View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3800_low_18 (Length: 204)

Name: NF3800_low_18
Description: NF3800
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3800_low_18
NF3800_low_18
[»] chr7 (51 HSPs)
chr7 (106-197)||(834083-834174)
chr7 (106-197)||(1199263-1199354)
chr7 (106-197)||(838171-838262)
chr7 (106-197)||(1203351-1203442)
chr7 (106-197)||(13891580-13891671)
chr7 (106-197)||(16110013-16110104)
chr7 (106-197)||(14420737-14420828)
chr7 (106-197)||(15166200-15166291)
chr7 (106-197)||(18871247-18871338)
chr7 (106-197)||(10897934-10898025)
chr7 (106-197)||(11660232-11660323)
chr7 (106-197)||(13891963-13892054)
chr7 (112-197)||(41283595-41283680)
chr7 (106-197)||(146450-146541)
chr7 (106-197)||(10607358-10607449)
chr7 (106-197)||(16004954-16005045)
chr7 (106-197)||(39268351-39268442)
chr7 (107-197)||(9752546-9752636)
chr7 (106-184)||(18606301-18606379)
chr7 (106-197)||(39721145-39721237)
chr7 (106-197)||(16582371-16582462)
chr7 (112-197)||(2531375-2531460)
chr7 (113-197)||(7520260-7520345)
chr7 (106-187)||(11302267-11302348)
chr7 (113-197)||(31675-31759)
chr7 (113-197)||(72416-72500)
chr7 (113-197)||(76525-76609)
chr7 (113-197)||(12706167-12706251)
chr7 (113-197)||(12713490-12713574)
chr7 (113-197)||(12717237-12717321)
chr7 (113-197)||(12722148-12722232)
chr7 (106-197)||(15083175-15083267)
chr7 (113-197)||(16908554-16908638)
chr7 (113-197)||(18277944-18278028)
chr7 (113-197)||(18281908-18281992)
chr7 (113-197)||(18424185-18424269)
chr7 (113-197)||(2833526-2833610)
chr7 (121-197)||(9752644-9752720)
chr7 (106-195)||(26291108-26291198)
chr7 (113-189)||(45171545-45171621)
chr7 (106-192)||(15213003-15213089)
chr7 (113-197)||(1860066-1860150)
chr7 (113-197)||(13919457-13919541)
chr7 (106-158)||(25928409-25928461)
chr7 (106-156)||(20486733-20486783)
chr7 (121-197)||(9752728-9752804)
chr7 (121-197)||(13891879-13891955)
chr7 (121-158)||(39268450-39268487)
chr7 (121-197)||(7520353-7520429)
chr7 (121-197)||(10607457-10607533)
chr7 (121-197)||(13891496-13891572)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (106-197)||(30145733-30145824)
chr4 (106-197)||(24048422-24048513)
chr4 (106-197)||(15533169-15533260)
chr4 (113-197)||(17052490-17052574)
chr4 (106-197)||(18211554-18211645)
chr4 (106-197)||(22634964-22635055)
chr4 (106-197)||(36036902-36036993)
chr4 (112-197)||(28384801-28384886)
chr4 (113-197)||(20158492-20158576)
chr4 (113-197)||(20163943-20164027)
chr4 (106-182)||(12422908-12422984)
chr4 (113-197)||(20161168-20161252)
chr4 (106-197)||(13813870-13813961)
chr4 (106-197)||(13818358-13818449)
chr4 (113-197)||(4562818-4562902)
chr4 (113-197)||(5758500-5758584)
chr4 (113-197)||(9555019-9555103)
chr4 (113-197)||(14759036-14759120)
chr4 (113-197)||(14955804-14955888)
chr4 (113-197)||(15223496-15223580)
chr4 (121-197)||(24048521-24048597)
chr4 (113-197)||(33740786-33740870)
chr4 (106-197)||(49549120-49549212)
chr4 (113-197)||(12486221-12486305)
chr4 (121-197)||(13818457-13818533)
chr4 (113-197)||(25688392-25688476)
chr4 (106-197)||(23997004-23997094)
chr4 (113-197)||(38106897-38106980)
chr4 (113-184)||(17807017-17807088)
chr4 (115-198)||(38106780-38106866)
chr4 (115-183)||(40906323-40906391)
chr4 (106-197)||(631785-631876)
chr4 (121-197)||(13813969-13814045)
chr4 (121-197)||(13818541-13818617)
chr4 (121-197)||(22635063-22635139)
chr4 (106-147)||(10711825-10711866)
chr4 (106-147)||(10925595-10925636)
chr4 (113-158)||(14047307-14047352)
chr4 (121-197)||(12422815-12422891)
chr4 (106-147)||(27532752-27532793)
chr4 (164-197)||(40906422-40906455)
chr4 (121-197)||(17052582-17052658)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (106-197)||(13435768-13435859)
chr3 (106-197)||(10834979-10835070)
chr3 (106-197)||(12853401-12853492)
chr3 (106-197)||(14764833-14764924)
chr3 (106-197)||(23372581-23372672)
chr3 (106-197)||(51299483-51299574)
chr3 (106-197)||(3801920-3802011)
chr3 (106-197)||(16795453-16795544)
chr3 (106-197)||(54519547-54519638)
chr3 (112-197)||(41084-41169)
chr3 (112-197)||(8928911-8928996)
chr3 (113-197)||(11301710-11301794)
chr3 (106-197)||(9532208-9532299)
chr3 (113-197)||(5219797-5219881)
chr3 (106-197)||(18899400-18899494)
chr3 (113-197)||(19774148-19774232)
chr3 (106-197)||(20249887-20249978)
chr3 (106-197)||(29545976-29546067)
chr3 (113-197)||(7108188-7108272)
chr3 (113-197)||(7112123-7112207)
chr3 (113-197)||(11068563-11068647)
chr3 (113-197)||(11167138-11167222)
chr3 (113-197)||(15616127-15616211)
chr3 (113-197)||(22320079-22320163)
chr3 (113-197)||(22335134-22335218)
chr3 (113-197)||(28948411-28948495)
chr3 (113-197)||(55021326-55021410)
chr3 (113-197)||(4108834-4108918)
chr3 (113-197)||(4112683-4112767)
chr3 (113-189)||(11853664-11853740)
chr3 (113-197)||(14664375-14664459)
chr3 (113-197)||(14667539-14667623)
chr3 (106-197)||(30064334-30064426)
chr3 (113-197)||(14497898-14497981)
chr3 (113-197)||(16751946-16752030)
chr3 (106-192)||(11912382-11912468)
chr3 (115-197)||(15564801-15564883)
chr3 (106-195)||(18933393-18933483)
chr3 (113-197)||(12337206-12337290)
chr3 (112-184)||(16326085-16326158)
chr3 (113-189)||(15963455-15963531)
chr3 (113-189)||(15967379-15967455)
chr3 (113-189)||(15971303-15971379)
chr3 (106-184)||(12304136-12304215)
chr3 (115-196)||(15555586-15555670)
chr3 (106-197)||(38312895-38312985)
chr3 (106-192)||(16840241-16840327)
chr3 (113-197)||(15463828-15463912)
chr3 (106-156)||(14670017-14670067)
chr3 (106-156)||(14681541-14681591)
chr3 (106-158)||(23173286-23173338)
chr3 (147-197)||(17348806-17348856)
chr3 (106-147)||(4590198-4590239)
chr3 (106-147)||(8491770-8491811)
chr3 (106-147)||(17318547-17318588)
chr3 (121-197)||(12853500-12853576)
chr3 (149-192)||(51608602-51608645)
chr3 (106-147)||(14068100-14068141)
chr3 (121-197)||(8929004-8929080)
chr3 (121-197)||(17348864-17348940)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (106-197)||(29533837-29533928)
chr1 (106-197)||(22132136-22132227)
chr1 (106-197)||(32649017-32649108)
chr1 (113-197)||(33795983-33796067)
chr1 (106-197)||(16370875-16370966)
chr1 (106-197)||(20439190-20439281)
chr1 (113-197)||(1009212-1009296)
chr1 (113-197)||(1926840-1926924)
chr1 (113-197)||(16376860-16376944)
chr1 (113-197)||(20925854-20925938)
chr1 (106-195)||(20230176-20230266)
chr1 (113-197)||(41389709-41389793)
chr1 (113-197)||(39245215-39245297)
chr1 (113-197)||(39248770-39248852)
chr1 (113-197)||(52634218-52634302)
chr1 (106-189)||(41801316-41801399)
chr1 (106-147)||(21406253-21406294)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (106-197)||(33887-33978)
scaffold0080 (106-151)||(28468-28513)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (104-197)||(23427776-23427869)
chr8 (106-197)||(8729647-8729738)
chr8 (106-197)||(27942723-27942814)
chr8 (112-197)||(8415020-8415105)
chr8 (112-197)||(11774246-11774331)
chr8 (107-197)||(363218-363308)
chr8 (113-197)||(14399137-14399221)
chr8 (106-197)||(21409850-21409942)
chr8 (106-197)||(21804342-21804434)
chr8 (113-197)||(21829505-21829589)
chr8 (113-197)||(21974228-21974312)
chr8 (113-197)||(22110551-22110635)
chr8 (113-197)||(43250152-43250236)
chr8 (113-197)||(21978338-21978422)
chr8 (113-182)||(44385878-44385947)
chr8 (113-189)||(18864149-18864225)
chr8 (113-189)||(30941609-30941685)
chr8 (112-192)||(42560925-42561005)
chr8 (106-197)||(23913215-23913306)
chr8 (106-186)||(21328527-21328607)
chr8 (106-147)||(21386159-21386200)
chr8 (112-147)||(21968036-21968071)
chr8 (112-147)||(21980876-21980911)
chr8 (112-147)||(21985859-21985894)
chr8 (112-147)||(22000822-22000857)
chr8 (121-197)||(23427692-23427768)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (106-198)||(28372119-28372211)
chr5 (106-197)||(37600046-37600137)
chr5 (113-197)||(38146463-38146547)
chr5 (106-197)||(22120629-22120720)
chr5 (106-197)||(41878689-41878780)
chr5 (112-197)||(33473975-33474060)
chr5 (106-197)||(19510412-19510503)
chr5 (106-197)||(22335432-22335523)
chr5 (106-197)||(22338962-22339053)
chr5 (116-197)||(23113450-23113531)
chr5 (113-197)||(15238162-15238246)
chr5 (113-197)||(24768607-24768691)
chr5 (123-197)||(22108503-22108577)
chr5 (113-197)||(20294464-20294548)
chr5 (114-197)||(20912298-20912381)
chr5 (113-194)||(18354750-18354831)
chr5 (112-189)||(40727442-40727519)
chr5 (113-197)||(10751767-10751851)
chr5 (113-189)||(19474217-19474293)
chr5 (113-197)||(11219505-11219589)
chr5 (113-197)||(11224091-11224175)
chr5 (113-197)||(11227913-11227997)
chr5 (113-197)||(11226107-11226191)
chr5 (113-197)||(11229903-11229987)
chr5 (104-192)||(36459503-36459591)
chr5 (106-156)||(22749152-22749202)
chr5 (121-197)||(22108585-22108661)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (106-197)||(3554-3645)
scaffold0544 (137-197)||(1-61)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (106-197)||(109551-109642)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (106-197)||(224180-224271)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (106-197)||(4475745-4475836)
chr6 (106-197)||(12941171-12941262)
chr6 (112-197)||(23955319-23955404)
chr6 (113-197)||(22075435-22075519)
chr6 (106-197)||(27222782-27222873)
chr6 (106-197)||(28290932-28291023)
chr6 (113-197)||(14470831-14470915)
chr6 (113-197)||(27416572-27416656)
chr6 (113-197)||(31479507-31479591)
chr6 (106-197)||(23537931-23538022)
chr6 (113-197)||(8242362-8242446)
chr6 (113-197)||(11565351-11565435)
chr6 (113-197)||(11716985-11717069)
chr6 (113-197)||(12620378-12620462)
chr6 (113-197)||(23988253-23988337)
chr6 (113-197)||(27555490-27555573)
chr6 (113-197)||(16758665-16758749)
chr6 (113-197)||(22861705-22861789)
chr6 (113-197)||(22947617-22947701)
chr6 (113-197)||(22951573-22951657)
chr6 (113-197)||(23870061-23870145)
chr6 (113-197)||(23874017-23874101)
chr6 (113-189)||(23393599-23393675)
chr6 (106-197)||(23400627-23400719)
chr6 (113-189)||(23413507-23413583)
chr6 (107-192)||(34297811-34297896)
chr6 (106-192)||(1254114-1254200)
chr6 (113-174)||(19869160-19869221)
chr6 (113-188)||(16622796-16622869)
chr6 (113-197)||(25737842-25737926)
chr6 (113-197)||(2076236-2076320)
chr6 (122-197)||(16244978-16245053)
chr6 (121-194)||(23537857-23537923)
chr6 (106-147)||(18918618-18918659)
chr6 (121-197)||(23537769-23537845)
chr6 (120-197)||(20078559-20078639)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (106-197)||(10686284-10686375)
chr2 (106-197)||(19663595-19663686)
chr2 (106-197)||(20260207-20260298)
chr2 (106-197)||(9240624-9240715)
chr2 (106-197)||(21074545-21074636)
chr2 (112-197)||(37378986-37379071)
chr2 (106-197)||(6481734-6481825)
chr2 (106-197)||(6485201-6485292)
chr2 (113-197)||(10103341-10103425)
chr2 (113-197)||(12902651-12902735)
chr2 (113-197)||(24630092-24630176)
chr2 (113-197)||(24645101-24645185)
chr2 (113-197)||(24647044-24647128)
chr2 (113-197)||(24647877-24647961)
chr2 (113-197)||(30346702-30346786)
chr2 (114-197)||(31343867-31343950)
chr2 (113-189)||(27381038-27381114)
chr2 (113-189)||(27385008-27385084)
chr2 (113-197)||(27600321-27600405)
chr2 (113-189)||(41532487-41532563)
