View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3820_low_7 (Length: 795)

Name: NF3820_low_7
Description: NF3820
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3820_low_7
NF3820_low_7
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (3-780)||(27608409-27609187)
chr6 (2-775)||(27715788-27716562)
chr6 (139-780)||(27703643-27704281)
chr6 (62-780)||(27695939-27696658)
chr6 (1-757)||(28794525-28795285)
chr6 (1-780)||(27674861-27675644)
chr6 (333-780)||(27681077-27681524)
chr6 (1-740)||(26804649-26805377)
chr6 (272-780)||(27590539-27591047)
chr6 (128-627)||(28788631-28789133)
chr6 (122-731)||(31286718-31287333)
chr6 (1-757)||(26648598-26649352)
chr6 (1-757)||(26754566-26755320)
chr6 (1-233)||(27681600-27681833)
chr6 (539-757)||(28788404-28788622)
chr6 (1-694)||(25513054-25513751)
chr6 (342-730)||(26863751-26864139)
chr6 (411-695)||(26658157-26658441)
chr6 (411-695)||(26764128-26764412)
chr6 (480-757)||(26625387-26625663)
chr6 (480-757)||(26731364-26731640)
chr6 (411-694)||(25547147-25547430)
chr6 (1-308)||(25547545-25547856)
chr6 (502-694)||(26145032-26145224)
chr6 (523-694)||(25485226-25485397)
chr6 (122-233)||(26826532-26826643)
chr6 (554-730)||(27529116-27529292)
chr6 (549-711)||(26637718-26637880)
chr6 (549-711)||(26743684-26743846)
chr6 (545-731)||(26886248-26886434)
chr6 (117-308)||(25485558-25485749)
chr6 (342-694)||(25076030-25076382)
chr6 (1-308)||(26145565-26145873)
chr6 (1-456)||(27602010-27602466)
chr6 (411-694)||(25581886-25582169)
chr6 (411-694)||(26058086-26058369)
chr6 (411-694)||(26078056-26078339)
chr6 (545-711)||(27602555-27602721)
chr6 (117-238)||(26658620-26658741)
chr6 (117-238)||(26764591-26764712)
chr6 (342-730)||(27425225-27425613)
chr6 (342-730)||(26825966-26826354)
chr6 (549-692)||(26951958-26952101)
chr6 (117-233)||(26980053-26980168)
chr6 (1-99)||(27662659-27662757)
chr6 (117-230)||(26638048-26638161)
chr6 (117-230)||(26744014-26744127)
chr6 (117-230)||(25076539-25076652)
chr6 (116-233)||(26961754-26961871)
chr6 (169-320)||(26625697-26625836)
chr6 (169-320)||(26731674-26731813)
chr6 (41-238)||(26886747-26886945)
chr6 (169-233)||(25582347-25582411)
chr6 (169-233)||(26058559-26058623)
chr6 (169-233)||(26078529-26078593)
chr6 (342-462)||(27662845-27662965)
chr6 (174-232)||(26876218-26876276)
chr6 (342-684)||(26850858-26851200)
chr6 (545-588)||(26145282-26145325)
chr6 (1-87)||(26851300-26851386)
chr6 (411-456)||(27528973-27529018)
chr6 (342-510)||(26979773-26979941)
chr6 (342-465)||(26952185-26952308)
chr6 (53-97)||(26625912-26625956)
chr6 (53-97)||(26731889-26731933)
chr6 (1-163)||(26952331-26952494)
chr6 (411-462)||(26145408-26145459)
chr6 (40-87)||(26876364-26876411)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (1-780)||(29271126-29271905)
chr8 (122-750)||(22023396-22024030)
chr8 (549-600)||(15038975-15039026)
chr8 (1-86)||(22024067-22024152)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (2-775)||(15383-16157)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-757)||(1975-2735)
scaffold0277 (128-757)||(11066-11698)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-757)||(9651-10411)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-757)||(265618-266373)
chr1 (342-730)||(28125322-28125710)
chr1 (342-730)||(28130353-28130748)
chr1 (341-722)||(26138085-26138466)
chr1 (122-233)||(26138643-26138754)
chr1 (117-233)||(28130059-28130175)
chr1 (122-233)||(28125033-28125144)
[»] scaffold1870 (1 HSPs)
scaffold1870 (412-757)||(932-1277)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (122-757)||(18728950-18729576)
chr4 (413-757)||(18697139-18697483)
chr4 (545-757)||(18677428-18677640)
chr4 (413-757)||(18687351-18687695)
chr4 (413-757)||(18721810-18722154)
chr4 (545-757)||(18653346-18653558)
chr4 (342-730)||(18075942-18076330)
chr4 (122-318)||(18726447-18726645)
chr4 (122-318)||(18677014-18677210)
chr4 (122-226)||(18696857-18696961)
chr4 (122-318)||(18682171-18682369)
chr4 (122-226)||(18721528-18721632)
chr4 (1-87)||(18686941-18687027)
chr4 (122-318)||(18652932-18653128)
chr4 (122-225)||(18687063-18687166)
chr4 (413-446)||(18677296-18677329)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (347-711)||(17990853-17991217)
chr2 (172-241)||(17990606-17990675)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (342-730)||(61750-62138)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 459; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 780
Target Start/End: Original strand, 27608409 - 27609187
Alignment:
Q  3 ttcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtacct 102  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |   ||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27608409 ttcttttacttgaggaactcaatgatttgcattcgcttgcagaaagccatttaagatttggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtccct 27608508  T
Q  103 cacattaatttta-caagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccac 201  Q
    |||| |||||  | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27608509 cacagtaattagaacaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgctatatgataagtctagacatgtcacattaacaaaccac 27608608  T
Q  202 ttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgtt 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27608609 ttgagaagtattgggagacattcatctgagaggttgcaatccatgagagtaagctctgtcatatttgaaaacactattgaatacatcttatcattctgtt 27608708  T
Q  302 ttgggaagctcagcattccaaattccaattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaacca 401  Q
    ||||||| |||||| |||||  | ||| |  |||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    |||| |    
T  27608709 ttgggaacctcagcgttccatttgccactgataactcttgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcttatggaagtactaatcaacaa 27608808  T
Q  402 aatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaa 501  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27608809 aatattgtctatctttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactctcacaaccactgagattcaatttcttaagagatgccaaacctaaa 27608908  T
Q  502 ggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaat 601  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27608909 ggtggaaaacgttcgagctttctgcaaccatatgcacttaaccattcaagtttatttaggtgtccaatagaattgtgaattgtaattaaattatcacaac 27609008  T
Q  602 tttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaa 701  Q
     |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27609009 atgtaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatagttcaatgtcaagactttcatattctgaaa 27609108  T
Q  702 cttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactataatactttcagagtgatttctttt 780  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  27609109 cttctgcatacacacaaggaagaaacaaatcaataaattaaaactcaaagacaataatactttcatactgatttctttt 27609187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 775
Target Start/End: Original strand, 27715788 - 27716562
Alignment:
Q  2 attcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtacc 101  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27715788 attcttttacttgaggaactcaatgattgacatccttgtgcattaatctcttttagatttggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtacc 27715887  T
Q  102 tcacattaatttta-caagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacca 200  Q
     ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  27715888 ccacattaatttcaacaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgctatataataagtttagagatgtcatattaacacacca 27715987  T
Q  201 cttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgt 300  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27715988 cttgagaactcttcggagacattcatctgagaggttgcaatggtagagagtaagctgtgtcacatttgaaaacactattgaatacatcttatcattctgt 27716087  T
Q  301 tttgggaagctcagcattccaaattccaattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaacc 400  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  || |  ||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||    
T  27716088 tttgggaacctcagcattccatatgtcactgataacttatgaagttcactaagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtattacacaacc 27716187  T
Q  401 aaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  27716188 aaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactcctgcaagaactgagattcaattccttaagagatgccaaacctaa 27716287  T
Q  501 aggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaa 600  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27716288 aggtggaaaatgttcgaccttattgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttattaaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattataacat 27716387  T
Q  601 ttttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaa 700  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  27716388 ctttcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatatttacatcggtccaatatcaagactttcatatcctgga 27716487  T
Q  701 acttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagact-ataatactttcagagtgattt 775  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||    
T  27716488 acttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactaatattactttcatactgattt 27716562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 780
Target Start/End: Original strand, 27703643 - 27704281
Alignment:
Q  139 cactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgc 238  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27703643 cactcaggaagaattttgaaattgttgtacattaagtctagagatgtcatattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagaggttgc 27703742  T
Q  239 aattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcattccaaattccaattctaacac 338  Q
    |||  | |||| |||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | ||| |  |||| |    
T  27703743 aatggcagagagtaagttgtgtcacatttaaaaacactattgaatacatcttatcattctgttttgggaacctcagcattccatttaccactgataactc 27703842  T
Q  339 atcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattct 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27703843 atcaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatagaagtatgctgcaaccaaatattatctatatttgtcatcttgcataataattct 27703942  T
Q  439 ggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcac 538  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  27703943 ggaaaactatcgagactctcacaataacggagattcaattctttaagagatgctaaccctaaaggtggaaaacgtttgaactccctgcaaccaaatgcac 27704042  T
Q  539 ttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctga 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27704043 ttaacctttcaagtttatttaggtggccaatcgaattgtgaatcgtaattaaattatcacaatattcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctga 27704142  T
Q  639 gacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacaca-aaaggaagaaacaaatcaataa 737  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||    
T  27704143 gacatcgggtatatgtgttaaatatttacaatggtccaatgtcaagactgtcatatccgggaacttctgcataaacacaaaggaagaaac-tataaataa 27704241  T
Q  738 attaagaatcaaagactataatactttcagagtgatttctttt 780  Q
    ||||| || |||| |||   ||||||||| |||||||||||||    
T  27704242 attaaaaagcaaacact---atactttcatagtgatttctttt 27704281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 62 - 780
Target Start/End: Original strand, 27695939 - 27696658
Alignment:
Q  62 ggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtacctcacattaatttt-acaagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  27695939 ggtggaatccctctaatttcctcaagggacttgcagtacctcacaataatttccacaagatggtgactttcactaaggcactctggaagaattttgaaat 27696038  T
Q  161 tgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgt 260  Q
     | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||    ||||  ||| |||||    
T  27696039 cgctatatgataaatctagatatgtcatattaacacaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagaggtagcaatcgaagagagaaagctttgt 27696138  T
Q  261 cacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcattccaaattccaattctaacacatcaagttcactgagaatttga 360  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||  || |   ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27696139 catatttgaaaacactattgaatacatcttatcattatgttctgggaacctcaggattccatatgacactgtgaactcatcaagttcactgagattttga 27696238  T
Q  361 aatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccac 460  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |     | |    ||| |  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |   |    
T  27696239 aatgaaaatggcagttttcctatggaaatataaaatatatcaatctcttttatatgtgccatcttgcataataattctggaaaattttcgagacacgagc 27696338  T
Q  461 aatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttag 560  Q
     | |  |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  27696339 cacccatgagattaagttccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgtttgagctttctgtaaccagttacacttaacctttcaagtttacttag 27696438  T
Q  561 gtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaa 660  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27696439 gtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattcttacaatgttcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcttgagacatcgggtatatgtgttaaa 27696538  T
Q  661 tattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagact-ataat 759  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||| |    
T  27696539 tattcacaatcgtccaatgtcaagattttcatattctggaacttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactaatatt 27696637  T
Q  760 actttcagagtgatttctttt 780  Q
    ||||||| | |||||||||||    
T  27696638 actttcatactgatttctttt 27696658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 28795285 - 28794525
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||  ||  | ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||      
T  28795285 cattcttctacttgaggaactcaatgatttgcatcccattgcagaaagcctttcaagatttggtggaatccctctaatttcctcgagagacttgcagtta 28795186  T
Q  101 ctcacattaattttac-aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
