View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3710_low_1 (Length: 829)

Name: NF3710_low_1
Description: NF3710
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3710_low_1
NF3710_low_1
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (26-819)||(4123866-4124659)
chr4 (22-449)||(4344377-4344804)
chr4 (22-449)||(4360808-4361235)
chr4 (22-471)||(4320542-4320991)
chr4 (26-453)||(4335071-4335499)
chr4 (40-450)||(4133366-4133774)
chr4 (30-291)||(7885322-7885583)
chr4 (22-414)||(6728172-6728564)
chr4 (23-414)||(6621431-6621822)
chr4 (22-414)||(6498449-6498841)
chr4 (24-414)||(6675469-6675859)
chr4 (23-375)||(6650872-6651224)
chr4 (22-414)||(6752726-6753118)
chr4 (23-414)||(6796553-6796944)
chr4 (29-417)||(6758487-6758875)
chr4 (131-414)||(6815236-6815519)
chr4 (22-375)||(6545371-6545724)
chr4 (133-414)||(6837040-6837321)
chr4 (689-789)||(4360050-4360150)
chr4 (22-414)||(6588119-6588511)
chr4 (258-412)||(6532391-6532545)
chr4 (329-414)||(6772870-6772955)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (22-456)||(5690082-5690516)
chr6 (22-456)||(5354537-5354971)
chr6 (24-456)||(5181852-5182284)
chr6 (22-449)||(5176470-5176897)
chr6 (22-449)||(5278297-5278724)
chr6 (30-445)||(5447322-5447737)
chr6 (23-456)||(5344585-5345018)
chr6 (29-440)||(5128347-5128758)
chr6 (24-440)||(5433775-5434191)
chr6 (22-442)||(5096446-5096866)
chr6 (22-425)||(5073831-5074234)
chr6 (31-442)||(5102546-5102957)
chr6 (35-456)||(5284325-5284746)
chr6 (22-451)||(5383055-5383484)
chr6 (26-442)||(5066621-5067037)
chr6 (22-441)||(5425649-5426068)
chr6 (29-442)||(5157558-5157971)
chr6 (89-450)||(5257324-5257685)
chr6 (29-456)||(5396674-5397101)
chr6 (22-419)||(5350157-5350552)
chr6 (106-440)||(5446897-5447231)
chr6 (24-440)||(5370311-5370727)
chr6 (142-419)||(5243910-5244187)
chr6 (249-440)||(5147046-5147237)
chr6 (22-200)||(5281280-5281458)
chr6 (22-200)||(5179521-5179699)
chr6 (23-100)||(5243837-5243914)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (22-451)||(8823-9252)
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (24-456)||(36213754-36214186)
chr7 (29-419)||(18935147-18935537)
chr7 (29-419)||(34724516-34724906)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (29-456)||(8877333-8877760)
[»] chr3 (5 HSPs)
chr3 (89-453)||(47986842-47987206)
chr3 (89-453)||(47996129-47996493)
chr3 (89-453)||(48005416-48005780)
chr3 (89-453)||(48014701-48015065)
chr3 (164-286)||(6905991-6906113)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (31-267)||(22584146-22584382)
chr2 (155-294)||(14767123-14767262)
[»] scaffold0813 (1 HSPs)
scaffold0813 (23-375)||(4750-5102)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (23-375)||(6464-6816)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (131-414)||(8317-8600)
[»] scaffold0373 (1 HSPs)
scaffold0373 (133-414)||(9456-9737)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (24-212)||(3286560-3286748)
chr8 (22-213)||(3262670-3262860)
chr8 (24-87)||(3364262-3364325)
chr8 (24-87)||(3391581-3391644)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 633; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 819
Target Start/End: Original strand, 4123866 - 4124659
Alignment:
Q  26 gagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagag 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  4123866 gagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgaccttactaccgaaaagggcacttttgttatagcagtattatttgcaatcagag 4123965  T
Q  126 tggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4123966 tggttaaagattccatttgttccaactcctcttccaacttgtcaatcattaaacatcccgatagaatgagagttttcagagatttcaacgaataaatgtt 4124065  T
Q  226 tcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacag 325  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||     
T  4124066 tcttggaaggttagaaaggctagtacaatctttcaaatttatcaaaagaactttcttaagatgtccaattgtatgggatacctcagacagccttggacaa 4124165  T
Q  326 tctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctcca 425  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4124166 tctttgagtaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctcca 4124265  T
Q  426 ttctctgcaagaacagaaatattatagagaacttgcggataaagcataaaaagataagtacaagcacgtacgacgtgtcaccaaccttgagagtggtaat 525  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4124266 ttctctgcaagaacagaaatattatagagaacttgcggataaagcataaaaagagaagtacaagcacgtacgacgtgtcgccaaccttgagagtggtaat 4124365  T
Q  526 aaaatatttgtgtgggtgcatagccannnnnnnaataccaacatacgttggtttagtattactttttgctcaaaatattcgggtgccagcattctgctgt 625  Q
    |||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4124366 aaaatatttgtgtgagtgcatagccatttttttaataccaacatacgttagtttagtattactttttgctcaaaatattcgggtgccagcattctgctgt 4124465  T
Q  626 gaattttaaaattcagcataatagataggtttgaaattcctctggtttcttttatttactgtgttgatttatggactgatgtgtgaattttgtttgtact 725  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4124466 gaattttaaaattcagcataatagataggtttgaaattcctctggtttcttttatttactgtgttgatttatggactgttatgtgaattttgtttgtact 4124565  T
Q  726 tgtatacattgtaactaaattcatagttagggctatgatggatcttttgtattataatcgaactattcatagttttcaactgttttgtcctttg 819  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4124566 tatatacattgtaactaaattcatagttagggctatgatggatcttttgtattataatcaaattattcatagttttcaactgttttgtcctttg 4124659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 22 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4344804 - 4344377
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4344804 acgtgagaatccttcatatccacacaaagaaataaatccaatgcgttttgaccttactactgaaaagggtacttttgttatagcagtgttatttgcaatc 4344705  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4344704 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttccaacttgtcaatcattaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 4344605  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4344604 tgtttcttggaaggttacaaaggctaatacaatttttcaaatttatcaaaagaattttgttgagatgtccaatactttgggaaatctcagacagccttgg 4344505  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  4344504 acaatctttgagtactagcttttcaagattaggcaagtatgaaaagtcaggcgtctgtgtcagacaatgagaatgactgagattgagaattttcagctga 4344405  T
Q  422 tccattctctgcaagaacagaaatatta 449  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4344404 tccatcctctgcaagaacggaaatatta 4344377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 22 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 4361235 - 4360808
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4361235 acgtgagaatccttcatatccacacaaagaaataaatccaatgcgttttgatcttacaattgaaaagggtacttttgttataccagtgttatttgcaatc 4361136  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4361135 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttccaacgtgtcaatcattgaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 4361036  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4361035 tgtttcttggaaggttacaaaggctaatgcaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaatctcagacagccttgg 4360936  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
    ||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4360935 acaatctttaagtactagcttttcaagattaggcaagtatgaaaagtcaggcgtctgtgtcagatattgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 4360836  T
Q  422 tccattctctgcaagaacagaaatatta 449  Q
    ||||| | ||| || |||| ||||||||    
T  4360835 tccatcccctgaaataacataaatatta 4360808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 22 - 471
Target Start/End: Original strand, 4320542 - 4320991
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  4320542 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgaccttactaatgaaaagggaacttttgttataccagtattatttgcaatc 4320641  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4320642 agggtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttccaacttgtcaatcattaaacatcccgatagaatgagagtattcagagttttcaacgtataga 4320741  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||    
T  4320742 tgtttcttggaaggctacaaaggctaatacaatctttcaaatttatcaaaacaacttttttgagatgtccaatgctatgggaaacctgagacagccttgg 4320841  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
     || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4320842 gcaatcttcgagcactagcttttcaagattaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcaaatgatgagaatgactaagatttagaatcttcagctgc 4320941  T
Q  422 tccattctctgcaagaacagaaatattatagagaacttgcggataaagca 471  Q
    ||||| |||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4320942 tccatcctctgcaaaaataaaaatattatagagaagttacggataaagca 4320991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 26 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4335499 - 4335071
Alignment:
Q  26 gagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagag 125  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||    
T  4335499 gagaatccttcatacccacacaaagagatatagccaatgctttttgactttactactgaaaagggcacttttgttataccagtgttatctgccatgagag 4335400  T
Q  126 tggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4335399 tggttaaagattccatttgttccaagtcctcttccaacttgtcaatctttaaacatcctgatagaatgagagttttcagagacttcaacgtatagatgtt 4335300  T
Q  226 tcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacag 325  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||     
T  4335299 tcttggaaggttacaaaggctaatgcaatctttcaaatttatcaaaagaactttcttaagatgtccaattgtatgggatacctcagacagcctcggacaa 4335200  T
Q  326 tctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctcca 425  Q
    |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4335199 tctttgagtactaggttttcaagattaggcaagtatgaaaaatcaggggtctgtgttagataatgagaatgactaagattgagaattttcaactgctcca 4335100  T
Q  426 ttctctgcaag-aacagaaatattataga 453  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4335099 tcctctgcaagaaacagaaatattataga 4335071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 40 - 450
Target Start/End: Original strand, 4133366 - 4133774
Alignment:
