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Alignment Overview

Query: NF3762_low_3 (Length: 783)

Name: NF3762_low_3
Description: NF3762
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3762_low_3
NF3762_low_3
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (1-577)||(21401675-21402255)
chr4 (577-745)||(54897328-54897495)
chr4 (576-745)||(789528-789696)
chr4 (578-745)||(32202481-32202646)
chr4 (609-739)||(28755646-28755774)
chr4 (578-745)||(7768958-7769124)
chr4 (578-745)||(29591209-29591375)
chr4 (577-744)||(43944528-43944693)
chr4 (585-747)||(50619104-50619264)
chr4 (577-737)||(12356272-12356431)
chr4 (578-745)||(16536068-16536234)
chr4 (608-735)||(37987965-37988091)
chr4 (584-739)||(54655883-54656036)
chr4 (605-739)||(24679670-24679802)
chr4 (577-745)||(4268821-4268988)
chr4 (628-745)||(15186263-15186378)
chr4 (624-741)||(39843931-39844046)
chr4 (578-745)||(18067879-18068045)
chr4 (578-745)||(32217065-32217230)
chr4 (577-739)||(6164120-6164280)
chr4 (578-744)||(33108673-33108837)
chr4 (606-739)||(4089168-4089300)
chr4 (578-734)||(4220226-4220380)
chr4 (605-737)||(19503132-19503263)
chr4 (578-745)||(43202384-43202549)
chr4 (608-739)||(42898774-42898906)
chr4 (587-745)||(47231881-47232038)
chr4 (624-739)||(54945826-54945938)
chr4 (578-735)||(36395129-36395285)
chr4 (584-708)||(30387140-30387265)
chr4 (587-738)||(53655887-53656037)
chr4 (624-738)||(31680510-31680622)
chr4 (606-731)||(46148973-46149097)
chr4 (577-748)||(5091611-5091779)
chr4 (606-745)||(30154191-30154328)
chr4 (636-739)||(54054574-54054675)
chr4 (628-738)||(52533836-52533944)
chr4 (620-739)||(49915185-49915303)
chr4 (647-742)||(42815132-42815225)
chr4 (611-744)||(3783534-3783666)
chr4 (577-699)||(39877246-39877371)
chr4 (635-744)||(55882705-55882811)
chr4 (578-698)||(16820917-16821038)
chr4 (636-739)||(46688264-46688370)
chr4 (605-738)||(50603254-50603387)
chr4 (667-739)||(50167617-50167685)
chr4 (580-739)||(1432550-1432702)
chr4 (642-721)||(53268764-53268840)
chr4 (610-734)||(52697083-52697205)
chr4 (606-701)||(31517227-31517324)
chr4 (578-684)||(53003956-53004063)
chr4 (666-708)||(41265514-41265556)
chr4 (630-688)||(8133782-8133840)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (577-745)||(29993486-29993653)
chr7 (576-739)||(24798401-24798563)
chr7 (577-745)||(24438497-24438664)
chr7 (606-746)||(23363195-23363334)
chr7 (584-739)||(1737006-1737159)
chr7 (610-744)||(5239306-5239439)
chr7 (630-745)||(30810675-30810788)
chr7 (578-744)||(34606282-34606447)
chr7 (605-742)||(8754612-8754748)
chr7 (579-737)||(11686324-11686482)
chr7 (608-744)||(47083076-47083211)
chr7 (578-745)||(34333304-34333469)
chr7 (608-738)||(28587936-28588065)
chr7 (584-745)||(18485981-18486141)
chr7 (576-739)||(4628592-4628754)
chr7 (606-745)||(12218464-12218602)
chr7 (606-745)||(43594064-43594202)
chr7 (576-738)||(525074-525234)
chr7 (606-736)||(45045799-45045928)
chr7 (628-746)||(47839511-47839627)
chr7 (579-746)||(5729365-5729531)
chr7 (606-739)||(47657006-47657136)
chr7 (578-739)||(42044294-42044453)
chr7 (606-735)||(13064904-13065033)
chr7 (636-734)||(34546373-34546469)
chr7 (606-738)||(7689228-7689359)
chr7 (642-739)||(27456178-27456273)
chr7 (606-733)||(18117175-18117301)
chr7 (628-743)||(46716660-46716773)
chr7 (606-738)||(33636479-33636610)
chr7 (642-744)||(37631607-37631707)
chr7 (642-708)||(37674169-37674235)
chr7 (630-720)||(22739868-22739957)
chr7 (608-734)||(28262062-28262182)
chr7 (579-742)||(23357711-23357870)
chr7 (666-738)||(4087650-4087720)
chr7 (652-735)||(29835779-29835860)
chr7 (665-739)||(4100612-4100684)
chr7 (630-739)||(18469993-18470099)
chr7 (666-734)||(3021922-3021988)
chr7 (622-701)||(13556474-13556553)
chr7 (666-737)||(36437405-36437474)
chr7 (629-688)||(47118041-47118100)
chr7 (578-734)||(38128322-38128478)
chr7 (666-734)||(18220527-18220593)
chr7 (666-721)||(18220759-18220812)
chr7 (670-736)||(18220624-18220688)
chr7 (577-649)||(6097451-6097524)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (583-747)||(2350670-2350833)
chr6 (578-745)||(392116-392282)
chr6 (577-739)||(12145116-12145277)
chr6 (578-744)||(23402159-23402324)
chr6 (578-739)||(26467124-26467284)
chr6 (578-745)||(32929508-32929674)
chr6 (578-745)||(4215715-4215881)
chr6 (577-739)||(3515792-3515953)
chr6 (578-739)||(18276612-18276775)
chr6 (578-737)||(2580980-2581138)
chr6 (585-739)||(13416967-13417122)
chr6 (584-735)||(32985199-32985349)
chr6 (606-733)||(34851877-34852003)
chr6 (578-745)||(27433512-27433678)
chr6 (576-737)||(1391176-1391336)
chr6 (576-738)||(35043917-35044076)
chr6 (610-739)||(7851191-7851319)
chr6 (609-739)||(29451146-29451275)
chr6 (606-741)||(1840275-1840409)
chr6 (584-739)||(3026015-3026169)
chr6 (610-737)||(12525747-12525873)
chr6 (579-741)||(5323424-5323585)
chr6 (636-739)||(20897974-20898075)
chr6 (628-739)||(21878398-21878507)
chr6 (636-739)||(34477609-34477710)
chr6 (578-735)||(25165413-25165569)
chr6 (605-733)||(9661018-9661145)
chr6 (646-734)||(34396596-34396682)
chr6 (606-739)||(11115125-11115255)
chr6 (642-745)||(23629641-23629742)
chr6 (602-723)||(961051-961171)
chr6 (628-734)||(28225252-28225355)
chr6 (607-738)||(29978259-29978389)
chr6 (664-739)||(13529481-13529554)
chr6 (577-724)||(31280362-31280502)
chr6 (533-577)||(2516309-2516353)
[»] chr8 (47 HSPs)
chr8 (579-745)||(30675574-30675738)
chr8 (578-746)||(9063052-9063219)
chr8 (578-746)||(4648213-4648380)
chr8 (610-745)||(33357161-33357295)
chr8 (576-739)||(34228708-34228870)
chr8 (578-744)||(168487-168652)
chr8 (578-744)||(27988500-27988664)
chr8 (578-744)||(28045802-28045966)
chr8 (610-745)||(42035013-42035147)
chr8 (577-739)||(16888543-16888704)
chr8 (578-747)||(29444140-29444308)
chr8 (609-738)||(36730471-36730599)
chr8 (585-739)||(21595872-21596025)
chr8 (585-738)||(2805267-2805419)
chr8 (578-738)||(11112666-11112825)
chr8 (578-744)||(4537744-4537909)
chr8 (568-737)||(9537813-9537982)
chr8 (577-739)||(40831303-40831464)
chr8 (578-745)||(13643032-13643197)
chr8 (578-745)||(13743457-13743622)
chr8 (624-733)||(16890527-16890634)
chr8 (606-738)||(20831581-20831712)
chr8 (578-744)||(32113929-32114095)
chr8 (577-732)||(7304517-7304671)
chr8 (575-745)||(16394058-16394227)
chr8 (584-745)||(9253908-9254067)
chr8 (581-738)||(37373232-37373388)
chr8 (606-734)||(12203885-12204012)
chr8 (606-734)||(12448313-12448440)
chr8 (575-739)||(43119243-43119405)
chr8 (584-739)||(28626794-28626947)
chr8 (606-739)||(3930261-3930393)
chr8 (577-746)||(29235254-29235422)
chr8 (609-739)||(16785112-16785241)
chr8 (628-735)||(10870382-10870487)
chr8 (663-738)||(9278239-9278312)
chr8 (648-731)||(34192809-34192890)
chr8 (630-736)||(42433597-42433700)
chr8 (642-738)||(17467630-17467724)
chr8 (576-691)||(24843278-24843393)
chr8 (663-739)||(10618044-10618118)
chr8 (686-742)||(12652653-12652707)
chr8 (628-700)||(39406905-39406977)
chr8 (628-707)||(22956761-22956840)
chr8 (630-700)||(22451847-22451916)
chr8 (642-708)||(30933387-30933452)
chr8 (705-739)||(36923789-36923823)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (578-745)||(13661828-13661994)
chr5 (578-739)||(34650833-34650993)
chr5 (578-738)||(35504241-35504399)
chr5 (577-734)||(21547393-21547549)
chr5 (578-738)||(35132549-35132707)
chr5 (578-745)||(8787359-8787525)
chr5 (578-732)||(40564404-40564557)
chr5 (606-742)||(12506319-12506454)
chr5 (610-738)||(20175254-20175381)
chr5 (581-744)||(6283583-6283745)
chr5 (578-745)||(11957967-11958133)
chr5 (624-745)||(10054400-10054518)
chr5 (626-739)||(13470177-13470288)
chr5 (606-731)||(11846106-11846230)
chr5 (578-702)||(10956013-10956137)
chr5 (636-744)||(19647717-19647823)
chr5 (628-737)||(9721658-9721765)
chr5 (636-745)||(10069989-10070095)
chr5 (629-738)||(39066987-39067095)
chr5 (597-737)||(31909659-31909793)
chr5 (577-732)||(40057340-40057494)
chr5 (663-745)||(4837277-4837357)
chr5 (578-702)||(4268623-4268747)
chr5 (615-739)||(39069407-39069527)
chr5 (655-738)||(2619635-2619716)
chr5 (629-738)||(19436890-19436995)
chr5 (666-738)||(6284822-6284892)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (578-739)||(15227765-15227925)
chr1 (578-744)||(47010014-47010179)
chr1 (585-739)||(3784720-3784873)
chr1 (578-733)||(19031815-19031969)
chr1 (578-745)||(29657791-29657957)
chr1 (578-745)||(14350279-14350443)
chr1 (579-744)||(38162871-38163035)
chr1 (609-745)||(30294412-30294547)
chr1 (578-738)||(51065748-51065907)
chr1 (578-744)||(5694342-5694507)
chr1 (578-744)||(18043183-18043348)
chr1 (584-745)||(12072068-12072228)
chr1 (576-745)||(24178461-24178629)
chr1 (584-745)||(42769996-42770156)
chr1 (605-745)||(3097679-3097818)
chr1 (577-739)||(9266727-9266888)
chr1 (606-745)||(35985649-35985787)
chr1 (602-732)||(6770370-6770499)
chr1 (609-737)||(48071510-48071637)
chr1 (578-739)||(17333284-17333442)
chr1 (578-747)||(38701937-38702101)
chr1 (606-732)||(45431311-45431436)
chr1 (578-732)||(50128172-50128325)
chr1 (636-744)||(29210434-29210540)
chr1 (606-737)||(51368813-51368943)
chr1 (606-739)||(36446353-36446484)
chr1 (609-735)||(23473495-23473620)
chr1 (606-738)||(43286749-43286880)
chr1 (577-747)||(30657626-30657789)
chr1 (577-739)||(41730331-41730495)
chr1 (576-733)||(47532669-47532824)
chr1 (606-733)||(12306950-12307075)
chr1 (606-745)||(29683215-29683354)
chr1 (629-738)||(38335196-38335303)
chr1 (606-745)||(13961232-13961369)
chr1 (606-735)||(8472942-8473070)
chr1 (608-747)||(48383141-48383279)
chr1 (624-735)||(52749632-52749741)
chr1 (606-735)||(45449272-45449400)
chr1 (654-737)||(15282591-15282672)
chr1 (663-745)||(26228213-26228293)
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chr1 (580-708)||(52431636-52431765)
chr1 (606-737)||(35700680-35700808)
chr1 (578-738)||(3838777-3838936)
chr1 (624-721)||(37315315-37315409)
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chr1 (624-739)||(30217786-30217901)
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chr1 (663-736)||(28481873-28481940)
chr1 (666-719)||(37503260-37503311)
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[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (578-745)||(52520701-52520867)
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[»] chr2 (42 HSPs)
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[»] scaffold0425 (1 HSPs)
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[»] scaffold0050 (2 HSPs)
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[»] scaffold0325 (1 HSPs)
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[»] scaffold0533 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 577
Target Start/End: Original strand, 21401675 - 21402255
Alignment:
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    |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21401675 agaggtgagtattgttttattattgtagttattctatctcgctctgaacatataatgaaattatttcatcaaaagattcaaaacacaaaagtaaagtaaa 21401774  T
Q  97 attagttttatatattgttaacaaaagatagttttagnnnnnnnnnnnnnnnnntaatgtcatatataatatcaaaatagtttttcttagagataatatc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21401775 attagttttatatattgttaacaaaagatagttttagaaaaaacttcaaaaaaataatgtcatatataatatcaaaatagtttttcttagagataatatc 21401874  T
Q  197 aaaatagttaaaattgtactatctccctgttgaaataacatttttaattaaattacatcagagataagtagagtttcaatttcttatcttgtgggagttt 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21401875 aaaatagttaaaattatactatctccctgttgaaataacatttttaattaaattatatcagagataagtagagtttcaatttcttatcttgtgagagttt 21401974  T
Q  297 cttttgtctaaagagatgcaaattcgtctatggtttatgttcgggaagtgcaacaaccggtaaatttgaattctatgttaaagatctttttgattcatga 396  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21401975 cttttgtctaaagagatgtaaattcgtctatggtttatgttcgggaagtgcaacaaccggtaaatttgaattctatgttaaagatctttttgattcatga 21402074  T
Q  397 aaaaagttcacaaacgaataaagaagacatttcatcatattttggtccctagatagtggtcaaaaggcataataagcgggagcaattgagtggtgcactc 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21402075 aaaaagttcacaaacgaataaagaagacattccatcatattttggtccctagatagtggtcaaaaggcataataagcgggagcaattgagtggtgcactc 21402174  T
Q  497 aatcgaaatttcaagagcaggaaaatcacgaagatgcaagtaaatttattaatattgatgaagtcattataaataaagatt 577  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21402175 aatcaaaatttcaagagcaggaaaatcacgaaaatgcaagtaaatttattaatattgatgaagtcattataaataaagatt 21402255  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 577 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 54897495 - 54897328
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  54897495 tgggtcctgctaaccggtgcctccgggacactggttaaacataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttattataaatta 54897396  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  54897395 attatacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttctcatatccttaaccagtgccccggg 54897328  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 576 - 745
Target Start/End: Original strand, 789528 - 789696
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    |||||||  |||||||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  789528 ttgggtcccgctaaccggtgcctctgggctactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatt 789627  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  789628 aattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaacccgtgccccggg 789696  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Original strand, 32202481 - 32202646
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    ||||| || |||| ||||||||  ||| | || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  32202481 gggtcctgttaactggtgcctctgggacattgattaagcatatcataaaaggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaat 32202580  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  32202581 tacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttttatatccttaacccgtgccccggg 32202646  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 609 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 28755774 - 28755646
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28755774 ggttaagcatactataaaaggaagtattatcataaaaggaaactgtttctaactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tata 28755677  T
Q  709 taatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28755676 taatttcctttttcatatccttaaccagtgc 28755646  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 7769124 - 7768958
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  || ||||||| ||   ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7769124 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagtatgccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttaacattattataaattaa 7769025  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7769024 ttacacaatttcaatacattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 7768958  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 29591375 - 29591209
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  29591375 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactagttaagcataccataaaaggtaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 29591276  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  29591275 gtacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttattcatattcttaaccagtgccccggg 29591209  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 577 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 43944693 - 43944528
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  43944693 tgggtcttgctaaccggtgccctcgggc-actggttaagcataccatacaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatta 43944595  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43944594 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccgg 43944528  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 585 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 50619264 - 50619104
Alignment:
Q  585 gctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacaca 683  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  50619264 gctaaccggtgcc-cctgggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttttactttattataaattaagtacaca 50619166  T
Q  684 atttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggag 747  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  50619165 atttcaatgcattaactac--tatataattttctttttcatattcttaatcagtgccccgggag 50619104  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 577 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 12356431 - 12356272
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||||||||| || | | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  12356431 tgggtcctgctaaccggtgcccccggaacactggttaagcataccataaaagagaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 12356332  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12356331 attatataatttcaatgtattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagt 12356272  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 16536234 - 16536068
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  |||||||||| |||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  16536234 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagaataccataaaatagaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 16536135  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||    
T  16536134 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaatccgtgccccggg 16536068  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 608 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 37988091 - 37987965
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgata 706  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  37988091 tggttaagcatactataaaagagaattattacaataaaaggaaactgtttttaacattattataaattaattacacaatttcaatacattaactac--ta 37987994  T
Q  707 tataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37987993 tataatttcctttttcatacccttaacca 37987965  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 584 - 739
Target Start/End: Original strand, 54655883 - 54656036
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  54655883 tgctaaccggtgcc-ccgggacactggttaagcatatcataagagagaattattatcctaaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacac 54655981  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54655982 aatttcaatacattaactac--tatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 54656036  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 605 - 739
Target Start/End: Original strand, 24679670 - 24679802
Alignment:
Q  605 tactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacg 703  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  24679670 tactgattaagcataccataaaagagaattattaccataaa-ggaaattgtttttaactttattataaattaattacacaatttcaatacattaactac- 24679767  T
Q  704 atatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24679768 -tatataatttcttttttcatatccttaaccagtgc 24679802  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 577 - 745
Target Start/End: Original strand, 4268821 - 4268988
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  4268821 tgggtcctgctaaccggtgccctcggggcactggttaatcataccataaaagggaattattaccataaaaagaaactgtttttgacattattataaatta 4268920  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4268921 attacataatttcaatgcattaactac--tatatagtttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 4268988  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 628 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 15186378 - 15186263
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  15186378 ggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatggattaactac--tatataatttcctttttcatacc 15186281  T
Q  728 cttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||| |||||    
T  15186280 cttaaccagtgccccggg 15186263  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 624 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 39844046 - 39843931
Alignment:
Q  624 aaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttca 723  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  39844046 aaaaggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaactac--tatataatttcatttttca 39843949  T
Q  724 tatccttaaccagtgctc 741  Q
    |||||||||||| |||||    
T  39843948 tatccttaaccaatgctc 39843931  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Original strand, 18067879 - 18068045
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||    
T  18067879 gggtcttgctaaccggtgcccccggggaacgggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgacattatgataaattaa 18067978  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18067979 ttacacaattttaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 18068045  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 32217230 - 32217065
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||  || |||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  32217230 gggtcctgttaaccggtgcctccggggcacaggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaa-aaactgtttttgactttattataaattaa 32217132  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32217131 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttttatatccttaaccagtgccccggg 32217065  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 577 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 6164280 - 6164120
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||||||| |  | || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||||    
T  6164280 tgggtcctgctaaccggtgtcctcggggtactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgttttttgctttattataaatta 6164181  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  6164180 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataattttc-ttttgatatccttaaccagtgc 6164120  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Original strand, 33108673 - 33108837
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  33108673 gggtcctgctaaccggtgcctccggggcacgggttaagcataccataaaaaggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 33108772  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||| || ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33108773 ttatactatttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatat-cttaaccagtgccccgg 33108837  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 4089300 - 4089168
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4089300 actggttaaacataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 4089203  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  4089202 tatataattttctttttcatacccttaatcagtgc 4089168  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 578 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 4220380 - 4220226
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||||||||||||||||||| | |   ||  ||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4220380 gggtcatgctaaccggtgcctacggagcacatgttaagcataccataaaagggaattattac-ataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaa 4220282  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220281 ttacacaatttcaatacattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacc 4220226  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 605 - 737
Target Start/End: Original strand, 19503132 - 19503263
Alignment:
Q  605 tactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacg 703  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  19503132 tactagttaagcataccataaaagggaattattacaataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaacta-- 19503229  T
Q  704 atatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503230 gtatataatttcctttttcatatccttaaccagt 19503263  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Original strand, 43202384 - 43202549
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  43202384 gggtcctgctaaccggtgcccccgggc-actggttaagcttaccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgacattattataaattaa 43202482  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  43202483 ttacacaattttaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatacccttaactagtgccccggg 43202549  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 608 - 739
Target Start/End: Original strand, 42898774 - 42898906
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaag-gaattattaccaca--aaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  42898774 tggttaagcataccataaaagagaattattaccacataaaaagaaactatttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 42898871  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42898872 tatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 42898906  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 587 - 745
Target Start/End: Original strand, 47231881 - 47232038
Alignment:
Q  587 taaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaat 685  Q
    |||||||||| ||| || || ||||||| ||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  ||    
T  47231881 taaccggtgcttccggggtattggttaaacataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaattacattat 47231980  T
Q  686 ttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47231981 ttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcacatccttaaccagtgctccggg 47232038  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 624 - 739
Target Start/End: Original strand, 54945826 - 54945938
Alignment:
Q  624 aaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttca 723  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  54945826 aaaaggaattat-accataaaacgaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaact--gctatataatttcctttttca 54945922  T
Q  724 tatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||    
T  54945923 tatccttaaccagtgc 54945938  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 578 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 36395285 - 36395129
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||| ||| || |||| || ||||||||||||||    
T  36395285 gggtcctgctaactggtgcccccagggcactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaagaaaactgcttttgactttattataaattaa 36395186  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36395185 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatttttaacca 36395129  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 584 - 708
Target Start/End: Original strand, 30387140 - 30387265
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    ||||||||||||  ||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  30387140 tgctaaccggtgtttccagggtattgattaagcatatcataaaaaggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacac 30387239  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  30387240 aatttcaatgcattaactactatata 30387265  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 587 - 738
Target Start/End: Original strand, 53655887 - 53656037
Alignment:
Q  587 taaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaat 685  Q
    ||||||||||||||  |  |||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53655887 taaccggtgcctccgaggcactgattaagcataccataaaatgaaattattaccataaaataaaattatttttaactttattataaattaattacacaat 53655986  T
Q  686 ttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  53655987 ttcaatacattaacta--ttatataatttcttttttcatatccttaacaagtg 53656037  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 624 - 738
Target Start/End: Original strand, 31680510 - 31680622
Alignment:
Q  624 aaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttca 723  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||| ||| || ||||||||    
T  31680510 aaaatgaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattaacta--ttatgtaactttctttttca 31680607  T
Q  724 tatccttaaccagtg 738  Q
    || ||||||||||||    
T  31680608 tacccttaaccagtg 31680622  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 606 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 46149097 - 46148973
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       
T  46149097 actggttaaacataccataaaagagaattattaccataaaaagaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaatta--t 46149000  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatcctta 731  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  46148999 tatataatttcctttttcatattctta 46148973  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 577 - 748
Target Start/End: Original strand, 5091611 - 5091779
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  5091611 tgggtcctgctaaccggtgc-tcccggacactggttaagcatac-ataaaagggaattattactataaaaggaaactgtttatgactttattataaatta 5091708  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggagt 748  Q
    |||||||||||| |||  ||||| ||   ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5091709 attacacaattttaatatattaatta--ttatataattttatttttcatattcttaaccagtgccccgggagt 5091779  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 606 - 745
Target Start/End: Original strand, 30154191 - 30154328
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||      
T  30154191 actggttaagcacaccataaaagagaattattatcatataaggaaattgtttttgattttattataaattaattacataatttcaatacattaactac-- 30154288  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  30154289 tatataatttcctttttcatat-cttaactagtgccccggg 30154328  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 636 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 54054675 - 54054574
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  54054675 taccataaaaggaaattgtttttgactttattatcaattaattacactatttcaatgcattaacta--ttatataatttcttttttcatatccttaaccg 54054578  T
Q  736 gtgc 739  Q
    ||||    
T  54054577 gtgc 54054574  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 628 - 738
Target Start/End: Original strand, 52533836 - 52533944
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  52533836 ggaattattaccataaaaggaaactgttttcgactttattatcaattaattattcaatttcagtgcattaactac--tatataatttcctttttcatatt 52533933  T
Q  728 cttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||    
T  52533934 cttaaccagtg 52533944  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 620 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 49915303 - 49915185
Alignment:
Q  620 ttataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctt 718  Q
    |||||||||||| ||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| || |||    
T  49915303 ttataaaaggaaattattattataaaaggaaactgttttttactttattataaattaattacacaatttcaatacattaattac--tatataaatttctt 49915206  T
Q  719 tttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  49915205 tttcatatccttaatcagtgc 49915185  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 647 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 42815225 - 42815132
Alignment:
Q  647 gaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctcc 742  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42815225 gaaactgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatacattaactatg--atataatttcctttttcatatccttaaccagtactcc 42815132  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 611 - 744
Target Start/End: Original strand, 3783534 - 3783666
Alignment:
Q  611 ttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatat 709  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||    
T  3783534 ttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatcaattaattaaacaattttaatgcattaactac--tatat 3783631  T
Q  710 aatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  3783632 aatttcatttttcatatgtttaaccggtgccccgg 3783666  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 577 - 699
Target Start/End: Original strand, 39877246 - 39877371
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatatt--ataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaat 673  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||   ||||||| |||||||||| | |||| |||| ||||||| || |||||||||||    
T  39877246 tgggtcctgctaacccgtgcctccggggcactggttaagcatataccataaaagagaattattactataaaatgaaactgtttttgactttattataaat 39877345  T
Q  674 taattacacaatttcaatgcattaac 699  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  39877346 taattacacaatttcaatacattaac 39877371  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 635 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 55882811 - 55882705
Alignment:
Q  635 ttaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||||||||     
T  55882811 ttaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaattac--tatataattt-ttttttcatatccttaacg 55882715  T
Q  735 agtgctccgg 744  Q
    ||||| ||||    
T  55882714 agtgccccgg 55882705  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 578 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16821038 - 16820917
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  | | || ||||||||| ||||    
T  16821038 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgcgtatgactttattataagttaa 16820939  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaa 698  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  16820938 ttacagaatttcaatgcattaa 16820917  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 636 - 739
Target Start/End: Original strand, 46688264 - 46688370
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcc-----tttttcatatcctt 730  Q
    ||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |     ||||||||||||||    
T  46688264 taccataaaaggaaactgcttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tgtataattttctttaatttttcatatcctt 46688361  T
Q  731 aaccagtgc 739  Q
    |||||||||    
T  46688362 aaccagtgc 46688370  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 605 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 50603387 - 50603254
Alignment:
Q  605 tactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaat-tgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac 702  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||  |||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  50603387 tactggttaagcataccataaaagagaattattatcataaaaaaaaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaatta- 50603289  T
Q  703 gatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
      |||| ||||||||||| || | ||||||||||||    
T  50603288 -ttatacaatttccttttccacacccttaaccagtg 50603254  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 667 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 50167685 - 50167617
Alignment:
Q  667 tataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  50167685 tataaattaattacacaatttcaatgcattaactac----tataattttctttttcatatctttaaccagtgc 50167617  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 580 - 739
Target Start/End: Original strand, 1432550 - 1432702
Alignment:
Q  580 gtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaatt--attaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  1432550 gtcatgctaaccggtgcttctgaggtactggttaagcatattataaaagagaattttattatcataaaag-aaactgttttttattttattataaattaa 1432648  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||   ||    ||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1432649 tt---ca----caatgtattaactat--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 1432702  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 642 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 53268840 - 53268764
Alignment:
Q  642 aaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttccttttt 721  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  53268840 aaaagaaaattgtttttgacttt-ttataaattaattacacaattttaatgcattaacta--atatataatttctttttt 53268764  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 610 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 52697205 - 52697083
Alignment:
Q  610 gttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||  ||||    
T  52697205 gttaaacatatcataaaagagaattattacaataaaggaaaattatttttgactttattataaatta-ttatataattttaatgtattaactac--tata 52697109  T
Q  709 taatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||    
T  52697108 taattttgtttttcatatccttaacc 52697083  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 606 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 31517324 - 31517227
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaa-attgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaacta 701  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||  || ||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31517324 actggttaagcataccatataagagaattattaccataaaaaaaacattatttttgactttattatcaattaattacactatttcaatgcattaacta 31517227  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 578 - 684
Target Start/End: Original strand, 53003956 - 53004063
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||| | |  ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  53003956 gggtcctgctaaccggtgtcccggggacactgattaagcatatcataaaagagaattattattttaaaaggaaattatttttgactttattatacattaa 53004055  T
Q  677 ttacacaa 684  Q
    ||||||||    
T  53004056 ttacacaa 53004063  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 666 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 41265556 - 41265514
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41265556 ttataaattaattacacaatttcactgcattaactactatata 41265514  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 630 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 8133840 - 8133782
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttc 688  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8133840 aattattaccataaaagaaaactatttttgactttattataaattaattacacattttc 8133782  T

