View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3704_1D_low_24 (Length: 247)

Name: NF3704_1D_low_24
Description: NF3704_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3704_1D_low_24
NF3704_1D_low_24
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (18-233)||(123369-123584)
scaffold0029 (19-61)||(77391-77433)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (18-233)||(9582893-9583108)
chr7 (18-233)||(16119849-16120064)
chr7 (22-233)||(23515067-23515278)
chr7 (18-233)||(14551098-14551314)
chr7 (18-233)||(8717865-8718080)
chr7 (18-233)||(13673856-13674071)
chr7 (18-233)||(18593352-18593567)
chr7 (18-233)||(18618117-18618332)
chr7 (18-226)||(4312564-4312772)
chr7 (18-226)||(538755-538964)
chr7 (18-226)||(12567020-12567229)
chr7 (18-225)||(12548805-12549012)
chr7 (18-226)||(8780936-8781146)
chr7 (20-226)||(9003958-9004165)
chr7 (18-226)||(20108375-20108584)
chr7 (19-225)||(48801777-48801983)
chr7 (18-223)||(9264939-9265145)
chr7 (18-226)||(13657873-13658081)
chr7 (18-226)||(11921307-11921512)
chr7 (18-226)||(16532100-16532311)
chr7 (18-226)||(16633351-16633562)
chr7 (18-226)||(16465616-16465821)
chr7 (18-69)||(825788-825839)
chr7 (18-69)||(14221718-14221769)
chr7 (18-69)||(15916776-15916827)
chr7 (18-69)||(18287766-18287817)
chr7 (18-69)||(27291501-27291552)
chr7 (18-71)||(4461242-4461295)
chr7 (18-67)||(15065935-15065984)
chr7 (18-69)||(5397280-5397331)
chr7 (18-73)||(9194544-9194599)
chr7 (18-69)||(15206584-15206635)
chr7 (22-71)||(6713072-6713121)
chr7 (19-69)||(4791383-4791433)
chr7 (19-71)||(15348535-15348587)
chr7 (34-71)||(15522520-15522557)
chr7 (19-61)||(15940731-15940773)
chr7 (145-226)||(15065779-15065858)
chr7 (145-226)||(18287612-18287691)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (18-233)||(15699555-15699770)
chr6 (18-233)||(22165549-22165764)
chr6 (18-233)||(22243812-22244027)
chr6 (18-233)||(22061503-22061718)
chr6 (18-226)||(24855245-24855453)
chr6 (18-233)||(22767116-22767331)
chr6 (18-233)||(20170242-20170458)
chr6 (18-226)||(18448140-18448349)
chr6 (18-226)||(23023093-23023302)
chr6 (18-218)||(18854026-18854226)
chr6 (22-226)||(20107784-20107989)
chr6 (18-226)||(25625691-25625899)
chr6 (18-223)||(2181063-2181269)
chr6 (18-226)||(21560554-21560762)
chr6 (18-226)||(25631269-25631477)
chr6 (18-225)||(29595697-29595904)
chr6 (18-226)||(25963248-25963457)
chr6 (18-226)||(25967895-25968104)
chr6 (18-221)||(30671807-30672011)
chr6 (98-226)||(19585622-19585750)
chr6 (129-232)||(20016339-20016443)
chr6 (18-87)||(18184874-18184943)
chr6 (18-69)||(35270977-35271028)
chr6 (18-69)||(11204009-11204060)
chr6 (18-69)||(18731880-18731931)
chr6 (18-81)||(20218981-20219044)
chr6 (18-81)||(22113006-22113069)
chr6 (22-69)||(23517835-23517882)
chr6 (18-71)||(29686604-29686657)
chr6 (186-226)||(29686449-29686489)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (18-233)||(20595831-20596046)
chr5 (18-233)||(20602117-20602332)
chr5 (18-233)||(20608408-20608623)
chr5 (18-233)||(15735534-15735749)
chr5 (43-233)||(23710701-23710892)
chr5 (18-233)||(23748051-23748266)
chr5 (18-226)||(24940540-24940749)
chr5 (18-233)||(18072900-18073115)
chr5 (18-233)||(24953174-24953389)
chr5 (36-225)||(20622170-20622359)
chr5 (18-233)||(20790714-20790929)
chr5 (22-226)||(20444843-20445048)
chr5 (18-226)||(23600636-23600845)
chr5 (18-226)||(24219752-24219961)
chr5 (18-212)||(21387410-21387605)
chr5 (18-222)||(20916456-20916660)
chr5 (148-226)||(22948518-22948596)
chr5 (102-225)||(20575510-20575633)
chr5 (18-69)||(22317513-22317564)
chr5 (18-69)||(25006808-25006859)
chr5 (18-69)||(30759655-30759706)
chr5 (18-68)||(25116171-25116221)
chr5 (18-69)||(18484212-18484263)
chr5 (18-69)||(26847808-26847859)
chr5 (18-63)||(25175261-25175306)
chr5 (22-69)||(22855728-22855775)
chr5 (19-63)||(27270563-27270607)
chr5 (145-226)||(22317639-22317719)
chr5 (19-67)||(17412736-17412784)
chr5 (145-226)||(22855572-22855651)
chr5 (145-225)||(25006934-25007012)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (18-233)||(11496614-11496829)
chr4 (18-233)||(13822913-13823128)
chr4 (18-227)||(42709731-42709940)
chr4 (18-232)||(15254349-15254563)
chr4 (18-225)||(10630758-10630965)
chr4 (18-226)||(3354646-3354855)
chr4 (18-225)||(18291945-18292153)
chr4 (18-225)||(17484910-17485118)
chr4 (18-226)||(18081459-18081669)
chr4 (18-226)||(45234232-45234441)
chr4 (18-225)||(38426745-38426938)
chr4 (18-225)||(56580539-56580748)
chr4 (148-223)||(8092559-8092634)
chr4 (18-69)||(14653998-14654049)
chr4 (20-69)||(15865652-15865701)
chr4 (18-69)||(10650552-10650603)
chr4 (18-69)||(15260109-15260160)
chr4 (18-69)||(15409534-15409585)
chr4 (18-69)||(16682918-16682969)
chr4 (18-68)||(9488878-9488928)
chr4 (19-67)||(17296250-17296298)
chr4 (18-78)||(8092427-8092487)
chr4 (145-224)||(15260235-15260312)
chr4 (186-226)||(12515042-12515081)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (18-233)||(10602472-10602687)
chr3 (18-233)||(13504881-13505096)
chr3 (18-233)||(11947407-11947622)
chr3 (18-233)||(16448760-16448975)
chr3 (18-233)||(9360971-9361186)
chr3 (18-233)||(7600355-7600570)
chr3 (18-233)||(15556942-15557157)
chr3 (18-233)||(16373565-16373780)
chr3 (18-233)||(12187076-12187291)
chr3 (18-233)||(37942378-37942593)
chr3 (19-225)||(12193491-12193697)
chr3 (22-233)||(6814868-6815079)
chr3 (18-233)||(10147011-10147226)
chr3 (18-233)||(15645001-15645216)
chr3 (18-233)||(10160173-10160388)
chr3 (19-233)||(13187418-13187632)
chr3 (19-225)||(3245589-3245795)
chr3 (18-225)||(2721305-2721511)
chr3 (18-226)||(4382751-4382961)
chr3 (18-225)||(13001425-13001634)
chr3 (18-226)||(13097711-13097919)
chr3 (18-226)||(10546936-10547148)
chr3 (18-226)||(11398215-11398424)
chr3 (18-226)||(20156515-20156722)
chr3 (18-226)||(1992803-1993011)
chr3 (18-226)||(13690608-13690816)
chr3 (18-226)||(14348588-14348797)
chr3 (18-223)||(22637702-22637908)
chr3 (18-225)||(3279191-3279399)
chr3 (18-223)||(17387839-17388045)
chr3 (18-226)||(12160207-12160416)
chr3 (135-233)||(16655798-16655897)
chr3 (26-233)||(17045697-17045902)
chr3 (26-233)||(17047857-17048062)
chr3 (18-71)||(27356728-27356781)
chr3 (18-69)||(3339226-3339277)
chr3 (18-69)||(12776534-12776585)
chr3 (18-69)||(13136210-13136261)
chr3 (18-69)||(15946773-15946824)
chr3 (18-69)||(20584267-20584318)
chr3 (18-71)||(13601224-13601277)
chr3 (18-69)||(14445768-14445819)
chr3 (18-69)||(15619283-15619334)
chr3 (18-69)||(13195458-13195509)
chr3 (18-71)||(8686387-8686440)
chr3 (18-226)||(20225754-20225960)
chr3 (18-69)||(13068306-13068357)
chr3 (18-49)||(2005499-2005530)
chr3 (186-233)||(13601062-13601108)
chr3 (145-226)||(12776660-12776739)
chr3 (145-226)||(15946619-15946698)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (18-233)||(22665062-22665277)
chr2 (18-233)||(117543-117758)
chr2 (18-233)||(22044660-22044875)
chr2 (18-233)||(25357511-25357726)
chr2 (18-226)||(11615-11823)
chr2 (18-233)||(16775651-16775866)
chr2 (18-233)||(17590407-17590622)
chr2 (18-233)||(24795285-24795500)
chr2 (18-233)||(27627580-27627796)
chr2 (18-226)||(25144757-25144966)
chr2 (18-225)||(5500265-5500473)
chr2 (18-226)||(25804267-25804475)
chr2 (18-225)||(23798922-23799129)
chr2 (23-224)||(25370890-25371091)
chr2 (18-226)||(23643950-23644160)
chr2 (98-226)||(24502168-24502297)
chr2 (18-172)||(24178193-24178348)
chr2 (18-81)||(24171498-24171561)
chr2 (18-69)||(23159385-23159436)
chr2 (18-69)||(23570642-23570693)
chr2 (18-69)||(27631660-27631711)
chr2 (18-69)||(27768816-27768867)
chr2 (18-87)||(25337651-25337720)
chr2 (18-87)||(24506796-24506865)
chr2 (22-87)||(24321314-24321380)
chr2 (18-71)||(23257570-23257622)
chr2 (145-226)||(27631506-27631585)
chr2 (19-64)||(29955868-29955913)
chr2 (19-63)||(19805618-19805662)
chr2 (19-67)||(21512567-21512615)
chr2 (19-61)||(17334606-17334648)
chr2 (37-79)||(23648123-23648165)
chr2 (186-226)||(15532753-15532792)
chr2 (19-71)||(24019068-24019120)
chr2 (186-226)||(24019228-24019267)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (18-233)||(15678-15893)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (18-233)||(27046874-27047089)
chr1 (18-233)||(17094601-17094816)
chr1 (18-233)||(20237456-20237671)
chr1 (18-233)||(21798662-21798878)
chr1 (22-223)||(8653126-8653327)
chr1 (18-226)||(52938621-52938830)
chr1 (18-226)||(3989944-3990154)
chr1 (18-219)||(19364043-19364244)
chr1 (18-106)||(14070632-14070720)
chr1 (22-76)||(19875648-19875702)
chr1 (18-69)||(21784472-21784523)
chr1 (18-69)||(4027844-4027895)
chr1 (21-71)||(16382578-16382628)
chr1 (18-69)||(8947515-8947566)
chr1 (145-225)||(21784598-21784677)
chr1 (19-61)||(18478234-18478276)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (18-233)||(21382093-21382309)
chr8 (18-233)||(21098794-21099009)
chr8 (18-233)||(21104115-21104330)
chr8 (18-233)||(23911441-23911655)
chr8 (18-233)||(8314467-8314683)
chr8 (18-233)||(8322846-8323062)
chr8 (18-226)||(21843524-21843733)
chr8 (18-226)||(21939996-21940206)
chr8 (18-226)||(20038981-20039189)
chr8 (18-225)||(23454945-23455154)
chr8 (18-225)||(17620755-17620961)
chr8 (18-226)||(16418620-16418830)
chr8 (18-197)||(24034049-24034230)
chr8 (29-225)||(14352181-14352378)
chr8 (18-207)||(21538573-21538765)
chr8 (18-129)||(20712537-20712649)
chr8 (18-69)||(11346953-11347004)
chr8 (18-69)||(19767689-19767740)
chr8 (18-69)||(20002279-20002330)
chr8 (18-69)||(22370107-22370158)
chr8 (18-69)||(21831181-21831232)
chr8 (18-69)||(22033555-22033606)
chr8 (18-69)||(22099655-22099706)
chr8 (18-69)||(22102557-22102608)
chr8 (157-226)||(20712470-20712539)
chr8 (18-69)||(22817755-22817806)
chr8 (19-67)||(18572977-18573025)
chr8 (19-61)||(19902174-19902216)
chr8 (145-226)||(22102403-22102482)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (18-233)||(615-831)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (18-233)||(1038-1253)
scaffold0404 (18-81)||(3461-3524)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (18-226)||(220-428)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (18-223)||(2852-3058)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (18-226)||(251870-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (18-218)||(11064-11264)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (18-226)||(2287-2496)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (18-226)||(831-1041)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (18-225)||(14662-14869)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (18-223)||(482-687)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (18-226)||(7941-8149)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (18-225)||(120954-121162)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (18-226)||(510-718)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (18-176)||(164403-164562)
scaffold0011 (19-87)||(172248-172316)
scaffold0011 (18-69)||(162007-162058)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (18-226)||(1108-1318)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (18-226)||(58628-58838)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (18-226)||(97726-97936)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (18-136)||(10206-10325)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (18-223)||(13002-13207)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (18-223)||(35104-35307)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (18-165)||(8720-8869)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (20-179)||(12450-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (20-179)||(232789-232948)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (18-119)||(38508-38610)
scaffold0096 (148-198)||(38625-38675)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (18-226)||(5090-5295)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (18-86)||(1834-1902)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (159-226)||(2859-2926)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (18-69)||(919-970)
[»] scaffold0566 (2 HSPs)
scaffold0566 (18-69)||(2767-2818)
scaffold0566 (145-226)||(2612-2692)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (18-69)||(12743-12794)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (18-69)||(42249-42300)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (18-69)||(50506-50557)
scaffold0035 (19-61)||(88361-88403)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (18-69)||(10725-10776)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (22-69)||(22159-22206)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (18-69)||(54849-54900)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (22-224)||(37722-37922)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (19-71)||(1196-1248)
scaffold0094 (186-226)||(1041-1080)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (18-62)||(22774-22818)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (18-65)||(37743-37790)
scaffold0116 (145-225)||(37869-37948)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (18-68)||(72572-72622)
scaffold0037 (18-68)||(84762-84812)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (18-63)||(18218-18263)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (18-69)||(45228-45279)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (34-71)||(83174-83211)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (21-61)||(3251-3291)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (186-226)||(5830-5869)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 123584 - 123369
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123584 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 123485  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123484 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 123385  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  123384 gtgtgtgtgaagtcca 123369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 77391 - 77433
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 61  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  77391 atcaaactcccctacacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 77433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9583108 - 9582893
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9583108 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 9583009  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9583008 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 9582909  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  9582908 gtgtgtgtgaagtcca 9582893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 16119849 - 16120064
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119849 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacatatacatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 16119948  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119949 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 16120048  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  16120049 gtgtgtgtgaagtcca 16120064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23515278 - 23515067
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515278 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 23515179  T
Q  122 tctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515178 tctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgt 23515079  T
Q  222 gtgtgatgtcca 233  Q
    |||||| |||||    
T  23515078 gtgtgaagtcca 23515067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14551314 - 14551098
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551314 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 14551215  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaat-ttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551214 catgtcccctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaattttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 14551115  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  14551114 tgtgtgtgtgaagtcca 14551098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8718080 - 8717865
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8718080 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatagtagcaccaatagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 8717981  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8717980 catgtctcctcaagggcttaaatcccaagtgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 8717881  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  8717880 gtgtgtgtgaagtcca 8717865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13674071 - 13673856
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13674071 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 13673972  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13673971 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatcttttttctacccaacgatcaagttttaagtgagt 13673872  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  13673871 gtgtgtgtgaagtcca 13673856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 18593352 - 18593567
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  18593352 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagta 18593451  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18593452 catgtctcctcaagggcttaaatccaaaatgtacactaattacaaactcaagtatttcttggaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 18593551  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  18593552 gtgtgtgtgaagtcca 18593567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18618332 - 18618117
