View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF3820_low_79 (Length: 347)

Name: NF3820_low_79
Description: NF3820
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF3820_low_79
NF3820_low_79
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-331)||(13487355-13487685)
chr5 (5-331)||(535069-535396)
chr5 (1-331)||(26174110-26174441)
chr5 (8-331)||(42426938-42427265)
chr5 (5-323)||(16408634-16408954)
chr5 (1-331)||(29721703-29722036)
chr5 (1-331)||(16545772-16546103)
chr5 (1-331)||(40381448-40381779)
chr5 (21-276)||(13294990-13295247)
chr5 (26-235)||(27911513-27911725)
chr5 (2-235)||(18510400-18510636)
chr5 (5-201)||(34478139-34478337)
chr5 (5-175)||(15355594-15355767)
chr5 (147-235)||(20044175-20044264)
chr5 (5-201)||(31544094-31544293)
chr5 (5-201)||(23666408-23666606)
chr5 (116-307)||(31466821-31467015)
chr5 (5-175)||(6746432-6746606)
chr5 (26-235)||(20504853-20505065)
chr5 (21-201)||(10756271-10756453)
chr5 (4-126)||(13693993-13694116)
chr5 (157-215)||(32608817-32608875)
chr5 (179-234)||(41586994-41587049)
chr5 (2-235)||(659075-659311)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (5-331)||(28221930-28222257)
chr1 (5-326)||(13548195-13548516)
chr1 (5-331)||(28221559-28221886)
chr1 (5-325)||(776407-776728)
chr1 (5-325)||(50167863-50168184)
chr1 (9-233)||(28242923-28243147)
chr1 (8-233)||(31928880-31929104)
chr1 (6-190)||(31658477-31658661)
chr1 (1-326)||(13126298-13126624)
chr1 (147-276)||(19753444-19753575)
chr1 (9-124)||(19753276-19753391)
chr1 (26-307)||(14098835-14099123)
chr1 (2-235)||(28202347-28202583)
chr1 (111-295)||(25249574-25249762)
chr1 (116-307)||(31423946-31424139)
chr1 (136-234)||(41139221-41139319)
chr1 (41-230)||(6996681-6996872)
chr1 (112-307)||(16430116-16430316)
chr1 (5-201)||(51751398-51751597)
chr1 (5-201)||(16227529-16227727)
chr1 (8-201)||(47178726-47178922)
chr1 (5-203)||(31736529-31736730)
chr1 (116-215)||(50077800-50077899)
chr1 (285-331)||(31658658-31658704)
chr1 (264-312)||(51751645-51751693)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (5-331)||(47674645-47674971)
chr7 (5-331)||(48490739-48491066)
chr7 (1-331)||(6593038-6593369)
chr7 (1-331)||(18390672-18391007)
chr7 (2-269)||(6047880-6048148)
chr7 (63-276)||(26214180-26214394)
chr7 (6-105)||(6430736-6430835)
chr7 (26-234)||(44726009-44726221)
chr7 (6-124)||(4509986-4510104)
chr7 (6-124)||(4511828-4511946)
chr7 (5-235)||(38395354-38395587)
chr7 (147-237)||(4509842-4509933)
chr7 (147-237)||(4511684-4511775)
chr7 (141-261)||(6430901-6431021)
chr7 (2-276)||(44011455-44011734)
chr7 (5-201)||(22136174-22136372)
chr7 (5-201)||(40551201-40551399)
chr7 (32-235)||(24816014-24816219)
chr7 (138-267)||(38281418-38281548)
chr7 (5-201)||(1048008-1048207)
chr7 (5-201)||(7093180-7093379)
chr7 (2-201)||(28486631-28486833)
chr7 (116-294)||(24749770-24749950)
chr7 (26-235)||(9679748-9679958)
chr7 (5-203)||(20298349-20298550)
chr7 (171-256)||(6067995-6068080)
chr7 (5-201)||(7350372-7350569)
chr7 (148-296)||(21679274-21679426)
chr7 (1-46)||(1560757-1560802)
chr7 (5-175)||(31157030-31157203)
chr7 (264-312)||(43856-43904)
chr7 (264-312)||(1047912-1047960)
chr7 (264-312)||(28486881-28486929)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (1-331)||(34571108-34571435)
chr4 (5-331)||(12740239-12740566)
chr4 (5-331)||(12748445-12748772)
chr4 (6-276)||(54881919-54882189)
chr4 (2-324)||(8394751-8395074)
chr4 (1-331)||(7124040-7124371)
chr4 (1-331)||(5137424-5137755)
chr4 (21-326)||(10113973-10114281)
chr4 (21-331)||(26559018-26559329)
chr4 (61-276)||(36770623-36770841)
chr4 (2-235)||(47563866-47564103)
chr4 (2-235)||(22801758-22801994)
chr4 (2-296)||(12401678-12401979)
chr4 (2-307)||(36379337-36379649)
chr4 (131-276)||(47565851-47565997)
chr4 (1-307)||(14788343-14788656)
chr4 (26-235)||(24879647-24879859)
chr4 (2-235)||(36920519-36920755)
chr4 (26-307)||(16454440-16454728)
chr4 (2-204)||(22133298-22133503)
chr4 (5-175)||(9175217-9175391)
chr4 (5-201)||(11007288-11007486)
chr4 (5-201)||(22781457-22781655)
chr4 (26-235)||(5099954-5100164)
chr4 (6-201)||(16932868-16933065)
chr4 (148-296)||(12396736-12396888)
chr4 (5-201)||(22045433-22045632)
chr4 (264-312)||(22045339-22045387)
chr4 (1-127)||(12399576-12399705)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (5-331)||(29812204-29812530)
chr3 (8-331)||(5258829-5259153)
chr3 (1-331)||(23198645-23198976)
chr3 (1-324)||(6717841-6718166)
chr3 (77-331)||(9635004-9635260)
chr3 (1-331)||(10210530-10210861)
chr3 (2-331)||(4599224-4599554)
chr3 (1-331)||(10057577-10057908)
chr3 (1-331)||(10059799-10060130)
chr3 (1-331)||(10062021-10062352)
chr3 (1-331)||(10064243-10064574)
chr3 (1-331)||(10066465-10066796)
chr3 (1-257)||(7763600-7763856)
chr3 (27-331)||(15824365-15824667)
chr3 (6-246)||(32892424-32892664)
chr3 (221-331)||(37407810-37407920)
chr3 (6-124)||(43403172-43403290)
chr3 (141-233)||(43403032-43403125)
chr3 (2-307)||(3315718-3316030)
chr3 (5-203)||(4309224-4309425)
chr3 (26-235)||(28138227-28138439)
chr3 (87-276)||(27422094-27422275)
chr3 (192-307)||(35918808-35918927)
chr3 (116-235)||(890892-891012)
chr3 (42-235)||(28100994-28101189)
chr3 (2-307)||(53916584-53916896)
chr3 (1-123)||(1619605-1619729)
chr3 (2-296)||(18097753-18098054)
chr3 (5-201)||(457247-457445)
chr3 (147-271)||(1619474-1619599)
chr3 (148-235)||(23634948-23635036)
chr3 (5-203)||(5898752-5898953)
chr3 (42-307)||(43422381-43422651)
chr3 (5-175)||(6064538-6064711)
chr3 (2-175)||(42991335-42991512)
chr3 (279-331)||(7763864-7763916)
chr3 (2-177)||(25634867-25635045)
chr3 (5-203)||(43227420-43227621)
chr3 (264-312)||(457493-457541)
chr3 (26-85)||(7769906-7769966)
chr3 (264-312)||(10956972-10957020)
chr3 (264-312)||(43227667-43227715)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (1-331)||(34255012-34255343)
chr8 (5-331)||(4732964-4733292)
chr8 (5-331)||(41365522-41365846)
chr8 (14-236)||(42436230-42436439)
chr8 (21-329)||(31574457-31574767)
chr8 (90-331)||(17849089-17849329)
chr8 (141-232)||(40220644-40220735)
chr8 (172-328)||(29797068-29797221)
chr8 (6-105)||(40220801-40220900)
chr8 (26-235)||(41383788-41384000)
chr8 (2-235)||(15071871-15072105)
chr8 (5-201)||(18812124-18812322)
chr8 (5-201)||(43081018-43081216)
chr8 (2-78)||(17848974-17849051)
[»] scaffold1908 (1 HSPs)
scaffold1908 (6-323)||(698-1016)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (1-324)||(16554008-16554332)
chr6 (1-324)||(16630564-16630888)
chr6 (1-324)||(16652270-16652594)
chr6 (1-331)||(34166216-34166547)
chr6 (115-331)||(5407630-5407847)
chr6 (115-331)||(5411955-5412172)
chr6 (1-187)||(16568296-16568482)
chr6 (115-331)||(5406862-5407078)
chr6 (115-331)||(5411187-5411403)
chr6 (2-261)||(30444681-30444941)
chr6 (1-276)||(11137464-11137741)
chr6 (122-298)||(10456158-10456333)
chr6 (6-105)||(17758640-17758739)
chr6 (26-235)||(3630929-3631141)
chr6 (1-91)||(5407076-5407166)
chr6 (1-91)||(5411401-5411491)
chr6 (90-235)||(15533622-15533768)
chr6 (2-231)||(3395369-3395601)
chr6 (141-233)||(17758805-17758897)
chr6 (159-273)||(28038613-28038728)
chr6 (101-237)||(24543467-24543600)
chr6 (5-201)||(33310250-33310448)
chr6 (137-249)||(26944598-26944711)
chr6 (286-331)||(16568485-16568530)
chr6 (190-319)||(22615253-22615382)
chr6 (5-201)||(26067117-26067313)
chr6 (206-276)||(28078333-28078404)
[»] scaffold0491 (1 HSPs)
scaffold0491 (9-331)||(9423-9746)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (5-331)||(14634505-14634832)
chr2 (21-271)||(28569036-28569290)
chr2 (2-307)||(31733792-31734101)
chr2 (77-271)||(42018468-42018661)
chr2 (2-307)||(6263065-6263376)
chr2 (90-237)||(41303930-41304077)
chr2 (61-231)||(21519348-21519519)
chr2 (116-235)||(22404986-22405106)
chr2 (6-201)||(36559864-36560061)
chr2 (5-201)||(35216689-35216888)
chr2 (158-253)||(16676966-16677061)
chr2 (142-276)||(6396483-6396618)
chr2 (205-326)||(13829045-13829167)
chr2 (256-331)||(41303847-41303922)
chr2 (76-124)||(16604651-16604699)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (2-234)||(34951-35187)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (138-307)||(3980-4151)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (30-185)||(23009-23164)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (5-175)||(532-706)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-307)||(51074-51387)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (5-201)||(23488-23687)
[»] scaffold1899 (1 HSPs)
scaffold1899 (5-201)||(985-1184)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (26-175)||(70272-70425)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 13487355 - 13487685
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13487355 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 13487454  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13487455 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 13487554  T
Q  201 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13487555 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaag 13487654  T
Q  301 tgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13487655 tgggagacgttccatggttgaagagggtttg 13487685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 535069 - 535396
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  535069 ctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggaggtgcaaggtgaaggcatagtatgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaa 535168  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 203  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  535169 agctcaacttaaggtggagttgaggatatcgggaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgctctagttatgagcatgtgaattcttcatgggg 535268  T
Q  204 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| || ||||||    
T  535269 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattagatgcaatgtgatcttcgaggaagtgg 535368  T
Q  304 gagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  535369 gagacgttccgtggttgaagagggtttg 535396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 26174110 - 26174441
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  26174110 tagtctggagaggaggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggtggaagcatagtgcaagtactcatttggaagttgaggtag 26174209  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26174210 agaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggaggctttgggagtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 26174309  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||    
T  26174310 gaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaa 26174409  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26174410 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 26174441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42427265 - 42426938
Alignment:
Q  8 gagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagc---aaggt-gaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagaga 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    ||||| |||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  42427265 gagaggcggtgtgaagagtacccgtgatcaacctttaaggtggaggagttggaaggtagaag-catattgtgagtatgcatttggaagttgaggaagaga 42427167  T
Q  104 aagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgag 202  Q
    ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  42427166 aagctcaacttgaggtggagtggatgacaccgagaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgctctagctgtgagcatgtgaattcttcatgat 42427067  T
Q  203 gacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtg 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |    
T  42427066 gacggaaggcattctggggtttgaagaatatatgatgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaaacg 42426967  T
Q  303 ggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42426966 ggagacgttccgtggttgaagagggtttg 42426938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 323
Target Start/End: Original strand, 16408634 - 16408954
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16408634 ctggagaggcggtggtgagaatactcatgatcaacctttgaggtggagtggcaaggtggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtagagaa 16408733  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 203  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408734 agctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggagactttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 16408833  T
Q  204 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacct-aaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtg 302  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||| |    
T  16408834 acggaaggtactccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaagcg 16408933  T
Q  303 ggagacgttccatggttgaag 323  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  16408934 ggagacgttccgtggttgaag 16408954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 29721703 - 29722036
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  29721703 tagtctggagaggcggtgataacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaagtggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 29721802  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccg-agaatggtataactatggaggccttgggtgtt--atgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29721803 agaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccggaaaatggtatgactatggaggctttgggagttttatgctctagttgtgagcatgcgaattcttc 29721902  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaaga 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||     
T  29721903 atgaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacctaaaacaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgagg 29722002  T
Q  298 aagtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |   |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29722003 agacgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 29722036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 16545772 - 16546103
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  16545772 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 16545871  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||   |||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16545872 cgaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacggctatgggggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtgaattcttcat 16545971  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| |     
T  16545972 gaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtttggggtggcttgtgtgattgcctaaaagaccaaaggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggag 16546071  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16546072 gcgggagacgttccgtagttgaagatggtttg 16546103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 40381448 - 40381779
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||| |||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   ||||||||| ||||||||||| ||    
T  40381448 tagtttggagaggcggtgataacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtacgcatttggaagttgaggcag 40381547  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||   || ||| ||||| ||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40381548 agaaagctcaacttgaggtggagttggtaactccgggaatgttacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 40381647  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  40381648 gaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggtgacttgtgtgattgcctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 40381747  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  40381748 gcgggagacgttccgtagttgaagatggtttg 40381779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 276
Target Start/End: Original strand, 13294990 - 13295247
Alignment:
Q  21 aagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggt 119  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  13294990 aagaatactcgtgatcagccttagaggtggagttgcaaggtgaaagacatagtggaagtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcagcttgaggt 13295089  T
Q  120 ggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgg 219  Q
    |||| ||| |||||| | |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||| | ||||||| | | |||| |||    
T  13295090 ggagatgatgacaccaaaaatggtacgactatggagaccttgggtgctatgctctagttgtgagcaagggagctctttaagaggacgaacgacatttcgg 13295189  T
Q  220 ggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgattg 276  Q
     ||||||| |||||||||  |||||| || ||||| || |||||||||| ||| ||||    
T  13295190 agtttgaaaaatgtatggcatgacttttgggattacccgaaaagaccaaaggtaattg 13295247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 27911513 - 27911725
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||| |||||||| | | ||| | | |||||||    
T  27911513 tactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaaggtagagtacgctcagcgtgaggtgga 27911612  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| || |    
T  27911613 gttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggag 27911711  T
Q  222 tttgaagaatgtat 235  Q
     |||||||||||||    
T  27911712 gttgaagaatgtat 27911725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18510636 - 18510400
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  18510636 agtctggagaggcggaggcaaaaatactcataatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 18510537  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| |   |||   | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  18510536 agagtactctcagtgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 18510438  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  18510437 atgaagacggaaggcattccggaggttaaagaatgtat 18510400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34478337 - 34478139
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  34478337 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 34478238  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  34478237 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 34478139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15355767 - 15355594
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  15355767 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 15355668  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctcta 175  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||    
T  15355667 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 15355594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 235
Target Start/End: Original strand, 20044175 - 20044264
Alignment:
Q  147 actatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  20044175 actatggaggaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagagatttcttcatgaagacggaagacattccggaggttgaagaatgtat 20044264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 31544094 - 31544293
