418869 tacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcatgaacagctgcagatgccctaa 11418968  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  11418969 gggagacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcttttttgcatgaaccgcccttccgggctttcgattcatcgagacgctcat 11419068  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11419069 tcttgcctgagttgcgtgcaatctca 11419094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 26509686 - 26510012
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26509686 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 26509785  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26509786 gtacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 26509885  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26509886 agggggacggcggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcgtttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctca 26509985  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26509986 ttcttgcctgagttgcgtgcaatctca 26510012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 10910910 - 10911235
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  10910910 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtga 10911009  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||| |||| |||||  || | ||| |||||||||  ||| |||||||| | |||||||||||    
T  10911010 tacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgtattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcgttaacagcggcagatgccccaa 10911109  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10911110 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggtccatcgagacgctcat 10911209  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  10911210 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 10911235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10847730 - 10847452
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10847730 aagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtgg 10847631  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||    
T  10847630 tacattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatgatcattaacagctgcagatgccccaa 10847531  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttt 288  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10847530 ggggatggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttt 10847452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 77 - 335
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532185
Alignment:
Q  77 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctga 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttaga 26532025  T
Q  177 tgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 275  Q
    ||||||  ||||| ||| || | ||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532026 tgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccg 26532125  T
Q  276 cccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26532126 ccctttcggattttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 26532185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 175 - 335
Target Start/End: Original strand, 16732684 - 16732845
Alignment:
Q  175 gatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16732684 gatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaac 16732783  T
Q  274 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16732784 cgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctca 16732845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 216 - 335
Target Start/End: Original strand, 2104357 - 2104476
Alignment:
Q  216 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2104357 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgcttattcttgc 2104456  T
Q  316 ctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2104457 ctgagttgcgtacaatctca 2104476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 26595815 - 26595750
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 76  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595815 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Original strand, 795898 - 795955
Alignment:
Q  260 atttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  795898 atttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatttttgcct 795955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Original strand, 16284754 - 16284811
Alignment:
Q  260 atttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  16284754 atttttgcttgagccgccctttcgggttttcagcccaccgagacgctcatttttgcct 16284811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1906413 - 1906089
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906413 aagcacagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 1906314  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1906313 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatgagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 1906214  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1906213 ggggatggtggtttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggtttttggctcatcgagacgctcatt 1906114  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1906113 cttgcctgagttgcgtacaatctca 1906089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39856798 - 39856473
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856798 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 39856699  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39856698 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaa 39856599  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39856598 gggggacggtggttggccagatacagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctcat 39856499  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  39856498 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 39856473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15233977 - 15233653
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233977 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 15233878  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15233877 tacattggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaagcttatgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 15233778  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233777 ggggatggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 15233678  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  15233677 cttgcctgagttacgtacaatctca 15233653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 54839552 - 54839228
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839552 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 54839453  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  54839452 tacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacaactgcagatgccccaa 54839353  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839352 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 54839253  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  54839252 cttgcctgagttgtgtacaatctca 54839228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21975856 - 21975537
Alignment:
Q  20 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975856 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 21975757  T
Q  120 cacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccc---aagggga 215  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||    
T  21975756 cacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccccaaggggga 21975657  T
Q  216 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 315  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21975656 cggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 21975557  T
Q  316 ctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21975556 ctgagttgcgtacaatctca 21975537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 24586465 - 24586791
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24586465 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 24586564  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24586565 gtacattgaacacatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 24586664  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24586665 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggtttttggctcatcgagacactca 24586764  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24586765 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 24586791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6576015 - 6575698
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576015 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 6575916  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||  |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  6575915 acacagtaatcatcacatttcctagaaactttgaatttgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 6575816  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6575815 gtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 6575716  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  6575715 gagttgtgtacaatctca 6575698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 20332527 - 20332852