chr2 (106-158)||(9783983-9784035)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (106-197)||(150-241)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (106-197)||(25605-25696)
scaffold0124 (106-197)||(37570-37661)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (106-192)||(10859-10945)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (113-197)||(865-949)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (106-197)||(5192-5283)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (106-197)||(8777-8868)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (113-195)||(14796-14878)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (113-197)||(5575-5659)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (113-197)||(11104-11188)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (113-197)||(70705-70789)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (106-197)||(18773-18864)
scaffold0327 (121-162)||(18724-18765)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (113-197)||(11001-11085)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (113-197)||(68600-68684)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (113-197)||(60370-60454)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (113-197)||(11727-11811)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (113-197)||(34172-34256)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (113-197)||(115390-115473)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (113-189)||(15619-15695)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (106-192)||(4076-4162)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (113-194)||(8530-8611)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (113-197)||(5775-5859)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (113-197)||(6365-6448)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (138-197)||(641-700)
scaffold1873 (121-197)||(557-633)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (106-197)||(6998-7089)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (106-197)||(74369-74460)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (116-186)||(10759-10828)
scaffold0040 (116-186)||(21878-21947)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (106-148)||(37240-37282)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (106-158)||(10756-10808)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (112-192)||(163611-163691)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (122-197)||(54655-54730)
[»] scaffold0380 (1 HSPs)
scaffold0380 (106-147)||(3974-4015)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (106-147)||(23975-24016)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (106-147)||(62877-62918)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (127-158)||(21390-21421)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (155-197)||(7749-7791)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (155-197)||(11706-11748)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (128-186)||(12919-12977)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (120-197)||(7813-7893)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (106-147)||(37235-37276)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 51)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 834083 - 834174
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  834083 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 834174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 1199263 - 1199354
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1199263 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 1199354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 838171 - 838262
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  838171 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 838262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 1203351 - 1203442
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1203351 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 1203442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13891671 - 13891580
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13891671 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13891580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 16110013 - 16110104
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16110013 atgatggttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 16110104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14420828 - 14420737
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14420828 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 14420737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15166291 - 15166200
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15166291 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15166200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18871338 - 18871247
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18871338 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18871247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 10897934 - 10898025
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10897934 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttttatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10898025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11660323 - 11660232
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11660323 atgatggttatgttaagttggtaagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaattatgatgt 11660232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13892054 - 13891963
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13892054 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttttgcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13891963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41283680 - 41283595
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  41283680 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 41283595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 146541 - 146450
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  146541 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctactcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 146450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 10607358 - 10607449
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10607358 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10607449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16005045 - 16004954
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16005045 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 16004954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 39268351 - 39268442
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39268351 atgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 39268442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 197
Target Start/End: Original strand, 9752546 - 9752636
Alignment:
Q  107 tgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9752546 tgatggttatgttaagttgataagttgccttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18606379 - 18606301
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattat 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18606379 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattat 18606301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39721237 - 39721145
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39721237 atgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39721145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16582462 - 16582371
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16582462 atgatggttatgataagttgataagttgtctttttttcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 16582371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Original strand, 2531375 - 2531460
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2531375 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataaagagatgttttatgaataattattattatgaattaatgatgt 2531460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 7520260 - 7520345
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaat-aattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  7520260 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataaattattattatgaaatgatgatgt 7520345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 11302348 - 11302267
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaa 187  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11302348 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtaatgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaa 11302267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31759 - 31675
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31759 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 72416 - 72500
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  72416 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 72500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 76525 - 76609
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  76525 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 76609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 12706167 - 12706251
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12706167 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12706251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12713574 - 12713490
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12713574 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12713490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12717321 - 12717237
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12717321 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12717237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12722232 - 12722148
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12722232 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12722148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15083267 - 15083175
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaag-ttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15083267 atgatggttatgttaaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15083175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 16908554 - 16908638
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16908554 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16908638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18278028 - 18277944
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18278028 ttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18277944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18281992 - 18281908
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18281992 ttatgttaaattgataagttgtcttttattgatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18281908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18424269 - 18424185
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18424269 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 18424185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 2833526 - 2833610