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  18618332 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagta 18618233  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18618232 catgtctcctcaagggcttaaatccaaaatgtacactaattacaaactcaagtatttcttggaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 18618133  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  18618132 gtgtgtgtgaagtcca 18618117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4312772 - 4312564
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    ||||| ||||||||||||||||| |     
T  4312772 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaact 4312673  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
     |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4312672 tatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 4312573  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  4312572 gtgtgtgtg 4312564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 538755 - 538964
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  538755 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 538854  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagca-tttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||| ||||| || |||  |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  538855 catgtctcctgaagggttttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttttttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 538954  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  538955 tgtgtgtgtg 538964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12567229 - 12567020
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  12567229 catcaaactcccccacacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtagaacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 12567130  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
     ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12567129 tcatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaaacatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 12567030  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  12567029 tgtgtgtgtg 12567020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 12548805 - 12549012
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    ||| |||| ||||||||| |||||||      
T  12548805 catcaaactccccaacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaataatattatcatatgacaatttaattaaat- 12548903  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12548904 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtccactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagcttcaagtgag 12549003  T
Q  217 tgtgtgtgt 225  Q
    |||||||||    
T  12549004 tgtgtgtgt 12549012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 8780936 - 8781146
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||    || || |||||||||||||||||  |    
T  8780936 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaaa 8781035  T
Q  118 c--atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    |  |||||||||||| |||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  8781036 cttatgtctcctcaaaggcttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaacctttattcaacccaacaatcaagtttcaaggta 8781135  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  8781136 gtgtgtgtgtg 8781146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9004165 - 9003958
Alignment:
Q  20 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||  | ||||| ||||||||||||||||| |      
T  9004165 tcaaactcccccacacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaacaagtttatcatatgacaattcaattaaaactt 9004066  T
Q  119 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 218  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9004065 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaattacaaactcaagcatttcttgtgatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtg 9003966  T
Q  219 tgtgtgtg 226  Q
    | ||||||    
T  9003965 tatgtgtg 9003958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20108584 - 20108375
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||    ||||| |||| |||||||||||| |    
T  20108584 catcaaactcccccacacttgaatcttttattgtcctcaagcaaaagacataaacatagtagcataaaacaaggttatcatatgagaattcaattaaaac 20108485  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
      |||||||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20108484 tgatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 20108385  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  20108384 tgtgtgtgtg 20108375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 48801777 - 48801983
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcac-aaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||   ||||||   ||||||||||||| |||     
T  48801777 atcaaactcccccacacttgaatcttttcttgtcctcaagcaaaaggcatacacatagtagcaataaacaagattatat---atgacaattcaatcaaaa 48801873  T
Q  116 cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||    
T  48801874 ctcatgtctcctcaaaggctttaatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtaaaaagtga 48801973  T
Q  216 gtgtgtgtgt 225  Q
    || |||||||    
T  48801974 gtatgtgtgt 48801983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 9264939 - 9265145
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaag-c 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || ||    || || ||||||||||||| |||  |    
T  9264939 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaggcataaacatagcagcataagcaagattaacatatgacaattcaataaaaaac 9265038  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
      |||||||||||| | |||  ||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9265039 ttatgtctcctcaaagacttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 9265138  T
Q  217 tgtgtgt 223  Q
    |||||||    
T  9265139 tgtgtgt 9265145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13658081 - 13657873
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||    ||    ||||||||| ||||||| ||    
T  13658081 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatcaacatggtagcgtaaacaagattacttcatgacaatttaattaaaaca 13657982  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||   | ||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  13657981 catatctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcccttttccacccaacaatcaagtttcaaatgagt 13657882  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  13657881 gtgtgtgtg 13657873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 11921307 - 11921512
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  |||| ||   ||| |||||||||  |||||||||    
T  11921307 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagtcataaacatggtagca-taacattt---tcacatgacaattacattaaagca 11921402  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    || |||||||||| |||||  ||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||   |||||||    
T  11921403 cacgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaacgcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatctagtcctaagtgag 11921502  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  11921503 tgtgtgtgtg 11921512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16532311 - 16532100
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||| |    | ||| |||||||||  ||||||||    
T  16532311 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattttcatatgacaattacattaaagc 16532212  T
Q  117 acatgtctcctcaagggc-ttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa-cgatcaagtttcaagtg 214  Q
    |||||||||||||| ||| || | | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||| | || ||    
T  16532211 acatgtctcctcaaaggcatttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagtatttcttataaccttttttcaacccaatcaatcaagtcttaattg 16532112  T
Q  215 agtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||    
T  16532111 agtgtgtgtgtg 16532100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 16633351 - 16633562
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||| |    | ||| |||||||||  ||||||||    
T  16633351 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattttcatatgacaattacattaaagc 16633450  T
Q  117 acatgtctcctcaagggc-ttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa-cgatcaagtttcaagtg 214  Q
    |||||||||||||| ||| || | | | ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||| | || ||    
T  16633451 acatgtctcctcaaaggcatttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagtatttcttataaccttttttcaacccaatcaatcaagtcttaattg 16633550  T
Q  215 agtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||    
T  16633551 agtgtgtgtgtg 16633562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 16465616 - 16465821
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||      || ||  ||||||| |  |||||| ||    
T  16465616 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatagtagcataa-----catttctcatgacaaatacattaaaaca 16465710  T
Q  118 catgtctcctc-aagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    || |||||||| || |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| |  || |||   ||||||    
T  16465711 cacgtctcctcaaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccatcagtctagtcctaagtga 16465810  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  16465811 gtgtgtgtgtg 16465821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 825839 - 825788
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  825839 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 825788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 14221718 - 14221769
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221718 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 14221769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 15916776 - 15916827
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916776 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15916827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18287817 - 18287766
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287817 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 18287766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27291552 - 27291501
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291552 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 27291501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Original strand, 4461242 - 4461295
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4461242 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 4461295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15065984 - 15065935
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065984 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 15065935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 5397331 - 5397280
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5397331 catcaaactcccctacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 5397280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 73
Target Start/End: Original strand, 9194544 - 9194599
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaata 73  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9194544 catcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaata 9194599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 15206584 - 15206635
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15206584 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcata 15206635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 71
Target Start/End: Original strand, 6713072 - 6713121
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713072 aaactcccctatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 6713121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 69
Target Start/End: Original strand, 4791383 - 4791433
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4791383 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcagaatgcata 4791433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15348587 - 15348535
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15348587 atcaaacttccccaaacttgaatctttgtttgtcctcaagtaaaaggcataaa 15348535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15522557 - 15522520
Alignment:
Q  34 acttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15522557 acttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaa 15522520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15940773 - 15940731
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 61  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15940773 atcaaactcccctacacttgaaccgttgcttgtcctcaagcaa 15940731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15065858 - 15065779
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||    
T  15065858 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatctcaagtgagtgtgtgtgtg 15065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18287691 - 18287612
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||    
T  18287691 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtctgtgtg 18287612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15699770 - 15699555
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699770 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 15699671  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699670 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15699571  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  15699570 gtgtgtgtgaagtcca 15699555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 22165549 - 22165764
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165549 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22165648  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165649 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22165748  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  22165749 gtgtgtgtgaagtcca 22165764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22244027 - 22243812
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22244027 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22243928  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243927 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22243828  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  22243827 gtgtgtgtgaagtcca 22243812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 22061503 - 22061718
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061503 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22061602  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061603 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22061702  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  22061703 gtgtgtgtgaagtcca 22061718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 24855245 - 24855453
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24855245 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 24855343  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24855344 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 24855443  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  24855444 tgtgtgtgtg 24855453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 22767116 - 22767331
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22767116 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtaacatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 22767214  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22767215 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 22767314  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
     |||||||||| |||||    
T  22767315 agtgtgtgtgaagtcca 22767331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20170458 - 20170242
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagtt-atatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  20170458 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagtttaaatcaaatgacaatt-aattaaagc 20170360  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20170359 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtga 20170260  T
Q  216 gtgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||||| |||||    
T  20170259 gtgtgtgtgtgaagtcca 20170242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18448349 - 18448140
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  18448349 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacttggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 18448250  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||  |||||||||||||||     
T  18448249 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcatcccaacagtcaagtttcaagtgac 18448150  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  18448149 tgtgtgtgtg 18448140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23023302 - 23023093
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||| || ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  23023302 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagtcttaaacatggtagcataagacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 23023203  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23023202 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 23023103  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    |||| |||||    
T  23023102 tgtgcgtgtg 23023093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18854226 - 18854026
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  18854226 catcaaactcccccatacttgaatcttttcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaataca 18854127  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18854126 catgtctcctcaagggctttaatttccagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 18854027  T
Q  218 g 218  Q
    |    