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332527 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 20332626  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  20332627 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaa 20332726  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332727 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 20332826  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  20332827 tcttgcctgatttgcgtacaatctca 20332852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Original strand, 40099745 - 40100066
Alignment:
Q  15 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099745 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 40099844  T
Q  115 ttgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg- 213  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||     
T  40099845 ttgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaaggga 40099944  T
Q  214 gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattctt 313  Q
    ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099945 gacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattctt 40100044  T
Q  314 gcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  40100045 gcctgagttgtgtacaatctca 40100066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14104696 - 14104380
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104696 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 14104597  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  14104596 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggacgg 14104497  T
Q  219 tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 318  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  14104496 tggttagccagatatagttacttgccttttgcttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcatttttgcctg 14104397  T
Q  319 agttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||| |||||||||    
T  14104396 agttgcgaacaatctca 14104380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5012039 - 5011713
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5012039 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 5011940  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5011939 gtacattgaacacagcaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaaaatggtcattaacagctgcagatgcctca 5011840  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5011839 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 5011740  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5011739 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 5011713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 18794721 - 18795046
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794721 aagcaaaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 18794820  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  18794821 tacattgaacacggtaaccactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 18794920  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18794921 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcctgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 18795020  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  18795021 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 18795046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30759925 - 30759600
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759925 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 30759826  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  30759825 tacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 30759726  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759725 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgtatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 30759626  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||    
T  30759625 tcttgcctgagttgtttacaatctca 30759600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 14753597 - 14753922
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14753597 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 14753696  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14753697 tacattgaacacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcaaatgccccaa 14753796  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14753797 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacactcat 14753896  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  14753897 tcttgcctgagttgtgttcaatctca 14753922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 15276736 - 15277061
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15276736 aagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtgg 15276835  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15276836 tacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 15276935  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| | | | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15276936 ggggatggtggtttgccagatacagtcattagtcttttcatttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggcccatcgagacgctcat 15277035  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15277036 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 15277061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 33667905 - 33668230
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667905 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 33668004  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  33668005 tacattgaacacagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 33668104  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33668105 gggggacggtggttagccagatatagttccttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 33668204  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||    
T  33668205 ttttgcctgagttgtttacaatctca 33668230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5700694 - 5700375
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5700694 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 5700595  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagg-ggat 216  Q
    |||||||||||||   |||||||   ||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||     
T  5700594 aacacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggac 5700495  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgg-ctcatcgagacgctcattcttgc 315  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5700494 ggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggtctcatcgagacgctcattcttgc 5700395  T
Q  316 ctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5700394 ctgagttgcgtacaatctca 5700375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14671171 - 14670852
Alignment:
Q  18 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14671171 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacatt 14671072  T
Q  117 gaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-ga 215  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  14671071 gaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcacaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaga 14670972  T
Q  216 ttgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 315  Q
      ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670971 cggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 14670872  T
Q  316 ctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  14670871 ctgagttgtgtacaatctca 14670852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17019214 - 17018888
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17019214 aagcataggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 17019115  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17019114 atacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 17019015  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17019014 agggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 17018915  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17018914 ttcttgcctgagttgcatgcaatctca 17018888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 31120615 - 31120943
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31120615 aagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtgg 31120714  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccc- 208  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||| || || |||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  31120715 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagataccccc 31120814  T
Q  209 --aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 306  Q
      | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31120815 caagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 31120914  T
Q  307 cattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31120915 cattcttgcctgagttgtttacaatctca 31120943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 15380342 - 15380667