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaagg-tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  31544094 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 31544193  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  31544194 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 31544292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 23666408 - 23666606
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  23666408 ctggagaggcggtggtaagaatactcaggatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 23666507  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  23666508 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 23666606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31467015 - 31466821
Alignment:
Q  116 aggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcat 214  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| |||||||| |||    
T  31467015 aggtggagttaaacacaccgataatggtacgactatggaggaccttggttgctatgctcta-tggtgagcaagagatttcttcatgaagacggaagacat 31466917  T
Q  215 tccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc---taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggaga 307  Q
    | | | | ||||||||||||| |   | |||| | |||||||    ||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31466916 ttcagaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaagaaagtgggaga 31466821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Original strand, 6746432 - 6746606
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  6746432 ctggagaggtggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 6746531  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctcta 175  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6746532 gtatgctcaccgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta 6746606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20505065 - 20504853
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| ||||| |   ||| | | |||||||    
T  20505065 tactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagttagagtacactcagcgtgaggtgga 20504966  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    || ||  ||||||  |||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| | || || ||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  20504965 gtggaacacaccggtaatggtacggctatggaggaccttggatgttatgctcta-tggtgagcaagggatttgttcatgaagacggaaggcattacggag 20504867  T
Q  222 tttgaagaatgtat 235  Q
     |||||||||||||    
T  20504866 gttgaagaatgtat 20504853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 10756271 - 10756453
Alignment:
Q  21 aagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaag 117  Q
    |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| | | ||| | | ||    
T  10756271 aagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtatgctcagcgtgag 10756370  T
Q  118 gtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    ||||||||||   |||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  10756371 gtggagttgaactcaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 10756453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13694116 - 13693993
Alignment:
Q  4 tctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtg-aagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagag 102  Q
    |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||  | || |||||  ||| || ||||||||    
T  13694116 tctggagaggcggaaataagaatactcgtgatcaaccttagaggtggagttacaaggtgaaagtcatagtggatttatgcattttgaattttaggtagag 13694017  T
Q  103 aaagatcaacttaaggtggagttg 126  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||    
T  13694016 aaagctcaacttgaggtagagttg 13693993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Original strand, 32608817 - 32608875
Alignment:
Q  157 ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcatt 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  32608817 ccttgggtgttatgctctatttgtgagcaagagaattcttcaagaggacgaaagacatt 32608875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41587049 - 41586994
Alignment:
Q  179 gtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgta 234  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41587049 gtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 41586994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 659075 - 659311
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||| ||||||  |||| | |||||||||||| | ||||||||||    |||| ||||    
T  659075 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgagatggagtttcaagattgaagacatagtgggatgtacgcattttctagtttaggt 659174  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| | | ||||||||||||  |||| |  |||||||  |||||| ||| ||||||||| | ||||||| |  |||||| | || ||||||    
T  659175 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctttgctcta-tgatgagcaagggatttcttc 659273  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  659274 atgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgtat 659311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28222257 - 28221930
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28222257 ctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaa 28222158  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 203  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28222157 agctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtataactatggaggccttaggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 28222058  T
Q  204 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgg 303  Q
    || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  28222057 acagaagccattccggggtttgaataatgtatagtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtgg 28221958  T
Q  304 gagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  28221957 gagacgttccatggttaaagagggtttg 28221930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13548516 - 13548195
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13548516 ctggagagacggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtgtacgcatttggaagttaaggtagagaa 13548417  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagga 204  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13548416 agctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggaggccttgagtgctatgttctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagga 13548317  T
Q  205 cggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtggg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||| |||    
T  13548316 cggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaagatgatcttcaaggaagcggg 13548217  T
Q  305 agacgttccatggttgaagagg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  13548216 agacgttccatggttgaagagg 13548195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28221886 - 28221559
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28221886 ctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtgtatgcatttggaagttgaggtagagaa 28221787  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 203  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28221786 agctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtataactatggaggcctttggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 28221687  T
Q  204 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgg 303  Q
    || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  28221686 acagaaggcattacggggtttgaataatgtattgtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 28221587  T
Q  304 gagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28221586 gagacgttccgtggttaaagagggtttg 28221559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 776407 - 776728
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  776407 ctggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtatacgcatttggaagttgaggtagataa 776506  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 203  Q
    || ||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  776507 agctcaacttgaggtggagttgataacaccggaaatggtaccactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 776606  T
Q  204 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgg 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  776607 acggaaggcattccggggtttgaagactgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 776706  T
Q  304 gagacgttccatggttgaagag 325  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  776707 gagacgttccgtggttgaagag 776728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50168184 - 50167863
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  50168184 ctggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtgtacacatttggaagttgaggtagagaa 50168085  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 203  Q
    |  ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50168084 aactcaacttgaggtggagttgatgacaccggaaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 50167985  T
Q  204 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgg 303  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||| ||| ||    
T  50167984 acgaaaggcattccggggtttgaaaaatgtatgatatggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggttattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgg 50167885  T
Q  304 gagacgttccatggttgaagag 325  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  50167884 gagacgttccgtggttgaagag 50167863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 28242923 - 28243147
Alignment:
Q  9 agaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagat 108  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  28242923 agaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggtgaaagcatagtgtgtgtacacatttggaagttgaggtagagaaagct 28243022  T
Q  109 caacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacgga 208  Q
    |||||  ||||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28243023 caactagaggtggagttagtgacaccgggaatggtacgactatggaggtattgggtgttatgctctatttgtgagcatgtgaattctccatgaggacgga 28243122  T
Q  209 aggcattccggggtttgaagaatgt 233  Q
    | |||||||| ||||||||||||||    
T  28243123 aagcattccgtggtttgaagaatgt 28243147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31929104 - 31928880
Alignment:
Q  8 gagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaaga 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  31929104 gagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaatgcatagtgtgtgtacg-atttggaagttgaggtagagaaagt 31929006  T
Q  108 tcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacgg 207  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||     
T  31929005 tcgacttgaggtggagttggtgacaccaggaatggtacgactatggagaccttgggtgatatgctctagttgtgagcaagagaattcttcaagaggacga 31928906  T
Q  208 aaggcattccggggtttgaagaatgt 233  Q
    ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  31928905 aagacatttcgggggttgaagaatgt 31928880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 190
Target Start/End: Original strand, 31658477 - 31658661
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  31658477 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatca-cctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatggtgtgtgtaagcatttggacgttgaggtagagaaa 31658575  T
Q  106 gatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtg-ttatgctctagttgtgagcatgtga 190  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31658576 gctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtga 31658661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13126624 - 13126298
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtg-aagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||| |||||||| |  |||| |||| || ||| |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  13126624 tagtctgaagaggcggaggtaagaatacttgtaatctacctttaaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacgcatttggaagttgaggt 13126525  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||||||||  |||| || |||||||  ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  13126524 agagaaagctcagctagaggtggagttgaacacactgaaaatggtacgactatagaggaccttg--tgttatgctctagttgtgagcaaggaaattcttc 13126427  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattac-ctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaag 296  Q
    |||| |||  |||||||||||  |||||||||| |||| |  || |||||| |||||| |||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  13126426 atgaagacaaaaggcattccgaagtttgaagaaagtatagcatggcttgtgggattacgctaaaaaaccaagggtgattagatgcaaggagatcttcaag 13126327  T
Q  297 aaagtgggagacgttccatggttgaagagg 326  Q
     ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  13126326 gaag-gggagatgttccgtggttgaagagg 13126298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 276
Target Start/End: Original strand, 19753444 - 19753575
Alignment:
Q  147 actatggaggccttgggtg-ttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgactt 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19753444 actatggaggccttgggtgcttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcatttcggggtttgaagaatgtatggcgttactt 19753543  T
Q  246 gtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattg 276  Q
    |||  ||||||  |||||||||| ||| ||||    
T  19753544 gtggaattaccggaaaagaccaatggtaattg 19753575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 19753276 - 19753391
Alignment:
Q  9 agaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagat 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||    
T  19753276 agaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaaccttttaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtatgtgtacgcgtttggaagttgaggtggagaaatat 19753375  T
Q  109 caacttaaggtggagt 124  Q
    || ||| |||||||||    
T  19753376 cagcttgaggtggagt 19753391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14099123 - 14098835
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||| |||| |  |||||||| |||| | | ||| | | |||||||    
T  14099123 tactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggcagagtacgctcagcgtgaggtgga 14099024  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||  ||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| || |    
T  14099023 gttgaacacaccggtaatggtatgtctatggaggaccttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggag 14098925  T
Q  222 tttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggaga 307  Q
     ||||||||||||| |  || |||| | |||||||     ||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  14098924 gttgaagaatgtatagcatggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagaccttcaaggaagcgggaga 14098835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28202583 - 28202347
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||| |||||| |  |||||||||    
T  28202583 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgttcgcatttgctagttgaggt 28202484  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| ||| ||||||||||||  ||| ||  ||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | |  ||||||    
T  28202483 agagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatggcacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggttttcttc 28202385  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28202384 atgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtat 28202347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25249762 - 25249574
Alignment:
Q  111 acttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaa 209  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||  ||| |||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| | || |||||||||| ||| |||    
T  25249762 acttgaggtggagttgaacacaccggaaatcgtatgactatggaggaccttgggtgctatgatctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaa 25249663  T
Q  210 ggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacct---aaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaa 295  Q
    ||||||| || | ||||| ||||||| |  ||||||| | |||||||    ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  25249662 ggcattctggaggttgaataatgtatagcatgacttgcgggattaccctaaaaaaggccaagggtgattggatgcaagatgatcttcaa 25249574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31424139 - 31423946
Alignment:
Q  116 aggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||| |||  ||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  31424139 aggtggagttgaacacaccggtaatagtacgactatgggggaccttgggtgctatgctctag--gtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcat 31424042  T
Q  215 tccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc---taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggaga 307  Q
    ||||| | ||||||||||||| |   | |||| | |||||||    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31424041 tccggaggttgaagaatgtattgcacggcttgcgggattaccctaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggaga 31423946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 41139221 - 41139319
Alignment:
Q  136 agaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgta 234  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||||||||    
T  41139221 agaatggtacaactatggagaccttgcgtgttatgctctaactgtgagcaagagaattcttcaagaggacgaaaggcattctagggtatgaagaatgta 41139319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 230
Target Start/End: Original strand, 6996681 - 6996872
Alignment:
Q  41 tttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgaga 138  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| | | ||| | | ||||||||||||  ||| ||  |    
T  6996681 tttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggta 6996780  T
Q  139 atggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaa 230  Q
    ||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6996781 atggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaa 6996872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 307
Target Start/End: Original strand, 16430116 - 16430316
Alignment:
Q  112 cttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaag 210  Q
    ||||||||||||||||  |||||   |||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||||    
T  16430116 cttaaggtggagttgaacacaccagtaatggtacggctatggaggaccttggatgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaag 16430215  T
Q  211 gcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggag 306  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||| |   | |||| | |||||||     ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  16430216 gcattccgaaggttggagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcgggag 16430315  T
Q  307 a 307  Q
    |    
T  16430316 a 16430316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 51751398 - 51751597