      ||   |||  |||  |||| ||| | |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||   ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  28795185 tccaatctaaggttattaagaaggtaacattcactaaggcactcaggaataaatttgaaattgttccatgataagtctagcaatttcacattaacacacc 28795086  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  28795085 acttgagaaatattgggagacattcatctgagaggttgcagtcgctgagactaagctttctcaaatttgaaaacactatagaatacatttgatcattctg 28794986  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattccaattct---aacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccac 396  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||   ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||     |     
T  28794985 ttttgggaacctcatcattccacattccactactgataactcatcaagttcattgagattttgaaatgaagatggcaattctcctatggaagtataagat 28794886  T
Q  397 aaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaac 496  Q
    |  | ||| |  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||  |  ||||  |||||| |||||||||||||| |    
T  28794885 ataccaatctctttgatatttgtcatcttgcataataattttggaaaattcttgagactctcacaaaaagagagatccaattcgttaagagatgccaacc 28794786  T
Q  497 ctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatc 596  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||      
T  28794785 ctaaaggtggaaaacgttcgagcttgctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaattgaattgtgaattgtaattaatttacg 28794686  T
Q  597 acaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattc 696  Q
    ||||| | ||||||| || ||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  28794685 acaatatgcaaacgagaacttttccaaattttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacttgtccaatgtcaagactttcatgttc 28794586  T
Q  697 tgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  28794585 tggaacttctgcataaacacaaggaagaaacaaataaataaattaaaaattaaacactata 28794525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 780
Target Start/End: Original strand, 27674861 - 27675644
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||     
T  27674861 cattcttctacatgaggaactcaatgatttacattgatatgcggaaagctctttaagatttggtggaatccctctaatttcctcaagagaagagcagtaa 27674960  T
Q  101 ctcacattaattttac-aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
      || |  ||  |    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  27674961 tgcaaaccaagatgcttaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgttatgtgataagtctagcaattccacattaacacacc 27675060  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    ||   |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  27675061 acttaagaactatttggagatattcatctgagaggttgcactcgtagattctaagctttgtcacctttgaaaacactttagaatacattctatcattatg 27675160  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattccaattct---aacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccac 396  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||  | ||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||  |     |     
T  27675161 ttttgggaacctcagcattctagcttcccgtactgataactcatcaagttcactgagattttgaaatgaagatggcaattctcctatggatatattata- 27675259  T
Q  397 aaccaaat-attgtct---atatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgcc 492  Q
    | | |||| | | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||  || || |  || ||||||||||||||||    
T  27675260 atctaaatcaatctctttgatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactcgaacaacaacagatatccagttccttaagagatgcc 27675359  T
Q  493 aaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaat 592  Q
    || ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27675360 aaccctaaaggtggaaaacgtttgagctttctgcaaccaaatgcacttaacctttcaagtttgtttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaat 27675459  T
Q  593 tatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcat 692  Q
    ||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  27675460 tataacaacattcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatatcaagattgtcat 27675559  T
Q  693 attctgaaacttctgcatacaca-aaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactataatactttcagagtgatttctttt 780  Q
    || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||| || |||| |||   ||||||||| |||||||||||||    
T  27675560 atcctggaacttctgcataaacacaaaggaagaaac-tataaataaattaaaaagcaaacact---atactttcatagtgatttctttt 27675644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 333 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 27681524 - 27681077
Alignment:
Q  333 taacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataat 432  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||     | |    ||| |  | ||||| || |||||||||||||    
T  27681524 taactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtattagatatatcaatctcttttatatgtgccatcttgcataat 27681425  T
Q  433 aattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccat 532  Q
    |||||||||||| |||| |||| | |||| |||  |||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27681424 aattctggaaaattatcaagacactcacactcatagagtatcaatttcttaagagatgccaaccctaaaggtcgaaaatgttcgagctttctgcaaccat 27681325  T
Q  533 atgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaag 632  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27681324 atgcacttaaccattcaagtttatttaggtgtccaatagaattgtgaattgtaattaaattatcacaacatgtaaacgataacttttctaaatttgaaag 27681225  T
Q  633 gcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatc 732  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27681224 gcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatagtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacacaaggaagaaacaaatc 27681125  T
Q  733 aataaattaagaatcaaagactataatactttcagagtgatttctttt 780  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  27681124 aataaattaaaaatcaaagacaataatactttcatactgatttctttt 27681077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 26805377 - 26804649
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||     
T  26805377 cattcttctacttgatgaactcaatgatttacatccttctgcagaaagctcttttagattcggtggaatccctctaatttcctcaagagatgtgcagtaa 26805278  T
Q  101 ctcacattaattttac-aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
      || || ||  |    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| | |   |||||||||||||    
T  26805277 gacaaatcaagatgcttaagatggtgacattcactaagacactcaggaagaattttgaaattgttgtttgataactctagttcttcaacattaacacacc 26805178  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    |||| |||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| |||| | |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||       
T  26805177 acttaagaactatttggaggtattcatctgagaggttgcaatctttgagactaagctctgtcacatttgaaaacattatagaatacattttatcatt--- 26805081  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattccaattct---aacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccac 396  Q
                |||||||||| |||||  | ||   ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||| | |||      |    
T  26805080 ------------cagcattccacattcccgtactgataactcatcaagttcactcagattttgaaatgaagatagcaattctcctatgggagtataattc 26804993  T
Q  397 aaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaac 496  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||  |||||  ||  |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  26804992 aaccaaatacagtctatgtttgtcatctcgcataataattttggaaaactcttgagactatcacaacaacatagattcaattctttaagagatgccaaac 26804893  T
Q  497 ctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatc 596  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26804892 ctaaaggtggaaaacgttcaagcttgctgcaaccaaatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtcaattgtaattaaattctc 26804793  T
Q  597 acaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattc 696  Q
    ||||| || |||||| || ||||||||||||  ||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||     
T  26804792 acaatatttaaacgagaacttttctaaattttgaagacctgagagatcaggtatgtgggttaaatattcattatcgtccaatgtcaagactttcatattt 26804693  T
Q  697 tgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaatt 740  Q
    || || ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  26804692 tggaaattctgcataaacacaaggaagaaacaaataaataaatt 26804649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 272 - 780
Target Start/End: Original strand, 27590539 - 27591047
Alignment:
Q  272 acactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcattccaaattccaattct---aacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaa 368  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27590539 acactatagaatacattctatcattatgttttgggaacctcagcattccaaattcccgtactgataactcatcaagttcactgagattttgaaatgaaga 27590638  T
Q  369 tggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactg 468  Q
    ||||| ||||| ||| |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||   ||||  |       
T  27590639 tggcaattctcgtatggaagtataccaaaaccaaatcttgtctatatttgtcatcttgcataataattttggaaaacttttgagactataacaacaagaa 27590738  T
Q  469 agacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 568  Q
    ||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27590739 agcttcaattctttaagagatgccaaccctaaaggtggaaaacgtttgagcgtcctgcaaccaaatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa 27590838  T
Q  569 tcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcaca 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27590839 tcgaattgtgaattgtaattaaattcttacaatattcaaatgataacttttctaaatttgaaagccctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcaca 27590938  T
Q  669 atggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacaca-aaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactataatactttcag 767  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||| || |||| |||   |||||||||     
T  27590939 atggtccaatatcaagattgtcatatcctggaacttctgcataaacacaaaggaagaaac-tataaataaattaaaaagcaaacact---atactttcat 27591034  T
Q  768 agtgatttctttt 780  Q
    |||||||||||||    
T  27591035 agtgatttctttt 27591047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 128 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 28789133 - 28788631
Alignment:
Q  128 attcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatc 227  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28789133 attcactaaggcactcaggaataagtttgaaattgttccatgataagtctagatatgtcacataaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatc 28789034  T
Q  228 tgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcattccaaattcc 327  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  28789033 tgagagcttgcaattattgagaacaagatttgtcacttttgaaaacactatagaatacatttgatcattctgttttgggaacctcagcattccagcttcc 28788934  T
Q  328 ---aattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatct 424  Q
       | |  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||   |  ||||||||| || |  |||||||||||||    
T  28788933 cgtactgttaactcatgaagttcactgagattttgaaatgaagatggcaattctcttatggaagtattctgcaaccaaatctttttaatatttgtcatct 28788834  T
Q  425 tgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctct 524  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |  ||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |  ||    
T  28788833 tgcataataattttggaaaactcttgagactcccacaatgagagagattcaattcattaagggatgccaaccctaaaggtggaaaactttcgagtttgct 28788734  T
Q  525 gcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaa 624  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||| || ||||| |||    
T  28788733 gcaatcaaatgcatttaacctttcaagtttatttaggtgtccaattgaattgtgaattgtaattaatttacgacaatatgcaaacgagaacttttccaaa 28788634  T
Q  625 ttt 627  Q
    |||    
T  28788633 ttt 28788631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 122 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 31287333 - 31286718
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttg---ttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggag 218  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||   ||||  |||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||| |||||| |     
T  31287333 ggtgacattcattaagacactcgggaagaatattgaaattgaagttatgcgataagtctagccttttcacattaacaaaccacttgagaagtattggtaa 31287234  T
Q  219 acattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcatt 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||  || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31287233 acattcatctgagaggttgcaattttggagactaagctgtgtcacatttgaaaacactatagaattaattttgtcattatgttttgggaacctcagcatt 31287134  T
Q  319 ccaaat---tccaattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagt-tccccacaaccaaatattgtctata 414  Q
    ||| ||   || | |  ||   ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |   || ||| |||||   | ||||    
T  31287133 ccacatctctctattgatatgtcattaagttcactgagattttgaaatgaagatggcaattctcctatggaagtattaaca-aacaaaatacgttttata 31287035  T
Q  415 tttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgtt 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |  |||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  31287034 tttgtcatcttgcataataattctggaaaactattgagactcacacaaaaagagagttccaattccttaagagatgccaaacctaagggtggaaaacgct 31286935  T
Q  515 cgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataa 614  Q
     |||||  |||||||||  ||||||||    ||||||||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||||||   ||||  || ||| || ||    
T  31286934 tgagcttgctgcaaccaattgcacttatgaattcaagtttattttggtggccaattgaatcgtcaattgtaattaaatttctacaaaatttaaatgagaa 31286835  T
Q  615 tttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacac 714  Q
     || |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  31286834 cttctctatatttgaaagacctgagacatcaggtatatgtgttaaatattcacaatcgtccaatgtcaagactttcatattctggaacttctgcgtaaac 31286735  T
Q  715 aaaaggaagaaacaaat 731  Q
    | |||||||||||||||    
T  31286734 acaaggaagaaacaaat 31286718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 26649352 - 26648598
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    ||||||||||  ||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    |||       
