View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3735_low_3 (Length: 479)

Name: NF3735_low_3
Description: NF3735
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3735_low_3
NF3735_low_3
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (19-460)||(13746152-13746594)
chr3 (19-460)||(6742075-6742517)
chr3 (19-460)||(3949931-3950373)
chr3 (19-460)||(8159414-8159856)
chr3 (19-460)||(30946073-30946515)
chr3 (19-460)||(16445808-16446250)
chr3 (19-460)||(36815947-36816389)
chr3 (19-461)||(14399743-14400188)
chr3 (19-460)||(46991677-46992119)
chr3 (19-460)||(48249297-48249740)
chr3 (19-461)||(77450-77893)
chr3 (19-457)||(7838784-7839223)
chr3 (19-449)||(6504397-6504828)
chr3 (19-457)||(21954673-21955111)
chr3 (39-457)||(29949193-29949611)
chr3 (39-457)||(29998347-29998765)
chr3 (19-397)||(7841511-7841888)
chr3 (19-214)||(9428510-9428706)
chr3 (39-285)||(29908027-29908273)
chr3 (194-350)||(28610460-28610616)
chr3 (172-324)||(9556331-9556483)
chr3 (165-326)||(51548098-51548259)
chr3 (165-325)||(2284623-2284783)
chr3 (165-325)||(4120360-4120520)
chr3 (165-325)||(33940190-33940350)
chr3 (165-325)||(40467774-40467934)
chr3 (165-325)||(12491422-12491582)
chr3 (148-325)||(8117907-8118084)
chr3 (213-380)||(4510548-4510715)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (19-460)||(29355119-29355561)
chr1 (19-460)||(3946892-3947334)
chr1 (19-460)||(44466770-44467212)
chr1 (19-460)||(20350644-20351086)
chr1 (19-460)||(38774546-38774988)
chr1 (19-460)||(3984301-3984744)
chr1 (19-460)||(5079123-5079565)
chr1 (19-460)||(13630604-13631046)
chr1 (19-460)||(41455025-41455467)
chr1 (19-460)||(12649010-12649452)
chr1 (19-460)||(50116194-50116636)
chr1 (19-457)||(37016102-37016541)
chr1 (19-457)||(38691373-38691812)
chr1 (22-457)||(46974355-46974791)
chr1 (19-457)||(51663446-51663885)
chr1 (19-457)||(13174969-13175408)
chr1 (77-457)||(19497898-19498277)
chr1 (22-278)||(21942977-21943234)
chr1 (19-380)||(32106165-32106516)
chr1 (165-325)||(36360086-36360246)
chr1 (165-325)||(45472687-45472847)
chr1 (165-325)||(7403953-7404115)
chr1 (165-380)||(28863225-28863440)
chr1 (165-325)||(18887360-18887520)
chr1 (190-325)||(27283400-27283535)
chr1 (19-89)||(44619905-44619976)
chr1 (19-155)||(26466006-26466143)
chr1 (189-325)||(20240034-20240170)
chr1 (167-280)||(31445866-31445979)
chr1 (86-195)||(25231558-25231667)
chr1 (247-303)||(25231665-25231721)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (19-460)||(2069-2511)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (19-460)||(33997-34439)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (19-460)||(30304041-30304483)
chr8 (19-460)||(32431296-32431738)
chr8 (19-461)||(8422286-8422729)
chr8 (19-460)||(7341267-7341709)
chr8 (19-460)||(32377339-32377781)
chr8 (19-460)||(35965176-35965618)
chr8 (19-457)||(43370955-43371394)
chr8 (19-449)||(2145441-2145877)
chr8 (19-449)||(7169088-7169510)
chr8 (63-457)||(22581061-22581455)
chr8 (19-331)||(43688731-43689044)
chr8 (19-337)||(45455564-45455883)
chr8 (26-166)||(1115967-1116108)
chr8 (324-457)||(43686584-43686717)
chr8 (19-147)||(39751772-39751901)
chr8 (165-325)||(45116582-45116742)
chr8 (165-326)||(44321173-44321334)
chr8 (131-305)||(14401359-14401532)
chr8 (160-276)||(17316787-17316903)
chr8 (187-275)||(17340364-17340452)
chr8 (198-269)||(13781580-13781651)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (19-460)||(43622566-43623008)
chr7 (19-460)||(617180-617622)
chr7 (19-460)||(18106576-18107018)
chr7 (19-460)||(30787727-30788169)
chr7 (19-460)||(42500595-42501037)
chr7 (19-460)||(45764567-45765009)
chr7 (103-460)||(15067162-15067519)
chr7 (19-457)||(47062071-47062511)
chr7 (19-457)||(43827040-43827479)
chr7 (222-457)||(12116803-12117038)
chr7 (19-250)||(8400774-8401006)
chr7 (19-107)||(15060801-15060890)
chr7 (165-325)||(1297321-1297481)
chr7 (342-457)||(8401016-8401131)
chr7 (165-380)||(40445076-40445291)
chr7 (165-325)||(47867065-47867225)
chr7 (165-380)||(43378819-43379034)
chr7 (165-325)||(16794179-16794339)
chr7 (140-324)||(16795663-16795847)
chr7 (165-325)||(40794258-40794418)
chr7 (165-325)||(45172475-45172635)
chr7 (165-309)||(46791660-46791804)
chr7 (152-380)||(8193790-8194019)
chr7 (79-380)||(3762154-3762455)
chr7 (196-241)||(23558969-23559014)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (19-460)||(19072088-19072530)
chr4 (19-460)||(3404978-3405420)
chr4 (19-460)||(9891210-9891652)
chr4 (19-460)||(41024387-41024831)
chr4 (19-457)||(4769322-4769761)
chr4 (19-447)||(38463281-38463710)
chr4 (19-342)||(49565013-49565337)
chr4 (19-457)||(4978392-4978827)
chr4 (19-460)||(11502694-11503136)
chr4 (19-457)||(4976943-4977382)
chr4 (19-435)||(44049798-44050215)
chr4 (19-457)||(21471981-21472421)
chr4 (28-425)||(6182875-6183273)
chr4 (18-178)||(51643211-51643372)
chr4 (165-324)||(32716628-32716787)
chr4 (165-325)||(1591168-1591328)
chr4 (189-325)||(4617916-4618052)
chr4 (165-325)||(17916521-17916681)
chr4 (148-435)||(13897239-13897526)
chr4 (19-105)||(18580117-18580201)
chr4 (165-325)||(46517000-46517160)
chr4 (200-326)||(17496893-17497019)
chr4 (186-299)||(34979909-34980022)
chr4 (148-310)||(20971086-20971248)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (19-460)||(5348355-5348797)
chr2 (19-460)||(27274791-27275233)
chr2 (19-460)||(41561200-41561642)
chr2 (19-460)||(211872-212314)
chr2 (19-460)||(10622885-10623327)
chr2 (19-460)||(38946951-38947393)
chr2 (19-460)||(39795158-39795600)
chr2 (19-460)||(3801997-3802439)
chr2 (19-458)||(24750846-24751287)
chr2 (79-460)||(7264229-7264610)
chr2 (19-457)||(1098260-1098699)
chr2 (19-457)||(24604523-24604962)
chr2 (19-457)||(43948716-43949155)
chr2 (19-457)||(45476546-45476984)
chr2 (19-460)||(12906923-12907365)
chr2 (19-457)||(34920216-34920655)
chr2 (19-460)||(41007407-41007853)
chr2 (19-449)||(436499-436931)
chr2 (23-457)||(9655348-9655782)
chr2 (19-460)||(11692261-11692688)
chr2 (19-407)||(17996656-17997045)
chr2 (187-457)||(24941084-24941354)
chr2 (19-244)||(28354549-28354775)
chr2 (148-380)||(21535507-21535733)
chr2 (140-304)||(28423061-28423225)
chr2 (377-457)||(28347831-28347911)
chr2 (187-278)||(3353894-3353985)
chr2 (204-244)||(35001701-35001741)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (19-460)||(1611182-1611624)
chr6 (69-460)||(28357557-28357948)
chr6 (19-457)||(31147510-31147949)
chr6 (19-433)||(29287411-29287821)
chr6 (42-457)||(21357784-21358200)
chr6 (42-457)||(23961766-23962182)
chr6 (19-457)||(18607184-18607623)
chr6 (165-325)||(9095463-9095623)
chr6 (19-62)||(28251084-28251127)
chr6 (165-305)||(31196905-31197045)
chr6 (127-305)||(31176265-31176443)
chr6 (23-70)||(24220360-24220408)
chr6 (238-380)||(34111230-34111372)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (19-460)||(37819308-37819750)
chr5 (19-460)||(11031883-11032325)
chr5 (19-460)||(38858621-38859063)
chr5 (19-460)||(34078968-34079410)
chr5 (19-460)||(27866276-27866718)
chr5 (22-460)||(1036542-1036981)
chr5 (19-398)||(28884901-28885281)
chr5 (19-460)||(13566538-13566964)
chr5 (19-460)||(25895528-25895974)
chr5 (19-457)||(18536770-18537209)
chr5 (19-442)||(4202388-4202812)
chr5 (19-457)||(7799440-7799879)
chr5 (19-352)||(7020419-7020753)
chr5 (19-412)||(20287456-20287851)
chr5 (19-246)||(20286197-20286424)
chr5 (165-380)||(11819551-11819766)
chr5 (165-325)||(27013235-27013395)
chr5 (165-325)||(6553124-6553284)
chr5 (165-325)||(42343826-42343985)
chr5 (165-325)||(43295549-43295709)
chr5 (140-245)||(25053043-25053148)
chr5 (222-309)||(9376353-9376440)
chr5 (424-460)||(28884869-28884905)
chr5 (196-244)||(14218175-14218223)
chr5 (196-304)||(20162236-20162344)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (19-460)||(15788-16230)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (19-457)||(17257-17696)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (234-460)||(25377-25603)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (19-147)||(12450-12580)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (241-337)||(4-100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (165-325)||(28452-28612)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (173-309)||(4179-4315)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 13746594 - 13746152
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746594 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 13746495  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746494 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 13746395  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746394 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 13746295  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746294 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 13746195  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13746194 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 13746152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 6742075 - 6742517
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742075 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 6742174  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6742175 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 6742274  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742275 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 6742374  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742375 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 6742474  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6742475 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 6742517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 3949931 - 3950373
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949931 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 3950030  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3950031 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 3950130  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950131 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 3950230  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950231 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgcttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 3950330  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3950331 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 3950373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 8159856 - 8159414
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159856 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 8159757  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8159756 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 8159657  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159656 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 8159557  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159556 tttatgacacacgagaaagaagaaaactttgtttggattttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 8159457  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8159456 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 8159414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 30946515 - 30946073
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946515 aagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 30946416  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30946415 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 30946316  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946315 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 30946216  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30946215 tttatgacacatgcgaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattattaccg 30946116  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30946115 atagggatatgtctttgatgaaagtggttgcacatgtttttcc 30946073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 16445808 - 16446250
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16445808 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtata 16445907  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445908 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 16446007  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446008 ggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 16446107  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446108 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 16446207  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  16446208 atagggatatgtctttgatgacagcggttgcacatatttttcc 16446250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 36816389 - 36815947
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816389 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 36816290  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816289 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtaatacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 36816190  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816189 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 36816090  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816089 tttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 36815990  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36815989 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 36815947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Original strand, 14399743 - 14400188
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14399743 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaatttggaggagcacaactata 14399842  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399843 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 14399942  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtt-ggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399943 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgg 14400042  T
Q  317 atttatgacacatgagaaaga-agaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttac 415  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14400043 atttatgacacatgagaaagagcaaaaactttgtttgtgttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggggattgttac 14400142  T
Q  416 cgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcca 461  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  14400143 cgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcca 14400188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 46992119 - 46991677
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  46992119 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctttatgttggaggagcacaactata 46992020  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992019 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 46991920  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991919 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 46991820  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991819 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 46991720  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | | |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  46991719 acatggatatgtctttgatgaaaacgattgcaaatgtttttcc 46991677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 48249740 - 48249297
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  48249740 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctctatgttggatgagcacaactata 48249641  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||  |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249640 cttatcactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 48249541  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtt-ggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  48249540 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttgggggtcactttgaccaatttgacatattcggttgagtttgg 48249441  T
Q  317 atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249440 atttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcatcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 48249341  T
Q  417 gatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48249340 gacaaggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 48249297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 77893 - 77450
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77893 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 77794  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  77793 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactaccatcgaagatatcttttgggctcatccaacatttgttaagttgtttaacaatttttcaacggtttt 77694  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77693 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 77594  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77593 tttttgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 77494  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcca 461  Q
    | | ||||  |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  77493 acacggatgagtctttgatgaaagcggttggaattgtttttcca 77450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 7838784 - 7839223
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7838784 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtggcaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactata 7838883  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| || ||||||| ||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838884 cttattacttaagaacataaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccgacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 7838983  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838984 ggtcatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgatttgacatattcggttgggtttgga 7839083  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7839084 tttgtgacacatgagaaagtggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 7839183  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  7839184 acagggatatgtctgtgatgaaagcggttgcaaatgtttt 7839223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 6504828 - 6504397
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6504828 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcacatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaacctcgaagttggaggagcacaactatt 6504729  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6504728 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttttttaacaattttccaaccgtttt 6504629  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504628 ggttatggactccacctacataaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttgaggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 6504529  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6504528 tttgtgacacatgaggaagaggaaaactttgtttgggtcttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgttaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaacg 6504429  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgca 449  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6504428 acacggatatgtctttgatgaaagcggttgca 6504397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21955111 - 21954673
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21955111 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatat-taatctcgaagttggaggaccacaactata 21955013  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||||||  || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955012 cttatttctcaagaaaacaaagtgaaagtaccacaatcgaagataccttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 21954913  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21954912 ggttatggactccacctacaaaacgaacatgtacaggatgccaatatttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcgattgggtttgga 21954813  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  21954812 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaacttcttacgtcaaatatgaatttgcctaaggtgactgttatcg 21954713  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21954712 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 21954673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 39 - 457