T  18854026 g 18854026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 20107784 - 20107989
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaaca-gttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcaca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | || | || |||||||||||||| ||| |  |    
T  20107784 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagataaa-catatgacaattcaattgaaaactta 20107882  T
Q  120 tgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgt 219  Q
    ||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20107883 tgtctcctcaaaggctttcatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgt 20107982  T
Q  220 gtgtgtg 226  Q
    |||||||    
T  20107983 gtgtgtg 20107989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25625899 - 25625691
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  25625899 catcaaactcccccatacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggtgtaaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 25625800  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
     ||||||||| |||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25625799 tatgtctccttaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 25625700  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  25625699 gtgtgtgtg 25625691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2181269 - 2181063
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcac-aaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  2181269 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 2181170  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |  | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  2181169 acatgtctcctcaagggcttaaatttcgagcgcacattaatcacaaacttaagcatttctcgtaatccttattcaactcaacaaccaagtttcaagtgag 2181070  T
Q  217 tgtgtgt 223  Q
    |||||||    
T  2181069 tgtgtgt 2181063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 21560554 - 21560762
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    ||    ||| ||||| ||||||| ||    
T  21560554 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgtcaatttaattaaaaca 21560653  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  21560654 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 21560753  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  21560754 gtgtgtgtg 21560762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 25631269 - 25631477
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcac-aaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || ||||||  |||||   ||||||   |||||||||||||||||    
T  25631269 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaggaaaaatgcataaacatggtagcaataaacaagattatat---atgacaattcaattaaa 25631365  T
Q  115 gcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtg 214  Q
     |  || |||| |||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25631366 acttatatctcttcaaaggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtg 25631465  T
Q  215 agtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||    
T  25631466 agtgtgtgtgtg 25631477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29595904 - 29595697
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |    ||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  29595904 catcaaactccctcacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaagcataaacatggtagcataaataagattatcacatgacgatttaattaaaaca 29595805  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  29595804 catgtctccccaagggctttaatttcaagtgtacactaataaaaaactcaaacatttcttgtaatcctttttcaacccaataatcaagtttcaaatgact 29595705  T
Q  218 gtgtgtgt 225  Q
    ||||||||    
T  29595704 gtgtgtgt 29595697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25963457 - 25963248
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaac-agttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||   || || |||||||||||||||||      
T  25963457 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaat 25963358  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
       ||||||||||| |||||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  25963357 ttgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcctttaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 25963258  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  25963257 tgtgtgtgtg 25963248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25968104 - 25967895
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaac-agttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||   || || |||||||||||||||||      
T  25968104 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaat 25968005  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
       ||||||||||| |||||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  25968004 ttgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcctttaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 25967905  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  25967904 tgtgtgtgtg 25967895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 30671807 - 30672011
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaac-agttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | ||   || || |||||||||||||||||      
T  30671807 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagtagcataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaat 30671906  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
       ||| ||| ||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||    
T  30671907 ttgtgtttccccaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaattgag 30672006  T
Q  217 tgtgt 221  Q
    |||||    
T  30672007 tgtgt 30672011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Original strand, 19585622 - 19585750
Alignment:
Q  98 atgacaattcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa 197  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||  ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19585622 atgacaatacaattaaaactcatgtctcctaaaaggcttttatttcaaacgtacactaatcacaaacacaagcatttcttgtaatctttattcaacccaa 19585721  T
Q  198 cgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    | ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19585722 caatcaagttttaagtgagtgtgtatgtg 19585750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 232
Target Start/End: Original strand, 20016339 - 20016443
Alignment:
Q  129 aagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtga 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016339 aagggcttaaatcccaaaatgtacactaattgcaaactcaagtatttcttgaaatctttattctatccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtga 20016438  T
Q  228 tgtcc 232  Q
     ||||    
T  20016439 agtcc 20016443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Original strand, 18184874 - 18184943
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaaca 87  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  18184874 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaca 18184943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 35271028 - 35270977
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35271028 catcaaacacccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 35270977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11204060 - 11204009
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11204060 catcaaactcccccacacttaaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 11204009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18731931 - 18731880
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18731931 catcaaactcctccacacttgaatcttagcttgtcctcaagcaaaaggcata 18731880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 20218981 - 20219044
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20218981 catcaaactcccccacacatgaatctttgcttctcttcaagcaaaaggcataaacatagcagca 20219044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 22113006 - 22113069
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22113006 catcaaactcccccacacatgaatctttgcttctcttcaagcaaaaggcataaacatagcagca 22113069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Original strand, 23517835 - 23517882
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23517835 aaactcccccatacttgaatctttgcttatcctcaagcaaaaggcata 23517882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 29686657 - 29686604
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29686657 catcaaactctcccatacttgaatcttttcttgtcctcaagcaagaggcataaa 29686604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29686489 - 29686449
Alignment:
Q  186 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  29686489 tattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagtgtgtgtgtg 29686449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 20595831 - 20596046
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595831 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 20595930  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595931 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 20596030  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  20596031 gtgtgtgtgaagtcca 20596046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 20602117 - 20602332
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602117 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 20602216  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602217 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 20602316  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  20602317 gtgtgtgtgaagtcca 20602332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 20608408 - 20608623
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608408 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacggttatatcaaatgacaattcaattaaagca 20608507  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608508 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 20608607  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  20608608 gtgtgtgtgaagtcca 20608623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15735749 - 15735534
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735749 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 15735650  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735649 catgtctcctcaagggcttaaatcccaagtgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15735550  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  15735549 gtgtgtgtgaagtcca 15735534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Original strand, 23710701 - 23710892
Alignment:
Q  43 tttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaatt-caattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatc 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710701 tttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcactaacagttatatcaaatgacaatttcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatc 23710800  T
Q  142 ccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23710801 ccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttatttaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 23710892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23748266 - 23748051
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23748266 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagca 23748167  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23748166 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 23748067  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  23748066 gtgtgtgtgaagtcca 23748051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24940749 - 24940540
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24940749 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 24940650  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24940649 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtaaactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgag 24940550  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    || |||||||    
T  24940549 tgagtgtgtg 24940540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18073115 - 18072900
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18073115 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaa-tcaattaaagca 18073017  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  18073016 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaattaagtttcaagtgag 18072917  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  18072916 tgtgtgtgtgaagtcca 18072900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 24953174 - 24953389
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24953174 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggtataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 24953272  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24953273 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 24953372  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  24953373 tgtgtgtgtgaagtcca 24953389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20622359 - 20622170
Alignment:
Q  36 ttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcacatgtctcctcaagggct 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622359 ttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacaattaaatcaaatgacaatttaattaaagcacatgtctcctcaagggct 20622260  T
Q  136 taaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20622259 taaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagtgtgtgtgt 20622170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 20790714 - 20790929
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20790714 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagca 20790812  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||    
T  20790813 catgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacctaacaatcaagtttcaagcgag 20790912  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20790913 tgtgtgtgtgaagtcca 20790929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 20444843 - 20445048
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagcacat 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  20444843 aaactcccccacacttgaatctttgattgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcacaaaataatattatcatatgacaatttaattaaaacacat 20444942  T
Q  121 gtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 220  Q
    |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20444943 gtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaactttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtg 20445042  T
Q  221 tgtgtg 226  Q
    ||||||    
T  20445043 tgtgtg 20445048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 23600636 - 23600845
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||| | |    
T  23600636 catcaaattcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattagaac 23600735  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23600736 acatgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 23600835  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  23600836 tgtgtgtgtg 23600845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24219961 - 24219752
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  24219961 catcaaactcccccacacttgagtctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 24219862  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24219861 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 24219762  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  24219761 tgtgtgtgtg 24219752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21387605 - 21387410
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||    || || |||||||||||||| ||| |    
T  21387605 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaatgcataaacatagcagcacacacaagactaacatatgacaattcaattgaaaac 21387506  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaag 212  Q
      |||||||||||| | |||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21387505 ttatgtctcctcaaagactttcatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaag 21387410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Original strand, 20916456 - 20916660
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||     ||  || | ||||||| ||| ||| |     
T  20916456 catcaaactcccctacacatgaatttttggttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagctgcataaaataagattacataggacaattaaatcaaaact 20916555  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20916556 catgtctcctcaaaggcttttatttcaaccgtacactaatcacgaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 20916655  T
Q  218 gtgtg 222  Q
    |||||    
T  20916656 gtgtg 20916660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22948596 - 22948518
Alignment:
Q  148 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22948596 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 22948518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20575633 - 20575510
Alignment:
Q  102 caattcaattaaagcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgat 201  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  20575633 caattcaatcaaaactcatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtagtctttattcaacccgacaat 20575534  T
Q  202 caagtttcaagtgagtgtgtgtgt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  20575533 caagtttcaagtgagtgcgtgtgt 20575510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 22317513 - 22317564
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317513 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 22317564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 25006808 - 25006859