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Target: chr7 (Bit Score: 103; Significance: 8e-51; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 577 - 745
Target Start/End: Original strand, 29993486 - 29993653
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  29993486 tgggtcctgctaaccgatgcctccgggacactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaattgattttgactttattataaatta 29993585  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29993586 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccggtgccccggg 29993653  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 576 - 739
Target Start/End: Original strand, 24798401 - 24798563
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  24798401 ttgggtcctgctaactggtgcccccggggcactggttaagcatactataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaatt 24798500  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24798501 aattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatcctcaacaagtgc 24798563  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 577 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 24438664 - 24438497
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  24438664 tgggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatta 24438565  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  24438564 attacataatttcaatgcattaactac--tatatagtttcctttttcatacccttaactagtgccccggg 24438497  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 606 - 746
Target Start/End: Original strand, 23363195 - 23363334
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  23363195 actggttaaacataccataaaagagaaatattaccataaaaggaaactgtttttaactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 23363292  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggga 746  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23363293 tatacaatttcctttttcttatccttaacgagtgctccggga 23363334  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 584 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 1737159 - 1737006
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacaca 683  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  1737159 tgctaaccggtgcttccggggcactggttaagcataccataaaatgaattattatcataaatggaaaatgtttttaactttattatcaattaattacact 1737060  T
Q  684 atttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1737059 atttcaatgcattaacta--ttatataatttcatttttcatatccttaaccagtgc 1737006  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 610 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 5239439 - 5239306
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Q  610 gttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5239439 gttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaagaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tata 5239342  T
Q  709 taatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5239341 taatttcctttttcataccattaaccagtgctccgg 5239306  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 630 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 30810788 - 30810675
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Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcct 729  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30810788 aattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatcct 30810691  T
Q  730 taaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||| |||||    
T  30810690 taaccagtgccccggg 30810675  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 34606447 - 34606282
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Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||  || |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||    
T  34606447 gggtcctgctaaccggtgctcccggggcacgggttaagcataccataaaaggtaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataaattaa 34606348  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34606347 tttcacaatttcaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccgg 34606282  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 605 - 742
Target Start/End: Original strand, 8754612 - 8754748
Alignment:
Q  605 tactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacg 703  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8754612 tactagttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaacaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac- 8754710  T
Q  704 atatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctcc 742  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8754711 -tatataatttcatttttcatatccttaaccagtgctcc 8754748  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 579 - 737
Target Start/End: Original strand, 11686324 - 11686482
Alignment:
Q  579 ggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaat--tgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  |||   ||||||| || |||||||||||||    
T  11686324 ggtcctgctaaccggtgcctccggg-tacaggttaagcatatcataaaagagaattattaccataaaaaaaaaaactgtttttgactttattataaatta 11686422  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11686423 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttttatatccttaaccagt 11686482  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 608 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 47083211 - 47083076
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgata 706  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  47083211 tggttaaacatatcataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttaactttattatcaattaattacacaatttcaatacattaactac--ta 47083114  T
Q  707 tataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  47083113 tataatttcttttttcatatccttaaccggtgttccgg 47083076  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 34333469 - 34333304
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  || |||||| ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  34333469 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaacataccataaaaaggaattattaccataaaaggaaactgttttga-cattattataaattaa 34333371  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  34333370 ttacacaatttcaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 34333304  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 608 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 28588065 - 28587936
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgata 706  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||    
T  28588065 tggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattgactac--ta 28587968  T
Q  707 tataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28587967 tataatttcctttttcatatccttaaccagtg 28587936  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 584 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 18486141 - 18485981
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    |||||||||||| || | ||  || |||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18486141 tgctaaccggtgtcttcggggcacgggttaagcataccataaaatgaaattattaccataaaaggaaactgtttttaactttattataaattaattacac 18486042  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  18486041 aatttcaatacattaattac--tatataatttccttttcaatatccttaaccagtgccccggg 18485981  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 576 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 4628754 - 4628592
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||||| |||||||||||||| |   |  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| | || ||||||||||||    
T  4628754 ttgggtcctgctaaccggtgcccctaaggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagtaaactgtttctgactttattataaatt 4628655  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4628654 aattaaacaatttcaatgtattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccggtgc 4628592  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 745
Target Start/End: Original strand, 12218464 - 12218602
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12218464 actggttaaacataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactattttttattttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 12218561  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  12218562 tatataatttcctttttcatatacttatccagtgccccggg 12218602  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 745
Target Start/End: Original strand, 43594064 - 43594202
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  43594064 actggttaagcataccataaaagagaattattatcataagaggaaactgtttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattaacta--t 43594161  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  43594162 tatataatttccttttttatatccttaaccagtgttccggg 43594202  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 576 - 738
Target Start/End: Original strand, 525074 - 525234
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  525074 ttgggtcctgctaaccggtgc-tccggagtactggttaaacatatcataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgattttattataaatt 525172  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  525173 aattatacaatttcaatgcattaactac--tgtatacttttctttttcatatctttaaccagtg 525234  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 45045928 - 45045799
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  45045928 actggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaattac-- 45045831  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccag 736  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45045830 tatataatttcatttttcatacccttaaccag 45045799  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 628 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 47839627 - 47839511
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  47839627 ggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaacta--ttatataaattcctttttcatatc 47839530  T
Q  728 cttaaccagtgctccggga 746  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  47839529 cttaaccagtaccccggga 47839511  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 579 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 5729531 - 5729365
Alignment:
Q  579 ggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||   ||||||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||    
T  5729531 ggtcctgctaacctgtgcctccgaggcactggttaagcatgccataaaagagaattattactataaaagaaaattatttttgactttattatcaattaat 5729432  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggga 746  Q
    ||||  |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5729431 tacattatttcaatacattaactat--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggga 5729365  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 47657136 - 47657006
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  47657136 actgattaagcataccataaaagggaattattaccataaaa--aaactgcttttaactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaattac-- 47657041  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47657040 tatataattttctttttcatatccttaaccagtgc 47657006  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 578 - 739
Target Start/End: Original strand, 42044294 - 42044453
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  42044294 gggtcatgctaaccggtgcc-ccggggcactggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgacattattataaattaa 42044392  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||    
T  42044393 ttacacaatttcaatctattaactac--tatataatttcttttttcatacctttaaccggtgc 42044453  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 735
Target Start/End: Original strand, 13064904 - 13065033
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgttttta-accttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacg 703  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||      
T  13064904 actggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttttgactttattataaattaattacacaaattcaatacattaaatat- 13065002  T
Q  704 atatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13065003 -tatataatttcctttttcatatccttaacca 13065033  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 636 - 734
Target Start/End: Original strand, 34546373 - 34546469
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34546373 taccataaaagtaaactgtttttgactttactataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacc 34546469  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 606 - 738
Target Start/End: Original strand, 7689228 - 7689359
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  7689228 actggttaagtataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaattac-- 7689325  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    | || |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7689326 tgtaaaatttccttttttatatccttaatcagtg 7689359  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 642 - 739
Target Start/End: Original strand, 27456178 - 27456273
Alignment:
Q  642 aaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27456178 aaaaggaaactgcttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttctttttccatatccttaaccagtgc 27456273  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 606 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 18117301 - 18117175
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| | ||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  18117301 actggttaagcataccataaaatgaaattattactataaaaaaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaactac-- 18117204  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18117203 tatataatttcctctttcatatacttaac 18117175  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 628 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 46716773 - 46716660
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  46716773 ggaattattatcataaaaggaaaatatttttgactttattataaattaattacataatttcagtgcattaagta--ttatataatttccttttttatatc 46716676  T
Q  728 cttaaccagtgctccg 743  Q
     ||||||| |||||||    
T  46716675 tttaaccaatgctccg 46716660  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 606 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 33636610 - 33636479
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||  ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||       
T  33636610 actggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaaataaactattttttactttattataaattaattacacaatttcaatgaattaatta--t 33636513  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  33636512 tatataattttctttttcatattcttaactagtg 33636479  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 642 - 744
Target Start/End: Original strand, 37631607 - 37631707
Alignment:
Q  642 aaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctc 741  Q
    ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  37631607 aaaaggaaactgtttttgattttattataaattaattacataattttaatgcattaatta--ttatataatttccttttttatatccttaacccgtgccc 37631704  T
Q  742 cgg 744  Q
    |||    
T  37631705 cgg 37631707  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 642 - 708
Target Start/End: Original strand, 37674169 - 37674235
Alignment:
Q  642 aaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37674169 aaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactactatata 37674235  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 630 - 720
Target Start/End: Complemental strand, 22739957 - 22739868
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttatt-ataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttt 720  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22739957 aattattaccataaaagaaaactgtttttaattttttttataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatatactttcctttt 22739868  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 608 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 28262182 - 28262062
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgata 706  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||     |||||||  ||    
T  28262182 tggttaagcataccataaaaaagaattattactataaaaggaaactgtttttgattttattatcaattaattacataatttcaa-----taactac--ta 28262090  T
Q  707 tataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28262089 tataatttcctttttcatatccttaacc 28262062  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 579 - 742
Target Start/End: Original strand, 23357711 - 23357870
Alignment:
Q  579 ggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    |||| |||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||| || || ||||||||||||    
T  23357711 ggtcttgctaatcggtgtctccggggcactggttaagcatatcatagaagagaattattatcataaatggaaactgtttttgacttttttataaattaat 23357810  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctcc 742  Q
    || ||   |  ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23357811 tatac---tgaaatgcattaactac--tatacaattttctttttcatatccttaacgagtactcc 23357870  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 4087720 - 4087650
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  4087720 ttataaattaatcacactatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttagtatgcttaaccagtg 4087650  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 652 - 735
Target Start/End: Original strand, 29835779 - 29835860
Alignment:
Q  652 tgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  29835779 tgtttttaactttattacaaattaattacgcaattttaatacattaacta--gtatataacttcctttttcatatctttaacca 29835860  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 665 - 739
Target Start/End: Original strand, 4100612 - 4100684
Alignment:
Q  665 attataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4100612 attataaattaataacataattttaatacattaattac--tatataatttcctttttcatatccttaaccggtgc 4100684  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 630 - 739
Target Start/End: Original strand, 18469993 - 18470099
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcct 729  Q
    ||||||||||| |||| | || ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||  ||| ||    
T  18469993 aattattaccataaaatgtaactgtttttgacttt-tcataaattaattacacaatttcaatgtattaact--gctatataatttcctttttagtatgct 18470089  T
Q  730 taaccagtgc 739  Q
    ||||| ||||    
T  18470090 taaccggtgc 18470099  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 666 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 3021988 - 3021922
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3021988 ttataaattaattatacaatttcaatgtattaacta--gtatataatttcctttttaatatgcttaacc 3021922  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 622 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 13556553 - 13556474
Alignment:
Q  622 ataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaacta 701  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13556553 ataaaaggaaattattaccataaaaagatattgttattgacttt-ttataaattaattacacaatttcaatgcattgacta 13556474  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 36437474 - 36437405
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  36437474 ttataaattaattaaacaatttcaatgaattacctac--tatataattacctttttagtatccttaaccagt 36437405  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 629 - 688
Target Start/End: Original strand, 47118041 - 47118100
Alignment:
Q  629 gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttc 688  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  47118041 gaattattaccataaaaggaaactgctcttgactttattataaattaattacacaatttc 47118100  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 38128478 - 38128322
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  | |||||| |||| |||||| |||||||| || || || || |  ||||| |||||    
T  38128478 gggtcatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagcatacaaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaagtt-ttgttgacttatttatagattaa 38128380  T
Q  677 ttacacaa-tttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||| |||| |||||||||| ||| ||  ||||| | ||||||||||  |||||||||||    
T  38128379 ttaaacaattttcaatgcaataattaacatata-attttcctttttattatccttaacc 38128322  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 666 - 734
Target Start/End: Original strand, 18220527 - 18220593
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  18220527 ttataaattaattacacaattttaatacattaattac--tatataattttctttttagtatccttaacc 18220593  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 666 - 721
Target Start/End: Original strand, 18220759 - 18220812
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttccttttt 721  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18220759 ttataaattaattacacaatttctatacattaattac--tatataatttccttttt 18220812  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 670 - 736
Target Start/End: Original strand, 18220624 - 18220688
Alignment:
Q  670 aaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccag 736  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  18220624 aaattaattacacaatttcaatacagtaattac--tatataatttcctttttagtattcttaaccag 18220688  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 6097524 - 6097451
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaa 649  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  6097524 tgggtcatgctaaccagtgcctccggggcacgggttaagcatataaaaaaaggaaattcttaccataaaaggaa 6097451  T