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaagg-tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  51751398 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 51751497  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  51751498 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 51751596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 16227529 - 16227727
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  16227529 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagatatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 16227628  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  16227629 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 16227727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Original strand, 47178726 - 47178922
Alignment:
Q  8 gagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| |    
T  47178726 gagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagta 47178825  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
     | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  47178826 cgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 47178922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31736730 - 31736529
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    |||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  31736730 ctggagaggcggttgtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 31736631  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggag-gccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||   ||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  31736630 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatggagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 31736532  T
Q  201 agg 203  Q
    |||    
T  31736531 agg 31736529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50077899 - 50077800
Alignment:
Q  116 aggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||||  |||||| || ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  50077899 aggtggagttgaacacaccgataatggtacgactatggagaaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcat 50077801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 331
Target Start/End: Original strand, 31658658 - 31658704
Alignment:
Q  285 gtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31658658 gtgatcttcaaggaagcaggagacgttccgtggttgaagagggtttg 31658704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Original strand, 51751645 - 51751693
Alignment:
Q  264 ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttc 312  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  51751645 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 51751693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 47674971 - 47674645
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47674971 ctggataggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttaaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaa 47674872  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagga 204  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47674871 agctcaacttaaggtggagttgatgacacctggaatggtacaactatggtggccttgagtgatatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagga 47674772  T
Q  205 cggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtggg 304  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||    
T  47674771 cggaagacattccagggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagatcaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggg 47674672  T
Q  305 agacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47674671 agacgttccgtggttgaagagggtttg 47674645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 48490739 - 48491066
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48490739 ctggagaggcactgtgaataatacttgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaa 48490838  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 203  Q
    || ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48490839 agctcaacttgaggtggagtagatgacaccgggaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtaaattcttcatgagg 48490938  T
Q  204 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgg 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| ||    
T  48490939 acggaaggcattccgaggtttgaagaatgtatgatgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaagaagcgg 48491038  T
Q  304 gagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  48491039 gagacgttccgtggttgaagagggtttg 48491066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6593369 - 6593038
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  6593369 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggatgtacgcatttggaagttgaggtag 6593270  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6593269 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggttatggaggctttgggagtttatgctctagttgtgagcatgtggattcttcat 6593170  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  6593169 gaggacggatggtcttccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 6593070  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6593069 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 6593038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18391007 - 18390672
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  18391007 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcatgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggatgtacgcatttggaagttgaggtag 18390908  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatg----tgaattct 195  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||   |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  18390907 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagttgtgagcatgcatgtgaattct 18390808  T
Q  196 tcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaa 295  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  18390807 tcatgaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacctaaaagaccaaaggtgatcggatgcaaggtgatcttcaa 18390708  T
Q  296 gaaagtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | | | |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  18390707 ggaggcgggagacgttccgtagttgaagatggtttg 18390672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Original strand, 6047880 - 6048148
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||    
T  6047880 agtctgaagaggcggaggtaagaatacttgtaatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaagacatagtgtgcgtacttatttggaagttgaggtag 6047979  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    |||||  ||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| |  ||||||||| |    
T  6047980 agaaatgtcagcttgaggtggagttgatgacatcgagaatggtacaactatgg-gaccttgggtgctaggctctagttgtgagcaaggaaattcttcaag 6048078  T
Q  201 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc-taaaagaccaagg 269  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  6048079 aggacgaaaggcatttcggggtttgaagaatgcatggcatgacttgtaggattaccagaaaagaccaagg 6048148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 276
Target Start/End: Original strand, 26214180 - 26214394
Alignment:
Q  63 aagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgg 162  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||   ||| | ||  ||||||||| ||||||    
T  26214180 aagacctattgtgtgtacgcatttggaagttgaggtagataaagctcagcttgaggtggagttggtgacactaggaacgatacgactatggagaccttgg 26214279  T
Q  163 gtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc-taaaa 261  Q
    ||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||  || |||||| |||||||  ||||    
T  26214280 gtgctagactctagttgtgagcaagggaattcttcaagaagacggaagacattccgtagtttgaagaatgtatggcttggcttgtgggattaccagaaaa 26214379  T
Q  262 gaccaagggtgattg 276  Q
    ||| |||||| ||||    
T  26214380 gacgaagggtaattg 26214394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 105
Target Start/End: Original strand, 6430736 - 6430835
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  6430736 tggagaggcggtgtgaagaatatttgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtgtacgcgtttggaagttgaggtggagaaa 6430835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 44726009 - 44726221
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| | | ||| | | |||||||    
T  44726009 tactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaagttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgga 44726108  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||| || |||||||||||||| |    
T  44726109 gttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagatggaaggcattccggag 44726208  T
Q  222 tttgaagaatgta 234  Q
     ||||||||||||    
T  44726209 gttgaagaatgta 44726221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4510104 - 4509986
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||||    
T  4510104 tggaggggcggtgtgcagaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtaaaggcagagtatgtgtacgcgtttggaagttgaggtgcagaaa 4510005  T
Q  106 gatcaacttaaggtggagt 124  Q
      ||||||| |||||||||    
T  4510004 tctcaacttgaggtggagt 4509986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4511946 - 4511828
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||||    
T  4511946 tggaggggcggtgtgcagaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtaaaggcagagtatgtgtacgcgtttggaagttgaggtgcagaaa 4511847  T
Q  106 gatcaacttaaggtggagt 124  Q
      ||||||| |||||||||    
T  4511846 tctcaacttgaggtggagt 4511828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Original strand, 38395354 - 38395587
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||     
T  38395354 ctggagagacggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggggtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagg 38395453  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  38395454 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagcgatttcttcatg 38395552  T
Q  201 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38395553 aagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtat 38395587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4509933 - 4509842
Alignment:
Q  147 actatggaggccttgggtg-ttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatgg 237  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4509933 actattgaggccttaggtgcttatgttctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaagacagaaggcatttcggggttggaagaatgtatgg 4509842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4511775 - 4511684
Alignment:
Q  147 actatggaggccttgggtg-ttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatgg 237  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4511775 actattgaggccttaggtgcttatgttctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaagacagaaggcatttcggggttggaagaatgtatgg 4511684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 261
Target Start/End: Original strand, 6430901 - 6431021
Alignment:
Q  141 ggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgt 240  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||| |||  |    
T  6430901 ggtacaactatggaggccttggtgtttatgctctagtagcgagcatgtgaattcttcatgagcacggaagacatttcgagggttgaagaatgtttggcat 6431000  T
Q  241 gacttgtgtgattacctaaaa 261  Q
    ||||||||  |||||| ||||    
T  6431001 gacttgtggaattaccgaaaa 6431021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44011734 - 44011455
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggtg-aagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||| ||||| |||| |||| |||||||  ||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |  |||| ||      
T  44011734 agtctggagaggcggaggtaacagtactcatgatctacctattgaagtggagtttcaaggtggaagatatagtgtgatgtacgtatttgctagttaagag 44011635  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
      |||||| ||  ||| ||||||||| ||  ||||||  |||||||  |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  44011634 gtagaaagctctgcttgaggtggagtcgaacacaccggaaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctgtagttgtgagcaagggaattcttc 44011535  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattg 276  Q
    |||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||    || |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44011534 atgaagatggaaggtattccggaggttgaagaatgtataacatggcttgtgggattaccataaaagatcaagggtgattg 44011455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 22136174 - 22136372
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  22136174 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 22136273  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  22136274 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 22136372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 40551201 - 40551399
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  40551201 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 40551300  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  40551301 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 40551399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24816219 - 24816014
Alignment:
Q  32 tgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtg-aagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgagg 129  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||| ||||| |  |||||| |||||| | | ||| ||| ||||||||||||      
T  24816219 tgatctacatttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtatgcatttgctagttgaagtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaac 24816120  T
Q  130 acaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaag 228  Q
    |||||||||||||||  |||| || || ||| ||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||| ||| | ||||||    
T  24816119 acaccgagaatggtacgactacggtggacctcgggtgctatgctctagtggtgagcaag-ggattcttcatgaagaaggaaggtatttcggaggttgaag 24816021  T
Q  229 aatgtat 235  Q
    |||||||    
T  24816020 aatgtat 24816014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 138 - 267
Target Start/End: Original strand, 38281418 - 38281548
Alignment:
Q  138 aatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcat-gtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatg 236  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||  | |||||||||| ||||| ||| |  |||||| || ||||||||||||||    
T  38281418 aatggtaaaactatggagtccttgcgtgttgtgctctagtggagagcaaagggaattcttcaggaggatggaggagattccgagggttgaagaatgtatg 38281517  T
Q  237 gtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaa 267  Q
    |  ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  38281518 gcatgacttgtgggattacttaaaagaccaa 38281548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1048207 - 1048008
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  1048207 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 1048108  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  1048107 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 1048009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7093379 - 7093180
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  7093379 ctggagatgcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtaga 7093280  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||||| | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  7093279 gtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 7093181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 28486631 - 28486833
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  28486631 agtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 28486730  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  28486731 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 28486829  T
Q  198 atga 201  Q
    ||||    
T  28486830 atga 28486833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 294
Target Start/End: Original strand, 24749770 - 24749950
Alignment:
Q  116 aggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||   ||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||| | || |||||||| | ||||||||||||    
T  24749770 aggtggagttgaacacaccggtaatggtacgtctatggaggaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagagatttcttcataaagacggaaggcat 24749868  T
Q  215 tccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatta-cctaaaaga-ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttca 294  Q
    ||||| | ||||||||||||| |  ||||||| | ||||| ||||||| |  ||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  24749869 tccggaggttgaagaatgtatagcatgacttgcgggattaccctaaaaaaggcaaaggtgattgtatgcaaggtgatcttca 24749950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 9679748 - 9679958
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| | | ||| | | |||||||    
T  9679748 tactcatgatcaacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgga 9679847  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||  ||||||  |||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | | || || ||||||| ||||||| ||||| ||| |    
T  9679848 gttga--acaccggtaatggtactgctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagaaagagattttttcatgaagacggaatgcatttcggag 9679944  T
Q  222 tttgaagaatgtat 235  Q
     |||||||||||||    
T  9679945 gttgaagaatgtat 9679958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 20298349 - 20298550
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggtg-aagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  || | ||||| ||||| |||| |||| |||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  20298349 ctggagaggcggtggtaacaatactcatgatctacctgttgatgtggagtttcaaggtggaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtaga 20298448  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggag-gccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  20298449 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 20298547  T
Q  201 agg 203  Q
    |||    
T  20298548 agg 20298550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6068080 - 6067995
Alignment:
Q  171 ctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc 256  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||| |||||||    
T  6068080 ctctagttgtgagcaagggaattcttcaattagacggaaggcattccggagtttgaagaatgcatggcatggcttgtgggattacc 6067995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7350569 - 7350372
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaagg-tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  7350569 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 7350470  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||   ||| |  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  7350469 gtacgctcagcgtgaggtggagttga-accactggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 7350372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 296