Target Start/End: Original strand, 29949193 - 29949611
Alignment:
Q  39 tcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29949193 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29949291  T
Q  138 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 237  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29949292 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29949391  T
Q  238 aaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 337  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29949392 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgagacacatgagaaaga 29949491  T
Q  338 agaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgagg 437  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  29949492 ggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatg 29949591  T
Q  438 aaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  29949592 aaagaggttgcaaatgtttt 29949611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 39 - 457
Target Start/End: Original strand, 29998347 - 29998765
Alignment:
Q  39 tcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29998347 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29998445  T
Q  138 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 237  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29998446 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29998545  T
Q  238 aaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 337  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29998546 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgagacacatgagaaaga 29998645  T
Q  338 agaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgagg 437  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  29998646 ggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatgtctttgatg 29998745  T
Q  438 aaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  29998746 aaagaggttgcaaatgtttt 29998765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 7841888 - 7841511
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7841888 aagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaacta-a 7841790  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841789 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggttcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 7841690  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7841689 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttagaccgatttgacatattcggttggatttgga 7841590  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatat 397  Q
    ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7841589 tttgtgacacatgagaacgaggaaaactttgtttgggttttaa-aatgttgcgtaaacttctttcttcaaagatgaatat 7841511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9428706 - 9428510
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428706 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 9428607  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428606 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggt 9428510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 39 - 285
Target Start/End: Original strand, 29908027 - 29908273
Alignment:
Q  39 tcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaa 137  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29908027 tcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttagag-agcacaactatacttattactcaagaacacaa 29908125  T
Q  138 cttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtaca 237  Q
      |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29908126 agtgaaagtagtacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctaca 29908225  T
Q  238 aaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 285  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29908226 aaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactt 29908273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 194 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28610616 - 28610460
Alignment:
Q  194 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||  | |||||  || ||    
T  28610616 gtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtagaagatgtcaatgtttgaggtagttggaatcacttcggccaat 28610517  T
Q  294 ttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtt 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||    
T  28610516 ttgacatattcggttggatttggatttgtgacatatgagaaagagaaaatctttgtt 28610460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 172 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9556483 - 9556331
Alignment:
Q  172 ctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggt 271  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||  |    
T  9556483 ctcatccaacatccgtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccaacttgtacaggatgtcattgtttgaaat 9556384  T
Q  272 agttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatga 324  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9556383 agttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatga 9556331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 51548259 - 51548098
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| || ||||||||||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  51548259 ttttggacttatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 51548160  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgaca 326  Q
    ||||  ||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51548159 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgaca 51548098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2284783 - 2284623
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  2284783 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactattttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 2284684  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  2284683 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttgattttgcatttatgac 2284623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4120520 - 4120360
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || | |    
T  4120520 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgaccgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgacattct 4120421  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4120420 ttgaaatagttggagtcacattaacctatttgacatattcggttggttttgtatttatgac 4120360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 33940190 - 33940350
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||| |||||||| |||  | || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  33940190 ttttggactcatccaacatcggtaaagtcgtttaacactttctcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 33940289  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33940290 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 33940350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40467934 - 40467774
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||    
T  40467934 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataaaatgtcattgt 40467835  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  40467834 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgaaatattcggttggttttgcatttatgac 40467774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 12491422 - 12491582
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| ||| || |||    
T  12491422 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccaactgttttgataatggattccgcgtacaaaatcaacttgtatagaatgtcattgt 12491521  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || || ||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  12491522 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatatttggttggttttgcatttatgac 12491582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 325
Target Start/End: Original strand, 8117907 - 8118084
Alignment:
Q  148 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacat 247  Q
    |||||||| |||| || |||| | ||||||||  |||  ||||||||||||||||||| || || |||||| | ||| | |||||||||||||||||| |    
T  8117907 atactattcaagacatattttagactcatccacaatcagttaagttgtttaacaatttcccgactgttttgataatgaattccacgtacaaaaccaactt 8118006  T
Q  248 gtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||| | |||||   |||||||| | ||||| || || | |||| || ||| |||||| ||||  |||| |||||||||    
T  8118007 gtacatgatgctgttgtttgagattgttggagtcacctaaaccaatatgaaatattcagttgattttgcatttatgac 8118084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 380
Target Start/End: Original strand, 4510548 - 4510715
Alignment:
Q  213 gttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggt 312  Q
    |||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||| |||||    |||| || || || |||||| |||||||||||| |||||| |    
T  4510548 gttttgataatggattccacgtataaaaccaacttgtacaagatgccactgtttttaatagtcggagtcacctcaacctatttgacatattaggttggtt 4510647  T
Q  313 ttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctt 380  Q
    ||| |||||| ||    ||||| ||  | ||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  4510648 ttgcatttataacgttggagaaggagaataactttaattgggttttacaaatgttgcttaaacttctt 4510715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 29355561 - 29355119
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355561 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 29355462  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355461 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 29355362  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355361 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 29355262  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355261 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 29355162  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29355161 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 29355119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 3947334 - 3946892
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947334 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 3947235  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3947234 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 3947135  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947134 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 3947035  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947034 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 3946935  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3946934 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 3946892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 44466770 - 44467212
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466770 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 44466869  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44466870 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 44466969  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466970 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 44467069  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467070 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 44467169  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44467170 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 44467212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 20350644 - 20351086
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350644 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 20350743  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20350744 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 20350843  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350844 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtttgggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 20350943  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350944 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 20351043  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20351044 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 20351086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 38774988 - 38774546
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaata-gggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774988 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatatgggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 38774889  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38774888 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 38774789  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38774788 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgaa 38774689  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774688 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 38774589  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38774588 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 38774546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 3984301 - 3984744
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984301 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 3984400  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3984401 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 3984500  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984501 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 3984600  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtta-cc 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3984601 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccc 3984700  T
Q  417 gatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3984701 gatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 3984744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 5079123 - 5079565
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079123 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcagataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 5079222  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5079223 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttcaaacggtttt 5079322  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079323 ggttacggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 5079422  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079423 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 5079522  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5079523 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 5079565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 13630604 - 13631046
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13630604 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtata 13630703  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630704 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 13630803  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630804 ggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 13630903  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630904 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 13631003  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  13631004 atagggatatgtctttgatgacagcggttgcacatatttttcc 13631046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 41455025 - 41455467
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455025 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 41455124  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455125 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatattttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 41455224  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455225 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtaaaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 41455324  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41455325 tttatgacacatgagaaagaggaaaattttgtttgggttttacaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatacctaaggtgattgttaccg 41455424  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41455425 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 41455467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 12649452 - 12649010
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  12649452 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatatctatgttggaggagcacaactata 12649353  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649352 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 12649253  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12649252 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgaa 12649153  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649152 tttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgtgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 12649053  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12649052 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 12649010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 50116636 - 50116194
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50116636 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatgtcgaagttggaggagcacaactata 50116537  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116536 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 50116437  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50116436 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttggttgggtttgga 50116337  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50116336 tttgtgacacatgagaaagagaaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcttaaggtgattgttaccg 50116237  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  50116236 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 50116194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 37016102 - 37016541
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016102 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 37016201  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016202 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 37016301  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37016302 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcatttcgaccgatttgacatatttggttgggtttgga 37016401  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37016402 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacca 37016501  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  37016502 acatggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 37016541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 38691812 - 38691373
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38691812 aagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagagatgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgatgttggaggagcacaactata 38691713  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38691712 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaatttttcaacggtttt 38691613  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691612 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 38691513  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  38691512 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagataaatatgcctgaggtgattgtgaccg 38691413  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38691412 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 38691373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 22 - 457
Target Start/End: Original strand, 46974355 - 46974791
Alignment:
Q  22 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatactt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46974355 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactatactt 46974454  T
Q  121 attgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggt 220  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46974455 attactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaatcttccaacggttttggt 46974554  T