Q  40 tccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggttaaagattcc 139  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    |  ||||||||||||||||||||  |||||| ||   ||||||||||||||||||| |||    
T  4133366 tccacaaagagaaatatattcaatgctttttgaccttgcgactgaaaagggcacttttgttattgcagtgttatccacaatcagagtggttaaagactcc 4133465  T
Q  140 atttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttac 239  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4133466 atttgttccaagtcct--tccaatttgtcaataattaaacagccagaaagaataagagttttcagagatttcaacgaatagatggttcttggaaggttac 4133563  T
Q  240 aaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagcaccag 339  Q
     ||| ||  |||| |||||||||||||| |  |||| ||| | |||||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||    
T  4133564 gaaggctagtacagtctttcaaatttataatgagaactttatggagatgaccaatggtatgggaaacctcagacagccttggacaatctttgagtattag 4133663  T
Q  340 cttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattctctgcaagaac 439  Q
     ||||| || ||||||| || |||||| || |||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||  ||||||||||||    
T  4133664 tttttctagattaggcatgtgtgaaaaatctggggtctgtactagacaatgagaatgactaagattgagaaattttagattctccagcctctgcaagaac 4133763  T
Q  440 agaaatattat 450  Q
    | |||| ||||    
T  4133764 aaaaatgttat 4133774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 291
Target Start/End: Original strand, 7885322 - 7885583
Alignment:
Q  30 atccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggt 129  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | ||  | |||||||||| |||| ||| |||||||||  |||| ||  |||||    
T  7885322 atcctttataaccacatagagaaataaatgcaatgctttttgatcttactactgcaaagggcactcttgtgatagcagtgtcatccgcaaccaaggtggt 7885421  T
Q  130 taaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttctt 229  Q
    |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| |||||||| || |  ||| |||| ||| | |||    
T  7885422 taaagatttcatttgttctatatcctcttctaacttgtcaatttttgtacatccagacagaatgagtgttttcagcgagtctaacttatatatgctcctt 7885521  T
Q  230 ggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtcc 291  Q
    ||||| |  | ||| |   ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  7885522 ggaagttctcgaaggcctgtacaatctttcaaatttattaaaagaatctttttgagatgtcc 7885583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6728564 - 6728172
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||| ||||||||| | ||||  | ||||||| ||||||| |||||  | || | ||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||  ||||||    
T  6728564 acgtgaaaatccttcaaagccacgaaaagaaatatatccaatacttttcaatcttactattgaaaatggcacttttgttatagcagtcttatccgcaatc 6728465  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |  || || || |||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||| |  ||||||| || ||||| | |||||  |||||||| ||| | ||||    
T  6728464 aaggttgtcaatgattccatctgttccacgtcctcctccaatttgtcaatcatggaacatcctgaaagaatcaaagtttctagagattttaacttgtaga 6728365  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    ||||||||||||| || | |||||     || ||| |||||||||||| ||||||||| |  |||  |||||| |||||||| |||  |||||  || ||    
T  6728364 tgtttcttggaagtttccgaagacctgcgcagtctctcaaatttatcagaagaattttttgtagagatccaatgctttgggagaccgtagacaaacttgg 6728265  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||| ||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  6728264 acagtttttgagcacgagcttttcaagattaggtaagtaggaaaagtctggggtttcagtcaaatccagagaatgactaagattaagaatttt 6728172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 414
Target Start/End: Original strand, 6621431 - 6621822
Alignment:
Q  23 cgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatca 122  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| |||| || |  | ||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||  |||||||    
T  6621431 cgtgaaaatccttcaaatccacataaagaaatatatccaatgtttttagatcgtactattgaaaagggaacttttgttatagcagtcttatccgcaatca 6621530  T
Q  123 gagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagat 222  Q
      || || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |  ||||||| || ||||| | |||||  |||||||| ||  |||||||    
T  6621531 aggttgtcaatgattccatctgttccaagtcctcctccaatttgtcaatcatggaacatcctgaaagaattaaagtttctagagattttaatttatagat 6621630  T
Q  223 gtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgga 322  Q
    | |||||||||| |||| |||||  || || ||| |||||||||| |  |||| ||| | ||||  |||||| || ||||| ||   |||||  || |||    
T  6621631 gcttcttggaagtttacgaagacgtatgcagtctgtcaaatttataaggagaagtttatggagagatccaatgctatgggagactgtagacaaacttgga 6621730  T
Q  323 cagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| |  |||| ||    ||||||||||||||| ||||||||    
T  6621731 cagtctttgagcactagcttttcgagattaggcatgtatgaaaaatctggggtttcagtcaaatccaaagaatgactaagattaagaatttt 6621822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 414
Target Start/End: Original strand, 6498449 - 6498841
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||| ||||||| | ||||||  | ||||||  |||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||  ||||||    
T  6498449 acgtgaaaatcctttaaatccacctaaagaaatgtatccaatgctttttgatcttactattgaaaagggaacttttgttatagcagtcttatccgcaatc 6498548  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |  || || || |||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||  ||||||    
T  6498549 aaggttgtcaatgattccatctgttccacgtcctcctccaatttgtcaatcttggaacatccagaaagaatcaaagtttctagagattttaatttataga 6498648  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    || |||| ||||||||   |||||   | || ||  ||||||| ||||  |||| |||   ||||  |||||| || ||||| |||  |||||  || ||    
T  6498649 tgcttctcggaaggttttgaagaccagtgcagtccgtcaaattaatcattagaagtttacagagagatccaatgctatgggagaccgtagacaaacttgg 6498748  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||| |   ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6498749 acagtctttgagtactagcttttcaatattaggcaagtacgtaaagtctggggtttcaatcaaattctgagaatgactaagattaagaatttt 6498841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6675859 - 6675469
Alignment:
Q  24 gtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcag 123  Q
    |||| ||||||||| | ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| |||||| ||||| | || | || ||||||||     
T  6675859 gtgaaaatccttcaaagccacataaagagatgaatccaatgctctttgatcttactattgaaaagggaacttttattatagctgttttatctgcaatcaa 6675760  T
Q  124 agtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatg 223  Q
     || || |  |||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||  |  | |||    
T  6675759 ggttgtcattgattccatctgttccacgtcctcctccaatttgtcaatcttggaacatccagaaagaatcaaagtttctagagattttaatttgcaaatg 6675660  T
Q  224 tttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggac 323  Q
     |||| ||||| ||   |||||   | || ||  |||||||||||| |||||  || | ||||  |||||| || ||||| |||  |||||  || ||||    
T  6675659 cttctcggaagtttttgaagaccagtgcagtccgtcaaatttatcataagaagcttatggagagatccaatgctatgggagaccgtagacaaacttggac 6675560  T
Q  324 agtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| |  | || ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6675559 agtctttgagcaccagcttttcaatattgggcaagtatgaaaagtctggggtttcagccaaattttgagaatgactaagattaagaatttt 6675469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6651224 - 6650872
Alignment:
Q  23 cgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatca 122  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| || || | || | ||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||  |||||||    
T  6651224 cgtgaaaatccttcaaagccacatagagaaatatatccaatgtttcttaatcttactattgaaaacggcacttttgttatagcagtcttatccgcaatca 6651125  T
Q  123 gagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagat 222  Q
      ||  | || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||  |||| ||    
T  6651124 aggttttcaatgattccatctgttccaagtcctcctccaatttgtcaatcttggaacatccagaaagaatcaaagtttctagagattttaatttatatat 6651025  T
Q  223 gtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgga 322  Q
    | |||| ||||| ||   ||||||  | || ||| |||||||||| | ||||| ||| |  |||  |||||| ||  |||| ||| |||  |  || |||    
T  6651024 gcttctaggaagtttctgaagacttgtgcagtctgtcaaatttattagaagaagtttatgcagagatccaatgctacgggagaccgcagttaatcttgga 6650925  T
Q  323 cagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggt 375  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  6650924 cagtctttgagtactagcttttcaagattaggcatgaatgaaaagtctggggt 6650872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6753118 - 6752726
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||| ||||||||| | ||||  | ||||||| |||||||||||||  | || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||    
T  6753118 acgtgaaaatccttcaaagccacgaaaagaaatatatccaatgcttttcaatcttactattgaaaagggcacttttgttatagcagtcttatccgcaatc 6753019  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |  ||  | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||  |||| |    
T  6753018 aaggtaatcaatgattccatctgttccaagtcctcctccaatttgtcaatcatggaacatccagaaagaatcaaagtttctagagattttaatttatata 6752919  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    ||  ||| ||||| ||   ||||||  | || ||| |||||| ||||| |||||  || |  |||  |||||| || ||||| ||   |||||  || ||    
T  6752918 tgcatctaggaagtttctgaagactcgtgcagtctgtcaaatctatcagaagaagattatgtagagatccaatgctatgggagactgtagacaaacttgg 6752819  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||| || || |  |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6752818 acagtctttgagtacaagcttttcaagattaggcatatatgaaaagtctggagtttcggtcaaatcctgagaatgactaagattaagaatttt 6752726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6796944 - 6796553
Alignment:
Q  23 cgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatca 122  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||  ||||  | || | ||| ||||| ||||||||||| |||  ||| | || ||||||||    
T  6796944 cgtgaaaatccttcaaagccacaaaaagaaatatatccaatatttttcaatcttactattgaaaatggcacttttgtgatagaagtcttatctgcaatca 6796845  T
Q  123 gagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagat 222  Q
