View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3812_high_3 (Length: 428)

Name: NF3812_high_3
Description: NF3812
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3812_high_3
NF3812_high_3
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (1-416)||(23257608-23258023)
chr6 (1-416)||(23251635-23252047)
chr6 (1-416)||(23247223-23247635)
chr6 (1-416)||(23266169-23266578)
chr6 (1-239)||(23283458-23283696)
chr6 (16-236)||(23391243-23391463)
chr6 (15-131)||(23587035-23587151)
chr6 (7-220)||(23289790-23290003)
chr6 (15-217)||(23633983-23634185)
chr6 (1-220)||(23506800-23507019)
chr6 (15-225)||(23583058-23583267)
chr6 (264-366)||(23289629-23289731)
chr6 (264-359)||(23283296-23283391)
chr6 (308-411)||(23391074-23391174)
chr6 (64-227)||(23506631-23506794)
chr6 (293-366)||(23593009-23593082)
chr6 (325-362)||(23633835-23633872)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (16-71)||(3996385-3996440)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23258023 - 23257608
Alignment:
Q  1 aacacaaagaccaggatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23258023 aacacaaagaccaggatttggctggggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcct 23257924  T
Q  101 gtctcaattttgcagactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23257923 gtctcaattttgcagactcggtgtggcgccttcctattccagcaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttag 23257824  T
Q  201 accagacaagactttaatgattaatgatattgacaccgtcgtacctgtcgcggccacaaaggagttgaatatgttttgtgtggaagtcgaagaagagcag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23257823 accagacaagactttaatgattaatgatattgacaccgtagtacctgtcgtggccacaaaggagttgaatatgttttgtgtggaagtcgaagaagagcag 23257724  T
Q  301 gaaatgttgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaatgtcccctacgcatagctttgagtatcatgatcagtatgaagatattcatgtacaag 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23257723 gaaatgttgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaatgtcccctacacatagctttgagtatcatgatcagtatgaagatattcatgtacaag 23257624  T
Q  401 actttcaagatgatga 416  Q
    ||||||||||||||||    
T  23257623 actttcaagatgatga 23257608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23252047 - 23251635
Alignment:
Q  1 aacacaaagaccaggatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcct 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23252047 aacacaaagaataggatttggctaggaacttttccaacagccgagatggcagcccgagcccacgatgttgccgcgatagcattgaggggccgctatgcct 23251948  T
Q  101 gtctcaattttgcagactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  23251947 gtctcaattttgcagactcggtgtggcgccttcctattccagcaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcagctacaaaagccgccgaagcttttag 23251848  T
Q  201 accagacaagactttaatgattaatgatattgacaccgtcgtacctgtcgcggccacaaaggagttgaatatgttttgtgtggaagtcgaagaagagcag 300  Q
    ||||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||| ||| |||| |  || ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||   ||    
T  23251847 accagacaatactttaatgaccagtgacattgacaccgttgtagctgttgtcgcaacacaggagctgaatatgtttcgtgttgaagtcgaagaag---ag 23251751  T
Q  301 gaaatgttgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaatgtcccctacgcatagctttgagtatcatgatcagtatgaagatattcatgtacaag 400  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23251750 gaagtgttgaatatgccagagttgtggaggaatatggcactaatgtcccctacacatagctttgggtatcatgatcagtatgaagatattcatatacaag 23251651  T
Q  401 actttcaagatgatga 416  Q
    ||||||||||||||||    
T  23251650 actttcaagatgatga 23251635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23247635 - 23247223
Alignment:
Q  1 aacacaaagaccaggatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcct 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23247635 aacacaaagaataggatttggctgggaacttttccaacaccggagatggctgcccgagcccacgatgttgctgcaatggcattgaggggccgctatgcct 23247536  T
Q  101 gtctcaattttgcagactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttag 200  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  23247535 gtctcaatttctcagactcggtgtggcgccttcctattccagcaacttccgcaataaaagatattcaaaaggcagctacaaaagcggccgaagcttttag 23247436  T
Q  201 accagacaagactttaatgattaatgatattgacaccgtcgtacctgtcgcggccacaaaggagttgaatatgttttgtgtggaagtcgaagaagagcag 300  Q
    ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||  |||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| || ||    
T  23247435 accagacaatactttaatgactaacaatattgacactatcgtagatgtcgtcgccacaaaggagctgaatatgttttgtgtggaagttgatgaacaggag 23247336  T
Q  301 gaaatgttgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaatgtcccctacgcatagctttgagtatcatgatcagtatgaagatattcatgtacaag 400  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  23247335 gaaatgttgaatatgccagagttgtggaggaatatggcgttgatgtcacctacacatagctttgagtatcatg---agtatgacgatattcatgtacaag 23247239  T
Q  401 actttcaagatgatga 416  Q
    | ||||||||||||||    
T  23247238 attttcaagatgatga 23247223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 23266578 - 23266169