Target Start/End: Original strand, 21679274 - 21679426
Alignment:
Q  148 ctatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttg 246  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||||  ||||||  | ||||||||||||| |   ||||||    
T  21679274 ctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagatattccgaaggttgaagaatgtatagcacgacttg 21679372  T
Q  247 tgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaag 296  Q
     | |||||||     ||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||    
T  21679373 cgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgaccttcaag 21679426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 1560802 - 1560757
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgag 46  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||    
T  1560802 tagtctggagaggcggtgataacaatactcgtgatcaacctttgag 1560757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 31157203 - 31157030
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaagg-tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| || | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||    
T  31157203 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtaga 31157104  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctcta 175  Q
    | | | ||| | | ||||||| ||||  |||||   |||||||  |||||| || ||||||||| |||||||||    
T  31157103 gtacgctcagcgtgaggtggacttgaacacacctgtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta 31157030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Original strand, 43856 - 43904
Alignment:
Q  264 ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttc 312  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  43856 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 43904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1047960 - 1047912
Alignment:
Q  264 ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttc 312  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  1047960 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 1047912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Original strand, 28486881 - 28486929
Alignment:
Q  264 ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttc 312  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  28486881 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 28486929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34571435 - 34571108
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  34571435 tagtctggagaggtggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaagacatagtgtatgtacgcatttggaagttgaggtat 34571336  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    |   || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34571335 a---agctcaacttgaggtggagttggtgacaccgagaatgatacaactatgaaggccttgggtgctatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 34571239  T
Q  201 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  34571238 aggacggaaggcattccggggtttgaagactgtatggtctggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaag 34571139  T
Q  301 tgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
     ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  34571138 cgggagacattccgtggttgaagagggtttg 34571108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12740566 - 12740239
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12740566 ctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtggaagcatagtgtgtgtactcatttggaagttgaggtagagaa 12740467  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 203  Q
    || ||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12740466 agctcaacttgaggtagagttgatgataccggaaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtaagcacgtgaattcttcatgagg 12740367  T
Q  204 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgg 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  12740366 acggaagacattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 12740267  T
Q  304 gagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12740266 gagacgttccgtggttgaagatggtttg 12740239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12748772 - 12748445
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12748772 ctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtggaagcatagtgtgtgtactcatttggaagttgaggtagagaa 12748673  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagg 203  Q
    || ||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12748672 agctcaacttgaggtagagttgatgataccggaaatggtacaactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtaagcacgtgaattcttcatgagg 12748573  T
Q  204 acggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgg 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  12748572 acggaagacattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgg 12748473  T
Q  304 gagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  12748472 gagacgttccgtggttgaagatggtttg 12748445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 276
Target Start/End: Original strand, 54881919 - 54882189
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  54881919 tggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacctttaaggtggagtgacaaggtgaaagcatagtgtgtgtacacatttggaagttgaggtagagaaa 54882018  T
Q  106 gatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggac 205  Q
    | ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  54882019 gctcaacttgaggtggagttagtgacaccgagaatggtacgactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagagtac 54882118  T
Q  206 ggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattg 276  Q
    || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54882119 gggaggcattcccggggttgaagaatgtatggtgttgcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtaattg 54882189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 324
Target Start/End: Original strand, 8394751 - 8395074
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||     
T  8394751 agtctggagaggcggtgtgaataatactcatgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtagc 8394850  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgt-tatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8394851 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacgactatggaggctttgggagtgtatgctctagttgtgagcatatgaattcttcatg 8394950  T
Q  201 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaag 300  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| | |    
T  8394951 aggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacctaaaagaccaaaggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggagg 8395050  T
Q  301 tgggagacgttccatggttgaaga 324  Q
     |||||||||||| | ||||||||    
T  8395051 cgggagacgttccgtagttgaaga 8395074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 7124040 - 7124371
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  7124040 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggatgtacgcatttggaagttgaggtag 7124139  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||   || ||| ||||||||   || ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7124140 agaaagctcaacttgaggtggagttgctaactccgggaatggtacggctgtggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 7124239  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  7124240 gaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggtgacttgtgtgcttgcctaaaagatcacgggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 7124339  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  7124340 gcgggagacgttccgtagttgaagatggtttg 7124371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 5137424 - 5137755
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  5137424 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcatgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 5137523  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5137524 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 5137623  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |     
T  5137624 gaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggagtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggag 5137723  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5137724 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 5137755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 326
Target Start/End: Original strand, 10113973 - 10114281
Alignment:
Q  21 aagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaagg 118  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||   | |||||| |||| |||||| ||||||||||    ||||||||| || || | ||| ||| |||    
T  10113973 aagaatacttgtgatcaacctttgaggtggtgttttagggtgaaagacaaagtgtgatgtacgcattttctagttgaggttgacaacgctcagcttgagg 10114072  T
Q  119 tggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccg 218  Q
    ||||||| |  |||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  10114073 tggagttaaacacaccgggaatggtacgactatggagaccttgggtgttattctttagttgtgagcaatggaattcttcatgaagacataagacattccg 10114172  T
Q  219 gggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatt-acctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatgg 317  Q
    | |||||||||||||||||  || |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  10114173 gagtttgaagaatgtatggcatggcttgtgggattgccctaaaataccaagggtgattggatggaaggagatcttcaaggaagcgggagacgttccgtgg 10114272  T
Q  318 ttgaagagg 326  Q
    |||||||||    
T  10114273 ttgaagagg 10114281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 331
Target Start/End: Original strand, 26559018 - 26559329
Alignment:
Q  21 aagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggt 119  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||  || ||||||| | ||||||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  26559018 aagaatactcatgatcaacctttgaggtggagtttcaaagtgaaagtcatagtggatgcacgcatttgcaagttgatgtagagaaagctcatcgtaaggt 26559117  T
Q  120 ggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgg 219  Q
    |||||||| ||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||    |||| || | || ||  | |||||||   |    
T  26559118 ggagttgatgacaccataaatggtacaactatggagaccttgggtgctaggctctagttgttagcaacataatttttgaagaagataggaggcatttatg 26559217  T
Q  220 ggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggtt 319  Q
     |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||  |||||    
T  26559218 agtttgaagtatgtatggcatgacttgtgtgattatctaaaagatcaagggtgattggatgcaaggagatcttcacggaagcgggagacgttctgtggtt 26559317  T
Q  320 gaagagggtttg 331  Q
    ||||||| ||||    
T  26559318 gaagaggatttg 26559329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 276
Target Start/End: Original strand, 36770623 - 36770841
Alignment:
Q  61 tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-cc 158  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| |  ||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||  | ||||| |||||||   ||||||||  ||    
T  36770623 tgaagacatagtgggatgtgcgcatttgctagttgaggtagagtaagcttagcttgaggtggagttgaacagaccgataatggtacggctatggagaacc 36770722  T
Q  159 ttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatta-cct 257  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    || |||||| ||||| |||    
T  36770723 ttgggtgctatgctctagttgtgagcaagggaattcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtataacatggcttgtgggattaccct 36770822  T
Q  258 aaaagaccaagggtgattg 276  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  36770823 aaaagaccaaggttgattg 36770841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 47563866 - 47564103
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||  ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  47563866 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctaccggttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 47563965  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| ||| ||||||||||||  ||||||| |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||   || ||||||    
T  47563966 agagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccgataatggtacgactatggacgaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaatggatttcttc 47564065  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    |||| |||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  47564066 atgaagacggaaggcattatggaggttgaagaatgtat 47564103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22801994 - 22801758
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||| |||| |  |||||||||    
T  22801994 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggt 22801895  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||  | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  22801894 agaatacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 22801796  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  22801795 atgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtat 22801758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12401979 - 12401678
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| || | ||||||||||||  |||||| ||||||||| || | |||||||||| |  |||||||||    
T  12401979 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacttgttgaggtggagtttcaaggttgaagacataatgggatgtacgcatttgctagttgaggt 12401880  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| ||| ||||||||||||   |||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  12401879 agagtacgctcagcttgaggtggagttgaactcaccggtaatggtacagctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 12401781  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttc 293  Q
    |||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |   |||||| | |||||||     ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||    
T  12401780 atgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgtaaggtgatcttc 12401681  T
Q  294 aag 296  Q
    |||    
T  12401680 aag 12401678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Original strand, 36379337 - 36379649
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| | ||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||| |||| |  |||||||||    
T  36379337 agtctggagaggcggaggcaacaatactcattatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtac-catttgctagttgaggt 36379435  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaatt-ctt 196  Q
    |||| | | |||  || |||||||||| |  |||||| ||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||  |||||| |||    
T  36379436 agagtacgctcagtttgaggtggagttaaacacaccgggaatggtacgactatggaggaccttggatgctatgctctagtggtgagcaa-tgaatttctt 36379534  T
Q  197 catgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatctt 292  Q
    |||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||| |   | |||| | |||||||     ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36379535 catgaaaacggaaggcattccagagattgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattgaatgcaaggtgatctt 36379634  T
Q  293 caagaaagtgggaga 307  Q
    |||| ||| ||||||    
T  36379635 caaggaagcgggaga 36379649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 276
Target Start/End: Original strand, 47565851 - 47565997
Alignment:
Q  131 caccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaaga 229  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||     
T  47565851 caccgggaatggtatgactatggagaaccttgagtgatatgctcta-ttgtgagcaagggaattcttcatgaagacggaaggcattctggaggttgaagg 47565949  T
Q  230 atgtatggtgtgacttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgattg 276  Q
    |||||| |  || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47565950 atgtatagcatggcttgtgggattaccctaaaagaccaatggtgattg 47565997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14788656 - 14788343
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgagg 97  Q
    |||||| ||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||| |||| |  ||||||||    
T  14788656 tagtctagagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgagg 14788557  T
Q  98 tagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggcc-ttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattctt 196  Q
    ||||| | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||   ||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||    
T  14788556 tagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttctt 14788458  T
Q  197 catgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatctt 292  Q
    || || |||||||||| |||||| | ||||||||||||| |   | |||| | |||||||     ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14788457 cacgaagacggaaggcgttccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatctt 14788358  T
Q  293 caagaaagtgggaga 307  Q
    |||| ||| ||||||    
T  14788357 caaggaagcgggaga 14788343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 24879647 - 24879859
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||| |||||||| | | ||| |   |||||||    
T  24879647 tactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttaaggtagagtacgctcagcgagaggtgga 24879746  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  24879747 gttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaatgcattccggag 24879845  T
Q  222 tttgaagaatgtat 235  Q
     |||||||||||||    
T  24879846 gttgaagaatgtat 24879859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36920755 - 36920519
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | || || ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  36920755 agtctggagaggcggaggcaacaatattcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 36920656  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| | | ||||| | ||||  ||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  36920655 agagtacgttcagcgtgaggtgcatttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgcaatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 36920557  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  36920556 atgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtat 36920519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 16454440 - 16454728
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||| | | ||| ||| |||||||    
T  16454440 tactcatgatctacctgttgaggtggtgtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtgga 16454539  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||  ||||||  |||||||  |||||||||  ||||||||| ||| | ||| | ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| || |    
T  16454540 gttgaacacaccggtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatacgcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattctggag 16454638  T
Q  222 tttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggaga 307  Q
     ||||||||||||| |   | |||| | |||||||     ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16454639 gttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggaga 16454728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22133503 - 22133298