Q  221 tatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggattt 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46974555 tatggactccacctacaaaaccaacaggtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaatcgatttgacatattcggttgggtttagattt 46974654  T
Q  321 atgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgata 420  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  46974655 gtgacacatgagaaagagaaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgcaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccgaca 46974754  T
Q  421 gggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||||| |||||||    
T  46974755 gggatatgtctttaattaaagtggttgcaaatgtttt 46974791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 51663446 - 51663885
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663446 aagcaagtgtacattgaacgtcaacaaaaatggaaggcaaatagaggtgacaataagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 51663545  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663546 cttattagtcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatcctttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 51663645  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  51663646 gattatggactctacctacaaaaccaacatgtataaaatgccagtgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatatttggttgagtttgaa 51663745  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51663746 tatgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 51663845  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  51663846 acagtgatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 51663885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 13174969 - 13175408
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13174969 aagcaagtgtacaatgaaaatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatttcaaagttggaggagcacaactata 13175068  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13175069 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgtgctcatccaacatccgctaagttgtttaacaaatttccagcggtttt 13175168  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13175169 ggttatggactccacctacaaaaccatcatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtgtgga 13175268  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  13175269 tttgtgacccatgagaaagaggaaaaatttgtttgagtttcaaaaatgttgcgtaaacttattacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgactgtgactg 13175368  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  13175369 acagggatatgtctttgatgaaagtggttgtaaatgtttt 13175408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 77 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19498277 - 19497898
Alignment:
Q  77 gttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcat 176  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||||||| ||| ||  |||||| |||| ||||||||    
T  19498277 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatttctaaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatactttt-gggctcat 19498179  T
Q  177 ccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttg 276  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19498178 ccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacccacaaaacaaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttg 19498079  T
Q  277 gggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaact 376  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19498078 gggtcacttcgaccgatttgacatattcggtaggctttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaact 19497979  T
Q  377 tctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19497978 tcttacgtcaaagataaatatgcctaaggtgattgtgacagacagggatatatctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 19497898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21943234 - 21942977
Alignment:
Q  22 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatactt 120  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21943234 caagtgtacaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggcgacaagaaactgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatgctt 21943135  T
Q  121 attgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggt 220  Q
    ||| ||||| |||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21943134 atttctcaaaaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccatcattcgttaagttgtttaacaaattttcaacggttttggt 21943035  T
Q  221 tatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 278  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21943034 tatggattccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggg 21942977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 32106516 - 32106165
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| |  | |||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  32106516 aagcaagtatgcaattaacatcaacaaatatggaagtcgaacagaggtgacaagacgatgatgcattatataatctcaaagttggaggagcacaactatg 32106417  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
     ||||| | | |||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  32106416 tttatttcaccagaacacaaagtgaaagtactactattgaagacatattttaagctcatccaacatccattaagttgtttaacaatttt----------- 32106328  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |  || |||||||||||||| ||||  ||||||    
T  32106327 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggggtcaccttgactgatttgacatattcagttgattttgga 32106228  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctt 380  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  32106227 tttttgacacatgagaaagatgacaactttgtttgggttttacaaatgatgcttaaacttctt 32106165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36360246 - 36360086
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  36360246 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcactgt 36360147  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||| | || || |||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  36360146 ttgaaatagtttgagtcacctcaacctatttgatatattcggttggttttgcatttatgac 36360086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 45472687 - 45472847
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  45472687 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatcccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 45472786  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45472787 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 45472847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 7403953 - 7404115
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgcc--aat 262  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  | |    
T  7403953 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccatatt 7404052  T
Q  263 gtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  7404053 gtttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttagttttgcatttatgac 7404115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 165 - 380
Target Start/End: Original strand, 28863225 - 28863440
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||| | | || |||||||||| |||| | || |||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  28863225 ttttggactcatccaacattcgtaaaattgtttaacactttttcgactgttttgataatggattctacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 28863324  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaat 364  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| |||||||||||| | |||| |||| ||||| |||    ||||| || || ||||||| ||||| ||||  |||    
T  28863325 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatatttgattggttttgcatttacgacgtcggagaaggaggataactttgcttgggctttacaaat 28863424  T
Q  365 gttgcgtaaacttctt 380  Q
    ||||| ||||||||||    
T  28863425 gttgcttaaacttctt 28863440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18887520 - 18887360
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |   ||||| | ||||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||| || |||    
T  18887520 ttttggtctcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgatttttttgataatggattccacgtacagaactaacttgtataagatgtcattgt 18887421  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  18887420 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattctgttggttttgcatttatgac 18887360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 325
Target Start/End: Original strand, 27283400 - 27283535
Alignment:
Q  190 agttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaac 289  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  |  |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |  ||||||| || || |||||    
T  27283400 agttgtttaacaattttccgactgttttaatattggattccacgcacaaaaccaacttgtataggatgccattatttaaaatagttggagtcacctcaac 27283499  T
Q  290 cgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27283500 ctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 27283535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44619976 - 44619905
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaata-gggtgacaagaagccgttgcaatttcta 89  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44619976 aagcaagtgtgcaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatcta 44619905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26466143 - 26466006
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||| | || | |  |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||     
T  26466143 aagcaagtatacaatgaacgtcaataaatatggaagtcatacagaggttaaaaaacggtgttgcagtttctaatctcaaagttgaaggagcacaactatg 26466044  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactatt 155  Q
     ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  26466043 tttatttctcaagaacacaaaatgaaagtactactatt 26466006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 325
Target Start/End: Original strand, 20240034 - 20240170
Alignment:
Q  189 aagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaa 288  Q
    |||||||||||||||||||  || | |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||| || || | ||    
T  20240034 aagttgtttaacaattttctgactgctttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggatgtcattgtttgaaatagttggagtcaccttaa 20240133  T
Q  289 ccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    || ||| || ||||||| |||  |||| |||||||||    
T  20240134 cctattcgaaatattcgattgattttgcatttatgac 20240170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 280
Target Start/End: Original strand, 31445866 - 31445979
Alignment:
Q  167 ttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgttt 266  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||| | || ||||||||| | ||||||||  ||||| | ||| || |||||    
T  31445866 ttgggctcatccaaaatctataaagttgtttaacactttttcaacagttttgatcatagactccacgcataaaaccaatgtgtattgaatgtcattgttt 31445965  T
Q  267 gaggtagttggggt 280  Q
     |||||||| ||||    
T  31445966 aaggtagttagggt 31445979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 86 - 195
Target Start/End: Original strand, 25231558 - 25231667
Alignment:
Q  86 tctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatcc 185  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||| | | | |||| ||  |||||||| ||| ||| |||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  25231558 tctaatctcaaaattggaggagcacaactatgtttatttcaccataacaaaaagtgaaagtactacaattaaagacatattttgggttcatccaacatac 25231657  T
Q  186 attaagttgt 195  Q
     |||||||||    
T  25231658 gttaagttgt 25231667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 303
Target Start/End: Original strand, 25231665 - 25231721
Alignment:
Q  247 tgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatatt 303  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| || || ||||||||||||||||    
T  25231665 tgtacaggataccaatgtttgagatagttagggtcacctcgaccgatttgacatatt 25231721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 2069 - 2511
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2069 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 2168  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2169 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 2268  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2269 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 2368  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2369 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 2468  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2469 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 2511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 33997 - 34439
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33997 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 34096  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34097 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 34196  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34197 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 34296  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 34396  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34397 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 34439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 30304483 - 30304041
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304483 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 30304384  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30304383 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 30304284  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304283 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 30304184  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304183 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 30304084  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30304083 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 30304041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 32431738 - 32431296
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431738 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 32431639  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32431638 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 32431539  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431538 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 32431439  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431438 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 32431339  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32431338 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 32431296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 8422729 - 8422286
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422729 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 8422630  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  8422629 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattatattgtttaacaattttccaacggtttt 8422530  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422529 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 8422430  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422429 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 8422330  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcca 461  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8422329 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcca 8422286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 7341267 - 7341709
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341267 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 7341366  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7341367 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 7341466  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341467 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 7341566  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341567 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgcttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 7341666  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7341667 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 7341709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 32377781 - 32377339
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377781 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 32377682  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32377681 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 32377582  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377581 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 32377482  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377481 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaattttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 32377382  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32377381 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 32377339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 35965618 - 35965176
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965618 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 35965519  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965518 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacagttgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 35965419  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35965418 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatatttgaggtagttggggtcccttcgaccgatttgacatattcgattgggtttgga 35965319  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  35965318 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaatatgaatatgcctaaggtgattgttactg 35965219  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  35965218 acaaggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 35965176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 43370955 - 43371394
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43370955 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagctgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacagctata 43371054  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371055 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 43371154  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371155 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgtcaacgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 43371254  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  43371255 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagataaatatgtctaaggtgattgtgaccg 43371354  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43371355 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 43371394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 2145877 - 2145441
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag------ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2145877 aagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatataatagaggtgacaagaagttgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaa 2145778  T
Q  113 ctatacttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacg 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  2145777 ctatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagttgtttaacaattttccaacg 2145678  T
Q  213 gttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggt 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2145677 gttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggt 2145578  T
Q  313 ttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgt 412  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145577 ttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttaaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgt 2145478  T
Q  413 taccgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgca 449  Q
     ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2145477 gaccgacatggatatgtctttgatgaaagcggttgca 2145441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 7169088 - 7169510