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15380342 aagcacaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtgg 15380441  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15380442 tacattgaacacgataaccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttcggatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 15380541  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| | ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380542 ggggatggtggtttgccagatatagtcatttctcttttcatttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 15380641  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15380642 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 15380667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 27157418 - 27157746
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157418 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27157517  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  27157518 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaa 27157617  T
Q  211 gggg--attgtgatttgccagatatagttacttgcc-ttttgtttcaatctca-tttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 306  Q
    ||||     ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27157618 gggggacgggtggttggccagatatagttacttgcctttttgtttcaatctcattttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgct 27157717  T
Q  307 cattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27157718 cattcttgcctgagttgcgtgcaatctca 27157746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 36338630 - 36338947
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36338630 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattga 36338729  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  36338730 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 36338829  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36338830 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 36338929  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||| || |||||    
T  36338930 gagttgcgtgcactctca 36338947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 34183074 - 34183391
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183074 gctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 34183173  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  34183174 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatggagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 34183273  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34183274 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcct 34183373  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  34183374 gagttgcatacaatctca 34183391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24118816 - 24118498
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24118816 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 24118717  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtca-ttaacagctggagatgccccaaggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |      
T  24118716 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaggacggtcatttaacagctgcagatgccccaagggaacg 24118617  T
Q  218 gtgatttgccaga-tatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
    ||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24118616 gtggttggccatattatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcc 24118517  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  24118516 tgagttgcgtgcaatctca 24118498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 143 - 335
Target Start/End: Original strand, 18311414 - 18311608
Alignment:
Q  143 gaaattttgaattcacaagcacagaaacttct-gatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gattgtgatttgccagatatagttact 240  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||    
T  18311414 gaaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggagacagtggttggccagatatagttact 18311513  T
Q  241 tgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18311514 tgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctca 18311608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1674021 - 1673877
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674021 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 1673922  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaatt 155  Q
    || |||||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  1673921 tatattgaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaatt 1673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 36324421 - 36324484
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36324421 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagctt 36324484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3361469 - 3361412
Alignment:
Q  260 atttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  3361469 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcatttttgcct 3361412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3362166 - 3362109
Alignment:
Q  260 atttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  3362166 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcatttttgcct 3362109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 3362863 - 3362806
Alignment:
Q  260 atttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||    
T  3362863 atttttgcctggaccgccctttcgggttttcagtccatcgagacgctcatttttgcct 3362806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12186 - 11863
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 12087  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||    ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12086 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaag--cattcgcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 11989  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11988 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 11889  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11888 tcttgcctgagttgcatacaatctca 11863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1808 - 1482
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1808 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 1709  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1708 gtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaacttctgatgaagatggtcattaacaactgcagatgcccca 1609  T
Q  210 a-ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1608 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctca 1509  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  1508 ttcttgcctgagttgcgtgcaatctca 1482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12197 - 11872
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12197 aagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtg 12098  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12097 gtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaagtacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 11998  T
Q  210 aggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11997 aggggatggtggttggccagatatagttacttgtcttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggcccatcgagacgctcat 11898  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11897 tcttgtctgagttgtgtacaatctca 11872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 21697270 - 21697593
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697270 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 21697369  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21697370 tacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagctttagatgaaggtggtcattaacagctgcagatgccccaa 21697469  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697470 ggggacggtggttggccagatatagttacttgcc-tttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcatt 21697568  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21697569 cttgcctgagttgcgtacaatctca 21697593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 12710703 - 12711020
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710703 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 12710802  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||      
T  12710803 acacagtaatcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagacggtcattaatagctgcagatgccccaagggggacg 12710902  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710903 gtggttggccggatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 12711002  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  12711003 gagttgtatacaatctca 12711020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12592958 - 12592633
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592958 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 12592859  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  12592858 tacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaa 12592759  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592758 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcat 12592659  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  12592658 tcttgcctgatttgcgtacaatctca 12592633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40239657 - 40239332