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Target: chr6 (Bit Score: 103; Significance: 8e-51; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 583 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 2350833 - 2350670
Alignment:
Q  583 atgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattaca 681  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||    
T  2350833 atgctaaccggtgtctccggggtactggttaagcatatcataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattataaattaattaca 2350734  T
Q  682 caatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggag 747  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2350733 caatttcaatacattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccgggag 2350670  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 392282 - 392116
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  392282 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 392183  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  392182 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 392116  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 577 - 739
Target Start/End: Original strand, 12145116 - 12145277
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  12145116 tgggtcctgctaaccggtgcctccggagcactggttaagcatactataaaaggaaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 12145215  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12145216 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacaagtgc 12145277  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 23402324 - 23402159
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  23402324 gggtcctgctaaccggtgcctccggggcacgggttaagcataccataaaaggtaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 23402225  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    || ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23402224 tttcacaatttcaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccgg 23402159  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 578 - 739
Target Start/End: Original strand, 26467124 - 26467284
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||    
T  26467124 gggtcatgctaaccggtgcctccggggcactggttagacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattataaattaa 26467223  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26467224 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccggtgc 26467284  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Original strand, 32929508 - 32929674
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  32929508 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 32929607  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  32929608 ttacacaatttcaatgcattaatta--atatataatttcctttttcatacccttaaccattgccccggg 32929674  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 4215881 - 4215715
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  4215881 gggtcctgctaaccgatgcccccggggcactggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 4215782  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  4215781 ttacacaatttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatactcttaaccagtgccccggg 4215715  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 577 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 3515953 - 3515792
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||||||||| |  ||  || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  3515953 tgggtcctgctaaccggtgcccctggggcacaggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaatta 3515854  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3515853 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgc 3515792  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 739
Target Start/End: Original strand, 18276612 - 18276775
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatatta---taaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaat 673  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  18276612 gggtcctgctaaccggtgccccaggggcactggttaagcataataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaat 18276711  T
Q  674 taattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18276712 taattacacaaattcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 18276775  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 2581138 - 2580980
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||  || || || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  2581138 gggtcctgctaaccggtgctcccggggtattggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaattatttttgactttattataaattaa 2581039  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2581038 ttacataatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttttatatcattaaccagt 2580980  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 585 - 739
Target Start/End: Original strand, 13416967 - 13417122
Alignment:
Q  585 gctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttat---tataaattaattac 680  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||   ||||||||||||||    
T  13416967 gctaaccggtgcctccgggc-actggttaagcatattataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattattataaattaattac 13417065  T
Q  681 acaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13417066 acaatttcaatacattaacta--atatataatttcctttttcatatccttaactagtgc 13417122  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 584 - 735
Target Start/End: Original strand, 32985199 - 32985349
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32985199 tgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacac 32985298  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32985299 aatttcaatacattaactac--tatataatttccttttttatatccttaacca 32985349  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 606 - 733
Target Start/End: Original strand, 34851877 - 34852003
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  34851877 actggttaagcatattataaaagagaattattactataaaaggaaattatttttgactttattataaatcaattacacaatttcaatgcattaactac-- 34851974  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34851975 tatataatttcctttttcatatctttaac 34852003  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 27433678 - 27433512
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||    
T  27433678 gggtcttgctaaccggtgcccccggggaacgggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgacattatgataaattaa 27433579  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27433578 ttacacaattttaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 27433512  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 576 - 737
Target Start/End: Original strand, 1391176 - 1391336
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggat-actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaat 673  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  1391176 ttgggtcctgctaaccggtgt-tcctggaacactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaat 1391274  T
Q  674 taattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1391275 taattatacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaatcagt 1391336  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 576 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 35044076 - 35043917
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  35044076 ttgggtcatgttaaccggtgcc-ccggggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaatt 35043978  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35043977 aat-acacaatttcaatgaattaactac--tatataatttcttttttcatatccttaaccagtg 35043917  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 610 - 739
Target Start/End: Original strand, 7851191 - 7851319
Alignment:
Q  610 gttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||    
T  7851191 gttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaattttaatgcattaattac--tata 7851288  T
Q  709 taatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7851289 taattttctttttcatatccttaaccagtgc 7851319  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 609 - 739
Target Start/End: Original strand, 29451146 - 29451275
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29451146 ggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtgtttgactttattataatttaattacacaatttcaatgcattaactac--tat 29451243  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29451244 ataatttcctttttcatatccttaaccggtgc 29451275  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 606 - 741
Target Start/End: Original strand, 1840275 - 1840409
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||       
T  1840275 actggttaaacatatcataaaagggaattattaccatgaaaggaaactgtttttaactttattataaattaattacacaattttaatacattaatta--t 1840372  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctc 741  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1840373 tatataatttctttttttatatccttaaccagtgctc 1840409  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 584 - 739
Target Start/End: Original strand, 3026015 - 3026169
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    ||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  3026015 tgctaaccggtgccctcgggacactgattaagcataccataaaagagaattattacgataaaagaaaactgtttttgacattattataaattaattatac 3026114  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3026115 aatttcaatgcattaactac--tgtataatttcatttttcatacccttaaccagtgc 3026169  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 610 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 12525873 - 12525747
Alignment:
Q  610 gttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||    
T  12525873 gttaagcatatcataaaagggaattattaccataaaatgaaactgtgtttgacattattataaattaattacacattttcaatgtattaactac--tata 12525776  T
Q  709 taatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12525775 taatttcctttttcatacccttaaccagt 12525747  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 579 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 5323585 - 5323424
Alignment:
Q  579 ggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    ||||||| ||| |||||||||| ||  || ||||| |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5323585 ggtcatgttaatcggtgcctccagggcaccggttacgcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttattataaattaat 5323486  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctc 741  Q
    |||| ||||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  5323485 tacataattttaatgctttaattac--tatataatttccttttttatattcttaatcagtgctc 5323424  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 636 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 20898075 - 20897974
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20898075 taccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacca 20897978  T
Q  736 gtgc 739  Q
    ||||    
T  20897977 gtgc 20897974  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 628 - 739
Target Start/End: Original strand, 21878398 - 21878507
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21878398 ggaattattaccataaaaagaaactgtttttgactttattataaattaattaaataatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatc 21878495  T
Q  728 cttaaccagtgc 739  Q
    ||||||| ||||    
T  21878496 cttaacccgtgc 21878507  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 636 - 739
Target Start/End: Original strand, 34477609 - 34477710
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477609 taccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacca 34477706  T
Q  736 gtgc 739  Q
    ||||    
T  34477707 gtgc 34477710  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 578 - 735
Target Start/End: Original strand, 25165413 - 25165569
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||  | |||||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  25165413 gggtcctgctaaccggtgctcccagggcattggttaagcatatcgtaaaagagaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaa 25165512  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25165513 ttacacaatttcaatatattaactac--tatataatttcttttttcatatccttaacca 25165569  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 605 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 9661145 - 9661018
Alignment:
Q  605 tactggttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacg 703  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  9661145 tactgattaaacatattataaaatggaattattaccataaaaggaaactgcttttaactttattttaaattaattatacaatttcaatgcattaacta-- 9661048  T
Q  704 atatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9661047 ttatgtaatttcttttttcatatccttaac 9661018  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 646 - 734
Target Start/End: Original strand, 34396596 - 34396682
Alignment:
Q  646 ggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34396596 ggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacc 34396682  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Original strand, 11115125 - 11115255
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  11115125 actggttaaacatatcataaaagggaattattaccataaaagaaaactatttttga--ttattataaattaattacacaatttcaatgtattaacta--t 11115220  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11115221 tatataatttccttttttatatccttaaccagtgc 11115255  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 642 - 745
Target Start/End: Original strand, 23629641 - 23629742
Alignment:
Q  642 aaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctc 741  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  23629641 aaaaggaaattgtttttgactttattataaagtaattacacaatttcaatacattaactac--tatataattttctttttcatatccttaatcagtgccc 23629738  T
Q  742 cggg 745  Q
    ||||    
T  23629739 cggg 23629742  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 602 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 961171 - 961051
Alignment:
Q  602 ggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaact 700  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  961171 ggatacgggttaagcataccataaaagagaattattatcataaaaggaaattgtttctgactttattatcaattaattacacaattttaatgcattaact 961072  T
Q  701 acgatatataatttcctttttca 723  Q
    ||  |||||||||||||||||||    
T  961071 ac--tatataatttcctttttca 961051  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 628 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 28225355 - 28225252
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  28225355 ggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaattac--tatataa-ttcctttttcatatc 28225259  T
Q  728 cttaacc 734  Q
    |||||||    
T  28225258 cttaacc 28225252  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 607 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 29978389 - 29978259
Alignment:
Q  607 ctggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgat 705  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||| || |||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||  |    
T  29978389 ctggttaagcatatcataaaagggaattattaccataaaattaaactgtttttgactttattataaatatattacataatttcaatacattaaatac--t 29978292  T
Q  706 atataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29978291 atataatttcctttttcatatccttaactagtg 29978259  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 664 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 13529554 - 13529481
Alignment:
Q  664 tattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13529554 tattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcacatccttaaccagtgc 13529481  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 577 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 31280502 - 31280362
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||  |||    |||||||||| | |||||||||  |||||| || ||||||||||||||    
T  31280502 tgggtcctgctaaccggtgcctccgggc-actcgttaagcataccata----gaattattactataaaaggaaaccgtttttgacattattataaattaa 31280408  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcat 724  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31280407 ttatacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcat 31280362  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 533 - 577
Target Start/End: Original strand, 2516309 - 2516353
Alignment:
Q  533 caagtaaatttattaatattgatgaagtcattataaataaagatt 577  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  2516309 caagtaaatttattaatattgataatgtcattatagataaagatt 2516353  T

