View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3804_high_19 (Length: 452)

Name: NF3804_high_19
Description: NF3804
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3804_high_19
NF3804_high_19
[»] chr3 (116 HSPs)
chr3 (23-444)||(39656524-39656947)
chr3 (23-444)||(11328790-11329210)
chr3 (23-421)||(16880146-16880546)
chr3 (15-444)||(3576253-3576687)
chr3 (23-444)||(17191539-17191965)
chr3 (23-444)||(12952962-12953388)
chr3 (15-421)||(17139531-17139938)
chr3 (49-444)||(14059066-14059462)
chr3 (15-438)||(47784578-47784990)
chr3 (23-444)||(9590583-9591003)
chr3 (135-444)||(12488664-12488975)
chr3 (54-441)||(12560092-12560482)
chr3 (50-382)||(30207278-30207613)
chr3 (23-444)||(17204698-17205105)
chr3 (85-438)||(14295442-14295797)
chr3 (20-444)||(17960134-17960562)
chr3 (23-438)||(15876072-15876484)
chr3 (50-445)||(11060859-11061256)
chr3 (85-422)||(14301087-14301424)
chr3 (23-443)||(38810839-38811256)
chr3 (87-415)||(14814653-14814983)
chr3 (73-437)||(55440733-55441091)
chr3 (23-292)||(11882044-11882313)
chr3 (71-444)||(14080507-14080884)
chr3 (87-421)||(54424035-54424369)
chr3 (44-444)||(4162051-4162454)
chr3 (50-422)||(17522742-17523115)
chr3 (72-400)||(3578133-3578461)
chr3 (50-421)||(17100676-17101047)
chr3 (50-421)||(17101361-17101732)
chr3 (210-444)||(34559897-34560133)
chr3 (46-292)||(13301318-13301564)
chr3 (46-292)||(13311974-13312220)
chr3 (196-444)||(6228624-6228874)
chr3 (87-419)||(12349429-12349761)
chr3 (50-438)||(35123700-35124090)
chr3 (87-418)||(50111941-50112272)
chr3 (87-438)||(14298425-14298778)
chr3 (87-438)||(14304052-14304405)
chr3 (154-418)||(31412289-31412554)
chr3 (154-412)||(50313219-50313478)
chr3 (191-444)||(41661563-41661818)
chr3 (86-422)||(8631812-8632148)
chr3 (43-417)||(43427358-43427734)
chr3 (234-444)||(1990800-1991012)
chr3 (50-444)||(33368780-33369157)
chr3 (154-346)||(15517728-15517921)
chr3 (50-422)||(17938596-17938966)
chr3 (50-179)||(48421843-48421972)
chr3 (50-231)||(14527932-14528114)
chr3 (90-418)||(317403-317729)
chr3 (50-422)||(16181800-16182170)
chr3 (90-422)||(22144165-22144497)
chr3 (191-421)||(10912908-10913139)
chr3 (90-418)||(16995954-16996280)
chr3 (247-412)||(11638389-11638554)
chr3 (87-422)||(6154221-6154556)
chr3 (306-421)||(14528121-14528236)
chr3 (197-393)||(19260839-19261035)
chr3 (90-418)||(19570584-19570909)
chr3 (90-422)||(13817537-13817864)
chr3 (23-182)||(34560130-34560278)
chr3 (174-338)||(4145791-4145954)
chr3 (90-364)||(34439235-34439510)
chr3 (15-122)||(12487594-12487701)
chr3 (323-421)||(38375804-38375902)
chr3 (91-168)||(51961030-51961107)
chr3 (14-129)||(15550916-15551031)
chr3 (23-157)||(15520336-15520469)
chr3 (197-421)||(15859040-15859263)
chr3 (182-422)||(53898440-53898680)
chr3 (188-412)||(11402621-11402846)
chr3 (307-437)||(12349841-12349971)
chr3 (50-238)||(38527934-38528121)
chr3 (306-437)||(6146856-6146987)
chr3 (317-421)||(38167937-38168041)
chr3 (197-421)||(51158034-51158257)
chr3 (87-190)||(6146659-6146762)
chr3 (191-292)||(8604977-8605078)
chr3 (50-141)||(40939429-40939521)
chr3 (330-421)||(47984674-47984765)
chr3 (330-421)||(47993961-47994052)
chr3 (330-421)||(48003248-48003339)
chr3 (330-421)||(48012534-48012625)
chr3 (24-126)||(12031827-12031932)
chr3 (317-421)||(14284984-14285089)
chr3 (316-421)||(17912616-17912720)
chr3 (358-444)||(51961298-51961386)
chr3 (317-421)||(3992573-3992677)
chr3 (317-438)||(30152946-30153069)
chr3 (317-436)||(16934101-16934223)
chr3 (317-421)||(11477318-11477423)
chr3 (336-438)||(17956131-17956235)
chr3 (317-421)||(2844214-2844318)
chr3 (317-421)||(16261476-16261580)
chr3 (188-280)||(38375687-38375779)
chr3 (197-421)||(13838918-13839141)
chr3 (317-436)||(19946704-19946826)
chr3 (317-422)||(7854004-7854109)
chr3 (317-436)||(33341887-33342008)
chr3 (317-419)||(54685429-54685531)
chr3 (317-421)||(8268872-8268976)
chr3 (317-421)||(8275972-8276076)
chr3 (197-282)||(12030163-12030247)
chr3 (197-282)||(14842577-14842661)
chr3 (197-282)||(15936643-15936727)
chr3 (336-421)||(23492396-23492481)
chr3 (174-262)||(11196296-11196384)
chr3 (317-393)||(53771092-53771168)
chr3 (235-412)||(12539107-12539288)
chr3 (215-282)||(16821303-16821369)
chr3 (92-129)||(7854300-7854337)
chr3 (197-278)||(17912499-17912578)
chr3 (317-421)||(45581654-45581758)
chr3 (316-421)||(54038251-54038356)
chr3 (50-114)||(18970255-18970318)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (24-444)||(67990-68413)
chr2 (15-438)||(43645897-43646327)
chr2 (21-437)||(722400-722813)
chr2 (23-415)||(31146004-31146398)
chr2 (46-444)||(19666526-19666926)
chr2 (23-438)||(24294347-24294766)
chr2 (28-384)||(22775044-22775392)
chr2 (28-384)||(22780422-22780770)
chr2 (23-444)||(25305443-25305855)
chr2 (15-436)||(3063-3482)
chr2 (50-444)||(19668961-19669358)
chr2 (20-421)||(22579686-22580083)
chr2 (50-405)||(24571145-24571500)
chr2 (50-444)||(28974047-28974443)
chr2 (72-438)||(25602028-25602398)
chr2 (25-263)||(23821467-23821705)
chr2 (25-263)||(23830546-23830784)
chr2 (178-442)||(24884686-24884952)
chr2 (87-438)||(271174-271526)
chr2 (86-445)||(24277758-24278121)
chr2 (87-421)||(36890576-36890909)
chr2 (85-438)||(4448021-4448376)
chr2 (50-438)||(27261810-27262199)
chr2 (212-421)||(9636768-9636977)
chr2 (25-292)||(19660032-19660299)
chr2 (105-384)||(24087295-24087574)
chr2 (313-444)||(19433448-19433581)
chr2 (322-445)||(23821730-23821855)
chr2 (322-445)||(23830809-23830934)
chr2 (94-383)||(16292695-16292987)
chr2 (153-422)||(32465880-32466149)
chr2 (265-421)||(6094739-6094895)
chr2 (90-438)||(23836599-23836948)
chr2 (212-421)||(25595046-25595252)
chr2 (90-422)||(25875814-25876144)
chr2 (15-129)||(7321835-7321949)
chr2 (188-428)||(18536770-18537012)
chr2 (309-444)||(22138158-22138295)
chr2 (333-421)||(24560867-24560955)
chr2 (197-421)||(25265406-25265629)
chr2 (23-140)||(24884943-24885062)
chr2 (317-421)||(33128068-33128172)
chr2 (317-421)||(24341524-24341628)
chr2 (197-421)||(36982457-36982680)
chr2 (317-421)||(28031366-28031471)
chr2 (197-377)||(19794720-19794899)
chr2 (197-282)||(43642973-43643057)
chr2 (221-280)||(20279575-20279634)
chr2 (317-421)||(15633237-15633341)
chr2 (317-421)||(21274177-21274281)
chr2 (197-421)||(8891266-8891489)
chr2 (317-434)||(22274731-22274849)
chr2 (197-282)||(462901-462985)
chr2 (94-228)||(6094902-6095039)
chr2 (317-417)||(17204358-17204459)
chr2 (197-282)||(20627329-20627413)
chr2 (317-421)||(25213071-25213176)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (23-440)||(432465-432884)
chr5 (50-421)||(7728443-7728816)
chr5 (23-444)||(5450666-5451092)
chr5 (23-444)||(19862207-19862633)
chr5 (23-444)||(3673860-3674284)
chr5 (23-383)||(28902252-28902614)
chr5 (23-383)||(28938647-28939009)
chr5 (15-444)||(21617014-21617448)
chr5 (23-421)||(16595531-16595929)
chr5 (15-444)||(21222424-21222857)
chr5 (15-444)||(23493917-23494352)
chr5 (23-444)||(37983362-37983787)
chr5 (23-384)||(21297000-21297361)
chr5 (20-418)||(32965970-32966368)
chr5 (49-342)||(21310560-21310854)
chr5 (50-436)||(11337038-11337427)
chr5 (50-421)||(19405560-19405934)
chr5 (54-441)||(29917966-29918356)
chr5 (87-444)||(6456622-6456980)
chr5 (114-438)||(23981433-23981759)
chr5 (86-444)||(24084075-24084438)
chr5 (154-418)||(22885668-22885932)
chr5 (50-438)||(1168058-1168447)
chr5 (50-438)||(24182984-24183372)
chr5 (50-328)||(23466552-23466830)
chr5 (87-421)||(20712099-20712433)
chr5 (154-421)||(26559771-26560039)
chr5 (191-421)||(21109773-21110003)
chr5 (87-422)||(21397111-21397449)
chr5 (94-434)||(16835192-16835538)
chr5 (145-418)||(23234432-23234706)
chr5 (23-242)||(24225171-24225391)
chr5 (148-421)||(23417264-23417539)
chr5 (88-422)||(21906742-21907054)
chr5 (90-422)||(28261543-28261869)
chr5 (92-422)||(11584073-11584405)
chr5 (90-422)||(4865284-4865615)
chr5 (50-168)||(22662534-22662652)
chr5 (197-421)||(22053849-22054072)
chr5 (311-421)||(24225431-24225541)
chr5 (21-179)||(25005082-25005240)
chr5 (90-422)||(21646634-21646964)
chr5 (356-421)||(19873867-19873932)
chr5 (317-421)||(18531202-18531306)
chr5 (174-422)||(24475605-24475847)
chr5 (342-421)||(23466480-23466559)
chr5 (317-438)||(2031814-2031937)
chr5 (197-421)||(23506989-23507212)
chr5 (317-421)||(7528923-7529028)
chr5 (311-384)||(11763619-11763692)
chr5 (94-271)||(19873934-19874115)
chr5 (317-393)||(21650746-21650822)
chr5 (317-421)||(9730510-9730615)
chr5 (197-281)||(18531083-18531166)
chr5 (317-438)||(11342688-11342812)
chr5 (197-281)||(34939441-34939524)
chr5 (215-282)||(29188306-29188372)
chr5 (317-421)||(108960-109065)
chr5 (317-418)||(27182682-27182783)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (20-444)||(15044826-15045253)
chr4 (20-444)||(15109171-15109598)
chr4 (50-445)||(52265360-52265758)
chr4 (15-419)||(13809328-13809732)
chr4 (23-444)||(7964536-7964960)
chr4 (23-444)||(18276432-18276856)
chr4 (49-444)||(14901230-14901627)
chr4 (23-444)||(7185669-7186093)
chr4 (23-444)||(41165780-41166195)
chr4 (50-421)||(27960994-27961366)
chr4 (45-444)||(15013131-15013531)
chr4 (88-444)||(41256259-41256618)
chr4 (50-421)||(18494181-18494552)
chr4 (23-444)||(37956849-37957274)
chr4 (15-384)||(47534895-47535252)
chr4 (50-444)||(19821628-19822025)
chr4 (50-421)||(30232348-30232720)
chr4 (85-438)||(16732173-16732527)
chr4 (94-444)||(40904828-40905182)
chr4 (50-444)||(38764707-38765103)
chr4 (90-421)||(12837094-12837424)
chr4 (145-421)||(18238104-18238381)
chr4 (90-437)||(30457909-30458257)
chr4 (22-420)||(21959287-21959686)
chr4 (94-444)||(13442571-13442928)
chr4 (148-421)||(13590024-13590298)
chr4 (94-421)||(50219837-50220164)
chr4 (94-421)||(54398406-54398736)
chr4 (87-438)||(34395261-34395614)
chr4 (87-422)||(44055937-44056271)
chr4 (87-438)||(45458746-45459098)
chr4 (87-422)||(23269824-23270159)
chr4 (191-418)||(41916720-41916947)
chr4 (50-179)||(34177501-34177629)
chr4 (87-310)||(20813437-20813660)
chr4 (90-422)||(53704627-53704958)
chr4 (91-384)||(40885458-40885756)
chr4 (87-437)||(819821-820154)
chr4 (154-384)||(47468304-47468535)
chr4 (91-438)||(55376493-55376840)
chr4 (90-422)||(44346849-44347179)
chr4 (90-384)||(8872366-8872658)
chr4 (197-421)||(15675105-15675328)
chr4 (90-422)||(53907602-53907921)
chr4 (317-421)||(31115653-31115757)
chr4 (197-421)||(54118260-54118483)
chr4 (317-384)||(10104385-10104452)
chr4 (317-421)||(14996151-14996255)
chr4 (317-421)||(19697500-19697604)
chr4 (317-421)||(19708085-19708189)
chr4 (317-438)||(14951766-14951889)
chr4 (221-384)||(21417366-21417530)
chr4 (197-421)||(13246454-13246677)
chr4 (334-421)||(26680225-26680312)
chr4 (317-422)||(25119335-25119440)
chr4 (197-281)||(10104266-10104349)
chr4 (317-386)||(14500344-14500414)
chr4 (395-438)||(47535244-47535289)
chr4 (197-282)||(122052-122136)
chr4 (317-421)||(9295717-9295822)
chr4 (317-421)||(16522841-16522946)
chr4 (395-445)||(47468527-47468579)
chr4 (357-421)||(111419-111483)
chr4 (333-421)||(8374532-8374620)
chr4 (317-393)||(15272440-15272516)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (15-444)||(2134-2565)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (15-438)||(21623172-21623599)
chr6 (15-444)||(22361581-22362014)
chr6 (15-421)||(25367053-25367461)
chr6 (50-421)||(18398961-18399333)
chr6 (27-444)||(33538198-33538618)
chr6 (24-444)||(18629433-18629860)
chr6 (20-418)||(21410872-21411270)
chr6 (15-384)||(17083014-17083384)
chr6 (15-444)||(16887608-16888041)
chr6 (20-444)||(35135834-35136261)
chr6 (163-444)||(18381649-18381932)
chr6 (50-444)||(33324691-33325088)
chr6 (50-444)||(25919611-25920009)
chr6 (50-412)||(17556872-17557231)
chr6 (221-444)||(25651235-25651460)
chr6 (15-421)||(15740252-15740651)
chr6 (149-421)||(29605473-29605744)
chr6 (94-421)||(34966890-34967220)
chr6 (87-444)||(19854153-19854515)
chr6 (50-431)||(15079563-15079944)
chr6 (87-422)||(18432665-18432999)
chr6 (87-437)||(16086022-16086374)
chr6 (87-422)||(32898812-32899147)
chr6 (87-413)||(16106547-16106873)
chr6 (205-418)||(28195101-28195315)
chr6 (174-438)||(31628272-31628538)
chr6 (92-349)||(22848110-22848368)
chr6 (94-421)||(22461991-22462320)
chr6 (154-412)||(17013595-17013855)
chr6 (90-393)||(18570330-18570632)
chr6 (23-218)||(25654350-25654546)
chr6 (237-421)||(29160343-29160527)
chr6 (90-437)||(22440940-22441287)
chr6 (191-421)||(23222770-23223004)
chr6 (234-421)||(23221937-23222126)
chr6 (177-421)||(18777169-18777413)
chr6 (114-384)||(32352107-32352379)
chr6 (90-422)||(13014601-13014934)
chr6 (211-444)||(19672293-19672519)
chr6 (197-421)||(35009455-35009678)
chr6 (216-384)||(21931263-21931432)
chr6 (87-280)||(31467483-31467680)
chr6 (317-438)||(35015285-35015408)
chr6 (191-384)||(19175210-19175404)
chr6 (91-281)||(1657660-1657847)
chr6 (323-422)||(25744339-25744438)
chr6 (191-280)||(16136427-16136516)
chr6 (197-282)||(23153610-23153694)
chr6 (317-382)||(29665936-29666001)
chr6 (91-281)||(15862635-15862822)
chr6 (87-143)||(18777431-18777486)
chr6 (317-393)||(26089786-26089862)
chr6 (317-421)||(27740862-27740966)
chr6 (46-129)||(14152626-14152709)
chr6 (215-421)||(14626152-14626357)
chr6 (395-443)||(17083376-17083426)
chr6 (317-436)||(18823515-18823637)
chr6 (89-128)||(25640453-25640492)
chr6 (325-421)||(16300116-16300213)
chr6 (317-421)||(19629354-19629458)
chr6 (317-421)||(32276891-32276995)
chr6 (317-421)||(18002624-18002728)
chr6 (317-393)||(23994974-23995050)
chr6 (317-384)||(18583377-18583444)
chr6 (317-436)||(18839370-18839492)
chr6 (344-421)||(1657909-1657986)
chr6 (92-129)||(18583635-18583672)
chr6 (337-422)||(19983439-19983524)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (23-444)||(13377527-13377953)
chr7 (15-421)||(49047492-49047898)
chr7 (23-444)||(48356642-48357066)
chr7 (23-444)||(9838878-9839302)
chr7 (23-442)||(16914752-16915175)
chr7 (23-444)||(9611306-9611731)
chr7 (15-444)||(17223752-17224187)
chr7 (15-417)||(13274814-13275206)
chr7 (51-421)||(12247973-12248345)
chr7 (23-444)||(34241031-34241437)
chr7 (23-444)||(14271723-14272135)
chr7 (50-421)||(26070118-26070488)
chr7 (50-421)||(26093905-26094275)
chr7 (50-421)||(16569858-16570230)
chr7 (50-421)||(16595432-16595804)
chr7 (87-444)||(20583442-20583803)
chr7 (15-438)||(11287421-11287845)
chr7 (87-444)||(31501171-31501531)
chr7 (44-441)||(38424220-38424620)
chr7 (50-422)||(12759009-12759383)
chr7 (87-444)||(4484725-4485084)
chr7 (87-445)||(13862823-13863180)
chr7 (50-444)||(15358795-15359191)
chr7 (88-384)||(28722169-28722468)
chr7 (50-444)||(14935361-14935757)
chr7 (50-444)||(15362954-15363350)
chr7 (225-406)||(16919597-16919778)
chr7 (90-422)||(15822325-15822656)
chr7 (87-438)||(45452058-45452409)
chr7 (114-444)||(28390310-28390644)
chr7 (87-398)||(12369730-12370041)
chr7 (94-444)||(13448721-13449076)
chr7 (94-445)||(4446209-4446566)
chr7 (90-421)||(3895048-3895378)
chr7 (148-421)||(9723757-9724031)
chr7 (181-444)||(14940751-14941015)
chr7 (191-421)||(17947586-17947816)
chr7 (43-397)||(33559694-33560050)
chr7 (148-418)||(46474027-46474299)
chr7 (181-444)||(15368344-15368608)
chr7 (87-437)||(47289787-47290139)
chr7 (90-437)||(143651-143993)
chr7 (90-437)||(44865233-44865584)
chr7 (92-436)||(7283956-7284301)
chr7 (145-384)||(8267675-8267915)
chr7 (196-346)||(4438881-4439031)
chr7 (90-422)||(39046521-39046848)
chr7 (94-301)||(9319457-9319667)
chr7 (323-421)||(45149625-45149723)
chr7 (91-168)||(25124406-25124483)
chr7 (197-422)||(13321037-13321263)
chr7 (24-163)||(16919811-16919954)
chr7 (317-421)||(3049606-3049710)
chr7 (15-108)||(13389693-13389786)
chr7 (90-438)||(35094821-35095168)
chr7 (91-421)||(47480943-47481270)
chr7 (191-411)||(8563341-8563562)
chr7 (21-85)||(9080965-9081029)
chr7 (358-444)||(25124128-25124216)
chr7 (191-292)||(45149736-45149837)
chr7 (317-438)||(126419-126542)
chr7 (334-421)||(7293041-7293128)
chr7 (197-421)||(11580755-11580978)
chr7 (197-421)||(16211790-16212013)
chr7 (304-421)||(42056405-42056521)
chr7 (317-421)||(111397-111501)
chr7 (337-421)||(9321176-9321260)
chr7 (197-282)||(13037030-13037114)
chr7 (87-178)||(14942269-14942362)
chr7 (87-178)||(15369862-15369955)
chr7 (197-282)||(18253851-18253935)
chr7 (317-421)||(2190314-2190418)
chr7 (197-421)||(3059990-3060213)
chr7 (216-282)||(16478985-16479050)
chr7 (92-129)||(111169-111206)
chr7 (317-421)||(371112-371217)
chr7 (197-278)||(25292354-25292434)
chr7 (373-445)||(4438818-4438893)
chr7 (357-421)||(36052691-36052755)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (23-438)||(21197977-21198395)
chr8 (23-444)||(5854612-5855036)
chr8 (23-421)||(15933321-15933721)
chr8 (23-444)||(26011492-26011913)
chr8 (23-444)||(23837196-23837622)
chr8 (15-444)||(38533647-38534080)
chr8 (23-444)||(33528424-33528848)
chr8 (15-421)||(39446583-39446990)
chr8 (50-364)||(22981353-22981664)
chr8 (23-411)||(29306450-29306842)
chr8 (23-444)||(33610877-33611302)
chr8 (15-325)||(17285323-17285636)
chr8 (37-444)||(22735686-22736087)
chr8 (46-444)||(23149779-23150177)
chr8 (46-444)||(23151684-23152082)
chr8 (68-436)||(15969824-15970197)
chr8 (46-440)||(23225927-23226321)
chr8 (46-440)||(23158165-23158556)
chr8 (15-381)||(25296222-25296590)
chr8 (15-381)||(25758242-25758610)
chr8 (44-444)||(18261319-18261720)
chr8 (87-421)||(38635536-38635872)
chr8 (15-421)||(31194140-31194548)
chr8 (50-438)||(20573044-20573435)
chr8 (72-421)||(21681025-21681377)
chr8 (50-376)||(20561483-20561810)
chr8 (87-421)||(22742784-22743123)
chr8 (87-421)||(45558824-45559161)
chr8 (94-444)||(45465022-45465375)
chr8 (90-422)||(41246680-41247011)
chr8 (90-421)||(20481628-20481957)
chr8 (94-418)||(33172254-33172579)
chr8 (94-445)||(18041426-18041782)
chr8 (50-417)||(19331168-19331535)
chr8 (92-409)||(24552462-24552782)
chr8 (191-421)||(22497203-22497433)
chr8 (90-437)||(37611674-37612022)
chr8 (190-444)||(37653609-37653863)
chr8 (289-440)||(27233159-27233312)
chr8 (45-269)||(27232938-27233162)
chr8 (245-438)||(20653953-20654148)
chr8 (250-438)||(20647882-20648072)
chr8 (90-422)||(22234698-22235028)
chr8 (15-129)||(21259314-21259428)
chr8 (191-411)||(16002031-16002251)
chr8 (90-422)||(19992950-19993279)
chr8 (90-260)||(25122626-25122795)
chr8 (87-187)||(20529743-20529843)
chr8 (317-438)||(41506937-41507060)
chr8 (197-421)||(16193732-16193955)
chr8 (197-282)||(16404991-16405075)
chr8 (244-344)||(18118336-18118437)
chr8 (311-408)||(20709728-20709825)
chr8 (317-422)||(24716990-24717095)
chr8 (317-421)||(274466-274570)
chr8 (317-421)||(641279-641383)
chr8 (317-421)||(827085-827189)
chr8 (388-444)||(17285265-17285323)
chr8 (334-421)||(22907365-22907452)
chr8 (323-393)||(16039015-16039085)
chr8 (317-421)||(3431408-3431513)
chr8 (215-421)||(6774280-6774485)
chr8 (368-438)||(20567329-20567401)
chr8 (368-438)||(20573522-20573594)
chr8 (197-282)||(24928807-24928891)
chr8 (366-437)||(25122542-25122614)
chr8 (215-282)||(24549145-24549211)
chr8 (197-421)||(43373484-43373707)
chr8 (91-129)||(41506708-41506746)
chr8 (50-110)||(20653885-20653946)
chr8 (317-421)||(22886350-22886454)
chr8 (191-260)||(22887945-22888014)
chr8 (197-281)||(17345733-17345816)
chr8 (334-409)||(21494593-21494669)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (23-444)||(2523-2948)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (15-438)||(20177179-20177607)
chr1 (20-381)||(16645975-16646338)
chr1 (23-383)||(16656699-16657061)
chr1 (15-444)||(37233676-37234109)
chr1 (23-440)||(17608930-17609351)
chr1 (15-438)||(36356109-36356536)
chr1 (23-417)||(20955265-20955659)
chr1 (20-421)||(51627487-51627888)
chr1 (50-444)||(21195012-21195409)
chr1 (23-444)||(19603095-19603515)
chr1 (23-444)||(22829251-22829673)
chr1 (46-444)||(22143210-22143610)
chr1 (15-421)||(38033489-38033898)
chr1 (15-437)||(27674801-27675227)
chr1 (15-444)||(13376674-13377089)
chr1 (45-445)||(8537757-8538160)
chr1 (45-445)||(8602996-8603399)
chr1 (50-414)||(49997133-49997499)
chr1 (44-412)||(52400663-52401032)
chr1 (87-421)||(27329656-27329979)
chr1 (85-422)||(21718250-21718585)
chr1 (86-384)||(9783953-9784248)
chr1 (94-421)||(5768063-5768393)
chr1 (191-421)||(40436263-40436493)
chr1 (87-421)||(35054779-35055113)
chr1 (87-437)||(22403000-22403351)
chr1 (197-418)||(33397378-33397599)
chr1 (90-422)||(49967672-49968004)
chr1 (15-262)||(35522170-35522417)
chr1 (148-383)||(25093920-25094156)
chr1 (317-438)||(35522439-35522562)
chr1 (311-421)||(76487-76597)
chr1 (99-422)||(41212091-41212415)
chr1 (197-421)||(20445703-20445926)
chr1 (354-438)||(41229096-41229182)
chr1 (197-421)||(20531468-20531691)
chr1 (334-439)||(9784237-9784344)
chr1 (148-280)||(20194189-20194323)
chr1 (197-421)||(37844466-37844690)
chr1 (336-438)||(22367023-22367127)
chr1 (197-282)||(41394385-41394469)
chr1 (340-418)||(20194070-20194149)
chr1 (90-123)||(20346345-20346378)
chr1 (317-421)||(21650167-21650272)
chr1 (317-422)||(21860033-21860138)
chr1 (215-282)||(2116418-2116484)
chr1 (197-280)||(20913195-20913277)
chr1 (197-280)||(20931510-20931592)
chr1 (15-60)||(17023390-17023436)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (15-437)||(28541-28967)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (15-444)||(35476-35910)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (15-444)||(76662-77096)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (23-444)||(69455-69880)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (23-421)||(102749-103146)
scaffold0022 (51-421)||(109613-109977)
scaffold0022 (15-438)||(112364-112785)
scaffold0022 (188-419)||(67948-68180)
scaffold0022 (94-328)||(131931-132166)
scaffold0022 (341-444)||(131834-131939)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (23-444)||(43622-44047)
scaffold0080 (45-418)||(23520-23893)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (15-444)||(6839-7274)
scaffold0162 (197-421)||(8196-8416)
scaffold0162 (340-421)||(11769-11850)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (15-444)||(11092-11523)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (23-444)||(31018-31443)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (23-444)||(197078-197502)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (23-444)||(6659-7085)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (15-421)||(33545-33952)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (23-443)||(97023-97446)
scaffold0031 (50-381)||(70676-71007)
scaffold0031 (72-421)||(31067-31418)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (15-421)||(3342-3749)
[»] scaffold0025 (6 HSPs)
scaffold0025 (92-444)||(53345-53699)
scaffold0025 (142-444)||(85531-85834)
scaffold0025 (197-393)||(146652-146848)
scaffold0025 (317-421)||(8873-8977)
scaffold0025 (197-421)||(148745-148968)
scaffold0025 (197-281)||(9013-9096)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (50-444)||(104476-104871)
scaffold0032 (151-438)||(93726-94015)
scaffold0032 (317-421)||(55604-55708)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (18-444)||(307-723)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (15-417)||(8699-9102)
scaffold0480 (50-422)||(5101-5471)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (50-442)||(1398-1794)
scaffold0456 (50-442)||(8543-8939)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (50-445)||(33659-34057)
scaffold0103 (311-383)||(33540-33612)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (85-438)||(464-819)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (23-444)||(22246-22671)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (91-444)||(8008-8364)
scaffold0123 (91-167)||(11153-11230)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (50-352)||(1200-1503)
scaffold0409 (50-352)||(9455-9758)
[»] scaffold0589 (2 HSPs)
scaffold0589 (50-334)||(7915-8200)
scaffold0589 (366-421)||(7857-7912)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (91-444)||(79537-79892)
scaffold0028 (197-383)||(89470-89655)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (52-438)||(85336-85724)
scaffold0014 (72-393)||(159350-159672)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (87-440)||(40660-41015)
scaffold0034 (87-445)||(46162-46522)
scaffold0034 (317-421)||(79887-79991)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (15-419)||(11712-12119)
scaffold0021 (87-422)||(132139-132475)
scaffold0021 (50-308)||(16035-16296)
scaffold0021 (50-308)||(25566-25827)
scaffold0021 (93-393)||(88326-88626)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (15-345)||(116374-116700)
scaffold0016 (90-422)||(164237-164567)
scaffold0016 (371-444)||(116687-116762)
scaffold0016 (336-438)||(162325-162430)
[»] scaffold0342 (3 HSPs)
scaffold0342 (129-445)||(5937-6257)
scaffold0342 (20-125)||(12588-12694)
scaffold0342 (317-422)||(579-684)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (50-422)||(9009-9382)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (90-445)||(4560-4915)
scaffold0447 (90-445)||(9174-9529)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (50-444)||(10660-11056)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (87-422)||(21534-21867)
scaffold0120 (87-422)||(31233-31566)
scaffold0120 (87-190)||(47440-47542)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (50-418)||(1942-2310)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (107-444)||(2453-2795)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (90-445)||(7168-7524)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (87-444)||(6542-6903)
scaffold0077 (92-384)||(15367-15658)
scaffold0077 (197-421)||(36929-37152)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (85-438)||(109349-109705)
scaffold0035 (85-438)||(117850-118206)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (87-445)||(27494-27857)
scaffold0004 (87-445)||(86354-86716)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (50-444)||(4603-4999)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (85-438)||(9941-10296)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (50-438)||(22281-22661)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (50-445)||(3249-3647)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (44-444)||(808-1195)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (50-444)||(70158-70555)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (90-436)||(150-498)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (88-438)||(60810-61163)
scaffold0001 (174-422)||(70598-70847)
scaffold0001 (87-232)||(79780-79925)
scaffold0001 (197-417)||(171933-172152)
scaffold0001 (197-417)||(177636-177855)
scaffold0001 (317-386)||(165093-165163)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (87-438)||(11459-11811)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (154-444)||(29962-30254)
scaffold0165 (94-421)||(22022-22351)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (87-421)||(108033-108369)
[»] scaffold0670 (1 HSPs)
scaffold0670 (98-421)||(7573-7899)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (94-444)||(37556-37910)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (110-437)||(252902-253231)
scaffold0012 (197-282)||(247458-247542)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (91-422)||(43-371)
scaffold0160 (370-422)||(3541-3593)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (155-444)||(4939-5231)
scaffold0075 (197-281)||(34476-34559)
scaffold0075 (323-407)||(34601-34686)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (87-393)||(24618-24924)
scaffold0037 (323-393)||(95026-95096)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (87-438)||(1321-1672)
scaffold0359 (90-437)||(11546-11892)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (87-422)||(22713-23048)
scaffold0008 (197-282)||(128185-128269)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (90-422)||(7591-7924)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (72-418)||(11582-11929)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (50-384)||(89717-90050)
scaffold0026 (390-444)||(90037-90093)
scaffold0026 (197-282)||(107910-107994)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (204-444)||(7400-7642)
scaffold0253 (204-444)||(16825-17067)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (87-422)||(38320-38655)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (92-438)||(1385-1732)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (154-412)||(25377-25637)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (90-422)||(715-1047)
scaffold0673 (101-422)||(6749-7073)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (91-436)||(25218-25564)
scaffold0158 (197-436)||(24965-25205)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (90-437)||(48153-48498)
scaffold0068 (90-437)||(61601-61946)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (94-384)||(14096-14388)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (92-436)||(10-355)
scaffold0310 (92-380)||(6304-6591)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (90-422)||(14899-15226)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (90-418)||(254708-255035)
scaffold0011 (90-418)||(261314-261641)
scaffold0011 (197-421)||(123180-123403)
scaffold0011 (15-67)||(123010-123062)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (191-418)||(874-1095)
[»] scaffold0153 (2 HSPs)
scaffold0153 (94-328)||(8606-8843)
scaffold0153 (333-445)||(1832-1944)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (191-421)||(2766-2999)
[»] scaffold0195 (3 HSPs)
scaffold0195 (296-438)||(617-761)
scaffold0195 (197-421)||(19230-19453)
scaffold0195 (197-421)||(21314-21537)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (50-179)||(1362-1490)
[»] scaffold0390 (3 HSPs)
scaffold0390 (309-444)||(15953-16090)
scaffold0390 (309-444)||(2969-3106)
scaffold0390 (375-444)||(5180-5251)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (87-208)||(5567-5689)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (50-261)||(5595-5806)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (91-421)||(13530-13857)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (50-179)||(372-500)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (309-444)||(4436-4573)
scaffold0786 (375-444)||(1592-1663)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (50-258)||(26843-27051)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (233-421)||(12769-12958)
[»] scaffold0049 (3 HSPs)
scaffold0049 (148-421)||(33363-33638)
scaffold0049 (92-342)||(20274-20524)
scaffold0049 (197-282)||(48350-48434)
[»] scaffold0065 (2 HSPs)
scaffold0065 (94-301)||(67791-68001)
scaffold0065 (323-421)||(68004-68106)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (311-421)||(12788-12898)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (317-418)||(17441-17542)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (317-418)||(61354-61455)
scaffold0023 (197-282)||(48761-48845)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (50-378)||(4351-4677)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (317-421)||(41672-41776)
scaffold0125 (197-281)||(41812-41895)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (336-436)||(3305-3407)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (385-445)||(147550-147612)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (90-238)||(2959-3106)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (368-438)||(5961-6033)
scaffold0327 (50-83)||(6030-6063)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (306-422)||(32225-32340)
scaffold0091 (306-422)||(41963-42078)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (92-284)||(19850-20041)
scaffold0122 (92-284)||(24154-24345)
scaffold0122 (362-438)||(24362-24440)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (324-421)||(10101-10198)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (336-438)||(30095-30199)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (317-421)||(49975-50080)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (317-438)||(6211-6334)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (317-421)||(17532-17636)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (323-421)||(5714-5813)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (197-421)||(1148-1371)
scaffold0266 (197-282)||(3598-3682)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (197-282)||(550-634)
[»] scaffold1311 (1 HSPs)
scaffold1311 (394-444)||(1673-1725)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (197-282)||(6080-6164)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (317-422)||(31408-31513)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (197-282)||(972-1056)
scaffold0175 (317-421)||(14972-15076)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (87-206)||(2263-2384)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (317-422)||(41331-41436)
scaffold0078 (334-421)||(37217-37304)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (317-421)||(13514-13618)
scaffold0251 (317-393)||(21488-21564)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (204-280)||(1349-1424)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (197-382)||(51198-51382)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (317-407)||(3000-3091)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (197-278)||(5696-5776)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (336-421)||(9654-9739)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (90-123)||(8668-8701)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (317-421)||(5245-5349)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (395-437)||(3321-3365)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (317-421)||(6671-6775)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (317-393)||(1106-1182)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (197-281)||(9042-9125)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (215-282)||(13347-13413)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (215-282)||(9371-9437)
scaffold0215 (215-282)||(16269-16335)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (50-92)||(1974-2016)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (188-278)||(19926-20016)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (317-421)||(6343-6448)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (317-381)||(17761-17826)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (197-282)||(41892-41976)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (317-421)||(12648-12752)
scaffold0039 (337-421)||(19049-19133)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (317-381)||(45094-45158)
scaffold0066 (317-381)||(54480-54544)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 116)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39656947 - 39656524
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||    || ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39656947 cttgaagattcaagaagatgatagaacctaggagttaaaatgaagcttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggagttagaattgatcataatc 39656848  T
Q  123 atttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39656847 atttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaatccgtgctccaattatgatgtta 39656748  T
Q  223 tgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgt 322  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39656747 tgtttgaatttatgaaattggtgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgt 39656648  T
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt--ggg 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  39656647 tgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagattcatgttcaattgatgtggttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttagggg 39656548  T
Q  421 ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39656547 ttcataattcatgatttgatgatg 39656524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 11328790 - 11329210
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11328790 cttgaagattcaagagttggagaggacctaggagctaaagtgaagcttgatctaggaaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 11328889  T
Q  123 attt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11328890 atttttagtgtaaattttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatga 11328989  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
     |||||     | || || ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11328990 catgtt-----gcataaagttgttaataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaatatgctcaaatt 11329084  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  11329085 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttggg 11329184  T
Q  421 --ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
      | ||| |||||||||||| |||||    
T  11329185 tatgcatgattcatgatttgttgatg 11329210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16880546 - 16880146
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880546 cttgaagattcaagagttggagaggacctagaagctaaagtgaagcttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 16880447  T
Q  123 attt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||  |||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||     
T  16880446 atttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaacaagtgtttaattgagtaattgattaattgttcataattgtttgaattcgtgctccaattacgatga 16880347  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||    
T  16880346 tatgtttgaatgcaagaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgttagaatatgctcaattt 16880247  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 420  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  16880246 gtgaaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataattcatggcttggg 16880147  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  16880146 t 16880146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 3576253 - 3576687
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3576253 aagaagagcttgaatattcaagaattggaagagatcctaggaggtaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgataattaaggtaagggggttagaattc 3576352  T
Q  114 a-tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||| ||    
T  3576353 aatcataatcattttagtgtaatttttcaattgttgtacgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtactctaa 3576452  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  3576453 ttatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaatgtatgagaaagtgatatatattgaattat 3576552  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3576553 gctcaaattgatggattatgctatgttgttgttgaattgtgataagagtcatgtttgattgatgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattca 3576652  T
Q  412 tggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  3576653 tggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatg 3576687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17191965 - 17191539
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattca-tcata 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17191965 cttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcaca 17191867  T
Q  120 atcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  17191866 atcattttagtgtaatttttcaattgttgtatgaacaattgcttaattgagtaaatgattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgat 17191767  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    | |||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17191766 gatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatttatgttgaattatgctcaaa 17191667  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt- 417  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  17191666 ttgatgaattatgttatgttgttgctgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgctgttgctaagtaatgttgttgttgatgattcatggcttg 17191567  T
Q  418 -gggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||    
T  17191566 agtgttcataattcatgatttgttgatg 17191539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 12953388 - 12952962
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataat 121  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12953388 cttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaattgaagtttgggctagggaattgatctaactaaggtaaggggattagaattcaatcataat 12953289  T
Q  122 ca-tttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataa-ttgttaaaattcgtgctccaattatgatg 219  Q
    || ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||    
T  12953288 caatttagtgtaatttttcaattactgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcattagttgttagaattcgtgttctaattatgatg 12953189  T
Q  220 ttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaat 319  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  12953188 atatgtttgaatgcatgaaattggtgataattagattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaa 12953089  T
Q  320 tgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg 419  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12953088 tgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagatttatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgg 12952989  T
Q  420 --gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
      |||||||| ||||||||||||||||    
T  12952988 gtgttcataaatcatgatttgatgatg 12952962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17139938 - 17139531
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17139938 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taggaggtaaattgaagcttgggctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 17139840  T
Q  114 atcataatcatt--tagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17139839 atcataatcattcttagtgtaaattt-caattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaagtgttcataattgttagaattcgtgctccaa 17139741  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  17139740 ttatgatgacatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaactatgagaaaatggtatatgttgaaatat 17139641  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  17139640 gctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattca 17139541  T
Q  412 tggcttgggt 421  Q
    ||||||||||    
T  17139540 tggcttgggt 17139531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 49 - 444
Target Start/End: Original strand, 14059066 - 14059462
Alignment:
Q  49 cctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  14059066 cctaggagctaaagtgaagtctaagctagggaattaatctaactaag-taagggggttataattcatcataatcattttagtgcaatttt-caattattg 14059163  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  14059164 tatgaataagtgcttaattgactaattgactaattgttcatgattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgat 14059263  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14059264 aattgaattgtttttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgacatatgttgaaatatgctcaatttgatgaattatgctatgttgttgttgaa 14059363  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  14059364 ttgtgataatattcatgttcaattgatgttattgttgctatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcatgatctgttgatg 14059462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 15 - 438
Target Start/End: Original strand, 47784578 - 47784990
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    |||| |||| |||| ||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47784578 aagaggaacctgaatattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagtttgggctagggaattgacctaactaaggtaagggggttagaattca 47784677  T
Q  115 tcataatca--tttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttca----taattgttaaaattcgtgctc 208  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     | |||||| |||||||||||    
T  47784678 tcataatcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgatttattgttcaaaggaagttgttataattcgtgctc 47784777  T
Q  209 caattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa 308  Q
     |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  47784778 taattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgt----- 47784872  T
Q  309 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 408  Q
                  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  47784873 --------------tgaattatgctatgttgttgttgaattgtagtaagaaacatgttcagttgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgat 47784958  T
Q  409 tcatggcttgg--gttcataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47784959 tcatggcttgggtgttcataattcatgatttg 47784990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 9590583 - 9591003
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggg--aattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataa 120  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||    ||||||| ||||||||||   |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9590583 cttgacgattcaagaattggtgagatcataggag----agtgaagcttgagctaggattaattg--ctaactaaggtaaggggattagaattcatcataa 9590676  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaa-ttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatg 219  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||    
T  9590677 tcatttagtgtaatttttcaaattgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtggttaattgttcatagttgttaaaatccgtgctctaactatgatg 9590776  T
Q  220 ttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaat 319  Q
     |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    |||| ||||||||| |    
T  9590777 atatgtttgaatgcattaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgtgaaagtggtatgatatgaattatgctcaatt 9590876  T
Q  320 tgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9590877 tgttgaattatgctatgttgttgttgagttctgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgg 9590976  T
Q  420 --gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
      ||||||| |||||||||||||||||    
T  9590977 gtgttcatagttcatgatttgatgatg 9591003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 135 - 444
Target Start/End: Original strand, 12488664 - 12488975
Alignment:
Q  135 ttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||||||| |    
T  12488664 ttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtcattaattaattgttcataattgttagaattcatgctctaattatgatattgtgtttggatgca 12488763  T
Q  235 tgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgcta 334  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12488764 tgaagttgttgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaaattgatgaattatgtta 12488863  T
Q  335 tgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcat 432  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  12488864 tgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgttcataattcat 12488963  T
Q  433 gatttgatgatg 444  Q
    ||||| ||||||    
T  12488964 gatttaatgatg 12488975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 54 - 441
Target Start/End: Original strand, 12560092 - 12560482
Alignment:
Q  54 gagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatga 152  Q
    |||||||| ||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  12560092 gagctaaattgaagcttaagttagggagattaatctaactaaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattattgtatga 12560191  T
Q  153 ataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattg 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||  ||||| |||    
T  12560192 ataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgattgaatgcttgaagttattgatacttg 12560291  T
Q  253 aattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 352  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12560292 aatttttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgtgaaaatatgcccaactggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 12560391  T
Q  353 gtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatg 441  Q
     || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | || | |||| |||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  12560392 atatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggtatgcatgattcatgatttgatg 12560482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30207613 - 30207278
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt--agtgcaatttttcaattgtt 146  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  30207613 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttataattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgtt 30207514  T
Q  147 gtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||    
T  30207513 gtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattattcatactggttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttga 30207414  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  30207413 taattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgcttaaattgatgaattgtgctatgttgttgttca 30207314  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30207313 attgtgataagattcaagttcaattgaagttgttgt 30207278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17205105 - 17204698
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattc-atcata 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17205105 cttgaagattcaagaattggtagaaatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaattccatcata 17205007  T
Q  120 atcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  17205006 atcattttagtgtaatttttcaattgtggtacgaacaagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgat 17204907  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    | |||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
T  17204906 gatatgtttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgt--------------- 17204822  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
        ||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17204821 ----tgaattatgctatattgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttg 17204726  T
Q  419 g--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |  ||| ||||||||||||||| |||||    
T  17204725 ggtgtttataattcatgatttgttgatg 17204698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 85 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14295797 - 14295442
Alignment:
Q  85 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || || ||| |||||||||    
T  14295797 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtgctaaaatgggtgaattgattaattg 14295700  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  14295699 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaag 14295600  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14295599 tatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgt 14295500  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  14295499 ttctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 14295442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 17960134 - 17960562
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 119  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17960134 gaacttgaagattgaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaaacttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 17960233  T
Q  120 atcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatga 217  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||    
T  17960234 atcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataattgcttaattgagtaattaattaattgttcatgatggttagaattcgtgctcctattatga 17960333  T
Q  218 tgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaa 317  Q
    | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||||||||   | ||||||| |    
T  17960334 ttttatgtttgtatgtaagaaattggtgataattgattttttgtgggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatatgtcatattatgctcta 17960433  T
Q  318 attgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
    | ||   | || || ||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| |||    
T  17960434 aatgacaatttgtgttatgttgatgttgaattatgctgagattcatattcaattgatgtgtttgctgctaagtgatgttgttattaataattcatgactt 17960533  T
Q  418 gg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||  || |||||||||||||||| |||||    
T  17960534 gggtgtgcataattcatgatttgttgatg 17960562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 15876484 - 15876072
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaaggggg-ttagaattcatcataa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15876484 cttgaagattcaagagttggagagatcttaggagttaaagtgaagcttgggctagg-aattgacgataattaaggtaaggggggttagaattcatcataa 15876386  T
Q  121 tcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||  || | |||||||||||| |||||||||    
T  15876385 tcatttttagtgtaaattttcaattattgtatgaataagtgcttaattga--------ttaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgat 15876294  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
      |||||||  ||| ||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||    
T  15876293 aatatgtttaaatgcatgatgttgttgataactgaattgttgttgatgaaattttatgttccaagtatgagaaagtgatatatcttgaatgatactcaaa 15876194  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    |||||| |||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||     
T  15876193 ttgttggattatcataagttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggctta 15876094  T
Q  419 gg--ttcataattcatgatttg 438  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  15876093 ggtattcataattcatgatttg 15876072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 445
Target Start/End: Original strand, 11060859 - 11061256
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||    
T  11060859 ctaggagcaaaactgaagcttaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttggaattcatcataatcata-attgcaatttttcaattattgt 11060957  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||| ||   || | |||||||||||| |||||||||   || |||  ||||||||| ||    |||    
T  11060958 atgaataagtgcttaattggataattaattatttgttaatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatca-atttttaaatgtatgaagttatgaata 11061056  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11061057 attggattgttgttagttgaatttcaggttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaa 11061156  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11061157 ttgtgataatagtcatgttcaattgatgttgttggtgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgatgatgt 11061256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 85 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 14301424 - 14301087
Alignment:
Q  85 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || || ||| |||||||||    
T  14301424 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtgctaaaatgggtgaattgattaattg 14301327  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||    
T  14301326 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaattcatgttcaaag 14301227  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14301226 tatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgt 14301127  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  14301126 ttctaagtgatgttgttgatgattattcatgtctttggtt 14301087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 443
Target Start/End: Original strand, 38810839 - 38811256
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattcatcataa 120  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38810839 cttgaagattcaagaactggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataa 38810937  T
Q  121 tcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||  |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38810938 tcatttttagtgtaaattttcaattgttgcatgaataagtgcttaattga--------ttaattgttcatgattgttagaattcgtgctccaattatgat 38811029  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    ||| | |||| ||||| | ||||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||| ||   |||| ||||||||||   | ||||||| ||    
T  38811030 gttctttttgtatgtaaggaattgatgataattaatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaaatacatgaaaatgatatatgtcatattatgctctaa 38811129  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
     |||  |||| || ||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  38811130 atgtcaaattgtgatatgttgatgttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttg 38811229  T
Q  419 g--gttcataattcatgatttgatgat 443  Q
    |  || ||||||||||| |||||||||    
T  38811230 ggtgtgcataattcatgttttgatgat 38811256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 415
Target Start/End: Original strand, 14814653 - 14814983
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||     
T  14814653 ctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgc 14814752  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14814753 tcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 14814852  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14814853 atgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 14814952  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14814953 ttaagagatattgttgttgatgtttcatggc 14814983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 73 - 437
Target Start/End: Original strand, 55440733 - 55441091
Alignment:
Q  73 gctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagta 171  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           ||||||||||||||||||||| ||     
T  55440733 gctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatt-----------gtatgaataagtgcttaattgggtg 55440821  T
Q  172 aat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaat 270  Q
    ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||| |||    
T  55440822 aattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagtggaat 55440921  T
Q  271 ttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaa 369  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  55440922 ttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgatgaaaatatgctcaactggttgaattatactatgttgtggttgaattgtgataagtttcatgatcaa 55441021  T
Q  370 ttgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgattt 437  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  55441022 ttgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgattt 55441091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 292
Target Start/End: Original strand, 11882044 - 11882313
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11882044 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagcttgacctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 11882143  T
Q  123 atttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtta 222  Q
    |||||||| || |||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  |||| || ||| ||||| |||||||||| ||    
T  11882144 atttagtgtaacttttaatttgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgttcttagatgttgaatttcatgctctaattatgatggta 11882243  T
Q  223 tgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaa 292  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  11882244 tgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgaatgttcatagtatgtgaaa 11882313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 71 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14080884 - 14080507
Alignment:
Q  71 gagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattga 168  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| | | ||||||||||||| |||||||     
T  14080884 gagctagggaattaatgtaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtaaattttcaactatggtatgaataagtgtttaattgg 14080785  T
Q  169 gtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaa 268  Q
     ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  14080784 ataaatgattaattgtgcatagatgttaaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgtggttagtgaa 14080685  T
Q  269 atttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttca 368  Q
     || |||||||||||||||   ||||| ||  |  |||| ||||||||| | | |||||| |||||| ||||||||||||| || | |||  ||||||||    
T  14080684 tttgcatgttcaaagtatgtataagtgctaacttatgaattatgctcaattgggtgaattgtgctatattgttgttgaattatgatgagaaccatgttca 14080585  T
Q  369 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  14080584 attgatgttgttattgcgaagtaatgttgttgttgatgatttacggcttgggtattcataattcatgatttggtgatg 14080507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 54424369 - 54424035
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  54424369 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 54424272  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||    
T  54424271 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagt 54424172  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  54424171 atgagaaattgatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttatt 54424073  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||  |||| | |||| |||||||||||||||    
T  54424072 gctaagtgacgttgtggatgattattcatggcttgggt 54424035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 444
Target Start/End: Original strand, 4162051 - 4162454
Alignment:
Q  44 gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaa 141  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||   ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| | |||||||||     
T  4162051 gagattctaggagctaaattgaagtttgggctagg-atttttgctaactaaggtaagggggttagagttcaaccataatcaattagttgtaatttttcat 4162149  T
Q  142 ttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaatt 241  Q
    |    | |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  || |||||    
T  4162150 taaaggcatgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacataaaatt 4162249  T
Q  242 ggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| || |||||||||    
T  4162250 ggtgataattgaattgctgttggtgaaattacaagttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgttatgttgtt 4162349  T
Q  342 gttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttga 439  Q
    |||||||  ||    || ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  4162350 gttgaatgatgacgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagaactattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttga 4162449  T
Q  440 tgatg 444  Q
    |||||    
T  4162450 tgatg 4162454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 17522742 - 17523115
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  17522742 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgt 17522840  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||  ||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||| || | || ||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||||  ||  |||    
T  17522841 atgag-aagtgcttatttgggtgaattgattatttgttcataaatgatgaacttcgtgctctaattatgatgacagttttggatgtatgaagatgtggat 17522939  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| | ||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  17522940 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtataacaaaatggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgttattgatga 17523038  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt-gatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    |||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17523039 attgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataattcatggcttgggtt 17523115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3578461 - 3578133
Alignment:
Q  72 agctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagt 170  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  3578461 agctagggagattaatctaactaaggtaagcgggttagaattcatcataatcatttattgcaa-ttttcaattattgtaggaataagtgcttaattgggt 3578363  T
Q  171 aaa-tgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaa 269  Q
    ||| ||||||||||||||||| || | | |||| | ||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||   ||||||||||||||| || ||  ||    
T  3578362 aaattgattaattgttcataaatgatgatattcattctctaattatgatgacatg-ttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttattagttgaa 3578264  T
Q  270 tttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||||| |||    
T  3578263 tttcatgttcaaagtatgagaaaatagtatatgttgaaaatatgctcaactggttgaattacgctatgttgtggttgaattgcgataagtttcatgatca 3578164  T
Q  369 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttg 400  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  3578163 attgat-ttgttgttgctaagtcatgttgttg 3578133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17101047 - 17100676
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaa-ttgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| |||||| | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  17101047 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagaaattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctatttt-caatttttgt 17100949  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||    
T  17100948 atgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 17100850  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | |  | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17100849 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaacatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatga 17100751  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  17100750 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggt 17100676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 17101732 - 17101361
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaa-ttgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| |||||| | |||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  17101732 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagaaattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctatttt-caatttttgt 17101634  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||    
T  17101633 atgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggat 17101535  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| | |  | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17101534 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaacatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatga 17101436  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  17101435 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggt 17101361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 210 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34560133 - 34559897
Alignment:
Q  210 aattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat 309  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| |    
T  34560133 aattataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaaatatgtgaatgtgttacatgttgaatt 34560034  T
Q  310 atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 409  Q
    |||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34560033 atgctctaaattttgaattatgttatgtagttgttgaattatgatgagattcatgttcgattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 34559934  T
Q  410 catggctt--gggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||    
T  34559933 catggcttgagtgttcataaatcataatttgatgatg 34559897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 292
Target Start/End: Original strand, 13301318 - 13301564
Alignment:
Q  46 gatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13301318 gatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgt 13301417  T
Q  146 tgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtg 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| | |||| ||  |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  13301418 tgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtg 13301517  T
Q  246 ataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaa 292  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  13301518 ataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa 13301564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 292
Target Start/End: Original strand, 13311974 - 13312220
Alignment:
Q  46 gatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13311974 gatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtgatttttcatttgt 13312073  T
Q  146 tgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtg 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| | |||| ||  |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||    
T  13312074 tgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattattggttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatggtatgtttgaatacatgaaattggtg 13312173  T
Q  246 ataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaa 292  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  13312174 ataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa 13312220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 196 - 444
Target Start/End: Original strand, 6228624 - 6228874
Alignment:
Q  196 aaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtg 295  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||    
T  6228624 aaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatg 6228723  T
Q  296 atatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatat 395  Q
    ||||||  |||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6228724 atatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgtcgaattatgatgtggatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagaaatat 6228823  T
Q  396 tgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  6228824 tgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatg 6228874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 419
Target Start/End: Original strand, 12349429 - 12349761
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  12349429 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattaattaattgt 12349526  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
     ||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| || ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  12349527 ccataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtataaatttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 12349626  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
     ||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12349627 gtgagaagttgttatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 12349725  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg 419  Q
    | || || || |||| | |||| | |||||||||||    
T  12349726 gatatgtcatgttgtagatgataaatcatggcttgg 12349761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35124090 - 35123700
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-g 147  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  35124090 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaaaggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattatttg 35123992  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || | |||||||| ||  ||||||||||   |||||||||||||||||||   ||    
T  35123991 tatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtactttaattatgatgacgtgtttggatgtatgaaattatgga 35123893  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||| |  ||||  | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  35123892 taattgaattgttgttagtcgaattacatgtt-aaagtgtatgaaaagggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttattg 35123795  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||| |||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  35123794 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcatgattcatgatttg 35123700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 418
Target Start/End: Original strand, 50111941 - 50112272
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  50111941 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 50112038  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  50112039 tcataaatgatgaaattcatgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagt 50112138  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50112139 atgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 50112237  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    | | ||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  50112238 gtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttg 50112272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14298778 - 14298425
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  14298778 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 14298681  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||    
T  14298680 tcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagt 14298581  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
     |  || |  | ||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  14298580 gtatgatatggttacgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttatt 14298482  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
      || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  14298481 aatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 14298425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14304405 - 14304052
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  14304405 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 14304308  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||    
T  14304307 tcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttgaattacatgttcaaagt 14304208  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
     |  || |  | ||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  14304207 gtatgatatggttacgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttatt 14304109  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
      || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  14304108 aatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 14304052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 418
Target Start/End: Original strand, 31412289 - 31412554
Alignment:
Q  154 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattg 252  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || ||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  31412289 taagtgcttaattgaataagtgattattttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattg 31412388  T
Q  253 aattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31412389 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctttaattgttgaattgtgatatgttgttgttgaattgtg 31412488  T
Q  353 gtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
     | ||| | | ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  31412489 atgagaattaggtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttg 31412554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 154 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 50313478 - 50313219
Alignment:
Q  154 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattg 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||   |||| ||| ||||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  50313478 taagtgcttaattgagtaagtgattattttgctcatagttgttgaaattcgtgctcttgttataatgatatgtttgagtgcatgaaattagtgataattg 50313379  T
Q  253 aattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  50313378 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttggattgtgatatgttgttgttgaattgtg 50313279  T
Q  353 gtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
     |  || ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  50313278 atgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcat 50313219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 41661818 - 41661563
