View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3711_low_23 (Length: 295)

Name: NF3711_low_23
Description: NF3711
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3711_low_23
NF3711_low_23
[»] chr2 (98 HSPs)
chr2 (134-295)||(5113614-5113775)
chr2 (132-295)||(17829060-17829224)
chr2 (130-295)||(34247963-34248129)
chr2 (132-295)||(37009004-37009168)
chr2 (130-295)||(35899145-35899311)
chr2 (167-295)||(41521568-41521696)
chr2 (132-290)||(34173055-34173213)
chr2 (129-291)||(16111071-16111234)
chr2 (130-295)||(38972471-38972637)
chr2 (131-295)||(20894180-20894346)
chr2 (130-295)||(33146603-33146769)
chr2 (132-290)||(37198938-37199092)
chr2 (137-295)||(552408-552567)
chr2 (130-295)||(11051566-11051732)
chr2 (130-295)||(22606323-22606489)
chr2 (130-295)||(15006438-15006603)
chr2 (130-295)||(11796147-11796313)
chr2 (140-295)||(37330275-37330431)
chr2 (130-295)||(4437319-4437484)
chr2 (132-295)||(7939894-7940058)
chr2 (140-295)||(14743029-14743184)
chr2 (167-295)||(40020655-40020783)
chr2 (167-295)||(42791528-42791655)
chr2 (130-295)||(13873323-13873488)
chr2 (130-295)||(14013448-14013613)
chr2 (169-295)||(41078059-41078185)
chr2 (132-295)||(3044937-3045101)
chr2 (142-291)||(11470396-11470547)
chr2 (133-263)||(11563807-11563938)
chr2 (133-295)||(31363904-31364067)
chr2 (167-264)||(5474669-5474766)
chr2 (173-294)||(20126063-20126184)
chr2 (170-295)||(24758166-24758291)
chr2 (132-264)||(38910684-38910817)
chr2 (130-295)||(31709637-31709804)
chr2 (177-290)||(64368-64482)
chr2 (130-294)||(3514810-3514976)
chr2 (72-126)||(5113182-5113236)
chr2 (185-295)||(5790920-5791030)
chr2 (169-295)||(43439176-43439300)
chr2 (147-295)||(10357030-10357170)
chr2 (134-286)||(43656919-43657072)
chr2 (167-295)||(44332125-44332253)
chr2 (185-295)||(22297648-22297758)
chr2 (194-295)||(26196778-26196879)
chr2 (194-264)||(32023720-32023790)
chr2 (169-289)||(26196081-26196200)
chr2 (220-289)||(44332463-44332532)
chr2 (172-295)||(18997092-18997215)
chr2 (172-295)||(28168115-28168238)
chr2 (133-295)||(31597716-31597879)
chr2 (200-295)||(36451529-36451624)
chr2 (166-295)||(18467821-18467950)
chr2 (229-293)||(22298256-22298320)
chr2 (132-278)||(11563628-11563775)
chr2 (200-255)||(20503157-20503212)
chr2 (220-295)||(33886392-33886467)
chr2 (183-236)||(1534608-1534661)
chr2 (197-291)||(6077945-6078031)
chr2 (133-249)||(11942884-11943001)
chr2 (132-191)||(3515477-3515537)
chr2 (170-289)||(32879320-32879439)
chr2 (139-286)||(40768850-40768998)
chr2 (130-188)||(5475141-5475200)
chr2 (129-191)||(40769374-40769437)
chr2 (130-191)||(6229889-6229951)
chr2 (244-294)||(14900365-14900415)
chr2 (130-191)||(31597232-31597294)
chr2 (236-294)||(32875168-32875226)
chr2 (225-291)||(32877822-32877888)
chr2 (130-191)||(33146042-33146104)
chr2 (130-191)||(37199604-37199666)
chr2 (229-294)||(3045603-3045668)
chr2 (198-294)||(24387077-24387174)
chr2 (250-295)||(35657464-35657509)
chr2 (229-293)||(13873991-13874055)
chr2 (229-293)||(14014116-14014180)
chr2 (199-295)||(16599602-16599697)
chr2 (130-188)||(11796817-11796876)
chr2 (208-291)||(14736720-14736802)
chr2 (130-188)||(34173721-34173780)
chr2 (217-291)||(5475141-5475215)
chr2 (244-290)||(6229344-6229390)
chr2 (130-191)||(28167547-28167609)
chr2 (229-295)||(39160285-39160351)
chr2 (229-295)||(39208843-39208909)
chr2 (130-159)||(1366350-1366379)
chr2 (134-190)||(7939338-7939395)
chr2 (242-291)||(33206111-33206160)
chr2 (130-190)||(34247390-34247451)
chr2 (140-193)||(38911335-38911388)
chr2 (130-190)||(38973150-38973211)
chr2 (130-190)||(43657598-43657659)
chr2 (138-197)||(8313671-8313731)
chr2 (130-170)||(17829715-17829755)
chr2 (132-191)||(41521707-41521767)
chr2 (130-205)||(42791460-42791536)
chr2 (229-293)||(44332388-44332452)
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (130-295)||(22934299-22934465)
chr8 (107-295)||(14363766-14363952)
chr8 (130-295)||(6292524-6292690)
chr8 (130-295)||(3075316-3075482)
chr8 (137-291)||(29636292-29636446)
chr8 (168-295)||(30353893-30354020)
chr8 (130-295)||(17565239-17565405)
chr8 (130-295)||(24810157-24810322)
chr8 (140-291)||(25485331-25485483)
chr8 (130-295)||(34364484-34364645)
chr8 (130-295)||(10216036-10216202)
chr8 (134-295)||(25598359-25598520)
chr8 (130-290)||(11759398-11759559)
chr8 (135-295)||(32905228-32905389)
chr8 (149-295)||(11140123-11140270)
chr8 (134-295)||(14880089-14880251)
chr8 (170-295)||(36016140-36016266)
chr8 (130-295)||(39998380-39998546)
chr8 (167-295)||(21304011-21304140)
chr8 (132-295)||(41262664-41262824)
chr8 (133-290)||(8627957-8628115)
chr8 (169-295)||(14093531-14093656)
chr8 (167-289)||(31846495-31846617)
chr8 (170-295)||(12330917-12331042)
chr8 (139-295)||(37304794-37304950)
chr8 (132-295)||(4256571-4256735)
chr8 (167-295)||(44283741-44283869)
chr8 (136-295)||(17496827-17496986)
chr8 (138-295)||(29459159-29459317)
chr8 (130-295)||(33972309-33972475)
chr8 (134-295)||(34679826-34679987)
chr8 (167-295)||(8297703-8297831)
chr8 (132-286)||(3075144-3075299)
chr8 (172-295)||(10674335-10674458)
chr8 (135-290)||(24778003-24778161)
chr8 (169-295)||(8437947-8438073)
chr8 (130-295)||(8442666-8442832)
chr8 (130-295)||(40791656-40791822)
chr8 (194-295)||(33969067-33969168)
chr8 (135-295)||(32904114-32904281)
chr8 (167-295)||(43764126-43764254)
chr8 (132-295)||(44746740-44746904)
chr8 (134-295)||(37837477-37837640)
chr8 (130-295)||(25954004-25954170)
chr8 (134-238)||(34923856-34923960)
chr8 (167-295)||(13421967-13422095)
chr8 (167-295)||(13440037-13440165)
chr8 (130-295)||(13573197-13573358)
chr8 (227-295)||(30991371-30991439)
chr8 (172-295)||(26928241-26928364)
chr8 (167-295)||(41311718-41311848)
chr8 (140-295)||(40298939-40299093)
chr8 (170-295)||(4855309-4855436)
chr8 (193-263)||(5872265-5872335)
chr8 (172-294)||(30279788-30279909)
chr8 (169-295)||(37265543-37265669)
chr8 (202-295)||(15847939-15848032)
chr8 (167-263)||(31739557-31739654)
chr8 (167-294)||(40133505-40133633)
chr8 (229-295)||(44284354-44284420)
chr8 (130-198)||(253536-253602)
chr8 (130-198)||(662256-662322)
chr8 (130-198)||(848054-848120)
chr8 (140-295)||(44147531-44147688)
chr8 (151-262)||(29621791-29621902)
chr8 (169-263)||(42166592-42166683)
chr8 (208-295)||(45489250-45489336)
chr8 (130-191)||(11141066-11141128)
chr8 (130-190)||(25597783-25597844)
chr8 (242-295)||(34924924-34924977)
chr8 (133-188)||(6099484-6099540)
chr8 (229-293)||(11141067-11141131)
chr8 (130-197)||(11760066-11760134)
chr8 (130-188)||(6293205-6293264)
chr8 (250-293)||(11760073-11760116)
chr8 (130-188)||(14879530-14879589)
chr8 (208-291)||(35366401-35366483)
chr8 (130-191)||(36016764-36016826)
chr8 (130-188)||(37872875-37872933)
chr8 (137-190)||(43777001-43777055)
chr8 (130-190)||(44284356-44284417)
chr8 (229-293)||(3075313-3075377)
chr8 (229-293)||(11140101-11140165)
chr8 (187-294)||(12962148-12962256)
[»] chr7 (100 HSPs)
chr7 (130-295)||(317286-317452)
chr7 (130-295)||(2146044-2146210)
chr7 (132-295)||(25266-25430)
chr7 (130-295)||(5228539-5228705)
chr7 (130-295)||(23742560-23742725)
chr7 (130-295)||(6184660-6184825)
chr7 (130-295)||(29823338-29823504)
chr7 (130-295)||(38670584-38670750)
chr7 (137-295)||(14078371-14078530)
chr7 (137-295)||(14388399-14388558)
chr7 (137-287)||(42813487-42813638)
chr7 (138-295)||(32867803-32867961)
chr7 (130-287)||(48982447-48982605)
chr7 (130-295)||(3340781-3340947)
chr7 (133-295)||(40343769-40343931)
chr7 (130-295)||(22263771-22263937)
chr7 (130-295)||(27144189-27144355)
chr7 (139-295)||(28308014-28308171)
chr7 (132-295)||(20261014-20261178)
chr7 (132-295)||(40400912-40401076)
chr7 (137-295)||(25607512-25607671)
chr7 (130-295)||(36847840-36848006)
chr7 (132-291)||(5951661-5951819)
chr7 (166-295)||(29103566-29103695)
chr7 (132-295)||(34999195-34999357)
chr7 (178-290)||(40402109-40402221)
chr7 (133-295)||(32388048-32388211)
chr7 (168-287)||(46010498-46010617)
chr7 (130-295)||(8122635-8122801)
chr7 (170-295)||(29736694-29736817)
chr7 (140-292)||(36889987-36890139)
chr7 (147-295)||(1573103-1573259)
chr7 (130-291)||(31220806-31220968)
chr7 (131-263)||(11640912-11641045)
chr7 (135-295)||(43450112-43450273)
chr7 (132-292)||(19435197-19435360)
chr7 (172-295)||(2790836-2790959)
chr7 (107-237)||(2935719-2935845)
chr7 (137-295)||(36687311-36687470)
chr7 (133-263)||(38790673-38790804)
chr7 (195-289)||(23233397-23233491)
chr7 (195-289)||(23243058-23243152)
chr7 (130-294)||(16425345-16425510)
chr7 (133-264)||(19156007-19156139)
chr7 (133-264)||(20755406-20755538)
chr7 (194-290)||(31872529-31872625)
chr7 (184-286)||(11696781-11696883)
chr7 (170-295)||(23728337-23728465)
chr7 (150-291)||(30870483-30870625)
chr7 (194-295)||(39186796-39186897)
chr7 (172-295)||(22712204-22712327)
chr7 (147-295)||(33869218-33869364)
chr7 (142-291)||(35783382-35783532)
chr7 (173-291)||(43133352-43133470)
chr7 (129-197)||(38790079-38790148)
chr7 (171-295)||(19332423-19332547)
chr7 (168-295)||(12679538-12679665)
chr7 (199-266)||(40188997-40189064)
chr7 (140-295)||(48872577-48872731)
chr7 (201-295)||(10410683-10410777)
chr7 (172-282)||(13904346-13904456)
chr7 (194-291)||(20096299-20096394)
chr7 (172-295)||(29616116-29616241)
chr7 (130-230)||(8535399-8535500)
chr7 (198-290)||(19155908-19156000)
chr7 (198-290)||(20755307-20755399)
chr7 (195-291)||(38988323-38988419)
chr7 (124-198)||(27619631-27619706)
chr7 (137-198)||(3341438-3341500)
chr7 (130-191)||(11639904-11639966)
chr7 (229-295)||(36848501-36848567)
chr7 (194-291)||(7192123-7192220)
chr7 (229-294)||(22263768-22263833)
chr7 (240-293)||(31388134-31388187)
chr7 (167-294)||(4518332-4518460)
chr7 (168-232)||(12677706-12677770)
chr7 (169-261)||(34835414-34835506)
chr7 (229-295)||(38670000-38670066)
chr7 (130-190)||(317963-318024)
chr7 (130-190)||(2146880-2146941)
chr7 (130-190)||(6185338-6185399)
chr7 (130-190)||(6191854-6191915)
chr7 (130-190)||(25606932-25606993)
chr7 (130-197)||(32867252-32867320)
chr7 (130-188)||(29736139-29736198)
chr7 (133-191)||(40401556-40401615)
chr7 (185-295)||(13067821-13067930)
chr7 (130-190)||(25952-26013)
chr7 (240-293)||(3391773-3391826)
chr7 (229-294)||(16425342-16425407)
chr7 (229-294)||(19156080-19156145)
chr7 (135-191)||(20261586-20261643)
chr7 (229-294)||(20755479-20755544)
chr7 (132-188)||(29615526-29615583)
chr7 (250-294)||(10412560-10412604)
chr7 (229-293)||(11639901-11639965)
chr7 (140-191)||(31221460-31221512)
chr7 (229-293)||(38670689-38670753)
chr7 (132-191)||(38987762-38987822)
chr7 (250-294)||(46208774-46208818)
[»] chr3 (111 HSPs)
chr3 (134-295)||(4757009-4757171)
chr3 (130-295)||(10887720-10887886)
chr3 (130-295)||(23309520-23309686)
chr3 (132-290)||(49764502-49764661)
chr3 (133-295)||(1363395-1363558)
chr3 (130-295)||(291683-291849)
chr3 (130-295)||(37183088-37183254)
chr3 (134-295)||(41586659-41586820)
chr3 (130-295)||(4558042-4558208)
chr3 (130-295)||(14602010-14602176)
chr3 (134-291)||(32737075-32737233)
chr3 (130-295)||(40927503-40927669)
chr3 (167-295)||(11055839-11055967)
chr3 (133-295)||(3089763-3089926)
chr3 (130-295)||(18365181-18365347)
chr3 (167-295)||(22129735-22129863)
chr3 (137-295)||(1763660-1763818)
chr3 (137-295)||(16067795-16067954)
chr3 (134-295)||(22524132-22524294)
chr3 (130-295)||(27255874-27256040)
chr3 (133-293)||(28248057-28248218)
chr3 (140-295)||(48841535-48841691)
chr3 (168-295)||(20029953-20030079)
chr3 (130-295)||(24542881-24543048)
chr3 (133-295)||(40974049-40974211)
chr3 (130-295)||(7725306-7725472)
chr3 (130-295)||(19546930-19547096)
chr3 (130-295)||(41865585-41865750)
chr3 (130-295)||(44950886-44951052)
chr3 (134-295)||(48224037-48224199)
chr3 (130-290)||(1262964-1263125)
chr3 (194-295)||(44499405-44499506)
chr3 (167-295)||(5963105-5963233)
chr3 (167-295)||(6293254-6293382)
chr3 (132-295)||(32255625-32255789)
chr3 (139-295)||(45307258-45307414)
chr3 (167-264)||(11581884-11581981)
chr3 (174-295)||(54404131-54404252)
chr3 (130-264)||(13625836-13625971)
chr3 (133-295)||(49080509-49080672)
chr3 (133-295)||(54606324-54606487)
chr3 (130-295)||(11344701-11344867)
chr3 (134-295)||(27394975-27395137)
chr3 (134-295)||(47793997-47794159)
chr3 (135-295)||(32221618-32221779)
chr3 (213-295)||(11388973-11389055)
chr3 (169-291)||(30604725-30604847)
chr3 (130-295)||(53490059-53490224)
chr3 (185-295)||(5984839-5984949)
chr3 (147-295)||(10592761-10592910)
chr3 (141-264)||(2756539-2756662)
chr3 (166-290)||(10689367-10689491)
chr3 (172-295)||(45241744-45241866)
chr3 (197-295)||(30128166-30128264)
chr3 (130-290)||(25481102-25481264)
chr3 (167-291)||(18480144-18480268)
chr3 (140-295)||(54876827-54876983)
chr3 (232-295)||(11581980-11582043)
chr3 (170-295)||(14600928-14601050)
chr3 (172-295)||(27638528-27638651)
chr3 (172-291)||(34667960-34668079)
chr3 (170-264)||(27392979-27393072)
chr3 (139-264)||(33115165-33115291)
chr3 (200-289)||(22517043-22517132)
chr3 (170-295)||(40035788-40035915)
chr3 (130-198)||(27255295-27255364)
chr3 (130-191)||(1262407-1262469)
chr3 (130-191)||(11345363-11345425)
chr3 (130-191)||(18364640-18364702)
chr3 (202-295)||(33979181-33979274)
chr3 (131-191)||(45241212-45241273)
chr3 (208-291)||(45851768-45851854)
chr3 (124-190)||(14600381-14600448)
chr3 (170-265)||(19538296-19538391)
chr3 (132-264)||(27397448-27397578)
chr3 (169-264)||(32373346-32373441)
chr3 (130-191)||(3090422-3090484)
chr3 (150-295)||(25259839-25259984)
chr3 (130-188)||(27394262-27394320)
chr3 (130-190)||(22130402-22130463)
chr3 (229-294)||(48223567-48223632)
chr3 (134-190)||(54403573-54403630)
chr3 (130-190)||(11414486-11414546)
chr3 (130-205)||(20612099-20612175)
chr3 (167-223)||(27517182-27517238)
chr3 (130-190)||(48842028-48842088)
chr3 (185-295)||(8449162-8449270)
chr3 (208-291)||(17057881-17057964)
chr3 (235-294)||(22518584-22518643)
chr3 (229-291)||(10688795-10688857)
chr3 (228-290)||(17764446-17764508)
chr3 (228-290)||(19065766-19065828)
chr3 (167-225)||(20612049-20612107)
chr3 (137-190)||(27396710-27396764)
chr3 (137-190)||(44500048-44500102)
chr3 (130-190)||(4558744-4558805)
chr3 (130-190)||(10888409-10888470)
chr3 (130-190)||(11056565-11056626)
chr3 (240-293)||(11397605-11397658)
chr3 (134-190)||(13623189-13623246)
chr3 (130-190)||(23308946-23309007)
chr3 (130-190)||(30605351-30605412)
chr3 (250-295)||(33314198-33314243)
chr3 (229-293)||(809712-809776)
chr3 (229-293)||(1262404-1262468)
chr3 (229-293)||(11581843-11581907)
chr3 (229-293)||(18364637-18364701)
chr3 (229-293)||(18365286-18365350)
chr3 (223-295)||(19556548-19556620)
chr3 (229-293)||(27255292-27255356)
chr3 (124-191)||(41587315-41587383)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (130-295)||(19547-19713)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (130-295)||(12026098-12026264)
chr6 (130-295)||(14873025-14873191)
chr6 (130-295)||(25577102-25577268)
chr6 (130-295)||(7127558-7127724)
chr6 (130-295)||(11522807-11522972)
chr6 (130-295)||(12033018-12033184)
chr6 (130-295)||(25527737-25527903)
chr6 (107-295)||(9240848-9241032)
chr6 (130-295)||(188334-188500)
chr6 (150-291)||(6936402-6936544)
chr6 (133-295)||(3767647-3767810)
chr6 (141-295)||(32113757-32113912)
chr6 (130-295)||(33950233-33950399)
chr6 (132-295)||(4100524-4100693)
chr6 (132-295)||(4125886-4126055)
chr6 (167-295)||(34280582-34280710)
chr6 (105-291)||(5442998-5443180)
chr6 (147-295)||(17311999-17312148)
chr6 (167-295)||(30462017-30462145)
chr6 (132-295)||(31881850-31882013)
chr6 (137-295)||(21801953-21802112)
chr6 (133-295)||(32003764-32003929)
chr6 (130-295)||(2523238-2523404)
chr6 (130-288)||(12693853-12694012)
chr6 (185-295)||(34709291-34709400)
chr6 (142-295)||(34794423-34794577)
chr6 (150-286)||(16325980-16326117)
chr6 (150-286)||(16349378-16349515)
chr6 (151-289)||(2091716-2091855)
chr6 (134-256)||(10702282-10702405)
chr6 (150-284)||(32130964-32131099)
chr6 (130-295)||(7448796-7448957)
chr6 (147-295)||(2655485-2655633)
chr6 (133-289)||(32522411-32522567)
chr6 (183-291)||(12026283-12026390)
chr6 (183-291)||(12033203-12033310)
chr6 (167-295)||(22022017-22022145)
chr6 (172-295)||(31281663-31281787)
chr6 (130-295)||(11794668-11794834)
chr6 (130-295)||(14313758-14313916)
chr6 (147-295)||(33276310-33276458)
chr6 (169-259)||(28494825-28494915)
chr6 (169-259)||(29807234-29807324)
chr6 (233-295)||(12767047-12767109)
chr6 (229-294)||(12767611-12767676)
chr6 (220-289)||(22022355-22022424)
chr6 (149-291)||(28712932-28713075)
chr6 (197-295)||(17336900-17336998)
chr6 (132-295)||(34250072-34250232)
chr6 (134-238)||(26391407-26391512)
chr6 (244-295)||(5916633-5916684)
chr6 (134-284)||(24619919-24620070)
chr6 (133-190)||(187780-187838)
chr6 (130-190)||(5443696-5443757)
chr6 (130-190)||(9241545-9241606)
chr6 (130-190)||(11523483-11523544)
chr6 (130-190)||(12025524-12025585)
chr6 (229-294)||(14306796-14306861)
chr6 (229-294)||(14313196-14313261)
chr6 (246-295)||(22268532-22268581)
chr6 (130-190)||(34709923-34709984)
chr6 (229-293)||(12409417-12409481)
chr6 (133-204)||(12766957-12767029)
chr6 (200-256)||(14223914-14223969)
chr6 (131-190)||(25528423-25528483)
chr6 (130-191)||(17307213-17307275)
chr6 (130-190)||(14306799-14306860)
chr6 (130-190)||(14873703-14873764)
chr6 (241-294)||(21847374-21847427)
chr6 (130-190)||(22342105-22342166)
chr6 (197-233)||(11722002-11722038)
chr6 (241-293)||(21802610-21802662)
chr6 (229-293)||(22022280-22022344)
chr6 (229-293)||(25527734-25527798)
chr6 (250-294)||(34250713-34250757)
chr6 (129-169)||(34709264-34709304)
[»] chr4 (125 HSPs)
chr4 (130-295)||(8192891-8193057)
chr4 (107-295)||(13395179-13395363)
chr4 (130-295)||(46095414-46095581)
chr4 (130-295)||(7165979-7166145)
chr4 (130-295)||(10155511-10155677)
chr4 (132-295)||(19313914-19314078)
chr4 (130-295)||(6233004-6233170)
chr4 (133-295)||(37423154-37423317)
chr4 (134-295)||(616033-616194)
chr4 (130-295)||(796391-796557)
chr4 (130-295)||(33047130-33047296)
chr4 (130-295)||(47030383-47030549)
chr4 (137-295)||(23308813-23308972)
chr4 (130-295)||(4950496-4950662)
chr4 (130-295)||(16960213-16960379)
chr4 (138-295)||(37708791-37708949)
chr4 (137-295)||(37423795-37423954)
chr4 (138-295)||(50824644-50824802)
chr4 (166-295)||(29979610-29979739)
chr4 (136-295)||(35667657-35667817)
chr4 (140-289)||(30192527-30192677)
chr4 (132-291)||(33032170-33032330)
chr4 (168-295)||(9784633-9784760)
chr4 (168-295)||(17729558-17729684)
chr4 (133-295)||(23721391-23721551)
chr4 (168-295)||(55069415-55069542)
chr4 (130-295)||(13771726-13771892)
chr4 (130-295)||(17722758-17722924)
chr4 (134-295)||(32448287-32448446)
chr4 (194-295)||(23272477-23272578)
chr4 (130-295)||(49621249-49621413)
chr4 (133-295)||(44665081-44665249)
chr4 (137-295)||(17201845-17202004)
chr4 (142-295)||(8138893-8139047)
chr4 (130-295)||(36897468-36897632)
chr4 (171-295)||(21037852-21037976)
chr4 (138-295)||(56309967-56310125)
chr4 (150-295)||(13482700-13482846)
chr4 (150-290)||(47931138-47931277)
chr4 (134-295)||(49702388-49702549)
chr4 (130-295)||(35854130-35854297)
chr4 (167-295)||(45847181-45847309)
chr4 (132-290)||(721332-721491)
chr4 (131-295)||(28464210-28464369)
chr4 (170-287)||(18362109-18362226)
chr4 (130-238)||(26705627-26705736)
chr4 (130-295)||(35667472-35667633)
chr4 (170-287)||(36600701-36600818)
chr4 (140-295)||(7796964-7797120)
chr4 (171-295)||(42074332-42074455)
chr4 (167-295)||(54092221-54092348)
chr4 (133-295)||(6233688-6233850)
chr4 (133-295)||(7478683-7478845)
chr4 (172-295)||(36651171-36651293)
chr4 (185-295)||(16191715-16191825)
chr4 (130-238)||(35667241-35667350)
chr4 (132-290)||(755432-755591)
chr4 (176-287)||(12251262-12251372)
chr4 (168-295)||(37735380-37735507)
chr4 (168-295)||(55139398-55139524)
chr4 (166-295)||(19854705-19854834)
chr4 (195-295)||(51020203-51020303)
chr4 (166-295)||(55814361-55814490)
chr4 (107-198)||(754858-754945)
chr4 (147-263)||(4649633-4649749)
chr4 (137-283)||(53306256-53306406)
chr4 (130-295)||(7851723-7851887)
chr4 (137-295)||(26808953-26809106)
chr4 (208-289)||(6711796-6711877)
chr4 (168-288)||(46076882-46077002)
chr4 (194-295)||(48372989-48373091)
chr4 (130-198)||(721977-722046)
chr4 (229-294)||(51019656-51019721)
chr4 (132-191)||(13482193-13482253)
chr4 (132-190)||(23722057-23722116)
chr4 (244-295)||(29429165-29429215)
chr4 (218-293)||(41919914-41919989)
chr4 (130-191)||(19313353-19313415)
chr4 (193-263)||(54145058-54145128)
chr4 (130-191)||(55068851-55068913)
chr4 (130-190)||(7165404-7165465)
chr4 (130-190)||(7797619-7797680)
chr4 (201-270)||(10519240-10519308)
chr4 (130-190)||(13392757-13392818)
chr4 (130-190)||(13395896-13395957)
chr4 (130-190)||(17730186-17730247)
chr4 (242-295)||(21037316-21037369)
chr4 (131-191)||(25010062-25010123)
chr4 (229-294)||(29429704-29429769)
chr4 (167-264)||(42397963-42398059)
chr4 (130-190)||(47029825-47029886)
chr4 (132-191)||(18362702-18362762)
chr4 (132-191)||(36600164-36600224)
chr4 (130-188)||(20545026-20545085)
chr4 (244-295)||(25009511-25009562)
chr4 (244-295)||(35666505-35666556)
chr4 (248-295)||(36408457-36408504)
chr4 (248-295)||(36422623-36422670)
chr4 (236-295)||(53989193-53989252)
chr4 (231-293)||(754875-754937)
chr4 (133-190)||(6232432-6232490)
chr4 (131-196)||(16960874-16960940)
chr4 (229-291)||(20545026-20545088)
chr4 (130-191)||(23269176-23269238)
chr4 (130-191)||(36898104-36898166)
chr4 (134-191)||(41919913-41919971)
chr4 (130-186)||(6232358-6232415)
chr4 (130-190)||(7479352-7479413)
chr4 (130-190)||(7479985-7480046)
chr4 (229-294)||(7797618-7797683)
chr4 (229-294)||(8138327-8138392)
chr4 (130-190)||(12250682-12250743)
chr4 (130-190)||(35667387-35667448)
chr4 (232-293)||(45847773-45847834)
chr4 (134-198)||(55814995-55815060)
chr4 (229-293)||(721985-722049)
chr4 (229-293)||(13482188-13482252)
chr4 (229-293)||(16192321-16192385)
chr4 (229-293)||(19313350-19313414)
chr4 (169-233)||(22474884-22474948)
chr4 (255-295)||(26619099-26619139)
chr4 (229-293)||(35667572-35667636)
chr4 (250-294)||(37147765-37147809)
chr4 (229-293)||(47030488-47030552)
chr4 (236-292)||(56310073-56310129)
[»] chr1 (93 HSPs)
chr1 (130-295)||(38011754-38011920)
chr1 (130-291)||(41321520-41321682)
chr1 (130-295)||(18407102-18407268)
chr1 (136-295)||(17109918-17110077)
chr1 (130-295)||(1845867-1846033)
chr1 (130-291)||(19997611-19997773)
chr1 (130-295)||(25068907-25069068)
chr1 (137-295)||(8061040-8061199)
chr1 (134-295)||(51611811-51611973)
chr1 (130-290)||(41575181-41575342)
chr1 (166-295)||(45195139-45195268)
chr1 (137-295)||(16536921-16537080)
chr1 (130-295)||(27226226-27226392)
chr1 (130-295)||(52505301-52505467)
chr1 (140-291)||(831838-831990)
chr1 (133-295)||(36605301-36605464)
chr1 (133-295)||(42830548-42830711)
chr1 (130-295)||(15356941-15357107)
chr1 (167-295)||(47553182-47553310)
chr1 (134-295)||(20584997-20585158)
chr1 (147-295)||(27931205-27931355)
chr1 (150-295)||(29510379-29510525)
chr1 (194-295)||(25991319-25991419)
chr1 (132-264)||(51362418-51362551)
chr1 (172-295)||(31765904-31766026)
chr1 (137-290)||(41575918-41576071)
chr1 (197-295)||(45737876-45737974)
chr1 (134-290)||(23739722-23739879)
chr1 (132-295)||(45738566-45738735)
chr1 (133-295)||(50143951-50144115)
chr1 (142-295)||(11916470-11916622)
chr1 (169-295)||(27532477-27532604)
chr1 (132-290)||(43319925-43320084)
chr1 (129-262)||(794681-794815)
chr1 (139-295)||(4666890-4667048)
chr1 (134-295)||(19072259-19072421)
chr1 (134-295)||(19120149-19120311)
chr1 (173-295)||(36511453-36511575)
chr1 (130-295)||(46682682-46682848)
chr1 (168-295)||(28045046-28045172)
chr1 (172-295)||(44645835-44645958)
chr1 (185-291)||(1386551-1386657)
chr1 (169-295)||(13574063-13574189)
chr1 (169-295)||(47233615-47233741)
chr1 (131-295)||(33126193-33126358)
chr1 (136-295)||(49129018-49129179)
chr1 (195-295)||(44649191-44649291)
chr1 (176-295)||(47291627-47291744)
chr1 (170-289)||(2275689-2275808)
chr1 (130-264)||(28971393-28971528)
chr1 (169-291)||(124976-125098)
chr1 (134-295)||(45559114-45559269)
chr1 (220-295)||(24064628-24064703)
chr1 (208-291)||(30242896-30242979)
chr1 (195-261)||(6851872-6851937)
chr1 (133-290)||(7306969-7307127)
chr1 (130-191)||(16536379-16536441)
chr1 (232-294)||(27225683-27225745)
chr1 (246-295)||(1114335-1114384)
chr1 (130-190)||(36604734-36604795)
chr1 (130-190)||(45738007-45738068)
chr1 (172-264)||(47141250-47141340)
chr1 (241-290)||(47216629-47216678)
chr1 (134-191)||(45737316-45737374)
chr1 (134-190)||(4601709-4601766)
chr1 (242-295)||(12126447-12126500)
chr1 (168-270)||(33475690-33475794)
chr1 (229-294)||(45738004-45738069)
chr1 (107-191)||(47292245-47292325)
chr1 (243-291)||(6645060-6645108)
chr1 (231-295)||(19997610-19997674)
chr1 (167-264)||(29344566-29344660)
chr1 (132-190)||(52505980-52506039)
chr1 (132-189)||(1846546-1846604)
chr1 (133-190)||(25813032-25813090)
chr1 (129-190)||(27225682-27225744)
chr1 (130-196)||(29778009-29778075)
chr1 (133-190)||(41322201-41322259)
chr1 (130-191)||(42831206-42831268)
chr1 (232-293)||(9998004-9998065)
chr1 (229-294)||(13574167-13574232)
chr1 (130-191)||(17109313-17109374)
chr1 (130-190)||(25068332-25068393)
chr1 (130-186)||(27930772-27930829)
chr1 (229-294)||(36604731-36604796)
chr1 (192-264)||(37419406-37419479)
chr1 (130-190)||(38011178-38011239)
chr1 (169-294)||(44563375-44563500)
chr1 (229-293)||(16536376-16536440)
chr1 (132-191)||(19071721-19071781)
chr1 (132-191)||(19119611-19119671)
chr1 (229-293)||(41321517-41321581)
chr1 (133-188)||(47233070-47233126)
[»] chr5 (97 HSPs)
chr5 (134-295)||(8007073-8007235)
chr5 (130-295)||(27979800-27979966)
chr5 (130-291)||(37334492-37334654)
chr5 (130-295)||(4054739-4054900)
chr5 (130-295)||(37657975-37658141)
chr5 (134-295)||(40957315-40957477)
chr5 (168-295)||(30782760-30782887)
chr5 (130-295)||(20691699-20691864)
chr5 (130-295)||(31476865-31477031)
chr5 (129-295)||(42598888-42599055)
chr5 (130-295)||(24625395-24625561)
chr5 (130-295)||(35751524-35751690)
chr5 (130-295)||(4877279-4877441)
chr5 (135-289)||(21639031-21639186)
chr5 (130-295)||(18524264-18524430)
chr5 (133-262)||(19408550-19408680)
chr5 (132-295)||(3933316-3933480)
chr5 (167-295)||(20540346-20540474)
chr5 (167-295)||(40027400-40027528)
chr5 (130-295)||(9118843-9119007)
chr5 (169-295)||(20259381-20259507)
chr5 (139-295)||(20183377-20183534)
chr5 (130-245)||(1199695-1199811)
chr5 (133-295)||(8572710-8572873)
chr5 (141-295)||(9017666-9017821)
chr5 (130-295)||(6047993-6048159)
chr5 (130-295)||(13280047-13280213)
chr5 (107-264)||(27028572-27028725)
chr5 (140-285)||(32458423-32458569)
chr5 (130-295)||(13686520-13686688)
chr5 (167-295)||(17780914-17781043)
chr5 (168-293)||(17967866-17967991)
chr5 (134-277)||(6031267-6031411)
chr5 (197-295)||(15612049-15612145)
chr5 (130-295)||(31850561-31850726)
chr5 (140-264)||(15175223-15175348)
chr5 (133-295)||(20570722-20570891)
chr5 (201-295)||(3079754-3079848)
chr5 (132-295)||(21687368-21687530)
chr5 (212-295)||(1931366-1931449)
chr5 (169-295)||(12586174-12586300)
chr5 (185-295)||(36762685-36762794)
chr5 (142-249)||(1405557-1405665)
chr5 (243-295)||(22730508-22730560)
chr5 (133-295)||(38497928-38498093)
chr5 (208-295)||(1405669-1405756)
chr5 (133-295)||(14594644-14594806)
chr5 (169-295)||(15144460-15144587)
chr5 (167-238)||(36742539-36742610)
chr5 (130-295)||(27301868-27302034)
chr5 (208-278)||(32347289-32347359)
chr5 (229-291)||(38497333-38497395)
chr5 (132-264)||(5138309-5138441)
chr5 (199-295)||(10402010-10402105)
chr5 (194-291)||(6180900-6180997)
chr5 (176-265)||(6734087-6734176)
chr5 (167-291)||(5700998-5701122)
chr5 (130-205)||(20570136-20570212)
chr5 (130-214)||(32020472-32020559)
chr5 (107-202)||(17781142-17781232)
chr5 (229-291)||(13279484-13279546)
chr5 (229-295)||(20540985-20541051)
chr5 (229-295)||(31476968-31477034)
chr5 (229-295)||(31850009-31850075)
chr5 (133-190)||(17781051-17781108)
chr5 (130-190)||(20691122-20691183)
chr5 (128-188)||(27979237-27979298)
chr5 (130-190)||(36737454-36737515)
chr5 (130-190)||(36762122-36762183)
chr5 (130-190)||(37333911-37333972)
chr5 (130-190)||(37657389-37657450)
chr5 (244-295)||(2554144-2554195)
chr5 (198-265)||(3079890-3079957)
chr5 (167-294)||(3769550-3769676)
chr5 (132-233)||(10688224-10688324)
chr5 (229-292)||(15175878-15175941)
chr5 (185-236)||(16614193-16614244)
chr5 (132-190)||(24624827-24624886)
chr5 (185-295)||(30920586-30920686)
chr5 (229-295)||(36762965-36763029)
chr5 (149-262)||(12548362-12548476)
chr5 (130-190)||(4055414-4055475)
chr5 (132-188)||(6029464-6029521)
chr5 (139-191)||(8573353-8573406)
chr5 (130-190)||(9119553-9119614)
chr5 (229-286)||(18524376-18524433)
chr5 (130-190)||(20540987-20541048)
chr5 (229-286)||(32020469-32020526)
chr5 (229-294)||(36737453-36737518)
chr5 (130-190)||(36742129-36742190)
chr5 (240-295)||(1199047-1199100)
chr5 (241-293)||(1406241-1406293)
chr5 (230-286)||(2074727-2074783)
chr5 (229-293)||(13685973-13686037)
chr5 (130-189)||(15175878-15175938)
chr5 (229-293)||(20570133-20570197)
chr5 (229-293)||(20570833-20570897)
[»] scaffold2113 (1 HSPs)
scaffold2113 (130-295)||(734-899)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (130-295)||(16493-16659)
scaffold0361 (229-293)||(17154-17218)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (130-290)||(26910-27069)
scaffold0102 (229-294)||(27007-27072)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (131-295)||(421830-421995)
scaffold0003 (130-294)||(14057-14222)
scaffold0003 (134-191)||(421159-421217)
scaffold0003 (229-294)||(14054-14119)
[»] scaffold1192 (1 HSPs)
scaffold1192 (130-295)||(168-334)
[»] scaffold0289 (3 HSPs)
scaffold0289 (130-295)||(3416-3582)
scaffold0289 (132-190)||(4053-4112)
scaffold0289 (229-293)||(3413-3477)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (169-291)||(351841-351963)
scaffold0004 (250-295)||(351940-351985)
[»] scaffold0368 (2 HSPs)
scaffold0368 (133-295)||(10604-10767)
scaffold0368 (130-191)||(11262-11324)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (130-295)||(12760-12926)
scaffold0340 (250-286)||(12216-12252)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (169-295)||(2791-2916)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (185-295)||(32745-32855)
scaffold0115 (130-291)||(31260-31420)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (137-291)||(25788-25942)
scaffold0036 (253-293)||(25889-25929)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (185-295)||(10041-10151)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (135-290)||(10981-11137)
scaffold0051 (133-191)||(11634-11693)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (169-290)||(15900-16021)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (132-295)||(26380-26542)
scaffold0068 (241-293)||(59277-59329)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (229-293)||(25911-25975)
[»] scaffold0712 (1 HSPs)
scaffold0712 (167-290)||(3697-3820)
[»] scaffold0709 (1 HSPs)
scaffold0709 (167-290)||(3717-3840)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (197-295)||(90468-90567)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (172-279)||(7936-8043)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (130-190)||(13464-13525)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (130-190)||(34320-34381)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (199-268)||(118792-118861)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 98)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 5113614 - 5113775
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5113614 ctcccctcaaagttgcttgaattacactcacctccctcttatgttaaattatacactcatcttccctcttatttaaaacatattagaaaacatttcactc 5113713  T
Q  234 ccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5113714 ctctctcctaagaaaagcttgaattatattctcctccattcttatgttaaaatctacacttt 5113775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 17829060 - 17829224
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  17829060 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactccactcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttca 17829159  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17829160 ctcccctttcctaagagaagcttgaattacattcccctccccccttatgttaaaatctacacttt 17829224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34248129 - 34247963
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  34248129 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacacttctctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaaatt 34248030  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34248029 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 34247963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 37009004 - 37009168
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  37009004 ccctcccatcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacacttctctcccctcttatttaaaacatattaaaaaatatgtca 37009103  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  37009104 ctcccctcccttgagagaagcttgaattacattcctctccccttttatgttaaaatctacgcttt 37009168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 35899145 - 35899311
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  35899145 tcccctcccctcaaagatgcttcaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaatttt 35899244  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35899245 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 35899311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41521696 - 41521568
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  41521696 ccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacttttcacacccctctcctaagagaagcttgaattacattccc 41521597  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
      || ||||||||||||||||||||||||    
T  41521596 tccccctcttatgttaaaatctacacttt 41521568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 34173055 - 34173213
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  34173055 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactaccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttca 34173154  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  34173155 ctcccctcccttgagagaagcttgaattacattcttttcc-ctcttatgttaaaatctac 34173213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 129 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16111234 - 16111071
Alignment:
Q  129 atcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatatta-aaaaacat 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
T  16111234 atcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctccactcttaagttaaaatatacacttctctccc-tcttattcaaaacatgttagaaaaaaat 16111136  T
Q  227 ttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  16111135 ttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctaca 16111071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 38972471 - 38972637
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| || || |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  38972471 tcccctctcctcaaagatgcttcaattacactcccctcccctcctaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 38972570  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38972571 cactcccctcccctaagagaaacttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 38972637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20894346 - 20894180
Alignment:
Q  131 cccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||    
T  20894346 cccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaaattc 20894247  T
Q  230 a-ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | | |||||| |||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20894246 accccccctcccctaagagaagcttgaattacatctccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 20894180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33146769 - 33146603
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  33146769 tcccctcccctcaaagatacttgaactacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 33146670  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  33146669 cactcccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 33146603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 37198938 - 37199092
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  37198938 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactc----ccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcac 37199033  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||||||| | | |||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  37199034 tcccctcccttgagagaagcttaaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctac 37199092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 552567 - 552408
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctc-ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| |    
T  552567 ccctcaaagatgcttgaattacactcccctccccccttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaaattcactctc 552468  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  552467 ctcccctaagagaagtttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 552408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 11051566 - 11051732
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| | || || ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||   |||    
T  11051566 tcccctcccctaaaagatacttgaattacactccccacctctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagtaatttttt 11051665  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11051666 cactcccctcccctaagagaagcttgaattatattcccctccccccttatgttaaaatctacacttt 11051732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 22606323 - 22606489
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||| |||| || |    
T  22606323 tcccctcccctcaaagatccttgaattacacacctctcctctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacattttataaaatatat 22606422  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22606423 cactcccctcacttgagagaagcttgtattacattcctctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 22606489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 15006438 - 15006603
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  15006438 tcccctcccctcaaagatacttgaattacatcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttc 15006537  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| |||| | | |||||||||| |||||||| |  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  15006538 actctcctcccttgagagaagcttcaattacatccccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 15006603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 11796147 - 11796313
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  11796147 tcccctcccttcaaagatgcttcaattacactcccctcccctcttatgttaaaatgtacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 11796246  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | | ||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  11796247 cactcccctcccttgatagaagcttgaattacatttccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 11796313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37330431 - 37330275
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc-ct 237  Q
    |||||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||    
T  37330431 tcaaagatgcttgaattacactctcttctcctcttatgttaaaatatacactctcatcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttcaccccctct 37330332  T
Q  238 ctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37330331 ctcctaagagaagcttgaattacatttccctcccctcttatgtt-aaatctacacttt 37330275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 4437319 - 4437484
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac--ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatt 227  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||| ||  || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  4437319 tcccctcccctctaagatgcttgaattacacttccatc-ccctcttatgttaaaatatacaatccccttccctcttattcaaaacatattagaaaacttt 4437417  T
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  4437418 acac-cccctcctctaagagaagcttgaattacattctcaccccctcttatgttaaaatctacacttt 4437484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7940058 - 7939894
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  7940058 ccctcctctcaaagatgtttgaattacactctcctccccttttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttca 7939959  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||||||| | | |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  7939958 ttcccctcccttgagagaagcttaaatttcattcatctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 7939894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14743184 - 14743029
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| ||||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||   |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||| |||| || ||    
T  14743184 tcaaagatgcttgaattatactcatcttccctcttatgttaaaatatacactttactcccctcgtattcaaaacatattagaaaatattacacttcc-tc 14743086  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14743085 ccctgagagaagcttgaattacatttatctcctctcttatgttaaaatctacacttt 14743029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40020783 - 40020655
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||      
T  40020783 ccctcttatgttaaaatatacacttcactcccctctttttcaaaacatattagaaaatatttcactcccctcccttgagagaagcttgaattacattccc 40020684  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40020683 ttcctctcttatgttaaaatctacgcttt 40020655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 42791528 - 42791655
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  42791528 ccctcttatgttaaaatatataatcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaactttacac-cccctcccctaagagaagcttgaattacattccc 42791626  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  42791627 ctcccctcttatattaaaatctacacttt 42791655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 13873323 - 13873488
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  13873323 tccccttccctcaaagatgcttgaattacaattccctcacctcttatgttaaaatatacactcccctcctctcttattcaaaacatattagaaaatattt 13873422  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  13873423 cac-cccctcccttgagagaagcttgaattacattcccatcccctcttaagttaaaatctacgcttt 13873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 14013448 - 14013613
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14013448 tccccttccctcaaagatgcttgaattacaattccctcacctcttatgttaaaatatacactcccctcctctcttattcaaaacatattagaaaatattt 14013547  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  14013548 cac-cccctcccttgagagaagcttgaattacattcccatcccctcttaagttaaaatctacgcttt 14013613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41078185 - 41078059
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41078185 ctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacataatagaaaacttttcattctcctcccctaagagaagcttgaattacatccctct 41078086  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||||||| ||| |||||| |||||    
T  41078085 cccctcttatattagaatctatacttt 41078059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 3044937 - 3045101
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||  || || ||||||| ||||||||||| |||| ||| ||    
T  3044937 cccttccctcaaagatgcttgaattacactctcctcacctcttatgttaaaatatacactccccttccatcttattcaaaacatattagaaaatattaca 3045036  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     | ||||| | | |||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  3045037 ttaccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcatctcttaagttaaaatctacgcttt 3045101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 11470547 - 11470396