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006808 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 25006859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 30759655 - 30759706
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759655 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 30759706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Original strand, 25116171 - 25116221
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116171 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 25116221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 18484212 - 18484263
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18484212 catcaaactccccaacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 18484263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26847859 - 26847808
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26847859 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaaccaaaaggcata 26847808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Original strand, 25175261 - 25175306
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175261 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 25175306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22855775 - 22855728
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22855775 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacata 22855728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 27270607 - 27270563
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 63  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27270607 atcaaactcccccacacttgaatcattgcttgtcctcaagcaaaa 27270563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 22317639 - 22317719
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||    
T  22317639 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgtg 22317719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 17412784 - 17412736
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17412784 atcaaactcccccatacttgaatcattgtttgtcgtcaagcaaaaggca 17412736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22855651 - 22855572
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||   |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||    
T  22855651 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtaa-acttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgtg 22855572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 225
Target Start/End: Original strand, 25006934 - 25007012
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 225  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  25006934 aatgtacactaatcataacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtgt 25007012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 11496614 - 11496829
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496614 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 11496713  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496714 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 11496813  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  11496814 gtgtgtgtgaagtcca 11496829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13823128 - 13822913
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823128 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 13823029  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13823028 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 13822929  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  13822928 gtgtgtgtgaagtcca 13822913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Original strand, 42709731 - 42709940
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709731 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 42709830  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709831 catgtctcctcaagggcttaaatctcaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 42709930  T
Q  218 gtgtgtgtga 227  Q
    ||||||||||    
T  42709931 gtgtgtgtga 42709940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 18 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15254563 - 15254349
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  15254563 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacgtagttgcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 15254464  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15254463 catgtctccttaagggtttaaatccaaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagt 15254364  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcc 232  Q
    |||||||||| ||||    
T  15254363 gtgtgtgtgaagtcc 15254349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10630965 - 10630758
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  | ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10630965 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacatat-tatcatatgacaatttaattaaagc 10630867  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10630866 acatgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 10630767  T
Q  217 tgtgtgtgt 225  Q
    |||||||||    
T  10630766 tgtgtgtgt 10630758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3354855 - 3354646
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  3354855 catcaaactcccccacacttgaatagttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 3354756  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3354755 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 3354656  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  3354655 tgtgtgtgtg 3354646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18292153 - 18291945
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  18292153 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccacaagaaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 18292054  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18292053 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaagtcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 18291954  T
Q  217 tgtgtgtgt 225  Q
     ||||||||    
T  18291953 cgtgtgtgt 18291945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 17484910 - 17485118
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  17484910 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatggtagcataaaacaagattatcacatgacaatttaattaaaac 17485009  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
      ||||||||||| ||||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17485010 ttatgtctcctcaggggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 17485109  T
Q  217 tgtgtgtgt 225  Q
    |||||||||    
T  17485110 tgtgtgtgt 17485118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 18081459 - 18081669
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcaca-aacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  18081459 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcatagaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 18081558  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  18081559 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 18081658  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  18081659 gtgtgtgtgtg 18081669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 45234232 - 45234441
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  45234232 catcaaactcccccagacttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtggcataaaacaagattatcatatgacaattaaattaaaac 45234331  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
      |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45234332 taatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacagtaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaactatcaagtttcaagtgag 45234431  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  45234432 tgtgtgtgtg 45234441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38426938 - 38426745
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |              ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  38426938 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaataatat--------------tatcatatgacaatttaattaaaaca 38426853  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38426852 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaagccaacaatcaagtttcaagtgagt 38426753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 56580539 - 56580748
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |    |||||  |||||||| |||||||||    
T  56580539 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatctgacaattaaattaaagc 56580638  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||   ||||||| | ||||||    
T  56580639 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcatttttcaacccataaatcaagtcttaagtga 56580738  T
Q  216 gtgtgtgtgt 225  Q
    ||||||||||    
T  56580739 gtgtgtgtgt 56580748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 223
Target Start/End: Original strand, 8092559 - 8092634
Alignment:
Q  148 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgt 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  8092559 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagtgtgtgt 8092634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 14653998 - 14654049
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14653998 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 14654049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15865701 - 15865652
Alignment:
Q  20 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15865701 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15865652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10650603 - 10650552
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10650603 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 10650552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 15260109 - 15260160
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15260109 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcata 15260160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15409585 - 15409534
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15409585 catcaaactcccccacactagaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15409534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16682969 - 16682918
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16682969 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcatcaagcaaaaggcata 16682918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Original strand, 9488878 - 9488928
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 68  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9488878 catcaaactcccccatacttcaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 9488928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 17296250 - 17296298
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 67  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17296250 atcaaactcccccatgcttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 17296298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 78
Target Start/End: Original strand, 8092427 - 8092487
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagta 78  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  8092427 catcaaactttcccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaagacataaacatagta 8092487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Original strand, 15260235 - 15260312
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||    
T  15260235 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtg 15260312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12515081 - 12515042
Alignment:
Q  186 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12515081 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 12515042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 10602472 - 10602687
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602472 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 10602571  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602572 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 10602671  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  10602672 gtgtgtgtgaagtcca 10602687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 13504881 - 13505096
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13504881 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagca 13504980  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504981 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 13505080  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  13505081 gtgtgtgtgaagtcca 13505096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11947622 - 11947407
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  11947622 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagca 11947523  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11947522 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaaatgagt 11947423  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  11947422 gtgtgtgtgaagtcca 11947407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 16448760 - 16448975
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16448760 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcaattaaagca 16448859  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448860 catgtctcctcaagggcttaaattccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 16448959  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  16448960 gtgtgtgtgaagtcca 16448975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 9360971 - 9361186
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |    
T  9360971 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagga 9361070  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9361071 catgtctcctcaagggcttaaattccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagt 9361170  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  9361171 gtgtgtgtgaagtcca 9361186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7600570 - 7600355
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7600570 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 7600471  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7600470 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 7600371  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  7600370 gtgtgtgtgaagtcca 7600355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 15556942 - 15557157
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15556942 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaattcaaatgacaattcaattaaagca 15557041  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557042 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaacttaagcatttcttgaaatctttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15557141  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||| ||| |||||    
T  15557142 gtgtgtatgaagtcca 15557157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 16373565 - 16373780
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16373565 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 16373663  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16373664 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 16373763  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16373764 tgtgtgtgtgaagtcca 16373780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 12187076 - 12187291
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12187076 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 12187174  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12187175 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 12187274  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  12187275 tgtgtgtgtgaagtcca 12187291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37942593 - 37942378
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37942593 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagca 37942495  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  37942494 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcctgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 37942395  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  37942394 tgtgtgtgtgaagtcca 37942378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 12193491 - 12193697
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 118  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12193491 atcaaactcccccatacctgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt-aattaaagcac 12193589  T
Q  119 atgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12193590 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 12193689  T
Q  218 gtgtgtgt 225  Q
    ||||||||    
T  12193690 gtgtgtgt 12193697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6815079 - 6814868
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcacatg 121  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  6815079 aaactccctcatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcacatg 6814981  T
Q  122 tctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6814980 tctcctcaagggcataaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 6814881  T
Q  221 tgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||| |||||    
T  6814880 tgtgtgaagtcca 6814868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10147226 - 10147011
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  10147226 catcaaactcccccatacttgagtctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagca 10147128  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10147127 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 10147028  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10147027 tgtgtgtgtgaagtcca 10147011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15645216 - 15645001