T  26649352 cattcttctacttgaggaactcaatgattcacatctcaatgcagaaagccatttaagatttggtggaatccccctaatttcctcaagagaggtacagccg 26649253  T
Q  101 ctcacattaatttta-caagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
      |||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | || |||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  26649252 tccacgataatttcaacaagatggtgacattcactaaggaactcgggaagaattttgaaattgttctttgctaagactagatttttcagattaacacacc 26649153  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    | ||||||| |||| |||||| ||||||  |||| ||||||||   ||||| |||||    ||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||| |    
T  26649152 atttgagaattattaggagactttcatcaaagaggttgcaattttcgagaacaagatgatccacatttgaaaacactacagaataaattttatcattagg 26649053  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattccaattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaac 399  Q
    ||||||||| || | ||||||||||   |  | |||   |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||   ||||     
T  26649052 ttttgggaacctaaacattccaaat---atgtgtaaactacgaagttcactgagattatgaaatgaagatggcaattctcctattgaagttctagacaaa 26648956  T
Q  400 caaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaaccta 499  Q
     ||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  26648955 aaaatatgttttatatttctcattttgcataataattctggaaaattctttagactctcacaaccactgagttccaattgcttaagagatgtcaacccta 26648856  T
Q  500 aaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcaca 599  Q
    | ||||||||| | | |||||  ||||||| |  ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||||||||||| | |||    
T  26648855 agggtggaaaacgcttgagcttgctgcaacaacctgcatctaagctttcaagtttatttaggtgcccaattgagtcgtcaattgtaattaaattcttaca 26648756  T
Q  600 attttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctga 699  Q
    |     ||| || || ||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||     
T  26648755 aaacataaatgagaacttttctaaattttgaagatctgagacatcaggtatatgagttaaatattcacaacagttcaatgtcaagactttcatattctgg 26648656  T
Q  700 aacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  26648655 aacttctgcataaacacaaggaacaaacaaataaataaattaaaaatcaaacactata 26648598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 26755320 - 26754566
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    ||||||||||  ||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    |||       
T  26755320 cattcttctacttgaggaactcaatgattcacatctcaatgcagaaagccatttaagatttggtggaatccccctaatttcctcaagagaggtacagccg 26755221  T
Q  101 ctcacattaatttta-caagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
      |||  |||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| | || |||| |||||| | ||| |||||||||||    
T  26755220 tccacgataatttcaacaagatggtgacattcactaaggaactcgggaagaattttgaaattgttctttgctaagactagatttttcagattaacacacc 26755121  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    | ||||||| |||| |||||| ||||||  |||| ||||||||   ||||| |||||    ||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||| |    
T  26755120 atttgagaattattaggagactttcatcaaagaggttgcaattttcgagaacaagatgatccacatttgaaaacactacagaataaattttatcattagg 26755021  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattccaattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaac 399  Q
    ||||||||| || | ||||||||||   |  | |||   |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||   ||||     
T  26755020 ttttgggaacctaaacattccaaat---atgtgtaaactacgaagttcactgagattatgaaatgaagatggcaattctcctattgaagttctagacaaa 26754924  T
Q  400 caaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaaccta 499  Q
     ||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  26754923 aaaatatgttttatatttctcattttgcataataattctggaaaattctttagactctcacaaccactgagttccaattgcttaagagatgtcaacccta 26754824  T
Q  500 aaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcaca 599  Q
    | ||||||||| | | |||||  ||||||| |  ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| || | || ||||||||||||||| | |||    
T  26754823 agggtggaaaacgcttgagcttgctgcaacaacctgcatctaagctttcaagtttatttaggtgcccaattgagtcgtcaattgtaattaaattcttaca 26754724  T
Q  600 attttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctga 699  Q
    |     ||| || || ||||||||||||  |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||     
T  26754723 aaacataaatgagaacttttctaaattttgaagatctgagacatcaggtatatgagttaaatattcacaacagttcaatgtcaagactttcatattctgg 26754624  T
Q  700 aacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  26754623 aacttctgcataaacacaaggaacaaacaaataaataaattaaaaatcaaacactata 26754566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27681833 - 27681600
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |   ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27681833 cattcttctacttgaggaactcaatgatttacaatatctagcacaaagctcttttagatttggtggaatccctctaatttcctcaagagactcgcagcac 27681734  T
Q  101 ctcacattaatttta-caagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
     |||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27681733 atcacattaatttcaacaagatggtgacattcacgaaggcactcaggaagaattttgaaattgctaaatgataagtctagatgtgtcatattaacacacc 27681634  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagag 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27681633 acttgagaactattgggagacattcatctgagag 27681600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 539 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 28788622 - 28788404
Alignment:
Q  539 ttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctga 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||| || ||||| ||||||  ||| |||||    
T  28788622 ttaacctttcaagtttatttaggtgtccaattgaattgtgaattgtaattaatttacgacaatatgcaaacgagaacttttccaaattttgaagacctga 28788523  T
Q  639 gacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaa 738  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28788522 gacatcaggtatatgggttaaatattcacacttgtccaatgtcaagactttcatgttctggaaattctgcataaacacaaggaagaaacaaataaataaa 28788423  T
Q  739 ttaagaatcaaagactata 757  Q
    |||| ||| ||| ||||||    
T  28788422 ttaaaaattaaacactata 28788404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25513751 - 25513054
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| | |||  | |||||| |||||  ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||    
T  25513751 cattcttatacttgaggaactcaatgaataacactcgtctgcaaaaagcctttcaagatttggtggaatccctctaatttcctcaagagccttgcaaaac 25513652  T
Q  101 ctcacattaattttac-aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
     ||| || ||  |    |||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25513651 ttcaaataaagatgcttaagacggtgatattcaccaaggcactcgggaagaattgtgaaattgttctccgataagtctagaaatgtcacattaacaaacc 25513552  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||   | ||||||   ||||| |  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  25513551 acttgagaagtattgggagacattcatctgagacgttgttgtcactgaggtcaagatgttccacatttgaaaacactattgaattcattttatcattata 25513452  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattcca---attct-aacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttcccca 395  Q
    ||||||||| || ||| ||||   | |||   ||| | |||   | ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||  |  |    
T  25513451 ttttgggaacctgagctttcctcct-ccagatattgttaaccgttaaagttcactgaaattttgaaatgaagatggcaattcttctatggaagtatcata 25513353  T
Q  396 caaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaa 495  Q
     | |  |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||  |||  ||  ||     |||| ||||||||| | ||      
T  25513352 tatctcaatatcttttatatttgtcatcttacataataattctggaaaattcttgagactcttacacccagagatttcaaatttcttaagagagggcagc 25513253  T
Q  496 cctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattat 595  Q
      ||| ||||| ||| | ||  | |  ||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  25513252 tgtaagggtgggaaaagctcaggtttgctgcaaccacatgtatttaagatttcaagtttatttaggtgtccaatcgaaatgtgaattgtaattaaactat 25513153  T
Q  596 cacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatat 694  Q
    |||||| |  |||  | || ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  25513152 cacaatatcgaaataagaacttttctagatttggaagacccgagacatcgggtatatgggttaaatattcacaaaaattcaatgtcaagactttcatat 25513054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 342 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 26864139 - 26863751
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||| |  ||||||  || |  | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26864139 aagttcactgagattttgaaatgaaaatgacaattctcttatggaagtttcagacaaccggatctcttttatatttatcatcttgcataataattctgga 26864040  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcactta 541  Q
    ||||| | ||| ||   ||| |||  |||   ||||  |||||||||||||||   ||| |||||||||   |||||||  ||||||   | |||| |||    
T  26864039 aaactcttgagtctgaaacactcatagagttccaatatcttaagagatgccaattgtaagggtggaaaactctcgagcttgctgcaatactttgcaatta 26863940  T
Q  542 acctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagac 641  Q
       ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| | || ||||||||||||| |||  | |||||    
T  26863939 gggtttcaagtttatttaggtacccaatcgagttgtgaattgtaattaaattatgacaatttataaacaacaacttttctaaatttggaagatcggagac 26863840  T
Q  642 atcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaa 730  Q
    || |||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  26863839 attgggtatacaggttaaatattcacaatagtccaatatcaagactttcatattctcgaacttctgcataaacacaaagaagaaacaaa 26863751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 411 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 26658441 - 26658157
Alignment:
Q  411 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaa 510  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||  |||   ||||||    |||||||||||||| |  |  | ||| |||||||||    
T  26658441 tatatttgacatcttgcatagtaattctggaaatttcttgagactcttacaccaactgagttgaaattccttaagagagggaagccgtaagggtggaaaa 26658342  T
Q  511 tgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacg 610  Q
      | ||| || ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |    
T  26658341 cttacgatctttctgcaaccatatgcatctaagatttcaagtttatttaggtatccaactgaattgtgaattgtaattaaattagcacaatttcgaaatg 26658242  T
Q  611 ataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatatt 695  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26658241 agaacttttctaaatttgagagacctgagacattgggtatatgggttaaatattcacaatcgtccaatgtcatgaatttcatatt 26658157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 411 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 26764412 - 26764128
Alignment:
Q  411 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaa 510  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||  |||   ||||||    |||||||||||||| |  |  | ||| |||||||||    
T  26764412 tatatttgacatcttgcatagtaattctggaaatttcttgagactcttacaccaactgagttgaaattccttaagagagggaagccgtaagggtggaaaa 26764313  T
Q  511 tgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacg 610  Q
      | ||| || ||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |    
T  26764312 cttacgatctttctgcaaccatatgcatctaagatttcaagtttatttaggtatccaactgaattgtgaattgtaattaaattagcacaatttcgaaatg 26764213  T
Q  611 ataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatatt 695  Q
    | || |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  26764212 agaacttttctaaatttgagagacctgagacattgggtatatgggttaaatattcacaatcgtccaatgtcatgaatttcatatt 26764128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 480 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 26625663 - 26625387
Alignment:
Q  480 cttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtga 579  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||| |  ||||||| | ||||||   |||||||||    |||||||||||||||||| ||||| || |  | |    
T  26625663 cttaagagataccaaccataagggtggaaagttctcgagctttttgcaacaggatgcacttactagttcaagtttatttaggtgcccaattgagtcatca 26625564  T
Q  580 attgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatg 679  Q
    |||||||||||||| | ||||   | ||| |  || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  26625563 attgtaattaaatttttacaaaaattaaatgtcaacttttgtaaatttgaaaggcctgagatatcgggtatatgtgttaaatgttcacattcgtccaatg 26625464  T
Q  680 tcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  26625463 ttaatactttcatattctggaacttctgcataaacacaaggaagaaac-aataaataaattaaaaatcaaacactata 26625387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 480 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 26731640 - 26731364
Alignment:
Q  480 cttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtga 579  Q
    |||||||||| |||| | ||| |||||||| |  ||||||| | ||||||   |||||||||    |||||||||||||||||| ||||| || |  | |    
T  26731640 cttaagagataccaaccataagggtggaaagttctcgagctttttgcaacaggatgcacttactagttcaagtttatttaggtgcccaattgagtcatca 26731541  T
Q  580 attgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatg 679  Q
    |||||||||||||| | ||||   | ||| |  || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  26731540 attgtaattaaatttttacaaaaattaaatgtcaacttttgtaaatttgaaaggcctgagatatcgggtatatgtgttaaatgttcacattcgtccaatg 26731441  T
Q  680 tcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  26731440 ttaatactttcatattctggaacttctgcataaacacaaggaagaaac-aataaataaattaaaaatcaaacactata 26731364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 411 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25547430 - 25547147
Alignment:
Q  411 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaa 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| |  ||     |||| ||||||||| | ||    ||| ||||| |||    
T  25547430 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaattcttgagactctcacaataagagatttcaaatttcttaagagagggcagctgtaagggtgggaaa 25547331  T
Q  511 tgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacg 610  Q
    || || ||||||  ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | |  ||| |    
T  25547330 tgctcaagctctaagcaaccatatgcatttaagatttcaagtttatttaggtgtccaatcgaactgtgaattgtaattaaactatgacattctcgaaagg 25547231  T