Alignment:
Q  142 aaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcc-cctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctct 239  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  11470547 aaagatgcttgaattacactcatcttccctcttatgttaaaatatacactcatttttacctcttatgcaaaacatattagaaaacatttcactctcctcc 11470448  T
Q  240 cctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||    
T  11470447 cctaaaagaaacttgaattactttccactcccctcttatgttaaaacctaca 11470396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 263
Target Start/End: Original strand, 11563807 - 11563938
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||    |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  11563807 cctcccctcaaagatgcttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatatacacttccttcccctcttattcaaaacatattggaaaatatttcac 11563906  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacatt 263  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  11563907 tcccctcccttgagagaagcttgaattacatt 11563938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 31363904 - 31364067
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||   |||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  31363904 cctcccctcaaagatgcttgaattacacaccccttccctcttatgttaaaatatacacttccctcctctctcattcaaaacatattagaaaatatttcac 31364003  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| | | ||| || |||||||||| |||  |||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  31364004 tcccctcccttgagataatcttgaattacgttcccctcccctcttgtgtttaaatctacgcttt 31364067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Original strand, 5474669 - 5474766
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  5474669 ccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcattcccctcttttgagagaagcttgaattacattc 5474766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20126184 - 20126063
Alignment:
Q  173 tatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccac 272  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| | |||||||| |||| |||||| |||| |||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| |    
T  20126184 tatgttaaaatatacacttctcttctctcttattcaaaatatattagaaaatatttcattctcctcccctaagagaaacttgaattacattcccctcccc 20126085  T
Q  273 tcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20126084 tcttatgttaaaatctacactt 20126063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Original strand, 24758166 - 24758291
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctc 269  Q
    |||||||||||| |||| |||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24758166 tcttatgttaaaatatatactttccttccctcttattcaaaacatattagaaaacattacacttccctcctataagagaagcttgaattacattctcctc 24758265  T
Q  270 cactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||    
T  24758266 ccctcttaatttaaaatctacacttt 24758291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 264
Target Start/End: Original strand, 38910684 - 38910817
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||| || |||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||    
T  38910684 ccctcctcttaaagatgtttgaattacactcccctcctctcttatgttaaaatatacacttcactcccctcttattcaaaacatattataagatatttca 38910783  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  38910784 ctcccctcccttgagagaagcttgaattacattc 38910817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31709804 - 31709637
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatct-cccctcttatttaaaacatattaaaaaacatt 227  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||| |   || |||||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  31709804 tccccttccctcaaagatgcttaaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacattttcctccccctctttttcaaaacatattagaaaatatt 31709705  T
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | || ||||||   | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31709704 ttacccccctcctttgagagaagcttgaattacattcacctcctctcttatgttaaaatctacacttt 31709637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 177 - 290
Target Start/End: Original strand, 64368 - 64482
Alignment:
Q  177 ttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatatta-aaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactct 275  Q
    ||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  64368 ttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaatatttcactcacctcccttgagagaagcttgaattacatttctctcccctct 64467  T
Q  276 tatgttaaaatctac 290  Q
    |||||||||||||||    
T  64468 tatgttaaaatctac 64482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 3514810 - 3514976
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatatt-aaaaaacatt 227  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||  || || ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |      
T  3514810 tcccctcccctcaaatatgcttcaattacattcatcttccctcttatgttaaaatatacacccccctcccctcttattcaaaacatattaaaaaaaaaaa 3514909  T
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||| ||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||  || | ||||||||||||||||||    
T  3514910 tcaatcccctcccttaagagaagcatgaattagattcctctctcctttaatgttaaaatctacactt 3514976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 126
Target Start/End: Original strand, 5113182 - 5113236
Alignment:
Q  72 gtctctttaaagttactacattgcctaaaatatttgagtaaattacactcccctc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5113182 gtctctttaaagttactacattgcctaaaatatttgagtaaattacactcccctc 5113236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5791030 - 5790920
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  ||  | |||||||||| ||||||||||    |||| |||||||||||||    
T  5791030 tacactcatctcccctcttattcaaaacatattagaaaacatttcaatcttcttccttaagagaagcatgaattacatgtccctcccctcttatgttaaa 5790931  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||||||||    
T  5790930 atctacacttt 5790920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Original strand, 43439176 - 43439300
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43439176 ctcttatgttaaaatatacactctcgtcccctcttattcaaaacatattagatttt-tttcacacccctcccctaagagaagcttgaattacattctcct 43439274  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  43439275 cc-cccttatgttaaaatctacacttt 43439300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10357170 - 10357030
Alignment:
Q  147 tgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaag 245  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||            
T  10357170 tgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattaggaaatatttcactcccct-------- 10357079  T
Q  246 agaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  10357078 -gaagcttgaattacattcccctcccctcttaagtcaaaatctacacttt 10357030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 286
Target Start/End: Original strand, 43656919 - 43657072
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| | | | || ||||| |||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  43656919 ctcccctcaaatatgtttgaattacactcccattccatcttaagttaaaatatacactctcctccccacttattcaaaacatattagaaaaaatttcact 43657018  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaat 286  Q
     || || ||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||    
T  43657019 tccatcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttcaaat 43657072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 44332125 - 44332253
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||||||||||| || ||||||||   |||| ||||| || ||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||       
T  44332125 ccctcttatgtttaaatatacactttcctcctctctttttcaaaacatattagaaattttttcactctcctcccctaagagaagcttgaattacattacc 44332224  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44332225 ctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 44332253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 22297648 - 22297758
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| || |||    
T  22297648 tacactctcctcccctcttattcaaaacatattaggaaatatttcattcccctcccttaatagaagcttgaattacattccactcccctcttaagtcaaa 22297747  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||||||||    
T  22297748 atctacacttt 22297758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26196879 - 26196778
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatatta-aaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacac 292  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||||||    
T  26196879 ctcccctcttattcaacacatattagaaaaacatttaactctcctcccctaagagaagcttgaattacattctcatcc-ctctaatgtcaaaatctacac 26196781  T
Q  293 ttt 295  Q
    |||    
T  26196780 ttt 26196778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32023790 - 32023720
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32023790 ctcccctcttattcaaaacatattagaaaactttttactcccctcccctaagagaagcttgaattacattc 32023720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 289
Target Start/End: Original strand, 26196081 - 26196200
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||| |||    
T  26196081 ctcttatgttaaaatatacgcttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcatctct-ttgagagaagtttgaattacattcctct 26196179  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatcta 289  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  26196180 tctctcttatgttaaaatcta 26196200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 44332532 - 44332463
Alignment:
Q  220 aaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  44332532 aaaacatttcactaccctcccttaagagaagcttgaattacattcctctcccctcttatattaaaatcta 44332463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18997215 - 18997092
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||   ||| | | |||| | ||||||||||||||| | ||     
T  18997215 ttatgttaaaatatacacttctctctcctcttatttaaaatatattagaaaatatttcacttatctcccttgagagcaacttgaattacattctccacct 18997116  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||||||||||| ||||||||    
T  18997115 cttttatgttaaaatttacacttt 18997092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28168238 - 28168115
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| |||| | || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  ||| | || ||| |||||| ||| |||||| ||||     
T  28168238 ttatgttaaaatatatattcctttcctctcttattcaaaacatattataaaacttttcactcgtctcccttatgagtagcttgtattgcattctcctcct 28168139  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  28168138 ctcttatgataaaatctacacttt 28168115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31597879 - 31597716
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||||||  |||| || ||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  31597879 cctccccataaagatgtttgaattacactctcctcccttcttatattaaaatatacacttccctccccttttattcaaaacatattagaaaatatttcac 31597780  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || | |  | | |||||| ||||||||||||||  || | || |||||||||||||||| ||||    
T  31597779 tctctttccttgagagaaacttgaattacattcccctacccttttatgttaaaatctacgcttt 31597716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36451624 - 36451529
Alignment:
Q  200 tcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  36451624 tcttattcaaaatatattagaaaatatttcacccccctctcttgagagaagtttgaattacatttccctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 36451529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 18467821 - 18467950
Alignment:
Q  166 tccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    || ||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||  |  || |||||||||||||||||     
T  18467821 tcccttttatgttaaattatacacttccatcaccttttattcaaaacagattagaaaatatttcactcccctcttttgtgaaaagcttgaattacattcc 18467920  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  18467921 cctcccttcttaagttaaaatctacgcttt 18467950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22298320 - 22298256
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22298320 cactcctctcttctaagagaagcttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacact 22298256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Original strand, 11563628 - 11563775
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||| ||||||||| ||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||     
T  11563628 cccttccctcaaagatgaatgaattacactcccctaccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttaatcaaaacatattagaaaatatttct 11563727  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttat 278  Q
    |||  ||| | |  ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||    
T  11563728 ctcatctcccttgcgagaagcttgaattacactcccctcccctcttat 11563775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 255
Target Start/End: Original strand, 20503157 - 20503212
Alignment:
Q  200 tcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttga 255  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20503157 tcttatttaaaatatattataaaatatttcactcccctcttctaagagaagcttga 20503212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 295
Target Start/End: Original strand, 33886392 - 33886467
Alignment:
Q  220 aaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  33886392 aaaatattttactcccctcccttaaaagaagcttgaattacattccccttccctcttatgttaaaatctacacttt 33886467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1534661 - 1534608
Alignment:
Q  183 tatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccc 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1534661 tatacactcatctctcctcttattcaaaacatatttgaaaacatttcactcccc 1534608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6078031 - 6077945
Alignment:
Q  197 ccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  6078031 ccctcttaatcaaaacatattagaaaacatttcac--------cctaagagaagtttgaattacattcctctcccttcttatgttaaaatctaca 6077945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11943001 - 11942884
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||||||| |||| || |||||||| || || ||| ||| |||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  11943001 cctccccttaaagatgtttgaattatactcatctctccttttatgttaaaatatacacttccatcccctcttatttaaaacatatgagaaaacttttcac 11942902  T
Q  232 tcccctctcctaagagaa 249  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  11942901 tctcctcacctaaaagaa 11942884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3515537 - 3515477
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3515537 ccctcccctcaaagatgtttgaattacacccccctcccctcttatgttaaaatatacactc 3515477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32879439 - 32879320
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttattt-aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| ||| || ||| ||||||||||| |||| |||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||    
T  32879439 tcttatgttaaaatatacacttctctctcctttttttttaaaacatattagaaaatattgtacttccctcccctaagagaagcttgatttatattcctct 32879340  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    || ||||||| || |||||||    
T  32879339 cc-ctcttatctttaaatcta 32879320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 40768850 - 40768998
Alignment:
Q  139 ctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccct 237  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  40768850 ctcaaagatgcttgaattacattctcctttccttttatgttaaaatatacactcccctccccttctattcaaaacatattagaaaatatttcactcccca 40768949  T
Q  238 ctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaat 286  Q
        | |||||| |||||||||||||   |||| |||||| ||||||||    
T  40768950 tcattgagagaaacttgaattacattgccctcccctcttaagttaaaat 40768998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 5475200 - 5475141
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5475200 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatataca 5475141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40769437 - 40769374
Alignment:
Q  129 atcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40769437 atcccctcccctcaaagatggttgaattacactcccctcacctcttatgttaaaatatacactc 40769374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6229951 - 6229889
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||    
T  6229951 tcccctcccctcaaagatccttgaattacactccccttccctcttatgttaaaatatacactc 6229889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 294
Target Start/End: Original strand, 14900365 - 14900415
Alignment:
Q  244 agagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14900365 agagaagcttaaattacatttttctccacggttatgttaaaatctacactt 14900415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 31597232 - 31597294
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  31597232 tcccctcccctcaaggatgcttgaattacactcacctcccctcttatgttaaaatataaactc 31597294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 294
Target Start/End: Original strand, 32875168 - 32875226
Alignment:
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  32875168 ctctcctaaaagatgcttgaattacactcttcttctctcttatgttaaaatatacactt 32875226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 291
Target Start/End: Original strand, 32877822 - 32877888
Alignment:
Q  225 atttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||| || |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  32877822 atttcattctcctcccttaagagatgcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatttaca 32877888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 33146042 - 33146104
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  33146042 tcccctcccctcaaagatgcttgaattgcactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 33146104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 37199666 - 37199604
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37199666 tcccctcccctcaaagatgtttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 37199604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3045668 - 3045603
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  3045668 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattaaattcttcttccctcttatgttaaaatatacactt 3045603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 294
Target Start/End: Original strand, 24387077 - 24387174
Alignment:
Q  198 cctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc-tccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||  | ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24387077 cctcttatgtaaaacatattagaaaatatttcactccccacccgtgaaagaagcttgaattatattccccatcccctcctatgttaaaatctatactt 24387174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 35657464 - 35657509
Alignment:
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35657464 gcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 35657509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13874055 - 13873991
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||||| | | ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13874055 cactcccctctctttaaagatgtttgaattacactcttctcctctcttatgttaaaatatacact 13873991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14014180 - 14014116
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||||| | | ||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14014180 cactcccctctctttaaagatgtttgaattacactcttctcctctcttatgttaaaatatacact 14014116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Original strand, 16599602 - 16599697
Alignment:
Q  199 ctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||| | || |  ||| |||||||||||||||| ||||  || | || |||||||||||||||||||||    
T  16599602 ctcttattcaaaacatattagaaaatatttcatttcctttccctgagagaagcttgaattaaattc-ccttcccttttatgttaaaatctacacttt 16599697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11796876 - 11796817
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11796876 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatataca 11796817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 14736802 - 14736720
Alignment:
Q  208 aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14736802 aaaacatgttagaaaatatttcacactcctcccctaa-agaagattgaattatattcctctcccctcatatgttaaaatctaca 14736720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34173780 - 34173721
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34173780 tcccctcccctcaaagatgtttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatataca 34173721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5475215 - 5475141
Alignment:
Q  217 taaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  5475215 taaaaaaaattatactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatataca 5475141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 290
Target Start/End: Original strand, 6229344 - 6229390
Alignment:
Q  244 agagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  6229344 agagaagcttcaattacattcctctcccctcttaagttaaaatctac 6229390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 28167547 - 28167609
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  28167547 tccccttccctcaaagatgattgaattacactccccttccctcttatgttaaaatatacactc 28167609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39160351 - 39160285
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39160351 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 39160285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Original strand, 39208843 - 39208909
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39208843 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 39208909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 159
Target Start/End: Original strand, 1366350 - 1366379
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattaca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1366350 tcccctcccctcaaagttgcttgaattaca 1366379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Original strand, 7939338 - 7939395
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7939338 ctcccttcaaagatgcttgaattacactctccttccctcttatgttaaaatatacact 7939395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 291
Target Start/End: Original strand, 33206111 - 33206160
Alignment:
Q  242 taagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  33206111 taagagaagcttgaattacactcatctcttctcttatgttaaaatataca 33206160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 34247390 - 34247451
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  34247390 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccttcttaagttaaaatctacact 34247451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38911388 - 38911335
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcat 193  Q
    |||||| || ||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  38911388 tcaaagatgtttgaattacactccccttcctcttatgttaaaatatacactcat 38911335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38973211 - 38973150
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  38973211 tcccctcccctcaaagatgcttcaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 38973150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43657659 - 43657598
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  43657659 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacacttccctcccatcttaagttaaaatatacact 43657598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Original strand, 8313671 - 8313731
Alignment:
Q  138 cctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcc 197  Q
    |||||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8313671 cctcaaggatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcctctcc 8313731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17829755 - 17829715
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct 170  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  17829755 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctccct 17829715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41521767 - 41521707
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  41521767 ccctcccctcaaagatgcttgaattacattctcttcccttcttatgttaaaatatacactc 41521707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 42791460 - 42791536
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttat 205  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||  | |  ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  42791460 tcccctcccctctaagatgcttgaattacacttctctcccctcttatgttaaaatatacaatcccctcccctcttat 42791536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 44332452 - 44332388
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44332452 cactcccctgccctcagagatgcttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatatacact 44332388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 22934299 - 22934465
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  22934299 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 22934398  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22934399 cactcccctcccctaagagaagcttgaattagatcctcctcccctcttatgttaaaatctacacttt 22934465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 295
Target Start/End: Original strand, 14363766 - 14363952
Alignment:
Q  107 gagtaaattacactcccctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttat 205  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||    
T  14363766 gagtaaattacactcccctc----cccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcacctcttat 14363861  T
Q  206 ttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattaca-ttcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14363862 tcaaaacatattagaaaaaatttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacaccccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 14363952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 6292524 - 6292690
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||    
T  6292524 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatatacaatcccctcccctcttattcaaaacatattagagaaaattt 6292623  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6292624 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 6292690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 3075316 - 3075482
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||| ||||  ||    |||    
T  3075316 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccttcccctcttattcaaaacttatttgaattttttt 3075415  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3075416 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 3075482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 29636446 - 29636292
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29636446 ccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactccactcccctcttattcaaaacatattagaaaa-atttcactccc 29636348  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29636347 ctcccctaagagaagctagaattacatctctctcccctcttatgttaaaatctaca 29636292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Original strand, 30353893 - 30354020
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||    
T  30353893 cctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttatttaaaacattttaaaaaatatttcactcccctcccttgagagaagcttgaattacattcctc 30353992  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30353993 tcccctcttatattaaaatctacacttt 30354020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17565405 - 17565239
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  17565405 tccccttccctcaaagatgcttcaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactcctctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 17565306  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| |||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  17565305 cactcacctctctttatagaagcttgaattacattttcctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 17565239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24810322 - 24810157
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| | | ||||  |||||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||    
T  24810322 tcccctcccctcaaagatatttgaattacactctcatcccctttatgttaaaatatacgttcccctcccctcttattcaaaacatattagaaattttttc 24810223  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24810222 actcccctcccctaagagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaaactacacttt 24810157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25485483 - 25485331
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25485483 tcaaagatgtttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctaccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcactcccctc 25485384  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||||||    
T  25485383 tcctaagagaagcttgaattacatccccctaccctcttatgttaaaatctaca 25485331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34364645 - 34364484
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  34364645 tcccctcccctcaaagatgcttgaattaccctc----ccctcttatgttaaaatatacactctcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttc 34364550  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  34364549 attcccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 34364484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10216202 - 10216036
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||  |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  10216202 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttcagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 10216103  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10216102 cactttccacccctaagagaagcttgaataacatctccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 10216036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25598520 - 25598359
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||    
T  25598520 ctcctctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactactctcccctcttattcaaaatatatagaaaaa-atttcact 25598422  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25598421 cccctcccctaagaaaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 25598359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 290
Target Start/End: Original strand, 11759398 - 11759559
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  11759398 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctccccacttatgttaaaatatacactttcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 11759497  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||||||||| | | | ||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||    
T  11759498 cactcccctcccttgaaagaagcttgaattacatttccctcccctcttaagttaaaatctac 11759559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32905389 - 32905228
Alignment:
Q  135 tcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctctt-atgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  32905389 tcccctcaaagatgcttgaattacactctcctccctttttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactc 32905290  T
Q  234 ccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | | | |||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  32905289 cccacccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttgtgttaaaatctacgcttt 32905228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 295
Target Start/End: Original strand, 11140123 - 11140270
Alignment:
Q  149 cttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagag 247  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| ||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||    
T  11140123 cttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcatattcaaaatatattcaaaaaaaattgactcccctcccctaagag 11140222  T
Q  248 aagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11140223 aagcttgaattacattcccctccccccttatgttaaaatctacacttt 11140270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14880251 - 14880089
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| |    
T  14880251 ctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattaaaaaaatattagaaaatatttcatt 14880152  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||| ||||    
T  14880151 cccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcgtaagttaaaatctacgcttt 14880089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Original strand, 36016140 - 36016266
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatt-taaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    |||||||||||| |||||||||  || | |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36016140 tcttatgttaaaatatacactccccttctctcttattctaaaacatattagaaaactttccactcccctcccctaagagaagcttgaattacattcctct 36016239  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  36016240 ctcctcttatgttaaaatctacacttt 36016266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 39998380 - 39998546
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  39998380 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatacacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 39998479  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||  ||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  39998480 cactctcctcccttgagagaagcttcaattacattctcttctcctcttaagttaaaatctacgcttt 39998546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 21304011 - 21304140
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaaca-tattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||     
T  21304011 ccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaaaaatattaaaaaacttttcactcacctcccttaagagaagcttgaattacattca 21304110  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21304111 cctcctctcttatgttaaaatctacacttt 21304140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41262824 - 41262664
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| |    ||||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||   ||||||    
T  41262824 ccctctcctcaaatatgcttgaattacactc----ccctcttatgttaaaatatatactcccctctcctcttattcaaaacatattagaaattttttcac 41262729  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt-ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41262728 tcccctcccctaagagaagcttgaattacatttttactccccccttatgttaaaatctacacttt 41262664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 8628115 - 8627957
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||    || | ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  8628115 cctcccttcaaagatgcttgaattacacttttcttctctcttatgttaaaatatacactctcctcccctcttattcaaaacattttagaatacatttcac 8628016  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||| |||||| ||||||||||||    
T  8628015 tcccctcccctaagagaagcttgaatgacatttccctcccctcttaagttaaaatctac 8627957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Original strand, 14093531 - 14093656
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14093531 ctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcatttccctc-cctaagagaagcttgaattacattcccct 14093629  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  14093630 cccctcttatgttaaaatctacacttt 14093656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 289
Target Start/End: Original strand, 31846495 - 31846617
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  31846495 ccctcttatgttaaaatatacactccccttccctcttattcaaaacatattagaaaatgtttcacttccctcccctaagagaagcttgaattacattccc 31846594  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  31846595 ctcttctcttatgttaaaatcta 31846617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Original strand, 12330917 - 12331042
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctc 269  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||     
T  12330917 tcttatgttaaagtatacactcccctcctctcttattcaaaatatattagaaaacatttcattcccctcccttaagataagcttgaattatattctcctt 12331016  T
Q  270 cactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  12331017 ccctcttatgttaaaatctacacttt 12331042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37304950 - 37304794
Alignment:
Q  139 ctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccct 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| | || |||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||    
T  37304950 ctcaaagatgcttgaattacactctccttctcttttatgttaaaatatagactcctctccccacttattcaaaacatagtataaaacatttcacacccct 37304851  T
Q  238 ctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |  |||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37304850 cctctaaaagaaacttgaattacgttc-tctcccctcttatgttaaaatctacacttt 37304794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 4256571 - 4256735
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||| |   || |||||||||| ||||||||||  |||| ||| |     
T  4256571 ccctcccctcaaagatgcttaaattacattcacattccctcttatgttaaaatatacatttcacttccctcttattcaaaacatattggaaaatattcct 4256670  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4256671 ctcccctcccttgagagaagcttgaattacatttctctcctctcttatgttaaaatctacacttt 4256735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 44283741 - 44283869
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||      
T  44283741 ccctcttatgttaaaatatacacttcactcccctctttttcaaaacatattagaaaatatttcactcccctcccttgggagaagcttgaattacattccc 44283840  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44283841 ctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 44283869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17496986 - 17496827
Alignment:
Q  136 cccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||    
T  17496986 cccctcaaagatgtttgaattacactccctcccctcttatgttaaaatatacaatctcttcccctcttattcaaaacataatagaaaatatttcactccc 17496887  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | | |||||||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  17496886 ctcccttgagagaagcttcaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 17496827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29459317 - 29459159
Alignment:
Q  138 cctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccc 236  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||  |||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| || | |||    
T  29459317 cctcaaagatgcttgaattacactcccctctcctcttatgttaaaatatccactcccctcatctcttattcaaaacatattagaaaatattacatttccc 29459218  T
Q  237 tctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  29459217 tcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacacttt 29459159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 33972309 - 33972475
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||    |||| ||||||||||||| |||||| |   ||| | ||||||| ||||||||||| |||| || |    
T  33972309 tcccctccccttaatgttgcttgaattacacttcactcctctcttatgttaaaatatacattaccctctcatcttattcaaaacatattagaaaatatct 33972408  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  33972409 cactcctctcccctaagagaaacatgaattacattctccgcccctcttatgttaaaatctacacttt 33972475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34679987 - 34679826
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  34679987 ctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcgtatgttaaaatatacactttcctccc-tcttattcaaaacatattagaaaatatttcact 34679889  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||| | | |||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34679888 ccgctcccttgagagaagcttgaattacatctccctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 34679826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8297831 - 8297703
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |      
T  8297831 ccctcttaagttaaaatatacacttccatcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcaccctcttcccctaagagaagcttgaattacatcccc 8297732  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8297731 ctcccctcttatgttaaaatctacacttt 8297703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 286
Target Start/End: Original strand, 3075144 - 3075299
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||| ||  ||  ||||||||| ||||| ||||  ||    |||||    
T  3075144 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactaccctcccctcttatgttaaaatatacattcccctatcctcttattcaaaacttatttgaatttttttca 3075243  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaat 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  3075244 ctcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaat 3075299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Original strand, 10674335 - 10674458
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||  ||||     
T  10674335 ttatattaaaatatacaatcttctcccctcttattcaaaacatattagaagacttttcaccctcctcccttaagagaagcttgaattacattcacctccc 10674434  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  10674435 ttcttatgttaaaatctacacttt 10674458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 290
Target Start/End: Original strand, 24778003 - 24778161
Alignment:
Q  135 tcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||     
T  24778003 tcccatcaaagatacttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacacttctctaccctcttattcaaaacatattataaaatatttcactt 24778102  T
Q  234 ccctctcctaagagaagcttgaattacattct--tctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||| | | | ||||||||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  24778103 cccacccttgagagaagcttgaattacattctcctcccccctattatgttaaaatctac 24778161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Original strand, 8437947 - 8438073
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||    
T  8437947 ctcttatgttaaaatatacactcccctccccttttattcaaaacatattaggaaatatttcactcccctcccttaatagaagcttgaattacattcccct 8438046  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||||| || |||| |||||||||    
T  8438047 cccctcttaagtcaaaacctacacttt 8438073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 8442666 - 8442832
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| |  || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8442666 tcccctcctctcaaagatgcttgaattacactctcttcccctcttatgttaaaatatacacacccctaccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 8442765  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||||||| | | |||||||||||| |||||||   |||| || ||| |||||||||||| ||||    
T  8442766 cattcccctcccttgagagaagcttgagttacatttccctcccctgttaagttaaaatctacgcttt 8442832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40791822 - 40791656
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||    
T  40791822 tcccctcccatcaaagatgcttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcacctcttattcaaaacatattagaaatttttt 40791723  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||  | ||| ||||||||||||||||||| ||| |   ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40791722 caccactctcccctaagagaagcttgaatttcatccacatcccctcttatattaaaatctacacttt 40791656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Original strand, 33969067 - 33969168
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33969067 ctcccctcttattcaaaatatattaaaaacattttcactcccctcccttaagagaaacttgaattgcattctcctcccctcttatgttaaaatctacact 33969166  T
Q  294 tt 295  Q
    ||    
T  33969167 tt 33969168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32904281 - 32904114
Alignment:
Q  135 tcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||   |||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||    
T  32904281 tcccttcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacacttccctccactcttattcaaaatatattagaaaatatttcactc 32904182  T
Q  234 ccctctcc------taagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| ||      | |||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  32904181 ccctccccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttgtgttaaaatctacgcttt 32904114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 43764126 - 43764254