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7169088 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtg---------cgttgcaatatataatctcaaagttggatgagcacaactata 7169178  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7169179 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacgatttt 7169278  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7169279 ggttatgaactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttagggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 7169378  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7169379 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcctaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgactg 7169478  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgca 449  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7169479 acaaggatatgtctttgatgaaagcggttgca 7169510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 63 - 457
Target Start/End: Original strand, 22581061 - 22581455
Alignment:
Q  63 ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagata 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||    
T  22581061 ggtgacaagaatccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaata 22581160  T
Q  163 ttttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaat 262  Q
    | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||    
T  22581161 tcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggttttggttatggactccacctgcaaaaccaacatgtacaagatgtcaat 22581260  T
Q  263 gtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaca 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22581261 gtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatatttggttgggtttggatttgcgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaa 22581360  T
Q  363 atgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  22581361 atgttgcgtaaacttcctacgtcaaagatgaatatgccaaaggtgattgtgactgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 22581455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 19 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43689044 - 43688731
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  43689044 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatttctaatttcgaagttgggggagcacaactata 43688945  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||  || |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688944 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactataatcgaagatatcttttgggctcatccaaaatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 43688845  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688844 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 43688745  T
Q  318 tttatgacacatga 331  Q
    ||| ||||||||||    
T  43688744 tttgtgacacatga 43688731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 337
Target Start/End: Original strand, 45455564 - 45455883
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45455564 aagcaagtgtacaatcaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaaaaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatt 45455663  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||| |||||  ||||||||  || ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45455664 cttattactcaagagcacaaagtgaaagtaccacaatcaaatatattttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaatttttccaacggtttt 45455763  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45455764 ggttatggactccaccaacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttgggatcacttcgatcgatttgacatatttggttgggtttgaa 45455863  T
Q  318 tttatgacacatgagaaaga 337  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  45455864 tttgtgacacatgagaaaga 45455883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 166
Target Start/End: Original strand, 1115967 - 1116108
Alignment:
Q  26 tgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1115967 tgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttatta 1116066  T
Q  125 ctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1116067 ctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatgtttt 1116108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 324 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 43686717 - 43686584
Alignment:
Q  324 acacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgataggg 423  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  43686717 acacatgagaaagaggaaaattttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgccaaagatgaatatgactaaggtgattgtgaccgacaggg 43686618  T
Q  424 atatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43686617 atatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 43686584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39751901 - 39751772
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39751901 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaaaccattgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaacttca 39751802  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagta 147  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  39751801 cttattactcaagaacacaaagtgaaagta 39751772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 45116582 - 45116742
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  45116582 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 45116681  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  45116682 ttgaaatagttggagttacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 45116742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Original strand, 44321173 - 44321334
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  | |||    
T  44321173 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgttattgt 44321272  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgaca 326  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44321273 ttgaaatagttggagttacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgaca 44321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 131 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14401532 - 14401359
Alignment:
Q  131 aacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactcc 230  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||   |||  ||||||||||||| |||||| | |  |||||| | || |||| |    
T  14401532 aacacaatgtgaaagta-tactattcatgatatattttgggctcatcctgaatctgttaagttgtttaataatttttcgatagttttgttcatcgacttc 14401434  T
Q  231 acgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcg 305  Q
    || || |||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  14401433 acctataaaaccaacacgtataggatgtcattgtttgagatagttggggtcacctcaactgatatgacatattcg 14401359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 276
Target Start/End: Original strand, 17316787 - 17316903
Alignment:
Q  160 atattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgcc 259  Q
    |||||||||| ||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| | | ||| |||||||||||| |||| | ||||||    
T  17316787 atattttttgagctcacccacaatcatttaagttgtttaacaattttccgactgttttgatcatgaatttcacatacaaaaccaacttgtacatgatgcc 17316886  T
Q  260 aatgtttgaggtagttg 276  Q
    | |||||||| ||||||    
T  17316887 attgtttgagatagttg 17316903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 275
Target Start/End: Original strand, 17340364 - 17340452
Alignment:
Q  187 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagtt 275  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||| | ||||| | ||| |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  17340364 ttaagttgtttaacaatttcccgattgttttgatcatggatttcacatacaaaaccaacttgtacatgatgccattgtttgagatagtt 17340452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13781651 - 13781580
Alignment:
Q  198 aacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgag 269  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||  ||||||||    
T  13781651 aacacttttccgaccgttttggtcatggactccacttacaaaaccaacatctatcgaatgccgttgtttgag 13781580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 43623008 - 43622566
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623008 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 43622909  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43622908 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 43622809  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622808 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 43622709  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622708 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 43622609  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43622608 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 43622566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 617622 - 617180
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617622 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 617523  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  617522 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacgatttt 617423  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617422 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 617323  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617322 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 617223  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  617222 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 617180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 18106576 - 18107018
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106576 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 18106675  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106676 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 18106775  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106776 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgctaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 18106875  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106876 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 18106975  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18106976 atagggatatgtctttggtgaaagcggttgcacatgtttttcc 18107018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 30787727 - 30788169
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787727 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaagcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 30787826  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30787827 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 30787926  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787927 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 30788026  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788027 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 30788126  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30788127 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 30788169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 42500595 - 42501037
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500595 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 42500694  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500695 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 42500794  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500795 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 42500894  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500895 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatattgtgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 42500994  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42500995 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 42501037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 45764567 - 45765009
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764567 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 45764666  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45764667 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 45764766  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764767 ggttatggactccacgtacaagaccagcatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 45764866  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764867 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 45764966  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  45764967 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatatttttcc 45765009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 103 - 460
Target Start/End: Original strand, 15067162 - 15067519
Alignment:
Q  103 aggagcacaactatacttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067162 aggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaa 15067261  T
Q  203 ttttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatat 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067262 ttttccaacggttttggttatggactccacatacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatat 15067361  T
Q  303 tcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgccta 402  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067362 ttggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgccta 15067461  T
Q  403 aggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15067462 aggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 15067519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 47062071 - 47062511
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg--tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47062071 aagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggttgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaagagcacaactat 47062170  T
Q  117 acttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttt 216  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47062171 acttattactcaa-aacacaaagtgaaagtactacaattgaagatatctttcgggctcatccaacatccgttaagttgtttaaaaaatttccaacggttt 47062269  T
Q  217 tggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg 316  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47062270 tggttatggactccacctacaaaaccaaaatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgg 47062369  T
Q  317 atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttggg-ttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttac 415  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  47062370 atttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggtttttaaaattgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctacggtgattgtgac 47062469  T
Q  416 cgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  47062470 cgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 47062511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 43827479 - 43827040
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  43827479 aagcaagtgtacaatgaacgtcagcaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatcta-tctcgaagttgaatgagcacaactata 43827381  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43827380 cttatttcacaagaacacaaagtgaaagtactacaattgaaaatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaatggtttt 43827281  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgac-ttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43827280 ggttatggactccacctacaaaaccaacgtgtacaagatgccaatgtttgaggtagtttgggtcactttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgg 43827181  T
Q  317 atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 416  Q
    |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  43827180 atttgtgacatatgagaaagataaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgttaaagatgaatatgcttaaggtgattgtcact 43827081  T
Q  417 gatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
       |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  43827080 agcagggatatgtctttgatgaaagcggttggaaatgtttt 43827040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 222 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12117038 - 12116803
Alignment:
Q  222 atggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggattta 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12117038 atggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcggccgatttgacatattcggttgggtttggatttg 12116939  T
Q  322 tgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatag 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || |     
T  12116938 tgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagataaatatgcctaaggtgattgtgactgacat 12116839  T
Q  422 ggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12116838 ggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 12116803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 8400774 - 8401006
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8400774 aagcaagtgtacattgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagacggcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 8400873  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8400874 cttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactacaattaaagatattttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttctaacggtttt 8400973  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgta 250  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  8400974 ggttatggatttcacctacaaaaccaacatgta 8401006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 107
Target Start/End: Original strand, 15060801 - 15060890
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaata-gggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggag 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15060801 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggag 15060890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 1297321 - 1297481
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  1297321 ttttggactcatccaacatcgataaagttgtttaacatttttccaactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccatttt 1297420  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  1297421 ttgaaatagttggagccacctcaacctatttgacatattcggttggtttttcatttatgac 1297481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 342 - 457
Target Start/End: Original strand, 8401016 - 8401131
Alignment:
Q  342 aactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaag 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||| |||||    
T  8401016 aactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaagatgcctaaggtgattgtgactgacaatgatatgtctttgatgaaag 8401115  T
Q  442 cggttgcacatgtttt 457  Q
    |||||| | |||||||    
T  8401116 cggttgaaaatgtttt 8401131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40445291 - 40445076
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  40445291 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgttttgataatggattccatgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 40445192  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaat 364  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||| || || ||||||  ||||| |||   |||    
T  40445191 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgacatcggagaaggaggataactttacttgggctttgcaaat 40445092  T
Q  365 gttgcgtaaacttctt 380  Q
    ||||| ||||||||||    
T  40445091 gttgcttaaacttctt 40445076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47867225 - 47867065
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  || | |||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||    
T  47867225 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttctgactgctttgataatggactccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 47867126  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  47867125 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 47867065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 43379034 - 43378819
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | | |||    
T  43379034 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtataggattctattgt 43378935  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaat 364  Q
    ||||  ||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||   |||||| || || ||||||  ||||| |||   |||    
T  43378934 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttgattttgcatttatgacgtctgagaaggaggataactttacttgggctttgtaaat 43378835  T