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||| ||  ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  41661818 ttgttaaaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 41661719  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||     
T  41661718 aaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttgaga 41661619  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggctt--gggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||| |||||||||    
T  41661618 gatattgttgttgatgattcatagcttgagtgttcataaatcatgaattgatgatg 41661563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 86 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 8632148 - 8631812
Alignment:
Q  86 tctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattg 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | ||| | |||||||    
T  8632148 tctatctaaggtaagggggttaggattcatcataatcacttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattaattaattg 8632051  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
    ||| ||| || | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  8632050 ttcttaagtgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 8631951  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    | ||||||  || ||||||||| |||||||||  | ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    |||||||||||||||    
T  8631950 tttgagaagttggtatatgttgaaaatatgct-tatttagtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgt 8631852  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    || || || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8631851 tgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggtt 8631812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 417
Target Start/End: Original strand, 43427358 - 43427734
Alignment:
Q  43 agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttc 139  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||   ||||  |||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  43427358 agagattctaggagctaaattgaagtttttgctaggattattg--ctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttc 43427455  T
Q  140 aattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttg--ga-tgtat 235  Q
      |  ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| || | || || ||||| ||||||||||||   ||||| || ||||||||  || |  ||    
T  43427456 c-taattgtatgcataagtgcttaattgaataagtgattattttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatggtgatatgtttgatgagtacat 43427554  T
Q  236 gaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctat 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  | || | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  43427555 gaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtaaattgtgctctaattgttgaattgtgctat 43427654  T
Q  336 gttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
    ||||||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43427655 gttgttgttgagttgtgatgagaatcatgattaattgatgttgttgttgtt--gagatattgttgttgatgattcatagctt 43427734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 234 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1991012 - 1990800
Alignment:
Q  234 atgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgct 333  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||   |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| || |    
T  1991012 atgaaattggtaataattgaattattgtttgtgaaattgcatgttcatagtagatgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgt-gaattgtgtt 1990914  T
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg---gttcataattc 430  Q
    |||||||||||||| |||| | ||| ||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  1990913 atgttgttgttgaactgtgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatc 1990814  T
Q  431 atgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||||    
T  1990813 atgatttgatgatg 1990800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Original strand, 33368780 - 33369157
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||   | |||||| |  |||     
T  33368780 ctaggagctaaattgaagttttggctagg-atttgtgctaacaaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaattttcattaattgc 33368878  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||  |||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  33368879 atgattaagtgcttatttgaataattaattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctttaattgtggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgata 33368978  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||| || ||||            ||        |||||| |||||||||||||||||||    
T  33368979 attgaattgtggttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgttata------------ct-------gtgaattgtgctatgttgttgttgaat 33369059  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    | || | ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  33369060 tatgatgagaatcatgtttaattgatgtttttgttgttaaggaatattgttgttgacgattcatgacttgggtgttcataaatcatgatttgatgatg 33369157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 15517921 - 15517728
Alignment:
Q  154 taagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattga 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  15517921 taagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcataaatgttaaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattga 15517822  T
Q  254 attgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg-agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||  | |||||  |||| | |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  15517821 attgttgttggtgaaattgcatgttcatggtatgtataaatgggtatattgtgaattgtgcttaaattgatgaattgtgctaagttgttgttga 15517728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 17938966 - 17938596
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gt 148  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||  || | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||    
T  17938966 ctaggagcaaaattgaagcttaagctaggga-ttactccatctaagataagggggttagggttcatcataatcacttattgcaatttt-caattatttgt 17938869  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaat-tggtga 246  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||| | | || | |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||   ||||      
T  17938868 atgaa-aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcttgagtgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttggatgtataaagcatggt-- 17938772  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||  ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17938771 taagcgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatgagaagttgatatatgttgaaaatatgcttaa-ttgatgaattatgctttgttgttgttg 17938673  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  17938672 gattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcattcatggcttgggtt 17938596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48421972 - 48421843
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgta 149  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  48421972 ctaggagttaaagtgaagctagagctagggaattgatctaactaaggtaagagagttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 48421873  T
Q  150 tgaataagtgcttaattgagtaaatgatta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  48421872 tgaataagtgcttaattgaataagtgatta 48421843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 14527932 - 14528114
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14527932 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattattgt 14528031  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggat 231  Q
    ||||| ||||||||||||  || || ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  14528032 atgaa-aagtgcttaattaggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggat 14528114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 418
Target Start/End: Original strand, 317403 - 317729
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  317403 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 317499  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||    
T  317500 taagtgatgaaattcgtgctctaagtatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatg 317599  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    | |||  | ||| |||  ||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||| |     
T  317600 aaaaatgggtatgtgtgaaaatatgct-aaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttt 317698  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  317699 agtcatgttgttgatgataattcatggcttg 317729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 16181800 - 16182170
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-g 147  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |    
T  16181800 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttg 16181896  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |    
T  16181897 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaa 16181995  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    ||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||| |  |||| | | ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||||  ||| |||| ||    
T  16181996 taattgaattg-tgttagttaaattacatgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgc-caaattggtgaattatgcattgtcgttgatg 16182093  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||||||| |||| || ||| ||||||| ||||||||||  | ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16182094 aattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 16182170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 22144165 - 22144497
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  22144165 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactttttgtaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaactgttca 22144262  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | ||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |     
T  22144263 taactgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgta 22144361  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
     |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  22144362 tgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgt 22144460  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||||  || |||||| |||| || |||||||||||||    
T  22144461 taagccatgttgttgatgataatacatggcttgggtt 22144497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 10913139 - 10912908
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||| ||    
T  10913139 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtga 10913040  T
Q  291 aagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
    || ||  |||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |    
T  10913039 aaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgtggttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttgtcatg 10912940  T
Q  390 tgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  10912939 agatattgatgttgatgattcacagcttgggt 10912908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 418
Target Start/End: Original strand, 16995954 - 16996280
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||    
T  16995954 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattattca 16996050  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    || ||||||||||||||  |  ||||  ||||||||||||||    
T  16996051 taagtggtgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttacttgaattgtatgttcaaagtatg 16996150  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    | |||  | ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||| |     
T  16996151 aaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttt 16996249  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  16996250 agtcatgttgttgatgataattcatggcttg 16996280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11638554 - 11638389
Alignment:
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||  |||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11638554 taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgaattgtgctttaattgttgaattgtgctatgttgttgttga 11638455  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||    
T  11638454 tttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttattcagagatattggtgttgatgattcat 11638389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Original strand, 6154221 - 6154556
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttg-tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  6154221 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataatttt-caattatttctatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 6154318  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| |  | |||||||| ||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||    ||| ||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||    
T  6154319 tcataagtcatgaaattcgtcctctaattataatgacatgtttagatgtatgaaattatgaatagttgaattgt-gttagttgaattacatgttcaaagt 6154417  T
Q  285 atgagaaagtga-tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
     |  |||| ||  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  6154418 ttatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttat 6154516  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    || ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6154517 tgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 6154556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 306 - 421
Target Start/End: Original strand, 14528121 - 14528236
Alignment:
Q  306 aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 405  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  14528121 aaatatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggt 14528220  T
Q  406 gattcatggcttgggt 421  Q
     |||||||||||||||    
T  14528221 aattcatggcttgggt 14528236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 197 - 393
Target Start/End: Original strand, 19260839 - 19261035
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||  |     
T  19260839 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 19260938  T
Q  297 tatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  19260939 tatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgat 19261035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 418
Target Start/End: Original strand, 19570584 - 19570909
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||    
T  19570584 actaaggtaagggg-ttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaatttttca 19570679  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | ||||| |||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||| |     
T  19570680 tatgtgatgaaatttgtgctctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgt-gttagttgaattacatgttcaaagtgta 19570778  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  19570779 tgaaaatgagtatatgtggaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 19570877  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
     ||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  19570878 tagtcatgttgttgatgataattcatggcttg 19570909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13817864 - 13817537
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||| ||    
T  13817864 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgtaca 13817768  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| | ||| ||  |||| |||||||||||| |     
T  13817767 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattat-gttagttgaattacatgttcaaagtgta 13817669  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||       
T  13817668 tgaaaatgggtatatgtggaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttt-- 13817572  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  13817571 -agtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 13817537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 34560278 - 34560130
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             | ||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  34560278 cttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagcta-------------attaaggtaagggggttagaattcaatcatga 34560192  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt 182  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34560191 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaatt 34560130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Original strand, 4145791 - 4145954
Alignment:
Q  174 tgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 273  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4145791 tgattatttgttcatagttgttgaaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaa-ttggtgataattgaattgttgttgatgaaattac 4145889  T
Q  274 atgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgtt 338  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  4145890 atgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaactgtgctctaaatgttgaattgtgctatgtt 4145954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 364
Target Start/End: Original strand, 34439235 - 34439510
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||  | ||| |||||||||||||    
T  34439235 actaaggtaaggagattagaattcatcataatcacttattgtaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgtttaattggatgaattgattaattgttca 34439332  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgttt-ggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtat 286  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||| ||   ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  34439333 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttatgaggtatgaagttatggataaatgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtat 34439432  T
Q  287 gagaaagtgatatatg-ttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg 364  Q
    |  |||  | ||| || || |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  34439433 gtaaaatgggtatgtgtttaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatg 34439510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Original strand, 12487594 - 12487701
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487594 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taagagctaaaatgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 12487692  T
Q  114 atcataatc 122  Q
    |||||||||    
T  12487693 atcataatc 12487701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 421
Target Start/End: Original strand, 38375804 - 38375902
Alignment:
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | | |||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  38375804 tgaattgtgctatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttgtcatgagatactgttgttgatgattcatagcttgggt 38375902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Original strand, 51961030 - 51961107
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattga 168  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  51961030 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattga 51961107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 15551031 - 15550916
Alignment:
Q  14 caagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgat-ctaactaaggtaagggggttagaatt 112  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||    
T  15551031 caagaggagcttgaagattcaagagttggagagatcctacgagttaaagtgaagcttgggcta-ggaattggtgataattaagataagggggttagaatt 15550933  T
Q  113 catcataatcatttagt 129  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15550932 catcataatcacttagt 15550916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15520469 - 15520336
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||| ||||   ||||||| |||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15520469 cttgaagatttaagaagaggagagaacctaggagcttaattgaagcttgggctagggaattgacctaactaagataa-ggggttataattcatcataatc 15520371  T
Q  123 a-tttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataag 157  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  15520370 attttagtgtaatttttc-attgttgtatgattaag 15520336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 15859040 - 15859263
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| |||||  || |||    
T  15859040 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgaacaaatga 15859137  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| | | || ||| ||||     
T  15859138 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatg 15859236  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  15859237 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 15859263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 422
Target Start/End: Original strand, 53898440 - 53898680
Alignment:
Q  182 tgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||| ||    ||||||||||||| ||| ||   |||  ||||||||    
T  53898440 tgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatctatgaagttatgaataattgaattgt-gttagttgcattaaatgttcaa 53898538  T
Q  282 agtatgagaaagtga-tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgt 379  Q
    ||| |  |||| ||  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||    
T  53898539 agtgtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgt 53898637  T
Q  380 tgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  53898638 tgttgatatgtcatgttgttggtgataattcatggcttgggtt 53898680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11402846 - 11402621
Alignment:
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||  || ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||    
T  11402846 taattgttgaaattcgtgctcatattatagtgatatgtttgagtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcatggggtg 11402747  T
Q  288 -agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     | |||  | |||||  |||| | ||||||||| | |||||| || || ||||||||||| ||||| |   || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  11402746 tataaataggtatattgtgaattgtgctcaaatggatgaattgtgttaggttgttgttgatttgtgattgaatacatgtttaattgatgttgttgttgtt 11402647  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    | |  || ||||||||||||||||||    
T  11402646 atgatatgttgttgttgatgattcat 11402621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 307 - 437
Target Start/End: Original strand, 12349841 - 12349971
Alignment:
Q  307 aatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatg 406  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   || |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||||     
T  12349841 aatatgctcaa-ttggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgata 12349939  T
Q  407 attcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12349940 attcatggcttgggttgcatgattcatgattt 12349971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38528121 - 38527934
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||  | |  ||||    
T  38528121 ctaggagcaaaattgaagcttaagctagggagattaaccta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaattttcaactatttgt 38528024  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaa 238  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  38528023 atgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaa 38527934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 437
Target Start/End: Original strand, 6146856 - 6146987
Alignment:
Q  306 aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 405  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||| || |||||| | ||    
T  6146856 aaatatgctcaa-ttggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataat 6146954  T
Q  406 gattcatggcttggg-ttcataattcatgattt 437  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  6146955 aattcatggcttgggtttcatgattcatgattt 6146987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 38168041 - 38167937
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  38168041 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggct 38167942  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  38167941 tgggt 38167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 51158034 - 51158257
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  51158034 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 51158131  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||  |||| | || ||||| ||||||||||||||| | | || ||| ||||     
T  51158132 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatg 51158230  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  51158231 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 51158257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 190
Target Start/End: Original strand, 6146659 - 6146762
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  6146659 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 6146756  T
Q  185 tcataa 190  Q
    ||||||    
T  6146757 tcataa 6146762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8605078 - 8604977
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8605078 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtaataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtga 8604979  T
Q  291 aa 292  Q
    ||    
T  8604978 aa 8604977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40939521 - 40939429
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaa 141  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  40939521 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattcattgcaaattttcaa 40939429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47984765 - 47984674
Alignment:
Q  330 tgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47984765 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggt 47984674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 47994052 - 47993961
Alignment:
Q  330 tgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  47994052 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggt 47993961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48003339 - 48003248
Alignment:
Q  330 tgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48003339 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggt 48003248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 48012625 - 48012534
Alignment:
Q  330 tgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  48012625 tgctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggt 48012534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12031932 - 12031827
Alignment:
Q  24 ttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgat-ctaactaaggtaaggggg-ttagaattc-atcata 119  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12031932 ttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggcta-ggaattggtgataattaaggtaagggggtttagaattcaatcata 12031834  T
Q  120 atcattt 126  Q
    |||||||    
T  12031833 atcattt 12031827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14285089 - 14284984
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| ||| |    
T  14285089 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctcagatatgttgttgtttatgatttatgac 14284990  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  14284989 ttgggt 14284984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 421
Target Start/End: Original strand, 17912616 - 17912720
Alignment:
Q  316 aaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    |||||| |||||| || |||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  ||    
T  17912616 aaattgatgaatt-tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgc 17912714  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  17912715 ttgggt 17912720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 444
Target Start/End: Original strand, 51961298 - 51961386
Alignment:
Q  358 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  51961298 attcatgcttaattgatgttgttgttgatatgagatgttgttgttgatgattcatggtttgggtgttcacaaatcatgatttgatgatg 51961386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3992677 - 3992573
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  3992677 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 3992578  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  3992577 tgggt 3992573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30153069 - 30152946
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||  ||||||    
T  30153069 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggct 30152970  T
Q  417 tgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||    
T  30152969 tgggtttgcatgattcatgatttg 30152946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 436
Target Start/End: Original strand, 16934101 - 16934223
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  16934101 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatttatggc 16934200  T
Q  416 ttggg--ttcataattcatgatt 436  Q
    |||||  ||||||| ||||||||    
T  16934201 ttgggtattcataaatcatgatt 16934223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 11477318 - 11477423
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  11477318 aattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgctgctgagatatgttgttgtttatgatttatggc 11477417  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  11477418 ttgggt 11477423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Original strand, 17956131 - 17956235
Alignment:
Q  336 gttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatg 433  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||    
T  17956131 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatg 17956230  T
Q  434 atttg 438  Q
    |||||    
T  17956231 atttg 17956235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 2844318 - 2844214
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  2844318 aattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 2844219  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  2844218 tgggt 2844214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16261580 - 16261476
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  16261580 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 16261481  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  16261480 tgggt 16261476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 280
Target Start/End: Original strand, 38375687 - 38375779
Alignment:
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  38375687 taattgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttgatgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttca 38375779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13839141 - 13838918
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  13839141 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaa-taggaacaaatga 13839044  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || ||||| ||||||||||||||| | | || ||| ||||     
T  13839043 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatg 13838945  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||    
T  13838944 ttgtggttgatgaatcattgtttgggt 13838918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 19946826 - 19946704
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||| || || || |||||| |||| || ||||||    
T  19946826 aattgatgatttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggc 19946727  T
Q  416 ttgggtt--cataattcatgatt 436  Q
    |||||||  ||| ||||||||||    
T  19946726 ttgggtttgcatgattcatgatt 19946704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7854109 - 7854004
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatg-ttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  7854109 aattggtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggc 7854011  T
Q  416 ttgggtt 422  Q
    |||||||    
T  7854010 ttgggtt 7854004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 33342008 - 33341887
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| ||||||||||    
T  33342008 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggct 33341909  T
Q  417 tgggtt--cataattcatgatt 436  Q
    ||||||  ||| ||||||||||    
T  33341908 tgggtttgcatgattcatgatt 33341887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 419
Target Start/End: Original strand, 54685429 - 54685531
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| ||||||||||    
T  54685429 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggct 54685528  T
Q  417 tgg 419  Q
    |||    
T  54685529 tgg 54685531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 8268872 - 8268976
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  8268872 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggc 8268970  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  8268971 ttgggt 8268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 8275972 - 8276076
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || |||||||||| |||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  8275972 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttattgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggc 8276070  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  8276071 ttgggt 8276076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 12030163 - 12030247
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  12030163 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 12030247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 14842577 - 14842661
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| |||||  |||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  14842577 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaa 14842661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 15936643 - 15936727
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  15936643 aaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 15936727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23492481 - 23492396
Alignment:
Q  336 gttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  23492481 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggt 23492396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 262
Target Start/End: Original strand, 11196296 - 11196384
Alignment:
Q  174 tgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgtt 262  Q
    |||||||||||||||   || | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  11196296 tgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgctctaataatgatgatatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 11196384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 53771168 - 53771092
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  53771168 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 53771092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 412
Target Start/End: Original strand, 12539107 - 12539288
Alignment:
Q  235 tgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgct 333  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||   || |   || ||| |||||  |||| | ||||||||| | |||||| ||||    
T  12539107 tgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgataagtataaatgagtatattgtgaattgtgctcaaatggatgaattgtgct 12539206  T
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgtt---gttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    | ||||||||||| ||||| |   || |||||| ||||||||||   ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  12539207 aagttgttgttgatttgtgattgaatacatgtttaattgatgttgttgttgttgttatgagatgttgttgttgatgattcat 12539288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821303
Alignment:
Q  215 tgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcat-aaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 16821303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7854337 - 7854300
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7854337 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagt 7854300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 278
Target Start/End: Original strand, 17912499 - 17912578
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 278  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  17912499 aaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 17912578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 45581758 - 45581654
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatg-ttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| || | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  45581758 aattggtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggc 45581660  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  45581659 ttgggt 45581654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 421
Target Start/End: Original strand, 54038251 - 54038356
Alignment:
Q  316 aaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||| |||| |||| || | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  54038251 aaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgataattcatggc 54038350  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  54038351 ttgggt 54038356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18970318 - 18970255
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18970318 ctaggagctaaattgatgtttgggctagg-atttgtgctaactaaggtaagggggttagatttca 18970255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 68413 - 67990
Alignment:
Q  24 ttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68413 ttgaagattcaagagttggagaga-cctagaagctaaagtgaagcttgagctagggaattaatataactaaggtaagggggttagaattcatcataatca 68315  T
Q  124 ttt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtt 221  Q
    |||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  68314 tttttagtataaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaatagattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgtt 68215  T
Q  222 atgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattg 321  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68214 atgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattg 68115  T
Q  322 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt--gg 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |     
T  68114 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggcttgcgt 68015  T
Q  420 gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  68014 gttcataattcatgatttgatgatg 67990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 43646327 - 43645897
Alignment:
Q  15 aagaagaa-cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaat 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  43646327 aagaagaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaat 43646229  T
Q  112 tca-tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctc 208  Q
    ||| ||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  43646228 tcagtcataatcatttttagtgtaaatttccaattgttgtatgaataagtgtttaattgagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtgctc 43646129  T
Q  209 caattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa 308  Q
     ||||||| || |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  43646128 taattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtgatatatgttgaat 43646029  T
Q  309 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43646028 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaactgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgtcgatgat 43645929  T
Q  409 tcatggcttgg--gttcataattcatgatttg 438  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  43645928 tcatgacttgggtgttcataattcatgatttg 43645897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 722813 - 722400
Alignment:
Q  21 aacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataa 120  Q
    |||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  722813 aacttgaagattcaagaagatgagagaacctaggagctaaagtgaagtttgggctagggaattgaactaactaaggtaaaggggttagaattcatcataa 722714  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  722713 tcatttagtgcaatttg-caattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatat 722615  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||    ||||||| || |    
T  722614 tatgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatatgtt----tatgctctaaat 722519  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    ||  |||| || ||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||     
T  722518 gtcaaattgtgatatgttgatgttgaattatgctgagattcatgttcaattgaagtagttgctgctaagtgatgttgttattgataattcatggcttggg 722419  T
Q  420 -gttcataattcatgattt 437  Q
     || |||||||||||||||    
T  722418 tgtgcataattcatgattt 722400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 415
Target Start/End: Original strand, 31146004 - 31146398
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31146004 cttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggctagagaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 31146103  T
Q  123 at--ttagtgcaatttttcaa-ttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatg 219  Q
    ||  || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31146104 atcttttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaataagtgcttaactgagtaattgattaattgtccataattgttagaattcgtgttccaattatgatg 31146203  T
Q  220 ttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaat 319  Q
     |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31146204 gtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaat 31146303  T
Q  320 tgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||    
T  31146304 tgttgaattatgctatg-tgttgttgaattgtaataagattcctgttcaattgatgttactgttgctaagtgatgttgttgatgataaatcatggc 31146398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 46 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19666926 - 19666526
Alignment:
Q  46 gatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19666926 gatcctaggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaattat 19666827  T
Q  146 tgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtg 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  19666826 tgtatgaataaatgcttaattgaataagtgattaattgttcatagttgttaaaattcatgctctaactataatgatatgtttgaatgcatgaaattggtg 19666727  T
Q  246 ataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||   ||||| ||  |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  19666726 ataattgaattgtttttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataagtgttaacttatgaattatgctcaaatggttgaattatgctatgttgttattg 19666627  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgat 443  Q
    |||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  19666626 aattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgtcgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgttttgatgat 19666527  T
Q  444 g 444  Q
    |    
T  19666526 g 19666526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 24294347 - 24294766
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24294347 cttgaagattcaagaggaggagagaacctaggagctaaattgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttaaagttcatcataatc 24294446  T
Q  123 attt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||  |||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24294447 atttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataaattcttaattgagtaattgattaattgttcatgattgttagaattcgtgctccaattatgatgt 24294546  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||  ||| ||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||  | ||||||| || |    
T  24294547 tataattgtatgtgagaaattgatgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatatgttatattatgctccaaat 24294646  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 420  Q
    ||  |||| || ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  24294647 gtcaaattgtgatatgttgatgttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatgattcatggcttgag 24294746  T
Q  421 --ttcataattcatgatttg 438  Q
      ||||||||||||||||||    
T  24294747 tattcataattcatgatttg 24294766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 384
Target Start/End: Original strand, 22775044 - 22775392
Alignment:
Q  28 agattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt- 126  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22775044 agattcaagagttggagaggacctaggagctaaagtgaatcttgaggtagggaattgatctaactaaggtaagggggtaagaattcatcataatcatttt 22775143  T
Q  127 -agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgt 225  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22775144 tagtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgtt----------agaattcgtgctccaattatgatgttatgt 22775233  T
Q  226 ttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttga 325  Q
    ||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||  |||    
T  22775234 ttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttatatatgttgaattgtgttcaaatttatga 22775333  T
Q  326 attatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22775334 attatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttg 22775392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 28 - 384
Target Start/End: Original strand, 22780422 - 22780770
Alignment:
Q  28 agattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt- 126  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22780422 agattcaagagttggagaggacctaggagctaaagtgaatcttgaggtagggaattgatctaactaaggtaagggggtaagaattcatcataatcatttt 22780521  T
Q  127 -agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgt 225  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780522 tagtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgtt----------agaattcgtgctccaattatgatgttatgt 22780611  T
Q  226 ttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttga 325  Q
    ||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||  |||    
T  22780612 ttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaagttatatatgttgaattgtgttcaaatttatga 22780711  T
Q  326 attatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780712 attatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgttg 22780770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25305855 - 25305443
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattca-tcata 119  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25305855 cttgaagattcaagaattggaagagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctatg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcata 25305757  T
Q  120 atcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25305756 atcattttagtataattttacaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcaaagttgttataattcgtgctctaattatgat 25305657  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    | |||||||| ||| ||||| |||               |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25305656 gatatgtttgaatgcatgaagttg---------------ttgttgatgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatgtgttgaattatgctcaaa 25305572  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttg-ttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  25305571 ttgttgaattatgctatgttgattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgtggctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcct 25305472  T
Q  418 ggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||    
T  25305471 gggtattcataattcatgatttgttgatg 25305443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 15 - 436
Target Start/End: Original strand, 3063 - 3482
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3063 aagaggaacttgaagattcaagaagagaagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 3162  T
Q  115 tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  3163 tcataatcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgattatgtgcttaattgagtaattgattaattgttcatgattgttagaattcgtgctcctat 3262  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||||||||   | |||     
T  3263 tatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatatgtcatattatt 3362  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||| || |||  | || || ||      ||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3363 ctctaaatgtcaatttgtgata------tgttgaattatgcttaggttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcat 3456  T
Q  413 ggcttgg--gttcataattcatgatt 436  Q
    |||||||  |||||||||||||||||    
T  3457 ggcttgggtgttcataattcatgatt 3482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Original strand, 19668961 - 19669358
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  19668961 ctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaacggggttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattattgt 19669060  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| || |||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  19669061 atgaataagtgattaattggataaatgattaattgttcatagatgttaaaatccatgctctaactatggtgatatgtttgtatgcatgaaattgatgata 19669160  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||| ||  |  ||||  ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19669161 attgagttgttgttggtgaaattgcatgttctaagtatgtgtaagtgttaacttgtgaatcatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaat 19669260  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    | || |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  19669261 tatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaactgatgatg 19669358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 421
Target Start/End: Original strand, 22579686 - 22580083
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcat 118  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||| | ||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22579686 gaacttgaagaatcaagattggaagagagc-taggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatttaactaaggtaagggggttagaattcatcat 22579784  T
Q  119 aatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22579785 aatcact-attgcaatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattgtgtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgat 22579883  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag-aaagtgatatatgttgaaatatgctcaa 317  Q
    |  ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  22579884 gacatgtttgtatgtatgaagtt-atgataattgaattgttgttggtgaaactttatgatcaaggtatgagaaaaatgttatatgttgaaatatgctcaa 22579982  T
Q  318 attgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
     | |||||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || || || ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22579983 ttggttgaattatgct---ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataattcatggctt 22580079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 50 - 405
Target Start/End: Original strand, 24571145 - 24571500
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  24571145 ctaggagctaaattgaagtttaagatagggagattaatctaactaaggttagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatgtttcaattattgt 24571243  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||| |||| |||||  | ||||| ||| ||||| |||  ||||    
T  24571244 atgaataaatgcttaattgggtaattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattttgatgacacgtttgaatgcatgaagttgtggata 24571343  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24571344 cttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaggtatgagaaaatgatatatgttgaaatatgctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaat 24571443  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 405  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  24571444 tgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgat 24571500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28974443 - 28974047
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||    
T  28974443 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-atttcaatttttcaattattgt 28974345  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||   |||    
T  28974344 atgaa-aagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggat 28974246  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||| |||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||    
T  28974245 aatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcat-ttggcgaattatgctatgttgttgatga 28974147  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  28974146 attgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatg 28974047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 72 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25602398 - 25602028
Alignment:
Q  72 agctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagt 170  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25602398 agctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattgggt 25602299  T
Q  171 -aaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaa 269  Q
     || |||||||||||||||   || | |||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  ||    
T  25602298 gaattgattaattgttcatggatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaa 25602199  T
Q  270 tttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttca 368  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||    
T  25602198 ttacatgttcaaagtatgagaaattgatatatgttgaaaatatgctc-aattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatca 25602100  T
Q  369 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||||||||||||||| || || |||||  |||| | ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  25602099 attgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaatcatggcttaggtttgcatgattcatgatttg 25602028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Original strand, 23821467 - 23821705
Alignment:
Q  25 tgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 124  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23821467 tgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagatttcattataatcat 23821566  T
Q  125 ttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatg 224  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23821567 ttagtgtaatttttcaattattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatg 23821666  T
Q  225 tttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttg 263  Q
    |||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23821667 tttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttg 23821705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Original strand, 23830546 - 23830784
Alignment:
Q  25 tgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 124  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23830546 tgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagatttcattataatcat 23830645  T
Q  125 ttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatg 224  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23830646 ttagtgtaatttttcaattattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgttatg 23830745  T
Q  225 tttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttg 263  Q
    |||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23830746 tttgaatgcaggaagttgttgataattgaattgttgttg 23830784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 178 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24884952 - 24884686
Alignment:
Q  178 taattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgt 277  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24884952 taatttttcatagttgttaaaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgt 24884853  T
Q  278 tcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgtt 377  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  24884852 tcaaagtatgtgaaagtgatatattgtgagttatgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 24884753  T
Q  378 gttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatga 442  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  24884752 gttgttgctaatagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatgatttgatga 24884686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 271526 - 271174
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| ||    
T  271526 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattatt 271429  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| ||   |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||     
T  271428 cataaatgaagaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtg 271329  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    |  ||||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  271328 tatgaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 271230  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
     || || || |||||| |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  271229 atatgtcatgttgttgatgataattcatagcttgggtttgcatgattcatgatttg 271174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 86 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 24278121 - 24277758
Alignment:
Q  86 tctaactaaggtaagggggttagaattc-atcataatcatttag-tgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattg 183  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||     
T  24278121 tctaattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatttt 24278022  T
Q  184 t-tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    | || || ||| | ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24278021 tctcttagttg-tgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgacaattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 24277923  T
Q  283 gtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||    
T  24277922 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaaatgatgttgttgt 24277823  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt--tcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  24277822 tgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtactcataaatcatgatttgatgatgt 24277758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 421
Target Start/End: Original strand, 36890576 - 36890909
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  36890576 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgttatttt-caattatggtatgaa-aagtgcttatttgggtgaattgattaattgtt 36890673  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  36890674 cataaatgatgaaattcgtgctctaattgtgatggcatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 36890773  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||||| ||  ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  36890774 tgagaaaatggaatatgttgaaaatatgcttaa-ttggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttg 36890872  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||    
T  36890873 ctaagtgatgttgtggatgattattcatggcttgggt 36890909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 85 - 438
Target Start/End: Original strand, 4448021 - 4448376
Alignment:
Q  85 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttg-tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4448021 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattatttatatgaa-aagtgcttaattgagtgaattgattaatt 4448118  T
Q  183 gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  4448119 gttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa 4448218  T
Q  283 gtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttg 381  Q
    || |  ||||  | | | ||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4448219 gtgtatgaaatgggtttgtgttgaaaatatgttc-aattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 4448317  T
Q  382 ttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  4448318 ttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 4448376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27262199 - 27261810
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27262199 ctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggagttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattattgt 27262100  T
Q  149 atgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||   || | ||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||| || ||   |||    
T  27262099 atgaataagtgcttaattggatgaattgattaattgttcatggatgatgaaatttgtgccctaattatgatgacatgtttggatgtataaagttatggat 27262000  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||       ||   |    
T  27261999 aattgaattgttgttagttcaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaatatgctc--attggtgaattatgctcaaagtatgagaa 27261902  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||  || |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  27261901 at--tgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 27261810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 212 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9636977 - 9636768
Alignment:
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| |||    
T  9636977 ttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattat 9636878  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9636877 gctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattca 9636778  T
Q  412 tggcttgggt 421  Q
    | | ||||||    
T  9636777 tagtttgggt 9636768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19660299 - 19660032
Alignment:
Q  25 tgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattcatcataatca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19660299 tgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggg-ttagaattcatcataatca 19660202  T
Q  124 -tttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtta 222  Q
     ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||| |||||| ||  |||| || ||||||||| |||||||||| ||    
T  19660201 ctttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgtttaatggaataagtgattatttgttcttagatgttgaatttcgtgctctaattatgatgata 19660102  T
Q  223 tgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaa 292  Q
    |||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  19660101 tgttcgtatacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaa 19660032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 384
Target Start/End: Original strand, 24087295 - 24087574
Alignment:
Q  105 ttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcg 203  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24087295 ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttca-ttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattattcataaatgttaaaattcg 24087393  T
Q  204 tgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg-agaaagtgatatatg 302  Q
     |||| |||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||  | |||||     
T  24087394 ggctctaattatgatgatatgtttgagcacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatggtatgtataaatgggtatatt 24087493  T
Q  303 ttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
     |||| | |||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||| || ||||   ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  24087494 atgaattgtgcttaaattgatgaattgtgctaagttgttgttgatttatggttgaattcatgtttaa-tgaagttgttgttg 24087574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 313 - 444
Target Start/End: Original strand, 19433448 - 19433581
Alignment:
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19433448 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttattgaattgttgtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcat 19433547  T
Q  413 ggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  19433548 ggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatg 19433581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 322 - 445
Target Start/End: Original strand, 23821730 - 23821855
Alignment:
Q  322 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg-- 419  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  23821730 ttgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggt 23821829  T
Q  420 gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23821830 gttcataattcatgatttgatgatgt 23821855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 322 - 445
Target Start/End: Original strand, 23830809 - 23830934
Alignment:
Q  322 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg-- 419  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  23830809 ttgaattgtgctatgttattgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggt 23830908  T
Q  420 gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23830909 gttcataattcatgatttgatgatgt 23830934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 383
Target Start/End: Original strand, 16292695 - 16292987
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||| || | || ||     
T  16292695 aggtaagggggttagagttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattaagtaagtgattattttgctcttag 16292794  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||| |||||    |||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  16292795 ttgttgaaatttgtgctattgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaactgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgcga 16292894  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    || || |||||  | || | ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16292895 aaatggtatattgtcaattgtgctttaattgttgaattgtactatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgtt 16292987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 153 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32466149 - 32465880
Alignment:
Q  153 ataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataatt 251  Q
    ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||  || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    || |||    
T  32466149 ataagtgcttatttgaatgaattgattaattgttcatatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgatt 32466050  T
Q  252 gaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgt 351  Q
    ||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||| ||||||||    
T  32466049 gaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatgaaaaatggatatgtgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttcttgatgaattgt 32465951  T
Q  352 ggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32465950 gataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 32465880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 6094895 - 6094739
Alignment:
Q  265 tgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg 364  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  6094895 tgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatg 6094796  T
Q  365 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6094795 tttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 6094739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 438
Target Start/End: Original strand, 23836599 - 23836948
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || | |||| ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  23836599 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgaatga-taagtgcttaattagatgaattgattaattgttca 23836695  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| |     
T  23836696 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgt-gttagtggaattacatgttcaaagtgta 23836794  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
     |||| ||  ||| |||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||||     
T  23836795 tgaaaatgggtatgtgtgaaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgt 23836893  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    | ||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    
T  23836894 ttagtcattttgttgatgataattcatgacttgggtttgcataattcttgatttg 23836948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25595252 - 25595046
Alignment:
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    |||||||| ||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||| |||| || |||||  |||| | |    
T  25595252 ttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataaatgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaatggtatattgtgaattgt 25595153  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |   ||||||||||||||    
T  25595152 actctaattgttgaattgtgctatgttgtttttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagaga---ttgttgatgattca 25595056  T
Q  412 tggcttgggt 421  Q
    | ||||||||    
T  25595055 tagcttgggt 25595046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 25875814 - 25876144
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| |||||| |||||||  | ||| |||||||||||||    
T  25875814 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgtttaattggatgaattgattaattgttca 25875910  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||| | ||| ||  |||| |||||||||||| |     
T  25875911 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattat-gttagttgaattacatgttcaaagtgta 25876009  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| ||  ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| |||| || ||||||| ||| |    
T  25876010 tgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtt 25876108  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25876109 tagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 25876144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7321949 - 7321835
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7321949 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagatc-taggagctaaattgaagtttgagcttgggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 7321851  T
Q  114 atcataatcatttagt 129  Q
    || ||||||| |||||    
T  7321850 attataatcacttagt 7321835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18537012 - 18536770
Alignment:
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    |||||||  ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||| | ||||    
T  18537012 taattgtcgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtgataattaaattgctgtagatgaaattgcatgttcataatatg 18536913  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| ||  |||||  | || | ||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |      
T  18536912 tgaaaatgggtatattgtaaattgtgctctaattgttaaattgtgttatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgtcgtc 18536813  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg-gttcataat 428  Q
    | | |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18536812 atgagatactgttgttgatgattcatagcttggtgttcataat 18536770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 309 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 22138295 - 22138158
Alignment:
Q  309 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 408  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||   |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22138295 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgat 22138196  T
Q  409 tcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    | ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  22138195 ttatgacttgggtattcataattcatgaattgatgatg 22138158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Original strand, 24560867 - 24560955
Alignment:
Q  333 tatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24560867 tatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 24560955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 25265406 - 25265629
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||  ||||  ||| ||     
T  25265406 aaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaatgt 25265503  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
     |  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  25265504 gaagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatg 25265602  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  25265603 ttgttgtttatgaatcatggcttgggt 25265629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 24885062 - 24884943
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagttt-gagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc-atcata 119  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||  || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24885062 cttgaagattcaagaactggtagagatcctaggagctaaattgaagtttggggcta-ggaattgtgcttactaaggtaagggggttataattcaatcata 24884964  T
Q  120 atcatttagtgcaatttttca 140  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  24884963 atcatttagtgtaatttttca 24884943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 33128172 - 33128068
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33128172 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttgtggttaagagatattgttgttaatgattcatggct 33128073  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  33128072 tgggt 33128068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 24341524 - 24341628
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||  ||||||||| |||| |||    
T  24341524 aattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatcattgct 24341623  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  24341624 tgggt 24341628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 36982457 - 36982680
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||  ||||| ||| ||||||||| |   ||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  36982457 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaa-ttgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 36982554  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  36982555 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatg 36982653  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  36982654 ttgttgttgatgaatcattgtttgggt 36982680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 28031366 - 28031471
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  28031366 aattgatgaattatgatatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgttgagatatgttgttgtttatgatttatggc 28031465  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  28031466 ttgggt 28031471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 377
Target Start/End: Original strand, 19794720 - 19794899
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  19794720 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-taggaacaaatga 19794817  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgtt 377  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  19794818 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgtt 19794899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 43642973 - 43643057
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  43642973 aaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 43643057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20279634 - 20279575
Alignment:
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20279634 tatgtttgggtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 20279575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15633341 - 15633237
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||  || ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||||| |||||    
T  15633341 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaaacaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgct-atgatttatggc 15633243  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  15633242 ttgggt 15633237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 21274177 - 21274281
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||  || | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  21274177 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 21274276  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  21274277 tgggt 21274281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8891489 - 8891266
