View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3775_low_1 (Length: 643)

Name: NF3775_low_1
Description: NF3775
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3775_low_1
NF3775_low_1
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (140-641)||(42803298-42803799)
chr5 (140-340)||(4818484-4818685)
chr5 (141-340)||(40530203-40530403)
chr5 (140-340)||(8698242-8698443)
chr5 (140-339)||(41496014-41496213)
chr5 (140-325)||(6315771-6315956)
chr5 (140-340)||(27542729-27542929)
chr5 (140-340)||(40899852-40900052)
chr5 (141-340)||(6753638-6753836)
chr5 (140-340)||(15818459-15818661)
chr5 (140-329)||(6615870-6616059)
chr5 (195-340)||(8724988-8725133)
chr5 (140-340)||(1248583-1248783)
chr5 (140-338)||(6753963-6754160)
chr5 (143-340)||(7827905-7828102)
chr5 (141-340)||(31654987-31655187)
chr5 (140-340)||(27580540-27580735)
chr5 (192-340)||(29570378-29570526)
chr5 (142-338)||(19929882-19930078)
chr5 (192-324)||(22848379-22848511)
chr5 (192-340)||(29374328-29374476)
chr5 (144-340)||(21060569-21060764)
chr5 (193-340)||(2232052-2232195)
chr5 (141-340)||(9515668-9515880)
chr5 (193-313)||(4441008-4441128)
chr5 (191-307)||(11796179-11796295)
chr5 (204-334)||(30512670-30512801)
chr5 (204-334)||(30553010-30553141)
chr5 (376-457)||(42800505-42800586)
chr5 (195-339)||(15439299-15439442)
chr5 (194-338)||(41478815-41478959)
chr5 (194-338)||(41492290-41492434)
chr5 (553-641)||(42800169-42800258)
chr5 (225-340)||(29856066-29856179)
chr5 (140-318)||(41062161-41062338)
chr5 (205-340)||(37184058-37184193)
chr5 (140-328)||(3348116-3348309)
chr5 (239-337)||(32440174-32440272)
chr5 (140-340)||(2588047-2588242)
chr5 (191-340)||(11904190-11904340)
chr5 (205-313)||(18841478-18841586)
chr5 (216-313)||(38161422-38161515)
chr5 (240-340)||(38508166-38508266)
chr5 (195-250)||(37101274-37101329)
chr5 (205-272)||(39325862-39325929)
chr5 (278-340)||(843509-843571)
chr5 (191-305)||(11761313-11761426)
chr5 (238-323)||(5731808-5731893)
chr5 (205-286)||(26285511-26285592)
chr5 (486-533)||(42800349-42800396)
chr5 (198-324)||(5129227-5129353)
chr5 (228-286)||(7330529-7330587)
chr5 (141-183)||(29374128-29374170)
chr5 (192-234)||(41480137-41480179)
chr5 (376-462)||(42834270-42834356)
chr5 (191-236)||(32439857-32439902)
chr5 (193-234)||(41478772-41478813)
chr5 (204-236)||(3076622-3076654)
chr5 (194-234)||(41480181-41480221)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (140-339)||(41506054-41506253)
chr7 (140-340)||(11373416-11373616)
chr7 (140-340)||(34947441-34947641)
chr7 (140-340)||(28202297-28202497)
chr7 (140-340)||(21350616-21350814)
chr7 (140-340)||(21390235-21390436)
chr7 (140-340)||(23670426-23670626)
chr7 (140-340)||(759079-759279)
chr7 (140-340)||(83325-83526)
chr7 (140-340)||(28103671-28103874)
chr7 (141-340)||(2459413-2459610)
chr7 (140-340)||(8592428-8592628)
chr7 (144-340)||(24516277-24516473)
chr7 (143-326)||(34100549-34100732)
chr7 (143-340)||(3178192-3178391)
chr7 (140-340)||(37245631-37245833)
chr7 (140-340)||(42935599-42935802)
chr7 (141-340)||(33819154-33819355)
chr7 (140-340)||(40076259-40076456)
chr7 (140-340)||(9785929-9786129)
chr7 (140-340)||(21759972-21760172)
chr7 (140-340)||(32346040-32346240)
chr7 (140-340)||(43873864-43874064)
chr7 (191-340)||(46478281-46478430)
chr7 (140-340)||(7463153-7463354)
chr7 (140-329)||(19271732-19271920)
chr7 (205-340)||(30865973-30866108)
chr7 (191-340)||(26974018-26974170)
chr7 (141-340)||(7457409-7457607)
chr7 (191-340)||(22738693-22738842)
chr7 (195-340)||(38391744-38391889)
chr7 (140-336)||(48608808-48608999)
chr7 (205-340)||(13961965-13962100)
chr7 (191-340)||(5524369-5524521)
chr7 (140-340)||(27920927-27921129)
chr7 (219-340)||(16560558-16560679)
chr7 (219-340)||(16604983-16605104)
chr7 (201-340)||(31930485-31930626)
chr7 (191-340)||(29835402-29835550)
chr7 (140-273)||(25571361-25571493)
chr7 (239-340)||(12631345-12631446)
chr7 (195-342)||(49101659-49101809)
chr7 (207-314)||(35333051-35333158)
chr7 (191-340)||(16904371-16904520)
chr7 (140-268)||(36790679-36790809)
chr7 (195-272)||(6494990-6495067)
chr7 (191-326)||(32018917-32019053)
chr7 (140-253)||(47045546-47045653)
chr7 (205-340)||(17828340-17828473)
chr7 (143-286)||(24166934-24167078)
chr7 (191-326)||(32018714-32018849)
chr7 (140-340)||(44424086-44424276)
chr7 (238-340)||(2850869-2850971)
chr7 (204-285)||(42796010-42796094)
chr7 (262-340)||(44180268-44180346)
chr7 (198-270)||(30546413-30546485)
chr7 (243-340)||(46211472-46211572)
chr7 (203-313)||(31665731-31665842)
chr7 (192-254)||(4958674-4958736)
chr7 (192-248)||(37850807-37850863)
chr7 (145-273)||(21937842-21937970)
chr7 (196-231)||(29198777-29198812)
chr7 (143-246)||(37490319-37490422)
chr7 (245-313)||(39452390-39452457)
chr7 (196-272)||(46602047-46602123)
chr7 (243-315)||(47045467-47045538)
chr7 (211-286)||(39005433-39005508)
chr7 (210-255)||(17610913-17610958)
chr7 (193-246)||(37490457-37490510)
chr7 (229-273)||(7930083-7930127)
chr7 (231-271)||(17783148-17783188)
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (140-340)||(43253844-43254045)
chr3 (143-340)||(37311886-37312084)
chr3 (151-329)||(37695658-37695837)
chr3 (140-340)||(36476518-36476718)
chr3 (140-340)||(36460397-36460597)
chr3 (140-340)||(10366623-10366830)
chr3 (140-340)||(30190641-30190841)
chr3 (140-340)||(44301495-44301696)
chr3 (191-340)||(8679035-8679184)
chr3 (140-340)||(19822945-19823145)
chr3 (140-340)||(37497425-37497626)
chr3 (140-340)||(37772945-37773147)
chr3 (195-340)||(1778632-1778776)
chr3 (192-341)||(30711059-30711208)
chr3 (192-340)||(11632067-11632214)
chr3 (207-339)||(24569082-24569214)
chr3 (140-340)||(51837940-51838141)
chr3 (140-345)||(54726419-54726624)
chr3 (195-340)||(29023947-29024091)
chr3 (196-340)||(28690763-28690907)
chr3 (204-323)||(23004380-23004499)
chr3 (140-340)||(27471269-27471469)
chr3 (140-340)||(38795278-38795478)
chr3 (144-303)||(39043772-39043932)
chr3 (204-340)||(45710848-45710984)
chr3 (205-340)||(11905821-11905956)
chr3 (195-340)||(3313243-3313384)
chr3 (141-340)||(38137424-38137626)
chr3 (140-319)||(3901151-3901330)
chr3 (195-340)||(5322920-5323063)
chr3 (140-336)||(17652687-17652878)
chr3 (529-638)||(27907034-27907143)
chr3 (192-340)||(12736553-12736701)
chr3 (140-340)||(53560150-53560351)
chr3 (193-340)||(34750483-34750630)
chr3 (205-340)||(19611908-19612042)
chr3 (195-340)||(14194545-14194689)
chr3 (191-313)||(12904849-12904972)
chr3 (239-340)||(49830162-49830264)
chr3 (195-319)||(19609288-19609412)
chr3 (204-340)||(52290891-52291027)
chr3 (140-340)||(34957438-34957637)
chr3 (140-272)||(33491408-33491542)
chr3 (193-340)||(49447775-49447919)
chr3 (140-340)||(31158503-31158691)
chr3 (239-341)||(50035197-50035299)
chr3 (144-340)||(23068137-23068334)
chr3 (143-283)||(27549323-27549464)
chr3 (211-327)||(43719272-43719387)
chr3 (216-307)||(54477473-54477564)
chr3 (279-340)||(33491064-33491125)
chr3 (199-256)||(38705168-38705225)
chr3 (199-319)||(30682068-30682188)
chr3 (205-285)||(36462982-36463062)
chr3 (143-256)||(41038458-41038571)
chr3 (193-306)||(24245109-24245221)
chr3 (192-313)||(38512011-38512132)
chr3 (140-253)||(40462255-40462366)
chr3 (212-340)||(48540981-48541109)
chr3 (210-269)||(37804839-37804898)
chr3 (205-256)||(41351629-41351680)
chr3 (191-272)||(1018908-1018989)
chr3 (191-256)||(40194488-40194553)
chr3 (236-317)||(42278695-42278776)
chr3 (194-243)||(50036510-50036559)
chr3 (143-236)||(24703599-24703692)
chr3 (192-295)||(25108551-25108654)
chr3 (140-183)||(30710583-30710626)
chr3 (140-179)||(45710783-45710822)
chr3 (278-340)||(7757599-7757661)
chr3 (141-171)||(24569246-24569276)
chr3 (205-256)||(26467108-26467161)
chr3 (278-340)||(51064799-51064861)
chr3 (490-530)||(27907189-27907229)
chr3 (1-57)||(41380614-41380670)
chr3 (229-273)||(54225884-54225928)
[»] chr1 (86 HSPs)
chr1 (140-340)||(39864045-39864245)
chr1 (92-340)||(24991637-24991886)
chr1 (140-340)||(12039016-12039216)
chr1 (140-340)||(23168977-23169175)
chr1 (191-340)||(9307612-9307761)
chr1 (141-333)||(7759150-7759342)
chr1 (141-340)||(28748926-28749125)
chr1 (141-322)||(40144849-40145030)
chr1 (140-340)||(49223970-49224170)
chr1 (140-275)||(35367736-35367871)
chr1 (143-340)||(13579605-13579801)
chr1 (140-340)||(37506058-37506261)
chr1 (140-340)||(16395031-16395229)
chr1 (140-340)||(26093328-26093528)
chr1 (140-322)||(20209842-20210024)
chr1 (140-340)||(33733247-33733446)
chr1 (195-333)||(37276450-37276588)
chr1 (191-340)||(6023633-6023782)
chr1 (140-254)||(6785190-6785304)
chr1 (195-340)||(34031511-34031656)
chr1 (195-319)||(36701910-36702034)
chr1 (195-319)||(36718014-36718138)
chr1 (140-340)||(31042731-31042931)
chr1 (199-340)||(15699115-15699257)
chr1 (195-340)||(30754925-30755070)
chr1 (195-340)||(38787330-38787475)
chr1 (140-309)||(14757609-14757777)
chr1 (167-340)||(44707744-44707917)
chr1 (143-340)||(52429279-52429478)
chr1 (195-340)||(917013-917158)
chr1 (143-340)||(2572405-2572602)
chr1 (143-340)||(45331276-45331475)
chr1 (195-340)||(21909990-21910133)
chr1 (146-340)||(32825976-32826171)
chr1 (196-319)||(8896337-8896460)
chr1 (205-340)||(10495838-10495972)
chr1 (195-340)||(11449875-11450017)
chr1 (192-294)||(22856267-22856369)
chr1 (141-340)||(31978636-31978832)
chr1 (207-338)||(24880874-24881008)
chr1 (195-322)||(4441605-4441732)
chr1 (205-340)||(42409993-42410128)
chr1 (143-332)||(9379169-9379358)
chr1 (195-326)||(6160457-6160588)
chr1 (241-332)||(22181371-22181462)
chr1 (140-267)||(4659711-4659837)
chr1 (191-273)||(37539112-37539194)
chr1 (195-313)||(44761542-44761660)
chr1 (140-340)||(41121806-41122007)
chr1 (143-256)||(3260529-3260641)
chr1 (198-272)||(25089137-25089212)
chr1 (143-308)||(27721470-27721634)
chr1 (195-305)||(7351625-7351735)
chr1 (140-239)||(35682879-35682977)
chr1 (140-253)||(26256159-26256272)
chr1 (191-295)||(29778425-29778529)
chr1 (197-340)||(5179383-5179526)
chr1 (225-340)||(12151195-12151310)
chr1 (208-326)||(32970565-32970683)
chr1 (260-340)||(43500768-43500848)
chr1 (141-256)||(39887769-39887885)
chr1 (192-339)||(41080586-41080731)
chr1 (207-313)||(29074885-29074991)
chr1 (208-286)||(32219699-32219777)
chr1 (194-319)||(26257945-26258070)
chr1 (193-334)||(27896942-27897083)
chr1 (192-256)||(37177822-37177886)
chr1 (263-341)||(27687298-27687376)
chr1 (220-313)||(6365645-6365738)
chr1 (198-313)||(31154120-31154235)
chr1 (143-213)||(3312056-3312126)
chr1 (140-246)||(17988823-17988929)
chr1 (278-334)||(35367635-35367691)
chr1 (226-313)||(44426746-44426836)
chr1 (205-256)||(2137437-2137488)
chr1 (144-254)||(9412873-9412982)
chr1 (241-340)||(35538678-35538777)
chr1 (195-286)||(52837269-52837360)
chr1 (206-256)||(15904751-15904801)
chr1 (232-273)||(13366000-13366041)
chr1 (230-308)||(17988574-17988654)
chr1 (288-340)||(4659839-4659891)
chr1 (234-314)||(13413316-13413396)
chr1 (192-244)||(24500058-24500110)
chr1 (195-235)||(35538644-35538684)
chr1 (229-321)||(49176940-49177032)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (140-330)||(35313821-35314011)
chr2 (140-340)||(5789627-5789826)
chr2 (140-340)||(37322363-37322563)
chr2 (140-340)||(45235513-45235715)
chr2 (143-340)||(43410363-43410560)
chr2 (140-340)||(14523351-14523551)
chr2 (140-340)||(16463621-16463823)
chr2 (140-340)||(17695262-17695464)
chr2 (140-340)||(25637414-25637614)
chr2 (141-340)||(8947031-8947232)
chr2 (140-340)||(36354422-36354621)
chr2 (195-340)||(39691479-39691624)
chr2 (140-340)||(34120418-34120616)
chr2 (140-340)||(39785519-39785722)
chr2 (140-340)||(15359066-15359268)
chr2 (143-340)||(34225527-34225724)
chr2 (192-340)||(16377635-16377787)
chr2 (140-340)||(36794218-36794418)
chr2 (140-340)||(3323265-3323451)
chr2 (204-340)||(16805879-16806015)
chr2 (204-340)||(16845160-16845296)
chr2 (204-340)||(31448672-31448808)
chr2 (155-338)||(35242278-35242461)
chr2 (140-322)||(9458268-9458444)
chr2 (153-340)||(43115781-43115968)
chr2 (199-340)||(11742508-11742648)
chr2 (205-329)||(39329652-39329777)
chr2 (262-340)||(19937733-19937811)
chr2 (205-326)||(17346356-17346476)
chr2 (246-340)||(32783404-32783498)
chr2 (205-291)||(32831203-32831289)
chr2 (143-254)||(5272204-5272314)
chr2 (141-272)||(26863405-26863539)
chr2 (192-335)||(28170567-28170710)
chr2 (140-248)||(7494909-7495018)
chr2 (207-333)||(41220932-41221058)
chr2 (192-323)||(43699595-43699723)
chr2 (193-302)||(43730603-43730709)
chr2 (204-329)||(18853190-18853316)
chr2 (140-324)||(28186148-28186331)
chr2 (143-285)||(19444083-19444225)
chr2 (195-256)||(19937374-19937435)
chr2 (279-340)||(26607947-26608008)
chr2 (195-284)||(26608178-26608267)
chr2 (191-254)||(7438917-7438980)
chr2 (195-258)||(17122973-17123036)
chr2 (225-314)||(19426474-19426564)
chr2 (228-322)||(31976370-31976464)
chr2 (300-340)||(5272172-5272212)
chr2 (238-287)||(3601416-3601465)
chr2 (248-329)||(11367121-11367202)
chr2 (241-313)||(1206709-1206781)
chr2 (195-235)||(1206775-1206815)
chr2 (205-253)||(18202104-18202152)
chr2 (229-285)||(26337155-26337211)
chr2 (193-241)||(45464009-45464057)
chr2 (275-342)||(12520827-12520894)
chr2 (1-56)||(25441587-25441642)
chr2 (140-183)||(34120657-34120700)
chr2 (193-285)||(36173376-36173463)
chr2 (205-272)||(38187930-38187997)
chr2 (144-182)||(8928547-8928585)
chr2 (278-340)||(27501517-27501579)
chr2 (199-272)||(30996347-30996419)
chr2 (140-254)||(34451400-34451511)
chr2 (241-329)||(27866527-27866614)
chr2 (229-273)||(33407020-33407064)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (140-340)||(9300095-9300297)
chr8 (92-340)||(21216083-21216330)
chr8 (140-316)||(44761500-44761674)
chr8 (140-340)||(13335151-13335350)
chr8 (140-340)||(39482546-39482749)
chr8 (141-340)||(45425648-45425848)
chr8 (143-340)||(11976918-11977115)
chr8 (143-340)||(10179929-10180126)
chr8 (140-340)||(22771817-22772017)
chr8 (140-340)||(34948669-34948867)
chr8 (141-340)||(39405697-39405896)
chr8 (143-337)||(31231667-31231861)
chr8 (140-319)||(5053156-5053334)
chr8 (143-342)||(14854914-14855115)
chr8 (229-340)||(1875574-1875685)
chr8 (140-340)||(26626094-26626294)
chr8 (197-340)||(32476278-32476421)
chr8 (191-340)||(7172899-7173048)
chr8 (204-340)||(40996347-40996483)
chr8 (205-340)||(10097973-10098108)
chr8 (144-340)||(17719240-17719436)
chr8 (143-340)||(34393936-34394137)
chr8 (140-340)||(4428334-4428531)
chr8 (198-340)||(31271013-31271155)
chr8 (195-340)||(31082608-31082753)
chr8 (196-308)||(42886990-42887102)
chr8 (140-340)||(17823856-17824054)
chr8 (203-340)||(42972490-42972630)
chr8 (143-322)||(396611-396790)
chr8 (144-336)||(2767277-2767475)
chr8 (205-339)||(27294042-27294176)
chr8 (192-312)||(36006897-36007017)
chr8 (140-274)||(10953786-10953914)
chr8 (140-274)||(10961791-10961919)
chr8 (141-272)||(29226578-29226708)
chr8 (195-273)||(32678392-32678470)
chr8 (258-340)||(36967413-36967495)
chr8 (195-313)||(40028501-40028623)
chr8 (248-324)||(7703154-7703230)
chr8 (225-340)||(51132-51246)
chr8 (217-319)||(31331419-31331521)
chr8 (192-326)||(41091981-41092114)
chr8 (195-273)||(35732110-35732188)
chr8 (278-338)||(1739712-1739772)
chr8 (145-230)||(1875831-1875916)
chr8 (140-340)||(39300923-39301138)
chr8 (192-319)||(4924070-4924197)
chr8 (203-316)||(5356597-5356709)
chr8 (140-285)||(39466074-39466219)
chr8 (192-256)||(1739529-1739593)
chr8 (209-341)||(33765663-33765795)
chr8 (209-313)||(34057627-34057731)
chr8 (192-256)||(35504937-35505001)
chr8 (193-273)||(43719285-43719365)
chr8 (266-325)||(10953405-10953464)
chr8 (266-325)||(10961410-10961469)
chr8 (229-321)||(3117021-3117111)
chr8 (229-273)||(135716-135760)
chr8 (292-340)||(32678804-32678852)
chr8 (205-256)||(12559562-12559613)
chr8 (140-182)||(40996501-40996543)
chr8 (233-295)||(44648559-44648621)
chr8 (228-257)||(6796394-6796423)
chr8 (228-273)||(29806330-29806375)
chr8 (140-173)||(32476222-32476255)
chr8 (262-314)||(12559649-12559701)
chr8 (143-183)||(15675373-15675413)
chr8 (205-269)||(21649414-21649478)
chr8 (239-279)||(25284988-25285028)
chr8 (198-273)||(27870856-27870932)
chr8 (251-283)||(29566172-29566204)
chr8 (140-221)||(40109647-40109727)
[»] chr4 (88 HSPs)
chr4 (140-340)||(35311210-35311412)
chr4 (140-334)||(35380326-35380521)
chr4 (140-340)||(47773006-47773206)
chr4 (140-340)||(49428329-49428528)
chr4 (143-340)||(47464352-47464550)
chr4 (140-340)||(38405089-38405290)
chr4 (193-329)||(53346746-53346882)
chr4 (92-328)||(6643659-6643894)
chr4 (140-340)||(11907586-11907786)
chr4 (191-340)||(17237283-17237432)
chr4 (143-340)||(34360592-34360789)
chr4 (192-340)||(43237229-43237377)
chr4 (143-340)||(44536183-44536381)
chr4 (140-339)||(52859787-52859981)
chr4 (191-340)||(32884786-32884935)
chr4 (195-340)||(33790718-33790863)
chr4 (143-340)||(40122841-40123039)
chr4 (140-340)||(5841414-5841615)
chr4 (141-329)||(49746895-49747083)
chr4 (140-340)||(7061651-7061851)
chr4 (140-340)||(42616890-42617090)
chr4 (143-340)||(52247415-52247611)
chr4 (140-340)||(2066725-2066923)
chr4 (140-340)||(22129976-22130181)
chr4 (195-340)||(6609750-6609895)
chr4 (140-340)||(49175921-49176122)
chr4 (143-340)||(16821318-16821516)
chr4 (195-322)||(54506777-54506904)
chr4 (140-340)||(28500878-28501072)
chr4 (205-340)||(11288617-11288751)
chr4 (205-340)||(17114439-17114574)
chr4 (140-323)||(21240708-21240887)
chr4 (143-340)||(2653357-2653552)
chr4 (140-340)||(25233116-25233315)
chr4 (191-326)||(36985771-36985906)
chr4 (143-324)||(2942648-2942831)
chr4 (140-266)||(51624720-51624846)
chr4 (143-340)||(46396870-46397055)
chr4 (195-340)||(3689551-3689696)
chr4 (199-340)||(38502469-38502610)
chr4 (195-327)||(42517638-42517773)
chr4 (197-339)||(48914131-48914278)
chr4 (140-307)||(26147635-26147805)
chr4 (195-340)||(30682183-30682328)
chr4 (241-340)||(52869107-52869206)
chr4 (140-340)||(4972507-4972694)
chr4 (192-326)||(53412094-53412228)
chr4 (191-340)||(41711443-41711592)
chr4 (191-294)||(38663480-38663583)
chr4 (195-305)||(50264102-50264212)
chr4 (195-340)||(461947-462092)
chr4 (144-329)||(19265744-19265931)
chr4 (193-295)||(18741506-18741608)
chr4 (195-340)||(39397333-39397478)
chr4 (259-340)||(51625136-51625217)
chr4 (192-340)||(35998798-35998945)
chr4 (194-312)||(7986962-7987080)
chr4 (143-234)||(28911249-28911340)
chr4 (228-340)||(30192227-30192339)
chr4 (195-313)||(35251888-35251996)
chr4 (191-318)||(47358958-47359085)
chr4 (140-256)||(10754308-10754423)
chr4 (140-256)||(10968077-10968192)
chr4 (198-272)||(20612226-20612300)
chr4 (140-270)||(49579235-49579363)
chr4 (205-273)||(44526378-44526446)
chr4 (205-272)||(2400777-2400844)
chr4 (201-322)||(23915435-23915555)
chr4 (195-254)||(31370373-31370432)
chr4 (205-340)||(32469935-32470069)
chr4 (196-256)||(10672643-10672703)
chr4 (196-256)||(10886283-10886343)
chr4 (192-256)||(43902237-43902301)
chr4 (204-269)||(25142437-25142502)
chr4 (143-230)||(29295163-29295254)
chr4 (206-251)||(43967611-43967656)
chr4 (242-286)||(17512380-17512424)
chr4 (143-183)||(21698653-21698693)
chr4 (262-329)||(8175578-8175645)
chr4 (197-256)||(54202187-54202246)
chr4 (241-327)||(29575143-29575229)
chr4 (198-256)||(30260996-30261054)
chr4 (140-170)||(54921772-54921802)
chr4 (228-273)||(16506287-16506332)
chr4 (267-320)||(21325171-21325224)
chr4 (196-232)||(10699504-10699540)
chr4 (196-232)||(10913274-10913310)
chr4 (143-183)||(20681406-20681446)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (140-340)||(34000-34199)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (140-338)||(181491-181687)
chr6 (140-340)||(3720221-3720421)
chr6 (140-340)||(23142602-23142801)
chr6 (140-340)||(11655926-11656127)
chr6 (143-340)||(15058055-15058251)
chr6 (140-340)||(1781739-1781936)
chr6 (140-324)||(31894206-31894387)
chr6 (195-341)||(13909413-13909559)
chr6 (140-340)||(29363238-29363440)
chr6 (195-340)||(13087519-13087664)
chr6 (140-340)||(21010105-21010311)
chr6 (140-345)||(5302285-5302490)
chr6 (140-340)||(6801864-6802065)
chr6 (191-325)||(24983444-24983578)
chr6 (140-340)||(30716833-30717034)
chr6 (197-340)||(3291748-3291891)
chr6 (140-340)||(32440625-32440827)
chr6 (205-340)||(6834349-6834484)
chr6 (140-340)||(7920175-7920372)
chr6 (198-319)||(17828932-17829053)
chr6 (140-272)||(34657610-34657745)
chr6 (196-340)||(1063583-1063727)
chr6 (140-285)||(11143622-11143766)
chr6 (149-340)||(1955959-1956150)
chr6 (195-329)||(1225037-1225170)
chr6 (193-285)||(10923413-10923505)
chr6 (143-308)||(15582222-15582385)
chr6 (258-329)||(27367427-27367498)
chr6 (245-340)||(27448136-27448231)
chr6 (258-329)||(27457774-27457845)
chr6 (193-254)||(15046111-15046171)
chr6 (204-319)||(21804530-21804644)
chr6 (191-285)||(8695030-8695124)
chr6 (143-285)||(34299931-34300074)
chr6 (213-313)||(17835391-17835491)
chr6 (141-242)||(21425635-21425738)
chr6 (205-256)||(22398412-22398463)
chr6 (204-256)||(16205222-16205274)
chr6 (193-256)||(7071997-7072060)
chr6 (140-183)||(21478232-21478275)
chr6 (140-221)||(27367524-27367607)
chr6 (140-221)||(27457871-27457954)
chr6 (195-273)||(4367300-4367378)
chr6 (199-272)||(21425397-21425470)
chr6 (278-336)||(34639436-34639494)
chr6 (195-272)||(33510129-33510206)
chr6 (262-309)||(4590609-4590656)
chr6 (141-332)||(23397609-23397796)
chr6 (140-183)||(27367236-27367279)
chr6 (140-183)||(27457583-27457626)
chr6 (198-256)||(13206896-13206954)
chr6 (141-236)||(28106013-28106105)
chr6 (262-326)||(4581975-4582039)
chr6 (229-285)||(8115073-8115129)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (195-340)||(105673-105818)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (140-310)||(695-864)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (193-340)||(136018-136165)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (141-340)||(50139-50338)
scaffold0095 (140-285)||(22282-22427)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (195-340)||(2014-2159)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (140-340)||(7962-8163)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (204-340)||(16096-16232)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (205-340)||(5389-5524)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (191-340)||(17020-17169)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (195-340)||(20334-20479)
[»] scaffold0110 (2 HSPs)
scaffold0110 (195-340)||(1693-1838)
scaffold0110 (143-183)||(1493-1533)
[»] scaffold1391 (1 HSPs)
scaffold1391 (241-340)||(1798-1897)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (140-273)||(252853-252984)
scaffold0003 (245-340)||(39127-39222)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (143-242)||(76229-76328)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (192-256)||(14233-14297)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (209-340)||(6741-6871)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (233-314)||(279851-279932)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (268-320)||(143892-143944)
[»] scaffold2146 (1 HSPs)
scaffold2146 (198-285)||(397-484)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (209-253)||(56664-56708)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 140 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 42803799 - 42803298
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42803799 ctcaaaataattgtcattttacagtactaatgcatcatttattattttcttttaatattatactcttatttattgaatttcatccaacttaaccactcca 42803700  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  42803699 ttaactacaattaataatggtgttttagtaaatactactaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttctttgataatcgtgcataaaccttaa 42803600  T
Q  340 aaccatttgaaggagaaaaaatgtaannnnnnnnnn-attttcacccaagaggtatatgaccatggttattaagattctagagtgtacccgaagtggctt 438  Q
    | ||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42803599 a-ccatttgaaggagaaaaaatgtaatttttatttttattttcacccaagaggtatatgaccatggttattaagattttagagtgtacccgaagtggctt 42803501  T
Q  439 ctcagtttgaaatatcatcattatcatctaaaattttcttcttttcctattatctaacgaacaacatttctctgttttaatttcactactttctactgct 538  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42803500 ctcagtttgaaatatcatcattatcatctaaaatttccttcttttcctattatctagtgaacaacatttctctgttttaatttcactactttctactgct 42803401  T
Q  539 actgtacttgaaactatttatttccttataccatttgtgaaactaaggttgcaacaatcatgtttctctaatacattttttgtaatgtgcccttaattct 638  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42803400 actgtacttgaaactatttattttcttataccatttgtgaaactaaggttgcaacaatcatgtttctccaatacattttctgtaatgtgcccttaattct 42803301  T
Q  639 gtg 641  Q
    |||    
T  42803300 gtg 42803298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 4818484 - 4818685
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncc-actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||       || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  4818484 ctcaaaataattgtcactttataataccaatgtagcatttattatttttttcccactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaatcactcc 4818583  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4818584 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttacaattgaaatcaacacaattaattatttccttaataatcgtgcacaaacctta 4818683  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  4818684 aa 4818685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40530403 - 40530203
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncc-actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||       || |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  40530403 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattatttatttcccactattatacccttatttatttaatttcatccaacttaaccactcca 40530304  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  40530303 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacagaccttaa 40530204  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  40530203 a 40530203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 8698242 - 8698443
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8698242 ctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtagtatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaccactcc 8698341  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8698342 actaactacaattaataagggtgttttggtaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaacctta 8698441  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  8698442 aa 8698443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 339
Target Start/End: Original strand, 41496014 - 41496213
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||       ||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  41496014 ctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattattcttttccactattatacctttatttattgcatttcatccaatttaactactcca 41496113  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||    
T  41496114 ctaactacaattaataatgatgttttactaaatgcaactaattttaccattgaaatcaacacaattaattatttttttaataatcgtgtacaaaccttaa 41496213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6315956 - 6315771
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6315956 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttca 6315857  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcg 325  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6315856 ctaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaacacaatcaatcatttccttaataatcg 6315771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 27542729 - 27542929
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||  || |||||       ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27542729 ctcaaaataattgtgactttagaatactaatgcagcatgtattacttttttccattattatactcttatttattgaattttatccaacttaactactcca 27542828  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27542829 ctaactacaattaataagagtattttagtaaatggtattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaa 27542928  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  27542929 a 27542929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 40899852 - 40900052
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40899852 ctcaaaataattgtcactttagaataacattgcagcatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcca 40899951  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40899952 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttgccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgcataaaccttaa 40900051  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  40900052 a 40900052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6753836 - 6753638
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6753836 tcaaaataattatcactttagaataccaatgcaacatttattatctttttccattattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactactccac 6753737  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6753736 taactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaattaata-aattaatcattttcttaataatcgtgcataaaccttaaa 6753638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15818661 - 15818459
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||       |||||||||| |  ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  15818661 ctcaaaataactgtcactttacaataccaatgcaacattaattacttgtttccactattatgcctttatttattaaatttcatccaatttaactactcca 15818562  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaat--gctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15818561 ctgattacaattaataaaggtgttttagtaaatatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaaacatttccttaataatcgtgcataaacctt 15818462  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  15818461 aaa 15818459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6616059 - 6615870
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  6616059 ctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatt-catccaacttaaccactcc 6615961  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6615960 actaactaaaattaataaggatgttttggtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattatttatttaataatcgtgca 6615870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8725133 - 8724988
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8725133 tattatactattatttattgaatttcattcaagttaactactccactaactacaattaataagtgtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaa 8725034  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8725033 tcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 8724988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1248783 - 1248583
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||        || |||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||    
T  1248783 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattatttttcattattatacccttattaattgaattttattcaacttaactacttca 1248684  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  1248683 ctaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacataattaataatttccttaataaccgtgcacaaatcttaa 1248584  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  1248583 a 1248583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 338
Target Start/End: Original strand, 6753963 - 6754160
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||        |||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6753963 ctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacattttttttttttttccatcaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 6754062  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  6754063 ctaactacaattaataagagtgttttagtaaatgacattaattttactattgaaatcaaca-aattaatcattttcttattaatagtgcataaacctta 6754160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7828102 - 7827905
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||| |||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||        || |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7828102 aaaaaaattatcattttaaaatatcaatgcaatatttattatcttttttcattattatatccttatttattaaatttcatccaacttaactactccacta 7828003  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  7828002 actacaattaataagggtattttaataaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattttcttaataatcgtgtacaaaccttaaa 7827905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Original strand, 31654987 - 31655187
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaa-taccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  31654987 tcaaaataattgtcactttaaaaataccaatacaataattattatttatttccactattatacccttatttattgaatttcattcaacataattactcca 31655086  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  31655087 ctaactacaattaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtacacaaactttaa 31655186  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  31655187 a 31655187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 27580540 - 27580735
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||        ||| ||||||||  ||||||| | ||||||||  |||||||||||||||    
T  27580540 ctcaaaataattgtcactttacataaccaatgcaacatttttt------tcccattattatacatttatttaattaatttcattcaacttaactactcca 27580633  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaa-taatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  27580634 ctaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcctaaattaatcgtgcagaaacctta 27580733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 29570378 - 29570526
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||  |||     
T  29570378 cactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactattccattaactacaattaataaaggtgttttagcaaatactaataattttaacatta 29570477  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  29570478 aaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaatcttaaa 29570526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 338
Target Start/End: Original strand, 19929882 - 19930078
Alignment:
Q  142 caaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||    
T  19929882 caaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactatttcact 19929981  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||    || |||||| ||  |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19929982 aactacaattaataaggatgttttagtaaatgacgctagttttaccatcaaaatcaacaaaattaatcattttcttaataatcgtgcataaatctta 19930078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22848511 - 22848379
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  22848511 cactattatacccttatttattgaatttcatccaatctaactactccattaactacaattaataagggtgttttaataaatactattaattttactattg 22848412  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  22848411 aaatcaacacaattaatcgcttccttaataatc 22848379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 29374328 - 29374476
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29374328 cactattatacccttatttattgaattttattcaatttaactactccactaactacaattaataaaggtcttttagtaaatgctattaattttatcattg 29374427  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||||| | |  ||||||||||||    
T  29374428 aaatcaacataattaatcattttcttaataaccttaaataaaccttaaa 29374476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 21060569 - 21060764
Alignment:
Q  144 aaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaa 243  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||        ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21060569 aaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttatt-ttattttccattattataccattatttattgaattttatccaacttaactactccactaa 21060667  T
Q  244 ctacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||  || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21060668 ctacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttaccatcaaaataaacacaattaatcatttccctaataaccgtgcataaaccttaaa 21060764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2232195 - 2232052
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||  || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  2232195 actattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaa----aattaataagagttttttaataaatgctactaattttaccattga 2232100  T
Q  293 aatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2232099 aatcaacacaattattcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 2232052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Original strand, 9515668 - 9515880
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn---ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  9515668 tcaaaataattgtcactttacaatactaatgcatcatttattattattattttccactattatactcttatttaatgaatttcattcaacttaactactc 9515767  T
Q  238 cactaactacaat----------taataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtg 327  Q
    |||||||||| ||          |||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  9515768 cactaactactatgacctactattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattatcttaataatcgtg 9515867  T
Q  328 cataaaccttaaa 340  Q
    || ||||||||||    
T  9515868 cacaaaccttaaa 9515880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 313
Target Start/End: Original strand, 4441008 - 4441128
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||  |||||||||||  ||| |    
T  4441008 actattataccgttatttattgaatttcatccaatttaactactccactaactacaattaataaaaatattttagtaaataatattaattttatcattaa 4441107  T
Q  293 aatgaacacaattaattattt 313  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  4441108 aatcaacacaattaattattt 4441128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 191 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11796295 - 11796179