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  22133503 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 22133404  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  22133403 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 22133305  T
Q  198 atgagga 204  Q
    |||||||    
T  22133304 atgagga 22133298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 9175391 - 9175217
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  9175391 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtaga 9175292  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctcta 175  Q
    | | | ||||| | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  9175291 gtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtactatgctcta 9175217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 11007486 - 11007288
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||    
T  11007486 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtaga 11007387  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| |  ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  11007386 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 11007288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22781655 - 22781457
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||| |||| |  ||||||||||||    
T  22781655 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgaggtaga 22781556  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  |||| |  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  22781555 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 22781457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 5099954 - 5100164
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||| | | ||| | | |||||||    
T  5099954 tactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtgga 5100053  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    ||| |  ||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||| |||| |||||||| |    
T  5100054 gttaa--acaccggtaatagtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaagacattccggag 5100150  T
Q  222 tttgaagaatgtat 235  Q
     |||||||||||||    
T  5100151 gttgaagaatgtat 5100164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16933065 - 16932868
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaagg-tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagag 102  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||    
T  16933065 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggctgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagag 16932966  T
Q  103 aaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
     | | ||| | | ||||||||||||  |||| |  |||||||  |||||| |  ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  16932965 tacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaaaaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 16932868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12396888 - 12396736
Alignment:
Q  148 ctatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttg 246  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |   ||||||    
T  12396888 ctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacagaaggaattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttg 12396790  T
Q  247 tgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaag 296  Q
     | |||||||     ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  12396789 cgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgtaaggtgatcttcaag 12396736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22045632 - 22045433
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaagg-tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| ||||    
T  22045632 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagataga 22045533  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||   ||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  22045532 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 22045434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22045387 - 22045339
Alignment:
Q  264 ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttc 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  22045387 ccaagggtgattgaatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 22045339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12399705 - 12399576
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgagg 97  Q
    |||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||| || | || |||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||    
T  12399705 tagtctggagaggcggagggaacaatactcatgatctacatgttaaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagg 12399606  T
Q  98 tagagaaagatcaacttaaggtggagttga 127  Q
    ||||| | | ||| ||| ||||||||||||    
T  12399605 tagagtacgctcagcttgaggtggagttga 12399576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 29812204 - 29812530
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29812204 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtgtacgcatttggaagttgaggtagagaa 29812303  T
Q  105 agatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagga 204  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29812304 agctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggatgccttgagtgctatgctctagttgtgagcttgtgaattcttcatgagaa 29812403  T
Q  205 cggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtggg 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||    
T  29812404 cggaaggcattctggggtttgaagaatgtatggtgtagcttgtgtggttacctaaaagaccaagcgtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcggg 29812503  T
Q  305 agacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29812504 agatgttccggggttgaagagggtttg 29812530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5259153 - 5258829
Alignment:
Q  8 gagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaaga 107  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |  |||||||    ||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  5259153 gagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacccttgaggtggagttacaaggtggaagcatagtggaaatactcatttggaagttgaggtagagaaagc 5259054  T
Q  108 tcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacg 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5259053 tcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggctttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacg 5258954  T
Q  207 gaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggag 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||| |||||    
T  5258953 gaaggtattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaagcgggag 5258854  T
Q  307 acgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    ||||| | |||||||||||||||||    
T  5258853 acgtttcgtggttgaagagggtttg 5258829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23198976 - 23198645
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||| ||||  || | ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  23198976 tagtctggagaggtggtggtaacaatactcatgatcaacctttgaggtggagtggtaaggtggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 23198877  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23198876 agaaagctcaacttaaggtggagttgatgacatcgggaatggtatgactatggaggctttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 23198777  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| || ||    
T  23198776 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatacaaggtgatcttcgaggaa 23198677  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |  | ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23198676 gcagaagacgttccgtggttgaagatggtttg 23198645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 6717841 - 6718166
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  6717841 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaagtggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 6717940  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgag-aatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttca 198  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6717941 agaaagttcaacttgaggtggagttgatgacaccggggaatggtatgactatggaggctttgggagtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttca 6718040  T
Q  199 tgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaa 298  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |    
T  6718041 tgaggacgggaggtattccagggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgagga 6718140  T
Q  299 agtgggagacgttccatggttgaaga 324  Q
     | |||||||||| | ||||||||||    
T  6718141 ggcgggagacgtttcgtggttgaaga 6718166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 77 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9635260 - 9635004
Alignment:
Q  77 gtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctcta 175  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9635260 gtactcatttggaagttgaggtagagaaagctcaacttaaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttggttgtttatgctcta 9635161  T
Q  176 gttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaa-gggtgat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9635160 gttgtgagcatgtgaattcttcatgaggatggaaggcattccggggtttgaagaatgtatgatgtagcttgtgtgattacctaaaagaccaaggggtgat 9635061  T
Q  275 tgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
     |  ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9635060 cggatgcaaggtgatcttcgaggaagcgggagacgttccgtggttgaagaggatttg 9635004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 10210530 - 10210861
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  10210530 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtacccatttggaagttgaggtag 10210629  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| || |||||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10210630 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccaagaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 10210729  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |     
T  10210730 gaggacagatggtattccggggtttgaagaatgtatggagtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggag 10210829  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10210830 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 10210861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 4599554 - 4599224
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| |||||||||||||||    
T  4599554 agtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtaga 4599455  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4599454 gaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccgggaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtgaattcttcatg 4599355  T
Q  201 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaag 300  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || | |    
T  4599354 aggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggagg 4599255  T
Q  301 tgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
     |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  4599254 cgggagacgttctgtggttgaagatggtttg 4599224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 10057577 - 10057908
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  10057577 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 10057676  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10057677 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 10057776  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  10057777 gaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 10057876  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10057877 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 10057908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 10059799 - 10060130
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  10059799 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 10059898  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10059899 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 10059998  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  10059999 gaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 10060098  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10060099 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 10060130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 10062021 - 10062352
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  10062021 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 10062120  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10062121 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 10062220  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  10062221 gaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 10062320  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10062321 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 10062352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 10064243 - 10064574
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  10064243 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 10064342  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10064343 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 10064442  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  10064443 gaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 10064542  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10064543 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 10064574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 10066465 - 10066796
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  10066465 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 10066564  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10066565 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 10066664  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  10066665 gaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 10066764  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  10066765 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 10066796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 7763600 - 7763856
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  7763600 tagtctggagaggcggtgtgaataatactcgtgatcaacctt-gaggtggagctgcaaggtgaaggcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 7763698  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtg-ttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  7763699 agaaagctcaacttgaggtggagtttgtgacaccgagaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgctctaggtgtgagcatatgaattcttcat 7763798  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacct 257  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||    
T  7763799 gaggacggaagacattctggggtttgaagaatgtatgacgttgcttgtgcgattacct 7763856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 15824667 - 15824365
Alignment:
Q  27 actcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaag-acatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagtt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |   |||| || |     |||||||||||||||  ||| |||   ||||||||    
T  15824667 actcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggttaaacacatagaggaagtactcaatttcctgttgaggtagagaaatctcatctt---gtggagtt 15824571  T
Q  126 gaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttg 225  Q
    || ||||||| | |||||| ||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||    
T  15824570 gatgacaccgggcatggtacaactattaagaccttaggtgttatgctctagttgcgagcaagtgaattcttcaagaggacggaagtcattctgaggtttg 15824471  T
Q  226 aagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagag 325  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15824470 aagaatgtatagcatgacttgtgtgattacctaaaacaccaagggtgattggatgcaaggtgatattcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagag 15824371  T
Q  326 ggtttg 331  Q
    ||||||    
T  15824370 ggtttg 15824365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 246
Target Start/End: Original strand, 32892424 - 32892664
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  32892424 tggagaggcggtgtgaataatacttgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaagcatggtgtgtgtacgcatttgaaagttgaggcagagaaa 32892523  T
Q  106 gatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggac 205  Q
    | ||||||| ||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||    ||||||||| ||||||    
T  32892524 gctcaacttgaggtggagttagtgacaccgaaaatggtacaactatggagatcttgggtgttaggctctagttttgagcaaagaaattcttcaagaggac 32892623  T
Q  206 ggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttg 246  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32892624 ggaaggcctttcgaagtttgaagaatgtatagtgtgacttg 32892664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 221 - 331
Target Start/End: Original strand, 37407810 - 37407920
Alignment:
Q  221 gtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  37407810 gtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttg 37407909  T
Q  321 aagagggtttg 331  Q
    |||| ||||||    
T  37407910 aagatggtttg 37407920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 43403290 - 43403172
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  43403290 tggagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacctttgaggtgaagttgcaaggtgaaggcatagtgtgtgtacgcgtttggaagttgaggtggagaaa 43403191  T
Q  106 gatcaacttaaggtggagt 124  Q
      ||| ||| |||||||||    
T  43403190 tctcagcttgaggtggagt 43403172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43403125 - 43403032
Alignment:
Q  141 ggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgt 233  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43403125 ggtacaactatggaggctttgggtgtttatgctctagtagcgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggggttgaagaatgt 43403032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Original strand, 3315718 - 3316030
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  3315718 agtctggagaggcggaggcaagaatactcatgatcttcctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 3315817  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| ||| || ||||||| |  ||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  3315818 agagtacgctcagcttgagctggagtttaaaacaccggtaatggtatgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 3315916  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttc 293  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||||||||| ||| |   |||||| | |||||||     |||||  ||||||||||||| ||||||  || ||||    
T  3315917 atgaagacggaagacattccggaggttgaagaatatatagcacgacttgcgggattaccctaaaaaaaggtcaagggtgattgaatgcaagaagaccttc 3316016  T