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  8891489 aaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaa-taggaacaaatga 8891392  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||  |||| | || ||||| ||||||||||||||| | | |  ||| ||||     
T  8891391 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatg 8891293  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  8891292 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 8891266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22274849 - 22274731
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |  | |||||| ||||| | |||||||| || | ||| ||||||||| |||||||  ||||||    
T  22274849 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatagatggct 22274750  T
Q  417 tgggtt-cataattcatga 434  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  22274749 tgggttgcatgattcatga 22274731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 462985 - 462901
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  462985 aaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 462901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6095039 - 6094902
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |  |||||||  |||||||||| |||| ||| |||||| || | || ||     
T  6095039 aggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattttgctcttag 6094940  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttg 228  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  6094939 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttg 6094902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 17204459 - 17204358
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| | |||||    
T  17204459 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatattgttgattatgaattatggc 17204360  T
Q  416 tt 417  Q
    ||    
T  17204359 tt 17204358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 20627329 - 20627413
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| | ||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20627329 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaa 20627413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 25213176 - 25213071
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||    
T  25213176 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggc 25213077  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  25213076 ttgggt 25213071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 23 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 432884 - 432465
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataat 121  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  432884 cttgaagattcaagaattggaagagagc-taggagctaaagtgaagctagagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataat 432786  T
Q  122 catttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtt 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  432785 catttactgcaatttttcaattgttgcatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgatcataattgttaaaattcgcgctccaattatgatgat 432686  T
Q  222 atgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattg 321  Q
    ||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  432685 atgtttgaatgcatgtagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgttgaattatgctcaaattg 432586  T
Q  322 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg- 420  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  432585 atgaattatactatgttgttgttggattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcctggcttgggt 432486  T
Q  421 -ttcataattcatgatttgat 440  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  432485 attcataatttatgatttgat 432465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7728816 - 7728443
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattta--gtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||| ||||||    
T  7728816 ctaggagctaaagtgaagctagagccagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgtaaattttcatttgttg 7728717  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  7728716 tatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtactccaattatgaagttatatttgaatggatgaaattggtgat 7728617  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7728616 aattgatttgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 7728517  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||    
T  7728516 ttgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgcttgggt 7728443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 5450666 - 5451092
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattcatcataa 120  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5450666 cttgaagattcaagaattggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattgataataattaaggtaagggggttagaattcatcataa 5450764  T
Q  121 tcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||  |||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5450765 tcatttttagtgtaaattttcaattgttgcataaataaatgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcatgctccaattatgat 5450864  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5450865 gttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaaa 5450964  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  5450965 ttgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataaaattcatgttcaactgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcttggcttg 5451064  T
Q  419 g--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |  | |||||| ||||||||||||||||    
T  5451065 gatgatcataaatcatgatttgatgatg 5451092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19862633 - 19862207
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattca-tcata 119  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||||||  ||||   ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19862633 cttgaagattcaagaattggtattgatcttaggagctaaagtgaagtttaggctaaa-aattggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcata 19862535  T
Q  120 atcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19862534 atcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaattatgat 19862435  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    | |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19862434 gatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaaa 19862335  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19862334 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgacttg 19862235  T
Q  419 g--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  19862234 ggtgttcataattcatgatttgatgatg 19862207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3674284 - 3673860
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||   ||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3674284 cttgaagattcaagaagaggagaggatctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 3674185  T
Q  123 attt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  3674184 atttttagtgtaatttt-caattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctcaaattatgatga 3674086  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||  || || ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3674085 tatgtttgaatacattaagttgttgataattgaattgttgttagggaaatttcatgatcaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaatatgctcaaatt 3673986  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||     
T  3673985 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggcttggg 3673886  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||    
T  3673885 tgttcataaatcacgatttgatgatg 3673860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28902614 - 28902252
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28902614 cttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 28902515  T
Q  123 attt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28902514 atttgtagtgttaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgt 28902415  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28902414 tatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaaatt 28902315  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28902314 gatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgtt 28902252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 28939009 - 28938647
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28939009 cttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 28938910  T
Q  123 attt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28938909 atttgtagtgttaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgt 28938810  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28938809 tatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaaatt 28938710  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28938709 gatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgtt 28938647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21617448 - 21617014
Alignment:
Q  15 aagaagaa-cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaatt 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21617448 aagaagaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaaggttgggctagg-aattgtgctaattaaggtaagggggttagaatt 21617350  T
Q  113 ca-tcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataa-ttgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |    
T  21617349 caatcataatcatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagggattaattgttcattagttgttagaattcgtgctcta 21617250  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  21617249 attatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttagtgaaattgcatgttccaagtatatgaaagtgttatatgttgaacta 21617150  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21617149 tgctctaaatgttgaattgttctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattc 21617050  T
Q  411 atggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21617049 atggcttgggtgttcataattcatgatttgatgatg 21617014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 23 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16595929 - 16595531
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16595929 cttgaagattcaagagttggagaggacctaggagctaaagtgaaacttgagctatggaattaatcttactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 16595830  T
Q  123 attt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtt 221  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16595829 attttagtgtaaattttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaattgactaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgtt 16595730  T
Q  222 atgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattg 321  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16595729 atgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgatagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaatatgctcaaattg 16595630  T
Q  322 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||  |||| ||||| ||||||| |||||||    
T  16595629 -tgaattatgttatgttgatgttgaattatgttgagattcatgttcaattgatgtagatgttgttaaatgatgatgttattgataattcatgacttgggt 16595531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 21222424 - 21222857
Alignment:
Q  15 aagaagaa-cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaat 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |    
T  21222424 aagaagaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtatgggggttagagt 21222522  T
Q  112 tca-tcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  21222523 tcaatcataattatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtat-tgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctcta 21222621  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||    
T  21222622 attatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaatta 21222721  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21222722 tgctctaaatgtttaattgtgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattaatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 21222821  T
Q  411 atggctt--gggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||    
T  21222822 atggattgagtgttcataaatcatgacttgatgatg 21222857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23494352 - 23493917
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga---gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaat 111  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  23494352 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagaacctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaaa 23494253  T
Q  112 tcatcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcc 209  Q
    |||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23494252 tcatcataatcatttttagtgtaaattt-caattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaatcaattaattgttcataattgttagaattcgtgctcc 23494154  T
Q  210 aattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat 309  Q
    || |||||||  ||||| | ||| ||||| |||  || |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||  ||  | |||||||||| ||    
T  23494153 aactatgatgacatgttcgaatgcatgaagttgtggaaaattgaattgttattagtggaattttatgttcaaagtatgaagaataggtatatgttgagat 23494054  T
Q  310 atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 409  Q
    ||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23494053 atgcgaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgatt 23493954  T
Q  410 catggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23493953 catggcttgggtgttcataattcatgatttgatgatg 23493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37983787 - 37983362
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37983787 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagaaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataa 37983688  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||| ||     
T  37983687 tcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctctatctatggtga 37983588  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| || |    
T  37983587 tatatttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatattcaaagtatgtgaaagtgatatattgtgaattatgctctaaat 37983488  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  37983487 gttgaattgtgctatgttattgttgaattgtaatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttggg 37983388  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||    
T  37983387 tgttcataaatcaggatttgatgatg 37983362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 384
Target Start/End: Original strand, 21297000 - 21297361
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21297000 cttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggatagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatt 21297099  T
Q  123 attt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtt 221  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||| |    
T  21297100 attttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcataaatgttaaaattcgtcctctaactatgatgat 21297199  T
Q  222 atgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattg 321  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||   ||||||    
T  21297200 atgtttgaacgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtgaaaatgatatatgttgaattatgtcaaaattg 21297299  T
Q  322 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | || |||| | ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  21297300 ttgaattgtgctaagttgttgttaatttatggttaaattcatgtttaa-tgaagttgttgttg 21297361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 418
Target Start/End: Original strand, 32965970 - 32966368
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 119  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32965970 gaacttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggctagggaattgatctaactaaggtaagagggttagaattcatcata 32966069  T
Q  120 atcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatga 217  Q
    |||||||  ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32966070 atcatttttagtgtgaattttcaattgttgtataaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatga 32966169  T
Q  218 tgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaa 317  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| | ||||||| |  | ||||||| |    
T  32966170 tgttatgttggaatgtaagaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaataatatatgat--attatgctcta 32966267  T
Q  318 attgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
    | ||     || || ||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  32966268 aatgacatcttgtgatatgttgatgttgaattatgttgagattcatgttcaattgatgtaattgcttctaagtggtgttgttattgataattcatggctt 32966367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 49 - 342
Target Start/End: Original strand, 21310560 - 21310854
Alignment:
Q  49 cctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  21310560 cctaggagataaagtgaagcttgggctagggaattgatccaactaaggtaagggggttaaaattcatcataatcattttagtgtaatttttcatttgttg 21310659  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21310660 tatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcataaatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 21310759  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  21310760 aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtttgtgaaaatgatatatgttgaattatgctaaaattgttaaattgtgctaagttgttg 21310854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 436
Target Start/End: Original strand, 11337038 - 11337427
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  11337038 ctaggagcaaaattgaagcttgagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttt-caattattgt 11337136  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||    ||    
T  11337137 atgaataagtgcttaattggatgaattggttaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgtatgaagttatgaat 11337236  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  11337237 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaatatggtaaatgttgaaaatatgctcat-ttggtgaattatgttatgttgttgatga 11337335  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatt 436  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  11337336 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattcatggcttgagtttacatgattcatgatt 11337427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19405934 - 19405560
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19405934 ctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattattgt 19405835  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||  || |||| ||||||||| ||   |||    
T  19405834 atgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttatgctctaattatgatgacatatttgaatgtatgaagttatggat 19405735  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||    
T  19405734 aattgaattattgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaattagttgaattatgattcgttgttgttga 19405635  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||  || || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  19405634 attgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggt 19405560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 54 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29918356 - 29917966
Alignment:
Q  54 gagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatg 151  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||   || | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| | || |||||| |  ||| |||    
T  29918356 gagctaaattgaagtttgggctaggatgttca-ctaactaaggtaagggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaacttttcattaattgcatg 29918258  T
Q  152 aataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataatt 251  Q
    | ||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  29918257 attaaatgcttaattgaataagtgattttttgttcatagttgttgaaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataatt 29918158  T
Q  252 gaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgt 351  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||   |||||||  |||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  29918157 gaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaacaggatatattgtgaattatgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattat 29918058  T
Q  352 ggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatg 441  Q
    | | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  29918057 gatgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatg 29917966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 87 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6456980 - 6456622
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  6456980 ctaactaagataagggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgt 6456881  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| | || ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||||||| |||    
T  6456880 tcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgaagatacgtttgaatacatgaaattggcgataattgaattgttg---gtgaaattgcatgttcatagt 6456784  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  6456783 atgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 6456684  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  6456683 ttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatg 6456622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 114 - 438
Target Start/End: Original strand, 23981433 - 23981759
Alignment:
Q  114 atcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||    
T  23981433 atcataatcacttattgcaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaatttagtgcattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaa 23981530  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   || || ||  |  |||| |||    
T  23981531 ttatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgttaacttatgaattat 23981630  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23981631 gctcaaatggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 23981730  T
Q  412 tggcttgg--gttcataattcatgatttg 438  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  23981731 tggcttgggtgttcataactcatgatttg 23981759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 86 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24084438 - 24084075
Alignment:
Q  86 tctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattg 183  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||    
T  24084438 tctaactaaggtaaggggattagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattatttg 24084339  T
Q  184 ttcat-aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||| ||||| | | |||||||| | ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  24084338 ttcattaattggtgacattcgtgccctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattacatgttcata 24084239  T
Q  283 gtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||    
T  24084238 gtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgt 24084139  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||    
T  24084138 tgctaagaaatattgttgttgaagattcatggcttgggtgttagtaaatcatgatttgatgatg 24084075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22885932 - 22885668
Alignment:
Q  154 taagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattga 253  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||  ||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22885932 taagtgcttaattgaataattgataatttgttcatggttgttgaaattcgtgctttaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattga 22885833  T
Q  254 attgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgg 353  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||  |||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||     
T  22885832 attgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtgaattgtgctcaaattattgaattgtgttatgttgttgttgaattatgt 22885733  T
Q  354 taagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22885732 tgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttg 22885668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Original strand, 1168058 - 1168447
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-g 147  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| || |    
T  1168058 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcata-tcacttattgcaatttt-caattatttg 1168154  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||||| || |||||| ||  || ||| |||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||    
T  1168155 tatgaaaaa-tgcttattttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgga 1168253  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||| |||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  1168254 taatagaatggttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcaatgttgttgatg 1168352  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  1168353 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 1168447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Original strand, 24182984 - 24183372
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttg 147  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||    
T  24182984 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaattatttg 24183082  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |    ||    
T  24183083 tatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtcatgga 24183181  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |  ||||  | ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24183182 taattgaattgttgttagtcgaattacatgttcaaagtgtatgaaaagggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgttg 24183280  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| || || |   ||||| |||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24183281 aattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtca---tgttgatgataattaatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 24183372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23466830 - 23466552
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||    
T  23466830 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcaattattgcaatttt-caattattgt 23466732  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||     ||||||| ||||| ||| ||  |||||    
T  23466731 atgaataagtgattaattgtgtaattgattaattgttcataattattagaattcgtgctccaattatggcaacatgtttgtatgtaagaagtt-atgata 23466633  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag-aaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaatt 328  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23466632 attgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgagaaaaatggtgtatgttgaaatatgctcaattggttgaatt 23466552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20712433 - 20712099
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt-gcaatttttcaattg-ttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20712433 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttatttgcaatttt-caattacttgtatgaa-aagtgcttaattgagtgaattgattaattg 20712336  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
    |||||||| | | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   ||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  20712335 ttcataat-gatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataactgaattgttgttgattgaattacatgttcaaag 20712237  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttga-aatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||| |||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  20712236 tatgaaaaatgggtatgtgttgataatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgt 20712138  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    || ||||| || |||||| || | |||||||||||||||    
T  20712137 tgttaagtcatgttgttgatgttaattcatggcttgggt 20712099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 421
Target Start/End: Original strand, 26559771 - 26560039
Alignment:
Q  154 taagtgcttaattgagtaaatgattaattgt-tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattg 252  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   ||||| ||||| ||||||||||||    ||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  26559771 taagtgcttaattgaataaatgattattttaatcatagttgttgaaattcgtgctcttgctatgattatatgtttgaatacatgaaattggtgataattg 26559870  T
Q  253 aattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26559871 aattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtg 26559970  T
Q  353 gtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26559971 atgagaattatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattgttggtgatgattcttggcttgggt 26560039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21110003 - 21109773
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   || ||||| ||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  21110003 ttgttgaaattcgtgctcttgttctgatgatatgtttgagtacatgaaattggtaataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 21109904  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  21109903 aaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaga 21109804  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21109803 gatattgttattgatgattcatagcttgggt 21109773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21397449 - 21397111
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  21397449 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 21397352  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||    
T  21397351 tcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagt 21397253  T
Q  285 atgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttg---t 379  Q
     |  |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||   |    
T  21397252 gtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttat 21397154  T
Q  380 tgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21397153 tgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 21397111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 434
Target Start/End: Original strand, 16835192 - 16835538
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaat-ttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcata 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||  |  || |||| ||||||||||| |||| ||| |||||| || |  | ||    
T  16835192 aggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatcttttccctaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcactta 16835291  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
     ||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |    
T  16835292 gttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgggtacatgaaattggtgataattgatttgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtg 16835391  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
    ||| |  |||||  |||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  16835392 aaaatagtatattgtgaattgtgctctaattgtcgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattaatgttgttgttgttaag 16835491  T
Q  390 tgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatga 434  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  16835492 agatgttgttgttgatgattcatagcttggatgttcataaatcatga 16835538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 145 - 418
Target Start/End: Original strand, 23234432 - 23234706
Alignment:
Q  145 ttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattgg 243  Q
    |||||||  |||||||||| |||| ||| |||||| || | || || ||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||   |  ||||||||||    
T  23234432 ttgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttaagtacatgaaattgg 23234531  T
Q  244 tgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgt 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23234532 tgataattgaattgttgttggtgtaattgcatgtttatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattattgaattgtgctattttgttgt 23234631  T
Q  344 tgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||| | ||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23234632 tgattagtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttattgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttg 23234706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 242
Target Start/End: Original strand, 24225171 - 24225391
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24225171 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattgtgctaactaaggtaagggagttagaattcaatcataa 24225269  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| || |||||||   ||||||| ||     
T  24225270 tcatttagtgtaatttttcactagttgtatggttaagtgcttaattgattaagtgattaattgttcttagatgttgaatttcgtgccttaattatggtga 24225369  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattg 242  Q
    |||||||| || ||||||||||    
T  24225370 tatgtttgtatatatgaaattg 24225391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 148 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23417539 - 23417264
Alignment:
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||| || |  | |||||||| ||||||||||||   |||||||| | ||||||  |  ||||| |||||||    
T  23417539 tatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttaattgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatttgtttgagtacatgaatttggtga 23417440  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | | |||||  |||| | ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23417439 tgattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaattggtatattgtgaattgtgctctaattgctgaattgtgctatgttgttgttg 23417340  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    | ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23417339 atttgtggtgacattcatgtttaattgatgttgttgttgttatgaggtattgttgttgatgattcatagcttgggt 23417264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21907054 - 21906742
Alignment:
Q  88 taactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgtt 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||    
T  21907054 taactaaggtaagggggt-agaatttatcataatcatttatcacaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattaattaattgtt 21906958  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||  |||||| ||   ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  21906957 cataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagacatatgaagttatggataattgaattgatgttggttgaattacatgttcaaagta 21906858  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
    |||                 ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||       
T  21906857 tga-----------------aaatatgttc-aattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt--- 21906779  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21906778 taagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 21906742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 28261869 - 28261543
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  28261869 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 28261773  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||    
T  28261772 taagtggtgaaattcgtgctctagttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatg 28261673  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    | ||    |||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | ||||||| || | || ||| ||||||| ||||||||||| |     
T  28261672 aaaa----atatgtgtgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgttt 28261578  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||| || ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  28261577 agtcatgttgctgatgataattcatggcttgggtt 28261543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 11584405 - 11584073
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||     
T  11584405 taaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattaattaattgttcatg 11584309  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
    | || | |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||  |||| |  |    
T  11584308 agtggtgaaattcgtgctctatttatgatgacatatttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtatg 11584209  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg---aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
    |||  | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||| || | |||||| ||||| | |||||||||||     
T  11584208 aaaagggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgt 11584110  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  11584109 ttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtt 11584073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 4865615 - 4865284
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  4865615 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 4865519  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||    
T  4865518 taaatggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatg 4865419  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    | |||  | |||  ||  |||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||| || | |||||| ||||||| |||| | |||| |     
T  4865418 aaaaatgggtatgggtgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgttt 4865320  T
Q  388 agtgatattgttgttgatga-ttcatggcttgggtt 422  Q
    | | || |||||| |||| | |||||||||||||||    
T  4865319 attcatgttgttgatgataatttcatggcttgggtt 4865284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 22662534 - 22662652
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||  ||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||    
T  22662534 ctaggagaaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggatagaattcatcataatcatttagtg-tagttttcatttgttgt 22662632  T
Q  149 atgaataagtgcttaattga 168  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  22662633 atgaataagtgtttaattga 22662652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 22053849 - 22054072
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||  ||||  ||| ||     
T  22053849 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaa-ttgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaatgt 22053946  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
     |  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||     
T  22053947 gaagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 22054045  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22054046 ttgttgttgatgaatcattgcttgggt 22054072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Original strand, 24225431 - 24225541
Alignment:
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  24225431 tgctctaattgttgaattgtgctattttgttgttgatttgtggtggaattcatgtttaattgatgttattgttgttatgagatattgttgttgatgattc 24225530  T
Q  411 atggcttgggt 421  Q
    ||  |||||||    
T  24225531 ataacttgggt 24225541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25005240 - 25005082
Alignment:
Q  21 aacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc--taactaaggtaagggggttagaattcatcat 118  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||  | || | ||  ||| |||  || |||| |||||||||||||  ||||||||    
T  25005240 aacttgaagaatcaagaattggagtgaatctaggagctaaagtgaagcctaagtttgg--attaatcattatctaaagtaagggggttagtcttcatcat 25005143  T
Q  119 aatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgatta 179  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  25005142 aatcatttagtttagtttttcaattgttgtatgaataagtgctcaattgaataagtgatta 25005082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 21646634 - 21646964
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||| ||||||    
T  21646634 actaaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttattgcaa--tttcaattatttgtatgaa-aagtgcttatttgggtgaattgattaaatgttca 21646730  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||| |||| ||  |||| |||||| ||||| |     
T  21646731 tatgtgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttaaaagtgta 21646829  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctat-gttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
     |||| | | ||| | |  ||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| || ||||||||     
T  21646830 tgaaaatgggtatgtatgaaaatatgttc-aattggtgaattatg-tatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgt 21646927  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | ||| ||  ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21646928 ttagtcatgatgttgatgataattcatggcttgggtt 21646964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19873932 - 19873867
Alignment:
Q  356 agattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19873932 agattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 19873867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 18531202 - 18531306
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  18531202 aattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgct 18531301  T
Q  417 tgggt 421  Q
     ||||    
T  18531302 cgggt 18531306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 24475847 - 24475605
Alignment:
Q  174 tgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 273  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||| |||| ||  |||| |    
T  24475847 tgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattac 24475749  T
Q  274 atgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattg 372  Q
    ||||||||||| |  |||| | | ||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||  || | |||||| |||||      
T  24475748 atgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaat-- 24475654  T
Q  373 atgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24475653 -tgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 24475605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23466559 - 23466480
Alignment:
Q  342 gttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  23466559 gttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgatagttcatggcttgggt 23466480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2031937 - 2031814
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  2031937 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggct 2031838  T
Q  417 tgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||    
T  2031837 tgggtttgcatgattcatgatttg 2031814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23507212 - 23506989
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  23507212 aaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 23507115  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||     
T  23507114 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatg 23507016  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||    
T  23507015 ttgtggttgatgaataattgcttgggt 23506989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7529028 - 7528923
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| ||| |    
T  7529028 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatttatgac 7528929  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  7528928 ttgggt 7528923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 384
Target Start/End: Original strand, 11763619 - 11763692
Alignment:
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11763619 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgggattcatgtttaattgttgttgttgttg 11763692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19874115 - 19873934
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattc-atcataatcatttagt-gcaat-ttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcata 189  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||| |||||  |  || |||| ||||||||||| |||| ||| |||||| || |  | ||    
T  19874115 aggtaagggggttagatttccatcataatcacttagttgtaatcttttccctaattatatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcactta 19874016  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatt 271  Q
     ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19874015 gttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaatt 19873934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21650822 - 21650746
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21650822 aattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 21650746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 9730510 - 9730615
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  9730510 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttgctgagacatattgttgtttatgatttatggc 9730609  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  9730610 ttgggt 9730615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Original strand, 18531083 - 18531166
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  18531083 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 18531166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11342812 - 11342688
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt-gctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  11342812 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggc 11342713  T
Q  416 ttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||    
T  11342712 ttgggtttgcatgattcatgatttg 11342688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 34939524 - 34939441
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||    
T  34939524 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 29188306 - 29188372
Alignment:
Q  215 tgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29188306 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 29188372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 108960 - 109065
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||    
T  108960 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 109059  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  109060 ttgggt 109065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 418
Target Start/End: Original strand, 27182682 - 27182783
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||  |||| | || ||||| ||||||||||||||| | | || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||    
T  27182682 aattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgct 27182781  T
Q  417 tg 418  Q
    ||    
T  27182782 tg 27182783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15045253 - 15044826
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcat 118  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15045253 gaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taggagctaaggtgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagatttcatcat 15045155  T
Q  119 aatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatga 217  Q
    |||||||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15045154 aatcattttagtttaaattctcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatga 15045055  T
Q  218 tgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaa 317  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15045054 tgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaa 15044955  T
Q  318 attgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15044954 attgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggctt 15044855  T
Q  418 gg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  15044854 gggtgttcataaatcatgatttgatgatg 15044826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 15109171 - 15109598
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcat 118  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15109171 gaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taggagctaaggtgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagatttcatcat 15109269  T
Q  119 aatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatga 217  Q
    |||||||| |||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  15109270 aatcattttagtttaaattctcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattattcataatagttagaattcatgctccaattatga 15109369  T
Q  218 tgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaa 317  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15109370 tgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatactcaa 15109469  T
Q  318 attgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  15109470 attgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggctt 15109569  T
Q  418 gg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  15109570 gggtgttcataaatcatgatttgatgatg 15109598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 50 - 445
Target Start/End: Original strand, 52265360 - 52265758
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  52265360 ctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctgactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattattgt 52265459  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||    
T  52265460 atgaataagtgtttaattgggtaattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgata 52265559  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52265560 attgaattgttgttagagaaattttatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgcaatgttgttgttgaat 52265659  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  52265660 tgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgatgatgt 52265758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 15 - 419
Target Start/End: Original strand, 13809328 - 13809732
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13809328 aagaggaacttgaagattcaaggattgggagagagc-taggggctaaattgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 13809426  T
Q  114 atcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaatt 213  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13809427 atcataatcatttattgccatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaatt 13809526  T
Q  214 atgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgc 313  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13809527 atgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgagatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaatatgc 13809626  T
Q  314 tcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 413  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  13809627 tcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatg 13809726  T
Q  414 gcttgg 419  Q
    ||||||    
T  13809727 gcttgg 13809732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 7964536 - 7964960
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7964536 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgggcaaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataa 7964635  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  7964636 tcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgagtaattgttcatagttgttaaaatccgtgctctaattatgatga 7964735  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  7964736 tatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttc-aagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 7964834  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt--g 418  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7964835 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgattttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgag 7964934  T
Q  419 ggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  7964935 tgttcataaatcatgatttgatgatg 7964960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 18276856 - 18276432
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18276856 cttgaagattcaagaagtggtacagatcctaggagctaaagtgaagcttgagctagg-aattgtactaattaaggtaacggggttagaattcaatcataa 18276758  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||     
T  18276757 tcatttagtgcgatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtatgtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaaatatgatga 18276658  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  18276657 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagcatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 18276558  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18276557 gttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttggg 18276458  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||    
T  18276457 tgttcataaatcatgatttgacgatg 18276432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 49 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14901627 - 14901230
Alignment:
Q  49 cctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||| |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  14901627 cctaggagttaaagtgaagcttaagcttggggattgatctaactaaggtaagggggttaaatttcatcataatcattttattgcaatttttcaattattg 14901528  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||     
T  14901527 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcatatttgttataattcgtgctctaattatgacaatatgtttgaatgtatgaaattgttgaa 14901428  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||    
T  14901427 aattga-ttgttgttggtgaaatttcatgtttgaagtatgagaaagtgatatatgtttaaatatgctcaaaatgttgaattatgatatgttattattgaa 14901329  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||  || |||||||||||| |||||||||    
T  14901328 ttgtggtaagaatcatattcaattgatgttgttgttgctaagtgatgctgttgttgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatg 14901230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 7185669 - 7186093
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagag-atcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataat 121  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7185669 cttgaagattcaagaagtggtgaggatcctatgagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaaggaggttagaattcatcataat 7185768  T
Q  122 catttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtt 221  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  7185769 catttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatgat 7185868  T
Q  222 atgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattg 321  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||| | || ||    
T  7185869 atgtttgaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatatgttgaattgtgcactaaatg 7185968  T
Q  322 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg-- 419  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||      
T  7185969 atgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggt 7186068  T
Q  420 gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||    
T  7186069 gtttataaatcatgatttgatgatg 7186093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 41165780 - 41166195
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattcatcataat 121  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41165780 cttgaagattcaagaattggagagttcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataat 41165878  T
Q  122 cattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatg 219  Q
    |||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          | |||| ||||||||||||||||     
T  41165879 catttttagtgtaaattttcaattgtggtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgtt----------agaatttgtgctccaattatgata 41165968  T
Q  220 ttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaat 319  Q
     ||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41165969 atatatttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaaat 41166068  T
Q  320 tgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  41166069 tgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgg 41166168  T
Q  420 g--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |  ||||||| | |||||||| |||||    
T  41166169 gtattcataacttatgatttgttgatg 41166195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27961366 - 27960994
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt--tagtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||||    
T  27961366 ctaggagcaaaagtgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattgttagtgtaaattt-caattgttg 27961268  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||    ||    
T  27961267 tatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaatccgtgctccaattatgatgacatgtttgaatgcatgaagttatgaat 27961168  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27961167 aattgaattgttgttagtggaatttcatgttcaaagtatgaagaagtggtatatgttgaaatatgctaaattggttgaattatgttatattgttgttgaa 27961068  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||    
T  27961067 ttgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggt 27960994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 45 - 444
Target Start/End: Original strand, 15013131 - 15013531
Alignment:
Q  45 agatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgcaatttttcaatt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||||| ||    
T  15013131 agattctaggagctaaagtgaagcttgagctagg-atttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaattttcattt 15013229  T
Q  144 gttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattgg 243  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| |||||||||     
T  15013230 gttgtatgtttaagtgcttaattgaataagtgattaattgttcatagttgtttaaattcgtgctctaattatgatgatatgtt-gaatgcatgaaattga 15013328  T
Q  244 tgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15013329 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgacatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgt 15013428  T
Q  344 tgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatg 441  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  15013429 tgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatattgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatg 15013528  T
Q  442 atg 444  Q
    |||    
T  15013529 atg 15013531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 88 - 444
Target Start/End: Original strand, 41256259 - 41256618
Alignment:
Q  88 taactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41256259 taactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgcttaattgaataagtgattaattgtt 41256358  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41256359 catagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtt-gaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagta 41256457  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
    || |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||||||||||||     
T  41256458 tgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaattgtgatgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgt 41256557  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  41256558 taagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatg 41256618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Original strand, 18494181 - 18494552
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| ||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||    
T  18494181 ctaggagctaaattgaggcttaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttt-caattatggt 18494279  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||  |||||    
T  18494280 atgaataggtgcttaattgtgtaattgatcaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgttcgtatgtatgaagtta-tgata 18494378  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaag-tgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||||||||    
T  18494379 attgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaatgtgctcaattggttggatgatgctatgttgttgttgaa 18494478  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || | | |||||||||||||    
T  18494479 ttgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggt 18494552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 37956849 - 37957274
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    ||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37956849 cttgaagatccaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 37956948  T
Q  123 attt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||  |||| || |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  37956949 atttttagtgtaaattttcaattgttgtatgattatttgtttaattgagtaattgattaattgttcatgattgttggaattcgtgctcctattatgatgt 37957048  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||||||||   | ||||||| || |    
T  37957049 tatgtttgtatgtaagaaattggtggtaattgattagttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatatgtcatattatgctctaaat 37957148  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    ||  | ||    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||     
T  37957149 gtcaatttggaatatgttgatgttgaattatgctgagattcatgttcaattgatgtggttgctgctaagtgatgttgttattgataattcacggcttggg 37957248  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     || |||||||||||||||| |||||    
T  37957249 tgtgcataattcatgatttgttgatg 37957274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 384
Target Start/End: Original strand, 47534895 - 47535252
Alignment:
Q  15 aagaagaa-cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaat 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  47534895 aagaagaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggcgagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaat 47534993  T
Q  112 tca-tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcc 209  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||                |||||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  47534994 tcaatcataatcattttagtgtaatttttccattattgtatgattaa----------------atgattaattgttcataaatgataaaattcgtgctct 47535077  T
Q  210 aattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat 309  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47535078 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcaagttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat 47535177  T
Q  310 atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  47535178 atgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagaatcatgttcaattgacgttgttgttg 47535252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Original strand, 19821628 - 19822025
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||     
T  19821628 ctaggagctaaagtgaagctagaactagagaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtcaattttcaattgttt 19821727  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  19821728 tatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgatcatgattattagagttcgtgctcctattatgatgttatgtttgtatgtgagaaattggtgat 19821827  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||  | |||||||| ||||||   || ||||||| |  |||| ||||||||||   | ||||||| || || | |||| || |||||| ||||||||    
T  19821828 aattggttggttgttggagaaattgagtgatcaaagtgtatgaaaatgatatatgtcatattatgctctaaatgat-aattgtgatatgttattgttgaa 19821926  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    || || | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  19821927 ttatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatg 19822025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Original strand, 30232348 - 30232720
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaattttt-caattgttg 147  Q
    |||||||| ||| |||||| | |||||| || ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | |    
T  30232348 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagagggttagaattcatcataatcacttattgcaattttttcaattatgg 30232447  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||  ||||    
T  30232448 tatgaataagtgcttaattgtgtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagtt-atgat 30232546  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag-aaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||   |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  30232547 aattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtatgtgaaaagtgggttatgtgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgttgttgttaa 30232645  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  30232646 attgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggt 30232720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16732527 - 16732173
Alignment:
Q  85 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattg 183  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  16732527 atctaactaaggtaaagaggttagaattcatcataatcatt-attgcaattttttaattagtgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 16732430  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
    ||||||| || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  16732429 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 16732330  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||||||  || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  16732329 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgt 16732231  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  16732230 tgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 16732173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 94 - 444
Target Start/End: Original strand, 40904828 - 40905182
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| | |||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||     
T  40904828 aggtaagggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaatttttcaataattgcatggttaagtgcttaattgaataaatgattactttgttcatag 40904927  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  40904928 ttgttgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatacatgaaattgctgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 40905027  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||||  ||  |||| | | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  40905028 aaatgatgcattgtgaattgtactccaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtt-aattgatgttgttgttgctaaga 40905126  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  40905127 gatattgttgttgatgactcgtggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatg 40905182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 38765103 - 38764707
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| | | |||  |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  |||    
T  38765103 ctaggagctaaattgaagtttgggctatg-atttgtgctaattaaggtaagagggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattg 38765005  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
     ||||  ||||||||| |||| ||| |||||| || |||||| ||||| |||||||||||  |||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38765004 catgataaagtgcttagttgaataattgattattt-ttcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggggatatgtttgaatgaatgaaattggtgat 38764906  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||  |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  38764905 aattgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtgaattgtgctcaaattgttgaattatgcgatgttgttgttcaa 38764806  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    || || | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  38764805 ttatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgaagatg 38764707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 90 - 421
Target Start/End: Original strand, 12837094 - 12837424
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||    
T  12837094 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctatttt-caatttttgaatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtccat 12837191  T
Q  189 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 288  Q
    || || | | |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  12837192 aaatgatgatattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatga 12837291  T
Q  289 gaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  12837292 gaaattggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgtta 12837390  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  12837391 agtgatgttatggatgttaattcatggcttgggt 12837424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 421
Target Start/End: Original strand, 18238104 - 18238381
Alignment:
Q  145 ttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattgg 243  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||  |||||| || | || || ||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||  |||| |||||    
T  18238104 ttgtatgcttaagtgcttaattgaataggtgattattttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattgg 18238203  T
Q  244 tgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgt 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18238204 tgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgt 18238303  T
Q  344 tgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18238304 tgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 18238381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 90 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 30458257 - 30457909
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||  | |  ||||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  30458257 actaaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaattttgaattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 30458159  T
Q  189 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 288  Q
    || || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||   ||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||     
T  30458158 aaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatggataattaaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatgt 30458059  T
Q  289 gaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
     |||  | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  30458058 aaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtta 30457960  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    ||| || | |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30457959 agtcatgtggttgatgataattcatggcttgggttgcataattcattattt 30457909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 420
Target Start/End: Original strand, 21959287 - 21959686
Alignment:
Q  22 acttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||    |||||||| ||| |||||| | |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21959287 acttgaagaatcaagagttgggagaagagctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 21959386  T
Q  120 atcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatga 217  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||| || ||| | || ||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||    
T  21959387 atcatttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttatttgggtgaattaattgattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattgtga 21959484  T
Q  218 tgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctca 316  Q
    ||  ||||||  ||||||||| ||   |||| |||||||||||||| |  |||| ||| | |||||||||| |||  | ||| |||||||| ||||||||    
T  21959485 tgacatgtttaaatgtatgaagttatggatatttgaattgttgttgattgaattacatct-caaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctca 21959583  T
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  21959584 a-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggct 21959682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 444
Target Start/End: Original strand, 13442571 - 13442928
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||| | |  ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| || | || ||     
T  13442571 aggtaagggggttagagttcaatcataatcaattagttgtaattttt-attaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttgctcttag 13442669  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  13442670 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgtttgtgaaattgcatgttcatagtatgtga 13442769  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattga---tgttgttgttgcta 387  Q
    || || |||||  |||| ||||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||   ||||||||||| ||    
T  13442770 aaatgttatattgtgaattatgctctaaatgttgaattgtgttatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttgtta 13442869  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    || ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||| |||||||||    
T  13442870 agagattttgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaattatgaattgatgatg 13442928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 421
Target Start/End: Original strand, 13590024 - 13590298
Alignment:
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||| || |  | |||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  13590024 tatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttaattgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgggtacatgaaattggtga 13590123  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13590124 taattcaattgatgttgatgaaactgcatgttcataatatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttga 13590223  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13590224 tttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattattgttgatgattcatagcttgggt 13590298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 421
Target Start/End: Original strand, 50219837 - 50220164
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattc-atcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataat 191  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||  |  || |    
T  50219837 aggtaagggggttagatttcgatcataatcaattagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgt--tagt 50219934  T
Q  192 tgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaa 291  Q
    |||| ||||| ||||||   ||| |||| ||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  50219935 tgttgaaatttgtgctcttgttacgatgatatgtttgagtacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa 50220034  T
Q  292 agtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtg 391  Q
    | |||||||| ||||| | ||||| || ||||||||| || | |||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  50220035 aatgatatattttgaattgtgctctaaatgttgaattgtgttgtgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagag 50220134  T
Q  392 atattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  50220135 atattgttgttgatgattcatagtttgggt 50220164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 54398736 - 54398406
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||| |||  ||||| || | || ||     
T  54398736 aggtaagggggttagatctcaatcataatcacttagttgtaatttttctctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagggattattttgctcttag 54398637  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    || || ||||||||||||   ||||| || ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||  ||    
T  54398636 tttttgaaattcgtgctcttgttatgttgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatatga 54398537  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || | ||||||  |||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  54398536 aaataatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaga 54398437  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54398436 gatattgttgttgatgattcatggcttgggt 54398406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34395614 - 34395261
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  34395614 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcattatcacttattgcaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaactgattaattgt 34395517  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |     |||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||    
T  34395516 tcataaatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtaatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagt 34395418  T
Q  285 atgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