Alignment:
Q  1 aacacaaagaccaggatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcct 100  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  23266578 aacacgaagactagaatttggctaggaacttttccaacagccgagatggcagcccgagcccacgatgttgctgcgatggcattgaggggtcgctacgcct 23266479  T
Q  101 gtctcaattttgcagactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttag 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  23266478 gtctcaattttgcagattcggtgtggcggcttcctattccagcaacttcctcaataaaagatattcaaaaggcagctacaaaagccgccgaagcttttag 23266379  T
Q  201 accagacaagactttaatgattaatgatattgacaccgtcgtacctgtcgcggccacaaaggagttgaatatgttttgtgtggaagtcgaagaagagcag 300  Q
    ||||||||| ||| |||||||||   | ||||| || || ||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   ||    
T  23266378 accagacaatactataatgattaccaacattgagactgttgtagctgttgtcgccacaaaggagttgaatatgttttgtgtggaa---gaagaag---ag 23266285  T
Q  301 gaaatgttgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaatgtcccctacgcatagctttgagtatcatgatcagtatgaagatattcatgtacaag 400  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||    
T  23266284 gaaatgttgaatatgccggagttttggaggaatatggcactaatgtcccctacacatagctttgagtatcatgatcaatatgaagattttcattttcaag 23266185  T
Q  401 actttcaagatgatga 416  Q
    ||||||||||||||||    
T  23266184 actttcaagatgatga 23266169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23283696 - 23283458
Alignment:
Q  1 aacacaaagaccaggatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcct 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  23283696 aacaaaaagactaggatttggctagggacttttccaacggctgagatggctgcacgagcacacgacgttgcagccatggcattaaggggccgctatgcct 23283597  T
Q  101 gtctcaattttgcagactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgc-ga--taaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttt 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | ||||| ||   |||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  23283596 gtctcaactttgcagactcggtgtggaggcttcctattcctg---cctccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctgcagaagccgccgaggcttt 23283500  T
Q  198 tagaccagacaagactttaatgattaatgatattgacaccgt 239  Q
     |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23283499 cagaccagacaagactttaatgactaacgacattgacaccgt 23283458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23391463 - 23391243
Alignment:
Q  16 atttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcctgtctcaattttgcag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23391463 atttggctaggcacttttccaactgcggagatggcagcccgagcacatgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctacgcctgtctcaactttgcag 23391364  T
Q  116 actcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttagaccagacaagacttt 215  Q
    |||| | ||||||||| ||||| || |  ||  |   |  ||||||||| ||||||||||||||  | || || || ||||| ||||||||||||||||     
T  23391363 actccgcgtggcggctccctatacctgccaccactcaggcaaaagatatacaaaaggcggctgcacaggccgctgaggctttcagaccagacaagacttc 23391264  T
Q  216 aatgattaatgatattgacac 236  Q
    ||| | |||||| ||||||||    
T  23391263 aattactaatgacattgacac 23391243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23587151 - 23587035
Alignment:
Q  15 gatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcctgtctcaattttgca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  23587151 gatttggctagggacttttccaactgccgagatggcagcccgtgcccacgatgttgctgcaatggcattgaggggccgctacgcttgtctcaactttgca 23587052  T
Q  115 gactcggtgtggcggct 131  Q
    ||||| | |||||||||    
T  23587051 gactcagcgtggcggct 23587035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23290003 - 23289790
Alignment:
Q  7 aagaccaggatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcctgtctca 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23290003 aagactaggatttggctagggacttttgcaacagccgagatggctgcccgtgcacacgacgttgcagcaattgcattgaggggccgctacgcctgtctca 23289904  T
Q  107 attttgcagactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgc-ga--taaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttagacc 203  Q
    | ||||||||||||| ||||  |||||||||||| |   | ||||| ||   |||||| ||||||| ||| ||||  ||||| || || ||||| |||||    
T  23289903 actttgcagactcggcgtggaagcttcctattcctg---cctccgctgaagcaaaagacattcaaagggcagctggagaagccgctgaggctttcagacc 23289807  T
Q  204 agacaagactttaatga 220  Q
    |||||||||||||||||    
T  23289806 agacaagactttaatga 23289790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23634185 - 23633983
Alignment:
Q  15 gatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcctgtctcaattttgca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||| || || ||| | |||||||| ||||||||     
T  23634185 gatttggctagggacttttccaacggccgagatggcagcacgagcacatgatgtcgcggcattggcattaagaggtcgcaacgcctgtcttaattttgct 23634086  T
Q  115 gactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttagaccagacaagactt 214  Q
    ||||| |  | ||||||||||||||| |  ||| | | || || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23634085 gactctgcctcgcggcttcctattcctgccactacagagacaagagatatacaaaagacggctgcagaagctgccgaggctttcagaccagacaagactt 23633986  T