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Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 47)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 579 - 745
Target Start/End: Original strand, 30675574 - 30675738
Alignment:
Q  579 ggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaatt 678  Q
    |||| |||||||||||| | || ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  30675574 ggtcctgctaaccggtgtccccggggcactggttaagcataccataaaaggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaatt 30675673  T
Q  679 acacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30675674 acacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 30675738  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 578 - 746
Target Start/End: Original strand, 9063052 - 9063219
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9063052 gggtcctgctaaccggtgcttccggggcactggttaagcatatcacaaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaa 9063151  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggga 746  Q
    || ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9063152 ttgcacgatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggga 9063219  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 578 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 4648380 - 4648213
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    |||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  4648380 gggtcatgctaaccggtgctcccaagatactggttaagcatatcataaaagggaattattaccatcaaaagaaactgtttttgacattattataaattaa 4648281  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggga 746  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4648280 ttacacaatttcaatgtattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaatcagtgccccggga 4648213  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 610 - 745
Target Start/End: Original strand, 33357161 - 33357295
Alignment:
Q  610 gttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  33357161 gttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tata 33357258  T
Q  709 taatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33357259 taatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 33357295  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 576 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 34228870 - 34228708
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||    
T  34228870 ttgggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaatt 34228771  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34228770 aattacacaatttcaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 34228708  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 168652 - 168487
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  168652 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccataaaatggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 168553  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  168552 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccgg 168487  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Original strand, 27988500 - 27988664
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  27988500 gggtcctgctaaccggtgcccccgggc-actggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 27988598  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27988599 ttacacaatttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccgg 27988664  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Original strand, 28045802 - 28045966
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  28045802 gggtcctgctaaccggtgcccccgggc-actggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 28045900  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28045901 ttacacaatttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccgg 28045966  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 610 - 745
Target Start/End: Original strand, 42035013 - 42035147
Alignment:
Q  610 gttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  42035013 gttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaactac--tata 42035110  T
Q  709 taatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42035111 taatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 42035147  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 577 - 739
Target Start/End: Original strand, 16888543 - 16888704
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  16888543 tgggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccacaaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 16888642  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16888643 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacctgtgc 16888704  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 578 - 747
Target Start/End: Original strand, 29444140 - 29444308
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| || ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  29444140 gggtcctgttaatcggtgcctccgggacactggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaa 29444239  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggag 747  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29444240 ttacacaatttcaatgcgttaactac--tatataatttcctttttcatatccttaatcagtgccccgggag 29444308  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 609 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 36730599 - 36730471
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  36730599 ggttaagcatactataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tat 36730502  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36730501 ataatttcctttttcatatccttaactagtg 36730471  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 585 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 21596025 - 21595872
Alignment:
Q  585 gctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacaca 683  Q
    ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21596025 gctaaccagtgtctccgggacactggttaagcataccataaaagggaattaataccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacaca 21595926  T
Q  684 atttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21595925 atttcaatgcattaactcc--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgc 21595872  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 585 - 738
Target Start/End: Original strand, 2805267 - 2805419
Alignment:
Q  585 gctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacaca 683  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||  |||||||||||    
T  2805267 gctaaccggtgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataggttaattacaca 2805366  T
Q  684 atttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805367 atttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 2805419  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 578 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 11112825 - 11112666
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||  || |||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  11112825 gggtcctgctaaccagtgcccccagggcacaggttaagcataccataaaagtgaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaa 11112726  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11112725 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 11112666  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Original strand, 4537744 - 4537909
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||  || |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  4537744 gggtcctgctaaccggtgcctctggggcacaggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 4537843  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4537844 ttacataatttcaatgcattaactac--tatataatttcctattttatatccttaaccagtgccccgg 4537909  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 568 - 737
Target Start/End: Original strand, 9537813 - 9537982
Alignment:
Q  568 aataaagat-tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaacctta 665  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | |||| |||| |  |||| |  |||    
T  9537813 aataaagatatgggtcctgctaaccggtgtctccgggacactggttaagcataccataaaaggaaattattactataaaaagaaactccttttgaattta 9537912  T
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9537913 ttataaattaattacacaattttaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagt 9537982  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 577 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 40831464 - 40831303
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||||||| |||| || ||| | ||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  40831464 tgggtcctgctaaccggtgtctccagggtacagattatgcatactataaaagaaaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaatta 40831365  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  40831364 attatacaatttcaatgcattaactac--tatataattttctttttcatatctttaaccagtgc 40831303  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 13643197 - 13643032
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcct-ggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  13643197 gggtcctgctaaccggtgc-tcctagggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaattt-tttttgactttattataaatta 13643100  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13643099 attacataatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcgtatccttaaccagtgccccggg 13643032  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 13743622 - 13743457
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcct-ggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||    
T  13743622 gggtcctgctaaccggtgc-tcctagggcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaattt-tttttgactttattataaatta 13743525  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13743524 attacataatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcgtatccttaaccagtgccccggg 13743457  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 624 - 733
Target Start/End: Original strand, 16890527 - 16890634
Alignment:
Q  624 aaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttca 723  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16890527 aaaaggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttca 16890624  T
Q  724 tatccttaac 733  Q
    ||||||||||    
T  16890625 tatccttaac 16890634  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 606 - 738
Target Start/End: Original strand, 20831581 - 20831712
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||      
T  20831581 actgattaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataaattaattatactatttcaatgcattaactac-- 20831678  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20831679 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 20831712  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 32114095 - 32113929
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggat-actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaagg-aaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  32114095 gggtcctgctaaccggtggctc-tggagcactggttaaacatactataaaagggaattattatcataaaagggaaactgttttttactttattataaatt 32113997  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32113996 aattaaacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccaatactccgg 32113929  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 577 - 732
Target Start/End: Original strand, 7304517 - 7304671
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| | |||||||||||| || |   ||||||||||||||  ||||||| ||||||||  || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  7304517 tgggtcctactaaccggtgcccccggagcactggttaagcataccataaaagagaattattttcataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 7304616  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaa 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  7304617 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataattttctttttcatatccttaa 7304671  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 745
Target Start/End: Original strand, 16394058 - 16394227
Alignment:
Q  575 attgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaat 673  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| |||    
T  16394058 attgggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccataaaagagaattattagcataaaaggaaactgtttttgactttattatcaat 16394157  T
Q  674 taattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16394158 taattacattatttcaatgcattaacta--ttatataattttctttttcacatccttaaccagtgccccggg 16394227  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 584 - 745
Target Start/End: Original strand, 9253908 - 9254067
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    |||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||    
T  9253908 tgctaaccggtgcccctgggacattggttaagcataccataaaagagaattattactataaaaggaaactgtttttgactttattatca-ttaattacac 9254006  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9254007 aatttcaatgcattaactac--tataaaatttcatttttcatatccttaaccagtgccccggg 9254067  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 581 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 37373388 - 37373232
Alignment:
Q  581 tcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaatta 679  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||| || |||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||  || ||||||| |||||||||    
T  37373388 tcatgttaatcggtgtctccgggacacgggttaagcataccatgaaagggaattattaccataaaagaaaactgttttcgactttattatcaattaatta 37373289  T
Q  680 cacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37373288 cacaatttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 37373232  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 606 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 12204012 - 12203885
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12204012 actggttcagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 12203915  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12203914 tatataatttcttttttcatacccttaacc 12203885  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 606 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 12448440 - 12448313
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||| ||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12448440 actggttcagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 12448343  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12448342 tatataatttcttttttcatacccttaacc 12448313  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 575 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 43119405 - 43119243
Alignment:
Q  575 attgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaat 673  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  43119405 attgggtcctgctaaccggtgcc-ccgggccattggttaagcataccataaaagagaattatcaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaat 43119307  T
Q  674 taattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  43119306 taattatacaatttcaatgcattaactac--tatataattttctttttcatatctttaatcagtgc 43119243  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 584 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 28626947 - 28626794
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  28626947 tgctaaccggtgc-tcccggacactgattaagcataccataaaagggaattattatcataaaaagaaactgtttttgactttattataaattaatcacac 28626849  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28626848 aatttcaatacattaactac--tatataatttcctttttcacatccttaaccggtgc 28626794  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Original strand, 3930261 - 3930393
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  3930261 actggttaagcatatcataaaaggaaattattatcaaaaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaacttcaatgcattaactac-- 3930358  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||    
T  3930359 tatataatttcctctttcatattattaactagtgc 3930393  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 577 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 29235422 - 29235254
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||  | ||||| |  |||||||||||||    
T  29235422 tgggtcatgctaaccggtgttcccgggacactggttaagcatcctataaaaggaaattattatcataaaaggaacctatttttgattttattataaatta 29235323  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggga 746  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  29235322 attacacaaatttaatgcattaactac--tatataatttctttttttatatccttaatcaatgctccggga 29235254  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 609 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 16785241 - 16785112
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||    
T  16785241 ggttaatcataccataaaagagaattattattataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaact--gctat 16785144  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16785143 ataatttcttttttcatatccttaaccagtgc 16785112  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 628 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 10870487 - 10870382
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||| |||||    
T  10870487 ggaattattaccataaaaggaaactgtttttgattttattataaattaattacacaatttcaatgtattaacta--ttatataattttcttttttatatc 10870390  T
Q  728 cttaacca 735  Q
     |||||||    
T  10870389 attaacca 10870382  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 663 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 9278312 - 9278239
Alignment:
Q  663 ttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9278312 ttattataaattaattacacaatttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatatctttaacgagtg 9278239  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 648 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 34192890 - 34192809
Alignment:
Q  648 aaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcctta 731  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  34192890 aaattatttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaacta--gtatataatttcctttttcatattctta 34192809  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 630 - 736
Target Start/End: Original strand, 42433597 - 42433700
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcct 729  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||| ||    
T  42433597 aattattaccataaaagaaaactgtttttgacttt-ttataaattaattacacaatttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttagtatgct 42433693  T
Q  730 taaccag 736  Q
    |||||||    
T  42433694 taaccag 42433700  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 642 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 17467724 - 17467630
Alignment:
Q  642 aaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17467724 aaaaggaaattgtttttgattttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaattac--tgcataatttcctttttcatatcattaactagtg 17467630  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 576 - 691
Target Start/End: Original strand, 24843278 - 24843393
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||  || ||||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  24843278 ttgggtcctgctaaccggtgc-tcccgaatactgattaagcataccataaaagagaattattgtcataaaaggaaactgattttgactttattataaatt 24843376  T
Q  675 aattacacaatttcaat 691  Q
    |||||||||||||||||    
T  24843377 aattacacaatttcaat 24843393  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 663 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 10618118 - 10618044
Alignment:
Q  663 ttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  10618118 ttattatcaattaattacacaatttaattgcattaactac--tatataattttctttttcatatccttaacctgtgc 10618044  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 686 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 12652707 - 12652653
Alignment:
Q  686 ttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctcc 742  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12652707 ttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctcc 12652653  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 628 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 39406977 - 39406905
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaact 700  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  39406977 ggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaattttaacgcattaact 39406905  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 628 - 707
Target Start/End: Complemental strand, 22956840 - 22956761
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  22956840 ggaatttttaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacataattttaatgtattaactaccatat 22956761  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 630 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 22451916 - 22451847
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaact 700  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22451916 aattattaccataaaaggaagctatttttgacttt-ttataaattaattacacaatttcaatgcattaact 22451847  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 642 - 708
Target Start/End: Original strand, 30933387 - 30933452
Alignment:
Q  642 aaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30933387 aaaagaaaaatgtttttaacttt-ttataaattaattacacaatttcaatgcattaattactatata 30933452  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 705 - 739
Target Start/End: Original strand, 36923789 - 36923823
Alignment:
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36923789 tatataatttcctttttcatatccttaatcagtgc 36923823  T