     |  |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34395417 gtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 34395319  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||| || || |||||| |||| |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  34395318 tgctatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcatgattcatgatttg 34395261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44056271 - 44055937
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  44056271 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 44056174  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||  |||   ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  44056173 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtt-atgaattttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 44056075  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||   |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||     
T  44056074 atgaaaaatgaatatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtg 44055976  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | | ||  || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44055975 gtttagccatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 44055937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 438
Target Start/End: Original strand, 45458746 - 45459098
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  45458746 ctaactaaggtaagggg-ttataattcatcataatcatttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 45458842  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| |    |||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||| |    
T  45458843 tcataagtgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagtgatagataattgaattgttgttagttgaattacatgctcaaaat 45458942  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaa-atatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||||||  |  |||||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  45458943 atgagaagtttgtatatgttaaagatatgttcaa-ttggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgtt 45459041  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    | || || || ||||||  ||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  45459042 gatatgtcatgttgttgaagataatccatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 45459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Original strand, 23269824 - 23270159
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||  || |||||||||||    
T  23269824 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgtttaattggatgaattgattaattgt 23269921  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||    
T  23269922 tcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagt 23270020  T
Q  285 atgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
     |  |||| | | ||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23270021 gtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatactc-aattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgt 23270119  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    || ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23270120 tgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 23270159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 191 - 418
Target Start/End: Original strand, 41916720 - 41916947
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| |||||||| |||   |||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  41916720 ttgttgaaattcgtactcttgttatgatgatatgtttgaatacataaaattggtgataatataattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 41916819  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    |  ||||||||  |||  | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||||||| ||||     
T  41916820 agatgatatattgtgagttgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgttaaga 41916919  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41916920 gatattgttgttgatgattcattgcttg 41916947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 34177501 - 34177629
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgta 149  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34177501 ctaggagctaaagtgaagctagagctagggaattgatctaactaaggtaagggg-ttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgta 34177599  T
Q  150 tgaataagtgcttaattgagtaaatgatta 179  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34177600 tgaataagtgcttaattgaataagtgatta 34177629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 310
Target Start/End: Original strand, 20813437 - 20813660
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |  ||||||||| || |||||||||| || ||| |||||||||||    
T  20813437 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaattttaaattatttgtatgaaaaa-tgcttaattgggtgaattgattaattgtt 20813535  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  20813536 cataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagta 20813635  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||| |||  | ||| ||||||||||    
T  20813636 tgaaaaatgggtatgtgttgaaata 20813660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 53704627 - 53704958
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  53704627 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgttatttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 53704724  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||||    
T  53704725 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatg 53704824  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    | |||  | ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||| |     
T  53704825 aaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttt 53704923  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  53704924 agtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 53704958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 91 - 384
Target Start/End: Original strand, 40885458 - 40885756
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcat------ttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| | ||||||  | || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||    
T  40885458 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatgattatttagagtaattttctatttcttgtatgaataagtgattaattgaataattggataattgt 40885557  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    ||||  ||| |||||||||| |||||| | || || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  40885558 tcatgtttgctaaaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaa-ttggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagt 40885656  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||   || ||  |  |  ||||| ||||||| ||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  40885657 atgtataaatgtcaagttatgaaattatgctc-aattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgtt 40885755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 87 - 437
Target Start/End: Original strand, 819821 - 820154
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |  ||||||||| || |||||||||| || || ||||||||||||    
T  819821 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaa-aaatgcttaattgggtgaattgattaattgtt 819919  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| || | |||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||         |||     |     
T  819920 cataagtgatgaaattcgtgctctaattatggtgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgttg---------gtt-----tg 820005  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||   |||||||||||    
T  820006 tgaaaatgtg-tatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgttgttgttg 820100  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
     ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  820101 ttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttgcatgattcatgattt 820154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 154 - 384
Target Start/End: Original strand, 47468304 - 47468535
Alignment:
Q  154 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattg 252  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||  ||||  |||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||||||| |||||||||    
T  47468304 taagtgcttaattgaataagtgattattttgctcttagctgttgtaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattgatgataattg 47468403  T
Q  253 aattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 352  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||   |||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  47468404 aattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatagtgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtg 47468503  T
Q  353 gtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
     | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  47468504 atgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 47468535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 438
Target Start/End: Original strand, 55376493 - 55376840
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 188  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  |  || ||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  55376493 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcactt--ttgaaattttcaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 55376589  T
Q  189 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 288  Q
    |  || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||||||||| ||  ||||  |||||| ||||||||    
T  55376590 atgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgttctaagtatga 55376689  T
Q  289 gaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaa 388  Q
     |||  | ||| |||  |||||| ||||| ||| |||||||| |  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  55376690 aaaatgggtatgtgtgaaaatatactcaa-ttggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaa 55376788  T
Q  389 gtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
     | || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  55376789 attatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 55376840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 44347179 - 44346849
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  44347179 actaaggtaagggagttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 44347083  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |     
T  44347082 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgta 44346984  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    ||||| | | ||| |||  |||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  ||||||||| || | |||||| |||| || ||||||||||| |    
T  44346983 agaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctc-aattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtt 44346885  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  44346884 tagtgatgtcgttgatgataattcatggcttgggtt 44346849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 384
Target Start/End: Original strand, 8872366 - 8872658
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  8872366 actaaagtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 8872462  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||  |    || |||||| ||||||| ||  ||||  ||||||||||||||    
T  8872463 taagtggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagctatgaatgattgaagtgttgttagttgaattgtatgttcaaagtatg 8872562  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    | |||  | ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  8872563 aaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttg 8872658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 15675105 - 15675328
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||  ||||  ||| ||     
T  15675105 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaatgt 15675202  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
     |  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  15675203 gaagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatg 15675301  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15675302 ttgttgttgatgaatcattgcttgggt 15675328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 53907602 - 53907921
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatca-tttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||   | ||||||||| || |||||| ||||||||||||||       |||||||||||||    
T  53907602 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttttgt---agttttcaattatttgtatga-taagtgcttaattg-------gattaattgttca 53907690  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    || ||||||||||| || ||   |||  ||||||||||||||    
T  53907691 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttattagttggattgtatgttcaaagtatg 53907790  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    | |||  | ||| |||  |||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||  | | |||||| |||||||   ||||||||| |     
T  53907791 aaaaatgggtatgtgtgaaaatatgcccaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaattg---ttgttgttgatt 53907886  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  53907887 agtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 53907921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31115757 - 31115653
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  31115757 aattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgct 31115658  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  31115657 tgggt 31115653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 54118260 - 54118483
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  54118260 aaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-taggaacaattga 54118357  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||  |||  | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||     
T  54118358 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatg 54118456  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  54118457 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 54118483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 384
Target Start/End: Original strand, 10104385 - 10104452
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10104385 aattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgttg 10104452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 14996255 - 14996151
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttc-aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  14996255 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggc 14996157  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  14996156 ttgggt 14996151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 19697500 - 19697604
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  19697500 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggc 19697598  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  19697599 ttgggt 19697604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 19708085 - 19708189
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  19708085 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggc 19708183  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  19708184 ttgggt 19708189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14951889 - 14951766
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||  ||||||    
T  14951889 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatgatgatatatggct 14951790  T
Q  417 tgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||    
T  14951789 tgggtttgcatgattcatgatttg 14951766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21417530 - 21417366
Alignment:
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg-agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaat 319  Q
    |||||||| || | |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   |||| | |||    |||||  |||| | |||||||||    
T  21417530 tatgtttgaatatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaatttcatgttcacgatatgtataaatatgtatattgtgaattgtgctcaaat 21417431  T
Q  320 tgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
     | |||||| || || ||||||||||| ||||| | | || |||||| |||||||||||||||||    
T  21417430 ggatgaattgtgttaggttgttgttgatttgtgattaaatacatgtttaattgatgttgttgttg 21417366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13246677 - 13246454
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||  ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  13246677 aaattcgtgctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-taggaacaaatga 13246580  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||  |||| | || ||||| ||||||||||||||| | | || ||| ||||     
T  13246579 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatg 13246481  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13246480 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 13246454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 26680312 - 26680225
Alignment:
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  26680312 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 26680225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Original strand, 25119335 - 25119440
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||| ||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||| |||||||    
T  25119335 aattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataatgatacatggct 25119434  T
Q  417 tgggtt 422  Q
    ||||||    
T  25119435 tgggtt 25119440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Original strand, 10104266 - 10104349
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  10104266 aaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 10104349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 386
Target Start/End: Original strand, 14500344 - 14500414
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  14500344 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgct 14500414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 438
Target Start/End: Original strand, 47535244 - 47535289
Alignment:
Q  395 ttgttgttgatgattcatggctt--gggttcataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  47535244 ttgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttg 47535289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 122136 - 122052
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  122136 aaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 122052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 9295822 - 9295717
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||    
T  9295822 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggc 9295723  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  9295722 ttgggt 9295717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16522946 - 16522841
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| | |||| | |||||    
T  16522946 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggc 16522847  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  16522846 ttgggt 16522841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 445
Target Start/End: Original strand, 47468527 - 47468579
Alignment:
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  47468527 ttgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttgatgatgt 47468579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 111483 - 111419
Alignment:
Q  357 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  111483 gattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggt 111419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 333 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8374620 - 8374532
Alignment:
Q  333 tatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||||| || | |  ||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||| ||||||| | ||| | |||||||||||    
T  8374620 tatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatggcttgggt 8374532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 15272440 - 15272516
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | | |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15272440 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 15272516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 2134 - 2565
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2134 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taggagctaaagtgaagcttgagcaagagaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 2232  T
Q  114 atcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2233 atcataatcattttagtgcaattttt-aattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattaatcataattattagaattcgtgctccaat 2331  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2332 tatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgacatatgttgaattatg 2431  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2432 ctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcat 2531  T
Q  413 ggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2532 ggcttgggcgttcataattcatgttttgatgatg 2565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 15 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21623599 - 21623172
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21623599 aagaagagcttgaagattcaagaattgaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaattc 21623501  T
Q  114 a-tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21623500 aatcataatcattttagtgtaatttctcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataaatgttagaattcgtgctccaa 21623401  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21623400 ttatgatggtatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattat 21623301  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||    
T  21623300 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttctattgatgttgttgttgctaagtgatgttgatgttaatgagtca 21623201  T
Q  412 tggcttggg--ttcataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21623200 tggcttgggtattcataattcatgatttg 21623172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 22361581 - 22362014
Alignment:
Q  15 aagaagaa-cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaat 111  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  22361581 aagaagaagcttggagattcaagaattgggagagatcctaggagctaaagtgaagcttggcctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaat 22361679  T
Q  112 tca-tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcc 209  Q
    ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||     
T  22361680 tcaatcataatcattttagt--aatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagcaaatgattaattgttcatagatgataaaatttgtgctct 22361777  T
Q  210 aattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat 309  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  22361778 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgctgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgacataagttgaatt 22361877  T
Q  310 atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 409  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22361878 atgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 22361977  T
Q  410 catggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  22361978 catggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatg 22362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Original strand, 25367053 - 25367461
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||| ||| ||||  ||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25367053 aagaggaacttgaagattcaagaagaggaaagaacctataagctaaagtgaatctttggctagagaattgatctagctaaggtaagggggttagaattca 25367152  T
Q  115 tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaatt 213  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25367153 tcataatcattttagtgtaaattttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagcaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaatt 25367252  T
Q  214 atgatgttatgtttggatgtatgaaattggt-gataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  25367253 atgatgttatgtttgaatgtatgaagttttttgataatggaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtttatgttgaaatatg 25367352  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  25367353 ctcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcat 25367452  T
Q  413 ggcttgggt 421  Q
    |||||||||    
T  25367453 ggcttgggt 25367461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18399333 - 18398961
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||| ||||| |||    
T  18399333 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcttcataatcattttagtgtaaattt-caattattg 18399235  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  18399234 tatgaataagtgcttaattgagtaattgactaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgat 18399135  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399134 aattgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatagtatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 18399035  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  18399034 ttgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggt 18398961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 27 - 444
Target Start/End: Original strand, 33538198 - 33538618
Alignment:
Q  27 aagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcat 124  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33538198 aagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgcgaactaaggtaagggggttagaattcaatcataatcat 33538297  T
Q  125 ttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatg 224  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || |||     
T  33538298 ttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaactatggtgatata 33538397  T
Q  225 tttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttg 324  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| ||||||| ||  ||||    
T  33538398 tttgaatgcatgaaattggtga-aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgatatgttgtgaattatgctctaaaggttg 33538496  T
Q  325 aattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt--gggtt 422  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  33538497 aattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttattgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgtt 33538596  T
Q  423 cataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  33538597 cataaatcatgatttgatgatg 33538618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 444
Target Start/End: Original strand, 18629433 - 18629860
Alignment:
Q  24 ttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataat 121  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18629433 ttgaagattcaagaagtggtatagatcctaggaggtaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataat 18629532  T
Q  122 catttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtt 221  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18629533 catttagtgtaattttttatttgttgtatgattaagtgtttaattgaataagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatgat 18629632  T
Q  222 atgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattg 321  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||  | ||    
T  18629633 atgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtggtatattgtgaattatgctctgaatg 18629732  T
Q  322 ttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattga---tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18629733 ttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttg 18629832  T
Q  419 g--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  18629833 ggtgttcataaatcatgatttgatgatg 18629860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 418
Target Start/End: Original strand, 21410872 - 21411270
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 119  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410872 gaacttgaagattcaagaagaggagagaatctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 21410971  T
Q  120 atca-tttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  21410972 atcattttagtgtaaattttcaattattgtatgaataagtgcttaattgaggaattgactaattgttcataatcgttagaatttgtgctccaattatgat 21411071  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21411072 gttatgtatgaatgcatgaagttgttgataattgaatggttgttaaataaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaatatgctcaaa 21411171  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || | |||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||  |||| || || ||||||||||||    
T  21411172 ttg-tgaattatgctatgttgatgttggattatgctgagattcatgtgcaattgatgtagatgttgttaaatgatgatgttatttataattcatggcttg 21411270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 384
Target Start/End: Original strand, 17083014 - 17083384
Alignment:
Q  15 aagaagaa-cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggg--aattgatctaactaaggtaagggggttagaa 110  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17083014 aagaagaagcttgaagatttaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttcggctaggattaattg--ctaactaaggtaagggggttagaa 17083111  T
Q  111 ttcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  17083112 ttcattttaatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattaattgttcatagttgttaatattcgtgctcta 17083211  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |     
T  17083212 attatgatgatatgtttgaatgcatg-aattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatatgttgaattg 17083310  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17083311 tgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttg 17083384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 16887608 - 16888041
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    |||| ||||||||||| ||||||   ||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887608 aagaggaacttgaagaatcaagaagaggagagaacataggagctaaagtgaagcttgaactagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 16887707  T
Q  115 tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||     
T  16887708 tcataatcatttttagtataatttttcaattattgtatgaataagtgattaattgaataaatgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaac 16887807  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    ||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||||| ||  |  |||| ||||    
T  16887808 tatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgctaacttgtgaattatg 16887907  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||| |||||||  ||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  16887908 ctcaattgggtgaattatgttatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgattttgttgtcactatgtgatgttattgttaatgattcat 16888007  T
Q  413 ggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||  | |||||||||||| ||| |||||    
T  16888008 ggcttgggtatacataattcatgaattggtgatg 16888041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 444
Target Start/End: Original strand, 35135834 - 35136261
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcat 118  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35135834 gaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taggagctaaagtgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcat 35135932  T
Q  119 aatcattt-agtgcaattttt-caattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatg 216  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |    
T  35135933 aatcattttagtgtaattttttcaattattgtatgaataagtgattaattagataattgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactagg 35136032  T
Q  217 atgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctca 316  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||   ||||| ||  |  |||| ||||||||    
T  35136033 atgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgtt-gtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgctaacttgtgaattatgctca 35136131  T
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    | | | ||||||||||||| |||| |||||||| || | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35136132 attggatgaattatgctatattgtggttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 35136231  T
Q  417 tggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  35136232 tgggtattcataattcatgaattggtgatg 35136261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 163 - 444
Target Start/End: Original strand, 18381649 - 18381932
Alignment:
Q  163 aattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgtt 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||  ||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  18381649 aattgtgtaaatgattaattgttcaaagttgttataatttgtgctctaattatgatgatatttttgaatacatgaagttgttgataattgaatggttgtt 18381748  T
Q  263 ggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattca 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  18381749 ggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgcttaaattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtca 18381848  T
Q  363 tgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  18381849 tgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatg 18381932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33325088 - 33324691
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-tttagtgcaatt-tttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||    
T  33325088 ctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattcatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgtaattatttcaattaatg 33324989  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  33324988 tatgaataagtgattaattggataattgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaaattgttgat 33324889  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||   ||||| ||  |  |||| ||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  33324888 aattgaattgttgtt-gtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgctaacttatgaattatgctcaattggatgaattatgctatattgtggttgaa 33324790  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    || || | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  33324789 ttatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatg 33324691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25920009 - 25919611
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||||| ||||||    
T  25920009 ctaggagctaaagtgaagttagaactagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttagtgtcaattttcatttgttg 25919910  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||    
T  25919909 aatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattggtcatgattattagaattcgtgctcctattatgatgttatatttgtacgtgagaaattggtgat 25919810  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||  | |||||||| ||||||   || || |||| |  |||| ||||||||||   | ||| ||| || || | | || || |||||||||||||||    
T  25919809 aattggttggttgttggagaaattgagtgatccaagtgtatgaaaatgatatatgtcatattatactctaaatgataatttgtgatatgttgttgttgaa 25919710  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    || || | |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  25919709 ttatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatatgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatg 25919611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 412
Target Start/End: Original strand, 17556872 - 17557231
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |  |||     
T  17556872 ctaggagataaagtgaagcttaggctagg-atttgagctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatctagtgtaatttttcattaattgc 17556970  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    || | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17556971 attattaagtgcttaattgaataattgattatttgttcatagttgttaaa-ttcgtgctctaattatgatgatatgtttg-atgcatgaaattggtgata 17557068  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17557069 attgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctatagatgttgaatt-tgctatgttgttgttgaat 17557167  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    |||| | | | |||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  17557168 tgtgattataatcatatttaattgatgttgttgttgctaactaatattgttgttaatcattcat 17557231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 221 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25651460 - 25651235
Alignment:
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  25651460 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 25651361  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25651360 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 25651261  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| |||||||| |||||||    
T  25651260 tgttcataaatcatgattggatgatg 25651235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15740651 - 15740252
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| |         ||| |||||||||||    
T  15740651 aagaagagcttgaagattcaagagttggagaggacttaggagcgaaagtgaagcttgaattagggaattgatctta---------gggagttagaattca 15740561  T
Q  115 tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    ||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  15740560 tcataatcatttttagtgtaaattttcaatttttgtatgaataagtacttaattgagtaattgattaattgttcatgattgttagatttcgtgctccaat 15740461  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||   ||| ||||||||||   | ||||    
T  15740460 tatgatgctatgtttgtatgtaagaaattggtgataattgattggttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatataaaaatgatatatgtcatattatg 15740361  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||| |  |||  | || || ||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||  |||| || || ||||||    
T  15740360 ctctatatgtcaatttgtgatatgttgatgttgaattatactgagattcatgttcaattgatgtagatgttgttaaatgatgatgttattaataattcat 15740261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 149 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 29605744 - 29605473
Alignment:
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||| || ||||||    
T  29605744 atgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaa-ttagtgata 29605646  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||  |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29605645 attgaattgttgttggtgaaattacatgttcatagtatgtgaaaatgaaatattgtgaattgtgctcaaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaat 29605546  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    | || |  || ||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29605545 tatgatgtgaatcatgcttaattgatgttgttgttgctaagaaatattgttgttgatgattcatggtttgggt 29605473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 34967220 - 34966890
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt-tcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||     
T  34967220 aggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatttttctcttag 34967121  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||    
T  34967120 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttcgtgaaattgcatgttcatagtatgtga 34967021  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    ||  |||||||  |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  34967020 aaaagatatattgtgaattgtactctaattgttgaattatgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaga 34966921  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34966920 gatattgttgttgatgattcatagcttgggt 34966890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 87 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19854515 - 19854153
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-g 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  19854515 ctaattaaggtaagggggttagagttcaatcacaatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttg 19854416  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
     || ||  |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19854415 ctcttagctgttgaaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 19854316  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||| || |||||  |||  | ||||| || |  |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19854315 tatgtgaaaatggtatattgtgagttgtgctctaaataatgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 19854216  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  19854215 gctaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatg 19854153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 431
Target Start/End: Original strand, 15079563 - 15079944
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctag-ggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||     
T  15079563 ctaggagcaaaagtgaagcttaagctagagggattaatctaactaaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaattattt 15079661  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    |||||||||| | |||||||  ||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| || || |||| |||| ||| ||| ||||| |||  |||    
T  15079662 tatgaataagggattaattggataattgattaattattcatagatgtt-aaattcgtgctctaactaggatgatatg-ttgtatgcatgaagttgaggat 15079759  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    |||| ||  |  |||| ||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||    
T  15079760 aattgaattgttgtt-gtgaaattgcatgttcaaagtgtgtatgagtgctaacttgtgaattatgctcaattgggtgaattatgctatattgttgttgaa 15079858  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattca 431  Q
    || || | |||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15079859 ttatgatgagaaccatgttcaattgatattgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggtttgggtattcataattca 15079944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18432999 - 18432665
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  18432999 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaaattttcaattattgtatgaa-aagagcttaattgggtgaattgattatttgtt 18432902  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| || | |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||| |||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||    
T  18432901 cataaatgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatacttgaattgttgttgattgaattacatgttaaaagta 18432802  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||  | | |||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  18432801 tgaaaaatgggtgtatgttgaaaatatgcttaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttg 18432703  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     || || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18432702 atatgttatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 18432665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16086374 - 16086022
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattg-ttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  16086374 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttt-caattaattgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattaattaattgt 16086277  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  16086276 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattacatgttcaaagt 16086177  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    | || |||  | ||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||||||||||| || |||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  16086176 acgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgct-taattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgtt 16086078  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgattt 437  Q
    | || || || |||||  |||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  16086077 gatatgtcatgttgttaatgataattcatgacttgggtttgcatgattcatgattt 16086022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32899147 - 32898812
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttg-tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  32899147 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaatttt-caattattggtatgaa-aagtgcttaatttggtgaattgattaattgt 32899050  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  32899049 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 32898950  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | |||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  32898949 atgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgtt 32898851  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | | ||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  32898850 gtttagtcatgttgttgatgataattaatggcttgggtt 32898812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16106873 - 16106547
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattg-ttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16106873 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttt-caattaattgtatgaa-aagtgcttaattgagtgaattaattaattgt 16106776  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    || ||| || | ||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  16106775 tcgtaaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagt 16106676  T
Q  285 atgagaaagtga-tatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    |||| ||| ||| ||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  16106675 atga-aaaatgagtatgtgttgaaaatatgct-taattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgt 16106578  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 413  Q
    || || || || |||||  |||| |||||||    
T  16106577 tgatatgtcatgttgttaatgataattcatg 16106547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 205 - 418
Target Start/End: Original strand, 28195101 - 28195315
Alignment:
Q  205 gctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgtt 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  28195101 gctccaattatgatgatatgtttgaatgtatgaagttgttgataattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcatagtatgagaaaatggtatatgat 28195200  T
Q  305 gaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaaga-ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttg 403  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  28195201 gaaatgtgctcaattagttgaattatgccatgatgttgttgaattgtgatgagattttatgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatg 28195300  T
Q  404 atgattcatggcttg 418  Q
    || ||||||||||||    
T  28195301 ataattcatggcttg 28195315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31628538 - 31628272
Alignment:
Q  174 tgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttc 273  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||  || |||||||||   |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  31628538 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtattcgaattatgattacatgtttagatgtatgaagttattgataattgaattgttgttagttgaattac 31628439  T
Q  274 atgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattg 372  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  31628438 atgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattg 31628340  T
Q  373 atgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  31628339 atgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 31628272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22848368 - 22848110
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||    
T  22848368 taaggtaagggaattagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgtttaagtgcttagttgaataattgatta-ttgttcata 22848270  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
     ||||| ||||||||||   |||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22848269 gttgttgaaattcgtgcattaattatgatgatatgtttaaatgcaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatagtatgtg 22848170  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaatt 349  Q
    ||| || |||||  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22848169 aaaatgttatattgtgaattgtgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaatt 22848110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 421
Target Start/End: Original strand, 22461991 - 22462320
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttca--ta 189  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| | ||||||||  |  ||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||| || ||||  ||    
T  22461991 aggtaagggggttagatttcaataataatcacttagttgtaatttttccctaattgtatgcataagtgcttatttgaataagttattattt-ttcactta 22462089  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
     ||||| |||||||| |||   |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |    
T  22462090 gttgttgaaattcgttctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtg 22462189  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
    |||||| |||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22462190 aaagtggtatattgtgaattttgctctaattgttgaattgtgctatgatgttgttg-gttgtgatgagattcatgtttaaatgatgttgttgttgttaag 22462288  T
Q  390 tgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22462289 agatattgttgttgatgattcatagcttgggt 22462320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 412
Target Start/End: Original strand, 17013595 - 17013855
Alignment:
Q  154 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattg 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | || || ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| |||||    
T  17013595 taagtgcttaattgagtaagtgattattttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgaaaattg 17013694  T
Q  253 aattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 352  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  17013695 aattgttgttggtgaaattgcctgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctttaattgttgaattgtgctatgttcttgttgatttgtg 17013794  T
Q  353 gtaagattcatgttcaattgatg-ttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
     | ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  17013795 atgagattcatgtttaattgatgattgttgttattaagaaatattgttgttgatgattcat 17013855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18570632 - 18570330
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  18570632 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcaattt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 18570536  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | ||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||  ||   ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||    
T  18570535 taagtgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgatgttatggataattgaattgttattagttaaattacatgttcaaagtatg 18570436  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    | |||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| || || ||||||| |    
T  18570435 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgtt 18570337  T
Q  387 aagtgat 393  Q
    |||||||    
T  18570336 aagtgat 18570330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25654546 - 25654350
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataat 121  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |  ||  |||| |||||||||||||||||||||  |  ||||    
T  25654546 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaaacttgcgctaggaatctgtgctaattaaggtaagggggttagaatttgtgctaat 25654447  T
Q  122 catttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25654446 catttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaggtgattaattgttcagagttgttaaaattcgtgctctaattatgat 25654350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 237 - 421
Target Start/End: Original strand, 29160343 - 29160527
Alignment:
Q  237 aaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||  |||  | ||||| |||||||||||| |||||||    
T  29160343 aaattggtgataattgaattgttgttagtgaaattgcatgttcatggtatgtgaaaatgatatattgtgagttgtgctctaattgttgaattgtgctatg 29160442  T
Q  337 ttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||| ||| | | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29160443 ttgttgttgatttgcgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 29160527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22441287 - 22440940
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22441287 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgcaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattgagtgaattgattaattgttca 22441191  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||| ||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||||  | ||   |||| |||||| ||||||||    
T  22441190 tatatgatgaaattcgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtgatggggtgaattacatgttaaaagtatg 22441091  T
Q  288 agaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    | |||  | |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  22441090 aaaaatgggtatgagttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 22440992  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    |||| || |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  22440991 aagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttgcatgattcatgattt 22440940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 191 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23223004 - 23222770
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||    
T  23223004 ttgttgaaattcgtgctctttttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtga 23222905  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg--ctaa 388  Q
    || ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||   |||    
T  23222904 aaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtactatgttgttgtttatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttataa 23222805  T
Q  389 gtgatat--tgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    | |||||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  23222804 gagatatcatgttgttgatgattcatagattgggt 23222770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 234 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23222126 - 23221937
Alignment:
Q  234 atgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgct 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| || |||||  |||| ||||||| |||||||||||| |  |    
T  23222126 atgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatggtatattgtgaattatgctctaattgttgaattgtatt 23222027  T
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg--ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  23222026 atgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatattgttgttgttataagagatattgttgttgatgattcatagattgggt 23221937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 18777413 - 18777169
Alignment:
Q  177 ttaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatg 276  Q
    ||||||||||||||  | | ||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||    
T  18777413 ttaattgttcataaaagatgaaattcgtgttctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatg 18777314  T
Q  277 ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatg 375  Q
    |||||||||||| |||  | ||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||  |||    
T  18777313 ttcaaagtatgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgttcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatg 18777215  T
Q  376 ttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||| |||||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  18777214 ttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggt 18777169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32352379 - 32352107
Alignment:
Q  114 atcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| ||||| |||||| |||||       
T  32352379 atcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgctcatagttgttgaaattcatgctcttt 32352280  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
     ||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | |    
T  32352279 ctatgatggtatatttgaatacatgaaattggtgataattgaattgtttatggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgt 32352180  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    | || || |||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32352179 gttctaaatgttgaattatgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 32352107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 13014601 - 13014934
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgt---tgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||| |   |||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  13014601 actaaggtaagggggttagaatttatcataatcacttattgtaatttt-caattatgtttgtatgaa-aagtgctaaattgggtgaattgattaattgtt 13014698  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| || | |||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||||||||| ||  ||||  |||||  |||||    
T  13014699 cataagtgatgaaattcgtgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattgtatgtt-gaagta 13014797  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgtt-gaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||  | |||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||| || ||    
T  13014798 tgaaaaatgggtatgagttggaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatg 13014896  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||||| || |||||| |||| |||| |||||||||||    
T  13014897 ttaagtcatgttgttgatgataattcgtggcttgggtt 13014934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 211 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19672519 - 19672293
Alignment:
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| |     
T  19672519 attatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttaatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgatatattgtgaattg 19672420  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| || ||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||||        || ||||||||||||||||||||    
T  19672419 tgctccaaatgttgaattgtgctatcttattgttgaattgcgatgaga-tcatgtttaattgatgttgt--------agagatattgttgttgatgattc 19672329  T
Q  411 atggctt--gggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||  |||  | |||||||| |||||| |||||||||    
T  19672328 ataacttcggtgttcataaatcatgaattgatgatg 19672293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 35009455 - 35009678
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||||||||||| || | |||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||  ||||  ||| ||     
T  35009455 aaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat-tatgtaaaaatgt 35009552  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
     |  | ||||||  | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  35009553 gaagttttgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatg 35009651  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35009652 ttgttgttgatgaatcattgcttgggt 35009678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21931432 - 21931263
Alignment:
Q  216 gatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg-agaaagtgatatatgttgaaatatgct 314  Q
    |||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| | |||  | |||||  |||| ||||||    
T  21931432 gatgatatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatgtataaatgggtatattgtgaattatgct 21931333  T
Q  315 caaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
     |||||| ||| || || |||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21931332 taaattgatgagttgtgttatgttgttgttgatttgtggttgaattcatgttcaaatgaagttgttgttg 21931263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 280
Target Start/End: Original strand, 31467483 - 31467680
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattg-ttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt- 182  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||    |  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| ||     
T  31467483 ctaactaaggtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttttcctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatttt 31467582  T
Q  183 gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    | || || ||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  31467583 gctcttagttgttgaaattcatgctcttattatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttaatgaaattgcatgttca 31467680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Original strand, 35015285 - 35015408
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  35015285 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggct 35015384  T
Q  417 tgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||    
T  35015385 tgggtttgcatgattcatgatttg 35015408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19175404 - 19175210
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||   ||||       
T  19175404 ttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtatataaaattgatgataattgaattgttgttgataaaattgcatgttcatgatatgtat 19175305  T
Q  291 aagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    || ||| |||||  |||| | |||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  19175304 aaatgagtatattgtgaattgtgcttaaattgatgaattgtactatgttgttgttgatttgtggttgaattcatgtttaaatgaagttgttgttg 19175210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 281
Target Start/End: Original strand, 1657660 - 1657847
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcat------ttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | | | |||||| ||||||  |||||||    
T  1657660 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgt 1657759  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    |  |||        |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||    
T  1657760 tgctaa--------attcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 422
Target Start/End: Original strand, 25744339 - 25744438
Alignment:
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| |||| || ||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25744339 tgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 25744438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16136516 - 16136427
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||    
T  16136516 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgataatatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaatagtttttgatgaaattgcatgttca 16136427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23153694 - 23153610
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  23153694 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 23153610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 29666001 - 29665936
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  29666001 aattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgttgt 29665936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15862822 - 15862635
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcat------ttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | | | |||||| ||||||  |||||||    
T  15862822 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgt 15862723  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    |  |||        |||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||    
T  15862722 tactaa--------attcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 18777486 - 18777431
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||    
T  18777486 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattggaa-ttttcaatt 18777431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 26089862 - 26089786
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26089862 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 26089786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 27740966 - 27740862
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| |  ||  |||| ||||||| ||||| |||||| |    
T  27740966 aattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtt 27740867  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  27740866 tgggt 27740862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14152709 - 14152626
Alignment:
Q  46 gatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 129  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||  |||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  14152709 gatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggcaagggggttattcttcatcataatcaattagt 14152626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 421
Target Start/End: Original strand, 14626152 - 14626357
Alignment:
Q  215 tgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgc- 313  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||  |  |||||  ||      
T  14626152 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 14626249  T
Q  314 tcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 413  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| | |  ||||| || |||||||||||| | |||| ||| |||| |||| |||||||| ||||     
T  14626250 tgcaattggtgaattatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcatt 14626349  T
Q  414 gcttgggt 421  Q
    ||||||||    
T  14626350 gcttgggt 14626357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 443
Target Start/End: Original strand, 17083376 - 17083426
Alignment:
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgat 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  17083376 ttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgat 17083426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 436
Target Start/End: Original strand, 18823515 - 18823637
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||| || || || |||||| |||| || ||||||    
T  18823515 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgcggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggc 18823614  T
Q  416 ttgggtt--cataattcatgatt 436  Q
    |||||||  ||| ||||||||||    
T  18823615 ttgggtttgcatgattcatgatt 18823637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 128
Target Start/End: Original strand, 25640453 - 25640492
Alignment:
Q  89 aactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttag 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25640453 aactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttag 25640492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 421
Target Start/End: Original strand, 16300116 - 16300213
Alignment:
Q  325 aattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||  |||||| |||||||||||    
T  16300116 aattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtatatgatttatggcttgggt 16300213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19629458 - 19629354
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  19629458 aattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggc 19629360  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  19629359 ttgggt 19629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 32276891 - 32276995
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  32276891 aattgatgaattgtgacatgttattgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatt-atggc 32276989  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  32276990 ttgggt 32276995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 18002624 - 18002728
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  || | | || | ||||||||||    
T  18002624 aattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaattcatggct 18002723  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  18002724 tgggt 18002728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23995050 - 23994974
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23995050 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 23994974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18583444 - 18583377
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  18583444 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttg 18583377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 436
Target Start/End: Original strand, 18839370 - 18839492
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||| |||  || ||| ||| |||||||||||||||||| || || || |||||| |||| || ||||||    
T  18839370 aattgatgacttatgacatgttattgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggc 18839469  T
Q  416 ttgggtt--cataattcatgatt 436  Q
    |||||||  ||| ||||||||||    
T  18839470 ttgggtttgcatgattcatgatt 18839492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 421
Target Start/End: Original strand, 1657909 - 1657986
Alignment:
Q  344 tgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||| | || ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||  ||||||||    
T  1657909 tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggt 1657986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 18583672 - 18583635
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18583672 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagt 18583635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 422
Target Start/End: Original strand, 19983439 - 19983524
Alignment:
Q  337 ttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||| | | | | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19983439 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggcttgggtt 19983524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 13377953 - 13377527
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattcatcataa 120  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377953 cttgaagatttaagaattggaagagatcttaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataa 13377855  T
Q  121 tcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13377854 tcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgattcattgagtaatcgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgat 13377755  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13377754 gttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatactcaaa 13377655  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  13377654 ttgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgatgattcatggcttg 13377555  T
Q  419 g--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  13377554 ggtgttcataaatcatgatttgatgatg 13377527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Original strand, 49047492 - 49047898
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49047492 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taggagctaaattgaagcttgaactagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 49047590  T
Q  114 atcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaatt 213  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  49047591 atcataatcatttattgccatttttcaattgttatatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcagaattgttagaatttgtgctccaatt 49047690  T
Q  214 atgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgc 313  Q
    || |||  ||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  49047691 ataatgacatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagagagtggtatatgttgaaatatgc 49047790  T
Q  314 tcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 413  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  49047791 tcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatg 49047890  T
Q  414 gcttgggt 421  Q
    ||||||||    
T  49047891 gcttgggt 49047898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 48357066 - 48356642
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48357066 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctagg-aattgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataa 48356968  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  48356967 tcatttagtgtaatttttcattcgttgtatgattaaatgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatga 48356868  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  48356867 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 48356768  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48356767 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 48356668  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  48356667 tgttcataaatcatgatttgatgatg 48356642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9839302 - 9838878
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| | ||   |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9839302 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttcggcgaggaatttttgctaattaaggtaagagggttagaattcaatcataa 9839203  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9839202 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatcattaagtgcttaattgagtacgtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatga 9839103  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  9839102 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 9839003  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9839002 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttggt 9838903  T
Q  420 gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  9838902 gttcataaatcatgatttgatgatg 9838878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 442
Target Start/End: Original strand, 16914752 - 16915175
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  16914752 cttgaagattgaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgggctaggaatttgtcctaattaaggtaaaggggttagaattcaatcacaa 16914851  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16914852 tcatttagtgtaacttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatga 16914951  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||      
T  16914952 tatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaac 16915051  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16915052 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttggg 16915151  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatga 442  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  16915152 tgttcataaatcatgatttgatga 16915175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9611731 - 9611306
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| | ||   |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9611731 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttcggcgaggaatttttgctaattaaggtaagagggttagaattcaatcataa 9611632  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9611631 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatcattaagtgcttaattgagtacgtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatga 9611532  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgc-tcaaat 319  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||     
T  9611531 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgcttctaaa 9611432  T
Q  320 tgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg 419  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9611431 tgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgg 9611332  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  9611331 tgttcataaatcatgatttgatgatg 9611306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 17223752 - 17224187
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaatt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| |||| | ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  17223752 aagaagaacttgaaaattcaagaattggaagagatcctacgaggtaaagtgaagcttgggctaag-aattggtgataattaaggtaagggggttagaatt 17223850  T
Q  113 ca-tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcc 209  Q
    || ||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||     
T  17223851 caatcataatcatttttagtgtaatttttcaattattttatgattaagtgcttaattgagtaaataattaattgttcaaagttgttataattcgtgctct 17223950  T