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||  || |||||||||||||      
T  43764126 ccctcttatgttaaaatatacactctcctccccttttattcaaaacatattagaaaatattttactcccttcccctaagaatagtttgaattacattccc 43764225  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  43764226 cttccctcttatgttaaaatttacacttt 43764254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44746904 - 44746740
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||  | ||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  44746904 ccctcccctcaaatatacttgaatcacactcatctctcctcttatgttaaaatatacactcccctctcctcttattcaaaacatattagaaaatatttca 44746805  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||   ||| | | |||||||||| ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  44746804 ctaatctcccttgagagaagctttaattacattcacctcctctcttaagttaaaatctacgcttt 44746740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37837640 - 37837477
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaac-atttcac 231  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||| ||||| ||||||||   |||| ||| |||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  37837640 ctcctctcaaagatgcttgaattacattctcctcccctcttatcttaaaatatacacttccctcctctcctattcaaaacatattagaaaattatttcac 37837541  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||||| | |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37837540 tctcctctcttgagagaaacttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 37837477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25954170 - 25954004
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||   |||||||| ||||| ||||||||   ||  |||||| || ||||||||| | |||| ||||    
T  25954170 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacactccccagtcctcttattttaaaatatacacttcacttacctctttttcaaaacatatcagaaaatattt 25954071  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  25954070 cactcccctcccttgagagaagcttgaattacattcacttcccctcttatgttaaaatctacgcttt 25954004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 34923856 - 34923960
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34923856 ctccccttaaagatgcttgaattatactc-cctcctctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttatttaaaacatattagaaaacttttcact 34923954  T
Q  233 cccctc 238  Q
    ||||||    
T  34923955 cccctc 34923960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13422095 - 13421967
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||       
T  13422095 ccctcttatgttaaaatatacactcccctcctctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcccctcctttgagagaagattgaattacatttcc 13421996  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  13421995 ctcatctcttaagttaaaatctacgcttt 13421967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13440165 - 13440037
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||       
T  13440165 ccctcttatgttaaaatatacactctcatcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcactcccctcccttgagagaagattgaattacatttcc 13440066  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  13440065 ctcatctcttaagttaaaatctacgcttt 13440037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 13573197 - 13573358
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |    | ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  13573197 tcccctcccctctaagatgcttgtattacactc----cactcttatgttaaaatatacaatcccctcccctcttactcaaaacatattagaaaacttttc 13573292  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||||||  ||||||||| |||||| |||||||  |||  |||||||  |||||||||||||||    
T  13573293 acccccctcctctaagagaaacttgaactacattcccctctcctcttataataaaatctacacttt 13573358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30991439 - 30991371
Alignment:
Q  227 ttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30991439 ttcactcccgtctcctaagagaagcttgaattacattcccctcctctcttatgttaaaatctacacttt 30991371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Original strand, 26928241 - 26928364
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||   | || ||||||||||||||||||  ||||     
T  26928241 ttatgttaaaatatacactttcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatttttcactcccctcctttgagggaagcttgaattacattcgcctccc 26928340  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||    
T  26928341 ctcttgtgttaaaatctacgcttt 26928364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 41311718 - 41311848
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacatt-ct 265  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  41311718 cccttttatgttaaaatatacattcccctcccctcttattcaaaatatattaaaaaaaaattcaatcccctcccctaagagaagcatgaattacattccc 41311817  T
Q  266 tctccactcttatgttaa-aatctacacttt 295  Q
     |||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  41311818 cctcccctcttatgttaagattctacacttt 41311848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 40298939 - 40299093
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| | | ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  40298939 tcaaagatgcttgaattacactccccttcattcttatgttaaaatatacactttcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattttactcccctc 40299038  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     | |  ||||| ||||||||||||||  || | |||||| |||||||||||| ||||    
T  40299039 cctt--gagaaacttgaattacattccccttccctcttaagttaaaatctacgcttt 40299093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Original strand, 4855309 - 4855436
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagag--aagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | |||| ||||||||  |||||| ||||| ||||| |    
T  4855309 tcttatgttaaaatatacaatcccctcctctcttattcaaaacatattagaaaacttttcatcctcctcccctaagagaaaagcttaaattatattctcc 4855408  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4855409 tcccctcttatgttaaaacctacacttt 4855436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 5872265 - 5872335
Alignment:
Q  193 tctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacatt 263  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5872265 tctcccctcttattcaaaatatattataaaatatttcacttccctcccctaagagaagtttgaattacatt 5872335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 294
Target Start/End: Original strand, 30279788 - 30279909
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||   ||| | ||| | |||||||||||||||| || |||     
T  30279788 ttatgtaaaaatatacactcttctcccctcttatgcaaaacatactaaaaaaaattacacttttctcccttaaaa-aagcttgaattacattattttcct 30279886  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  30279887 ctcttatgttaacatctacactt 30279909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Original strand, 37265543 - 37265669
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    |||||||||||||  |||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | |||| |  || |||||||||| |||    
T  37265543 ctcttatgttaaaacatacactttcctctcctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcccctcccttgagaggaatttcaattacattcctct 37265642  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||||| |||||||| ||| ||||    
T  37265643 cccctcttaagttaaaatatacgcttt 37265669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 295
Target Start/End: Original strand, 15847939 - 15848032
Alignment:
Q  202 ttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||| |||| | || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  15847939 ttatttaaaacatattagtaaacattccattcctctcttctaaaaaaaacttgaattacattcatcttctctcttatgttaaaatttacacttt 15848032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 263
Target Start/End: Original strand, 31739557 - 31739654
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacat-attaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacatt 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31739557 ccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcgaaatataattagaaaacttttcactcatctcccttaagagaagcttgaattacatt 31739654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 40133505 - 40133633
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacatt--c 264  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| ||  |||| |||||| |||| ||| |||||||||| ||| | ||||| |||||||||| |  |    
T  40133505 ccctcttatgtcaaaatatacactccactcccctctcatgcaaaaaatattagaaaaaattgcactcccctccccttaaagaagattgaattacactccc 40133604  T
Q  265 ttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  40133605 ttc-cccctctaatgttaaaatctacactt 40133633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44284420 - 44284354
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44284420 cactcccctcccctaagagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacacttt 44284354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 253536 - 253602
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctccc 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  253536 tcccctcccctcaaagatgcttgaattaca--ctcccccctcttatgttaaaatatacactcctctccc 253602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 662322 - 662256
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctccc 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  662322 tcccctcccctcaaagatgcttgaattaca--ctcccccctcttatgttaaaatatacactcctctccc 662256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 848120 - 848054
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctccc 198  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  848120 tcccctcccctcaaagatgcttgaattaca--ctcccccctcttatgttaaaatatacactcctctccc 848054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44147688 - 44147531
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||| ||||| ||||| ||| |||||||||  ||| |||||| || |||||| |||| ||||| ||| | |||||||    
T  44147688 tcaaagatgcttgaattacattctccttccctcctatgtcaaaatatacactctcctctcctcttcttcaaaacacattataaaacttttaagtcccctc 44147589  T
Q  239 tcct-aagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
       | |||||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44147588 catttaagagaagtttgaattacgttcccctcccctcttatgttaaaatatacacttt 44147531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29621902 - 29621791
Alignment:
Q  151 tgaattacacccacctccctc-ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaa 249  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||  | || | ||||    
T  29621902 tgaattacacccccctctcttattatgttaaat-atatacttctctcccctcttatgtaaaccatattagaaaacattccactccccctttctgaaagaa 29621804  T
Q  250 gcttgaattacat 262  Q
    |||||||||||||    
T  29621803 gcttgaattacat 29621791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42166683 - 42166592
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacatt 263  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  42166683 ctcttatattaaat-atacactctcctcccctattattcaaaacatattagaaaatatttca--cccctcccttaagagaagcttcaattacatt 42166592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45489336 - 45489250
Alignment:
Q  208 aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  45489336 aaaatatattagaaaatatttcactctcccc-cttaagagaagcttgaattacattcttatcccctctcatgttaaaatatacgcttt 45489250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11141128 - 11141066
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11141128 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcccctcctctcttatgttaaaatatacactc 11141066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 25597783 - 25597844
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  25597783 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcctctcttaagttaaaatatacact 25597844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 34924924 - 34924977
Alignment:
Q  242 taagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34924924 taagagaagcttgaattacttccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 34924977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6099540 - 6099484
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattataca 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  6099540 cctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctctcctcttatgttaaaatataca 6099484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11141131 - 11141067
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11141131 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcccctcctctcttatgttaaaatatacact 11141067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11760134 - 11760066
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcc 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11760134 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacattctcctcctctcttatgttaaaatatacactcttctcc 11760066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 6293264 - 6293205
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6293264 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatataca 6293205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11760116 - 11760073
Alignment:
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11760116 gcttgaattacattctcctcctctcttatgttaaaatatacact 11760073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Original strand, 14879530 - 14879589
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14879530 tcccctcccctcaaagatgtttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatataca 14879589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 291
Target Start/End: Original strand, 35366401 - 35366483
Alignment:
Q  208 aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | ||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||||    
T  35366401 aaaacatattagaaaatatttcactccccacccctgaaagaagtttgaattacattgtccacc-ctcttatgttaaaatttaca 35366483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36016826 - 36016764
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  36016826 tccccttccctcaaagatgcttgaattacaatcccctcctctcttatgttaaaatatacactc 36016764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37872933 - 37872875
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | |  ||||||||||||||| ||||||    
T  37872933 tcccctcccctcaaagatgcttgaattaccctccctcccctcttatgttaaaatataca 37872875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43777055 - 43777001
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  43777055 ccctcaaagatgcttgaattacactccacttccctcttatgtttaaatatacact 43777001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44284417 - 44284356
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  44284417 tcccctcccctaagagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 44284356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 3075313 - 3075377
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3075313 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 3075377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 11140101 - 11140165
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11140101 cactcccgtctcctaaaagatacttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 11140165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12962256 - 12962148
Alignment:
Q  187 cactcatctcccctcttatttaaaacatatta-aaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaa 285  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| ||| || |||| |||| | ||| || || ||||||||||||| ||  |||| || ||||||    
T  12962256 cactcatctcccctcttatgaaaaacatactagaaaaaaattacattcccatctcgtgagaaaaactcgaattacattcttatctcctctaatattaaaa 12962157  T
Q  286 tctacactt 294  Q
    |||| ||||    
T  12962156 tctatactt 12962148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 100)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 317286 - 317452
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  317286 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 317385  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  317386 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatttccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 317452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 2146044 - 2146210
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||    
T  2146044 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactctcctctcctcttattcaaatcatattagaaaaaattt 2146143  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2146144 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 2146210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 25266 - 25430
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  25266 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttca 25365  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25366 ctcccctcccctaagagaagcttgaattacatctccctcccctcttatattaaaatctacacttt 25430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5228705 - 5228539
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || |||    
T  5228705 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacactctcctccccttttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaatactttt 5228606  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5228605 cactcccttcccttaagagaagcttgaattacattctcctcccttcttatgttaaaatctacacttt 5228539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23742725 - 23742560
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  23742725 tcccctcccctctaagatgcttgaattacactcatctcatctcttatgttaaaatatacaatcatctcccctcttattcaaaacatattagaaaattttt 23742626  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  23742625 cac-cccctcccctcagagaagcttgaattacattcttctcccctcttataataaaatctacacttt 23742560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 6184660 - 6184825
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  6184660 tcccctcccctcaaagatgtttgaattacactctcctccctcttaagttaaaatatacactcccctccactcttattcaaaacatattagaaaaaatttc 6184759  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6184760 acttccctcctctaagagaagcttgaattacatccccctctcctcttatgttaaaatctacacttt 6184825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 29823338 - 29823504
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  29823338 tcccctcccctcaaagatgtttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaaaattt 29823437  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29823438 catccccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 29823504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38670750 - 38670584
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  38670750 tcccctctcctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactaccctcccctctttttcaaaacatattagaaaaaattt 38670651  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38670650 cactctcctctcctaagagaaggttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 38670584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 14078371 - 14078530
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | | |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  14078371 ccctcaaagatgcttgaattaaactctcttcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttcaatccc 14078470  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | |||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14078471 ctcccttaagagaagcatcaattgcattcctctcctctcttatgttaaaatctacacttt 14078530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 14388399 - 14388558
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| ||||||||||| || | | |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  14388399 ccctcaaagatgcttgaattaaactctcttcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttcaatccc 14388498  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | |||||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14388499 ctcccttaagagaagcatcaattgcattcctctcctctcttatgttaaaatctacacttt 14388558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42813638 - 42813487
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42813638 ccctcaaagatgcttgaattacactcccctcctctcttatgttaaaatatacactttcctcccctcttattcaaaacatattagaaaacatttccctccc 42813539  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatc 287  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  42813538 ctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatc 42813487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32867961 - 32867803
Alignment:
Q  138 cctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccc 236  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| || |  || |  |||||||||||    
T  32867961 cctcaaagatgcttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacttaattgaatatttttcactcccc 32867862  T
Q  237 tctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32867861 tcccctaagagaagcttgaattacattcccctcctctcttatgttaaaatctacacttt 32867803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 48982605 - 48982447
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  48982605 tcccctctcctcaaatatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 48982506  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatc 287  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||    
T  48982505 cactcccctctcttgagagaagcttgaattacattccgttccgctcttaagttaaaatc 48982447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 3340781 - 3340947
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact-catctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatt 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  3340781 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacatttcccttccctcttatgttaaaatatacacttcat-tcccctcttattcaaaagatattagaaaacatt 3340879  T
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||| |   |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3340880 tcaatccccaccattaagagaagcatgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 3340947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 40343769 - 40343931
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||  |||| |||| |||||||    
T  40343769 cctcccctcaaagatgcttgaattacactccccttccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaactaattagaaaaaatttcac 40343868  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||| ||||||| | ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40343869 tcgcctcccctaaga-atgcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 40343931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 22263771 - 22263937
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  |  |||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  22263771 tcccctcctctcaaagatgcttgaattacattcttctcctctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaatatattagaaaatattt 22263870  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | || ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22263871 cactcccctcccttgagggaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 22263937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 27144189 - 27144355
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||  ||    |||    
T  27144189 tcccctcccctcaaagatgcttaaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacttatttgaattttttt 27144288  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27144289 cactcccctccgctaagagaatcttgaattacattcccatcccctcttatgttaaaatctacacttt 27144355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 28308014 - 28308171
Alignment:
Q  139 ctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccct 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  28308014 ctcaaagatgcttgaattacactcccctctcctcttatgttaaaatatatacttttctcccctctttttcaaaacatattaaaaaatatttcgctcccca 28308113  T
Q  238 ctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | |||||||||| | ||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28308114 cccctaagagaaacatgaattacattcccgtccccacttatgttaaaatctacacttt 28308171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 20261014 - 20261178
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  20261014 ccctctcctcaaagatgctggaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacattttaaaaaatatttca 20261113  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||  | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  20261114 ctccccttccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttacgttaaaatctactcttt 20261178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 40400912 - 40401076
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||    
T  40400912 cccttccctcaaagatgcttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatatacactcctctcccctcttattcaaaacatattagaaattttttca 40401011  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| | | | | ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40401012 ctcccctcccttgacaaaagcttgaattacgttcccctcccctcttatgttaaaatctatacttt 40401076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25607671 - 25607512
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    |||| |||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |    
T  25607671 cccttaaagatgtttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaattttcactctc 25607572  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25607571 ctcgcctaagagaaacttgaattacatccccctctcctcttatgttaaaatctacacttt 25607512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 36847840 - 36848006
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||     
T  36847840 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacgaccccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattc 36847939  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||| ||    | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  36847940 cattcctctgctttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 36848006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 291
Target Start/End: Original strand, 5951661 - 5951819
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||   ||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||     
T  5951661 ccctcctctcaaagatgtttgaatttcactaccctcctctcttatgttaaaatatacacttttctcccctc--attcaaaacatattagaaaacatttct 5951758  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||    
T  5951759 ctcccctcccctaagagaagcttgaattacattttcttcttctcttatgttaaaatctaca 5951819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 29103566 - 29103695
Alignment:
Q  166 tccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||| |||| |||||  |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  29103566 tccctcttatgttaaaatatacacttccctcctctcttattcaaaatatatttgaaaatagttcactcccctcccctaagagaagcttgaattatattct 29103665  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29103666 cctcccctcttgtgttaaaatctacacttt 29103695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 34999195 - 34999357
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||   |||||    
T  34999195 ccctcccctaaaagatacttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaacacatattaaaaactttttca 34999294  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34999295 ct-ccctcccttaagagaagcttgaattacatccccctcc-cccttatgttaaaatctacacttt 34999357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 40402221 - 40402109
Alignment:
Q  178 taaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactctta 277  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  40402221 taaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcccctctcttgagagaagcttgaattacattcctctcccatctta 40402122  T
Q  278 tgttaaaatctac 290  Q
     ||||||||||||    
T  40402121 agttaaaatctac 40402109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32388211 - 32388048
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  32388211 cctctcctcaaagatgcttgaattacactccactcccctcttatgttaaaatatacacttccctcccatctttttcaaaacatattagaaaatatttcac 32388112  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||    
T  32388111 tctcctcccctgagagaagtttgaattacattctcttctcctcttatgttaaaatatacgcttt 32388048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 287
Target Start/End: Original strand, 46010498 - 46010617
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | | |||||||||| ||||||||||  |    
T  46010498 cctcttatgttaaaatatacactcctctctcctcttatttaaaacatattagaaaatatttcactcctctcccttgagagaagcttaaattacattcccc 46010597  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatc 287  Q
    ||| |||||| |||||||||    
T  46010598 tcccctcttaagttaaaatc 46010617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 8122635 - 8122801
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||   ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8122635 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactccccttatctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 8122734  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
       ||||||| | | |||||||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  8122735 ttatcccctcccttgagagaagcttgaattacattcccatcccctcttaagttaaaatctacgcttt 8122801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29736817 - 29736694
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctc 269  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29736817 tcttatgttaaaatatacacttccctcccct--tattcaaaacatattagaaaacattttactctcttcttctaagagaagcttgaattacattctcatc 29736720  T
Q  270 cactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  29736719 ccctcttatgttaaaatctacacttt 29736694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36890139 - 36889987
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||  ||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||| |||| |||||| ||||||     
T  36890139 tcaaagatgcttgaattacactcttctcccctcttctgttaatatatacactcttttcccctctcattcaaaatatattagaaaatatttcattcccct- 36890041  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacac 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  36890040 tcctaagagaagcttgaattacattcccctcccttcttatgttaaaatctacac 36889987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Original strand, 1573103 - 1573259
Alignment:
Q  147 tgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac----tcccct---- 237  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    ||||||        
T  1573103 tgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatataca-tcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaacgtttcaccccctcccctaagt 1573201  T
Q  238 ctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1573202 cccctaagagaagcttgaattacattccactcccctcttatgttaaaatctacacttt 1573259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 31220806 - 31220968
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||| |||||| |   |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31220806 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacactcttctcccttcttatattaaaatatacaattccctcctctcttattcaaaacatattaaaaaatattt 31220905  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||| ||| ||||||||    
T  31220906 cactcccctaccttaagagaagcttgatttacattcccctctcctcttatattataatctaca 31220968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 131 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11641045 - 11640912
Alignment:
Q  131 cccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||| | |||||| | |||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  11641045 cccctcccctcaaagatggttaaattacactcccctccccttttatgttaatatatacacttttctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttc 11640946  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacatt 263  Q
    ||||||||| | | | ||||||||||||||||||    
T  11640945 actcccctcccttgaaagaagcttgaattacatt 11640912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 295
Target Start/End: Original strand, 43450112 - 43450273
Alignment:
Q  135 tcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||| |||||| ||  |||| || ||||| ||||||||||  |||| |||||||||    
T  43450112 tcccttcaaagatgcttgaattacacttccctcatctcttatgttaaaatatacattctcctcctcttttattcaaaacatattggaaaatatttcactc 43450211  T
Q  234 ccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||| | | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  43450212 ctctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 43450273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19435360 - 19435197
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| |  |||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||    
T  19435360 ccctcctctcaaagatgtttgaattacactcctctccactcttatgttataatatacacttttctcccctcttattcaaaacaaattagaaaatatttca 19435261  T
Q  231 --ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacac 292  Q
      |||||||| | ||||||||| ||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||    
T  19435260 ctctcccctcccttaagagaagtttgaattacatttcccttccctcttatgttaaaatctacac 19435197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2790959 - 2790836
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||  ||||     
T  2790959 ttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaatatatgagaaaacttttcactcccttcccctaagagaagtttgaattgcattcccctccc 2790860  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  2790859 ctcttatgttaaaatccacacttt 2790836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2935845 - 2935719
Alignment:
Q  107 gagtaaattacactcccctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttat 205  Q
    ||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  2935845 gagtaaattacactcccctc-----cccttccctcaaagatgcttgaattacactcccttcccctcttatgttaaaatatacacttctctcccctcttat 2935751  T
Q  206 ttaaaacatattaaaaaacatttcactcccct 237  Q
    | ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  2935750 tcaaaacatatgagaaaacttttcactcccct 2935719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 36687311 - 36687470
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    |||| |||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  36687311 cccttaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactccccccccgtcttattcaaaacatattagaaaatatttcactctc 36687410  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | |  ||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  36687411 ctcccttgtgagaagcttcaattacattttcctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 36687470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38790804 - 38790673
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||    
T  38790804 cctcccctcaaagatgtttgaattacactcccctctcctcttatattaaaatatacacgtccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttaac 38790705  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacatt 263  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  38790704 tcccctcccttgagagaagcttgaattacatt 38790673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23233491 - 23233397
Alignment:
Q  195 tcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  23233491 tcccctcttattcaaaacatattagaaaacatttcacttccctcccttaagagaaacttgaattacattcacatcccctcttatgttaaaatcta 23233397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23243152 - 23243058
Alignment:
Q  195 tcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  23243152 tcccctcttattcaaaacatattagaaaacatttcacttccctcccttaagagaaacttgaattacattcacatcccctcttatgttaaaatcta 23243058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 16425345 - 16425510
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  16425345 tcccctcccatcaaagaagtttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacacttccctccattcttattcaaaacatactagaaaatattt 16425444  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||||  || | | |||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||    
T  16425445 cactcctatcccttgagagaagcttgaattacattctccttccctcttatgttcaaatctacactt 16425510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19156139 - 19156007
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19156139 cctctcctcaaagatgtttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattgaaaacatattaaaaaatatttcac 19156040  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||  ||| | | | ||||||||||||| |||||    
T  19156039 tcatctcccttgatagaagcttgaattgcattc 19156007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20755538 - 20755406
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  20755538 cctctcctcaaagatgtttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattgaaaacatattaaaaaatatttcac 20755439  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||  ||| | | | ||||||||||||| |||||    
T  20755438 tcatctcccttgatagaagcttgaattgcattc 20755406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 31872529 - 31872625
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31872529 ctcctctcttattcaaaacattttaaaaaatatttcactcccttccattgagagaagcttgaattacattcatctcccctcttatgttaaaatctac 31872625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 184 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11696883 - 11696781
Alignment:
Q  184 atacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaa 283  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  11696883 atacactcccctcccctcttattcaaaacttattagaaaatatttcactctccccccttaagagaagcttgaattacattcctcacccctcttatgttaa 11696784  T
Q  284 aat 286  Q
    |||    
T  11696783 aat 11696781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23728465 - 23728337
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcct---aagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||  |    
T  23728465 tcttatgttaaaatatacactttcatccccttttattcaaaatatattagaaaaaatttcactcccccctcccctcaagagaagcttgaatcacatttct 23728366  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23728365 ctcccctcttatgttaaaatctacacttt 23728337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30870625 - 30870483
Alignment:
Q  150 ttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagaga 248  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||| |||||| |||||||||  |||| |||||||| |||| || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  30870625 ttgaattacacgctcctcctttcttaggttaaaatatacactcccctcctctcttattcaaaatattttagaaaatatttcacttccctcccctaagaga 30870526  T
Q  249 agcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||||    
T  30870525 agcttgaattacatttccttcccttcttatgttaaaatctaca 30870483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39186897 - 39186796
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcct-aagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacac 292  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||    
T  39186897 ctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaaattcactcacctcccctaaagagaagcttgaattacattcccctcc-cccttatgttaaaatctacac 39186799  T
Q  293 ttt 295  Q
    |||    
T  39186798 ttt 39186796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22712327 - 22712204
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | | | |||||||||||||| ||||  ||||     
T  22712327 ttatgttaaaatatacactaccctcccttcttattcaaaacatattagaaaatatttcactccactcccttgaaagaagcttgaattatattcccctccc 22712228  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| |||||||||||| ||||    
T  22712227 ctcttaagttaaaatctacgcttt 22712204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Original strand, 33869218 - 33869364
Alignment:
Q  147 tgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaag 245  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    ||||||||||  |||   ||||||| || || | ||||    
T  33869218 tgcttgaattacactctcctctcctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttc---aaaacatattcgaaattttttcactaccttcccataag 33869314  T
Q  246 agaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33869315 agaagtttgaatttcattctcatcccctcttatgttaaaatctacacttt 33869364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 291
Target Start/End: Original strand, 35783382 - 35783532
Alignment:
Q  142 aaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctc 240  Q
    |||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||||||  |||| ||| || |||| |||||||||| |   |    
T  35783382 aaagatgcttgaattacacttccctctcctcttatgttaaaatatacactccattcccctcttatgcaaaatataatagaaaatatttcactccacatcc 35783481  T
Q  241 ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    || | |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||    
T  35783482 ctgaaagaagcttgaattacattctccatccctcttatgttaaaatctaca 35783532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 291
Target Start/End: Original strand, 43133352 - 43133470
Alignment:
Q  173 tatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccac 272  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| |||||||  |||| |||||| ||||| |||||||| | | |||||||| || |||||||||||||||||  | |    
T  43133352 tatgttaaaatatacattcttctccactcttatgcaaaatatattagaaaacgtttcactctcatttcctaagaaaaacttgaattacattcttcaactc 43133451  T
Q  273 tcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  43133452 tctaatgttaaaatctaca 43133470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 197
Target Start/End: Original strand, 38790079 - 38790148
Alignment:
Q  129 atcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcc 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38790079 atcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcatctcc 38790148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 295
Target Start/End: Original strand, 19332423 - 19332547
Alignment:
Q  171 cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcc 270  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| | | | ||||||||||||||||||   |||     
T  19332423 cttatgttaaaatatacactttcctcccatcttattcaaaacatattagaaaatatttcacttccctcccttgaaagaagcttgaattacatttccctct 19332522  T
Q  271 actcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||||| |||||||||||| ||||    
T  19332523 cctcttaagttaaaatctactcttt 19332547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12679665 - 12679538
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| | |||| ||||||||||  ||| ||  |    
T  12679665 cctcttatgttaaaatatacaatgctttcccctcttattcaaaacatattagaaaacatttcactttcctcgcataagggaagcttgaaaaacagtcccc 12679566  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  12679565 tccccgcttatcttagaatctacacttt 12679538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40189064 - 40188997
Alignment:
Q  199 ctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40189064 ctcttattcaaaacatattagaaaacatttcactctccacccctaagagaagcttgaatgacattctt 40188997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48872731 - 48872577
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctct 239  Q
    |||||| |||||||||||||| |  || ||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | |  ||||     
T  48872731 tcaaagatgcttgaattacactcctcttcct-tcatgttaaaatatacacacccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattttattatcctcc 48872633  T
Q  240 cctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | | ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||| ||||    
T  48872632 catgagagaagcttgaattacattcatcttccttcttaagttaaaatctacgcttt 48872577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10410777 - 10410683
Alignment:
Q  201 cttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  10410777 cttattcaaaacatattagaaaccatttcactctcctaccctaagagaagtttgaattacattccactcatctcttattttaaaatatacacttt 10410683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13904456 - 13904346
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| ||||||||    |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||  ||||     
T  13904456 ttatgttaaaatatacacttccatccccttttattcaaaacatattagaaaatatttcactctcctccgttgagagaagcttgaattacattcccctccc 13904357  T