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Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 13661994 - 13661828
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||    
T  13661994 gggtcctgctaaccggtgcctccggggcacgggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaa 13661895  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13661894 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 13661828  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 578 - 739
Target Start/End: Original strand, 34650833 - 34650993
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  34650833 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 34650932  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34650933 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgc 34650993  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 578 - 738
Target Start/End: Original strand, 35504241 - 35504399
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| || |||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||| || ||||||| || ||||||||||||||    
T  35504241 gggtcctgctaaccggtgccccc-ggacacgggttaagcataccataaaagggaattattgccataaaagggaactgtttttgacattattataaattaa 35504339  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35504340 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtg 35504399  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 577 - 734
Target Start/End: Original strand, 21547393 - 21547549
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |  |||| |||| ||||||| || |||||||||||||    
T  21547393 tgggtcctgctaaccggtgtctccggggtactggttaagcataccataaatgagaattattaacttaaaatgaaactgtttttgactttattataaatta 21547492  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21547493 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttttatatccttaacc 21547549  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 35132707 - 35132549
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  35132707 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccataaaagagaattattaccataaa-gaaaactgtttttgactttattataaattaa 35132609  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35132608 ttacacaatttcaatgtattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 35132549  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 8787525 - 8787359
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  || |||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  8787525 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcacaggttaagcataccataaaatggaattattatcataaaaggaaactgtttttgatattattataaattaa 8787426  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  8787425 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcatttttcatacccttaaccaatgccccggg 8787359  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 578 - 732
Target Start/End: Original strand, 40564404 - 40564557
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||    || || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  40564404 gggtcctgctaaccggtgcccttggggtattggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaaaaaattgtttttgactttattataaattaa 40564503  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaa 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40564504 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcaaatccttaa 40564557  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 606 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 12506454 - 12506319
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12506454 actggttaagcattccataaaagagaattattactataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 12506357  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctcc 742  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  12506356 tatataatttcctttttcatactcttaacgagtgctcc 12506319  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 610 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 20175381 - 20175254
Alignment:
Q  610 gttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20175381 gttaagcatattataaaagggaattattatcataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tata 20175284  T
Q  709 taatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  20175283 taatttctttttttatatttttaaccagtg 20175254  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 581 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 6283745 - 6283583
Alignment:
Q  581 tcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaatta 679  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6283745 tcatgctaaccggtgcccctagggcactggttaagcataccataaaaatgaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaatta 6283646  T
Q  680 cacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  6283645 cacaatttcaatgcattaatta--ttatataattttctttttcatatctttaactagtgccccgg 6283583  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Original strand, 11957967 - 11958133
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||  |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  11957967 gggtcctgctaaccggtgcccctggggcactggttaagcatgccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 11958066  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  11958067 ttacacaatttcattgcattaactac--tatataatttccttttttatatctttaacctgtgccccggg 11958133  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 624 - 745
Target Start/End: Original strand, 10054400 - 10054518
Alignment:
Q  624 aaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttca 723  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  10054400 aaaaggaattattaccataaaaggaaactgttttga-cattattataaattaattacacaatttcaatgcattaatta--ttatataatttcctttttca 10054496  T
Q  724 tatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  10054497 tacccttaaccagtgccccggg 10054518  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 626 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 13470288 - 13470177
Alignment:
Q  626 aaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcata 725  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||    
T  13470288 aaggtattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattgactac--tatattatttcctttttcata 13470191  T
Q  726 tccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||    
T  13470190 tccttaaccagtgc 13470177  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 11846230 - 11846106
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaaggaatt-attaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  11846230 actggttaagcatactataaaagggatttattaccataaaaggaaactacttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaactac-- 11846133  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatcctta 731  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11846132 tatataatttccttttttatatcctta 11846106  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 578 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 10956137 - 10956013
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||| | | | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  10956137 gggtcttgctaaccggtacattcggggtactggttaagcatatcataaaaggaaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttgttataaattaa 10956038  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactac 702  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10956037 tta-acaatttcaatgcattaactac 10956013  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 636 - 744
Target Start/End: Original strand, 19647717 - 19647823
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19647717 taccataaaaggaaactgtttatgactttattatcaattaattatacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacca 19647814  T
Q  736 gtgctccgg 744  Q
    |||| ||||    
T  19647815 gtgccccgg 19647823  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 628 - 737
Target Start/End: Original strand, 9721658 - 9721765
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    |||||||||| || ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  9721658 ggaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattaaacaatttcaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatatt 9721755  T
Q  728 cttaaccagt 737  Q
    ||||||||||    
T  9721756 cttaaccagt 9721765  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 636 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 10070095 - 10069989
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10070095 taccataaaaagaaactgtttttgactttattatca-ttaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacca 10069999  T
Q  736 gtgctccggg 745  Q
    |||| |||||    
T  10069998 gtgccccggg 10069989  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 629 - 738
Target Start/End: Original strand, 39066987 - 39067095
Alignment:
Q  629 gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcc 728  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  39066987 gaattattaccataaaaggatattgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatatattaacta-attatataatttcttttttcatatcc 39067085  T
Q  729 ttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||    
T  39067086 ttaaccagtg 39067095  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 597 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 31909793 - 31909659
Alignment:
Q  597 ctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcat 695  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||     ||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31909793 ctccgggatactggttaagcataccataaaagaaaattattatca-----ggaaactgtttttgactttattataaatcaattacacaatttcaatgcat 31909699  T
Q  696 taactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31909698 taactac--tatataatttcccttttaatatccttaaccagt 31909659  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 577 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 40057494 - 40057340
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||| || || |||||||| || |||||| | ||||| ||| || |||| |  |||||||||||||    
T  40057494 tgggtcctgctaaccggtgcctcgaggtcactggttaaacacatcataaaagggaaatattactataaaagaaaactgcttttgattttattataaatta 40057395  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaa 732  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40057394 attatactatttcaatgcactaactac--tatataatttcctttttcatatccttaa 40057340  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 663 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 4837357 - 4837277
Alignment:
Q  663 ttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  4837357 ttattataaattaattacacaatttcaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatattcttaaccggtgccccggg 4837277  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 578 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 4268747 - 4268623
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||  | ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||| |  || |||||||||||    
T  4268747 gggtcatactaaccggtgccccctggacacgggttaagcataccaaaaaagaaaattattaccataaaaggaaactgttttttatttt-ttataaattaa 4268649  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactac 702  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4268648 ttacacaattttaatgcattaactac 4268623  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 615 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 39069527 - 39069407
Alignment:
Q  615 gcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaacc-ttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataat 712  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  39069527 gcatatcataaaagagaattattaccataaaaggaaattgtttttcacaattattata---taattacacaattttaatgcattaactac--tatataat 39069433  T
Q  713 ttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||    
T  39069432 ttcc-ttttcatacccttaaccagtgc 39069407  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 655 - 738
Target Start/End: Original strand, 2619635 - 2619716
Alignment:
Q  655 ttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2619635 ttttaactttattataaattaattacacaatttcaatacattaactac--taaataattttctttttcatatccttaacaagtg 2619716  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 629 - 738
Target Start/End: Original strand, 19436890 - 19436995
Alignment:
Q  629 gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcc 728  Q
    |||||||||||| ||||  ||| | |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19436890 gaattattaccataaaaa-aaactatttttaactttat-ataaattaattatacaatttcaatgctttaaccac--tatataatttcctttttcatatcc 19436985  T
Q  729 ttaaccagtg 738  Q
    ||||| ||||    
T  19436986 ttaacgagtg 19436995  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 666 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 6284892 - 6284822
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6284892 ttataaattaattatacaatttcaatacattaattac--tatataatttcctttttagtatccttaaccagtg 6284822  T