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||  |||||||||||  |||    
T  11796295 ccactagtatactcttatttattaaatttcatctaacttaactactacactaactacaattaataataatattttagtaaataatattaattttatcatt 11796196  T
Q  291 gaaatgaacacaattaa 307  Q
     |||| |||||||||||    
T  11796195 aaaatcaacacaattaa 11796179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30512801 - 30512670
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaa-ttaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacaca 302  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||  || | |||||||||| | |||||||||| |||||||| || |||    
T  30512801 cttatttattaaatttcatccaacttaactatttcactaactacatgttaataagagtatcttagtaaatgatgttaattttaccattgaaatcaataca 30512702  T
Q  303 attaattatttccttaataatcgtgcataaac 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30512701 attaatcatttccttaataatcgtgcataaac 30512670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 30553141 - 30553010
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaa-ttaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacaca 302  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||  |||||||  || | |||||||||| | |||||||||| |||||||| || |||    
T  30553141 cttatttattaaatttcatccaacttaactatttcactaactacatgttaataagagtatcttagtaaatgatgttaattttaccattgaaatcaataca 30553042  T
Q  303 attaattatttccttaataatcgtgcataaac 334  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30553041 attaatcatttccttaataatcgtgcataaac 30553010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 376 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 42800586 - 42800505
Alignment:
Q  376 attttcacccaagaggtatatgaccatggttattaagattctagagtgtacccgaagtggcttctcagtttgaaatatcatc 457  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42800586 attttcacccaagtggtatatgactatggttattaagattctagagtgtattcgaagtggcttctcagtttcaaatatcatc 42800505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15439442 - 15439299
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  15439442 tattatacccttatttattaaatta-atcaaacttaactactactctaaatacaattaataaaagtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaa 15439344  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    | || ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||    
T  15439343 ttaatacaattaatcatttccttaaatatcgtgcacaaaacttaa 15439299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Original strand, 41478815 - 41478959
Alignment:
Q  194 ctattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatgg-tgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  41478815 ctattatacccttatttattgaatttcatctaacttaacta-tccattaactgcaattaacaagggatattttagtaaatgacactaattttaccattga 41478913  T
Q  293 aatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  41478914 aataagcacaattaatcattttcttaaaaatcgcgcacaaacctta 41478959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 338
Target Start/End: Original strand, 41492290 - 41492434
Alignment:
Q  194 ctattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatgg-tgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| || || | ||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  41492290 ctattatacccttatttattgaatttcatctaacttaacta-tccattaactacatttaacaagggatattttagtaaatgtcactaattttaccattga 41492388  T
Q  293 aatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||| | |||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  41492389 aataagcacaattaatcattttcttaaaaatcgcgcacaaacctta 41492434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 553 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 42800258 - 42800169
Alignment:
Q  553 tatttatttccttataccatttgtgaaactaaggttgcaacaatcatgtttctctaatacat-tttttgtaatgtgcccttaattctgtg 641  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42800258 tatttatttccttataccatttgtaaaactaaagctgaaacaatcatgtttctccaatacatccttttgtaatgtgcccttaattctgtg 42800169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 29856066 - 29856179
Alignment:
Q  225 aacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || || |||||||||||  |||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  29856066 aacttaactactccactaactacaattaataagagtattttagcaagtgatattaattttatcattgaaatcaacgcaatt--ttatttccttaataatc 29856163  T
Q  325 gtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| ||| ||||||    
T  29856164 gtgcacaaatcttaaa 29856179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41062338 - 41062161
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| ||| |||| ||||||||||||| | |||| | ||||| || || |    
T  41062338 ctcaaaataattataactttagaataccaatgcaacatttattatttttt-ccattataatacccttatttattgaactccatccagcttaattattcta 41062240  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttcctta 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||  |||| |||| |||||||||||| ||||    
T  41062239 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttatcatcaaaatcaacataattaattattttctta 41062161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37184193 - 37184058
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | || | |||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  37184193 ttatttattgaatttcatcaaacttaatcagtctattaactacaatgaataaagatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaactcaat 37184094  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| ||||  |||| |||| |||| ||| ||||||    
T  37184093 taatcatttttttaaaaatcttgcacaaaacttaaa 37184058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3348309 - 3348116
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||       ||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  3348309 ctcaaaataattgtcattttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattataatatccttatttattgaacttcatccaacttaattacttca 3348210  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaat-----gctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgc 328  Q
    | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||     | || ||||||||| ||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3348209 ccaactacatttaataagggtgttttaataaataatggggtactaattttaccatcaaaatcaacataattaataatttccttaataaccgtgc 3348116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 337
Target Start/End: Original strand, 32440174 - 32440272
Alignment:
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| |||| |||||||    
T  32440174 actaagtacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttctttaaaaatcatgcacaaacctt 32440272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2588242 - 2588047
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||         || ||| |||| ||||||||||||| || ||| || ||||||||| ||    
T  2588242 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattttattttttcattataatacccttatttattgaactttatccaatttaactactgca 2588143  T
Q  240 c--taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||       || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||    
T  2588142 cactaactacaattaataagggtgttttag-------tactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataactgtgcatcaacctt 2588050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 11904190 - 11904340
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaatt-aataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaat 289  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||||||| |||||||||||  ||    
T  11904190 ccactattatagccttaattattgatttttatcgaatttaactactccaccaactacaattaaataagagtattttagtaaatgatattaattttattat 11904289  T
Q  290 tgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| | || ||||||||| | || |||||  |||||||| |||| |||||    
T  11904290 tgaactcaatacaattaatcactttcttaaagatcgtgcacaaacattaaa 11904340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 313
Target Start/End: Original strand, 18841478 - 18841586
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| || | |||    
T  18841478 ttatttattgaatttcacccaatttaattatttcactaactacaattaataacggtattttattaaatgatattaattttaccatttaaatcaatataat 18841577  T
Q  305 taattattt 313  Q
    |||| ||||    
T  18841578 taatcattt 18841586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38161515 - 38161422
Alignment:
Q  216 atttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattattt 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||| ||||    ||||||||||||| ||||    
T  38161515 atttcatccaacttaactactccactaactacgattaataaggatattttagtaaatgatatgaattttaccattg----gaacacaattaatcattt 38161422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38508266 - 38508166
Alignment:
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| | | || || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  38508266 ctaactacaattaataagagtattttaatgagtgatactaattttaccattgaaattaacacaattaatcattttcttaaaaatcgagcacaaatcttaa 38508167  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  38508166 a 38508166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37101329 - 37101274
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaat 250  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  37101329 tattatatttttatttattgaatttcatcaaatttaattactctactaactacaat 37101274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 39325862 - 39325929
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| | |||||||||    
T  39325862 ttatttattgaatttaatccaacttaactactccactaactatatgtaataaaggtatcttagtaaat 39325929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 843509 - 843571
Alignment:
Q  278 taattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  843509 taattttatcattgaaatcaacaaaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 843571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11761426 - 11761313
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||| | |||| | || |||| ||||  || ||||||| |||| || ||||||||| |||    
T  11761426 ccactattatacgcttatttattgaattccaaccaacttaactatttcacttagtataatttataagagtattttagt-aatgatactaattttaccatt 11761328  T
Q  291 gaaatgaacacaatt 305  Q
     |||| |||||||||    
T  11761327 aaaatcaacacaatt 11761313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 323
Target Start/End: Original strand, 5731808 - 5731893
Alignment:
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataat 323  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||   |||||   ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5731808 cactaactacgattaataaggatgttttagtaaatgatacacattttgttattaaaatgaacacaattaatcattttcttaataat 5731893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26285592 - 26285511
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttac 286  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||  |||||| || |||||||||    
T  26285592 ttatttattgaattttatacaacttaactacttcattaactacaattaatacgtgtgttttcataaatgatactaattttac 26285511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 486 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 42800396 - 42800349
Alignment:
Q  486 tattatctaacgaacaacatttctctgttttaatttcactactttcta 533  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42800396 tattatataatgagcaacatttctctgttttaatttcattactttcta 42800349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5129353 - 5129227
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatga 297  Q
    |||| ||||||||||| | ||| ||  || |||||||||| | ||||||||||||||||   |||| ||||||||  |||||||||||| ||| |||  |    
T  5129353 tatattcttatttattaatttttattcaatttaactactctaataactacaattaataagaatgttatagtaaattatattaattttaccattcaaacca 5129254  T
Q  298 acacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    |  ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5129253 atgcaactaattattttcttaagaatc 5129227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 286
Target Start/End: Original strand, 7330529 - 7330587
Alignment:
Q  228 ttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttac 286  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||    
T  7330529 ttaactactccactaattagaattaataagagtgttttactgaatgatattaattttac 7330587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 29374128 - 29374170
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29374128 tcaaaataattatcactttacaatatcaatgcaacatttatta 29374170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 234
Target Start/End: Original strand, 41480137 - 41480179
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacta 234  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41480137 cactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaacta 41480179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 376 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 42834356 - 42834270
Alignment:
Q  376 attttcacccaagaggtatatgaccatggttattaagattctagagtgtacccgaagtggcttctcagtttgaaatatcatcattat 462  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | || ||||||  ||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||    
T  42834356 attttcacccaagaggtgtatgactatggttattagaactttatagtgtagtcgaagtggcttgttagtttaatatatcataattat 42834270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 236
Target Start/End: Original strand, 32439857 - 32439902
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactact 236  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32439857 ccactattatatccctatttattgaatttcatccaacttaactact 32439902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 234
Target Start/End: Original strand, 41478772 - 41478813
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacta 234  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41478772 actattatacctttatttattgaatttcatccaacttaacta 41478813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 236
Target Start/End: Original strand, 3076622 - 3076654
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactact 236  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3076622 cttatttattgaatttcatctaacttaactact 3076654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 234
Target Start/End: Original strand, 41480181 - 41480221
Alignment:
Q  194 ctattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacta 234  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41480181 ctatcataatcttatttattgaatttcatctaacttaacta 41480221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 140 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 41506253 - 41506054
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41506253 ctcaaaataattatcactttacaatatcaatgcaatatttattaatttttttcaatattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 41506154  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41506153 ctaactacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaattaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 41506054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11373616 - 11373416
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11373616 ctcaaaataattgttactttacaatatcaatgcagcatttattattttttcccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 11373517  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11373516 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccatcgaaatcaacacaattaaacatttccttaataatcgtgcacaatccttaa 11373417  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  11373416 a 11373416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 34947441 - 34947641
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34947441 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatttttttccattattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactcca 34947540  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  34947541 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgataataattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaataaacatgcacaaaccttaa 34947640  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  34947641 a 34947641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28202497 - 28202297
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28202497 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatacagcatttattatttttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaactttactactcca 28202398  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28202397 ctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgacattaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattttcttaataaccgtgcataaaccttaa 28202298  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  28202297 a 28202297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21350814 - 21350616
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21350814 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 21350715  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21350714 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatacaactatttttaccattgaaatcaacacaatta---atttccttaataatcgtgcacaaacctta 21350618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 21390235 - 21390436
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||        ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21390235 ctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacgtttattattttttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcc 21390334  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21390335 actaactacaatcaataaggatgttttagtaaatgatattagttttaccatcaaaattaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaacctta 21390434  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  21390435 aa 21390436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 23670426 - 23670626
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncca-ctattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||       ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23670426 ctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcatcatttattattttccccccgctattatactcttatttattaaatttcatcaaacttaactactcc 23670525  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  23670526 actaactaccattaataagagtgttttagtaaatgctattaattttaccatggaaatcaacacaattaa-tattcccttaataattgtgcacaaacctta 23670624  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  23670625 aa 23670626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 759279 - 759079
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  759279 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccg 759180  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  759179 ctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataaaccttaa 759080  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  759079 a 759079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 83325 - 83526
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  83325 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccattatcatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 83424  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  83425 gctaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataaacctta 83524  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  83525 aa 83526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 28103671 - 28103874
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn---ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactact 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||          |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28103671 ctcaaaataattgtcactttacaatacaattgcaacatttattattttttttttccactattatacgcttatttattgaatttcatccaacttaaccact 28103770  T
Q  237 ccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacct 336  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28103771 tcactaactacaattaataagggtgttttggtaaatgctgctaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaacct 28103870  T
Q  337 taaa 340  Q
    ||||    
T  28103871 taaa 28103874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Original strand, 2459413 - 2459610
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2459413 tcaaaataattgacactttacaataccaatgcagcatttattattttttttcactattatacccttatttattgaatttcatcctacttaactactccac 2459512  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2459513 taactacaattaataagggtgttgtagtaaatg--actaattttaccgttgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaacattaaa 2459610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8592628 - 8592428
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  ||||||||       | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  8592628 ctcaaaataattttcattttacaatatcaatgcagcatttattattttttcctactattatactcttatttattaaatttcatctaactttactactcca 8592529  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  8592528 ctaactacaattaataagggtgttttattaaatactactaatttaaccattgaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcatgcacaaaccttaa 8592429  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  8592428 a 8592428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24516473 - 24516277
Alignment:
Q  144 aaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaa 243  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||       |||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24516473 aaataattgtcattttacaatatcaatgcaacatttattatcttttcccactattttatctttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaa 24516374  T
Q  244 ctacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  24516373 ctacaattaataaggtttttttagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttattaataatcgtgtataaaccttaaa 24516277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34100732 - 34100549
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||    
T  34100732 aaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatgttttttcactattatacccttatttattgaatgtcatccaacttaactacttcagta 34100633  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgt 326  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34100632 actacaattaataaagatattttagtaaatgctactaattttactattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgt 34100549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3178391 - 3178192
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaa--tatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||       ||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3178391 aaaataattgttactttagaatactaatgcaacatatttattatgttttcccattaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccac 3178292  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  3178291 taactacaattaataaaggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaatcaatcatttacttaataatcatgcacaaaccttaaa 3178192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 37245631 - 37245833
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  37245631 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattttttctcactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaccactcca 37245730  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttcctt---aataatcgtgcataaacct 336  Q
    || | ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||   |||||||||||| ||||||    
T  37245731 cttattacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaa-tttaccattgaaatcaacagaattaatctttttcttataaataatcgtgcacaaacct 37245829  T
Q  337 taaa 340  Q
    ||||    
T  37245830 taaa 37245833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 42935599 - 42935802
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc- 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||       | | ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||     
T  42935599 ctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattattttttccaattataatactcttatttattgaacttcatccaacttaactcctcct 42935698  T
Q  239 --actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacct 336  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||    
T  42935699 ccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataaccgtgcatcaacct 42935798  T
Q  337 taaa 340  Q
    ||||    
T  42935799 taaa 42935802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Original strand, 33819154 - 33819355
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc--cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||          ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||    
T  33819154 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattattattattttcactattatacccttatttaatgaatttcattcaacttcactactcc 33819253  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    || ||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  33819254 acaaacaacaattaataagagtgattttgtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtacattaacctta 33819353  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  33819354 aa 33819355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 40076259 - 40076456
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       ||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||      
T  40076259 ctcaaaataattgtcactttataataccaatgcagcatttattatttttttccattatcacacccttatttattgaatttcatccaacttaactaatc-- 40076356  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40076357 -taagtacaattaataatagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaattaacacaattaatcatttctttaataatcgtgcataaaccttaa 40076455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 9785929 - 9786129
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||        |  |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  9785929 ctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcagcatttattattatttttctttattatacccttatttattgaattttatccaacttaactacttca 9786028  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9786029 ctaactacaattaataagcgtgttttagtaaatgaaattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacagaccttaa 9786128  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  9786129 a 9786129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21760172 - 21759972
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||       ||  |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21760172 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatatttttcctttattataccctcaattattgaatttcatccaacttaactactcca 21760073  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  21760072 ttaactacaattagtaagggtgttttattaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcatgcacaaaccttaa 21759973  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  21759972 a 21759972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32346240 - 32346040
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||  ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  32346240 ctcaaaataattatcattttagaatactaatgcagcatttattatctttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactcca 32346141  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||| || |||||||||  || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  32346140 ctaattataattaataagagtattttagtagatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaattatttccttaataaccgtacacaaaccttaa 32346041  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  32346040 a 32346040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 43873864 - 43874064
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||       ||| ||| ||||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  43873864 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattttttcccattataatacatttatttattaaacttcatccaacttaactactcca 43873963  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  43873964 ctaactacatttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttctttaataaccatgcatcaaccttaa 43874063  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  43874064 a 43874064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 46478430 - 46478281
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  46478430 ccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcaattaactacaattaataagggtattttagtaaatgctactaactttactatt 46478331  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||| || ||| |||||    
T  46478330 aaaattaacacaattaatcatttaattaataatcgtgtatgaactttaaa 46478281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 7463153 - 7463354
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaa-tgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  ||||||||        ||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7463153 ctcaaaataatcgtcactttacaataacaaatgcatcatttattattatttttcactattctatctttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 7463252  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  7463253 actaactacaattaatgagggtatttaagtaaatgctactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgcacaatcctta 7463352  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  7463353 aa 7463354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19271920 - 19271732
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  19271920 ctcaaaataattgttactttacaataccaatgcaacatttattatttttt-ccaatattatacccttatttattaattttcatccaacttaactactcca 19271822  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||||| | |||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  19271821 ctaactacaattaataaaagtattttagtcaatgccactaatttgatcattgaaatcaacacaattaatcatttttttaataatcgtgca 19271732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 30865973 - 30866108
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  30865973 ttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaattataattaataagagtattttagtaaatgatattaattataccattgaaattaacacaat 30866072  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30866073 taatcatttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 30866108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 26974018 - 26974170
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgct---attaattttaca 287  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |   |||||||||||     
T  26974018 ccactattatacatttatttaataaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagagtattttagtaaatgatgatattaattttacc 26974117  T
Q  288 attgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26974118 attgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 26974170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7457607 - 7457409
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| || ||| |    
T  7457607 tcaaaataattatcactttacaatatcaatgcaacatttattatttttt-ccactattatactcttatttattgaatttaatttaacttaattattccgc 7457509  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  7457508 taactacatttaataagggtcttttagtaaatgtaactaattttaccattgaaatcaacataattaatcatttttttaataatcgtgcacaaacattaaa 7457409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 22738693 - 22738842
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | | | |||||||||||| || ||||||||| |||    
T  22738693 ccactattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactaatctactaactacaattaatgaggatattttagtaaatgatactaattttaccatt 22738792  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22738793 gaaatctacacaattaatcatttctttaataatcgtgcataaaccttaaa 22738842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 38391744 - 38391889
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||    
T  38391744 tattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattattccactaactacaattaacaagagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaa 38391843  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  38391844 tcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataaaccttaaa 38391889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 336
Target Start/End: Original strand, 48608808 - 48608999
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  48608808 ctcaaaataattgtcactttaaaatattaatgcagtatttattatttttt-ccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactacatca 48608906  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacct 336  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||    || || |||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48608907 ctaactacgattaataaggatgttttagtaa----tactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcatgcataaacct 48608999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 13961965 - 13962100
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||| || |||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  13961965 ttatttattaaatttcatccaacttaactactccactaactacacttaataaggatattttattaagtgatattaattttatcattaaaatcaacacaat 13962064  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13962065 taatcatttccttaataaacgtgcataaaccttaaa 13962100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 5524369 - 5524521
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattga---atttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttaca 287  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |   |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||| |||||| || |||||||||     
T  5524369 ccactattatacctttatttattaataaatttcatccaacttaactactcaactaactataattaataaaagtgttttattaaatgttactaattttacc 5524468  T
Q  288 attgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  5524469 attgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaactttaaa 5524521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 27920927 - 27921129
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccac--tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||       || |  ||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |     
T  27920927 ctcaaaataattgtcactttagaatattaatgcaacatttattatttttttccccattataatactcttattgattgaacttcatccaacttaactaatg 27921026  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||    
T  27921027 cactaactacaattaataagagtgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaacataattaatcattttcttaataactgtgcatcaacctt 27921126  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  27921127 aaa 27921129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16560679 - 16560558
Alignment:
Q  219 tcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttcctta 318  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  16560679 tcatccaacttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttcctta 16560580  T
Q  319 ataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16560579 ataatcgtgcataaatcttaaa 16560558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 340
Target Start/End: Original strand, 16604983 - 16605104
Alignment:
Q  219 tcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttcctta 318  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  16604983 tcatccaacttaactaccccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaataaacacaattaatcatttcctta 16605082  T
Q  319 ataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16605083 ataatcgtgcataaatcttaaa 16605104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 201 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31930626 - 31930485
Alignment:
Q  201 actcttatttattgaatttcatcaaacttaacta--ctccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||   |||| |||||| ||| |||| ||    
T  31930626 actcttatttattgaatttcatcaaacttaactatactccactaactacaattaataagggtattttaaaaaattagattagttttaccattaaaatcaa 31930527  T
Q  299 cacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31930526 cacagtcaatcatttctttaataatcgtgcataaactttaaa 31930485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29835550 - 29835402
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29835550 ccactattatatctttatttattgaattacatccaact-aactactccgttaactgcaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccatt 29835452  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     |||| |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  29835451 taaatcaacataattaatcatttccttaataagcgcgcacaaaccttaaa 29835402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 273
Target Start/End: Original strand, 25571361 - 25571493
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||         | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25571361 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttta-attattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattcca 25571459  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  25571460 ctaactacaactaataagggtattttagtaaatg 25571493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 239 - 340
Target Start/End: Original strand, 12631345 - 12631446
Alignment:
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12631345 actaactacaattaataaggatgttttgataaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaattatttccttaataatcgtgcacaaacctta 12631444  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  12631445 aa 12631446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Original strand, 49101659 - 49101809
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttt---tagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||   ||||||||| |||||||||||   ||     
T  49101659 tattatacttttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaatatgagtattttaatagtaaatgatattaattttatcctta 49101758  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaaac 342  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  49101759 aaataaacacaattaatcattttcttaaaaatcgtaaacaaaccttaaaac 49101809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 207 - 314
Target Start/End: Original strand, 35333051 - 35333158
Alignment:
Q  207 atttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaatta 306  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  35333051 atttgttgaatttcatctaacttaactactccactaactacaattaataataatattttaataaataatattaattatataattgaaatcaacacaatta 35333150  T
Q  307 attatttc 314  Q
    | ||||||    
T  35333151 actatttc 35333158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 16904371 - 16904520
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||   || |||||| || || || ||||||||| |||    
T  16904371 ccactattatacccttatttattgaatttgatccaacttaattatttcactaactataattaatacgagtattttagaaagtgataataattttactatt 16904470  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||  |||| ||||||||||    
T  16904471 gaaatcaacacaattaatcattttcttaaaaattttgcacaaaccttaaa 16904520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 268
Target Start/End: Original strand, 36790679 - 36790809
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn--ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||         ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  36790679 ctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcagcatttattattattttttccattattatacccttatttattgaatttcatccgacataactactc 36790778  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagt 268  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36790779 aactaactacaattaataagggtgttttagt 36790809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6495067 - 6494990
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6495067 tattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactccactaactacaattaataaaagtgttttagtaaat 6494990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 191 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32019053 - 32018917
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||  |||||||| |||    
T  32019053 ccactattaatcccttatttattaaatttcatccaacttaattactccactaacaacaattaataagagtattttagtaaatgatagaaattttactatt 32018954  T
Q  291 -gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgt 326  Q
      |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  32018953 caaaatcaacacaattaatcatttcattaaaaatcgt 32018917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47045653 - 47045546
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||        |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  47045653 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacttttttt------ttccactattatactcttatttgttgaatttcatccaacttaactactaca 47045560  T
Q  240 ctaactacaattaa 253  Q
    ||||| ||||||||    
T  47045559 ctaaccacaattaa 47045546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17828473 - 17828340
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||  ||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||     
T  17828473 ttatttattgaatt-catccaacttaattactccactaactacaattgataagagtaattttgtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacaaaaa 17828375  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  17828374 taatcgtttccttaat-atcgtgcacaaactttaaa 17828340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 286
Target Start/End: Original strand, 24166934 - 24167078
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta-nnnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||| |||| | ||||||| |||||||||||  ||  |||||||| ||||    
T  24166934 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattatttttatttcacttttattcccttatttcttgaatttcattcaatgtaactactgcact 24167033  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttac 286  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||    
T  24167034 aactactattaataagggtattttagtaaataacattaattttac 24167078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32018849 - 32018714
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||||  | |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||| ||  |||||||| |||    
T  32018849 ccactattaagcccttatttattaaatttaatccaacttaattactctactaacgacaattaataagagtattttagtaaatgatagaaattttactatt 32018750  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgt 326  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  32018749 gaaatcaacacaattattcatttcattaaaaatcgt 32018714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 44424086 - 44424276
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||       | | ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  44424086 ctcaaaataattatcactttaaaatatcaatgcagcatttattatttttttc-attataatacccttatttattgaacttcatccaacttaattactcca 44424184  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||| ||||||| |||      |||||||    ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44424185 ctaactacatttaataagggt------gtaaatg---ataattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgcatcaaccttaa 44424275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 2850971 - 2850869
Alignment:
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  2850971 cactaactataattaatgagggtattttagtaaataatattaattttatcattgaaatcaacataattaatcatttccttaataatcatgcacaaaccat 2850872  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  2850871 aaa 2850869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 204 - 285
Target Start/End: Original strand, 42796010 - 42796094
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaac---tactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  42796010 cttatttaatgaatttcatccaacttaacaactactccactaactacaattaataagggtgttttaataaatgttactaatttta 42796094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 340
Target Start/End: Original strand, 44180268 - 44180346
Alignment:
Q  262 ttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||  || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  44180268 ttttagtaaattatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgtataaaccttaaa 44180346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 198 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30546485 - 30546413
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaa 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30546485 tatacccttatttattgaatttcactccacttaactactccaataactacaattaataaaggtgttttagtaa 30546413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 340
Target Start/End: Original strand, 46211472 - 46211572
Alignment:
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaat---tttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| || || |   ||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46211472 actacaattaataaggatgttttagtaaatgatagtactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataaaccttaa 46211571  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  46211572 a 46211572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31665842 - 31665731
Alignment:
Q  203 tcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg-ctattaattttacaattgaaatgaacac 301  Q
    |||||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||   | ||||||||||||   ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  31665842 tcttatttattgaaatttatctaatttaactactctactaactactattaataaatatattttagtaaatgaaaattaattttaccattaaaatcaacac 31665743  T
Q  302 aattaattattt 313  Q
    || |||||||||    
T  31665742 aactaattattt 31665731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4958736 - 4958674
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaat 254  Q
    ||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4958736 cactattatacccctattgattgaacttcatcaaacttaactacttcactaactataattaat 4958674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37850863 - 37850807
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactaca 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  37850863 cactattatattcttatttattgattttcatctaacttaacaactccattaactaca 37850807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21937970 - 21937842
Alignment:
Q  145 aataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaac 244  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||       |||||| || || ||| |||||| |||| || |  | |||||||||||||||||    
T  21937970 aataattgtcaatttagaatgccaatgcagcatttattattttcccccactaatacacccttgtttattaaattccacctcaattaactactccactaac 21937871  T
Q  245 tacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  21937870 tacaattaataagagtgctttagtaaatg 21937842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29198812 - 29198777
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29198812 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaa 29198777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 246
Target Start/End: Original strand, 37490319 - 37490422
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||         |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  37490319 aaaacaatagtcactttaaaataccaatgcaacatttattattattttttactagtatgctcttatttattgaatttcattcaatttaattactccacta 37490418  T
Q  243 acta 246  Q
    ||||    
T  37490419 acta 37490422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 39452390 - 39452457
Alignment:
Q  245 tacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattattt 313  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  39452390 tacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaaca-tattaattattt 39452457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 272
Target Start/End: Original strand, 46602047 - 46602123
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||    ||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46602047 attatacccttatttattcaattccactgcactaaactactgcactaactacaatgaataagggtgttttagtaaat 46602123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 47045538 - 47045467
Alignment:
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttcc 315  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  47045538 actacaattaataagggtattttaggaaatgatactaattttac-attgaaatcaactcaattaatcatttcc 47045467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 286
Target Start/End: Original strand, 39005433 - 39005508
Alignment:
Q  211 attgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttac 286  Q
    |||||||||||   ||||||| || || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||    
T  39005433 attgaatttcacttaacttaattaatctactaactacaattattaaaggtattttagtaaatgatactaattttac 39005508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 255
Target Start/End: Original strand, 17610913 - 17610958
Alignment:
Q  210 tattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaata 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  17610913 tattgaatttcatccaacttaactatttcaataactacaattaata 17610958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 246
Target Start/End: Original strand, 37490457 - 37490510
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaacta 246  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||    
T  37490457 actagtatgctcttatttattgaatttcattcaatttaattactccactaacta 37490510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Original strand, 7930083 - 7930127
Alignment:
Q  229 taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7930083 taactatttcactaactataattaataagggtgttttagtaaatg 7930127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17783188 - 17783148
Alignment:
Q  231 actactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaa 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  17783188 actactccactaactataattaataaagatgttttagtaaa 17783148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43254045 - 43253844
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  43254045 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattagtttttttccactattatacccttatttaatgaatttcatcccacttaactactcc 43253946  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43253945 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaacctta 43253846  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  43253845 aa 43253844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 37311886 - 37312084
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncc-actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||        | | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37311886 aaaataattgtcactttacaatatcaatgcagcatttattattatttttctattattatactcttatttattgaatttcattaaatttaactactccact 37311985  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311986 aactacaattaataagggttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 37312084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37695837 - 37695658
Alignment:
Q  151 tgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaa 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||        ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37695837 tgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccactaactacaa 37695738  T
Q  250 ttaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37695737 ttaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgca 37695658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 36476518 - 36476718
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36476518 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattacttttttctattattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactcta 36476617  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  36476618 ctaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgcaatcaacacaatcaattattttcttaataaccgtgaacaaaccttaa 36476717  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  36476718 a 36476718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36460597 - 36460397
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  36460597 ctcaaaataattgtcactttacgatatcaatgcaatatttattatttgtttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactcca 36460498  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
     ||||||||||||||||   | ||||| |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  36460497 ttaactacaattaataagaatattttaataaatgttactaattttactattgaaattaacacaattaataattttcttaataatcgtgcacaaactttaa 36460398  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  36460397 a 36460397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10366830 - 10366623
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  10366830 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttca 10366731  T
Q  240 ctaactacaattaataat-------ggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataa 332  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  10366730 ctaactacaattaataattaataagagtgttttaataaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaa 10366631  T
Q  333 accttaaa 340  Q
    ||||||||    
T  10366630 accttaaa 10366623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30190841 - 30190641
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||| || ||||||||       ||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30190841 ctcaaaataattgtcactttagaataaaaatgtaacatttattattaatttccattattttacccttattaattgaatttcatccaacttaactactcca 30190742  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  30190741 ctaactacaattaataagggtattttagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttcataaccgtgcacaaaccttaa 30190642  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  30190641 a 30190641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 44301495 - 44301696
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44301495 ctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattaatatttttccactattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 44301594  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||| ||| ||||||||    
T  44301595 actaattacaattgataagggtattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacataattaaatatttccttaaaagtcgggcacaaacctta 44301694  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  44301695 aa 44301696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8679184 - 8679035
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8679184 ccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattaattcactaactataattaataaggatcttttagtaaatgctactaattttaccatt 8679085  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8679084 gaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaatcttaaa 8679035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 19822945 - 19823145
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcacttt-acaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||       | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  19822945 ctcaaaataattgtcacttttagaataccaatgcagcatttattatttttttc-attaatatacccttatttattgaatttcatccaacttaactattcc 19823043  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19823044 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattctaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaacctta 19823143  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  19823144 aa 19823145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 37497425 - 37497626
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc-cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||         || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37497425 ctcaaaataattgtcactttataataccaatacaacatttattattattttttcattattatacgtttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 37497524  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37497525 actaactacagttaacaacggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaataaatcatttccttaataatcgtgcataaatctta 37497624  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  37497625 aa 37497626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37773147 - 37772945
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatt--annnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |       ||| |||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| ||    
T  37773147 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcatttattttatttttttccattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactattc 37773048  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37773047 cactgactataattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgtaatcaatacaattaatcatttccttaataatcatgcacaaacctt 37772948  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  37772947 aaa 37772945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 1778632 - 1778776
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||    
T  1778632 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttatctactccactaactacaat-aataaggatgttttagtaaatgtcattaattttatcattgaaa 1778730  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1778731 tcaacacaattaatcatttccttaataatcatgcacaaaccttaaa 1778776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Original strand, 30711059 - 30711208
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||     
T  30711059 cactattataatcttatttattgaatttcatctaacttaattgctccattaactacaattaataatggtgttttagtaaatgatattaattttatcatta 30711158  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaaa 341  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||   |||| |||||||||||    
T  30711159 aaatcaacataattaattatttctttaataacaatgcacaaaccttaaaa 30711208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 11632067 - 11632214
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||    
T  11632067 cactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaacttttccactaactacaattaataaaggtgttttagtaaatactactaattttaccgttg 11632166  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  11632167 aaatcaacacaattaatcattt-tttaataatcgtgcacaaatcttaaa 11632214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24569214 - 24569082
Alignment:
Q  207 atttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaatta 306  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24569214 atttaatgaatttcattcaacttaactactccactaactacaattaataagggtattttagtaaataatattaattttaccattgaaatcaacacaatta 24569115  T
Q  307 attatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24569114 atcattttcttaataatcgtgcataaatcttaa 24569082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51838141 - 51837940
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||        |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  51838141 ctcaaaataattgtcactttacaattataatgcaacatttattattttttttccactattatacccttatttaatgaatttcattcaacgtaactactcc 51838042  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||| ||||||||    
T  51838041 actagctacaactaataagggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttacttaatactcatgcacaaacctta 51837942  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  51837941 aa 51837940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 345
Target Start/End: Original strand, 54726419 - 54726624
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||       ||| ||| |||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  54726419 ctcaaaataattgcaactttagaatactaatgcaacatttattagtttttcccattataatacccttatttattaaacttcatctaacttaactactcca 54726518  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
     |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  54726519 ttaactacaattaataaagatgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacatttaatcattttcttaataaccgtgcatcaaccttaa 54726618  T
Q  340 aaccat 345  Q
     |||||    
T  54726619 caccat 54726624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 29024091 - 29023947
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||  |||    
T  29024091 tattataccattatttattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataa-gatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaa 29023993  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29023992 tcaacacaattaatcatttttttaataatcgtgcataaaccttaaa 29023947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28690907 - 28690763
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaat 295  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  28690907 attatacatttatttattgaatttcatccaacttaactatctcactaactacaattaataaagatattttagtaaatgatattaattttaccgttgaaat 28690808  T
Q  296 gaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28690807 caacacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 28690763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 23004499 - 23004380
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||  ||||||    
T  23004499 cttatttattgaatttcatacaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtatatactactaattttaccattgaaatcgacacaa 23004400  T
Q  304 ttaattatttccttaataat 323  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  23004399 ttaatcatttccttaataat 23004380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 27471269 - 27471469
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||       ||||||  ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27471269 ctcaaaataattgtcactttataataccaatacagcatttattatttttgtccactaccatacctttatttattgaatttcattcaacttaactactcca 27471368  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||  || |||||||||  |||||||||||||||| | |||||| || |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  27471369 ctacttataattaataagagtgttttagtaaatgcaactaatttcaccattgaaatcaacataattaatcattttcttaataatcgtgcacaaatcttaa 27471468  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  27471469 a 27471469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 38795278 - 38795478
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |        |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  38795278 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaatattttattttattttccactattatgcccttttttattaaatttcatccaacttaacaactcca 38795377  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    | ||||||||||||||| ||  |||  ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  38795378 ccaactacaattaataagggcatttgggtaaatgatactaattttaccattgaaataaacacaattaatcatttccttaaatatcgtgcacaaacattaa 38795477  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  38795478 a 38795478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 144 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39043932 - 39043772
Alignment:
Q  144 aaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaa 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||        || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39043932 aaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatttttt--cattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaa 39043835  T
Q  244 ctacaattaataatggtgttttagtaaatg---ctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39043834 ctacaattaataaaggtattttagtaaatgatactattaattttaccattgaaatcaacacaa 39043772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 340
Target Start/End: Original strand, 45710848 - 45710984
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||| ||    
T  45710848 cttatttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaaagtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacataa 45710947  T
Q  304 ttaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  45710948 ttaatcattttcttaacaaccgtgcatcaaccttaaa 45710984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 11905821 - 11905956
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||  ||  |||| ||||||||    
T  11905821 ttatttattgaatttcatccaacttaacaactccattaactacaattaataagggtgctttagtaaatgatactaattttatcatcaaaattaacacaat 11905920  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11905921 taatcattttcttaataatcgtgcataaactttaaa 11905956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 3313243 - 3313384
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||    
T  3313243 tattataatcttatttattgaatttcatccaacttaaatactccattaactacaattaataagggtgttttagttaattctactaattttaccattgaaa 3313342  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |  |||    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3313343 tcgaca----taatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 3313384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38137626 - 38137424
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||       |||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  38137626 tcaaaataattgtcactttgcaatactaatgcaatatttattattattttccactattatatctttatttattgaatttcatcgaatttaactaccccac 38137527  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatg---ctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    |||||||| |||||||   | |||||||| |||    || ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||    
T  38137526 taactacagttaataagaatattttagtagatgtcagtactaattttactattgaaatcgacacaatgaattatttcatttataatcatgcacaaacctt 38137427  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  38137426 aaa 38137424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3901330 - 3901151
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||| ||| |  |||||||||| || ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  3901330 ctcaaaataattgttactcttgaataccaatgtaacatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaagtacccca 3901231  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaa 319  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||||||||||  |||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  3901230 ctaactacaactaataagaatgttttagtaaatgatattaattttatcattgaaattaatacaattaatcattttcttaa 3901151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5323063 - 5322920
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||  || |||||||||||| |||||||||||  | |||||    
T  5323063 tattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactttactaattataattaataagtgtattttagtaaatgatattaattttatcactgaaa 5322964  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  5322963 tcaacataattaatcattt--ttaataatcgtgcacaaaccttaaa 5322920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 336
Target Start/End: Original strand, 17652687 - 17652878
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| |       | | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||    
T  17652687 ctcaaaataattgtcactttagaatattaatgcagtatttat-aattttttcaattattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactacctca 17652785  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacct 336  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||    || || |||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17652786 ctaactacaattaataaggatgttttagtaa----tactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaacct 17652878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 529 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 27907143 - 27907034
Alignment:
Q  529 ttctactgctactgtacttgaaactatttatttccttataccatttgtgaaactaaggttgcaacaatcatgtttctctaatacattttttgtaatgtgc 628  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  27907143 ttcttctgctactgcatttgaaactatttatttccttatagcattagtgaaactaaagttgaaacaatcatgtttctccaatgcattttctgtaatgtgc 27907044  T
Q  629 ccttaattct 638  Q
    ||||||||||    
T  27907043 ccttaattct 27907034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12736701 - 12736553
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||  |||     
T  12736701 cactattatacccttatttattgaattttatccaaattaactactacactaagtacaattaataagggtattgtagtaaatgatactaattttatcatta 12736602  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  12736601 gaatcaacacaattaatcatttccttaaaaatcgtgcacaaactttaaa 12736553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 53560150 - 53560351
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatt-annnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||| |       ||| ||| | || ||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  53560150 ctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttatttatttttttccattataacacccttatttattgaacttcattcaacttaactactct 53560249  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| ||  |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  53560250 actaactatatttaataagggtgttttagtaaatgatacaaattttaccatcaaaatcaacataattaatcatttccttaatcatcgtgcatcaacctta 53560349  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  53560350 aa 53560351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 340
Target Start/End: Original strand, 34750483 - 34750630
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||| |    
T  34750483 actattataccattatttattaattttcatccaagttaactactccaccaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccattaa 34750582  T
Q  293 aatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||    
T  34750583 aatcaacacaatcaatcatttcatcaaaaatcgtgcacaaaccttaaa 34750630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 19611908 - 19612042
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||  || ||||||||  |||||||| ||||||||    
T  19611908 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaacaacaattaataaggatattttagtaaattata-taattttaacattgaaatcaacacaat 19612006  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| | || ||||| |||||| || |||| |||||    
T  19612007 taatcactttcttaaaaatcgtacacaaactttaaa 19612042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 14194545 - 14194689
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||||| || ||||||||  |||||||    
T  14194545 tattatacctttattaattgaatttcatccaacttaattactccactaac-acaattcataaaagtattttagtaaatggtactaattttatcattgaaa 14194643  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | ||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  14194644 tcaacacaattgatcatttctttaaaaatcgtgcacaaaccttaaa 14194689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 191 - 313
Target Start/End: Original strand, 12904849 - 12904972
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaat-aatggtgttttagtaaatgctattaattttacaat 289  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || | | ||||  |||||  || |||||||| |||    
T  12904849 ccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactccactaactacaattaataaaagatattttgataaatcatactaattttataat 12904948  T
Q  290 tgaaatgaacacaattaattattt 313  Q
    |||||| |||| ||||||||||||    
T  12904949 tgaaatcaacataattaattattt 12904972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 340
Target Start/End: Original strand, 49830162 - 49830264
Alignment:
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaatta-tttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||||||| |||| ||    
T  49830162 actaactacaattaataatggtattttagtaaatgatattaattttactattgaaatcaacacaattaatcattttttttaataatcgtgcacaaacgtt 49830261  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  49830262 aaa 49830264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 319
Target Start/End: Original strand, 19609288 - 19609412
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||   | |||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19609288 tattatacatttatttattgaattttatcaaacttatctactccactaacaacaagtaataagaatatttttgtaaatgatattaattttacgattgaaa 19609387  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaa 319  Q
    | ||||||| |||| |||| |||||    
T  19609388 tcaacacaaataatcattttcttaa 19609412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 340
Target Start/End: Original strand, 52290891 - 52291027
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||||||||| ||  |||| || ||||    
T  52290891 cttatttattgaactttattcaacttaactactccactaactataattaataaggctgttttaataaatggtactaattttaccatcaaaatcaatacaa 52290990  T
Q  304 ttaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  52290991 ttaatcattttcttaataaccgtacatcaaccttaaa 52291027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 34957438 - 34957637
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||       ||  || ||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  34957438 ctcaaaataattatcactttaaaataccaatgtaacatttattatttttt-ccgttactatatccttatttattgaatttcatttaactgaactactcca 34957536  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||| ||||||||| | | ||| |||||||  ||  |||||||| ||  || | |||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  34957537 ctaactataattaataaggatatttaagtaaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaattaatcatttccttagtaattgtccataaaccttaa 34957636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 33491542 - 33491408
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc-cactattatactcttatttattgaa-tttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |       | ||||||||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  33491542 ctcaaaataattgtcactttacaatactaatgtagtatttatgatttttttcgcactattatacccttatttattaaaatttcatacaacttaactactc 33491443  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  33491442 cactaactataattaataagagtgttttagtaaat 33491408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 49447919 - 49447775
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||| |||     ||||    
T  49447919 actattatacccttatttattaaatttcatcaaatttaactattctactaactacaattaataagggtattttggtaaataatattatttt---cgttga 49447823  T
Q  293 aatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||    
T  49447822 aatcaacacaattaatcatttcgttaattatcgtacacaaacattaaa 49447775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31158691 - 31158503
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||       | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||      
T  31158691 ctcaaaataattctcactttacaatacaaatgcagtatttattatttttttc-actattataccattatttattgaatttcatctaacttaactattc-- 31158595  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
            || |||||   ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  31158594 --------aaataataggagtgttttagtaaatgttattaattttactatcgaaatcagcacaattaatcattt-tttaataatcgtgcacaaaccttaa 31158504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 50035299 - 50035197
Alignment:
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  50035299 actaactacaattaacaacggtgttttggtaaatgctactaattttattattgaaatcaacataattattcattttcttaataatcatgcacaaacctta 50035200  T
Q  339 aaa 341  Q
    |||    
T  50035199 aaa 50035197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Original strand, 23068137 - 23068334
Alignment:
Q  144 aaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaa 243  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||       | | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||    
T  23068137 aaataattgttactttacaatatcaatacaacatttattatttttgtc-attattatacttttatttattgaatttcatctaacttaaatatttcacaaa 23068235  T
Q  244 ctacaattaataatggtgttttagtaaatgcta---ttaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||| | |||| | | |||| |||| |||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||    
T  23068236 ctacaattaataa-ggtgtttcagtgaatgctactattattcttaccactaaaatcaacataattaattattttcttgataatcatgcacaaactttaaa 23068334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 27549464 - 27549323
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncc-actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||       || |||||||||   ||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||    
T  27549464 aaaataactgtcactttacaatatcaatgcaacatttattatttttttcccactattataactttatttattgaatttaatttaatttaactacgccact 27549365  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattt 283  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  27549364 aactataactaataatgttgttttagtaaatgcaactaattt 27549323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 327
Target Start/End: Original strand, 43719272 - 43719387
Alignment:
Q  211 attgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaatta 310  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||| || ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |    
T  43719272 attgaattccatccaatttaactactccactaactacaattaataaggatgtttcagtgaatgata-taattttaccattaaaatcaacacaattaatca 43719370  T
Q  311 tttccttaataatcgtg 327  Q
    |||  ||||| ||||||    
T  43719371 ttttattaatgatcgtg 43719387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 54477564 - 54477473
Alignment:
Q  216 atttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaa 307  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  54477564 atttcattcaacttaactactccattaactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacacaattaa 54477473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33491125 - 33491064
Alignment:
Q  279 aattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33491125 aattttactattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 33491064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 256
Target Start/End: Original strand, 38705168 - 38705225
Alignment:
Q  199 atactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38705168 atactcttatttattgaatttcatctaacttaattactcaactaactacaattaataa 38705225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30682188 - 30682068
Alignment:
Q  199 atactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaa 298  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||   | |||||||||||| || | ||||||  ||| |||| ||    
T  30682188 atactattatttattgaatttcgtccaacttaattattccattaactacaattaataagattattttagtaaatgatactcattttaacattaaaattaa 30682089  T
Q  299 cacaattaattatttccttaa 319  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  30682088 aacaattaatcatttccttaa 30682068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36463062 - 36462982
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||    
T  36463062 ttatttatttaatttcatccaacttaattactccacaaacaacaattaataaggttattttagtaaatgctaccaatttta 36462982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41038571 - 41038458
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||       ||| ||| |||  ||||||||||||| |||| | |||||||||||| || ||    
T  41038571 aaaataattgtcactttaaaatacaaatgcagcatttattatttttttccattataatatccttatttattgaacttcaaccaacttaactacttcatta 41038472  T
Q  243 actacaattaataa 256  Q
    ||||||||||||||    
T  41038471 actacaattaataa 41038458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24245221 - 24245109
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||  | |||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||  |||||    
T  24245221 actattatattattatttattgaattgcatccgatttaactactttactaagtacaattaataat-atgttttagtaaataatactaattttattattga 24245123  T
Q  293 aatgaacacaatta 306  Q
    ||| |||| |||||    
T  24245122 aatcaacataatta 24245109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 313
Target Start/End: Original strand, 38512011 - 38512132
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   | ||||| |||||| ||| |||||||  |||     
T  38512011 cactactatacccttattttttaaattccatcaaacttaactactccaataattacaatcaataaatatattttaataaatgatatcaattttatcatta 38512110  T
Q  292 aaatgaacacaattaattattt 313  Q
    |||| || | ||||||||||||    
T  38512111 aaatcaataaaattaattattt 38512132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 253
Target Start/End: Original strand, 40462255 - 40462366
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| |||||||        ||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||||||      
T  40462255 ctcaaaatagttgtcactttagaatgtcaatgcaacatttatt--tttttcccactattatacaactatttattgaattttatccaacttaactactctt 40462352  T
Q  240 ctaactacaattaa 253  Q
    ||||||||||||||    
T  40462353 ctaactacaattaa 40462366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 48541109 - 48540981
Alignment:
Q  212 ttgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattat 311  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||   | ||||| |||||| |||||||||||  || |||||  ||| ||||| | ||    
T  48541109 ttgaatttcattcaacttaactactcaactaattacaattaataagaatattttaataaatgatattaattttattatagaaattgacataattagtcat 48541010  T
Q  312 ttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||  || ||||| |||| |||||    
T  48541009 ttccttaaacattgtgcacaaactttaaa 48540981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 269
Target Start/End: Original strand, 37804839 - 37804898
Alignment:
Q  210 tattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagta 269  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||    
T  37804839 tatttaatttcataaaacttaactactccactaaccataattaataagggtattttagta 37804898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41351680 - 41351629
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41351680 ttatttattgaatttcattcaacttaactactccactaactatcattaataa 41351629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1018989 - 1018908
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || |||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||    
T  1018989 ccactaatatacttttatttattgtatctcaagcaacctaactactccactaactgcaattaataatgatatattagtaaat 1018908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 191 - 256
Target Start/End: Original strand, 40194488 - 40194553
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40194488 ccactattatatctttatttattaaatttcttccaactcaactacgccactaactacaattaataa 40194553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Original strand, 42278695 - 42278776
Alignment:
Q  236 tccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttcctt 317  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||  ||| |||| ||||||||    
T  42278695 tccactaactataattaatatgagtgttttagtaaatgatgttaattttacgattgaaatcaattcaactaatcatttcctt 42278776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 194 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50036559 - 50036510
Alignment:
Q  194 ctattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaa 243  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  50036559 ctattatacctttatttattgaatttcatcaaacttaactattcaactaa 50036510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 236
Target Start/End: Original strand, 24703599 - 24703692
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactact 236  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||| |||       |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24703599 aaaataattgtcattttaaagtgccaatgtaatatttgttatttctttccactattatatctttatttattgaatttcatccaacttaactact 24703692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25108654 - 25108551
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||   | ||||||||| || ||||||| |||| || |  |||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  25108654 cactaatatatttttatttattgaatttcattctatttaactacttcattaactacgattagtacttatgttttagaagatgatattaattttaccattg 25108555  T
Q  292 aaat 295  Q
    ||||    
T  25108554 aaat 25108551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 183
Target Start/End: Original strand, 30710583 - 30710626
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  30710583 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttatta 30710626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 179
Target Start/End: Original strand, 45710783 - 45710822
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatattt 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45710783 ctcaaaataattgtcactttataataccaatacaatattt 45710822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Original strand, 7757599 - 7757661
Alignment:
Q  278 taattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  7757599 taattttatcattgaaatcaacacaattaatcttttccttaacaaacgtgcataaaccctaaa 7757661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 24569276 - 24569246
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24569276 tcaaaataattgtcactttacaataccaatg 24569246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 256
Target Start/End: Original strand, 26467108 - 26467161
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca--ctaactacaattaataa 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  26467108 ttatttattgaatttcatctaacttaactacttcattataactacaattaataa 26467161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 51064861 - 51064799
Alignment:
Q  278 taattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  51064861 taattttaccattgaaagcaacacaattaatcatttttttaatattcgtgcataaactttaaa 51064799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 490 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 27907229 - 27907189
Alignment:
Q  490 atctaacgaacaacatttctctgttttaatttcactacttt 530  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27907229 atctaatgagcaacatttctctgttttaatttcattacttt 27907189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 41380670 - 41380614
Alignment:
Q  1 aaggccgcaattaagacgactaggggcgggccacaataaaagtggaagttccaacag 57  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||| |||||||||    
T  41380670 aaggtcgcaattaaggcgactaggggcgggccgcaattaaggcggaatttccaacag 41380614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 54225928 - 54225884
Alignment:
Q  229 taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  54225928 taaccactccactaactataattaataaggctgttttagtaaatg 54225884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 8e-66; HSPs: 86)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 39864045 - 39864245
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39864045 ctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 39864144  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39864145 ctaactacaattaataagagtattttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaactttaa 39864244  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  39864245 a 39864245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 92 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24991886 - 24991637
Alignment:
Q  92 tactccattcgtctcacaattattgtttctttagcannnnnnnnnnnnctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||       |    
T  24991886 tactccatccgtctcacaattattgtctctttagcattttttttccttctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattatttttttc 24991787  T
Q  192 c-actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||  ||    
T  24991786 ccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactattccactaactacaattaataaaggtgttgtagtaaatactattaattttaccgtt 24991687  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  24991686 gaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgtacaaaccttaaa 24991637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 12039016 - 12039216
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  12039016 ctcaaaataattgtcactttacaatactaatgcaacatttattattattttccactattatacccttatttattgaattacatccaacttaaatactcca 12039115  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
     ||||||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12039116 ttaactacaattaataagagtgtattagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaa 12039215  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  12039216 a 12039216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23169175 - 23168977
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |  |    
T  23169175 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattactttt--ccactattatactcttatttattgaatttcacctcacttaactatttaa 23169078  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  23169077 ctaactataattaataaggatgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaattattttcttaataatcgtgcacaaactttaa 23168978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 9307612 - 9307761
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  9307612 ccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaacaagggtgttttagtaaatgctattaattttatcatt 9307711  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  9307712 gaaatcaacacagttaatcatttccttaataatcgtgtacaaaccttaaa 9307761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 141 - 333
Target Start/End: Original strand, 7759150 - 7759342
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  7759150 tcaaaataattgtcactttacaataataatgcatcatttattatttttttccattattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactattccac 7759249  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaa 333  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7759250 taactacaattaataagagtattttagtaaatgatattaatttcaccattgaaatcaacacaattaattatttttttaataatcgtgcataaa 7759342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Original strand, 28748926 - 28749125
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||       |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| | || ||    
T  28748926 tcaaaataattatcactttataatagcaatgcagcatttattattttttcccactattatacccttatttataaaatttcatccaacttaacaattctac 28749025  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28749026 taattacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaatcttaaa 28749125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 141 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40145030 - 40144849
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||       ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||     
T  40145030 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccat 40144931  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataa 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  40144930 taactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataa 40144849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 49224170 - 49223970
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||        || ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  49224170 ctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattattttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcca 49224071  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| || |||||    
T  49224070 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttagtaaccgtgcatcaatcttaa 49223971  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  49223970 a 49223970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 275
Target Start/End: Original strand, 35367736 - 35367871
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35367736 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgaaacatttattagtctttttcactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcca 35367835  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgct 275  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35367836 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgct 35367871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13579801 - 13579605
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||         | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13579801 aaaataattgtcactttaaaataccgatgcaatatttattattattttt-attattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaaatactccacta 13579703  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| ||   ||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  13579702 actacaattaatatgggtgtttttgtaaatgatattaatattgtcatcaaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcatgcataaaccttaaa 13579605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 37506058 - 37506261
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||       ||| ||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37506058 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatttttttccattataatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactcca 37506157  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatg---ctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacct 336  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||    || ||||||||  ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37506158 ctaactacaattaataaaagtgttttagtaaatgatagtactaattttatcatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgcatcaacct 37506257  T
Q  337 taaa 340  Q
    ||||    
T  37506258 taaa 37506261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16395229 - 16395031
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||       | | |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16395229 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgtaggatttattatttttttc-attattatatcattatttattgaatttcatctaacttaactactcca 16395131  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16395130 ctaactacaattaaaaa-ggtattttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataaaccttaa 16395032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 26093328 - 26093528
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| |||| || ||||||||       ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  26093328 ctcaaaacaattgtcactttagtatactaatgtaacatttattatatttttccattattatacccttatttattgaacttcatctaacttaattacttca 26093427  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  26093428 ctaactacaattaataaggatattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaatcttaa 26093527  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  26093528 a 26093528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20210024 - 20209842
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20210024 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcca 20209925  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataa 322  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  20209924 ctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttactatcaaaatcaacataattaatcattttcttaataa 20209842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33733446 - 33733247
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||| |    
T  33733446 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgaagcatttattattcttttccattattatacccttatttattgaatttcattctacctaaccactcta 33733347  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  33733346 ctaactacaattaataaaagtattttagtaaatgttaataattttaccattgaaatcaacacaa-taatcatttccttaataatcgtgcacaaactttaa 33733248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 333
Target Start/End: Original strand, 37276450 - 37276588
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||| ||  |||    
T  37276450 tattatacccttatttattgaatttcatccaatttaactattccactaactacaattaataagggtgttttagtaaacgatactaattttaccatcaaaa 37276549  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaa 333  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37276550 tcaacacagttaatcatttccttaataatcgtgcataaa 37276588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6023782 - 6023633
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||    
T  6023782 ccactattatactctcatgtattgaatttcatccaacttaactactccaataactacaattaataaaggtattttagtaaaagctactaaatttaccatt 6023683  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||| ||| |||| |||||    
T  6023682 gaaatcaacacaattaaacatttccgtaataatcgcgcacaaacattaaa 6023633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Original strand, 6785190 - 6785304
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785190 ctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcaacatttattatttttttccactattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 6785289  T
Q  240 ctaactacaattaat 254  Q
    |||||||||||||||    
T  6785290 ctaactacaattaat 6785304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34031656 - 34031511
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  34031656 tattatactcttatttattgaatttcattcaaccttactattacactaactacaattaataacggtattttagtaaatgatattaattttaccattggaa 34031557  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34031556 tcaacacaagtaatcatttccttaataatcatgcacaaaccttaaa 34031511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 319
Target Start/End: Original strand, 36701910 - 36702034
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  36701910 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacgattccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattgaaa 36702009  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaa 319  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||    
T  36702010 tcaacataattaatcatttccttaa 36702034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 319
Target Start/End: Original strand, 36718014 - 36718138
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  36718014 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacgattccactaactacaattaataagggcattttagtaaatgatactaattttaccattgaaa 36718113  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaa 319  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||    
T  36718114 tcaacataattaatcatttccttaa 36718138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 31042731 - 31042931
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||       ||||||| |||   ||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||    
T  31042731 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatacatcatttattatttttttccactatgatatctttatttattgaatttcattcaacttaattacttca 31042830  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31042831 ctacctacaattaataagggtattacagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcatgcacaaaccttaa 31042930  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  31042931 a 31042931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 199 - 340
Target Start/End: Original strand, 15699115 - 15699257
Alignment:
Q  199 atactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaa 298  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||    
T  15699115 atacccttatttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaa 15699214  T
Q  299 cacaattaatta-tttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  15699215 cacaattaatcatttttcttaataactgtgcatcaaccttaaa 15699257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30755070 - 30754925
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||  || |||    
T  30755070 tattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactatttcactaactataattaataatgatattttagtaaataatataaattttacccttaaaa 30754971  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30754970 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaatcttaaa 30754925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 38787330 - 38787475
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| | ||||| || || |||||| ||  |||    
T  38787330 tattatacccttatttattgaatttcatccaatttaactactccactaactataattaataaggatgttttggcaaatgatactagttttaccatcaaaa 38787429  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38787430 tcaacacaatcaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 38787475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 14757777 - 14757609
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |       |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  14757777 ctcaaaataattgtc-ctttacaatacaaatgcagaatttataatttttttccactattatacccttatttattaaatttcatcgaacttaactacttca 14757679  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaatt 309  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  14757678 ctaactacaattaataagagtgttttagtaaatgttactaattttatcgttgaaatcaacacaattaatt 14757609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44707917 - 44707744
Alignment:
Q  167 caatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgtttta 266  Q
    |||||||||||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  44707917 caatgcaatatttattatttgtttccactattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactgcttcactaactacaattaataaatgtgtttta 44707818  T
Q  267 gtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||| ||| ||||||||  |||||||| || | ||||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||||    
T  44707817 gtaaatactactaattttatcattgaaatcaatataattaatcatttctataataatcgtgcaaaaactttaaa 44707744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 52429279 - 52429478
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccac--tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||        | |  |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52429279 aaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttattattttttttctcattattatacccttatttaatgaatttcattcaacttaactactccac 52429378  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||| ||||| || | ||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52429379 taactacaattaataagggtattttaataaatgacattaaatttaccatcgtaatcaaccaaattaatcatttccttcataatcgtgcacaaaccttaaa 52429478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 917013 - 917158
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  917013 tattttacccttatttattaaatttcatgcaacttaactaatctactaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatttaaa 917112  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  917113 tcaacataattaatcatttatttaataatcgtgcacaaaccttaaa 917158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 2572405 - 2572602
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatt-annnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |       ||| ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2572405 aaaacaattgccactttaaaatatcaatgcaatatttatttatttttttccattattatatttttatttattgaatttcattcaacttaactactccact 2572504  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||   ||||||||||| || |||| |||||    
T  2572505 aactacaattaataattgt-atttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaatacaattaatcattattttaataatcgtacacaaactttaaa 2572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 45331276 - 45331475
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacta---ctcca 239  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| |||  ||| || |||||||||| |||||| ||||||||||   |||||    
T  45331276 aaaataattgttactttaaaataccaatgcaacatttattatttttt-ccattatattaccctaatttattgaacttcatccaacttaactattcctcca 45331374  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||    
T  45331375 ttaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacataattaattattttcttaataaccgtgcgtcaaccttaa 45331474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21910133 - 21909990
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||| |||||||||| ||| | || ||||||||| ||  |||    
T  21910133 tattatac-cttatttattgaattccatcaaacttaactactcctcaaactatagttaataa-ggtgttttagcaaacgatactaattttaccatcaaaa 21910036  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21910035 tcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcataaaccttaaa 21909990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32826171 - 32825976
Alignment:
Q  146 ataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc---acta 242  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||       ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||    
T  32826171 ataattgtcactttgaaataccaatacaacatttattatttttt-ccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcctccacta 32826073  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32826072 attacaattaataaaggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacac-attaatcatttccttaataaccgtgcatcaaccttaaa 32825976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 8896460 - 8896337
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaat 295  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8896460 attatacctttatttattgaatttcatccaacttaaccactccactaactacaattaataaatatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaat 8896361  T
Q  296 gaacacaattaattatttccttaa 319  Q
     |||||||| ||| |||| |||||    
T  8896360 caacacaatcaatcattttcttaa 8896337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 10495838 - 10495972
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||| |||    
T  10495838 ttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaattacaattaataa-agtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacaaaat 10495936  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  10495937 taataatttttttaataatcttacataaaccttaaa 10495972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 11449875 - 11450017
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  11449875 tattatac-cttatttattgaatttcatccaattttactactctattaactacaattaataaatgtgttatagaaaat--tattaattttaccattgaaa 11449971  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11449972 tcaacataattaaccatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 11450017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 192 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22856369 - 22856267
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  22856369 cactattatacttttatttattgaatttcatccagcttaactactccactaactacaattaattagggtattttagtaaatggtattaattttatgattg 22856270  T
Q  292 aaa 294  Q
    |||    
T  22856269 aaa 22856267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31978832 - 31978636
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||        ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||     
T  31978832 tcaaaataattgttactttacaataccaatgtagtatttttt---ttttcccattattatacccttatttaatgaatttaattcaacttaactactccat 31978736  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||| |||||||||   |  |||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  31978735 taactataattaataagaatagtttagtaagtgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatctttttcttaataatcgtgcacaaactttaaa 31978636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 338
Target Start/End: Original strand, 24880874 - 24881008
Alignment:
Q  207 atttattgaatttcatcaaactta---actactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  24880874 atttattgaatttcatccaacttactaactactccactaactacaattaataaaagtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacataa 24880973  T
Q  304 ttaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    | ||| |||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  24880974 tcaatcatttccgtaataattatgcacaaacctta 24881008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4441732 - 4441605
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||| ||| |||    
T  4441732 tattatacctttatttattaaatttcatctaatttaattactccactaactacaattaacaagggtgttttagtaaagacgattaattttaccattaaaa 4441633  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataa 322  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||    
T  4441632 tcaccacaattaattattttcttaataa 4441605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 42409993 - 42410128
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  42409993 ttatttattgaacttcatcctacttaactatccaactaactacaattaataagggtgctttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaat 42410092  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  42410093 taatcatttttttaataaccgtgcatcaaccttaaa 42410128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Original strand, 9379169 - 9379358
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc-act 241  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||        ||| ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  9379169 aaaataattgtcattttagaatatcaatgcaatatttatt-tatttttccattattatacctatatttattaaatttcatcaaacttaactactcccact 9379267  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataa 332  Q
    |||||||||||||||   | ||||| |||||| |||||||||||  ||| |||| |  ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  9379268 aactacaattaataaatatattttaataaatgatattaattttatcattaaaatcattacaattaatcatttctttaaaaattgtgcataa 9379358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 195 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6160588 - 6160457
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  || ||||||||  |||||||    
T  6160588 tattatacccttgtttattgaattacattcaacttaactattccattaactacaattaataagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaa 6160489  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgt 326  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  6160488 tcaacacaattaatcattttcttaaaaatcgt 6160457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 241 - 332
Target Start/End: Original strand, 22181371 - 22181462
Alignment:
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataa 332  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22181371 taactacaataactaagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatgaactcaactaatcatttccttaataaccgtgcataa 22181462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 267
Target Start/End: Original strand, 4659711 - 4659837
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||        |||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  4659711 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatt-atttattttttccactattatatccttatttattgaatttcattcaacttaattactcca 4659809  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttag 267  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||    
T  4659810 ctaactatcattaatgatggtattttag 4659837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 191 - 273
Target Start/End: Original strand, 37539112 - 37539194
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  37539112 ccactatgatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactactctactaactacaattaacaagagtgttgtagtaaatg 37539194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44761660 - 44761542
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||  ||| |||    
T  44761660 tattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaccattccactaactataattaataaagatattttagtaaatgatattaattttatcattaaaa 44761561  T
Q  295 tgaacacaattaattattt 313  Q
    | |||| ||||||| ||||    
T  44761560 ttaacataattaatcattt 44761542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41122007 - 41121806
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttat---ttattgaatttcatcaaacttaactact 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||        || |||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||     |||    
T  41122007 ctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatacaacatttattattttttttcattattatacccttataatttattaaatttcatcaaact-----act 41121913  T
Q  237 ccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttcc---ttaataatcgtgcataaa 333  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |  ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||   |||||||  |||||||||    
T  41121912 ccactaactacaattaataagggtattttagtaaattatgctaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcctaattaataaatgtgcataaa 41121813  T
Q  334 ccttaaa 340  Q
    |||||||    
T  41121812 ccttaaa 41121806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 256
Target Start/End: Original strand, 3260529 - 3260641
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||       | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3260529 aaaataattatcactttagaatactaatacaatatttattatttgtt-ctactattataaacttatttattcaatttcatcaaacttaacttctccacta 3260627  T
Q  243 actacaattaataa 256  Q
    ||||||||||||||    
T  3260628 actacaattaataa 3260641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25089212 - 25089137
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatgg-tgttttagtaaat 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  25089212 tatacccttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactacaattaataaaggatgttttagtaaat 25089137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 308
Target Start/End: Original strand, 27721470 - 27721634
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||| || ||||    
T  27721470 aaaataattgccactttacaatacaaatgcatcatttattatttttt-ccactattatacttttatttattgaattttatccaatttaactattctacta 27721568  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaat 308  Q
    ||||||||||||| ||||  |||| |||||   | ||||||||| ||| |||| |||||| |||||    
T  27721569 actacaattaatattggtactttaataaataaaaataattttaccattaaaatcaacacatttaat 27721634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 305
Target Start/End: Original strand, 7351625 - 7351735
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||| || ||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||  |||||||||||  ||| |||    
T  7351625 tattatactcttatttattgaattttgtccaacttaattattccactaactagaattaataaggttattttagtaaataatattaattttatcattaaaa 7351724  T
Q  295 tgaacacaatt 305  Q
    | |||||||||    
T  7351725 tcaacacaatt 7351735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 35682977 - 35682879
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35682977 ctcaaaataattgccaatttagaatatcaatgcaatatttattatttttt-ccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 35682879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26256272 - 26256159
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||||||       ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  26256272 ctcaaaataattgccactttataataccaatgtatcatttattaattctttccactattatattcttctttattgactttcatccaacttaactactcta 26256173  T
Q  240 ctaactacaattaa 253  Q
     |||||||||||||    
T  26256172 ttaactacaattaa 26256159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29778529 - 29778425
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||    
T  29778529 ccactattatattattatttattgaattttatccaacttaggttcttaactaactacaattaataatgatattttagtaaatgatactaattttaccatt 29778430  T
Q  291 gaaat 295  Q
    |||||    
T  29778429 gaaat 29778425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5179526 - 5179383
Alignment:
Q  197 ttatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatg 296  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| || | ||||| | ||||||||     
T  5179526 ttatactcttatttcctgaatttcatccaatttatctactccactaactacaattaatatgaaaactttagtaaatgatactcattttgctattgaaatc 5179427  T
Q  297 aacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||| | ||||||||||    
T  5179426 aacacaattaatcattttgttaagaatcgtgtacaaaccttaaa 5179383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 12151195 - 12151310
Alignment:
Q  225 aacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |   | |||||||||||| || ||||||||  |||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  12151195 aacttaactgctccactaactacaattaattacaatattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacataattaataatctccttaataatc 12151294  T
Q  325 gtgcataaaccttaaa 340  Q
     | || ||||||||||    
T  12151295 atacacaaaccttaaa 12151310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32970683 - 32970565
Alignment:
Q  208 tttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaa 307  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || |  |||||| ||||||||||   || |||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  32970683 tttattgaattttatccaacttaattattttactaacaacaattaatacgagtattttagtaaataatattaattttatcattgaaatcaacacaattaa 32970584  T
Q  308 ttatttccttaataatcgt 326  Q
    | |||| ||||||||||||    
T  32970583 tcattttcttaataatcgt 32970565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 260 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43500848 - 43500768
Alignment:
Q  260 tgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43500848 tgttttagtaaatgaaactaattataccatcaaaatcaacacaattaataatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 43500768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 39887769 - 39887885
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc-cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||       | |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  39887769 tcaaaataattgtcactttaaaatattagtgcaatatttgttatttttttctcactgttatacatttatttattgaatttcatcaaacttaattactcaa 39887868  T
Q  240 ctaactacaattaataa 256  Q
    |||||||| ||||||||    
T  39887869 ctaactactattaataa 39887885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 339
Target Start/End: Original strand, 41080586 - 41080731
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| |||||||||||| | | ||| | |||||| ||| |||||||| |||     
T  41080586 cactatcatacctttatttattgaatt-catccaacttacct-ctccactaattacaattaataaagatatttcaataaatgatataaattttactatta 41080683  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||| | || ||||||||||||||    
T  41080684 aaatcaacacaattaatcatttttttaaaattcatgcataaaccttaa 41080731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 313
Target Start/End: Original strand, 29074885 - 29074991
Alignment:
Q  207 atttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaatta 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| | |  |||| ||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||| ||    
T  29074885 atttattgaatttcatccaacttaactattacgttaacaacaattaatatggatgttttaataaatgatattaattttaccattaaaatcaacacaacta 29074984  T
Q  307 attattt 313  Q
    || ||||    
T  29074985 atcattt 29074991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 32219777 - 32219699
Alignment:
Q  208 tttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttac 286  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||    
T  32219777 tttattgaatttcatccaacttaaccactccacaaactataattaataagagtattttaataaatgatattaattttac 32219699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 26258070 - 26257945
Alignment:
Q  194 ctattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaa 293  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||| || || |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| || | ||||| | ||||||    
T  26258070 ctattatacccttatttactggttttcatccaacttaattattctactaaccacgattaataaaggtattttagtaaatgataatcattttgctattgaa 26257971  T
Q  294 atgaacacaattaattatttccttaa 319  Q
    || || ||||||||| ||||| ||||    
T  26257970 atcaatacaattaatcatttctttaa 26257945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 27896942 - 27897083
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||   | ||||  |||||  || ||||||||  ||| |    
T  27896942 actattatacctttatttattaaatttcatccaactaaattactccactaactataattaataagaatattttgataaattatactaattttatcattaa 27897041  T
Q  293 aatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaac 334  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  27897042 aatcaacacgtttaattatttccttaaaaatcatgcacaaac 27897083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Original strand, 37177822 - 37177886
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  37177822 cactattatactcttatttatttaattttatccaacttaactactatactaactaccattaataa 37177886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 341
Target Start/End: Original strand, 27687298 - 27687376
Alignment:
Q  263 tttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaaa 341  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27687298 tttagtaaataatattaattttaccattgaaatcaacacaactaatcatttttttaataattgtgcacaaaccttaaaa 27687376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 6365645 - 6365738
Alignment:
Q  220 catcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattattt 313  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||  || |||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  6365645 catcaaacttaactaattcactaactacaattaacaatgatattttaataaataatactaatttgattattgaaatcaacacaattaatcattt 6365738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 313
Target Start/End: Original strand, 31154120 - 31154235
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatga 297  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||  |   ||||||| ||  || ||||||||  ||| |||| |    
T  31154120 tatacacttatttactgaatttcatcaaacttaagcactctaccaactacaattaataaatgcaatttagtagataatactaattttatcattaaaatca 31154219  T
Q  298 acacaattaattattt 313  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31154220 acacaattaatcattt 31154235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 213
Target Start/End: Original strand, 3312056 - 3312126
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttatt 213  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||    
T  3312056 aaaataattgtcactttataatatcaatacaacatttattattatattccactattatactcttatttatt 3312126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17988929 - 17988823
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||       |||||||||||||| ||||||||   || |||| || ||||||||||||    
T  17988929 ctcaaaataattgtcattttaaaatattaatgcaacatttattatttctttccactattatactcatatttattttgttacatccaaattaactactcca 17988830  T
Q  240 ctaacta 246  Q
     ||||||    
T  17988829 ttaacta 17988823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35367691 - 35367635
Alignment:
Q  278 taattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaac 334  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35367691 taattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataaac 35367635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44426836 - 44426746
Alignment:
Q  226 acttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg---ctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattattt 313  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||   |||  |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  44426836 acttaattgctccactaattacaattaataaagatgttttagtaaatgatactacaaattttaccattgaaatcaactcaactaattattt 44426746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2137488 - 2137437
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  2137488 ttatttattgaattttatccaacttaaatactccaataacaacaattaataa 2137437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9412982 - 9412873
Alignment:
Q  144 aaataattgtcactttacaataccaatgcaatattta-ttannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||        ||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||    
T  9412982 aaataattgtcactttacaatactaatgcaaaatttatttatttattttcactat--tacaattatttattgaatttcatccaacccaactattccatta 9412885  T
Q  243 actacaattaat 254  Q
    ||||||||||||    
T  9412884 actacaattaat 9412873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 340
Target Start/End: Original strand, 35538678 - 35538777
Alignment:
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||  |||  ||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||  ||||| ||||||    
T  35538678 taactacaattaataaggatattttagtaaataatatccattttatcattgaaatcaacacaattaataattttcttaaaaattgtaaataaatcttaaa 35538777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 286
Target Start/End: Original strand, 52837269 - 52837360
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttac 286  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||  ||  |||||||||||    
T  52837269 tattatacctttaattattgaatttcattcatattaactactccactagctacaattaataagagtattttagtagttgaaattaattttac 52837360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 256
Target Start/End: Original strand, 15904751 - 15904801
Alignment:
Q  206 tatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15904751 tatttattgaatttcacttcacttaactacttcactaactacaattaataa 15904801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13366041 - 13366000
Alignment:
Q  232 ctactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  13366041 ctactccactaactactattaataagggtattttagtaaatg 13366000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 17988654 - 17988574
Alignment:
Q  230 aactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctat--taattttacaattgaaatgaacacaattaat 308  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||||  |||  ||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  17988654 aactacttcattaactacaattaataagagtattttagtaaataatatactaattttaacattgaaatcaacacaattaat 17988574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 340
Target Start/End: Original strand, 4659839 - 4659891
Alignment:
Q  288 attgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||| ||||    
T  4659839 attgaaatcaacacaattaatcattttcttaatattcatgcataaaccctaaa 4659891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 314
Target Start/End: Original strand, 13413316 - 13413396
Alignment:
Q  234 actccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttc 314  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |   ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  13413316 actccactagctataattaatcaaaatgttttaataaattatattaattttataattgaaatcatctcaattaattatttc 13413396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24500110 - 24500058
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaac 244  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24500110 cactattacaccattatttgttgaatttcatctaacttaactactcaactaac 24500058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Original strand, 35538644 - 35538684
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactac 235  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35538644 tattataatattatttattgaatttcatctaacttaactac 35538684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 321
Target Start/End: Original strand, 49176940 - 49177032
Alignment:
Q  229 taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaata 321  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||  || ||||||||||||  |   |||||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  49176940 taactactctattaactataattaataagagtattttagtaaatgacacatattttacctttgaaatcaacattattaattatttccttaata 49177032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 140 - 330
Target Start/End: Original strand, 35313821 - 35314011
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35313821 ctcaaaataattgtcactttacaataataatgcaacatttattacttttttccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 35313920  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcat 330  Q
    ||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35313921 ctaactacaattaataaggttgctttaataaatactactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcat 35314011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5789826 - 5789627
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  5789826 ctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatttttt-ccactattataccattatttattgaatttcatccaacttaactatttca 5789728  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5789727 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaa 5789628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 37322363 - 37322563
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37322363 ctcaaaataattgtcactttagaatacctatgtagcatttattatttttt-ccattattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactcca 37322461  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaatta-tttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37322462 ctaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcattttccttaataatcgtgcataaacctta 37322561  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  37322562 aa 37322563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 45235513 - 45235715
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc--cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||          || || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  45235513 ctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattatttttttcattactatatccttatttattgaatttcatcaaacttaactattt 45235612  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45235613 cattaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcatttccttaataatcgtgcacaaacctt 45235712  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  45235713 aaa 45235715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 43410363 - 43410560
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||       ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  43410363 aaaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttattatttttttccattattatactctcatttattgaatttcattcaacttaactactccatta 43410462  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43410463 actacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttatcattgatatcaacacaattaataatttccttaataatcgtgcacaaacattaaa 43410560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 14523551 - 14523351
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||       ||| |||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14523551 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattattattttccattattatatccttattaattgaatttcatctaacttaactactcca 14523452  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  14523451 ctaactacaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaaaaaatcatttccttaataaccttgcataaactttaa 14523352  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  14523351 a 14523351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 16463621 - 16463823
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn--ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||         ||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16463621 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattttaccattatttattaaatttcatcaaactttactactc 16463720  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16463721 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgcataaacctt 16463820  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  16463821 aaa 16463823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 17695262 - 17695464
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn--ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||         |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17695262 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattattttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 17695361  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
     |||||||| |||||||||   | |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17695362 tactaactataattaataagaatatttttgtaaatgatatcaattttaccattgaaatcaatacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaacctt 17695461  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  17695462 aaa 17695464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 25637414 - 25637614
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||        ||| ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  25637414 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattttttttccattattacacccttatttattaaatttcatccaacttaactactcc 25637513  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25637514 tataactacaattaataaaggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcctt-ataatcgtgcataaacctta 25637612  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  25637613 aa 25637614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8947232 - 8947031
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaa---taccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||       | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8947232 tcaaaataattgtcattttacaacaataccaatgcaatatttattatttttttc-attattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactc 8947134  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  8947133 cactaactataattaataaggatgttttagtaaatattactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataattatgcacaaacttt 8947034  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  8947033 aaa 8947031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36354621 - 36354422
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36354621 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagaatttattatttttt-ccattattataccattatttattgaatttcatccaacttaactactcca 36354523  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||  |||||| | |||||  || ||||||||| ||  |||| ||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36354522 ctaactacaattaataagagtgtttcaataaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaactagtcatttccttaataatcgtacataaaccttaa 36354423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 39691479 - 39691624
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  39691479 tattatacccttatttattgaatttcattcaactttactactccactaactgcaattaataagagtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaa 39691578  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39691579 tcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 39691624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34120616 - 34120418
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34120616 ctcaaaataattgtcactttaaaataccaatgcagcatttattatttttttccattattatactcttacttattgaatttcatccaacttaactattcca 34120517  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||   | |||||||||||  || || |||||| ||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  34120516 ctaactacaattaataa--atattttagtaaataatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcatgcataaactttaa 34120419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 39785519 - 39785722
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||       ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39785519 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttactattttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcca 39785618  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatg---ctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacct 336  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||    || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39785619 ttaactacaattaataagagtgttttagtaaatgatagtactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgcatcaacct 39785718  T
Q  337 taaa 340  Q
    ||||    
T  39785719 taaa 39785722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15359268 - 15359066
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc--cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||          || ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15359268 ctcaaaataattgttactttagaatatcaatgcagtatttattagtatttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactc 15359169  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||| |||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||    
T  15359168 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatattaattttatcatcaaaatcaacacaattaatcatcttcttaataaccgtgcatcaacctt 15359069  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  15359068 aaa 15359066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 34225527 - 34225724
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||        || |||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  34225527 aaaataattgtcactttggaataccaatgcagtatttattattttttttcattattatacccttatttattaaatttcattcaacttaaatactccatta 34225626  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| ||||| ||| |||| || | ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34225627 actacaattaataagggtgttttagtaaataatactaagtttaccattaaaatcaatataattattcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 34225724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16377787 - 16377635
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaa----ctactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttaca 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| ||||||||||||     
T  16377787 cactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaattaactactccactaactacaattaataaggttattttggtaaatgatattaattttacc 16377688  T
Q  288 attgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  16377687 attgtaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaatcttaaa 16377635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 36794218 - 36794418
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||        || ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36794218 ctcaaaataattatcactttaaaataccaatgcagcatttattattttttttcattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcca 36794317  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||| | || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || |||||    
T  36794318 ctaactacagttaataagggcgttttagtaaaagatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccatgcatcaatcttaa 36794417  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  36794418 a 36794418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3323451 - 3323265
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3323451 ctcaaaataattctcactttacaataccaatgcagcatttattattttttcccactattacactcttacttattgaatttcatccaacttaactactcca 3323352  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||              |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||    
T  3323351 ctaactacaattaa--------------taaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttttataataatcgtgcacaaaccttaa 3323266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 340
Target Start/End: Original strand, 16805879 - 16806015
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    ||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  16805879 cttatctattaaatttaatccaacttaacaactccactaactacaattaataaggatattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaa 16805978  T
Q  304 ttaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16805979 ttaatcatttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 16806015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 340
Target Start/End: Original strand, 16845160 - 16845296
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    ||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||    
T  16845160 cttatctattaaatttaatccaacttaacaactccactaactacaattaataaggatattttagtaaatgatactaattttactattaaaatcaacacaa 16845259  T
Q  304 ttaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16845260 ttaatcatttctttaataatcgtgcacaaaccttaaa 16845296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 31448808 - 31448672
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||  |||| |||||||    
T  31448808 cttatttattgaatttcatccaacttaactatttcactaactgcaattagtaagggtgttttagtaaatgactctaattttaccatcaaaatcaacacaa 31448709  T
Q  304 ttaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31448708 ttaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 31448672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 35242461 - 35242278
Alignment:
Q  155 actttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaat 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35242461 actttagaataccaatgcaatatttattattagttttcactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaactactcaactaactacaattaat 35242362  T
Q  255 aatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||   | || ||||||||| |  ||||||||  ||| |||| |||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  35242361 aaatatattctagtaaatgattctaattttaacattaaaatcaacacaattaaacatctccttaaaaattgtgcataaatctta 35242278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9458444 - 9458268
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       ||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  9458444 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttt-ccattattatacccttatttattaaatttcatccaactttactactcca 9458346  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataa 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||      | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9458345 ctaactacaattaataagggtgttttaata-----cactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattattttcttaataa 9458268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 43115968 - 43115781
Alignment:
Q  153 tcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaatta 252  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||||       ||| ||||||||  |||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  43115968 tcactttacaatatcaatgtagcatttattatttttttccattattataccattattcgttgaatttcattcaacttaactactccactaactacaataa 43115869  T
Q  253 ataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||  || ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||    
T  43115868 ataagagtattttagtaaatgctactaactttatcattgaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgcgcacaaactttaaa 43115781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11742648 - 11742508
Alignment:
Q  199 atactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaa 298  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| | ||||| ||  |||| ||    
T  11742648 atacccttatttattgaacttcatcaaacttaactactccattaactacaattaataagggtgttttaataaataatattga-tttaccatcaaaatcaa 11742550  T
Q  299 cacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     ||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||    
T  11742549 tacaattaaaaaatttcttaataatcgtgcataaacgttaaa 11742508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39329777 - 39329652
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatga--acaca 302  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||||    
T  39329777 ttatttattgaatttcatccaatttaactactcca-taactacaattaataagagtgttttagtaaatgctattaattttatcattgaaatcaatacaca 39329679  T
Q  303 attaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||| || |||| ||||  |||||||||    
T  39329678 attgatcattttcttagaaatcgtgca 39329652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 340
Target Start/End: Original strand, 19937733 - 19937811
Alignment:
Q  262 ttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19937733 ttttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 19937811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 205 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17346476 - 17346356
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||| || | |||    
T  17346476 ttatttattgaatttcttccaacttaactactccactaactacaattaataaaaatattttaataaatgatattaattttacttttgaaatcaaaataat 17346377  T
Q  305 taattatttccttaataatcgt 326  Q
    ||| |||||| |||||||||||    
T  17346376 taa-tatttctttaataatcgt 17346356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 340
Target Start/End: Original strand, 32783404 - 32783498
Alignment:
Q  246 acaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  32783404 acaattaataaaggtgttttagtaaatgatattaattttactatcaaaataaacacaattaatcattttcttaataaccgtgcatcaaccttaaa 32783498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 32831289 - 32831203
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32831289 ttatttattgaatttcatctcatttaactactccaataactacaattaataaagatgttttagtaaatgatattaattttaccattg 32831203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 5272314 - 5272204
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  5272314 aaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattatttttc-ccattattatacccttatttattgaatttcatccaatttaattactccacta 5272216  T
Q  243 actacaattaat 254  Q
    ||||||||||||    
T  5272215 actacaattaat 5272204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26863539 - 26863405
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn---ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||          ||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  26863539 tcaaaataattgtcactttacaatatctatgtaaaatttattatatttcttttccactattatacatttatttaatgaatttcatccgacttaactactc 26863440  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  26863439 cactaactacaattaataaaagtgttttaataaat 26863405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28170710 - 28170567
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || || | |||||||||||||||| | |||  |||||||||| | |||||||||  |||    
T  28170710 cactattatactcttatttatagaatttcatccaatttaattattctattaactacaattaataaagctgtactagtaaatgcaactaattttacccttg 28170611  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacc 335  Q
    |||| |||| ||||||| ||||  | |||| ||||||| |||||    
T  28170610 aaatcaacataattaatcattttttaaatactcgtgcacaaacc 28170567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7495018 - 7494909
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc-cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||         || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7495018 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcc 7494919  T
Q  239 actaactaca 248  Q
     |||||||||    
T  7494918 gctaactaca 7494909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41221058 - 41220932
Alignment:
Q  207 atttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaatta 306  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||||| |||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41221058 atttattgaacttcatctgacttaactacttcattaactacaattaataaaaatattttaataaatgatactaattttataattgaaatcaacacaatta 41220959  T
Q  307 attatttccttaataatcgtgcataaa 333  Q
    || || |  |||| |||||| ||||||    
T  41220958 atcatgtttttaaaaatcgtacataaa 41220932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 192 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43699723 - 43699595
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||   | ||||||||   || ||||| |||||| || ||||||||| ||||    
T  43699723 cactattatacccttgtttattgaattttatccaacttaattactccacta---aaaattaataggtgtattttaataaatgatactaattttactattg 43699627  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataat 323  Q
    |||| |||||| ||||| |||| |||||||||    
T  43699626 aaatcaacacagttaatcattttcttaataat 43699595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 302
Target Start/End: Original strand, 43730603 - 43730709
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  43730603 actaatatacttttatttattgaatttcaccta-cttaactactctagtaactacaattaataa-ggt-ttttagtaaatgatattaattttaccattaa 43730699  T
Q  293 aatgaacaca 302  Q
    ||| ||||||    
T  43730700 aatcaacaca 43730709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18853316 - 18853190
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatt--ttacaattgaaatgaacac 301  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||| ||||||| ||  ||||  |||  |||||||| |||||    
T  18853316 cttatttattgaatttcatccaaattaattactctactaactacaactaataagagtattttggtaaatgata-caattaattatcattgaaatcaacac 18853218  T
Q  302 aattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18853217 aattaattatttccttaaagatcgtgca 18853190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 324
Target Start/End: Original strand, 28186148 - 28186331
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||       ||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||||      
T  28186148 ctcaaaataattgtcactttataatataaatgcagtattaattatatttttccactattatttttttatttattgaatttcattcaacttaactactctg 28186247  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    ||||||| ||| ||||| | | ||||| |||||| |  ||||||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  28186248 ctaactaaaatgaataaggatattttaataaatgattataattttaccattaatatcaaca-tattaattattttcttaaaaatc 28186331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 285
Target Start/End: Original strand, 19444083 - 19444225
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||        || |||||||| ||| ||||||||| || ||| | ||||||||||| ||||    
T  19444083 aaaataattgtcacttcaaaatatcaatgcaacatttattatttttttacattattatacccttgtttattgaaatttatccatcttaactactcgacta 19444182  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    | |||||||||||||    |||||||||||  |||||||||||    
T  19444183 attacaattaataataacattttagtaaataatattaatttta 19444225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Original strand, 19937374 - 19937435
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19937374 tattatacctttatttattgaattttattcaacttaactactccactaactacaattaataa 19937435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26608008 - 26607947
Alignment:
Q  279 aattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26608008 aattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 26607947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 26608267 - 26608178
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttt 284  Q
    |||||||| |||||||| | | ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||||||    
T  26608267 tattatacccttatttaattattttcattcaacttaactaatccactaactataattaataagagtattttagtaaatgatattaatttt 26608178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 7438980 - 7438917
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaat 254  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  7438980 ccactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactactccaataattataattaat 7438917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 258
Target Start/End: Original strand, 17122973 - 17123036
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatg 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17122973 tattatactcttatttattgaatttcatctaatctaacaactcaactaattacaattaataatg 17123036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 314
Target Start/End: Original strand, 19426474 - 19426564
Alignment:
Q  225 aacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg-aaatgaacacaattaattatttc 314  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  19426474 aacttaactactcgacttactacaattaataatgatattttagtaaatgttgctaattttatcattgaaaatcaacacaattaatcatttc 19426564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 322
Target Start/End: Original strand, 31976370 - 31976464
Alignment:
Q  228 ttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataa 322  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||  |   ||||||| |||||||| ||||| | |||| |||||||||||||    
T  31976370 ttaactactccactaactataattattaagagtgttttagtaaatgaaacatattttactattgaaatcaacactactaatcatttccttaataa 31976464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5272212 - 5272172
Alignment:
Q  300 acaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5272212 acaattaattatttccttaataatcgtgcgtaaaccttaaa 5272172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 287
Target Start/End: Original strand, 3601416 - 3601465
Alignment:
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttaca 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||    
T  3601416 cactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgcaactatttttaca 3601465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 329
Target Start/End: Original strand, 11367121 - 11367202
Alignment:
Q  248 aattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | |||| ||||| ||||    
T  11367121 aattaataaaggtatttaagtaaatgacattaattttacaattaaaatcaacacaattaatcatcttcttactaatcttgca 11367202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1206781 - 1206709
Alignment:
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattattt 313  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||||| ||||    
T  1206781 taactacaattaataaggatattttagtaaatgttactaattttaccactgaaatcaacataattaatcattt 1206709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1206815 - 1206775
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactac 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1206815 tattatactcatatttattgaatttcatccaacttaactac 1206775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 253
Target Start/End: Original strand, 18202104 - 18202152