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239657 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 40239558  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40239557 tacattgaacacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaaaatggtcattaacagctgcagataccccaa 40239458  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239457 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 40239358  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  40239357 tcttgtctgagttgtttacaatctca 40239332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3788642 - 3788317
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788642 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 3788543  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3788542 tacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgtcccaa 3788443  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788442 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 3788343  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3788342 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 3788317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 11629278 - 11629603
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629278 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 11629377  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11629378 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 11629477  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629478 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcattcttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 11629577  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  11629578 tcttgcctgagttgcatgcaatctca 11629603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27809849 - 27809524
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809849 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27809750  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  27809749 tacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagatggtcattaacagcagcagatgccccaa 27809650  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27809649 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgcacat 27809550  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27809549 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 27809524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32055950 - 32055626
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32055950 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtga 32055851  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32055850 tacattgaacacagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggttattaacagctgcagatgccccaa 32055751  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 310  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32055750 ggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcatt 32055651  T
Q  311 cttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32055650 cttgcctgagttgcgtacaatctca 32055626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 21671266 - 21671592
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21671266 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 21671365  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21671366 gtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 21671465  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21671466 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 21671565  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  21671566 ttcttgcctgagttgtgttcaatctca 21671592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 37679986 - 37680312
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37679986 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 37680085  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37680086 gtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 37680185  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37680186 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 37680285  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  37680286 ttcttgcctgagttgtgttcaatctca 37680312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 37695251 - 37695577
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37695251 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 37695350  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37695351 gtacattgaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 37695450  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37695451 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 37695550  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||    
T  37695551 ttcttgcctgagttgtgttcaatctca 37695577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 16823431 - 16823759
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823431 aagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16823530  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccc- 208  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16823531 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccc 16823630  T
Q  209 --aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 306  Q
      | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16823631 caagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 16823730  T
Q  307 cattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16823731 cattcttgcctgagttgtttacaatctca 16823759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16898049 - 16897721
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16898049 aagcacagtctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16897950  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccc- 208  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16897949 tacattgaacacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaagctttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccc 16897850  T
Q  209 --aaggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 306  Q
      | |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16897849 caagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgct 16897750  T
Q  307 cattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16897749 cattcttgcctgagttgtttacaatctca 16897721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27782380 - 27782055
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27782380 aagcaacggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27782281  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  27782280 tacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 27782181  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27782180 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 27782081  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27782080 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 27782055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34160984 - 34160667
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160984 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 34160885  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  34160884 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 34160785  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160784 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 34160685  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  34160684 gagttgtgtacaatctca 34160667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34867831 - 34867506
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867831 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 34867732  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||   || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  34867731 tacattgaacacagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaagtgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 34867632  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34867631 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcat 34867532  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  34867531 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 34867506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37931520 - 37931195
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931520 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 37931421  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||    
T  37931420 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagataggcattaacagctgcagatgctccaa 37931321  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931320 gggagacggtggttgactagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 37931221  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  37931220 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 37931195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 13930640 - 13930965
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930640 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 13930739  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  13930740 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaa 13930839  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13930840 gggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttctgggttttcggctcatcgagacgctcat 13930939  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  13930940 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 13930965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16167626 - 16167301