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15645216 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacaa-tcaattaaagca 15645118  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  15645117 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtgtttcttgaaatctttattctacccaacaattaagtttcaagtgag 15645018  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15645017 tgtgtgtgtgaagtcca 15645001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 10160173 - 10160388
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  10160173 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcgaatgacagtt-aattaaagca 10160271  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10160272 catgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgag 10160371  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  10160372 tgtgtgtgtgaagtcca 10160388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 13187418 - 13187632
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  13187418 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaaatcaaatgacagtt-aattaaagcac 13187516  T
Q  119 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  13187517 atgtctcctcaagggctttaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcgagtttcaagtgagt 13187616  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  13187617 gtgtgtgtgaagtcca 13187632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 225
Target Start/End: Original strand, 3245589 - 3245795
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    ||||| ||||||||||||||||| |      
T  3245589 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaactt 3245688  T
Q  119 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 218  Q
    |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  3245689 atgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagta 3245788  T
Q  219 tgtgtgt 225  Q
    |||||||    
T  3245789 tgtgtgt 3245795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2721511 - 2721305
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    ||| | ||||||||||||||||| |     
T  2721511 catcaaactcccc-acacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattataatatgacaattcaattaaaact 2721413  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
     |||||||||||| |||||  |   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2721412 tatgtctcctcaaaggcttttaattcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 2721313  T
Q  218 gtgtgtgt 225  Q
    ||||||||    
T  2721312 gtgtgtgt 2721305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4382961 - 4382751
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcaca-aacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  4382961 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcatagaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 4382862  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  4382861 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 4382762  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  4382761 gtgtgtgtgtg 4382751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 13001425 - 13001634
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  13001425 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 13001524  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  13001525 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 13001624  T
Q  216 gtgtgtgtgt 225  Q
    ||||||||||    
T  13001625 gtgtgtgtgt 13001634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13097919 - 13097711
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||    ||    ||||||||| ||||||| ||    
T  13097919 catcaaactcccccacatttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgacaatttaattaaaaca 13097820  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13097819 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtacactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 13097720  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  13097719 gtgtgtgtg 13097711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 10546936 - 10547148
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagtta-tatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  | || ||||| ||||||||| | |  ||||    
T  10546936 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacgatattatcatatgacaattaattcgaagc 10547035  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaat--ttttattcaacccaacgatcaagtttcaagt 213  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||    
T  10547036 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttttcaacccaacaatcaagtcttaagt 10547135  T
Q  214 gagtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||||    
T  10547136 gagtgtgtgtgtg 10547148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11398424 - 11398215
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    || || | |||||||||||| ||| |    
T  11398424 catcaaactcccccacacttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagcagcataaacaagattaacatacgacaattcaattgaaaac 11398325  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
      ||||||| |||| |||||  ||   ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11398324 ttatgtctcttcaaaggcttttatttaaagcgtacactaatcataaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 11398225  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  11398224 tgtgtgtgtg 11398215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 20156515 - 20156722
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaaca-gttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| | || |||| ||||||||| ||||||| |    
T  20156515 catcaaactcccccacacttgaatctt-gcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtagcataaacaagata-atcatatgacaattaaattaaaac 20156612  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
     ||||||||||||| |||||  ||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20156613 tcatgtctcctcaaaggcttttatttcaattttacactaatcacaagctcaagcatttcttgtaaactttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgag 20156712  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  20156713 tgtgtgtgtg 20156722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1993011 - 1992803
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    ||||| ||||||||| ||||||| |     
T  1993011 catcaaactctctcccacttgaatctttgcttatgctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagattatcatatgacaattaaattaaaact 1992912  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
     |||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  1992911 tatgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaactcaacaatcaaatttcaagtgagt 1992812  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  1992811 gtgtgtgtg 1992803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13690816 - 13690608
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||    |||   ||||||||| ||||||| ||    
T  13690816 catcaaactcccccacacttgaatctttagttgtcatcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattatttcatgacaatttaattaaaaca 13690717  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13690716 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtccactaatcacaaactcaagcattctttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 13690617  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  13690616 gtgtgtgtg 13690608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 14348588 - 14348797
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaaca-gttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || || || |   || || ||||||||||||||||| |    
T  14348588 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatggtaacataagcaagacttaacatatgacaattcaattaaaac 14348687  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
       ||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||    
T  14348688 ttgtgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaaccaaacaatcaagttctaagtgag 14348787  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  14348788 tgtgtgtgtg 14348797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22637908 - 22637702
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || || |||||| ||| ||    ||||| ||||||||||||||||| |    
T  22637908 catcaaactcccctacacttgaatctttacttgtgctcaagcaaaaggcatcaacatggtagcataaaacaagattatcatatgacaattcaattaaaac 22637809  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
      ||| |||||||| | |||  ||  |||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22637808 ttatgcctcctcaaagacttttatttcaagcgtacactaatcacaaacttaagcaattcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 22637709  T
Q  217 tgtgtgt 223  Q
    |||||||    
T  22637708 tgtgtgt 22637702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3279399 - 3279191
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||| |  | | || ||||||||| ||||||| |    
T  3279399 catcaaactcccccacacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcaacataaacaatacttaacatatgacaattaaattaaaac 3279300  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
       ||||||||||| | |||  ||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  3279299 ttgtgtctcctcaaagacttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcgaacatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgag 3279200  T
Q  217 tgtgtgtgt 225  Q
    |||||||||    
T  3279199 tgtgtgtgt 3279191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17388045 - 17387839
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||| ||    |||||  |||||||||||||||| |    
T  17388045 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccttaagcaaaaggcatcaacatggtagcataaaacaagattatcatgtgacaattcaattaaaac 17387946  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
      || ||||||||| |||||  ||  |||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17387945 ttatatctcctcaaaggcttttatttcaagcacacactaatcacaaactcaagcaattcttgaaatctttattcaacccaacaatcaagtttaaagtgag 17387846  T
Q  217 tgtgtgt 223  Q
    |||||||    
T  17387845 tgtgtgt 17387839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 12160207 - 12160416
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||  ||| |    ||||| ||||||||| ||||||||     
T  12160207 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcataaacatggtggcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaaga 12160306  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    ||||||||||||||  | ||  ||  ||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  12160307 acatgtctcctcaaatgtttttatttcaaagagtacactaataaaaaactcaagcatttcttgtaattctt-ttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 12160405  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  12160406 gtgtgtgtgtg 12160416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16655897 - 16655798
Alignment:
Q  135 ttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16655897 ttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 16655798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17045902 - 17045697
Alignment:
Q  26 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcacatgtct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    || || |||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  17045902 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaaatagtagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgtct 17045803  T
Q  125 cctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtg 224  Q
    |||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  17045802 cctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaac-aacaaattccaagtgagtgtgtgtg 17045706  T
Q  225 tgatgtcca 233  Q
    ||| |||||    
T  17045705 tgaagtcca 17045697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17048062 - 17047857
Alignment:
Q  26 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcacatgtct 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    || || |||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  17048062 tcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaaaatagtagcataaacaagattaacatatgacaattcaattaaaaacttatgtct 17047963  T
Q  125 cctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtg 224  Q
    |||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||    
T  17047962 cctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaac-aacaaattccaagtgagtgtgtgtg 17047866  T
Q  225 tgatgtcca 233  Q
    ||| |||||    
T  17047865 tgaagtcca 17047857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Original strand, 27356728 - 27356781
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356728 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 27356781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 3339226 - 3339277
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339226 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 3339277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 12776534 - 12776585
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12776534 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 12776585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 13136210 - 13136261
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136210 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 13136261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15946824 - 15946773
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946824 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15946773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20584318 - 20584267
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584318 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 20584267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13601277 - 13601224
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13601277 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaa 13601224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 14445768 - 14445819
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14445768 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaggcata 14445819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 15619283 - 15619334
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15619283 catcaaactgccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 15619334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 13195458 - 13195509
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13195458 catcaaactcccacacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcata 13195509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Original strand, 8686387 - 8686440
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8686387 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaaacaaaaagcataaa 8686440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 20225754 - 20225960
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 116  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| |    || || |||||||  ||||| ||| |    
T  20225754 catcaaactcccccatacttaaatctttgtttgtcctcaagcaaaagacataaacatagcagcataaataagattaacatatgacaaaacaattaaaaac 20225853  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
      |||||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |    ||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  20225854 ttatgtctcctcaaaggctt-tatttcaagtgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtga-acctattcaacccagc-aacaagtttcaagtaag 20225950  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  20225951 tgtgtgtgtg 20225960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13068357 - 13068306
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13068357 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaaccaaaagacata 13068306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 2005530 - 2005499
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgctt 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005530 catcaaactcccccacacttgaatctttgctt 2005499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13601108 - 13601062
Alignment:
Q  186 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13601108 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtgaagtcca 13601062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 12776660 - 12776739
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12776660 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactt-attcaacccaacaa-caagtctcaagtgagtgtgtgtgtg 12776739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15946698 - 15946619
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||    
T  15946698 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatctcaagtgagtgtgtgtgtg 15946619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22665277 - 22665062
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665277 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 22665178  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665177 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22665078  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  22665077 gtgtgtgtgaagtcca 22665062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 117758 - 117543
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  117758 catcaaactcccccacacttgcatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagctcaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 117659  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117658 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 117559  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  117558 gtgtgtgtgaagtcca 117543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 22044660 - 22044875