Q  272 ctcttatgtta 282  Q
    |||||||||||    
T  13904356 ctcttatgtta 13904346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 291
Target Start/End: Original strand, 20096299 - 20096394
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||  |||| |||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||    
T  20096299 ctcccctcttattcaaaacatattaaaaaaa--ttaactcccctcctctaaaagaagcttgaattatattttcctcccctcttatgttcaaatctaca 20096394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29616241 - 29616116
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattac--attcttctc 269  Q
    |||| ||||| |||| | || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||  |||    
T  29616241 ttatattaaaatatataatcctctcccctcttattcaaatcatattagaaaaactttcactcccctcccctaagagatgcttgagttacatattcacctc 29616142  T
Q  270 cactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | |||| |||||||||||||| ||||    
T  29616141 ccctctcatgttaaaatctactcttt 29616116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8535500 - 8535399
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8535500 tcccctcccgtcaaagatgtttgaattacactcccctccccttttatgttaaaatatatactccactcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 8535401  T
Q  229 ca 230  Q
    ||    
T  8535400 ca 8535399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 19156000 - 19155908
Alignment:
Q  198 cctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |  ||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19156000 cctcttattcaaaacatgttagaaaatatttcacccatctcccttgagataagcttgaattacattcctctcccctcttatgttaaaatctac 19155908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 20755399 - 20755307
Alignment:
Q  198 cctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |  ||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20755399 cctcttattcaaaacatgttagaaaatatttcacccatctcccttgagataagcttgaattacattcctctcccctcttatgttaaaatctac 20755307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38988419 - 38988323
Alignment:
Q  195 tcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||| | | |||||| ||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  38988419 tcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcacttccctcccttgagagaaacttcaattacattttcctccccttttatgttaaaatctaca 38988323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27619706 - 27619631
Alignment:
Q  124 ctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctccc 198  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27619706 ctctcctccccttccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcctctccc 27619631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3341500 - 3341438
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctccc 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3341500 ccctcaaagatgcttgaattacactctcctctcctcttatgttaaaatatacactcatctccc 3341438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 11639904 - 11639966
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11639904 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 11639966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36848567 - 36848501
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  36848567 cactcccctctccttaaagatgcttgaattacactcttctctcctcttatgttaaaatatacacttt 36848501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7192220 - 7192123
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| |||| | |||||||| | | ||| | |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  7192220 ctcccctcttatgcgaaacgtattagaaaataattcactccacacccctgaaagaagcttgaattacattctccacccctcttatgttaaaatctaca 7192123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 22263768 - 22263833
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22263768 cactcccctcctctcaaagatgcttgaattacattcttctcctctcttatgttaaaatatacactt 22263833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31388187 - 31388134
Alignment:
Q  240 cctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  31388187 cctaagagaagcttgaattacattattcttttctcttatgttaaaatctacact 31388134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 4518332 - 4518460
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatatta-aaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    |||||||||| |||| |||||||    ||| |||||||   ||||||||||| ||||| ||| ||||| | |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  4518332 ccctcttatgctaaaatatacacatccctctcctcttaagcaaaacatattagaaaaaaattacactctctttccctaagagaagcttaaattacattct 4518431  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
      ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4518432 catcccctctaatgttaaaatctacactt 4518460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12677770 - 12677706
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  12677770 cctcttatgttaaaatatacaatgctttcccctcttattcaaaacatattagaaaacatttcact 12677706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 169 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34835506 - 34835414
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattaca 261  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   | | |||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34835506 ctcttatgttaaaatatacaatctctttctctctaattcaaaacatattagaaaatatttaacttccctcccctaagagaagcttgaattaca 34835414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Original strand, 38670000 - 38670066
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  38670000 cactcccctctccttaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacacttt 38670066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 318024 - 317963
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  318024 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 317963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2146941 - 2146880
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  2146941 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactccccttccctcttaagttaaaatatacact 2146880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6185399 - 6185338
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  6185399 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 6185338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 6191915 - 6191854
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  6191915 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 6191854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 25606932 - 25606993
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  25606932 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 25606993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 197
Target Start/End: Original strand, 32867252 - 32867320
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcc 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32867252 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatatacactcctctcc 32867320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Original strand, 29736139 - 29736198
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29736139 tcccctcctcttaaagatgcttgaattacactccacttccctcttatgttaaaatataca 29736198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40401615 - 40401556
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40401615 cctcccttcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 40401556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 13067821 - 13067930
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||| | | |||||| ||| ||||||||||  || | |||||| ||||||    
T  13067821 tacactcccctcccctattattcaaaacatattagaaaatatgtcact-ccctcacttgagagaaacttcaattacattccacttccctcttaagttaaa 13067919  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||| ||||    
T  13067920 atctacgcttt 13067930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26013 - 25952
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  26013 tccccttccctcaaagatgtttgaattacactcacctcccctcttaagttaaaatatacact 25952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Original strand, 3391773 - 3391826
Alignment:
Q  240 cctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3391773 cctaagagaagtttgaattacatttcactcccctcttatgttaaaatatacact 3391826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 16425342 - 16425407
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| | | | ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16425342 cactcccctcccatcaaagaagtttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactt 16425407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19156145 - 19156080
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||| |||||||| | ||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19156145 cactctcctctcctcaaagatgtttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaatatacactt 19156080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20261643 - 20261586
Alignment:
Q  135 tcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  20261643 tcccctcaaagatgcttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatatacactc 20261586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20755544 - 20755479
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||| |||||||| | ||| | |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20755544 cactctcctctcctcaaagatgtttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaatatacactt 20755479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 188
Target Start/End: Original strand, 29615526 - 29615583
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29615526 cccttccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatataca 29615583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10412604 - 10412560
Alignment:
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  10412604 gcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactt 10412560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 11639901 - 11639965
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11639901 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 11639965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31221512 - 31221460
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31221512 tcaaagatgcttgaattacactcccctcccttcttatgttaaaatatacactc 31221460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 38670753 - 38670689
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||  |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  38670753 cactcccctctcctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 38670689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 38987762 - 38987822
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  38987762 ccctcctctcaaagatgcttgaattaaactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 38987822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 46208818 - 46208774
Alignment:
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  46208818 gcttgaattacactcatcttctctcttatgttaaaatctacactt 46208774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 111)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 4757009 - 4757171
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  4757009 ctcccctcaaagatgtttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacactcccatcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcact 4757108  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757109 cccctcccctaagagaagcttgaattacattctcctccactcttatgttaaaatctacacttt 4757171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 10887720 - 10887886
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  10887720 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 10887819  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10887820 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 10887886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23309686 - 23309520
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  23309686 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcctctcttaacttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 23309587  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23309586 cacttccctcccctaagagaagcttgaattacattcctctcccctcttatgttaaaatctacacttt 23309520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 49764502 - 49764661
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  49764502 ccctcccctcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacacttctctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttca 49764601  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  49764602 ctcccctcccttgagagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatctac 49764661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 1363395 - 1363558
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||||||| |||| || |||||||| || ||||  |||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  1363395 cctccccttaaagatgtttgaattaaactccactcccctattatgttaaaatatacattctcctcccctcttattcaaagcatattagaaaacatttcac 1363494  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1363495 tcccctcccctaagagaagcttgaattacattcatctccattcttatgttaaaatctacacttt 1363558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 291849 - 291683
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||    
T  291849 tcccctcccctcaaaaatgcttgaattacaccctcctcccctcttatgttcaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatgtattaaaaaatattt 291750  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  291749 cactccactcccctaagagaagcatgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacacttt 291683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 37183088 - 37183254
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  37183088 tcccctcccctcaaagatgtttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 37183187  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37183188 cactcccctgccctaagagaagcttgaataacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 37183254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 41586659 - 41586820
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc---cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||   |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  41586659 ctcccctcaaagatgcttgaattacactaccctctcccctcttatgttaaaatatacactc--ctcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttca 41586756  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41586757 ctcctctc-cttaagagaagcttgaattacattcatctcccctcttatgttaaaatctacacttt 41586820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 4558042 - 4558208
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||     
T  4558042 tcccctccccttaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaattta 4558141  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4558142 cattcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 4558208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14602176 - 14602010
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14602176 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 14602077  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14602076 caccctgctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 14602010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32737233 - 32737075
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   |||||| | ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  32737233 ctcccctcaaagatgcttgaattacactttcctccccttttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcact 32737134  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  32737133 cccctcccctaagagaagcttgaattacatccacctcccctcttatgttaaaatctaca 32737075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 40927503 - 40927669
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||    
T  40927503 tcccctcccctctaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatttattagaaaatattt 40927602  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40927603 cacttccctcccttaagagaagcttgaattacattcctctctcctcttatgttaaaatctacacttt 40927669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 11055839 - 11055967
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  11055839 ccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaatacatattagaaaaaatttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacattccc 11055938  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11055939 ctcccctcttatgttaaaatctacacttt 11055967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 3089763 - 3089926
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  3089763 cctcccctcaaagatacttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcac 3089862  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  3089863 tcccctcccttgagagaagcttgaattacattcacctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 3089926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18365347 - 18365181
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  18365347 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 18365248  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| | | |||||||||||||| ||||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  18365247 cacccccctcccttgagagaagcttgaatcacattcccctcctttcttaagttaaaatctacgcttt 18365181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 22129735 - 22129863
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |      
T  22129735 ccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcacccccctcccctaagagaagcttgaattacatcccc 22129834  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22129835 ctcccctcttatgttaaaatctacacttt 22129863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 1763660 - 1763818
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctctt-atgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| || |||||||||||   ||||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1763660 ccctcaaagatgtttgaattacactttcctccctttttatgttaaaatatacactctcctcccctcttattcaaaacatattaaaaaacattt-actccc 1763758  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1763759 ctcccttaagaaaatcttgaactacattcttctcctctcttgtgttaaaatctacacttt 1763818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16067954 - 16067795
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | | | ||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  16067954 ccctcaaagatgcttgaattacactcccattctctcttatgttaaaatatacactcacatcccttcttattcaaaacatattagaaaatatttcactccc 16067855  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16067854 ctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacacttt 16067795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 22524132 - 22524294
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  22524132 ctcccttcaaagatgcttgaattacactcctctcccctcttaagttaaaagatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaattttcact 22524231  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22524232 cccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 22524294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27256040 - 27255874
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  27256040 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatattaaaatatacacttccctcccctattattcaaaacatattagaaaatattt 27255941  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  27255940 cactcccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctccttttttatgttaaaatctacgcttt 27255874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28248218 - 28248057
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||    |||| | ||||||||||| |||||| |  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  28248218 cctcctctcaaagatgcttgaattacacttcactcctttcttatgttaaaatatacatttttctcccctcttgttcaaaacatattataaaacatttcaa 28248119  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28248118 tcccctcctctaagagaagcatgaattatattcttctcccctcttatgttaaaatctacact 28248057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 48841535 - 48841691
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| | |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48841535 tcaaagatacttgaattacactcctctctcctcttatgttaaattatacactctcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcccctc 48841634  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || | |||||||||||||||||||||  |||  |||||| | |||||||||| ||||    
T  48841635 tcttgagagaagcttgaattacattcccctctcctcttaagctaaaatctacgcttt 48841691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Original strand, 20029953 - 20030079
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||  |    
T  20029953 cctcttatgttaaaatatacactc-tctcccctcttatttaaaatttattagaaaatattttacttccctcccttaagagaagcttgaattacattcacc 20030051  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20030052 tcccctcttatgttaaaatctacacttt 20030079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24543048 - 24542881
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccc-tcttatttaaaacatattaaaaaacatt 227  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||| | |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  24543048 tcccctcccttcaaagatgcttgagttacactcccctcctctcttaagttaaaatgtacactcccctccccctcttattcaaaacatattagaaaaaatt 24542949  T
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24542948 acattcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 24542881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 40974049 - 40974211
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  40974049 cctcccctctaagatgtttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacaatcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttcac 40974148  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  40974149 accc-tcccctaagagaagcttgaattacattcatcttccctcttataataaaatctacacttt 40974211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7725472 - 7725306
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  7725472 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactccccactcctcttatgttaaaatatacacttcactcccctctttttcaaaacatattagaaaatattt 7725373  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | |||||| |||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  7725372 cactcccctcccttgagagaaacttgaattacatttccctcccctcttatgttaaaatttacgcttt 7725306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19547096 - 19546930
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||   | | || ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  19547096 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactattctcctctcttatgttaaaatatacactccctttctcttttattcaaaacatattagaaaatattt 19546997  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19546996 tactcccttctcctagaagaagcttgaattacattctcctcacctcttatgttaaaatctacacttt 19546930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 41865750 - 41865585
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatatta-aaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||  ||| |||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||    
T  41865750 tcccctcccctcaaagatacttgaattacactcccctcccctttaagttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaaaatt 41865651  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41865650 cactcccct-tcctaagagaagcttgaattacacccccctctcctcttatgttaaaatctacacttt 41865585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44951052 - 44950886
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  44951052 tcccctctcctcaaagatgtttgaaatacactcacctcccctcttatgttaaaatatacactttcctcccctcttattcaaaatatattagaaaatattt 44950953  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  44950952 cactcctctcccttgtgagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 44950886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48224199 - 48224037
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  48224199 ctcccttcaaagatgcttgaattacactcccctcccatcttatgttaaaatatacacttccctcccctctttttcaaaacctattagaaaatatttcact 48224100  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | |||| | | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48224099 ctcctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctactcttt 48224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1263125 - 1262964
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  1263125 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactttcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 1263026  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||||  ||| | | | ||||||||||||||||||   |||| |||||| ||||||||||||    
T  1263025 cactcatctcccttgaaagaagcttgaattacatttccctcccctcttaagttaaaatctac 1262964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Original strand, 44499405 - 44499506
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44499405 ctcccctcttattcaaaacatattagaatacttttcactcccctcccttaagagaagcttgaattacattcatctcctctcttatgttaaaatctacact 44499504  T
Q  294 tt 295  Q
    ||    
T  44499505 tt 44499506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 5963105 - 5963233
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||      
T  5963105 ccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaattttttcacacccctcccccaagagaagcttgaattacattccc 5963204  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  5963205 ctcccctcttatgttaatatctacacttt 5963233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 6293254 - 6293382
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| |||| |||||| ||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  6293254 ccctcttatgttaaaatatacactccgctcctctcttattcaaaatatattagaatttttttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacattccc 6293353  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6293354 ctcccctcttatgttaaaatctacacttt 6293382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32255789 - 32255625
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||| |||| |||   |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  32255789 ccctcccctcaaagatgcttgaattacacttccctctcctcttatgttaaaatatatacttccctccactcttattcaaaacatattataaaatatttca 32255690  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||  | ||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||||    
T  32255689 ctcacctcttttgagagaagcttgaattacattcctcaccccacttatgttaaaatctacgcttt 32255625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45307414 - 45307258
Alignment:
Q  139 ctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    ||||||| || || || ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  45307414 ctcaaagatgtttaaactacactctcctccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaagcatattagaaaaaatttcgctcccctc 45307315  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45307314 ccctaagagaagcttgaattatactcccctcccctcttatgttaaaatccacacttt 45307258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Original strand, 11581884 - 11581981
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11581884 ccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttcactcctctcccctaagagaagcttgaattacattc 11581981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54404252 - 54404131
Alignment:
Q  174 atgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccact 273  Q
    |||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||| ||    
T  54404252 atgttaaaatatacattcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcattcccctcccttaagagaagcttgaattacactcccctcccct 54404153  T
Q  274 cttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  54404152 cttatgttaaaatctacacttt 54404131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13625971 - 13625836
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  13625971 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccatcttatgttaaaatataccctcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 13625872  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    | |||||||| |   |||||| ||||||||||||||    
T  13625871 ctctcccctccctcgagagaaacttgaattacattc 13625836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 49080672 - 49080509
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||    
T  49080672 cctcctctcaaagatgcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttgttcaaaacatattagaaaatatttcac 49080573  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| || | | ||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  49080572 tcccgtcccttgagagaagcttcgattacattcatctcccctcttaagtcaaaatctacgcttt 49080509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54606487 - 54606324
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||||||| |||  || ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||  ||    ||||||    
T  54606487 cctcccctaaaaaatgtttgaattacactcccctctcctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacttatttgaatttttttcac 54606388  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54606387 tcccctcccctaagataagcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 54606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 11344701 - 11344867
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  11344701 tcccctcccgtcaaagatacttgaattacactcccctcccctcttatgctaaaatatacaccctcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 11344800  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| | | ||||||||||||||||||||   || | |||||| |||||||||||| ||||    
T  11344801 cacccccctcccttgagagaagcttgaattacattacccttccctcttaagttaaaatctacgcttt 11344867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27395137 - 27394975
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| || |  |||||||    
T  27395137 ctcccttcaaagatgcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatatacactccactccccacttattcaaaacatattagaatatttttcact 27395038  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||  |  | |||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27395037 ccatttccttaagagaagcttgaattacattcccctcccttcttatgttaaaatctacacttt 27394975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 47793997 - 47794159
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| ||||||||    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  47793997 ctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcacctcttatcttaaaatatacactttcttcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcact 47794096  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| | | ||||||| |||| ||||||||  |||   |||||||||||||||||| ||||    
T  47794097 cccctcccttgagagaagtttgagttacattcccctctcatcttatgttaaaatctacgcttt 47794159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 295
Target Start/End: Original strand, 32221618 - 32221779
Alignment:
Q  135 tcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| | ||| |||| |  ||||||| |||||||||   |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  32221618 tccccccaaagatgcttgaattgcactccccttccctttcttgttaaaatatacactcccatcccctcttattcaaaatatattagaaaacatttcactc 32221717  T
Q  234 ccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||| | ||||||| | |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32221718 ctctcccttaagagacgattgaattacattctcctcccctctaatgttaaaatctacacttt 32221779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11389055 - 11388973
Alignment:
Q  213 atattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11389055 atattagaaaacttttcactcccatcccctaagagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatctacacttt 11388973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 291
Target Start/End: Original strand, 30604725 - 30604847
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||| |||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  30604725 ctcttatgttaaaatatacactcccatcccttcttcttcaaaacatattaaaaaatatttcattcccctcccctaagagaagctagaattacattcccct 30604824  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    || |||| |||||||| ||||||    
T  30604825 cccctctaatgttaaattctaca 30604847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 53490059 - 53490224
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacc-cacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||   ||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||| | |||| |||| |||| ||||    
T  53490059 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacacttcattcccctcttatgttaaaatatacacccc-cttccctcttattcacaacagattagaaaatattt 53490157  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | |||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53490158 cactcccctcccttgagagaagcttcaattacattctcttcctctcttaagttaaaatctacacttt 53490224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5984949 - 5984839
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  5984949 tacactcccctcccctattattcaaaacatattagaaaatatttcattcccctcccttgagagaagcttgaattacattcctctcccctcttaagttaaa 5984850  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||| ||||    
T  5984849 atctacgcttt 5984839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Original strand, 10592761 - 10592910
Alignment:
Q  147 tgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccc-tcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaa 244  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    ||    
T  10592761 tgcttgaattacacccccctcacctcttatgttaaaatatacactcacctccccttcaaattcaaaacatattagaaaaaatttcactcccctccttcaa 10592860  T
Q  245 gagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||||||||  |||| |||| || ||||||| |||||||||||||    
T  10592861 gagaagtttgaattattttctcctccccttttatgtt-aaatctacacttt 10592910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2756662 - 2756539
Alignment:
Q  141 caaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctct 239  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  || || ||||||| ||||||||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  2756662 caaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactccccttccatcttattcaaaacatattagaaaaggtttcacccccttct 2756563  T
Q  240 cctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  2756562 -ctaagagaagcttgaattacattc 2756539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 10689491 - 10689367
Alignment:
Q  166 tccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||| | | |||||||||||||||||| ||     
T  10689491 tccctcctatgttaaaatatacattctcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattacattcccctcccttgagagaagcttgaattacaatcc 10689392  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
     |||| |||||| ||||||||||||    
T  10689391 cctcctctcttaagttaaaatctac 10689367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45241866 - 45241744
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| |||| | ||  || |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  45241866 ttatgttaaaatatataatctccttccctcttattcaaaacatattagaaaactttacactctt-tctcctaagagaagcttgaattacattcccctccc 45241768  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  45241767 ctcttatgttaaaatctgcacttt 45241744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30128264 - 30128166
Alignment:
Q  197 ccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30128264 ccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcacttctctcccttgagagaagcttgaattacattccactcccctcttatgttaaaatctacgcttt 30128166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25481264 - 25481102
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc---cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacat 226  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||   |||||||||||||| ||||||||   ||||||  || ||  |||||||||| |||| ||    
T  25481264 tcccctcgcctcaaagatgcttgaattacactaccctctctcctcttatgttaaaatatacacttccctccccattttttcgaaacatattagaaaatat 25481165  T
Q  227 ttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  25481164 ttcactctcctcccttgagagaagcttgaattacattcccct-ctctcttatgttaaaatctac 25481102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Original strand, 18480144 - 18480268
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||       
T  18480144 ccctcttatgttaaaataaacattcccctcccctcttattcaaaacttattagaaaacattttactctcctccactaggagaagcttcaattacatttcg 18480243  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  18480244 cttccctcttatgttaaaatctaca 18480268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54876983 - 54876827
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| | |||||||||||| | |||||| || ||||||||| | |||||||  ||| ||| |||   ||||||||||| |||   || ||| ||||||    
T  54876983 tcaaagattcttgaattacactcccctcccctcctatgttaaaatttacactctcctctccttttaggcaaaacatattataaatttttgcacccccctc 54876884  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  54876883 acctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaggttaaaatctacacttt 54876827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 232 - 295
Target Start/End: Original strand, 11581980 - 11582043
Alignment:
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11581980 tcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcctctcttatgttaaaatctacacttt 11582043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14601050 - 14600928
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctc 269  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||  |||    
T  14601050 tcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacattttaaaaaatatttcactcccctcctttgagagaagtttgaattacattcacctc 14600951  T
Q  270 cactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |   | ||||||||||||||| ||||    
T  14600950 c---cctatgttaaaatctactcttt 14600928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Original strand, 27638528 - 27638651
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| |||| | ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||  ||||     
T  27638528 ttatgttaaaatatatattcccctcctctcttattgaaaacatattagaaaatatttcactcccctcctttgagagaagtttgaattacattcccctccc 27638627  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| |||||||||||| ||||    
T  27638628 ctcttaagttaaaatctacgcttt 27638651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Original strand, 34667960 - 34668079
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| ||||||||    ||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||  | ||     
T  34667960 ttatgttaaaatatacactgtcatcctctcttatgcaaaacatattagaaaatatttcactccccacccctgaaagaagcttgaattacattccccaccc 34668059  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34668060 ctcttatgttaaaatctaca 34668079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Original strand, 27392979 - 27393072
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27392979 tcttatgtttaaatatacactcccctcccctcttattcaaaaca-attagaaaatttttcactccccttccctaagagaagcttgaattacattc 27393072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33115291 - 33115165
Alignment:
Q  139 ctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccct 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||||||||  ||    
T  33115291 ctcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacacttttctccacttttattcaaaacattttaaaaaatatttcactctact 33115192  T
Q  238 ctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    | | | |||| ||||||||||||||||    
T  33115191 cccttgagagtagcttgaattacattc 33115165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 289
Target Start/End: Original strand, 22517043 - 22517132
Alignment:
Q  200 tcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  22517043 tcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcccctcccttaagagaagtttgaattgcattcccctctcctcttatgttaaaatcta 22517132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 295
Target Start/End: Original strand, 40035788 - 40035915
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctc 269  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |     | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40035788 tcttatgttaaaatatatactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaactt-----taccctcccctaagagaagcttgaattacattcctctc 40035882  T
Q  270 c-------actcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |       | |||||||||||||||||||||||    
T  40035883 ccttcttaattcttatgttaaaatctacacttt 40035915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Original strand, 27255295 - 27255364
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctccc 198  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27255295 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactcatctccc 27255364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 1262407 - 1262469
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1262407 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 1262469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11345425 - 11345363
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11345425 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 11345363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 18364640 - 18364702
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18364640 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 18364702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33979274 - 33979181
Alignment:
Q  202 ttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||  | | ||||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33979274 ttattcaaaacatattagaaaatatttcactctccttccttgagagaagtttgatttacatttatctccattcttatgttaaaatctacgcttt 33979181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 191
Target Start/End: Original strand, 45241212 - 45241273
Alignment:
Q  131 cccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  45241212 cccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcctctcttatgttaaaatatacactc 45241273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 291
Target Start/End: Original strand, 45851768 - 45851854
Alignment:
Q  208 aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctc---ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||  |||||   |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  45851768 aaaacatattagaaaaaattacactcgtctctctctctaagagaagcttgaattacattcatcttttctcttatgttaaaatctaca 45851854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 190
Target Start/End: Original strand, 14600381 - 14600448
Alignment:
Q  124 ctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  14600381 ctctcctcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctccccacttatgttaaaatatacact 14600448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19538391 - 19538296
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||  |||  |||| |||||||||||||||    
T  19538391 tcttatgttaaaatatacacttccctccactcttattcaaaacatattagaaaacattttactctcttccactagaagaaacttgaattacattct 19538296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27397578 - 27397448
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||  |||   ||| |    
T  27397578 ccctcctcccaaagatgcttgaattac---cacctaccctcttatgttaaaatatacattcccctcccctcttattcaaaacatatttgaaattttttta 27397482  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
      ||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  27397481 tgcccttcccctaaaagaagcttgaattacattc 27397448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 264
Target Start/End: Original strand, 32373346 - 32373441
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||||||||||||| |||||| |   ||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||   | |||||| ||||||||||||||    