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167626 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 16167527  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||   |||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  16167526 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttatatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaa 16167427  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167426 gggggacggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 16167327  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  16167326 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 16167301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12661679 - 12661362
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661679 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 12661580  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-gatt 217  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  12661579 acacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggagacg 12661480  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12661479 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaatcgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcct 12661380  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  12661379 gagttgtgtacaatctca 12661362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 22922239 - 22922564
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922239 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 22922338  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22922339 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 22922438  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922439 gggagacggtggttgaccagatatagttacttgccttctgtttcaatctcattcttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 22922538  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  22922539 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 22922564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27122673 - 27122348
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122673 aagcaaaggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27122574  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  27122573 tacattgaacacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaa 27122474  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122473 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 27122374  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27122373 tcttgcctgagttgcgtgcaatctca 27122348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27396471 - 27396146
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27396471 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtgg 27396372  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27396371 tacattgaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 27396272  T
Q  211 ggggattgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    |||||| ||| ||||||||||| | | | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27396271 ggggatggtggtttgccagatacaatcatttgtcttttcatttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcggattttcggctcatcgagacgctcat 27396172  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  27396171 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 27396146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 27428540 - 27428865
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428540 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 27428639  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||| |  |  || ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  27428640 tacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaactcacaagcataagagtttttgatgaagatggtcattaccagctgcagatgccccaa 27428739  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27428740 gggggacggtggttggccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 27428839  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27428840 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 27428865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28888427 - 28888102
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888427 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 28888328  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| |||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||| |  | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  28888327 tacattgaacacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagattgtcattaacagctgcagatgccccaa 28888228  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888227 gggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 28888128  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  28888127 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 28888102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 37945960 - 37946285
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945960 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 37946059  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | |||||||||||    
T  37946060 tatattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaa 37946159  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37946160 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcgt 37946259  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  37946260 tcttgcctgatttgcgtacaatctca 37946285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 34269023 - 34269339
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269023 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattga 34269122  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    |||||  |||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||  | | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  34269123 acacaacaatcatgacatttcctagaaactttgaattcacaagcatgggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 34269222  T
Q  219 tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 318  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34269223 tggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 34269322  T
Q  319 agttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||    
T  34269323 agttgcgtacaatctca 34269339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 19410580 - 19410906
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410580 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 19410679  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||   ||| ||||| |||||||   | ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19410680 tacattgaacacagtaatcattacatttcccaaaaactttgatttcacaaatgcggaagcttcagatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 19410779  T
Q  211 --ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
      |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19410780 ggggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcattctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctca 19410879  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||    
T  19410880 ttcttgcctgagttgtatacaatctca 19410906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37383818 - 37383500
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37383818 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 37383719  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  37383718 aacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggggac 37383619  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383618 ggtggttggccagatatagttacttgcctttggtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 37383519  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  37383518 tgagttgcgttcaatctca 37383500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34297296 - 34296980
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297296 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 34297197  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    ||||||||||||   ||| |||| |||| ||||||||| ||||||    | ||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  34297196 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagcatgagagcttttgatgaaaatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 34297097  T
Q  219 tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 318  Q
    || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297096 tggttggccagatataattacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 34296997  T
Q  319 agttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||| ||||||||    
T  34296996 agttgcgtgcaatctca 34296980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 254746 - 255071
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254746 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 254845  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  |||||  || || | |||||||||||    