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2833526 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgttcaatgaataattattattatgaattaatgatgt 2833610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 9752644 - 9752720
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9752644 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 9752720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26291198 - 26291108
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgat 195  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26291198 atgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaattaatgat 26291108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 45171545 - 45171621
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45171545 ttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 45171621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15213089 - 15213003
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15213089 atgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 15213003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 1860066 - 1860150
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  1860066 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 1860150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 13919457 - 13919541
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  13919457 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 13919541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Original strand, 25928409 - 25928461
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25928409 atgatggttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgctaatga 25928461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20486783 - 20486733
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20486783 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 20486733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 9752728 - 9752804
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || | || |||||||| ||||| |||||||    
T  9752728 agttgataagttatcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatattattacgaattaatgatgt 9752804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13891955 - 13891879
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| | || | |||||| ||||| |||||||    
T  13891955 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttgatggagaaatgttattacgaattaatgatgt 13891879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 158
Target Start/End: Original strand, 39268450 - 39268487
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39268450 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatga 39268487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 7520353 - 7520429
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  7520353 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 7520429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 10607457 - 10607533
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  10607457 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 10607533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13891572 - 13891496
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  13891572 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 13891496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30145824 - 30145733
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30145824 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 30145733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 24048422 - 24048513
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24048422 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15533260 - 15533169
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15533260 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 15533169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 17052490 - 17052574
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17052490 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 17052574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18211645 - 18211554
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18211645 atgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18211554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 22634964 - 22635055
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634964 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22635055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36036993 - 36036902
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36036993 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttcatgaataattattattatgaaatgatgatgt 36036902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28384886 - 28384801
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28384886 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 28384801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 20158492 - 20158576
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20158492 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20158576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 20163943 - 20164027
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20163943 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20164027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12422984 - 12422908
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12422984 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 12422908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 20161168 - 20161252
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20161168 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 20161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 13813870 - 13813961
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13813870 atgatggttatgttaagttgataagttgccttttgttcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13813961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 13818358 - 13818449
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13818358 atgatggttatgttaagttgataagttgcattttattcatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 4562818 - 4562902
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4562818 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4562902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 5758500 - 5758584
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5758500 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 5758584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9555103 - 9555019
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9555103 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 9555019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 14759036 - 14759120
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14759036 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14759120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 14955804 - 14955888
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14955804 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14955888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15223580 - 15223496
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15223580 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15223496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 24048521 - 24048597
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24048521 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgttaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 24048597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33740870 - 33740786
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33740870 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 33740786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 49549120 - 49549212
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataa-gttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  49549120 atgatggttatgttaagttgataccgttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 49549212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12486305 - 12486221
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12486305 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12486221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 13818457 - 13818533
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13818457 agttgataagttgtcttttatccatgaatttataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13818533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25688476 - 25688392
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25688476 ttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 25688392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 23997004 - 23997094
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23997004 atgatggttatgt-aagttgataagttctcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataatcattattatgaattaatgatgt 23997094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38106980 - 38106897
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38106980 ttatgttaagttgataaattgtctttcattcatgagttgctaatg-aatgtttgatgaagaattattattatgaattaatgatgt 38106897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17807088 - 17807017
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattat 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17807088 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattat 17807017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38106866 - 38106780
Alignment:
Q  115 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatta---tgaattgatgatgtc 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  38106866 atgttaagttgttaagttgtcttctatttatgagttgctaatgagatgttttatgaagaattattattagggtgaattgatgatgtc 38106780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40906391 - 40906323
Alignment:
Q  115 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatta 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40906391 atgttaagttgttaagttgtcttctattcataagttgctaatgaaatgttttatgaagaattattatta 40906323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 631785 - 631876
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  631785 atgatggttatgttaagttgataagttgtattctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 631876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 13813969 - 13814045
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  13813969 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 13814045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 13818541 - 13818617
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  13818541 agttgataagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 13818617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 22635063 - 22635139
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  22635063 agttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 22635139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10711866 - 10711825
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10711866 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10711825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10925636 - 10925595