Q  611 ataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatat 694  Q
    |  | ||||||| ||||  ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  25547230 agcacttttctagatttcgaagacccgagacatcaggtatatgggttaaatattcacaaagatccaatatcaagactttcatat 25547147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25547856 - 25547545
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| | |||  | |||||| |||||  ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |    
T  25547856 cattcttatacttgaggaactcaatgaataacactcgtctgcaaaaagcctttcaagatttggtggaatccctctaatttcctcaagaaaattgcagttc 25547757  T
Q  101 ctcacattaattt-tacaagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaattt---gttatctgataagtctagatatgtcacattaacac 196  Q
     ||| || || || |  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||   ||| || |||||||||||| ||||||||||||||     
T  25547756 ttcaaataaagttgtttaagatggtgacattcgctaaggcactcaggaagaattgtgaaattatcgttctccgataagtctagaaatgtcacattaacaa 25547657  T
Q  197 accacttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcatt 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||   || |||||   || || |  ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25547656 accacttgagaagtattgggagacattcatctgagaggttgttgtttctgaggtcaacatgttccacatttgaaaacactattgaattcattttatcatt 25547557  T
Q  297 atgttttgggaa 308  Q
    || |||||||||    
T  25547556 atattttgggaa 25547545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 502 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 26145224 - 26145032
Alignment:
Q  502 ggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaat 601  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||| |    
T  26145224 ggtggaaaatgctcaagcttgctgcaaccagatgcatttaagatttcaagtttatttaggtgtccaatcgaactgtgaattctaattaaactttcacagt 26145125  T
Q  602 tttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatat 694  Q
    ||| ||| ||  | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  26145124 tttgaaaggagcacttttctagatttggaagacctgagacatcgggtatatgggttaaatatcgagaatagttcaatgtcaagactttcatat 26145032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 523 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25485397 - 25485226
Alignment:
Q  523 ctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttcta 622  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||| |  ||| ||  | |||||||    
T  25485397 ctgcaaccatatgcatttaagatttcaagtttatttaggtgtccaatcgaactgggaattgtaattaaactaaaacaatatcgaaatgagcacttttcta 25485298  T
Q  623 aatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatat 694  Q
     ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25485297 gatttggaagacccgagacatcgggtatatgggttaaatattcacaaaaatccaatgtcaagactttcatat 25485226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 122 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26826643 - 26826532
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26826643 ggtgaagttcactaaggcactcaggaataattttgaatttgttccctgataagtctagagatgtcacattaacacaccacttgagaaatatcgggagaca 26826544  T
Q  222 ttcatctgagag 233  Q
    | ||||||||||    
T  26826543 tccatctgagag 26826532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 554 - 730
Target Start/End: Original strand, 27529116 - 27529292
Alignment:
Q  554 tatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatg 653  Q
    ||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  27529116 tatttaggtatctaagtgaattgtgaattgtaactaaattatgacatcttacaaacgagaacttttctaaatttggaagccctgagacatccggtatatg 27529215  T
Q  654 tgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaa 730  Q
     |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||  | |||||||||||    
T  27529216 ggttaaatattcacaattgttcaatatcaagactttcatatcttcaaacttctgcataaacacgaagaagaaacaaa 27529292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 549 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 26637880 - 26637718
Alignment:
Q  549 aagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggt 648  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  26637880 aagtttacttagctgcccaatcgaatcgtgaattgtaattcaatttttacactttttaaacgagaacttttcaaaatttgatagacctgagacatcgggt 26637781  T
Q  649 atatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcata 711  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  26637780 atatgagttaaatagtgacaatggttcaatgtcaagactttcatatagttgaacttctgcata 26637718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 549 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 26743846 - 26743684
Alignment:
Q  549 aagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggt 648  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  26743846 aagtttacttagctgcccaatcgaatcgtgaattgtaattcaatttttacactttttaaacgagaacttttcaaaatttgatagacctgagacatcgggt 26743747  T
Q  649 atatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcata 711  Q
    ||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  26743746 atatgagttaaatagtgacaatggttcaatgtcaagactttcatatagttgaacttctgcata 26743684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 545 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 26886434 - 26886248
Alignment:
Q  545 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatc 644  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||  || || ||||||||||||  ||| ||||||||||     
T  26886434 tttcaagtttatttagcttcccaatcgaatcgtgaattgtaattaaattattactcttttcaactgagaacttttctaaatttagaagacctgagacatt 26886335  T
Q  645 gggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaat 731  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    |  |||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  26886334 gggtacatgggttaaatattcacaattgtcaaatgtcaagactttcatgaagtcgaacttctgcataaacacaaagaagaaacaaat 26886248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25485749 - 25485558
Alignment:
Q  117 aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattggg 216  Q
    |||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  25485749 aagacggtgacattcaccaaggcactcgggaagaattgtgaaattgttctgcgataagtctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattggg 25485650  T
Q  217 agacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaa 308  Q
    ||||||||||||||||| |||   || |||||   || || |  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||    
T  25485649 agacattcatctgagaggttgttgtttctgagctcaacatgttccacatttgaaaacactattgaattcattttatcattatatttttggaa 25485558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 342 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25076382 - 25076030
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||   |||| ||||| | |  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25076382 aagttcactgagattttgaaatgaaaatggcaattctcctatggaagtaccgtccaacaaaatacttttcaaatttgtcatcttgcacaataattctgga 25076283  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcactta 541  Q
    ||||| | |||||||| ||| |||   ||   ||||||||||||||| | ||  | ||| |||||||||  || |||||    |||      |||| |||    
T  25076282 aaactcttgagactccaacactcagaaagtttcaattccttaagagagggcagccgtaagggtggaaaacttttgagcttatagcatttccttgcattta 25076183  T
Q  542 acctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagac 641  Q
       ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||   ||| ||||  || || |  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25076182 tgatttcaagtttacttaggcatccaattgaattgtgaattgtaattaagttccaacacttttttaatgagatcttttctaaatttggaagacctgagac 25076083  T
Q  642 atcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatat 694  Q
    |||||||||||| |||||| | | | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  25076082 atcgggtatatgagttaaagagtaaaaatggttcaatatcaagactttcatat 25076030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26145873 - 26145565
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| | |||  | |||||| |||||  ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||    
T  26145873 cattcttatacttgaggaactcaatgaataacactcgtctgcacaaagcctttcaagatttggtggaatccctctaatttcctcaagagcctcgcaaaac 26145774  T
Q  101 ctcacattaattttac-aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
     ||| || ||  |    |||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| |||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  26145773 ttcaaataaagatgcttaagacggtgacattcaccaaggcactcgggaagaattgtgaaatagttctccgataagtctagaaatgtcacattaacaaacc 26145674  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||   |  |||||   || || |  ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||     
T  26145673 acttgagaagtattgggagacattcatccgagaggttgttgtctctgaggtcaacatgttccacatttgaaaacactattgaattcattgtatcattata 26145574  T
Q  300 ttttgggaa 308  Q
    |||||||||    
T  26145573 ttttgggaa 26145565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Original strand, 27602010 - 27602466
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgca-gaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||  | | |||| ||||  | ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||      
T  27602010 cattcttctacttgaggaactcaatgattcacagtcctttgcatgaaatat-tttaagatttggtggaaaccctctaatttcctcaagaaacttgcagcc 27602108  T
Q  100 cctcacattaat-tttacaagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacac 198  Q
       ||||| ||| |||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | || |||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  27602109 atccacataaatgtttttaagaaggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgctctcagataagactagattttccacattaacacac 27602208  T
Q  199 cacttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattat 298  Q
    ||| | |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||    |   ||||||   |||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  27602209 cacattagaagtattcggagaaattcatctgagaggttgctcttttcaattctaagatggttcacatttgaaaatactatagaattcattttatcatttt 27602308  T
Q  299 gttttgggaagctcagcattccaaat---tccaattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttcccca 395  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||   |  | || |||   |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||   | ||  ||||| |       
T  27602309 gttttgggaacctgagcattccacattgatatatttgtaagcgatcaagttcactgagattttgaattgaaaatggaaatt---ccatgcaagtttcatt 27602405  T
Q  396 caaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactc 456  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27602406 caaccaaatatcttttaaatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactc 27602466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 411 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 25582169 - 25581886
Alignment:
Q  411 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaa 510  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||| | |  ||     |||| ||||||||| | ||    ||| ||||| |||    
T  25582169 tatatttctcatcttgcataataattctggaaaattcttgagactctcacacttagagatttcaaatttcttaagagagggcagctgtaagggtgggaaa 25582070  T
Q  511 tgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacg 610  Q
    || || || |  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||  || ||| |    
T  25582069 tgctcaagtttgctgcaaccatatgcatttaagatttcaagtttatttaggtgtccaatcgaactgtgaattgtaattaaactaaaacaaaattgaaatg 25581970  T
Q  611 ataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatat 694  Q
    |  | ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |  || ||  |||||| |||||||||||||||    
T  25581969 agcacttttctagatttggaagacccgagacatcgggtatatgggttaaatctgaactataatccaatttcaagactttcatat 25581886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 411 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 26058369 - 26058086
Alignment:
Q  411 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaa 510  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||     |||| ||||||||| | ||    ||| ||||| |||    
T  26058369 tatatttgtcatctcacataataattctggaaaattcttgagactcacacaatcagtgatttcaaatttcttaagagagggcagctgtaagggtgggaaa 26058270  T
Q  511 tgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacg 610  Q
    || || || || ||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||   |  ||| |    
T  26058269 tgctcaagttcgctgcaaccaaatgtatctaagatttcaagtttatttagatgtccaatcgaactgtgaattttaattaaactatcacatcctcgaaagg 26058170  T
Q  611 ataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatat 694  Q
    |  | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||  ||||||||||    
T  26058169 agcacttttctagatttggaagacctgagacatcgggtatatgggttaaatattgagaaccgtccaatgtcataactttcatat 26058086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 411 - 694
Target Start/End: Complemental strand, 26078339 - 26078056
Alignment:
Q  411 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaa 510  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||     |||| ||||||||| | ||    ||| ||||| |||    
T  26078339 tatatttgtcatctcacataataattctggaaaattcttgagactcacacaatcagtgatttcaaatttcttaagagagggcagctgtaagggtgggaaa 26078240  T
Q  511 tgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacg 610  Q
    || || || || ||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||   |  ||| |    
T  26078239 tgctcaagttcgctgcaaccaaatgtatctaagatttcaagtttatttagatgtccaatcgaactgtgaattttaattaaactatcacatcctcgaaagg 26078140  T
Q  611 ataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatat 694  Q
    |  | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||||||||  ||||||||||    
T  26078139 agcacttttctagatttggaagacctgagacatcgggtatatgggttaaatattgagaaccgtccaatgtcataactttcatat 26078056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 545 - 711
Target Start/End: Original strand, 27602555 - 27602721
Alignment:
Q  545 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatc 644  Q
    |||||||| | ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27602555 tttcaagtctgtttaggaatccaactgaattgtgaattgtaattaaattctcacaaaattgaaacgataacttttctaaatttggaagtcctgagacatc 27602654  T