Q  210 aattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat 309  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | ||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17223951 aattatgatgatatgtttgaatgcacgaagttgtggataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaatt 17224050  T
Q  310 atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 409  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  17224051 atactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgatgatt 17224150  T
Q  410 catggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  17224151 catggcttgggtattcataattcatgatttgttgatg 17224187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13275206 - 13274814
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13275206 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taggagctaaagtgaatcttgagttagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 13275108  T
Q  114 atcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaatt 213  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13275107 atcataatcatttattgccatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaatt 13275008  T
Q  214 atgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgc 313  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||| ||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |          ||||||    
T  13275007 atgatgatatgtttgaatgcaagaagttgttggtaattgaattgttgttagtaaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggt----------atatgc 13274918  T
Q  314 tcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 413  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13274917 tcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatg 13274818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 421
Target Start/End: Original strand, 12247973 - 12248345
Alignment:
Q  51 taggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgta 149  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  12247973 taggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaattattgta 12248072  T
Q  150 tgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataa 249  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||    
T  12248073 tgaataagtgcttaattggataattgattacttgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataa 12248172  T
Q  250 ttgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    |||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12248173 ttgaattgttattagttgaatttcatgtttaaagtatgagaaaatagtatatgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaat 12248272  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| |||||||    
T  12248273 tgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataatgcatgacttgggt 12248345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 34241031 - 34241437
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| | || | | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34241031 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctatgagctaaagtgaagcttgggttaagaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataa 34241130  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  34241131 tcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgattaattgagtaagtgattaattgttcatagttgataaaattcgtgttataattatgatgt 34241230  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||                   |    
T  34241231 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttaaaagtatgtgaaagtaatata-------------------t 34241311  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt--g 418  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  34241312 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgataagtgacattgttgttgatgattcatggcttgag 34241411  T
Q  419 ggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  34241412 tgttcataaatcatgatttgatgatg 34241437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 14271723 - 14272135
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattca-tcata 119  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||| ||  | |||| ||||| |  ||| |||||||||||  |||||||||| |||||    
T  14271723 cttgaagattcaagaattggaagatatcctatgagttaaagtgaagcttaggttagg-aattggtgataattaaggtaagggaattagaattcaatcata 14271821  T
Q  120 atcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |    
T  14271822 atcattttagtgtaatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcatagttgtcaaa-ttcgtgctctaattatggt 14271920  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    | |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  14271921 gatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattcaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaaatgatatatgttgaactatgctccaa 14272020  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt- 417  Q
    ||||||| | |||||||||| |             ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14272021 ttgttgattcatgctatgttat-------------taagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttg 14272107  T
Q  418 -gggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||    
T  14272108 agtgttcataattcatgattagatgatg 14272135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Original strand, 26070118 - 26070488
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| |||||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||    
T  26070118 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggg-ttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattatggt 26070215  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||||    
T  26070216 atgaataagtgcttaattgtgtaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggata 26070315  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  26070316 attgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgct-taattggtgaattatgttatgttgttgatgaa 26070414  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||    
T  26070415 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggcttgggt 26070488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Original strand, 26093905 - 26094275
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| |||||| | |||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||    
T  26093905 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagagagattaacctaactaaggtaagggg-ttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattatggt 26094002  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||||    
T  26094003 atgaataagtgcttaattgtgtaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggata 26094102  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  26094103 attgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgct-taattggtgaattatgttatgttgttgatgaa 26094201  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||    
T  26094202 ttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggcttgggt 26094275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Original strand, 16569858 - 16570230
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  16569858 ctaggagctaaattgaagcataagctagggagattaatctaacaaaggtaagggggttaaaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgt 16569956  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||| || | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||||    
T  16569957 atgaataagtgcttaattggataattgattatttgctcataaatgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggata 16570056  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16570057 attgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaa 16570156  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||    
T  16570157 ttgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcatggcttgggt 16570230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16595804 - 16595432
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  16595804 ctaggagctaaattgaagcataagctagggagattaatctaacaaaggtaagggggttaaaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgt 16595706  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||| || | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||||    
T  16595705 atgaataagtgcttaattggataattgattatttgctcataaatgatgaaattcgtgctctcattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggata 16595606  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16595605 attgatttgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatctggaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaa 16595506  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||    
T  16595505 ttgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcatggcttgggt 16595432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 87 - 444
Target Start/End: Original strand, 20583442 - 20583803
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||    
T  20583442 ctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcctaattgaataagtgattatttgt 20583541  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    ||||| ||||| |||||  ||| | |||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||    
T  20583542 tcatagttgttgaaatttttgccctaattatgaagatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattattgttgatgaaattgcatgttcatagt 20583641  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20583642 atgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 20583741  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  20583742 ttaagggatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatg 20583803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11287845 - 11287421
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| ||||||||||| |||||   |||||||| | ||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11287845 aagaggaacttgaagaatcaaggagtggagagagc-taggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 11287747  T
Q  114 atcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||| || | ||||| ||||||  ||    
T  11287746 atcataatcatt-attgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattagtgctctgat 11287649  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tat 311  Q
    |||| ||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||    
T  11287648 tatgttgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatat 11287549  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||    
T  11287548 gctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattca 11287450  T
Q  412 tggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  11287449 tggcttgggtttgcatgattcatgatttg 11287421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 87 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31501531 - 31501171
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatca-taatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgtt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||   | |||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  31501531 ctaactaaggtaagggggttagaattcaacaataatcaattagttgtaattttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgtt 31501432  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    |||| ||| | ||||| ||| || |||||||| | |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  31501431 catagttgatgaaattagtgatctaattatgaagatatgtttaaatacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagta 31501332  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
    || |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  31501331 tgtgaaaatgatatattgtgaataatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgt 31501232  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  31501231 tatgagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgagtcatgatttgatgatg 31501171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 44 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 38424620 - 38424220
Alignment:
Q  44 gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaa 141  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||   ||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| || ||||| | |||||||||     
T  38424620 gagattctaggagctaaattgaagtttgggctagg-atttttgctaactaaggtaaggaggttagatttcaaccataaacaattagttgtaatttttcat 38424522  T
Q  142 ttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaatt 241  Q
    |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||  || |||||    
T  38424521 taattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattctttgttcatagttgttgaaattcgtgctctggttatgatgatatgtttgaatacataaaatt 38424422  T
Q  242 ggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38424421 ggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgttctatgttgtt 38424322  T
Q  342 gttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttga 439  Q
    |||||||| || | ||| | ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  38424321 gttgaattatgatgagaattatgtttaagtgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatgatttga 38424222  T
Q  440 tg 441  Q
    ||    
T  38424221 tg 38424220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 12759383 - 12759009
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-g 147  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |    
T  12759383 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaacctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttg 12759284  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||   ||    
T  12759283 tatgaa-aagtgtttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctccaattatgatgatatgtttagatgtatgaagttatgga 12759185  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | ||| |||| | ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12759184 taattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaaatgtgaaaaaggggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgttgttggtg 12759086  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    |||| || |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12759085 aattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataattcatggcttgggtt 12759009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4485084 - 4484725
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||   | |||||| |  |   |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  4485084 ctaactaaggtaaaggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaattttcattaatatcatgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgtt 4484985  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  4484984 catagttgttgaaattcgtg-tcctaatatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcattgta 4484886  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
    || |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  4484885 tgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgt 4484786  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  4484785 taagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatgatttgatgatg 4484725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 87 - 445
Target Start/End: Original strand, 13862823 - 13863180
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || |||||||     ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  13862823 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaatttt-caattatttgtatgaa-----gcttaattgggtgaatagattaattgt 13862916  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
     ||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  13862917 ccataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagt 13863016  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13863017 atgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgttgttgttgtt 13863116  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  13863117 gctaagtgatattgttgttaatgatgcatggcttgggtgttcataatcaatgatttgataatgt 13863180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15359191 - 15358795
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgc-aatttttcaattgttg 147  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |  |||    
T  15359191 ctaggatctaaattgaagcttgggctagg-atttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtggtaatttttcattaattg 15359093  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
     |||| ||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15359092 catgattaagtacttagttgaataactgatta-ttgttcatagttgttgaaattcgtgttttaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 15358994  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  15358993 aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaa 15358894  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||    
T  15358893 ttgtgatgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagaagttttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatatatcaagatttgatgatg 15358795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 88 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28722468 - 28722169
Alignment:
Q  88 taactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||| ||| ||||||||||| ||| ||| |  |||||    
T  28722468 taactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaaatgcttaattgaataagtgaatctttgtt 28722369  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28722368 catagttgttgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagta 28722269  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaag-attcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    || |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  28722268 tgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaattcatgtttaaatgaagttgttgttg 28722169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14935757 - 14935361
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggg--gttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgt 145  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||   |||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  |    
T  14935757 ctaggagctaaattgaagtttgggctagg-atttttgctaattaaggtaaggggccgttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaat 14935659  T
Q  146 tgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtg 245  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||| ||| |  ||| ||| | ||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  14935658 tgcatgattaagtgcttaattgaataagtgaatctttggtcacagttgttgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtg 14935559  T
Q  246 ataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14935558 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgatatgttgttgttg 14935459  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgat 443  Q
    |||| || | ||| |||| || || ||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  14935458 aattatgatgagaatcatttttaaatgatgttgttgt---taagagatattgttgttgaagattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgat 14935362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15363350 - 15362954
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggg--gttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgt 145  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||   |||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  |    
T  15363350 ctaggagctaaattgaagtttgggctagg-atttttgctaattaaggtaaggggccgttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaat 15363252  T
Q  146 tgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtg 245  Q
    || |||| ||||||||||||||| ||| ||| |  ||| ||| | ||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  15363251 tgcatgattaagtgcttaattgaataagtgaatctttggtcacagttgttgaaattcgtgctctagttatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtg 15363152  T
Q  246 ataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15363151 ataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgatatgttgttgttg 15363052  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgat 443  Q
    |||| || | ||| |||| || || ||||||||||||   |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| ||||    
T  15363051 aattatgatgagaatcatttttaaatgatgttgttgt---taagagatattgttgttgaagattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgat 15362955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 225 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16919778 - 16919597
Alignment:
Q  225 tttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttg 324  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16919778 tttgaatgcatgaaattgttgataatcgaattgttattggtgaaatttcatgttcaaaatatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaaattgatg 16919679  T
Q  325 aattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16919678 aattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcgtgtttaattgatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatg 16919597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 15822325 - 15822656
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || || || ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  15822325 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaatttt-cagttatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 15822422  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| | |     
T  15822423 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtt-ggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaaatgta 15822521  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| || |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15822522 tgaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaaatggt-gaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgat 15822620  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15822621 atgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggtt 15822656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 438
Target Start/End: Original strand, 45452058 - 45452409
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  45452058 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 45452155  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  45452156 tcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 45452255  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| ||||| |||||||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  45452256 atgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaatttg-tga--catgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgtt 45452352  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    | || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  45452353 gatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttg 45452409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 114 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 28390644 - 28390310
Alignment:
Q  114 atcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| || | || || ||||| ||||||||||||       
T  28390644 atcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttgctcttagttgttcaaattcgtgctcttg 28390545  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||  |||| | |    
T  28390544 ttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatggtatattgtgaattgt 28390445  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28390444 gctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgataatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattca 28390345  T
Q  412 tggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    | | ||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  28390344 tagtttgggtgttcataaatcatgaattgatgatg 28390310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 398
Target Start/End: Original strand, 12369730 - 12370041
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  12369730 ctaactaaggtaagggggttagatttcatcattatcatttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattaattaattgt 12369827  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  12369828 tcataaatgattaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttacggataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagt 12369927  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  12369928 atgaaaaatgggtatctgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgtt 12370026  T
Q  384 gctaagtgatattgt 398  Q
    |||||||||| ||||    
T  12370027 gctaagtgatgttgt 12370041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 444
Target Start/End: Original strand, 13448721 - 13449076
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt-tcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||| | ||| | ||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||   || ||     
T  13448721 aggtaagggggttagagttcaaccataatcaataagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttactcttag 13448820  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| |||||| |||||   |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  13448821 ttgttgaaattcatgctcttgttatcatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 13448920  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  13448921 aaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaga 13449020  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  ||| |||| |||||| |||||||||    
T  13449021 gatattgttgttgatgattcgtagcttgggtgttgataaatcatgaattgatgatg 13449076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 94 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 4446566 - 4446209
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaa-ttgttcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  |   |||| ||||||||||||||  ||| ||||||  ||| || |||    
T  4446566 aggtaagggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaatatcatgattaagtgcttaattggataactgattatgttgctcttaa 4446467  T
Q  191 ttgtt-aaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  4446466 ttgttgaaaatacgtgctctagttatgatgatatgtttgcacacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtg 4446367  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
    ||| ||||||||  || | | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4446366 aaaatgatatattatgtattgtgctccaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtt-aattgatgttgttgttgataag 4446268  T
Q  390 tgatattgttgttg-atgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
     |||  || ||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  4446267 agatgctgatgttgaatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgt 4446209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 90 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3895378 - 3895048
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  3895378 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 3895282  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    |||||| | |||||| ||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  3895281 taattgatgaaattcatgctctaattctgatgaaatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattgcatgttcaaagtatg 3895182  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    | |||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  3895181 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 3895083  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  3895082 aagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggt 3895048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 148 - 421
Target Start/End: Original strand, 9723757 - 9724031
Alignment:
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||| || |  | |||||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  9723757 tatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttaattgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgggtacatgaaattggtga 9723856  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9723857 taattcaattgatgttgatgaaactgcatgttcataatatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttga 9723956  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  9723957 tttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattattgttgatgattcatagcttgggt 9724031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 181 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14941015 - 14940751
Alignment:
Q  181 ttgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||    
T  14941015 ttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaatttgtgataattaaattgttg---gtgaaattgcatgttca 14940919  T
Q  281 aagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 380  Q
     |||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| || ||||||||||    
T  14940918 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaaatgatgttgtt 14940819  T
Q  381 gttgctaagtgatattgttg--ttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||| |||| ||  || | |  |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  14940818 gttgttaagagagtttttagaattgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatg 14940751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 191 - 421
Target Start/End: Original strand, 17947586 - 17947816
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| |||| |||||||   |||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| || |||||| ||    
T  17947586 ttgttgaaatacgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggttaaactgaatgtgcatagtatgtga 17947685  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||||||||  | || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  17947686 aaatgatatattgtaaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaga 17947785  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17947786 gatattgttgttgatgattcatagcttgggt 17947816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 33560050 - 33559694
Alignment:
Q  43 agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttc 139  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||  |||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||| | ||||||||    
T  33560050 agagattctaggagctaaattgaagctttggctagggttattg--ctaattgaggtaagggggttagatttcaatcataattaattagttgtaatttttc 33559953  T
Q  140 aattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaa 238  Q
    | |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||  |||| |||||||| |||    ||||||| ||||||   ||  |||||    
T  33559952 attaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgttcatagctgttgaaattcgtcctcttgctatgatgatatgttaaaatacatgaa 33559853  T
Q  239 attggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgtt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| |  |||| || ||||||||| || ||||||    
T  33559852 attggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgagaaaatgatatattgtgaattgggctctaaatgttgaattgtgttatgtt 33559753  T
Q  339 gttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattg 397  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33559752 gttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattg 33559694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 46474299 - 46474027
Alignment:
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt-tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||   || || ||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| |  |  |||||||||||||    
T  46474299 tatgcataagtgtttaattgagtaagtgattattttactcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgttagagtacatgaaattggtga 46474200  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| | || ||  |||||  | || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46474199 taattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtggaaatgtgtatattgttaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttg 46474100  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  46474099 atttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttg 46474027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 181 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 15368608 - 15368344
Alignment:
Q  181 ttgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||| ||||||||    
T  15368608 ttgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaatttgtgataattaaattgttg---gtgaaattgcatgttca 15368512  T
Q  281 aagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 380  Q
     |||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||||| || ||||||||||    
T  15368511 tagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattaatgaattgtgatatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaaatgatgttgtt 15368412  T
Q  381 gttgctaagtgatattgttg--ttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||| |||| ||  || | |  |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  15368411 gttgttaagagagtttttagaattgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatg 15368344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 47290139 - 47289787
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgt 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||| ||  || |||||||||||    
T  47290139 ctaattaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaa-aaatgcttaattggatgaattgattaattgt 47290041  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||| |||||| ||    |||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||    
T  47290040 tcataaatgatgaaattcgagctctaattatgatgccatgtttagatatatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagt 47289942  T
Q  285 atgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
     |  |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||| || |||||     
T  47289941 gtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgc 47289843  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    || ||||| || ||| || |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  47289842 tgttaagtcatgttgatgatgataattcatggcttgtgttgcatgattcatgattt 47289787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 143993 - 143651
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  143993 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaattatttgtat-aaaaagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 143896  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |     
T  143895 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgta 143797  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
     |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||      |||||||||     
T  143796 tgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa------ttgttgttgt 143704  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    ||||| || |||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  143703 taagtcatgttgttaatgataattcatggcttgggttgcataattcatgattt 143651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 44865584 - 44865233
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  44865584 actaaggtaagggggttaga-ttcatcataatcacttattgtaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 44865488  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |     
T  44865487 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtgta 44865388  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaa---ttgatgttgttgt 382  Q
     |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||| |||| |||||| | ||   ||| |||||||||    
T  44865387 tgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgt 44865289  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    || ||||| || | |||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44865288 tgttaagtcatgtagtttatgataattcatggcttgggttgcataattcatgattt 44865233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 436
Target Start/End: Original strand, 7283956 - 7284301
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttg-tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  7283956 taaggtaagggggttagttttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttatatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 7284052  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
    | || | |||||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||| |||| ||   ||| ||||||||||| || ||  ||||  ||||||||||||||||    
T  7284053 agtggtgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtgtgaagttatggatgattgaattgttattagttgaattgtatgttcaaagtatgag 7284152  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaa 388  Q
    ||  || |||||||||||| |||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  7284153 aagttggtatatgttgaaaatatgcttaa-ttggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatat 7284251  T
Q  389 gtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatt 436  Q
    || || |||||| | || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  7284252 gtcatgttgttgataataattcatggcttgagtttgcatgattcatgatt 7284301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 145 - 384
Target Start/End: Original strand, 8267675 - 8267915
Alignment:
Q  145 ttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattgg 243  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||| || |  | || ||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||||||||    
T  8267675 ttgtatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttagttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattgg 8267774  T
Q  244 tgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgt 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8267775 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgt 8267874  T
Q  344 tgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| ||||| | ||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  8267875 tgatttgtgatgagaattatgtttaattgatgatgttgttg 8267915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 196 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4439031 - 4438881
Alignment:
Q  196 aaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtg 295  Q
    ||||||||||||  | |||||||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||    
T  4439031 aaaattcgtgctatagttatgataatatgtttgcacacatgaaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagtatgttaaaatg 4438932  T
Q  296 atatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||  |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4438931 atatattgtgaattgtgctccaattgttgaattgtgctatgttgttgttga 4438881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 39046521 - 39046848
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  39046521 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgttatttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 39046618  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||| ||||| ||  ||||  ||||||||    ||    
T  39046619 tatgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattattgttagttgaattgtatgttcaa---ttg 39046715  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    | ||| ||| |||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  39046716 a-aaaatgagtatatgtgaaaatat-ctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 39046812  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39046813 tagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 39046848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 301
Target Start/End: Original strand, 9319457 - 9319667
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||| | || |  | ||     
T  9319457 aggtaaggaggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgatcattttgcgcttag 9319556  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| |||||||| |||   |||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  9319557 ttgttgaaattcgtactcttgttatgatgatatgtttgaatacaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 9319656  T
Q  291 aagtgatatat 301  Q
    || ||||||||    
T  9319657 aaatgatatat 9319667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 323 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 45149723 - 45149625
Alignment:
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45149723 tgaattgtgctatgatgttgttggtttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 45149625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 91 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 25124483 - 25124406
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattga 168  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25124483 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattga 25124406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 197 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 13321263 - 13321037
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt-caaagtatgagaaagtg 295  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| |||||||||   || ||    
T  13321263 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatg 13321165  T
Q  296 atatatgttgaaata-tgctcaaattgttgaattatgctatgttg-ttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
      |  |  ||||||  ||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  13321164 tcaagttatgaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgat 13321066  T
Q  394 attgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13321065 gttgttgttgatgaatcatgacttgggtt 13321037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16919954 - 16919811
Alignment:
Q  24 ttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  16919954 ttgaagatacaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaagataagggggttaaaattcaatcataa 16919856  T
Q  121 tcattt-agtgcaattttt-caattgttgtatgaataagtgctta 163  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16919855 tcattttagtgtaattttttcaattgttgtatgaataagtgctta 16919811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3049710 - 3049606
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  3049710 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatggct 3049611  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  3049610 tgggt 3049606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 13389786 - 13389693
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgat-ctaactaaggtaagggggttag 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||    
T  13389786 aagaagagcttgaagattcaagaattggagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggcta-ggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 90 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35095168 - 35094821
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  35095168 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 35095072  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||| ||||| |||| ||||   |||||| |||||||||| ||    || ||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||     
T  35095071 tatgtgatgaaattcatgctctaattgtgataacatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtata 35094973  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| | | ||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||   | | |||||| |||| || || |||||||| |    
T  35094972 tgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaa-tgttgctgttgttgtt 35094875  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
     ||| || |||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  35094874 tagtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcataattcttgatttg 35094821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 421
Target Start/End: Original strand, 47480943 - 47481270
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcat------ttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | | | |||||| ||||||  |||||||    
T  47480943 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatattcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgt 47481042  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |  |||        |||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||| |    
T  47481043 tgctaa--------attcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaa-t 47481132  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    |||  ||| |||||  |  |||||  | || |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| | |     
T  47481133 atgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgc 47481231  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |  ||| |||| || |||||||||| |||| ||||||||    
T  47481232 tcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggt 47481270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 411
Target Start/End: Original strand, 8563341 - 8563562
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||| ||||||   |||||||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||        
T  8563341 ttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatatat 8563440  T
Q  291 aagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
    || ||| |||||  |||  ||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| ||||| |   ||  ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  8563441 aaatgagtatattgtgagttatgctcaaatggatgaattgtgttaggttgttgttgatttgtgattgaatatatgtttaattgatgttgttgttgttatg 8563540  T
Q  390 tgatattgttgttgatgattca 411  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  8563541 agatgttgttgttgatgattca 8563562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 9081029 - 9080965
Alignment:
Q  21 aacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattga 85  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9081029 aacttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattga 9080965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 358 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 25124216 - 25124128
Alignment:
Q  358 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  25124216 attcatgcttaattgatgttgttgttgatatgagatgttgttgttgatgattcatggcatgggtgttcacaaatcatgatttgatgatg 25124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45149837 - 45149736
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||| ||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||    
T  45149837 ttgttgaaattcgtgctcttgttataatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcacaatatgtga 45149738  T
Q  291 aa 292  Q
    ||    
T  45149737 aa 45149736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 126542 - 126419
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  126542 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatgatgatacatggct 126443  T
Q  417 tgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||    
T  126442 tgggtttgcatgattcatgatttg 126419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7293128 - 7293041
Alignment:
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  7293128 atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 7293041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 11580755 - 11580978
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  11580755 aaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-taggaacaaatga 11580852  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||  |||| | || ||||| ||||||||||||||| | | || ||| ||||     
T  11580853 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatg 11580951  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  11580952 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 11580978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16212013 - 16211790
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |   ||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  16212013 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaa-tatgtaaaaatga 16211916  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| | |  ||||| |||| |||||||||| | |||| ||| ||||     
T  16211915 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatg 16211817  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16211816 ttgtggttgatgattcattgcttgggt 16211790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 421
Target Start/End: Original strand, 42056405 - 42056521
Alignment:
Q  304 tgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttg 403  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |   ||    
T  42056405 tgaattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatg 42056503  T
Q  404 atgattcatggcttgggt 421  Q
     | |||||||||||||||    
T  42056504 ctaattcatggcttgggt 42056521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 111397 - 111501
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| ||||||||||    
T  111397 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggct 111496  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  111497 tgggt 111501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 421
Target Start/End: Original strand, 9321176 - 9321260
Alignment:
Q  337 ttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| ||||||||||| | ||| | || || ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9321176 ttgtagttgaattgtgatgagaattatatttaattgatgttgttgttgataatagatattgttgttaatgattcatagcttgggt 9321260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 13037030 - 13037114
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  13037030 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaa 13037114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14942362 - 14942269
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattc-atcataatcatttag-tgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgatt 178  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  14942362 ctaattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgatt 14942269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15369955 - 15369862
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattc-atcataatcatttag-tgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgatt 178  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| || ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  15369955 ctaattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgatt 15369862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 18253851 - 18253935
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18253851 aaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 18253935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 2190314 - 2190418
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  2190314 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 2190413  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  2190414 tgggt 2190418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3060213 - 3059990
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||  ||| |||| ||| || || ||| ||||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  3060213 aaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaa-ttgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 3060116  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    || ||  |||||  |||||||||| || |||||| || || |||||||||  |||| | || ||||| ||||||||||||||| |   || ||| ||||     
T  3060115 taaattgtgaaaattatgctcaaa-tggtgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatg 3060017  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  3060016 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 3059990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 282
Target Start/End: Original strand, 16478985 - 16479050
Alignment:
Q  216 gatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 16479050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 129
Target Start/End: Original strand, 111169 - 111206
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  111169 taaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagt 111206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 371217 - 371112
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||  ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  371217 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttgccgagacatgttgttgtttatgatttatggc 371118  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  371117 ttgggt 371112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 278
Target Start/End: Original strand, 25292354 - 25292434
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 278  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  25292354 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaa-ttgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 25292434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 373 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 4438893 - 4438818
Alignment:
Q  373 atgttgttgttgctaagtgatattgttgttga-tgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    |||||||||||| |||| |||  || |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  4438893 atgttgttgttgataagagatgctgatgttgaatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgt 4438818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 357 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 36052755 - 36052691
Alignment:
Q  357 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| |||||||| | || ||||||||    
T  36052755 gattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataattgcttgggt 36052691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 21197977 - 21198395
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattcatcataat 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21197977 cttgaagattcaagagttggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaagataagggggttagaattcattataat 21198075  T
Q  122 cattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||     
T  21198076 cattttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaattgattaattgttcatagatgatgaaattcgtgctctaattatgatga 21198175  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21198176 tatgtttgaatgcatgaagttgtagataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaaatt 21198275  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||     
T  21198276 gttgaattatgttatgttgttgttgaattgtggtaagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgctgttaatgattcatggcttggg 21198375  T
Q  420 -gttcataattcatgatttg 438  Q
     |||||||||||||||||||    
T  21198376 tgttcataattcatgatttg 21198395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5855036 - 5854612
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  5855036 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattgtgctaattaaggtaaggaggttagaattcaatcataa 5854938  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  5854937 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatga 5854838  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  5854837 tatgtttgaatgcatgaaattggcgataattgaattgttgttggtgaaatagcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 5854738  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5854737 gttgagttgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 5854638  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  5854637 tgttcataaatcatgatttgatgatg 5854612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15933721 - 15933321
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15933721 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcctgggctaggaaattgtgctaattaaggtaagggggttagaattaaatcataa 15933622  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  15933621 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctctaattatgatga 15933522  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| || |    
T  15933521 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttaaatgttgaattatgctctaaat 15933422  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 420  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15933421 gttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 15933322  T
Q  421 t 421  Q
    |    
T  15933321 t 15933321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 26011913 - 26011492
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||   |||| ||||||    
T  26011913 cttgaagattcaagaagtggtagagatcataggaggtaaagtgaagcttgggctagg-aattgtgctaattaaggtaagggggtta---ttcaatcataa 26011818  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  26011817 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgtttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatga 26011718  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  26011717 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 26011618  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26011617 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 26011518  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  26011517 tgttcataaatcatgatttgatgatg 26011492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23837622 - 23837196
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattca-tcata 119  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| ||| | |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23837622 cttgaagattcaagaatttgaagagatcctaggagataaagtgaaccttgggctagg-aatcggtgataattaaggtaagggggttagaattcaatcata 23837524  T
Q  120 atcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||| | |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  23837523 atcattttaatatagattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcatagatgataaaattcgtgctctaattatgat 23837424  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    | |||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23837423 gatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttattgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaactatgctcaaa 23837324  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23837323 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttg 23837224  T
Q  419 gg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||  |||||||||||||||||| |||||    
T  23837223 ggtattcataattcatgatttgttgatg 23837196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 38534080 - 38533647
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38534080 aagaagaacttgaagattcaaagattggaagagagc-taggagctaaagtgaagctagagctaggaaattgatttgactaaggtaagggggttagaattc 38533982  T
Q  114 atcataatcatttagtgcaatttt---tcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    |||||||||||||| || | | ||   | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38533981 atcataatcattta-tgaattgttgtatgaattattgtatgaataagtgcttaattaagtaattgactaattgttcataattgttagaattcgtactcca 38533883  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38533882 attatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagagaaatctcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaata 38533783  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||    
T  38533782 tgctcaaattattgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattc 38533683  T
Q  411 atggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||  || |||||||||||||||| |||||    
T  38533682 atggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatg 38533647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33528848 - 33528424
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaaga-gttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33528848 cttgaagattcaagaagtagtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataa 33528749  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| || | ||||||| ||||||||||     
T  33528748 tcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattaattgttcttagatgttgaattccgtgctctaattatgatga 33528649  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  || |||  |||||  |||| |||||||||||||| | ||||| || |    
T  33528648 tatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttgatgaaattgtatcttcttagtatatgaaaatgatatatgttgaattgtgctctaaat 33528549  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  33528548 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatatt-ttgttgatgattcatggcttggg 33528450  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  33528449 tgttcataaatcatgatttgatgatg 33528424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Original strand, 39446583 - 39446990
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39446583 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagc-tatgagctaaattgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 39446681  T
Q  114 atcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    |||||||||||||  |||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39446682 atcataatcatttttagtgtaaattt-caattgttgtatgaataaatgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcatgctccaa 39446780  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    ||||||||  ||||||| |||  |||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  39446781 ttatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatgaagaagtgttatatgttgaaatat 39446880  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||    
T  39446881 gctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattca 39446980  T
Q  412 tggcttgggt 421  Q
    ||||||||||    
T  39446981 tggcttgggt 39446990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 50 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22981664 - 22981353
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgta 149  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  22981664 ctaggagctaaattgaagcttgagctggggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatatattgcaatttttcaatt-ttgta 22981566  T
Q  150 tgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataa 249  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |  || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  22981565 tgaataagtgcttaattgggtaattgattaattgttcaga--tgatgaaatttgtgctctaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataa 22981468  T
Q  250 ttgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaatt 349  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22981467 ttgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaatt 22981368  T
Q  350 gtggtaagattcatg 364  Q
    ||| |||||||||||    
T  22981367 gtgataagattcatg 22981353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29306842 - 29306450
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaaga-gttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaag-ggggttagaattca-tcata 119  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| | |||  |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29306842 cttgaagattcaagaagtcgtagagatcttaggagctaaactgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagaggggttagaattcaatcata 29306743  T
Q  120 atcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||    
T  29306742 atcattttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattgaataagtgattgattgttcatagatgttaatattcgtgctctaactatgat 29306643  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    | ||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29306642 gatatgttctaatgcatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaatttgtatgttcaaagtttgtgaaaatgatatatgttgaattatgctcaaa 29306543  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29306542 ttgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 29306450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 33610877 - 33611302
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagag-atcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggg--aattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcat 118  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||  ||| ||||||   |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33610877 cttgaagattcaagaagtggtgaggatcataggagctaaagttaaacttgggctaggattaattg--ctagctaaggtaagggggttagaattcaatcat 33610974  T
Q  119 aatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||||    
T  33610975 aatcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgtttaagtgattaattgaataagtgattaattgttcatagttgttaaaatttgtgctctaactatgat 33611074  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    | ||| |||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||  ||    
T  33611075 gatatatttgaatgcatgaaattggtgatcattagattgttgttggtgaaaattcatgttcaaagtatgtgaaagtgatatattgagaattatgctataa 33611174  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct-- 416  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33611175 atattgaattatgctatgttgttgttgaattgtgttgagaaccatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 33611274  T
Q  417 tgggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||    
T  33611275 tgtgttcataaatcatgatttgatgatg 33611302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 15 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17285636 - 17285323
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17285636 aagaagagcttgaagattcaagaattggagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggttagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaattc 17285538  T
Q  114 a-tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    | ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17285537 aatcataatcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgattaagtgcttaattgaataattgaataattgttcataattgttagaattcgtgctcca 17285438  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||||||||| |||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17285437 attatgatgatatgtttaaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaatta 17285338  T
Q  311 tgctcaaattgttga 325  Q
    |||||||||||||||    
T  17285337 tgctcaaattgttga 17285323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 37 - 444
Target Start/End: Original strand, 22735686 - 22736087
Alignment:
Q  37 agttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt--agtgcaat 134  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || ||     
T  22735686 agttggagaggacctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaatttatctaactaaggtaagggggttaaaattcatcataatcatttttaatgtaaa 22735785  T
Q  135 ttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||          | |||||||||||||||||||||  |||||| | ||| |    
T  22735786 ttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgtt----------agaattcgtgctccaattatgataatatgtt-gaatgca 22735874  T
Q  235 tgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaag-tgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgct 333  Q
    |||| | | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||    
T  22735875 tgaagtggttgataattgagttgttgttggtaaaacttcatgttcaaagtataaaaaaaatgatatatgttgaattatgatcaaattgatgaattatact 22735974  T
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattca 431  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||    
T  22735975 atgttgttgttggattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttcttgctaactgatgttgttgttgttaattcatggcttgggtgtgcataattca 22736074  T
Q  432 tgatttgatgatg 444  Q
    ||| ||| |||||    
T  22736075 tgaattgttgatg 22736087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 46 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 23150177 - 23149779
Alignment:
Q  46 gatcctaggagctaaagtgaag-tttgagctaggg--aattgatctaactaaggtaaggggg-ttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||   |    
T  23150177 gatcctaggagctaaagtgaagctttgggctaggattaattg--ctaactaaggtaaggggggttataattcatcataatcatttagtttaattttc--a 23150082  T
Q  142 ttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaatt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |    
T  23150081 ttgttgtatgagtaagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaact 23149982  T
Q  242 ggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatg-ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgt 340  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||    |||| ||||||||| | ||||||||||||||    ||    
T  23149981 agtgataaatgaattgttgttggtgaaatttcatgattcaaaatatgtgaaagtggtatggtatgaattatgctcaattggttgaattatgcta---agt 23149885  T
Q  341 tgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttg 438  Q
    ||||||||| || | ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  23149884 tgttgaattatgatgagaatcatgttcaatagttgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttg 23149785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 46 - 444
Target Start/End: Original strand, 23151684 - 23152082
Alignment:
Q  46 gatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgat--ctaactaaggtaaggggg-ttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaat 142  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |    
T  23151684 gatcgtaggagctaaagtgaagcttgggctagg--attgattactaactaaggtaaggggggttagaattcatcataatcatttagtgta--ttttca-t 23151778  T
Q  143 tgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattg 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| |     
T  23151779 tgttgtgtgaataagtgcttaattcagtaaatgattaattgttcatatttgttaaaattcgtgttccaattatgatgatatatttgaatgcatgaaacta 23151878  T
Q  243 gtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||    |||| | ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  23151879 gtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaattgtatgaaagtggtatgaagtgaattttgcccaattggttgaattatgatatgttgttg 23151978  T
Q  343 ttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgat 440  Q
    ||||||| || | |||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  23151979 ttgaattatgatgagaaccgtgttcaattgatgctgttgttgctatgtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgat 23152078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 68 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15970197 - 15969824
Alignment:
Q  68 tttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattg 167  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15970197 tttgagatagggaattgatataactaaggtaagggggttggaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattattgtatgaataaatgcttaattg 15970098  T
Q  168 agtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15970097 agtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgtacgaaagaaattggtgataattgatttgttgttggtga 15969998  T
Q  268 aatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatg---ttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg 364  Q
    ||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||   |   | ||||||| || |||  | || || |||| ||  |||||||| || | |||||||||    
T  15969997 aattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatatgtcatattattatgctctaaatgtcaatttgtgatatgatgaggttgaattatgctgagattcatg 15969898  T
Q  365 ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatt 436  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  15969897 ttcaattggtgtagttgttgttaagtgatgttgctattgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatt 15969824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 46 - 440
Target Start/End: Original strand, 23225927 - 23226321
Alignment:
Q  46 gatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattg 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23225927 gatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctcattaaggtaaaggggttagaattcatcataatcattttagtgcaatttttcaatta 23226026  T
Q  145 ttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggt 244  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |    
T  23226027 ttgtatgaaaaagtgtttaattgg---aatgattaattgttcatagatgttaaaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgat 23226123  T
Q  245 gataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgtt 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||   ||||| ||  |  |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  23226124 gataattgagttgttgttggtgaatttgcatgtcaaaagtatgtataagtgttaacttatgaattatgctcaaatgattgaattatgttatgttgttgtt 23226223  T
Q  345 gaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgat 440  Q
    ||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23226224 gaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgat 23226321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 23158556 - 23158165
Alignment:
Q  46 gatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggg--aattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt 143  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||   |||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    ||    
T  23158556 gatcctaggagttaaagtgaagcttgggctaggattaattgat--aactaagataagggagttataattcattataatcatttagtgtaattttc---tt 23158462  T
Q  144 gttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattgg 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | |    
T  23158461 gttgtatgaataagtgcttatttgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcatgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaactag 23158362  T
Q  244 tgataattgaattgttgttggtgaaatttcatg-ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||| |||    |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  23158361 tgataaatgaattgttgttggtgaaatttcatgattcaaaatacgtgaaagtggtatgatatgaattatgctcaattggttgaattatgttatgttgttg 23158262  T
Q  343 ttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgat 440  Q
    ||||||| || | |||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23158261 ttgaattatgatgagaaccatgttcaatagttgttgttgttcctaagtga---tgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgat 23158165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25296590 - 25296222
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||    |||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25296590 aagaagagcttgaagattcaagaagaagagagaacctaagagctaaagtgaagcttgggctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 25296491  T
Q  115 -tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
     ||||||||||||  |||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  25296490 atcataatcatttttagtgtaaatttttgattgttgtatgaataagtgtttaattgagtaagtaattaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaa 25296391  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
     ||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||    
T  25296390 ctatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaagcttgtgaaaatgatatatgttgaattat 25296291  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttg 381  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| || | ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  25296290 gctcaaattgttgaattgttctatg-tgttgttcaattatgatgagaattatgtttaattgatgttgttg 25296222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 15 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25758610 - 25758242
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    ||||||| ||||||||||||| |    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25758610 aagaagagcttgaagattcaaaaagaagagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 25758511  T
Q  115 -tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
     ||||||||||||  |||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  25758510 atcataatcatttttagtgtaaatttttgattgttgtatgaataagtgtttaattgagtaagtaattaattgttcatacatgttaaaattcgtgccctaa 25758411  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
     ||||||| |||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |  |||| |||||||||||||| |||    
T  25758410 ctatgatgatatgtttgaatgcatgaaattaatgataattgaattgctgttggtgaaattgcatgttcaaagcttttgaaaatgatatatgttgaattat 25758311  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttg 381  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| || | ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  25758310 gctcaaattgttgaattgttctatg-tgttgttcaattatgatgagaattatgtttaattgatgttgttg 25758242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 444
Target Start/End: Original strand, 18261319 - 18261720
Alignment:
Q  44 gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagtgcaatttttcaat 142  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| | ||   ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||   | |||||| |    