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Target: chr1 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 578 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 15227925 - 15227765
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  15227925 gggtcttgctaaccggtgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 15227826  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227825 ttacacaatttcaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 15227765  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 47010179 - 47010014
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggat-actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||    
T  47010179 gggtcctgctaaccggtgcc-cctggagcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttgaatttattataaatta 47010081  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47010080 attacacaatttcaatacattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 47010014  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 585 - 739
Target Start/End: Original strand, 3784720 - 3784873
Alignment:
Q  585 gctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacaca 683  Q
    ||||||||||||| || ||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  3784720 gctaaccggtgcccccgggacacgggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattatcaattaattacaca 3784819  T
Q  684 atttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784820 atttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 3784873  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 578 - 733
Target Start/End: Original strand, 19031815 - 19031969
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  19031815 gggtcctgctaaccggtgtctccggggtacgggttaagcatatcataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 19031914  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19031915 ttacacaatttcaatgttttaactac--tatataatttcctttttcatatccttaac 19031969  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 29657957 - 29657791
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  29657957 gggtcctgctaaccggtgcccccagggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccaaaaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 29657858  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29657857 ttatacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttttatatccttaaccagtgccccggg 29657791  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Original strand, 14350279 - 14350443
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  || || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14350279 gggtcctgctaaccggtgcc-ccggggcactggttaagcataccattaagggaattattaccataaaaggaaattgtttttgacattattataaattaat 14350377  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14350378 tacacaattttaatgcattaactac--aatataatttcctttttcatacccttaaccggtgctccggg 14350443  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 579 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 38163035 - 38162871
Alignment:
Q  579 ggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    |||| |||||||||||||| || ||  || |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  38163035 ggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaat 38162936  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38162935 tacacaatttcaatgcattaactac--tatataattttctttttcatacccttaaccagtgccccgg 38162871  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 609 - 745
Target Start/End: Original strand, 30294412 - 30294547
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  30294412 ggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaagaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tat 30294509  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30294510 ataatttcctttttcatatccttaaccaatgctccggg 30294547  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 578 - 738
Target Start/End: Original strand, 51065748 - 51065907
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  51065748 gggtcctgctaaccggtgcccctggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 51065847  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51065848 ttacacaatttcaatacattaactac--tatataatttactttttcatatccttaaccagtg 51065907  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 5694507 - 5694342
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || |   ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  5694507 gggtcctgctaaccggtgcccccggagcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 5694408  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5694407 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccctttttatatccttaaccagtgccccgg 5694342  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 18043348 - 18043183
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  18043348 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaagaaaactgtttttgacattattataaattaa 18043249  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  18043248 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttttatacccttaaccagtgccccgg 18043183  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 584 - 745
Target Start/End: Original strand, 12072068 - 12072228
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  12072068 tgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaaaggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacac 12072167  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  12072168 aatttcaatgcattaactac--tacataatttcctttttcatatccttaaccggtgccccggg 12072228  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 745
Target Start/End: Original strand, 24178461 - 24178629
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    |||||||  ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||| || |||||||| |||    
T  24178461 ttgggtccggctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatgaaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattatagatt 24178560  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24178561 aattacacaatttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccggg 24178629  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 584 - 745
Target Start/End: Original strand, 42769996 - 42770156
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  42769996 tgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaaggaaactgtttttgatattattataaattaattacac 42770095  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  42770096 aatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcataccattaaccagtgccccggg 42770156  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 605 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 3097818 - 3097679
Alignment:
Q  605 tactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacg 703  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  3097818 tactggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaactac- 3097720  T
Q  704 atatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3097719 -tatataatttcctttttcatatccttaaccaggactccggg 3097679  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 577 - 739
Target Start/End: Original strand, 9266727 - 9266888
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggat-actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||    
T  9266727 tgggtcctgctaaccggtgcttc-tggagcactggttaagtataccataaaagcgaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatgaatt 9266825  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9266826 aattacacaatttcaatgcattaaatac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 9266888  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 606 - 745
Target Start/End: Original strand, 35985649 - 35985787
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35985649 actggttaagtatactataaatgggaattattaccataaaaggaaactgtttttcactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 35985746  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  35985747 tatataatttccttttttatatccttaaacagtgatccggg 35985787  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 602 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 6770499 - 6770370
Alignment:
Q  602 ggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaact 700  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6770499 ggatactggttaagcatatcataaaagggaattattatcataaaatgaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaact 6770400  T
Q  701 acgatatataatttcctttttcatatccttaa 732  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6770399 ac--tatataatttcctttttcatatccttaa 6770370  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 609 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 48071637 - 48071510
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  48071637 ggttaagcatactataaaagataattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaacta--ttat 48071540  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48071539 ataatttccttttacatatccttaaccagt 48071510  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 578 - 739
Target Start/End: Original strand, 17333284 - 17333442
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||  ||  |||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  17333284 gggtcctgctaaccggtgcctccggggcattggttaag--taccataaaagggaagtattatcataaaaggaaactgtttttgactttattatgaattaa 17333381  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17333382 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 17333442  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 578 - 747
Target Start/End: Original strand, 38701937 - 38702101
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||  ||||   |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  38701937 gggtcctgctaaccggtgccctcggggcactggttaagcataccataa---gaattattaccataaaagaaaactgtttttgacattattataaattaat 38702033  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggag 747  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38702034 tacataatttcaatgcattaactac--tatatagtttcctttttcatacccttaaccagtgccccgggag 38702101  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 606 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 45431436 - 45431311
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  45431436 actggttaagtatatcataaaagagaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaactac-- 45431339  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaa 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45431338 tatataatttcctttttcatatccttaa 45431311  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 578 - 732
Target Start/End: Original strand, 50128172 - 50128325
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  50128172 gggtcctgctaaccggtgtttctgggacactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaatgaaactgcttttaactttattataaattaa 50128271  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaa 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  50128272 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatgtaattttctttttcatatccttaa 50128325  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 636 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29210540 - 29210434
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29210540 taccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaacca 29210443  T
Q  736 gtgctccgg 744  Q
    |||| ||||    
T  29210442 gtgccccgg 29210434  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 737
Target Start/End: Original strand, 51368813 - 51368943
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  51368813 actggttaagcataccataaaatggaattattactataaaaggaaactatttttgacattattataaattaactacacaatttcaatgcattaactac-- 51368910  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51368911 tatataatttcctttttcatacccttaaccagt 51368943  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Original strand, 36446353 - 36446484
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  36446353 actggttaaacataccataaaagggaattattactataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 36446450  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36446451 tatataatttccttttt-atattcttaaccagtgc 36446484  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 609 - 735
Target Start/End: Original strand, 23473495 - 23473620
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||    
T  23473495 ggttaagcatattataaaaagaaattattaccataaaaggaaactgctttaaactttattataaattaattatacaatttcaatacattaact--gctat 23473592  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23473593 ataatctcctttttcatatccttaacca 23473620  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 606 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 43286880 - 43286749
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||       
T  43286880 actggttaagcataccataaaagagaattattactataaaaggaaactatttttgactttattataaattaattacataatttcaaaacattaacta--t 43286783  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43286782 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 43286749  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 577 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 30657789 - 30657626
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||       ||||||| || |||||||||||||    
T  30657789 tgggtcctgctaatcggtgcctccggggtactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaac------tgtttttgactttattataaatta 30657696  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggag 747  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  30657695 attacataatttcaatgcattaactac--tatataatttcttttttcatatgcttaactagtgccccgggag 30657626  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 577 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 41730495 - 41730331
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||| |||| ||  ||  ||| ||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  41730495 tgggtcctgctaaccagtgcttctggggcacttgttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 41730396  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacga-tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  41730395 attaaacaatttcaatgcattaattactactatataatttcttttttcatattcttaacccgtgc 41730331  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 733
Target Start/End: Original strand, 47532669 - 47532824
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||||| |||||||||||| || | ||  | ||||||||||||  |||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||| | ||    
T  47532669 ttgggtcttgctaaccggtgtcttcggggcattggttaagcataccataaaagggaattattattataaaaggaaattatttttgactttattatca-tt 47532767  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47532768 aattacacaatttcaatgcattaactac--tatataattttctttttcatatccttaac 47532824  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 606 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 12307075 - 12306950
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  12307075 actggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaatctgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaactac-- 12306978  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
     ||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  12306977 -atataattttctttttcgtatcattaac 12306950  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 606 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 29683354 - 29683215
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||      
T  29683354 actggttaagcataccataaaagtgaattattactataaaatgaaactgtttttgactttattataaattaattatacgatttcaatgcattaactac-- 29683257  T
Q  705 tatataatttcc-tttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29683256 tatataatttcctttttttatatctttaaccagtgccccggg 29683215  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 629 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 38335303 - 38335196
Alignment:
Q  629 gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcc 728  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||     
T  38335303 gaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaattacaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatatct 38335206  T
Q  729 ttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||    
T  38335205 ttaaccagtg 38335196  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 606 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 13961369 - 13961232
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  13961369 actggttaagcataccataaaagaaaattattaccataaaatgaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 13961272  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  13961271 tatataattt-tttttttatatccttaacccgtgccccggg 13961232  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 606 - 735
Target Start/End: Original strand, 8472942 - 8473070
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||  | |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  8472942 actggttaagtataccataaaagagaattattattataaaatgaaactgtttttgactttattataaattaattacacaattttaatgcattaacta--t 8473039  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8473040 tatataatttccttttttatatccttaacca 8473070  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 608 - 747
Target Start/End: Original strand, 48383141 - 48383279
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgata 706  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||     |    
T  48383141 tggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaattacattatttcaatacattaact--ttca 48383238  T
Q  707 tataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggag 747  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  48383239 tataattttctttttcacatccttaaccagtgccccgggag 48383279  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 624 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 52749741 - 52749632
Alignment:
Q  624 aaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttca 723  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||    
T  52749741 aaaaggaattattaccataaaaaaaaattgtttttaactttattgtaaatttagtatacaatttcaatacattaacta--ttatataatttcctttttca 52749644  T
Q  724 tatccttaacca 735  Q
    |||| |||||||    
T  52749643 tatctttaacca 52749632  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 606 - 735
Target Start/End: Original strand, 45449272 - 45449400
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||      
T  45449272 actggttaaacataccataaaaggcaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataatttaattacactattttaatgcattaactac-- 45449369  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  45449370 tatataattttcttttttatatctttaacca 45449400  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 654 - 737
Target Start/End: Original strand, 15282591 - 15282672
Alignment:
Q  654 tttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15282591 tttttgactttattataaattaattacacaatttcaatatattaactac--tatataattttctttttcatatccttaaccagt 15282672  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 663 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 26228293 - 26228213
Alignment:
Q  663 ttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  26228293 ttattataaattaattacataatttcaatgcattaactac--tatataatttcattttttatctccttaaccagtgcttcggg 26228213  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 642 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 39497428 - 39497326
Alignment:
Q  642 aaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctc 741  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  39497428 aaaagaaaattatttttgactttattataaattaattatataattttaatgcattaactac--tatataattttctttttcatatccttaatcaatgctc 39497331  T
Q  742 cggga 746  Q
     ||||    
T  39497330 tggga 39497326  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 580 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 52431765 - 52431636
Alignment:
Q  580 gtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg--aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    |||||||||||||||| | |  ||  ||||||||||||||  | |||| |  ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||||||||||    
T  52431765 gtcatgctaaccggtgtccctggggcactggttaagcataccaaaaaaaggaaattattaccataaaagaaaattgcttttgacatt-ttataaattaat 52431667  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52431666 tacacaatttcaatgcattaactactatata 52431636  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 606 - 737
Target Start/End: Original strand, 35700680 - 35700808
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||||| || ||||  ||||| |||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  35700680 actggttaaggatatcaaaaaaggaagttattatcataaaa--aaatttttttttgactttttataaattaattacacaatttcaatgtattaactac-- 35700775  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    | |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35700776 tgtataatttcctttttagtatccttaaccagt 35700808  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 578 - 738
Target Start/End: Original strand, 3838777 - 3838936
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg--aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||| |||||||| ||||||  | || ||||| ||||||||| || |||| |  ||||||| ||| ||||  |||||| |||| || || ||||||||||    
T  3838777 gggttatgctaactggtgccctcggggtactgattaagcatactaaaaaaaggaaattattgccataaaaaaaaattgcttttgacatt-ttataaatta 3838875  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  3838876 attacacaattttaatgcattaacta--ttatataatttcctttttagtatgcttaaccagtg 3838936  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 624 - 721
Target Start/End: Original strand, 37315315 - 37315409
Alignment:
Q  624 aaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttccttttt 721  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37315315 aaaagaaattattagcataaaagaaaactgtctttgacttt-ttataaattaattacataatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttt 37315409  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 575 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 39081989 - 39081827
Alignment:
Q  575 attgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaat 673  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  | ||||| |||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||| || ||||||  || ||||||||    
T  39081989 attggatcatgctaaccggtacccccgaggtactgattaagcatattaaaaaagaaaattattatcataaaatgaaactgcttttaatatt-ttataaat 39081891  T
Q  674 taattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  39081890 taattataaaatttcaatacattaacta--gtatataatttcatttttagtatgcttaaccagtgc 39081827  T

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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 666 - 739
Target Start/End: Original strand, 39912368 - 39912439
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  39912368 ttataaattaatcacacaatttcaatgcattaacta--gtatataatttccctttttatatccttaatcagtgc 39912439  T

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Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 624 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 30217901 - 30217786
Alignment:
Q  624 aaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcc--ttttt 721  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  | | ||||| ||  |||||    
T  30217901 aaaagaaattattaccataaaagaaaactatttttgactttattataaattaattaaataatttaaatgcattaactac--tctctaattcccttttttt 30217804  T
Q  722 catatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||| |||||||    
T  30217803 catatccttagccagtgc 30217786  T

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Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 689 - 746
Target Start/End: Original strand, 19011108 - 19011163
Alignment:
Q  689 aatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggga 746  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19011108 aatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacccgtgccccggga 19011163  T

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Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 28481940 - 28481873
Alignment:
Q  663 ttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccag 736  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28481940 ttattataaattaattacacaattttaatgcatta------ctgtataatttcctttttcatatccttaaccag 28481873  T

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Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 666 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 37503311 - 37503260
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttccttt 719  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  37503311 ttataaattaattacacaatttcaatgtattaactac--tatataatttccttt 37503260  T

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Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 667 - 702
Target Start/End: Original strand, 19011057 - 19011092
Alignment:
Q  667 tataaattaattacacaatttcaatgcattaactac 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19011057 tataaattaattacacaatttcaatgcattaactac 19011092  T

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Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 683 - 739
Target Start/End: Original strand, 10976008 - 10976062
Alignment:
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10976008 aattttaatgcattaactac--tatataatctcctttttcatatccttaacaagtgc 10976062  T

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Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 705 - 737
Target Start/End: Original strand, 14881092 - 14881124
Alignment:
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14881092 tatataatttcctttttcatatccttaaccagt 14881124  T

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Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 634 - 684
Target Start/End: Original strand, 14881036 - 14881086
Alignment:
Q  634 attaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaa 684  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  14881036 attaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattatacaa 14881086  T

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Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 577 - 618
Target Start/End: Original strand, 38595751 - 38595792
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcat 618  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  38595751 tgggtcatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagcat 38595792  T