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22044660 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 22044759  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22044760 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 22044859  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  22044860 gtgtgtgtgaagtcca 22044875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25357726 - 25357511
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25357726 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 25357627  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25357626 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgagt 25357527  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  25357526 gtgtgtgtgaagtcca 25357511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 11615 - 11823
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  11615 catcaaactcccccacacttgcctctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagctcaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 11714  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11715 catatctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagttttaagtgagt 11814  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  11815 gtgtgtgtg 11823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16775866 - 16775651
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16775866 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagca 16775767  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16775766 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 16775667  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  16775666 gtgtgtgtgaagtcca 16775651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17590622 - 17590407
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17590622 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcagcaacagttaaatcaaatgacaattaaattaaagca 17590523  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17590522 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttctggaaatctctattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 17590423  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||| ||||| |||||    
T  17590422 gtgtatgtgaagtcca 17590407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 24795285 - 24795500
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24795285 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtaccatcagcagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 24795384  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24795385 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgagt 24795484  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  24795485 gtgtgtgtgaagtcca 24795500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27627796 - 27627580
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  27627796 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcgacagttgaatcaaatgacaaattaattaaagca 27627697  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcc-caaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27627696 catgtctcctcaagggcttaaatcctaaaatgtacattaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgag 27627597  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  27627596 tgtgtgtgtgaagtcca 27627580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 25144757 - 25144966
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  25144757 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 25144856  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25144857 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 25144956  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  25144957 tgtgtgtgtg 25144966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 5500265 - 5500473
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  5500265 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 5500364  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5500365 acatgtctcctcaagggcttcaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcacgtaaaccttattcaactcaacaatcaagtttcaagtgag 5500464  T
Q  217 tgtgtgtgt 225  Q
    |||||||||    
T  5500465 tgtgtgtgt 5500473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 25804267 - 25804475
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    || || ||||||||||||||||| |     
T  25804267 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcacaaacaagattaacatatgacaattcaattaaaact 25804366  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
     |||| ||||||| |||||  |   |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25804367 tatgtatcctcaaaggcttttaattcaagcgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaaatttcaagtgagt 25804466  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    ||| |||||    
T  25804467 gtgcgtgtg 25804475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 23798922 - 23799129
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     ||  || ||||||||||||| ||| |     
T  23798922 catcaaactcccccacacttgaatctttgattatcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcataaaacaagattacatatgacaattcaatcaaaact 23799021  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23799022 catgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtatcctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagt 23799121  T
Q  218 gtgtgtgt 225  Q
    ||||||||    
T  23799122 gtgtgtgt 23799129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 224
Target Start/End: Original strand, 25370890 - 25371091
Alignment:
Q  23 aactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcac-aaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagcaca 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||  ||||||   ||||||||||||| ||| | ||    
T  25370890 aactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatagtaacaataaacaggattatat---atgacaattcaatcaaaactca 25370986  T
Q  120 tgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgt 219  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  25370987 tgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactaattacaaactcaagcatttcttataatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagtgt 25371086  T
Q  220 gtgtg 224  Q
    |||||    
T  25371087 gtgtg 25371091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23644160 - 23643950
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||| |    ||||| ||||||||| |||||||||    
T  23644160 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaagc 23644061  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaa-atgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    || ||||||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| || ||||||| | |||||     
T  23644060 acgtgtctcctcaaaggcttttatttcaaggagtacactaatcacaaactcaagcatttcctgtaatcctttttcaaccctacaatcaagtcttaagtgg 23643961  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    ||| |||||||    
T  23643960 gtgcgtgtgtg 23643950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24502297 - 24502168
Alignment:
Q  98 atgacaattcaattaaag-cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaaccca 196  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24502297 atgacaattcaattaaaaacttatgtctcctcaaatgcttttatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaaccca 24502198  T
Q  197 acgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24502197 acaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 24502168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 172
Target Start/End: Original strand, 24178193 - 24178348
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||    ||||| ||||||||| |||| ||| |    
T  24178193 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcttcaaacaaaaggcataaacatagcagcataaacaagattatcatatgacaatttaattaaaaac 24178292  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcat 172  Q
      ||||||||||||  ||||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24178293 ttatgtctcctcaaaagcttttatttcaaacgtacactaatcacaaactcaagcat 24178348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 24171561 - 24171498
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24171561 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagatatagcagca 24171498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 23159385 - 23159436
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159385 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 23159436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 23570642 - 23570693
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570642 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 23570693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 27631711 - 27631660
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631711 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 27631660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 27768816 - 27768867
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768816 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 27768867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Original strand, 25337651 - 25337720
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaaca 87  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  25337651 catcaaattcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaatatagcagcataaaca 25337720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24506865 - 24506796
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaaca 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||    
T  24506865 catcaaactcccccacacttgaatcttttattgtcctcaagcaaaagacataaacatagcagcataaaca 24506796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24321380 - 24321314
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaata-tagtagcacaaaca 87  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  24321380 aaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcgtaaacattagtagcataaaca 24321314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 71
Target Start/End: Original strand, 23257570 - 23257622
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23257570 catcaaactcccc-atacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 23257622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27631585 - 27631506
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  27631585 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgtgtgtgtg 27631506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 29955913 - 29955868
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaag 64  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29955913 atcaaacttcccgatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaag 29955868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 63
Target Start/End: Original strand, 19805618 - 19805662
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 63  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  19805618 atcaaactcccccacactagaaccattgcttgtcctcaagcaaaa 19805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 21512567 - 21512615
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 67  Q
    |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21512567 atcaaattcccccatgcttgaatccttgcttgtcctcaagcaaaaggca 21512615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 17334606 - 17334648
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 61  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  17334606 atcaaactcccccacacttgaaccattgattgtcctcaagcaa 17334648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23648165 - 23648123
Alignment:
Q  37 tgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtag 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  23648165 tgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacatagtag 23648123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15532792 - 15532753
Alignment:
Q  186 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15532792 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 15532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Original strand, 24019068 - 24019120
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  24019068 atcaaattcccccatacttgaatctttttttgtcctcaaacaaaagacataaa 24019120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 24019228 - 24019267
Alignment:
Q  186 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24019228 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 24019267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15893 - 15678
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15893 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcacaaacagttttatcaaatgacaattcaattaaagca 15794  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15793 catgtctcctcaagggcttaaatctcaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 15694  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  15693 gtgtgtgtgaagtcca 15678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27047089 - 27046874
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047089 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagctccaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 27046990  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046989 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 27046890  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  27046889 gtgtgtgtgaagtcca 27046874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 17094601 - 17094816
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17094601 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaatagttaattcaaatgacaattcaattaaagca 17094700  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094701 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaacttaagcatttcttgaaatctttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 17094800  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  17094801 gtgtgtgtgaagtcca 17094816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20237671 - 20237456
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||    
T  20237671 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatgcagtagcacaaataattttatcaaatgacaattcgattaaagca 20237572  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20237571 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaaccacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagctttaagtgagt 20237472  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    || ||||||| |||||    
T  20237471 gtttgtgtgaagtcca 20237456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 21798662 - 21798878
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  21798662 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaattaaatttaaagc 21798761  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21798762 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatttttattctacccaacgatcaagttttaagtgag 21798861  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21798862 tgtgtgtgtgaagtcca 21798878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8653327 - 8653126
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcac-aaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagcac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||   ||||||   ||||||||||||| ||| | |    
T  8653327 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaataaacaagattatat---atgacaattcaatcaaaactc 8653231  T
Q  119 atgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtg 218  Q
    |||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||    
T  8653230 atgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgtgtg 8653131  T
Q  219 tgtgt 223  Q
    |||||    
T  8653130 tgtgt 8653126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 52938621 - 52938830
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||| ||| |    
T  52938621 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataatcatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaatc 52938720  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  52938721 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 52938820  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  52938821 tgtgtgtgtg 52938830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3990154 - 3989944
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  3990154 catcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 3990055  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaat-gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    ||||||||| |||| |||||  ||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  3990054 acatgtctcgtcaaaggcttttatttcaaagagtgcactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 3989955  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  3989954 gtgtgtgtgtg 3989944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19364244 - 19364043
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||     ||  || ||||||||||||| ||| |     
T  19364244 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgcatagacatagcagcataaaacaagattacatatgacaattcaatcaaaact 19364145  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  19364144 catgtctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtagtctttattcaacccaacaatccagttctaagtgagt 19364045  T
Q  218 gt 219  Q
    ||    
T  19364044 gt 19364043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14070720 - 14070632
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaatt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  14070720 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacagttaaatcaaatgacaatt 14070632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 76