T  18261319 gagattctaggagctaaattgaagcttgagctagg-atttttgctaactaaggtaagggg-ttagatttcaaccataatcaattagttgtaattttcatt 18261416  T
Q  143 tgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattg 242  Q
      ||| |||| |||||| |||||||| ||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||  |  |||||||||    
T  18261417 aattgcatgattaagtgtttaattgaataagtgattctttgttcatagttgttgaaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgagtacatgaaattg 18261516  T
Q  243 gtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18261517 gtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatcttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttg 18261616  T
Q  343 ttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgat 440  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||    
T  18261617 ttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttgat 18261716  T
Q  441 gatg 444  Q
    ||||    
T  18261717 gatg 18261720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 87 - 421
Target Start/End: Original strand, 38635536 - 38635872
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| |  ||||    
T  38635536 ctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgaatctttgt 38635635  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | |||| ||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  38635636 tcatagttgttgaaattcgtgctctagttatcatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcataat 38635735  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||| ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  38635736 atgcgaaaatgatatattgtgaattatactcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 38635835  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38635836 ttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggt 38635872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Original strand, 31194140 - 31194548
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaa-gagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31194140 aagaagaacttgaggattcaaagatttgaaga-atcataggagcaaaagtgaagcttaagctagtgaattaatctaactaaggtaagggggttagttttc 31194238  T
Q  114 atcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  31194239 atcataatcatttttagtgcaaattttcaattgttgtatgaataattgcttaattgagtaattgattaattgttcatgattgttagaattcgtgctctaa 31194338  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatg-ttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||  |||  ||||||| |  |||  ||||||||||   | ||    
T  31194339 ttacgatgttctgtttgtatgtaagaaattggtgataattg-gttgttgtgggtaaaattgaatgcatcaaagtgtatgaagatgatatatgtcatatta 31194437  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    ||||| || |||  |    || ||||||||||||||||| || |   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31194438 tgctctaaatgtcaatgggtgttatgttgttgttgaattatgttgttatccatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattc 31194537  T
Q  411 atggcttgggt 421  Q
    || ||||||||    
T  31194538 atagcttgggt 31194548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Original strand, 20573044 - 20573435
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-g 147  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  20573044 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattatttg 20573142  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||   ||    
T  20573143 tatga-taagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatgga 20573241  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |  ||||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  20573242 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaagggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatcctttgttgttgttg 20573340  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  20573341 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 20573435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21681377 - 21681025
Alignment:
Q  72 agctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaa-ttgag 169  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||      
T  21681377 agctagggagattaatctaaataaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgcaatttttcaattattgtatgaataagtgcttaatttgtt 21681278  T
Q  170 taaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaa 269  Q
     || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||  || |||| |||||| |  ||   |||||||||||| ||||| ||  ||    
T  21681277 gaattgattaattgttcataaatgataaaattcgtgatctaattatgatgacatatttgaatgtataagtttatggataattgaattattgttagttgaa 21681178  T
Q  270 tttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttca 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| |||    
T  21681177 tttcatgtttaaagtatgagagaagggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatca 21681078  T
Q  369 attgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||  || || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  21681077 attgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggt 21681025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 376
Target Start/End: Original strand, 20561483 - 20561810
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-g 147  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |    
T  20561483 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattatttg 20561581  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||    
T  20561582 tatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttataga 20561680  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  20561681 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatg-tttaattggtgaattatgctatgttgttgatg 20561779  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgt 376  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  20561780 aattgtgataagtttcatgatcaattgatgt 20561810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22743123 - 22742784
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||    
T  22743123 ctaattaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttagttgaataattgattatttgt 22743024  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    ||||| ||||| |||||||||||   |||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22743023 tcatagttgttgaaattcgtgctttgattatggtgatatgtttgagtgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagt 22742924  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  22742923 atgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 22742824  T
Q  385 cta---agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     |    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22742823 ttgttgaggaatattgttgttgatgattcgtggcttgggt 22742784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 421
Target Start/End: Original strand, 45558824 - 45559161
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-g 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  |||||| ||| |||| ||| |||||| || |    
T  45558824 ctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgattatttgaataagtgattattttg 45558923  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
     || || ||||| |||||| |||||   |||||||| ||||||||  |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  45558924 ctcttagttgttgaaattcatgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 45559023  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45559024 tatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtt 45559123  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45559124 gttaagggatattgttgttgatgattcatagcttgggt 45559161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 444
Target Start/End: Original strand, 45465022 - 45465375
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataat 191  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||| || | | || |    
T  45465022 aggtaagggggttagagttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaaatgcttaattgagtaagtgattattt-tgcttagt 45465120  T
Q  192 tgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaa 291  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  45465121 tgttgaaattcgtgctcctgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa 45465220  T
Q  292 agtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtg 391  Q
    | || |||||  |||| ||||||| |  |||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  45465221 aatgttatattgtgaattatgctctagatgttgaattgagctatgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagag 45465320  T
Q  392 atattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  45465321 atattgttgttgatgattcatagtttgggtgttcataaatcatgaattgatgatg 45465375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41247011 - 41246680
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||| ||||    
T  41247011 actaaggtaagggggttagagttcatcataatcacttattgtaatttt-caattagttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaatttttca 41246914  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||    |||||| |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |    
T  41246913 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaattgttgttggttgaattacatgttaaaagtagg 41246814  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    | |||  | |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  41246813 aaaaatgggtatatgatgaaatatgcttaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtta 41246715  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41246714 agtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 41246680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20481957 - 20481628
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || || |||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||     
T  20481957 actaaggtaagggggttaaaattcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattaatgtatgaataagtgcttaattggataattgattatttgttcatg 20481860  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
      || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||     
T  20481859 gatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaa 20481760  T
Q  290 aaagtgatatatgttga-aatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaa 388  Q
    |||  ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  20481759 aaatggatatgtgttgataatatgctc-aattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaa 20481661  T
Q  389 gtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    || || |||||| || | |||||||||||||||    
T  20481660 gtcatgttgttgatgttaattcatggcttgggt 20481628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33172579 - 33172254
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataat 191  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||  |  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || || |    
T  33172579 aggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaattttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgctc-tagt 33172481  T
Q  192 tgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaa 291  Q
    |||| ||||| || |||   |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  33172480 tgttgaaatttgtactcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa 33172381  T
Q  292 agtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtg 391  Q
    | ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| |    
T  33172380 aatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttataaagag 33172281  T
Q  392 atattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||    
T  33172280 atatggttgttgatgattcatagcttg 33172254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 445
Target Start/End: Original strand, 18041426 - 18041782
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||| ||||  |  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||     
T  18041426 aggtaaggggtttagatttcaatcataatcacttagttgtaatctttccctaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgctcttag 18041525  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||| | ||||||||||||   |||||| | ||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  18041526 ttgctgaaattcgtgctcttgttatgacgatatgtttgagtacaagaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 18041625  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||||||||  |||| | | |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  18041626 aaatgatatattgtgaattgtactcaaattgttgaattgtgttatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaga 18041725  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggctt--gggttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| |||||| || |||||||    
T  18041726 tatattgttgttgatgattcatagcttaggtgttcataaatcatgagtttatgatgt 18041782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 417
Target Start/End: Original strand, 19331168 - 19331535
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttg 147  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |  |||    
T  19331168 ctaggaggtaaattgaagcttgagctagg-attttttctaactaatgtaagggggttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttcattaattg 19331266  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt-tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
     |||  |||||||||| |||| ||| |||||| || | || |  ||||| ||||||||||||   ||||||   |||||||| ||  |||||||||||||    
T  19331267 catgcttaagtgcttatttgaataagtgattatttttctcttggttgttgaaattcgtgctcttgttatgactatatgtttgaatacatgaaattggtga 19331366  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19331367 taattgaattgt---tggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgagttgtgctatgttgttgttga 19331463  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattg-ttgttgatgattcatggctt 417  Q
    |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||  | || ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19331464 attgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttattgagagatattgtttgttgatgattcatagctt 19331535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 409
Target Start/End: Original strand, 24552462 - 24552782
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcat 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || || | ||||||||| |  ||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||| || | |  |    
T  24552462 taaggtaagggggttagatttcaatcataatcactttgttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattttgctttt 24552561  T
Q  189 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 288  Q
    | ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  24552562 agttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgt 24552661  T
Q  289 gaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaa 388  Q
    |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24552662 gaaaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttaatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaa 24552761  T
Q  389 gtgatattgttgttgatgatt 409  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  24552762 gagatatggttgttgatgatt 24552782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 191 - 421
Target Start/End: Original strand, 22497203 - 22497433
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||    
T  22497203 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtagatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtga 22497302  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  22497303 aaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgataaga 22497402  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    | |||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22497403 ggtattgttgttaatgattcatagtttgggt 22497433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 37612022 - 37611674
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  37612022 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattataatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattagatgaattgattaattgttca 37611925  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |     
T  37611924 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgta 37611826  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
     |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  37611825 tgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgt 37611727  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    ||||| || | |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37611726 taagtcatgtggttgatgataattcatggcttgggttgcataattcatgattt 37611674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 190 - 444
Target Start/End: Original strand, 37653609 - 37653863
Alignment:
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| || | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |    
T  37653609 attgttgaaattcgtgctttaattatggtgatgtgtttgtatgcatgaatttggtgataattgaattgttgttgctgaaattgcatgttcatagtatgtg 37653708  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
    ||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| |  ||| ||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  37653709 aaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgttttatattgttgttgaattctgttgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaag 37653808  T
Q  390 tgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  37653809 gaatattgttgttgatgatttatggcttgggtgttcata--tcatgatttgatgatg 37653863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 289 - 440
Target Start/End: Original strand, 27233159 - 27233312
Alignment:
Q  289 gaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaa 388  Q
    |||| ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27233159 gaaaatgatatattgtgaattatgctcaaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaa 27233258  T
Q  389 gtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgat 440  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  27233259 gagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgat 27233312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 269
Target Start/End: Original strand, 27232938 - 27233162
Alignment:
Q  45 agatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaat 142  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||   ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |    
T  27232938 agattctaggagataaattgaagtttgggctagg-atttttgctaactaaggtaagggg-ttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcatt 27233035  T
Q  143 tgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattg 242  Q
      ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||    
T  27233036 aattgcatggttaagtgcttaattgaataagtgattattagttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattg 27233135  T
Q  243 gtgataattgaattgttgttggtgaaa 269  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27233136 gtgataattgaattgtttttggtgaaa 27233162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 438
Target Start/End: Original strand, 20653953 - 20654148
Alignment:
Q  245 gataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgt 343  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| || ||| |||||||||||| |||||||     
T  20653953 gataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaa-ttggtgaattatgctaagttgttga 20654051  T
Q  344 tgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || || |||||| || | |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  20654052 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaattcattgcttgggtttgcatgattcatgatttg 20654148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 250 - 438
Target Start/End: Original strand, 20647882 - 20648072
Alignment:
Q  250 ttgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat-atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20647882 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaat 20647980  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || || |||||| || | || |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  20647981 tgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatccatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 20648072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 22234698 - 22235028
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  22234698 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattgaatgaattgattaattgttca 22234794  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||   ||||| |||||||||| ||    |||||| |||||| ||| ||  |||| |||| ||||||| |     
T  22234795 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacgtgtttagatgtatgaagttatgaataatttaattgt-gttagttgaattacatgctcaaagtgta 22234893  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| ||  ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  22234894 tgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtt 22234992  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||| || |||||| |||| |||||||| |||||||    
T  22234993 tagtcatgttgttgatgataattcatggattgggtt 22235028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 21259314 - 21259428
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21259314 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taggagctaaattgaagcttaagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 21259412  T
Q  114 atcataatcatttagt 129  Q
    |||||||||| |||||    
T  21259413 atcataatcacttagt 21259428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16002251 - 16002031
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| |||||| |||||   |||||||| ||||||||  | |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||   |||| ||    
T  16002251 ttgttgaaattcatgctcttgttatgatgatatgtttgagtatatgaatttgatgataatttaattgttgttgatgaaattgtatgttcatgatatgtga 16002152  T
Q  291 aagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
    || ||| |||||  | || | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| || |    
T  16002151 aaatgagtatattgtaaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtggt-ggatccatgtttaattgatgttgttgttgttatg 16002053  T
Q  390 tgatattgttgttgatgattca 411  Q
     ||| ||||||||||| |||||    
T  16002052 agatgttgttgttgattattca 16002031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 19992950 - 19993279
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  || |||||  ||||| || ||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  19992950 actaaggtaagggggttataattcatcataatcacttt-tgtaattt--caattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 19993045  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||| ||| ||| ||||||||||  |||||| |||||| ||| ||    ||||||||||||| ||| ||  |||| | |||||||||| |     
T  19993046 taaatgatgaaatccgtactctaattatgatgacatgtttagatgtacgaagttatgaataattgaattgt-gttagttgaattacttgttcaaagtgta 19993144  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| ||  ||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||  |||||  ||||||| ||||||||||| |    
T  19993145 tgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtt 19993243  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||| || |||||| |||| |||||||||| |||||    
T  19993244 tagtcatgttgttgatgataattcatggctagggtt 19993279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 25122795 - 25122626
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  25122795 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attataatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 25122699  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttg 260  Q
    ||| || | ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||    
T  25122698 taaatgatcaaattcgtgctccaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttg 25122626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 187
Target Start/End: Original strand, 20529743 - 20529843
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  20529743 ctaactaaggtaagggggttataattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 20529840  T
Q  185 tca 187  Q
    |||    
T  20529841 tca 20529843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Original strand, 41506937 - 41507060
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  41506937 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggct 41507036  T
Q  417 tgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||    
T  41507037 tgggtttgcatgattcatgatttg 41507060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 16193732 - 16193955
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  16193732 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 16193829  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||| |  |||||||| | ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||     
T  16193830 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatg 16193928  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  16193929 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 16193955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 16404991 - 16405075
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16404991 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 16405075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 344
Target Start/End: Original strand, 18118336 - 18118437
Alignment:
Q  244 tgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg-agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| | ||| || |||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  18118336 tgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgatatgcataaattggtatatggtgaattgtgcttaaattgatgaattgtgctatgttgttg 18118435  T
Q  343 tt 344  Q
    ||    
T  18118436 tt 18118437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20709825 - 20709728
Alignment:
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 408  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||| || || | ||| ||||||| |||||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||    
T  20709825 tgctctaattattgaattgtgctattttgttgttgagttttgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgatgttgagagatattgttgtagatgat 20709728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Original strand, 24716990 - 24717095
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |  | |||||||||||| | |||||||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  24716990 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatgatacatggct 24717089  T
Q  417 tgggtt 422  Q
    ||||||    
T  24717090 tgggtt 24717095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 274570 - 274466
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  274570 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 274471  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  274470 tgggt 274466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 641279 - 641383
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  641279 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 641378  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  641379 tgggt 641383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 827085 - 827189
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  827085 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 827184  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  827185 tgggt 827189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 388 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17285323 - 17285265
Alignment:
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||    
T  17285323 agtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatg 17285265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Original strand, 22907365 - 22907452
Alignment:
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  22907365 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 22907452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 393
Target Start/End: Original strand, 16039015 - 16039085
Alignment:
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16039015 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 16039085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 3431408 - 3431513
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  3431408 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcgattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatttatggc 3431507  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  3431508 ttgggt 3431513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 215 - 421
Target Start/End: Original strand, 6774280 - 6774485
Alignment:
Q  215 tgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa--tatg 312  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||  |  |||||  | ||    
T  6774280 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 6774377  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||| | ||| | |  ||||| || |||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||| |||     
T  6774378 ctc-aattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcac 6774476  T
Q  413 ggcttgggt 421  Q
     ||||||||    
T  6774477 tgcttgggt 6774485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 438
Target Start/End: Original strand, 20567329 - 20567401
Alignment:
Q  368 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  20567329 aattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 20567401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 438
Target Start/End: Original strand, 20573522 - 20573594
Alignment:
Q  368 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  20573522 aattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 20573594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 24928807 - 24928891
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24928807 aaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 24928891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 366 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25122614 - 25122542
Alignment:
Q  366 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25122614 tcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttgcatgattcatgattt 25122542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 24549211 - 24549145
Alignment:
Q  215 tgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  24549211 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 24549145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 43373484 - 43373707
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||| ||||| ||| ||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  43373484 aaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 43373581  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| | |  ||||| ||||||||||||| | | |||| ||| ||||     
T  43373582 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatg 43373680  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||    
T  43373681 ttgtggttgatgaataattgcttgggt 43373707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 129
Target Start/End: Original strand, 41506708 - 41506746
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagt 129  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41506708 ctaaggtaagggggttagttttcatcataatcatttagt 41506746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 110
Target Start/End: Original strand, 20653885 - 20653946
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaa 110  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20653885 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaa 20653946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22886454 - 22886350
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| ||| |    
T  22886454 aattgatgaactatgacatgttgttgt-gaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatttatgac 22886356  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  22886355 ttgggt 22886350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22888014 - 22887945
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttg 260  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  | |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  22888014 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtatatgaatttgatgatatttgaattgttg 22887945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345733
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 409
Target Start/End: Original strand, 21494593 - 21494669
Alignment:
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 409  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||| ||||||    
T  21494593 atgttgttgttggattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatt 21494669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2948 - 2523
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2948 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggaatttttgctaactaaggtaagcgggttagaattcaatcataa 2849  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||  || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2848 tcatttagtgtaatttttcatttgttgtaagattagatgattaattcagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatga 2749  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  2748 tatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 2649  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  2648 gttgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttggg 2549  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  2548 tgttcataaatcatgatttgatgatg 2523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 15 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20177607 - 20177179
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaatt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  20177607 aagaagagcttgaagattcaagaattggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtaatggggttagaatt 20177509  T
Q  113 ca-tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20177508 caatcataatcattttagtgtaatttttcaattattgtatgtttaagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctcca 20177409  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||||||||| |||||||  ||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20177408 attatgatgatatgttttaatgcacgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaatta 20177309  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20177308 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaaaagtcaagttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattc 20177209  T
Q  411 atggcttgg--gttcataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  20177208 atggcttggatattcataattcatgatttg 20177179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 16646338 - 16645975
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 119  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16646338 gaacttgaagattcaagagaatgagagaacctaggaactaaagtgaagcttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 16646239  T
Q  120 atcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatga 217  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16646238 atcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatga 16646139  T
Q  218 tgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaa 317  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16646138 tgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataatttaattgatgttggtaaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattattctcaa 16646039  T
Q  318 attgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttg 381  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16646038 attgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttg 16645975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 23 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 16657061 - 16656699
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16657061 cttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgggctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 16656962  T
Q  123 attt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||  ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16656961 atttttagtgttaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgt 16656862  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16656861 tatgtttgaatgcataaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcgtgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatgctcaaatt 16656762  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16656761 gatcaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgaagttgttgtt 16656699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 37233676 - 37234109
Alignment:
Q  15 aagaagaa-cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaatt 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  37233676 aagaagaagcttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggaggtaaagtgaagcttgggctagg-aattgtgctaattaaggtaagggggttagaatt 37233774  T
Q  113 ca-tcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||  |     
T  37233775 caatcataatcatttagtgtaatttttcaattattgtattattaagtgcttaattgagtaagtgagtaattgttaatagttgttagaattcgtgctttag 37233874  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  37233875 ttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgatatatgttgaattat 37233974  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37233975 gctctaaatgttgaattatgctatgttgtggttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 37234074  T
Q  412 tggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    || |||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  37234075 tgacttgggtgtccataaatcatgatttgatgatg 37234109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 17609351 - 17608930
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17609351 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggttaggaatttgtgctaactaaggtaagggggttagaattcaatcataa 17609252  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  17609251 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattagttgatcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatga 17609152  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  17609151 tatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatatgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 17609052  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17609051 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 17608952  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgat 440  Q
     |||||||| ||||||||||||    
T  17608951 tgttcataaatcatgatttgat 17608930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 438
Target Start/End: Original strand, 36356109 - 36356536
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36356109 aagaggaacttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattgatctaactaaagtaagggggttagaattca 36356208  T
Q  115 tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  36356209 tcataatcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcatgattgttagaattcgtgctcctat 36356308  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||||||||  |||| ||||||||||   | ||||    
T  36356309 tatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgaaatgttgttggtgaaattgaaggatcaaagtatatgaaaatgatatatgtcatattatg 36356408  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||| || |||  |||| || ||||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  36356409 ctctaaatgtcaaattgtgatatgttgatgttgatttatgctgagattcatgttcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgatgatttat 36356508  T
Q  413 ggcttgg--gttcataattcatgatttg 438  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||    
T  36356509 ggcttgggtgttcataattcatgatttg 36356536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 417
Target Start/End: Original strand, 20955265 - 20955659
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20955265 cttgaagattcaagaaaaggagagaacctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttataattcatcataatc 20955364  T
Q  123 atttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtta 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20955365 atttagtgcaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttagaatttgtgctccaattatgatgtta 20955464  T
Q  223 tgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgt 322  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||  || | ||||||||||   | ||||||| || |||    
T  20955465 tgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatctgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgagaatgatatatgtcatattatgctctaaatgt 20955564  T
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
        || || ||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  20955565 catcttgtgatatgttgatgttgaattatgctgaaattcatgttcaattgatgtagttgctgctaagtgatgttgttattgataattcatggctt 20955659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 421
Target Start/End: Original strand, 51627487 - 51627888
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 119  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51627487 gaacttgaagattcaaggattggagggagc-taggagctaaattgaagcttaagctagggagttaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcata 51627585  T
Q  120 atcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatga 217  Q
    |||||||  |||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  51627586 atcatttttagtgtaaattt-caattgttgcatgaataagtgcttaattgagtaattgattatttgttcataatcgttagaatttgtgctccaattatga 51627684  T
Q  218 tgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaa 317  Q
    || |||| ||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  51627685 tgatatgcttgaatgcatgaatttgttgatgattgaattgttgttagtgaaacttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatatgttgaaatatgttcaa 51627784  T
Q  318 attgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
     | ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  51627785 ttggttgaattatgatatggtgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgttgatgataattcatggctt 51627884  T
Q  418 gggt 421  Q
    ||||    
T  51627885 gggt 51627888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 21195409 - 21195012
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  21195409 ctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-atttgtgctaactaaggtaaggggtttagaattcaatcataatcatttagttgtaatttttcatttgttg 21195311  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21195310 tatgtttaagtgcttaattgaataagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 21195211  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21195210 aattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattgttgaattgtgctaggttgttgttgaa 21195111  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  21195110 ttgtgatgagaatcatgtttaattaatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatg 21195012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 19603515 - 19603095
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19603515 cttgaagattcaagaagaggagaaaacctaggagctaaagtgaagcttgggct---gaattgatctaactaaggtaagggggctagaattcatcataatc 19603419  T
Q  123 atttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtta 222  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19603418 atttagtgcaaattttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtta 19603319  T
Q  223 tgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgt 322  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||||||||   | ||||||| || |||    
T  19603318 tgtttgaatgtatgaaattggtgataattgatttgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatatgtcatattatgctctaaatgt 19603219  T
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--g 420  Q
        || || ||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||  |    
T  19603218 catcttgtgatatgttgatgttgaattatgctgaaattcatgttcaattgatgtagttgctgctaagtgatgtggttattgataattcatgacttgggtg 19603119  T
Q  421 ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |  ||||||||||||||| |||||    
T  19603118 tgaataattcatgatttgttgatg 19603095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 22829251 - 22829673
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||   |||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22829251 cttgaagattcaagaagaggaaggatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagggaattgatctaactaaagtaagggggttagaattcatcataatc 22829350  T
Q  123 atttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgtta 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22829351 atttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattattcataattgttagaattcgtgctccaattatgatgtta 22829450  T
Q  223 tgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgt 322  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||| ||  |||| ||||||||||   | ||||||| || ||     
T  22829451 tgtttgaatgtatgaaactggtgataattgatttgttgttagtgaaattgaatggtcaaagcatatgaaaatgatatatgtcatattatgctctaaatg- 22829549  T
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--g 420  Q
    | |||| || |||||||  |||||||| || | || ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||||  |    
T  22829550 tcaattgtgatatgttgaggttgaattatgttgagtttcatgttccattgatgtaattgttgttaagtgatttttctattgataattcatggcttgggtg 22829649  T
Q  421 ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    | |||||||||||||||| |||||    
T  22829650 tgcataattcatgatttgttgatg 22829673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 444
Target Start/End: Original strand, 22143210 - 22143610
Alignment:
Q  46 gatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggg--aattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaat 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22143210 gatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggattaattg--ctaactaaggtaagggg-ttagaattcatcataatcattttagtgtaatttttcaat 22143306  T
Q  143 tgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattg 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| ||| ||||||||     
T  22143307 tattgtatgaataagtgcttaattggataaatgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaattt 22143406  T
Q  243 gtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   || || ||  |  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22143407 gtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgttaacttatgaattatgctcaaatggttgaattatgctatgttgttg 22143506  T
Q  343 ttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgat 440  Q
    ||||||| || | |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22143507 ttgaattatgatgagaaccatgctcaattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgat 22143606  T
Q  441 gatg 444  Q
    ||||    
T  22143607 gatg 22143610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Original strand, 38033489 - 38033898
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaa-gggggttagaattc 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38033489 aagaggaacttgaagattcaagaagaggagagaacctaggagctaaagtgaagctcgaactagggaattgatataactaaggtaaagggggttagaattc 38033588  T
Q  114 atcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| |    
T  38033589 atcataatcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttaatgattattagaattcgtgctccta 38033688  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| |||||||||||  | |||    
T  38033689 ttatgatgttatgtttgtatgtaagaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgaatgatcaaagtatatgaaaatgatatatgttatattat 38033788  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||| || |||  | || || ||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||| | |||||    
T  38033789 gctctaaatgtcaagttgtgatatattgatgttgaattatgttgagattcatgttcaattgatgtgattgctgctaagtgatgttgctgttgttaattca 38033888  T
Q  412 tggcttgggt 421  Q
    ||||||||||    
T  38033889 tggcttgggt 38033898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27675227 - 27674801
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||  ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27675227 aagaagagcttgaagattcaagattggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaattta 27675128  T
Q  115 tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    |||||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  27675127 tcataatcgtttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattatttgttcatgactgttagaattcgtgctccaat 27675028  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||  | || ||||||||||   |  |||    
T  27675027 tatgatgttatgtttgaatgtaagaaattggtgataattgatttgttattggtgaaattgaatgatcaaagtatatggaaatgatatatgtcatatcatg 27674928  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||| || |||  | || || |||||||  |||||||| || | ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  27674927 ctctaaatgtcaatttgtgatatgttgaggttgaattatgctgagattcatgttcaattggtgtagttgttgttaagtgatgttgttattgataattcat 27674828  T
Q  413 ggcttgg--gttcataattcatgattt 437  Q
    |||||||  || |||||||||||||||    
T  27674827 ggcttgggtgtgcataattcatgattt 27674801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 13376674 - 13377089
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaatt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  13376674 aagaagagcttgaagattcaacaattggtaaagatcctaggagctaaagtgaagtttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaatt 13376772  T
Q  113 ca-tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || | | | |||||||| |    
T  13376773 caatcataatcattttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaatttagtaattgattaattgttcatagatgatgagaatcgtgctcta 13376872  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||             
T  13376873 attatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattaaattgttgtcgttgaaatttcatgttcaaagtatgaagaagtggtatat--------- 13376963  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
              ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  13376964 ----------gttgaattatgttatgttgttgttgaattatggtgaaagtcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattc 13377053  T
Q  411 atggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  13377054 atggcttgagtattcataattcatgatttgttgatg 13377089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 445
Target Start/End: Original strand, 8537757 - 8538160
Alignment:
Q  45 agatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaat 142  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |    
T  8537757 agattctaggagttaaagtgaagcttgggctagg-atttgtgctaactaaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcatt 8537855  T
Q  143 tgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattg 242  Q
      ||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||| ||||||||     
T  8537856 aattgcatgattaagtgcttagttgaataattgattattcgttcatggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaatta 8537955  T
Q  243 gtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||  |||| | |||| ||||||||||| | |  ||||||||||    
T  8537956 gtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtgaattgtgcttaaattgttgaaatgtcttatgttgttg 8538055  T
Q  343 ttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgat 440  Q
    ||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  8538056 ttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaataatgatttgat 8538155  T
Q  441 gatgt 445  Q
    |||||    
T  8538156 gatgt 8538160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 45 - 445
Target Start/End: Original strand, 8602996 - 8603399
Alignment:
Q  45 agatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaat 142  Q
    |||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |    
T  8602996 agattctaggagttaaagtgaagcttgggctagg-atttgtgctaactaaggtaagggagttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttcatt 8603094  T
Q  143 tgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattg 242  Q
      ||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||  ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||| ||| ||||||||     
T  8603095 aattgcatgattaagtgcttagttgaataattgattattcgttcatggttgttgaaattcgtgctttgattatgatgatatgtttgaatgcatgaaatta 8603194  T
Q  243 gtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| || |||||  |||| | |||| ||||||||||| | |  ||||||||||    
T  8603195 gtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgttatattgtgaattgtgcttaaattgttgaaatgtcttatgttgttg 8603294  T
Q  343 ttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgat 440  Q
    ||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||    
T  8603295 ttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaataatgatttgat 8603394  T
Q  441 gatgt 445  Q
    |||||    
T  8603395 gatgt 8603399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 414
Target Start/End: Original strand, 49997133 - 49997499
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcat-cataatcatttagt-gcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||| |  |||    
T  49997133 ctaggagctaaattgaagtttgagctagg-atttttgctaactaaggtaagggggttagaattcaaacataatcaattagttgtaatttttcattaattg 49997231  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
     |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||||| |||| | | ||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  49997232 catgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgttcatgattgttgaaatttgtgccctagttatggtgatatgtttgaatatatgaaattggtgat 49997331  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | | ||| || | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49997332 aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtactctaaattttgaattgtgctatgttgttgttgaa 49997431  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc-taagtgatattgttgttgatgattcatgg 414  Q
    ||  ||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  49997432 ttaaggtgagaatcatgtttaactgatgttgttgttgcttaagagatattgttgttgatcattcatgg 49997499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 52401032 - 52400663
Alignment:
Q  44 gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaa 141  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||||     
T  52401032 gagattctaggagctaaattgaagcttgggctagg-atttttgctaactaaggtaagagggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcat 52400934  T
Q  142 ttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaatt 241  Q
    |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||| || |||||||| ||  ||||||||    
T  52400933 taattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgttcatagttgttgactttcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaatt 52400834  T
Q  242 ggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||  || ||||||||| ||||||||||||    
T  52400833 ggtgatagttgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctataaatgttgaattgtgctatgttgtt 52400734  T
Q  342 gttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    |||||||| || | ||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  52400733 gttgaattatgatgagaatcatgtttaattgacgttgttgttgctgagagatgttgttgttgatgattcat 52400663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 421
Target Start/End: Original strand, 27329656 - 27329979
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttc 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||     
T  27329656 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatggtatgaataagtgtttaattgtgtaattgattaattgtt- 27329754  T
Q  187 ataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtat 286  Q
             | ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27329755 ---------agaattcgtgctccaattatgatgacatgtttgtatatatgaagtta-tgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgatcaaagtat 27329844  T
Q  287 gagaaa-gtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
    | |||| |||   |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||     
T  27329845 gtgaaaagtgggttatgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgt 27329943  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  27329944 taagtgatgttatggatgttaattcatggcttgggt 27329979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21718585 - 21718250
Alignment:
Q  85 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattg 183  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  21718585 atctaactaaggtaaggga-ttagaattcaatataatcatt-attgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattg 21718489  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
    |||||   || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||    
T  21718488 ttcatggatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaag 21718389  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||||||| || ||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21718388 tatgagaaattggtatgtgttcaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 21718290  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    || || || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21718289 tgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 21718250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 86 - 384
Target Start/End: Original strand, 9783953 - 9784248
Alignment:
Q  86 tctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttg-tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattg 183  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||| ||| |||||    
T  9783953 tctatctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttactgcaatttt-caattattggtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgataaattg 9784050  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
    ||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  9784051 ttcataagtgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaag 9784150  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||||||  || ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9784151 tatgagaagttggtatatgttgaaaatatgct-taattggtgaattatgct---ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 9784246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 421
Target Start/End: Original strand, 5768063 - 5768393
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||   |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | || ||     
T  5768063 aggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaattttttcctaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgctcttag 5768162  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  5768163 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcatagtatgtga 5768262  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  5768263 aaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttaatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaga 5768362  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5768363 gatattgttgttgatgattcatagattgggt 5768393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 421
Target Start/End: Original strand, 40436263 - 40436493
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||    
T  40436263 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtga 40436362  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||     
T  40436363 aaatgatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatgtttaattgatgttgttgtttttaaga 40436462  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40436463 gatattgttgttgatgattcatagcttgggt 40436493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 87 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 35055113 - 35054779
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||    
T  35055113 ctaactaaggtaagggggttaaaattcatcataatcacttatttctatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattggttaattgt 35055016  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || |  ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  35055015 tcataaatgatttaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 35054916  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  35054915 atgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtt 35054817  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    | |||||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  35054816 gttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggt 35054779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 437
Target Start/End: Original strand, 22403000 - 22403351
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  22403000 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 22403097  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||| ||    |||||| ||||| |||| ||  |||| ||||||||||||    
T  22403098 tcataagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtctagatgtatgaagttatgaataattaaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagt 22403196  T
Q  285 atgagaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
     |  |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| | || || |||||||||    
T  22403197 gtatgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgt 22403295  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg-ttcataattcatgattt 437  Q
    || ||||| || |||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22403296 tgttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttcatgattcatgattt 22403351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 197 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33397599 - 33397378
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | |||| |||| | |    
T  33397599 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgagttgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaataa 33397500  T
Q  297 tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatatt 396  Q
    |||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  33397499 tatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatcttgttgttgttaagagatatt 33397400  T
Q  397 gttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  33397399 gttgttgatgattcatagcttg 33397378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 49968004 - 49967672
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||| || | ||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  49968004 actaaggtaagggggttagaattcatcgtaatcacttattgtaatttt-caattatttgcatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 49967907  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
     || |  | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||     
T  49967906 aaaatcatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaattata 49967807  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    | |||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||| |  |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  49967806 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgtt 49967708  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    |||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  49967707 aagtcatgttgttgatgataattcattgcttcggtt 49967672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 262
Target Start/End: Original strand, 35522170 - 35522417
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | || ||||| | ||||||| ||| |||||  | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35522170 aagaggaacttgaagaatcaaggggtgaagagagc-taggagcaaaattgaagcctaagctaaggagattaatctaactaaggtaagggagttagaattc 35522268  T
Q  114 atcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||    
T  35522269 atcataatcatt-attgcaatttttcaattatttgtatgaa-aagggcttaattgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaa 35522366  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgtt 262  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  35522367 ttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgtt 35522417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25094156 - 25093920
Alignment:
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||| |||||| || |  | ||| |||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||| |||||||    
T  25094156 tatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgcacttaactgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtga 25094057  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||  |||| | || || |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25094056 taattgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgagaaaatgatatattgtgaattgtgttctaattgttgaattgtgttatgttgttgttga 25093957  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
     ||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25093956 tttgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgtt 25093920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Original strand, 35522439 - 35522562
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||    
T  35522439 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataattcatggct 35522538  T
Q  417 tgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||    
T  35522539 tgggtttgcatgattcatgatttg 35522562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Original strand, 76487 - 76597
Alignment:
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||||    
T  76487 tgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaaatgcggtgagattcatgtttaattgatattgttgttattatgagatattgttgttgatgattc 76586  T
Q  411 atggcttgggt 421  Q
    || ||||||||    
T  76587 atagcttgggt 76597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41212415 - 41212091
Alignment:
Q  99 agggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgtta 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| |||||| |||||||  | ||| |||||||||||||||| || |     
T  41212415 agggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgtttaattggatgaattgattaattgttcataaatgatg 41212319  T
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||| || ||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  || |  ||||||||||||||| |||  |     
T  41212318 aaattcgtgctctaattatgatgacctgtttagaggtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaactgtatgttcaaagtatgaaaaatggg 41212219  T
Q  297 tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta---agtgat 393  Q
    ||| |||  |||||||||||| | || |||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||| |    ||| ||    
T  41212218 tatgtgtaaaaatatgctcaattagt-gaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcat 41212120  T
Q  394 attgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  41212119 gttgttgatgataattcatggcttgggtt 41212091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20445926 - 20445703
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  || |||    
T  20445926 aaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa-gtaggaacaaatga 20445829  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  || |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| | | || ||| ||||     
T  20445828 taagtggtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatg 20445730  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20445729 ttgtagttgatgaatcattgcttgggt 20445703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 354 - 438
Target Start/End: Original strand, 41229096 - 41229182
Alignment:
Q  354 taagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt--gggttcataattcatgatttg 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  41229096 taagaatcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttg 41229182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 20531691 - 20531468
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||  || |||    
T  20531691 aaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa-gtaggaacaaatga 20531594  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  || |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| | | || ||| ||||     
T  20531593 taagtggtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatg 20531495  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20531494 ttgtagttgatgaatcattgcttgggt 20531468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 334 - 439
Target Start/End: Original strand, 9784237 - 9784344
Alignment:
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattca 431  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||    
T  9784237 atgttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattca 9784336  T
Q  432 tgatttga 439  Q
    ||||||||    
T  9784337 tgatttga 9784344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20194323 - 20194189
Alignment:
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgga-tgtatgaaattggtg 245  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| || |  | || ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||| || | |||||| ||||||    
T  20194323 tatgcataagtgcttatttgaataaatgattattttgcacttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgttttgagtatatgaatttggtg 20194224  T
Q  246 ataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20194223 ataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttca 20194189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 37844466 - 37844690
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||||| ||  || |||    
T  37844466 aaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc-aagtaggaacaaatga 37844563  T
Q  297 t-atatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    | | ||  |||||  | ||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||  |||| | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||    
T  37844564 taaaatagtgaaaattgtgctc-aattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgat 37844662  T
Q  394 attgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  37844663 gttgtggttgatgagtcattgcttgggt 37844690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22367127 - 22367023
Alignment:
Q  336 gttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatg 433  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||    
T  22367127 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatg 22367028  T
Q  434 atttg 438  Q
    |||||    
T  22367027 atttg 22367023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41394469 - 41394385
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  41394469 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcat-aaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaa 41394385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 20194149 - 20194070
Alignment:
Q  340 ttgttgaattgtggtaagat-tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20194149 ttgttgaattgtgttacgttgtcatgtttaattgatgttgttgttgtcatgagatattgttgttgatgattcatagcttg 20194070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20346378 - 20346345
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346378 actaaggtaagggggttagaattcatcataatca 20346345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 21650167 - 21650272
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  21650167 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattaaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgttgagacatgttgttgtttatgatttatggc 21650266  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  21650267 ttgggt 21650272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21860138 - 21860033
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  21860138 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggct 21860039  T
Q  417 tgggtt 422  Q
     |||||    
T  21860038 cgggtt 21860033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2116484 - 2116418
Alignment:
Q  215 tgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  2116484 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 2116418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20913277 - 20913195
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  20913277 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 20913195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20931592 - 20931510
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  20931592 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttca 20931510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 17023436 - 17023390
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaa 60  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17023436 aagaagagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaa 17023390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28967 - 28541
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28967 aagaggaacttgaagattcaagaagaggagagaacctaggaactaaagtgaagcttgggctagggatttgatctaactaaggtaacggggttagaattca 28868  T
Q  115 tcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||  |||||||||| |||    
T  28867 tcataatcatttttagtttaaattttcaattgttgtatgaataagttcttaattgagtaaatgattaattgtccaaagttgttatcattcgtgctctaat 28768  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28767 tatgatgatatgtttgaatgcatgaacttgttgataactgaattgttgttggtgaaattatatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattatg 28668  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28667 ctcaaattgttgaattatggtatgttgttgttgaattgtagtaagaattatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttaatgattcat 28568  T
Q  413 ggcttgg--gttcataattcatgattt 437  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    
T  28567 ggcttgggtgttcataattcatgattt 28541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 35910 - 35476
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaatt 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  35910 aagaagagcttgaagattcaagaattggaagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaatt 35812  T
Q  113 ca-tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  35811 caatcataatcattttagtgtaatttttcaattgttgtatgaataggtgcttaattgagtaaaagattaattgttcaaagttcttataattcgtgctcca 35712  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    || |||||| |||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35711 atcatgatgatatgtttgaatgcatgaagttattgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaatta 35612  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35611 tactcaaattgttgatttatgctatgttgttgttgaaatgtggtaagagtcatgttcaattgatgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattc 35512  T
Q  411 atggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  35511 atggcttgggtattcataattcatgatttgttgatg 35476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 76662 - 77096
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaatt 112  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||    
T  76662 aagaagagcttgaagatacaacaattggtaaagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattgctgataattaaggtaagggggttagaatt 76760  T
Q  113 ca-tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  || | |||||| ||||| |    
T  76761 caatcataatcattttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtacttaattgagtaattgagtaattgttcatagatgatgaaattcatgctcta 76860  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  76861 attatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaatta 76960  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  76961 tgttcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattc 77060  T
Q  411 atggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  77061 atggcttgggtattcataattcatgatttgttgatg 77096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 69880 - 69455