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10925636 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 10925595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14047352 - 14047307
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  14047352 ttatgttaagttgataagttgtattttattcatgagttgttaatga 14047307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12422891 - 12422815
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| | || | |||||| ||||| |||||||    
T  12422891 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttgatggagaaatgttattacgaattaatgatgt 12422815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27532793 - 27532752
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27532793 atgatggttatgttaagttgataagttgccttctattcatga 27532752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40906455 - 40906422
Alignment:
Q  164 ttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40906455 ttgatgaagaattattattatgaattgatgatgt 40906422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 17052582 - 17052658
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  17052582 agttgttaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 17052658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13435859 - 13435768
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13435859 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 13435768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 10834979 - 10835070
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10834979 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaatttctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10835070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 12853401 - 12853492
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12853401 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 12853492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 14764833 - 14764924
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14764833 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 14764924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 23372581 - 23372672
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23372581 atgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 23372672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 51299574 - 51299483
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51299574 atgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 51299483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3802011 - 3801920
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3802011 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 3801920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16795544 - 16795453
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16795544 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 16795453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 54519638 - 54519547
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  54519638 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 54519547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41169 - 41084
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41169 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgaggaataattattattatgaaatgatgatgt 41084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Original strand, 8928911 - 8928996
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8928911 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatggactgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 8928996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 11301710 - 11301794
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11301710 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 11301794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9532299 - 9532208
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9532299 atgatggttatgttgagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 9532208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5219881 - 5219797
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5219881 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagacgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 5219797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18899494 - 18899400
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgc---taatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18899494 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaataatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 18899400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19774232 - 19774148
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19774232 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 19774148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 20249887 - 20249978
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20249887 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatattcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 20249978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 29545976 - 29546067
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29545976 atgatggttgtgttaagttgataagttgtcttttagtcatgaattgctaatggaaggtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 29546067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7108272 - 7108188
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7108272 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 7108188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7112207 - 7112123
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7112207 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 7112123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11068647 - 11068563
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11068647 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11068563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 11167138 - 11167222
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11167138 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11167222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15616211 - 15616127
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15616211 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15616127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22320163 - 22320079
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22320163 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22320079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22335218 - 22335134
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22335218 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22335134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28948495 - 28948411
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28948495 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 28948411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55021410 - 55021326
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55021410 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 55021326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 4108834 - 4108918
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4108834 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4108918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 4112683 - 4112767
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4112683 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatatttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 4112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11853740 - 11853664
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11853740 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcacgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaatt 11853664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14664459 - 14664375
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  14664459 ttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaattaatgatgt 14664375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14667623 - 14667539
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  14667623 ttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatatttatgaattaatgatgt 14667539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30064426 - 30064334
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30064426 atgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaattaatgatgt 30064334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14497981 - 14497898
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14497981 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14497898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 16751946 - 16752030
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16751946 ttatgttaagttgataagttatcttttattcatcaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16752030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11912468 - 11912382
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11912468 atgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 11912382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15564883 - 15564801
Alignment:
Q  115 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15564883 atgttaagttgatgtgttgtcttctgttcatgagttgctaatgaaatgttttatgaagaattattattatgaattgatgatgt 15564801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Original strand, 18933393 - 18933483
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgat 195  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18933393 atgatggttatgttaaagttgataagttgtattttattcatgaattaataatgagatgtttgacgaataattattattatgaattaatgat 18933483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12337290 - 12337206
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat-gaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12337290 ttatgttaaattgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 12337206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Original strand, 16326085 - 16326158
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataat-tattattat 184  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  16326085 gttatgtcaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaattatatattattat 16326158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15963531 - 15963455
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15963531 ttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15963455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15967455 - 15967379
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15967455 ttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15967379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15971379 - 15971303
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15971379 ttatgttaaattaataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15971303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12304215 - 12304136
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataat-tattattat 184  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  12304215 atgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaattatatattattat 12304136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15555670 - 15555586