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaa 253  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18202104 ttatttattaaatttcatccaacttaactacttcactaactacatttaa 18202152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26337211 - 26337155
Alignment:
Q  229 taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  26337211 taactactccactaactataattaatagaggtgttttaataaatgatatcaatttta 26337155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Original strand, 45464009 - 45464057
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  45464009 actattatacttttatttattgaatttcatctaatttaactacttcact 45464057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12520894 - 12520827
Alignment:
Q  275 tattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaaac 342  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  12520894 tattaattttaccattaaaatcaacacaattaattattttattgataatcgtgcacaaatctttaaac 12520827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 25441642 - 25441587
Alignment:
Q  1 aaggccgcaattaagacgactaggggcgggccacaataaaagtggaagttccaaca 56  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||    
T  25441642 aaggccgcaatttaggcgactaggggcggaccgcaataaaggtggaatttccaaca 25441587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34120700 - 34120657
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  34120700 ctcaaaataattgtcactttaaaataccaatgcagcatttatta 34120657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 36173463 - 36173376
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| || |||| ||||  || ||||| |||||| |||||||||||    
T  36173463 actattatacttttatttattgaatttcattaaacttaa----tccactaattataatt-ataagagtattttaataaatgatattaatttta 36173376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 38187997 - 38187930
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    |||||||||||||||||    |||||  ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  38187997 ttatttattgaatttcacttcacttacatactcgactaactacaattaataggggtgttttagtaaat 38187930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 182
Target Start/End: Original strand, 8928547 - 8928585
Alignment:
Q  144 aaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatt 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8928547 aaataattgtcactttataataccaatgcagtatttatt 8928585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27501579 - 27501517
Alignment:
Q  278 taattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  27501579 taattttaccattgaaatcaacataatttatcatttccttaataatcatacacaaaccttaaa 27501517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Original strand, 30996347 - 30996419
Alignment:
Q  199 atactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  30996347 atactcttatttattgcatttcatttatct-aactactccagtaactataattaataagagtgtttttgtaaat 30996419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34451511 - 34451400
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |        ||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||    
T  34451511 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttaat---ttttcccagtattatgcctttatttattgaatttcatccaactaaactatttca 34451415  T
Q  240 ctaactacaattaat 254  Q
     |||||| |||||||    
T  34451414 ataactagaattaat 34451400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 329
Target Start/End: Original strand, 27866527 - 27866614
Alignment:
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| |||| | |||||||||||  ||| |||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||    
T  27866527 taactacaattaataaggatattttactaaa-gatattaattttatcattaaaatcaacattattaatcatttccttaaaaatcgtgca 27866614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 33407064 - 33407020
Alignment:
Q  229 taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  33407064 taactaatccactaactataattaataatggtgtttcggtaaatg 33407020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9300297 - 9300095
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncc--actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||  |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9300297 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagtatttattatttctttccccactattatatccttatttattgaatttcattcaacttaactactc 9300198  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9300197 cactaactaaaattaataagggtgttttagtaaatgctattaattttaccattaaaatcaacacaaacaatcattttcttaataatcgtgcataaacctt 9300098  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  9300097 aaa 9300095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21216330 - 21216083
Alignment:
Q  92 tactccattcgtctcacaattattgtttctttagcannnnnnnnnnnnctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatt-annnnnnn 190  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||            || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |           
T  21216330 tactccatttgtctcacaattattgtctctttagcattttttctttttctgaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttatttattttttt 21216231  T
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    | ||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  21216230 ctactattataccatt--ttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgcaactaattttaccatt 21216133  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21216132 gaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcatgcacaaaccttaaa 21216083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 140 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44761674 - 44761500
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||       |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44761674 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagcat--attagttttttccactattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactactcca 44761577  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttcct 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  44761576 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttcct 44761500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 13335151 - 13335350
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13335151 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatttttt-ccattattataccctgatttattgaatttcatcaaacttaactactcta 13335249  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| |||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13335250 ctaactgcaattaataaatgtgttttactaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaaccatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 13335349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 39482546 - 39482749
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattat---actcttatttattgaatttcatcaaacttaactact 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||   || |||||||||||||||||||   ||||||||| |    
T  39482546 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcagtatttattattttttcccactattattatacccttatttattgaatttcattccacttaactagt 39482645  T
Q  237 ccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacct 336  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  39482646 ccactaactataattaataagggtgttttagtaaattctactaattttacccttgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaatct 39482745  T
Q  337 taaa 340  Q
    ||||    
T  39482746 taaa 39482749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 45425848 - 45425648
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  45425848 tcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatacaacttaattactcca 45425749  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  45425748 ctaactacaattaataagaatgttttaataaatgttattaattttaccattaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcatgcataaaacttaa 45425649  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  45425648 a 45425648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11977115 - 11976918
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||       || |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11977115 aaaataattgtcattttacaatactaatgtagcatttattatttttttccgctattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactactctacta 11977016  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  11977015 actacaattaataagggtattttagtaaatgctactgattataccattgaaatcaacacaattaatgatttccataataatcatgcacaaaccttaaa 11976918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10180126 - 10179929
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       | | |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10180126 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattattttctattattatacacttattaattgaatttcattcaacttaactactccacta 10180027  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||  || ||||||||| |||||||| || |||| || | |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10180026 actacaattaataagtgtattttagtaaattatactaattttaccattgaaatcaatacaactactcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 10179929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22772017 - 22771817
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||        || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||    
T  22772017 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattacttttcattattatacccttatttattgaatttcatccaacataattacttca 22771918  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||| ||  |||| ||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  22771917 ctaactacaattaataagggtgttttaataaatgacactaattttaccatcaaaatcaacccaattaatcaattccttaataactgtgcataaaccttaa 22771818  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  22771817 a 22771817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34948867 - 34948669
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       | | | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34948867 ctcaaaataattgttactttagaataccaatgcaatatttattatttttttc-attgttatac-cttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 34948770  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  ||||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| |||||    
T  34948769 ctaactacaattaataaatgtgtttctgtaaatgatactaattttactatttaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgtacaaatcttaa 34948670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Original strand, 39405697 - 39405896
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||        ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  39405697 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattatttttcactattatacccttatttatttaatttcattcaacttaattactccac 39405796  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||  ||||||||| | | || ||||||||| || ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39405797 taactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 39405896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 337
Target Start/End: Original strand, 31231667 - 31231861
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||       ||| ||| |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  31231667 aaaataattgtcattttataataccaatgcatcatttattatttttttccattataatacccttatttattgaactttatccaacttaactactccacta 31231766  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||  ||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31231767 actacaattaataagggtgtttcagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcgacacaattcatcatttccttaataaccgtgcatcaacctt 31231861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 140 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 5053334 - 5053156
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||        ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||     
T  5053334 ctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcaacatttatt-tttttccccattattatactcttatttattgaatctcatccaatttaactactccg 5053236  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaa 319  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5053235 ctaactacaattaataagactgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaa 5053156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14855115 - 14854914
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn--ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||         ||||||||||||  || |||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  14855115 aaaataattgtcactttacaatattaatgcaatatttattatttttttttccactattataccattctttattgaatttcattcagcctaactactccac 14855016  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| | | |||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  14855015 taactacaattaataaaggtgttttagcaaatgcaattaattttaccattaaaatcaacacaatgattcattttcttgataatcgtgtacaaaccttaaa 14854916  T
Q  341 ac 342  Q
    ||    
T  14854915 ac 14854914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1875685 - 1875574
Alignment:
Q  229 taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgc 328  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1875685 taactatttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgc 1875586  T
Q  329 ataaaccttaaa 340  Q
    | ||||||||||    
T  1875585 acaaaccttaaa 1875574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26626294 - 26626094
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||   |||||||||    
T  26626294 ctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttattattttttcccattattatacccttatttattgaatttcattcaaccggactactcca 26626195  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| |||||  ||  |||||||| ||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26626194 ctaactacaattaataaggatattttaataaattatacaaattttaccatcaaattcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 26626095  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  26626094 a 26626094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 197 - 340
Target Start/End: Original strand, 32476278 - 32476421
Alignment:
Q  197 ttatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatg 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||     
T  32476278 ttatacccttatttattgaatttcatcaaacttaactacttcattaactacaattaataagggtattttaataaatgatattaattttatcattgaaatc 32476377  T
Q  297 aacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  32476378 aacagaatcaatcattttcttaataaccgtgcacaaaccttaaa 32476421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 7172899 - 7173048
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  7172899 ccactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaactacttcattaactacaattaataaatatgttttagtaaatgctactaattttatcatt 7172998  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||    
T  7172999 gaaatcaacacaattaatcatttctttaataatgatacacaaaccttaaa 7173048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40996483 - 40996347
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||| |  |||| |||||||    
T  40996483 cttatttattgaatttcatccaacttaaccatttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgaaactaattttacattcaaaatcaacacaa 40996384  T
Q  304 ttaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40996383 ttaatcatttccttaacaattgtgcataaaccttaaa 40996347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10098108 - 10097973
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||  |||| || |||||    
T  10098108 ttatttattgaacttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttatagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaatacaat 10098009  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  10098008 taatcattttcttaataaccatgcatcaaccttaaa 10097973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 144 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17719436 - 17719240
Alignment:
Q  144 aaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaa 243  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17719436 aaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactactccactaa 17719337  T
Q  244 ctacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||| ||||||||| | | |||||||||||  || ||| ||||| ||| |||| |  ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  17719336 ctataattaataaggatattttagtaaataatactaactttaccattaaaatcattacaattaatcatttttttaataatcgtgcacaaatcttaaa 17719240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34394137 - 34393936
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       ||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  34394137 aaaataattgtcactttaaaataccaatgcataatttattaactttttccattacaatactcttatttattgaactttatccaacttaactactccacta 34394038  T
Q  243 ----actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
        |||| ||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  34394037 gttaactataattaataaaggtgttttagtaaattatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataaccgtgcatcaacttta 34393938  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  34393937 aa 34393936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4428531 - 4428334
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  4428531 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgtaacaattattattttt--ccactattatacttttatttattgaatttcatctaacttaactaattca 4428434  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||  ||| |||| ||||||| |||| |||| ||||| |||  | ||||||||||||    
T  4428433 ctaactacaattaataattgtattttagtaaatgataataattttatcattaaaatcaacacaaataatcattttcttaaaaat-atacataaaccttaa 4428335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 198 - 340
Target Start/End: Original strand, 31271013 - 31271155
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatga 297  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||| |||||||||||| ||| |||| |    
T  31271013 tatacccttatttattgaattttatccaacttaactactccactaactataattaataagagtattttagtatatgatattaattttaccattaaaatca 31271112  T
Q  298 acacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  31271113 acacaatcaatcattttcttaataatcgtacacaaaccttaaa 31271155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 31082608 - 31082753
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||  ||| |||    
T  31082608 tattatacctttatttattaaatttcatccaacttaactactccactaactataattaataagggtgttttagtaaataccactaattttatcattaaaa 31082707  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  31082708 tcaagacaattaatcatttccttaattatcgtgcacaaaccataaa 31082753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 196 - 308
Target Start/End: Original strand, 42886990 - 42887102
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaat 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||||    
T  42886990 attatactcttatttattgaattttatccaacttaactacgccactaactacaattaataaaggtattttagtaaatgatactaattttgctattgaaat 42887089  T
Q  296 gaacacaattaat 308  Q
     ||||||||||||    
T  42887090 caacacaattaat 42887102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 17823856 - 17824054
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  17823856 ctcaaaataattgtcaatttataataacaatacaatatttattatttcct-ccactattatactattatttatttaatttcatccaacttaactacttca 17823954  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||| || ||||||| | || ||||||||  |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |||  | || |||||||||    
T  17823955 ctaactacaattaataaaggtattctagtaaaagatactaattttatcattgaaatcaacacgattaact-tttccttaaaaataatacacaaaccttaa 17824053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42972630 - 42972490
Alignment:
Q  203 tcttatttattgaatttcatcaaacttaactac---tccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaac 299  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||     
T  42972630 tcttgtttattgaatttcattcaacttaactacgtctccactaactataattaataagggtattttagtaaacgatattaattttaccattgaaatcaaa 42972531  T
Q  300 acaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42972530 acaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 42972490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 396790 - 396611
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||        || |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||  |||||||| || ||    
T  396790 aaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattatttttcattattatacccttattaattgaattttatccaatataactacttcatta 396691  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataa 322  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  396690 actacaattaataaggatattgtagtaaatgatactaattttaccgttgaaatcaacataattaatcatttccttaataa 396611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2767475 - 2767277
Alignment:
Q  144 aaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc------ 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||       ||| ||| |||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||          
T  2767475 aaataattgtcactttagaatactaatacaacatttattacttttttccaatataatacccttatttattgaacttaatccaacttaactactcatcctc 2767376  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacct 336  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||| |||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  2767375 cactaactacaaataataaggatgttttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaataaccgtgcatcaacct 2767277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 27294176 - 27294042
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||| | || ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  27294176 ttatttattgaatttcatccaacttaattactccactaactgcaattaataaatatattttagtaaaagatactaattttatcattcaaatgaacacaat 27294077  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  27294076 taataacttctttaaaaatcgtgcacaaaccttaa 27294042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 192 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36007017 - 36006897
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | | ||||||| |||  |||||||||||  |||     
T  36007017 cactattatgctcttatttattgaatttcatcaaacttaattaccccactaactacaattaatagggatattttagtcaataatattaattttatcatta 36006918  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatt 312  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  36006917 aaatcaacacaactaattatt 36006897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10953914 - 10953786
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        || |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10953914 ctcaaaataattgtcactttacgataccaatgcaacatttattattttt---cattattatacccttatatattgaatttgatctaacttaactactcca 10953818  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgc 274  Q
    |||   ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10953817 cta---acaattaataagggtgttttagtaaatgc 10953786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 140 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10961919 - 10961791
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||        || |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10961919 ctcaaaataattgtcactttacgataccaatgcaacatttattattttt---cattattatacccttatatattgaatttgatctaacttaactactcca 10961823  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgc 274  Q
    |||   ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10961822 cta---acaattaataagggtgttttagtaaatgc 10961791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29226708 - 29226578
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||       | | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29226708 tcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcagcatttattatatttttc-attattgtacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccac 29226610  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  29226609 taactacaattaataagagtgttttaataaat 29226578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Original strand, 32678392 - 32678470
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32678392 tattatattcttatttatttaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatg 32678470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 258 - 340
Target Start/End: Original strand, 36967413 - 36967495
Alignment:
Q  258 ggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36967413 ggtgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 36967495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Original strand, 40028501 - 40028623
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaacta----caattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40028501 tattatattcttgtttattgaatttcatctaacttaattacttcactaactaaatacaattaataatgatattttaataaatgctattaattttaccatt 40028600  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattattt 313  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||    
T  40028601 gaaatcaacataattaatcattt 40028623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7703230 - 7703154
Alignment:
Q  248 aattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7703230 aattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattaattatttccttaataatc 7703154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 340
Target Start/End: Original strand, 51132 - 51246
Alignment:
Q  225 aacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| || | |||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51132 aacttaattaatccactaactacaattaataaatgtgtttttgtaaatgatacttattttaca-ttaaaatcaacacaattaatcattttcttaataatc 51230  T
Q  325 gtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| ||||||||||    
T  51231 gtgcacaaaccttaaa 51246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 319
Target Start/End: Original strand, 31331419 - 31331521
Alignment:
Q  217 tttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttcct 316  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || |||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  31331419 tttcatccaacttaattacttcactaactacaattaataatgatattttagtaaataataataattttataattgaaatcaatacaattaatcatttcct 31331518  T
Q  317 taa 319  Q
    |||    
T  31331519 taa 31331521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 326
Target Start/End: Original strand, 41091981 - 41092114
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| || |   |||||||||||||||||  || ||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  41091981 cactattatacccttatttattgaattacat-aaacttaaatatttttctaactacaattaataagagtattttaataaatgatattaattttaccattg 41092079  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgt 326  Q
    |||| ||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  41092080 aaatcaacacaattaatcgtttctttaaaaatcgt 41092114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Original strand, 35732110 - 35732188
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||    
T  35732110 tattatactcttatatattgaatttcatctaactttactactccactaattacaattaataggagtattttagtaaatg 35732188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Original strand, 1739712 - 1739772
Alignment:
Q  278 taattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  1739712 taattttaccattgaaatcaacacaattaattatttccttaataatcgtacacaaacctta 1739772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1875916 - 1875831
Alignment:
Q  145 aataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaactta 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  1875916 aataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattacttttttccactagtatacccttatttattaaatttcataaaactta 1875831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 39301138 - 39300923
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||| |   |||||||       ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||    
T  39301138 ctcaaaataattgtcattttagaatatcaatgaatcgtttattattattttccattattatacttttatttattgaatttcattcaactgaactacttca 39301039  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtg---------------ttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    ||||||||||||||||| |||                |||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  39301038 ctaactacaattaataagggtacaattaattagggttttttagtaaatgatattaattttaccatcgaaatcaacataattaatcatttctttaataatc 39300939  T
Q  325 gtgcataaaccttaaa 340  Q
    || || ||| ||||||    
T  39300938 gtacacaaatcttaaa 39300923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 4924197 - 4924070
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||| | | |||||||||||  || ||||||||| |||     
T  4924197 cactaatatacccttatttattaagtttcattcaacttaactactctattaactacaattaataaagatattttagtaaataatactaattttaccatta 4924098  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaa 319  Q
    ||||  |||||| |||| |||| |||||    
T  4924097 aaatatacacaactaataattttcttaa 4924070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Original strand, 5356597 - 5356709
Alignment:
Q  203 tcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacaca 302  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||  ||   |||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  5356597 tcttttttattgaatttcatccaacttaattattccattaactacaattaataa-agtacattagtaaatgatattaattttatcattaaaatcaacaca 5356695  T
Q  303 attaattatttcct 316  Q
    | |||| |||||||    
T  5356696 actaatcatttcct 5356709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 39466219 - 39466074
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaactt-aactactcc 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||       | |||||||||  |||||||||||||||| ||| || || ||||||| |    
T  39466219 ctcaaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattatttttttc-actattatatccttatttattgaattttatccaattttaactactgc 39466121  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    |||||| || |||||||| | | |||||||||||| || ||||||||    
T  39466120 actaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaatttta 39466074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Original strand, 1739529 - 1739593
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1739529 cacttttatacccttatttattaaatttcatcaaaattaactacttaactaactacaattaataa 1739593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 341
Target Start/End: Original strand, 33765663 - 33765795
Alignment:
Q  209 ttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaat 308  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||  | ||| |||||||||||||||  || | |||||||||| || ||||||||  ||| |||| |||| |||||||    
T  33765663 ttattgaatttcacccaatttatctgattcaccaactacaattaataaaagtatattagtaaatgatagtaattttagtattaaaatcaacataattaat 33765762  T
Q  309 tatttccttaataatcgtgcataaaccttaaaa 341  Q
     |||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  33765763 catttccttaaaaattgtgcacaaaccttaaaa 33765795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34057731 - 34057627
Alignment:
Q  209 ttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaat 308  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| || | | |||||||||||  || || |||||  |||||||| |||| |||||||    
T  34057731 ttattgaatttcatccaacttaactatttcactaactacaaataacaacgatattttagtaaataatactagttttattattgaaatcaacataattaat 34057632  T
Q  309 tattt 313  Q
    |||||    
T  34057631 tattt 34057627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35505001 - 35504937
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || | ||||||||||||||||    
T  35505001 cactattatactcttatttattgaattttatcgaatttaactattctattaactacaattaataa 35504937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43719365 - 43719285
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  43719365 actattatacctttatttattgaatttcatccaacttaattattcaactaactataattaataatgttattttaataaatg 43719285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10953464 - 10953405
Alignment:
Q  266 agtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcg 325  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10953464 agtaaatgctattaattatatcattaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcg 10953405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10961469 - 10961410
Alignment:
Q  266 agtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcg 325  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10961469 agtaaatgctattaattatatcattaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcg 10961410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3117111 - 3117021
Alignment:
Q  229 taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaata 321  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||  |   ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  3117111 taactactccattaactataattaacaagggtgttttagtaaatg--acacattttaccattgaaatcaacactattaatcatttcgttaata 3117021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 135760 - 135716
Alignment:
Q  229 taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  135760 taactactccactaactataattaataatagtgttttagcaaatg 135716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 340
Target Start/End: Original strand, 32678804 - 32678852
Alignment:
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32678804 aaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgtataaactttaaa 32678852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 256
Target Start/End: Original strand, 12559562 - 12559613
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  12559562 ttatttatttaaattcatcaaacttgactagttcactaactacaattaataa 12559613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 40996543 - 40996501
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  40996543 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacattcatt 40996501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 44648621 - 44648559
Alignment:
Q  233 tactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaat 295  Q
    ||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  44648621 tactccactaattacaattagtaagtatgttttagtaaatgatactaattttaccattgaaat 44648559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6796423 - 6796394
Alignment:
Q  228 ttaactactccactaactacaattaataat 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6796423 ttaactactccactaactacaattaataat 6796394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29806375 - 29806330
Alignment:
Q  228 ttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  29806375 ttaactattccactaactacagttaataaaagtgttttagtaaatg 29806330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 173
Target Start/End: Original strand, 32476222 - 32476255
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgca 173  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32476222 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgca 32476255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 314
Target Start/End: Original strand, 12559649 - 12559701
Alignment:
Q  262 ttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttc 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  12559649 ttttagtaaatggtattaattttattattaaaatcaacacaattaatcatttc 12559701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Original strand, 15675373 - 15675413
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15675373 aaaataactgtcactttagaataccaatacaatatttatta 15675413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21649478 - 21649414
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagta 269  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||  ||||||||  || ||||||||    
T  21649478 ttatttattgaatttcattcaatttaactactcaactaactatgattaataaatgtattttagta 21649414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25285028 - 25284988
Alignment:
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctatta 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  25285028 actaactacaattaataagggtgttttagtatatgatatta 25284988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 27870856 - 27870932
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaact-taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | | || |||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  27870856 tatacccttatttattgcatttcaaccatctataactattctactaactacaattaataaggttgttttactaaatg 27870932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 283
Target Start/End: Original strand, 29566172 - 29566204
Alignment:
Q  251 taataatggtgttttagtaaatgctattaattt 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29566172 taataagggtgttttagtaaatgctattaattt 29566204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Original strand, 40109647 - 40109727
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttca 221  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||||||       |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  40109647 ctcaaaataattgtcattttagaatat-aatgcaacatttattatatttttccactaatatattcttatttattgaatttca 40109727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 88)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35311412 - 35311210
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn--ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||         ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35311412 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattattttttccaatattatacctttatttattgaatttcatccaacttaattactc 35311313  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35311312 cactaactacaattaataagagtgttctagtaaatgcaattaattttaccattgaaattaacataattaatcatttccttaataatcgtgcacaaacctt 35311213  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  35311212 aaa 35311210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35380521 - 35380326