T  32373346 ctcttatgttaaaatatacattttcctctcctcttattcaaaacatattagaaaatatatcactcccctccattgagagaaacttgaattacattc 32373441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3090484 - 3090422
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3090484 tcccctcccctcaaagatgcttgaattgcactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 3090422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25259984 - 25259839
Alignment:
Q  150 ttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagaga 248  Q
    ||||||||||| | ||||| || |||||||||| |||| |  | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | | |   |    
T  25259984 ttgaattacactcccctcctcttttatgttaaaatatatatccctcttccctcttattcaaaacatattagaaaacatttcacttccctc-catgaataa 25259886  T
Q  249 agcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||||||||| | ||   |||||||||||||| ||||||||    
T  25259885 agcgtgaattacattcctgtctcttcttatgttaaaatttacacttt 25259839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Original strand, 27394262 - 27394320
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||    
T  27394262 tcccctcccctcaaagatgcatgaattacaccccctcccctcttatgttaaaatataca 27394320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22130463 - 22130402
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  22130463 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 22130402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 48223567 - 48223632
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| | | ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  48223567 cactcccctcgcctaagagatgcttgaattacactttcctcccttcttatgttaaaatatacactt 48223632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Original strand, 54403573 - 54403630
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  54403573 ctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 54403630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11414546 - 11414486
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||    
T  11414546 tcccatcccctcaaagatgcttgaattacactcccctccctcttaagttgaaatatacact 11414486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20612175 - 20612099
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttat 205  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||    
T  20612175 tcccctcccctctaagatgcttgaattacacttcccttccctcttatgttaaaatatacaatcccctcccctcttat 20612099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 27517182 - 27517238
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaa 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27517182 ccctcttaagttaaattatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaa 27517238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 48842088 - 48842028
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48842088 tcccctccccttaaagatgattgaattacactcccctcccttttatgttaaaatatacact 48842028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 8449162 - 8449270
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||| || |||| ||||| ||||| |||   |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||  |||| |||  ||||||||    
T  8449162 tacactcccctcccttcctattcaaaacttattagaaattttttcactcccctcctttaagagaaacttgaattacattcccctcccctc--atgttaaa 8449259  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||||||||    
T  8449260 atctacacttt 8449270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 291
Target Start/End: Original strand, 17057881 - 17057964
Alignment:
Q  208 aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||  | ||| ||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||    
T  17057881 aaaacatattagaaaatatttcactccccaccccagaaagacgcttgaattacattccttacccctcttatattaaaatctaca 17057964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22518643 - 22518584
Alignment:
Q  235 cctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22518643 cctcttctaagagaatcttgaattacacttctctcccctcttatgttaaaatatacactt 22518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 291
Target Start/End: Original strand, 10688795 - 10688857
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10688795 cactcccctcccctcaaagatgcttgacttacattcctctcccctcttatgttaaaatataca 10688857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Original strand, 17764446 - 17764508
Alignment:
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  17764446 tcactcccctcccttgagagaagcttcaattacattcctctcccctctgaagttaaaatctac 17764508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 290
Target Start/End: Original strand, 19065766 - 19065828
Alignment:
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||    
T  19065766 tcactcccctcccttgagagaagcttcaattacattcctctcccctctgaagttaaaatctac 19065828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20612107 - 20612049
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaaca 225  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20612107 ccctcttatgttaaaatatataatcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaca 20612049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 27396710 - 27396764
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  27396710 ccctcaaagatgcttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaatatacact 27396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44500102 - 44500048
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  44500102 ccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 44500048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4558805 - 4558744
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  4558805 tcccctcccctcaaagatgcttgaattatactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 4558744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10888470 - 10888409
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  10888470 tcccctcccctcaaagatgcttaaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 10888409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11056626 - 11056565
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  11056626 tcccctccccttaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 11056565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 293
Target Start/End: Original strand, 11397605 - 11397658
Alignment:
Q  240 cctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11397605 cctaagagaagcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacact 11397658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Original strand, 13623189 - 13623246
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13623189 ctcccctcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacact 13623246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 23308946 - 23309007
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  23308946 tcccctccccttaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 23309007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 30605412 - 30605351
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30605412 tccccttccctcaaagatgtttgaattacactcccctccactcttatgttaaaatatacact 30605351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Original strand, 33314198 - 33314243
Alignment:
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  33314198 gcttgatttacattcatctcccctcttatcttaaaatctacacttt 33314243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 809712 - 809776
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  809712 cactcctctcccctaaaagaaccttgaattacatttatctcctctcttaagttaaaatatacact 809776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 1262404 - 1262468
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1262404 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 1262468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 11581843 - 11581907
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||| ||||||||| | ||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11581843 cacttccctctccttaaagatgtttgaattacatttctctcccctcttatgttaaaatatacact 11581907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 18364637 - 18364701
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18364637 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 18364701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18365350 - 18365286
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18365350 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 18365286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19556620 - 19556548
Alignment:
Q  223 acatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| |||||||||| ||| | |||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||| ||||||||    
T  19556620 acattacactcccctcccctcaaagatacttgaattacattcctcttcccttttatgttaaaatatacacttt 19556548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 27255292 - 27255356
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| | | | ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27255292 cactcccctcccttcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacact 27255356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41587383 - 41587315
Alignment:
Q  124 ctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  41587383 ctctcctcccctcctctcaaagatacttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactc 41587315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19713 - 19547
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  19713 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 19614  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19613 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatctccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 19547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12026264 - 12026098
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||    
T  12026264 tcccctcctctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagagaaaattt 12026165  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12026164 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 12026098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 14873025 - 14873191
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14873025 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacattcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 14873124  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14873125 cacccccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 14873191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25577268 - 25577102
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| | | |||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  25577268 tcccctcccctcaaagaagcttgaattacactcccatcccctcttaagttaaaatatacactcacctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 25577169  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25577168 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 25577102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7127724 - 7127558
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  7127724 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctccccttttaagttaaaatgtacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 7127625  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7127624 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 7127558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 11522807 - 11522972
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  11522807 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaaaattt 11522906  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11522907 cacccccctctcctaagagaagcttgaattaca-tcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 11522972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12033184 - 12033018
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||    
T  12033184 tcccctccgctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagagaaaattt 12033085  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12033084 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 12033018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 25527737 - 25527903
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  25527737 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaatttt 25527836  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25527837 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatctccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 25527903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 107 - 295
Target Start/End: Original strand, 9240848 - 9241032
Alignment:
Q  107 gagtaaattacactcccctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttat 205  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  9240848 gagtaaattacactcccctc-----ccctcccctcaaagatgtttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacacttccctcccctcttat 9240942  T
Q  206 ttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9240943 tcaaagcatattagaaaaaatttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 9241032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 188500 - 188334
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  188500 tcccctccctttaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctctcctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 188401  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  188400 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 188334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 291
Target Start/End: Original strand, 6936402 - 6936544
Alignment:
Q  150 ttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagaga 248  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6936402 ttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactctcatcccctattatttaaaacatattagaaaacttatcactcccctctcctaagaga 6936501  T
Q  249 agcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6936502 agcttgaattacattcttctcccctcttatgttaaaatttaca 6936544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3767810 - 3767647
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||    
T  3767810 cctcccctcaaagatgtttgaattacactcatctcccctcttaagttaaaatatacactcctctcccctcttattcaaaatatatttgaaaaaatttcac 3767711  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3767710 tcccctcctctaagagaaacttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 3767647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 295
Target Start/End: Original strand, 32113757 - 32113912
Alignment:
Q  141 caaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctct 239  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||||||||||     
T  32113757 caaatttgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatatgttagaaaacttttcactcccctcc 32113856  T
Q  240 cctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32113857 cctaagagaagcttgaattactttcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 32113912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 33950233 - 33950399
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  33950233 tcccctcccctcaaagatgcttgaatcacactctcctcccctcttattttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 33950332  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||||||| ||||    
T  33950333 cactcccctcccttgagagaagcttgaattacattccccttccctcttaagttaaaatctacgcttt 33950399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 4100524 - 4100693
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattataca-----ctcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaaca 225  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||     |||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  4100524 ccctcctctcaaagatgcttaaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcccctcttattcaaaacatgttagaaaact 4100623  T
Q  226 tttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4100624 tttcactcccctcccttaagagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatctacacttt 4100693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 4125886 - 4126055
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattataca-----ctcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaaca 225  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||     |||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  4125886 ccctcctctcaaagatgcttaaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcccctcttattcaaaacatgttagaaaact 4125985  T
Q  226 tttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4125986 tttcactcccctcccttaagagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatctacacttt 4126055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34280710 - 34280582
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |      
T  34280710 ccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacatcccc 34280611  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34280610 ctcccctcttacgttaaaatctacacttt 34280582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 291
Target Start/End: Original strand, 5442998 - 5443180
Alignment:
Q  105 ttgagtaaattacactcccctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctctt 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||     |||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||    
T  5442998 ttgagtaaatttcactcccctc-----ccctcccctcaaagatacttgaattacacttccctcccttcttaagttaaaatatacactcccctcccctctt 5443092  T
Q  204 atttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  5443093 attcaaaacatattagaaaaaatttctcccccctcccctaagagaagtttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctaca 5443180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17312148 - 17311999
Alignment:
Q  147 tgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaag 245  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  17312148 tgcttgaattacactcccctccactcttatgttaaaatataaactcttatcccctcttattcaaaacatattagaaaacattttactcctctcccctaag 17312049  T
Q  246 agaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| |||||||| |  |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  17312048 agaagctttaattacatccccctcccctcttatgtaaaaatctacacttt 17311999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 30462145 - 30462017
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||      
T  30462145 ccctcttatattaaaatatacactctcatcccctcttattcaaagcatattagaaaacttttcactcccctctcctaagagaagtttgaattactttccc 30462046  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30462045 ctcccctcttatgttaaaatctacacttt 30462017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 31881850 - 31882013
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31881850 ccctcccttcaaagatgcttgaattacactcccctccccttttatgttaaaatatacactcccctctcctcttattcaaaacatattagaaaacatttca 31881949  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     || |||| | |||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31881950 atctcctc-cttaagagaagtatgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 31882013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 21801953 - 21802112
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21801953 ccctcaaagatgcttgaattacactcccctccattcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactccc 21802052  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | | |||||||||| ||||||| ||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  21802053 ctcccttgagagaagcttaaattacaatcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 21802112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 32003929 - 32003764
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaat---tacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  32003929 cctcccctcaaagatgcttgaataattacaccccctcccctcttatgttaaaatatacactctcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttc 32003830  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||||| | | ||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  32003829 attcccctcccttgagagaagcttgaattacatttccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 32003764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2523404 - 2523238
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||   ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  2523404 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactgacctcccttcttatgttaaaatatatacttccctcccctcttactcaaaacatattagaaaatattt 2523305  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| ||||   | |||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  2523304 cactcacctcctttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttgtgttaaaatctacgcttt 2523238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 288
Target Start/End: Original strand, 12693853 - 12694012
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    ||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  12693853 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacacttctctctcctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 12693952  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatct 288  Q
    ||||||| || | | |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  12693953 cactcccttcccttgagagaagcttaacttacattcccctcccctcttaagttaaaatct 12694012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 34709291 - 34709400
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  34709291 tacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaa-atttcacccccctcccctaagagaagcttgaattacatccctctcccctcttatgttaaa 34709389  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||||||||    
T  34709390 atctacacttt 34709400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 34794577 - 34794423
Alignment:
Q  142 aaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctc 240  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||   ||||| |||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||| |    
T  34794577 aaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactttcctcccatctttttcaaaacatattagaaaatacttcactcccctccc 34794478  T
Q  241 ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     | |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34794477 ttgagagaaacttgaattacattcatctcccctcttatgttaaaatctactcttt 34794423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16326117 - 16325980
Alignment:
Q  150 ttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagaga 248  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |   |||||    
T  16326117 ttgaattacactcacctcccctcttatattaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaccatattagaaaatatttcactcccctccctcgagaga 16326018  T
Q  249 agcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaat 286  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  16326017 agcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaat 16325980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 16349515 - 16349378
Alignment:
Q  150 ttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagaga 248  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |   |||||    
T  16349515 ttgaattacactcacctcccctcttatattaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaccatattagaaaatatttcactcccctccctcgagaga 16349416  T
Q  249 agcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaat 286  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  16349415 agcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaat 16349378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 151 - 289
Target Start/End: Original strand, 2091716 - 2091855
Alignment:
Q  151 tgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaa 249  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||    
T  2091716 tgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacacttaccttccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactctcctcccttgagagaa 2091815  T
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||    
T  2091816 gcttgaattacatttccctcccctcttaagttaaaatcta 2091855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Original strand, 10702282 - 10702405
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| |  ||||  |||||||    
T  10702282 ctcccctcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacataattgaaaatttttcact 10702381  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaa 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  10702382 cccctcccctaagagaagcttgaa 10702405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 284
Target Start/End: Original strand, 32130964 - 32131099
Alignment:
Q  150 ttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacata-ttaaaaaacatttcactcccctctcctaagaga 248  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  32130964 ttgaattacactcccctccctcttatgttaaaatatacacttcccttccctcttattcgaaatataattagaaaaaatttcactcccctcccctaagaga 32131063  T
Q  249 agcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||||||||||   |||| |||||||||||||    
T  32131064 agcttgaattacatttccctcccctcttatgttaaa 32131099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7448957 - 7448796
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  7448957 tcccctcccctcaaaaatgcttgaattacactcctttcccctcttatgttaaaatataca-----ctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 7448863  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||  || | |||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7448862 caatcctttcccttaagagaagcatgaattacattaacctcccctcttatgttaaaatctacacttt 7448796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2655633 - 2655485
Alignment:
Q  147 tgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaag 245  Q
    ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||  | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  2655633 tgcttgaattacacttccctcctctcttatgttaaaatatatactcctctcctattttattcaaaacatattacaaaaaatttcactcccctcccctaag 2655534  T
Q  246 agaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| ||||||||||||   |||  || |||||||||||||||||||||    
T  2655533 agaagtttgaattacatttccctctcct-ttatgttaaaatctacacttt 2655485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 32522567 - 32522411
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||||| | |||| || ||||||||||| || |||  ||||||||||||| ||||||||   || |||||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  32522567 cctccctttaaagatgtttgaattacactcatctcatctcttatgttaaaatatacacttcccttccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcac 32522468  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    ||||||| | | | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  32522467 tcccctcccttgaaagaagcttgaattacatt-atctcctctcttatgttaaaatcta 32522411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 291
Target Start/End: Original strand, 12026283 - 12026390
Alignment:
Q  183 tatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgtta 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||| | | | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12026283 tatacactc-tctcccctcttatgcaaaatatattagaaaatatttcactccccacccgtgaaagaagcttgaattacatttttcaccactcttatgtta 12026381  T
Q  283 aaatctaca 291  Q
    |||||||||    
T  12026382 aaatctaca 12026390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 291
Target Start/End: Original strand, 12033203 - 12033310
Alignment:
Q  183 tatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgtta 282  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||| |||||||||||| | | | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12033203 tatacactc-tctcccctcttatgcaaaatatattagaaaatatttcactccccacccgtgaaagaagcttgaattacatttttcaccactcttatgtta 12033301  T
Q  283 aaatctaca 291  Q
    |||||||||    
T  12033302 aaatctaca 12033310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 22022017 - 22022145
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||||||||||| || ||||||||   |||| ||||| || ||||||||||| |||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||       
T  22022017 ccctcttatgtttaaatatacactttcctcctctctttttcaaaacatattagaaattttttcactctcctcccctaagagaagcttgaattacattacc 22022116  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22022117 ctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 22022145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Original strand, 31281663 - 31281787
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctc-ccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcc 270  Q
    |||||||||| |||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||  |||    
T  31281663 ttatgttaaaatatacatttttctctccctcttattcaaaacatattagaaaacttttcaatttcctcccccaagagaagcttgaattacattctcatcc 31281762  T
Q  271 actcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  31281763 cctcttatgataaaatctacacttt 31281787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11794834 - 11794668
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| | |||| || ||||||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||||  || |||||||||  |||||||||||  ||| ||||    
T  11794834 tcccctccctttaaagatggttgaattacactcccatcccctcttatgttaaaatttacactccccttccctcttatacaaaacatattaggaaatattt 11794735  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || | ||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  11794734 cattgccctcccgtaatagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagtcaaaatctacacttt 11794668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14313916 - 14313758
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||     
T  14313916 tcccatcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacaatcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatta 14313817  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || | |||||         |||||||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14313816 catttccctc--------caagcttgaattacattcccatcccctcttaagttaaaatctacacttt 14313758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33276458 - 33276310
Alignment:
Q  147 tgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaag 245  Q
    |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||  |||||||   |||  ||||| || |||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||    
T  33276458 tgcttgaattacactcatctctccttttatgttaaaacatacacttccctcatctctttttcaaaacatattgaaaat-atttcactcccctcccttaag 33276360  T
Q  246 agaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33276359 agaagcttaaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 33276310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28494915 - 28494825
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacac-tcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaatta 259  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  28494915 ctcttatgttaaaatatacacatca-ctcccctcttattaaaaatatattagaaaacatttcactcctctcccttaagagaagcttgaatta 28494825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29807324 - 29807234
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacac-tcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaatta 259  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  29807324 ctcttatgttaaaatatacacatca-ctcccctcttattaaaaatatattagaaaacatttcactcctctcccttaagagaagcttgaatta 29807234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 295
Target Start/End: Original strand, 12767047 - 12767109
Alignment:
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12767047 cccctcccctaagagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatttacacttt 12767109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12767676 - 12767611
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12767676 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactt 12767611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22022424 - 22022355
Alignment:
Q  220 aaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22022424 aaaacatttcactaccctcccttaagagaagcttgaattacattcctctcccctcttatattaaaatcta 22022355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 291
Target Start/End: Original strand, 28712932 - 28713075
Alignment:
Q  149 cttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagag 247  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| || ||||  ||||||||||| | | | | ||    
T  28712932 cttgaattacactcacctcccctcttatctaaaagtatacactcatctcctctcttatgcaaaacata-tagaaaatgtttcactccccacccttgaaag 28713030  T
Q  248 aagcttgaattacatt-cttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||    
T  28713031 aagcttgaattacattcctccgcctcttttatgttaaaatctaca 28713075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 17336900 - 17336998
Alignment:
Q  197 ccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||  |||||  ||| || || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17336900 ccctcttattcaaaatatattataaaatattttacctccctcctctaggaaaaacttgaattacattcttctctcctcttatgttaaaatctacacttt 17336998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 34250072 - 34250232
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||      
T  34250072 ccctccccttaaagatgtttgaattacactcatctcccctattatgttaaaatatacacccc-ctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttat 34250170  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||   | | |||||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||| ||| ||||    
T  34250171 ctcccc---cttgagagaagcttgaattacattccccttccctcttaagttaaaatatacgcttt 34250232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 238
Target Start/End: Original strand, 26391407 - 26391512
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||| | |||||| |  |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  26391407 ctccgctcagagatgcttgaattacactcatctcctctcttatgttagaatatacatttttctcccttcttattcaaaatatattaaaaaatatttcact 26391506  T
Q  233 cccctc 238  Q
    ||||||    
T  26391507 cccctc 26391512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5916684 - 5916633
Alignment:
Q  244 agagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  5916684 agagaagcttgaattacattctcctcccctctgatgttaaaatctacacttt 5916633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 284
Target Start/End: Original strand, 24619919 - 24620070
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||    |||||  ||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||| |||| || |||||    
T  24619919 ctccccttaaagatgcttgaattacactagtctccccacttatgttaaaatatacacttccctcccctctgattcaaaacgtattagaaaatatatcact 24620018  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    | |||| | |   ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24620019 ctcctcccttggtagaagtttgaattacattctcctcccctcttatgttaaa 24620070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Original strand, 187780 - 187838
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacc-tccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  187780 cctcccctcaaagatgcttgaattacactcaccttccctcttaagttaaaatatacact 187838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5443757 - 5443696
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  5443757 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactccccttccctcttaagttaaaatatacact 5443696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9241606 - 9241545
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  9241606 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 9241545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11523544 - 11523483
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  11523544 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 11523483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 12025524 - 12025585
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  12025524 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactccccttccctcttaagttaaaatatacact 12025585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 14306796 - 14306861
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| | | | ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14306796 cactcccctcccttcaaagatgcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatatacactt 14306861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 14313196 - 14313261
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||    
T  14313196 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcctctccccttttatgttaaaatatacactt 14313261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Original strand, 22268532 - 22268581
Alignment:
Q  246 agaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22268532 agaagcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatttacacttt 22268581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34709984 - 34709923
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  34709984 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 34709923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 12409417 - 12409481
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  12409417 cactcccctcccctaagagaagcttgaatcacactcccctcccctcctatgttaaaatatacact 12409481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Original strand, 12766957 - 12767029
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctctta 204  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12766957 cctccccttaaagatgcttgaattacactcccctcccctcctatgttaaaatatacactctcctcccctctta 12767029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 256
Target Start/End: Original strand, 14223914 - 14223969
Alignment:
Q  200 tcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaa 256  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14223914 tcttatctaaaacatattagaaaacttttcactctcct-tcctaagagaagcttgaa 14223969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25528483 - 25528423
Alignment:
Q  131 cccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  25528483 cccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcctctcttaagttaaaatatacact 25528423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 17307213 - 17307275
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||    
T  17307213 tcccctcccctcaaagatgtttaaattacactcctcttccctcttatgttaaaatatacactc 17307275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 14306799 - 14306860
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14306799 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatatacact 14306860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14873764 - 14873703
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  14873764 tcccatcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 14873703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21847427 - 21847374
Alignment:
Q  241 ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  21847427 ctaagaaaagcttgaattagactctcctcccctcttatgttaaaatatacactt 21847374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 22342105 - 22342166
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  22342105 tcccctcccctcaaatatgcttgaattacactcatatcccctcttatgttaaaatatacact 22342166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11722038 - 11722002
Alignment:
Q  197 ccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11722038 ccctcttattcaaaacatattagaaaacatttcactc 11722002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21802662 - 21802610
Alignment:
Q  241 ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21802662 ctaaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacact 21802610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22022344 - 22022280
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22022344 cactcccctgccctcagagatgcttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatatacact 22022280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 25527734 - 25527798
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  25527734 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacact 25527798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34250757 - 34250713
Alignment:
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  34250757 gcttgaattacactcttctcccctcttatgctaaaatatacactt 34250713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 169
Target Start/End: Original strand, 34709264 - 34709304
Alignment:
Q  129 atcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc 169  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  34709264 atcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctccc 34709304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 125)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8193057 - 8192891
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8193057 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 8192958  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8192957 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatctccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 8192891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 107 - 295
Target Start/End: Original strand, 13395179 - 13395363
Alignment:
Q  107 gagtaaattacactcccctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttat 205  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  13395179 gagtaaattacactcccctc-----ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacacttccctcccctcttat 13395273  T
Q  206 ttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13395274 tcaaaacatattagaaaaaatttcacccccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 13395363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 46095414 - 46095581
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  46095414 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 46095513  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacatt-cttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46095514 cacccccctcccctaagagaagcttgaattacattccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 46095581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7166145 - 7165979
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||    
T  7166145 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacacttccctcctctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatatcagaaaaaattt 7166046  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7166045 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatttccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 7165979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 10155511 - 10155677
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctctt-atgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||| || | |||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  10155511 tcccctcccctcaaagatgtttgaattacactctcctccctttttaagttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 10155610  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10155611 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 10155677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19314078 - 19313914
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  19314078 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccgtcttatgttaaaatatacactcctctcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttca 19313979  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19313978 cgtccctcccctaagagaagtttgaattacattcacatccccccttatgttaaaatctacacttt 19313914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6233170 - 6233004
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  6233170 tcccctcccctcaaagatacttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 6233071  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc-tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6233070 cactcccctcccctaagagaagcttgaattaca-tctccatcccctcttatgttaaaatctacacttt 6233004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 37423154 - 37423317