Alignment:
Q  115 atgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatt---atgaattgatgatg 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  15555670 atgttaagttgttaagttgtcttatattcatgagttgctaatgagatgtttgatgaagaattattattaggatgaattgatgatg 15555586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 38312895 - 38312985
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat-gaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38312895 atgatggttatgttaagtttataagttgtcttttattcatgaa-tgctaatgggaatgttcgatgaat-attattattatgaaatgatgatgt 38312985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Original strand, 16840241 - 16840327
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16840241 atgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagattcttgctgaataattattgttatgaattgat 16840327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15463912 - 15463828
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  15463912 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 15463828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14670067 - 14670017
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14670067 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14670017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14681591 - 14681541
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14681591 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataat 14681541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23173338 - 23173286
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  23173338 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgagttgttaatga 23173286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 197
Target Start/End: Original strand, 17348806 - 17348856
Alignment:
Q  147 aattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17348806 aattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 17348856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 4590198 - 4590239
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4590198 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 4590239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 8491770 - 8491811
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8491770 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 8491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 17318547 - 17318588
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17318547 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 17318588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 12853500 - 12853576
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  12853500 agttgttaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgtttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 12853576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 192
Target Start/End: Original strand, 51608602 - 51608645
Alignment:
Q  149 ttgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51608602 ttgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 51608645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 14068100 - 14068141
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14068100 atgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 14068141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 8929004 - 8929080
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  8929004 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 8929080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 17348864 - 17348940
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  17348864 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatatttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 17348940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29533928 - 29533837
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29533928 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 29533837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 22132136 - 22132227
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132136 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22132227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32649108 - 32649017
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32649108 atgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 32649017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33796067 - 33795983
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33796067 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgatatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 33795983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16370966 - 16370875
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16370966 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 16370875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 20439190 - 20439281
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20439190 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 20439281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1009296 - 1009212
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1009296 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 1009212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 1926840 - 1926924
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1926840 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 1926924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 16376860 - 16376944
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16376860 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16376944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 20925854 - 20925938
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20925854 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 20925938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Original strand, 20230176 - 20230266
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgat 195  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20230176 atgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattcatgaattaataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgat 20230266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 41389709 - 41389793
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41389709 ttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 41389793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 39245215 - 39245297
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39245215 ttatgttaagttgataagtt--cttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39245297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 39248770 - 39248852
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39248770 ttatgttaagttgataagtt--cttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 39248852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 52634302 - 52634218
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52634302 ttatgttaaattgataagttattttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 52634218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 189
Target Start/End: Original strand, 41801316 - 41801399
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || | || |||||||| |||||    
T  41801316 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatattattacgaatt 41801399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21406294 - 21406253
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21406294 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21406253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33978 - 33887
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33978 atgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 33887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 28513 - 28468
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 151  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28513 atgatcgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattg 28468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 82; Significance: 6e-39; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23427869 - 23427776
Alignment:
Q  104 taatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23427869 taatgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattataaattgatgatgt 23427776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 8729647 - 8729738
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8729647 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8729738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 27942723 - 27942814
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27942723 atgatggttatgataagttaataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 27942814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Original strand, 8415020 - 8415105
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8415020 gttattttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 8415105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11774331 - 11774246
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11774331 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 11774246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 363308 - 363218
Alignment:
Q  107 tgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  363308 tgatggttatgttaagatgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 363218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 14399137 - 14399221
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  14399137 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaattaatgatgt 14399221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21409942 - 21409850
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21409942 atgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21409850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21804434 - 21804342
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21804434 atgatggttatgttaaagttgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21804342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 21829505 - 21829589
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21829505 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21829589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 21974228 - 21974312
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21974228 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21974312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22110635 - 22110551
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22110635 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22110551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43250236 - 43250152
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43250236 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 43250152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 21978338 - 21978422
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21978338 ttatgttatattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 21978422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 182