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Target: chr3 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 52520867 - 52520701
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  52520867 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 52520768  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  52520767 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 52520701  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 577 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 272407 - 272240
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||  || | |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||    
T  272407 tgggtcctgctaaccggtgcccccggggcaccgattaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattataaatta 272308  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  272307 attacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccggg 272240  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 577 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 46352821 - 46352654
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||||||| |||||    
T  46352821 tgggtcctgctaaccggtgcctccggggcacgggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaatta 46352722  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46352721 attacacaatttcaatgcattaactac--tgtataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccggg 46352654  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 738
Target Start/End: Original strand, 10617282 - 10617443
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||  || |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10617282 ttgggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaattgtttttgactttattataaatt 10617381  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10617382 aattacacaattttaatgcattaactac--tatataatttccttttttatatccttaatcagtg 10617443  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 585 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 49893510 - 49893351
Alignment:
Q  585 gctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacaca 683  Q
    ||||||||||||| || ||  |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  49893510 gctaaccggtgcccccggggcactgattaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatagattaattacaca 49893411  T
Q  684 atttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  49893410 atttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccggg 49893351  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 4168369 - 4168211
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  4168369 gggtcctgctaaccggtgcccccggggtacgggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaa 4168270  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4168269 ttacacaatttcaatacattaactac--tatataatttccttttttatatccttaaccagt 4168211  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 39074604 - 39074439
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  39074604 gggtcctgctaaccggtgcccctggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttga-cattattataaattaa 39074506  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39074505 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 39074439  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 585 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 858768 - 858615
Alignment:
Q  585 gctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacaca 683  Q
    ||||||||||||| || ||  || |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  858768 gctaaccggtgcccccggggcacgggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaattacaca 858669  T
Q  684 atttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  858668 atttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaactagtgc 858615  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 630 - 745
Target Start/End: Original strand, 41553993 - 41554106
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcct 729  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  41553993 aattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatcct 41554090  T
Q  730 taaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||| |||||    
T  41554091 taaccagtgcaccggg 41554106  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 43787057 - 43786892
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||    
T  43787057 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaatagaattattaccataaaaggaaactgtttttgatattattataaattaa 43786958  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  43786957 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcataccattaaccagtgccccgg 43786892  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 48725429 - 48725297
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  48725429 actggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaattac-- 48725332  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48725331 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 48725297  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 744
Target Start/End: Original strand, 42964249 - 42964414
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctg-gatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    ||||| |||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||    
T  42964249 gggtcctgctaaccggtgtc-cctgagacactggttaagcatatcataaaagtgaattattactataaaagaaaactgtttttgactttattataaatta 42964347  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42964348 attacacaatttcaatgcattaactac--tataaaatttcatttttcatatccttaaccagtgccccgg 42964414  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 622 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 2119571 - 2119457
Alignment:
Q  622 ataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttccttttt 721  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2119571 ataaaaggaattattac-ataaaaggaaattgtttttgactttattataaattaattactcaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttt 2119475  T
Q  722 catatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||| |||||||||||    
T  2119474 catatctttaaccagtgc 2119457  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 18014858 - 18014692
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||| |||||| || ||  |||| |||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||    
T  18014858 gggtcttgctaactggtgcccccggggcactgattaagcataccataaaaggaaattattatcataaaaggaaactgtttttaactttattatagtttaa 18014759  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18014758 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttactttttcatatccttaatcagtgccccggg 18014692  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 606 - 745
Target Start/End: Original strand, 49529294 - 49529435
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  49529294 actggttaaacataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaaatgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaactacta 49529393  T
Q  705 -tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49529394 gtatataattttctttttcatatccttaatcagtgccccggg 49529435  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 7468597 - 7468438
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||  |||||||| ||||||| || ||||| ||| || |||| || |||||||||||||    
T  7468597 ttgggtcctgctaaccggtgc-tccggggcactgattaagcataccataaaagggattattatcataaaagaaaactgcttttgactttattataaatta 7468499  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7468498 attatacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatttccttaaccagtg 7468438  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 578 - 743
Target Start/End: Original strand, 43269739 - 43269903
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||| |  ||||||||| | ||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||    
T  43269739 gggtcctgctaaccggtgcctccggggcactggttaagcataccataaaggataattattactataaaaggaaactgtgtttgattttattataaattaa 43269838  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccg 743  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43269839 ttacataatttcaatgcattaactac--tatgtaatttcccttttcatatccttaaccagtgctccg 43269903  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 608 - 745
Target Start/End: Original strand, 53489854 - 53489990
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgata 706  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  53489854 tggttaagcataccataaaatagaattattatcataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaattttaatgcattaactac--ta 53489951  T
Q  707 tataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  53489952 tataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 53489990  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 737
Target Start/End: Original strand, 2938040 - 2938198
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||  | || |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2938040 gggtcctgctaaccggtgccctcggggtactcgttaagcataccataaaagtgaattattaccataaaatgaaattgtttttgactttattataaattaa 2938139  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  2938140 tcacacaatttcagtgcattaactac--tatataattttcttttttatatctttaaccagt 2938198  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 584 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 22249066 - 22248912
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    ||||||||||||| ||  || || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  22249066 tgctaaccggtgcttctagggtattggtcaagcatactataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacac 22248967  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22248966 aatttcaatacaataactac--tatataatttcctttttcatatccttaactagtgc 22248912  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 20924150 - 20924013
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  20924150 actggttaagtataccataaaagagaattattaccttaaaaggaaactgtttttgatattattataaattaattacacaatttcaatgaattaactac-- 20924053  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20924052 tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccgg 20924013  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 744
Target Start/End: Original strand, 40362608 - 40362745
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  40362608 actggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaattttaatgcattaactac-- 40362705  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40362706 tatataatttcttttttcatatccttaatcagtgccccgg 40362745  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 584 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 41304183 - 41304026
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    |||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||     
T  41304183 tgctaaccggtgtctccggggcattggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaattaca- 41304085  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
     ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41304084 -atttcaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatatccttaaccactgccccgg 41304026  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 42548253 - 42548121
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  42548253 actggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaatgaaattatttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaactac-- 42548156  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  42548155 tatataatttcttttttcatatctttaagcagtgc 42548121  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 2505507 - 2505379
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  2505507 actggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgactttattatgaattaattacacaatttcaatgcactaactac-- 2505410  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2505409 tatataatttcctttttcatatctttaacca 2505379  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 584 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 13160076 - 13159929
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||  || || ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  13160076 tgctaaccggtgc-tcgtggatactgattaagcataccataaaaagaaattattaccgtaatagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacac 13159978  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13159977 aatttcaatgtattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaac 13159929  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 579 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 33141070 - 33140940
Alignment:
Q  579 ggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||| || |||||||||||||||    
T  33141070 ggtcttgctaaccggtgcttccggggtactgattaagcatatcataaaagggaattattaccataaaagaaaactgcttttgactttattataaattaat 33140971  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33140970 tatacaatttcaatgcattaactactatata 33140940  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 587 - 739
Target Start/End: Original strand, 50359195 - 50359346
Alignment:
Q  587 taaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaat 685  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||    
T  50359195 taaccggtgcttccgggacactggttaagcataccatagaagataattattaccacaaaagaaaactgtttttgactttattatatattaattacccaat 50359294  T
Q  686 ttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  50359295 ttcaatgcattaactac--tatataattttttttttcttaaccttaaccagtgc 50359346  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 578 - 738
Target Start/End: Original strand, 50395563 - 50395721
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| |  ||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  50395563 gggtcctgctaatcggtgtctccggtgtactgattaatcatatcataaaagagaattattaccataaaaggaaattgttttga-ctttattatcaattaa 50395661  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  50395662 ttacacaatttctatgcattaactac--tgtataattttctttttcatatccctaaccagtg 50395721  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 577 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 6842806 - 6842681
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  6842806 tgggtcctgctaaccgctgcccccggggcactggttaagcataccataaatgggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 6842707  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaacta 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6842706 attacacaatttcaatgcattaacta 6842681  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 611 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 29241790 - 29241669
Alignment:
Q  611 ttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatat 709  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| || |||| |||  ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  29241790 ttaagcatactataaaacggaattattatcataaaaagaatctgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaactac--tatat 29241693  T
Q  710 aatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  29241692 aatttccattttcatatccttaac 29241669  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 584 - 742
Target Start/End: Original strand, 41993626 - 41993782
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    |||||||||||||||   || |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  41993626 tgctaaccggtgcctttagggtactagttaagcataccataaaagagaattattat-ataaaaggaaactgtttttaactttattataaattaattacat 41993724  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctcc 742  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||    
T  41993725 aatttcaatgcattaactac--tatataatttcatttttaatatacttaacgaatgctcc 41993782  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 608 - 738
Target Start/End: Original strand, 11308241 - 11308369
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||   |||    
T  11308241 tggttaagcataccataaaaggaattattaccataaaaggaaactatttttgattttattatcaattaattacattatttcaatgcattaacta--ttat 11308338  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11308339 ataatttcctttttcacatccttaatcagtg 11308369  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 628 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 28139444 - 28139336
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  28139444 ggaattattaccataaaaggaatctgcttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattaactac--tatttaatttcttttttcatatc 28139347  T
Q  728 cttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||    
T  28139346 cttaaccagtg 28139336  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 648 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 52246697 - 52246603
Alignment:
Q  648 aaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52246697 aaattgtttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattaacaac--tatataatttcatttttcatatccttaaccagtgccccgg 52246603  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 609 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 38852372 - 38852246
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga-ta 706  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||| || ||||  ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  38852372 ggttaaacataccataaaagtgaattattatcataaaataaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaattactacta 38852273  T
Q  707 tataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38852272 tataatttcattttttatatccttaac 38852246  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 614 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 24488516 - 24488392
Alignment:
Q  614 agcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataat 712  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  24488516 agcatatcataaaagagaattattaccataaaaagaaactgtttttgattttattatcaattaattacactatttccatgcattaacta--ttatataat 24488419  T
Q  713 ttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||    
T  24488418 ttccttttttacattcttaaccagtgc 24488392  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 605 - 737
Target Start/End: Original strand, 50298972 - 50299103
Alignment:
Q  605 tactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacg 703  Q
    ||||||||||| |||  |||| || ||||||||| || |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  50298972 tactggttaagtataccataagagtgaattattatcataaaaagaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcagtgcattaactac- 50299070  T
Q  704 atatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
     |||||||||| | |||| ||||| |||| ||||    
T  50299071 -tatataattttcctttttatatctttaatcagt 50299103  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 600 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 31514954 - 31514829
Alignment:
Q  600 ctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 698  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31514954 ctgggtactggttaagtatactataaaaggaaattattactataaaaa-aaattgtttttgattttattataaattaattacacaattttaatacattaa 31514856  T
Q  699 ctacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||  ||||||||||  |||||||||||    
T  31514855 ctac--tatataattttatttttcatatc 31514829  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 682 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 2391688 - 2391633
Alignment:
Q  682 caatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2391688 caatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcttatccttaaccagtgc 2391633  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 682 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 2393449 - 2393394
Alignment:
Q  682 caatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2393449 caatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcttatccttaaccagtgc 2393394  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 678 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 52718252 - 52718186
Alignment:
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggag 747  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52718252 tacacaattttaatgtattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtg-tccgggag 52718186  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 21010181 - 21010041
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||||||||||||||||||   |  ||||| | |||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | |||| |  ||| |||||||||    
T  21010181 ttgggtcatgctaaccggtgttccagggatatttgttaaggatattaaaaaaggaagttattaccataaaaagaaacttttttga--ctttttataaatt 21010084  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttccttttt 721  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  21010083 aattatacaatttcaatg--ttaactac--tatataatttccttttt 21010041  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 664 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 6842642 - 6842604
Alignment:
Q  664 tattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6842642 tattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac 6842604  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 577 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 52552659 - 52552549
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||||||||||||| || | || ||| |||||||||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||| | | ||||||| || |||||||||||||    
T  52552659 tgggtcatgctaaccgatgtcccc-ggacactggttaaatataccataaaagagaattattaccataaaag-atactgtttttgactttattataaatta 52552562  T
Q  676 attacacaatttc 688  Q
    |||||||||||||    
T  52552561 attacacaatttc 52552549  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 704 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 2362862 - 2362819
Alignment:
Q  704 atatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggag 747  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  2362862 atatataatttcctttttcatatccttaaccattgcaccgggag 2362819  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 636 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 2362958 - 2362880
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcct 717  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  2362958 taccataaaagaaaactgtttttgattttattatcaattaattacactatttcaatgcattaact---atatataatttcct 2362880  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 531 - 577
Target Start/End: Original strand, 20402466 - 20402512
Alignment:
Q  531 tgcaagtaaatttattaatattgatgaagtcattataaataaagatt 577  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  20402466 tgcaattaaatttattaatattggtgaggtcattatacataaagatt 20402512  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 668 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 6842674 - 6842641
Alignment:
Q  668 ataaattaattacacaatttcaatgcattaacta 701  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6842674 ataaattaattacacaatttcaatgaattaacta 6842641  T

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Target: chr2 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 575 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 30486399 - 30486230
Alignment:
Q  575 attgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaat 673  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||  |    
T  30486399 attgggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatagtt 30486300  T
Q  674 taattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30486299 taattacacaatttcaatacattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccggg 30486230  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 584 - 745
Target Start/End: Original strand, 561524 - 561684
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||  | ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||    
T  561524 tgctaaccggtgcctccggggtactgattaagcataccataaaagagaattattattataaaaggaaactgattttgactttattataaattaattacac 561623  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  561624 aatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccggg 561684  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 578 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 20553117 - 20552957
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  20553117 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 20553018  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20553017 ttacacaatttcaatgcattaattac--tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 20552957  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 578 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 31438832 - 31438664
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  31438832 gggtcctgctaaccggtgtccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaa 31438733  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggag 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31438732 ttacacaatttcaatgcattaactac--tgtataatttcctttttcatatccttaaccagtgccccgggag 31438664  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 606 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 4381953 - 4381815
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaa-ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4381953 actggttaagcataccataaaatggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 4381856  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4381855 tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgcaccggg 4381815  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 577 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22887937 - 22887771
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |   ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22887937 tgggtcatgctaatcggtgcccccggagcactggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaactgtttttaactttattataaatta 22887838  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22887837 attacataatttcaatgcattaactac--tatataatttcttttttcatatccttaaccactgccccgg 22887771  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 578 - 738
Target Start/End: Original strand, 3668113 - 3668272
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  3668113 gggtcttgctaaccggtgccctcggggcactggttaaacatactataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 3668212  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3668213 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttccatacccttaaccagtg 3668272  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 606 - 733
Target Start/End: Original strand, 26387092 - 26387218
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26387092 actggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 26387189  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26387190 tatataatttcctttttcatatccttaac 26387218  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Original strand, 27856396 - 27856562
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  27856396 gggtcctgctaaccgatgcccccggggcactggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaa 27856495  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  27856496 ttacacaatttcaatgcattaacta--ttatataatttcctttttcatactcttaaccagtgccccggg 27856562  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 578 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 22567788 - 22567629
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggat-actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  22567788 gggtcctgctaaccggtgcc-cctggagcacgggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaggaaattatttttgactttattataaatta 22567690  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22567689 attacacaatttcaatacattaactac--tatataatttcttttttcatatccttaaccagtg 22567629  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 579 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 2898256 - 2898090
Alignment:
Q  579 ggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||  ||||||| |||||||||  | | ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  2898256 ggtcctgctaaccggtgcctccgggacactgattaaacataccataaaagagaattattatgatagaagaaaactgtttttgactttattataaattaat 2898157  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggga 746  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2898156 tacacaatttcaatgcattaactac--tatataattttctttttcatatccttaaccagtgttccggga 2898090  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 44588088 - 44587922
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||  ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  44588088 gggtcctgctaaccggtacccccggggcacttgttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgttttttactttattataaattaa 44587989  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  44587988 ttacacaatttcaatgtattaactac--tatataatttccttttttatatccttaaccggtgccccggg 44587922  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 6580347 - 6580215
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  6580347 actggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgacattattataaattaattacataatttcaatgcattaactac-- 6580250  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6580249 tatatagtttcctttttcatacccttaaccagtgc 6580215  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 609 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 43637319 - 43637191
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    |||||| |||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  43637319 ggttaaacatactgtaaaaggaaattattaccataaaaagaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tat 43637222  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43637221 ataatttccttattcatatccttaaccagtg 43637191  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 584 - 739
Target Start/End: Original strand, 8969413 - 8969567
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    |||||||||||||| |  ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||    
T  8969413 tgctaaccggtgccccaggggcactagttaagcatactataaaaggaaattattaccataaaaggaaactgcttttgactttattataaattaattacac 8969512  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  8969513 tatttcaatgcattaactac--tatataattttctttttcatatccttaactagtgc 8969567  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Original strand, 22068320 - 22068485
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  22068320 gggtcctgctaatcggtgcccccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaattaa 22068419  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22068420 ttatacaatttcaatgca-taactac--tatataattccctttttcatatccttaaccagtgccccggg 22068485  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 609 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 31390167 - 31390033
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||    
T  31390167 ggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatacattaactac--tat 31390070  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31390069 ataatttcctttttcatatccttaactagtgccccgg 31390033  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 606 - 733
Target Start/End: Original strand, 34442560 - 34442686
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34442560 actggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 34442657  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  34442658 tatataatcttctttttcatatccttaac 34442686  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 575 - 745
Target Start/End: Original strand, 32360866 - 32361035
Alignment:
Q  575 attgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaat 673  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||    
T  32360866 attgggtcctgctaaccggtgcccccggggcattggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattatcaat 32360965  T
Q  674 taattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32360966 taattatattatttcaatgcattaacta--ttatataattttctttttcacatccttaaccagtgccccggg 32361035  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 622 - 743
Target Start/End: Original strand, 5093583 - 5093703
Alignment:
Q  622 ataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttt 720  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  5093583 ataaaaggaaattattatcataaaaggaaattgcttttgactttattataaattaattacacaattttaatgcattaactac--tatttaatttcctttt 5093680  T
Q  721 tcatatccttaaccagtgctccg 743  Q
    ||||||||||||| |||||||||    
T  5093681 tcatatccttaactagtgctccg 5093703  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 32860259 - 32860128
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  32860259 actggttaagcataccataaaagagaattattac-ataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaaatac-- 32860163  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32860162 tatataatttccttttttatatccttaacccgtgc 32860128  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 628 - 743
Target Start/End: Original strand, 11021273 - 11021386
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  11021273 ggaattattaccacaaaagaaaactgtttttgactttattatatattaattacacaatttcaatgcattaactac--catataatttcttttttcatatc 11021370  T
Q  728 cttaaccagtgctccg 743  Q
     |||| ||||||||||    
T  11021371 tttaatcagtgctccg 11021386  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 1859320 - 1859192
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  1859320 actggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattacataatttcaatgcattaactac-- 1859223  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  1859222 tatacaatttctttttttatatccttaacca 1859192  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 28601124 - 28600993
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  28601124 actggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaaagaaactgtttttaactttattatcaattaattatacaatttcaatgca-taactac-- 28601028  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28601027 tttataattccctttttcatatccttaaccagtgc 28600993  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 586 - 739
Target Start/End: Original strand, 38590883 - 38591034
Alignment:
Q  586 ctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaa 684  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  38590883 ctaaccggtgcctcgggg-tattggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacacaa 38590981  T
Q  685 tttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||| ||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38590982 ttttaatacattaactac--tgtataatttcctttttcatattcttaaccagtgc 38591034  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 585 - 738
Target Start/End: Original strand, 25782840 - 25782989
Alignment:
Q  585 gctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacaca 683  Q
    |||||||| || | || ||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  25782840 gctaaccgatgtccccgggacactggttaagcataccataaaagggaattattatcataaaagaaaattgtttttgactttattataaaataattacaca 25782939  T
Q  684 atttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25782940 atttcaatgcattaac-----tatataatttcctttttcatattcttaactagtg 25782989  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 579 - 737
Target Start/End: Original strand, 4022480 - 4022636
Alignment:
Q  579 ggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaat 677  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| | || |||||||||||||||    
T  4022480 ggtcctgctaaccggtgcccccgggacactggttaaacatatcataaaaggaaattattatcataaaaggaaactgtttctgactttattataaattaat 4022579  T
Q  678 tacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||   ||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  4022580 tacagaatttcaatacattaactactat---taatttcttttttcatattcttaatcagt 4022636  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 636 - 738
Target Start/End: Original strand, 26891722 - 26891822
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  26891722 taccataaaaggaaactatttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaacta--atatataatttccttttttatatccttaatca 26891819  T
Q  736 gtg 738  Q
    |||    
T  26891820 gtg 26891822  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 609 - 737
Target Start/End: Original strand, 13574060 - 13574187
Alignment:
Q  609 ggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatat 707  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||    
T  13574060 ggttaagcataccataaaaggaaattattaccataaaaagaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaatt--tttat 13574157  T
Q  708 ataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13574158 atattttcctttttcatatccttaaccagt 13574187  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 629 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 27584872 - 27584769
Alignment:
Q  629 gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcc 728  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  27584872 gaattattaccataaaaggaaactgcttttgattttattataaattaattacacaatttcaatgctttaactac--tatataatttcccttttcatatcc 27584775  T
Q  729 ttaacc 734  Q
    ||||||    
T  27584774 ttaacc 27584769  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 630 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 38296310 - 38296203
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatcct 729  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |    
T  38296310 aattattaccataaaaagaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaattac--tatataattttctttttcatatctt 38296213  T
Q  730 taaccagtgc 739  Q
    ||||||||||    
T  38296212 taaccagtgc 38296203  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 608 - 739
Target Start/End: Original strand, 35851781 - 35851911
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgata 706  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||   ||    
T  35851781 tggttaagcataccataaaagagaattattaccataaaatgaaactgtttttgactttattatcaattaattacattatttcaatgcattaacta--tta 35851878  T
Q  707 tataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  35851879 tataatttcctttttcacatccttaaccggtgc 35851911  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 577 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 39532009 - 39531868
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||   ||||| || |||||||| ||||| ||| || |||| ||  | |||||||||||    
T  39532009 tgggtcatgctaaccggtgcctctgagacactggttaagcatatcgaaaaagaaaatattaccataaaagaaaactggttttgactct-ttataaattaa 39531911  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttccttttt 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  39531910 ttacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttt 39531868  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 630 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 5881354 - 5881236
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcat----taactacgatatataatttcctttttcata 725  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5881354 aattattatcataaaaggaaactctttttgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcatgcattaactac--tatataatttcctttttcata 5881257  T
Q  726 tccttaaccagtgctccggga 746  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  5881256 tccttaacctgtgctccggga 5881236  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 630 - 721
Target Start/End: Original strand, 15079012 - 15079100
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttccttttt 721  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15079012 aattattatcataaaaggaaattgtttttgacttt-ttataaattaattacacaatttcaatacattaactac--tatataatttccttttt 15079100  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 603 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 25772272 - 25772137
Alignment:
Q  603 gatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaacta 701  Q
    ||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25772272 gatactgattaagtataccataaaagggaattattatcataaagggaaattatttttgactttattataaattaattacacaatttcattgcattaatta 25772173  T
Q  702 cgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
       | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25772172 -tttttataatttcctttttcatattcttaactagtg 25772137  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 608 - 735
Target Start/End: Original strand, 29102313 - 29102439
Alignment:
Q  608 tggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgata 706  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||| | ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  || ||    
T  29102313 tggttaaacatatcataaaagataattattactataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaattataaaatttcaatgtattaac--cgcta 29102410  T
Q  707 tataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  29102411 tataattttctttttgatattcttaacca 29102439  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 721
Target Start/End: Original strand, 34123057 - 34123166
Alignment:
Q  610 gttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatata 708  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||||    
T  34123057 gttaagcatattaaaaaagaaaattatgaccataaaaggaaactgtttttgacttt-ttataaattaattacacaaattcaaagcattaacta--ttata 34123153  T
Q  709 taatttccttttt 721  Q
    ||||||| |||||    
T  34123154 taatttctttttt 34123166  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 599 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 15146796 - 15146694
Alignment:
Q  599 cctggatactggttaagcatattataaaaggaa--ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcatt 696  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||||  |||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15146796 cctggatactggttaaacatacca-aaaaggaaaattattatcataaaaggaaattatttttgacttt-ttataaattaattatacaatttcaatgtatt 15146699  T
Q  697 aacta 701  Q
    |||||    
T  15146698 aacta 15146694  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 630 - 701
Target Start/End: Complemental strand, 10820615 - 10820546
Alignment:
Q  630 aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaacta 701  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10820615 aattattaccataaaaggaaactgtttttaa-ctttttataaattaatta-acaatctcaatgtattaacta 10820546  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 705 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 43993214 - 43993180
Alignment:
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43993214 tatataatttcctttttcatatccttaaccggtgc 43993180  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 706 - 748
Target Start/End: Original strand, 44854467 - 44854509
Alignment:
Q  706 atataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgggagt 748  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  44854467 atataatttcctttttattatccttaaccagtgccccgggagt 44854509  T