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||  |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  69880 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaagataagggggttagaattcaatcataa 69781  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  69780 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagaaagtgattaattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaattatgatga 69681  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  69680 tatgtttaaatgcatgaaattggttataattgaattgttgtaggtgaaattgcatgtttaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 69581  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  69580 gttgaattgtgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 69481  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  69480 tgttcataaatcatgatttgatgatg 69455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 421
Target Start/End: Original strand, 102749 - 103146
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatc 122  Q
    |||||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  102749 cttgaagattcaagaa---gagagaacctagaagctaaagtgaagcttgagctaggggattgatctaactaaggtaaggggtttataattcatcataatc 102845  T
Q  123 attta--gtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    ||||   ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  102846 attttttgtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaattatgatga 102945  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| || ||    
T  102946 tatgtttgaatgcatgaagtttttgataattgaattgttgttagtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatggtggaatatgctaaattt 103045  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||    
T  103046 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataacattcatgttcaattgatgttattgtttctaagtgatgttgttgatgataattcatggtttggg 103145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 51 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 109977 - 109613
Alignment:
Q  51 taggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat--ttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||    
T  109977 taggagctaaagtgaagcctaagctagggaattaatctaactaaggtaaggtggttagaattcatcataatcatcttttgtgtaaattatcaattgttgt 109878  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||  ||||| ||| |||||    
T  109877 atgaataaatgcttaattga--------ttaattgatgataattgttagaattcgtgatccaagtatgatgatatgtttgaatccatgaagttgttgata 109786  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  109785 attgaattgttgttaatgaaatttcatgtttaaagtatgagaaagtggtatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattttgctatgttgttgttgaat 109686  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  109685 tgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggt 109613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 438
Target Start/End: Original strand, 112364 - 112785
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | || ||||| | ||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  112364 aagaggaacttgaagaatcaaggggtgaagagagc-taggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 112462  T
Q  114 atcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| || ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||    
T  112463 atcataatcatt-attgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtacttatttgggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaat 112560  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tat 311  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||    | ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  112561 tatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaacaattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaaatat 112660  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    |||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| |   |||||||||| |||||    
T  112661 gctcaattagt-gaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtca---tgttgttgataattca 112756  T
Q  412 tggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  112757 tggcttgggtttgcatgattcatgatttg 112785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 188 - 419
Target Start/End: Original strand, 67948 - 68180
Alignment:
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    |||||||| ||||||||| ||   |||||||| |||||||   |  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| | ||||    
T  67948 taattgttgaaattcgtgttcttgttatgatgatatgtttaagtacatgaatttggtgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatatg 68047  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| ||  |||||  |||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||      
T  68048 tgaaaatgggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgttatgttgttgttgaaatgtggtgagattcatgtttaattgatgttgttgttgtc 68147  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg 419  Q
    | | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  68148 atgagatattgtttttgatgattcatagcttgg 68180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 132166 - 131931
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataat 191  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||  || || |    
T  132166 aggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttctc-tagt 132068  T
Q  192 tgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaa 291  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| |||    
T  132067 tgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtaaaattgcatgttcgtagtatgtgaa 131968  T
Q  292 agtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaatt 328  Q
    | ||||||||  |||| | ||||| || |||||||||    
T  131967 aatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaatt 131931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 131939 - 131834
Alignment:
Q  341 tgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||    
T  131939 tgttgaattgtgatgagaatcatgcttaattgttgttgttgttgttaagaaatatttttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattg 131840  T
Q  439 atgatg 444  Q
    ||||||    
T  131839 atgatg 131834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 43622 - 44047
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43622 cttgaagatttaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataa 43721  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||     
T  43722 tcatttagtgtaatttttcaattgttgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttaaaattaatgctctaattatgatgc 43821  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |  | || || |    
T  43822 tatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaaggatatgaaagtgatatatgttgaattgggttctaaat 43921  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg- 419  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43922 gtcaaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 44021  T
Q  420 -gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||||||||||||||||    
T  44022 tgttcataaatcatgatttgatgatg 44047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 45 - 418
Target Start/End: Original strand, 23520 - 23893
Alignment:
Q  45 agatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgcaatttttcaatt 143  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||   |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||   || ||||||||| |     
T  23520 agattctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-atttttgctaattaagataagggggttagaattcaatcataatgattagttgtaatttttcatta 23618  T
Q  144 gttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattgg 243  Q
     ||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| ||  ||||||||      
T  23619 attgcatgattaagtgcttagttgaataattgattatttgttcatagttgttgaaattcgtgctttaattatggtgatatgtttgtatacatgaaatttt 23718  T
Q  244 tgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgt 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  23719 tgataattgaattgttgttggagaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgttgt 23818  T
Q  344 tgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23819 tgaattgtgatgagaatcatgtttaattgacgttgttgttgttaaggaatattgttgttgatgattcatggcttg 23893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Original strand, 6839 - 7274
Alignment:
Q  15 aagaagaa-cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaat 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  6839 aagaagaagcttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagttaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagaat 6937  T
Q  112 tca-tcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcc 209  Q
    ||| | |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||     
T  6938 tcaattataatcattttaatgtaatttttcaatcgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgatttgttgttcataattgtcaaaattcgtgctct 7037  T
Q  210 aattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat 309  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7038 aattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttagtgaaatttaatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaatt 7137  T
Q  310 atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7138 atgctcaaattgtttaattatgttatgttgttattggattgtgataagaatcatgttcaattgatgttgttgctgctaagtgatattgttgttgatgatt 7237  T
Q  410 catggctt--gggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||| ||| |||||    
T  7238 catggcttgagtgttcataattcatgaattgttgatg 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 8196 - 8416
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||| || ||||||  ||||  ||| ||     
T  8196 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaat-tatgtaaaaatgt 8293  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
     |  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| |||||||||   |||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  8294 gaagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatg 8389  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    
T  8390 ttgttgtttatgaatcatggcttgggt 8416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 11850 - 11769
Alignment:
Q  340 ttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||||||||    
T  11850 ttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtt-atgatttatggcttgggt 11769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11523 - 11092
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11523 aagaagagcttgaagattcaaggattggaagagagc-taggaggtaaagtgaagctagagctagggaattaatctaactaaggtaagggg-ttataattc 11426  T
Q  114 atcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaa-ttcgtgctccaat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  11425 atcataatcatttagtgtaatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattgagtagatgattaattgttcataattgttaaaaattcatgttccaat 11326  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  11325 tatgatgatatgtttgaatgcatgaaactagtgataattgaattgttgtttgtgaaatttcatgttcaaagtgtgtgaaagtgatatatgttgaattatg 11226  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  11225 ctcaaatagttgaaatatgctatcttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatgtgatgttgttgtttatgattcat 11126  T
Q  413 ggctt--gggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||  | |||||||  ||||||||||||||||    
T  11125 ggcttaggtgttcatagatcatgatttgatgatg 11092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 31443 - 31018
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    ||||||||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31443 cttgaagattcaagaatttgtagaaatactaggagctaaagtgaagcttgggctaggaatttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataa 31344  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  31343 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagttgttagaattcgtgctctaattatgatga 31244  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  || |    
T  31243 tatatttgaatgcatgaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctttaaat 31144  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt--g 418  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  31143 gttgaattgtgctatgttcttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatactgttgttgatgattcatggcttgag 31044  T
Q  419 ggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||    
T  31043 tgttcataaatcaagatttgatgatg 31018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 197078 - 197502
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  197078 cttgaagattcaagaagtggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataa 197176  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||  |||| || |||| |||| ||||||||||     
T  197177 tcatttagtgtaatttttcatttgttgtatgattaagtgcttaattggataagtgattaattgttcttagatgttgaatttcgggctctaattatgatga 197276  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||| || |    
T  197277 tatgtttgaatgtatgaaattgttgataattgaattgttgttggtgaaattgcaagttcaaagtatgtgaaagtgttataagttgaattatgctctaaat 197376  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 420  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  197377 gttgaattgtcctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttggg 197476  T
Q  421 --ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
      ||||||| ||||| ||||||||||    
T  197477 tcttcataaatcatgctttgatgatg 197502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7085 - 6659
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattca-tcata 119  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| || |||||||||||||||||| | |||||    
T  7085 cttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaaggttgggctagg-aattggtgataattatggtaagggggttagaattgaatcata 6987  T
Q  120 atcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatga 217  Q
    |||||||  |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6986 atcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataaatgcttaaatgtgtaaatgattaattgttca-agttgttataattcgtgctataattatga 6888  T
Q  218 tgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaa 317  Q
    || |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6887 tgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaattttgctcaa 6788  T
Q  318 attgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt 417  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6787 attgttgaattatgctatgctattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttactcctaagtgatgtttttgttgatgattcatggctt 6688  T
Q  418 gggt--tcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  6687 gggtggtcataattcatgatttgttgatg 6659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Original strand, 33545 - 33952
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33545 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagc-tatgagctaaattgaagcttgagctagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattc 33643  T
Q  114 atcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    |||||||||||||  |||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33644 atcataatcatttttagtgtaaattt-caattgttgtatgaataaatgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcatgctccaa 33742  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatat 311  Q
    ||||||||  ||||||| |||  |||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  33743 ttatgatgacatgtttgaatgcttgaagttgtggataattgaattgttgttagtggaatttcatgtttaaagtatgaagaagtgttatatgttgaaatat 33842  T
Q  312 gctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattca 411  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||    
T  33843 gctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattca 33942  T
Q  412 tggcttgggt 421  Q
    ||||||||||    
T  33943 tggcttgggt 33952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 443
Target Start/End: Original strand, 97023 - 97446
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataa 120  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  97023 cttgaagattcaagaaatggtagagatcgtaggaggtaaagtgaagcttgggctagg-aattgtgctaatgaaggtaagggggttagaattcaatcataa 97121  T
Q  121 tcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt 220  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  97122 tcatttagtgtaatttttcaattattgtatgatttagtgtttaattgagtgagtgattaattgttcatagttgttaagattcgtgctctaattatgatga 97221  T
Q  221 tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaatt 320  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || |    
T  97222 tatgtttgaatgcataaaattggtgataattgaattgttgttggtggaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttatatgttgaattatgctctaaat 97321  T
Q  321 gttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg 420  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  97322 gttgaattatgctatgttggtgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatattgttgttactaattgatattattgttgatgattcatgccttggg 97421  T
Q  421 --ttcataattcatgatttgatgat 443  Q
      ||||||| |||||||||||||||    
T  97422 ttttcataaatcatgatttgatgat 97446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 50 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 71007 - 70676
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || || ||||    
T  71007 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttattgtaatttt-cagttattgt 70909  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| | ||||| ||| |||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||    
T  70908 atgaa-aagtgcttaattgggtgaattaattaatagtttataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgtcatgtttggatgtatgaagttatggat 70810  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  70809 aattgaattgttgttagttgaatt-catgttcaaagtatgagaaaatggaatatgttgaaaatatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttga 70711  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttg 381  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  70710 attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 31418 - 31067
Alignment:
Q  72 agctaggga-attgatctaactaaggtaaggggg--ttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattga 168  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  31418 agctagggagattaatctaactaaggtaagggggggttagaattcatcataatcattcattgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtgcttaattgg 31320  T
Q  169 gtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtga 267  Q
    || ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||| ||      
T  31319 gtgaattgattatttgttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgtggttagttg 31220  T
Q  268 aatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt 366  Q
    || |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| |    
T  31219 aa-ttcatgttcaaagtataagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaatttgttaagttatg-tttgtagttgttgaattgtgataagtttcatgat 31122  T
Q  367 caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
     |||||||||||||| || || ||||  || ||| |||| ||| |||||||||||    
T  31121 taattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggt 31067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 3749 - 3342
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttgga-gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaatt 112  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||| ||||| || || |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3749 aagaggaacttgaagattcaaggattggaagagagc-taggagctaaattgaagcttaagatagggggattaatctaactaaggtaagggggttagaatt 3651  T
Q  113 catcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaat 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3650 catcataatcatttattgcaattttacaattattgtatgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcataattgttagaattcgtgctccaat 3551  T
Q  213 tatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatg 312  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||  | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  3550 tatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttataattgaattgttgttagagaaatttaatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgtgaaaatatg 3451  T
Q  313 ctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
    ||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | || | ||||||    
T  3450 ctcaattggtccaattatgctatgttgtagttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcat 3351  T
Q  413 ggcttgggt 421  Q
    |||||||||    
T  3350 ggcttgggt 3342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 6)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 92 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 53699 - 53345
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  53699 taaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtgtaatttttcaattattgtatgattaagtgcttaattgagtaagtgattaattgttcatag 53600  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  53599 ttgttagaattcatgctctaataatgatgatatgtttgaatgcatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtga 53500  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53499 aggtgttatatgttgaattatgctctaaatgttcaattatgctattttgttgatgaattgtgatgagattcatgttcaatggatgttgttgttgctaagt 53400  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttggg-ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  53399 gacattgttgttaatgattcatggcttgggagtcattaatcatgatttgatgatg 53345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 142 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 85834 - 85531
Alignment:
Q  142 ttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaatt 241  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||    
T  85834 ttgttgtatgtttaaatgcttaattgaataagtgattaattgttcatagttgttgaaattcgtgctctaattatgatgatatgttta-atgcatgaaatt 85736  T
Q  242 ggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  85735 ggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattatgctcaaattaatgaattgtgttatgttgtt 85636  T
Q  342 gttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttga 439  Q
    |||||||| || | ||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||     
T  85635 gttgaattatgatgagaatcatgtttaagtgatattgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatggtttgt 85536  T
Q  440 tgatg 444  Q
    |||||    
T  85535 tgatg 85531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 146848 - 146652
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||||| ||||  ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||  |     
T  146848 aaattcatgctttaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgtataattgaactgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaaaatggg 146749  T
Q  297 tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  146748 tatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 146652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 8977 - 8873
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||| |  ||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  8977 aattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcattgct 8878  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  8877 tgggt 8873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 148968 - 148745
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  148968 aaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 148871  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||      
T  148870 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaag 148772  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  148771 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 148745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9096 - 9013
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  9096 aaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 9013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Original strand, 104476 - 104871
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgta 149  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| | | |||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  104476 ctaggagctaaagtgaagcttgggctaagaatttgtgctaattaaggtaagtgggttagaattcatcataatcatttagtgtaatttttcaattgttgta 104575  T
Q  150 tgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataa 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  104576 tgaataattgcttaattgagtaagtgattaattgttcatagatgttaaaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataa 104675  T
Q  250 ttgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaatt 349  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||   || || ||  |  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  104676 ttgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaagtatgtataaatgctaacttatgaattatgctcaaatggttgaattatgttatgttgttgttgaatt 104775  T
Q  350 gtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     || | | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  104776 atgatgataaccatgtt-aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 104871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 151 - 438
Target Start/End: Original strand, 93726 - 94015
Alignment:
Q  151 gaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgtta-aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataa 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||  ||||||    
T  93726 gaataagtgcttaattgggtaaattattaattgttcataactgttagaaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaagtttttgataa 93825  T
Q  250 ttgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaatt 349  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  93826 ttgaatggttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaaatggtatttgttgaaatatgctcaaattattgaagtatgctatg-tgttgttaaatt 93924  T
Q  350 gtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt--tcataattcatgatttg 438  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||| |||||||  ||||||   ||||||||||||||||    
T  93925 gtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttattaataagtgatgttgttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttg 94015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 55708 - 55604
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  55708 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 55609  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  55608 tgggt 55604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 18 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 723 - 307
Alignment:
Q  18 aagaacttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-t 115  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | |   ||| || |||||||||||||||||| | |    
T  723 aagaactagaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctaggaattagtgataattatggtaagggggttagaattgaat 624  T
Q  116 cataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaatt 213  Q
    |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||  ||||    
T  623 cataatcatttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttca-agttgttataattcgtcctataatt 525  T
Q  214 atgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgc 313  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||| | |||    
T  524 atgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattatattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag---------------tatgttgaattttgc 440  T
Q  314 tcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  439 tcaaattgttgaattatgctatgttattgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatg 340  T
Q  414 gcttgggt--tcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  339 ccttgggtgctcataattcatgatttgttgatg 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 417
Target Start/End: Original strand, 8699 - 9102
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | | ||||| | ||||||  ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8699 aagaggaacttgaagaatcaagattggaagagagc-taggagaaaaaatgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagagttc 8797  T
Q  114 atcataatcattta--gtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    |||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |    
T  8798 atcataatcatttttggtgcaattt--caattattgtatgaataagtgcttaattgggaaaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctcta 8895  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata 310  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  8896 attatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgttgatata 8995  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  8996 tgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattc 9095  T
Q  411 atggctt 417  Q
    |||||||    
T  9096 atggctt 9102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Original strand, 5101 - 5471
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-g 147  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | | | ||||||||| || |    
T  5101 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt--ttctaattttcaattatttg 5197  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||| ||    |    
T  5198 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctcttattatgatgagatgtttagatgtatgaagttatgaa 5296  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||| |  |||| | | ||| ||   |||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||| ||    
T  5297 taattgaattgt-gttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaataggtatgtgcgaaaatatgctcaa-ttggtgaattaggcattgttgttgatg 5394  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||    
T  5395 aattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtt 5471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Original strand, 1398 - 1794
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||    
T  1398 ctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattaatctatctaaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattattgt 1497  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  1498 atgaataagtgcttaattggataaatgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgata 1597  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||   || || ||  |  |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1598 attgaattgttgttggtgaatttgcttgttaaaagtatgtataaatgctaatttatgaattatgttcaaatgggtgaattatgctatgttgttgttgaat 1697  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg-ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatga 442  Q
    | || | |||  |||| |||||||| ||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1698 tatgatgagaaccatgctcaattgaagttgttgttgaattagatatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgatga 1794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 442
Target Start/End: Original strand, 8543 - 8939
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| ||||    
T  8543 ctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaattaatctatctaaggtaaggggtttagaattcatcataattattttagtgtaaattttcaattattgt 8642  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  8643 atgaataagtgcttaattggataaatgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattagtgata 8742  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||   || || ||  |  |||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8743 attgaattgttgttggtgaatttgcttgttaaaagtatgtataaatgctaatttatgaattatgttcaaatgggtgaattatgctatgttgttgttgaat 8842  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg-ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatga 442  Q
    | || | |||  |||| |||||||| ||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8843 tatgatgagaaccatgctcaattgaagttgttgttgaattagatatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgatga 8939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 34057 - 33659
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||    
T  34057 ctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaaggggattagaattcatcataatcatttattgcaatttt-caattactgt 33959  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    |||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||   |||    
T  33958 atgattaagtgcttaattggatgaattgattaattgttcgtaaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatagat 33859  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat-atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  33858 aattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaaattatgtttaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatga 33760  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  33759 attttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctagggtgttcataattcatgatttgataatg 33660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 33612 - 33540
Alignment:
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||    
T  33612 tgctcaaattgttggattgagatattgtgttgttgaattatggttgaattcatgttcaattgaagttgttgtt 33540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 438
Target Start/End: Original strand, 464 - 819
Alignment:
Q  85 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  464 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcata-tcatttattgctatttttcaattattgtatgaataagtgcttaattgggtgaattgattaattg 562  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
    ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||  |  |||| |||||||||||    
T  563 ttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaaattatggataatagaattgttgttaattgaattacatgttcaaag 662  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  663 tatgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcat-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgt 761  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  762 tgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttg 819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 444
Target Start/End: Original strand, 22246 - 22671
Alignment:
Q  23 cttgaagattcaagagttgg-agagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggg--aattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcat 118  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22246 cttgaagattcaagaattggtagagatcctaggagctaaagtgaagtttgggctaggattaactg--ctaactaaggtaagggggttagaattcaatcat 22343  T
Q  119 aatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgat 218  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  22344 aatcatttagtgtaatttctcatttgttgtattaataaatgcttaatagaataagtgaataattgttcatagttgttaaaattcgtgctctaaatatgat 22443  T
Q  219 gttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaa 318  Q
    | |||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||   || || ||  |  |||| ||||||||||    
T  22444 gatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatgctaacttatgaattatgctcaaa 22543  T
Q  319 ttgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |  || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||    
T  22544 ttattgaattgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaattgatattgttgttgaagattcatagtttg 22643  T
Q  419 g--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |  |||||| | | ||||||||||||||    
T  22644 ggtgttcatgaattatgatttgatgatg 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 91 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8364 - 8008
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8364 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttaatgtaatttttcaattattgtatgaataagtgattaattggataaatgattaattgttcata 8265  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
      ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||      
T  8264 gatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgta 8165  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
     ||||| ||  |  |||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8164 taagtgctaacttatgatttatgctcaattgggtgaattatgctatgttgttgtggaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctatg 8065  T
Q  390 tgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  8064 tgatgttgttgttgatgattcatagcttgggtattcataattcatgaattggtgatg 8008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11230 - 11153
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatca-tttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattg 167  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11230 ctaaggtaagggggttagaagtcatcataatcattttaatgtaatttttcaattattgtatgaataagtgattaattg 11153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 352
Target Start/End: Original strand, 1200 - 1503
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat-ttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  1200 ctaggagctaaagtgaagcttgatctagggaattaatctatctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattattgt 1299  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||    
T  1300 atgaataagtgcttaattggataaatgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgata 1399  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||| |||||||||  ||||| ||    
T  1400 attggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatgatatatgatgaatcatgctctaaatgttgtattgtgctatgttactgttggat 1499  T
Q  349 tgtg 352  Q
    ||||    
T  1500 tgtg 1503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 352
Target Start/End: Original strand, 9455 - 9758
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat-ttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  9455 ctaggagctaaagtgaagcttgatctagggaattaatctatctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatattagtgtaatttttcaattattgt 9554  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||    
T  9555 atgaataagtgcttaattggataaatgattaattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgata 9654  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||  |||||| || ||||| ||| |||||||||  ||||| ||    
T  9655 attggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatgatatatgatgaatcatgctctaaatgttgtattgtgctatgttactgttggat 9754  T
Q  349 tgtg 352  Q
    ||||    
T  9755 tgtg 9758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 50 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8200 - 7915
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  8200 ctaggagctaaattgaagcttaagctagggggattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcgtaatcatttattgcaattttacaattattgt 8101  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  | |||    
T  8100 atgaataagtgcttaattgagtaattgattaattgttcatatttgttagaattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttatttata 8001  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgcta 334  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||  ||||||||||    
T  8000 attgaattgttgttagagaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtggtatatgtgaaaatatgctcaattggtccaattatgcta 7915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 366 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 7912 - 7857
Alignment:
Q  366 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||||    
T  7912 tcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggt 7857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 79892 - 79537
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcata 189  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  79892 ctaaggtaagggg-ttagaattcatcataattattttagtgtaatttttcaattattgtatgaataagtgattaattggataaatgattaattgttcata 79794  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
      || |||||||||||| | || ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  79793 gatgctaaaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgagttgttggtggtgaaattgcatgttctaagtatgtg 79694  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
     ||||| ||  |  |||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  79693 taagtgttaacttgtgaattatgcttaattggttgaattatgatatgttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaag 79594  T
Q  390 tgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  79593 tgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatg 79537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 383
Target Start/End: Original strand, 89470 - 89655
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||  || | |    
T  89470 aaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-taggaacaaatta 89567  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    ||  |  |||||  | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  89568 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 52 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 85724 - 85336
Alignment:
Q  52 aggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtat 150  Q
    |||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  85724 aggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatcttactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgtat 85626  T
Q  151 gaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataa 249  Q
    ||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||| || | |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||   |||||    
T  85625 gaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtttataaatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataa 85527  T
Q  250 ttgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||| || ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  85526 ttgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaaattggtatatattgaaaatatgcttaa-ttggtgaattatgctaggttgttgatgaat 85428  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||    
T  85427 tgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtttgggtttgcatgattcatgatttg 85336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 72 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 159672 - 159350
Alignment:
Q  72 agctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagt 170  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  159672 agctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgtacgaa-aagtgcttaattgggt 159575  T
Q  171 aaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaa 269  Q
     ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||   |||||| | ||||||||| ||  ||    
T  159574 gaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggataatggcattgttgttagttgaa 159475  T
Q  270 tttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat-atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttca 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  159474 tttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatgagttgaaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatca 159375  T
Q  369 attgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  159374 attgatgttgttgttgctaagtgat 159350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 87 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41015 - 40660
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  41015 ctaactaaggtaagggggttataattcatcataatcatttattgcaattttt-aattattgtatgaata-gtgcttaattgggtgaattgattaattgtt 40918  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggt-gaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    ||||| || | |||||||| ||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  40917 cataaatgatgaaattcgtactctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagt 40818  T
Q  285 atgagaaa-gtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    ||| |||| |||   |||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  40817 atgtgaaaagtgggttatgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtt 40719  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgat 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40718 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgat 40660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 87 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 46522 - 46162
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 185  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  46522 ctaattaaggtaagagggttataattcatcataatcatttattgcaattttt-aattattgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtt 46425  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggt-gaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    ||||| || | |||||||| ||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  46424 cataaatgatgaaattcgtactctaattttgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaaacttcatgatcaaagt 46325  T
Q  285 atgagaaa-gtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    ||| |||| |||   |||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  46324 atgtgaaaagtgggttatgtgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtt 46226  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  46225 tctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgataatgt 46162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 79991 - 79887
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatg-ttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| || | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  79991 aattggtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggc 79893  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  79892 ttgggt 79887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11712
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||    ||||||| |||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12119 aagaggaacttgaagaatcaaggattggagaagagctaggagttaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaaggtggttagaattc 12020  T
Q  114 atcataatcattta--gtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctcca 210  Q
    |||||||||||||   |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || | || ||||||||| |    
T  12019 atcataatcatttttggtgcaattt--caattattgtatgaataagtgcttaattgggtcaattgattaattgttcataaatgatgaatttcgtgctcta 11922  T
Q  211 attatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaat- 309  Q
    |||||||||  ||||||  ||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||      
T  11921 attatgatgacatgtttcaatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaaagatatgagttgaaaac 11822  T
Q  310 atgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 409  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||    
T  11821 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataatt 11722  T
Q  410 catggcttgg 419  Q
    ||||||||||    
T  11721 catggcttgg 11712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Original strand, 132139 - 132475
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttg-tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  132139 ctaactaaggtaagggggttggaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttctatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgt 132237  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  132238 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgtttgttgaattatatgttcaaagt 132337  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  132338 atgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 132436  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  132437 gttaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 132475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16296 - 16035
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattta--gtgcaatttttcaattgtt 146  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||    
T  16296 ctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaattt--caattatt 16199  T
Q  147 gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggt 244  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||       
T  16198 gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcataaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatg 16099  T
Q  245 gataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa 308  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  16098 gataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatgagttgaaa 16035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25827 - 25566
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattta--gtgcaatttttcaattgtt 146  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| ||    
T  25827 ctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttggtgcaattt--caattatt 25730  T
Q  147 gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggt 244  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| || | |||| ||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||| ||       
T  25729 gtatgaacaagtgcttaattgggtgaattgattaatttgttcataaatgatgaaatccgtgctctaattatgatgacatgttttaatgtatgaagttatg 25630  T
Q  245 gataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa 308  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  25629 gataattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatgagttgaaa 25566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 88626 - 88326
Alignment:
Q  93 aaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||    
T  88626 aaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgctatttt-caattatttgtatgaa-aagtgtttaattgggtgaattgattaattgtccataa 88529  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
     || | |||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||| || ||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |    
T  88528 atgatgaaattcgtgctataattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattaaaatgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgaaa 88429  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaag 389  Q
    ||  | ||| |||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||| ||||    
T  88428 aatgggtatgtgttgaaaatatgatcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaag 88330  T
Q  390 tgat 393  Q
    ||||    
T  88329 tgat 88326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 345
Target Start/End: Original strand, 116374 - 116700
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattc 113  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  116374 aagaagagcttgaagattcaataattggagagatcctaggagctaaagtgaagcttgggctagg-aattggtgataattaaggtaagggggttagatttc 116472  T
Q  114 atcataatcattt--agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaa 211  Q
    |||||||||||||  |||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  116473 atcataatcatttttagtgtaaattttgaatggttgtatgaataagtgcttaattgagtaaattattaattgctcataattgttagaattcgtgctccaa 116572  T
Q  212 ttatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaata- 310  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  116573 ttatgatgttatgtttgaaggcatgaaattgttgataattgaattg-tgtgggt----tttcatgttcaaagtatgagaaaatgatatatgttgaaatat 116667  T
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    ||||||||| | ||| |||||  ||||||||||||    
T  116668 tgctcaaatggatgatttatg--atgttgttgttg 116700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 164567 - 164237
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattg-ttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||  | ||| |||||||| ||||    
T  164567 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattaattgtatgg-taagtgcttaattggatgaattgattaatttttca 164471  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||| ||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||| |     
T  164470 taagtgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgt-gttagttgaattacatgttcaaagtgta 164372  T
Q  288 agaaagtga-tatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| ||  ||| |||  | |||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| |||| || ||||||||||| |    
T  164371 tgaaaatgggtatgtgtgaagatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtt 164273  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||| || |||||| || | ||||||||||||||||    
T  164272 tagtcatgttgttgatggtaattcatggcttgggtt 164237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 371 - 444
Target Start/End: Original strand, 116687 - 116762
Alignment:
Q  371 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  116687 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatg 116762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Original strand, 162325 - 162430
Alignment:
Q  336 gttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt-gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcat 432  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | |||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||| ||||||    
T  162325 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcat 162424  T
Q  433 gatttg 438  Q
    ||||||    
T  162425 gatttg 162430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 129 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 6257 - 5937
Alignment:
Q  129 tgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgttt 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |  ||||||    
T  6257 tgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtgcttaatttggtgaattgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgacgacatgttt 6159  T
Q  228 ggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaag-tgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttga 325  Q
    | ||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  6158 gaatgtatgaagttatggataattggattgttgttggtagaatttcatgttcaaagtatgagaaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaattggttaa 6059  T
Q  326 attatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt--gggttc 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  6058 attatgctatgtggttgttgaattgtgataatattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttc 5959  T
Q  424 ataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  5958 ataatccatgatttgatgatgt 5937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 12694 - 12588
Alignment:
Q  20 gaacttgaagattcaag-agttggagagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatca 117  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||  ||| |||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12694 gaacttgaagaatcaaggagtggaagaga-cctaggagaaaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatca 12596  T
Q  118 taatcatt 125  Q
    ||||||||    
T  12595 taatcatt 12588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Original strand, 579 - 684
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | |||||||| |  | | | ||||||||| ||||||| |||||||    
T  579 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatgatgatacatggct 678  T
Q  417 tgggtt 422  Q
    ||||||    
T  679 tgggtt 684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 50 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9382 - 9009
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaattttt-caattgttg 147  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||| |||    
T  9382 ctaggagcaaaattgaagtctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaatttatcataatcatt-attgcaattttttcaattattg 9284  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   ||    
T  9283 tatgaa-aagtgcttaattgagtgaattgattaatttttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgga 9185  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9184 taattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgctatgttgttgatg 9086  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | ||||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9085 atttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 9009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 90 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 4915 - 4560
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  4915 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt---gtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 4821  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  4820 tatatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatg 4721  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    | |||  | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4720 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgct 4621  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4620 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgt 4560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 90 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 9529 - 9174
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  9529 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt---gtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 9435  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  9434 tatatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatg 9335  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    | |||  | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9334 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattgatgttgttgttgct 9235  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9234 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgt 9174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 11056 - 10660
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||    
T  11056 ctaggagcaaaagtgaagctagagctagaggattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtataatttt-caattattgt 10958  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  10957 atgaataagtgattaattggataaataattaattgttcatagatgttataattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgata 10858  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    ||||| ||||||| || ||| || |||||||||||||||   ||||| ||  |  |||| |||||| || | |||| |||||| || |||||||| ||||    
T  10857 attgagttgttgtcggagaatttgcatgttcaaagtatgtataagtgttaacttgtgaattatgcttaattggttggattatgatacgttgttgtcgaat 10758  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    | || | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  10757 tatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtttttgctaagtgatgttgttgttgatcattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatg 10660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 21867 - 21534
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  21867 ctaactaaggtaagggggttataattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgtatgaaaaag-gcttaattgggcgaattgattaattgtt 21770  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  21769 cataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtta-tgataattggattgttgttagttgaattacatgttcaaagta 21671  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||    
T  21670 tgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttg 21572  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21571 ctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 21534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 31566 - 31233
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  31566 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtgcttaattgggcgaattgattaattgtt 31469  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| || | |||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||  ||||  ||||||||||||    
T  31468 cataaatgatgaaattcatgatctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagtta-tgataattggattgttgttagttgaattaaatgttcaaagta 31370  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||    
T  31369 tgagaaaatggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttg 31271  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31270 ctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 31233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 190
Target Start/End: Original strand, 47440 - 47542
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgag-taaatgattaattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  47440 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-ttattgcaatttttcaattattgtatgaa-aagtgcttaattgggcgaattgattaattgtt 47537  T
Q  186 cataa 190  Q
    |||||    
T  47538 cataa 47542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 2310 - 1942
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  2310 ctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaagtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttcaattattgt 2212  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||   |||    
T  2211 atgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgctcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttgaatgtatgaagttatggat 2113  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||| || |||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  2112 aattgaattgttgttagttgaatttcatgttcaaagtatgcgaaaatggtatatgatgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatg-tgttgttga 2014  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
     ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||| |||| |||||||    
T  2013 tttgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattcttggcttg 1942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 107 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2453
Alignment:
Q  107 agaattcatcataatcattt--agtg-caatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcg 203  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||    
T  2795 agaattcatcataatcatttttagtgtcaatttttcaattgttgtatgagtaagtgctttattgagtaattgattaattggtcatgattattagaattcg 2696  T
Q  204 tgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgt 303  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||  ||| ||||||| |  |||| ||||||||||    
T  2695 tgctcctattatgatggtatgtttgtatgtgagaaattggtgataattggttggttgttggagaaattgaatgatcaaagtgtatgaaaatgatatatgt 2596  T
Q  304 tgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttg 403  Q
    |  | ||||||| || || | | ||||| ||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2595 tatattatgctctaaatgataatttatgatatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttg 2496  T
Q  404 atgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  2495 atgattcatggcttgggtattcataattccttatttgatgatg 2453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 90 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 7524 - 7168
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  7524 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt---gtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 7430  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  7429 tatatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtatg 7330  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattg-atgttgttgttgc 385  Q
    | |||  | ||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7329 aaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtttaattgtgataatattcattttcaattggatgttgttgttgc 7230  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7229 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgt 7168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 87 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 6903 - 6542
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttag-tgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||| || |||| || ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  6903 ctaactaaggtaagggggttagaatttaaccataaccaattaggtgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattatttgt 6804  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    ||||| ||| | ||||| ||| || ||||||| || |||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  6803 tcatagttgatgaaatttgtgttctaattatggtgatatgtttaaatacatggaattggtgataattgaattgttattggtgaaattgcatgttcatagt 6704  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||| ||||||||  |||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  6703 atgtgaaaatgatatattgtgagttatactcaaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgatgttgttg 6604  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggctt--gggttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  6603 ctaagagatattgttgttgatgattcatggcttaggtgttcataaatcatgatttgatgatg 6542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 384
Target Start/End: Original strand, 15367 - 15658
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataa 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||  | |  |||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  15367 taaggtaagggggttagcattcatcataatcacttt-tgtaattttaaattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataa 15464  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
     || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   || ||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||||| | |    
T  15465 gtggtgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggacaattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtataaaa 15564  T
Q  291 aagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    || | | ||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  15565 aaatgggtatgtgtgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttg 15658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 36929 - 37152
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  36929 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 37026  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | |||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||| | || || || ||||||||||| ||| | | || ||| ||||     
T  37027 taagttgtgaaaattgtgct-aaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatg 37125  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  37126 ttgtggttgatgaatcattgcttgggt 37152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 438
Target Start/End: Original strand, 109349 - 109705
Alignment:
Q  85 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaattttt--caattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||    
T  109349 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttttcaattattgtatgaa-aagtgcttaattggctgaattgattaat 109446  T
Q  182 tgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  109447 tgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaa 109546  T
Q  282 agtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 380  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  109547 agtatgagaaattggtatatattgaaaatatgat-aaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 109645  T
Q  381 gttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  109646 gttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggattgcatgattcatgatttg 109705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 85 - 438
Target Start/End: Original strand, 117850 - 118206
Alignment:
Q  85 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaattttt--caattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||    
T  117850 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatt-attgcaatttttttcaattattgtatgaa-aagtgcttaattggctgaattgattaat 117947  T
Q  182 tgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||    
T  117948 tgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaa 118047  T
Q  282 agtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 380  Q
    ||||||||||  || |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||    
T  118048 agtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgttcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgtt 118146  T
Q  381 gttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttg 438  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  118147 gttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggggttgcatgattcatgatttg 118206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 27857 - 27494
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-g 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  27857 ctaattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataaatgattattttg 27758  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||||   |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27757 ctcatagttgttgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcatag 27658  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||| ||||||||  |||| | ||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  27657 tatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgccctaaatgttgaattgtgctatattgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgatgttgtt 27558  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| ||||||||||    
T  27557 gttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttgatgatgt 27494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 86716 - 86354
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gt 184  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||   | |||||  |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || |     
T  86716 ctaattaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaattttccctaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgc 86617  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    || || ||||| |||| |||||||   ||||| || ||||||||  |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||    
T  86616 tcttagttgttgaaatccgtgctcttgttatgttgatatgtttgagtacatgaaatttgtgataattgaatttttgttggtgaaattggatgttcatagt 86517  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||| || |||||  |||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| | | | ||||||| |||||||||| ||||||    
T  86516 atgtgaaaatgttatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttatagttcaattgtgatgataatcatgtttaattgatgtttttgttg 86417  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  86416 ttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgt 86354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 4999 - 4603
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgc-aatttttcaattgttg 147  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |  |||    
T  4999 ctaggatctaaattgaagcttgggctagg-atttgtgctaattaaggtaagggggttagaattcaatcataatcatttagtggtaatttttcattaattg 4901  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
     |||| ||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |  ||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4900 catgattaagtacttagttgaataactgatta-ttgttcatagttgttgaaattcgtgttttaattatggtgatatgtttgaatgcatgaaattggtgat 4802  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4801 aattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgttatgttgttgttgaa 4702  T
Q  348 ttgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||    
T  4701 ttgtgatgggaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagaagttttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatatatcaagatttgatgatg 4603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 85 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10296 - 9941
Alignment:
Q  85 atctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  10296 atctaactaaggtaagggggttagaattcataataatcatt-attgcaaattttcaattctttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaatt 10199  T
Q  183 gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||    
T  10198 gttcataaatgataaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaa 10099  T
Q  283 gtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttg 381  Q
    |  |  ||||  | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10098 gagtatgaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 10000  T
Q  382 ttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  9999 ttgatatgtcatgttgttgatgattattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 9941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 438
Target Start/End: Original strand, 22281 - 22661
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||    
T  22281 ctaggagctaaagtgaagcttgaggtagggaattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattttagtgttattttttaattattgt 22380  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgata 248  Q
    ||||||||||| |||||||  | | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||  |||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  22381 atgaataagtgattaattggatgattgattgattgttcatagatgttaaaattcgtgctctaactaggataatatgtttgtatgcatgaaattgatgata 22480  T
Q  249 attgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaat 348  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   ||||| ||  |  |||| ||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  22481 attgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtgtgtataagtgttaacttgtgaattatgctcaattgggtgaattatgctaagttgttgttgaat 22580  T
Q  349 tgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttg 438  Q
    | || | |||  |           ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22581 tatgatgagaacc-----------atgtttttgttgctaagtgatgttgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttg 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 3647 - 3249
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttg 147  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |  ||     
T  3647 ctaggagttaaagtgaagcttgggctagg-atttgagctaattaaggcaagggggttagaattcaatcataatcaattagttgtaatttttccctaattt 3549  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
     |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| ||||| |||||||||| |   |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||    
T  3548 catgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgctcatagttgttgaaattcgtgcgcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtga 3449  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3448 taattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgggctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttga 3349  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||| | | | ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  3348 attgtgatga-aatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgagttgatgatg 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 444
Target Start/End: Original strand, 808 - 1195
Alignment:
Q  44 gagatcctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaa 141  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||     
T  808 gagattctatgagctaaattgaagcttgggctagg-attttttctaactaaggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttcat 906  T
Q  142 ttgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaatt 241  Q
    |  ||| |||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  907 taattgcatgattaagtgcttaattaaataagtgattatttgttcatagttgttaaaattcgtgttctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaatt 1006  T
Q  242 ggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgtt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||   ||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  1007 ggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgggaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttgtt 1106  T
Q  342 gttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttga 439  Q
                    | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  1107 ----------------aatcatgtttaattgatgttgttgttgctaaggaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttga 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 444
Target Start/End: Original strand, 70158 - 70555
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatca-tttagtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| |||    
T  70158 ctaggagcaaaaatgaagcttaagctagggggattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttttgtg-aaattttcaattattg 70256  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgtt-aaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||    
T  70257 tatgaataagtgattaaatgtataattgattaattgttcatagatgttaaaaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatga 70356  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttga 346  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||| ||    |||| ||  |  |||| ||||||||| | | ||||||||| ||| ||||||||||    
T  70357 taattcaattattgtt-gtgaatttgcatgttcaaagtgtgtatgagtgctaacttgtgaattatgctcaattgggtgaattatgttatattgttgttga 70455  T