Q  294 aagaaagtgggaga 307  Q
    ||| ||||||||||    
T  3316017 aaggaagtgggaga 3316030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4309425 - 4309224
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  4309425 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 4309326  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  4309325 gtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 4309227  T
Q  201 agg 203  Q
    |||    
T  4309226 agg 4309224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28138439 - 28138227
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| | | ||| ||| |||||||    
T  28138439 tactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcttgaggtgga 28138340  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||  ||||||  |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||| | | ||||| | || |||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  28138339 gttgaacacaccggtaatggtacgactatggatgaccttgggtgctatgctcta-tggcgagcaagggatttcttcatgaagacgaaaggcattccggag 28138241  T
Q  222 tttgaagaatgtat 235  Q
     |||||||||||||    
T  28138240 gttgaagaatgtat 28138227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 276
Target Start/End: Original strand, 27422094 - 27422275
Alignment:
Q  87 ggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcat 186  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||| | |||||||||| |         |||||| ||||||||||||     
T  27422094 ggaagttgagctagagaaagctcagcttaaggtggagttgatggcactgagaatggaacaactatggagac---------tatgctttagttgtgagcaa 27422184  T
Q  187 gtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattg 276  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||  | |||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  27422185 gagaattcttcaagaagacggaaggcattctagagtttaaagaatgtatagcatgacttgtgagattaccagaaaagactaagggtaattg 27422275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35918927 - 35918808
Alignment:
Q  192 ttcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattac-ctaaaaga---ccaagggtgattgagtgcaaggtg 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |   |||||| | |||||| ||||||||   |||||||||||||  |||||||||    
T  35918927 ttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattactctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggtg 35918828  T
Q  288 atcttcaagaaagtgggaga 307  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  35918827 atcttcaaggaagtgggaga 35918808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 891012 - 890892
Alignment:
Q  116 aggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcat 214  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||| |||    
T  891012 aggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggagtaccttgggtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagacat 890913  T
Q  215 tccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  890912 tccggaggttgaagaatgtat 890892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28101189 - 28100994
Alignment:
Q  42 ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaa 139  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | ||||||||||    |||| |||||||| | | ||| ||| ||||||||||||  ||||||  ||    
T  28101189 ttgaggtggagtttcaaggttgaagacatggtgggatgtacgcattttctagttaaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaa 28101090  T
Q  140 tggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    |||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  28101089 tggtacgactatgaaggaccttgggtgttatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcatttcggaggttgaagaatgtat 28100994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 53916896 - 53916584
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggtg-aagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |    
T  53916896 agtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggtggaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgagtt 53916797  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| | | ||||||||||||  ||| ||  |||||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  53916796 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacggctatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 53916698  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatta-cct---aaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttc 293  Q
    |||| || ||||| |||||||| | ||||||||||||| |   |||||| | ||||| |||   ||||| |||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  53916697 atgaagatggaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgcgggattatcctaaaaaaaggccaacggtgattggatgcaaggtaatcttc 53916598  T
Q  294 aagaaagtgggaga 307  Q
    ||| ||| ||||||    
T  53916597 aaggaagcgggaga 53916584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1619729 - 1619605
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||| |||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  1619729 tagtctgaagaggcggaggtaagaatacttgtgatcagccttttaggtggagtttcaaggtgaaagacatggtgggatgtacgcatttggaagttgaggt 1619630  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggag 123  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  1619629 agagaaagttcagcttgaggtggag 1619605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18098054 - 18097753
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||| | ||||||||||    |||||||||    
T  18098054 agtctggagaggcggaggcaaaaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttgaaggttgaagacatagtgggatgtacgcattttctagttgaggt 18097955  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| | | ||||||| || |  ||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  18097954 agagtacgctcagcatgaggtggaatttaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgccatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 18097856  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatta-cctaaaaga---ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttc 293  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||||||||||||| |   | |||| | ||||| |||||||||   |||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  18097855 atgaagacggaaggcattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaagaaggccaagggtgattggatgcaaggcgatcttc 18097756  T
Q  294 aag 296  Q
    |||    
T  18097755 aag 18097753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 457247 - 457445
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||| ||||| |  ||||||||||||    
T  457247 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtatgcatttgccagttgaggtaga 457346  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  457347 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 457445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1619599 - 1619474
Alignment:
Q  147 actatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttg 246  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || | ||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||||| |||||||| |  || ||||    
T  1619599 actatggagaccttgggtgctatgctctagtggtgaccaagggaattcttcatgaagacagaaggcattctagtgtttgaggaatgtatagcatggcttg 1619500  T
Q  247 tgtgattac-ctaaaagaccaagggt 271  Q
    || ||||||   ||||||||||||||    
T  1619499 tgggattacgagaaaagaccaagggt 1619474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 235
Target Start/End: Original strand, 23634948 - 23635036
Alignment:
Q  148 ctatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  23634948 ctatggaggaccttcggtgttatgctctactggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccgaaggttgaagaatgtat 23635036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 5898752 - 5898953
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaagg-tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  5898752 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 5898851  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | |   ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||| ||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  5898852 gtacactcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgtgtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 5898950  T
Q  201 agg 203  Q
    |||    
T  5898951 agg 5898953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43422651 - 43422381
Alignment:
Q  42 ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaa 139  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||| ||| |  | ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||  ||||    ||    
T  43422651 ttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgtatttgctaattgaggtagagtacgctcaacttgaggtggagttgaacacactagtaa 43422552  T
Q  140 tggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggt 238  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | | | ||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |     
T  43422551 tggtaagactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagaaag-ggatttttcattaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagc 43422454  T
Q  239 gtgacttgtgtgatta-cctaaaaga---ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggaga 307  Q
      | |||| | ||||| ||||||| |   |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  43422453 acggcttgcgggattaccctaaaaaaatgccaagggtgattggatgctaggtgatcttcaaggaagcgggaga 43422381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6064711 - 6064538
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  6064711 ctggagaggcggtggtaagaatactc-tgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 6064613  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctcta 175  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  |||| |  |||||||  |||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  6064612 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 6064538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 175
Target Start/End: Original strand, 42991335 - 42991512
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  42991335 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttaaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 42991434  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctcta 175  Q
    |||| | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  42991435 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttaggtgctatgctcta 42991512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 331
Target Start/End: Original strand, 7763864 - 7763916
Alignment:
Q  279 tgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7763864 tgcaaggtgatcttcgaggaagcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 7763916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Original strand, 25634867 - 25635045
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggta 99  Q
    ||||||||||| ||| |  || | ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||       
T  25634867 agtctggagagacggaggtaacaatactcatgatctacctttgacgtggagtttcaaggtggaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagagg 25634966  T
Q  100 gagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagt 177  Q
     |||||| |||  || ||||||||||||  ||| ||  |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25634967 tagaaagttcagtttgaggtggagttgaacacagcggaaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctagt 25635045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 43227420 - 43227621
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaagg-tgaagacatag-tgtgtgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |  ||||||||||||    
T  43227420 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagttggatgtatgcatttgctagttgaggtaga 43227519  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatg-gaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | |||| |||||||  ||||||  |||||||  ||||||  || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  43227520 gtacgctcagcgtgaggtagagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 43227618  T
Q  201 agg 203  Q
    |||    
T  43227619 agg 43227621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Original strand, 457493 - 457541
Alignment:
Q  264 ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttc 312  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  457493 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagtaggagatgttc 457541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 85
Target Start/End: Original strand, 7769906 - 7769966
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaaga-catagtgtgtgtacgcatt 85  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  7769906 tactcgtgaacaaactttgaggtggagttgcaaggtgaaaatcatagtggatgtacgcatt 7769966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10957020 - 10956972
Alignment:
Q  264 ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttc 312  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  10957020 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 10956972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Original strand, 43227667 - 43227715
Alignment:
Q  264 ccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttc 312  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  43227667 ccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagcgggagatgttc 43227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 34255343 - 34255012
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  34255343 tagtccggagaggcggtatgaataatactcgtgatcaacctttgaggtggagttacaaggtggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 34255244  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34255243 agaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 34255144  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || ||    
T  34255143 gaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggaa 34255044  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34255043 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 34255012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Original strand, 4732964 - 4733292
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagaga 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4732964 ctggagaggcagtgtgaagagtactcatgatcaacctttgaggtggagttgcaagggagaaagcatagtgtgtgtacgcatttggaaattgaggtagaga 4733063  T
Q  104 aagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtg-ttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgag 202  Q
    ||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4733064 aatctcaacttgaggtggagttgatgacaccgaaaatggtacgactatggaggtcttgggtgtttatgctctagttgtgtgcatgtgaatgcttcatgag 4733163  T
Q  203 gacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatgg-tgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagt 301  Q
    || | ||| |||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||     
T  4733164 gatgaaagtcattcccgggtttgaagaatgtatggcagtg-tttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 4733262  T
Q  302 gggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4733263 gggagacgttccgtggttaaagagggtttg 4733292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41365846 - 41365522
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagaga 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||| ||||| ||||||||||      |    
T  41365846 ctggagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaggcaaaaggcatagtgtgtgtatgcatttggaagttgag------a 41365753  T
Q  104 aagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat---g 200  Q
    ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  41365752 aagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggaggccttgggtgctatgctctagttgtgagcatgggaattcttcatgaag 41365653  T
Q  201 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaag 300  Q
    | |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| | ||||||||||| |||    
T  41365652 aagacggaagacattccagagtttgaagaatgtatggtatgactagtgtgattacctaaaagaccaagagtgattggatgcacgatgatcttcaaggaag 41365553  T
Q  301 tgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
      ||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  41365552 caggagatgttccgtgtttgaagaaggtttg 41365522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42436439 - 42436230
Alignment:
Q  14 cggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaact 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| || | |    
T  42436439 cggtgtgaagaatactcgtgatcaatctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcatactgtatgtacgcatttgaaagttgaggtagagaaagctcgatt 42436340  T
Q  114 taaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggca 213  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42436339 tgaggtggagttgatgacacagagaatg-------------ggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacgaaaggca 42436253  T
Q  214 ttccggggtttgaagaatgtatg 236  Q
    ||  |||||||||||||||||||    
T  42436252 ttgtggggtttgaagaatgtatg 42436230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31574767 - 31574457
Alignment:
Q  21 aagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggt 119  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||  |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31574767 aagaatactcgtgatcagcctttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcattgtggatgtacgcatttgctagttgaggtagagaaagctcaacttgaggt 31574668  T
Q  120 ggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgg 219  Q
    |||||| | |||| || ||||| ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  31574667 ggagtttatgacatcgggaatgatacgactatggagaccttgggtgctatgctctagttatgagaaagggaattcttcatgaagacagaaggcattccga 31574568  T
Q  220 ggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggt 318  Q
     |||||||||||||||    || | |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||  ||||||||  | ||||    
T  31574567 agtttgaagaatgtataacatggcatgtgggattacctttaaagaacaagggtgattggatgcaaggagatcttcaaggaagcaggagacgtctcgtggt 31574468  T
Q  319 tgaagagggtt 329  Q
    |||||||||||    
T  31574467 tgaagagggtt 31574457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 331
Target Start/End: Original strand, 17849089 - 17849329
Alignment:
Q  90 agttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtg 189  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||  |   |  |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| | |    
T  17849089 agttgaggtagagaaagctcaccttgaggtggagttgatgacattggacaaagtatgactatggagaccttgggtgctaggctctagttgttagcaagag 17849188  T
Q  190 aattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgat 289  Q
    |||||||||  | ||||||||||||| |||  |||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  17849189 aattcttcaaaaagacggaaggcatttcggattttgaagaatgtatgacatgacttgtgtgattatctaaaagaccaaggatgattggatacaaggtgat 17849288  T