Target Start/End: Original strand, 19875648 - 19875702
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatag 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19875648 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatag 19875702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 21784472 - 21784523
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21784472 catcaaactcccccacacttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 21784523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 4027895 - 4027844
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4027895 catcaaactcccccacccttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcata 4027844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 71
Target Start/End: Original strand, 16382578 - 16382628
Alignment:
Q  21 caaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16382578 caaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggaataaa 16382628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 8947515 - 8947566
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  8947515 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaaggaaaagacata 8947566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 225
Target Start/End: Original strand, 21784598 - 21784677
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 225  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  21784598 aatgtacactaatcacaacttcaagtatttcttgtgaactttattcaacccaac-aacaagtcttaagtgagtgtgtgtgt 21784677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 18478234 - 18478276
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 61  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18478234 atcaaactcccctacacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 18478276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21382309 - 21382093
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaatt-caattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21382309 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcactaacagttatatcaaatgacaatttcaattaaagc 21382210  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382209 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 21382110  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21382109 tgtgtgtgtgaagtcca 21382093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 21098794 - 21099009
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  21098794 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 21098893  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21098894 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtcatttttattcaacccaatgatcaagttttaagtgagt 21098993  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  21098994 gtgtgtgtgaagtcca 21099009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 21104115 - 21104330
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  21104115 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaacaattttatcaaatgacaattcgattaaagca 21104214  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21104215 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaattcaagcatttcttgtcatttttattcaacccaatgatcaagttttaagtgagt 21104314  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  21104315 gtgtgtgtgaagtcca 21104330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23911655 - 23911441
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23911655 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcaccaatagttatatcaaatgacaattcgattaaagca 23911556  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23911555 catgtctcctcaagggcttaaatcccagatgtacactaatcacaaacttaaacatttcttgtaatttttattcaacccaa-gatcaaatttcaagtgagt 23911457  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    |||||||||| |||||    
T  23911456 gtgtgtgtgaagtcca 23911441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8314683 - 8314467
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagc 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  8314683 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcaacatttaaatcaaatgacaattaaatttaaagc 8314584  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  8314583 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagttttaagtgag 8314484  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8314483 tgtgtgtgtgaagtcca 8314467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 8322846 - 8323062
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  8322846 catcaaactccctcatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagtagcatcgacagttaaatcaaatgacaaattaattaaagca 8322945  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatccc-aaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8322946 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacgatcaagtttcaagtgag 8323045  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  8323046 tgtgtgtgtgaagtcca 8323062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 21843524 - 21843733
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  21843524 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 21843623  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21843624 acatgtctcctcaagggcttaaatttcaagcgtacagtaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 21843723  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  21843724 tgtgtgtgtg 21843733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 21939996 - 21940206
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttat-atcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||     || |||| ||||||||| |||||||||    
T  21939996 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattaaattaaagc 21940095  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaat-gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21940096 acatgtctcctcaaaggctttcatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtctgaagtga 21940195  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  21940196 gtgtgtgtgtg 21940206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 20038981 - 20039189
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||     |||| |||||| || || |||   |    
T  20038981 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagatcatcacatgacattttaactaagata 20039080  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||| |||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20039081 catgtctcttcaaaggctttaatttcaaatgtacaataatcacaaactcaagtatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 20039180  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  20039181 gtgtgtgtg 20039189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23455154 - 23454945
Alignment:
Q  18 catcaaactccccc-acacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaag 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    |  || |||||||||||||| |||     
T  23455154 catcaaactccccccacacttgaatctttgcttgtcctcgagcaaaaggcataaacatagtagcataaacaagactcacatatgacaattcaattgaaaa 23455055  T
Q  116 cacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
       |||||||||||| |||||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23455054 tttatgtctcctcaaaggctttcatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaatccaacaatcaagtttcaagtga 23454955  T
Q  216 gtgtgtgtgt 225  Q
    ||||||||||    
T  23454954 gtgtgtgtgt 23454945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17620961 - 17620755
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    ||    ||||||||| ||||||| ||    
T  17620961 catcaaactcccccacacttgaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaagattacttcatgacaatttaattaaaaca 17620862  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17620861 catgtctcctcaaaggctttaatttcaagtgtaccctaatcataaactcaagcattctttgtaatcctttttcaa-ccaacaatcaagtttcaagtgagt 17620763  T
Q  218 gtgtgtgt 225  Q
    ||||||||    
T  17620762 gtgtgtgt 17620755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 16418620 - 16418830
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |    ||||| |||||||||  |||||| |    
T  16418620 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgttctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaaac 16418719  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  16418720 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 16418819  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  16418820 gtgtgtgtgtg 16418830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24034230 - 24034049
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagc-acaaac-agttatatcaaatgacaattcaatt-aaa 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| || | ||  | |||||||||||||| |||    
T  24034230 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtccacaagcaaaaggcataaacatagtagcaataaacgagat-taatatatgacaattcaattgaaa 24034132  T
Q  115 gcacatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaa 197  Q
     |  |||||||||||| ||||| |||  |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24034131 acttatgtctcctcaaaggctttaatttcaagcgtacactgatcacaaactcaagcatttcttgtaatctttattcaacccaa 24034049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 14352181 - 14352378
Alignment:
Q  29 cccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaaca-gttatatcaaatgacaattcaa-ttaaagcacatgtctcc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| | || || | ||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  14352181 cccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacataaacatggtagcataaacaagata-attatatgacaattaaaattaaaactcatgtctcc 14352279  T
Q  127 tcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 225  Q
    ||   |||||  ||  |||  |||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14352280 tccgaggcttttatttcaagcgtacactaattactaactcaagcattctttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtctcaagtgagtgtgtgtgt 14352378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21538765 - 21538573
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    ||||| ||||||||||||||||| |    
T  21538765 catcaaaatcccccacacttaaatttttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaagattatcatatgacaattcaattaaaac 21538666  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacac--taatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtt 207  Q
      |||||||||||| | ||| |||  |||  ||||||  ||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21538665 ttatgtctcctcaaagactttaatttcaatcgtacactataatcacaaactccagggtttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtt 21538573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20712649 - 20712537
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  20712649 catcaaactcccctacacttaaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaacattatcatatgacaatttaatcaaagc 20712550  T
Q  117 acatgtctcctca 129  Q
    |||||||||||||    
T  20712549 acatgtctcctca 20712537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 11346953 - 11347004
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11346953 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 11347004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19767740 - 19767689
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767740 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 19767689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20002330 - 20002279
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002330 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 20002279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22370158 - 22370107
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370158 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 22370107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21831232 - 21831181
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21831232 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacata 21831181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 22033555 - 22033606
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22033555 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacata 22033606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 22099655 - 22099706
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22099655 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagacata 22099706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22102608 - 22102557
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22102608 catcaaactcccctacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 22102557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20712539 - 20712470
Alignment:
Q  157 tcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20712539 tcacaaactcaatcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtctcaaatgagtgtgtgtgtg 20712470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22817806 - 22817755
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22817806 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaagacata 22817755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 67
Target Start/End: Original strand, 18572977 - 18573025
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggca 67  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  18572977 atcaaactcccccatacttgaattttttcttgtccttaagcaaaaggca 18573025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 19902174 - 19902216
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 61  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19902174 atcaaactcccctacacttgaaccgttgcttgtcctcaagcaa 19902216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22102482 - 22102403
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||   ||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  22102482 aatgtacactaatcacaacttcaagcattccttgtaa-acttattcaacccgac-aacaaatttcaagtgagtgcgtgtgtg 22102403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 615 - 831
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  615 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaagcataaatatggtagcacaaacaattttatcaaatcacaattcgattaaagca 714  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaag-tttcaagtgag 216  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  715 caagtctcctcaagggattaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttttaagtgag 814  T
Q  217 tgtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    ||||||||||| |||||    
T  815 tgtgtgtgtgaagtcca 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1038
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1253 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttttcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagcatcagcagttaaatcaaatgacaatttaattaaagca 1154  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1153 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgaaatctttattctacccaacaatcaagtttcaagtgagt 1054  T
Q  218 gtgtgtgtgatgtcca 233  Q
    || ||||||| |||||    
T  1053 gtatgtgtgaagtcca 1038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3524 - 3461
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3524 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacgtagtagca 3461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 428 - 220
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |  ||||  ||||||||| |||||||  |    
T  428 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcgtatgacaatttaattaaaata 329  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  328 catgtctcctcaagggctttaatttaaagcgtacactaatcacaaactgaagcatttcttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 229  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  228 gtgtgtgtg 220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 2852 - 3058
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  2852 catcaaactcccacatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 2951  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    ||||||||||| |||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2952 acatgtctccttaagggctttaatttcatgtgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgag 3051  T
Q  217 tgtgtgt 223  Q
    |||||||    
T  3052 tgtgtgt 3058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 251870 - 252079
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| || |  |||||  |||||||| ||||||| |    
T  251870 catcaaactcccccacacttgaatctttacttgtcctcaagcaaatggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatttgacaatttaattaaaac 251969  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  251970 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactagtcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagttccaagtgag 252069  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  252070 tgtgtgtgtg 252079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11264 - 11064
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11264 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgacaatttaattaaaaca 11165  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  11164 catgtctcctcaagggctttaattttaagcgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaaaaattaagtttcaagtgagt 11065  T
Q  218 g 218  Q
    |    
T  11064 g 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 2287 - 2496
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  2287 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 2386  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  2387 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcttttttcaacccaacaatcaagtcttaagtgag 2486  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  2487 tgtgtgtgtg 2496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 831
