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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF3762_low_8 (Length: 608)
Name: NF3762_low_8
Description: NF3762
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF3762_low_8 |
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Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 512; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 575
Target Start/End: Original strand, 37446055 - 37446606
Alignment:
| Q |
19 |
agtcatgttccagtcatactcgttaatgtgttccatatataggacccgtttcaagtgtggatactagagaggaatgagttttatatggttcgctttgcaa |
118 |
Q |
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| T |
37446055 |
agtcatgttccagtcatactcgttaatgtgttccatatataggacccgtttcaagtgtggatactagagaggaatgagttttatatggttcgctttgtaa |
37446154 |
T |
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| Q |
119 |
tgatgactcaactaagatcgataatgtatgttattggtgtgtgactctgaatgtgtgtgtttatatttctcttgatcgggtttgtttatatagtatatga |
218 |
Q |
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| T |
37446155 |
tgatgactcaactaagatcgataatgtatgttattggtgtgtgactctgaatatgtgtgtttatatttctcttgatcgggtttgtttatatagtatatga |
37446254 |
T |
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| Q |
219 |
aattatgaatgttatcaatgatttttgttttattttgaaaaggcgcacccacttgattgttataaagataaaaggcaatttgagataaaaacttctaaag |
318 |
Q |
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| T |
37446255 |
aattatgaatgttatcaatgatttttgttttattttgaaaaggcgcacccacttgattgttataaagataaaaggcaatttgagataaaaacttctaaag |
37446354 |
T |
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| Q |
319 |
tagaagcttcttatccccttacacagtacaatttccaactcactatatactacatcaacaaaagcgtagacgtatcgtattgtacaccaatcattaaaca |
418 |
Q |
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| T |
37446355 |
tagaagcttcttatccccttacactgtacaatttccaactcactatatactacatcaacaaaagcgtagacgtatcgtattgtacaccaatcattaaaca |
37446454 |
T |
|
| Q |
419 |
caccaaattaatctaatgttttaactagaacataacatgaatcaaatcactctattactccctcattctaaaattttggtacgtacatattcattcttct |
518 |
Q |
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| T |
37446455 |
caccaaattaatcttatgttttaactagaacataacatgaatcaaatcactctattactccctcattctaaaattttg----gtacatattcattctttt |
37446550 |
T |
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| Q |
519 |
ttaactaacaaaatgaatatattattttattgcatataaaacaaatgtacatgttgc |
575 |
Q |
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| T |
37446551 |
ttaactaacaaaatgaatatatta-tttattgcatataaaacaaatgtacatgttgc |
37446606 |
T |
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