Q  215 taa 217  Q
    |||    
T  23633985 taa 23633983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23507019 - 23506800
Alignment:
Q  1 aacacaaagaccaggatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcct 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||||||| ||| |||| ||||  ||  || | ||||    
T  23507019 aacaaaaagaccaagatttggctaggaacttttccaacagccgagatggcagctcgggcccatgatgttgcggcactggcgttgaaaggtggcgacgcct 23506920  T
Q  101 gtctcaattttgcagactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttag 200  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |  ||| |||||||| |  |||| || || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || || ||    
T  23506919 gtctcaactttgcagactcggccttgacgctccctattcctgctacttgcgagacaaaagatatacaaaagacggctgctgaagctgctgaggcattcag 23506820  T
Q  201 accagacaagactttaatga 220  Q
    ||||| ||||||| ||||||    
T  23506819 accaggcaagactgtaatga 23506800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23583267 - 23583058
Alignment:
Q  15 gatttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcctgtctcaattttgca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | || |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23583267 gatttggctagggacttttccaactgcggagatggcaacccgtgcccacgatgttgctgcaatggcattga-gggccgctacgcctgtctcaactttgca 23583169  T
Q  115 gactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgcgataaaagatattcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttagaccagacaagactt 214  Q
    ||||| |  |||||||| || |  || | |||| |   |  ||| ||||| |||||||| ||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  23583168 gactcagcatggcggctccccaaacctgcaactactcaggcaaaggatatacaaaaggctgctgcagaggccgccaaggctttcagaccagacaagactt 23583069  T
Q  215 taatgattaat 225  Q
    || ||| ||||    
T  23583068 tattgactaat 23583058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23289731 - 23289629
Alignment:
Q  264 gttgaatatgttttgtgtggaagtcgaagaagagcaggaaatgttgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaatgtcccctacgcatagcttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23289731 gttgaatatgttttgtgtggaagtcgaaaaagaagaggaagtgttgaatatgcaagagttgtggaaaaatatggcactaatgtcccctacacatagtttt 23289632  T
Q  364 gag 366  Q
    |||    
T  23289631 gag 23289629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 264 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23283391 - 23283296
Alignment:
Q  264 gttgaatatgttttgtgtggaagtcgaagaagagcaggaaatgttgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaatgtcccctacgcatag 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  23283391 gttgaatatgttttgtgtggaagtcgaaaaagaagaggaagtgttgaatatgtcagagatgtggaggaatatggcgttaatgtcccctacacatag 23283296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 308 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23391174 - 23391074
Alignment:
Q  308 tgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaatgtcccctacgcatagctttgagtatcatgatcagtatgaagatattcatgtacaagactttca 407  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |||   | |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23391174 tgaacatgccagagttgttgaggaatatggcactaatgtctcctacacatagctctgggtataatg---aatatgaaaatattcatgttcaagactttca 23391078  T
Q  408 agat 411  Q
    ||||    
T  23391077 agat 23391074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23506794 - 23506631
Alignment:
Q  64 gatgttgccgcaatggcattgaggggccgctatgcctgtctcaattttgcagactcggtgtggcggcttcctattccagtaacttccgcgataaaagata 163  Q
    ||||| || ||| ||||||| || || ||| | ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| |  |||   | || || |||||    
T  23506794 gatgtcgcggcattggcattaagaggtcgcaacgcctgtctcaactttgcagactcggcctcgcggcttcctattcctgccactaaagagacaagagata 23506695  T
Q  164 ttcaaaaggcggctgctgaagctgccgaagcttttagaccagacaagactttaatgattaatga 227  Q
    | ||||| |||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23506694 tacaaaacgcggctgcagaagctactgaggctttcagaccagacaagactttaacgactaatga 23506631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 23593082 - 23593009
Alignment:
Q  293 aagagcaggaaatgttgaatatgccagaattgttgaggaatatggcactaatgtcccctacgcatagctttgag 366  Q
    ||||| ||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  23593082 aagaggaggaagtgttgaacattccagagtcgttgaggaatatggctctaatgtcccctacacatagcgttgag 23593009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23633872 - 23633835
Alignment:
Q  325 ttgaggaatatggcactaatgtcccctacgcatagctt 362  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23633872 ttgaggaatatggctctaatgtcccctacacatagctt 23633835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3996440 - 3996385
Alignment:
Q  16 atttggctagggacttttccaacacccgaaatggcagcccgagcccacgatgttgc 71  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  3996440 atttggctaggcacttatccaacacccgagatggcagctcgagcccatgacgttgc 3996385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University