Q  290 cttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
T  17849289 cttcaaggaagtgtgagac-tttagtggttgaagagggtttg 17849329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40220735 - 40220644
Alignment:
Q  141 ggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatg 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  40220735 ggtacaactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcaagagtacgaaaggcatttcgggggttgaagaatg 40220644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29797221 - 29797068
Alignment:
Q  172 tctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggt 271  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| | ||| ||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29797221 tctagttgtgagcaaggaaattctttaagagcacgaaaggctttatggggtttgaggaatgtatggaatgacttgtgggattacctaaaagaccaatggt 29797122  T
Q  272 gattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagagggt 328  Q
     ||||  |||||||  ||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||    
T  29797121 aattgcatgcaaggaaatcttcaaga---cggaagacgttccatggttgaagagggt 29797068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 40220900 - 40220801
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  40220900 tggagaggtggtgtgaacaatactcatgttcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaggcataacgtgtgtacgcgtttggaagttgaggtggagaaa 40220801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Original strand, 41383788 - 41384000
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||| | |||| |  ||||||||||||| | | ||| ||| |||||||    
T  41383788 tactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtgcacatttgctagttgaggtagagtacgctcatcttgaggtgga 41383887  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||  ||||||  |||||||   ||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  41383888 gttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggaccttggatgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggag 41383986  T
Q  222 tttgaagaatgtat 235  Q
     |||||||||||||    
T  41383987 gttgaagaatgtat 41384000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 235
Target Start/End: Original strand, 15071871 - 15072105
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  15071871 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctattgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 15071970  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| | | ||||||||||||  |||| |  |||||||  || ||||| | ||||| ||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||    
T  15071971 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacactggtaatggtacgacaatggaagaccttgagtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttc 15072069  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15072070 atgaagacggaaggcattccggg--ttgaagaatgtat 15072105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 18812124 - 18812322
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  18812124 ctggaaaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 18812223  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  18812224 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 18812322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 43081018 - 43081216
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||    
T  43081018 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttactagttgaggtaga 43081117  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  43081118 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 43081216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 78
Target Start/End: Original strand, 17848974 - 17849051
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtg-aagacatagtgtgtgt 78  Q
    |||||| |||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17848974 agtctgaagaggcggaggtaagaatactcatgatcaacctttgaggtggagttgcaaggtgaaagacatagtgtgtgt 17849051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 323
Target Start/End: Original strand, 698 - 1016
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  698 tggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacatttgaggtggagtggcaaggtgaaagcatagtgtgtgtacgcatatggaagttgaggtagagaaa 797  T
Q  106 gatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgagga 204  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  798 gctcaacttaaggtggagttgttgacaccgagactggtacaactatggaggtcttgggtgtttatgctctagttttgagcatgtgaattcttcatgagga 897  T
Q  205 cggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtggg 304  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||  |||    
T  898 cggaaggcgctccggggtttgaagaatgtatggtgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtaattgaaaacaaggtgatcttcaaggaaacggg 997  T
Q  305 agacgttccatggttgaag 323  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  998 agacgttccgtggttgaag 1016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 16554008 - 16554332
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  16554008 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaagtggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 16554107  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16554108 agaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggaggctttgggagtttatgttctagtggtgagcatgtgaattcttcat 16554207  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  16554208 gaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggaggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 16554307  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaaga 324  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  16554308 gcgggagacgttccgtggttgaaga 16554332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 16630564 - 16630888
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  16630564 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaagtggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 16630663  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16630664 agaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtatgactatggaggctttgggagtttatgttctagtggtgagcatgtgaattcttcat 16630763  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  16630764 gaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggaggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 16630863  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaaga 324  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  16630864 gcgggagacgttccgtggttgaaga 16630888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 16652270 - 16652594
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  16652270 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttgcaaagtggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 16652369  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16652370 agaaagctcaacttgaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggctttgggagtttatgttctagtggtgagcatgtgaattcttcat 16652469  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| || |     
T  16652470 gaggacggaaggtattccggggtttgaagaatgtatggggaggcttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgtaaggtgatcttcgaggag 16652569  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaaga 324  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  16652570 gcgggagacgttccgtggttgaaga 16652594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 34166216 - 34166547
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||   |||| |||| ||||||||||||||    
T  34166216 tagtctggagaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggcggaagcatagtggaagtactcatttggaagttgaggtag 34166315  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||  |||||||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34166316 agaaagctcaacttgaggtggagttggtgactccggaaatggtacggctatggaggctttgggagtttatgctctagtggtgagcatgtggattcttcat 34166415  T
Q  200 gaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaa 299  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| || |     
T  34166416 gaggacggatggtattccggggtttgaagaatgtatggggtggcttgtgtgattgcctaaaaggccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcgaggag 34166515  T
Q  300 gtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34166516 gcgggagacgttccgtggttgaagatggtttg 34166547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 115 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5407847 - 5407630
Alignment:
Q  115 aaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggca 213  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5407847 aaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggaggccttgggtatttatgctctagttgtgagcatgtaaactcttcatgaggacggaaggca 5407748  T
Q  214 ttccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttcc 313  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  5407747 ttccaaggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcggggaagcgggagacgttcc 5407648  T
Q  314 atggttgaagagggtttg 331  Q
     |||||||||| ||||||    
T  5407647 gtggttgaagatggtttg 5407630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 115 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5412172 - 5411955
Alignment:
Q  115 aaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggca 213  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  5412172 aaggtggagttgatgacaccgggaatggtacaactatggaggccttgggtatttatgctctagttgtgagcatgtaaactcttcatgaggacggaaggca 5412073  T
Q  214 ttccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttcc 313  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  5412072 ttccaaggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgatcggatgcaaggtgatcttcggggaagcgggagacgttcc 5411973  T
Q  314 atggttgaagagggtttg 331  Q
     |||||||||| ||||||    
T  5411972 gtggttgaagatggtttg 5411955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 16568296 - 16568482
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  16568296 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttacaaggtggaagcatagtgtgtgtactaatttggaagttgaggtag 16568395  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatg 187  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16568396 agaaatctcaacttgaggtggagttggtgacaccgggaatggtacaactatggagaccttgggagttatgctctagttgtgagcatg 16568482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5407078 - 5406862
Alignment:
Q  115 aaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggca 213  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || |||||||||| || |||||||    
T  5407078 aaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgggtatttatgctccagttgtgagcatgttaactcttcatgag-acagaaggca 5406980  T
Q  214 ttccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttcc 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  5406979 ttccggggtttgaagaatgcatgatgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaatggtgatcagaagcaaggtgatcttcggggaagcgggagacgttcc 5406880  T
Q  314 atggttgaagagggtttg 331  Q
     |||||||||| ||||||    
T  5406879 gtggttgaagatggtttg 5406862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 5411403 - 5411187
Alignment:
Q  115 aaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggca 213  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || |||||||||| || |||||||    
T  5411403 aaggtggagttgatgacaccgggaatggtacgactatggaggccttgggtatttatgctccagttgtgagcatgttaactcttcatgag-acagaaggca 5411305  T
Q  214 ttccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttcc 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||    
T  5411304 ttccggggtttgaagaatgcatgatgtggcttgtgtgattacctaaaagaccaatggtgatcagaagcaaggtgatcttcggggaagcgggagacgttcc 5411205  T
Q  314 atggttgaagagggtttg 331  Q
     |||||||||| ||||||    
T  5411204 gtggttgaagatggtttg 5411187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 261
Target Start/End: Original strand, 30444681 - 30444941
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtag 100  Q
    |||||| |||||||| |  |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||  | |||  ||| |||| |||||||||    
T  30444681 agtctgaagaggcggaggtaagaatactcatgatcaatctttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcatagtggatatacatatttggaacttgaggtag 30444780  T
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||| ||| | || | |||||  ||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  30444781 agaaaggtcagcttgaggtggagttgatgacgctgatagtggtacgactatggagacattgggtgctagtctctagttgtgagcaagagaattcttcaag 30444880  T
Q  201 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaa 261  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||    
T  30444881 aggacagaaggcattcaggggtttgaagaatgtatggcatgacttgtgggattaccaaaaa 30444941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 11137464 - 11137741
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcgg-tgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||  ||||||| || |  |||| ||||    
T  11137464 tagtctgaagaggcggatgt-aagaatactcatgttcaacctttgaggtggagtttcaaggtgaaagtcatagtggatgtacgcgtttgctagttcaggt 11137562  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttca 198  Q
    |||||||  ||| |||  ||||||||||| |||| || ||||||||  || |||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11137563 agagaaaactcagcttgtggtggagttgatgacatcgggaatggtacgacgatggagaccttgggtgctaggctctagttgtgagcaagagaattcttca 11137662  T
Q  199 tgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattg 276  Q
     || || |||| ||||||  | |||| ||||||||||||  |||||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  11137663 agaagaaggaatgcattctagagtttaaagaatgtatggaatgacttataggattaccagaaaagaccaagggtaattg 11137741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10456333 - 10456158
Alignment:
Q  122 agttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||| ||||  | |     
T  10456333 agttgatgacaccg-gaatggtacgactatggagactttggatgttatgctctagttgtgagcaagggaattcttcaagagaacggaagacattttgtga 10456235  T
Q  222 tttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaa 298  Q
     |||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||    
T  10456234 gttgaagaatgtatggcacaacttgtgggattacctaaaagaccaagggtgattggatgtaaggagatattcaagaa 10456158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 105
Target Start/End: Original strand, 17758640 - 17758739
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaa 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  || |||||||| ||||||    
T  17758640 tggagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaaccttagaggtggagttgcaaggtgtagacatagtgtgtgtacgcgtttagatgttgaggtggagaaa 17758739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3631141 - 3630929
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| | | ||||||| |||||||    
T  3631141 tactcatgatctacctgttgaggtggactttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcaacttgaggtgga 3631042  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccgggg 221  Q
    |||||  ||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  3631041 gttgaacacaccggtaatggtatgactttggaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaagacattccggag 3630943  T
Q  222 tttgaagaatgtat 235  Q
     |||||||||||||    
T  3630942 gttgaagaatgtat 3630929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5407166 - 5407076
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaag 91  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||| |||| |||||    
T  5407166 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttacaaggtggaagcatagtgtgtgtactcatttggaag 5407076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 5411491 - 5411401
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaag 91  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||| |||| |||||    
T  5411491 tagtctggagaggcggtgtgaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagttacaaggtggaagcatagtgtgtgtactcatttggaag 5411401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15533768 - 15533622
Alignment:
Q  90 agttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgt 188  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |     
T  15533768 agttgaggtagagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcacgg 15533669  T
Q  189 gaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||   | |||||||||||||    
T  15533668 gatttcttcatgaagacggaaggcattccaaaggttgaagaatgtat 15533622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 3395369 - 3395601
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||| | |||||||||| |  ||||||| |    
T  3395369 agtctggagaggcggagacaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgtagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgagct 3395468  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| |   ||| ||| ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||| | || ||||||    
T  3395469 agagtaccctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctcta-tggttagcaagggatttcttc 3395567  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaat 231  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3395568 atgaagacggaaggcattccggaggttgaagaat 3395601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Original strand, 17758805 - 17758897
Alignment:
Q  141 ggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgt 233  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||  || |||||||||||    
T  17758805 ggtaaaacaatggaggccttgggtgttatgcactagttgtgagtatgtgaattcttcaagagtatgaaaggcattcctagggttgaagaatgt 17758897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28038728 - 28038613
Alignment:
Q  159 ttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatta-cct 257  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||    
T  28038728 ttgggtgctatggtctagtggtgaggaaggggattcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgtatagcatgacttgtgggattaccct 28038629  T
Q  258 aaaagaccaagggtga 273  Q
    ||| ||||||||||||    
T  28038628 aaacgaccaagggtga 28038613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24543600 - 24543467
Alignment:
Q  101 agaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||  |||||||||| | || ||||||| |    
T  24543600 agaaagctcaacttgaggtggagttgatgacactggaaatggtacaactatggagaccttgggttctaggctc--gttgtgagcaagggagttcttcaag 24543503  T
Q  201 aggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatgg 237  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  24543502 aggacgaaaggcatt-cgggatttgaaaaatgtatgg 24543467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 33310250 - 33310448