Q  365 gttgcgtaaacttctt 380  Q
    ||||| ||||||||||    
T  43378834 gttgcttaaacttctt 43378819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16794339 - 16794179
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||    
T  16794339 ttttggactcatcaaacatcagtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaacaaacttgtacatgatgccattgt 16794240  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  16794239 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggtttttcatttatgac 16794179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 16795847 - 16795663
Alignment:
Q  140 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaa 239  Q
    ||||||||| ||| || ||||  | |||||| |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||    
T  16795847 tgaaagtaaaactgttcaagacttattttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacaattttccaactgttttgataatggattccatgtacaaa 16795748  T
Q  240 accaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatga 324  Q
    || ||| |||| | ||||||| |||||||  ||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16795747 acaaacttgtacatgatgccattgtttgaaatagttgaactcacttcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatga 16795663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 40794258 - 40794418
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||  |||||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||    
T  40794258 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactattttgagaatggattccacgtacaaaatcaacttgtatagaatgccattgt 40794357  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    || |  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  40794358 tttaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 40794418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45172635 - 45172475
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | || || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  45172635 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataattgattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattat 45172536  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||| | || ||||| ||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  45172535 ttgaaatagtttgagtcacttcgacctatttgacatattcagttgattttgcatttatgac 45172475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 309
Target Start/End: Original strand, 46791660 - 46791804
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||    
T  46791660 ttttggactcatccaacatcagtaaagttatttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaactaacttgtatagaatgccattgt 46791759  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttg 309  Q
    ||||  ||||||| || || || ||| ||||||||||||||||||    
T  46791760 ttgaaatagttggagtcacctcgacctatttgacatattcggttg 46791804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8194019 - 8193790
Alignment:
Q  152 tattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtat 251  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| || |||||| | ||| | |||||||||||||||||| ||||     
T  8194019 tattcaagacatattttggactcatccaacattggtaaagttgtttaataattttccgactgttttgataatgcattccacgtacaaaaccaacttgtac 8193920  T
Q  252 aggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg-atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtt 350  Q
    | ||||||| |||||||  ||||| | || || |||||  || |||||||||||||| |||| || |||||||||    ||||| || || ||||||  |    
T  8193919 atgatgccattgtttgaaatagttagagtcacctcaactaatatgacatattcggtttggttaggcatttatgacgtcggagaaggatgataactttact 8193820  T
Q  351 tgggttttaacaatgttgcgtaaacttctt 380  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  8193819 tgggctttacaaatgttgcttaaacttctt 8193790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 380
Target Start/End: Original strand, 3762154 - 3762455
Alignment:
Q  79 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 178  Q
    |||| |||||| | || |||||||| ||| |||| |||  ||||| | |||||||||||  ||| |||  ||||||| | || || |||||||||||| |    
T  3762154 tgcagtttctagtgtcaaagttggaagagtacaaatatgtttatttcacaagaacacaatgtgagagttctactattcaggacatattttgggctcattc 3762253  T
Q  179 aacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 278  Q
       |||  |||||||||||||| |||| |  |  |||||| | ||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||| | |||||||| || |||||    
T  3762254 cgaatcggttaagttgtttaacgatttcctgaaagttttgatcatggactccacctataaaaccaacttgtacatgatgcaattgtttgagataattggg 3762353  T
Q  279 gtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttc 378  Q
     | || ||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |  |||||| || || ||||||  ||||||||||   ||||||| | ||||||    
T  3762354 ttcacctcaaccgatatgaaatattcggttgcttttgcatttctgatagttgagaaggaggataactttacttgggttttacggatgttgcttcaacttc 3762453  T
Q  379 tt 380  Q
    ||    
T  3762454 tt 3762455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23559014 - 23558969
Alignment:
Q  196 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaac 241  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23559014 ttaacacttttccaaccgttttggtcatggactccacttacaaaac 23558969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 19072530 - 19072088
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072530 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 19072431  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19072430 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 19072331  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072330 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 19072231  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072230 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 19072131  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19072130 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 19072088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 3404978 - 3405420
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3404978 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 3405077  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3405078 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttcaaacggtttt 3405177  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405178 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 3405277  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405278 tttatggcacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaattttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 3405377  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3405378 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 3405420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 9891210 - 9891652
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891210 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 9891309  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891310 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttggactcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 9891409  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891410 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 9891509  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891510 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtgaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 9891609  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9891610 atagggatgtgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 9891652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 41024387 - 41024831
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024387 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaaaaagtcgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 41024486  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41024487 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 41024586  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024587 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatgtttgaggtggttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 41024686  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024687 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 41024786  T
Q  418 ataggg--atatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41024787 acagggatatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 41024831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 4769322 - 4769761
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  4769322 aagcaagtgtacaatgaatgtctacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctgatttcgaagttggaggagcacaactata 4769421  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769422 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 4769521  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769522 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgtcaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 4769621  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4769622 tttgtgacacatgagaaagagaaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaatcttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgactg 4769721  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4769722 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 4769761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 38463710 - 38463281
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463710 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatacggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 38463611  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463610 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 38463511  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463510 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgctaatgtttgaggtagttggagtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 38463411  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38463410 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaacttcttacgtcaaaaatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 38463311  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttg 447  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38463310 acagggatatgtctttgatgaaagcggttg 38463281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49565337 - 49565013
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565337 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 49565238  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49565237 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 49565138  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565137 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 49565038  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  49565037 tttatgacacatgagaaagaagaaa 49565013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4978827 - 4978392
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4978827 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaa---ggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactatac 4978731  T
Q  119 ttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttg 218  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4978730 ttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcttccaacgtctgttaagttgtttaacaattttcgaacggttttg 4978631  T
Q  219 gttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggat 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978630 gttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgtcaatgtttgaggtagttagggtcacttcgatcgatttgacatattcggttgggtttggat 4978531  T
Q  319 ttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccga 418  Q
    || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4978530 ttgtgatacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaatgatgaatatgcctaaggtgattgtgaccga 4978431  T
Q  419 tagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4978430 cagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 4978392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 11502694 - 11503136
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11502694 aagcaagtaaacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaagagcacaactata 11502793  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||   ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11502794 cttattactcaagaacacaaagagaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatcaaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 11502893  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11502894 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgaa 11502993  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11502994 tttgtgacacatgagaaagaggaatactttgtttgggttttaaaaatgttgtgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgacca 11503093  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | | ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  11503094 acatggatatgtccttgatgaaagtggttgcaaatgtttttcc 11503136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 4976943 - 4977382
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4976943 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaatgcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactata 4977042  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| || |||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977043 cttattactaaagagcacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 4977142  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977143 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 4977242  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggtttt-aacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 416  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4977243 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttggtttttaaaaaatgttgcgtaaacttcttacgt-tcagatgaatatgcctaaggtgattgtgacc 4977341  T
Q  417 gatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4977342 gacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 4977382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 435
Target Start/End: Original strand, 44049798 - 44050215
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44049798 aagcaagtgtacaacgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcgcagctata 44049897  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||| || ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44049898 cttattactcaataacacaaagtgaaactactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 44049997  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||  |    
T  44049998 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgatttgacatattcggttgggtttaaa 44050097  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  44050098 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatgtgcctaaggtgattgtgatcg 44050197  T
Q  418 atagggatatgtctttga 435  Q
    | |||||||||| |||||    
T  44050198 acagggatatgtttttga 44050215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 21471981 - 21472421
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471981 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatttaatctcgaagttggaggagcacaactata 21472080  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| || ||||||||||  |||||||| ||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21472081 cttattacttaagaacacaaagtgaaagtactaaaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 21472180  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaa-accaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21472181 ggttatggactccacctacaaacaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgatttgacatattcggttgggtttgg 21472280  T
Q  317 atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 416  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||| |||    
T  21472281 atttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacatcaaagataaatatgactaaggagattgtgacc 21472380  T
Q  417 gatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    || || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  21472381 gacagagatatgtctttaatgaaagcggttgcaaatgtttt 21472421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 425
Target Start/End: Original strand, 6182875 - 6183273
Alignment:
Q  28 tacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgct 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||| |||| || |||||||||| |  | |||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||  ||||| |     
T  6182875 tacaatgaacatcaaaaaatattcaagtcaaacagaggtgacaagacggtgatgcaatatctaatctcaaaattggaggaacacaactatgtttatttca 6182974  T
Q  127 caagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 226  Q
    | | ||||||| ||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  6182975 ccataacacaaattgaaagtactactattcaagacatattttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacagttttgattatgaa 6183074  T
Q  227 ctccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgaca 326  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||    
T  6183075 ctccatctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgagatagttggggtcatctcgaccgatttgacaaatttagttggttttggatttttgaca 6183174  T
Q  327 catgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggat 425  Q
      || |||||| || || |||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||   |||||||  |||||| |||||||| |||| || || ||||||    
T  6183175 gctgggaaagaggataattttgtttgggttttagaaacaatgcttaaacttcttaactcaaagagtaatatgtctaaggtggttgtgactgacagggat 6183273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51643372 - 51643211
Alignment:
Q  18 aaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagggt-gacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51643372 aaagcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagacgccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 51643273  T
Q  117 acttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 178  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  51643272 acttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatcc 51643211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 165 - 324
Target Start/End: Original strand, 32716628 - 32716787
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  32716628 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 32716727  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatga 324  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32716728 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatga 32716787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 1591168 - 1591328
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  1591168 ttttggactcatccaacatcagtaaagttgtttaacaatttttcgactgttttgataatggattccacgtagaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 1591267  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  1591268 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttgtgac 1591328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 325
Target Start/End: Original strand, 4617916 - 4618052
Alignment:
Q  189 aagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaa 288  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||| || || ||||    
T  4617916 aagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggacgccattgtttgaaatagttggagtcacctcaa 4618015  T
Q  289 ccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4618016 cttatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 4618052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 17916521 - 17916681
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| | ||||||||||||||   ||||||| |||||| |||    
T  17916521 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgataatggatttcacgtacaaaaccattttgtatagaatgccattgt 17916620  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17916621 ttgaaatagttggagtcaccttaacccatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 17916681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 13897526 - 13897239
Alignment:
Q  148 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacat 247  Q
    |||||||| || | || ||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||||  | || |||||| | ||||| ||| |||| ||||||||| |    
T  13897526 atactattcaatacatattttggggtcatccagaatcggttaagttgtttaacaatttctcgactgttttgatcatggattcctcgtagaaaaccaactt 13897427  T
Q  248 gtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaacttt 347  Q
    ||| | |||| || |||||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||   |||||| || || ||||||    
T  13897426 gtacatgatgtcattgtttgagatagttggagtcacctcacccgatatgacatattcggtgggttttgaatttatgacgactgagaaggaggataacttt 13897327  T
Q  348 gtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttga 435  Q
       |||| ||||   ||||||| ||||||| ||  ||||||||   ||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||    
T  13897326 acctgggctttacagatgttgcttaaactttttaagtcaaagagtgatatgcctaaggtgattgtgactgacagggatacgactttga 13897239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18580201 - 18580117
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggagg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  18580201 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgga---caaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatttaatctcgaagtttgagg 18580117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46517160 - 46517000
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||  |||||| || |||||| | ||| | |||||| |||||| |||| ||||||| ||| || |||    
T  46517160 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacgtttttccgactgttttgataatgaattccacgaacaaaatcaacttgtatagaatgtcattgt 46517061  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46517060 ttgaaatagttggagacacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 46517000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 326
Target Start/End: Original strand, 17496893 - 17497019
Alignment:
Q  200 caattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgaca 299  Q
    ||||||||| ||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||  ||||||| || || |||||| ||| ||||    
T  17496893 caattttccgactattttgataatggattccacgtacaaaaccaatttgtataagatgtcattgtttgaaatagttggagtcacctcaacctattagaca 17496992  T
Q  300 tattcggttgggtttggatttatgaca 326  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17496993 tattcggttggttttgcatttatgaca 17497019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 299
Target Start/End: Original strand, 34979909 - 34980022
Alignment:
Q  186 attaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgactt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |  ||| || |||||||| |||||||||| || |    
T  34979909 attaagttgtttaacaattttctgtctattttggtcatggacttcacctataaaaccaacatgtacataatgtcattgtttgagatagttggggtcacct 34980008  T
Q  286 caaccgatttgaca 299  Q
     ||||||| |||||    
T  34980009 taaccgatatgaca 34980022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20971248 - 20971086
Alignment:
Q  148 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacat 247  Q
    |||| ||| |||| || |||||| ||||||||  |||  ||||||| ||||| ||||| || || |||||| | || || ||||| |||||||||||| |    
T  20971248 atacaattcaagacatattttggactcatccacaatcggttaagttttttaataatttcccgactgttttgataatagattccacatacaaaaccaacgt 20971149  T
Q  248 gtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgg 310  Q
    | | | |||| || |||||||| | |||||  | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20971148 gaacatgatgtcattgtttgagattgttggattcacctcaaccgatatgacatattcggttgg 20971086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 419; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 5348355 - 5348797
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348355 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 5348454  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5348455 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 5348554  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348555 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 5348654  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348655 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 5348754  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5348755 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 5348797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27275233 - 27274791
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275233 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 27275134  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275133 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 27275034  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275033 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 27274934  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274933 tttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 27274834  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27274833 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 27274791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 41561200 - 41561642
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561200 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 41561299  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41561300 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 41561399  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561400 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 41561499  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561500 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 41561599  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41561600 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 41561642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 212314 - 211872
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212314 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 212215  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  212214 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 212115  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212114 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 212015  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  212014 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcataaggtgattgttaccg 211915  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  211914 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 211872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 10623327 - 10622885
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623327 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 10623228  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10623227 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatctaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 10623128  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623127 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 10623028  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623027 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 10622928  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10622927 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 10622885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 38946951 - 38947393
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38946951 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 38947050  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947051 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 38947150  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38947151 ggttatggactccacgtacaagaccaacatgtataagatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaactgatttgacatattcggttgggtttgga 38947250  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947251 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttttttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 38947350  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38947351 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 38947393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 39795158 - 39795600
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39795158 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtata 39795257  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795258 cttattactcaagaacacaacttgatagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 39795357  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795358 ggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 39795457  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795458 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 39795557  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39795558 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 39795600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 3802439 - 3801997
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3802439 aagcaagtgtacaatgaacttcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttgaaggagcacaactata 3802340  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802339 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacttccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 3802240  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg-tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3802239 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgttttgaggtagtt-gggtgacttcaaccgacttgacatattcagttgggtttgg 3802141  T
Q  317 atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802140 atttatgacacatgagaaagaggaaaattttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttttgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 3802041  T
Q  417 gatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3802040 gatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 3801997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 458
Target Start/End: Original strand, 24750846 - 24751287
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750846 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 24750945  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750946 cttattactcaagaatacaaagtgaaagtaatacgatcaaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 24751045  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgt-ataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751046 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgttataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgg 24751145  T
Q  317 atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 416  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751146 atttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 24751245  T
Q  417 gatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgttttt 458  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24751246 gatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgttttt 24751287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 460
Target Start/End: Original strand, 7264229 - 7264610
Alignment:
Q  79 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatcc 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7264229 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaataccattgaagatattttttaggctcatcc 7264328  T
Q  179 aacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 278  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7264329 aacatccattaagtagttaaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaattaacatgtataggatgccaatgtttgatgtagttggg 7264428  T
Q  279 gtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttc 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7264429 gtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttc 7264528  T
Q  379 tttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7264529 tttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttatcgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 7264610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 1098699 - 1098260
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098699 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 1098600  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    ||||||  ||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098599 cttattattcaagaacacaaagtgaaagtactacaaccgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 1098500  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  1098499 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcacatcgaccgatttgacataatcggttgggtttaga 1098400  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1098399 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagaggaatatgcctaaggtgattgttaccg 1098300  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1098299 atagggaattgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 1098260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24604962 - 24604523
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604962 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatagggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 24604863  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604862 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcaaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 24604763  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24604762 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgattggacatattcggttgggtttgga 24604663  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24604662 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 24604563  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24604562 acagggatatttctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 24604523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 43949155 - 43948716
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43949155 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatataggtgacaagaagccgttgcgttatctaatctcgaagttagaggagcacaactata 43949056  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949055 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 43948956  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  43948955 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttctactgatttgacatattcggttgggtttgaa 43948856  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43948855 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaaattcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 43948756  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  43948755 acagagatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 43948716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 45476546 - 45476984
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476546 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaa-tatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 45476644  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476645 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 45476744  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45476745 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaacgatctgacatattcggtttggtttgga 45476844  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  45476845 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacatcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgactg 45476944  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | || |||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  45476945 acagtgatatgtctttgataaaagcggttgcaaatgtttt 45476984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 12907365 - 12906923
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12907365 aagcaagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttcaaatttcgaagttggaggagcacaactata 12907266  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12907265 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaaaatatcttttggactcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggattt 12907166  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12907165 ggttatggacttcacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggtttggtttgga 12907066  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  12907065 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatattgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattatgactg 12906966  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  12906965 acagtgatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatatttttcc 12906923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34920655 - 34920216
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  34920655 aagcaagtgtacaatgaaattcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatttcgaagttggaggagcacacttata 34920556  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34920555 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaatattccaacggtttt 34920456  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34920455 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgatatattcggttgggtttgga 34920356  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || |    
T  34920355 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctatgatgattgtgactg 34920256  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  34920255 acagggatatgtctttgatgaaagcggatgcaaatgtttt 34920216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 41007853 - 41007407
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007853 aagcaagtctaaaatgaacgtcaacaaatatgtaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 41007754  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41007753 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaatttctcaacggtttt 41007654  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  41007653 gattatggactccacctacaaaactaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgatatattcggttgggtttcga 41007554  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41007553 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttaggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 41007454  T
Q  418 ataggg----atatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | ||||    ||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  41007453 acagggatatatatgtcattgatgaaagcggttgcaaatatttttcc 41007407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 19 - 449
Target Start/End: Original strand, 436499 - 436931
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  436499 aagcaattgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacatctata 436598  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    ||||||  |||||||||||   |||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436599 cttattattcaagaacacatagtgaaagtactacaatctaagatatcttttgggctcatctaacatcttttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 436698  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatg-tttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg 316  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  436699 gattatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatggtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattccgttgggtttgg 436798  T
Q  317 atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacc 416  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  436799 atttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgttaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgact 436898  T
Q  417 gatagggatatgtctttgaggaaagcggttgca 449  Q
    || |||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  436899 gacagggatatgtcttttatgaaagtggttgca 436931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 23 - 457
Target Start/End: Original strand, 9655348 - 9655782
Alignment:
Q  23 aagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatactta 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  9655348 aagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatgtcgaagttgaaggagcacaactatattta 9655447  T
Q  122 ttgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggtt 221  Q