Q  645 gggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcata 711  Q
    |||||| || |||||||||| ||||  || |||| |||| ||||||||||  |  ||||||||||||    
T  27602655 gggtatttgggttaaatattgacaactgttcaatttcaatactttcatatagttgaacttctgcata 27602721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26658741 - 26658620
Alignment:
Q  117 aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattggg 216  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26658741 aagaaggtgacattcactaaggcactcgggtagaattttgaaattgttctttgataagtttagatatttcacattaacacaccacttgagaagtattgga 26658642  T
Q  217 agacattcatctgagagcttgc 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  26658641 agacagtcatctgagagattgc 26658620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26764712 - 26764591
Alignment:
Q  117 aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattggg 216  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26764712 aagaaggtgacattcactaaggcactcgggtagaattttgaaattgttctttgataagtttagatatttcacattaacacaccacttgagaagtattgga 26764613  T
Q  217 agacattcatctgagagcttgc 238  Q
    ||||| ||||||||||| ||||    
T  26764612 agacagtcatctgagagattgc 26764591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 730
Target Start/End: Original strand, 27425225 - 27425613
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||  |||| | |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27425225 aagttcactaagattttgaaaggaaaatggaaattctcctatggaagtttccttcaacaagatagattttatatttgtcatcttgcataataattctgga 27425324  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctct-gcaaccatatgcactt 540  Q
    ||||| | |||||||  ||||| |  |||   ||| | || |||||| |   |   ||| |||||||||   ||||||| ||| |||||| | |||| ||    
T  27425325 aaactcttgagactcttacaattagagagttccaaattctgaagagagggagactgtaagggtggaaaactctcgagct-tctcgcaaccctctgcattt 27425423  T
Q  541 aacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgaga 640  Q
    ||  |||| | | ||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||    
T  27425424 aagatttctaatctatttaggtatctaagtgaattgtgaattgtaactaaattatgacatcttgcaaacgagaacttttctaaatttggaagccatgaga 27425523  T
Q  641 catcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaa 730  Q
    |||||||| |||   |||||| || ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  27425524 catcgggtgtatagattaaatcttgacaattgtcgaatatcaacactttcatattctcaagcttctgcataaacacacagaagaaacaaa 27425613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 342 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 26826354 - 26825966
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||  |  |||| |||||    | ||| ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  26826354 aagttcattgagatttcgaaatgaagatggcaattctcctatggaagtatcatacaaacaaattccttttatttttgtcatctcacataataattttgga 26826255  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcactta 541  Q
    ||||| | |||||||  |||  ||  |||   ||| |||||||| || | ||| | ||| |||||||||   |||||||  ||||||   | |||| |||    
T  26826254 aaactcttgagactcttacagccagagagtttcaaatccttaagggagggcaaccgtaagggtggaaaactctcgagcttgctgcaattctctgcattta 26826155  T
Q  542 acctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagac 641  Q
    |  |||||||||||| |||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||  ||| ||| | ||||||    
T  26826154 agatttcaagtttatctaggtacccaatcgagatgtcaattgtaattaaattacgacattttttaaatgagaatttttctaatattggaagacatgagac 26826055  T
Q  642 atcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaa 730  Q
    ||||||||| || ||||||| || ||| | ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || ||| |||||||    
T  26826054 atcgggtatgtgggttaaatgttgacacttgtccaatgaaaagactttcatattctcgaacttctgcataaacacaaagaaaaaacaaa 26825966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 549 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 26952101 - 26951958
Alignment:
Q  549 aagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggt 648  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||  || |||||  || ||| || || |||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26952101 aagtttatttaggtacccaaccgaattgtgaattgtaattaacctaacacaaccttgaaatgagaagttttttaaatttggaagacctgagacatcgggt 26952002  T
Q  649 atatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcat 692  Q
    ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||    
T  26952001 atatgagttaaatagtcactattgtccaatgtcaagattttcat 26951958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26980168 - 26980053
Alignment:
Q  117 aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattggg 216  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26980168 aagatggtgacattcattaaggcactcaggtagaattttgaaattgttgt-tcttaagtttaaatatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattggg 26980070  T
Q  217 agacattcatctgagag 233  Q
    |||||||||||||||||    
T  26980069 agacattcatctgagag 26980053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 27662659 - 27662757
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagta 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27662659 cattcttctacttgaggaactcaatgatttacatccttctgcataaagatttgttagattgggtggaatccctctaatttcctcaagagactcacagta 27662757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26638161 - 26638048
Alignment:
Q  117 aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattggg 216  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26638161 aagaaggtgacatacactaaggcactcaggaagaattttgaaattgttaccagataagtataacaatttcacattagcacaccacttgagaagtattggg 26638062  T
Q  217 agacattcatctga 230  Q
    ||||||||||||||    
T  26638061 agacattcatctga 26638048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26744127 - 26744014
Alignment:
Q  117 aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattggg 216  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||   || |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26744127 aagaaggtgacatacactaaggcactcaggaagaattttgaaattgttaccagataagtataacaatttcacattagcacaccacttgagaagtattggg 26744028  T
Q  217 agacattcatctga 230  Q
    ||||||||||||||    
T  26744027 agacattcatctga 26744014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25076652 - 25076539
Alignment:
Q  117 aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattggg 216  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || |  || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  25076652 aagatggcgacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaatcattgttagacaagtctagatatttcacattaacaaaccacttgagaagtattgga 25076553  T
Q  217 agacattcatctga 230  Q
    ||||||||||||||    
T  25076552 agacattcatctga 25076539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26961871 - 26961754
Alignment:
Q  116 caagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgg 215  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    ||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  26961871 caagacggtgacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaattgttcttcattaattttagagatgtcacattaacaaacaacttgagaagtattgg 26961772  T
Q  216 gagacattcatctgagag 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26961771 gagacattcatctgagag 26961754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26625836 - 26625697
Alignment:
Q  169 gataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttg 268  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||  ||| | ||||||||       
T  26625836 gataagtctagatgtttcacattaacaaaccacttgagaattattgggagatattcatctgagaggttgcattccctgagacaaagctctgtcacat--- 26625740  T
Q  269 agaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcattcc 320  Q
             |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26625739 ---------ttgaatacattttatcattatgttttgggaacctcagcattcc 26625697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26731813 - 26731674
Alignment:
Q  169 gataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttg 268  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||  ||| | ||||||||       
T  26731813 gataagtctagatgtttcacattaacaaaccacttgagaattattgggagatattcatctgagaggttgcattccctgagacaaagctctgtcacat--- 26731717  T
Q  269 agaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcattcc 320  Q
             |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26731716 ---------ttgaatacattttatcattatgttttgggaacctcagcattcc 26731674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26886945 - 26886747
Alignment:
Q  41 gcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtacctcacattaattttac-aagatggtgaaattcactaagcc 139  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |   |||  | || | | | |||| ||||| ||||  |||| |    
T  26886945 gcagaaaggtctttaagatttggtggtatccctctaatttcctcaagagacttgcaatgattcaattcaagtatcctaagaaggtgacattccttaaggc 26886846  T
Q  140 actcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgc 238  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  26886845 actcgggaagaattttgaaattgttctttgataagtctagatgtttcacattaacaaaccacttgagaagcattggaagacattcaaatgagagattgc 26886747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25582411 - 25582347
Alignment:
Q  169 gataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgagag 233  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25582411 gataaatctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagag 25582347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26058623 - 26058559
Alignment:
Q  169 gataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgagag 233  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26058623 gataaatctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagag 26058559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26078593 - 26078529
Alignment:
Q  169 gataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgagag 233  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26078593 gataaatctagaaatgtcacattaacaaaccacttgagaagtattgggagacattcatctgagag 26078529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 462
Target Start/End: Original strand, 27662845 - 27662965
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||  | || |||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27662845 aagttcattgagatttttaaatgaaaatggcatttcttctatggaagtatcacataaccaaatctcttttatatttgacatcttgcataataattctgga 27662944  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaa 462  Q
    ||||| | |||||||| ||||    
T  27662945 aaactcttgagactcctacaa 27662965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26876276 - 26876218
Alignment:
Q  174 gtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgaga 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26876276 gtctagatatctcacattaacacaccacttgagaagtagtgggagacattcatctgaga 26876218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 26851200 - 26850858
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |     |||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26851200 aagttcactgagatttttaaatgaagatggcaattctcctatggaagtacgatgtaactcaatctcttctatatttgtcatcttgcataataattctgga 26851101  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcactta 541  Q
    ||| | | |||||||  |||   |   |    ||||||||||||||| | |||   ||| |||||||||   || ||||   |||||||  |||||  ||    
T  26851100 aaattcttgagactcgaacacctagataatatcaattccttaagagagggcaattgtaagggtggaaaactctcaagcttgttgcaaccccatgcatcta 26851001  T
Q  542 acctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagac 641  Q
    |  ||||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||   | ||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||    
T  26851000 agatttcaagtttaatcaggtacccaattgaattgtgaattgtaattaaactatgacaacaatgaaatgagagcttttctaaatttggaagtccagagac 26850901  T
Q  642 atcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaag 684  Q
    ||| | |||||| |||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  26850900 atcagatatatgggttaaatatttagaaccgtccaatgtcaag 26850858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 545 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 26145325 - 26145282
Alignment:
Q  545 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaatt 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26145325 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgagttgtgaattgtaatt 26145282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 26851386 - 26851300
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaag 87  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||| || |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26851386 cattcttctgcttgaggaactcaatgatttgcaatctattgcagacaggtaatttagattcggtggaatccctctaatttcctcaag 26851300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 456
Target Start/End: Original strand, 27528973 - 27529018
Alignment:
Q  411 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactc 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27528973 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactc 27529018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 26979941 - 26979773
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||     | |||| ||| || | ||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  26979941 aagttcactgagatattgaaatgaaaatggcaattctcctatggaagtattagagaacccaatcttttttatatttttcatttgacataataattctgga 26979842  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaa 510  Q
    ||||| | ||||||  |||| |||  |||   ||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||    
T  26979841 aaacttttgagactatcacactcagagagttccaattccttaagagagggcaaatgtaagggtggaaaa 26979773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26952308 - 26952185
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||| || ||| |  | | |  ||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26952308 aagttcactgagatttccaaatgaaaatggcaattctcctatggatgtttcatatatcgtaatctcttttatatttgtcatcttgcataataattctgga 26952209  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatca 465  Q
    || || | ||||||| |||| |||    
T  26952208 aagctcttgagactctcacactca 26952185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26625956 - 26625912