     |||  | || |||||||| |||||||||||||| || || || |||||| |   ||||||||| ||||| | |||||  |||||||| || ||||||||    
T  6796844 aagtaatcaatgattccatctgttccaagtcctcctccaatttttcaatcatggtacatccagaaagaatcaaagtttctagagattttaatgtatagat 6796745  T
Q  223 gtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgga 322  Q
    | |||||||||| || | |||||  || || ||| |||||||||| | ||||||||| |  |||  |||||| || ||||| |||  |||||  || |||    
T  6796744 gcttcttggaagtttccgaagacctatgcagtctgtcaaatttatgagaagaattttatgtagagatccaatgctatgggagaccgtagacaaacttgga 6796645  T
Q  323 cagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    || | ||| || || ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |  |||| ||   | |||||||||||||| ||||||||    
T  6796644 caattttttagtactagcttttcaagatttggtaagtatgtaaagtctggggtttcagtcaaatccagggaatgactaagattaagaatttt 6796553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 6758875 - 6758487
Alignment:
Q  29 aatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtgg 128  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | || | ||| |||| ||| ||||  |||||  |||| | ||  |||||||  ||      
T  6758875 aatccttcaaagccacacagagaaataaatctaatgctttttaatcttaatattgaaatgggtacttccgttattgcagtcttatccgcaatcaatgtaa 6758776  T
Q  129 ttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttct 228  Q
    | || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| || ||||| | |||||  |||||||| || || |||||| ||||    
T  6758775 tcaatgattccatctgttccaagtcctcctccaatttgtcaatcttgatgcatcctgagagaatcaaagtttctagagattttaatgtttagatgcttct 6758676  T
Q  229 tggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtct 328  Q
     ||||| || | |||||  || || ||| |||||||||||| ||||| ||| |  ||   |||||| || | | | ||    | ||  || ||||||| |    
T  6758675 cggaagtttcctaagacctatgcagtctgtcaaatttatcagaagaagtttatgtagtgatccaatgctattgcagactgtggtcaaacttggacagttt 6758576  T
Q  329 ttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcag 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| | |  |||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6758575 ttgagcaccagcttttcaagattaggaaagtaggaaaagtctgggcttttagtcaaatccagagaatgactaagattaagaattttcag 6758487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6815519 - 6815236
Alignment:
Q  131 aaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||| |  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||  ||||| || ||||||    
T  6815519 aaagattccatctgttccaagtcctcctccaatttttcaatcatggaacatccagaaagaatcaaagtttctagagattttaatttatagttgcttcttg 6815420  T
Q  231 gaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtcttt 330  Q
    |||| || | |||||   | || ||| |||||||||| | ||||||||| |  |||  ||||||||| ||||| ||   |||||  || ||||| | |||    
T  6815419 gaagtttccgaagacctgtgcagtctgtcaaatttatgagaagaattttatgtagagatccaatactatgggagactgtagacaaacttggacaattttt 6815320  T
Q  331 gagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  6815319 gagtactagcttttcaagatttggcaagtatgtaaagtctggggtttcagtcaaatctggagaatgacttagattaagaatttt 6815236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 375
Target Start/End: Original strand, 6545371 - 6545724
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||| ||||||||| | ||||  | ||||||| |||||||||||||  | || | ||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||    
T  6545371 acgtgaaaatccttcaaagccacgaaaagaaatatatccaatgcttttcaatctaactattgaaaagggcacttttgttatagcagtcttatccgcaatc 6545470  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |  ||  | || |||||||| |||||||||||||| || || |||| ||||||  ||||||| || ||||| | |||||  |||||||| ||  ||||||    
T  6545471 aaggttttcaacgattccatctgttccaagtcctcctccaatttgttaatcttggaacatcccgaaagaatcaaagtttctagagattttaatttataga 6545570  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    || || | ||||| || | |||||   | || ||| |||||||||| | ||||| ||| |  |||  |||||| || ||||| ||   |||||  || ||    
T  6545571 tgcttttcggaagttttcgaagacctgtgcagtctgtcaaatttattagaagaagtttatgtagagatccaatgctatgggagactgtagacaaacttgg 6545670  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggt 375  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||    
T  6545671 acagcctttgagtactatcttttcaagattaggcatatatgaaaagtctggggt 6545724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6837321 - 6837040
Alignment:
Q  133 agattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttgga 232  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||| |  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| || ||||||||| |||| |||    
T  6837321 agattccatctgtaccaaatcctcctccaatttgtcaatcatggaacatccagaaagaatcaaagtttgtagagattttaatgtatagatgcttctcgga 6837222  T
Q  233 aggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttga 332  Q
    || || | |||||   | || |   | |||||||||| ||||| ||| | ||||  |||||| || ||||| ||| ||||||  || |||||||||||||    
T  6837221 agtttccgaagacctgtgcagttcgttaaatttatcagaagaagtttatggagagatccaatgctatgggagaccgcagacaaacttggacagtctttga 6837122  T
Q  333 gcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    | || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| || || |  |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6837121 gtactagcttttcaagattcggcatatatgagaagtctggagtttcagtcaaatcctgagaatgactaagattaagaatttt 6837040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 689 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 4360150 - 4360050
Alignment:
Q  689 ttgatttatggactgatgtgtgaattttgtttgtacttgtatacattgtaactaaattcatagttagggctatgatggatcttttgtattataatcgaac 788  Q
    |||||||||| |||  | |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  4360150 ttgatttatgtactactatgtggattttgtttatactattatacattgtaaacaaattcattgttagggttatgatggatcttatgtaatataatcaaac 4360051  T
Q  789 t 789  Q
    |    
T  4360050 t 4360050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 414
Target Start/End: Original strand, 6588119 - 6588511
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||||||   ||| | ||| ||||| ||||||||||| ||  |||| | ||  ||||||    
T  6588119 acgtgaaaatccttcaaagccacaaaaagaaatatatccaatgcttttcatccttactattgaaaatggcacttttgtgatggcagtcttatcggcaatc 6588218  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |  ||  | || |||||||| |||||||||||||| || |  || |||||| |  |||||||||| ||||| | |||||  |  ||||| ||  ||||||    
T  6588219 aaggtaatcaacgattccatctgttccaagtcctcctccagtttttcaatcatagaacatccagaaagaatcaaagtttctaacgattttaatttataga 6588318  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    || ||||||| || || | |||||   | ||  || ||||||||||||||| || ||| |  |||  |||||| || ||||| |||   ||||  || ||    
T  6588319 tgcttcttgggagtttccgaagacctgtgcagcctctcaaatttatcaaaataagtttatgtagagatccaatgctatgggagaccgtggacaaacttgg 6588418  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  |||| ||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  6588419 acagttttttagcacaagcttttcaagattaggtaagtaggaaaagtctggggtttcagtcaaatctagagaatgactaagattaagaatttt 6588511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 412
Target Start/End: Original strand, 6532391 - 6532545
Alignment:
Q  258 tcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaa 357  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | ||||  |||||| || ||||| ||| ||||||  || |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||     
T  6532391 tcaaatttatcagaagaagtttttggagagatccaatgctatgggagaccgcagacaaacttggacagtctttgagtactaacttttcaagattaggcat 6532490  T
Q  358 gtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatt 412  Q
     ||||||||||  ||||| |  |||| ||   |||||||||||||||| ||||||    
T  6532491 atatgaaaagtttggggtttcagtcaaatgtagagaatgactaagattaagaatt 6532545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 6772955 - 6772870
Alignment:
Q  329 ttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |  |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  6772955 ttgagtactagcttttcaagattcggcaagtatgaaaagtctggggtttcggtcaaatcatgggaatgactaagattaagaatttt 6772870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 22 - 456
Target Start/End: Original strand, 5690082 - 5690516
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |  || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  5690082 acgtgagaatccttcatgtccgcacagagaaatatacccaatgctttttgaccttacaattgaaaagggcacacttgttattccagtgtcatttgcaagc 5690181  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5690182 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttccaacttgttaatcattgaacacccggaaagaatgagagttttcagagatttcaacttataga 5690281  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    || |||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||  || ||| ||    
T  5690282 tgcttcttggaaggttagaaaggctaatacaatcttccaaatttatcagaagaattttgtcgagatgtccaatgctatgggaaacctcacgcaaccttgg 5690381  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
    ||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  5690382 acaatctttgagtattagcttttcaagattaggcatgattgaaaagtctggggtctgtgtcagataatgagagtgactaagattgagaattttaagcttc 5690481  T
Q  422 tccattctctgcaagaacagaaatattatagagaa 456  Q
    |||||  ||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  5690482 tccatcatctacaagaatataaatattaaagagaa 5690516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 456
Target Start/End: Original strand, 5354537 - 5354971
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||| || || | ||| || ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |    
T  5354537 acgtgagaatccttcatagccacataaagaaatatatccaatgcttttggaactaactattgagaagggtactcttgttattgcagtgtcatttgcaagc 5354636  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  5354637 agggtggttaaagattccaattgttccaagtcctcttccaacttgtctaactttttacaaccagaaagaatgagagttttcaaagatttcaacttgtaga 5354736  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    || ||||||| ||| || ||||  | || || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| | | | ||    
T  5354737 tgcttcttgggaggctagaaaggttaatgcagtctttgaaatttatcagaagaattttattgagatgtccaatgcttggagaaacttcagataacattgg 5354836  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5354837 acaatctttgagtacaagcttttcaagattaggcatgtaagaaaagtcaggggtatgtgtcagacaatgtgaatgactaagattgagaattttcagatgc 5354936  T