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  33310250 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 33310349  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| || |||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  33310350 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctaggctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 33310448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 26944598 - 26944711
Alignment:
Q  137 gaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  26944598 gaatggtacgactgtggaggaccttgggggctatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaatgcattccggaggttgaagaatgtat 26944697  T
Q  236 ggtgtgacttgtgt 249  Q
     ||  |||||||||    
T  26944698 agtacgacttgtgt 26944711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 331
Target Start/End: Original strand, 16568485 - 16568530
Alignment:
Q  286 tgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16568485 tgatcttcaaggaagcgggagacgttccgtggttgaagagggtttg 16568530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 319
Target Start/End: Original strand, 22615253 - 22615382
Alignment:
Q  190 aattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgat 289  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |||||| || |||   |||||||  ||    
T  22615253 aattcttaaagaggacggaagacgttttgggggttgaagaatgtatggtatgacttatgggattagctaaaataccaagcgtaattcgatgcaaggaaat 22615352  T
Q  290 cttcaagaaagtgggagacgttccatggtt 319  Q
    ||||||||    || |||||||||||||||    
T  22615353 cttcaagaggacggaagacgttccatggtt 22615382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26067313 - 26067117
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||  |||||| |||||||  ||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  26067313 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtgaagtttcaaggttgaagaca--gtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 26067216  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  26067215 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 26067117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28078404 - 28078333
Alignment:
Q  206 ggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgattg 276  Q
    ||||||||||  || | ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28078404 ggaaggcattatggaggttgaagaatgtatagcgtgacttgtgggattatcctgaaagaccaagggtgattg 28078333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9746 - 9423
Alignment:
Q  9 agaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagat 108  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||   |||| |||| | |||||||||||||||||| |    
T  9746 agaggcggtggtaacaatactcgtgatcaacctttgaggtggagtggcaaggtggaagcatagtggaagtactcatttgaaagttgaggtagagaaagct 9647  T
Q  109 caacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgtt-atgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacgg 207  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646 caacttgatgtggagttgatgacaccgagaatggtatgactatggaggctttgggtgtttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacgg 9547  T
Q  208 aaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggaga 307  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| || || ||| ||||||    
T  9546 aaggtatttcggggtttgaagaatgtattgtgtggcttgtgtgattacctaaaagatcaagggtgatcggatgcaaggtgatcctcgaggaagcgggaga 9447  T
Q  308 cgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||| |||||||||| ||||||    
T  9446 cgttccgtggttgaagatggtttg 9423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 14634832 - 14634505
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaaga-catagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagaga 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || | ||||||||||  ||||| | |||||||| ||||||||    
T  14634832 ctggagaggcggtgtgaagaatactcgtgatcaacctttaaggtggagttacaaggttaaaagcatagtgtgt--acgcaattggaagttggggtagaga 14634735  T
Q  104 aagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgag 202  Q
    ||  ||||||| ||||||||||   |||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14634734 aatctcaacttgaggtggagttagtgacaccggaaatggtacgactatggagggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgagaattcttcaagag 14634635  T
Q  203 gacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacct-aaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagt 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||     
T  14634634 gacggaaggcattccagggtttgaagaatatatggcgttgcttatgtgattacctaaaaagaccaagggtgattggatgcaaggtgatcttcaaggaagc 14634535  T
Q  302 gggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14634534 gggagacgttccgtggttgaagagggtttg 14634505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28569290 - 28569036
Alignment:
Q  21 aagagtactcgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtgaa-gacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggt 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28569290 aagaatactcgtgatcaacctttgaggtggatttgcaaggtgaaagccatagtgggtgtacgcatttggaagttgaggtagagaaagctcagcttaaggt 28569191  T
Q  120 ggagttgaggacaccgagaat---ggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattc 216  Q
    |||||||| ||||||  ||||   ||||  ||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  28569190 ggagttgatgacacctggaatattggtacgactatggagacctagggtgctattctctagttgtgagcaaggtaattcttcaagaggatggaaggcattc 28569091  T
Q  217 cggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggt 271  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||  ||||||||    
T  28569090 cggggtttgaagaatgtatggcatgacttgtgggattatcgaaaaagccaagggt 28569036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 31734101 - 31733792
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  31734101 agtctggagaggcggaggtaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 31734002  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| |   ||| ||| ||||||||||||  ||| ||  |||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  31734001 agagtacactcagcttgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacgactatggaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagtgatttcttc 31733903  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaag 296  Q
    |||| |||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |   ||||||   ||||| |||||||  |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  31733902 atgaagacgaaagacattccggaggttgaagaatgtatagcacgacttgctagattaccctaaaaagccaaaggtgattggatgcaaggagatcttcaag 31733803  T
Q  297 aaagtgggaga 307  Q
     ||| ||||||    
T  31733802 gaagcgggaga 31733792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 42018661 - 42018468
Alignment:
Q  77 gtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctag 176  Q
    |||||||||  ||||||||||||   |||  ||| ||| ||||| ||| || ||||| || ||| |||| ||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  42018661 gtacgcatttagaagttgaggtaataaaaactcagcttgaggtgaagtggatgacactga-aatagtatgactatggagacctttagtggtatgctctag 42018563  T
Q  177 ttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacctaaaagaccaagggt 271  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||   |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  42018562 ttgtgagcaggggaattcttcaagaggatggaaggcattccaggagttgaagaatgtatgacatgactttttagattacctaaaagaccaagggt 42018468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6263376 - 6263065
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| |||||  ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  6263376 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctgcctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 6263277  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| ||| ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| | || ||||||    
T  6263276 agagtacgctcagcttgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggaccttgggtgctatgctctag--gtgagcaagggatttcttc 6263179  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttc 293  Q
    |||| ||| |||| ||||| || | ||||||||||||| |   | |||| | |||||||     ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6263178 atgaagacagaagacattctggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagtgtgattggatgcaaggtgatcttc 6263079  T
Q  294 aagaaagtgggaga 307  Q
    ||| ||| ||||||    
T  6263078 aaggaagcgggaga 6263065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41304077 - 41303930
Alignment:
Q  90 agttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtg 189  Q
    |||||||||||||| ||   | ||| ||||||| |||| |||| || |||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| | |    
T  41304077 agttgaggtagagatagcatagcttgaggtggaattgatgacatcgggaatggtacaactatggagatcttgggtgctaggctctagttgtgagcaaggg 41303978  T
Q  190 aattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatgg 237  Q
    ||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  41303977 aattcttcaagaggacaaaagaaattccggggtttgaataatgtatgg 41303930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21519519 - 21519348
Alignment:
Q  61 tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-cc 158  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||||||| ||    
T  21519519 tgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatggaggacc 21519420  T
Q  159 ttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaat 231  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21519419 ttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccggaggttgaagaat 21519348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 22404986 - 22405106
Alignment:
Q  116 aggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcat 214  Q
    ||||||| ||||  ||||||  ||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||| |||| |||||||    
T  22404986 aggtggaattgaacacaccggtaatggtatggctatggaggaccttgagtgttatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacgaaaggcat 22405085  T
Q  215 tccggggtttgaagaatgtat 235  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  22405086 tccggaggttgaagaatgtat 22405106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36560061 - 36559864
Alignment:
Q  6 tggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagag 102  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||||||    
T  36560061 tggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtagag 36559962  T
Q  103 aaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatga 201  Q
     | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || ||||||||||    
T  36559961 tacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaagaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatga 36559864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35216888 - 35216689
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  35216888 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 35216789  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  35216788 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 35216690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 253
Target Start/End: Original strand, 16676966 - 16677061
Alignment:
Q  158 cttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgatt 253  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||| | || ||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||    
T  16676966 cttgggtgttatgttctaattgttagcaagggagttcttcaagaggacgaaatgcattccgggggttgaagaatgtatgacatgacttgtgagatt 16677061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 6396618 - 6396483
Alignment:
Q  142 gtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtg 241  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||  | |||||||||||||  |||| |||| ||||||||     |    
T  6396618 gtatgactatggagactttgggtgatatgatctagttgtgagtaagggaattcttcaacatgacggaaggcattttgggggttgacgaatgtataacacg 6396519  T
Q  242 acttgtgtgattacct-aaaagaccaagggtgattg 276  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  6396518 acttgtgggattaactgaaaagaccaagggtaattg 6396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13829167 - 13829045
Alignment:
Q  205 cggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc-taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgg 303  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |  || ||||||  |||||| |||||||  |||||||||||  | ||||  |||||||||| |||  |    
T  13829167 cggaaggcattctggagtttgaagaatgtatagcatggcttgtggcattaccctaaaagagtaagggtgattggatacaagaagatcttcaaggaagcag 13829068  T
Q  304 gagacgttccatggttgaagagg 326  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  13829067 gagatgttccgtggttgaagagg 13829045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41303922 - 41303847
Alignment:
Q  256 ctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggagacgttccatggttgaagagggtttg 331  Q
    |||||||||||||||||||||   |||| | |||||||| ||||| ||||||| |||| || || |||||||||||    
T  41303922 ctaaaagaccaagggtgattggaagcaatgagatcttcacgaaagcgggagacattccgtgattaaagagggtttg 41303847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 76 - 124
Target Start/End: Original strand, 16604651 - 16604699
Alignment:
Q  76 tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagt 124  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  16604651 tgtacacatttggaagttgaggtggagaaagctcaacttcaggtggagt 16604699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 34951 - 35187
Alignment:
Q  2 agtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggt 98  Q
    ||||||||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||||||||    
T  34951 agtctggagaggcggaggcaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggt 35050  T
Q  99 agagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttc 197  Q
    |||| | | ||| | | ||||||||||||  ||| ||  |||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||    
T  35051 agagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacatcggtaatggtacgactatggaggaccttgagtgctatgctctagtggtgagcaagggatttcttc 35150  T
Q  198 atgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgta 234  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  35151 atgaagacggaaggcattccggaggttgaagaatgta 35187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 307
Target Start/End: Original strand, 3980 - 4151
Alignment:
Q  138 aatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatg 236  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||     
T  3980 aatggtacgactatggaggaccttgggtgatatgctctagtggtgagcaagggatttcttcatgaagacggaaggcattccaaagtttgaagaatgtata 4079  T
Q  237 gtgtgacttgtgtgatta-cctaaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatcttcaagaaagtgggaga 307  Q
    |   |||||| | ||||| |||||||  |||||||||||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||    
T  4080 gcacgacttgcgggattaccctaaaaagccaagggtgattggatgtaaggagatcttcaaggaagcgggaga 4151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23164 - 23009
Alignment:
Q  30 cgtgatcaacctttgaggtggagtagcaaggtg-aagacatagtgtgtgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtggagttgag 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||   ||  |||||||||       
T  23164 cgtgatcaacctttaaggtggagttgcaaggtgaaagacataatggatgtacgcatttggaagttgaggtggagaaagctcggattgcggtggagttagt 23065  T
Q  129 gacaccgagaatggtataactatggaggccttgggtgttatgctctagttgtgagca 185  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  23064 tacaccga-aatggtatgactatggagatcttgggtactatgctctagttgtgagca 23009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 706 - 532
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  706 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 607  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctcta 175  Q
    | | | ||||| | ||||||||||||  ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  606 gtacgctcaacgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacaactatgaaggaccttgggtgctatgctcta 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 51074 - 51387
Alignment:
Q  1 tagtctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgagg 97  Q
    |||||| ||||||||| |  || | ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | ||||| |||| |  ||||||||    
T  51074 tagtctagagaggcggagacaacaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctagttgagg 51173  T
Q  98 tagagaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggaggcc-ttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattctt 196  Q
    ||||| | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||   ||||||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||    
T  51174 tagagtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacggctatggaggacgttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttctt 51272  T
Q  197 catgaggacggaaggcattccggggtttgaagaatgtatggtgtgacttgtgtgattacc----taaaagaccaagggtgattgagtgcaaggtgatctt 292  Q
    || || |||||||||| |||||| | ||||||||||||| |   | |||| | |||||||     ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  51273 cacgaagacggaaggcgttccggaggttgaagaatgtatagcacggcttgcgggattaccctaaaaaaaggccaagggtgattggatgcaaggtgatctt 51372  T
Q  293 caagaaagtgggaga 307  Q
    |||| ||| ||||||    
T  51373 caaggaagcgggaga 51387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 23488 - 23687
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||    
T  23488 ctggagaggcggtggtaagaatactcaggatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacgcatttgctagttgaggtaga 23587  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  23588 gcacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 23686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 985 - 1184
Alignment:
Q  5 ctggagaggcggtgtgaagagtactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaagg-tgaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtaga 101  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| |||| |  | ||||||||||    
T  985 ctggagaggcggtggtaagaatactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgggatgtacacatttgctaattgaggtaga 1084  T
Q  102 gaaagatcaacttaaggtggagttgaggacaccgagaatggtataactatggagg-ccttgggtgttatgctctagttgtgagcatgtgaattcttcatg 200  Q
    | | | ||| | | ||||||||||||  ||||||  |||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| | || |||||||||    
T  1085 gtacgctcagcgtgaggtggagttgaacacaccggtaatggtacgactatgaaggaccttgggtgctatgctcta-tggtgagcaagggatttcttcatg 1183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70272
Alignment:
Q  26 tactcgtgatcaacct-ttgaggtggagtagcaaggt-gaagacatagtgtg-tgtacgcattcggaagttgaggtagagaaagatcaacttaaggtgga 122  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||| | | ||| | | |||||||    
T  70425 tactcatgatctacctgttgaggtggagtttcaaggttgaagacatagtgagatgtacgcatttgctagttgaggtagagtacgctcatcgtgaggtgga 70326  T
Q  123 gttgaggacaccgagaatggtataactatgg-aggccttgggtgttatgctcta 175  Q
    |||||  |||| |  |||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  70325 gttgaacacactggtaatggtacgactatggaagaccttgggtgctatgctcta 70272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University