Alignment:
Q  53 tttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcag 97  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26625956 tttagatttggtggaatccctctaatttcctcaagagactcgcag 26625912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 26731933 - 26731889
Alignment:
Q  53 tttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcag 97  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26731933 tttagatttggtggaatccctctaatttcctcaagagactcgcag 26731889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26952494 - 26952331
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttt-tatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagta 99  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || |  ||| || |||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||      
T  26952494 cattcttctacttgcggaactcaacgactcgcaatctactgcagaaag-tctttctagattcggtggaatccctctgatttcctcaagggaatagcagcc 26952396  T
Q  100 cctcac-attaattttacaagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgt 163  Q
       ||| || | ||  |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26952395 atccacgataacttcaacaagatggtggcattcactaaggcactcgggaagaattttgaaattgt 26952331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 411 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 26145459 - 26145408
Alignment:
Q  411 tatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaa 462  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  26145459 tatatttgtcatcttacataataattctggaaaattcttgagactctcacaa 26145408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 26876411 - 26876364
Alignment:
Q  40 tgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaag 87  Q
    ||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26876411 tgcagaaagcctttctatatttggtggaatccctctaatttcctcaag 26876364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 441; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 780
Target Start/End: Original strand, 29271126 - 29271905
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||       
T  29271126 cattcttttacttgaggaactcaatgattcacaatattcaacagaaagctcttttagatttggtggaatccctctaatttccttaagagaatggcagcca 29271225  T
Q  101 ctcacattaattttacaa-gatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
    |||| |||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29271226 ctcatattaattttataaagatggagacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaatagttaaatgataagtctagatatgtcacattaacacacc 29271325  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29271326 acttgagaagtattgggagacattcatctgagaagtcgcaatcgtcgagagtaagatgtgtcacatttgggaacactattgaatacatcttatcattatg 29271425  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattccaattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaac 399  Q
    ||||||||||||||||||||||  || || |  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||  ||||      ||||    
T  29271426 ttttgggaagctcagcattccagctttcactgataactcatgaagttcactgagattttgaaatgaaaatggaagttctgcaatgaaagtatgatgcaac 29271525  T
Q  400 caaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaaccta 499  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29271526 aaaatattgtctatatttttcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcacacaaccactgagattcaattccttaagagatgccaaaccta 29271625  T
Q  500 aaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcaca 599  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29271626 aaggtggaaaatgtttgagctttttgcaagcatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtagttaaattatcaca 29271725  T
Q  600 attttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctga 699  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29271726 attttcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcggggatatgtgttaagtattcacatcggtccaatatcaagactttcatatcctga 29271825  T
Q  700 aacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactataatactttcagagtgatttctttt 780  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29271826 aacttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactataatactttcatagtgatttctttt 29271905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 122 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 22024030 - 22023396
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||      || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22024030 ggtgacattcattaaggcactcgggaagaattttgaaattgttattcgataagtctagcgtaaccatattaacacaacacttgagaaatattgggaggca 22023931  T
Q  222 ttcatctgagagcttgca---attactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcatt 318  Q
    ||||||  |||| |||||   ||  | |||| |||| | |||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| || |  |||    
T  22023930 ttcatcaaagaggttgcagcaatctcggagactaagctctgtcacatttggaaacactatagaataaattttatcattatattttgggaaactgaatatt 22023831  T
Q  319 ccaaattccaattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttg 418  Q
    ||| || || ||  |  |  || ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||     ||||| ||||||  |||||||||     
T  22023830 ccacatccccatagttgcg-ataaagtttactgagattttgaaaagaagatggcaattctcttatggaagtattatacaacgaaatatattctatatttt 22023732  T
Q  419 tcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgag 518  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |    |||   ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  22023731 tcatcttgcataataattttggaaaact--cgagactcctacacttggagagttccaatttcttaagtgatgccaaacctaatggtggaaaacgctcgag 22023634  T
Q  519 ctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaa---tcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataat 615  Q
     |  |||||||||| |||| | ||  ||||||||||| || ||||||  |   ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  22023633 attgctgcaaccatctgcattcaagatttcaagtttactttggtgtctgatcgtcgaattgtcaattgtaattaaattcttacaattttcaaacgataac 22023534  T
Q  616 ttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacaca 715  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||  || ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22023533 ttttctaaatttggaagacctgagacattacgtatataggtaaaatattcacaatggtatgacgtcaagactttcatattctggaacttctgcataaaca 22023434  T
Q  716 aaagga---agaaacaaatcaataaattaagaatcaaa 750  Q
     |||||   ||||||||||  || |||||| |||||||    
T  22023433 caaggaattagaaacaaatacatgaattaaaaatcaaa 22023396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 549 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 15039026 - 15038975
Alignment:
Q  549 aagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaa 600  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15039026 aagtttatttaggtatccagtcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaa 15038975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22024152 - 22024067
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaa 86  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||  ||||||||||  ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22024152 cattcttctacttgaggaactcaatgatttgcattctattgcagaaagcctttcaagatttggtggaatccctctaatttcctcaa 22024067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 16157 - 15383
Alignment:
Q  2 attcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtacc 101  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16157 attcttttacttgaggaactcaatgattgacatccttgtgcattaatctcttttagatttggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtacc 16058  T
Q  102 tcacattaatttta-caagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacca 200  Q
     ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  16057 ccacattaatttcaacaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaaattgctatataataagtttagagatgtcatattaacacacca 15958  T
Q  201 cttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgt 300  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||    |||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15957 cttgagaactcttcggagacattcatctgagaggttgcaatggtagagagtaagctgtgtcacatttgaaaacactattgaatacatcttatcattctgt 15858  T
Q  301 tttgggaagctcagcattccaaattccaattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaacc 400  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  || |  ||||  || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||    
T  15857 tttgggaacctcagcattccatatgtcactgataacttatgaagttcactaagattttgaaatgaaaatggcagttctcctatggaagtattacacaacc 15758  T
Q  401 aaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaa 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15757 aaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactcttgagactcctgcaagaactgagattcaattccttaagagatgccaaacctaa 15658  T
Q  501 aggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaa 600  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15657 aggtggaaaatgttcgaccttattgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttattaaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattataacat 15558  T
Q  601 ttttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaa 700  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  15557 ctttcaaacgataacttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatatttacatcggtccaatatcaagactttcatatcctgga 15458  T
Q  701 acttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagact-ataatactttcagagtgattt 775  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||||||    
T  15457 acttctgcataaacacaagaaagaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactaatattactttcatactgattt 15383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 757
Target Start/End: Original strand, 1975 - 2735
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| || ||   ||||||||||  ||  | ||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||      
T  1975 cattcttctacttgaagaactcaatgatttgcatcccattgcagaaagcatttcaagatttggtggaatccctctaatttcctccagagacttgcagtta 2074  T
Q  101 ctcacattaattttac-aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
      ||   |||   ||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2075 tccaatataaggatattaagaaggtgacattcactaaggcactcaggaataagtttgaaattgttatatgataagtctagagatgtcacattaacacacc 2174  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  2175 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaatcatggagaataagatttgtcacttttgaaaacactatagaatacatttgatcattctg 2274  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattccaattc---taacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccac 396  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||     ||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  |  |    
T  2275 ttttgggaacctcagcattccacattcccatagcgttaacagaaaaagttcattgagattttgaaatgaagatggcaattctcttatggaagttttctgc 2374  T
Q  397 aaccaaat-attgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaa 495  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |  || |  |||||| ||||| ||||| |      
T  2375 aaccaaatcattttc-atatttgtcatcttgcataataattttggaaaactcttgagactctcacaataagagatattcaattcattaagggatgcaagc 2473  T
Q  496 cctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattat 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2474 cctaaaggtggaaaacgttcgagtttgctgcaaccatttgcacttaacctttcaagtttattgaggtgtccaattgaattgtgaattgtaattaaattct 2573  T
Q  596 cacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatatt 695  Q
    |||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||    
T  2574 cacaatattcaaaggagaacttttctaaattttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacctgtccaatgtcaagattttcatgtt 2673  T
Q  696 ctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||    
T  2674 ctggaacttctgcataaacacaaggaagaaacaaataaattaattaaaaattaaacactata 2735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 128 - 757
Target Start/End: Original strand, 11066 - 11698
Alignment:
Q  128 attcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatc 227  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11066 attcactaaggcactcaggaataagtttgaaattgttccatgataagtctagatatgtcacataaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatc 11165  T
Q  228 tgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcattccaaattcc 327  Q
    ||||||||||||||||  |||    || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  11166 tgagagcttgcaattatagagttctagttttgtcacttttgaaaacactatagaatacatttgatcattctgttttgggaacctcagcattccagcttcc 11265  T
Q  328 aattct---aacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatct 424  Q
      | ||   ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||   |  ||||||||| || |  |||||||||||||    
T  11266 cgtactgttaactcatgaagttcactgagattttgaaatgaagatggcaattctcttatggaagtattctgcaaccaaatctttttaatatttgtcatct 11365  T
Q  425 tgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctct 524  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |  ||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| |  ||    
T  11366 tgcataataattttggaaaactcttgagactcccacaatgagagagattcaattcattaagggatgccaaccctaaaggtggaaaactttcgagtttgct 11465  T
Q  525 gcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaa 624  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||| || ||||| |||    
T  11466 gcaatcaaatgcatttaacctttcaagtttatttaggtgtccaattgaattgtgaattgtaattaatttacgacaatatgcaaacgagaacttttccaaa 11565  T
Q  625 tttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaaga 724  Q
    |||  ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||    
T  11566 ttttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacttgtccaatgtcaagactttcatgttctggaaattctgcataaacacaaggaaga 11665  T
Q  725 aacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    ||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  11666 aacaaataaataaattaaaaattaaacactata 11698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 10411 - 9651
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||   ||||||||||  ||  | ||| |||| |||||||||||||||||| || |||| |||||      
T  10411 cattcttctacttgaggaactcaatgatttgcatcccattgcagaaagcctttcaagatttggtgcaatccctctaatttcctccagagacttgcagtta 10312  T