Q  422 tccattctctgcaagaacagaaatattatagagaa 456  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  5354937 tccattctctgcaagaacatacatattaaagagaa 5354971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 456
Target Start/End: Original strand, 5181852 - 5182284
Alignment:
Q  24 gtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcag 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||| ||| | | ||  ||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||     
T  5181852 gtgagaatccttcatatccacacaaggaaatatatgcaatgcttttggactttactactgaaaacggcactcttgttattgcagtgttatttgcaatcaa 5181951  T
Q  124 agtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatg 223  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||  ||||||||    
T  5181952 tgtggttaaagatttcatttgttccaaatcctcttccaacttgtcaatcattaaacacccagaaagaatgagagtgtttaatgatttcaaattatagatg 5182051  T
Q  224 tttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggac 323  Q
     ||||||||||| |   ||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  5182052 cttcttggaaggctttgaaggctaatgcaatcttccaaatttatcaaaagtattttattgagatctccaatactttgggaaacttcagacaacttcggac 5182151  T
Q  324 agtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctc 423  Q
    | ||| |||| || | || ||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5182152 aatctgtgagtactaactgttcaaggttaggcaagtttgaaaagtctggagtctttgacagaaaatgagaatgactaagattgagaattttcagcttctc 5182251  T
Q  424 cattctctgcaagaacagaaatattatagagaa 456  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5182252 cagcctctgcaagaacagaaatgttataaagaa 5182284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5176897 - 5176470
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |    
T  5176897 acgtgagaatccttcatagccgcacaaagagatgtatccaatgctttttgaccttactattgacaagggcactcttgttattgcagtgttatttgcaagc 5176798  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  5176797 agagtagttaaagattccatttgttccaagtcctcttccaacttgtcaatcatcgaacacccagaaagaatgagtgttttcaaagatttcaacttataga 5176698  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    |  ||||||||||  |   ||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||  || ||| ||    
T  5176697 tacttcttggaagactctgaaggctaatacaatcttccaagtttatcagaagaattttatcgagatgtccaatgctatgggaaacctcacgcaaccttgg 5176598  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
     || ||| |||| |  ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5176597 gcaatctatgagtataagcttttcaagattaggcatgtttgaaaagtctggggtctctgtcagataatgagaatgactaagattaagaattttcagcttc 5176498  T
Q  422 tccattctctgcaagaacagaaatatta 449  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5176497 tccatcctctgcaagaacaaaaatatta 5176470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 22 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5278724 - 5278297
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |    
T  5278724 acgtgagaatccttcatagccgcacaaagagatgtatccaatgctttttgaccttactatagacaagggcactcttgttattgcagtgttatttgcaagc 5278625  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  5278624 agagtagttaaagattccatttgttccaagtcctcttccaacttgtcaatcatcgaacacccagaaagaatgagtgttttcaaagatttcaacttataga 5278525  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    |  ||||||||||  |   ||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||| || || ||||||||| ||| ||| ||    
T  5278524 tacttcttggaagactctgaaggctaatacaatcttccaagtttatcagaagaattttatcgagatatccaatgctatgagaaacctcacacaaccttgg 5278425  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
     || ||| |||| |  ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5278424 gcaatctatgagtataagcttttcaagattaggcatgtttgaaaagtctggggtctctgtcagataatgagaatgactaagattaagaattttcagcttc 5278325  T
Q  422 tccattctctgcaagaacagaaatatta 449  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5278324 tccatcctctgcaagaacaaaaatatta 5278297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 5447737 - 5447322
Alignment:
Q  30 atccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggt 129  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||| |||||||   ||| | |||||||| |||||||||    
T  5447737 atccttcaaatccgcacaaagaaatatatccaatgctcttcgacctaactaccgaaaagggcactgttgttattgaagtattatttgcaagcagagtggt 5447638  T
Q  130 taaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttctt 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  5447637 taaagattccatctgttccaagtcctcttccagcttgtcaatctttaaacaaccagaaagaatgagagttttcaaagatttcaacttatagatgcttctt 5447538  T
Q  230 ggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctt 329  Q
    || |||||||  || |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| | | ||||| ||||    
T  5447537 gggaggttacctaggccaatacaatcttccaaatttatcagaagaattttattgagatgtccaatgctaggagaaacctcagacaacattggacaatctt 5447438  T
Q  330 tgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattct 429  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | | |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||    
T  5447437 tgagtactagcttttcaagattaggcaagcatgaaaagtccgggatgtttgtcagacgatgagaatgactaagattgagatttttcagattttccatcct 5447338  T
Q  430 ctgcaagaacagaaat 445  Q
    ||||||||||| ||||    
T  5447337 ctgcaagaacaaaaat 5447322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5345018 - 5344585
Alignment:
Q  23 cgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatca 122  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  5345018 cgtgagaatccttcatagccacacagagaaatatatccaatgctttttgaccttactactaaaaagggaacttttgttattgcagtgttatttgcgatca 5344919  T
Q  123 gagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagat 222  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  5344918 gaatggttaaagatttcatttgttctaagtcctcttccaacttgtcaatctttaaacaacccgaaagaatgagagtttttagagaattcaacttatagat 5344819  T
Q  223 gtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgga 322  Q
    | ||||||| ||| |||| || || ||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||| |||  || |||    
T  5344818 gcttcttggcaggctacataggctaatacagtcttccaaattaatgagaagaattttcttgagatctccaatgctatgagaaatctcacacaaacttgga 5344719  T
Q  323 cagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgct 422  Q
    || ||   ||| || | ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5344718 caatccacgagtactaacttttcaagattaggtaagtaagaaaagtccggggtttgtatcaggtaatgagaatgactaagattgagaattttcagcttct 5344619  T
Q  423 ccattctctgcaagaacagaaatattatagagaa 456  Q
    ||||  |||| ||||||| |||| || |||||||    
T  5344618 ccatcatctgtaagaacataaatgttgtagagaa 5344585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 440
Target Start/End: Original strand, 5128347 - 5128758
Alignment:
Q  29 aatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtgg 128  Q
    ||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||| || ||||  |||||| |||||||| |||||| |    
T  5128347 aatccttcatggccgcacagagagatatatccaatgctttttgaccttactactgaaaagggtactctttttattgcagtgttatttgcaagcagagttg 5128446  T
Q  129 ttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttct 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5128447 ttaatgattccatttgttccaagtcctcttccaacttgtcaatcattatacaaccagaaagaatgagagttttcaaagatttcaacttatagatgcttct 5128546  T
Q  229 tggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtct 328  Q
    ||| ||| |||| || || || ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||    ||||||||||||| | | | ||| |||    
T  5128547 tgggaggctacataggctaatgcaatcttccaaatttatcagaagaattttattgagatgtccgatgctagtagaaacctcagacaacattgaacaatct 5128646  T
Q  329 ttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattc 428  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||      
T  5128647 ttgagtactagcttttcaagattaggtaaatatgaaaagtctggggtgtgtgtcagacaatgagaatgactatgattgagaattttcagcttctccatca 5128746  T
Q  429 tctgcaagaaca 440  Q
    ||||||||||||    
T  5128747 tctgcaagaaca 5128758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 24 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5434191 - 5433775
Alignment:
Q  24 gtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcag 123  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| || ||||  |||||| |||||||| |||    
T  5434191 gtgagaatccttcataaccgcacaaagagatatatccaatgctttttgatctcagtactgaaagaggcactctttttattgcagtgttatttgcaagcag 5434092  T
Q  124 agtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatg 223  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  5434091 agtggttaaagattccatatgttccaagtcatcttccaaattgtcaatctttaaacagccagtaaggatgagagttttcaaagatttcaacttatatatg 5433992  T
Q  224 tttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggac 323  Q
     ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||  | |||| |||||| || || ||||    
T  5433991 cttcttgggaggttacataggccaatacaatcttccaaatttatcagaagaatttcattgagatggccaatgctaggagaaatctcagaaagacttggac 5433892  T
Q  324 agtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctc 423  Q
    | ||| |||| || | ||||||||| |||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  5433891 aatctgtgagtactaacttttcaagattaggcaaatttgaaaagtctggtgtttgtgtcagataatgacaatgactaaggttaagaattttcagcttctc 5433792  T
Q  424 cattctctgcaagaaca 440  Q
    |||||||||||||||||    
T  5433791 cattctctgcaagaaca 5433775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5096866 - 5096446
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||| |    
T  5096866 acgtgaaaatccttcatggccacatagagaaatgtatccaatgctttttgaccttactactgaaaagggtactctttttattccagtgttatttgcaagc 5096767  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5096766 agaatggttaatgattccatttgttctatgtcctcttccaactcgtcaatcattatacacccagaaagaatgagagttttcagagatttcaacttataga 5096667  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    || ||| ||||||| ||| ||| || | |||||||| ||||| ||| | ||||||||   |||||| |||||| ||  | ||||||||||||| | | ||    