T  254846 tacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcgacggcagcagatgccccaa 254945  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  254946 gggggacggtggctggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttctgggttttcgattcatcgagacgctcat 255045  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  255046 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 255071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 9344089 - 9344406
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344089 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 9344188  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| |||||      
T  9344189 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacg 9344288  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344289 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 9344388  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  9344389 gagttgtgtacaatctca 9344406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39896209 - 39895891
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896209 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 39896110  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    |||||||||||| | |||||||   |||  ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |     
T  39896109 acacagtaatcattacatttccccaaaaactttgaattctcaagtacagaagcttcagatgacgatggtcattaacagctgcagatgtcccaagggggac 39896010  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896009 ggtggttagccagatatagttacttgcctcttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccctccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 39895910  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39895909 tgagttgcgtacaatctca 39895891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 19450529 - 19450846
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19450529 gctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattga 19450628  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    |||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19450629 acacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggatgg 19450728  T
Q  219 tgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    || ||||||||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19450729 tggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggcccatcgagacgctcattcttgcct 19450828  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  19450829 gagttgcgtacaacctca 19450846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 23122666 - 23122992
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23122666 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 23122765  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
     |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  23122766 atacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 23122865  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122866 agggggacggtggttggctagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 23122965  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||    
T  23122966 ttcttgcctgagttgcatgcaatctca 23122992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31882427 - 31882110
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31882427 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattga 31882328  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| |||||      
T  31882327 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacg 31882228  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31882227 gtggttagccaggtatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 31882128  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| |||||||||||    
T  31882127 gagttgtgtacaatctca 31882110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20844061 - 20843736
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20844061 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 20843962  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20843961 gtacattgaacacagcaatcattacatttcctaggaactttgaattcgcaagcgtagag-cttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccca 20843863  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  20843862 agggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggtttttggttcatcgagacgctca 20843763  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20843762 ttcttgcctgagttgtgtacaatctca 20843736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 39045924 - 39046241
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39045924 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattga 39046023  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||  || | |||  ||||||||  ||||| ||| || | ||||||||||| |||||      
T  39046024 acacagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagctttagatgaagatagtcatcaacggcagcagatgccccaagggggacg 39046123  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39046124 gtggttggccagatacagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcct 39046223  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  39046224 gagttgcgtgcaatctca 39046241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 335
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887912
Alignment:
Q  106 ggtggtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgc 31887781  T
Q  206 cccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacg 304  Q
    ||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  31887782 cccaagggggacggtggttagccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttctgggttttcgattcatcgagacg 31887881  T
Q  305 ctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31887882 ctcattcttgcctgagttgcatacaatctca 31887912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27821974 - 27821812
Alignment:
Q  174 tgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 272  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27821974 tgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaa 27821875  T
Q  273 ccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27821874 ccgcccttccgggttttcgattcatcgagacgctcattcttgcctgagttgtgtacaatctca 27821812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Original strand, 31868879 - 31868979
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31868879 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtgg 31868978  T
Q  111 t 111  Q
    |    
T  31868979 t 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15719 - 15394
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719 aagcaaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 15620  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||    
T  15619 tacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaa 15520  T
Q  211 -ggggattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
     |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15519 gggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 15420  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  15419 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 15394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 9040 - 9357
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9040 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 9139  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagg-ggatt 217  Q
    ||||||||||||   |||||||   ||| ||||||||| |||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||      
T  9140 acacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcataagagcttttgatgaagacggtcattaacagctgcagatgccccaaggaggacg 9239  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9240 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 9339  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9340 gagttgcgtacaatctca 9357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 9753 - 10069
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9753 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattga 9852  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggattg 218  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |    
T  9853 acacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaagggaacgg 9952  T
Q  219 tgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 318  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9953 tggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctg 10052  T
Q  319 agttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||| |||||||||||    
T  10053 agttgtgtacaatctca 10069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14092 - 13774
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14092 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 13993  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  13992 aacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggac 13893  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13892 ggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 13793  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13792 tgagttgcgtacaatctca 13774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 519 - 202
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  519 gctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 420  T