Q  101 ctcacattaattttac-aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
      ||   |||  |||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||   ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  10311 tccaatataaggttattaagaaggtgacattcactaaggcactcaggaataagtttgaaattgttccttgataagtctagcaatttcacattaacacacc 10212  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  10211 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattattgagaacaagatttgtcacttttgaaaacactatagaatacatttgatcattctg 10112  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattccaattc---taacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccac 396  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||     ||||  |  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||  |  |    
T  10111 ttttgggaacctcagcattccacattcccatagcgttaactgaaaaagttcattgagattttgaaatgaagatggcaattctcttatggaagttttctgc 10012  T
Q  397 aaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaac 496  Q
    ||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |  || |  |||||| ||||| ||||| |  |    
T  10011 aaccaaatcgttttcatatttgtcatcttgcataataattttggaaaactcttgagactctcacaataagagatattcaattcattaagggatgcaagcc 9912  T
Q  497 ctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatc 596  Q
    |||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  9911 ctaaaggtggaaaacgttcgagtttgctgcaaccatttgcacttaacctttcaagtttattgaggtgtccaattgaattgtgaattgtaattaaattctc 9812  T
Q  597 acaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattc 696  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |||    
T  9811 acaatattcaaaggagaacttttctaaattttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacctgtccaatgtcaagattttcatgttc 9712  T
Q  697 tgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  9711 tggaacttctgcataaacacaaggaagaaacaaataaataaattaaaaattaaacactata 9651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 757
Target Start/End: Original strand, 265618 - 266373
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaagggactcgcagtac 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || ||  | |  ||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||     
T  265618 cattcttttacttgaggaactcaatgagttgcattcatacgcaaaaagctctttaagatttggtggaatccctctaatttcctcaagatacttgcagtaa 265717  T
Q  101 ctcacattaatttta-caagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacacc 199  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | |    ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  265718 ctcacgttaattttaacaagatggtgacattcactaaggcactcaggaagagttttgaacttgctcttcattaagtttagatatatcacattaacacacc 265817  T
Q  200 acttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatg 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||   |||   ||||  | | ||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||||    
T  265818 acttgagaagtattgggagacattcatctgagagattgttatttacgagtgaaagagcttttacattggaaaacactatagaatacattttcccattatg 265917  T
Q  300 ttttgggaagctcagcattccaaattcc---aattctaacacatcaagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccac 396  Q
    ||||||||| |   ||||||||  | ||   | |  ||||  |  |||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| |  ||    
T  265918 ttttgggaacc---gcattccacgtccctctagtgataaccgagaaagtccactgagattttgaaatgaagatggcaattctcttatggaagtttcatac 266014  T
Q  397 aaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaac 496  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||  ||  |||   || |||||||||||| | ||       
T  266015 aacaaaatattttctatatttgtcatcttgcataataattttggaaagctattgagactccaacacccagagagttccatttccttaagagagggcagtt 266114  T
Q  497 ctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatc 596  Q
     ||| |||||||||   |  |||| |||||||||   ||||  |||  ||||||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |     
T  266115 gtaagggtggaaaactctttagctttctgcaacccattgcatctaagatttcaagtttaattaggtacccaactgaattgtgaattgtaattaaattctt 266214  T
Q  597 acaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattc 696  Q
    ||||| || ||| || |  |||| |||||| | ||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |    
T  266215 acaatctttaaatgagagcttttttaaattaggaagtcctgagacatcagatatatgggttaaatattcacaatggtctaatatcaagacattcatatcc 266314  T
Q  697 tgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  266315 tggaacttctgcatacacacaagg-agaaac-aataaataaactaaaaatcaaagactata 266373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 342 - 730
Target Start/End: Original strand, 28125322 - 28125710
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28125322 aagttcactgagattttgaaatgaaaatggtaattctcttatggaagttccacgcaaccaaatctcttctatatttgtcatcttgcctaataattctgga 28125421  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcactta 541  Q
    ||||| | ||||||| |||| ||||||||   ||||||||||||| | | |||   ||| || ||||||   |||||||  |||||||| | ||||  ||    
T  28125422 aaactcttgagactctcacattcactgagtttcaattccttaagacaggtcaactgtaaggggggaaaactctcgagcttgctgcaaccttctgcatcta 28125521  T
Q  542 acctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagac 641  Q
    |   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || || ||||||||||||| |||   ||||||    
T  28125522 agacttcaagtttatttaggtacccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaatatgcaaatgagaacttttctaaatttggaagatgtgagac 28125621  T
Q  642 atcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaa 730  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  28125622 atcgggtatatgggttaaatattcacaaaagttcaaagtcaagactttcatattctcgaacttctgcataaacacaaagaagaaacaaa 28125710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 342 - 730
Target Start/End: Original strand, 28130353 - 28130748
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||| |||||| | | ||||| ||| |  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28130353 aagttcacttagattttgaaatgaaaatggtaattctcttatggaagtttcactcaacctaatctcttgtatatttgtcaacttgcctaataattctgga 28130452  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcactta 541  Q
    ||  | | ||||||| |||| || |||||   ||||||||||||||| | ||| | ||| || |||||||  | |||||  |||||||| | |||| |||    
T  28130453 aattttttgagactctcacattccctgagttccaattccttaagagaagtcaaccgtaaggggggaaaattcttgagcttcctgcaaccctttgcattta 28130552  T
Q  542 acctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaat-------tgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggc 634  Q
    |   |||||||||||||||||  ||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||      
T  28130553 agacttcaagtttatttaggtacccaatagaattgtgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaatgagaacttttctaaatttggaagat 28130652  T
Q  635 ctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaa 730  Q
     |||||||| ||||||||  |||||||||| |||   || |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  28130653 gtgagacattgggtatattggttaaatatttacagaagttcaatgtcaagactttcgtattctcgaacttctgcataaacacaaagaagaaacaaa 28130748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 341 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 26138466 - 26138085
Alignment:
Q  341 caagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgg 440  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||| |  | ||||||||||| | | |  | |||||||||    
T  26138466 caagttcactgaaattttgaaatgaaaatggcaattctcctatggaggttccatacaaccaaatgtcttttatatttgtcaacctaccaactaattctgg 26138367  T
Q  441 aaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcactt 540  Q
    |||||| | |||||||  ||||  |  |||   ||||| ||||||||| | |||   ||| |||||||||   |||||||   ||||||| | |||| ||    
T  26138366 aaaactcttgagactcttacaaatagagagttccaatttcttaagagaggtcaactgtaagggtggaaaactctcgagcttgatgcaaccctttgcattt 26138267  T
Q  541 aacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgaga 640  Q
    ||  |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||  ||| |||||||    
T  26138266 aaggtttcaagtttatttaggaacccaattgaattgtgaattgtaattaaattgttacaattttcaaatgagaacttttctaaattttgaagacctgaga 26138167  T
Q  641 catcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaa 722  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||||| ||  ||  |||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  26138166 catcgggtagatcagttaaatattgacaatcgttaaagctcaaaactttcatatactcgaacttctgcatagacaaaaggaa 26138085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26138754 - 26138643
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || |  ||| | | ||||| ||||||  |||||||| ||||| || |||||| |||||| | |||    
T  26138754 ggtgacattcattaaggcactcaggaagaattttaaaatcattacccggtaagtatagatacttcacattagcacacaacctgagaattattggaacaca 26138655  T
Q  222 ttcatctgagag 233  Q
    ||||||||||||    
T  26138654 ttcatctgagag 26138643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Original strand, 28130059 - 28130175
Alignment:
Q  117 aagatggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattggg 216  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| |||| || ||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| |  |||||| |  | ||    
T  28130059 aagatggtgacattcattaagacactccggaataacttttatattgttatctgataagtatagatatttcacattagcgcacaatgtgagaactgctcgg 28130158  T
Q  217 agacattcatctgagag 233  Q
    | |||||||||||||||    
T  28130159 acacattcatctgagag 28130175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 233
Target Start/End: Original strand, 28125033 - 28125144
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |  || || |||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |  |||||| || | | | |||    
T  28125033 ggtgacattcactaagacactcgggaagaattttcatatttttttctgataagcgtagacatgtcacattagcacacaatgtgagaactactcgaataca 28125132  T
Q  222 ttcatctgagag 233  Q
    ||||||||||||    
T  28125133 ttcatctgagag 28125144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1870 (Bit Score: 166; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1870
Description:

Target: scaffold1870; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 412 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 1277 - 932
Alignment:
Q  412 atatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaat 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |  || |  |||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||     
T  1277 atatttgtcatcttgcataataattttggaaaactcttgagactctcacaataagagatattcaattcattaagggatgcaagccctaaaggtggaaaac 1178  T
Q  512 gttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacga 611  Q
    ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  1177 gttcgagtttgctgcaaccatttgcacttaacctttcaagtttattgaggtgtccaattgaattgtgaattgtaattaaattctcacaatattcaaagga 1078  T
Q  612 taatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcata 711  Q
     || ||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1077 gaacttttctaaattttgaagacctgagacatcaggtatatgggttaaatattcacacctgtccaatgtcaagattttcatgttctggaacttctgcata 978  T
Q  712 cacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
     ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||| ||||||    
T  977 aacacaaggaagaaacaaataaattaattaaaaattaaacactata 932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 757
Target Start/End: Original strand, 18728950 - 18729576
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    |   | |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  18728950 ggtgacattcactaaggcactcaggaagaattttgaactgaccaaaggttaagtctagaaatttcacattaatacaccacttgagaactatttggagaca 18729049  T
Q  222 ttcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcattcca 321  Q
    ||||| || ||| ||||||| | |||    ||||     ||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  18729050 ttcatatgggagattgcaatgattgaattcaagaacatccacatttgaaaacattatagaatacattttctcattatgttttgggaacctgagcatttca 18729149  T
Q  322 aattccaattctaacacatcaagttcactg-agaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtc 420  Q
     || |||||  | | |          |||| |||  ||||||||||||||||| ||||| | | ||||||   ||||  | ||| |  | | ||||||||    
T  18729150 catgccaataatgata----------actggagatattgaaatgaaaatggcaattctcttgtggaagttttacacattccaatctcttttgtatttgtc 18729239  T
Q  421 atcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagct 520  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||| | ||||   ||||||||||||||| | ||  |  || ||||||||||  || ||||    
T  18729240 atcttacataataattctggaaaactcttgagtctcttacaataagtgaggtccaattccttaagagagggcagccgcaagggtggaaaattctcaagct 18729339  T
Q  521 ctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttc 620  Q
       |||| ||  ||||| ||||  |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  18729340 tgatgcatccccatgcatttaagatttcaagtttatttagcttcccaatcgaatcgtgaattgcaattaaattgtcacaatattgaaacgagaatttttc 18729439  T
Q  621 taaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaagg 720  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| |||||| |    
T  18729440 taaatttggaagacctgagacattgggtatatgggttaaatattgacacttgtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcataaacaaaaag 18729539  T
Q  721 aagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  18729540 aagaaacaaacaaataaattaaaaataaaacactata 18729576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 413 - 757
Target Start/End: Original strand, 18697139 - 18697483
Alignment:
Q  413 tatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatg 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||    ||||||||| ||||| | ||  | ||| |||||||||      
T  18697139 tatttgtcatcttacataataattctggaaaactcttgagtctcctacaataagagatgtccaattccttcagagagggcagccataagggtggaaaact 18697238  T
Q  513 ttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgat 612  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||     
T  18697239 ctcaagcttgctgcatccacatgcatttatgatttcaagtttatttaggttcctaatcgaatcgtgaattgcaattaaattgttacatttttcaaacgag 18697338  T
Q  613 aatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatac 712  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  18697339 aattcttctaaatttggaagacctgagacattgggtatatgggttaaatattgacaattgtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcataa 18697438  T