T  5096666 tgcttcctggaaggctacgaaggctaacacaatcttccaaatctattagaagaatttcactgagatttccaatgctaggagaaacctcagacaacattgg 5096567  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  5096566 acaatctttaagtaccagcttctcaagattaggcatgtatgaaaagtctggggtgtgtgtcagacaatgagaatgactaagatttagaattttcagtttt 5096467  T
Q  422 tccattctctgcaagaacaga 442  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  5096466 tccatcctctgcaagaacaga 5096446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 425
Target Start/End: Original strand, 5073831 - 5074234
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||| |||||||  | |||| |||||| |||    
T  5073831 acgtgagaatccttcatagccgcacaaagaaatatatccaatgcttttcgaccttactactgaaaagggcactcttgttattgcggtgttatttgctatc 5073930  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| || || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5073931 agagtggttaaagatgtcatctgttctaagtcctcttccaacttgtcaatcattgaacacccggaaagaatgagagtttttagagatttcaacttataga 5074030  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    |  ||||||||||| |   |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||| ||    
T  5074031 tacttcttggaaggctctgaagaccaatacaatcttccaaatttatcagaagaattttattgagatgttcaatactatgagaaacctctgacaaccttgg 5074130  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
    ||| ||| |||| || || | |||||| |||||||||| |||||| || || || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  5074131 acaatctgtgagtactagttgttcaagattaggcaagtttgaaaaatctggagtttgcgtcagataatgagaatgactaagattgagtattttcagcttc 5074230  T
Q  422 tcca 425  Q
    ||||    
T  5074231 tcca 5074234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 442
Target Start/End: Original strand, 5102546 - 5102957
Alignment:
Q  31 tccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggtt 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||  ||||||  ||||| |  |||||||||    
T  5102546 tccttcatagccacatagagagatatatccaatgctttttgaccttactactgaaaagggcactgttgttattgcagtgttgtttgctagaagagtggtt 5102645  T
Q  131 aaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttg 230  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  5102646 aatgattccatttgttccaagtcgtcttccaacttgtcaatcattaaacacccagaaagaatgagtattttcaaagatttcaacttatagatgcttcttg 5102745  T
Q  231 gaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtcttt 330  Q
    ||||| ||| ||| || | |||||||| ||||| ||| | ||| ||||   |||||| ||||||  |  |  |||||||||||| | | ||||| |||||    
T  5102746 gaaggctacgaaggctaacacaatcttccaaatctattagaagtatttcagtgagatctccaatggtaggacaaacctcagacaacattggacaatcttt 5102845  T
Q  331 gagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattctc 430  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  |||    
T  5102846 gagtaccagcttctcaagattaggcaagtatgaaaagtcaggggtgtgcgtcagacaatgagaatgactaagatttagaattttcagcttttccaacctc 5102945  T
Q  431 tgcaagaacaga 442  Q
    ||||||||||||    
T  5102946 tgcaagaacaga 5102957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 35 - 456
Target Start/End: Original strand, 5284325 - 5284746
Alignment:
Q  35 tcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggttaaag 134  Q
    ||||| || |||| || |||| ||||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||| |||||||  | |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  5284325 tcataaccgcacaaagcaatatatccaatgcttttcgaccttactactgaaaagggcactcttgttattgcggtgttattagctatcagagtggttaaag 5284424  T
Q  135 attccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaag 234  Q
    ||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||    
T  5284425 atgtcatctgttctaagtcctcttccaacttgtcaatcattgaacacccaaaaagaatgaaagtttttagagatttcaacttatagatgcttcgtgggag 5284524  T
Q  235 gttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagc 334  Q
    | |||| |  || |||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  5284525 gctacataagctaatacaaccttcaaaatttatcaaagcaattttattgagatttccaatgctaggtgaaacctcagatagccttggacaatctttgagc 5284624  T
Q  335 accagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattctctgca 434  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5284625 actagcttttcaagattaggcatgttcgaaaagtcagggcttcgtgtgagataatgggaatgactaagattgagaattttcagcttctccatcctctgca 5284724  T
Q  435 agaacagaaatattatagagaa 456  Q
    |||||| ||||||||| |||||    
T  5284725 agaacataaatattattgagaa 5284746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 5383484 - 5383055
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||| || |||| ||||||||||| |  || |||| ||| ||| |||||||  |||||| || ||||| |    
T  5383484 acgtgagaatccttcatggccgcacaaagaaatatatacaatactttttgaccttaaaattgaaaggggaactcttgttattgcagtgttatctgcaagc 5383385  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  5383384 aaagtagttaaagattccatttgttctatgtcctcttccaacttggtaatctttaaacaaccagaaagaatgagagttttcagagatttcaacttataaa 5383285  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    || ||||||| ||| |||| || || | ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||| |||| ||||||    
T  5383284 tgcttcttgggaggctacataggctaacacagtcttccaaattaatcagaagaattttcttgagatctccaatgctaggagaaacctcggacaacctcgg 5383185  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
    ||| |||  ||| || ||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||   |    
T  5383184 acaatctgcgagtactagcttttcaagattaggcaaatttgagaagtctggggtctgcaccaggtaatgagaatgactaaggtttaggattttcagtatc 5383085  T
Q  422 tccattctctgcaagaacagaaatattata 451  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5383084 tccatcctctgcaagaacataaatattata 5383055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 442
Target Start/End: Original strand, 5066621 - 5067037
Alignment:
Q  26 gagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagag 125  Q
    |||||||||||||| || |||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | | || ||||  |||| | || ||||| |||||    
T  5066621 gagaatccttcatagccgcacaaagagatgtatccaatgctttttgaccttactactgaaaagggtattctttttattgcagttttatgtgcaagcagag 5066720  T
Q  126 tggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtt 225  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  5066721 tggttaaagattccatttgttctatgtcctcttctaacttgtcaatcattatacacccagaaagaatgagagttttaagagatttcaacttatagatgct 5066820  T
Q  226 tcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacag 325  Q
    |||||||||||||| ||| || | |||||||| ||||| ||| | ||||||||   |||| | ||| ||  |  | |||||||| ||||   | |||||     
T  5066821 tcttggaaggttacgaaggctaacacaatcttccaaatctattagaagaatttcactgagttttcctattgtaggagaaacctcggacaatattggacaa 5066920  T
Q  326 tctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctcca 425  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||    
T  5066921 tctttgagtactagcttttcaagattaggcatatatgaaaagtcaggggtgtgcatcagacaatgagaatggctaagatttagaattttcagcttttcca 5067020  T
Q  426 ttctctgcaagaacaga 442  Q
    | |||||||||||||||    
T  5067021 tcctctgcaagaacaga 5067037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 5426068 - 5425649
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||  |||||||||||| |||| | |  |  |||||||| ||| || ||||  |||| | || |||||||    
T  5426068 acgtgaaaatccttcatagccgcacaaagagatgtatccaatgctttgtgacattaccactgaaaagggtactctttttattgcagttttatgtgcaatc 5425969  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5425968 agagtggttaaagattccatttgttctatgtcctcttccaacttgtcaatcattacacacccagaaagaatgagagttttcagagatttcaacttataga 5425869  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    |||||||||||||| |   ||| |  | ||||||||  |||||||| | ||||||||   |||||| |||||| ||  | |||| |||||||| | | ||    
T  5425868 tgtttcttggaaggctttgaaggcgaacacaatcttctaaatttattagaagaatttctctgagatttccaatgctaggagaaatctcagacaacattgg 5425769  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  5425768 acaatctttgagcaccagcttttcaagattaggcatgaatgtaaagtcaggggtgcgcgtcagacaatgagaatgactaagatttagaattttcagcttt 5425669  T
Q  422 tccattctctgcaagaacag 441  Q
    ||||| | |||||| |||||    
T  5425668 tccatccactgcaaaaacag 5425649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 442
Target Start/End: Original strand, 5157558 - 5157971
Alignment:
Q  29 aatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtgg 128  Q
    ||||||||||| || | || ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| ||| || ||||  ||||||| | ||||| ||||||||    
T  5157558 aatccttcatagccgcccaaagagatgtatccaatgctttttgaccttactactgaaaagggtactctttttattgcagtgtcgtgtgcaagcagagtgg 5157657  T
Q  129 ttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttct 228  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5157658 ttaaagattccatctgttctatgtcctcttccaacttgtcaatcattatacaccctgaaagaattaaaattttcagagatttcaacttatagatgcttct 5157757  T
Q  229 tggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtct 328  Q
    ||||||| | | ||| || | |||||||| ||||| ||| | ||||||||   |||||| |||||| ||  | ||||||||||||| | | ||||| |||    
T  5157758 tggaaggcttcgaaggctaacacaatcttccaaatctattagaagaatttcactgagatttccaatgctaggagaaacctcagacaacattggacaatct 5157857  T
Q  329 ttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattc 428  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||      
T  5157858 ttgagtaccagcttctcaagattaggcatgtatgaaaagtctggggtgtgcgtcagacaatgagaatgactaagatttagaatttttagcttttccatca 5157957  T
Q  429 tctgcaagaacaga 442  Q
    ||||||||||||||    
T  5157958 tctgcaagaacaga 5157971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 89 - 450
Target Start/End: Original strand, 5257324 - 5257685
Alignment:
Q  89 ggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagata 188  Q
    |||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| |    
T  5257324 ggcactcttgttattgcagtgttatttgcaattagagtggttaaagatgtcatctgttctaagtcctcttccaacttgtcaatcattgaacacccagaaa 5257423  T
Q  189 gaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatg 288  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| || |  || |  || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  5257424 gaatgaaagtttttagagatttcaacttatagatgcttcttgggagttcgcataagctaatacaatcttccaaatttatcaaaacaattttcttgagatt 5257523  T
Q  289 tccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataa 388  Q