    || |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9655448 ttactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttgatt 9655547  T
Q  222 atggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggattta 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9655548 atggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttggggtcatttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttg 9655647  T
Q  322 tgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatag 421  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  9655648 taacacatgagaaa-aggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcataaacttcttacgtcaaagattaatatacctaaggtgattgtgaccgacag 9655746  T
Q  422 ggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||    
T  9655747 ggatatgtctatgatgaaagcagttgcaaatgtttt 9655782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 11692688 - 11692261
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagggt-gacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11692688 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagaagccgttgcaatatttaatctcgaaattggaggagcacaactata 11692589  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| || ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11692588 cttattactcaagaacacaaagtgaaattactacaatagaagatatattttgggcccatccaacatccgttaagttgtttaagaattttccaacggtttt 11692489  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||               ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11692488 ggttatggactccacctacaa---------------gatgccaatgtttaaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcagttgggtttgga 11692404  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  11692403 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagttgaatatgcctaaggtgattgtgactg 11692304  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  11692303 acagggatatgtctttgatgaaagtggttgcaaatgtttttcc 11692261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 17997045 - 17996656
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  17997045 aagcaagtatacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatagaggtgacaagacgatgttgtagtttctaatctcaaagttggaggagcacaactgtg 17996946  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
     ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17996945 tttatttctcaagaacacaaagtgaaagtactactattgaagatatcttttaggctcatccaacatccgttacgttgtttaacaatattccaatggtttt 17996846  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17996845 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaagatgccaatgtttgagatagttggggtcacctcgaccgatttgacatatttggttggctttgga 17996746  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtg 407  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17996745 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtgtggtttttacaaatgatgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctagggtg 17996656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 187 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24941354 - 24941084
Alignment:
Q  187 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttc 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24941354 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttc 24941255  T
Q  287 aaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtca 386  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24941254 gatcgattggacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgagttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtca 24941155  T
Q  387 aagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24941154 aagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccgacagggatatttctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 24941084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28354775 - 28354549
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354775 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatataggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 28354676  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354675 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 28354576  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaa 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28354575 ggttatggactccacctacaaaaccaa 28354549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 380
Target Start/End: Original strand, 21535507 - 21535733
Alignment:
Q  148 atactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacat 247  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||   |||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||      | |||||||||||    
T  21535507 atactattcaagacatattttgggctcatcctcaatcagttaggttggttaacaattttccaacagttttggttatggact------ataaaaccaacat 21535600  T
Q  248 gtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaacttt 347  Q
    ||| | ||||||| | |||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||| || ||||||   |||||| || || ||||||    
T  21535601 gtacatgatgccactatttgagatagttggggtcacctcaactgatatgacatattcggttggttttgcatatatgacgggtgagaaggaggataacttt 21535700  T
Q  348 gtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctt 380  Q
       |||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  21535701 acctgggctttacaaatgttgcttaaacttctt 21535733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28423225 - 28423061
Alignment:
Q  140 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaa 239  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||| || || |||||| | ||||  ||||||||||||    
T  28423225 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaatttcccgactgttttgataatgggttccacgtacaaa 28423126  T
Q  240 accaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattc 304  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||||||  ||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  28423125 accaacttgtacatgatgccattgtttgaaatagttggagtcacctcaaccgatgtgacatattc 28423061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 377 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28347911 - 28347831
Alignment:
Q  377 tctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  28347911 tcttacgtcaaagatgaatatgtctaaggtgattgtgaccgacatggatatgtctttgatgaaagcggttgaaaatgtttt 28347831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3353985 - 3353894
Alignment:
Q  187 ttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggg 278  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||    
T  3353985 ttaaattgtttaacaatttttcgactgttttgatcatggactccacctataaaaccaacatgtacaggatgttattgtttgagatagttggg 3353894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Original strand, 35001701 - 35001741
Alignment:
Q  204 tttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaa 244  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35001701 tttccaaccgttttggtcatggactccacttacaaaaccaa 35001741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1611624 - 1611182
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611624 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 1611525  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1611524 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaaattgtttaacaattttccaacggtttt 1611425  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611424 ggttatggactccacgtacaagaccaacatttataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 1611325  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611324 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttagcaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 1611225  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1611224 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 1611182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 460
Target Start/End: Original strand, 28357557 - 28357948
Alignment:
Q  69 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatttttt 168  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28357557 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatctttt 28357656  T
Q  169 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28357657 gggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaagaccaacatgtataggatgcaaatgtttga 28357756  T
Q  269 ggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttg 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28357757 ggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttg 28357856  T
Q  369 cgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28357857 cgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 28357948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 31147510 - 31147949
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147510 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 31147609  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147610 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatacaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 31147709  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147710 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttgtgttcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 31147809  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147810 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgtttggtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 31147909  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  31147910 acagggatatgtctttgatgaaagtggttgcaaatgtttt 31147949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 29287821 - 29287411
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29287821 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgc----tctaatatcgaagttggaggagcacaactata 29287726  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  29287725 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaatttgtttaa-aattttccaacggtttt 29287627  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29287626 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgatcgatttgacatattcggttggatttgga 29287527  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29287526 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 29287427  T
Q  418 atagggatatgtcttt 433  Q
    ||||||||||||||||    
T  29287426 atagggatatgtcttt 29287411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 42 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21358200 - 21357784
Alignment:
Q  42 acaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaactt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  21358200 acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagt 21358101  T
Q  141 gaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaa 240  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21358100 gaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaa 21358001  T
Q  241 ccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaaga 340  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  21358000 ccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttcgggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacaaatgagaaagagga 21357901  T
Q  341 aaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaa 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || || |  ||||||||||||| ||||    
T  21357900 aaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtagacttcttacgtcaaggatgaatatgcctagggtgactgtgactgacaaagatatgtctttgatgaaa 21357801  T
Q  441 gcggttgcacatgtttt 457  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  21357800 gcggtcgcaaatgtttt 21357784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 42 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23962182 - 23961766
Alignment:
Q  42 acaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatacttattgctcaagaacacaactt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |    
T  23962182 acaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttcgaggagcacaactatacttatttgtcaagaacacaaagt 23962083  T
Q  141 gaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaa 240  Q
    ||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23962082 gaaagtactacaatcgaagatatattttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacctacaaaa 23961983  T
Q  241 ccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaaga 340  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  23961982 ccaacatgtacaagatgccaatgtttgaggtagttcgggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacaaatgagaaagagga 23961883  T
Q  341 aaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtctttgaggaaa 440  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||| || || |  ||||||||||||| ||||    
T  23961882 aaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtagacttcttacgtcaaggatgaatatgcctagggtgactgtgactgacaaagatatgtctttgatgaaa 23961783  T
Q  441 gcggttgcacatgtttt 457  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  23961782 gcggtcgcaaatgtttt 23961766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 18607184 - 18607623
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| |||    
T  18607184 aagcaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatatctaatttttaagttggaggagcacaacaata 18607283  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607284 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacattcgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 18607383  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18607384 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatatttgaagtagttggggtcacttcgacagatttgacatattcgattgggtttaga 18607483  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||    
T  18607484 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgtgtaaacatcttacgtcaaagatgaatcaacctaatgtgattgtgaccg 18607583  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18607584 acatggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 18607623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 9095463 - 9095623
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||    
T  9095463 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacacttttccgactgttttgatcatggattccacgtacaaagccaacttgtatagaatgtcattgt 9095562  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9095563 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 9095623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 62
Target Start/End: Original strand, 28251084 - 28251127
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251084 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag 28251127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 305
Target Start/End: Original strand, 31196905 - 31197045
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||||  | ||||  ||| |||| ||||||||| |||    
T  31196905 ttttgggctcatctcgaatcgattaagttgtttaacaattttccaacagttttgatccttgactccaccaataaaataaacttgtacaggatgccattgt 31197004  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcg 305  Q
    ||| | || ||| ||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  31197005 ttgtgataattgaggtcacctcaaccgatatgacaaattcg 31197045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 305
Target Start/End: Original strand, 31176265 - 31176443
Alignment:
Q  127 caagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatgga 226  Q
    |||||||||||  ||| |||  || |||| |||| || |||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||    
T  31176265 caagaacacaatatgagagtgctattattcaagacatattttgggctcatctcgaatcgattaagttgtttaacaattttccaacagttttgatccttga 31176364  T
Q  227 ctccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcg 305  Q
    ||||||  | ||||   || |||| ||||||||| |||||| | || ||| ||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  31176365 ctccaccaataaaatagacttgtacaggatgccattgtttgtgataattgaggtcacctcaaccgatatgacaaattcg 31176443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 70
Target Start/End: Original strand, 24220360 - 24220408
Alignment:
Q  23 aagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaa 70  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24220360 aagtgtaaaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 24220408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 238 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34111372 - 34111230
Alignment:
Q  238 aaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 337  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||| || ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||| |||||  |||| |||| ||| |  ||||||||     
T  34111372 aaaccaacatgtacaagatgccgatgtttaagatagttagggtcacctcagccgatatgacatatttggttgcttttgcatttctgatagttgagaaagt 34111273  T
Q  338 agaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctt 380  Q
     || ||||||  ||||||||||   ||||||| | ||||||||    
T  34111272 ggagaactttacttgggttttacagatgttgcttcaacttctt 34111230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 37819750 - 37819308
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819750 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 37819651  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819650 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 37819551  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37819550 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttaggtttgga 37819451  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37819450 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagctgaatatgcctaaggtgattgttaccg 37819351  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37819350 agagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 37819308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 11032325 - 11031883
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11032325 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtata 11032226  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032225 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 11032126  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032125 ggttatggactcgacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 11032026  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032025 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 11031926  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11031925 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 11031883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 38859063 - 38858621
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38859063 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaagtata 38858964  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858963 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 38858864  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858863 ggttatggactcgacgtacaaaaccaacatatataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 38858764  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858763 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaaagatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 38858664  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38858663 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 38858621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 34078968 - 34079410
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078968 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 34079067  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079068 cttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 34079167  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079168 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 34079267  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079268 tttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcataaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 34079367  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34079368 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 34079410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27866718 - 27866276