Target Start/End: Original strand, 44385878 - 44385947
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattatt 182  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44385878 ttatgttaacttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattatt 44385947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 18864149 - 18864225
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18864149 ttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 18864225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 30941609 - 30941685
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  30941609 ttatgttaaattgataagttgtcttttattcataaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 30941685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 192
Target Start/End: Original strand, 42560925 - 42561005
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42560925 gttatgttaagttgacaagttgttccttattcatgcattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 42561005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23913306 - 23913215
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  23913306 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggacaaatgttattacgaattaatgatgt 23913215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21328607 - 21328527
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatga 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  21328607 atgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatgcttgttgaataattattgttatga 21328527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21386200 - 21386159
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21386200 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 147
Target Start/End: Original strand, 21968036 - 21968071
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21968036 gttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21968071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 147
Target Start/End: Original strand, 21980876 - 21980911
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21980876 gttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21980911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 147
Target Start/End: Original strand, 21985859 - 21985894
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21985859 gttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 21985894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 147
Target Start/End: Original strand, 22000822 - 22000857
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22000822 gttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 22000857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23427768 - 23427692
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  23427768 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 23427692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 198
Target Start/End: Original strand, 28372119 - 28372211
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgtc 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28372119 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgtc 28372211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 37600046 - 37600137
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37600046 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 37600137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 38146463 - 38146547
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38146463 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 38146547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 22120629 - 22120720
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22120629 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 22120720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 41878689 - 41878780
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  41878689 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttatttatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 41878780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Original strand, 33473975 - 33474060
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33473975 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 33474060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19510503 - 19510412
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19510503 atgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 19510412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22335523 - 22335432
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22335523 atgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaataatgatgt 22335432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22339053 - 22338962
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22339053 atgatggttatgttacgttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaataatgatgt 22338962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 197
Target Start/End: Original strand, 23113450 - 23113531
Alignment:
Q  116 tgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23113450 tgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatggaatgatgatgt 23113531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 15238162 - 15238246
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15238162 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 15238246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 24768607 - 24768691
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24768607 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaattaatgatgt 24768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Original strand, 22108503 - 22108577
Alignment:
Q  123 ttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22108503 ttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 22108577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20294548 - 20294464
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20294548 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 20294464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Original strand, 20912298 - 20912381
Alignment:
Q  114 tatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20912298 tatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaattaatgatgt 20912381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18354831 - 18354750
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatga 194  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18354831 ttatgttaagttgataaattgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaattaatga 18354750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 189
Target Start/End: Original strand, 40727442 - 40727519
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40727442 gttatgttaagttgataagttatcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaatt 40727519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10751851 - 10751767
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10751851 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcaagaaatgataatgagatggttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 10751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 19474217 - 19474293
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19474217 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 19474293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11219589 - 11219505
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  11219589 ttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11219505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11224175 - 11224091
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  11224175 ttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11224091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11227997 - 11227913
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  11227997 ttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11227913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11226191 - 11226107
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  11226191 ttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11226107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11229987 - 11229903
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  11229987 ttatgttaaattgataagctgtcttttattcatgaattgatcatgagatgtttgatgaataagtactattacgaattaatgatgt 11229903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36459591 - 36459503
Alignment:
Q  104 taatgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36459591 taatgatgattatgttaagttgataagttgttccttattcatgttttgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 36459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22749202 - 22749152
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  22749202 atgatggttatgttaagttgataagttgtcctatattcatgagttgttaat 22749152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Original strand, 22108585 - 22108661
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  22108585 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 22108661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 3554 - 3645
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3554 atgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 3645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 197
Target Start/End: Original strand, 1 - 61
Alignment:
Q  137 tttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1 tttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 109642 - 109551
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  109642 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 109551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 224180 - 224271
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  224180 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 224271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4475836 - 4475745
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4475836 atgattgttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 4475745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12941262 - 12941171
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12941262 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctgatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 12941171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23955404 - 23955319
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23955404 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgttaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 23955319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 22075435 - 22075519
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22075435 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 22075519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27222873 - 27222782
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27222873 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgttcgatgaataactattattatgaaatgatgatgt 27222782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 28290932 - 28291023