    |||||| |||   ||||||  ||| ||| | ||||| |||||||| || | ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |   ||| ||| ||    
T  5257524 tccaatgcttgaagaaaccctagatagcattggacaatctttgagtactaacttttcaagattaggcatgttggaaaagtcagggcttcttgtgagacaa 5257623  T
Q  389 tgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattctctgcaagaacagaaatattat 450  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5257624 cgggaatgactaagattgagaattttcagcttctccatcctctgcaagaacataaatattat 5257685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 5397101 - 5396674
Alignment:
Q  29 aatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtgg 128  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| |  || ||||| |||||| || ||||  |||||| |||||||| ||  ||||    
T  5397101 aatccttcatatccgcacaaagagataaatccaatgctttttaaccttaaaattgaaaacggcactctttttattgcagtgttatttgcaaccaaggtgg 5397002  T
Q  129 ttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttct 228  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||  |||||| ||||| ||||  |||||||  || ||||||||| |||| ||  ||||    
T  5397001 ttaaagattccatctgttccaaatcttcttccaatttgtcaatcagtaaacacccagaaagaagaagagtttgtagtgatttcaacttataaatacttct 5396902  T
Q  229 tggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtct 328  Q
    ||||||| |   |||  | |||||||  | ||||||||| | ||| ||||| || |||| ||||||| | |||||||| || |||| | | ||||| ||     
T  5396901 tggaaggctttgaagcttaatacaattctccaaatttattagaagtatttttttcagatctccaatattatgggaaacttctgacaactttggacaatca 5396802  T
Q  329 ttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattc 428  Q
     |||  || || | |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  5396801 gtgactactagttgttcaagattaggcatgtttgaaaagtctggggtctgtgtcaaataatgagaatgactaagattgagaattttcagcttctccagcc 5396702  T
Q  429 tctgcaagaacagaaatattatagagaa 456  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5396701 tctgcaagaacataaatattataaagaa 5396674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 5350552 - 5350157
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||  |||||||| | | || ||||  |||| | || ||||| |    
T  5350552 acgtgaaaatccttcatagccgcacaaagagatgtatccaatgctttttgaccttactactgaaaagggtattctttttattgcagttttatgtgcaagc 5350453  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  5350452 agagtggttaaagattccatttgttctatgtcctcttccaacttgtcaatcattatacaccctgaaagaatgagagttttgagagatttcaacttaaaga 5350353  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    || ||||||||||| |   ||| || | |||||| | ||||| ||| | ||||||||   |||||| |||||| ||  | |||||||| |||| | | ||    
T  5350352 tgcttcttggaaggctttgaaggctaacacaatcctccaaatctattagaagaatttcactgagatctccaatgctaggagaaacctcggacaacattgg 5350253  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagct 419  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5350252 acaatctttgagtactagcttttcaagattaggcatgtatgaaaagtc--gggtgtgtgtcagacaacaagaatgactaagatttagaattttcagct 5350157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 106 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5447231 - 5446897
Alignment:
Q  106 agtgtcatttgcaatcagagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcaga 205  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |    
T  5447231 agtgttatttgcaagaagagtggttaaagattccattttctcgaagtcctcttccaccttgtcaatctttaaacaaccagaaagaacgagagttttcaaa 5447132  T
Q  206 gatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaa 305  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| ||| |||| || || || || |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||  || ||  | ||||    
T  5447131 gatttcaacttatagatgctttttgggaggctacataggctaatgcagtcttccaagtttatcagaagaattttattgagatgtctgatgctaggtgaaa 5447032  T
Q  306 cctcagacagcctcggacagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagatt 405  Q
    ||||||||| |   || || |||||||| || || |||| ||| ||||||  || ||||||||||||| | ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  5447031 cctcagacaacagtgggcaatctttgagtactagtttttgaagattaggcgtgtttgaaaagtcagggctttgtgtgagatagtgcgaatggctaagatt 5446932  T
Q  406 gagaattttcagctgctccattctctgcaagaaca 440  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  5446931 gagaatttttagcttctccatcctctgcaagaaca 5446897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 5370727 - 5370311
Alignment:
Q  24 gtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcag 123  Q
    |||| |||||| |||  |||||||  |||||  ||||||||||||||||||  | ||  |||||||| ||  || ||||  |||||| |||||||| |||    
T  5370727 gtgaaaatcctacatggccacacaatgaaatgtatccaatgctttttgaccgtactactgaaaagggtaccctttttattgcagtgttatttgcaagcag 5370628  T
Q  124 agtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatg 223  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||| ||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||||||| |||| |||    
T  5370627 agtggttaatgattccatctgttctatatcctcttccaacttctcaatcattacacaccctgaaagaataagagtctttagagatttcaacttataaatg 5370528  T
Q  224 tttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggac 323  Q
     ||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||| ||| | ||||||||    |||||  ||||| ||  | ||||||||||||||| | | ||    
T  5370527 cttcttggaaggttacgaaggctaacacaatcttcaaaatctattagaagaatttcgccgagattcccaatgctaggagaaacctcagacagcattgaac 5370428  T
Q  324 agtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctc 423  Q
    | |||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||    
T  5370427 aatctttgagtactaacttttcaagcttaggcaagtatgaaaagtctggggtgtgcgtcagacaatgagaatgactaagatttagaatttttagcttttc 5370328  T
Q  424 cattctctgcaagaaca 440  Q
    |||  ||||||||||||    
T  5370327 catcatctgcaagaaca 5370311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 419
Target Start/End: Original strand, 5243910 - 5244187
Alignment:
Q  142 ttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttacaa 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |    
T  5243910 ttgttccaagtcctcttccaacttctcaatcattatacaccctgagagaatgaaagttttcagagatttcaacttatagatgcttcttggaaggcttcga 5244009  T
Q  242 agactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagcaccagct 341  Q
    || || | |||||||| ||||| ||| | ||||||||   ||||||  ||||| ||  | |||| ||| |||| |   | ||| |||||||| || ||||    
T  5244010 aggctaacacaatcttccaaatctattagaagaatttcactgagattcccaatgctaggagaaatctcggacaacactgaacaatctttgagtactagct 5244109  T
Q  342 tttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagct 419  Q
    ||||||| || | || |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5244110 tttcaagatttgacatgtatgaaaagtctggggtgtgcgtcagacaatgagaatgactaagatttagaatttttagct 5244187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 249 - 440
Target Start/End: Original strand, 5147046 - 5147237
Alignment:
Q  249 tacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagcaccagcttttcaag 348  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| | | ||||| ||   ||| || || | ||||||    
T  5147046 tacaatcttccaaatttatcagaagaattttattgagatatccaatactatgagaaacttcagacaacattggacaatcagagagtactagttgttcaag 5147145  T
Q  349 gttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattctctgcaagaaca 440  Q
     |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  5147146 attaggcaagtttaaaaagtttggggtctgtgtcaaataatgagagtgactaagcttgagaatttttagcttctccatcctctgcaagaaca 5147237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5281458 - 5281280
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||| ||| || || | ||||||| |||||||| ||||  ||||   ||  | |||||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  5281458 acgtgagaatcctttatagccgcagaaagaaatatatccaatgtttttcaaccttcctactgcaaagggaactcttgttattgcagtgtcattagcaatc 5281359  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttt 200  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| ||||| |||||||    
T  5281358 agggtcgttaaggattccatttgttccaagtcctcttctaacttgttaatcattgaacacccagaaagaatcagagttt 5281280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5179699 - 5179521
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||| ||| || || | ||||||| |||||||| ||||  ||||   ||  | |||||| ||| | |||||  |||||||||| ||||||    
T  5179699 acgtgagaatcctttatagccgcagaaagaaatatatccaatgtttttcaaccttcctactgcaaagggaactctagttattgcagtgtcattagcaatc 5179600  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttt 200  Q
    || || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  5179599 agggtcgttaaggattccatttcttccaagtcctcttccaacttgttaatctttgaacacccagaaagaatcagagttt 5179521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 100
Target Start/End: Original strand, 5243837 - 5243914
Alignment:
Q  23 cgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgtt 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||    
T  5243837 cgtgaaaatccttcatagccacacaaagaaatatatccgatgctttttgaccttactactgaaaagggcactcttgtt 5243914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 162; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 451
Target Start/End: Original strand, 8823 - 9252
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||| || |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||   |||||| || ||||| |    
T  8823 acgtgagaatccttcatggccgcacaaagaaatatatacaatactttttgaccttactattgaaaagggcactcttgttaatgcagtgttatctgcaagc 8922  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtataga 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8923 agagtggttaaagattccatctgttctatgtcctcttccaacttgtcaatcattatacacccagaaagaatgagagttttcagagatttcaacttataga 9022  T
Q  222 tgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgg 321  Q
    || ||||||||||| ||| ||| || | |||||||| ||||| ||| | ||| ||||    ||||| ||||||  | || |||||||| | || | | ||    
T  9023 tgcttcttggaaggctacgaaggctaacacaatcttccaaatctattagaagtatttcaccgagatctccaatggtatgagaaacctcggtcaacattgg 9122  T
Q  322 acagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgc 421  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9123 acaatctttgagtactagcttttcaagattaggcaaatatgaaaagtctggggtatgcatcaaataatgagaatgactaagattgagaattttcagcttc 9222  T