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866718 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaaacctttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 27866619  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866618 cttattactcaagaacacaacgtgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 27866519  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866518 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggaggccaatgtttgaggtggttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 27866419  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866418 tttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 27866319  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27866318 atagggatatgtctttgatgaaagcgattgcacatgtttttcc 27866276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 460
Target Start/End: Original strand, 1036542 - 1036981
Alignment:
Q  22 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactatactt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036542 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatactt 1036641  T
Q  121 attgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggt 220  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036642 attactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatctaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggt 1036741  T
Q  221 tatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggattt 320  Q
    || |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036742 tacggactcaacctacaaaatcaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggattt 1036841  T
Q  321 atgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgata 420  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036842 atgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcataaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgata 1036941  T
Q  421 gggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1036942 gggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 1036981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28885281 - 28884901
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885281 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 28885182  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885181 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 28885082  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28885081 ggttatggattccacgtacgaaaccaacatgtattggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacataatccgttgggtttgga 28884982  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatg 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884981 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttggattttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatg 28884901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 13566964 - 13566538
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566964 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 13566865  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||                ||||||    
T  13566864 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatacaattgaagatatcttttgggatcattcaacatccattaagttgt----------------ggtttt 13566781  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566780 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtctaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 13566681  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566680 tttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 13566581  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13566580 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 13566538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 25895974 - 25895528
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaa----gttggaggagcacaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |     ||||||||||||||||    
T  25895974 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatatctatatatgttggaggagcacaac 25895875  T
Q  114 tatacttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacgg 213  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895874 tatacttattactcaagaacacaaagtgagagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacgg 25895775  T
Q  214 ttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtt 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  25895774 ttttggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgcttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcgggtgagtt 25895675  T
Q  314 tggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895674 tggatttatgacacatgagaaagaggaaaactttttttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtt 25895575  T
Q  414 accgatagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25895574 accgacagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 25895528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18537209 - 18536770
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537209 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 18537110  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18537109 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaatggtttt 18537010  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537009 ggttatggactccacctacaaaactaacatgtacaagatgctaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 18536910  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18536909 tttgtgacgcatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacatcagagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 18536810  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18536809 acaaggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 18536770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 19 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 4202812 - 4202388
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202812 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 4202713  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4202712 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacagtttt 4202613  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4202612 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacatgatgccaatgtttgaggtagttgaggtcacttcgaccgatttgacatattctgttgggtttgga 4202513  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4202512 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 4202413  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagc 442  Q
    | || ||||||||||||| ||||||    
T  4202412 acagagatatgtctttgatgaaagc 4202388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 7799879 - 7799440
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799879 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 7799780  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799779 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttgggctcatccaacatccgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 7799680  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7799679 ggttaaggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttaacatattcggttgggtttgga 7799580  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7799579 tttgtgagacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgtgaccg 7799480  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | | ||||||||||| || |||||| | |||| |||||||    
T  7799479 acatggatatgtcttcgatgaaagcagatgcaaatgtttt 7799440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 19 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7020753 - 7020419
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7020753 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacatctata 7020654  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020653 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatatcttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 7020554  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7020553 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttaga 7020454  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttg 352  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7020453 tttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttg 7020419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 412
Target Start/End: Original strand, 20287456 - 20287851
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||| |  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  20287456 aagcaagtatataatgaacgtcaataaatatgaaagtcaaacagaggtgacaagacggggttccagtttctaatctcaaagttggaggagcacaattatg 20287555  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgttt-aacaattttccaacggttt 216  Q
     ||||| |||||||||| |   | |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  20287556 tttatttctcaagaacaaatggtcaaagtactactattgaagacatattttgcgctcatccaacatccgttaagtttttttaacaattttccaacggttc 20287655  T
Q  217 tggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgg 316  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20287656 tggttatggactccacctaccaaaccaacatgtacaagatgcctatgtttgagatagttggggtcacctcgaccgatttgacatattcggttggctttga 20287755  T
Q  317 atttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgt 412  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||||| ||||    
T  20287756 atttgtgacgcatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttacaaatgatgtgtaaacttcttacgtcaaggatgaatgttcctaaggtggttgt 20287851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Original strand, 20286197 - 20286424
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||    | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  20286197 aagcaagtatacaatgaacatcaacaaatatggaagtcaaacagaggtgacaagactgtggtgcagtttctaatctcaaagttggaggagcacaattatc 20286296  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
     ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  20286297 tttatttctcaataacacaaaatgaaagtactactattgaagacatattttgggctcatccaacatccgcttagttg-ttatgaattttccaacagtttt 20286395  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaaca 246  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  20286396 ggttatggactccacctacctaaccaaca 20286424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 165 - 380
Target Start/End: Original strand, 11819551 - 11819766
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  11819551 ttttggactcatccaaaatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtataggatgctattgt 11819650  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaat 364  Q
    ||||  ||||||| || || | |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    ||||| || || ||||||  ||||| ||| | |||    
T  11819651 ttgaaatagttggagtcaccttaacttatttgacatattcggttggttttgcatttatgacgtcggagaaggaggataactttacttgggctttgaaaat 11819750  T
Q  365 gttgcgtaaacttctt 380  Q
    ||||| ||||||||||    
T  11819751 gttgcttaaacttctt 11819766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27013395 - 27013235
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||| | || || |||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  27013395 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacaattttccgactgttttgataatagattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 27013296  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  27013295 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattctgttggttttgcatttatgac 27013235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 6553124 - 6553284
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||    
T  6553124 ttttggactcatccaacttcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaatttgtatagaatgccattgt 6553223  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  |||| || || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6553224 ttgaaatagtgggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 6553284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 42343826 - 42343985
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  42343826 ttttggactcatccaacatc-agtatattgtttaacacttttccgactgttttgataatggattccacatacaaaaccaacttgtatagaatgccattgt 42343924  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  42343925 ttgaaatagttggagtaacctcaacctatttgacatattcggttagttttgcatttatgac 42343985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Original strand, 43295549 - 43295709
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| |||| | || |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| || | |    
T  43295549 ttttggactcatccaacatcggtaaagttgtttaacactttttcgactgttttgataatggattccacgtacaaaaccaacttgtatagaatgtcattat 43295648  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  43295649 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggtttgttctgcatttatgac 43295709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 245
Target Start/End: Original strand, 25053043 - 25053148
Alignment:
Q  140 tgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaa 239  Q
    ||||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||  | |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  25053043 tgaaagtcaaactattcaagacatattttggactcatccaatatcgataaagctgtttaacaattttccggctgttttgataatggattccacgtacaaa 25053142  T
Q  240 accaac 245  Q
    ||||||    
T  25053143 accaac 25053148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9376440 - 9376353
Alignment:
Q  222 atggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttg 309  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||| || ||||| ||| || ||||||||||||    
T  9376440 atggaccccacctataaaaccaacatgtacaagatgccattgtttgagatagttgaggtcacctcaacagatatgccatattcggttg 9376353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 424 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 28884905 - 28884869
Alignment:
Q  424 atatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28884905 atatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 28884869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14218223 - 14218175
Alignment:
Q  196 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaa 244  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14218223 ttaacacttttccgaccgttttggtcatggactccacttacaaaaccaa 14218175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 196 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20162344 - 20162236
Alignment:
Q  196 ttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgattt 295  Q
    |||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| || |||||| | |||||  ||||||| || || || |||||  |    
T  20162344 ttaacatttctccaaccgttttggtcatggactccacttataaaatcaatatgtacagaatgccattatttgatatagttggtgttacctctaccgacat 20162245  T
Q  296 gacatattc 304  Q
    |||||||||    
T  20162244 gacatattc 20162236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 399; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16230 - 15788
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggg-tgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16230 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaacgcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 16131  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16130 cttattactcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacttccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 16031  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16030 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgaa 15931  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15930 tttatgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatgtgcctaaggtgattgttaccg 15831  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15830 atagggatatgtctttgatgaaagcggttgcacatgtttttcc 15788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 457
Target Start/End: Original strand, 17257 - 17696
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactata 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17257 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgaaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactata 17356  T
Q  118 cttattgctcaagaacacaacttgaaagtaatactattgaagatattttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggtttt 217  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17357 cttattactcaagaacacaaagtgaaagtactacaatcgaagatatcttttaggctcatccaacatctgttaagttgtttaacaattttccaacggtttt 17456  T
Q  218 ggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttgga 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457 ggttatggactccacctacaaaaccaacatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcactttgaccgatttgacatattcggttgggtttgga 17556  T
Q  318 tttatgacacatgagaaagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccg 417  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17557 tttgtgacacatgagaaagaggaaaactttgtttgggttttaaaaatgttgcgtaaacttcttacgtcaaagatgaatatgcataaggtgattgtgaccg 17656  T
Q  418 atagggatatgtctttgaggaaagcggttgcacatgtttt 457  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17657 acagggatatgtctttgatgaaagcggttgcaaatgtttt 17696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 234 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 25603 - 25377
Alignment:
Q  234 tacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgaga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25603 tacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccaatttgacatattcggttgggtttggatttatgacatatgaga 25504  T
Q  334 aagaagaaaactttgtttgggttttaacaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttaccgatagggatatgtcttt 433  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  25503 aagaggaaaactttgttttggttttaaaaatgttgcgtaaacttctttcgtcaaagatgaatatgcctaaggtgattgttacctacattgatatgtcttt 25404  T
Q  434 gaggaaagcggttgcacatgtttttcc 460  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||    
T  25403 gatgaaagcggttgcaaatgtttttcc 25377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 147
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12580
Alignment:
Q  19 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaa-ggcaaatag-ggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12450 aagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatcgaaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 12549  T
Q  117 acttattgctcaagaacacaacttgaaagta 147  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  12550 acttattactcaagaacacaaagtgaaagta 12580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 241 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 100 - 4
Alignment:
Q  241 ccaacatgtataggatgccaatgtttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgacacatgagaaaga 337  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  100 ccaagatgtacaggatgccaatgtttgaggtagttggggtcacttcgaccgatttgacatattcggttgggtttggatttgtgacacatgagaaaga 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28612 - 28452
Alignment:
Q  165 ttttgggctcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgt 264  Q
    |||||| |||||||||||||  | || |||||||||| |||||| || |||||| | ||||| || || || ||||||||| ||||||| ||| || |||    
T  28612 ttttggactcatccaacatcggtaaaattgtttaacacttttccgactgttttgataatggattctacataaaaaaccaacttgtatagaatgtcattgt 28513  T
Q  265 ttgaggtagttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttgggtttggatttatgac 325  Q
    ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28512 ttgaaatagttggagtcacctcaacctatttgacatattcggttggttttgcatttatgac 28452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 309
Target Start/End: Original strand, 4179 - 4315
Alignment:
Q  173 tcatccaacatccattaagttgtttaacaattttccaacggttttggttatggactccacgtacaaaaccaacatgtataggatgccaatgtttgaggta 272  Q
    |||||||||||   | |||||||||||||||||||  || |||||| | ||||| ||||| || ||||||||| |||| |  |||||| |||||||  ||    
T  4179 tcatccaacattggtaaagttgtttaacaattttctgactgttttgataatggattccacatataaaaccaacttgtagaaaatgccattgtttgaaata 4278  T
Q  273 gttggggtgacttcaaccgatttgacatattcggttg 309  Q
    ||||| || || |||||  ||||||||||||||||||    
T  4279 gttggagtcacctcaacatatttgacatattcggttg 4315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University