Q  347 attgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||| || | ||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  70456 attatgatgaggaccatgttcaattgatgttgttattgctaagtgatgttgttgttgatgattcttggcttgggtattcataattcatgaattggtgatg 70555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 90 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 498 - 150
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  498 actaaggtaagggggttagaattaatcataatcacttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgttca 401  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  || ||||||||  |||| |     
T  400 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaaattcatgtttcaagtgta 301  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     ||||  | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  300 tgaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgat 202  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatt 436  Q
    | || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  201 atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 61163 - 60810
Alignment:
Q  88 taactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgtt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  61163 taactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtt 61065  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagta 285  Q
    ||||| || | |||||||||||| |||||||||   |||||| |||||||||  ||    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  61064 cataaatgatgaaattcgtgctctaattatgataacatgtttagatgtatgatgttatgaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagta 60965  T
Q  286 tgagaaagtgatatatgtt-gaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    ||| |||  | ||| ||||  |||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  60964 tgaaaaatgggtatgtgttaaaaatatact-taattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 60866  T
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
     || || || |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  60865 atatgtcatgttgttgatgataattcatgacttgggtttgcatgattcatgatttg 60810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 422
Target Start/End: Original strand, 70598 - 70847
Alignment:
Q  174 tgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga-taattgaattgttgttggtgaaattt 272  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| || ||||| ||  ||||     
T  70598 tgattaattgttcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttaatgaataattgatttattgttagttgaatta 70697  T
Q  273 catgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaat 370  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | |||||| ||||||||| |||| |||||| ||| |    
T  70698 catgttcaaagtatga-aaagtaggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcatt 70795  T
Q  371 tgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||||||||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  70796 ggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgacttgggtt 70847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 232
Target Start/End: Original strand, 79780 - 79925
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | || || |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  79780 ctaactaagctaagggggttagaattgatcataatcactcattgtaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 79877  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatg 232  Q
    |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  79878 tcataaatgatgaaattcatgctctaattatgatgacatgtttagatg 79925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 172152 - 171933
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  172152 aaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaa-ttgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaa-taggaacaaatga 172055  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | |||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| | | || ||| ||||     
T  172054 taagttgtgaaaattgtgct-aaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatg 171956  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggctt 417  Q
    |||| |||||||| |||| ||||    
T  171955 ttgtggttgatgaatcattgctt 171933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 177855 - 177636
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    |||| |||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  ||| |||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  177855 aaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaa-ttgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaa-taggaacaaatga 177758  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | |||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| | | || ||| ||||     
T  177757 taagttgtgaaaattgtgct-aaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatg 177659  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggctt 417  Q
    |||| |||||||| |||| ||||    
T  177658 ttgtggttgatgaatcattgctt 177636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 386
Target Start/End: Original strand, 165093 - 165163
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  165093 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagttttaattgatgttgttgttgct 165163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 438
Target Start/End: Original strand, 11459 - 11811
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttc 186  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||||||   || |||||||||||||    
T  11459 ctaactaaggtatgggggttagaattcatcataatcacttattgcaatttttaattatttgtatgaa-aagtgtttaattgttgaattgattaattgttc 11557  T
Q  187 ataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtat 286  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||    
T  11558 ataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttgttgattgaattacatgttcaaagtat 11657  T
Q  287 gagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
    || |||  | ||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||     
T  11658 gaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgct-taattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttga 11756  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    || || || |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  11757 tatgtcatgttgttgatgataattcatgacttgggtttgcataattcatgatttg 11811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30254 - 29962
Alignment:
Q  154 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattg 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | || || | ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  30254 taagtgcttaattgagtaagtgattattttgctc-tagtagttaaaattcgtgctcttactatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattg 30156  T
Q  253 aattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 352  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30155 aattgttgtaggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattttgctctaattgttgaattgtgctatgtttttgttgaattgtg 30056  T
Q  353 gtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggttc--ataattcatgatttgatgatg 444  Q
     | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||| |||||| |||||||||    
T  30055 atgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagcgatattgttgttgatgattcatagcttgggtacgtataaatcatgaattgatgatg 29962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22351 - 22022
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt-tcataat 191  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||   | |||||| |  ||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||| || | ||||| |    
T  22351 aggtaagggggttagatttcaatcatagtcaattagttgtaattttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgaataagtgattatttttctcatagt 22252  T
Q  192 tgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaa 291  Q
    |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  22251 tgttgaaattcgtgctcttgctatgatgttatgtttgagtatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaa 22152  T
Q  292 agtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtg 391  Q
    | || |||||  |||| | ||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  22151 aatggtatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgggctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgttaagag 22052  T
Q  392 atattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22051 atattgttgttgatgattcacagcttgggt 22022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 108369 - 108033
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-g 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |    
T  108369 ctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttaattgaataagtgattattttg 108270  T
Q  184 ttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaag 283  Q
     || ||  |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  108269 ctcttacatgttgaaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatag 108170  T
Q  284 tatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggt-aagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    |||| |||| || |||||  |||| ||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  108169 tatgtgaaaatggtatattatgaattatgctctaaatgttgaattatgct-tgttattgttgaattgtgatgaaga-tcatgtttaattgatgttgttgt 108072  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  108071 tgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggt 108033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0670 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0670
Description:

Target: scaffold0670; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 421
Target Start/End: Original strand, 7573 - 7899
Alignment:
Q  98 aagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgt 194  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |  |||||||  |||||||||| |||| ||| |||||| || |||| || ||||    
T  7573 aaggggtttagatttcaatcataatcacttagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgcttatttgaataagtgattattttgttcttagttgt 7672  T
Q  195 taaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt 294  Q
    | ||||| ||||||   |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |    
T  7673 tgaaatttgtgctcttgttatgatgatatgtttgactacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaat 7772  T
Q  295 gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    |||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7773 gatatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaagagata 7872  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7873 ttgttgttgatgattcatagcttgggt 7899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 94 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 37910 - 37556
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| || | || ||     
T  37910 aggtaaggaggttagagttcaatcataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttgctc-tag 37812  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  37811 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgaaaattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 37712  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || || |||||  |||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |   ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  37711 aaatggtatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattgtgctatgttattgttgaattgagacgagaatcatgtttaattgatgttgttgttgttaaga 37612  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  37611 gatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatg 37556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 437
Target Start/End: Original strand, 252902 - 253231
Alignment:
Q  110 attcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgct 207  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  252902 attcatcataatcacttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattgattaattgtgcataaatgataaaattcgtgct 252999  T
Q  208 ccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttg-a 306  Q
       |||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  253000 ttgattatgatgacatgtttggatgtatgaagttagggataattgaattgttgttagttgaattacattttcaaagtatgagaaattggtatatgttgaa 253099  T
Q  307 aatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatg 406  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||| ||||     
T  253100 aatatgctc-aattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgata 253198  T
Q  407 attcatggcttgggtt--cataattcatgattt 437  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  253199 attcaaggcttgggtttgcatgattcatgattt 253231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 247458 - 247542
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||    
T  247458 aaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaa 247542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 371 - 43
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgttcat 188  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  371 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcat 274  T
Q  189 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 288  Q
    || || | |||||||||||| ||| ||||    |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  273 aaatgatgaaattcgtgctctaatgatgac---atgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattgcatgttcaaagtatga 177  T
Q  289 gaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  176 gaaattggtatatgttgaaaatatgctcaattcgt-gaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgcta 78  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  77 tgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtt 43  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 370 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3541
Alignment:
Q  370 ttgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3593 ttgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtt 3541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 155 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5231 - 4939
Alignment:
Q  155 aagtgcttaattgagtaaatga-ttaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattga 253  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||    
T  5231 aagtgcttaattgggtgaattaattaattgttcataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattga 5132  T
Q  254 attgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 352  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||| ||||||||||  || |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5131 attgttgttagttgaattacatgttcacagtatgagaagttggtatatgttgaaaatatgcttaa-ttggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtg 5033  T
Q  353 gtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  5032 ataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttggttgttcataattcatgatttgctgatg 4939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Original strand, 34476 - 34559
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  34476 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 323 - 407
Target Start/End: Original strand, 34601 - 34686
Alignment:
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatga 407  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  34601 tgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 34686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 87 - 393
Target Start/End: Original strand, 24618 - 24924
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  24618 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgaaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattaggtgaattgattaattgt 24715  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
     ||||| || | ||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  24716 ccataaatgatgaaatttgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttattgataattaaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 24815  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaa-atatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24816 atgaaaaatgggtatgtgttgaacatatgctcaa-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgtt 24914  T
Q  384 gctaagtgat 393  Q
    | ||||||||    
T  24915 gttaagtgat 24924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 95096 - 95026
Alignment:
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  95096 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgat 95026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 116; Significance: 8e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 87 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1672 - 1321
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||   ||||| || ||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||    
T  1672 ctaactaaggcaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaatt---caattatttgtatgaa-aagtggttaattgaatgaattgattaattgt 1577  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
      |||| || | |||||||||||| ||| ||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  1576 gtataaatgatgaaattcgtgctctaatcatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattgaattgttggtggttgaattacatgttcaaagt 1477  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| || ||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1476 atgaaaaatgggtatgtgatgaaaatatgcttaa-ttggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 1378  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    | || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  1377 gatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 1321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 437
Target Start/End: Original strand, 11546 - 11892
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  11546 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 11643  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| |     
T  11644 taaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgccatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttcttggttgaattacatgttcaaagtgta 11743  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
     |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||   |||||||||||     
T  11744 tgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaat---tgttgttgttgt 11839  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11840 taagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttgcataactcatgattt 11892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22713
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || |||| || |||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  23048 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaatttt-caattatttgtatcaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgt 22951  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  22950 tcataaatgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttttgaataattgaattgttgttagttgaattacatgttcaaagt 22851  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    |||| |||  | ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  | |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22850 atgaaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtt 22752  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | |  || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22751 gttttgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 22713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 128185 - 128269
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  128185 aaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa 128269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 7924 - 7591
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  7924 actaaggtaagggggttagaattcatcataattacttattgtaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 7827  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgt-tatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtat 286  Q
    ||| || | |||||| || || ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  7826 taaatgatgaaattcatgatctaattatgatgcctatgtttagatgtatgaagttataaataattgaattgttgttggttgaattacatgttcaaagtat 7727  T
Q  287 gagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
    || |||  | |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| | |||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  7726 gaaaaatgggtatatgatgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgt 7628  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7627 taagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 7591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 418
Target Start/End: Original strand, 11582 - 11929
Alignment:
Q  72 agctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgag 169  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||      
T  11582 agctagggagattaatctaactaagctaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattgga 11679  T
Q  170 taaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaa 268  Q
    | ||| |||||||||||||||  || | ||||| || ||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||||||   |    
T  11680 tgaattgattaattgttcatatgtgatgaaatttgtactctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggatga 11779  T
Q  269 atttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttc 367  Q
    ||| |||||||||||||||| |||  | |||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||| || |||| |||||| ||    
T  11780 attacatgttcaaagtatgaaaaatgggtattagttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatc 11878  T
Q  368 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||    
T  11879 aattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttg 11929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 384
Target Start/End: Original strand, 89717 - 90050
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| |||    
T  89717 ctaggagctaaattgaagcctaagctagggagattaatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatctttttagtgtaatttt-caattattg 89815  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  89816 tatgaataagtgattaattggataattgattaattgttcatagatgttaaa-ttcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgat 89914  T
Q  248 aattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaa 347  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||   ||||  ||  |  |||| ||||||||| |   || |||||||||| || ||||||||    
T  89915 acttgaattgttgtt-gtgaatttgtatgttcaaagtgtgtataagtactaacttgtgaattatgctcaattgagtggattatgctatattattgttgaa 90013  T
Q  348 ttgtggt-aagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    || || | ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  90014 ttatgatgaaga-ccatgttcaattgatgttgttgttg 90050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 444
Target Start/End: Original strand, 90037 - 90093
Alignment:
Q  390 tgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  90037 tgatgttgttgttgatgattcatgacttgggtgttcataaatcatgatttgatgatg 90093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 107994 - 107910
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  107994 aaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 107910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 204 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7642 - 7400
Alignment:
Q  204 tgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgt 303  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| |||| ||||||||      
T  7642 tgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattattgttggtgaaattgcattctcatagtatgtgaaaatgatatattg 7543  T
Q  304 tgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttg 403  Q
    |||| | ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |     
T  7542 tgaattgtgctataaatgttgaattgtgctatgctgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatattgttgcta 7443  T
Q  404 atgattcatggcttgggt--tcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7442 atgattcatggcttgggtactcataaatcatgatttgatgatg 7400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 204 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17067 - 16825
Alignment:
Q  204 tgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgt 303  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| |||| ||||||||      
T  17067 tgctctaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattagtgataattgaattattgttggtgaaattgcattctcatagtatgtgaaaatgatatattg 16968  T
Q  304 tgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttg 403  Q
    |||| | ||||  || ||||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |     
T  16967 tgaattgtgctataaatgttgaattgtgctatgctgttgttgaattatgatgagaatcatgtttaattgatgttggtgttgctaagagatattgttgcta 16868  T
Q  404 atgattcatggcttgggt--tcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  16867 atgattcatggcttgggtactcataaatcatgatttgatgatg 16825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 38655 - 38320
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || || | |||||||||    
T  38655 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaattatttgtatgaa-aagtgcttaattgggtgaattaattaattgt 38558  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |||||| || | |||| || |||| ||||||||||  |||||| ||| |||||| ||    ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||     
T  38557 tcataaatgatgaaatacgcgctctaattatgatgacatgtttagatttatgaatttatgaataattgaatttttgttggttgaattacatgttcaaagg 38458  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgtt 383  Q
    | ||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  38457 aagagaaatgggtatatgttgaaaatatgctc-aattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgtt 38359  T
Q  384 gctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | | ||| || |||||| |||| ||||||  ||||||||    
T  38358 gtttagtcatgttgttgatgataattcataacttgggtt 38320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 92 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1732 - 1385
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || | |||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||    
T  1732 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttggatga-taagtgcttaattgggtgaattgattaattgttccta 1636  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
      || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  1635 tgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttggttgaattatatgttcaaagtatgag 1536  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaa 388  Q
    ||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| ||||||||     
T  1535 aaattggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttgttgaattatgttatgtgattgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctat 1437  T
Q  389 gtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    || || |||||| |||| | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  1436 gtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcatgattcatgatttg 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25637 - 25377
Alignment:
Q  154 taagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattg 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || | || || ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||||||||||| |||||    
T  25637 taagtgcttaattgagtaagtgattattttgctcttagttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgaaaattg 25538  T
Q  253 aattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtg 352  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||  |||| | ||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  25537 aattgttgttggtgaaattgcctgttcatagtatgtgaaaatgatatattgtgaattgtgctttaattgttgaattgtgctatgttcttgttgatttgtg 25438  T
Q  353 gtaagattcatgttcaattgatg-ttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcat 412  Q
     | ||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  25437 atgagattcatgtttaattgatgattgttgttattaagaaatattgttgttgatgattcat 25377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Original strand, 715 - 1047
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  715 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttattgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattgagtgaattgattgattgttca 812  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||| ||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  813 tatgtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattggattgttgttagatgaattacatgttcaaagtatg 912  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
    | |||  | |||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||| ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  913 aaaaatgggtatgagttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgat 1011  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    | || || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1012 atgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 1047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 101 - 422
Target Start/End: Original strand, 6749 - 7073
Alignment:
Q  101 ggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaattgagt-aaatgattaattgttcataattgttaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||||||  || | ||    
T  6749 ggggttagaattcatcataatcacttattgcaa-ttttcaattatttgtatg-atcagtgcttaattgggtgaattgattaattgttcatatgtgatgaa 6846  T
Q  199 attcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gat 297  Q
    |||||||||| ||||| || |  |||||| |||||||||| ||    ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |  |||| | | |    
T  6847 attcgtgctctaattacgaggacatgtttagatgtatgaagttatgaatagttgaattgttgttggttgaattacatgttcagagtgtatgaaaatgggt 6946  T
Q  298 atatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaa---ttgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    || |||  |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||   ||| ||||||||||| | ||| ||     
T  6947 atgtgtgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatg 7045  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7046 ttgttgatgataattcatggcttgggtt 7073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25564 - 25218
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcat 188  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  25564 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcacttattgcaatttt-caattatttgtatgaa-aagtgcttaattggatgaattgattaattgttcat 25467  T
Q  189 aattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatga 288  Q
    || || | ||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||  |||| |      
T  25466 aaatgatgaaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtag 25367  T
Q  289 gaaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    ||||  | |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||    
T  25366 gaaaagggtatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgata 25268  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgatt 436  Q
     |  || |||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25267 tggcatgttgttgatgataattcatggcttgggttgcatgattcatgatt 25218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 25205 - 24965
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  || ||||||||  |||| |  ||||  |     
T  25205 aaatttgtgctctatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaaattcatgtttcaagtgtaggaaaaggg 25106  T
Q  297 tatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatat 395  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||| || |  || |    
T  25105 tatatgttgaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgt 25007  T
Q  396 tgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgatt 436  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  25006 tgttgatgataattcatggcttgggttgcatgattcatgatt 24965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 48498 - 48153
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  48498 actaaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 48403  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  48402 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatg 48303  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    | |||  | ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||| | || |||||| ||    
T  48302 aaaaatgggtatgtgttaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgtta 48204  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    ||  || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48203 agccatgttgttgatgataattcatggcttgggttgcataattcatgattt 48153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 61946 - 61601
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  61946 actaaggtaagggg-ttagaatttatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 61851  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    || |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||    
T  61850 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgaaatgtttagatgtatgaagttatgaatgattgaattgttgttagttgaattttatgttcaaagtatg 61751  T
Q  288 agaaagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgcta 387  Q
    | |||  | ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||  ||| |||||| ||||||| | || |||||| ||    
T  61750 aaaaatgggtatgtgttaaaatatgctcaa-ttggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgtta 61652  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt-cataattcatgattt 437  Q
    ||  || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  61651 agccatgttgttgatgataattcatggcttgggttgcataattcatgattt 61601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14388 - 14096
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagtgc-aatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||   |||| |||| |  ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| || | || ||     
T  14388 aggtaagggggttagagttcaatcataatcaattagttataattcttcattaattgcatgcttaagtgcttaattgagtaagtgattattttgctc-tag 14290  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  14289 ttgttaaaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgctggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 14190  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttg 384  Q
    || || |||||  |||| | ||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14189 aaatggtatattgtgaattgtgctctaaatgttgaattatactacgttattgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgttg 14096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 436
Target Start/End: Original strand, 10 - 355
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||| |||| |||    
T  10 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaaatgttaata 106  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
    | || | |||||||||||  | ||||||||  |||||| |||||||||| ||   |||||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||    
T  107 aatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttagatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagtatgag 206  T
Q  290 aaagtgatatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaa 388  Q
    ||  || |||||||||||| |||||| || | || |||||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||| ||     
T  207 aagttggtatatgttgaaaatatgcttaattcgt-gaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatat 305  T
Q  389 gtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatt 436  Q
    || || |||||| |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  306 gtcatgttgttgatgataattcatagcttgggtttgcatgattcatgatt 355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 380
Target Start/End: Original strand, 6304 - 6591
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||    
T  6304 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaactgttcata 6400  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
    | || | |||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||    
T  6401 aatgatgaaattcgtgctatatttatgatgacatgtttggatgtatgaagttatggataattggattgttgttagttgaaatacatgttcaaagtatgag 6500  T
Q  290 aaagtgatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgtt 380  Q
    ||  || ||||||||| |||||||||  ||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  6501 aagttggtatatgttgaaaatatgct-taattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgtt 6591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 15226 - 14899
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgt-tgtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  15226 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatatgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttca 15130  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||| || | |||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| ||    |||||||||||| |||| || | ||| |||||||||||| |     
T  15129 taagtgatgaaattcgtgctctaattatgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattg-tgttagttagattacatgttcaaagtgta 15031  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgct 386  Q
     |||| | | ||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| || | |||||| |||||   ||||||||||| |    
T  15030 tgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaat---tgttgttgttgtt 14935  T
Q  387 aagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt 422  Q
     ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14934 tagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtt 14899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 418
Target Start/End: Original strand, 254708 - 255035
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttca 187  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||  || ||||||||||||||    
T  254708 actaaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaa--tttcaattatttgtatg-ataagtgtttaattggatgaattgattaattgttca 254804  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| |||| |||||  ||| || |||||||||| ||    |||||||||||||||| | || |||| |||||||||||| |     
T  254805 tatatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgtagttg-aattacatgttcaaagtgta 254903  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
     |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  254904 tgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttga 255002  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    || || || |||||| |||| ||||||||||||    
T  255003 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 255035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 418
Target Start/End: Original strand, 261314 - 261641
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttca 187  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||  ||||||| ||||||| |||||| ||  || ||||||||||||||    
T  261314 actaaggtaagggggatataattcatcataatcacttattgtaa--tttcaattatttgtatg-ataagtgtttaattggatgaattgattaattgttca 261410  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatg 287  Q
    ||  || | |||||||||||| |||| |||||  ||| || |||||||||| ||    ||||||||||||| || | || |||| |||||||||||| |     
T  261411 tatatgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgcttagatgtatgaagttatgaataattgaattgtagtagttg-aattacatgttcaaagtgta 261509  T
Q  288 agaaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgc 385  Q
     |||| | | ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  261510 tgaaaatgggtatgtgttgaaaatatgctc-aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttga 261608  T
Q  386 taagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    || || || |||||| |||| ||||||||||||    
T  261609 tatgtcatgttgttgatgataattcatggcttg 261641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Original strand, 123180 - 123403
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| || ||  || |||    
T  123180 aaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-taggaacaaatga 123277  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||  |||  | || ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| ||||     
T  123278 taagttgtgaaaattgtgctc-aattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatg 123376  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||    
T  123377 ttgtggttgatgaataatggcttgggt 123403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 67
Target Start/End: Original strand, 123010 - 123062
Alignment:
Q  15 aagaagaacttgaagattcaagagttggagagatcctaggagctaaagtgaag 67  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  123010 aagaagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaag 123062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 418
Target Start/End: Original strand, 874 - 1095
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||| ||    
T  874 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtaaatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtga 973  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagt 390  Q
    || ||      | || | | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| || |     
T  974 aaatg------ggtgtattgtgctctaattgttgaattgtgctatgttgttgttgaaatgtggggagattcatgtttaattgatgttgttgttgttatga 1067  T
Q  391 gatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  1068 gatatcgttgttaatgattcatagcttg 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8843 - 8606
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattca-tcataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |  |||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| || |||| ||     
T  8843 aggtaagggggttagatttcaatcataatcaattagttgtaatttttccttaattgtatgcttaagtgcttaattgaataagtgattattttgttcttag 8744  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    || || ||||||||||||   || ||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8743 ttattgaaattcgtgctcttgttgtgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatagtatgtga 8644  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaatt 328  Q
    || ||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||    
T  8643 aaatgatatattatgaattgtgctctaattgttgaatt 8606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 1944 - 1832
Alignment:
Q  333 tatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt-tcataattca 431  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||    
T  1944 tatgttgttgt-gaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgatgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtgtcataaatca 1846  T
Q  432 tgatttgatgatgt 445  Q
    ||| ||||||||||    
T  1845 tgaattgatgatgt 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 191 - 421
Target Start/End: Original strand, 2766 - 2999
Alignment:
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| |||||||| |||   |||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||| | |||| ||    
T  2766 ttgttgaaattcgtactcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaatcgttgttgataaaattgcattttcataatatgtga 2865  T
Q  291 aagtgatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgtt---gttgttgcta 387  Q
    || || |||||  |||| | ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||||   ||||||| ||    
T  2866 aaatggtatattgtgaattgtgctctaattgttgaattgtattatgttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaatttatgttgttgttgttgtta 2965  T
Q  388 agtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2966 aaagatattgttgttgatgattcatagcttgggt 2999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 438
Target Start/End: Original strand, 617 - 761
Alignment:
Q  296 atatatgttgaaa-tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||     
T  617 atatatgttgaaaatatgctcat-ttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatg 715  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  716 ttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatgatttg 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 19453 - 19230
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  19453 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 19356  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||     
T  19355 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 19257  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19256 ttgttgttgatgaatcattgcttgggt 19230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 21537 - 21314
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  21537 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 21440  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||     
T  21439 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatg 21341  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21340 ttgttgttgatgaatcattgcttgggt 21314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 1362 - 1490
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||    
T  1362 ctaggaactaaagtgaagcttgagctagg-aattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtg-tagttttcatttgttgt 1459  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgatta 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1460 atgaataagtgcttaattgaataaatgatta 1490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 309 - 444
Target Start/End: Original strand, 15953 - 16090
Alignment:
Q  309 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 408  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||   |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15953 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgat 16052  T
Q  409 tcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    | ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16053 ttatgacttgggtattcataattcatgaattgatgatg 16090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 444
Target Start/End: Original strand, 2969 - 3106
Alignment:
Q  309 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 408  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||   |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2969 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgat 3068  T
Q  409 tcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    | ||| | ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3069 ttatgacatgggtattcataattcatgaattgatgatg 3106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 375 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5251 - 5180
Alignment:
Q  375 gttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  5251 gttgttgttgctatgtgatattgttgttggtgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 208
Target Start/End: Original strand, 5567 - 5689
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcattt-agtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgtt 185  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5567 ctaactaagataagggggttataattcatgataatcattttagtgtaatttttcaattattatatgaataagtgcttaattgaataagtgattaattgtt 5666  T
Q  186 cataattgttaaaattcgtgctc 208  Q
    ||||  |||||||| | ||||||    
T  5667 catagatgttaaaacttgtgctc 5689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5806 - 5595
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||| | |  ||     
T  5806 ctaggagctaaattgaagcttgggctagg-atttttgctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaattttttattaattc 5708  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
     |||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  5707 catgt-taagtgcttaattgaataagtgattatttgttcatcatttttgaaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgat 5609  T
Q  248 aattgaattgttgt 261  Q
    ||||||||||||||    
T  5608 aattgaattgttgt 5595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 13857 - 13530
Alignment:
Q  91 ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcat------ttagtgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | | | |||||| ||||||  |||||||    
T  13857 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgt 13758  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
    |  |||        |||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||  |    
T  13757 tgctaa--------attcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaat-t 13668  T
Q  285 atgagaaagtgatatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    |||  ||| ||  |  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||  ||||||||||||||||||||||    
T  13667 atgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaa-ttgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgt 13569  T
Q  383 tgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    || ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13568 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggt 13530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 500 - 372
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatc-taactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgttgt 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  500 ctaggagctaaagtgaagcttgagctagg-aattggtgataactgaggtaagggggttagaattcattgtaatcatttagtgtagtttt-catttgttgt 403  T
Q  149 atgaataagtgcttaattgagtaaatgatta 179  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  402 atgaataagtgcttaattgaataagtgatta 372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 444
Target Start/End: Original strand, 4436 - 4573
Alignment:
Q  309 tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgat 408  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||   |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4436 tatgctcaattggttgaattatgctatgatgtttttgaattatgaagagaaccatgtttaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgat 4535  T
Q  409 tcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    | |||  |||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  4536 ttatgatttgggtattcataattcatgaattgatgatg 4573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 375 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1663 - 1592
Alignment:
Q  375 gttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  1663 gttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 1592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 258
Target Start/End: Original strand, 26843 - 27051
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaactaaggtaagggggttagaattcatc-ataatcatttagt-gcaatttttcaattgttg 147  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||   |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |  ||     
T  26843 ctaggagctaaattgaagcttgtgctagg-atttttgctaactaaggtaagggggttagaattcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattc 26941  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgat 247  Q
     |||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  26942 catgt-taagtgcttaattgaataagtgattatttgttcatcattgttgaaaatcgtgctataattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgat 27040  T
Q  248 aattgaattgt 258  Q
    |||||||||||    
T  27041 aattgaattgt 27051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 421
Target Start/End: Original strand, 12769 - 12958
Alignment:
Q  233 tatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtg-atatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatg 331  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||  ||| || |||| |  |||| | ||||| |||||||||||| ||    
T  12769 tatgaaattattcataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcataatatgttaaaatggatatgttgtgaattgtgctctaattgttgaattgtg 12868  T
Q  332 ctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||||||||  ||||||   ||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12869 ctatgttgttgttgatgtgtggtggaattcatgtttaaatgatgttgttgttgttatgagatattgttgttgatgattcataacttgggt 12958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 421
Target Start/End: Original strand, 33363 - 33638
Alignment:
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    |||| ||||||||||| |||| | | |||||| || || | ||||| || ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |  ||||| |||||||    
T  33363 tatgcataagtgcttatttgaatgagtgattattttgtacttaatttttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacatgaatttggtga 33462  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    ||||| ||||| ||| | |||||||  ||||||| | ||||||||| | | |||||  | || | ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  33463 taattaaattgatgtagatgaaattgaatgttcataatatgagaaaataggtatattataaattgtgctctaattgttaaattgtgttatgttgttgttg 33562  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    || |||||| |||||||  || |||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  33563 aaatgtggtgagattcacatttaattgatgttgttgttgtcatgagatattattgttgatgatttatagcttgggt 33638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20274
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  20524 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 20428  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgag 289  Q
      || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||||||| |  |    
T  20427 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagtgtatg 20328  T
Q  290 aaagt-gatatatgttg-aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttg 342  Q
    ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  20327 aaaatagatatatgttgaaaatatgctc-aattggttaattatgctttgttgttg 20274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48434 - 48350
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  48434 aaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 48350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 301
Target Start/End: Original strand, 67791 - 68001
Alignment:
Q  94 aggtaagggggttagaattcat-cataatcatttagt-gcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaatt-gttcataa 190  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| | ||||||||  |  |||||||  |||||| |||||||| ||| |||||| || | || ||     
T  67791 aggtaagggggttagatttcaaacataaccaattagttgtaatttttccctaattgtatgcttaagtgattaattgaataagtgattactttgctcttag 67890  T
Q  191 ttgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgaga 290  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  67891 ttgttgaaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgagtacgtgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtga 67990  T
Q  291 aagtgatatat 301  Q
    || ||||||||    
T  67991 aaatgatatat 68001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 421
Target Start/End: Original strand, 68004 - 68106
Alignment:
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattg----atgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttg 418  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| | || || |||||    |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| || |||||    
T  68004 tgaattgtgctatgttgttgttgatttgtgatgagaattatatttaattgatgtatgttgttgttgttaagatacattgttgttgatgatttatagcttg 68103  T
Q  419 ggt 421  Q
    |||    
T  68104 ggt 68106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 12898 - 12788
Alignment:
Q  311 tgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattc 410  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  12898 tgctctaattgtttaattgtgctatgttgttgttgatttgtggtggaattcatgtttaattgatgttgttgttgttatgagatattgttgttgatgattc 12799  T
Q  411 atggcttgggt 421  Q
    ||  |||||||    
T  12798 ataacttgggt 12788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 317 - 418
Target Start/End: Original strand, 17441 - 17542
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17441 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtggttaagagatattgttgttgatgattcatggct 17540  T
Q  417 tg 418  Q
    ||    
T  17541 tg 17542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 317 - 418
Target Start/End: Original strand, 61354 - 61455
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  61354 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgtggttaagagatattgttgttgatgattcatggct 61453  T
Q  417 tg 418  Q
    ||    
T  61454 tg 61455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 48845 - 48761
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  48845 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 48761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4677 - 4351
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctaggga-attgatctaactaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-g 147  Q
    |||||||| ||| |||||  | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||||| ||||| || |    
T  4677 ctaggagcaaaattgaagcctaagctagggagattaatcta-ctaaggtaagggggttagaattcatcataatcacgtt-tgtaatttt-caattatttg 4581  T
Q  148 tatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcataattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtga 246  Q
    ||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||| |||||    |    
T  4580 tatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcataagtgatgaaattcgtgctctaattataatgacatgtttagatgtatcaaattatgaa 4482  T
Q  247 taattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagt-gatatatgttgaaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttg 345  Q
    ||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||| |  |||| | | ||| |||  ||||||| || ||||| ||||||||||  |||||||| ||    
T  4481 taattgaattg-tgttagttgaattacatgttcaaagtgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaatatgttc-aattggtgaattatgcattgttgttgatg 4384  T
Q  346 aattgtggtaagattcatgttcaattgatgttg 378  Q
    ||||||| |||| || ||| ||||||| |||||    
T  4383 aattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 41776 - 41672
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  41776 aattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgct 41677  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  41676 tgggt 41672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 41895 - 41812
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  41895 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 336 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3305
Alignment:
Q  336 gttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatg 433  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T
Q  434 att 436  Q
    |||    
T  3307 att 3305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 385 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 147612 - 147550
Alignment:
Q  385 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgatttgatgatgt 445  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  147612 ctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataatccatgatttgatgatgt 147550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 238
Target Start/End: Original strand, 2959 - 3106
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaatt-gttgtatgaataagtgcttaatt-gagtaaatgattaattgttca 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || || |||||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||    
T  2959 actaaggtaagggggttagaattcatcataatcactt-ttgtaa-ttttcaattatttgtatg-ataaatgcttaattggatgaattgattaattgttca 3055  T
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaa 238  Q
    ||| || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  3056 taagtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaa 3106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 368 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6033 - 5961
Alignment:
Q  368 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttggg--ttcataattcatgatttg 438  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6033 aattaatgtttttgttgctaagtgatgttgttattgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttg 5961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6063 - 6030
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaatt 83  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6063 ctaggagctaaagtgaagcttgagctagggaatt 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 32340 - 32225
Alignment:
Q  306 aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 405  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||   |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| || |||||| ||||    
T  32340 aaatatgctcaa-ttggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 32242  T
Q  406 gattcatggcttgggtt 422  Q
     ||||||||||||||||    
T  32241 aattcatggcttgggtt 32225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 422
Target Start/End: Original strand, 41963 - 42078
Alignment:
Q  306 aaatatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 405  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||   |||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||||||| | ||| || |||||| ||||    
T  41963 aaatatgctcaa-ttggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 42061  T
Q  406 gattcatggcttgggtt 422  Q
     ||||||||||||||||    
T  42062 aattcatggcttgggtt 42078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 284
Target Start/End: Original strand, 19850 - 20041
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  19850 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 19946  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
      || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  19947 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 20041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 284
Target Start/End: Original strand, 24154 - 24345
Alignment:
Q  92 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatttagtgcaatttttcaattgtt-gtatgaataagtgcttaattgagtaaat-gattaattgttcata 189  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  24154 taaggtaagggggttagtgttcatcataatcacttt-tgtaatttt-caattatttgtatga-taagtgcttaattggatgaattgattaattgttcata 24250  T
Q  190 attgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagt 284  Q
      || | |||||||||||| |||| |||||  |||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||    
T  24251 tgtgatgaaattcgtgctctaattgtgatgacatgtttagatgtatgaagttatgaataattgaattgttgttagttgaattgtatgttcaaagt 24345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 438
Target Start/End: Original strand, 24362 - 24440
Alignment:
Q  362 atgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||| |||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24362 atgttgaattgttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttg 24440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 421
Target Start/End: Original strand, 10101 - 10198
Alignment:
Q  324 gaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | |||||||||||||||    
T  10101 gaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggt 10198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30199 - 30095
Alignment:
Q  336 gttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtt--cataattcatg 433  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  30199 gttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 30100  T
Q  434 atttg 438  Q
    |||||    
T  30099 atttg 30095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 49975 - 50080
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  49975 aattgatgaattatgacatgttgtggttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgtttatgatttatggc 50074  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  50075 ttgggt 50080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Original strand, 6211 - 6334
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||| ||    
T  6211 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatgatgatacatgact 6310  T
Q  417 tgggtt--cataattcatgatttg 438  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||    
T  6311 tgggtttgcatgattcatgatttg 6334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 17532 - 17636
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  17532 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 17631  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  17632 tgggt 17636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 421
Target Start/End: Original strand, 5714 - 5813
Alignment:
Q  323 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  5714 tgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagaaatgttgttgtttatgatttatgacttgggt 5813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 1371 - 1148
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||| | ||| ||||| ||| | ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||    
T  1371 aaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaa-ttgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatga 1274  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgata 394  Q
    ||  |  |||||  | ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| | ||| | |  ||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||||    
T  1273 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgata 1175  T
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||| |||||||| | || ||||||||    
T  1174 ttgtggttgatgaataattgcttgggt 1148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 3598 - 3682
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  3598 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 3682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 550 - 634
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  550 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1311 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1311
Description:

Target: scaffold1311; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 1725 - 1673
Alignment:
Q  394 attgttgttgatgattcatggcttgggt--tcataattcatgatttgatgatg 444  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1725 attgttgtttatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgatgatg 1673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6164
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  6080 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 6164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Original strand, 31408 - 31513
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  31408 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggct 31507  T
Q  417 tgggtt 422  Q
    | ||||    
T  31508 taggtt 31513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Original strand, 972 - 1056
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  972 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 1056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 15076 - 14972
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  15076 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 14977  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  14976 tgggt 14972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2384 - 2263
Alignment:
Q  87 ctaactaaggtaagggggttagaattc-atcataatcatttag-tgcaatttttcaattgttgtatgaataagtgcttaattgagtaaatgattaattgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||||||| |  ||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||| || |    
T  2384 ctaactaaggtaagggggttagatttcaaccataatcaattagttgtaatttttcattaattgcatgattaagtgcttcattgaataaatgattatttat 2285  T
Q  185 tcataattgttaaaattcgtgc 206  Q
    | ||| ||||| ||||| ||||    
T  2284 taatagttgttgaaatttgtgc 2263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 41436 - 41331
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  41436 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatggct 41337  T
Q  417 tgggtt 422  Q
    | ||||    
T  41336 taggtt 41331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 421
Target Start/End: Original strand, 37217 - 37304
Alignment:
Q  334 atgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||| |||| |||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  37217 atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggt 37304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 13514 - 13618
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  13514 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 13613  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  13614 tgggt 13618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 21488 - 21564
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21488 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 21564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1349
Alignment:
Q  204 tgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 280  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  1424 tgctctaattatgatgatatgtttg-atacatgaaattagtgataattgagttgttgttggggaaattgcatgttca 1349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 382
Target Start/End: Original strand, 51198 - 51382
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaagtatgagaaagtga 296  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| || |  ||| |||    
T  51198 aaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaa-taggtaaaaatga 51295  T
Q  297 tatatgttgaaa--tatgctcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgt 382  Q
    ||  |  |||||  | ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  51296 taagttgtgaaaattgtgctcaa-ttggtgaattatgttatgtggttgatgaattgtgatgagaatcatgtttaattgatgttgttgt 51382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3091 - 3000
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatga 407  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| | || |||||||| || |||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||    
T  3091 aattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatga 3000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 197 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5776 - 5696
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 278  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  5776 aaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 5696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 336 - 421
Target Start/End: Original strand, 9654 - 9739
Alignment:
Q  336 gttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  || | | || | |||||||||||||||    
T  9654 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaattcatggcttgggt 9739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8701 - 8668
Alignment:
Q  90 actaaggtaagggggttagaattcatcataatca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701 actaaggtaagggggttagaattcatcataatca 8668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 5349 - 5245
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||| |||||    
T  5349 aattgatgaattgtgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagatttaattgatgttgttgttgctgagacatgttgttgtttatgatt-atggc 5251  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  5250 ttgggt 5245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 395 - 437
Target Start/End: Original strand, 3321 - 3365
Alignment:
Q  395 ttgttgttgatgattcatggcttgg--gttcataattcatgattt 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3321 ttgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattt 3365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 6671 - 6775
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 416  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| || ||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || | | || | ||||||||||    
T  6671 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 6770  T
Q  417 tgggt 421  Q
    |||||    
T  6771 tgggt 6775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 393
Target Start/End: Original strand, 1106 - 1182
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgat 393  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1106 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgat 1182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 9125 - 9042
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaa 281  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| | ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||    
T  9125 aaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatg-aatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 9042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 13347 - 13413
Alignment:
Q  215 tgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  13347 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 13413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9437
Alignment:
Q  215 tgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 9437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16335
Alignment:
Q  215 tgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaa 16335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 1974 - 2016
Alignment:
Q  50 ctaggagctaaagtgaagtttgagctagggaattgatctaact 92  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  1974 ctaggagctaaattgaagcttgagctagggaattaatctaact 2016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 278
Target Start/End: Original strand, 19926 - 20016
Alignment:
Q  188 taattgttaaaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgtt 278  Q
    |||||||| ||||||||||||   || |  |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  19926 taattgttgaaattcgtgctcatgttttagtgttatgtttgggtatgtgaaattgatgataattgaattgttgatgtggaaattgcatgtt 20016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 6343 - 6448
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgtt-caattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| |||  || ||| ||| ||||||||||||||| |||| ||  || |||||| | |||||| |||||    
T  6343 aattgatgacttatgacatgttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgatgctgagatatgttgttgattatgatttatggc 6442  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  6443 ttgggt 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17826 - 17761
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatg-ttcaattgatgttgttg 381  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  17826 aattgatgaattatgacatgttgttgttgaattgaggtgagaatcaagtttcaattgatgttgttg 17761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41976 - 41892
Alignment:
Q  197 aaattcgtgctccaattatgatgttatgtttggatgtatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 282  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||||||||   | |||||||||||||| |||| |||||    
T  41976 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaa 41892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 421
Target Start/End: Original strand, 12648 - 12752
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatg-ttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggc 415  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| || | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  12648 aattggtgaattatgc-atgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggc 12746  T
Q  416 ttgggt 421  Q
    ||||||    
T  12747 ttgggt 12752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 421
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19133
Alignment:
Q  337 ttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggt 421  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggt 19133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 45158 - 45094
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttg 381  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||| || | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  45158 aattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttg 45094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 317 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 54544 - 54480
Alignment:
Q  317 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttg 381  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||| || | |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  54544 aattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttg 54480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University