Q  422 tccattctctgcaagaacagaaatattata 451  Q
     |||  |||||||||| || ||||||||||    
T  9223 gccagcctctgcaagaccataaatattata 9252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 24 - 456
Target Start/End: Original strand, 36213754 - 36214186
Alignment:
Q  24 gtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcag 123  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||| ||| |  | |||||||| || || | ||  ||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||     
T  36213754 gtgagaatccttcatagccgcacaaagatatataagcgatgcttttagatcttactactgaaaatggcactcttgttattgcagtgttatttgcaatcaa 36213853  T
Q  124 agtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatg 223  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||     
T  36213854 ggtggttaaagattccatctgttccatgtcctcttccaatttgtcaatctttgaacatccagaaagaatgagagttttaagtaattttaacttatagata 36213953  T
Q  224 tttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggac 323  Q
      | | |||||| |   ||| || |||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||    
T  36213954 cctttaggaaggctttgaaggctaatacaatcttccaaatttattagaagaactttattgagatgtccaatactgtgggaaacctcagacaatcttggac 36214053  T
Q  324 agtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctc 423  Q
    | ||| |||| || || |||||||||||||||| || |||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  36214054 aatctgtgagtactagtttttcaaggttaggcatgtttgaaaaatctggagtctttgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagcttttc 36214153  T
Q  424 cattctctgcaagaacagaaatattatagagaa 456  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36214154 cagcctctgcaagaacagaaatgttataaagaa 36214186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 18935537 - 18935147
Alignment:
Q  29 aatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtgg 128  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||  | |||||||||| |||||| | |||| | ||  |||| ||| ||||    
T  18935537 aatccttcaaatccacacagtgaaataaatccaatgctttttgatcttactactgcaaagggcactcttgttacagcagtcttatccgcaaccagggtgg 18935438  T
Q  129 ttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttct 228  Q
    | ||||||  ||| ||||| | ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||| |  || |  ||  |||||||| ||||    
T  18935437 tcaaagatgtcatctgttctatgtcctcttccaacttgtcaatttttgtacatccagataaaatgagagctttgaccgactctaatttatagatgcttct 18935338  T
Q  229 tggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtct 328  Q
    |||||| | |||||| |   |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||   ||||  || || || |||    
T  18935337 tggaagttcacaaaggcctgtacagtctttcaaatttattaaaagaattttcttgagaagtcctatactatgagaaaccgaggacaaacttgggcaatct 18935238  T
Q  329 ttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagct 419  Q
    ||||| |  | ||||||||| || ||||||| ||||||||  ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  18935237 ttgagtattaacttttcaagattcggcaagtttgaaaagttcggggtttgtctcaggttatgagaatgactaagattaagaaacttcagct 18935147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 419
Target Start/End: Original strand, 34724516 - 34724906
Alignment:
Q  29 aatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtgg 128  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | ||  | ||| || ||  |||||| |  ||| | ||  ||||  ||| |||    
T  34724516 aatccttcaaatccacaaagtgaaataaatccaatgctttttgatcttactactgcaaatggaacccttgttacagaagtcttatccgcaactagaatgg 34724615  T
Q  129 ttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttct 228  Q
    | |||||   ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||| |  || |||||  |||||||| ||||    
T  34724616 tcaaagaagtcatttgttctatgtcctcttccaacttgtcaatttttgtacatccagacacaatgagagtttttactgacttcaatttatagatgcttct 34724715  T
Q  229 tggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtct 328  Q
    |||||| | |||||| |   |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |  | |||||    ||||   | ||||| |||    
T  34724716 tggaagctcacaaaggcctgtacagtctttcaaatttatcaatagaattttcttgagatttcctatattaggagaaactgaggacaaatttggacaatct 34724815  T
Q  329 ttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagct 419  Q
    ||||| |  | ||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||| |||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34724816 ttgagtattaacttttcaagatttggcaagtatgaaaagtctggtgtttgtttcaagttatgagaatgactaagattaagaaatttcagct 34724906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 8877760 - 8877333
Alignment:
Q  29 aatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtgg 128  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||| || ||| || ||||  |||||| |||||||| ||||||||    
T  8877760 aatccttcatagccgcacaaagaaatatatccaatgctttttgaccttactaatgaaaatggtactctttttattgcagtgttatttgcaagcagagtgg 8877661  T
Q  129 ttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttct 228  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||| || |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | || ||  ||||    
T  8877660 ttaaagatttcatctgttctaagtcctcctccaacttgtcaatcattgaacacccagaaagaatgagagattttagagatttcaacttgtatatacttct 8877561  T
Q  229 tggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtct 328  Q
    ||||||| | | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||| | || |||| |||   || ||||||||| |||    
T  8877560 tggaaggctccgaaggctaatacaatcttccaaatttatcaaaagaactttattcagaagtcctatagtatgcgaaatctctatcaacctcggacaatct 8877461  T
Q  329 ttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattc 428  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||| | ||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  8877460 ttgagtactagcttttcaagattaggcaagtttaaaaagtctggagtttgtgtcagatgatgagagtggctaagattgagaatttttagcttctccatcc 8877361  T
Q  429 tctgcaagaacagaaatattatagagaa 456  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8877360 tctgcaagaacataaatttgatagagaa 8877333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 453
Target Start/End: Original strand, 47986842 - 47987206
Alignment:
Q  89 ggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagata 188  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  47986842 ggcactcttgttatcgcagtgttatttgcaaccaaagtagttaaagatttcatttattccatgtcctcttccaacttgttaatctttaaacagccagaaa 47986941  T
Q  189 gaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatg 288  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  | ||  || ||||||| ||| |||| || || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  47986942 gaatgagagtttttagagattttaatttgtatgtgcttcttgggaggctacataggctaatacagtcttccaaatttatcagaagaattttgtcgagatg 47987041  T
Q  289 tccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataa 388  Q
    |||||| ||  | |||| |||||| | | | || || |||||||| || |||||||| || ||||||| || |||||||||| || |  |||| ||||||    
T  47987042 tccaatgctaggagaaatctcagataacattgggcaatctttgagtactagcttttcgagattaggcatgtttgaaaagtcaaggcttcgtgtgagataa 47987141  T
Q  389 tgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattctctgcaagaacagaaatattataga 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||  ||| |||||||    
T  47987142 tgagaatgactaagattgagaatttttagcttttccatcttctgcaagaacatgaattttataga 47987206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 453
Target Start/End: Original strand, 47996129 - 47996493
Alignment:
Q  89 ggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagata 188  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  47996129 ggcactcttgttatcgcagtgttatttgcaaccaaagtagttaaagatttcatttattccatgtcctcttccaacttgttaatctttaaacagccagaaa 47996228  T
Q  189 gaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatg 288  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  | ||  || ||||||| ||| |||| || || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  47996229 gaatgagagtttttagagattttaatttgtatgtgcttcttgggaggctacataggctaatacagtcttccaaatttatcagaagaattttgtcgagatg 47996328  T
Q  289 tccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataa 388  Q
    |||||| ||  | |||| |||||| | | | || || |||||||| || |||||||| || ||||||| || |||||||||| || |  |||| ||||||    
T  47996329 tccaatgctaggagaaatctcagataacattgggcaatctttgagtactagcttttcgagattaggcatgtttgaaaagtcaaggcttcgtgtgagataa 47996428  T
Q  389 tgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattctctgcaagaacagaaatattataga 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||  ||| |||||||    
T  47996429 tgagaatgactaagattgagaatttttagcttttccatcttctgcaagaacatgaattttataga 47996493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 453
Target Start/End: Original strand, 48005416 - 48005780
Alignment:
Q  89 ggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagata 188  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  48005416 ggcactcttgttatcgcagtgttatttgcaaccaaagtagttaaagatttcatttattccatgtcctcttccaacttgttaatctttaaacagccagaaa 48005515  T
Q  189 gaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatg 288  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  | ||  || ||||||| ||| |||| || || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  48005516 gaatgagagtttttagagattttaatttgtatgtgcttcttgggaggctacataggctaatacagtcttccaaatttatcagaagaattttgtcgagatg 48005615  T
Q  289 tccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataa 388  Q
    |||||| ||  | |||| |||||| | | | || || |||||||| || |||||||| || ||||||| || |||||||||| || |  |||| ||||||    
T  48005616 tccaatgctaggagaaatctcagataacattgggcaatctttgagtactagcttttcgagattaggcatgtttgaaaagtcaaggcttcgtgtgagataa 48005715  T
Q  389 tgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattctctgcaagaacagaaatattataga 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||  ||| |||||||    
T  48005716 tgagaatgactaagattgagaatttttagcttttccatcttctgcaagaacatgaattttataga 48005780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 453
Target Start/End: Original strand, 48014701 - 48015065
Alignment:
Q  89 ggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagata 188  Q