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Target: scaffold0524 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 606 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 983 - 846
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  983 actggttaagcataccataaaagagaattattactataaaaggaaattgattttgactttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactac-- 886  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  885 tatataattttctttttcatatccttaactagtgctccgg 846  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 745
Target Start/End: Original strand, 68288 - 68456
Alignment:
Q  576 ttgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatt 674  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | || |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  68288 ttgggtcctgctaaccgatgccttcggggtactggttaagcataccataaaagggaattattaccttaaaaggaaactgattttaactttattataattt 68387  T
Q  675 aattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  68388 atttacacaattttaatgcattaactac--tatataatttcatttttcatatccttaaccagtgccccggg 68456  T

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Target: scaffold0264 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 606 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 23119 - 22981
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||      
T  23119 actggttaaacataccataaaagagaattattaacataaaaggaaactgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatgtattaattac-- 23022  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23021 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 22981  T

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Target: scaffold0190 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 577 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 15083 - 14916
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15083 tgggtcctgttaaccagtgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 14984  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  14983 actacacaatttcagtgcattaactac--tatataatttctttttttatatctttaaccagtgccccggg 14916  T

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Target: scaffold0113 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 577 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 41106 - 40940
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| || | |||||||||||    
T  41106 tgggtcctgccaaccggtgtctccgggacactggttaagcatatcataaaaggaaattattatcataaaaggaaactgtttttgacttcattataaatta 41007  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||    
T  41006 attacataatttcaatgcattaacta--ttatataatttcatttttcatattcttaatcggtgctccgg 40940  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 745
Target Start/End: Original strand, 53685 - 53851
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  || |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||    
T  53685 gggtcttgctaaccggtgcccccggggaacgggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaaggaaactatttttgacattatgataaattaa 53784  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccggg 745  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  53785 ttacacaattttaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatacccttaaccagtgccccggg 53851  T

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Target: scaffold0188 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 578 - 739
Target Start/End: Original strand, 6110 - 6270
Alignment:
Q  578 gggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagga-attattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaa 676  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||  || |||||| ||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||    
T  6110 gggtcctgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaacataccataaaaggggattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataatttaa 6209  T
Q  677 ttacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6210 ttacacaattccaatgcattaactac--tatatagtttcctttttcatatccttaaccagtgc 6270  T

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Target: scaffold1266 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 577 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 479 - 318
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||| | |  ||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  479 tgggtcctgctaaccagagtttccaggatactgattaatcatatcataaaagagaattattaccgtagaaggaaactgtttttgactttattataaattt 380  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  379 attacacaatttcaatgcattaacta--ttatataattttctttttcatatgcttaaccagtgc 318  T

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Target: scaffold1152 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 575 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 866 - 702
Alignment:
Q  575 attgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaat 673  Q
    |||||||| | |||||||||||| || || || | ||||||||||  ||||||| ||||||| |||| ||||| |||  |||||| || |||||||||||    
T  866 attgggtcctactaaccggtgcc-ccgggctattagttaagcataccataaaagagaattatcaccataaaagaaaacagtttttgactttattataaat 768  T
Q  674 taattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctc 741  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  767 taattacacaatttcaatggattaactac--tatataatttcctttttcatatctttaacccgtgctc 702  T

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Target: scaffold0674 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 636 - 739
Target Start/End: Original strand, 7956 - 8057
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7956 taccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacca 8053  T
Q  736 gtgc 739  Q
    ||||    
T  8054 gtgc 8057  T

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Target: scaffold0549 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 636 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 7415 - 7314
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7415 taccataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaacca 7318  T
Q  736 gtgc 739  Q
    ||||    
T  7317 gtgc 7314  T

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Target: scaffold0045 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 606 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 50706 - 50569
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacga 704  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||      
T  50706 actggttaaacatactataaaagagaattattatcataaaagaaaattgattttgactttattataaattaattatacaatttcaaaacattaactac-- 50609  T
Q  705 tatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccgg 744  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50608 tatataatttcctttttcatatctttaaccagtgccccgg 50569  T

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Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 648 - 738
Target Start/End: Original strand, 53417 - 53505
Alignment:
Q  648 aaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtg 738  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53417 aaattgtttttgactttattataaattaattatacaatttcaatgcattaactac--tatataatttccttttttatatccttaaccagtg 53505  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 584 - 733
Target Start/End: Original strand, 146912 - 147059
Alignment:
Q  584 tgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacac 682  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||  || || ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  146912 tgctaaccggtgc-tcgtggatactgattaagcataccataaaaagaaattattaccgtaatagaaaactgtttttgactttattatcaattaattacac 147010  T
Q  683 aatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaac 733  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  147011 aatttcaatgtattaactac--tatataatttcctttttcatatccttaac 147059  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 628 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 116339 - 116224
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  116339 ggaattattatcataaaaggaaactgtttctgactttattatcaattaattacacaatttcaatgcattaactac--tatataatttcctttttcatatc 116242  T
Q  728 cttaaccagtgctccggg 745  Q
     |||||| |||| |||||    
T  116241 tttaacctgtgccccggg 116224  T

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Target: scaffold0206 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 636 - 738
Target Start/End: Original strand, 11029 - 11129
Alignment:
Q  636 taccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacca 735  Q
    ||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11029 taccataaaatgaaactgtttttgactttattatagtttaattacacaatttcaatgcattaacta--atatataatttcctttttcatatccttaacca 11126  T
Q  736 gtg 738  Q
    |||    
T  11127 gtg 11129  T

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Target: scaffold0038 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 628 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 25853 - 25750
Alignment:
Q  628 ggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatc 727  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  25853 ggaattattaccataaaagaaaattgtttttgactttattataaattaattacacaatttcaatacattaattac--tatataa-ttcctttttcatatc 25757  T
Q  728 cttaacc 734  Q
    |||||||    
T  25756 cttaacc 25750  T

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Target: scaffold0425 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 577 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 10897 - 10771
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||  |  ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  10897 tgggtcctgctaaccgctgcccccgaggcactggttaagcataccataaatgggaattattaccataaaaggaaactgtttttgactttattataaatta 10798  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactac 702  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10797 attacacaatttcaatgcattaactac 10771  T

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Target: scaffold0050 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 606 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 69383 - 69252
Alignment:
Q  606 actggttaagcatattataaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgat 705  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  ||||  ||| || |||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |    
T  69383 actggttaagcataccataaaagaaattattaccttaaaaaaaaactgcttttgactttattataaattaattacataattttaatgtattaactac--t 69286  T
Q  706 atataatttcctttttcatatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  69285 atataatttactttttcatatccttaacgagtgc 69252  T

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Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 666 - 743
Target Start/End: Original strand, 33770 - 33845
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaaccagtgctccg 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  33770 ttataaattaattacacaatttcaatgtattaacta--ttatataatttccattttaatatacttaacaagtgctccg 33845  T

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Target: scaffold0325 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 624 - 739
Target Start/End: Original strand, 17518 - 17630
Alignment:
Q  624 aaaaggaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttca 723  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  17518 aaaaggaattattatcataaaagaaaactgtttttgactttattataaattaatt-cacaatttcaatgcattagctac--tatataattttctttttca 17614  T
Q  724 tatccttaaccagtgc 739  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  17615 tatccgtaaacagtgc 17630  T

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Target: scaffold0263 (Bit Score: 56; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 577 - 734
Target Start/End: Original strand, 19584 - 19740
Alignment:
Q  577 tgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaag-gaattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaatta 675  Q
    |||||| |||||||||| |  ||| ||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||| |  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||     
T  19584 tgggtcctgctaaccggagtttccgggacactgattaatcatatcataaaagagaactattatcgtaaaaggaaactgtttttgactttattataaattc 19683  T
Q  676 attacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19684 attacacaatttcaatgcattaatta--ttatataatttcttttttcatatgcttaacc 19740  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 602 - 737
Target Start/End: Original strand, 95609 - 95742
Alignment:
Q  602 ggatactggttaagcatattataaaagg-aattattaccacaaaaggaaattgtttttaaccttattataaattaattacacaatttcaatgcattaact 700  Q
    |||||| |||||| ||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  95609 ggataccggttaaacataccataaaagggaattattaccataaaagaaaactgttttga-ctttattataaattaattacataatttcaattcattaatt 95707  T
Q  701 acgatatataatttcctttttcatatccttaaccagt 737  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  95708 at--tatataatttcctttttcatattcttaaccagt 95742  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 565 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 234052 - 233918
Alignment:
Q  565 ataaataaagattgggtcatgctaaccggtgcctcctggatactggttaagcatattataaaaggaa-ttattaccacaaaaggaaattgtttttaacct 663  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |  ||| |||||| ||||  |||||||||| |||||  || ||||||||| || |||| || |    
T  234052 ataaataaataaggggtcctgctaaccggtgcccccggagtaccggttaaacataccataaaaggaaattattttcataaaaggaaactgcttttgactt 233953  T
Q  664 tattataaattaattacacaatttcaatgcattaa 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  233952 tattataaattaattacacaatttcaatgaattaa 233918  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 666 - 734
Target Start/End: Complemental strand, 5136 - 5070
Alignment:
Q  666 ttataaattaattacacaatttcaatgcattaactacgatatataatttcctttttcatatccttaacc 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||  ||||| |||| |||||||    
T  5136 ttataaattaattacacaatttcaataaattaactac--tatataattttttttttaatattcttaacc 5070  T

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