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| ||| || |   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  37423154 cctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctccattcttatgttaaaatatgcagtttcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcac 37423253  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  37423254 tcccctctcctgagagaagcttgaattacattcctctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 37423317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 616194 - 616033
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  616194 ctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcctctcttaagttaaaatatacactctcatcccctcttattcaaaacatattaaaaaaaatt-cact 616096  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  616095 cccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 616033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 796391 - 796557
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  796391 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaagatattagaaaaaattt 796490  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  796491 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatctccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 796557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33047296 - 33047130
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  33047296 tcccctccccttaaagttgtttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccttcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 33047197  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33047196 cactcccctcccctaagagatgcttgaattatattcccctcccctctcatgttaaaatctacacttt 33047130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47030549 - 47030383
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  47030549 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 47030450  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  47030449 cacccccctcccctaagagaagcttgaattacatctccctcccctcttatgtcaaaatctacacttt 47030383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 23308813 - 23308972
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23308813 ccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactttcctcccctcttattcaaaacatattagaaataatttcactccc 23308912  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23308913 ctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 23308972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4950662 - 4950496
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  4950662 tcccctcccctcaaagatgcttgaatcacactcccctctcttcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 4950563  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  4950562 cactcccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 4950496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 16960213 - 16960379
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  16960213 tcccctctcttcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaactttt 16960312  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16960313 cacttccctcccctaagagaagcttaaattacatttctcttccctcttatgttaaaatctacacttt 16960379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Original strand, 37708791 - 37708949
Alignment:
Q  138 cctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccc 236  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  37708791 cctcaaagatgcttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacataatagaaaacttttcactcccc 37708890  T
Q  237 tctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  37708891 tcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttgtgttaaaatctacccttt 37708949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 37423795 - 37423954
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37423795 ccctcaaagatgcttaaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactccccacccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactccc 37423894  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  37423895 ctcccttgagagaagcttgaattacattctcctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 37423954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Original strand, 50824644 - 50824802
Alignment:
Q  138 cctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccc 236  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  50824644 cctcaaagatgcttgaattacactccacttctctcttatgttaaaatatacactctcatcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcccc 50824743  T
Q  237 tctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  50824744 tcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 50824802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29979739 - 29979610
Alignment:
Q  166 tccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||     
T  29979739 tcccttttatgttaaattagacactcctctctcctcttatttaaaacatattagaaaacatttcactctcctcccctaataaaagcttgaattgcattca 29979640  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29979639 tcttccctcttatgttaaaatctacacttt 29979610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35667817 - 35667657
Alignment:
Q  136 cccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||    
T  35667817 cccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactccccccccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcattcc 35667718  T
Q  235 cctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  35667717 cctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 35667657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 289
Target Start/End: Original strand, 30192527 - 30192677
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  30192527 tcaaagatgtttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcattcccctc 30192626  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
     ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  30192627 ccctgagagaagcttgaattacattccactcccctcttatgttaaaatcta 30192677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 291
Target Start/End: Original strand, 33032170 - 33032330
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||    
T  33032170 ccctcccctcaaagatgcttgaattacacttctctcccctattatgttaaaatatacactcctctccccttttattcaaaacatattagaaaatttttca 33032269  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||| || | ||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||    
T  33032270 ctcccatcccttaagagaagcttgaattacattctcatccccccttatgttaaaatctaca 33032330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Original strand, 9784633 - 9784760
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||    
T  9784633 cctcttatgttaaaatatacactctcctcctctcttattcaaaacatattagaaaatttttcactcacatcccctaagagaatcttgaattacattcatc 9784732  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9784733 tcccctcttatgttaaaatctacacttt 9784760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Original strand, 17729558 - 17729684
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  17729558 cctcttatgttaaaatatacattcccctcgcctcttattcaaaacatattagaaaacttttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccc 17729657  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17729658 tcc-cccttatgttaaaatctacacttt 17729684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 23721391 - 23721551
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||| |||||||||| |||||| |   |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  23721391 cctcccctcaaagatgtttgaattacaccccctccccttttatgttaaaatatacattttcctccccacttattcaaaacatattagaaaacttttcact 23721490  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  23721491 ctcctcccctaagagaagcttgaattacattc--ctccccccttatgttaaaacctacacttt 23721551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 55069542 - 55069415
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |    
T  55069542 cctcttatgttaaaatatacaattccctcccctcttattcaaaacatattagaaaactttacacgcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccc 55069443  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55069442 tcccctcttatgttaaaatctacacttt 55069415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 13771726 - 13771892
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   | | ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  13771726 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactttcatcccctcttatgttaaaatatacactcccctcctctcttattcaaaacatattagaaaatattt 13771825  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||  | | ||||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  13771826 cactccccttccttgagagaagattgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 13771892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 17722758 - 17722924
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||    
T  17722758 tcccctccctttaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattaggaaaaattt 17722857  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  17722858 cactcccttccattaatagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagtcaaaatctacacttt 17722924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 32448287 - 32448446
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||  |  ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  32448287 ctcccttcaaagatgcttaaattacacctcctcccctcttatgttaaaatatacattctcctcccctcttatttaaaacatattagaaaaaatttcattc 32448386  T
Q  234 ccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32448387 ccctccccta--agaagcttgaattaaactcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 32448446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Original strand, 23272477 - 23272578
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23272477 ctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacact 23272576  T
Q  294 tt 295  Q
    ||    
T  23272577 tt 23272578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 49621413 - 49621249
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  49621413 tcccctcccttcaaaaatgcttgaattacatccccctccctcttattttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttc 49621314  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||| | | || |||| || |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  49621313 actcccctc-cttgagggaagtttcaattacattcctctcctctcttaagttaaaatctacgcttt 49621249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44665249 - 44665081
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  44665249 cctcccctcaaagttgcttgaattacgctcccctccccttttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaaaatttcac 44665150  T
Q  232 tcc-----cctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||     |||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44665149 tcctctcccctccccttagagaagcttgaattacatttccctccccccttatgttaaaatctacacttt 44665081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17202004 - 17201845
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||||| | ||||||   ||||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||    
T  17202004 ccctcaaagatgcttgaattacacttctctccactcttatgttaaaatctacacttccctcccatcttattcaaaatatattagaaaatatttcactccc 17201905  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17201904 ctcccttgagagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 17201845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8139047 - 8138893
Alignment:
Q  142 aaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctc 240  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| |    
T  8139047 aaagatgcttgaattacaatcccctcccctcatatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattgggaaatatttcactcccctccc 8138948  T
Q  241 ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  8138947 ttaatagaagcttgaattacattctcctcccctcttaagtcaaaatctacacttt 8138893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 36897468 - 36897632
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| |  | |||| ||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||    
T  36897468 tcccctcccctcaaagatgcttaaattacactcctc-cccttttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttc 36897566  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |  || |||  |||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36897567 atcccactcctctaagagaagcttgaattacattaccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 36897632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21037976 - 21037852
Alignment:
Q  171 cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcc 270  Q
    ||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  21037976 cttatgttaaaatatatactcccctccccttttatttaaaatatattagaatttttttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacatttttcttc 21037877  T
Q  271 actcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  21037876 cctcttatgttaaaatctacacttt 21037852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 138 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 56310125 - 56309967
Alignment:
Q  138 cctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca-ctccc 235  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| | |||    
T  56310125 cctcaaagatgcttgaattacactctcctcctctcttatgttaaaatatacacccc-ctcccctcttattcaaaacatatttgaaaacttttcagccccc 56310027  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  56310026 ctcccctaagagaagcttgaattacatgcccctcctttcttatgttaaaatctacgcttt 56309967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13482846 - 13482700
Alignment:
Q  150 ttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagaga 248  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | |||||    
T  13482846 ttgaattacactcccctcctctcttatgtttaaatatacacttccttcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcaatcccctcgcttgagaga 13482747  T
Q  249 agcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13482746 agcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctactcttt 13482700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47931277 - 47931138
Alignment:
Q  150 ttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagaga 248  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| || |  |||    
T  47931277 ttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaatatacactcctcacctctcttattcaaaatatattagaaaatatttcactcccctccccca--aga 47931180  T
Q  249 agcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  47931179 agcttgaattacattcgcctcccctcttatgttaaaatctac 47931138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 49702388 - 49702549
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||  | |  ||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | |     
T  49702388 ctcccctctaagatgcttgaattacacttctctcccctcttatattaaaatatacaatcttctcccctcttattcaaaacatattagaaaactttacgc- 49702486  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  49702487 cccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctctttcgttaaaatctacacttt 49702549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35854297 - 35854130
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacc--tccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatt 227  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||||   ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35854297 tcccctctcttcaaagatgtttgaattacactcacccttccatcttgtgttaaactatacacttccctttcctcttattcaaaacatattagaaaacatt 35854198  T
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  35854197 tcactcccctcccttgagagaagcttgaattacattccccttccctcttatgttagaatctacgcttt 35854130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 45847181 - 45847309
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | |  | ||||||||||||| |||||||||||      
T  45847181 ccctcttatgttaaaatatacaatcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaactttacaccctctccccctaagagaagctggaattacattccc 45847280  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45847281 ctcccctcttatgttaaaatctacacttt 45847309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 721332 - 721491
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  721332 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatattaaaatatacacttcccttccctcttattcaaaacatattagaaaatatttca 721431  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||| |||| | | | |||||||||||||||||||  || |  | ||||||||||||||||    
T  721432 ctctcctcccttgaaagaagcttgaattacattccccttccattttatgttaaaatctac 721491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Original strand, 28464210 - 28464369
Alignment:
Q  131 cccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||    |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  28464210 cccctcccctcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacacttccatccccttttattcaaaacatattagaaaatatttc 28464309  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||       |||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  28464310 actcccctc------cagaagcttgaattacattccccttccctcttatgttaaaatctacgcttt 28464369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 287
Target Start/End: Original strand, 18362109 - 18362226
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctc 269  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||    
T  18362109 tcttatgttaaaatatacatttctctcccctcttattcaaaacattttaaaaaatattttagtcccctcccttgagagaagcttgagttacattctcctc 18362208  T
Q  270 cactcttatgttaaaatc 287  Q
    | ||||||||||||||||    
T  18362209 ccctcttatgttaaaatc 18362226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26705736 - 26705627
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  26705736 tcccttcccttcaaagatgcttgaattacactcccctcctctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 26705637  T
Q  229 cactcccctc 238  Q
    ||||||||||    
T  26705636 cactcccctc 26705627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35667633 - 35667472
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||||||||||  |||| |||     
T  35667633 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactttcctcccctcttatgttaaaatatacactcccctccccacttattcaaaacatatt--aaaatattg 35667536  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||||||| | | ||||||||||||||||||   ||| || |||||| |||||||||||| ||||    
T  35667535 cattcccctcacttgagagaagcttgaattaca---ttcccccctcttaagttaaaatctacgcttt 35667472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 36600818 - 36600701
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctc 269  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||    
T  36600818 tcttatgttaaaatatacatttctctcccctcttattcaaaacattttaaaaaatattttagtcccctcccttgagagaagcttgagttacattctcctc 36600719  T
Q  270 cactcttatgttaaaatc 287  Q
    | ||||||||||||||||    
T  36600718 ccctcttatgttaaaatc 36600701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 295
Target Start/End: Original strand, 7796964 - 7797120
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||||| ||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| || | |||||    
T  7796964 tcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcctatgttaaaatatacacttccctctcctcttattcaaaacatattagaaaatattacatttccctc 7797063  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  7797064 ccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaaggtaaaatctacacttt 7797120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42074455 - 42074332
Alignment:
Q  171 cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcc 270  Q
    ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||    
T  42074455 cttatgttaaaatatatactcctcccccctcttattcaaaacatattagaaaactttttattcccctcccctaagagaaacttgaattaca-tcccctcc 42074357  T
Q  271 actcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
T  42074356 cctcttatgttgaaatctacacttt 42074332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 54092221 - 54092348
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||     
T  54092221 ccctcttatgtaaaat-atacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcattcccctcccttgagagaagcttgaattacattctc 54092319  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| || | |||||||||||||| ||||    
T  54092320 ctcccctttcatgttaaaatctacgcttt 54092348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6233850 - 6233688
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctct-tatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | | | ||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||  ||||  ||    ||||||    
T  6233850 cctcccctcaaagatgtttgaattacactcccattcctttctatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatttatttgaattt-tttcac 6233752  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6233751 tccccttccctaagagaagcttgaattacattctcttcccctcttatgttaaaatctacacttt 6233688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 7478683 - 7478845
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||| |  |||| ||| |||||||| |||||| ||  ||||| | || || ||||||||||| ||||| |||||||    
T  7478683 cctctcctcaaagatgtttgaattacactcctctcc-tctcatgttaaaatatacattcccctcccttttttttcaaaacatattagaaaacttttcact 7478781  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgtt-aaaatctacacttt 295  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7478782 cccctcctccaagagaagcttgaattacattctcatcccctcttatgttaaaaatctacacttt 7478845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36651293 - 36651171
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  36651293 ttatgttaaagtatacactttcctcccttcttattcaaaacatattagaattt-tttcactcccctcccctaagagaaacttgaattacatttccctcca 36651195  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36651194 ctcttatgttaaaatctacacttt 36651171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 16191715 - 16191825
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||||||||||| || || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||    
T  16191715 tacactcccctcctctcttattcaaaacatattagaatacttttcacccccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttataataaa 16191814  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||||||||    
T  16191815 atctacacttt 16191825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35667350 - 35667241
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||     
T  35667350 tcccctcccatcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattc 35667251  T
Q  229 cactcccctc 238  Q
    || |||||||    
T  35667250 cattcccctc 35667241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 755591 - 755432
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||| ||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  755591 ccctcccctcaaagatgcttgaattatactcccctcccctcttatattaaaatatacacttcccttccctcttattcaaaacatattagaaaatatttca 755492  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||| |||| | | | |||| ||||||||||||||  || |  | ||||||||||||||||    
T  755491 ctctcctcccttgaaagaaacttgaattacattccccttccattttatgttaaaatctac 755432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12251372 - 12251262
Alignment:
Q  176 gttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactct 275  Q
    |||||| ||||||||   || |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||    
T  12251372 gttaaaatatacacttcccttccctcttattcaaaacatattagaaaaattttcactcccctc-cctaagagaagcttgaattacatccccctcccctct 12251274  T
Q  276 tatgttaaaatc 287  Q
    ||||||||||||    
T  12251273 tatgttaaaatc 12251262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37735507 - 37735380
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| || | | ||||||| | |||||||||||| |    
T  37735507 cctcttatattaaaatatacacttctctcttctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcccttcccttgagagaagttagaattacattctcc 37735408  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  37735407 tcatctcttatgttaaaatctacgcttt 37735380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Original strand, 55139398 - 55139524
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||   | |||||||||| |||| |||| | |||   |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |    
T  55139398 cctcttatgttaaaatatacactccatttccctcttattcaaaatatatcagaaattttttcactcccatcccctaagagaagcttgaattacattcccc 55139497  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55139498 tcc-cccttatgttaaaatctacacttt 55139524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19854834 - 19854705
Alignment:
Q  166 tccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||  |||| || || |||||||||||||||    
T  19854834 tcccttttatgttaaaatatacatttctctcccctcttattcaaaacatatttgaaaacatttcactctccttccctaggaaaatcttgaattacattct 19854735  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||||   ||||||| | ||||||||||||    
T  19854734 cctccctgcttatgtaagaatctacacttt 19854705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 51020303 - 51020203
Alignment:
Q  195 tcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  51020303 tcccctcttttttaaaatatattagaaaatatttcactcccctctattaagagaagtttgaattacaatcacgtcctcttttatgttaaaatctacactt 51020204  T
Q  295 t 295  Q
    |    
T  51020203 t 51020203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Original strand, 55814361 - 55814490
Alignment:
Q  166 tccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    ||||||||||||| || |||||| |   ||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  55814361 tccctcttatgtttaaatatacatttccctcccctcttattcaaaacatcttagaaaatatttcactctcctcccttgagagaagcttgaattacattct 55814460  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
      |||  |||||| ||||||| ||| ||||    
T  55814461 catcccttcttattttaaaatgtactcttt 55814490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 198
Target Start/End: Original strand, 754858 - 754945
Alignment:
Q  107 gagtaaattacactcccctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctccc 198  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  754858 gagtaaattacactcccctc-----ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactcatctccc 754945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4649749 - 4649633
Alignment:
Q  147 tgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaaga 246  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||   |||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||   | |||    
T  4649749 tgcttgaattacactcccctcgctcttatgttaaaatatacacttcactcttctcttattcaaaatatattaaaaaatatttcacttcgctcctttgaga 4649650  T
Q  247 gaagcttgaattacatt 263  Q
    |||||||||||||||||    
T  4649649 gaagcttgaattacatt 4649633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 53306406 - 53306256
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctc---ttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||| ||| || |||||||||  | |||| |   ||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  53306406 ccctcaaagatgcatgaattacactcccctcccctcttaagttgaaatatacactccccccccccccttttattcaaaacacattagaaaatatttcact 53306307  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaa 283  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||    
T  53306306 tccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctccccttttatgttaa 53306256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 7851723 - 7851887
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||   | |||| | ||| |||||| ||||||| |  |||| |||||||| |||| ||||| |||    |||    
T  7851723 tcccctcccctcaaagaagctttaattacactttcatcccctattaagttaaaatatacaccc--ctcctctcttattcaaaagatattgaaattttttt 7851820  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7851821 cactcccctcccataagagaagcttgaactacattcccctctcctcttatgttaaaatctacacttt 7851887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26809106 - 26808953
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | |||| | ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||    
T  26809106 ccctcaaagatgtttgaattacactcccctcacatctcatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaatt-tttcactccc 26809008  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     || ||| | |||||||||||||||||||| |||| |     ||||||||||||||||||    
T  26809007 atcccctgatagaagcttgaattacattctcctcccc-----tgttaaaatctacacttt 26808953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 6711877 - 6711796
Alignment:
Q  208 aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||    
T  6711877 aaaacatattagaaaatatttcattcccctcccttgagagaagcttgaattacattctcctcctcttttaagttaaaatcta 6711796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 46077002 - 46076882
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattataca-ctcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||||     
T  46077002 cctcttatgttaaaatatacatctcct-taccctctcattcaaaacatgttagaaaatatttcactcctctcccttgagagaagcatgaattacattctc 46076904  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatct 288  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  46076903 ctctcctcttatgttaaaatct 46076882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48373091 - 48372989
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct-ccactcttatgttaaaatctacac 292  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||   || || || || |||||||||||||||    
T  48373091 ctcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcacccccctcctctaagagaagcatgaattacatttccctcccccttttttgttaaaatctacac 48372992  T
Q  293 ttt 295  Q
    |||    
T  48372991 ttt 48372989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 722046 - 721977
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctccc 198  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  722046 tcccctcccctcaaagatacttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactcatctccc 721977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 51019656 - 51019721
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  51019656 cactgccctcccctaagagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactt 51019721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 13482193 - 13482253
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13482193 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactc 13482253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23722116 - 23722057
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23722116 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 23722057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Original strand, 29429165 - 29429215
Alignment:
Q  244 agagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29429165 agagaagcttgaattacattcctctcc-ctcttatgttaaaatctactcttt 29429215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 41919989 - 41919914
Alignment:
Q  218 aaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||| ||| |||||| ||| ||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41919989 aaaaaaaattacactcctctcccctcaaagatgcttgaattacactcttctcctctcttatgttaaaatatacact 41919914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 19313353 - 19313415
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  19313353 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatatacactc 19313415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 54145058 - 54145128
Alignment:
Q  193 tctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacatt 263  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||    
T  54145058 tctcccctcctattcaaaacatatgagaaaatatttcactcccctcccttgagagaagcttcaattacatt 54145128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 55068851 - 55068913
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  55068851 tcccctcctctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 55068913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 7165404 - 7165465
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  7165404 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 7165465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7797680 - 7797619
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7797680 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcccctcccttcttatgttaaaatatacact 7797619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 270
Target Start/End: Original strand, 10519240 - 10519308
Alignment:
Q  201 cttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcc 270  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10519240 cttatttaaaacat-taaaaaaatatttcacatctctctcttaagagaaacttgaattacattcttctcc 10519308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13392818 - 13392757
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  13392818 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 13392757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13395957 - 13395896
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  13395957 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 13395896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17730247 - 17730186
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  17730247 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctctccttttatgttaaaatatacact 17730186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Original strand, 21037316 - 21037369
Alignment:
Q  242 taagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21037316 taagagaagcttgaattacactcccctcctctcttatgttaaaatatacacttt 21037369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25010123 - 25010062
Alignment:
Q  131 cccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  25010123 cccctcccttcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactc 25010062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29429769 - 29429704
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||    
T  29429769 cactccccttccctaagagatgcttgaattacactctccttctctcttatgttaaaatatacactt 29429704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42398059 - 42397963
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||||||  ||| |||| | | |||||||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  42398059 ccctcttatgtaaaat-atacactcctctcccctcttaagtaaaacaagttagaaaaaaatacactcccctccctcgagagaagcttgaattacattc 42397963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 47029825 - 47029886
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  47029825 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 47029886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18362762 - 18362702
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  18362762 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctaccctcttatattaaaatatacactc 18362702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 36600164 - 36600224
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  36600164 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctaccctcttatattaaaatatacactc 36600224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20545085 - 20545026
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattataca 188  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20545085 tcccctcccctcagagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatataca 20545026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Original strand, 25009511 - 25009562
Alignment:
Q  244 agagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  25009511 agagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 25009562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35666556 - 35666505
Alignment:
Q  244 agagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  35666556 agagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 35666505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36408504 - 36408457
Alignment:
Q  248 aagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  36408504 aagcttgaattacattcctctcccctcttataataaaatctacacttt 36408457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36422670 - 36422623
Alignment:
Q  248 aagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  36422670 aagcttgaattacattcctctcccctcttataataaaatctacacttt 36422623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 53989252 - 53989193
Alignment:
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||    
T  53989252 ctctcataagagaagtttgaattacattcttcacccttcttgtgttaaaatctaaacttt 53989193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 293
Target Start/End: Original strand, 754875 - 754937
Alignment:
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  754875 ctcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacact 754937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Original strand, 6232432 - 6232490
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  6232432 cctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctctcctcttaagttaaaatatacact 6232490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16960940 - 16960874
Alignment:
Q  131 cccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctc 196  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| || | |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16960940 cccctcccctcaaagattcttgaattatactcccctctcctcttatgttaaaatatacactcctctc 16960874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20545088 - 20545026
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||    
T  20545088 cactcccctcccctcagagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatataca 20545026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 23269176 - 23269238
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  23269176 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactc 23269238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36898166 - 36898104
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  36898166 tcccctcccctcaaagatacttgaattacactcccctctccttttatgttaaaatatacactc 36898104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 41919971 - 41919913
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  41919971 ctcccctcaaagatgcttgaattacactcttctcctctcttatgttaaaatatacactc 41919913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Original strand, 6232358 - 6232415
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattata 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  6232358 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatata 6232415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7479413 - 7479352
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  7479413 tcccctcccctcaaagttgcttgaatcacactttcatcccctcttatgttaaaatatacact 7479352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 7480046 - 7479985
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||| |||||||||||| ||||||||    
T  7480046 tcccctcccctcaaagttgcttgaatcacactttcatcccttcttatgttaaaatatacact 7479985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7797683 - 7797618
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  7797683 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcccctcccttcttatgttaaaatatacactt 7797618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 8138327 - 8138392
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||   ||||||||||||||| |||||||    
T  8138327 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacacacccctttcctcttatgttaaaatatacactt 8138392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 12250682 - 12250743
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  12250682 tcccttcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 12250743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35667448 - 35667387
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35667448 tcccttcccctcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacact 35667387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 45847834 - 45847773
Alignment:
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||| ||| | ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45847834 tcccctcaccttaaagatgcttgaattacaatcctctcctctcttatgttaaaatatacact 45847773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 55815060 - 55814995
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctccc 198  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  55815060 ctcccatcaaagatgcttgaattacactctcctcctctcttacgttaaaatatacactcctctccc 55814995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 722049 - 721985
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | |||  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  722049 cactcccctcccctcaaagatacttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacact 721985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 13482188 - 13482252
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||| ||||| ||| | ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13482188 cacttccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacact 13482252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16192385 - 16192321
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||||||| || | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16192385 cactcccctctactgaaagatgcttgaattacactcccctcctctcttatgttaaaatatacact 16192321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 19313350 - 19313414
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19313350 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatatacact 19313414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Original strand, 22474884 - 22474948
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    |||||| |||||| ||||||||   ||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  22474884 ctcttaagttaaaatatacactttcctctcctcttatgcaaaacatattaaaaaatatttcactc 22474948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26619139 - 26619099
Alignment:
Q  255 aattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26619139 aattacattcccctcctctcttatgttaaaatctacacttt 26619099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35667636 - 35667572
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35667636 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactttcctcccctcttatgttaaaatatacact 35667572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 294
Target Start/End: Original strand, 37147765 - 37147809
Alignment:
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37147765 gcttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactt 37147809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 47030552 - 47030488
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  47030552 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacact 47030488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 56310129 - 56310073
Alignment:
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacac 292  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  56310129 ctctcctcaaagatgcttgaattacactctcctcctctcttatgttaaaatatacac 56310073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 93)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38011920 - 38011754
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  38011920 tccccttcccttaaagatgcttgaattacactcccctccactcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 38011821  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38011820 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 38011754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 41321520 - 41321682
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  41321520 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 41321619  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  41321620 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctaca 41321682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18407268 - 18407102