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28290932 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcataaattgctaattgaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 28291023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14470915 - 14470831
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14470915 ttatgttaggttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 14470831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 27416572 - 27416656
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27416572 ttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 27416656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 31479507 - 31479591
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31479507 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31479591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23538022 - 23537931
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538022 atgatggttatgttaagttgataagttgtcccttattcgtgaattgttaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 23537931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8242446 - 8242362
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8242446 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 8242362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11565435 - 11565351
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11565435 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11565351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 11716985 - 11717069
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11716985 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11717069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 12620378 - 12620462
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12620378 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12620462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23988337 - 23988253
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23988337 ttatattaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23988253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27555573 - 27555490
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27555573 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 27555490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16758749 - 16758665
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16758749 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatagtgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22861789 - 22861705
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22861789 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattatgattatgaattaatgatgt 22861705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22947701 - 22947617
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22947701 ttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22947617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22951657 - 22951573
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22951657 ttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 22951573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23870145 - 23870061
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23870145 ttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23870061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23874101 - 23874017
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23874101 ttatgttaaattgataagttgtcttttattagtgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 23874017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23393675 - 23393599
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23393675 ttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 23393599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23400719 - 23400627
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaa-gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  23400719 atgatggttatgttaaagttgataagttgtcctttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaagtaatgatgt 23400627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23413583 - 23413507
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  23413583 ttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 23413507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 192
Target Start/End: Original strand, 34297811 - 34297896
Alignment:
Q  107 tgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34297811 tgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 34297896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1254200 - 1254114
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1254200 atgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgttaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 1254114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19869221 - 19869160
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataa 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19869221 ttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataa 19869160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16622869 - 16622796
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaat 188  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16622869 ttatgttaagttgataagtt--cttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaatgattatcattatgaat 16622796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25737926 - 25737842
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  25737926 ttatgctaagttgataagttgtcccttattcatgtattgctaatgagatgcttgctgaataattactgttatgaattgataatgt 25737842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2076320 - 2076236
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  2076320 ttatgttaagttgataagttgttttttattcatgaattgataatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 2076236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16245053 - 16244978
Alignment:
Q  122 gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  16245053 gttgataagttgtcatatattcataagttgttaatgaaatgttatatgaagaattataattataaattgatgatgt 16244978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23537923 - 23537857
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatga 194  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23537923 agttgctaagttgtcttttattcatgaattgctaatga-------gatgaatatttattattatgaactgatga 23537857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 18918618 - 18918659
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18918618 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 18918659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23537845 - 23537769
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| || | |||| |||||| ||||| |||||||    
T  23537845 agttgctaagttgtcttcaattcatgatttgctaatgaaatgcttggtggagaatttttattacgaattaatgatgt 23537769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Original strand, 20078559 - 20078639
Alignment:
Q  120 aagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatga---attgatgatgt 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||   |||||||||||    
T  20078559 aagttgttaagttgtcttctatacatgagttgttaatgaagtgttttatgaagaattatgattatgatgaattgatgatgt 20078639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 10686284 - 10686375
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10686284 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 10686375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 19663595 - 19663686
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19663595 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 19663686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20260298 - 20260207
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20260298 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 20260207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9240715 - 9240624
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9240715 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 9240624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 21074545 - 21074636
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21074545 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaaaaaaatgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 21074636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37379071 - 37378986
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  37379071 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaaaaattattattatgaaatgatgatgt 37378986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6481825 - 6481734
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6481825 atgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 6481734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6485292 - 6485201
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6485292 atgatggttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgctaatggaacgtttgatgaataattattattatgaaatgatgatgt 6485201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 10103341 - 10103425
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10103341 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 10103425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 12902651 - 12902735
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12902651 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 12902735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 24630092 - 24630176
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24630092 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24645185 - 24645101
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24645185 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24645101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24647128 - 24647044
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24647128 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24647044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24647961 - 24647877
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24647961 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattggtaatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 24647877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 30346702 - 30346786
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30346702 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 30346786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31343950 - 31343867
Alignment:
Q  114 tatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31343950 tatgttaagttgataagctgtcttttattcatgaattgataaagagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 31343867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 27381038 - 27381114
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381038 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 27381114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 27385008 - 27385084
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27385008 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaatt 27385084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27600405 - 27600321
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27600405 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattgttatgaattaatgatgt 27600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 41532487 - 41532563