Q  119 acacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa-ggggatt 217  Q
    |||| |||| |||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||      
T  419 acacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatgaagataggcattaacagctgcagatgccccaagggggacg 320  T
Q  218 gtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcct 317  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  319 gtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggttcatcgagacgctcattcttgcct 220  T
Q  318 gagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||    
T  219 gagttgcgtacaatctca 202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10064 - 9739
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgg 110  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10064 aagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtga 9965  T
Q  111 tacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaa 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9964 tacattgaacacagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaa 9865  T
Q  211 ggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 309  Q
    ||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9864 gggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcat 9765  T
Q  310 tcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  9764 tcttgcctgagttgtgtacaatctca 9739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33448 - 33122
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33448 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 33349  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
     |||||||||||||  ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||| ||   ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  33348 atacattgaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcataggggcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 33249  T
Q  210 agggg-attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    ||||| |  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33248 agggggacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatggaccgccctttcgggttttcggttcatcgagacgctca 33149  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33148 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 33122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25259 - 24941
Alignment:
Q  17 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25259 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacatt 25160  T
Q  117 gaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggat 216  Q
    |||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25159 gaacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 25060  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgcctttt-gtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 315  Q
     ||| ||||||||||| ||| | ||| |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25059 ggtggtttgccagatacagtcatttgtcttttcatttcaatctcattttagc-tgaaccgccctttcgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgc 24961  T
Q  316 ctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24960 ctgagttgcgtacaatctca 24941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18728 - 18410
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18728 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18629  T
Q  118 aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaagggg-at 216  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |     
T  18628 aacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgtagatgccccaagggggac 18529  T
Q  217 tgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 316  Q
     ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18528 ggtggttggtcagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttcagggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcc 18429  T
Q  317 tgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  18428 tgagttgtgtacaatctca 18410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6217 - 5891
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6217 aagcacaggctcaatatgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtg 6118  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6117 gtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 6018  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6017 agggagacggtggttggccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggttcattgagacgctca 5918  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5917 ttcttgcctgagttgcgtgcaatctca 5891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 335
Target Start/End: Original strand, 4716 - 5037
Alignment:
Q  19 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4716 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacatt 4815  T
Q  117 gaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggg-ga 215  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  4816 gaacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagcataggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgccccaagggaga 4915  T
Q  216 ttgtgatttgccagatatagttacttgcc-ttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgccctt-ccgggttttcggctcatcgagacgctcattctt 313  Q
      ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4916 cggtggttggccagacatagttacttgcctttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttcccgggttttcggttcatcgagacgctcattctt 5015  T
Q  314 gcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  5016 gcctgagttgtgtacaatctca 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Original strand, 25005 - 25331
Alignment:
Q  11 aagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtg 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25005 aagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtg 25104  T
Q  110 gtacattgaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgcccca 209  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||  |||||  || | ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  25105 gtacattgaacccagcaatcattacatttcctagaaactttgaatttgcaagcgtaggagcttttgatgaagatagtcattaacagctgcagatgcccca 25204  T
Q  210 aggg-gattgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctca 308  Q
    |||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25205 agggagacggtggttggccagatatagttacttgcctttcgtttctatctcatttttgcatgaaccgcccttccgagttttcggctcatcgagacactca 25304  T
Q  309 ttcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||    
T  25305 ttcttgcctgagttgcatgcaatctca 25331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26458
Alignment:
Q  17 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  117 gaacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatgaagacggtcattaacagctggagatgccccaaggggat 216  Q
    || ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatgaagatggtcattaacagctgcagatgccccaaggggat 26442  T
Q  217 tgtgatttgccagata 232  Q
     ||| ||||| |||||    
T  26443 ggtggtttgctagata 26458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 313
Target Start/End: Original strand, 40759 - 41068
Alignment:
Q  23 aaattgatgtataagagtggtggtc-agccaaaggcatgactcc-acggattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-att 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40759 aaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaatt 40858  T
Q  117 g-aacacagtaatcacttcatttcctggaaattttgaa-ttcacaagcacagaaac-ttctgatgaagacggtcattaacagctggagatg-ccccaagg 212  Q
    | ||||||  ||||| | |||||||| |||| |||||| ||| | |||| || | | || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40859 gaaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatttcgcgagcataggagctttttgatgaagatggtcattaacagctgcagatgcccccaagg 40958  T
Q  213 gg---attgtgatttgccagatatagttacttgccttttgtttcaatctc-atttttg-catgaaccgcccttccggg--ttttcggct--catcgagac 303  Q
    ||      ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||    
T  40959 ggggacgggtggttggccagatatagttacttgcctctcgtttcaatctctatttttgtcatgaaccgcccttccggggtttttcggcttcgatcgagac 41058  T
Q  304 gctcattctt 313  Q
    ||||||||||    
T  41059 gctcattctt 41068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Original strand, 20512 - 20622
Alignment:
Q  225 gccagatatagttacttgccttttgtttcaatctcatttttgcatgaaccgcccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgc 324  Q
    |||| |||||||||||||||| | || ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20512 gccaaatatagttacttgcctgtggtgtcaatctcaatttggcatgacccccccttccgggttttcggctcatcgagacgctcattctttcctgagtcgc 20611  T
Q  325 gtacaatctca 335  Q
    |||||||||||    
T  20612 gtacaatctca 20622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11934 - 11855
Alignment:
Q  258 tcatttttg-catgaaccgcccttccgggttttcgg-ctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11934 tcatttttgtcatgaaccgccctttcgggttttcggtctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 11855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 351 - 309
Alignment:
Q  293 ctcatcgagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351 ctcatcaagacgctcattcttgcctgagttgcgtacaatctca 309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University