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  35380521 ctcaaaataattgtcactttataataccaatgcaacatttattattttttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaaccactcc 35380422  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaac 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  35380421 actaactacaattaataatgatgttttagtaaatgctactaattttaccattaaaatcaacataattaatcattttcttaataatcgtgtataaac 35380326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47773206 - 47773006
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       ||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  47773206 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactactcca 47773107  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  47773106 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaattatttccttaataactgtgcatcaaccttaa 47773007  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  47773006 a 47773006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 49428528 - 49428329
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  49428528 ctcaaaataattgtcactttagaa-atcaatgcaacatttattacttttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattactcca 49428430  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49428429 ctaactacaattaataagggtattttagtaaattatattaattttaccattgaaatcaacacaaataatcatttccttaataatcgtgcaaaaaccttaa 49428330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 47464550 - 47464352
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  47464550 aaaataattatcgttttacaataccaatgcattatttattattttttttccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccacc 47464451  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47464450 aactacaattaataagagttttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgctcaaaccttaaa 47464352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38405290 - 38405089
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||        ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38405290 ctcaaaataattgtcactttagaatagcaatgcaacatttattactttttttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaactacacc 38405191  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38405190 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccatttaaatcaacagaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaacctta 38405091  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  38405090 aa 38405089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Original strand, 53346746 - 53346882
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53346746 actattatactcatatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactaaaattaataagggtgttttagtaaatgctattaattttaccattga 53346845  T
Q  293 aatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  53346846 aactaacacaatcaattattttcttaataatcgtgca 53346882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6643894 - 6643659
Alignment:
Q  92 tactccattcgtctcacaattattgtttctttagcannnnnnnnnnnnctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||            |||||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||        |    
T  6643894 tactccatccgtctcacaattattgtctctttagcatattttcttttcctcaaaataattgtcactttacaatttcaacgcagcatttatt-tatttttc 6643796  T
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6643795 cactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactataccactaactacaattaataaagatgttttagtaaatgctactaattttaccattg 6643696  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgc 328  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6643695 aaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgc 6643659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11907786 - 11907586
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       ||| ||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11907786 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttccattataatacatttatttattgaacttcatccaacttaactactcca 11907687  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11907686 ataactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcattaaccttaa 11907587  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  11907586 a 11907586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17237432 - 17237283
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  17237432 ccactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataaggttgttttagtaaatgttactaattttaccatt 17237333  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  17237332 gcaatcaacacaattaattattttcttaataatcatgcacaaaccttaaa 17237283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 34360592 - 34360789
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||        |||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  34360592 aaaataattgtcactttacaataccaatttaacattttttttttttttccactattatacccttatttattgaattttattcaacttaactactccacta 34360691  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  34360692 actacaattaataagagtgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaatacaattaatcatttctttaataatcgtgcacaaactttaaa 34360789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 43237229 - 43237377
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||  || ||||||||| ||||    
T  43237229 cactattatacacttatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactataattaataatgattttttagtaaatattactaattttaccattg 43237328  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43237329 aaataaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 43237377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 44536381 - 44536183
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatt--annnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  |       |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  44536381 aaaataattgtcactttacaatactaatgcagcatttattttattcttttccactattatacccttattt-ttgaatttcatctaacttagctactccac 44536283  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44536282 taactacaattaataagggtgttttaataaatcctgctaattttaccattaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaactttaaa 44536183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 140 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 52859981 - 52859787
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||| |||||||| ||     ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52859981 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacatttattattttttcccattattataccct-----attgaatttcattcaacttaactactcca 52859887  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52859886 ctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataagccttaa 52859787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 32884786 - 32884935
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||    
T  32884786 ccactattatatccttatttattgaattccatccaacttaactactccactaactacaattaataagagtgttttactaaatgctactaattctaccatt 32884885  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32884886 gaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 32884935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 33790863 - 33790718
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||| ||  |||    
T  33790863 tattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagcaaatgaaactaattttaccatcaaaa 33790764  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33790763 tcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcataaaccttaaa 33790718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 40123039 - 40122841
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncc-actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||       || || ||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  40123039 aaaataattatcactttacaataccaatgcaacatttattatttttttcccaccattgtacccttatttattgaatttcgtcgaacttaactgctccact 40122940  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  40122939 aactacaatcaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaacattaaaatcaacgcaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaagcttaaa 40122841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5841615 - 5841414
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaa-ctactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||       ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5841615 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcatcatttattattaatttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaaactactcc 5841516  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  5841515 actaactacaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacgcaatcaatcatttccttaatagttgtgcacaaacctta 5841416  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  5841415 aa 5841414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 141 - 329
Target Start/End: Original strand, 49746895 - 49747083
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  49746895 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaacatttattattatttttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcaa 49746994  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49746995 ctaactataattaatgaaggtattttagtaaatactactaattttatcattgaaatcaacacaattaattattt-tttaataatcgtgca 49747083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7061851 - 7061651
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||    
T  7061851 ctcaaaataattgttactttaaaatatcaatacaacatttattatttattttcactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaattaatcca 7061752  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7061751 ctaactacaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgtacaaaccttaa 7061652  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  7061651 a 7061651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 42617090 - 42616890
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||       ||| |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  42617090 ctcaaaataattgtcactttagaatacaaatgcaacatttattattattttccattattatacacttatttattgaatttcattcgacttaactactcca 42616991  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    || ||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||    
T  42616990 cttactacaattaataaaaatattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacagttaatcatttctttaataatcatgcacaaaacttaa 42616891  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  42616890 a 42616890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 52247611 - 52247415
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||       |||  ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  52247611 aaaataattgtcactttacaa-accaatagaacatttattattcttttccatcattatacacttatttaatgaatttcattcaacttaactactccacta 52247513  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  52247512 actacaattaataaggatattttagtaaattgtattaattttaccattgaaattaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaatccttaaa 52247415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 2066725 - 2066923
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||        || ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  2066725 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgaagcatttattatttttt--cattattatacctttatttattgaatttcatctaacttaactacccca 2066822  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||  || ||| ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2066823 ctaactaaaattaataagggtgttttaataaataatactaactttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 2066922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 22129976 - 22130181
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||        ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22129976 ctcaaaataattgtcattttacaataccaatgcaacatttattattttttttccattattatacctttatttattgaatttcatccaacttaattactcc 22130075  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaac----acaattaattatttccttaataatcgtgcataaac 334  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||| ||| |||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22130076 actaactacaattaataaggatgtttttgtaaatgatactaattataccattgaaatcaacacatacaattaatcatttccttaataaccgtgcacaaac 22130175  T
Q  335 cttaaa 340  Q
    ||||||    
T  22130176 cttaaa 22130181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 6609750 - 6609895
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||| ||  |||    
T  6609750 tattatactcttatttattgagtttcatccaacttaactactccaataattacaattaataaagatgtttttgtaaatgatactaattttaccatcaaaa 6609849  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6609850 tcaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcataaactttaaa 6609895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 49176122 - 49175921
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncc-actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||       || |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  49176122 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcaacaattattatttttttcccactattatacccttatttattgaattttatccaacttaactactcc 49176023  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
     ||||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||||  ||||||||   |||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  49176022 gctaactacaattaataaggttattttagtaaatgatactaattttatcattgaaatctccacaattaatcattttcttaaaaatcatgcacaaacctta 49175923  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  49175922 aa 49175921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16821516 - 16821318
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc-cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||         ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  16821516 aaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattattatttttgcactattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaatactccact 16821417  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| ||||||||| | | || ||||||||| || ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  16821416 aactataattaataaggatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaatcaacacaattaatcattgcattaataatcgtgcacaaaccttaaa 16821318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 322
Target Start/End: Original strand, 54506777 - 54506904
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  54506777 tattatattcttattaattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattgataatgatattttaataaatgatattaattttaccattgaaa 54506876  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataa 322  Q
    | |||||| ||||| |||| ||||||||    
T  54506877 tcaacacagttaatcattttcttaataa 54506904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28501072 - 28500878
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn--ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||         ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28501072 ctcaaaataattgtctctttagaataccaatacaacatttattattttttttcccattattatacccttatttattgaatttcatcaaacttaacta--- 28500976  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
         ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  28500975 -----actgcaattaataagggtattttagtaaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaatcaatcatttccttaataatcgtgcacaaacatt 28500881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11288751 - 11288617
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||| | |||||||| || |||||    
T  11288751 ttatttattgaattttatccaacttaactactccaccaactacaattaataa-gatattttagtaaatgatattaattttgccattgaaatcaatacaat 11288653  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11288652 taatcattttcttaataatcgtacataaaccttaaa 11288617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 17114439 - 17114574
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    |||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  17114439 ttatttattgaacttcctccaaattaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaat 17114538  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  17114539 taatcatttccttaataactgtgcatcaaccttaaa 17114574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21240887 - 21240708
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||         ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  21240887 ctcaaaataaatgtcactttagaatatcaatgcaacatttat----attttccattattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcaa 21240792  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataat 323  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21240791 ctaactacaattaataaggatgtgttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacagttaatcatttccttaataat 21240708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 2653357 - 2653552
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||       ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||    
T  2653357 aaaatagttgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatctttttccattattatacctttatttattaaatttcatccaatttaactactccttta 2653456  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||  || ||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  2653457 actacaattaataagagtattttaataaatgatactaattttacaattgaaatcaacacaattaatcattt--ttaataatcatgcacaaatcttaaa 2653552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 25233116 - 25233315
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||       | | ||| |||   |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  25233116 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatttttttc-attataatatctttatttattgaacttcatccaacttaactacttca 25233214  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||    
T  25233215 ctaactataattaatactagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaattaacacaattaattatttctttaataactgtacatcaaccttaa 25233314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 326
Target Start/End: Original strand, 36985771 - 36985906
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||| |||    
T  36985771 ccaccattatacccttatttattgaatttcatccaacttaattattctactaactacaattaatacgggtattttagtaaatgatactaattttaccatt 36985870  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgt 326  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  36985871 gaaatcaacacaattaatcatttcctgaaaaatcgt 36985906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2942831 - 2942648
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn---ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||          |||||||||||   || ||||||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  2942831 aaaataattgtcattttacaatatcaatgaaatatttattattatttttttccactattatatctttgtttattgaaattcattcaacttaaccactcca 2942732  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2942731 ctaactacaattaataa-ggtgttttagtaaatgctactaattttatcatcgaaatcaacacaattaatcatttctttaataatc 2942648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 140 - 266
Target Start/End: Original strand, 51624720 - 51624846
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||       ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51624720 ctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgtaacatttattatttttttccactatcatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 51624819  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgtttta 266  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  51624820 ctaactacaaataataaaagtgtttta 51624846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 46397055 - 46396870
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||       ||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||               
T  46397055 aaaataattgtcactttacgatacgaatacaacatttattagttttttccattattatacccttatttaatgaattttatccaacttaa----------- 46396967  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  46396966 -ctacaattaataagagtgttttagtaaatgctattaattttaccattgaaatcaacacaattaatcatttacttaatgatcgtgcacaaaccttaaa 46396870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 3689551 - 3689696
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||    
T  3689551 tattatacccttattaatttaatttcatctaacttaacaactcaactaactataattaataagagtgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaa 3689650  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | || ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  3689651 tcaatacaattaatcatttctttaataaccgtacataaaccttaaa 3689696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 199 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 38502610 - 38502469
Alignment:
Q  199 atactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||  || ||||| |||||| || ||||||||| ||  |||| ||    
T  38502610 atactcttatttattgaattttatccaacttaactactacattaactataattaataaaagtattttaataaatgatactaattttaccatcaaaatcaa 38502511  T
Q  299 cacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||    
T  38502510 cacaattaattatttccttaataactatgcatcaaccttaaa 38502469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42517773 - 42517638
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc---cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |    ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  42517773 tattatactgttatttattgaatttcatctaactttactagtatttcactaactataattaataagggtattttagtaaatgatcttaattttaccattg 42517674  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtg 327  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42517673 aaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtg 42517638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 197 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 48914278 - 48914131
Alignment:
Q  197 ttatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgct-----attaattttacaattg 291  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| | | |||||||| ||| |     | ||||||||| ||||    
T  48914278 ttataccctaatttattgaatttcattaaacttaattacttcactaactacaaataataaggatattttagtatatgatggagtactaattttaccattg 48914179  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  48914178 aaatgaacacaattaattatttccttaaaaactgtgcataaaccttaa 48914131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 140 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26147805 - 26147635
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatt--annnnnnnccactattatactcttatttattgaat-ttcatcaaacttaactact 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||  |       ||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  26147805 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatacaacatttattttatttttttccattattatacccttatttattgaaaattcatccaacttaattact 26147706  T
Q  237 ccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  26147705 ccactaactacaattaataagaatgttttagtaaatgatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaa 26147635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 30682328 - 30682183
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||| | | || ||||||||| |||||||||||| | | |||    
T  30682328 tattatgcttttatttattgaatttcattcaaattaactactctactaactacaactaataaggatattatagtaaatgatattaattttaccaataaaa 30682229  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  30682228 ttaacacaattaatcatttttttaatagtcgtgcaaaaaccttaaa 30682183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 340
Target Start/End: Original strand, 52869107 - 52869206
Alignment:
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  52869107 taactacaattaataaaggtattttaataaacgatattaatcttactattgaaatcaacacaattaattatttccttaataattgtgcacaaaccttaaa 52869206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 4972507 - 4972694
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||       | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||           
T  4972507 ctcaaaataactgtcactttacaataccaatgtaacatttattatttttttc-actattatacacttatttattgaatttcatctaacataac------- 4972598  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
         ||||||||||||  |||||||||||||||  |  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  4972599 -----tacaattaataagagtgttttagtaaatgtcaccaatttttcaattgaaatcaacacaattaatcatttcattaataatcgtgcacaaatcttaa 4972693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 326
Target Start/End: Original strand, 53412094 - 53412228
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||   | |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  53412094 cactattatacttttatttattgaatttcatccaacttaactattccacaaactataattaataaaaatattttagtaaatgatactaattttaccattg 53412193  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgt 326  Q
    |||| || | |||||||  ||| ||||| ||||||    
T  53412194 aaatcaataaaattaatcgttttcttaaaaatcgt 53412228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 41711592 - 41711443
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| || |||||| |||| | |||||  ||||| |||||||||||| |||    
T  41711592 ccactattgtatccttatttattgaatttcataaaacttaacaactccgctaaataaaattaaaaatgatattttaaaaaatgatattaattttaccatt 41711493  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     |||| |||| ||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  41711492 aaaatcaacataattaatcatttccataaaaattgtgcacaaaccttaaa 41711443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 191 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38663583 - 38663480
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  38663583 ccactattgtacccatatttattaaatttcatccaacttaactactttactaactacgattaataaaagtgttttagtaaatgctactaattttaccatt 38663484  T
Q  291 gaaa 294  Q
    ||||    
T  38663483 gaaa 38663480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 50264212 - 50264102
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||||||  |||||||    
T  50264212 tattatacccttatttattgaatttcattcaacttaaatatttcactaactacaattaataagagtattttagtaaatgatgttaattttaacattgaaa 50264113  T
Q  295 tgaacacaatt 305  Q
    | |||||||||    
T  50264112 tcaacacaatt 50264102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 461947 - 462092
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  461947 tattatacccttatttgttgaattttattcaacttaactactccgctaattacaattaataaggatattttagtaaataatattacttttaccattgaaa 462046  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | || ||||||||| |||| ||||| |||  |||| ||| ||||||    
T  462047 tcaatacaattaatcattttcttaaaaattatgcacaaatcttaaa 462092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 144 - 329
Target Start/End: Original strand, 19265744 - 19265931
Alignment:
Q  144 aaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactat--tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||       ||| |||  || || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19265744 aaataattgtcactttagaatactaatgcaacatttagtatttttttccattatattacacccttaattattgaatttcattcaacttaactactccact 19265843  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||||| ||||||||| | | ||||| |||||   ||||||||||  |||||||| || | ||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  19265844 aactataattaataaggttattttaataaataacattaattttattattgaaataaatataattaatcattttcttaataaccgtgca 19265931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18741608 - 18741506
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||||||  | |||||||||  ||||    
T  18741608 actattataaacttatttattgaatttcatccaacttaactactccattaactacaattaataaagatattttaataaatgacactaattttaccgttga 18741509  T
Q  293 aat 295  Q
    |||    
T  18741508 aat 18741506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 39397333 - 39397478
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |  ||||||| || | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||  ||||| ||||| | |||||    
T  39397333 tattatacccttatttattaaatttcatccattttaactaatctagtaactacaattaatatggggattttagtaaatgacattaaatttaccaatgaaa 39397432  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||    
T  39397433 tcaacataattaatcatttccttaaacatcgtgcacaaactttaaa 39397478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 259 - 340
Target Start/End: Original strand, 51625136 - 51625217
Alignment:
Q  259 gtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  51625136 gtgttttagtaaatgttactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaactttaaa 51625217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 340
Target Start/End: Original strand, 35998798 - 35998945
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattg 291  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||| || |||||||||  ||     
T  35998798 cactattatatctttatttattgaatt-catccaacttaactactccatcaactacaattaataatgatattttaataaatgttactaattttactgtta 35998896  T
Q  292 aaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||| || |||| ||||  ||||||||||| || |||| |||||    
T  35998897 aaatcaacataaataataatttttttaataatcgtacaaaaacattaaa 35998945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 312
Target Start/End: Original strand, 7986962 - 7987080
Alignment:
Q  194 ctattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaa 293  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||  | |||||||| ||| || ||||||||  ||| ||    
T  7986962 ctattatacttttatttatttaatttcattaaacttaactactctactaacaataattaataataatattttagtagatgatactaattttatcattaaa 7987061  T
Q  294 atgaacacaattaattatt 312  Q
    || ||||| |||| |||||    
T  7987062 atcaacactattatttatt 7987080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28911340 - 28911249
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacta 234  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28911340 aaaataattgtcgatttagaatatcaatgcaacatttattatttttttccattattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaacta 28911249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Original strand, 30192227 - 30192339
Alignment:
Q  228 ttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtg 327  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||   | |||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  30192227 ttaattactctactaactacaattaataagaatattttagcaaatgacattaattttataattgaaatcaacacaattaatcattttcttaaaaatcgtg 30192326  T
Q  328 cataaaccttaaa 340  Q
     | |||| |||||    
T  30192327 tacaaacattaaa 30192339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Original strand, 35251888 - 35251996
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||          ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  35251888 tattatatccttatttattgaatttcatctaacttaattactccactaa----------taatggtattttagtaaatgatattaattttatcattgaaa 35251977  T
Q  295 tgaacacaattaattattt 313  Q
    | | |||||||||||||||    
T  35251978 taaccacaattaattattt 35251996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47359085 - 47358958
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || |||||| ||||  |  ||||||||  |||    
T  47359085 ccactattgcacccttatttattgaatttcattcaacttaattactccactgactacaattaataaaagtattttagaaaattattctaattttatcatt 47358986  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttcctta 318  Q
    ||||| |||||||| ||| |||| ||||    
T  47358985 gaaatcaacacaatcaataattttctta 47358958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Original strand, 10754308 - 10754423
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||| | ||||||       | || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||    
T  10754308 ctcaaaataattgtcaatctaaaataccaatgcaacaattattatttttc-caaccattatactcttatttattaaatttcattcaacttaattattcca 10754406  T
Q  240 ctaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||||||||||    
T  10754407 ctaactacaattaataa 10754423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Original strand, 10968077 - 10968192
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||||| | ||||||       | || |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||    
T  10968077 ctcaaaataattgtcaatctaaaataccaatgcaacaattattatttttc-caaccattatactcttatttattaaatttcattcaacttaattattcca 10968175  T
Q  240 ctaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||||||||||    
T  10968176 ctaactacaattaataa 10968192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 20612300 - 20612226
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20612300 tatactattatttattgaatttcaattcacttaactacttcattatctacaattaataatggtgttttagtaaat 20612226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 49579363 - 49579235
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||         |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||    
T  49579363 ctcaaaataattgtcactttaaaatatcaatgcaatattt-ttatttttttt-actagtacattcttatttattgaatttcatccaacttaacaatttca 49579266  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaa 270  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  49579265 ataactacaattaataaaagtgttttagtaa 49579235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 273
Target Start/End: Original strand, 44526378 - 44526446
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  44526378 ttatttattaaatttcatccaacttcactattccactaactacaattaataaggatgttttaataaatg 44526446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 2400777 - 2400844
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  2400777 ttatttattgaattttattatacttaactactccacaaactacaatcaatgagggtgttttagtaaat 2400844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23915555 - 23915435
Alignment:
Q  201 actcttatttattgaatttca-tcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaac 299  Q
    |||||||||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |   ||||||| ||| |||| |||    
T  23915555 actcttatttattgtatttcaatca--cctaactactccactaactataattaataatgatgttttagtaaattaaacatattttaccattaaaatcaac 23915458  T
Q  300 acaattaattatttccttaataa 322  Q
    || | |||| |||||||||||||    
T  23915457 actactaatcatttccttaataa 23915435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31370432 - 31370373
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaat 254  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31370432 tattatacatttatttattgattttcatccaacttaactactccactaactataattaat 31370373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32470069 - 32469935
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||  | |||||||| |||||||   ||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  32470069 ttatttattgaattt-atcaaacttaaaaactttattaactacagttaataagaatgttttaataaatgatactaattttaccattaaaatcaacacaat 32469971  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||| ||| | |||  |||||||| ||||||    
T  32469970 taatcattttctttaaaattatgcataaatcttaaa 32469935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 256
Target Start/End: Original strand, 10672643 - 10672703
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | |||| |||||||||    
T  10672643 attatactcttatttattgaatttcatccaacttaactatttcattgactaaaattaataa 10672703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 256
Target Start/End: Original strand, 10886283 - 10886343
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || | |||| |||||||||    
T  10886283 attatactcttatttattgaatttcatccaacttaactatttcattgactaaaattaataa 10886343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Original strand, 43902237 - 43902301
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  43902237 cactattatgcccttatttattgaatttcatgcaacttaattactccactaactatgattaataa 43902301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25142502 - 25142437
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagta 269  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||| | | ||||||||    
T  25142502 cttatttattgaatttcatccaacttaactacatcactaactgcaatcaataaggatattttagta 25142437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 29295163 - 29295254
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn----ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaactta 230  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||           ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29295163 aaaataattatcactttagaataccaatgcagtatttattattttttttcttccattataatactcttatttattgaatttcatcaaactta 29295254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43967656 - 43967611
Alignment:
Q  206 tatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaatt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  43967656 tatttattgaatttcatcaaacttaactattctactgactacaatt 43967611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 242 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17512424 - 17512380
Alignment:
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttac 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  17512424 aactacaattaataatggtattttagtaaattatattaattttac 17512380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21698693 - 21698653
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21698693 aaaataattgtcactttaaaatatcaatgcaatatttatta 21698653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8175645 - 8175578
Alignment:
Q  262 ttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||| ||||    
T  8175645 ttttaataaatgatattaattttaccattgaaatcaacacaattattcatttttttaataatcatgca 8175578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 256
Target Start/End: Original strand, 54202187 - 54202246
Alignment:
Q  197 ttatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||| |||||| ||||||||||||    
T  54202187 ttatattcttatttattgaatttcatcccactcaattacttcactaattacaattaataa 54202246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 327
Target Start/End: Original strand, 29575143 - 29575229
Alignment:
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtg 327  Q