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41532487 ttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 41532563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9784035 - 9783983
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9784035 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatga 9783983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 241 - 150
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  241 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgtaatgatgatgt 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 25605 - 25696
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25605 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgtgatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 25696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 37570 - 37661
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37570 atgatggttatgttaagttgatacgttgtcttttattcatgtattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 37661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Original strand, 10859 - 10945
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10859 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatggaatgtttgatgaataattattattatgaaatgat 10945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 73; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 865 - 949
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  865 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5283 - 5192
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5283 atgatggttatgttaagttgataagttgtctattattcatgaaatgctaatggaatgtttgatgaataattattatgatgaattgatgatgt 5192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 8777 - 8868
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  8777 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattataaaatgatgatgt 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14878 - 14796
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14878 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgat 14796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 5575 - 5659
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  5575 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattatgaattaatgatgt 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 11104 - 11188
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11104 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattaatattatgaattaatgatgt 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 70789 - 70705
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  70789 ttatgttaagttgataggttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 70705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 68; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18864 - 18773
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18864 atgatggttatgttaagttgataagttgtcatttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataattgttattataaattgatgatgt 18773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18765 - 18724
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatg 162  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18765 agttgctaagttgtcttctattcatgagttgctaatgaaatg 18724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11085 - 11001
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11085 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 11001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 68600 - 68684
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  68600 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 68684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 60370 - 60454
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  60370 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 60454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 65; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11811 - 11727
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11811 ttatgttaagttgatatgttgtcttttatacatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 11727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 34172 - 34256
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34172 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgatgatgagatgtttgatgaataattattattatgaattaatgatgt 34256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 115390 - 115473
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  115390 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtatttttatgaattgatgatgt 115473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 189
Target Start/End: Original strand, 15619 - 15695
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaatt 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15619 ttatgttaaattgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgtttgatgaataagtattattacgaatt 15695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 55; Significance: 8e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4162 - 4076
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4162 atgatggttatgttaagttgataagttgttccttattcatgtattgctaatgagatggttgatgaataattattgttatgaattgat 4076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8611 - 8530
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatga 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8611 ttatgttaagttaataagttgtcttttattcatgaaatgataatgagatgtttgatgaatgattattattattaattaatga 8530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5859 - 5775
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaat-gaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5859 ttatgttaagttgata-gttgtcttttattcatgaattgataattgagacgtttgatgaataagtattattatgaattgatgatgt 5775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 197
Target Start/End: Original strand, 6365 - 6448
Alignment:
Q  113 ttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6365 ttatgttaaattgataagttgtcttttattaatgaattgataatgagatg-ttgatgaataactattattatgaattaatgatgt 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 700 - 641
Alignment:
Q  138 ttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  700 ttatccatgaattgataatgagatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 557
Alignment:
Q  121 agttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  633 agttgataagttgtcttttattcatgaatcgataatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 6998 - 7089
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||| || | |||||| ||||| |||||||    
T  6998 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgataatgagatgcttagtgaagaaatgttattacgaattaatgatgt 7089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 197
Target Start/End: Original strand, 74369 - 74460
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || | || | |||||| ||||| |||||||    
T  74369 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgagttgctaatgagatgcttggtggagaaatgttattacgaattaatgatgt 74460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10828 - 10759
Alignment:
Q  116 tgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatga 186  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  10828 tgttaagttgctaagtggtcttttatccatgagttgctaatgaagtgttt-atgaataattcttattatga 10759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21947 - 21878
Alignment:
Q  116 tgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatga 186  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  21947 tgttaagttgctaagtggtcttttatccatgagttgctaatgaagtgttt-atgaataattcttattatga 21878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 148
Target Start/End: Original strand, 37240 - 37282
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37240 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaa 37282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 10808 - 10756
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatga 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  10808 atgatggttatgttaagttgataagttgtattttattcatgaatagataatga 10756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 192
Target Start/End: Original strand, 163611 - 163691
Alignment:
Q  112 gttatgttaagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgat 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||||||||  ||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  163611 gttatgttaagttgataacttgttccttattcatgttttggtaatgagatgcttgctgaataattattgttatgaattgat 163691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 54730 - 54655
Alignment:
Q  122 gttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| | ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  54730 gttgataagttgtcgtttattcataagttgttaatgaagtattatatgaagaattattattattaattgatgatgt 54655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0380 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0380
Description:

Target: scaffold0380; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4015 - 3974
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4015 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 23975 - 24016
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23975 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 24016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 62877 - 62918
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  62877 atgatggttatgttaagttgataagttgtcttctattcatga 62918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 158
Target Start/End: Original strand, 21390 - 21421
Alignment:
Q  127 taagttgtcttttattcatgaattgctaatga 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21390 taagttgtcttttattcatgaattgctaatga 21421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7791 - 7749
Alignment:
Q  155 atgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7791 atgaaatgttttatgaggaattattattatgaattgatgatgt 7749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 197
Target Start/End: Original strand, 11706 - 11748
Alignment:
Q  155 atgaaatgtttgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11706 atgaaatgttttatgaggaattattattatgaattgatgatgt 11748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12977 - 12919
Alignment:
Q  128 aagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtttgatgaataattattattatga 186  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12977 aagttgtcttctatacatgagttgttaatgaagtgtttaatgaagaattattattatga 12919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7893 - 7813
Alignment:
Q  120 aagttgataagttgtcttttattcatgaattgctaatgaaatgtt---tgatgaataattattattatgaattgatgatgt 197  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||   |||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  7893 aagttgttaagttgtcttctatacatgagttgttaatgaagtgttttatgatgaattatgattataatgaattgatgatgt 7813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 147
Target Start/End: Original strand, 37235 - 37276
Alignment:
Q  106 atgatagttatgttaagttgataagttgtcttttattcatga 147  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37235 atgatggttatgttaagtcgataagttgtcttctattcatga 37276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University