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  18407268 tcccctccccttaaagatgtttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacattcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaactttt 18407169  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18407168 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctccccccttatgttaaaatctacacttt 18407102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17110077 - 17109918
Alignment:
Q  136 cccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcc 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17110077 cccctcaaagatgcttgaattacactaccctcccctcttatgttaaaatatacactc-tcttccctcttatttaaaacatattagaaaacttttcactcc 17109979  T
Q  235 cctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17109978 cctcccttaagagaagcttgaattccattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 17109918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 1845867 - 1846033
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  1845867 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaacatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 1845966  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1845967 cactaccctcccctaaaagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 1846033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Original strand, 19997611 - 19997773
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  19997611 tcccctccccttaaagatgcttaaattacattctcctcccctcttatgttaaaatatacacttttctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 19997710  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19997711 cactctcctcccctaagagaagcctgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatctaca 19997773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25069068 - 25068907
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |    |||||||| |||||| ||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  25069068 tcccctcccctcaaagatgcatgaattacactc----ccctcttaagttaaaatatacacttccctcccatcttattcaaaacatattagaaaaaatttc 25068973  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25068972 actcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 25068907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Original strand, 8061040 - 8061199
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8061040 cccttaaagatgcttgaattacactctcctcctctcttatgttaaaatatacactccccttccctcttattcaaaacatattagaaaacttttcactccc 8061139  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8061140 ctcccgtaagagaagcttgaattacatttccctccattcttatgttaaaatctacacttt 8061199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 51611811 - 51611973
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacc-cacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  51611811 ctcctctcaaagatgtttgaattacacttctcttccctcttatgttaaaatatacactttcctcccctcttatttaaaacatatgagaaaacttttcact 51611910  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51611911 cccctcctctaagagaagtttgaattgcattcttctcccctcttatgttaaaatctacacttt 51611973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 290
Target Start/End: Original strand, 41575181 - 41575342
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  41575181 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcctcttccctcttatgttaaaatatgcactcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaatattt 41575280  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||    
T  41575281 cactcccctcccctatgagaagcttgaattatatttccctcccctcttatgttaaaatctac 41575342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45195268 - 45195139
Alignment:
Q  166 tccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45195268 tccctcttatgttaaaatatacactcccctccccttttattcaaaacatattagaaaacttttcactcgcctcccttaagagaagcttgaattacattct 45195169  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45195168 cctcccctcttatgttaaaatctacacttt 45195139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16537080 - 16536921
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16537080 ccctcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactttcctcccctcttattcaaaacattttaaaaaatatttcactccc 16536981  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16536980 ctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctactcttt 16536921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27226392 - 27226226
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| |   |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  27226392 tcccctcccctcaaaaatgtttgaattacactcccctctcctcttatgttaaaatatacatttccctcccctctttttcaaaacatattagaaaatattt 27226293  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27226292 cactcccctcccttgagagaagcttgaatgacattcacctcccctcttatgttaaaatctacacttt 27226226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 52505301 - 52505467
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||    ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  52505301 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacacccccctcccctcttaagttagaatatacactcccaccccctcttattcaaaacatattagaaaaaaatt 52505400  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52505401 catcccccttccctaagagaagcttgaattacatcccactcccctcttatgttaaaatctacacttt 52505467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 831990 - 831838
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||   |||| |||| |||||| |||   |||||||||||||    
T  831990 tcaaagatgcttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaatatacactctcctcccccaatattcaaaatatattagaaattttttcactcccctc 831891  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  831890 tcctaagagaagcttgaattacattcttcttccctcttatgttaaaatttaca 831838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36605464 - 36605301
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||     
T  36605464 cctcccctcaaagatgtttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcattttccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcat 36605365  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||  | | ||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  36605364 tccccttccttgagagaagcttgaattacatttccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 36605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 42830548 - 42830711
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  42830548 cctcccctcaaagatgtttgaattacactccccgcccctcttatgttaaaatatacatttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcac 42830647  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  42830648 tcccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctccccttttatgttaaaatctacgcttt 42830711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 15356941 - 15357107
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||     
T  15356941 tcccctcccctttaagatggttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacaatcccctcccctcttattcaaaaaatattagaaaacttta 15357040  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15357041 cacccctctctcctaagagaagcttgaattacattcccctcccgtcttatgttaaaatctacacttt 15357107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 47553182 - 47553310
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||  ||| | ||||||||| ||||||||||||| |    
T  47553182 ccctcttatgttaaaatatacattcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcactcatctcccttaagagaagtttgaattacattcct 47553281  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47553282 ctcccctcttatgttaaaatctacacttt 47553310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 20584997 - 20585158
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||    ||||||| ||||||||||| |||||| || ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||     
T  20584997 ctcccccctaagatgcttgaattacaatgccctcccttcttatgttaaaatatacaatcctcttctctcttattcaaaacatattagaaaatttttcac- 20585095  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20585096 cccctcgcttaagagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatctacacttt 20585158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27931355 - 27931205
Alignment:
Q  147 tgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaag 245  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||| |   ||||||||||||| |||||| |||  ||||| |||||| |||||| ||||||    
T  27931355 tgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacaattccctcccctcttattcaaaacaaatttgaaaacttttcacccccctcccctaag 27931256  T
Q  246 agaagcttgaattacattcttctccactcttat-gttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27931255 agaagcttgaattacatttctctcccctcttatggttaaaatctacacttt 27931205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29510525 - 29510379
Alignment:
Q  150 ttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagaga 248  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||| |||    
T  29510525 ttgaattacactccccttccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactctcctcccataataga 29510426  T
Q  249 agcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  29510425 agcttgaattacattcccctcctctcttaagtcaaaatatacacttt 29510379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25991419 - 25991319
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  25991419 ctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcactctcctcccctaagagaagcttgaattacattctcctcctc-cttatgttaaaatctacact 25991321  T
Q  294 tt 295  Q
    ||    
T  25991320 tt 25991319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 132 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 51362551 - 51362418
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51362551 cccttccctcaaagatgcttgaattacactttcctccccttttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattaaaaaatatttca 51362452  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||| |||| | | |||||||||||||||||||||    
T  51362451 ctcacctcccttgagagaagcttgaattacattc 51362418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31766026 - 31765904
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   ||||     
T  31766026 ttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatttttcactccacttccctaagagaagcttgaattacattaccctcc- 31765928  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31765927 ctcttatgttaaaatctacacttt 31765904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 41576071 - 41575918
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||||| || |||||||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41576071 ccctcaaagatgcttgaattacattcccctcctcttttatgttaaaatatacacttccctcccctctt-ttcaaaacatattagaaaatatttcactccc 41575973  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||| | | ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  41575972 ctcccttgagagaagattgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctac 41575918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45737974 - 45737876
Alignment:
Q  197 ccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45737974 ccctcttattcaaaacatattagaaaatttttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctccccccttatgttaaaatctacacttt 45737876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23739879 - 23739722
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  23739879 ctcccttcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactctcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatctttcact 23739780  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
     ||||| | | |||||||||| |||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||    
T  23739779 tccctcccttgagagaagcttaaattacatccccctcccctcttaagttaaaatctac 23739722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 45738735 - 45738566
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacact-----catctcccctcttatttaaaacatattaaaaaaca 225  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||     |  ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  45738735 ccctcccatcaaagatgcttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcccctcttattcaaaacatattaaaaaata 45738636  T
Q  226 tttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||| ||||    
T  45738635 tttcattcccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcgtaagttaaaatctacgcttt 45738566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50144115 - 50143951
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  50144115 cctcccctcaaagatacttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatatacactctcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatttttcac 50144016  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacatt-cttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| |   ||||||||||||||| |||| |  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  50144015 tcccctccctggagagaagcttgaattgcattccccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 50143951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 295
Target Start/End: Original strand, 11916470 - 11916622
Alignment:
Q  142 aaagttgcttgaattacacccacctccctc-ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctc 240  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||| |  |||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||| |    
T  11916470 aaagatgcttgaattacactcccctcctttattatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaatatattagaaaaattttcactcccctccc 11916569  T
Q  241 ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||  |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11916570 ccaaga--agcttgaattacattctcttcccctcttatgttaaaatctacacttt 11916622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27532604 - 27532477
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacac-tcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| |    
T  27532604 ctcttatgttaaaatatacacgtcccctcccctcttattcaaaacatattgaaaaacttttcactcccttcgcctaaaagaaacttgaattatattctcc 27532505  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  27532504 tctcctcttattttaaaatctacacttt 27532477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 290
Target Start/End: Original strand, 43319925 - 43320084
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||| | |||| ||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||    
T  43319925 ccctctcctcaaagatgtttgaattacactcccctctccttttatgttaaaatatacattcccctcccctcttaatcaaaacatattagaaaatatttca 43320024  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||| ||| | | |||||||||||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||    
T  43320025 ctcctctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccatcttaagttaaaatctac 43320084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 794815 - 794681
Alignment:
Q  129 atcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatt 227  Q
    ||||||| || |||||| || || |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  794815 atccccttccatcaaagatgatttaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcctctcttattcaaaacatattagaaaatatt 794716  T
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacat 262  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  794715 tcactcccctcccttgagagaagcttgaattacat 794681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 4666890 - 4667048
Alignment:
Q  139 ctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaat-tatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccc 236  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  4666890 ctcaaagatgcttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcattcccc 4666989  T
Q  237 tctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||   | |||||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  4666990 tcctttgagagaagcttgaattatattcccctcctctcttaagttaaaatctacgcttt 4667048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19072421 - 19072259
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||    
T  19072421 ctcccctcaaagatgtttgaattacactcccctcctctcttatattaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcact 19072322  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||| ||  ||||  ||||| |||||||| ||| ||||    
T  19072321 cccctcccttgagagaagcttaaattacaatcccctcccatcttaagttaaaatatacgcttt 19072259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 19120311 - 19120149
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||    
T  19120311 ctcccctcaaagatgtttgaattacactcccctcctctcttatattaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcact 19120212  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| | | |||||||||| ||||||| ||  ||||  ||||| |||||||| ||| ||||    
T  19120211 cccctcccttgagagaagcttaaattacaatcccctcccatcttaagttaaaatatacgcttt 19120149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 295
Target Start/End: Original strand, 36511453 - 36511575
Alignment:
Q  173 tatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccac 272  Q
    |||||||||  |||||||   |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  36511453 tatgttaaaacatacacttcactcccctctttttcaaaacatattagaaaatatttcactcccctttcttgagagaagcttgaattacattctcctcccc 36511552  T
Q  273 tcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | |||||||||||||||| ||||    
T  36511553 ttttatgttaaaatctacgcttt 36511575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 46682682 - 46682848
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||    ||| |||||||||||||| |||||||||  || | |||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  46682682 tccccttccctcaaagatgtttgaattacacttcgctctcctcttatgttaaaatatacactccccttctctcttattcaaaatatattagaaaatattt 46682781  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  46682782 cacttccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 46682848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28045172 - 28045046
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||| |   || |||||||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  28045172 cctcttatgttaaaatatacaattcccttccctcttactcaaaagatattagaaaacttttcac-cctctcccctaagagaagcttgaattacattctcc 28045074  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  28045073 tcccctcttatattaaaatctacacttt 28045046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44645958 - 44645835
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||      
T  44645958 ttatgttaaaatatacactctcatcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcactcatctctcgtaagagaagcttgaattacattcccctcat 44645859  T
Q  272 ctcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  44645858 ttcttatgttaaaatctatacttt 44645835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 1386657 - 1386551
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  1386657 tacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaatattcactcccctcccctaagaaaagcttgaattacatccccctcctctcttatgttaaa 1386558  T
Q  285 atctaca 291  Q
    |||||||    
T  1386557 atctaca 1386551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13574189 - 13574063
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||   ||    
T  13574189 ctcttatgttaaaatatacacttctctctcctattattcaaaacatattagaaaacttttcacttccctcccctaagaaaagtttgaaatacatttccct 13574090  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||    
T  13574089 cctctcttatgttaaaatatacacttt 13574063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47233741 - 47233615
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||  ||    
T  47233741 ctcttatgttaaaatatacattcccttcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcccctcccttgagagaagcttgagttactttcccct 47233642  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||    
T  47233641 cccctcttaagttaaaatctacgcttt 47233615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Original strand, 33126193 - 33126358
Alignment:
Q  131 cccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||  | ||||  ||||||||||||| |||| | |   |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||     
T  33126193 cccctctcctcaaagatgtttgaattacattcccctcttctcttatgttaaaatatataattccctcccctctttttcaaaacatattagaaaatatttg 33126292  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33126293 actcccctccctcaagagaagtttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 33126358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 295
Target Start/End: Original strand, 49129018 - 49129179
Alignment:
Q  136 cccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcc 234  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||     
T  49129018 cccctcaaagatgtttgaattacactctcatcccttcttatgttaaaatatacactcctcttccctcttattcaaaacattttagaatttttttcactca 49129117  T
Q  235 cctctcctaagagaagcttgaattacattcttct-ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | || ||| |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||    
T  49129118 catcccctgagagaagcttgagttacattcccctccccctcttatgttaaaatctacacttt 49129179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44649291 - 44649191
Alignment:
Q  195 tcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||||||    
T  44649291 tcccctcttattcaaaatatattagaaaacatatcactcatctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcatttcttatgttaaaatctacactt 44649192  T
Q  295 t 295  Q
    |    
T  44649191 t 44649191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 295
Target Start/End: Original strand, 47291627 - 47291744
Alignment:
Q  176 gttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactct 275  Q
    |||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||    
T  47291627 gttaaaatatatactcacctctcctcttattcaaaatatattaaaaaatatttcatccccctcctctaagagaagcttg--ttacattcctcttccctct 47291724  T
Q  276 tatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47291725 tatgttaaaatctacacttt 47291744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2275808 - 2275689
Alignment:
Q  170 tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctc 269  Q
    |||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||    
T  2275808 tcttatgttaaaatatacattctcctccgctcttatttaaaatatgttagaaaatatttaactcccctcccttgagagaagcttcaattacattctcctc 2275709  T
Q  270 cactcttatgttaaaatcta 289  Q
    | |||||| |||||||||||    
T  2275708 ccctcttaagttaaaatcta 2275689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28971528 - 28971393
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||   || |||| |||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  28971528 tcccctcccgtcaaagatgtttgaattacatttacatcccctcttatgttaaaatatacacgctcctcctctcttattcaaaacttattagaaaacattt 28971429  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
     ||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  28971428 tactcctcacccctaagagaagcttgaattacattc 28971393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 125098 - 124976
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  | |  || | ||||||||||||||||||| ||     
T  125098 ctcttatgttaaaatatacactcctctcctctcttatgcaaaacatattagaaaatatttcactcttcacctctgaaagaagcttgaattacattcatcg 124999  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  124998 ctcctcttatgttaaaatctaca 124976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 45559114 - 45559269
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||| |   ||||||||||||| |||| |       ||| ||||||||    
T  45559114 ctccgctcaaagatgcttgaattacactccccttccatcttatgttaaaatatacatttccctcccctcttattcaaaaga-------aaatatttcact 45559206  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45559207 ccactcccctaagagaagcttaaattacattcccctctcctcttatgttaaaatctacacttt 45559269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 295
Target Start/End: Original strand, 24064628 - 24064703
Alignment:
Q  220 aaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  24064628 aaaatatttcactcccctctcctaagagaagtttaaattacattcatctctcctcttatgttaaaatatacacttt 24064703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30242979 - 30242896
Alignment:
Q  208 aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | | | | |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  30242979 aaaacatattagaaaacatttcacttctcacccgttagagaagcttgaattacattctccttacctcttatgttaaaatctaca 30242896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 261
Target Start/End: Original strand, 6851872 - 6851937
Alignment:
Q  195 tcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattaca 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6851872 tcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttcac-accctctcctaagagaagcttgagttaca 6851937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 290
Target Start/End: Original strand, 7306969 - 7307127
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || | | |||| | |||||||||| ||||||||    ||||||||| || ||||||||||| ||||  || |||    
T  7306969 cctccccttaaagatgcttgaattatactctcatccccttttatgttaaaatatacacttccttcccctctttttcaaaacatattagaaaatgttccac 7307068  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    || | || | | |||||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||    
T  7307069 tctcttcccttgagagaaacttgaattacattccccttccctcttatgttaaaatctac 7307127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 16536379 - 16536441
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  16536379 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 16536441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 294
Target Start/End: Original strand, 27225683 - 27225745
Alignment:
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27225683 tcccctcccctaagagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactt 27225745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 295
Target Start/End: Original strand, 1114335 - 1114384
Alignment:
Q  246 agaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1114335 agaagcttgaattacattcagctcccctcttatgttaaaatctacacttt 1114384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 36604734 - 36604795
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  36604734 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcctcttccctcttatgttaaaatatacact 36604795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 45738007 - 45738068
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  45738007 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacact 45738068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47141340 - 47141250
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    |||||||||| |||||| |  || |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||    
T  47141340 ttatgttaaaatatacatt--tcccccctcttatttaaaatatattagaaaatatttcactccactttcttgagagaaacttgaattacattc 47141250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 241 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 47216678 - 47216629
Alignment:
Q  241 ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  47216678 ctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctac 47216629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Original strand, 45737316 - 45737374
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45737316 ctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 45737374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4601766 - 4601709
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacc-tccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  4601766 ctcccctcaaagatgcttgaattacactctccttccctcttatgttaaaatatacact 4601709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12126500 - 12126447
Alignment:
Q  242 taagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12126500 taagagaagcatgaatttcattcatctctcctcttatgttaaaatctacacttt 12126447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 270
Target Start/End: Original strand, 33475690 - 33475794
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccc--tcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    |||||||||||||| |||||| |  |||||||  ||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||  | ||| | ||| ||||||||||||||    
T  33475690 cctcttatgttaaaatatacatttctctcccccctcttattcaaaatatattagaaaacaattcactccccttccataaaaaaagtttgaattacattct 33475789  T
Q  266 tctcc 270  Q
     ||||    
T  33475790 cctcc 33475794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 45738004 - 45738069
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  45738004 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactt 45738069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 47292325 - 47292245
Alignment:
Q  107 gagtaaattacactcccctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattaca-cccacctccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||||||||  || | ||| |||||||||||| |||||||||    
T  47292325 gagtaaattacactcccctc-----ccctcccctcaaagatgcttgaattacattccccttccttcttatgttaaactatacactc 47292245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6645108 - 6645060
Alignment:
Q  243 aagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  6645108 aagataagcttgaattacattcctctcatctcttatgttaaaatctaca 6645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 19997610 - 19997674
Alignment:
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19997610 ctcccctccccttaaagatgcttaaattacattctcctcccctcttatgttaaaatatacacttt 19997674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Original strand, 29344566 - 29344660
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctccta-agagaagcttgaattacattc 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  29344566 ccctcttatgttaaaatatacact--tc-cccttcttattcaaaacatattagaaaatatttcaccctcct-tcctcgagagaagcttgaattacattc 29344660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 52506039 - 52505980
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  52506039 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 52505980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1846604 - 1846546
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacac 189  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  1846604 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacac 1846546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Original strand, 25813032 - 25813090
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  25813032 cctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 25813090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 190
Target Start/End: Original strand, 27225682 - 27225744
Alignment:
Q  129 atcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27225682 atcccctcccctaagagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacact 27225744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29778075 - 29778009
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctc 196  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| |  ||||||| || ||||||||||||||    
T  29778075 tcccctcccctcaaaaatgcttgaattacattcacctctcctttatgttgaaatatacactcatctc 29778009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41322259 - 41322201
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  41322259 cctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 41322201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42831268 - 42831206
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  42831268 tcccctccccttaaagatacttgaattacactcccctccgctcttatgttaaaatatacactc 42831206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9998065 - 9998004
Alignment:
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |   |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9998065 tcccctcccctaagagaagcttgaattacccttccctcccctcttatgttaaaatatacact 9998004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13574232 - 13574167
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  13574232 cacttccctctcctcaaagatgcttgaaatacattattcttctctcttatgttaaaatatacactt 13574167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Original strand, 17109313 - 17109374
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17109313 tcccctcccctcaaagatatttgaattacactcctctctctcttatgttaaaatatacactc 17109374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 25068332 - 25068393
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  25068332 tccccacccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacact 25068393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Original strand, 27930772 - 27930829
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattata 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||    
T  27930772 tcccctcctctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatata 27930829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 36604731 - 36604796
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  36604731 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcctcttccctcttatgttaaaatatacactt 36604796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37419479 - 37419406
Alignment:
Q  192 atctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccct-ctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  37419479 atcttccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactatcctccccctaagagaaacatgaattacattc 37419406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 38011178 - 38011239
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  38011178 tcccctcccctcaaatatgcttgaattatactcacctcccctcttaagttaaaatatacact 38011239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44563500 - 44563375
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||   |||||||||||| ||| ||| || |||||||   ||| |||| ||| |||||||| | |||    
T  44563500 ctcttatgtcaaaatatacactcccctcctctcttaaacaaaacatattaagaaaaattacattcccctcctttaaaagaaccttaaattacatccatct 44563401  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |  |||| || |||||||||||||||    
T  44563400 catctctaatattaaaatctacactt 44563375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 16536376 - 16536440
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16536376 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 16536440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 19071721 - 19071781
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19071721 cccttccctcaaagatgtttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactc 19071781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 191
Target Start/End: Original strand, 19119611 - 19119671
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19119611 cccttccctcaaagatgtttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactc 19119671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 41321517 - 41321581
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  41321517 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacact 41321581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 188
Target Start/End: Original strand, 47233070 - 47233126
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattataca 188  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||    
T  47233070 cctcccctcaaagatacttgaattacactcccctcccttcttatgttaaaatataca 47233126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 97)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Original strand, 8007073 - 8007235
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||||||    
T  8007073 ctcccctcaaagatgcttgaattacaccgttctcccctcttatgttaaaatatacactcttctcctctcttattcaaaatatattataaaatatttcact 8007172  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8007173 ctcctcccctaagagaagcttgaattacattcctcttccctcttatgttaaaatctacacttt 8007235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27979966 - 27979800
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  27979966 tcccctcccctcaaagatgtttgaattacaccctcctcatctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 27979867  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27979866 cactccccttccctaagagatgcttgaattacattcccctcccctctcatgttaaaatctacacttt 27979800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 37334654 - 37334492
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  37334654 tcccctcccttcaaagatgcttgaattacacttccctcccttcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 37334555  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  37334554 cactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctaca 37334492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 4054739 - 4054900
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |    |||||||| |||||| ||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  4054739 tcccctcccctcaaagatgcatgaattacactc----ccctcttaagttaaaatatacacttccctcccatcttattcaaaacatattagaaaaaatttc 4054834  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4054835 actcccctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 4054900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 37658141 - 37657975
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||     
T  37658141 tcccctcccctcaaatatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattc 37658042  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37658041 cacccccctccccttagagaagcttgaattacatccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 37657975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40957477 - 40957315
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||     
T  40957477 ctcccctctaagatgcttgaattacactcacctcccctcttaggttaaaatatacaatctcctcctctcttattcaaaacatattatcaaacttttcaca 40957378  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||    
T  40957377 cccctctcctaagagaagcttgaattacattctcctcccctcttataataaaatctacacttt 40957315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Original strand, 30782760 - 30782887
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  30782760 cctcttatgttaaaatatacacgttcctcccctcttattcaaaacatattagaaaacatatcactcccctctcttaagagaaacttgaattacattctcc 30782859  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30782860 tcccctcttatgttaaaatctacacttt 30782887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20691864 - 20691699
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||     |||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  20691864 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacaattcactcctctcttaagttaaaatatacactcccctcccctattattcaaaacatattagaaaaaattt 20691765  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20691764 ccctcccctcccctaagagaagcttgaattacattc-cctcccctcttatgttaaaatctacacttt 20691699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31477031 - 31476865
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  31477031 tcccctctcctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactttcatcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 31476932  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  31476931 cactcccctcccttaagagaagcttgaattatattccgctcccctcttaagttaaaatctactcttt 31476865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42599055 - 42598888
Alignment:
Q  129 atcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatt 227  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||    
T  42599055 atcccctcccctcaaaactgtttgaattacactctcctccactcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattgaaaatatattagaaaatatt 42598956  T
Q  228 tcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| || | ||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42598955 tcactcccatcccttaaaaaaagcttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatctacacttt 42598888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24625561 - 24625395
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||    ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  24625561 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacacccccctcccctcttaagttagaatatacactcccaccccctcttattcaaaacatattagaaaaaaatt 24625462  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24625461 catcccccttccctaagagaagcttgaattacatcccactcccctcttatgttaaaatctacacttt 24625395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 35751524 - 35751690
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  35751524 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccttcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttaatcaaaacatattagaaaatattt 35751623  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||   | ||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  35751624 cactcccctcctttgagagaagcttgaattacatttccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 35751690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4877441 - 4877279
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||     
T  4877441 tcccatcccctcaaatttgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatt- 4877343  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
       ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  4877342 ---tccgctcccctaagagaagcttgaattacattcccctcaccccttatgttaaaatctacacttt 4877279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 289
Target Start/End: Original strand, 21639031 - 21639186
Alignment:
Q  135 tcccctcaaagttgcttgaattacac-ccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  21639031 tcccttcaaagatgcttgaattacactccactcccctcttatgttaaaatatacactctcctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactc 21639130  T
Q  234 ccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatcta 289  Q
    |||||   | |||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  21639131 ccctcctttgagagaagcttcaattacattcctctcccatcttaagttaaaatcta 21639186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18524430 - 18524264
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  18524430 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcgcctcccctcttatgttaaaatatatagtcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaacattt 18524331  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||||||||  |||||||||||||  |||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18524330 tactccccttccctaagagaagctaaaattacatttccatccactcttatgttaaaacctacacttt 18524264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 133 - 262
Target Start/End: Original strand, 19408550 - 19408680
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||    
T  19408550 cctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaatatatttcac 19408649  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacat 262  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  19408650 tcccctcccttgagagaagcttgaattacat 19408680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 3933316 - 3933480
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||  | ||| || |||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  3933316 cccttccctcaaagatgcttgaattacaccatcttcctcttttattttaaaatatacacttctctccccttttattcaaaatatattagaaaacttttca 3933415  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     ||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3933416 ttccccttccctaagagaagcttgaattacattcccctcacctcttatgttaaaatctacacttt 3933480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Original strand, 20540346 - 20540474
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |      
T  20540346 cccttttaagttaaaatatacactctcctccccttttattcaaaacatattagaaaaaatttcactcccctcccctaagagaagcttgaattacatccca 20540445  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20540446 ctcccctcttatgttaaaatctaaacttt 20540474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40027528 - 40027400
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  40027528 ccctcttgtgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacatttcc 40027429  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  40027428 ctcccttcttatgttcaaatctacacttt 40027400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 9118843 - 9119007