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaa-cagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |    ||||| ||||||||| |||||||||    
T  1041 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaattaacattatcatatgacaattaaattaaagc 942  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  941 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 842  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  841 gtgtgtgtgtg 831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 14662 - 14869
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| |  ||||| |||| |||| ||||||| ||    
T  14662 catcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatggtagcataaacaatattatcatatgaaaatttaattaaaaca 14761  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14762 catgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacattattcataaactcaagcatttcttgtaaaccttatgaaacccaacaatcaagtttcaagtgagt 14861  T
Q  218 gtgtgtgt 225  Q
    ||||||||    
T  14862 gtgtgtgt 14869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 687 - 482
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||| |||||    ||||| |||||||||||||||||       
T  687 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaatgtataaacatagcagcataaacaagattatcatatgacaattcaattaaaatt 588  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
     ||||||||||||  ||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  587 aatgtctcctcaaaagcttttatttcaagtgtacactaatcacaaactcaaccattttttgtaatctttattcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 488  T
Q  218 gtgtgt 223  Q
    ||||||    
T  487 gtgtgt 482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8149 - 7941
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||||     || | |||||| || || |||| ||    
T  8149 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcttcaagcaaaaggcataaacacggtagcataaacaagatcattacatgacattttaactaaaaca 8050  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
    |||||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8049 catgtctcttcaaaggctttaatttcaaatgtacactaatcacaaactcgagcatttcttgtaatcctttttcaacccaacaatcaagtttcaaatgagt 7950  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  7949 gtgtgtgtg 7941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 121162 - 120954
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaa-atgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    ||| |  | ||||||||| |||| || |    
T  121162 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaataatatttttatatgacaatttaattgaaac 121063  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||| | |||||| |||||| |    
T  121062 acatgtctcctcaagggctttaatttcaagcgtacactaatcacaaactcaagtatttcttgtaaaccttattcaacccaacaaccaagttccaagtgtg 120963  T
Q  217 tgtgtgtgt 225  Q
    |||||||||    
T  120962 tgtgtgtgt 120954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 510 - 718
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||  || ||||||||||||| ||| |     
T  510 catcaaactcccccatacttgaatctttgtttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcataaaacaagattacatatgacaattcaatcaaaact 609  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
     || ||||||||| |||||  ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  610 tatatctcctcaaaggcttttatttcaagcgtacactaatcacaaactcaaacatttcttgtaacctttattcaacccaacaatcaagttctaagtgagt 709  T
Q  218 gtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||    
T  710 gtgtgtgtg 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 164403 - 164562
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcac-aaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  164403 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttatcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaaaacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 164502  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttct 176  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  164503 acatgtctcctcaagggcttcaatttaaagcgcacactaatcacaaactcaagcatttct 164562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 172316 - 172248
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaaca 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  172316 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatagcagcataaaca 172248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 162058 - 162007
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162058 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 162007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1318 - 1108
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |    ||||| |||||||||  ||||| ||    
T  1318 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaggc 1219  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  1218 acatgtcccctcaaaggcttttatttcaaagagtacattaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 1119  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  1118 gtgtgtgtgtg 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 58628 - 58838
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||  ||| |    ||||| |||||||||  ||||||||    
T  58628 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagtaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaagc 58727  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  58728 acatgtctcctcaaatgcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaaccatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 58827  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||    
T  58828 gtgtgtgtgtg 58838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 97726 - 97936
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||| |    ||||| |||||||||  ||||||||    
T  97726 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctaaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaataacattatcatatgacaattacattaaagc 97825  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtga 215  Q
    ||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  97826 acatgtctcctcaaatgcttttatttcaaagagtacactaatcacaaactcaagcatttcttataatcctttttcaacccaacaatcaagtcttaagtga 97925  T
Q  216 gtgtgtgtgtg 226  Q
    || ||||||||    
T  97926 gtatgtgtgtg 97936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 136
Target Start/End: Original strand, 10206 - 10325
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaa-acagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  10206 catcaaactcccccaaacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcacaagacaatattatcatatgacaatttaattaaaac 10305  T
Q  117 acatgtctcctcaagggctt 136  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10306 acatgtctcctcaagggctt 10325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 13002 - 13207
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| || ||    ||||| || | |||||||||||| |     
T  13002 catcaaactccgccacacttgaatctttgcttgtcctcaagtaagaggcataaacatagtagcataaccaagattatcatataataattcaattaaaact 13101  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagt 217  Q
     |||||| ||||| |||||  ||  ||   ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  13102 tatgtcttctcaaaggcttttatttcatgcgtacactaataccatactcaagcatttcttgtaatctttattaaacccaagaatcaagtttcaagtgagt 13201  T
Q  218 gtgtgt 223  Q
    | ||||    
T  13202 gcgtgt 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 35104 - 35307
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||        | |||||||||||| |||| ||    
T  35104 catcaaactcccccacacttgaatctttccttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaca--------agatgacaattcaactaaaaca 35195  T
Q  118 catgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaa------tttttattcaacccaacgatcaagtttcaa 211  Q
    ||||||||||  | ||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||      ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  35196 catgtctcctttaaggctttaatttcaagtgtacagtaatcacaaactcaagcattcttggtaatcttttttttttttcaacccaacaatgaagtttcaa 35295  T
Q  212 gtgagtgtgtgt 223  Q
     |||||||||||    
T  35296 atgagtgtgtgt 35307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8869 - 8720
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagca-caaacagttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||    ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  8869 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaacatggtagcataaaacaacattatcatatgacaattaaatcaaagc 8770  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaa-tgtacactaatcacaaact 165  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  8769 acatgtctcctcaaaggcttttatttcaaagagtacactaatcacaaact 8720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 12609 - 12450
Alignment:
Q  20 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagc-acaaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||   ||||||||||||| |||      
T  12609 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaataaacaggattatat---atgacaattcaatcaaaat 12513  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 179  Q
     ||||||||||||| | |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12512 tcatgtctcctcaaagacttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 179
Target Start/End: Original strand, 232789 - 232948
Alignment:
Q  20 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagc-acaaacag--ttatatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||   ||||||||||||| |||      
T  232789 tcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaaggcataaacatagtagcaataaacaggattatat---atgacaattcaatcaaaat 232885  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 179  Q
     ||||||||||||| | |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232886 tcatgtctcctcaaagacttttatttcaagcatacactaatcacaaactcaagcatttcttgt 232948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 119
Target Start/End: Original strand, 38508 - 38610
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagtta-tatcaaatgacaattcaattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |  || ||||| ||||||||| ||||||| |    
T  38508 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaagcataaacatggtagcacaaaaaaatattatcatatgacaatttaattaaaac 38607  T
Q  117 aca 119  Q
    |||    
T  38608 aca 38610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 148 - 198
Target Start/End: Original strand, 38625 - 38675
Alignment:
Q  148 gtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaac 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  38625 gtacattaatcacaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaac 38675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5295 - 5090
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattc-aattaaagc 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  || |   ||| || |||||||||| ||| |||||    
T  5295 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcatagacatagcagcaataaaaaagataacatatgacaattcaaataaaagc 5196  T
Q  117 acatgtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgag 216  Q
      |||||||||| | || || | | |  ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |    ||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  5195 ttatgtctcctctaaggtttcatttc--aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtga-acctattcaacccaacaat-aagtctcaagtgag 5100  T
Q  217 tgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||    
T  5099 tgtgtgtgtg 5090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1902 - 1834
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaac 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1902 catcaaactcccccacacttgaatctttgattgttctcaagcaaaaggcataaatatagcagcataaac 1834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2926 - 2859
Alignment:
Q  159 acaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2926 acaaactcaagcatttcttgtaaaccttattcaacccaacaatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 2859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 970 - 919
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 2818 - 2767
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 2767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2692 - 2612
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| | || || | |||||||||||||||||    
T  2692 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-aacatgtcttaagtgagtgtgtgtgtg 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 12794 - 12743
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12794 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 12743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 42300 - 42249
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42300 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 42249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 50506 - 50557
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50506 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 50557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 61
Target Start/End: Original strand, 88361 - 88403
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 61  Q
    |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  88361 atcaaactcccctacacttgaaccattgcttgtcctcaagcaa 88403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10776 - 10725
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10776 catcaaactcccccacactttaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 10725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 69
Target Start/End: Original strand, 22159 - 22206
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22159 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 54849 - 54900
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54849 catcaaactcccccacgcttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 54900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37922 - 37722
Alignment:
Q  22 aaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaatatagtagcacaaacagttatatcaaatgacaattcaatt-aaagcacat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| | || |||||    ||  | |||||||||||||| ||| |  ||    
T  37922 aaactcccccacacttgaatcttttcttgccctcaagcaaaagccataaacatagcaacataaacaaaattaaaatatgacaattcaattaaaatcttat 37823  T
Q  121 gtctcctcaagggcttaaatcccaaatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtg 220  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||  |    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37822 gtctcctcaaaggctt-aatttcaagtgtacactaatcacaacatcaagtattccttgcga-acctattcaacccaac-aacaagtttcaagtgagtgtg 37726  T
Q  221 tgtg 224  Q
    ||||    
T  37725 tgtg 37722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1248 - 1196
Alignment:
Q  19 atcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1248 atcaaactcccccatacttgaatctttgcttgtccacaagcaaaaggcataaa 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1080 - 1041
Alignment:
Q  186 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1080 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 22818 - 22774
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaa 62  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22818 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaa 22774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Original strand, 37743 - 37790
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagg 65  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37743 catcaaattcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaagg 37790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 225
Target Start/End: Original strand, 37869 - 37948
Alignment:
Q  145 aatgtacactaatcacaaactcaagcatttcttgtaatttttattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgt 225  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  37869 aatgtacactaatcacaacttcaagtattccttgtgaactttattcaacccaac-atcaagtcttaagtgagtgtgtgtgt 37948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Original strand, 72572 - 72622
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  72572 catcaaactcccccacacttgaatctttacttttcctcaagcaaaaggcat 72622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 68
Target Start/End: Original strand, 84762 - 84812
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcat 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  84762 catcaaactcccccacacttgaatctttacttttcctcaagcaaaaggcat 84812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 18263 - 18218
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaa 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18263 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagaaaaa 18218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 69
Target Start/End: Original strand, 45228 - 45279
Alignment:
Q  18 catcaaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcata 69  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45228 catcaaactcccccacacctgaatctttgcttgttctcaagcaaaagacata 45279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 83174 - 83211
Alignment:
Q  34 acttgaatctttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 71  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  83174 acttgaatatttgcttgtcctcaagcaaaaggcataaa 83211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 3291 - 3251
Alignment:
Q  21 caaactcccccacacttgaatctttgcttgtcctcaagcaa 61  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3291 caaactcccctacacttgaaccgttgcttgtcctcaagcaa 3251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 5830 - 5869
Alignment:
Q  186 tattcaacccaacgatcaagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 226  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5830 tattcaacccaacaa-caagtttcaagtgagtgtgtgtgtg 5869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University