    ||||||||||||| ||  || ||||| |||||| |||||||||||  ||| |||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  29575143 taactacaattaacaagagtattttaataaatgttattaattttatcatttaaattaacataattaatcattttcttagtaatcgtg 29575229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 256
Target Start/End: Original strand, 30260996 - 30261054
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30260996 tatagtcttatttattgaatttcactctacttaactactctactaattacaattaataa 30261054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 54921802 - 54921772
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaat 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54921802 ctcaaaataattgtcactttacaataccaat 54921772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16506332 - 16506287
Alignment:
Q  228 ttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16506332 ttaattactccattaactacaattaataaatgtgttttagtaaatg 16506287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21325224 - 21325171
Alignment:
Q  267 gtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaat 320  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  21325224 gtaaatgatactaattttaccattgaaataaacacaatttatcatttccttaat 21325171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10699540 - 10699504
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaac 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10699540 attatactcttatttattaaatttcatccaacttaac 10699504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10913310 - 10913274
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaac 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10913310 attatactcttatttattaaatttcatccaacttaac 10913274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Original strand, 20681406 - 20681446
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  20681406 aaaataattgtcactttaaaatatcaatacaatatttatta 20681446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34000
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  34199 ctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcatcatttattatttttt-ccactattataccattatttattgaatttcatccaacttaactatttca 34101  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34100 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgccactaattttactattgaattcaatacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaa 34001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 140 - 338
Target Start/End: Original strand, 181491 - 181687
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  181491 ctcaaaataattgtcactttacaatac-aatgcaacatttattattatttttcactattatacccttatttattgaatttcatccaacttaactactcca 181589  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  181590 ctaactataattaataatgatgttttagtaaatactactaattttactattgaaatcaatacaattaa-tatttttttaataatcgtgctcaaacctta 181687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3720421 - 3720221
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  3720421 ctcaaaataattgtcaatttacaatgccaatgcatcatttatttttcccccccactattatactcttatttactgaatttcattcaacttaactattcca 3720322  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3720321 ctaactacaattaataagagtgtttttgtaaatactacaaattttataattgaaatcaacacaattaatcatttcattaataatcgtgcacaaaccttaa 3720222  T
Q  340 a 340  Q
    |    
T  3720221 a 3720221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 23142602 - 23142801
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||         ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23142602 ctcaaaataattgtcactttacaatatcaatgcaacatttatcgttttttcccattattatac-cttctttattgaatttcatctagcttaactactcca 23142700  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  23142701 ctacctacaattaataagggtgttttagtaaatgccactatttttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcgtggataaaccttaa 23142800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11656127 - 11655926
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncc-actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||       || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11656127 ctcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattatttttttcccattattatacccttatttattgaatttcatccaactttactactcc 11656028  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11656027 actaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataaccgtgcataaacctta 11655928  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  11655927 aa 11655926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 340
Target Start/End: Original strand, 15058055 - 15058251
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  15058055 aaaataattgtcactttataataccgatgcaacatttattattttttgt-actattatacccttatttattgaatttcatccaacttaaatacttcacta 15058153  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15058154 actacaattaataagggtattttagtaaatgccactaattttaccattgaaattaacttaattaatcattttcttaataatcgtgcacaaaccttaaa 15058251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 1781739 - 1781936
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||        |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  1781739 ctcaaaataattgtcactttacaatatcattgcaacatttttt-tttcttcccactattatac-cttttttattgaatttcattcaacttaac-actcca 1781835  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1781836 ctaactacaattaataagggtgttttagtaaatgctactaattttaccattgagatcaacataattaatcattttcttaacaatcgtgcataaaccttaa 1781935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31894387 - 31894206
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||        ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  31894387 ctcaaaataaatgtca-tttacaatatcaatgcaacatttattatttttt--cactattatacccttatttattaaatttcatccaacttaactacttca 31894291  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatc 324  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31894290 ctaactacaattaataatgacgttttagtaaatgctactaattttaccattgaaatcaacacaattaatcattttcttaataatc 31894206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Original strand, 13909413 - 13909559
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  13909413 tattatactcttatttattcaatttcatctaacttaattactccactaactacaattaataagggtattttagtaaatgtcactaattttaccattgaaa 13909512  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaaa 341  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13909513 tcaacacatttaatcatttccttaataatcgtgcacaaactttaaaa 13909559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 29363238 - 29363440
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn--ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29363238 ctcaaaataattgtcacttcagaataccaatgcagcatttattattattttttccattattatactcttatttattgaatttcatccaacttaactaatc 29363337  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||| ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29363338 cgctaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatactagttttaccatcaaaatcaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataaacctt 29363437  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  29363438 aaa 29363440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 13087519 - 13087664
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13087519 tattatattcttatttattgaatttcatccaacttaattacttcactaactataattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttaccattgaaa 13087618  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| | || ||||||||||||  || |||||||||    
T  13087619 tcaacacaattaatcactttcttaataatcgtttatgaaccttaaa 13087664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 21010105 - 21010311
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn--ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |         ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21010105 ctcaaaataattgtcactttataataccaatgcagcatttataatttttttttccattattatactgttatttattgaatttcatccaacttaactactc 21010204  T
Q  238 cactaa----ctacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaa 333  Q
    ||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| | ||  |||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  21010205 cactaattaactacaatttataagggtgttttagtaaatgatactaatttttccatcaaaattaacacaattaatcattttcttaataattgtgcataaa 21010304  T
Q  334 ccttaaa 340  Q
    |||||||    
T  21010305 ccttaaa 21010311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 140 - 345
Target Start/End: Original strand, 5302285 - 5302490
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||       ||| ||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5302285 ctcaaaataattgtcactttagaatactaatgcagcatttattatttttttccattataatacccgtatttattgaacttcatccaacttaactactcca 5302384  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
     |||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||| ||  |||| |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  5302385 ttaactacaattaataaggatgttttggtaaattatattaattttaccatcaaaatcaacacatttaatcattttcttaataaccgtgcatcaaccttaa 5302484  T
Q  340 aaccat 345  Q
     |||||    
T  5302485 caccat 5302490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 6801864 - 6802065
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||        ||| ||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  6801864 ctcaaaataattgtcactttataatatcaatgcaacatttattattttttttccattataatacccttatttatcgaacttcatccaacttaactactcc 6801963  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||| |||||||| | ||||| || ||||    
T  6801964 actaactacaattaataagggcgttttagtaaatgatattaattttaccatcaaaatcaacataattaatcattttcttaataaccatgcatcaatctta 6802063  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  6802064 aa 6802065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24983578 - 24983444
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| |||    
T  24983578 ccactaatatacccttatttattgaatttcacccaacttaactactccactaactacaattaataagggtgttttagtaaatgacactaattttaccatt 24983479  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcg 325  Q
    ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||    
T  24983478 gaaatcaactcaactaatcatttccttaagaatcg 24983444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 30716833 - 30717034
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||        ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  30716833 ctcaaaataattgtcactttagaataccagtgcaacatttattattttttttccattataatactcttatttattgaattttatccaactttactactcc 30716932  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||  || | || | ||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||    
T  30716933 actaactacaattaataagggtgtttaagtaaatgatactaattttaccatcaaagtcaataaaattaatcatttccttaataactgtgcatcaatctta 30717032  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  30717033 aa 30717034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3291891 - 3291748
Alignment:
Q  197 ttatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatg 296  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  || |||| |||| ||| ||||     
T  3291891 ttatacacttatttattgaattttatccaacttaactacttcactaactacaattaataaaggtattttagtaaataatactaatattaccattaaaatc 3291792  T
Q  297 aacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3291791 gatacaattaatcatttccttaataatcgtgcaaaaaccttaaa 3291748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 32440827 - 32440625
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaa--taccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactc 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||  ||||||||       ||| |||| |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  32440827 ctcaaaataattgtcactttagaaaatatcaatgcagcatttattattattttccattattgtacctttatttattacatttcatccaacttaactactc 32440728  T
Q  238 cactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctt 337  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  32440727 tactaattacaattaataagggtgttttagtaaataatactaattttaccatcaaaatcaacacaattaatcatttcctaaataaccgtgcataaatctt 32440628  T
Q  338 aaa 340  Q
    |||    
T  32440627 aaa 32440625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6834484 - 6834349
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||||||| ||||  || ||| ||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| ||||||||    
T  6834484 ttatttattgaatctcattcaatttatctattctactaactataattaataaaggtgttttagtaaatgatattaatttgactatcaaaatcaacacaat 6834385  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6834384 taattattttcttaataatcgtgcataaactttaaa 6834349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Original strand, 7920175 - 7920372
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||         |||||||||||  ||||||||||||||||||  || |||| |||| ||    
T  7920175 ctcaaaataattatcactttagaatatcaatgcaacatttatttattttt--cactattataccattatttattgaatttcattcaaattaaatacttca 7920272  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaa 339  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||    
T  7920273 ctaactacaattaataa-gatattttagtaaatggttttaattttaccattgaaatcaacaaaattaatcatttctttaaaaatcgtgcacaaatcttaa 7920371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 319
Target Start/End: Original strand, 17828932 - 17829053
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatga 297  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |    
T  17828932 tatactcttattaattaaatttcatccaacttaattacttcactaactacaattaataaagatattttagtaaatgatattaattttactgttgaaatta 17829031  T
Q  298 acacaattaattatttccttaa 319  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  17829032 acactattaataatttccttaa 17829053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34657745 - 34657610
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn---ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactact 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34657745 ctcaaaataattgtcactttacaatacctatgcagaatttattatattttttttccactattatacatttatttattgaatttcatccaacttaactact 34657646  T
Q  237 ccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  34657645 ccactaactacaattaataaaagtgttttaataaat 34657610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1063727 - 1063583
Alignment:
Q  196 attatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaat 295  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||||  || ||||||||  ||||||||    
T  1063727 attatacccttacttattaaatttcatttaacttaactactccactaactacaattactcagagtattttagtaaataatactaattttatcattgaaat 1063628  T
Q  296 gaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     |||||||||||| |||| ||||| |||  | ||||||| |||||    
T  1063627 caacacaattaatcattttcttaaaaattatacataaactttaaa 1063583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 140 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11143766 - 11143622
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||       | | ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  11143766 ctcaaaaaaattgtcactttagactaccaatgcagcatttattatttttttc-attataatacccttatttattgaacttcatccaacttaactacttca 11143668  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  11143667 ctaactataattaataagggtgatttagtaaatgatactaatttta 11143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 149 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1956150 - 1955959
Alignment:
Q  149 attgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc-cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactac 247  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||       | || |||||||| |||||||||||||||| ||| |||  | ||||| ||||||||||    
T  1956150 attgtcactttataataacaatgcaacatttattatttttttctcattattatac-cttatttattgaattttatcgaacacagctacttcactaactac 1956052  T
Q  248 aattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||  || | |||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||||||  ||| |||||| |  ||| ||||||||||||    
T  1956051 aattaataagagtatattagtaaatgatactaattttaccattgaaatcaatacaattaatctttttcttaattactgtgtataaaccttaaa 1955959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 329
Target Start/End: Original strand, 1225037 - 1225170
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||   | |||||||||||  |||||||||||| ||| |||    
T  1225037 tattatacccttatttattcaattt-atccaacttaacttcttcactaactaaaattaataagaatattttagtaaataatattaattttactatttaaa 1225135  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    | |||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  1225136 tcaacacaattaatcatttctttaaaactcgtgca 1225170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10923505 - 10923413
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  10923505 actattatattcttatttattgaatttcatctaatttaattattccactagctacaattaacaacggtattttagtaaataatattaatttta 10923413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 308
Target Start/End: Original strand, 15582222 - 15582385
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||        |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  15582222 aaaataattgtcattttagaatatcaatgcaataattattatttttt--cactatcatatccttatttattgaatttcattaaacttaaccacttcacta 15582319  T
Q  243 actacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaat 308  Q
    |||||||  | |||  || ||||| |||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  15582320 actacaacaagtaaatgtattttaataaatgatactgattttaccattgaaatcaacacaattaat 15582385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27367498 - 27367427
Alignment:
Q  258 ggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27367498 ggtgttttagtaaatgcaattaattttacaactaaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgca 27367427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27448231 - 27448136
Alignment:
Q  245 tacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27448231 tacaattaataatgatgttttagtaaatgatactaatttcatcatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcaaaaaccttaaa 27448136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27457845 - 27457774
Alignment:
Q  258 ggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgca 329  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27457845 ggtgttttagtaaatgcaattaattttacaactaaaatcaacacaattaatcatttctttaataatcgtgca 27457774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Original strand, 15046111 - 15046171
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaat 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15046111 actattatacccttatttattgaatttcatccaac-taactactccactaactacaattaat 15046171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 21804644 - 21804530
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    |||| ||||| |||||| || ||||||| |  ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||    
T  21804644 cttagttattaaatttcttccaacttaatttttccactaactacaattaataa-gatatttaagtaaatgatactaattttacaattgaaattaatacaa 21804546  T
Q  304 ttaattatttccttaa 319  Q
    ||||| ||||| ||||    
T  21804545 ttaatcatttctttaa 21804530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 8695030 - 8695124
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||    | ||||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  8695030 ccactagtatattcttatttatagaatttcacttcatttaaccacttcactaactacaattaataagaatgttttagtaaatgctattaatttta 8695124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 285
Target Start/End: Original strand, 34299931 - 34300074
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn-ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccact 241  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||        |||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  34299931 aaaataattgtcactttagaatatcaatacaacatttattattttctttccactaatatatccttatttattgaataccatccaacttaactacttcact 34300030  T
Q  242 aactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    ||| ||||||||||| | | |||||||||||  || ||||||||    
T  34300031 aaccacaattaataaggatattttagtaaataatactaatttta 34300074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 17835391 - 17835491
Alignment:
Q  213 tgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatt 312  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||    
T  17835391 tgaatatcatccaacttaactactaaacaaactacaattaataaatgtattttagtaaatgagattaattttattattaaaatcaatacaattaattatt 17835490  T
Q  313 t 313  Q
    |    
T  17835491 t 17835491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21425738 - 21425635
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnn--ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||         |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  21425738 tcaaaataattgttactttacaatatcaatgcaacatttattattattttttccaccattatatccttatttattgaatttcatccaacttaactacttc 21425639  T
Q  239 acta 242  Q
    ||||    
T  21425638 acta 21425635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 256
Target Start/End: Original strand, 22398412 - 22398463
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22398412 ttatttattgaatttcatctaacttaactacttcaataactacaattaataa 22398463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16205274 - 16205222
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16205274 cttatttattgagtttcatctaacttaaatattccactaactacaattaataa 16205222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 7071997 - 7072060
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  7071997 actattatacacttatttattgaatttcatcaaacgttgctacttcactaactataatcaataa 7072060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 21478275 - 21478232
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21478275 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatacaacatttatta 21478232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27367607 - 27367524
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta--nnnnnnnccactattatactcttatttattgaatttca 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||         |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27367607 ctcagaataattgtcactttacaataccaatgtaacatttattagttttttttccactattatacccttatttattgaatttca 27367524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27457954 - 27457871
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta--nnnnnnnccactattatactcttatttattgaatttca 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||         |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27457954 ctcagaataattgtcactttacaataccaatgtaacatttattagttttttttccactattatacccttatttattgaatttca 27457871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4367378 - 4367300
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |||||| |||||    
T  4367378 tattattcccttatttattaaatttcatgcaacttaactacttcactaactacagttaataaggatattttagaaaatg 4367300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 21425470 - 21425397
Alignment:
Q  199 atactcttatttattgaatttca-tcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||   |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21425470 atactcttatttattgcatttcaatcatttttaagtactccactaactataattaataat-gtgttttagtaaat 21425397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 34639494 - 34639436
Alignment:
Q  278 taattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacct 336  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  34639494 taatttcaccattgaaattaacacaattaattatttccttattaatcgtgtacaaacct 34639436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 272
Target Start/End: Original strand, 33510129 - 33510206
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaat 272  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||   | |||||||||||    
T  33510129 tattatacccttatttaataaatttcatccaacttaactactcaattaattacaattaataaaaatattttagtaaat 33510206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4590656 - 4590609
Alignment:
Q  262 ttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaatt 309  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4590656 ttttagtaaacgatattaattttactattgaaatcaacacaattaatt 4590609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23397796 - 23397609
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnc-cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||       |  | || | |||| |||||||||||||||| |     |||| |||||||    
T  23397796 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcaacatttattatgttttccttagtaatttacttttatttattgaatttcgt-----ttaattactcca 23397702  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataa 332  Q
    ||||||||| ||||||   ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||| ||| ||| |||| |||| | ||| ||||| ||||||    
T  23397701 ctaactacacttaatagatgtgttttagtaaattacactaattttaccatttaaatcaactcaagtaataattttcataagaatcgcgcataa 23397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27367279 - 27367236
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  27367279 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttatta 27367236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 27457626 - 27457583
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  27457626 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcatcatttatta 27457583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13206954 - 13206896
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||   || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13206954 tatacccttatttattgaattacactcaatttaacaactccactaactacaattaataa 13206896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28106105 - 28106013
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactact 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |        |||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28106105 tcaaaataattgtcactttacaataacaatgcaagttttaat---tttttccactattatatcattatttattgaatttcattcaacttaactact 28106013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4582039 - 4581975
Alignment:
Q  262 ttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgt 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||| | ||| ||||||    
T  4582039 ttttagtaaatgatattaattttaccattaaaatcaacacagctaattattttcataagaatcgt 4581975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8115129 - 8115073
Alignment:
Q  229 taactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| || ||||||||    
T  8115129 taactaatccactaactaaaattaataagagtattttagtaaatgatactaatttta 8115073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 105673 - 105818
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  105673 tattatacccttatttatcgaatttcattcaacttaactacttcactaactacaattaataagggtgttttagtaaacgctattaattttaccattgaaa 105772  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  105773 taaacacaattaatcatttacttaataatcatgcataaatcttaaa 105818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 93; Significance: 6e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 140 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 864 - 695
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||       |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  ||||||    
T  864 ctcaaaataattgtcactttacaataccattgcaacattgaatatttttt-ccactattatacccttatttattgaatttcatccaatttaaacactcca 766  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaatta 310  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  765 ctaactacaatcaataaaggtgttttagtaaatgctattaattttaccattgaaatcaacacaattaatta 695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 136165 - 136018
Alignment:
Q  193 actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattga 292  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  136165 actattataccattatttatttaatttcatcaaacttaactacttcactaactataattaataagggtgttttagtaaatgctattaattttaccattga 136066  T
Q  293 aatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||| ||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  136065 aatcaacattattaatcatttatttaataatcgtgcataaatcttaaa 136018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 340
Target Start/End: Original strand, 50139 - 50338
Alignment:
Q  141 tcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccac 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||        ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  50139 tcaaaataattgtcactttagaatatcaatgcagcatttattattatttttcactattatacccttatttatttaatttcattcaacttaattactccac 50238  T
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||  ||||||||| | | || ||||||||| || ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50239 taactgtaattaataaagatattatagtaaatgatactaattttatcattgaaattaacacaattaatcatttccttaataatcgtgcacaaaccttaaa 50338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 285
Target Start/End: Original strand, 22282 - 22427
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaactt-aactactcc 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||       | |||||||||  |||||||||||||||| ||| || || ||||||| |    
T  22282 ctcaaaataattatcactttacaataccgatacaacatttattatttttttc-actattatatccttatttattgaattttatccaattttaactactgc 22380  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    |||||| || |||||||| | | |||||||||||| || ||||||||    
T  22381 actaaccacgattaataaagatattttagtaaatgatactaatttta 22427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 86; Significance: 9e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 2014 - 2159
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  2014 tattatacccttatttattgaatttcatcgaatgtaattaatccactaactacaattaataaggatgttttagtaaatgatattaattttatcattgaaa 2113  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2114 ttaacacaattaatcacttccttaataatcgtgcatgaaccttaaa 2159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8163 - 7962
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnncc-actattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcc 238  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||       || | ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  8163 ctcaaaataattgtcactttagaataccaatgcagcatttattatttttttcccattataatacccttatttattgaacttcatccaacttaattactcc 8064  T
Q  239 actaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaacctta 338  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| ||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  8063 actaactacaattaataagggtgttttggtaaataatattaattttaccatccaaatcaacaaaattaatcatttccttaataaccgtgcatcaaccgta 7964  T
Q  339 aa 340  Q
    ||    
T  7963 aa 7962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 204 - 340
Target Start/End: Original strand, 16096 - 16232
Alignment:
Q  204 cttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaa 303  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||    
T  16096 cttatttattgaatttcatccatcttaactgcttcattaactacaattaataagtgtgttttagtaaatgctattaattttatcattaaaatcaacacaa 16195  T
Q  304 ttaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  16196 ttaatcatttccttaataatcgtgaacaaatcttaaa 16232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 76; Significance: 8e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 205 - 340
Target Start/End: Original strand, 5389 - 5524
Alignment:
Q  205 ttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaat 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |    
T  5389 ttatttattgaatttcatccaacttaactactccactaactaaaattaataaggatattttagtaaatgatattaattttaccattgaattcaacacagt 5488  T
Q  305 taattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||| |||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  5489 taatcattttcttaataatcatgtacaaaccttaaa 5524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 191 - 340
Target Start/End: Original strand, 17020 - 17169
Alignment:
Q  191 ccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaatt 290  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||    
T  17020 ccactattataattttatttattgaatttcattcaacgtaattacgccattaactataattaataagggtgttctaataaatgctactaattttaccatt 17119  T
Q  291 gaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  17120 gaaatcaacacaattaatcattttcttaataatcatgcacaaaccttaaa 17169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20479 - 20334
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| || ||||||||||||  |||    
T  20479 tattataccctcatttattgaatttcatccaacttaactacttcactaactgcaattaataagggtattttactaaatgatactaattttacaatcaaaa 20380  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||||||||||| ||||  ||||||||| |||| || |||||||    
T  20379 tcaacacaattaatcatttaattaataatcttgcacaacccttaaa 20334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 340
Target Start/End: Original strand, 1693 - 1838
Alignment:
Q  195 tattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaa 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||||| ||  |||    
T  1693 tattatacccttatttattgaatttaatccaacttaactactccactgactacaattaatacgggtgtttaagtaaatgatactaattttaccatcaaaa 1792  T
Q  295 tgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    | |||| ||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  1793 tcaacataattaatcattttcttaataaccgtgtataaatcttaaa 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Original strand, 1493 - 1533
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttatta 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  1493 aaaataattgtcactttagaataccgatgcaacatttatta 1533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1391 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1391
Description:

Target: scaffold1391; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1798
Alignment:
Q  241 taactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1897 taactataattaataaaggtgttttagtaaatgatattaatttgactatcaaaatcaacacaattaattattttcttaataatcgtgcataaactttaaa 1798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 252984 - 252853
Alignment:
Q  140 ctcaaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactcca 239  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       | | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  252984 ctcaaaaaaattgtcactttataataccaatgcaacatttattatttttttc-attattatactcttatttattgaatttcattcaacttaactactcca 252886  T
Q  240 ctaactacaattaataatggtgttttagtaaatg 273  Q
     | |||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  252885 at-actacaattaataacgatattttagtaaatg 252853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 340
Target Start/End: Original strand, 39127 - 39222
Alignment:
Q  245 tacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |  ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39127 tacaattaataatgatgttttagtaaatgatactaatttcatcatcaaaatcaacacaattaatcatttccttaataattgtgcaaaaaccttaaa 39222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 242
Target Start/End: Original strand, 76229 - 76328
Alignment:
Q  143 aaaataattgtcactttacaataccaatgcaatatttattannnnnnnccactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccacta 242  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||         |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  76229 aaaataattgtcactctataatatcaatgcagtatttattattttttttgactattatacccttatttattgaatttcatctaacttaactactccacta 76328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14297 - 14233
Alignment:
Q  192 cactattatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataa 256  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14297 cactattatacctttatttattgaatttcatcaaatttaactactccattaactataattaataa 14233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 340
Target Start/End: Original strand, 6741 - 6871
Alignment:
Q  209 ttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaat 308  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||||| |   |||||||||||  || ||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  6741 ttattaaatttcatcatacttaactattctagtaacta-aattaataaagacattttagtaaataatactaattttatcattgaaattaaaacaattaat 6839  T
Q  309 tatttccttaataatcgtgcataaaccttaaa 340  Q
     |||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  6840 catttccttaaaaatcacgcacaaaccttaaa 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 314
Target Start/End: Original strand, 279851 - 279932
Alignment:
Q  233 tactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttc 314  Q
    |||||||||||||| ||||||| |   ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||    
T  279851 tactccactaactataattaatcaaaatgttttaataaattatattaattttataattgaaatcatctcaattaattatttc 279932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 143892 - 143944
Alignment:
Q  268 taaatgctattaattttacaattgaaatgaacacaattaattatttccttaat 320  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  143892 taaatgcaactaattttaccattgatatcaacacaattaattatttccttaat 143944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2146 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2146
Description:

Target: scaffold2146; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 285
Target Start/End: Original strand, 397 - 484
Alignment:
Q  198 tatactcttatttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaataatggtgttttagtaaatgctattaatttta 285  Q
    ||||| |||||||||||||||  | |  |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||    
T  397 tatacccttatttattgaattctaccttacttaattaatccactaactactattaataagggtgttttattgaatgatactaatttta 484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 253
Target Start/End: Original strand, 56664 - 56708
Alignment:
Q  209 ttattgaatttcatcaaacttaactactccactaactacaattaa 253  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  56664 ttattgaatttcttccaacttaattattccactaactacaattaa 56708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University