Q  713 acaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    ||| || |||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||    
T  18697439 acacaaagaagaaacaaacaaatatattaaaaatcaaatactata 18697483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 545 - 757
Target Start/End: Original strand, 18677428 - 18677640
Alignment:
Q  545 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatc 644  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  18677428 tttcaagtttatttaggttcccaatcgaatcgtgaattgcaattaaattatcacaaaatcgaaacgagaatttttctaaatttggaagacctgagacatt 18677527  T
Q  645 gggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaaga 744  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||| |    
T  18677528 gggtatatgggttaaatatagacaatagtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcataaacacaaagaagaaacaaacaaataaattaaaa 18677627  T
Q  745 atcaaagactata 757  Q
    |||||| ||||||    
T  18677628 atcaaacactata 18677640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 413 - 757
Target Start/End: Original strand, 18687351 - 18687695
Alignment:
Q  413 tatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatg 512  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||| |  ||    ||||||||| ||||| | ||  | ||| |||||||||      
T  18687351 tatttgtcatcttacataataattctggaaaactcttgagtctcctacaataagagatgtccaattccttcagagagggcagccataagggtggaaaact 18687450  T
Q  513 ttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgat 612  Q
     || ||||  ||||| ||| ||||| |||   ||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||     
T  18687451 ctcaagcttactgcatccacatgcatttatgatttcaagtttatttaggttccaaatcgaatcgtgaattgcaattaaattattacaatattaaaacgag 18687550  T
Q  613 aatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatac 712  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  18687551 aattattctaaatttggaagacctaagacattgggtatatgggttaaatattgacaattgtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcataa 18687650  T
Q  713 acaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    ||| || |||||||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  18687651 acacaaagaagaaacaaacaaataaattaaaaataaaacactata 18687695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 413 - 757
Target Start/End: Original strand, 18721810 - 18722154
Alignment:
Q  413 tatttgtcatcttgcataataattctggaaaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatg 512  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||| |||||  |  |||   |||||||| |||||| | ||  | ||| |||||||||      
T  18721810 tatttgtcatcttacataatagttctggaaaactcttgagtctctcacaaaaagagaggtccaattcctcaagagagggcagccataagggtggaaaact 18721909  T
Q  513 ttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgat 612  Q
     || ||||   |||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||  |  ||||||     
T  18721910 ctcaagcttgatgcatccagatgcatttaagatttcaagtttatttaggttcccaatcgaatcgtgaactgcaattaaattatcacaaaatcgaaacgag 18722009  T
Q  613 aatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatac 712  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  18722010 aatttttctaaatttggaagacctgagacattgggtatatgggttaaatattgacacttgtccaatgtcaagactttcatatgctcaaacctctgcataa 18722109  T
Q  713 acaaaaggaagaaacaaatcaataaattaagaatcaaagactata 757  Q
    ||| || |||||||||||  |||||||||| ||| ||| ||||||    
T  18722110 acacaaagaagaaacaaacaaataaattaaaaataaaacactata 18722154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 545 - 757
Target Start/End: Original strand, 18653346 - 18653558
Alignment:
Q  545 tttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatc 644  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||  || |||||| |||| ||||||||| | ||| ||| ||||||     
T  18653346 tttcaagtttatttaggttcccaatcgaatcgtgaattgcaattaaattaatacaaaattgaaacgagaattattctaaattaggaagacctaagacatt 18653445  T
Q  645 gggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaatcaataaattaaga 744  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||| || |||||||||||  |||||||||| |    
T  18653446 gggtatatgggttaaatattgacaattgtccaatgtcaagactttcatatcctcaaacctctgcataaacacaaagaagaaacaaacaaataaattaaaa 18653545  T
Q  745 atcaaagactata 757  Q
    |||||| ||||||    
T  18653546 atcaaacactata 18653558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 18076330 - 18075942
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||  |||| | |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18076330 aagttcactaagattttgaaaggaaaatggaaattctcctatggaagtttccttcaacaagatagattttatatttgtcatcttgcataataattctgga 18076231  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctct-gcaaccatatgcactt 540  Q
    ||||| | |||||||  ||||| |  |||   ||| | || |||||| |   |   ||| |||||||||   ||||||| ||| |||||| | |||| ||    
T  18076230 aaactcttgagactcttacaattagagagttccaaattctgaagagagggagactgtaagggtggaaaactctcgagct-tctcgcaaccctctgcattt 18076132  T
Q  541 aacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgaga 640  Q
    ||  |||| | | ||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||    
T  18076131 aagatttctaatctatttaggtatctaagtgaattgtgaattgtaactaaattatgacatcttgcaaacgagaacttttctaaatttggaagccatgaga 18076032  T
Q  641 catcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaa 730  Q
    |||||||| |||   |||||| || ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  18076031 catcgggtgtatagattaaatcttgacaattgtcgaatatcaacactttcatattctcaagcttctgcataaacacacagaagaaacaaa 18075942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 318
Target Start/End: Original strand, 18726447 - 18726645
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacatta--acacaccacttgagaaatattgggaga 219  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |   |||||||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  18726447 ggtgacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaattgccaaaggataagtctagaaatttcacattaacacacacaacttgagaactatttggaga 18726546  T
Q  220 cattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcatt 318  Q
    ||||||| || ||| ||||||| | ||| |  ||||  |  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18726547 cattcatatgggagattgcaatcattgaaacgaagaccttccacatttgaaaacattattgaatacattttatcattatgttttgggaacctgagcatt 18726645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 318
Target Start/End: Original strand, 18677014 - 18677210
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||  |   |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||     
T  18677014 ggtgacattcattaaggcactcgggaagaattttgaaattgccaaaggataagtctagaaatttcacattaacacacaacttgagaactatttggagacc 18677113  T
Q  222 ttcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcatt 318  Q
    ||||| || ||| ||||||| |  ||||  |||| ||  ||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  18677114 ttcatatgggagattgcaataatggagatgaagagtttccacatttgaaaaccttattgaatacattttctcattatgttttgtgaacctgagcatt 18677210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 226
Target Start/End: Original strand, 18696857 - 18696961
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  18696857 ggtgacattcactaaggcactcgggaagaattttgaatttgccaagggataagtttagatatttcacattaacacacgacttgagaactatttggagaca 18696956  T
Q  222 ttcat 226  Q
    |||||    
T  18696957 ttcat 18696961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 318
Target Start/End: Original strand, 18682171 - 18682369
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacatta--acacaccacttgagaaatattgggaga 219  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |   |||||||||||| || ||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||    
T  18682171 ggtgacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaattgccaaaggataagtctagaaatttcacattaacacacacgacttgagaactatttggaga 18682270  T
Q  220 cattcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcatt 318  Q
    ||||||| || ||| | | || | | ||||  ||||  |  |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18682271 cattcatatgggagatagtaacttccgagataaagaacttccacattcgaaaacattattgaatacattttatcattatgttttgggaacctgagcatt 18682369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 226
Target Start/End: Original strand, 18721528 - 18721632
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | |  |   |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  18721528 ggtgacattcattaaggcactcaggaagaattttgaaatagccaaaggataagtctagaaatttcacattaacacacgacttgagaactatttggagaca 18721627  T
Q  222 ttcat 226  Q
    |||||    
T  18721628 ttcat 18721632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 18686941 - 18687027
Alignment:
Q  1 cattcttctacttgaggatctcaatgatttacaaccttctgcagaaagctcttttatattaggtggaatccctctaatttcctcaag 87  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||  ||| | ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18686941 cattcttctacttgaggaactcaatgatttacaatcatatgcatcaagatatttgagattcggtggaatccctctaatttcctcaag 18687027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 318
Target Start/End: Original strand, 18652932 - 18653128
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    ||||| ||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||  |   ||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  18652932 ggtgacattcattaaggtactcgggaagaattttgaaattgcaacgggataagcttagaaatttcacattaacacacgacttgagaactatttggagaca 18653031  T
Q  222 ttcatctgagagcttgcaattactgagaataagatttgtcacatttgagaacactattgaatacatcttatcattatgttttgggaagctcagcatt 318  Q
    ||||| || ||| | | ||  |  ||||  |||| ||  ||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  18653032 ttcatatgggagatagtaagcatcgagatgaagagtttccacatttgaaaacattatagaatacattttctcattatgttttgggaacctgagcatt 18653128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 225
Target Start/End: Original strand, 18687063 - 18687166
Alignment:
Q  122 ggtgaaattcactaagccactcaggaagaattttgaatttgttatctgataagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagaca 221  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |   ||||||| |||| || |||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||    
T  18687063 ggtgacattcactaaggcactcgggaagaattttgaaattgccaaaggataagtttagaaatttcacattaacacacgacttaagaactatttggagaca 18687162  T
Q  222 ttca 225  Q
    ||||    
T  18687163 ttca 18687166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 446
Target Start/End: Original strand, 18677296 - 18677329
Alignment:
Q  413 tatttgtcatcttgcataataattctggaaaact 446  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18677296 tatttgtcatcttacataataattctggaaaact 18677329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 347 - 711
Target Start/End: Original strand, 17990853 - 17991217
Alignment:
Q  347 cactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctggaaaact 446  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  |   |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17990853 cactgagattttgaaatgaaaatggcaattctcctatggaactatctgccaaccaaatatgttctatctttgtcatcttgcataataattctggaaaact 17990952  T
Q  447 atcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctctgcaaccatatgcacttaacctt 546  Q
     |  ||  ||| |||   |   ||   ||||| |||||||||||||||   ||| || ||||||   |||||||  || ||||| | |||| ||||  ||    
T  17990953 ctttaggttcctacatctagatagttccaatttcttaagagatgccaactgtaagggaggaaaactctcgagcttgctacaaccctgtgcatttaagatt 17991052  T
Q  547 tcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgagacatcgg 646  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| || || | || |||  ||  ||| |||||||||||||    
T  17991053 tcaagtttatttaggtacccaatcgaatcgtgaattgtaattaaattattacactcttcaaatgagaactcttttaagctttgaagacctgagacatcgg 17991152  T
Q  647 gtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcata 711  Q
    |||| |   ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17991153 gtattttcattaaatattgacaacggttaaatgtcaagactttcatattctcgaacttctgcata 17991217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 241
Target Start/End: Original strand, 17990606 - 17990675
Alignment:
Q  172 aagtctagatatgtcacattaacacaccacttgagaaatattgggagacattcatctgagagcttgcaat 241  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  |  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  17990606 aagtctagatgtttcacattagcacaccacttgagaaccaacggaagacattcatctgagaggttgcaat 17990675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 342 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 62138 - 61750
Alignment:
Q  342 aagttcactgagaatttgaaatgaaaatggcagttctcctatcgaagttccccacaaccaaatattgtctatatttgtcatcttgcataataattctgga 441  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||  |||| | |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62138 aagttcactaagattttgaaaggaaaatggaaattctcctatggaagtttccttcaacaagatagattttatatttgtcatcttgcataataattctgga 62039  T
Q  442 aaactatcgagactcccacaatcactgagacacaattccttaagagatgccaaacctaaaggtggaaaatgttcgagctctct-gcaaccatatgcactt 540  Q
    ||||| | |||||||  ||||| |  |||   ||| | || |||||| |   |   ||| |||||||||   ||||||| ||| |||||| | |||| ||    
T  62038 aaactcttgagactcttacaattagagagttccaaattctgaagagagggagactgtaagggtggaaaactctcgagct-tctcgcaaccctctgcattt 61940  T
Q  541 aacctttcaagtttatttaggtgtccaatcgaattgtgaattgtaattaaattatcacaattttcaaacgataatttttctaaatttgaaaggcctgaga 640  Q
    ||  |||| | | ||||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||| |||  || ||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||    
T  61939 aagatttctaatctatttaggtatctaagtgaattgtgaattgtaactaaattatgacatcttgcaaacgagaacttttctaaatttggaagccatgaga 61840  T
Q  641 catcgggtatatgtgttaaatattcacaatggtccaatgtcaagactttcatattctgaaacttctgcatacacaaaaggaagaaacaaa 730  Q
    |||||||| |||   |||||| || ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||| ||| |  |||||||||||    
T  61839 catcgggtgtatagattaaatcttgacaattgtcgaatatcaacactttcatattctcaagcttctgcataaacacacagaagaaacaaa 61750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University