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||| | | ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  9118843 tcccctcctcttaaagatgtttgaattacactcccttcctctcttaagttaaaatatacactcctctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 9118942  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9118943 cac-cccctaccctaagagaagcttgaattaca-tcccctcccctcttatgttaaaatttacacttt 9119007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Original strand, 20259381 - 20259507
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |   ||||||| ||||||||||||  |||    
T  20259381 ctcttatgttaaaatatacacttatctcccttcttattcaaaacatattagaaaacatttcactctcctccctcgagagaagtttgaattacatttatct 20259480  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20259481 ctcctcttatgttaaaatctacacttt 20259507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 295
Target Start/End: Original strand, 20183377 - 20183534
Alignment:
Q  139 ctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccct 237  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||  ||||    
T  20183377 ctcaaagatgcttgaattacactcccctcccttcttatgttaaaatatacactccccttccctcttattcaaaacatattagaaaatattccacaaccct 20183476  T
Q  238 ctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20183477 cccttaagagaggcttgaattacatttccctcccctcttaagttaaaatctacacttt 20183534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1199811 - 1199695
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  1199811 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactccccttccctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 1199712  T
Q  229 cactcccctctcctaag 245  Q
    |||||||||| ||||||    
T  1199711 cactcccctcccctaag 1199695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 8572710 - 8572873
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  8572710 cctcccctcaaaaatgcttgaattacactcccctcatctcttatgttaaaatatacacttcactcctctcttattcaaaacatattagaaaatatttcac 8572809  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| | | |||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||| ||| ||||    
T  8572810 tcccctcccttgagagaagctttaattacattctcctccccttttttgttaaaatgtacgcttt 8572873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 295
Target Start/End: Original strand, 9017666 - 9017821
Alignment:
Q  141 caaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctct 239  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  9017666 caaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactctcctcc 9017765  T
Q  240 cctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | | ||||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  9017766 cttgagagaagcttgaattacatttctttcccctcttaagttaaaatttacgcttt 9017821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 6047993 - 6048159
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||    
T  6047993 tcccctcctatcaaagatgtttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacactctcctcccctcttattcaaaccatatttgaaaatattt 6048092  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| || |||||    
T  6048093 cacccccctcctctaagagaagcttgaattacatttatctcttctcttatgttaaaatttatacttt 6048159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13280213 - 13280047
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| |||||| ||    |||    
T  13280213 tcccctaccctcaaagatgtttgaattacactgccctcccctcttatgttaaaatatacacttccctccccccttatttaaaatatattagaattttttt 13280114  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13280113 cactcctcttccttaaaagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatctacacttt 13280047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 107 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27028725 - 27028572
Alignment:
Q  107 gagtaaattacactcccctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||| || |||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  27028725 gagtaaattacactcccctctc-----ctcctcttaaagatgcttgaattacactcccctcctctcttatgttaaaatatatactcctctctcctcttat 27028631  T
Q  206 ttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    | ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | | || ||||||||||||||||||    
T  27028630 tcaaaacatattagaaaatatttcactcctctcccttgagggaagcttgaattacattc 27028572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 32458569 - 32458423
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  32458569 tcaaagatgcttgaattacactctcctccccttttatattaaaatatacactcctctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactcccctc 32458470  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaa 285  Q
     | | |||||||||||||||| |||   |||| |||||| |||||||    
T  32458469 ccttgagagaagcttgaattatatttccctcccctcttaagttaaaa 32458423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13686688 - 13686520
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||| |||   |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  13686688 tcccctcctctcaaagatgcttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatataccctctcatcccctcttattcaaaatatattagaaaatattt 13686589  T
Q  229 cactcccctctcct--aagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | |   |||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13686588 cactcccctcccttgagagagaagcttcaatcacattctcctcccctcttaagttaaaatctacacttt 13686520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17781043 - 17780914
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacact-catctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||     
T  17781043 ccctcttatgttaaaatatacacttcctatcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactccactcccttgagagaagcttgaattacattcc 17780944  T
Q  266 tctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     |||  || |||||||||||||||||||||    
T  17780943 cctctccttttatgttaaaatctacacttt 17780914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 293
Target Start/End: Original strand, 17967866 - 17967991
Alignment:
Q  168 cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||    |||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |      
T  17967866 cctcttatgttaaaatatacacttccatcccctcttattcaaaacatatcagaaaacttttcactcccctcccataagagaagcttgaattacattttca 17967965  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  17967966 tcccttcttatgttaaaatctacact 17967991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6031411 - 6031267
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcact 232  Q
    |||||||||||| || |||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  6031411 ctcccctcaaagatgtttgaattacactttcatcccttcttatgttaaaatatatactccactcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcact 6031312  T
Q  233 cccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactctta 277  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  6031311 cccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcccctctta 6031267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 15612145 - 15612049
Alignment:
Q  197 ccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15612145 ccctcttattcaaaacatattaaaaaacatttcacttccctcttctgaaagaagcttgaattacattctcctc--cccttatgttaaaatctacacttt 15612049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31850726 - 31850561
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccac-ctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |   ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  31850726 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactctctacccctcttatgttaaaatatacatttcactcccctctt-ttcaaaacatattagaaaatattt 31850628  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||   | ||||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  31850627 cactcccctcctttgagagaagtttgaattacattttcctcccttcttatgttaaaatctacgcttt 31850561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Original strand, 15175223 - 15175348
Alignment:
Q  140 tcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15175223 tcaaagatgcttgaattacacttccctcccctcttatgttaaaatatacacttccctcccctctttttcaaaacatattagaaaatatttcactcccctc 15175322  T
Q  239 tcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
       | |||||||||||||||||||||    
T  15175323 ctttgagagaagcttgaattacattc 15175348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20570891 - 20570722
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  20570891 cctctcctcaaagatgcttgaatcacactctcctcccctcttatgttaaaatatacactccactcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcac 20570792  T
Q  232 ----tcccctctcc--taagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
        ||| ||||||  | |||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||| |||||||| ||||    
T  20570791 tcgatcctctctcccttgagagaagcttgaattacattcccctcctctgttaagttgaaatctacgcttt 20570722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3079848 - 3079754
Alignment:
Q  201 cttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3079848 cttattcaaaacatattaaaaaacatttaactcccctcctttgagagaagcttgaattacattatcatcccctcttatgttaaaatctaaacttt 3079754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Original strand, 21687368 - 21687530
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | | | | | ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21687368 ccctcctctcaaagatgcttgaattaccctctcattctctcttatgttaaaatatacaccc--ctcccctcttatttaaaatatattataaaacatttca 21687465  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     | ||||    ||||||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  21687466 ttacccttctgtaagagaagcttgaattgcatccccctctcctcttatgttaaaatctagacttt 21687530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 295
Target Start/End: Original strand, 1931366 - 1931449
Alignment:
Q  212 catattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1931366 catattagaaaacatttcactcccgtcccttaagagaagcctcaattacattcctctcccctcttttgttaaaatctacacttt 1931449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12586300 - 12586174
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |   || ||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |  |||||| |||||||||||||  ||    
T  12586300 ctcttatgttaaaatatacattttccttccctcttttttaaaacatattagaaaatatttgactcccctcccttgtgagaagtttgaattacattcccct 12586201  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || || |||||||||||||||| ||||    
T  12586200 ccccttttatgttaaaatctacgcttt 12586174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36762794 - 36762685
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||    
T  36762794 tacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaatcttttcaatcccctcccctaaaagatgcttgaattacactc-cctcccctcttgtgttaaa 36762696  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||||||||    
T  36762695 atctacacttt 36762685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 249
Target Start/End: Original strand, 1405557 - 1405665
Alignment:
Q  142 aaagttgcttgaattacacccacctc-cctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctc 240  Q
    |||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  1405557 aaagatgcttgagttacactcccctcacctcttatgttaaaatatacactcatctctcctcttattcaaaatatattaggaaatatttcactccactctc 1405656  T
Q  241 ctaagagaa 249  Q
     ||| ||||    
T  1405657 ttaatagaa 1405665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Original strand, 22730508 - 22730560
Alignment:
Q  243 aagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22730508 aagagaagcttgaattacattctcctcccctcttatgttaaaatctacacttt 22730560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38498093 - 38497928
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaat---tatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    |||| || |   |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  38498093 cctcccctcgaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaaatatataaacccccttcccctcttattcaaaacatattagaaaat-ttt 38497995  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  38497994 cactctcctcccttaagagatgcttgaattacatcattctcccatcttatattaaaatatacacttt 38497928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 295
Target Start/End: Original strand, 1405669 - 1405756
Alignment:
Q  208 aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1405669 aaaacatattaggaaatatttcactcccctcccttaatagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagtcaaaatctacacttt 1405756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14594806 - 14594644
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||| |   |||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  14594806 cctctcctcaaagatgcttgaattacacacctctcccctcttatgttaaaatatacatttcactcctctctcattcaaaacatattagaaaatatttcac 14594707  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    | ||||| | | |||||| |||||||||| |||  |||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  14594706 t-ccctcccttgagagaatcttgaattacgttcccctcccctcttgtgtttaaatctacgcttt 14594644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Original strand, 15144460 - 15144587
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccc-tctcctaagagaagcttgaattacattcttc 267  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| |||| || | | |||||||||||||||||||||  |    
T  15144460 ctcttatgttaaaatatacacttccctctccttttattctaaacatattagaaaatatttcacgccccatcccttgagagaagcttgaattacattcccc 15144559  T
Q  268 tccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  15144560 tcacctcttatgttaaaatctacgcttt 15144587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36742610 - 36742539
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctc 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  36742610 ccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatagtagaaaaaatttcactcccctc 36742539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 27301868 - 27302034
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||    ||| | |||||| ||||| |||| |||  |||| | ||||||| ||||||||||| |||| | ||    
T  27301868 tcccctctcctcaaatatgcttgaattacacttttctctcgtcttatattaaaatatatacttctctcacatcttattcaaaacatattagaaaagaatt 27301967  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||  | | |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  27301968 cacttcccttccttgagagaagcttaaattacatttttctcttctcttatgttaaaatctacgcttt 27302034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 278
Target Start/End: Original strand, 32347289 - 32347359
Alignment:
Q  208 aaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttat 278  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32347289 aaaatatattaaaaaatatttcactcccatcacataagagaagcttgaattacatttttctcctctcttat 32347359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 291
Target Start/End: Original strand, 38497333 - 38497395
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38497333 cactcccctcctctaagagaagcttgaattacactcttctcccctcttatgttaaaatataca 38497395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 264
Target Start/End: Original strand, 5138309 - 5138441
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccct-cttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||| |||| || |  ||||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||    
T  5138309 cccttccctcaaagatgcttaaattacactcccctcctttcttatgttaaaatatatacccc-ctcccttcttattcaaaatatattagaaaatatttca 5138407  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattc 264  Q
    |||||||| | | |||||| ||||||||||||||    
T  5138408 ctcccctcccttgagagaaacttgaattacattc 5138441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 295
Target Start/End: Original strand, 10402010 - 10402105
Alignment:
Q  199 ctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||  | |||||||||||| ||||||||    
T  10402010 ctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactttcctcccgtaagagaagtttgaattacattctcctcc-tttttatgttaaaatttacacttt 10402105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 6180997 - 6180900
Alignment:
Q  194 ctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||  ||| | ||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  6180997 ctcccctcttatgcaaaacatattagaaacaattactctctcctcacctgagaaaagcttaaattacattcttcactcctcttatgttaaaatctaca 6180900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6734176 - 6734087
Alignment:
Q  176 gttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || | ||| ||||  ||||||||||||||    
T  6734176 gttaaaatatacactaatctccattcttattcaaaaaatattaaaaaacatttcacttccatcccttaaaagaaatttgaattacattct 6734087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5701122 - 5700998
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||    ||||||||||| |||| ||| || ||||||| | | |||||||||||||||||||||      
T  5701122 ccctcttatattaaaatatacacttccctcccctttttagcaaaacatattagaaaaaattacaatcccctcccttgagagaagcttgaattacattccc 5701023  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||  |||| |||||||||||||||    
T  5701022 ctcatctctaatgttaaaatctaca 5700998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 20570136 - 20570212
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttat 205  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  20570136 tcccctcccttcagagatgcttgaattacactcccctcctctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttat 20570212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 214
Target Start/End: Original strand, 32020472 - 32020559
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaa--ttatacactcatctcccctcttatttaaaacat 214  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  32020472 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaatatatacactcccctcccctcttattcaaaacat 32020559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17781232 - 17781142
Alignment:
Q  107 gagtaaattacactcccctctcatcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacactcatctcccctct 202  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  17781232 gagtaaattacactcccctc-----ccctcccctcaaagatgcttgaattacactatctcccctcttatgttaaaatatacgctctcctcccctct 17781142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 291
Target Start/End: Original strand, 13279484 - 13279546
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||    
T  13279484 cactcccctcctctaagagaagcttgaattacacttccctcctctcttatgttaaaatctaca 13279546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20541051 - 20540985
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  20541051 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacattctcctcccctcttaagttaaaatatacacttt 20540985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31477034 - 31476968
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31477034 cactcccctctcctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacacttt 31476968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Original strand, 31850009 - 31850075
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31850009 cactcccctcgtctaagagatgcttgaattacactctcatcctctcttatgttaaaatatacacttt 31850075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17781108 - 17781051
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  17781108 cctcccctcaaagatgcttgaattacactccctcccctcttatgttaaaatatacact 17781051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 20691122 - 20691183
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  20691122 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 20691183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 188
Target Start/End: Original strand, 27979237 - 27979298
Alignment:
Q  128 catcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27979237 catctcctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatataca 27979298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36737515 - 36737454
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  36737515 tcccctccccttaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacact 36737454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 36762122 - 36762183
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36762122 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttattttaaaatatacact 36762183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 37333911 - 37333972
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  37333911 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 37333972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 37657389 - 37657450
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  37657389 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 37657450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 244 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2554195 - 2554144
Alignment:
Q  244 agagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  2554195 agagaagcttgaattacattatcctccccacttatgttaaaatctacgcttt 2554144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3079957 - 3079890
Alignment:
Q  198 cctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattct 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||   |||||||| ||||||||| |||||    
T  3079957 cctcttattcaaaacatattaaaaaacatttcattcatctcctttaagagaaacttgaattatattct 3079890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 3769550 - 3769676
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  ||||| |||||| |||||||||||| | || |||  | | | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||      
T  3769550 ccctcttatgttaaaatatacacccc-ctcccttcttatgtaaaacatattagagaaaattagagttcactcccctgagagaagtttgaattgcattccc 3769648  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||    
T  3769649 ctcctcttttaagttaaaatctacactt 3769676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10688324 - 10688224
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||  | | ||||| ||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  10688324 cccttccctcaaagatgtttgaattatcctcccctcctctcttatgttaaaatatataccc--ctcccctcttattcaaaatatattagaaaacatttca 10688227  T
Q  231 ctc 233  Q
    |||    
T  10688226 ctc 10688224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15175941 - 15175878
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacac 292  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| |||||    
T  15175941 cactcccctcccctaagagatgcttgaattacactcccctcccttcttatgttaaaatatacac 15175878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 236
Target Start/End: Original strand, 16614193 - 16614244
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccc 236  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16614193 tacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaacttttcactcccc 16614244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Original strand, 24624827 - 24624886
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  24624827 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatatacact 24624886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 30920586 - 30920686
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||           |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  30920586 tacactcccctcccctcttattcaaaacatattaggaaatatttcactcccctc----------cgcttgaattacattcccctcctctcttaagttaaa 30920675  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||||||||    
T  30920676 atctacacttt 30920686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36763029 - 36762965
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  36763029 cactcccctcttctaagagaagtttaaattacat--ttctctcctcttatgttaaaatatacacttt 36762965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12548476 - 12548362
Alignment:
Q  149 cttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagag 247  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||  ||  ||| | ||    
T  12548476 cttgaattacactcatcttctctcttatgttaaaatatacatatctctcccctcttatctaatatatattagaaaatatttcactcatcttccctgaaag 12548377  T
Q  248 aagcttgaattacat 262  Q
    |||||||||||||||    
T  12548376 aagcttgaattacat 12548362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4055475 - 4055414
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  4055475 tccccacccctcaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacact 4055414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 188
Target Start/End: Original strand, 6029464 - 6029521
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattataca 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  6029464 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactctcatcctctcttatgttaaaatataca 6029521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8573406 - 8573353
Alignment:
Q  139 ctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  8573406 ctcaaagatgcttgaattacactctccttccctcttatgttaaaatatacactc 8573353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9119614 - 9119553
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  9119614 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttaagttaaaatgtacact 9119553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18524433 - 18524376
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaat 286  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  18524433 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcgcctcccctcttatgttaaaat 18524376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20541048 - 20540987
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  20541048 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacattctcctcccctcttaagttaaaatatacact 20540987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 286
Target Start/End: Original strand, 32020469 - 32020526
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaat 286  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  32020469 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacattcccctcccctcttatgttaaaat 32020526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36737518 - 36737453
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  36737518 cactcccctccccttaaagatgcttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactt 36737453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 36742129 - 36742190
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || | | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  36742129 tcccctcccctcaaagatgcttgaattaaactctcatcccctcttatgttaaaatatacact 36742190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 1199100 - 1199047
Alignment:
Q  240 cctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||||||||||||| ||   ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1199100 cctaagagaagcttgaattatatc--tctcctcttttatgttaaaatctacacttt 1199047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1406293 - 1406241
Alignment:
Q  241 ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  1406293 ctaagagaagcttgaattacactctcatctcctcttatgttaaaatatacact 1406241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 2074783 - 2074727
Alignment:
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaat 286  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  2074783 actccccttccctaagagaaacttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaat 2074727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 13685973 - 13686037
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13685973 cactcccctctcctcaaagatccttgaattacactctcatcccctcttatgttaaaatatacact 13686037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15175938 - 15175878
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacac 189  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||    
T  15175938 tcccctcccctaagagatgcttgaattacactcccctcccttcttatgttaaaatatacac 15175878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 20570133 - 20570197
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20570133 cactcccctcccttcagagatgcttgaattacactcccctcctctcttatgttaaaatatacact 20570197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20570897 - 20570833
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20570897 cactctcctctcctcaaagatgcttgaatcacactctcctcccctcttatgttaaaatatacact 20570833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2113 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold2113
Description:

Target: scaffold2113; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 734 - 899
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  734 tcccatcccctcaaagatgcttgaattacactcccctccactcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaattt 833  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  834 cac-cccctcccctaagagaagcttgaattacacccccctcccctcttatgttaaaatctacacttt 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 16493 - 16659
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| | |||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||| ||||    
T  16493 tcccctccctttaaagatgcttgaattacactcccctcccatcttatgttaaaatatacactcctctcccctcttattcaaaatatattaggaaatattt 16592  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||||||    
T  16593 cactcccctcccttaatagaagcttgaattacattcccctcccctcttaagtcaaaatctacacttt 16659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17218 - 17154
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17218 cactcccctcttctaagagaagcttgaattacactcacatcccctcttatgttaaaatatacact 17154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 27069 - 26910
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  27069 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaatatacacttctctcccctcttattcaaaacataatagaaaa-attt 26971  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    ||| |||||| | | ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  26970 cac-cccctcccatgagagaagcttggattacattctcctcccctcttatgttaaaatctac 26910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27072 - 27007
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27072 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacactcatctcccctcttatgttaaaatatacactt 27007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 421995 - 421830
Alignment:
Q  131 cccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttc 229  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||| ||||||||| || ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  421995 cccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccttcccctcttatgtttaaatatacacttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttc 421896  T
Q  230 actcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  421895 actcccctcccatgagagaagcttgaattacattcccatcccctcttatgttaaaatctactcttt 421830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Original strand, 14057 - 14222
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  14057 tcccctcccatcaaagaagtttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacacttccctccattcttattcaaaacatactagaaaatattt 14156  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    ||||||  || | | |||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||    
T  14157 cactcctatcccttgagagaagcttgaattacattctccttccctcttatgttcaaatctacactt 14222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 191
Target Start/End: Original strand, 421159 - 421217
Alignment:
Q  134 ctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactc 191  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  421159 ctcccctcaaagatgtttgaattacactcccctcccctcttatgttaaaatatacactc 421217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 294
Target Start/End: Original strand, 14054 - 14119
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacactt 294  Q
    |||||||||| | | | ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14054 cactcccctcccatcaaagaagtttgaattacactcctctcccctcttatgttaaaatatacactt 14119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1192 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1192
Description:

Target: scaffold1192; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 168 - 334
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||   | ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  168 tcccctcctcttaaagatgtttgaattacagtcccctcccctcttatgttaaaatatacacttcccacccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 267  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  268 cacttccctctcttgagagaagcttgaattacattcttctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Original strand, 3416 - 3582
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  3416 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacacactcctcccctcttatgttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatattt 3515  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
      |||| ||| | | ||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  3516 atctcctctcccttgagagaagcttgaactacattcccctcccctcttaagttaaaatctacgcttt 3582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 4053
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4112 ccctcccctcaaagatgcttgaattacactcccctcccatcttatgttaaaatatacact 4053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 3413 - 3477
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3413 cactcccctcccctcaaagatgcttgaattacacactcctcccctcttatgttaaaatatacact 3477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 169 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 351963 - 351841
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  351963 ctcttatgttaaaatatacacttttctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcactctcctcctctaagagaagcctgaattacattctcct 351864  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  351863 cccctcttatgttaaaatctaca 351841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 351985 - 351940
Alignment:
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  351985 gcttaaattacattcctctcctctcttatgttaaaatatacacttt 351940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 295
Target Start/End: Original strand, 10604 - 10767
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcac 231  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  10604 cctcccctcaaagatgtttgaattacactccccgcccctcttatgttaaaatatacatttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcac 10703  T
Q  232 tcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  10704 tcccctcccttgagagaagcttgaattacattcccctccccttttatgttaaaatctacgcttt 10767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11324 - 11262
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11324 tcccctccccttaaagatacttgaattacactcccctccgctcttatgttaaaatatacactc 11262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12926 - 12760
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||| ||  || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  12926 tcccctcccctcaaagatgtttgaattacactctcttcctctcttatgttaaaatatacattccccttccctcttattcaaaacatattagaaaactttt 12827  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  12826 cactcatctcacttaagagaagcttgaattatattctcctccctccttatgttaaaatctacacttt 12760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 286
Target Start/End: Original strand, 12216 - 12252
Alignment:
Q  250 gcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaat 286  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12216 gcttgaattacattcctctcccctcttatgttaaaat 12252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2916 - 2791
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2916 ctcttaagttaaaatatacactcccctcccctcttattcaaaatatattagaaaatatttcatttccctc-cctaagagaagcttgaattacattcccct 2818  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  2817 cccctcttatgttaaaatctacacttt 2791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Original strand, 32745 - 32855
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||    
T  32745 tacactcccctcccctcttattcaaaacatattagaaaaaatttcattcccctcccctaagagaagcttgaattacatctccctcccctcttatgttaaa 32844  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||||||||    
T  32845 atctacacttt 32855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 130 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31420 - 31260
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacattt 228  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||   |||||| | |||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  31420 tcccctcccttgaaagatgcttgaattacactttcctccccttttatgttaaaatatacactcccctcccttcttttttaaaacatattacaaaagattt 31321  T
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||   ||| ||||||| ||||||||||||    
T  31320 cactcccctcccctaa-agaagcttggtttaaattcccatcc-ctcttatcttaaaatctaca 31260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25942 - 25788
Alignment:
Q  137 ccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactccc 235  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||    
T  25942 ccctcaaagatgct-gaattacattcatctcctctcttatgttaaaatatacactcttctatcctcttattcaaaatacattagaaagcatttcactccc 25844  T
Q  236 ctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctaca 291  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25843 ctccccaaagagaagcttaaattacatttctctcctctcttatgctaaaatctaca 25788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25929 - 25889
Alignment:
Q  253 tgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25929 tgaattacattcatctcctctcttatgttaaaatatacact 25889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10151 - 10041
Alignment:
Q  185 tacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaa 284  Q
    |||||||  ||||| | ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10151 tacactcccctcccttgttattcaaaatatattagaaaacttttcactcccctcccccgagagaagcttgaattacattcttttcccctcttatgttaaa 10052  T
Q  285 atctacacttt 295  Q
    |||||||||||    
T  10051 atctacacttt 10041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 290
Target Start/End: Original strand, 10981 - 11137
Alignment:
Q  135 tcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactc 233  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||    || |||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  10981 tcccctcaaagatgcttgatttacacttttctcccctcttatgttaaaacatacactcccctcccctattattcaaaacatattagaaaatatttcactc 11080  T
Q  234 ccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||    
T  11081 cgctctcttgagagaagcttaaattatattcccctcccctcttaagttaaaatctac 11137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11693 - 11634
Alignment:
Q  133 cctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctccc-tcttatgttaaattatacactc 191  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11693 cctcccctcaaagatgcttcaattacactcacctcccctcttatgttaaattatacactc 11634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 16021 - 15900
Alignment:
Q  169 ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    ||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||  ||    
T  16021 ctcttatgttaaaatatacagttccctcccctcttattcaaaacatattagaaaatatttcacttccctcccttgaaagaagcttgaattacattcccct 15922  T
Q  269 ccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  15921 cccctcttaagttaaaatctac 15900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 26542 - 26380
Alignment:
Q  132 ccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacctcc-ctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttca 230  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| | | | | | ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26542 ccctcctctcaaagatgcttgaattaccctctcattctctcttatgttaaaatatacaccc--ctcccctcttatttaaaatatattataaaacatttca 26445  T
Q  231 ctcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
     | ||||    ||||||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  26444 ttacccttctgtaagagaagcttgaattgcatccccctctcctcttatgttaaaatctagacttt 26380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 293
Target Start/End: Original strand, 59277 - 59329
Alignment:
Q  241 ctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  59277 ctaaaagatgcttgaattacactctcctcccctcttatgttaaaatatacact 59329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 293
Target Start/End: Original strand, 25911 - 25975
Alignment:
Q  229 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacact 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||||||    
T  25911 cactcccctctcctaagagaagcttgaattacactctactctcatcttatgttaaaatatacact 25975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0712 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0712
Description:

Target: scaffold0712; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 290
Target Start/End: Original strand, 3697 - 3820
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||| |||||||||| |||||| |  ||| | |||||||| ||||||||||| |||| || ||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||     
T  3697 cccttttatgttaaaatatacatttctcttctctcttattcaaaacatattagaaaatatatcattcacctcccttgagagaagcttgaattacattctc 3796  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||  |||| | ||||||||||||    
T  3797 ctcatctctaaagttaaaatctac 3820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0709 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0709
Description:

Target: scaffold0709; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 290
Target Start/End: Original strand, 3717 - 3840
Alignment:
Q  167 ccctcttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattctt 266  Q
    |||| |||||||||| |||||| |  ||| | |||||||| ||||||||||| |||| || ||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||     
T  3717 cccttttatgttaaaatatacatttctcttctctcttattcaaaacatattagaaaatatatcattcacctcccttgagagaagcttgaattacattctc 3816  T
Q  267 ctccactcttatgttaaaatctac 290  Q
    |||  |||| | ||||||||||||    
T  3817 ctcatctctaaagttaaaatctac 3840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 90468 - 90567
Alignment:
Q  197 ccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcc-taagagaagcttgaattacattcttctccactcttatgttaaaatctacacttt 295  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| | || | ||| |||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  90468 ccctcttattcaaaagatattaaaaaatatttcacccccccccccttgagaaaagcatggattacattcccctcccctcttatgttaaaatctacgcttt 90567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8043 - 7936
Alignment:
Q  172 ttatgttaaattatacactcatctcccctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttctcca 271  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| |  ||| || || | | |||||||||||| |||| || ||     
T  8043 ttatgttaatatatacactcacctcccctcttatgcaaaacatattagaaaatatttcgcatcccacttcttaaaaaagcttgaattatattcctcaccc 7944  T
Q  272 ctcttatg 279  Q
    ||||||||    
T  7943 ctcttatg 7936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 13464 - 13525
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  13464 tcccctcccctcaaagatgcatgaattacactctcctcccctcttaagttaaaatatacact 13525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34381 - 34320
Alignment:
Q  130 tcccctcccctcaaagttgcttgaattacacccacct-ccctcttatgttaaattatacact 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  34381 tcccctcccctcaaagatgcttgaattacgctcccctcccctcttaagttaaaatatacact 34320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 118861 - 118792
Alignment:
Q  199 ctcttatttaaaacatattaaaaaacatttcactcccctctcctaagagaagcttgaattacattcttct 268  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| |||| |||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||    
T  118861 ctcttattcaaaatatattataaaatattttactcccctcctctagaaaaagcttgaattacattcttct 118792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University