    |||||| |||||||  |||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  48014701 ggcactcttgttatcgcagtgttatttgcaaccaaagtagttaaagatttcatttattccatgtcctcttccaacttgttaatctttaaacagccagaaa 48014800  T
Q  189 gaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatg 288  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  | ||  || ||||||| ||| |||| || || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  48014801 gaatgagagtttttagagattttaatttgtatgtgcttcttgggaggctacataggctaatacagtcttccaaatttatcagaagaattttgtcgagatg 48014900  T
Q  289 tccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataa 388  Q
    |||||| ||  | |||| |||||| | | | || || |||||||| || |||||||| || ||||||| || |||||||||| || |  |||| ||||||    
T  48014901 tccaatgctaggagaaatctcagataacattgggcaatctttgagtactagcttttcgagattaggcatgtttgaaaagtcaaggcttcgtgtgagataa 48015000  T
Q  389 tgagaatgactaagattgagaattttcagctgctccattctctgcaagaacagaaatattataga 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||  ||| |||||||    
T  48015001 tgagaatgactaagattgagaatttttagcttttccatcttctgcaagaacatgaattttataga 48015065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 164 - 286
Target Start/End: Original strand, 6905991 - 6906113
Alignment:
Q  164 ttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaat 263  Q
    |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |  ||||| || || | ||||||  |||| || |||||||    
T  6905991 ttgtcaatctttgaacaaccaaaaagaatgagagttttcacagatatcagctgatagatctcccttggtagattgccaagacttgtacagtccttcaaat 6906090  T
Q  264 ttatcaaaagaattttcttgaga 286  Q
    |||||| |||||  |||||||||    
T  6906091 ttatcagaagaagcttcttgaga 6906113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 267
Target Start/End: Original strand, 22584146 - 22584382
Alignment:
Q  31 tccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcagagtggtt 130  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  | | |||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  22584146 tccttcatagccacacaaagaaatgtaccaaatagtttttgacctaaatattgaaaatggcactttttttattgcagtttcatttgcaagcagagtggtt 22584245  T
Q  131 aaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttg 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  22584246 aaagattccatttgttccaagtcctcttccaacttataaagtttttaacagccagaaagaatgagagttttcaaagatttcaacttgtagatgtttcttg 22584345  T
Q  231 gaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttat 267  Q
    | ||| ||||||| || | ||| |||| |||||||||    
T  22584346 ggaggctacaaaggcttaaacagtcttgcaaatttat 22584382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 294
Target Start/End: Original strand, 14767123 - 14767262
Alignment:
Q  155 tcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttggaaggttacaaagactgatacaat 254  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| || || || ||||||||||||| |||||||||   |||||| | |||||| || ||   ||||||  |||| |    
T  14767123 tcttccaatttgtcaatctttgaacagccggaaaggatgagagttttcaaagatttcaattgatagatctctcttgggagattttcaagacttgtacagt 14767222  T
Q  255 ctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaat 294  Q
    | ||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||    
T  14767223 ccttcaaatttatgagaagaacattcttgagatctccaat 14767262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0813 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0813
Description:

Target: scaffold0813; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 4750 - 5102
Alignment:
Q  23 cgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatca 122  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| || || | || | ||| ||||| ||||||||||||||| |||| | ||  |||||||    
T  4750 cgtgaaaatccttcaaagccacatagagaaatatatccaatgtttcttaatcttactattgaaaacggcacttttgttatagcagtcttatccgcaatca 4849  T
Q  123 gagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagat 222  Q
      ||  | || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||  |||| ||    
T  4850 aggttttcaatgattccatctgttccaagtcctcctccaatttgtcaatcttggaacatccagaaagaatcaaagtttctagagattttaatttatatat 4949  T
Q  223 gtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgga 322  Q
    | |||| ||||| ||   ||||||  | || ||| |||||||||| | ||||| ||| |  |||  |||||| ||  |||| ||| |||  |  || |||    
T  4950 gcttctaggaagtttctgaagacttgtgcagtctgtcaaatttattagaagaagtttatgcagagatccaatgctacgggagaccgcagttaatcttgga 5049  T
Q  323 cagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggt 375  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  5050 cagtctttgagtactagcttttcaagattaggcatgaatgaaaagtctggggt 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6816 - 6464
Alignment:
Q  23 cgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatca 122  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||| |||| || |  | ||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||  |||||||    
T  6816 cgtgaaaatccttcaaatccacataaagaaatatatccaatgtttttagatcgtactattgaaaagggaacttttgttatagcagtcttatccgcaatca 6717  T
Q  123 gagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagat 222  Q
      ||  | || |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||  |||| ||    
T  6716 aggttttcaatgattccatctgttccaagtcctcctccaatttgtcaatcttggaacatccagaaagaatcaaagtttctagagattttaatttatatat 6617  T
Q  223 gtttcttggaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcgga 322  Q
    | |||| ||||| ||   ||||||  | || ||| |||||||||| | ||||| ||| |  |||  |||||| ||  |||| ||| |||  |  || |||    
T  6616 gcttctaggaagtttctgaagacttgtgcagtctgtcaaatttattagaagaagtttatgcagagatccaatgctacgggagaccgcagttaatcttgga 6517  T
Q  323 cagtctttgagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggt 375  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    
T  6516 cagtctttgagtactagcttttcaagattaggcatgaatgaaaagtctggggt 6464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 414
Target Start/End: Original strand, 8317 - 8600
Alignment:
Q  131 aaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||| |  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| ||  ||||| || ||||||    
T  8317 aaagattccatctgttccaagtcctcctccaatttttcaatcatggaacatccagaaagaatcaaagtttctagagattttaatttatagttgcttcttg 8416  T
Q  231 gaaggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtcttt 330  Q
    |||| || | |||||   | || ||| |||||||||| | ||||||||| |  |||  ||||||||| ||||| ||   |||||  || ||||| | |||    
T  8417 gaagtttccgaagacctgtgcagtctgtcaaatttatgagaagaattttatgtagagatccaatactatgggagactgtagacaaacttggacaattttt 8516  T
Q  331 gagcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| |  |||| ||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  8517 gagtactagcttttcaagatttggcaagtatgtaaagtctggggtttcagtcaaatctggagaatgacttagattaagaatttt 8600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0373 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0373
Description:

Target: scaffold0373; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 9737 - 9456
Alignment:
Q  133 agattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaacgtatagatgtttcttgga 232  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| || || ||||||||| |  |||||||||| ||||| | |||||  |||||||| || ||||||||| |||| |||    
T  9737 agattccatctgtaccaaatcctcctccaatttgtcaatcatggaacatccagaaagaatcaaagtttgtagagattttaatgtatagatgcttctcgga 9638  T
Q  233 aggttacaaagactgatacaatctttcaaatttatcaaaagaattttcttgagatgtccaatactttgggaaacctcagacagcctcggacagtctttga 332  Q
    || || | |||||   | || |   | |||||||||| ||||| ||| | ||||  |||||| || ||||| ||| ||||||  || |||||||||||||    
T  9637 agtttccgaagacctgtgcagttcgttaaatttatcagaagaagtttatggagagatccaatgctatgggagaccgcagacaaacttggacagtctttga 9538  T
Q  333 gcaccagcttttcaaggttaggcaagtatgaaaagtcaggggtctgtgtcagataatgagaatgactaagattgagaatttt 414  Q
    | || ||||||||||| || ||||  ||||| ||||| || || |  |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9537 gtactagcttttcaagattcggcatatatgagaagtctggagtttcagtcaaatcctgagaatgactaagattaagaatttt 9456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 3286560 - 3286748
Alignment:
Q  24 gtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatcag 123  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || ||| |||  ||||||||||| || |  || ||||||||||||| | | | | | || | ||||||||||||    
T  3286560 gtgataatccttcatatccacatagggatatatatctgatgctttttgatcttacaattgaaaagggcacttctttaacagctgtattatttgcaatcag 3286659  T
Q  124 agtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttca 212  Q
     || || || |||||||| ||  | | ||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||    
T  3286660 tgttgtcaaggattccatctgcactatgtcttcttccaacttgtcaatctttgaacaaccagaaaggatgagagtgttcaaagatttca 3286748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Original strand, 3262670 - 3262860
Alignment:
Q  22 acgtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaagggcacttttgttataccagtgtcatttgcaatc 121  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || || ||| |||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||| | | | | ||| || || |||||||||    
T  3262670 acgtgaaaatcct-catatccacatagggatatatatccaatgctttttgatcttactattgaatagggcacctctttcacacctgtatcctttgcaatc 3262768  T
Q  122 agagtggttaaagattccatttgttccaagtcctcttctaacttgtcaatctttaaacatccagatagaatgagagttttcagagatttcaa 213  Q
    || || || || |||||||| ||  | | ||| ||||| || |||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  3262769 agtgttgtcaaggattccatctgcactatgtcttcttccaatttgtcaatctttgagcaaccagaaagtatgagagttttcaaagatttcaa 3262860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 3364325 - 3364262
Alignment:
Q  24 gtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaa 87  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  3364325 gtgataatccttcatatccacatagagatatatatccaatgctttttgatctcactatcgaaaa 3364262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Original strand, 3391581 - 3391644
Alignment:
Q  24 gtgagaatccttcatatccacacagagaaataaatccaatgctttttgacctcagtatggaaaa 87  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  3391581 gtgataatccttcatatccacatagagatatatatccaatgctttttgatctcactatcgaaaa 3391644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University